SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011800647.1 NCBI__GCF_000015505.1:WP_011800647.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
42% identity, 93% coverage: 10:250/260 of query aligns to 3:251/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
F
 
M
G
 
N
L
 
L
A
 
T
G
 
D
R
 
K
V
 
T
C
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
Y
A
 
A
C
 
A
I
 
V
R
 
Q
R
 
A
F
 
F
A
 
L
R
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
Q
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
D
|
D
I
|
I
D
 
D
D
 
E
A
 
A
R
 
Q
G
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
M
A
 
V
G
 
R
E
 
K
L
 
E
G
 
N
G
 
N
-
 
D
-
 
R
-
 
L
L
 
H
Y
 
F
V
 
V
H
 
Q
C
x
T
D
 
D
V
x
I
G
 
T
D
 
D
K
 
E
A
 
A
Q
 
A
V
 
C
D
 
Q
A
 
H
L
 
A
V
 
V
A
 
E
Q
 
S
A
 
A
M
 
V
A
 
H
A
 
T
H
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
F
 
E
K
 
I
A
 
V
A
 
A
D
 
P
F
 
I
L
 
H
E
 
E
V
 
M
T
 
E
E
 
L
A
 
S
D
 
D
F
 
W
D
 
N
A
 
K
V
 
V
L
 
L
R
 
Q
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
S
 
M
F
 
F
L
 
L
V
 
M
G
 
S
Q
 
K
A
 
H
V
 
A
A
 
L
R
 
K
E
 
H
M
 
M
A
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
T
S
 
C
S
|
S
V
 
V
N
 
G
A
 
G
V
 
L
L
 
V
A
 
A
I
 
W
P
 
P
T
 
D
I
 
I
A
 
P
S
 
A
Y
|
Y
N
 
N
V
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
V
N
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
V
 
S
M
 
M
A
 
A
L
 
V
A
 
D
L
 
Y
A
 
A
D
 
K
K
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
T
x
I
I
|
I
A
 
D
T
 
T
E
 
P
L
 
L
A
 
N
A
 
E
K
 
K
A
 
S
V
 
F
L
 
L
-
 
E
-
 
N
-
 
N
-
 
E
-
 
G
T
 
T
S
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
I
K
 
K
A
 
K
R
 
E
I
 
K
M
 
A
S
 
K
R
 
V
T
 
N
P
 
P
M
 
L
K
 
L
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
K
P
 
P
S
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
N
T
 
V
V
 
M
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
L
A
 
S
S
 
S
Y
 
Y
I
 
M
T
 
T
G
 
G
E
 
S
I
 
A
V
 
I
V
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
45% identity, 92% coverage: 12:250/260 of query aligns to 8:249/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
L
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
V
C
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
|
A
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
A
C
 
T
I
 
G
R
 
R
R
 
R
F
 
L
A
 
R
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
G
D
|
D
I
|
I
D
 
D
D
 
P
A
 
T
R
 
T
G
 
G
A
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
A
G
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
E
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
V
 
V
H
 
P
C
x
V
D
|
D
V
|
V
G
 
S
D
 
E
K
 
Q
A
 
E
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
N
L
 
L
V
 
F
A
 
D
Q
 
T
A
 
A
M
 
A
A
 
S
A
 
T
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
F
 
S
K
 
P
A
 
P
A
 
E
D
 
D
F
 
D
L
 
L
E
 
-
V
 
I
T
 
E
E
 
N
A
 
T
D
 
D
F
 
L
D
 
P
A
 
A
V
 
W
L
 
Q
R
 
R
-
 
V
-
 
Q
-
 
D
I
 
I
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
S
S
 
V
F
 
Y
L
 
L
V
 
S
G
 
C
Q
 
R
A
 
A
V
 
A
A
 
L
R
 
R
E
 
H
M
 
M
A
 
V
K
 
P
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
T
S
 
A
S
|
S
V
 
F
N
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
M
A
 
G
I
 
S
P
 
A
T
 
T
I
 
S
A
x
Q
-
 
I
S
 
S
Y
|
Y
N
 
T
V
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
V
N
 
L
Q
 
A
L
 
M
T
 
S
R
 
R
V
 
E
M
 
L
A
 
G
L
 
V
A
 
Q
L
 
Y
A
 
A
D
 
R
K
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
C
P
|
P
G
 
G
T
x
P
I
x
V
A
 
N
T
 
T
E
 
P
L
 
L
A
 
L
A
 
Q
K
 
E
A
 
L
V
 
F
L
 
A
T
 
K
S
 
D
E
 
P
E
 
E
A
 
R
K
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
R
M
 
L
S
 
V
R
 
H
T
 
I
P
 
P
M
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
A
E
 
E
P
 
P
S
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
D
 
A
T
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
D
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
S
I
 
T
V
 
F
V
 
L
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
44% identity, 94% coverage: 12:256/260 of query aligns to 3:240/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
L
 
F
A
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
G
C
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
C
 
I
I
 
A
R
 
Q
R
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
V
 
V
V
 
A
V
 
L
A
 
C
D
|
D
I
x
L
D
x
R
D
 
P
A
 
-
R
 
E
G
 
G
A
 
K
A
 
E
L
 
V
A
 
A
G
 
E
E
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
A
Y
 
F
V
 
F
H
 
Q
C
x
V
D
|
D
V
x
L
G
 
E
D
 
D
K
 
E
A
 
R
Q
 
E
V
 
R
D
 
V
A
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
M
 
A
A
 
Y
A
 
A
H
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
I
|
I
F
 
A
K
 
A
A
 
P
A
 
G
D
 
S
F
 
A
L
 
L
E
 
T
V
 
V
T
 
R
E
 
L
A
 
P
D
 
E
F
 
W
D
 
R
A
 
R
V
 
V
L
 
L
R
 
E
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
A
S
 
P
F
 
M
L
 
H
V
 
L
G
 
S
Q
 
A
A
 
L
V
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
M
 
M
A
 
R
K
 
K
A
 
V
G
 
G
Q
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
V
S
 
A
S
|
S
V
 
V
N
 
Q
A
 
G
V
 
L
L
 
F
A
 
A
I
 
E
P
 
Q
T
 
E
I
x
N
A
 
A
S
 
A
Y
|
Y
N
 
N
V
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
L
N
 
V
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
V
 
S
M
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
D
L
 
L
A
 
A
D
 
P
K
 
L
G
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
T
 
A
I
|
I
A
 
A
T
|
T
E
 
E
L
x
A
A
x
V
A
 
L
K
 
E
A
 
A
V
 
I
L
 
-
T
 
-
S
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
A
K
 
R
A
 
R
R
 
D
I
 
W
M
 
E
S
 
D
R
 
L
T
 
H
P
 
A
M
 
L
K
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
K
P
 
P
S
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
E
T
 
A
V
 
V
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
A
 
K
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
A
I
 
I
V
 
L
V
 
P
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
-
M
 
M
T
 
T
L
 
A
N
 
S
Y
 
F

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
40% identity, 93% coverage: 10:251/260 of query aligns to 1:243/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
F
x
M
G
 
G
L
 
I
A
 
Q
G
 
N
R
 
R
V
 
V
C
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
A
 
A
Q
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
E
 
K
A
 
Q
C
 
T
I
 
A
R
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
N
D
|
D
I
 
I
D
 
D
D
 
A
A
 
E
R
 
K
G
 
V
A
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
V
G
 
D
E
 
E
L
 
F
G
 
S
G
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
H
-
 
R
-
 
V
L
 
L
Y
 
G
V
 
A
H
 
V
C
 
A
D
|
D
V
x
I
G
 
G
D
 
N
K
 
K
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
L
 
M
V
 
V
A
 
K
Q
 
Q
A
 
T
M
 
I
A
 
D
A
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
F
 
E
K
 
R
A
 
A
A
 
G
D
 
A
F
 
L
L
 
R
E
 
K
V
 
L
T
 
S
E
 
E
A
 
A
D
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
V
V
 
T
L
 
I
R
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
T
F
 
F
L
 
L
V
 
C
G
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
H
R
 
G
E
 
H
M
 
M
A
 
V
K
 
E
A
 
N
G
 
K
Q
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
I
S
 
A
S
 
S
V
 
-
N
 
R
A
 
A
V
 
W
L
 
L
A
 
G
I
 
G
P
 
A
T
 
G
I
 
Q
A
 
T
S
 
P
Y
|
Y
N
 
S
V
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
V
Q
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
R
V
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
G
D
 
R
K
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
L
I
 
I
A
 
H
T
 
T
E
 
P
L
 
M
A
 
W
A
 
D
K
 
E
A
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
L
S
 
P
E
 
E
E
 
K
A
 
D
K
 
Q
A
 
Q
R
 
F
I
 
L
M
 
L
S
 
S
R
 
R
T
 
Q
P
 
P
M
 
T
K
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
E
 
E
P
 
P
S
 
D
E
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
N
T
 
T
V
 
L
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
A
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
I
 
V
V
 
L
V
 
Y
A
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
R

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
40% identity, 93% coverage: 11:251/260 of query aligns to 1:242/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
G
 
G
L
 
I
A
 
Q
G
 
N
R
 
R
V
 
V
C
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
E
 
K
A
 
Q
C
 
T
I
 
A
R
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
N
D
|
D
I
|
I
D
 
D
D
 
A
A
 
E
R
 
K
G
 
V
A
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
V
G
 
D
E
 
E
L
 
F
G
 
S
G
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
H
-
 
R
-
 
V
L
 
L
Y
 
G
V
 
A
H
 
V
C
 
A
D
 
D
V
x
I
G
 
G
D
 
N
K
 
K
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
L
 
M
V
 
V
A
 
K
Q
 
Q
A
 
T
M
 
I
A
 
D
A
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
M
F
 
E
K
 
R
A
 
A
A
 
G
D
 
A
F
 
L
L
 
R
E
 
K
V
 
L
T
 
S
E
 
E
A
 
A
D
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
V
V
 
T
L
 
I
R
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
T
F
 
F
L
 
L
V
 
C
G
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
H
R
 
G
E
 
H
M
 
M
A
 
V
K
 
E
A
 
N
G
 
K
Q
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
I
S
 
A
S
|
S
V
 
-
N
 
R
A
 
A
V
 
W
L
 
L
A
 
G
I
 
G
P
 
A
T
 
G
I
 
Q
A
 
T
S
 
P
Y
|
Y
N
 
S
V
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
V
Q
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
R
V
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
G
D
 
R
K
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
L
I
|
I
A
 
H
T
 
T
E
 
P
L
 
M
A
 
W
A
 
D
K
 
E
A
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
L
S
 
P
E
 
E
E
 
K
A
 
D
K
 
Q
A
 
Q
R
 
F
I
 
L
M
 
L
S
 
S
R
 
R
T
 
Q
P
 
P
M
 
T
K
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
E
 
E
P
 
P
S
 
D
E
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
N
T
 
T
V
 
L
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
A
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
I
 
V
V
 
L
V
 
Y
A
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
R

5itvD Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
40% identity, 92% coverage: 12:250/260 of query aligns to 5:223/227 of 5itvD

query
sites
5itvD
L
 
L
A
 
T
G
 
D
R
 
K
V
 
T
C
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
Y
A
 
A
C
 
A
I
 
V
R
 
Q
R
 
A
F
 
F
A
 
L
R
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
Q
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
D
|
D
I
|
I
D
 
D
D
 
E
A
 
A
R
 
Q
G
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
M
A
 
V
G
 
R
E
 
K
L
 
E
G
 
N
G
 
N
-
 
D
-
 
R
-
 
L
L
 
H
Y
 
F
V
 
V
H
 
Q
C
x
T
D
|
D
V
x
I
G
 
T
D
 
D
K
 
E
A
 
A
Q
 
A
V
 
C
D
 
Q
A
 
H
L
 
A
V
 
V
A
 
E
Q
 
S
A
 
A
M
 
V
A
 
H
A
 
T
H
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
F
 
E
K
 
I
A
 
V
A
 
A
D
 
P
F
 
I
L
 
H
E
 
E
V
 
M
T
 
E
E
 
L
A
 
S
D
 
D
F
 
W
D
 
N
A
 
K
V
 
V
L
 
L
R
 
Q
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
S
 
M
F
 
F
L
 
L
V
 
M
G
 
S
Q
 
K
A
 
H
V
 
A
A
 
L
R
 
K
E
 
H
M
 
M
A
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
T
S
 
C
S
|
S
V
 
V
N
 
G
A
 
G
V
 
L
L
 
V
A
 
A
I
 
W
P
 
P
T
 
D
I
 
I
A
 
P
S
 
A
Y
|
Y
N
 
N
V
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
V
N
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
V
 
S
M
 
M
A
 
A
L
 
V
A
 
D
L
 
Y
A
 
A
D
 
K
K
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
T
 
I
I
|
I
A
 
D
T
 
T
E
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
M
 
-
S
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
M
 
-
K
 
L
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
K
P
 
P
S
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
N
T
 
V
V
 
M
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
L
A
 
S
S
 
S
Y
 
Y
I
 
M
T
 
T
G
 
G
E
 
S
I
 
A
V
 
I
V
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
40% identity, 92% coverage: 12:250/260 of query aligns to 6:244/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
L
 
L
A
 
A
G
 
S
R
 
K
V
 
T
C
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
F
A
 
G
C
 
I
I
 
A
R
 
Q
R
 
V
F
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
V
 
I
V
 
I
A
 
A
D
|
D
I
 
-
D
x
R
D
 
D
A
 
A
R
 
H
G
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
A
G
 
A
E
 
S
L
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
A
G
 
Q
G
 
A
L
 
L
Y
 
F
V
 
I
H
 
S
C
|
C
D
 
N
V
x
I
G
 
A
D
 
E
K
 
K
A
 
T
Q
 
Q
V
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
F
A
 
S
Q
 
Q
A
 
A
M
 
E
A
 
E
A
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
P
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
F
 
N
K
 
R
A
 
D
A
 
A
D
 
M
F
 
L
L
 
H
E
 
K
V
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
D
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
T
V
 
V
L
 
I
R
 
D
I
x
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
T
F
 
F
L
 
L
V
 
C
G
 
M
Q
 
Q
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
R
 
I
E
 
R
M
 
M
A
 
R
K
 
E
A
 
R
G
 
G
Q
 
A
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
 
I
S
 
A
S
 
S
V
 
A
N
 
S
A
 
W
V
 
L
L
 
G
A
 
N
I
 
V
P
 
G
T
 
Q
I
 
-
A
 
T
S
 
N
Y
|
Y
N
 
S
V
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
V
Q
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
K
V
 
T
M
 
A
A
 
C
L
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
K
K
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
F
I
|
I
A
 
D
T
|
T
E
 
D
L
 
M
A
x
T
A
 
R
K
 
G
A
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
V
S
 
P
E
 
E
E
 
N
A
 
V
K
 
W
A
 
Q
R
 
I
I
 
M
M
 
V
S
 
S
R
 
K
T
 
I
P
 
P
M
 
A
K
 
G
R
 
Y
L
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
A
S
 
K
E
 
D
I
 
V
A
 
G
D
 
E
T
 
C
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
G
A
 
A
S
 
R
Y
 
Y
I
 
I
T
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
V
V
 
I
V
 
N
A
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

7xqmB Indel-mutant short chain dehydrogenase bound to sah (see paper)
43% identity, 95% coverage: 12:259/260 of query aligns to 4:249/253 of 7xqmB

query
sites
7xqmB
L
 
F
A
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
G
C
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
-
Q
 
-
G
 
G
I
|
I
G
 
G
E
 
-
A
 
A
C
 
I
I
 
A
R
 
Q
R
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
V
 
V
V
 
A
V
 
L
A
 
C
D
|
D
I
x
L
D
x
R
D
 
P
A
 
-
R
 
E
G
 
G
A
 
K
A
 
E
L
 
V
A
 
A
G
 
E
E
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
A
Y
 
F
V
 
F
H
 
Q
C
x
V
D
 
D
V
x
L
G
 
E
D
 
D
K
 
E
A
 
R
Q
 
E
V
 
R
D
 
V
A
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
M
 
A
A
 
Y
A
 
A
H
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
I
 
I
F
 
A
K
 
A
A
 
P
A
 
G
D
 
S
F
 
A
L
 
L
E
 
T
V
 
V
T
 
R
E
 
L
A
 
P
D
 
E
F
 
W
D
 
R
A
 
R
V
 
V
L
 
L
R
 
E
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
A
S
 
P
F
 
M
L
 
H
V
 
L
G
 
S
Q
 
A
A
 
L
V
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
M
 
M
A
 
R
K
 
K
A
 
V
G
 
G
Q
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
V
S
 
A
S
 
S
V
 
V
N
 
Q
A
 
G
V
 
L
L
 
F
A
 
A
I
 
E
P
 
Q
T
 
E
I
 
N
A
 
A
S
 
A
Y
|
Y
N
 
N
V
 
A
S
 
S
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
L
N
 
V
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
V
 
S
M
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
D
L
 
L
A
 
A
D
 
P
K
 
L
G
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
A
I
 
I
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
A
A
 
V
A
 
L
K
 
E
A
 
A
V
 
I
L
 
A
T
 
L
S
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
P
E
 
E
E
 
R
A
 
T
K
 
R
A
 
R
R
 
D
I
 
W
M
 
E
S
 
D
R
 
L
T
 
H
P
 
A
M
 
L
K
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
K
P
 
P
S
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
E
T
 
A
V
 
V
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
A
 
K
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
A
I
 
I
V
 
L
V
 
P
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
-
M
 
M
T
 
T
L
 
A
N
 
S
Y
 
F
T
 
M
V
 
M
A
 
A

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
40% identity, 92% coverage: 12:250/260 of query aligns to 3:247/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
L
 
L
A
 
A
G
 
N
R
 
R
V
 
V
C
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
Q
|
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
I
C
 
Y
I
 
A
R
 
E
R
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
D
|
D
I
 
I
D
 
N
D
 
E
A
 
P
R
 
K
G
 
A
A
 
T
A
 
E
L
 
V
A
 
A
G
 
S
E
 
S
-
 
I
-
 
T
-
 
S
L
 
L
G
 
G
G
 
G
-
 
R
-
 
A
L
 
I
Y
 
A
V
 
A
H
 
A
C
 
V
D
 
D
V
|
V
G
 
S
D
 
D
K
 
V
A
 
E
Q
 
S
V
 
V
D
 
N
A
 
R
L
 
M
V
 
V
A
 
D
Q
 
S
A
 
A
M
 
V
A
 
E
A
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
x
A
I
 
I
F
 
F
-
x
S
-
 
T
-
 
L
K
 
K
A
 
M
A
 
K
D
 
P
F
 
F
L
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
S
E
 
G
A
 
D
D
 
E
F
 
W
D
 
D
A
 
K
V
 
L
L
 
F
R
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
A
K
 
K
G
 
G
S
 
T
F
 
F
L
 
L
V
 
C
G
 
C
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
S
R
 
P
E
 
V
M
 
M
A
 
R
K
 
K
A
 
N
G
 
Q
Q
 
Y
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
I
S
|
S
S
|
S
V
 
S
N
 
V
A
 
V
V
 
V
L
 
T
A
 
G
I
 
R
P
 
P
T
 
N
I
 
Y
A
 
A
S
 
H
Y
|
Y
N
 
I
V
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
I
 
V
N
 
W
Q
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
H
V
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
T
A
 
E
L
 
M
A
 
G
D
 
T
K
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
S
P
|
P
G
x
H
T
 
G
I
|
I
A
 
I
T
 
T
E
 
E
L
x
I
A
 
P
A
 
R
K
 
E
A
 
T
V
 
I
L
 
-
T
 
-
S
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
G
K
 
W
A
 
R
R
 
R
I
 
N
M
 
L
S
 
E
R
 
E
T
 
Q
P
 
A
M
 
L
K
 
K
R
 
R
L
 
K
G
 
G
E
 
D
P
 
A
S
 
S
E
 
D
I
 
L
A
 
V
D
 
G
T
 
I
V
 
L
A
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
S
S
 
K
Y
 
F
I
 
M
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
I
 
T
V
 
V
V
 
A
A
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
38% identity, 93% coverage: 12:252/260 of query aligns to 5:243/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
A
 
Q
G
 
D
R
 
K
V
 
V
C
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
Q
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
E
C
 
A
I
 
A
R
 
R
R
 
V
F
 
F
A
 
M
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
F
D
 
N
D
 
E
A
 
A
R
 
A
G
 
G
A
 
K
-
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
E
G
 
A
E
 
N
L
 
P
G
 
G
G
 
V
L
 
V
Y
 
F
V
 
I
H
 
R
C
x
V
D
|
D
V
|
V
G
 
S
D
 
D
K
 
R
A
 
E
Q
 
S
V
 
V
D
 
H
A
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
E
Q
 
N
A
 
V
M
 
A
A
 
E
A
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
F
 
T
K
 
R
A
x
D
A
 
S
D
 
M
F
 
L
L
 
S
E
x
K
V
 
M
T
 
T
E
 
V
A
 
D
D
 
Q
F
 
F
D
 
Q
A
 
Q
V
 
V
L
 
I
R
 
N
I
 
V
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
S
 
V
F
 
F
L
 
H
V
 
C
G
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
L
R
 
P
E
 
Y
M
 
M
A
 
A
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
T
S
 
S
S
|
S
V
 
V
N
 
T
A
 
G
V
 
T
L
 
Y
A
 
G
I
x
N
P
x
V
T
 
G
I
x
Q
A
 
T
S
 
N
Y
|
Y
N
 
A
V
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
I
Q
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
K
V
 
T
M
 
W
A
 
A
L
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
T
x
F
I
x
T
A
 
E
T
|
T
E
 
A
L
x
M
A
 
V
A
 
A
K
 
E
A
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
V
S
 
P
E
 
E
E
 
K
A
 
V
K
 
I
A
 
E
R
x
K
I
 
M
M
 
K
S
 
A
R
 
Q
T
 
V
P
 
P
M
 
M
K
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
K
P
 
P
S
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
N
T
 
A
V
 
Y
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
A
 
E
A
 
S
S
 
D
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
E
 
H
I
 
V
V
 
L
V
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
I
M
 
M

3o4rA Crystal structure of human dehydrogenase/reductase (sdr family) member 4 (dhrs4)
42% identity, 92% coverage: 12:250/260 of query aligns to 6:249/254 of 3o4rA

query
sites
3o4rA
L
 
L
A
 
A
G
 
N
R
 
K
V
 
V
C
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
x
A
G
 
S
A
x
T
Q
x
D
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
F
A
 
A
C
 
I
I
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
L
A
 
A
R
 
Q
E
 
D
G
 
G
A
 
A
Q
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
S
-
x
S
-
x
R
-
x
K
-
 
Q
-
 
Q
D
x
N
I
 
V
D
 
D
D
 
Q
A
 
A
R
 
V
G
 
-
A
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
E
 
E
L
 
-
G
 
-
G
 
G
L
 
L
Y
 
S
V
 
V
H
 
T
-
 
G
-
 
T
-
 
V
C
 
C
D
x
H
V
|
V
G
 
G
D
 
K
K
 
A
A
 
E
Q
 
D
V
 
R
D
 
E
A
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
T
A
 
A
M
 
V
A
 
K
A
 
L
H
 
H
G
 
G
R
 
G
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
|
N
A
 
A
G
x
A
I
 
V
F
 
N
K
 
P
A
 
F
-
 
F
A
 
G
D
 
S
F
 
I
L
 
M
E
 
D
V
 
V
T
 
T
E
 
E
A
 
E
D
 
V
F
 
W
D
 
D
A
 
K
V
 
T
L
 
L
R
 
D
I
 
I
N
 
N
L
 
V
K
 
K
G
 
A
S
 
P
F
 
A
L
 
L
V
 
M
G
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
V
R
 
P
E
 
E
M
 
M
A
 
E
K
 
K
A
 
R
G
 
G
Q
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
V
 
V
N
 
I
M
 
V
S
 
S
S
|
S
V
 
I
N
 
A
A
 
A
V
 
F
L
 
S
A
 
P
I
 
S
P
 
P
T
 
G
I
x
F
A
 
S
S
 
P
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
S
 
S
K
|
K
G
 
T
G
 
A
I
 
L
N
 
L
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
V
 
T
M
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
P
K
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
T
x
L
I
|
I
A
 
K
T
|
T
E
 
S
L
x
F
A
 
-
A
x
S
K
 
R
A
 
M
V
 
L
L
 
W
T
 
M
S
 
D
E
x
K
E
 
E
A
 
K
K
 
E
A
 
E
R
 
S
I
 
M
M
 
K
S
 
E
R
 
T
T
 
L
P
 
R
M
 
I
K
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
E
P
 
P
S
 
E
E
 
D
I
 
C
A
 
A
D
 
G
T
 
I
V
 
V
A
 
S
Y
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
D
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
V
 
V
V
 
V
A
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

Q9BTZ2 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4; NADPH-dependent carbonyl reductase; CR; NADPH-dependent retinol dehydrogenase/reductase; NRDR; humNRDR; Peroxisomal short-chain alcohol dehydrogenase; PSCD; SCAD-SRL; Short chain dehydrogenase/reductase family 25C member 2; Protein SDR25C2; Short-chain dehydrogenase/reductase family member 4; EC 1.1.1.184 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
42% identity, 92% coverage: 12:250/260 of query aligns to 30:273/278 of Q9BTZ2

query
sites
Q9BTZ2
L
 
L
A
 
A
G
 
N
R
 
K
V
 
V
C
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
A
G
 
S
A
 
T
Q
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
F
A
 
A
C
 
I
I
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
L
A
 
A
R
 
Q
E
 
D
G
 
G
A
 
A
Q
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
S
-
 
S
-
 
R
-
 
K
-
 
Q
-
 
Q
D
 
N
I
 
V
D
 
D
D
 
Q
A
 
A
R
 
V
G
 
-
A
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
E
 
E
L
 
-
G
 
-
G
 
G
L
 
L
Y
 
S
V
 
V
H
 
T
-
 
G
-
 
T
-
 
V
C
 
C
D
 
H
V
 
V
G
 
G
D
 
K
K
 
A
A
 
E
Q
 
D
V
 
R
D
 
E
A
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
T
A
 
A
M
 
V
A
 
K
A
 
L
H
 
H
G
 
G
R
 
G
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
 
N
A
 
A
G
 
A
I
 
V
F
 
N
K
 
P
A
 
F
-
 
F
A
 
G
D
 
S
F
 
I
L
 
M
E
 
D
V
 
V
T
 
T
E
 
E
A
 
E
D
 
V
F
 
W
D
 
D
A
 
K
V
 
T
L
 
L
R
 
D
I
 
I
N
 
N
L
 
V
K
 
K
G
 
A
S
 
P
F
 
A
L
 
L
V
 
M
G
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
V
R
 
P
E
 
E
M
 
M
A
 
E
K
 
K
A
 
R
G
 
G
Q
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
V
 
V
N
 
I
M
 
V
S
 
S
S
 
S
V
 
I
N
 
A
A
 
A
V
 
F
L
 
S
A
 
P
I
x
S
P
 
P
T
 
G
I
x
F
A
 
S
S
 
P
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
S
 
S
K
 
K
G
 
T
G
 
A
I
 
L
N
 
L
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
V
x
T
M
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
P
K
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
L
I
 
I
A
 
K
T
 
T
E
 
S
L
 
F
A
 
-
A
 
S
K
 
R
A
 
M
V
 
L
L
 
W
T
 
M
S
 
D
E
 
K
E
 
E
A
 
K
K
 
E
A
 
E
R
 
S
I
 
M
M
 
K
S
 
E
R
 
T
T
 
L
P
 
R
M
 
I
K
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
E
P
 
P
S
 
E
E
 
D
I
 
C
A
 
A
D
 
G
T
 
I
V
 
V
A
 
S
Y
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
D
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
V
 
V
V
 
V
A
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
39% identity, 92% coverage: 12:250/260 of query aligns to 3:236/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
L
 
L
A
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
C
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
Q
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
C
 
I
I
 
A
R
 
L
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
A
A
 
G
D
|
D
I
x
L
D
 
G
D
 
D
A
 
L
R
 
T
G
 
Y
A
 
S
A
 
H
L
 
P
A
 
N
G
 
V
E
 
E
L
 
-
G
 
-
G
 
G
L
 
M
Y
 
Y
V
x
L
H
x
N
C
 
-
D
 
-
V
|
V
G
 
T
D
 
D
K
 
V
A
 
T
Q
 
G
V
 
V
D
 
E
A
 
K
L
 
F
V
 
Y
A
 
Q
Q
 
S
A
 
V
M
 
I
A
 
D
A
 
K
H
 
Y
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
F
 
T
K
 
K
A
 
D
A
 
A
D
 
M
F
 
T
L
 
R
E
 
K
V
 
M
T
 
T
E
 
E
A
 
A
D
 
Q
F
 
W
D
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
I
R
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
V
F
 
F
L
 
N
V
 
L
G
 
T
Q
 
R
A
 
L
V
 
V
A
 
G
R
 
P
E
 
Q
M
 
M
A
 
Q
K
 
T
A
 
N
G
 
G
Q
 
Y
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
V
N
 
V
A
 
G
V
 
V
L
 
F
A
 
G
I
 
N
P
 
I
T
 
G
I
 
Q
A
 
A
S
 
N
Y
|
Y
N
 
A
V
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
I
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
M
V
 
T
M
 
W
A
 
A
L
 
K
A
 
E
L
 
F
A
 
A
D
 
L
K
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
T
 
Y
I
|
I
A
 
M
T
|
T
E
 
D
L
 
I
A
 
L
A
 
K
K
 
T
A
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
V
S
 
P
E
 
Q
E
 
D
A
 
L
K
 
L
A
 
D
R
 
K
I
 
F
M
 
A
S
 
A
R
 
L
T
 
T
P
 
M
M
 
L
K
 
N
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
S
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
K
T
 
V
V
 
A
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
D
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
I
 
T
V
 
I
V
 
N
A
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
39% identity, 92% coverage: 12:250/260 of query aligns to 3:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
R
 
K
V
 
V
C
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
D
C
 
I
I
 
A
R
 
I
R
 
N
F
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
V
 
I
V
 
F
V
 
F
A
x
N
D
x
Y
I
x
N
D
x
G
D
x
S
A
 
P
R
 
E
G
 
A
A
 
A
A
 
E
L
 
E
A
 
T
G
 
A
E
 
K
L
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
E
G
 
H
G
 
G
L
 
V
Y
 
E
V
 
V
H
 
E
C
 
A
-
 
M
-
 
K
-
 
A
D
x
N
V
|
V
G
 
A
D
 
I
K
 
A
A
 
E
Q
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
F
V
 
F
A
 
K
Q
 
Q
A
 
A
M
 
I
A
 
E
A
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
F
 
T
K
 
R
A
 
D
A
 
N
D
 
L
F
 
L
L
 
M
E
 
R
V
 
M
T
 
K
E
 
E
A
 
D
D
 
E
F
 
W
D
 
D
A
 
D
V
 
V
L
 
I
R
 
N
I
|
I
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
T
F
 
F
L
 
L
V
 
C
G
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
S
R
 
R
E
 
T
M
 
M
A
 
M
K
 
K
A
 
Q
G
 
R
Q
 
A
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
 
M
S
 
A
S
|
S
V
 
V
N
 
V
A
 
G
V
 
L
L
 
I
A
 
G
I
 
N
P
 
A
T
 
G
I
x
Q
A
 
A
S
 
N
Y
|
Y
N
 
V
V
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
I
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
V
 
T
M
 
T
A
 
A
L
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
P
K
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
T
 
F
I
|
I
A
 
T
T
|
T
E
 
D
L
 
M
A
 
T
A
 
D
K
 
K
A
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
L
S
 
D
E
 
E
E
 
K
A
 
T
K
 
K
A
 
E
R
 
A
I
 
M
M
 
L
S
 
A
R
 
Q
T
 
I
P
 
P
M
 
L
K
 
G
R
 
A
L
 
Y
G
 
G
E
 
T
P
 
T
S
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
N
T
 
A
V
 
V
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
S
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
I
 
T
V
 
L
V
 
S
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

2zatA Crystal structure of a mammalian reductase (see paper)
40% identity, 92% coverage: 12:250/260 of query aligns to 3:246/251 of 2zatA

query
sites
2zatA
L
 
L
A
 
E
G
 
N
R
 
K
V
 
V
C
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
x
A
G
 
S
A
x
T
Q
x
D
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
A
C
 
I
I
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
L
A
 
A
R
 
Q
E
 
D
G
 
G
A
 
A
Q
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
S
D
x
S
I
x
R
D
x
K
-
 
Q
-
 
E
-
x
N
-
 
V
D
 
D
A
 
R
R
 
T
G
 
V
A
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
E
 
E
L
 
-
G
 
-
G
 
G
L
 
L
Y
 
S
V
 
V
H
 
T
-
 
G
-
 
T
-
 
V
C
 
C
D
x
H
V
 
V
G
 
G
D
 
K
K
 
A
A
 
E
Q
 
D
V
 
R
D
 
E
A
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
M
A
 
A
M
 
V
A
 
N
A
 
L
H
 
H
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
|
N
A
 
A
G
x
A
I
 
V
F
 
N
K
 
P
A
 
F
-
 
F
A
 
G
D
 
N
F
 
I
L
 
I
E
 
D
V
 
A
T
 
T
E
 
E
A
 
E
D
 
V
F
 
W
D
 
D
A
 
K
V
 
I
L
 
L
R
 
H
I
 
V
N
 
N
L
 
V
K
 
K
G
 
A
S
 
T
F
 
V
L
 
L
V
 
M
G
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
V
R
 
P
E
 
E
M
 
M
A
 
E
K
 
K
A
 
R
G
 
G
Q
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
V
 
L
N
 
I
M
x
V
S
 
S
S
|
S
V
 
V
N
 
G
A
 
A
V
 
Y
L
 
H
A
 
P
I
 
F
P
 
P
T
 
N
I
x
L
A
 
G
S
 
P
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
S
 
S
K
|
K
G
 
T
G
 
A
I
 
L
N
 
L
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
V
 
N
M
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
P
K
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
T
 
L
I
|
I
A
 
K
T
|
T
E
 
N
L
x
F
A
x
S
A
 
-
K
 
-
A
 
Q
V
 
V
L
 
L
T
 
W
S
 
M
E
 
D
E
x
K
A
 
A
K
 
R
A
 
K
R
 
E
I
 
Y
M
 
M
S
 
K
R
 
E
T
 
S
-
 
L
P
 
R
M
 
I
K
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
N
P
 
P
S
 
E
E
 
D
I
 
C
A
 
A
D
 
G
T
 
I
V
 
V
A
 
S
Y
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
D
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
V
 
V
V
 
V
A
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

7do7A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NAD and l-rhamnose bound-form) (see paper)
40% identity, 92% coverage: 12:250/260 of query aligns to 3:250/256 of 7do7A

query
sites
7do7A
L
 
L
A
 
I
G
 
D
R
 
K
V
 
T
C
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
C
 
A
I
 
A
R
 
R
R
 
E
F
 
C
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
G
D
 
H
I
x
S
-
 
G
-
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
G
R
 
R
G
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
G
 
A
E
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
-
 
T
-
 
A
L
 
I
Y
 
A
V
 
V
H
 
G
C
 
A
D
|
D
V
x
A
G
 
A
D
 
D
K
 
L
A
 
D
Q
 
S
V
 
G
D
 
E
A
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
M
 
V
A
 
E
A
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
F
 
C
K
 
P
A
x
F
A
 
H
D
 
S
F
 
F
L
 
L
E
 
D
V
 
M
T
 
P
E
 
R
A
 
E
D
 
L
F
 
Y
D
 
L
A
 
K
V
 
T
L
 
V
R
 
G
I
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
N
G
 
G
S
 
A
F
 
Y
L
 
F
V
 
T
G
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
R
M
 
M
A
 
K
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
Q
 
R
-
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
A
M
x
V
S
|
S
S
|
S
V
 
I
N
x
S
A
 
A
V
 
L
L
 
V
A
 
G
I
 
G
P
 
A
T
 
M
I
x
Q
A
 
T
S
 
H
Y
|
Y
N
 
T
V
 
P
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
L
N
 
L
Q
 
S
L
 
L
T
 
M
R
 
Q
V
 
S
M
 
C
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
G
D
 
P
K
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
T
 
T
I
|
I
A
 
A
T
|
T
E
 
D
L
x
I
A
 
-
A
x
N
K
 
K
A
 
E
V
 
D
L
 
L
T
 
S
S
 
D
E
 
L
E
 
E
A
 
K
K
 
R
A
 
E
R
 
R
I
 
M
M
 
T
S
 
S
R
 
R
T
 
V
P
 
P
M
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
E
P
 
P
S
 
D
E
 
D
I
 
L
A
 
A
D
 
G
T
 
P
V
 
I
A
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
|
D
A
x
M
A
 
A
S
x
R
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
A
I
 
S
V
 
L
V
 
L
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7b81A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD bound-form) (see paper)
40% identity, 92% coverage: 12:250/260 of query aligns to 3:250/256 of 7b81A

query
sites
7b81A
L
 
L
A
 
I
G
 
D
R
 
K
V
 
T
C
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
C
 
A
I
 
A
R
 
R
R
 
E
F
 
C
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
G
D
 
H
I
 
S
-
 
G
-
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
G
R
 
R
G
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
G
 
A
E
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
-
 
T
-
 
A
L
 
I
Y
 
A
V
 
V
H
 
G
C
 
A
D
|
D
V
x
A
G
 
A
D
 
D
K
 
L
A
 
D
Q
 
S
V
 
G
D
 
E
A
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
M
 
V
A
 
E
A
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
F
 
C
K
 
P
A
 
F
A
 
H
D
 
S
F
 
F
L
 
L
E
 
D
V
 
M
T
 
P
E
 
R
A
 
E
D
 
L
F
 
Y
D
 
L
A
 
K
V
 
T
L
 
V
R
 
G
I
x
T
N
 
N
L
 
L
K
 
N
G
 
G
S
 
A
F
 
Y
L
 
F
V
 
T
G
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
R
M
 
M
A
 
K
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
Q
 
R
-
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
A
M
x
V
S
 
S
S
|
S
V
 
I
N
 
S
A
 
A
V
 
L
L
 
V
A
 
G
I
 
G
P
 
A
T
 
M
I
 
Q
A
 
T
S
 
H
Y
|
Y
N
 
T
V
 
P
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
L
N
 
L
Q
 
S
L
 
L
T
 
M
R
 
Q
V
 
S
M
 
C
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
G
D
 
P
K
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
T
 
T
I
|
I
A
 
A
T
|
T
E
 
D
L
x
I
A
 
-
A
 
N
K
 
K
A
 
E
V
 
D
L
 
L
T
 
S
S
 
D
E
 
L
E
 
E
A
 
K
K
 
R
A
 
E
R
 
R
I
 
M
M
 
T
S
 
S
R
 
R
T
 
V
P
 
P
M
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
E
P
 
P
S
 
D
E
 
D
I
 
L
A
 
A
D
 
G
T
 
P
V
 
I
A
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
M
A
 
A
S
 
R
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
A
I
 
S
V
 
L
V
 
L
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
39% identity, 93% coverage: 10:252/260 of query aligns to 3:257/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
F
 
F
G
 
D
L
 
L
A
 
S
G
 
G
R
 
R
V
 
K
C
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
S
Q
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
A
A
 
A
C
 
I
I
 
A
R
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
D
R
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
V
 
V
V
 
A
V
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
L
D
 
D
-
 
V
D
 
M
A
 
A
R
 
A
G
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
V
A
 
A
G
 
G
-
 
L
E
 
E
L
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
F
Y
 
A
V
 
V
H
 
E
C
x
V
D
|
D
V
|
V
G
 
T
D
 
K
K
 
R
A
 
A
Q
 
S
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
A
V
 
M
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
M
 
I
A
 
D
A
 
A
H
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
F
D
 
D
V
 
L
L
 
L
V
 
C
N
 
A
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
F
 
S
K
 
T
A
 
M
A
 
R
D
 
P
F
 
A
L
 
V
E
 
D
V
 
I
T
 
T
E
 
D
A
 
E
D
 
E
F
 
W
D
 
D
A
 
F
V
 
N
L
 
F
R
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
A
K
 
R
G
 
G
S
 
V
F
 
F
L
 
L
V
 
A
G
 
N
Q
 
Q
A
 
I
V
 
A
A
 
C
R
 
R
E
 
H
-
 
F
M
 
L
A
 
A
K
 
S
A
 
N
G
 
T
Q
 
K
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
T
S
 
A
S
|
S
V
 
L
N
 
A
A
 
A
V
 
K
L
 
V
A
 
G
I
 
A
P
 
P
T
 
L
I
x
L
A
 
A
S
 
H
Y
|
Y
N
 
S
V
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
F
G
 
A
I
 
V
N
 
F
Q
 
G
L
 
W
T
 
T
R
 
Q
V
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
R
A
 
E
L
 
M
A
 
A
D
 
P
K
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
C
P
 
P
G
|
G
T
 
F
I
x
V
A
 
K
T
|
T
E
 
A
L
x
M
A
 
Q
A
 
E
K
 
R
A
 
E
V
 
I
-
 
I
-
 
W
-
x
E
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
R
-
 
G
L
 
M
T
 
T
S
 
P
E
 
E
E
 
A
A
 
V
K
 
R
A
 
A
R
 
E
I
 
Y
M
 
V
S
 
S
R
 
L
T
 
T
P
 
P
M
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
E
E
 
E
P
 
P
S
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
D
T
 
V
V
 
V
A
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
R
Y
 
F
I
 
M
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
-
 
G
I
 
I
V
 
N
V
 
V
A
 
T
D
 
G
G
 
G
G
 
V
R
 
R
M
 
M

C1DMX5 L-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD(P)(+)); RhaDH; AvLRA1; EC 1.1.1.378 from Azotobacter vinelandii (strain DJ / ATCC BAA-1303) (see paper)
40% identity, 92% coverage: 12:250/260 of query aligns to 3:250/256 of C1DMX5

query
sites
C1DMX5
L
 
L
A
 
I
G
 
D
R
 
K
V
 
T
C
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
C
 
A
I
 
A
R
 
R
R
 
E
F
 
C
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
G
D
 
H
I
x
S
-
 
G
-
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
G
R
 
R
G
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
G
 
A
E
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
-
 
T
-
 
A
L
 
I
Y
 
A
V
 
V
H
 
G
C
 
A
D
|
D
V
x
A
G
 
A
D
 
D
K
 
L
A
 
D
Q
 
S
V
 
G
D
 
E
A
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
M
 
V
A
 
E
A
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
F
 
C
K
 
P
A
x
F
A
 
H
D
 
S
F
 
F
L
 
L
E
 
D
V
 
M
T
 
P
E
 
R
A
 
E
D
 
L
F
 
Y
D
 
L
A
 
K
V
 
T
L
 
V
R
 
G
I
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
N
G
 
G
S
 
A
F
 
Y
L
 
F
V
 
T
G
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
R
M
 
M
A
 
K
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
Q
 
R
-
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
A
M
 
V
S
 
S
S
|
S
V
 
I
N
x
S
A
 
A
V
 
L
L
 
V
A
 
G
I
 
G
P
 
A
T
 
M
I
x
Q
A
 
T
S
 
H
Y
|
Y
N
 
T
V
 
P
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
L
N
 
L
Q
 
S
L
 
L
T
 
M
R
 
Q
V
 
S
M
 
C
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
G
D
 
P
K
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
T
|
T
I
|
I
A
 
A
T
 
T
E
 
D
L
x
I
A
 
-
A
x
N
K
 
K
A
 
E
V
x
D
L
 
L
T
 
S
S
 
D
E
 
L
E
 
E
A
 
K
K
 
R
A
 
E
R
 
R
I
 
M
M
 
T
S
 
S
R
 
R
T
 
V
P
 
P
M
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
E
P
 
P
S
 
D
E
 
D
I
 
L
A
 
A
D
 
G
T
 
P
V
 
I
A
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
M
A
 
A
S
 
R
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
A
I
 
S
V
 
L
V
 
L
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
39% identity, 92% coverage: 12:250/260 of query aligns to 9:251/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
L
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
V
C
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
Q
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
A
A
 
A
C
 
I
I
 
A
R
 
K
R
 
A
F
 
L
A
 
A
R
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
N
D
 
Y
I
x
A
D
x
S
D
x
S
A
 
K
R
 
A
G
 
G
A
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
V
A
 
S
L
 
A
A
 
I
G
 
T
E
 
E
L
 
A
G
 
G
G
 
G
-
 
R
-
 
A
L
 
V
Y
 
A
V
 
V
H
 
G
C
x
G
D
|
D
V
|
V
G
 
S
D
 
K
K
 
A
A
 
A
Q
 
D
V
 
A
D
 
Q
A
 
R
L
 
I
V
 
V
A
 
D
Q
 
T
A
 
A
M
 
I
A
 
E
A
 
T
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
S
G
|
G
I
 
V
F
x
Y
K
 
E
A
 
F
A
 
A
D
 
P
F
 
I
L
 
E
E
 
A
V
 
I
T
 
T
E
 
E
A
 
E
D
 
H
F
 
Y
D
 
R
A
 
R
V
 
Q
L
 
F
R
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
V
K
 
F
G
 
G
S
 
V
F
 
L
L
 
L
V
 
T
G
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
V
R
 
K
E
 
H
M
 
L
A
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
G
Q
 
E
G
 
G
-
 
A
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
V
N
 
V
A
 
T
V
 
S
L
 
I
A
 
T
I
 
P
P
 
P
T
 
A
I
 
S
A
 
A
S
 
V
Y
|
Y
N
 
S
V
 
G
S
 
T
K
|
K
G
 
G
G
 
A
I
 
V
N
 
D
Q
 
A
L
 
I
T
 
T
R
 
G
V
 
V
M
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
G
D
 
P
K
 
R
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
N
P
|
P
G
|
G
T
x
M
I
|
I
A
 
V
T
|
T
E
 
E
L
x
G
A
x
T
A
 
H
K
 
S
A
 
A
V
 
G
L
x
I
T
 
I
S
 
G
E
 
S
E
 
D
A
 
L
K
 
E
A
 
A
R
 
Q
I
 
V
M
 
L
S
 
G
R
 
Q
T
 
T
P
 
P
M
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
E
P
 
P
S
 
N
E
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
S
T
 
V
V
 
A
A
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
D
A
 
A
S
 
R
Y
 
W
I
 
M
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
H
V
 
L
V
 
V
A
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>WP_011800647.1 NCBI__GCF_000015505.1:WP_011800647.1
MSNKSSTISFGLAGRVCIVTGGAQGIGEACIRRFAREGAQVVVADIDDARGAALAGELGG
LYVHCDVGDKAQVDALVAQAMAAHGRIDVLVNNAGIFKAADFLEVTEADFDAVLRINLKG
SFLVGQAVAREMAKAGQGSIVNMSSVNAVLAIPTIASYNVSKGGINQLTRVMALALADKG
IRVNAVAPGTIATELAAKAVLTSEEAKARIMSRTPMKRLGEPSEIADTVAYLASDAASYI
TGEIVVADGGRMTLNYTVAL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory