SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011780137.1 NCBI__GCF_000015305.1:WP_011780137.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6hulB Sulfolobus solfataricus tryptophan synthase ab complex (see paper)
46% identity, 94% coverage: 17:425/433 of query aligns to 4:410/416 of 6hulB

query
sites
6hulB
V
 
L
P
 
P
T
 
K
H
 
Y
W
 
W
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
A
 
I
A
 
P
E
 
D
L
 
L
D
 
P
E
 
K
P
 
P
I
 
L
P
 
P
P
 
P
H
 
P
L
 
R
H
 
D
P
 
P
G
 
Q
T
 
G
R
 
A
E
 
Y
P
 
F
V
 
S
G
 
R
P
 
I
D
 
D
D
 
L
L
 
L
A
 
R
P
 
S
L
 
I
F
 
L
A
 
P
S
 
K
A
 
E
L
 
V
I
 
L
A
 
R
Q
 
Q
E
 
Q
V
 
F
A
 
T
S
 
I
E
 
E
T
 
R
Y
 
Y
I
 
I
E
 
K
I
 
I
P
 
P
Q
 
E
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
 
D
I
 
R
Y
 
Y
-
 
L
A
 
S
M
 
I
W
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
F
R
 
R
A
 
A
R
 
K
R
 
R
F
 
L
E
 
E
K
 
E
A
 
Y
L
 
L
N
 
K
T
 
T
G
 
P
A
 
A
H
 
R
I
 
I
Y
 
Y
V
 
F
K
 
K
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
V
 
A
S
 
T
P
 
P
V
 
T
G
 
G
S
 
S
H
|
H
K
|
K
T
 
I
N
 
N
S
 
T
A
 
A
V
 
I
A
 
P
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
N
 
A
H
 
K
I
 
E
D
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
E
K
 
H
L
 
V
T
 
V
T
 
T
E
 
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
Q
|
Q
W
|
W
G
 
G
S
 
T
A
 
A
L
 
V
S
 
A
F
 
L
A
 
A
G
 
A
A
 
S
Q
 
M
F
 
Y
G
 
N
L
 
M
E
 
K
V
 
S
E
 
T
V
 
I
W
 
F
Q
 
M
V
 
V
R
 
K
A
 
V
S
 
S
Y
 
Y
E
 
E
S
 
Q
K
 
K
P
 
P
Y
 
M
R
 
R
G
 
R
H
 
S
L
 
I
I
 
M
R
 
Q
T
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
T
 
N
V
 
V
H
 
Y
S
 
A
S
 
S
P
 
P
S
 
T
T
 
N
L
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
Y
G
 
G
R
 
R
A
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
E
K
 
T
D
 
N
P
 
P
D
 
Q
T
 
H
T
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
M
 
I
A
 
A
V
 
M
S
 
S
E
 
E
A
 
A
V
 
I
E
 
E
V
 
Y
A
 
A
A
 
L
A
 
K
D
 
N
P
 
-
E
 
E
A
 
F
R
 
R
Y
 
Y
A
 
L
L
 
V
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
 
L
N
 
D
H
 
V
V
 
V
V
 
L
L
 
L
H
 
H
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
T
V
 
I
A
 
T
Q
 
Q
L
 
L
A
 
D
L
 
L
V
 
L
E
 
G
P
 
E
D
 
D
G
 
-
A
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
L
F
 
I
G
 
G
C
 
C
A
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
L
 
F
A
 
G
G
 
G
L
 
F
S
 
T
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
-
R
 
-
E
 
-
K
 
-
I
 
I
H
 
G
G
 
N
R
 
K
S
 
K
N
 
G
P
 
K
R
 
R
I
 
Y
V
 
I
A
 
A
A
 
V
E
 
S
P
 
S
A
 
A
A
 
E
C
 
I
P
 
P
S
 
K
I
 
F
T
 
S
R
 
K
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
R
 
K
Y
 
Y
D
 
D
H
 
F
G
 
P
D
 
D
V
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
V
K
 
K
M
 
M
H
 
I
T
 
T
L
 
L
G
 
G
M
 
K
D
 
D
F
 
Y
V
 
V
P
 
P
D
 
P
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
M
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
T
L
 
L
S
 
S
H
 
L
T
 
L
V
 
T
E
 
K
L
 
E
G
 
G
L
 
I
V
 
V
E
 
E
G
 
W
V
 
R
A
 
E
I
 
Y
S
 
N
Q
 
E
H
 
R
D
 
E
A
 
I
F
 
F
A
 
E
A
 
A
G
 
A
V
 
K
Q
 
I
F
 
F
A
 
I
R
 
E
T
 
N
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
P
E
|
E
S
 
S
T
 
A
H
 
H
A
 
A
I
 
I
A
 
R
A
 
A
A
 
V
-
 
V
-
 
D
-
 
E
A
 
A
A
 
I
H
 
E
V
 
A
A
 
R
D
 
K
D
 
N
P
 
N
R
 
E
E
 
R
Q
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
V
I
 
F
G
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
H
 
H
G
 
G
Q
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
P
 
S
A
 
N
Y
 
Y

4qysB Trpb2 enzymes (see paper)
42% identity, 97% coverage: 11:429/433 of query aligns to 5:416/418 of 4qysB

query
sites
4qysB
D
 
D
L
 
L
V
 
P
T
 
Q
V
 
D
K
 
E
V
 
I
P
 
P
T
 
A
H
 
Q
W
 
W
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
A
 
L
A
 
P
E
 
D
L
 
L
D
 
P
E
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
-
P
 
-
H
 
-
L
 
-
H
 
-
P
 
-
G
 
-
T
 
E
R
 
E
E
 
L
P
 
P
V
 
P
G
 
P
P
 
Q
D
 
E
D
 
L
L
 
L
A
 
K
P
 
E
L
 
V
F
 
L
A
 
P
S
 
S
A
 
K
L
 
V
I
 
L
A
 
E
Q
 
L
E
 
E
V
 
F
A
 
A
S
 
K
E
 
E
T
 
R
Y
 
Y
I
 
V
E
 
K
I
 
I
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
L
E
 
E
I
 
R
Y
 
Y
-
 
L
A
 
Q
M
 
V
W
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
I
I
 
I
R
 
R
A
 
A
R
 
K
R
 
R
F
 
L
E
 
E
K
 
E
A
 
Y
L
 
L
N
 
G
T
 
N
G
 
N
A
 
I
H
 
K
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
Y
 
M
E
 
E
G
 
S
V
 
Y
S
 
T
P
 
Y
V
 
T
G
 
G
S
 
S
H
|
H
K
|
K
T
 
I
N
 
N
S
 
S
A
 
A
V
 
L
A
 
A
Q
 
H
A
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
A
H
 
K
I
 
L
D
 
D
G
 
N
V
 
A
R
 
K
K
 
F
L
 
V
T
 
T
T
 
T
E
|
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
W
 
W
G
 
G
S
 
S
A
 
S
L
 
V
S
 
A
F
 
L
A
 
A
G
 
S
A
 
A
Q
 
L
F
 
F
G
 
R
L
 
M
E
 
K
V
 
A
E
 
H
V
 
I
W
 
F
Q
 
M
V
 
V
R
 
R
A
 
T
S
 
S
Y
 
Y
E
 
Y
S
 
A
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
G
 
K
H
 
Y
L
 
M
I
 
M
R
 
Q
T
 
M
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
T
 
E
V
 
V
H
 
H
S
 
P
S
 
S
P
 
P
S
 
S
T
 
D
L
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
F
G
 
G
R
 
R
A
 
Q
I
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
D
 
D
P
 
S
D
 
N
T
 
H
T
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
M
 
I
A
 
A
V
 
I
S
 
S
E
 
D
A
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
Y
A
 
A
A
 
H
A
 
K
D
 
N
P
 
G
E
 
-
A
 
G
R
 
K
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
V
N
 
N
H
 
S
V
 
D
V
 
I
L
 
M
H
 
F
Q
 
K
T
 
T
V
 
I
I
 
A
G
 
G
Q
 
M
E
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
K
Q
 
Q
L
 
M
A
 
E
L
 
L
V
 
I
E
 
G
P
 
E
D
 
D
G
 
-
A
 
P
D
 
D
V
 
Y
V
 
I
F
 
I
G
 
G
C
 
V
A
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
L
 
Y
A
 
A
G
 
A
L
 
L
S
 
A
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
L
R
 
G
E
 
D
K
 
E
I
 
L
H
 
R
-
 
S
G
 
G
R
 
K
S
 
V
N
 
R
P
 
R
R
 
K
I
 
Y
V
 
I
A
 
A
A
 
S
E
 
G
P
 
S
A
 
S
A
 
E
C
 
V
P
 
P
S
 
K
I
 
M
T
 
T
R
 
K
G
 
G
E
 
V
Y
 
Y
R
 
K
Y
 
Y
D
 
D
H
 
Y
G
 
P
D
 
D
V
 
T
A
 
A
G
 
K
L
 
L
T
 
L
P
 
P
L
 
M
L
 
L
K
 
K
M
 
M
H
 
Y
T
 
T
L
 
I
G
 
G
M
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
V
P
 
P
D
 
P
P
 
P
I
 
V
H
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
M
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
T
L
 
L
S
 
S
H
 
L
T
 
L
V
 
I
E
 
S
L
 
K
G
 
G
L
 
I
V
 
V
E
 
Q
G
 
A
V
 
R
A
 
D
I
 
Y
S
 
S
Q
 
Q
H
 
E
D
 
E
A
 
S
F
 
F
A
 
K
A
 
W
G
 
A
V
 
K
Q
 
L
F
 
F
A
 
S
R
 
E
T
 
L
Q
 
E
G
 
G
I
 
Y
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
E
|
E
S
 
T
T
 
S
H
 
H
A
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
I
I
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
I
A
 
A
A
 
E
H
 
E
V
 
A
A
 
K
D
 
K
D
 
S
P
 
G
R
 
E
E
 
R
Q
 
K
V
 
T
V
 
V
V
 
L
I
 
V
G
 
S
L
 
F
S
|
S
G
 
G
H
 
H
G
 
G
Q
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
P
 
G
A
 
N
Y
 
Y
A
 
A
E
 
S
Y
 
V
L
 
L

4qysA Trpb2 enzymes (see paper)
39% identity, 97% coverage: 11:429/433 of query aligns to 5:406/408 of 4qysA

query
sites
4qysA
D
 
D
L
 
L
V
 
P
T
 
Q
V
 
D
K
 
E
V
 
I
P
 
P
T
 
A
H
 
Q
W
 
W
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
A
 
L
A
 
P
E
 
D
L
 
L
D
 
P
E
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
-
P
 
-
H
 
E
L
 
E
H
 
L
P
 
P
G
 
P
T
 
P
R
 
Q
E
 
D
P
 
P
V
 
T
G
 
G
P
 
K
-
 
S
-
 
L
D
 
E
D
 
L
L
 
L
A
 
K
P
 
E
L
 
V
F
 
L
A
 
P
S
 
S
A
 
K
L
 
V
I
 
L
A
 
E
Q
 
L
E
 
E
V
 
F
A
 
A
S
 
K
E
 
E
T
 
R
Y
 
Y
I
 
V
E
 
K
I
 
I
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
L
E
 
E
I
 
R
Y
 
Y
-
 
L
A
 
Q
M
 
V
W
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
I
I
 
I
R
 
R
A
 
A
R
 
K
R
 
R
F
 
L
E
 
E
K
 
E
A
 
Y
L
 
L
N
 
G
T
 
N
G
 
N
A
 
I
H
 
K
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
Y
 
M
E
 
E
G
 
S
V
 
Y
S
 
T
P
 
Y
V
 
T
G
 
G
S
 
S
H
|
H
K
|
K
T
 
I
N
 
N
S
 
S
A
 
A
V
 
L
A
 
A
Q
 
H
A
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
A
H
 
K
I
 
L
D
 
D
G
 
N
V
 
A
R
 
K
K
 
F
L
 
V
T
 
T
T
 
T
E
|
E
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
|
W
G
 
G
S
 
S
A
 
S
L
 
V
S
 
A
F
 
L
A
 
A
G
 
S
A
 
A
Q
 
L
F
 
F
G
 
R
L
 
M
E
 
K
V
 
A
E
 
H
V
 
I
W
 
F
Q
 
M
V
 
V
R
 
R
A
 
T
S
 
S
Y
 
Y
E
 
Y
S
 
A
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
G
 
K
H
 
Y
L
 
M
I
 
M
R
 
Q
T
 
M
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
T
 
E
V
 
V
H
 
H
S
 
P
S
 
S
P
 
P
S
 
S
T
 
D
L
 
L
T
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
L
G
 
G
M
 
I
A
 
A
V
 
I
S
 
S
E
 
D
A
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
Y
A
 
A
A
 
H
A
 
K
D
 
N
P
 
G
E
 
-
A
 
G
R
 
K
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
V
N
 
N
H
 
S
V
 
D
V
 
I
L
 
M
H
 
F
Q
 
K
T
 
T
V
 
I
I
 
A
G
 
G
Q
 
M
E
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
K
Q
 
Q
L
 
M
A
 
E
L
 
L
V
 
I
E
 
G
P
 
E
D
 
D
G
 
-
A
 
P
D
 
D
V
 
Y
V
 
I
F
 
I
G
 
G
C
 
V
A
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
L
 
Y
A
 
A
G
 
A
L
 
L
S
 
A
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
L
R
 
G
E
 
D
K
 
E
I
 
L
H
 
R
-
 
S
G
 
G
R
 
K
S
 
V
N
 
R
P
 
R
R
 
K
I
 
Y
V
 
I
A
 
A
A
 
S
E
 
G
P
 
S
A
 
S
A
 
E
C
 
V
P
 
P
S
 
K
I
 
M
T
 
T
R
 
K
G
 
G
E
 
V
Y
 
Y
R
 
K
Y
 
Y
D
 
D
H
 
Y
G
 
P
D
 
D
V
 
T
A
 
A
G
 
K
L
 
L
T
 
L
P
 
P
L
 
M
L
 
L
K
 
K
M
 
M
H
 
Y
T
 
T
L
 
I
G
 
G
M
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
V
P
 
P
D
 
P
P
 
P
I
 
V
H
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
|
G
L
 
L
R
|
R
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
M
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
T
L
 
L
S
 
S
H
 
L
T
 
L
V
 
I
E
 
S
L
 
K
G
 
G
L
 
I
V
 
V
E
 
Q
G
 
A
V
 
R
A
 
D
I
 
Y
S
 
S
Q
 
Q
H
 
E
D
 
E
A
 
S
F
 
F
A
 
K
A
 
W
G
 
A
V
 
K
Q
 
L
F
 
F
A
 
S
R
 
E
T
 
L
Q
 
E
G
 
G
I
 
Y
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
E
|
E
S
 
T
T
 
S
H
 
H
A
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
I
I
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
I
A
 
A
A
 
E
H
 
E
V
 
A
A
 
K
D
 
K
D
 
S
P
 
G
R
 
E
E
 
R
Q
 
K
V
 
T
V
 
V
V
 
L
I
 
V
G
 
S
L
 
F
S
|
S
G
 
G
H
 
H
G
 
G
Q
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
P
 
G
A
 
N
Y
 
Y
A
 
A
E
 
S
Y
 
V
L
 
L

5vm5D Engineered tryptophan synthase b-subunit from pyrococcus furiosus, pftrpb2b9, with ser bound (see paper)
30% identity, 82% coverage: 69:422/433 of query aligns to 34:376/383 of 5vm5D

query
sites
5vm5D
E
 
E
I
 
F
P
 
N
Q
 
R
E
 
Q
V
 
L
R
 
N
E
 
Y
I
 
Y
Y
 
L
A
 
K
M
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
F
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
A
H
 
K
I
 
V
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
V
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
T
 
T
N
 
N
S
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
I
 
L
D
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
K
 
R
L
 
L
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
A
 
A
L
 
T
S
 
A
F
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
F
 
L
G
 
G
L
 
M
E
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
I
W
 
Y
Q
 
M
V
 
G
R
 
A
A
 
E
S
 
D
Y
 
V
E
 
E
S
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
G
 
V
H
 
F
L
 
R
I
 
M
R
 
K
T
 
L
Y
 
L
G
 
G
G
 
A
T
 
N
V
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
V
H
 
N
S
 
S
S
 
G
P
 
S
S
 
R
T
 
T
L
 
L
T
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
R
V
 
D
A
 
W
A
 
V
A
 
A
D
 
T
P
 
F
E
 
E
-
 
Y
A
 
T
R
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
V
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
A
 
L
L
 
E
V
 
A
E
 
E
P
 
G
D
 
Q
G
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
F
 
V
G
 
A
C
 
C
A
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
L
 
A
A
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
R
 
N
E
 
D
K
 
K
I
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
N
 
K
P
 
V
R
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
G
A
 
V
E
 
E
P
 
A
A
 
G
A
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
H
C
 
S
P
 
A
S
 
S
I
 
L
T
 
N
R
 
A
G
 
G
E
 
Q
Y
 
V
R
 
G
Y
 
V
D
 
S
H
 
H
G
 
G
D
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
M
L
 
L
K
 
S
M
 
Y
H
 
F
T
 
L
L
 
Q
G
 
D
M
 
G
D
 
Q
F
 
I
V
 
K
P
 
P
D
 
S
P
 
H
I
 
S
H
 
I
A
 
A
G
 
P
G
|
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
E
L
 
H
S
 
A
H
 
Y
T
 
L
V
 
K
E
 
K
L
 
I
G
 
Q
L
 
R
V
 
A
E
 
E
G
 
Y
V
 
V
A
 
A
I
 
V
S
 
T
Q
 
D
H
 
E
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
V
 
H
Q
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
|
E
S
 
S
T
 
A
H
 
H
A
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
M
A
 
K
H
 
L
V
 
A
A
 
K
D
 
E
D
 
M
P
 
S
R
 
R
E
 
D
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
I
I
 
V
G
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
L
 
K
D
 
D
L
 
L

5t6mA Structure of the tryptophan synthase b-subunit from pyroccus furiosus with b-methyltryptophan non-covalently bound (see paper)
30% identity, 82% coverage: 69:422/433 of query aligns to 34:376/383 of 5t6mA

query
sites
5t6mA
E
 
E
I
 
F
P
 
N
Q
 
R
E
 
Q
V
 
L
R
 
N
E
 
Y
I
 
Y
Y
 
L
A
 
K
M
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
F
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
A
H
 
K
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
V
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
K
|
K
T
 
T
N
 
N
S
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
I
 
F
D
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
K
 
R
L
 
L
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
A
 
A
L
 
T
S
 
A
F
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
F
 
L
G
 
G
L
 
M
E
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
I
W
 
Y
Q
 
M
V
 
G
R
 
A
A
 
E
S
 
D
Y
 
V
E
 
E
S
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
G
 
V
H
 
F
L
 
R
I
 
M
R
 
K
T
 
L
Y
 
L
G
 
G
G
 
A
T
 
N
V
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
V
H
 
N
S
 
S
S
 
G
P
 
S
S
 
R
T
 
T
L
 
L
T
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
R
V
 
D
A
 
W
A
 
V
A
 
A
D
 
T
P
 
F
E
 
E
-
 
Y
A
 
T
R
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
V
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
A
 
L
L
 
E
V
 
A
E
 
E
P
 
G
D
 
Q
G
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
F
 
V
G
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
A
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
R
 
N
E
 
D
K
 
K
I
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
N
 
K
P
 
V
R
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
G
A
 
V
E
 
E
P
 
-
A
 
A
A
 
G
C
 
G
P
 
K
S
 
G
I
 
L
T
 
E
R
 
S
G
 
G
E
 
K
Y
 
H
R
 
S
-
 
A
-
 
S
Y
 
L
D
 
N
H
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
V
A
 
G
G
 
V
L
 
F
T
 
H
P
 
G
L
 
M
L
 
L
K
 
S
M
 
Y
H
 
F
T
 
L
L
 
Q
G
 
D
M
 
G
D
 
Q
F
 
I
V
 
K
P
 
P
D
 
T
P
 
H
I
 
S
H
 
I
A
 
A
G
 
P
G
 
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
E
L
 
H
S
 
A
H
 
Y
T
 
L
V
 
K
E
 
K
L
 
I
G
 
Q
L
 
R
V
 
A
E
 
E
G
 
Y
V
 
V
A
 
T
I
 
V
S
 
T
Q
 
D
H
 
E
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
V
 
H
Q
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
 
E
S
 
S
T
 
A
H
 
H
A
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
M
A
 
K
H
 
L
V
 
A
A
 
K
D
 
E
D
 
M
P
 
S
R
 
R
E
 
D
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
I
I
 
V
G
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
L
 
K
D
 
D
L
 
L

5ixjD Tryptophan synthase beta-subunit from pyrococcus furiosus with l- threonine non-covalently bound in the active site (see paper)
30% identity, 82% coverage: 69:422/433 of query aligns to 34:376/394 of 5ixjD

query
sites
5ixjD
E
 
E
I
 
F
P
 
N
Q
 
R
E
 
Q
V
 
L
R
 
N
E
 
Y
I
 
Y
Y
 
L
A
 
K
M
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
F
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
A
H
 
K
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
V
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
K
|
K
T
 
T
N
 
N
S
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
I
 
F
D
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
K
 
R
L
 
L
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
A
 
A
L
 
T
S
 
A
F
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
F
 
L
G
 
G
L
 
M
E
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
I
W
 
Y
Q
 
M
V
 
G
R
 
A
A
 
E
S
 
D
Y
 
V
E
 
E
S
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
G
 
V
H
 
F
L
 
R
I
 
M
R
 
K
T
 
L
Y
 
L
G
 
G
G
 
A
T
 
N
V
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
V
H
 
N
S
 
S
S
 
G
P
 
S
S
 
R
T
 
T
L
 
L
T
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
R
V
 
D
A
 
W
A
 
V
A
 
A
D
 
T
P
 
F
E
 
E
-
 
Y
A
 
T
R
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
V
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
A
 
L
L
 
E
V
 
A
E
 
E
P
 
G
D
 
Q
G
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
F
 
V
G
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
A
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
R
 
N
E
 
D
K
 
K
I
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
N
 
K
P
 
V
R
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
G
A
 
V
E
 
E
P
 
-
A
 
A
A
 
G
C
 
G
P
 
K
S
 
G
I
 
L
T
 
E
R
 
S
G
 
G
E
 
K
Y
 
H
R
 
S
-
 
A
-
 
S
Y
 
L
D
 
N
H
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
V
A
 
G
G
 
V
L
 
F
T
 
H
P
 
G
L
 
M
L
 
L
K
 
S
M
 
Y
H
 
F
T
 
L
L
 
Q
G
 
D
M
 
G
D
 
Q
F
 
I
V
 
K
P
 
P
D
 
T
P
 
H
I
 
S
H
 
I
A
 
A
G
 
P
G
 
G
L
 
L
R
x
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
E
L
 
H
S
 
A
H
 
Y
T
 
L
V
 
K
E
 
K
L
 
I
G
 
Q
L
 
R
V
 
A
E
 
E
G
 
Y
V
 
V
A
 
T
I
 
V
S
 
T
Q
 
D
H
 
E
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
V
 
H
Q
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
 
E
S
 
S
T
 
A
H
 
H
A
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
M
A
 
K
H
 
L
V
 
A
A
 
K
D
 
E
D
 
M
P
 
S
R
 
R
E
 
D
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
I
I
 
V
G
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
L
 
K
D
 
D
L
 
L

5t6mB Structure of the tryptophan synthase b-subunit from pyroccus furiosus with b-methyltryptophan non-covalently bound (see paper)
30% identity, 82% coverage: 69:422/433 of query aligns to 34:378/386 of 5t6mB

query
sites
5t6mB
E
 
E
I
 
F
P
 
N
Q
 
R
E
 
Q
V
 
L
R
 
N
E
 
Y
I
 
Y
Y
 
L
A
 
K
M
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
F
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
A
H
 
K
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
V
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
K
|
K
T
 
T
N
 
N
S
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
I
 
F
D
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
K
 
R
L
 
L
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
 
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
A
 
A
L
 
T
S
 
A
F
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
F
 
L
G
 
G
L
 
M
E
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
I
W
 
Y
Q
 
M
V
 
G
R
 
A
A
 
E
S
 
D
Y
 
V
E
 
E
S
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
G
 
V
H
 
F
L
 
R
I
 
M
R
 
K
T
 
L
Y
 
L
G
 
G
G
 
A
T
 
N
V
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
V
H
 
N
S
 
S
S
 
G
P
 
S
S
 
R
T
 
T
L
 
L
T
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
R
V
 
D
A
 
W
A
 
V
A
 
A
D
 
T
P
 
F
E
 
E
-
 
Y
A
 
T
R
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
V
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
A
 
L
L
 
E
V
 
A
E
 
E
P
 
G
D
 
Q
G
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
F
 
V
G
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
A
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
R
 
N
E
 
D
K
 
K
I
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
N
 
K
P
 
V
R
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
G
A
 
V
E
 
E
P
 
-
A
 
A
A
 
G
C
 
G
P
 
K
S
 
G
I
 
L
T
 
E
R
 
S
G
 
G
E
 
K
Y
 
H
R
 
S
-
 
A
-
 
S
Y
 
L
D
 
N
H
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
V
A
 
G
G
 
V
L
 
F
T
 
H
P
 
G
L
 
M
L
 
L
K
 
S
M
 
Y
H
 
F
T
 
L
L
 
Q
G
 
D
M
 
E
D
 
E
F
 
G
V
 
Q
P
 
I
D
 
K
P
 
P
I
 
T
H
 
H
-
 
S
-
 
I
A
 
A
G
 
P
G
|
G
L
 
L
R
 
D
Y
|
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
E
L
 
H
S
 
A
H
 
Y
T
 
L
V
 
K
E
 
K
L
 
I
G
 
Q
L
 
R
V
 
A
E
 
E
G
 
Y
V
 
V
A
 
T
I
 
V
S
 
T
Q
 
D
H
 
E
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
V
 
H
Q
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
 
E
S
 
S
T
 
A
H
 
H
A
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
M
A
 
K
H
 
L
V
 
A
A
 
K
D
 
E
D
 
M
P
 
S
R
 
R
E
 
D
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
I
I
 
V
G
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
L
 
K
D
 
D
L
 
L

5dw0A Trpb from pyrococcus furiosus with l-serine bound as the external aldimine (see paper)
30% identity, 82% coverage: 69:422/433 of query aligns to 34:378/388 of 5dw0A

query
sites
5dw0A
E
 
E
I
 
F
P
 
N
Q
 
R
E
 
Q
V
 
L
R
 
N
E
 
Y
I
 
Y
Y
 
L
A
 
K
M
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
F
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
A
H
 
K
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
V
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
T
 
T
N
 
N
S
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
I
 
F
D
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
K
 
R
L
 
L
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
A
 
A
L
 
T
S
 
A
F
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
F
 
L
G
 
G
L
 
M
E
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
I
W
 
Y
Q
 
M
V
 
G
R
 
A
A
 
E
S
 
D
Y
 
V
E
 
E
S
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
G
 
V
H
 
F
L
 
R
I
 
M
R
 
K
T
 
L
Y
 
L
G
 
G
G
 
A
T
 
N
V
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
V
H
 
N
S
 
S
S
 
G
P
 
S
S
 
R
T
 
T
L
 
L
T
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
R
V
 
D
A
 
W
A
 
V
A
 
A
D
 
T
P
 
F
E
 
E
-
 
Y
A
 
T
R
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
V
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
A
 
L
L
 
E
V
 
A
E
 
E
P
 
G
D
 
Q
G
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
F
 
V
G
 
A
C
 
C
A
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
L
 
A
A
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
R
 
N
E
 
D
K
 
K
I
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
N
 
K
P
 
V
R
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
G
A
 
V
E
 
E
P
 
-
A
 
A
A
 
G
C
 
G
P
 
K
S
 
G
I
 
L
T
 
E
R
 
S
G
 
G
E
 
K
Y
 
H
R
 
S
-
 
A
-
 
S
Y
 
L
D
 
N
H
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
V
A
 
G
G
 
V
L
 
F
T
 
H
P
 
G
L
 
M
L
 
L
K
 
S
M
 
Y
H
 
F
T
 
L
L
 
Q
G
 
D
M
 
E
D
 
E
F
 
G
V
 
Q
P
 
I
D
 
K
P
 
P
I
 
T
H
 
H
-
 
S
-
 
I
A
 
A
G
 
P
G
|
G
L
 
L
R
x
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
E
L
 
H
S
 
A
H
 
Y
T
 
L
V
 
K
E
 
K
L
 
I
G
 
Q
L
 
R
V
 
A
E
 
E
G
 
Y
V
 
V
A
 
T
I
 
V
S
 
T
Q
 
D
H
 
E
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
V
 
H
Q
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
|
E
S
 
S
T
 
A
H
 
H
A
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
M
A
 
K
H
 
L
V
 
A
A
 
K
D
 
E
D
 
M
P
 
S
R
 
R
E
 
D
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
I
I
 
V
G
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
L
 
K
D
 
D
L
 
L

1v8zA X-ray crystal structure of the tryptophan synthase b2 subunit from hyperthermophile, pyrococcus furiosus (see paper)
30% identity, 82% coverage: 69:422/433 of query aligns to 34:378/386 of 1v8zA

query
sites
1v8zA
E
 
E
I
 
F
P
 
N
Q
 
R
E
 
Q
V
 
L
R
 
N
E
 
Y
I
 
Y
Y
 
L
A
 
K
M
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
F
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
A
H
 
K
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
V
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
T
 
T
N
 
N
S
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
I
 
F
D
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
K
 
R
L
 
L
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
W
 
H
G
 
G
S
 
V
A
 
A
L
 
T
S
 
A
F
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
F
 
L
G
 
G
L
 
M
E
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
I
W
 
Y
Q
 
M
V
 
G
R
 
A
A
 
E
S
 
D
Y
 
V
E
 
E
S
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
G
 
V
H
 
F
L
 
R
I
 
M
R
 
K
T
 
L
Y
 
L
G
 
G
G
 
A
T
 
N
V
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
V
H
 
N
S
 
S
S
 
G
P
 
S
S
 
R
T
 
T
L
 
L
T
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
R
V
 
D
A
 
W
A
 
V
A
 
A
D
 
T
P
 
F
E
 
E
-
 
Y
A
 
T
R
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
V
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
A
 
L
L
 
E
V
 
A
E
 
E
P
 
G
D
 
Q
G
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
F
 
V
G
 
A
C
 
C
A
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
L
 
A
A
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
R
 
N
E
 
D
K
 
K
I
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
N
 
K
P
 
V
R
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
G
A
 
V
E
 
E
P
 
-
A
 
A
A
 
G
C
 
G
P
 
K
S
 
G
I
 
L
T
 
E
R
 
S
G
 
G
E
 
K
Y
 
H
R
 
S
-
 
A
-
 
S
Y
 
L
D
 
N
H
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
V
A
 
G
G
 
V
L
 
F
T
 
H
P
 
G
L
 
M
L
 
L
K
 
S
M
 
Y
H
 
F
T
 
L
L
 
Q
G
 
D
M
 
E
D
 
E
F
 
G
V
 
Q
P
 
I
D
 
K
P
 
P
I
 
T
H
 
H
-
 
S
-
 
I
A
 
A
G
 
P
G
 
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
E
L
 
H
S
 
A
H
 
Y
T
 
L
V
 
K
E
 
K
L
 
I
G
 
Q
L
 
R
V
 
A
E
 
E
G
 
Y
V
 
V
A
 
T
I
 
V
S
 
T
Q
 
D
H
 
E
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
V
 
H
Q
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
|
E
S
 
S
T
 
A
H
 
H
A
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
M
A
 
K
H
 
L
V
 
A
A
 
K
D
 
E
D
 
M
P
 
S
R
 
R
E
 
D
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
I
I
 
V
G
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
L
 
K
D
 
D
L
 
L

7rnpA Engineered tryptophan synthase b-subunit from pyrococcus furiosus, pftrpb2b9_h275e with 4-cl-trp non-covalently bound (see paper)
30% identity, 82% coverage: 69:422/433 of query aligns to 34:378/384 of 7rnpA

query
sites
7rnpA
E
 
E
I
 
F
P
 
N
Q
 
R
E
 
Q
V
 
L
R
 
N
E
 
Y
I
 
Y
Y
 
L
A
 
K
M
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
F
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
A
H
 
K
I
 
V
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
V
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
K
|
K
T
 
T
N
 
N
S
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
I
 
L
D
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
K
 
R
L
 
L
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
A
 
A
L
 
T
S
 
A
F
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
F
 
L
G
 
G
L
 
M
E
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
I
W
 
Y
Q
 
M
V
 
G
R
 
A
A
 
E
S
 
D
Y
 
V
E
 
E
S
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
G
 
V
H
 
F
L
 
R
I
 
M
R
 
K
T
 
L
Y
 
L
G
 
G
G
 
A
T
 
N
V
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
V
H
 
N
S
 
S
S
 
G
P
 
S
S
 
R
T
 
T
L
|
L
T
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
R
V
 
D
A
 
W
A
 
V
A
 
A
D
 
T
P
 
F
E
 
E
-
 
Y
A
 
T
R
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
x
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
V
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
A
 
L
L
 
E
V
 
A
E
 
E
P
 
G
D
 
Q
G
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
F
 
V
G
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
A
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
R
 
N
E
 
D
K
 
K
I
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
N
 
K
P
 
V
R
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
G
A
 
V
E
 
E
P
 
-
A
 
A
A
 
G
C
 
G
P
 
K
S
 
G
I
 
L
T
 
E
R
 
S
G
 
G
E
 
K
Y
 
H
R
 
S
-
 
A
-
 
S
Y
 
L
D
 
N
H
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
V
A
 
G
G
 
V
L
 
S
T
 
E
P
 
G
L
 
M
L
 
L
K
 
S
M
 
Y
H
 
F
T
 
L
L
 
Q
G
 
D
M
 
E
D
 
E
F
 
G
V
 
Q
P
 
I
D
 
K
P
 
P
I
 
S
H
 
H
-
 
S
-
 
I
A
 
A
G
 
P
G
 
G
L
 
L
R
 
D
Y
|
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
E
L
 
H
S
 
A
H
 
Y
T
 
L
V
 
K
E
 
K
L
 
I
G
 
Q
L
 
R
V
 
A
E
 
E
G
 
Y
V
 
V
A
 
A
I
 
V
S
 
T
Q
 
D
H
 
E
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
V
 
H
Q
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
 
E
S
 
S
T
 
A
H
 
H
A
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
M
A
 
K
H
 
L
V
 
A
A
 
K
D
 
E
D
 
M
P
 
S
R
 
R
E
 
D
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
I
I
 
V
G
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
L
 
K
D
 
D
L
 
L

6am8B Engineered tryptophan synthase b-subunit from pyrococcus furiosus, pftrpb2b9 with trp bound as e(aex2) (see paper)
30% identity, 82% coverage: 69:422/433 of query aligns to 34:378/385 of 6am8B

query
sites
6am8B
E
 
E
I
 
F
P
 
N
Q
 
R
E
 
Q
V
 
L
R
 
N
E
 
Y
I
 
Y
Y
 
L
A
 
K
M
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
F
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
A
H
 
K
I
 
V
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
V
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
T
 
T
N
 
N
S
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
I
 
L
D
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
K
 
R
L
 
L
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
A
 
A
L
 
T
S
 
A
F
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
F
 
L
G
 
G
L
 
M
E
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
I
W
 
Y
Q
 
M
V
 
G
R
 
A
A
 
E
S
 
D
Y
 
V
E
 
E
S
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
G
 
V
H
 
F
L
 
R
I
 
M
R
 
K
T
 
L
Y
 
L
G
 
G
G
 
A
T
 
N
V
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
V
H
 
N
S
 
S
S
 
G
P
 
S
S
 
R
T
 
T
L
|
L
T
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
V
x
L
E
 
R
V
 
D
A
 
W
A
 
V
A
 
A
D
 
T
P
 
F
E
 
E
-
 
Y
A
 
T
R
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
x
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
V
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
A
 
L
L
 
E
V
 
A
E
 
E
P
 
G
D
 
Q
G
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
F
 
V
G
 
A
C
 
C
A
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
L
 
A
A
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
R
 
N
E
 
D
K
 
K
I
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
N
 
K
P
 
V
R
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
G
A
 
V
E
 
E
P
 
A
A
 
G
A
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
H
C
 
S
P
 
A
S
 
S
I
 
L
T
 
N
R
 
A
G
 
G
E
 
Q
Y
 
V
R
 
G
Y
 
V
D
x
S
H
|
H
G
 
G
D
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
M
L
 
L
K
 
S
M
 
Y
H
 
F
T
 
L
L
 
Q
G
 
D
M
 
E
D
 
E
F
 
G
V
 
Q
P
 
I
D
 
K
P
 
P
I
 
S
H
 
H
-
 
S
-
 
I
A
 
A
G
 
P
G
|
G
L
 
L
R
 
D
Y
|
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
E
L
 
H
S
 
A
H
 
Y
T
 
L
V
 
K
E
 
K
L
 
I
G
 
Q
L
 
R
V
 
A
E
 
E
G
 
Y
V
 
V
A
 
A
I
 
V
S
 
T
Q
 
D
H
 
E
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
V
 
H
Q
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
|
E
S
 
S
T
 
A
H
 
H
A
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
M
A
 
K
H
 
L
V
 
A
A
 
K
D
 
E
D
 
M
P
 
S
R
 
R
E
 
D
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
I
I
 
V
G
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
L
 
K
D
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6cutA Engineered holo trpb from pyrococcus furiosus, pftrpb7e6 with (2s,3s)- isopropylserine bound as the external aldimine (see paper)
31% identity, 82% coverage: 69:422/433 of query aligns to 34:378/385 of 6cutA

query
sites
6cutA
E
 
E
I
 
F
P
 
N
Q
 
R
E
 
Q
V
 
L
R
 
N
E
 
Y
I
 
Y
Y
 
L
A
 
K
M
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
F
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
A
H
 
K
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
V
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
T
 
T
N
 
N
S
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
P
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
I
 
L
D
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
K
 
R
L
 
L
T
 
I
T
 
A
E
 
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
A
 
A
L
 
T
S
 
A
F
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
F
 
L
G
 
G
L
 
M
E
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
I
W
 
Y
Q
 
M
V
 
G
R
 
A
A
 
E
S
 
D
Y
 
V
E
 
E
S
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
G
 
V
H
 
F
L
 
R
I
 
M
R
 
K
T
 
L
Y
 
L
G
 
G
G
 
A
T
 
N
V
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
V
H
 
N
S
 
S
S
 
G
P
 
S
S
 
R
T
 
T
L
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
A
K
 
K
D
 
D
P
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
A
V
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
R
V
 
D
A
 
W
A
 
E
A
 
A
D
 
T
P
 
F
E
 
E
-
 
Y
A
 
T
R
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
V
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
A
 
L
L
 
E
V
 
A
E
 
E
P
 
G
D
 
Q
G
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
F
 
V
G
 
A
C
 
C
A
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
L
 
A
A
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
R
 
N
E
 
D
K
 
K
I
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
N
 
K
P
 
V
R
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
G
A
 
V
E
 
E
P
 
-
A
 
A
A
 
G
C
 
G
P
 
K
S
 
G
I
 
L
T
 
E
R
 
S
G
 
G
E
 
K
Y
 
H
R
 
S
-
 
A
-
 
S
Y
 
L
D
 
N
H
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
V
A
 
G
G
 
V
L
 
L
T
 
H
P
 
G
L
 
M
L
 
L
K
 
S
M
 
Y
H
 
F
T
 
L
L
 
Q
G
 
D
M
 
E
D
 
E
F
 
G
V
 
Q
P
 
I
D
 
K
P
 
P
I
 
S
H
 
H
-
 
S
-
 
I
A
 
A
G
 
P
G
|
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
E
L
 
H
S
 
A
H
 
Y
T
 
L
V
 
K
E
 
K
L
 
I
G
 
Q
L
 
R
V
 
A
E
 
E
G
 
Y
V
 
V
A
 
T
I
 
V
S
 
T
Q
 
D
H
 
E
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
V
 
H
Q
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
|
E
S
 
S
T
 
A
H
 
H
A
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
M
A
 
K
H
 
L
V
 
A
A
 
K
D
 
E
D
 
M
P
 
S
R
 
R
E
 
D
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
I
I
 
V
G
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
L
 
K
D
 
D
L
 
L

5dw3A Tryptophan synthase beta-subunit from pyrococcus furiosus with product l-tryptophan non-covalently bound in the active site (see paper)
31% identity, 82% coverage: 69:422/433 of query aligns to 34:377/383 of 5dw3A

query
sites
5dw3A
E
 
E
I
 
F
P
 
N
Q
 
R
E
 
Q
V
 
L
R
 
N
E
 
Y
I
 
Y
Y
 
L
A
 
K
M
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
F
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
A
H
 
K
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
V
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
K
|
K
T
 
T
N
 
N
S
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
I
 
F
D
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
K
 
R
L
 
L
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
A
 
A
L
 
T
S
 
A
F
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
F
 
L
G
 
G
L
 
M
E
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
I
W
 
Y
Q
 
M
V
 
G
R
 
A
A
 
E
S
 
D
Y
 
V
E
 
E
S
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
G
 
V
H
 
F
L
 
R
I
 
M
R
 
K
T
 
L
Y
 
L
G
 
G
G
 
A
T
 
N
V
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
V
H
 
N
S
 
S
S
 
G
P
 
S
S
 
R
T
 
T
L
 
L
T
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
R
V
 
D
A
 
W
A
 
V
A
 
A
D
 
T
P
 
F
E
 
E
-
 
Y
A
 
T
R
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
V
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
A
 
L
L
 
E
V
 
A
E
 
E
P
 
G
D
 
Q
G
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
F
 
V
G
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
A
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
R
 
N
E
 
D
K
 
K
I
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
N
 
K
P
 
V
R
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
G
A
 
V
E
 
E
P
 
-
A
 
A
A
 
G
C
 
G
P
 
K
S
 
G
I
 
L
T
 
E
R
 
S
G
 
G
E
 
K
Y
 
H
R
 
S
-
 
A
-
 
S
Y
 
L
D
 
N
H
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
V
A
 
G
G
 
V
L
 
F
T
 
H
P
 
G
L
 
M
L
 
L
K
 
S
M
 
-
H
 
Y
T
 
F
L
 
L
G
 
Q
M
 
D
D
 
E
F
 
G
V
 
Q
P
 
I
D
 
K
P
 
P
I
 
T
H
 
H
-
 
S
-
 
I
A
 
A
G
 
P
G
 
G
L
 
L
R
 
D
Y
|
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
E
L
 
H
S
 
A
H
 
Y
T
 
L
V
 
K
E
 
K
L
 
I
G
 
Q
L
 
R
V
 
A
E
 
E
G
 
Y
V
 
V
A
 
T
I
 
V
S
 
T
Q
 
D
H
 
E
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
V
 
H
Q
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
 
E
S
 
S
T
 
A
H
 
H
A
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
M
A
 
K
H
 
L
V
 
A
A
 
K
D
 
E
D
 
M
P
 
S
R
 
R
E
 
D
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
I
I
 
V
G
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
L
 
K
D
 
D
L
 
L

6cuzA Engineered trpb from pyrococcus furiosus, pftrpb7e6 with (2s,3r)- ethylserine bound as the amino-acrylate (see paper)
31% identity, 82% coverage: 69:422/433 of query aligns to 34:378/383 of 6cuzA

query
sites
6cuzA
E
 
E
I
 
F
P
 
N
Q
 
R
E
 
Q
V
 
L
R
 
N
E
 
Y
I
 
Y
Y
 
L
A
 
K
M
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
F
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
N
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
A
H
 
K
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
V
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
T
 
T
N
 
N
S
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
P
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
I
 
L
D
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
K
 
R
L
 
L
T
 
I
T
 
A
E
 
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
A
 
A
L
 
T
S
 
A
F
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
F
 
L
G
 
G
L
 
M
E
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
I
W
 
Y
Q
 
M
V
 
G
R
 
A
A
 
E
S
 
D
Y
 
V
E
 
E
S
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
G
 
V
H
 
F
L
 
R
I
 
M
R
 
K
T
 
L
Y
 
L
G
 
G
G
 
A
T
 
N
V
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
V
H
 
N
S
 
S
S
 
G
P
 
S
S
 
R
T
 
T
L
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
A
K
 
K
D
 
D
P
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
A
V
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
R
V
 
D
A
 
W
A
 
E
A
 
A
D
 
T
P
 
F
E
 
E
-
 
Y
A
 
T
R
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
V
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
A
 
L
L
 
E
V
 
A
E
 
E
P
 
G
D
 
Q
G
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
F
 
V
G
 
A
C
 
C
A
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
L
 
A
A
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
R
 
N
E
 
D
K
 
K
I
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
N
 
K
P
 
V
R
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
G
A
 
V
E
 
E
P
 
-
A
 
A
A
 
G
C
 
G
P
 
K
S
 
G
I
 
L
T
 
E
R
 
S
G
 
G
E
 
K
Y
 
H
R
 
S
-
 
A
-
 
S
Y
 
L
D
 
N
H
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
V
A
 
G
G
 
V
L
 
L
T
 
H
P
 
G
L
 
M
L
 
L
K
 
S
M
 
Y
H
 
F
T
 
L
L
 
Q
G
 
D
M
 
E
D
 
E
F
 
G
V
 
Q
P
 
I
D
 
K
P
 
P
I
 
S
H
 
H
-
 
S
-
 
I
A
 
A
G
 
P
G
|
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
E
L
 
H
S
 
A
H
 
Y
T
 
L
V
 
K
E
 
K
L
 
I
G
 
Q
L
 
R
V
 
A
E
 
E
G
 
Y
V
 
V
A
 
T
I
 
V
S
 
T
Q
 
D
H
 
E
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
V
 
H
Q
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
|
E
S
 
S
T
 
A
H
 
H
A
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
M
A
 
K
H
 
L
V
 
A
A
 
K
D
 
E
D
 
M
P
 
S
R
 
R
E
 
D
Q
 
E
V
 
I
V
 
I
V
 
I
I
 
V
G
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
L
 
K
D
 
D
L
 
L

5ey5B Lbcats
30% identity, 80% coverage: 82:426/433 of query aligns to 49:382/383 of 5ey5B

query
sites
5ey5B
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
Y
R
 
F
A
 
A
R
 
E
R
 
N
F
 
L
E
 
T
K
 
K
A
 
D
L
 
L
N
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
A
H
 
K
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
N
P
 
H
V
 
T
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
T
 
I
N
 
N
S
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
I
 
R
D
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
K
K
 
R
L
 
V
T
 
I
T
 
A
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
W
 
H
G
 
G
S
 
V
A
 
A
L
 
T
S
 
A
F
 
T
A
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
M
F
 
F
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
C
E
 
V
V
 
V
W
 
Y
Q
 
M
V
 
G
R
 
A
A
 
E
S
 
D
Y
 
I
E
 
E
S
 
R
K
 
Q
P
 
A
Y
 
L
R
 
N
G
 
V
H
 
F
L
 
R
I
 
M
R
 
K
T
 
L
Y
 
L
G
 
G
G
 
A
T
 
K
V
 
V
H
 
R
S
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
P
D
 
V
T
 
T
T
 
S
G
 
G
S
 
S
-
 
R
-
 
T
L
 
L
G
 
K
M
 
D
A
 
A
V
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
M
E
 
R
V
 
D
A
 
W
A
 
V
A
 
T
D
 
N
P
 
V
E
 
E
-
 
D
A
 
T
R
 
F
Y
 
Y
A
 
I
L
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
 
V
N
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
-
 
M
H
 
M
V
 
V
V
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
R
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
I
A
 
L
L
 
E
V
 
K
E
 
E
P
 
G
D
 
R
G
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
A
V
 
I
F
 
V
G
 
A
C
 
C
A
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
L
 
A
A
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
F
F
 
H
P
 
P
F
 
F
L
 
I
R
 
D
E
 
D
K
 
E
I
 
S
-
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
H
 
K
G
 
G
R
 
I
S
 
E
N
 
T
P
 
G
R
 
K
I
 
H
V
 
A
A
 
A
A
 
T
E
 
L
P
 
S
A
 
A
A
 
G
C
 
R
P
 
P
S
 
G
I
 
V
T
 
L
R
 
H
G
 
G
E
 
A
Y
 
M
R
 
T
Y
 
Y
D
 
L
H
 
L
G
 
Q
D
 
D
V
 
E
A
 
D
G
 
G
L
 
-
T
 
-
P
 
Q
L
 
I
L
 
I
K
 
E
M
 
A
H
 
H
T
 
S
L
 
I
G
 
-
M
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
-
H
 
-
A
 
S
G
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
E
L
 
H
S
 
A
H
 
Y
T
 
L
V
 
K
E
 
D
L
 
T
G
 
G
L
 
R
V
 
A
E
 
E
G
 
Y
V
 
V
A
 
S
I
 
V
S
 
T
Q
 
D
H
 
D
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
E
A
 
A
G
 
F
V
 
Q
Q
 
L
F
 
L
A
 
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
|
E
S
 
S
T
 
S
H
 
H
A
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
M
A
 
K
H
 
L
V
 
A
A
 
P
D
 
E
D
 
L
P
 
S
R
 
K
E
 
D
Q
 
Q
V
 
I
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
L
 
K
D
 
D
L
 
V
P
 
N
A
 
T
Y
 
V
A
 
A

5kzmB Crystal structure of tryptophan synthase alpha-beta chain complex from francisella tularensis (see paper)
30% identity, 83% coverage: 63:422/433 of query aligns to 36:383/395 of 5kzmB

query
sites
5kzmB
A
 
A
S
 
D
E
 
E
T
 
S
Y
 
F
I
 
K
E
 
Q
I
 
E
P
 
F
Q
 
K
E
 
E
V
 
L
R
 
L
E
 
Q
I
 
E
Y
 
Y
A
 
A
M
 
-
W
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
A
L
 
L
I
 
T
R
 
K
A
 
T
R
 
R
R
 
N
F
 
I
E
 
V
K
 
K
A
 
-
L
 
-
N
 
N
T
 
T
G
 
R
A
 
T
H
 
K
I
 
L
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
L
P
 
H
V
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
K
|
K
T
 
T
N
 
N
S
 
Q
A
 
V
V
 
L
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
I
 
R
D
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
K
K
 
E
L
 
I
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
W
 
H
G
 
G
S
 
V
A
 
A
L
 
T
S
 
A
F
 
L
A
 
A
G
 
C
A
 
A
Q
 
L
F
 
L
G
 
D
L
 
L
E
 
K
V
 
C
E
 
R
V
 
V
W
 
Y
Q
 
M
V
 
G
R
 
A
A
 
K
S
 
D
Y
 
V
E
 
E
S
 
R
K
 
Q
P
 
S
-
 
P
-
 
N
-
 
V
Y
 
F
R
 
R
G
 
M
H
 
K
L
 
L
I
 
M
R
 
G
T
 
A
Y
 
E
G
 
V
G
 
I
T
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
S
S
 
G
P
 
S
S
 
A
T
 
T
L
 
L
T
 
K
E
 
D
A
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
A
V
 
C
S
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
R
V
 
D
A
 
W
A
 
S
A
 
A
D
 
N
-
 
Y
P
 
S
E
 
K
A
 
A
R
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
T
V
 
A
L
 
A
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
F
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
V
 
R
L
 
E
H
 
F
Q
 
Q
T
 
R
V
 
M
I
 
I
G
 
G
Q
 
E
E
 
E
A
 
T
V
 
K
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
M
A
 
L
L
 
A
V
 
K
E
 
E
P
 
G
D
 
R
G
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
A
V
 
V
F
 
I
G
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
A
 
I
G
 
G
L
 
M
S
 
F
F
 
A
P
 
D
F
 
F
L
 
I
R
 
D
E
 
E
K
 
K
I
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
N
 
N
P
 
V
R
 
K
I
 
L
V
 
I
A
 
G
A
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
A
A
 
G
C
 
-
P
 
K
S
 
G
I
 
I
T
 
E
R
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
H
R
 
G
-
 
A
-
 
P
Y
 
L
D
 
K
H
 
H
G
 
G
D
 
K
V
 
T
A
 
G
-
 
I
-
 
F
-
 
F
G
 
G
L
 
M
T
 
K
P
 
A
L
 
P
L
 
L
K
 
M
M
 
Q
H
 
N
T
 
S
L
 
D
G
 
G
M
 
Q
D
 
I
F
 
E
V
x
E
P
x
S
D
 
Y
P
 
S
I
 
I
H
 
S
A
 
A
G
 
-
G
 
G
L
 
L
R
x
D
Y
 
F
H
 
P
G
 
S
M
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
Q
L
 
H
S
 
A
H
 
H
T
 
L
V
 
L
E
 
A
L
 
I
G
 
G
L
 
R
V
 
A
E
 
K
G
 
Y
V
 
A
A
 
S
I
 
A
S
 
T
Q
 
D
H
 
D
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
D
A
 
A
G
 
F
V
 
K
Q
 
L
F
 
L
A
 
C
R
 
K
T
 
K
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
 
E
S
 
S
T
 
S
H
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
K
H
 
L
V
 
A
A
 
Y
D
 
E
D
 
D
P
 
P
-
 
N
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
V
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
L
 
K
D
 
D
L
 
I

6v82B Crystal structure of tryptophan synthase from chlamydia trachomatis d/uw-3/cx (see paper)
29% identity, 79% coverage: 82:423/433 of query aligns to 50:380/391 of 6v82B

query
sites
6v82B
R
 
R
P
 
Q
S
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
T
R
 
E
A
 
V
R
 
K
R
 
N
F
 
F
E
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
I
N
 
D
T
 
-
G
 
G
A
 
P
H
 
R
I
 
V
Y
 
F
V
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
L
P
 
H
V
 
T
G
 
G
S
 
A
H
 
H
K
 
K
T
 
L
N
 
N
S
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
G
Q
 
Q
A
 
C
Y
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
I
 
Y
D
 
L
G
 
G
V
 
K
R
 
T
K
x
R
L
 
V
T
 
V
T
 
A
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
W
 
H
G
 
G
S
 
V
A
 
A
L
 
T
S
 
A
F
 
T
A
 
A
G
 
C
A
 
A
Q
 
Y
F
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
D
V
 
C
E
 
V
V
 
V
W
x
Y
Q
 
M
V
 
G
R
 
A
A
 
K
S
 
D
Y
 
V
E
 
E
S
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
P
R
 
N
G
 
V
H
 
E
L
 
K
I
 
M
R
 
R
T
 
F
Y
 
L
G
 
G
G
 
A
T
x
E
V
 
V
H
x
V
S
 
S
S
 
V
P
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
T
T
 
K
G
 
G
S
 
S
L
 
C
G
 
G
M
 
L
-
 
K
-
 
D
A
 
A
V
 
V
S
 
N
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
E
 
Q
-
x
D
V
 
W
A
 
A
A
 
T
A
 
T
D
 
H
P
 
S
E
 
F
A
 
T
R
 
H
Y
 
Y
A
 
C
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
A
L
 
L
-
 
G
-
 
P
-
 
L
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
D
H
 
I
V
 
V
V
 
R
L
 
F
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
S
Q
 
A
E
 
E
A
 
V
V
 
K
A
 
E
Q
 
Q
L
 
I
A
 
H
L
 
A
V
 
V
E
 
A
P
 
G
D
 
R
G
 
D
A
 
P
D
 
D
V
 
I
V
 
L
F
 
I
G
 
A
C
 
C
A
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
A
 
I
G
 
G
L
 
F
S
 
F
F
 
H
P
 
H
F
 
F
L
 
I
-
 
P
R
 
N
E
 
P
K
 
K
I
 
V
H
 
Q
-
 
L
-
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
L
G
 
G
R
 
I
S
 
S
N
 
S
P
 
G
R
 
K
I
x
H
V
 
A
A
 
A
A
 
R
E
 
F
P
 
A
A
x
T
A
 
G
C
 
R
P
 
P
S
 
G
I
 
V
T
 
F
R
 
H
G
 
G
E
 
F
Y
 
Y
R
 
S
Y
 
Y
D
 
L
H
 
L
G
x
Q
D
|
D
V
 
D
A
 
D
G
 
G
L
 
-
T
 
-
P
 
Q
L
 
V
L
|
L
K
 
Q
M
 
T
H
 
H
T
 
S
L
 
I
G
 
-
M
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
-
H
 
-
A
 
S
G
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
S
M
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
D
L
 
H
S
 
A
H
 
E
T
 
M
V
 
H
E
 
E
L
 
S
G
 
G
L
 
R
V
 
A
E
 
F
G
 
Y
V
 
T
A
 
L
I
 
A
S
 
T
Q
 
D
H
 
E
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
R
A
 
A
G
 
F
V
 
F
Q
 
L
F
 
L
A
 
T
R
 
R
T
 
N
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
 
E
S
 
S
T
 
S
H
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
H
A
 
L
A
 
V
A
 
S
H
 
I
V
 
A
A
 
P
D
 
S
D
 
L
P
 
P
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
V
 
I
V
 
V
V
 
I
I
 
V
G
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
L
 
K
D
 
D
L
 
L
P
 
P

6ducB Crystal structure of mutant beta-k167t tryptophan synthase in complex with inhibitor n-(4'-trifluoromethoxybenzenesulfonyl)-2-amino-1- ethylphosphate (f9f) at the alpha-site, cesium ion at the metal coordination site, and 2-aminophenol quinonoid (1d0) at the beta-site
29% identity, 79% coverage: 82:422/433 of query aligns to 54:383/395 of 6ducB

query
sites
6ducB
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
A
L
 
L
I
 
T
R
 
K
A
 
C
R
 
Q
R
 
N
F
 
I
E
 
T
K
 
A
A
 
G
L
 
T
N
 
R
T
 
T
G
 
-
A
 
-
H
 
T
I
 
L
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
L
P
 
H
V
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
T
 
T
N
 
N
S
 
Q
A
 
V
V
 
L
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
I
 
R
D
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
S
K
 
E
L
 
I
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
A
 
A
L
 
S
S
 
A
F
 
L
A
 
A
G
 
S
A
 
A
Q
 
L
F
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
K
V
 
C
E
 
R
V
 
I
W
 
Y
Q
 
M
V
 
G
R
 
A
A
 
K
S
 
D
Y
 
V
E
 
E
S
 
R
K
 
Q
P
 
S
Y
 
P
R
 
N
G
 
V
H
 
F
L
 
R
I
 
M
R
 
R
T
 
L
Y
 
M
G
 
G
G
 
A
T
 
E
-
 
V
-
 
I
-
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
S
S
 
G
P
 
S
S
 
A
T
 
T
L
|
L
T
 
T
E
 
D
A
 
A
G
 
C
R
 
N
A
 
E
I
 
A
L
 
L
A
 
R
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
D
T
 
W
T
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
Y
G
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
E
E
 
T
A
 
A
R
 
H
Y
 
Y
A
 
M
L
 
L
G
 
G
S
x
T
V
 
A
L
 
A
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
V
 
R
L
 
E
H
 
F
Q
 
Q
T
 
R
V
 
M
I
 
I
G
 
G
Q
 
E
E
 
E
A
 
T
V
 
K
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
A
 
L
L
 
D
V
 
K
E
 
E
P
 
G
D
 
R
G
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
A
V
 
V
F
 
I
G
 
A
C
 
C
A
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
L
 
A
A
 
I
G
 
G
L
 
M
S
 
F
F
 
A
P
 
D
F
 
F
L
 
I
R
 
N
E
 
D
K
 
T
I
 
S
H
 
V
G
 
G
R
 
-
S
 
-
N
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
L
V
 
I
A
 
G
A
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
G
A
 
G
C
 
-
P
 
H
S
 
G
I
 
I
T
 
E
R
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
H
R
 
G
-
 
A
-
 
P
Y
 
L
D
 
K
H
 
H
G
 
G
D
 
R
V
 
V
A
 
-
G
 
G
L
 
I
T
 
Y
P
 
F
L
 
G
L
 
M
K
 
K
-
 
A
-
 
P
-
 
M
M
 
M
H
 
Q
T
 
T
L
 
A
G
 
D
M
 
G
D
 
Q
F
 
I
V
 
E
P
 
E
D
 
S
P
 
Y
I
 
S
H
 
I
A
 
S
G
 
A
G
|
G
L
 
L
R
 
D
Y
x
F
H
 
P
G
 
S
M
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
Q
L
 
H
S
 
A
H
 
Y
T
 
L
V
 
N
E
 
S
L
 
I
G
 
G
L
 
R
V
 
A
E
 
D
G
 
Y
V
 
V
A
 
S
I
 
I
S
 
T
Q
 
D
H
 
D
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
E
A
 
A
G
 
F
V
 
K
Q
 
T
F
 
L
A
 
C
R
 
R
T
 
H
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
|
E
S
 
S
T
 
S
H
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
K
H
 
M
V
 
M
A
 
R
D
 
E
D
 
Q
P
 
P
-
 
E
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
V
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
L
 
K
D
 
D
L
 
I

Sites not aligning to the query:

P0A879 Tryptophan synthase beta chain; EC 4.2.1.20 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
29% identity, 79% coverage: 82:422/433 of query aligns to 55:384/397 of P0A879

query
sites
P0A879
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
A
L
 
L
I
 
T
R
 
K
A
x
C
R
 
Q
R
 
N
F
 
I
E
 
T
K
 
A
A
 
G
L
 
T
N
 
N
T
 
T
G
 
-
A
 
-
H
 
T
I
 
L
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
L
P
 
H
V
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
K
 
K
T
 
T
N
 
N
S
 
Q
A
 
V
V
 
L
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
I
 
R
D
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
K
 
E
L
 
I
T
 
I
T
 
A
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
W
 
H
G
 
G
S
 
V
A
 
A
L
 
S
S
 
A
F
 
L
A
 
A
G
 
S
A
 
A
Q
 
L
F
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
K
V
 
C
E
 
R
V
 
I
W
 
Y
Q
 
M
V
 
G
R
 
A
A
 
K
S
 
D
Y
 
V
E
 
E
S
 
R
K
 
Q
P
 
S
Y
 
P
R
 
N
G
 
V
H
 
F
L
 
R
I
 
M
R
 
R
T
 
L
Y
 
M
G
 
G
G
 
A
T
 
E
-
 
V
-
 
I
-
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
S
S
 
G
P
 
S
S
 
A
T
 
T
L
 
L
T
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
C
R
 
N
A
 
E
I
 
A
L
 
L
A
 
R
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
D
T
 
W
T
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
Y
G
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
E
E
 
T
A
 
A
R
 
H
Y
 
Y
A
 
M
L
 
L
G
 
G
S
 
T
V
 
A
L
 
A
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
V
 
R
L
 
E
H
 
F
Q
 
Q
T
 
R
V
 
M
I
 
I
G
 
G
Q
 
E
E
 
E
A
 
T
V
 
K
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
A
 
L
L
 
E
V
 
R
E
 
E
P
 
G
D
 
R
G
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
A
V
 
V
F
 
I
G
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
A
 
I
G
 
G
L
 
M
S
 
F
F
 
A
P
 
D
F
 
F
L
 
I
R
 
N
E
 
E
K
 
-
I
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
T
N
 
N
P
 
V
R
 
G
I
 
L
V
 
I
A
 
G
A
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
G
A
 
G
C
 
-
P
 
H
S
 
G
I
 
I
T
 
E
R
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
H
R
 
G
-
 
A
-
 
P
Y
 
L
D
 
K
H
 
H
G
 
G
D
 
R
V
 
V
A
 
-
G
 
G
L
 
I
T
 
Y
P
 
F
L
 
G
L
 
M
K
 
K
-
 
A
-
 
P
-
 
M
M
 
M
H
 
Q
T
 
T
L
 
E
G
 
D
M
 
G
D
 
Q
F
 
I
V
 
E
P
 
E
D
 
S
P
 
Y
I
 
S
H
 
I
A
 
S
G
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
F
H
 
P
G
 
S
M
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
Q
L
 
H
S
 
A
H
 
Y
T
 
L
V
 
N
E
 
S
L
 
T
G
 
G
L
 
R
V
 
A
E
 
D
G
 
Y
V
 
V
A
 
S
I
 
I
S
 
T
Q
 
D
H
 
D
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
E
A
 
A
G
 
F
V
 
K
Q
 
T
F
 
L
A
 
C
R
 
L
T
 
H
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
 
E
S
 
S
T
 
S
H
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
K
H
 
M
V
 
M
A
 
R
D
 
E
D
 
N
P
 
P
-
 
D
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
V
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
L
 
K
D
 
D
L
 
I

Sites not aligning to the query:

6xt0B Salmonella typhimurium tryptophan synthase complexed with dioxindolyl- l-alanine and d-glycerol-3-phosphate (see paper)
29% identity, 79% coverage: 82:422/433 of query aligns to 54:383/396 of 6xt0B

query
sites
6xt0B
R
 
R
P
 
P
S
 
T
P
 
A
L
 
L
I
 
T
R
 
K
A
 
C
R
 
Q
R
 
N
F
 
I
E
 
T
K
 
A
A
 
G
L
 
T
N
 
R
T
 
T
G
 
-
A
 
-
H
 
T
I
 
L
Y
 
Y
V
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
L
P
 
H
V
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
T
 
T
N
 
N
S
 
Q
A
 
V
V
 
L
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
I
 
R
D
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
S
K
 
E
L
 
I
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
A
 
A
L
 
S
S
 
A
F
 
L
A
 
A
G
 
S
A
 
A
Q
 
L
F
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
K
V
 
C
E
 
R
V
 
I
W
 
Y
Q
 
M
V
 
G
R
 
A
A
 
K
S
 
D
Y
 
V
E
 
E
S
 
R
K
 
Q
P
 
S
Y
 
P
R
 
N
G
 
V
H
 
F
L
 
R
I
 
M
R
 
R
T
 
L
Y
 
M
G
 
G
G
 
A
T
 
E
-
 
V
-
 
I
-
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
S
S
 
G
P
 
S
S
 
A
T
 
T
L
|
L
T
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
C
R
 
N
A
 
E
I
 
A
L
 
L
A
 
R
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
D
T
 
W
T
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
Y
G
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
E
E
 
T
A
 
A
R
 
H
Y
 
Y
A
 
M
L
 
L
G
|
G
S
x
T
V
 
A
L
 
A
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
V
 
R
L
 
E
H
 
F
Q
 
Q
T
 
R
V
 
M
I
 
I
G
 
G
Q
 
E
E
 
E
A
 
T
V
 
K
A
 
A
Q
 
Q
L
 
I
A
 
L
L
 
D
V
 
K
E
 
E
P
 
G
D
 
R
G
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
A
V
 
V
F
 
I
G
 
A
C
 
C
A
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
L
 
A
A
 
I
G
 
G
L
 
M
S
 
F
F
 
A
P
 
D
F
 
F
L
 
I
R
 
N
E
 
D
K
 
T
I
 
S
H
 
V
G
 
G
R
 
-
S
 
-
N
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
L
V
 
I
A
 
G
A
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
G
A
 
G
C
 
-
P
 
H
S
 
G
I
 
I
T
 
E
R
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
H
R
 
G
-
 
A
-
x
P
Y
 
L
D
 
K
H
 
H
G
 
G
D
 
R
V
 
V
A
 
-
G
 
G
L
 
I
T
 
Y
P
 
F
L
 
G
L
 
M
K
 
K
-
 
A
-
 
P
-
 
M
M
 
M
H
 
Q
T
 
T
L
 
A
G
 
D
M
 
G
D
 
Q
F
 
I
V
 
E
P
 
E
D
 
S
P
 
Y
I
 
S
H
 
I
A
 
S
G
 
A
G
|
G
L
 
L
R
 
D
Y
x
F
H
 
P
G
x
S
M
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
Q
L
 
H
S
 
A
H
 
Y
T
 
L
V
 
N
E
 
S
L
 
I
G
 
G
L
 
R
V
 
A
E
 
D
G
 
Y
V
 
V
A
 
S
I
 
I
S
 
T
Q
 
D
H
 
D
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
E
A
 
A
G
 
F
V
 
K
Q
 
T
F
 
L
A
 
C
R
 
R
T
 
H
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
|
E
S
 
S
T
 
S
H
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
K
H
 
M
V
 
M
A
 
R
D
 
E
D
 
Q
P
 
P
-
 
E
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
V
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
H
 
R
G
 
G
Q
 
D
L
 
K
D
 
D
L
 
I

Query Sequence

>WP_011780137.1 NCBI__GCF_000015305.1:WP_011780137.1
MTEQLDATHPDLVTVKVPTHWYNLAAELDEPIPPHLHPGTREPVGPDDLAPLFASALIAQ
EVASETYIEIPQEVREIYAMWRPSPLIRARRFEKALNTGAHIYVKYEGVSPVGSHKTNSA
VAQAYYNHIDGVRKLTTETGAGQWGSALSFAGAQFGLEVEVWQVRASYESKPYRGHLIRT
YGGTVHSSPSTLTEAGRAILAKDPDTTGSLGMAVSEAVEVAAADPEARYALGSVLNHVVL
HQTVIGQEAVAQLALVEPDGADVVFGCAGGGSNLAGLSFPFLREKIHGRSNPRIVAAEPA
ACPSITRGEYRYDHGDVAGLTPLLKMHTLGMDFVPDPIHAGGLRYHGMAPALSHTVELGL
VEGVAISQHDAFAAGVQFARTQGIVPAPESTHAIAAAAAHVADDPREQVVVIGLSGHGQL
DLPAYAEYLDGKF

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory