SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011780353.1 NCBI__GCF_000015305.1:WP_011780353.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q5SHH5 [LysW]-aminoadipate semialdehyde transaminase; EC 2.6.1.118 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8)
40% identity, 94% coverage: 19:403/408 of query aligns to 17:394/395 of Q5SHH5

query
sites
Q5SHH5
R
 
K
H
 
T
L
 
L
S
 
D
Q
 
S
T
 
G
V
 
V
P
 
Y
G
 
N
R
 
K
K
 
H
E
 
D
F
 
L
V
 
L
V
 
I
A
 
V
E
 
R
A
 
G
R
 
Q
G
 
G
C
 
A
T
 
R
V
 
V
T
 
W
T
 
D
A
 
A
D
 
E
G
 
G
R
 
N
S
 
E
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
M
 
C
T
 
V
S
 
G
G
 
G
I
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
A
N
 
N
V
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
G
H
 
N
P
 
P
R
 
E
V
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
V
Q
 
K
A
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
E
R
 
T
Y
 
L
A
 
-
H
 
-
V
 
M
N
 
A
V
 
M
Y
 
P
G
 
Q
R
 
T
F
 
L
V
 
P
V
 
T
P
 
P
E
 
M
Q
 
R
V
 
G
E
 
E
L
 
F
V
 
Y
E
 
R
R
 
T
L
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
I
A
 
L
G
 
P
A
 
P
G
 
E
F
 
L
D
 
N
M
 
R
A
 
V
Y
 
F
L
 
P
T
 
V
S
 
N
S
 
S
G
|
G
A
x
T
E
 
E
S
 
A
T
 
N
E
 
E
C
 
A
A
 
A
M
 
L
K
 
K
L
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
A
H
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
K
K
 
K
F
 
F
V
 
V
A
 
A
F
 
A
E
 
M
R
 
R
A
 
G
Y
 
F
H
 
S
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
M
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
V
S
 
T
W
 
W
R
 
E
E
 
P
E
 
K
W
 
Y
R
 
R
A
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
V
D
 
E
E
 
P
V
 
V
M
 
E
F
 
F
V
 
I
P
 
P
Y
 
Y
D
 
N
S
 
D
L
 
V
T
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
K
A
 
R
A
 
A
V
 
V
D
 
D
D
 
E
R
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
 
E
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
P
P
 
A
S
 
T
D
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
L
P
 
R
G
 
A
L
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
I
C
 
T
D
 
Q
A
 
E
T
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
I
Q
 
Q
G
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
R
 
R
S
 
T
G
 
G
R
 
K
W
 
R
F
 
F
A
 
A
H
 
F
Q
 
E
H
 
H
T
 
F
D
 
G
V
 
I
R
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
L
T
 
T
M
 
L
A
 
A
K
|
K
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
A
L
 
V
A
 
M
S
 
R
A
 
E
E
 
E
L
 
V
F
 
A
A
 
R
T
 
S
F
 
M
V
 
-
D
 
-
P
 
P
P
 
K
L
 
G
S
 
G
H
 
H
L
 
G
T
 
T
T
|
T
M
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
L
A
 
A
C
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
I
D
 
R
V
 
Y
I
 
L
A
 
E
D
 
R
G
 
T
-
 
R
L
 
L
L
 
W
D
 
E
R
 
R
V
 
A
V
 
A
E
 
E
A
 
L
G
 
G
E
 
P
Y
 
W
L
 
F
R
 
M
T
 
E
G
 
K
L
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
I
C
 
P
D
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
S
G
 
P
L
 
K
L
 
I
V
 
R
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
M
G
 
G
L
 
L
W
 
M
C
 
V
A
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
K
V
 
E
D
 
K
A
 
A
N
 
A
P
 
P
V
 
Y
V
 
I
A
 
A
R
 
R
M
 
L
Q
 
E
Q
 
K
-
 
E
-
 
H
-
 
R
-
 
V
L
 
L
G
 
A
V
 
L
L
 
Q
V
 
A
G
 
G
S
 
P
V
 
T
L
 
V
N
 
-
Q
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
I
R
 
R
I
 
F
M
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
I
S
 
E
D
 
K
A
 
E
E
 
D
I
 
L
D
 
E
T
 
R
F
 
V
V
 
V
G
 
E
V
 
A
L
 
V
R
 
R
T
 
A
V
 
V
L
 
L

1wkhA Acetylornithine aminotransferase from thermus thermophilus hb8
39% identity, 94% coverage: 19:403/408 of query aligns to 9:386/387 of 1wkhA

query
sites
1wkhA
R
 
K
H
 
T
L
 
L
S
 
D
Q
x
S
T
 
G
V
 
V
P
 
Y
G
 
N
R
 
K
K
 
H
E
 
D
F
 
L
V
 
L
V
 
I
A
 
V
E
 
R
A
 
G
R
 
Q
G
 
G
C
 
A
T
 
R
V
 
V
T
 
W
T
 
D
A
 
A
D
 
E
G
 
G
R
 
N
S
 
E
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
M
 
C
T
 
V
S
 
G
G
 
G
I
x
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
A
N
 
N
V
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
G
H
 
N
P
 
P
R
 
E
V
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
V
Q
 
K
A
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
E
R
 
T
Y
 
L
A
 
-
H
 
-
V
 
M
N
 
A
V
 
M
Y
 
P
G
 
Q
R
 
T
F
 
L
V
 
P
V
 
T
P
 
P
E
 
M
Q
 
R
V
 
G
E
 
E
L
 
F
V
 
Y
E
 
R
R
 
T
L
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
I
A
 
L
G
 
P
A
 
P
G
 
E
F
 
L
D
 
N
M
 
R
A
 
V
Y
 
F
L
 
P
T
 
V
S
 
N
S
|
S
G
|
G
A
x
T
E
 
E
S
 
A
T
 
N
E
 
E
C
 
A
A
 
A
M
 
L
K
 
K
L
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
A
H
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
K
K
 
K
F
 
F
V
 
V
A
 
A
F
 
A
E
 
M
R
 
R
A
 
G
Y
x
F
H
x
S
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
M
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
V
S
 
T
W
 
W
R
 
E
E
 
P
E
 
K
W
 
Y
R
 
R
A
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
V
D
 
E
E
 
P
V
 
V
M
 
E
F
 
F
V
 
I
P
 
P
Y
 
Y
D
 
N
S
 
D
L
 
V
T
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
K
A
 
R
A
 
A
V
 
V
D
 
D
D
 
E
R
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
|
E
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
P
P
 
A
S
 
T
D
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
L
P
 
R
G
 
A
L
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
I
C
 
T
D
 
Q
A
 
E
T
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
|
D
E
 
E
V
x
I
Q
|
Q
G
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
R
 
R
S
 
T
G
 
G
R
 
K
W
 
R
F
 
F
A
 
A
H
 
F
Q
 
E
H
 
H
T
 
F
D
 
G
V
 
I
R
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
L
T
 
T
M
 
L
A
 
A
K
|
K
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
V
V
 
A
L
 
V
A
 
M
S
 
R
A
 
E
E
 
E
L
 
V
F
 
A
A
 
R
T
 
S
F
 
M
V
 
-
D
 
-
P
 
P
P
 
K
L
 
G
S
 
G
H
 
H
L
 
G
T
 
T
T
|
T
M
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
L
A
 
A
C
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
I
D
 
R
V
 
Y
I
 
L
A
 
E
D
 
R
G
 
T
-
 
R
L
 
L
L
 
W
D
 
E
R
 
R
V
 
A
V
 
A
E
 
E
A
 
L
G
 
G
E
 
P
Y
 
W
L
 
F
R
 
M
T
 
E
G
 
K
L
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
I
C
 
P
D
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
S
G
 
P
L
 
K
L
 
I
V
 
R
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
M
G
 
G
L
 
L
W
 
M
C
 
V
A
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
K
V
 
E
D
 
K
A
 
A
N
 
A
P
 
P
V
 
Y
V
 
I
A
 
A
R
 
R
M
 
L
Q
 
E
Q
 
K
-
 
E
-
 
H
-
 
R
-
 
V
L
 
L
G
 
A
V
 
L
L
 
Q
V
 
A
G
 
G
S
 
P
V
 
T
L
 
V
N
 
-
Q
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
I
R
|
R
I
 
F
M
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
I
S
 
E
D
 
K
A
 
E
E
 
D
I
 
L
D
 
E
T
 
R
F
 
V
V
 
V
G
 
E
V
 
A
L
 
V
R
 
R
T
 
A
V
 
V
L
 
L

1wkgA Acetylornithine aminotransferase from thermus thermophilus hb8
39% identity, 94% coverage: 19:403/408 of query aligns to 9:386/387 of 1wkgA

query
sites
1wkgA
R
 
K
H
 
T
L
 
L
S
 
D
Q
x
S
T
 
G
V
 
V
P
x
Y
G
 
N
R
 
K
K
 
H
E
 
D
F
 
L
V
 
L
V
 
I
A
 
V
E
 
R
A
 
G
R
 
Q
G
 
G
C
 
A
T
 
R
V
 
V
T
 
W
T
 
D
A
 
A
D
 
E
G
 
G
R
 
N
S
 
E
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
M
 
C
T
 
V
S
 
G
G
 
G
I
x
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
A
N
 
N
V
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
G
H
 
N
P
 
P
R
 
E
V
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
V
Q
 
K
A
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
E
R
 
T
Y
 
L
A
 
-
H
 
-
V
 
M
N
 
A
V
 
M
Y
 
P
G
 
Q
R
 
T
F
 
L
V
 
P
V
 
T
P
 
P
E
 
M
Q
 
R
V
 
G
E
 
E
L
 
F
V
 
Y
E
 
R
R
 
T
L
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
I
A
 
L
G
 
P
A
 
P
G
 
E
F
 
L
D
 
N
M
 
R
A
 
V
Y
 
F
L
 
P
T
 
V
S
 
N
S
 
S
G
|
G
A
x
T
E
 
E
S
 
A
T
 
N
E
 
E
C
 
A
A
 
A
M
 
L
K
 
K
L
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
A
H
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
K
K
 
K
F
 
F
V
 
V
A
 
A
F
 
A
E
 
M
R
 
R
A
 
G
Y
x
F
H
x
S
G
 
G
R
|
R
T
 
T
L
 
M
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
V
S
 
T
W
 
W
R
 
E
E
 
P
E
 
K
W
 
Y
R
 
R
A
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
V
D
 
E
E
 
P
V
 
V
M
 
E
F
 
F
V
 
I
P
 
P
Y
 
Y
D
 
N
S
 
D
L
 
V
T
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
K
A
 
R
A
 
A
V
 
V
D
 
D
D
 
E
R
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
|
E
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
P
P
 
A
S
 
T
D
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
L
P
 
R
G
 
A
L
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
I
C
 
T
D
 
Q
A
 
E
T
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
|
D
E
 
E
V
x
I
Q
|
Q
G
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
R
 
R
S
 
T
G
 
G
R
 
K
W
 
R
F
 
F
A
 
A
H
 
F
Q
 
E
H
 
H
T
 
F
D
 
G
V
 
I
R
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
L
T
 
T
M
 
L
A
 
A
K
|
K
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
V
V
 
A
L
 
V
A
 
M
S
 
R
A
 
E
E
 
E
L
 
V
F
 
A
A
 
R
T
 
S
F
 
M
V
 
-
D
 
-
P
 
P
P
 
K
L
 
G
S
 
G
H
 
H
L
x
G
T
|
T
T
|
T
M
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
L
A
 
A
C
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
I
D
 
R
V
 
Y
I
 
L
A
 
E
D
 
R
G
 
T
-
 
R
L
 
L
L
 
W
D
 
E
R
 
R
V
 
A
V
 
A
E
 
E
A
 
L
G
 
G
E
 
P
Y
 
W
L
 
F
R
 
M
T
 
E
G
 
K
L
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
I
C
 
P
D
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
S
G
 
P
L
 
K
L
 
I
V
 
R
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
M
G
 
G
L
 
L
W
 
M
C
 
V
A
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
K
V
 
E
D
 
K
A
 
A
N
 
A
P
 
P
V
 
Y
V
 
I
A
 
A
R
 
R
M
 
L
Q
 
E
Q
 
K
-
 
E
-
 
H
-
 
R
-
 
V
L
 
L
G
 
A
V
 
L
L
 
Q
V
 
A
G
 
G
S
 
P
V
 
T
L
 
V
N
 
-
Q
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
I
R
|
R
I
 
F
M
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
I
S
 
E
D
 
K
A
 
E
E
 
D
I
 
L
D
 
E
T
 
R
F
 
V
V
 
V
G
 
E
V
 
A
L
 
V
R
 
R
T
 
A
V
 
V
L
 
L

1vefA Acetylornithine aminotransferase from thermus thermophilus hb8
39% identity, 94% coverage: 19:403/408 of query aligns to 9:386/387 of 1vefA

query
sites
1vefA
R
 
K
H
 
T
L
 
L
S
 
D
Q
x
S
T
 
G
V
 
V
P
 
Y
G
 
N
R
 
K
K
 
H
E
 
D
F
 
L
V
 
L
V
 
I
A
 
V
E
 
R
A
 
G
R
 
Q
G
 
G
C
 
A
T
 
R
V
 
V
T
 
W
T
 
D
A
 
A
D
 
E
G
 
G
R
 
N
S
 
E
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
M
 
C
T
 
V
S
 
G
G
 
G
I
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
A
N
 
N
V
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
G
H
 
N
P
 
P
R
 
E
V
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
V
Q
 
K
A
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
E
R
 
T
Y
 
L
A
 
-
H
 
-
V
 
M
N
 
A
V
 
M
Y
 
P
G
 
Q
R
 
T
F
 
L
V
 
P
V
 
T
P
 
P
E
 
M
Q
 
R
V
 
G
E
 
E
L
 
F
V
 
Y
E
 
R
R
 
T
L
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
I
A
 
L
G
 
P
A
 
P
G
 
E
F
 
L
D
 
N
M
 
R
A
 
V
Y
 
F
L
 
P
T
 
V
S
 
N
S
 
S
G
|
G
A
x
T
E
 
E
S
 
A
T
 
N
E
 
E
C
 
A
A
 
A
M
 
L
K
 
K
L
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
A
H
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
K
K
 
K
F
 
F
V
 
V
A
 
A
F
 
A
E
 
M
R
 
R
A
 
G
Y
x
F
H
x
S
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
M
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
V
S
 
T
W
 
W
R
 
E
E
 
P
E
 
K
W
 
Y
R
 
R
A
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
V
D
 
E
E
 
P
V
 
V
M
 
E
F
 
F
V
 
I
P
 
P
Y
 
Y
D
 
N
S
 
D
L
 
V
T
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
K
A
 
R
A
 
A
V
 
V
D
 
D
D
 
E
R
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
|
E
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
P
P
 
A
S
 
T
D
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
L
P
 
R
G
 
A
L
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
I
C
 
T
D
 
Q
A
 
E
T
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
|
D
E
 
E
V
x
I
Q
 
Q
G
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
R
 
R
S
 
T
G
 
G
R
 
K
W
 
R
F
 
F
A
 
A
H
 
F
Q
 
E
H
 
H
T
 
F
D
 
G
V
 
I
R
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
L
T
 
T
M
 
L
A
 
A
K
|
K
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
V
V
 
A
L
 
V
A
 
M
S
 
R
A
 
E
E
 
E
L
 
V
F
 
A
A
 
R
T
 
S
F
 
M
V
 
-
D
 
-
P
 
P
P
 
K
L
 
G
S
 
G
H
 
H
L
 
G
T
 
T
T
|
T
M
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
L
A
 
A
C
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
I
D
 
R
V
 
Y
I
 
L
A
 
E
D
 
R
G
 
T
-
 
R
L
 
L
L
 
W
D
 
E
R
 
R
V
 
A
V
 
A
E
 
E
A
 
L
G
 
G
E
 
P
Y
 
W
L
 
F
R
 
M
T
 
E
G
 
K
L
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
I
C
 
P
D
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
S
G
 
P
L
 
K
L
 
I
V
 
R
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
M
G
 
G
L
 
L
W
 
M
C
 
V
A
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
K
V
 
E
D
 
K
A
 
A
N
 
A
P
 
P
V
 
Y
V
 
I
A
 
A
R
 
R
M
 
L
Q
 
E
Q
 
K
-
 
E
-
 
H
-
 
R
-
 
V
L
 
L
G
 
A
V
 
L
L
 
Q
V
 
A
G
 
G
S
 
P
V
 
T
L
 
V
N
 
-
Q
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
I
R
|
R
I
 
F
M
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
I
S
 
E
D
 
K
A
 
E
E
 
D
I
 
L
D
 
E
T
 
R
F
 
V
V
 
V
G
 
E
V
 
A
L
 
V
R
 
R
T
 
A
V
 
V
L
 
L

2eh6A Crystal structure of acetylornithine aminotransferase from aquifex aeolicus vf5
38% identity, 90% coverage: 37:403/408 of query aligns to 18:375/375 of 2eh6A

query
sites
2eh6A
R
 
K
G
 
G
C
 
V
T
 
Y
V
 
L
T
 
Y
T
 
D
A
 
E
D
 
E
G
 
G
R
 
K
S
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
M
 
F
T
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
N
N
 
S
V
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
A
H
 
Y
P
 
P
R
 
K
V
 
L
V
 
T
E
 
E
A
 
A
I
 
L
Q
 
K
A
 
E
Q
 
Q
A
 
V
A
 
E
R
 
K
Y
 
L
A
 
L
H
 
H
V
 
V
-
 
S
N
 
N
V
 
L
Y
 
Y
G
 
E
R
 
N
F
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
W
Q
 
Q
V
 
E
E
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
H
R
 
K
L
 
L
T
 
V
G
 
K
A
 
H
A
 
F
G
 
W
A
 
T
G
 
E
F
 
-
D
 
G
M
 
K
A
 
V
Y
 
F
L
 
F
T
 
A
S
 
N
S
 
S
G
|
G
A
x
T
E
 
E
S
 
S
T
 
V
E
 
E
C
 
A
A
 
A
M
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
K
 
K
H
 
Y
-
 
W
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
G
T
 
K
G
 
N
R
 
K
P
 
W
K
 
K
F
 
F
V
 
I
A
 
S
F
 
F
E
 
E
R
 
N
A
 
S
Y
x
F
H
|
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
Y
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
T
W
 
G
R
 
Q
E
 
P
E
 
K
W
 
F
R
 
H
A
 
K
P
 
G
F
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
L
L
 
V
D
 
P
E
 
G
V
 
F
M
 
S
F
 
Y
V
 
A
P
 
K
Y
 
L
D
 
N
S
 
D
L
 
I
T
 
D
A
 
S
A
 
V
A
 
Y
A
 
K
A
 
L
V
 
L
D
 
D
D
 
E
R
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
G
V
 
I
I
 
I
V
 
I
E
|
E
P
 
V
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
N
V
 
E
P
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
L
P
 
S
G
 
K
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
L
 
I
C
 
C
D
 
K
A
 
E
T
 
K
G
 
D
A
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
I
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
G
 
T
G
 
G
M
 
I
G
 
G
R
 
R
S
 
T
G
 
G
R
 
E
W
 
F
F
 
Y
A
 
A
H
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
T
 
F
D
 
N
V
 
L
R
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
V
I
 
I
T
 
A
M
 
L
A
 
A
K
|
K
A
 
G
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
L
A
 
A
S
 
R
A
 
E
E
 
E
L
 
V
F
 
A
A
 
Q
T
 
S
F
 
F
V
 
T
D
 
-
P
 
-
P
 
P
L
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
G
T
 
S
T
|
T
M
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
T
A
 
V
A
 
V
F
 
V
D
 
D
V
 
E
I
 
V
A
 
-
D
 
E
G
 
K
L
 
L
L
 
L
D
 
P
R
 
H
V
 
V
V
 
R
E
 
E
A
 
V
G
 
G
E
 
N
Y
 
Y
L
 
F
R
 
K
T
 
E
G
 
K
L
 
L
A
 
K
A
 
E
L
 
L
C
 
G
D
 
K
E
 
G
F
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
K
V
 
V
R
 
K
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
W
 
M
C
 
L
A
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
E
V
 
R
D
 
E
A
 
C
N
 
K
P
 
D
V
 
Y
V
 
V
A
 
L
R
 
K
M
 
A
Q
 
L
Q
 
E
L
 
K
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
I
G
 
N
S
 
C
V
 
T
L
 
A
N
 
G
Q
 
K
S
 
-
G
 
-
T
 
V
V
 
L
R
|
R
I
 
F
M
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
I
I
 
I
S
 
Q
D
 
K
A
 
E
E
 
H
I
 
I
D
 
D
T
 
R
F
 
A
V
 
I
G
 
S
V
 
V
L
 
L
R
 
R
T
 
E
V
 
I
L
 
L

O66442 Acetylornithine aminotransferase; ACOAT; EC 2.6.1.11 from Aquifex aeolicus (strain VF5)
38% identity, 90% coverage: 37:403/408 of query aligns to 19:376/376 of O66442

query
sites
O66442
R
 
K
G
 
G
C
 
V
T
 
Y
V
 
L
T
 
Y
T
 
D
A
 
E
D
 
E
G
 
G
R
 
K
S
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
M
 
F
T
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
N
N
 
S
V
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
A
H
 
Y
P
 
P
R
 
K
V
 
L
V
 
T
E
 
E
A
 
A
I
 
L
Q
 
K
A
 
E
Q
 
Q
A
 
V
A
 
E
R
 
K
Y
 
L
A
 
L
H
 
H
V
 
V
-
 
S
N
 
N
V
 
L
Y
 
Y
G
 
E
R
 
N
F
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
W
Q
 
Q
V
 
E
E
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
H
R
 
K
L
 
L
T
 
V
G
 
K
A
 
H
A
 
F
G
 
W
A
 
T
G
 
E
F
 
-
D
 
G
M
 
K
A
 
V
Y
 
F
L
 
F
T
 
A
S
 
N
S
 
S
G
|
G
A
x
T
E
 
E
S
 
S
T
 
V
E
 
E
C
 
A
A
 
A
M
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
K
 
K
H
 
Y
-
 
W
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
G
T
 
K
G
 
N
R
 
K
P
 
W
K
 
K
F
 
F
V
 
I
A
 
S
F
 
F
E
 
E
R
 
N
A
 
S
Y
 
F
H
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
Y
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
T
W
 
G
R
 
Q
E
 
P
E
 
K
W
 
F
R
 
H
A
 
K
P
 
G
F
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
L
L
 
V
D
 
P
E
 
G
V
 
F
M
 
S
F
 
Y
V
 
A
P
 
K
Y
 
L
D
 
N
S
 
D
L
 
I
T
 
D
A
 
S
A
 
V
A
 
Y
A
 
K
A
 
L
V
 
L
D
 
D
D
 
E
R
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
G
V
 
I
I
 
I
V
 
I
E
 
E
P
 
V
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
N
V
 
E
P
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
L
P
 
S
G
 
K
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
L
 
I
C
 
C
D
 
K
A
 
E
T
 
K
G
 
D
A
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
I
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
G
 
T
G
 
G
M
 
I
G
 
G
R
 
R
S
 
T
G
 
G
R
 
E
W
 
F
F
 
Y
A
 
A
H
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
T
 
F
D
 
N
V
 
L
R
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
V
I
 
I
T
 
A
M
 
L
A
 
A
K
|
K
A
 
G
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
L
A
 
A
S
 
R
A
 
E
E
 
E
L
 
V
F
 
A
A
 
Q
T
 
S
F
 
F
V
 
T
D
 
-
P
 
-
P
 
P
L
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
G
T
 
S
T
|
T
M
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
T
A
 
V
A
 
V
F
 
V
D
 
D
V
 
E
I
 
V
A
 
-
D
 
E
G
 
K
L
 
L
L
 
L
D
 
P
R
 
H
V
 
V
V
 
R
E
 
E
A
 
V
G
 
G
E
 
N
Y
 
Y
L
 
F
R
 
K
T
 
E
G
 
K
L
 
L
A
 
K
A
 
E
L
 
L
C
 
G
D
 
K
E
 
G
F
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
K
V
 
V
R
 
K
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
W
 
M
C
 
L
A
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
E
V
 
R
D
 
E
A
 
C
N
 
K
P
 
D
V
 
Y
V
 
V
A
 
L
R
 
K
M
 
A
Q
 
L
Q
 
E
L
 
K
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
I
G
 
N
S
 
C
V
 
T
L
 
A
N
 
G
Q
 
K
S
 
-
G
 
-
T
 
V
V
 
L
R
 
R
I
 
F
M
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
I
I
 
I
S
 
Q
D
 
K
A
 
E
E
 
H
I
 
I
D
 
D
T
 
R
F
 
A
V
 
I
G
 
S
V
 
V
L
 
L
R
 
R
T
 
E
V
 
I
L
 
L

8r2pD Yzwideal x16 a scaffold for cryo-em of small proteins of interest crystallizing in space group 19 (p 21 21 21)
38% identity, 89% coverage: 40:403/408 of query aligns to 68:442/507 of 8r2pD

query
sites
8r2pD
T
 
T
V
 
L
T
 
V
T
 
D
A
 
T
D
 
Q
G
 
G
R
 
Q
S
 
E
Y
 
F
L
 
I
D
 
D
M
 
C
T
 
L
S
 
G
G
 
G
I
 
F
G
 
G
V
 
I
A
 
F
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
C
 
R
H
 
N
P
 
P
R
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
S
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
A
 
N
Q
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
K
Y
 
Q
A
 
P
-
 
L
H
 
H
V
 
S
N
 
Q
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
R
 
E
F
 
L
V
 
L
V
 
D
P
 
P
E
 
L
Q
 
R
V
 
A
E
 
M
L
 
L
V
 
A
E
 
K
R
 
T
L
 
L
T
 
A
G
 
A
A
 
L
A
 
T
G
 
P
A
 
G
G
 
K
F
 
L
D
 
K
M
 
Y
A
 
S
Y
 
F
L
 
F
T
 
C
S
 
N
S
|
S
G
|
G
A
x
T
E
 
E
S
 
S
T
 
V
E
 
E
C
 
A
A
 
A
M
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
K
K
 
A
H
 
Y
T
 
Q
-
 
S
-
 
P
-
 
R
G
 
G
R
 
K
P
 
F
K
 
T
F
 
F
V
 
I
A
 
A
F
 
T
E
 
S
R
 
G
A
 
A
Y
x
F
H
|
H
G
|
G
R
 
K
T
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
T
W
 
A
R
 
K
E
 
S
E
 
T
W
 
F
R
 
R
A
 
K
P
 
P
F
 
F
E
 
M
P
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
P
E
 
G
V
 
F
M
 
R
F
 
H
V
 
V
P
 
P
Y
 
F
D
 
G
S
 
N
L
 
I
T
 
E
A
 
A
A
 
M
A
 
R
A
 
T
A
 
A
V
 
L
D
 
N
-
 
E
-
 
C
-
 
K
-
 
K
-
 
T
-
 
G
D
 
D
R
 
D
T
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
 
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
I
V
 
L
P
 
P
S
 
P
D
 
P
D
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
T
G
 
A
L
 
V
R
 
R
E
 
K
L
 
L
C
 
C
D
 
D
A
 
E
T
 
F
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
I
 
I
V
 
L
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
G
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
R
 
R
S
 
T
G
 
G
R
 
K
W
 
M
F
 
F
A
 
A
H
 
C
Q
 
E
H
 
H
T
 
E
D
 
N
V
 
V
R
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
L
T
 
C
M
 
L
A
 
A
K
|
K
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
V
L
 
M
P
 
P
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
T
L
 
I
A
 
A
S
 
T
A
 
E
E
 
E
L
 
V
F
 
F
A
 
S
T
 
V
F
 
L
V
 
F
D
 
D
P
 
N
P
 
P
L
 
F
S
 
L
H
 
H
L
 
T
T
 
T
T
 
T
M
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
T
F
 
I
D
 
N
V
 
V
I
 
L
A
 
L
D
 
E
-
 
Q
G
 
N
L
 
L
L
 
P
D
 
A
R
 
Q
V
 
A
V
 
E
E
 
Q
A
 
K
G
 
G
E
 
D
Y
 
M
L
 
L
R
 
L
T
 
D
G
 
G
L
 
F
A
 
R
A
 
Q
L
 
L
C
 
A
D
 
R
E
 
E
F
 
Y
A
 
P
G
 
D
L
 
L
L
 
V
V
 
Q
D
 
E
V
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
G
L
 
M
W
 
L
C
 
M
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
F
S
 
-
V
 
V
D
 
D
A
 
N
N
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
Y
P
 
N
V
 
F
V
 
A
A
 
S
R
 
E
M
 
M
Q
 
F
Q
 
R
L
 
Q
G
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
A
S
 
G
V
 
T
L
 
L
N
 
N
Q
 
N
S
 
A
G
 
K
T
 
T
V
 
I
R
 
R
I
 
I
M
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
T
I
 
L
S
 
T
D
 
I
A
 
E
E
 
Q
I
 
C
D
 
E
T
 
L
F
 
V
V
 
I
G
 
K
V
 
A
L
 
A
R
 
R
T
 
K
V
 
A
L
 
L

4uoxA Crystal structure of ygjg in complex with pyridoxal-5'-phosphate and putrescine (see paper)
38% identity, 89% coverage: 40:403/408 of query aligns to 69:443/453 of 4uoxA

query
sites
4uoxA
T
 
T
V
 
L
T
 
V
T
 
D
A
 
T
D
 
Q
G
 
G
R
 
Q
S
 
E
Y
 
F
L
 
I
D
 
D
M
 
C
T
 
L
S
 
G
G
 
G
I
 
F
G
 
G
V
 
I
A
 
F
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
C
 
R
H
 
N
P
 
P
R
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
S
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
A
 
N
Q
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
K
Y
 
Q
A
 
P
-
 
L
H
 
H
V
 
S
N
 
Q
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
R
 
E
F
 
L
V
 
L
V
 
D
P
 
P
E
 
L
Q
 
R
V
 
A
E
 
M
L
 
L
V
 
A
E
 
K
R
 
T
L
 
L
T
 
A
G
 
A
A
 
L
A
 
T
G
 
P
A
 
G
G
 
K
F
 
L
D
 
K
M
 
Y
A
 
S
Y
 
F
L
 
F
T
 
C
S
 
N
S
|
S
G
|
G
A
x
T
E
 
E
S
 
S
T
 
V
E
 
E
C
 
A
A
 
A
M
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
K
K
 
A
H
 
Y
T
 
Q
-
 
S
-
 
P
-
 
R
G
 
G
R
 
K
P
 
F
K
 
T
F
 
F
V
 
I
A
 
A
F
 
T
E
 
S
R
 
G
A
 
A
Y
x
F
H
|
H
G
|
G
R
 
K
T
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
T
W
 
A
R
 
K
E
 
S
E
 
T
W
 
F
R
 
R
A
 
K
P
 
P
F
 
F
E
 
M
P
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
P
E
 
G
V
 
F
M
 
R
F
 
H
V
 
V
P
 
P
Y
 
F
D
 
G
S
 
N
L
 
I
T
 
E
A
 
A
A
 
M
A
 
R
A
 
T
A
 
A
V
 
L
D
 
N
-
 
E
-
 
C
-
 
K
-
 
K
-
 
T
-
 
G
D
 
D
R
 
D
T
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
|
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
I
V
 
L
P
 
P
S
 
P
D
 
P
D
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
T
G
 
A
L
 
V
R
 
R
E
 
K
L
 
L
C
 
C
D
 
D
A
 
E
T
 
F
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
I
 
I
V
 
L
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
G
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
R
 
R
S
 
T
G
 
G
R
 
K
W
 
M
F
 
F
A
 
A
H
 
C
Q
 
E
H
 
H
T
 
E
D
 
N
V
 
V
R
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
L
T
 
C
M
 
L
A
 
A
K
|
K
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
V
L
 
M
P
 
P
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
T
L
 
I
A
 
A
S
 
T
A
 
E
E
 
E
L
 
V
F
 
F
A
 
S
T
 
V
F
 
L
V
 
F
D
 
D
P
 
N
P
 
P
L
 
F
S
 
L
H
 
H
L
 
T
T
|
T
T
|
T
M
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
T
F
 
I
D
 
N
V
 
V
I
 
L
A
 
L
D
 
E
-
 
Q
G
 
N
L
 
L
L
 
P
D
 
A
R
 
Q
V
 
A
V
 
E
E
 
Q
A
 
K
G
 
G
E
 
D
Y
 
M
L
 
L
R
 
L
T
 
D
G
 
G
L
 
F
A
 
R
A
 
Q
L
 
L
C
 
A
D
 
R
E
 
E
F
 
Y
A
 
P
G
 
D
L
 
L
L
 
V
V
 
Q
D
 
E
V
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
G
L
 
M
W
 
L
C
 
M
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
F
S
 
-
V
 
V
D
 
D
A
 
N
N
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
Y
P
 
N
V
 
F
V
 
A
A
 
S
R
 
E
M
 
M
Q
 
F
Q
 
R
L
 
Q
G
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
A
S
 
G
V
 
T
L
 
L
N
 
N
Q
 
N
S
 
A
G
 
K
T
 
T
V
 
I
R
|
R
I
 
I
M
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
T
I
 
L
S
 
T
D
 
I
A
 
E
E
 
Q
I
 
C
D
 
E
T
 
L
F
 
V
V
 
I
G
 
K
V
 
A
L
 
A
R
 
R
T
 
K
V
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

A0QYS9 Acetylornithine aminotransferase; ACOAT; EC 2.6.1.11 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
43% identity, 92% coverage: 27:403/408 of query aligns to 16:383/390 of A0QYS9

query
sites
A0QYS9
G
 
G
R
 
T
K
 
P
E
 
P
F
 
L
V
 
S
V
 
L
A
 
V
E
 
S
A
 
G
R
 
E
G
 
G
C
 
A
T
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
D
A
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
R
S
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
M
 
L
T
 
L
S
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
A
V
 
V
A
 
N
N
 
L
V
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
R
H
 
H
P
 
P
R
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
V
Q
 
T
A
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
D
R
 
T
Y
 
L
A
 
G
H
 
H
V
 
T
-
 
S
N
 
N
V
 
L
Y
 
Y
G
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
A
V
 
T
P
 
E
E
 
P
Q
 
G
V
 
I
E
 
A
L
 
L
V
 
A
E
 
E
R
 
A
L
 
L
T
 
V
G
 
G
A
 
Q
A
 
L
G
 
G
A
 
T
G
 
Q
F
 
A
D
 
R
M
 
V
A
 
-
Y
 
F
L
 
F
T
 
C
S
 
N
S
 
S
G
 
G
A
 
T
E
 
E
S
 
A
T
 
N
E
 
E
C
 
V
A
 
A
M
 
F
K
 
K
L
 
I
A
 
T
R
 
R
K
 
L
H
 
-
T
 
T
G
 
G
R
 
K
P
 
T
K
 
K
F
 
I
V
 
V
A
 
A
F
 
A
E
 
E
R
 
G
A
 
A
Y
 
F
H
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
M
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
A
V
 
L
S
 
T
W
 
G
R
 
Q
E
 
P
E
 
S
W
 
K
R
 
Q
A
 
A
P
 
P
F
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
L
L
 
P
D
 
G
E
 
N
V
 
V
M
 
M
F
 
H
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
D
 
G
S
 
D
L
 
V
T
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
D
 
D
R
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
F
V
 
L
E
 
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
M
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
V
V
 
V
P
 
P
S
 
P
D
 
A
D
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
V
G
 
A
L
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
I
C
 
T
D
 
S
A
 
K
T
 
H
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
V
V
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
G
 
T
G
 
G
M
 
V
G
 
G
R
 
R
S
 
T
G
 
G
R
 
A
W
 
F
F
 
F
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
H
 
H
T
 
D
D
 
G
V
 
I
R
 
V
P
 
P
D
 
D
I
 
V
I
 
V
T
 
T
M
 
M
A
 
A
K
 
K
A
 
G
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
C
L
 
L
A
 
A
S
 
V
A
 
G
E
 
A
L
 
T
F
 
-
A
 
G
T
 
D
F
 
L
V
 
L
D
 
T
P
 
P
P
 
G
L
 
L
S
 
-
H
 
H
L
 
G
T
 
S
T
 
T
M
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
V
A
 
C
C
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
V
F
 
L
D
 
K
V
 
T
I
 
L
-
 
A
A
 
A
D
 
E
G
 
D
L
 
L
L
 
V
D
 
A
R
 
R
V
 
A
V
 
G
E
 
V
A
 
L
G
 
G
E
x
K
Y
 
T
L
 
L
R
 
S
T
 
H
G
 
G
L
 
I
A
 
-
A
 
-
L
 
-
C
 
-
D
 
E
E
 
E
F
 
L
A
 
G
G
 
H
L
 
P
L
 
L
V
 
V
D
 
D
-
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
G
L
 
L
W
 
L
C
 
Q
A
 
G
I
 
I
E
 
V
L
 
L
S
 
T
V
 
V
-
 
P
D
 
S
A
 
A
N
 
K
P
 
A
V
 
V
V
 
E
A
 
T
R
 
A
M
 
A
Q
 
R
Q
 
D
L
 
A
G
 
G
V
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
N
S
 
A
V
 
A
L
 
A
N
 
P
Q
 
E
S
 
-
G
 
-
T
 
V
V
 
V
R
 
R
I
 
L
M
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
I
I
 
I
S
 
T
D
 
E
A
 
G
E
 
Q
I
 
I
D
 
E
T
 
A
F
 
F
V
 
I
G
 
T
V
 
A
L
 
L
R
 
P
T
 
A
V
 
V
L
 
L

P42588 Putrescine aminotransferase; PAT; PATase; Cadaverine transaminase; Diamine transaminase; Putrescine transaminase; Putrescine--2-oxoglutaric acid transaminase; Putrescine:2-OG aminotransferase; EC 2.6.1.82; EC 2.6.1.29 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
38% identity, 89% coverage: 40:403/408 of query aligns to 75:449/459 of P42588

query
sites
P42588
T
 
T
V
 
L
T
 
V
T
 
D
A
 
T
D
 
Q
G
 
G
R
 
Q
S
 
E
Y
 
F
L
 
I
D
 
D
M
 
C
T
 
L
S
 
G
G
 
G
I
 
F
G
 
G
V
 
I
A
 
F
N
 
N
V
 
V
G
 
G
H
 
H
C
 
R
H
 
N
P
 
P
R
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
S
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
A
 
N
Q
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
K
Y
 
Q
A
 
P
-
 
L
H
 
H
V
 
S
N
 
Q
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
R
 
E
F
 
L
V
 
L
V
 
D
P
 
P
E
 
L
Q
 
R
V
 
A
E
 
M
L
 
L
V
 
A
E
 
K
R
 
T
L
 
L
T
 
A
G
 
A
A
 
L
A
 
T
G
 
P
A
 
G
G
 
K
F
 
L
D
 
K
M
 
Y
A
 
S
Y
 
F
L
 
F
T
 
C
S
 
N
S
 
S
G
|
G
A
x
T
E
 
E
S
 
S
T
 
V
E
 
E
C
 
A
A
 
A
M
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
K
K
 
A
H
 
Y
T
 
Q
-
 
S
-
 
P
-
 
R
G
 
G
R
 
K
P
 
F
K
 
T
F
 
F
V
 
I
A
 
A
F
 
T
E
 
S
R
 
G
A
 
A
Y
 
F
H
 
H
G
 
G
R
 
K
T
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
T
W
 
A
R
 
K
E
 
S
E
 
T
W
 
F
R
 
R
A
 
K
P
 
P
F
 
F
E
 
M
P
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
P
E
 
G
V
 
F
M
 
R
F
 
H
V
 
V
P
 
P
Y
 
F
D
 
G
S
 
N
L
 
I
T
 
E
A
 
A
A
 
M
A
 
R
A
 
T
A
 
A
V
 
L
D
 
N
-
 
E
-
 
C
-
 
K
-
 
K
-
 
T
-
 
G
D
 
D
R
 
D
T
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
 
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
I
V
 
L
P
 
P
S
 
P
D
 
P
D
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
T
G
 
A
L
 
V
R
 
R
E
 
K
L
 
L
C
 
C
D
 
D
A
 
E
T
 
F
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
M
I
 
I
V
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
|
Q
G
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
R
 
R
S
 
T
G
 
G
R
 
K
W
 
M
F
 
F
A
 
A
H
 
C
Q
 
E
H
 
H
T
 
E
D
 
N
V
 
V
R
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
L
T
 
C
M
 
L
A
 
A
K
|
K
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
V
L
 
M
P
 
P
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
T
L
 
I
A
 
A
S
 
T
A
 
E
E
 
E
L
 
V
F
 
F
A
 
S
T
 
V
F
 
L
V
 
F
D
 
D
P
 
N
P
 
P
L
 
F
S
 
L
H
 
H
L
 
T
T
 
T
T
|
T
M
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
T
F
 
I
D
 
N
V
 
V
I
 
L
A
 
L
D
 
E
-
 
Q
G
 
N
L
 
L
L
 
P
D
 
A
R
 
Q
V
 
A
V
 
E
E
 
Q
A
 
K
G
 
G
E
 
D
Y
 
M
L
 
L
R
 
L
T
 
D
G
 
G
L
 
F
A
 
R
A
 
Q
L
 
L
C
 
A
D
 
R
E
 
E
F
 
Y
A
 
P
G
 
D
L
 
L
L
 
V
V
 
Q
D
 
E
V
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
G
L
 
M
W
 
L
C
 
M
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
F
S
 
-
V
 
V
D
 
D
A
 
N
N
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
Y
P
 
N
V
 
F
V
 
A
A
 
S
R
 
E
M
 
M
Q
 
F
Q
 
R
L
 
Q
G
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
A
S
 
G
V
 
T
L
 
L
N
 
N
Q
 
N
S
 
A
G
 
K
T
 
T
V
 
I
R
 
R
I
 
I
M
 
E
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
T
I
 
L
S
 
T
D
 
I
A
 
E
E
 
Q
I
 
C
D
 
E
T
 
L
F
 
V
V
 
I
G
 
K
V
 
A
L
 
A
R
 
R
T
 
K
V
 
A
L
 
L

Q9M8M7 Acetylornithine aminotransferase, chloroplastic/mitochondrial; ACOAT; Acetylornithine transaminase; AOTA; Protein HOPW1-1-INTERACTING 1; EC 2.6.1.11 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
39% identity, 92% coverage: 28:403/408 of query aligns to 75:453/457 of Q9M8M7

query
sites
Q9M8M7
R
 
R
K
 
A
E
 
P
F
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
S
E
 
S
A
 
G
R
 
K
G
 
G
C
 
C
T
 
K
V
 
L
T
 
F
T
 
D
A
 
P
D
 
E
G
 
G
R
 
K
S
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
M
 
C
T
 
A
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
A
V
 
V
A
 
N
N
 
A
V
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
G
H
 
D
P
 
P
R
 
D
V
 
W
V
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
V
Q
 
T
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
A
 
G
R
 
V
Y
 
L
A
 
A
H
 
H
V
 
V
-
 
S
N
 
N
V
 
V
Y
 
Y
G
 
-
R
 
-
F
 
Y
V
 
T
V
 
I
P
 
P
E
 
-
Q
 
Q
V
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
K
R
 
R
L
 
L
T
 
V
G
 
A
A
 
S
A
 
S
G
 
F
A
 
A
G
 
-
F
 
-
D
 
D
M
 
R
A
 
V
Y
 
F
L
 
F
T
 
C
S
 
N
S
 
S
G
 
G
A
 
T
E
 
E
S
 
A
T
 
N
E
 
E
C
 
A
A
 
A
M
 
I
K
 
K
L
 
F
A
 
S
R
 
R
K
 
K
H
 
F
T
 
Q
-
 
R
-
 
F
G
 
T
R
 
H
P
 
P
K
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
T
-
 
G
F
 
F
V
 
I
A
 
A
F
 
F
E
 
T
R
 
N
A
 
S
Y
 
F
H
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
A
V
 
L
S
 
T
W
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
Q
W
 
Y
R
 
R
A
 
T
P
 
P
F
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
I
L
 
M
D
 
P
E
 
G
V
 
V
M
 
T
F
 
F
V
 
L
P
 
E
Y
 
Y
D
 
G
S
 
N
L
 
I
T
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
D
A
 
L
V
 
I
D
 
R
D
 
S
-
 
G
R
 
K
T
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
F
V
 
V
E
 
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
Y
V
 
S
P
 
A
S
 
T
D
 
K
D
 
E
F
 
F
L
 
L
P
 
Q
G
 
S
L
 
L
R
 
R
E
 
S
L
 
A
C
 
C
D
 
D
A
 
A
T
 
A
G
 
G
A
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
V
V
 
F
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
G
 
C
G
 
G
M
 
L
G
 
G
R
 
R
S
 
T
G
 
G
R
 
L
W
 
M
F
 
W
A
 
A
H
 
Y
Q
 
E
H
 
A
T
 
F
D
 
G
V
 
V
R
 
T
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
M
T
 
T
M
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
P
V
 
L
G
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
V
S
 
T
A
 
E
E
 
K
L
 
V
F
 
A
A
 
E
T
 
T
F
 
I
V
 
N
D
 
Y
P
 
G
P
 
-
L
 
-
S
 
D
H
 
H
L
 
G
T
 
S
T
 
T
M
 
F
G
 
A
G
 
G
N
 
S
P
 
P
V
 
L
A
 
V
C
 
C
A
 
S
A
 
A
G
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
V
F
 
M
D
 
D
V
 
K
I
 
V
A
 
S
D
 
K
-
 
P
G
 
S
L
 
F
L
 
L
D
 
S
R
 
S
V
 
V
V
 
S
E
 
N
A
 
K
G
 
G
E
 
R
Y
 
Y
L
 
F
R
 
R
T
 
D
G
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
L
L
 
L
C
 
V
D
 
K
E
 
K
F
 
L
A
 
G
G
 
G
-
 
N
-
 
S
L
 
H
L
 
V
V
 
K
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
E
G
 
G
L
 
L
W
 
I
C
 
I
A
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
L
S
 
D
V
 
V
D
 
P
A
 
A
N
 
S
P
 
S
V
 
L
V
 
V
A
 
D
R
 
A
M
 
C
Q
 
R
Q
 
D
L
 
S
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
I
G
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
-
N
 
G
Q
 
K
S
 
G
G
 
N
T
 
V
V
 
V
R
 
R
I
 
I
M
 
V
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
I
S
 
S
D
 
E
A
 
E
E
 
E
I
 
I
D
 
E
T
 
R
F
 
A
V
 
V
G
 
E
V
 
I
L
 
M
R
 
S
T
 
Q
V
 
N
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P73133 Acetylornithine aminotransferase; ACOAT; EC 2.6.1.11 from Synechocystis sp. (strain ATCC 27184 / PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
36% identity, 92% coverage: 27:403/408 of query aligns to 40:425/429 of P73133

query
sites
P73133
G
 
G
R
 
R
K
 
F
E
 
P
F
 
I
V
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
R
A
 
G
R
 
Q
G
 
G
C
 
S
T
 
T
V
 
L
T
 
W
T
 
D
A
 
T
D
 
E
G
 
G
R
 
K
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
M
 
F
T
 
V
S
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
A
V
 
T
A
 
C
N
 
T
V
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
A
H
 
H
P
 
P
R
 
A
V
 
L
V
 
V
E
 
R
A
 
A
I
 
V
Q
 
S
A
 
D
Q
 
Q
A
 
I
A
 
Q
R
 
K
Y
 
L
A
 
H
H
 
H
V
 
V
N
 
S
V
 
-
Y
 
-
G
 
N
R
 
L
F
 
Y
V
 
Y
V
 
I
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
V
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
K
R
 
W
L
 
I
T
 
V
G
 
E
A
 
H
A
 
S
G
 
C
A
 
A
G
 
-
F
 
-
D
 
D
M
 
R
A
 
V
Y
 
F
L
 
F
T
 
C
S
 
N
S
|
S
G
|
G
A
|
A
E
 
E
S
 
A
T
 
N
E
 
E
C
 
A
A
 
A
M
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
V
R
 
R
K
 
K
H
 
Y
T
 
A
G
 
H
-
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
E
R
 
Q
P
 
P
K
 
V
F
 
I
V
 
L
A
 
T
F
 
A
E
 
K
R
 
A
A
 
S
Y
 
F
H
 
H
G
 
G
R
|
R
T
 
T
L
 
L
G
 
A
A
 
T
L
 
I
S
 
T
V
 
A
S
 
T
W
 
G
R
 
Q
E
 
P
E
 
K
W
 
Y
R
 
Q
A
 
Q
P
 
Y
F
 
F
E
 
D
P
 
P
L
 
L
L
 
V
D
 
P
E
 
G
V
 
F
M
 
D
F
 
Y
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
D
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
R
S
 
S
L
 
L
T
 
E
A
 
N
A
 
K
A
 
V
A
 
A
A
 
D
V
 
L
D
 
D
D
 
E
-
 
G
-
 
N
-
 
S
R
 
R
T
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
I
I
 
F
V
 
L
E
 
E
P
 
P
I
 
L
Q
 
Q
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
P
P
 
G
S
 
D
D
 
L
D
 
A
F
 
Y
L
 
F
P
 
K
G
 
R
L
 
V
R
 
R
E
 
E
L
 
I
C
 
C
D
 
D
A
 
Q
T
 
N
G
 
D
A
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
V
V
 
F
D
|
D
E
 
E
V
 
V
Q
|
Q
G
 
V
G
 
G
M
 
V
G
 
G
R
 
R
S
 
T
G
 
G
R
 
K
W
 
L
F
 
W
A
 
G
H
 
Y
Q
 
E
H
 
H
T
 
L
D
 
G
V
 
V
R
 
E
P
 
P
D
 
D
I
 
I
I
 
F
T
 
T
M
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
G
V
 
L
G
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
M
L
 
M
A
 
C
S
 
K
A
 
-
E
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
T
 
K
F
 
F
V
 
C
D
 
D
-
 
V
-
 
F
P
 
E
P
 
P
L
 
G
S
 
N
H
 
H
L
 
A
T
 
S
T
|
T
M
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
V
F
 
L
D
 
K
V
 
T
I
 
I
-
 
E
A
 
G
D
 
D
G
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
N
V
 
V
V
 
Q
E
 
A
A
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
Q
L
 
L
R
 
R
T
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
E
L
 
I
C
 
K
D
 
N
E
 
Q
F
 
Y
A
 
P
G
 
T
L
 
L
L
 
F
V
 
T
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
W
G
 
G
L
 
L
W
 
I
C
 
N
A
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
I
S
 
S
V
 
A
D
 
E
A
 
S
N
 
S
P
 
L
V
 
T
V
 
S
A
 
V
R
 
E
M
 
I
Q
 
V
Q
 
K
L
 
A
G
 
A
V
 
M
L
 
E
V
 
Q
G
 
G
S
 
L
V
 
L
L
 
L