SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011800804.1 NCBI__GCF_000015505.1:WP_011800804.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 12 hits to proteins with known functional sites (download)

8bftA The e. Coli trpd2 protein ybib in complex with a c-terminal peptide from obge (see paper)
41% identity, 98% coverage: 1:295/301 of query aligns to 2:301/321 of 8bftA

query
sites
8bftA
M
 
M
S
 
D
I
 
Y
S
 
R
H
 
K
Y
 
I
I
 
I
K
 
K
E
 
E
I
 
I
G
 
G
R
 
R
G
 
G
K
 
K
D
 
N
G
 
H
A
 
A
R
 
R
P
 
D
L
 
L
S
 
D
R
 
R
A
 
D
Q
 
T
A
 
A
A
 
R
D
 
G
L
 
L
L
 
Y
G
 
A
Q
 
H
V
 
M
L
 
L
D
 
N
G
 
G
V
 
E
V
 
V
T
 
P
D
 
D
L
 
L
E
 
E
I
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
V
C
 
L
L
 
I
A
 
A
M
 
L
R
|
R
I
 
I
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
G
P
 
E
E
 
A
E
 
E
M
 
M
A
 
L
G
 
G
F
 
F
L
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
M
H
 
Q
Q
 
N
R
 
H
-
 
T
L
 
I
N
 
K
L
 
L
L
 
T
P
 
P
A
 
P
S
 
A
D
 
G
G
 
K
P
 
P
T
 
M
-
 
P
V
 
I
V
 
V
L
 
I
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
N
 
N
G
 
G
A
 
A
R
|
R
K
 
K
L
 
Q
P
 
A
V
 
N
L
 
L
T
 
T
P
 
P
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
H
R
 
K
E
 
L
G
 
G
L
 
F
S
 
P
V
 
V
L
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
T
 
V
P
 
S
T
 
E
E
 
D
S
 
P
S
 
T
R
|
R
V
 
V
F
 
L
S
 
T
S
 
E
E
 
T
V
 
I
L
 
F
S
 
E
A
 
L
L
 
M
G
 
G
T
 
I
-
 
T
-
 
P
-
 
T
-
 
L
-
 
H
-
 
G
-
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
Q
T
 
A
A
 
K
I
 
L
K
 
D
P
 
E
I
 
H
A
 
Q
P
 
P
G
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
V
F
 
F
A
 
M
P
 
P
T
 
V
E
 
G
L
 
A
L
 
F
S
 
C
P
 
P
A
 
P
L
 
L
K
 
E
R
 
K
L
 
Q
L
 
L
D
 
A
V
 
M
R
 
R
R
 
W
A
 
R
V
 
M
G
 
G
L
 
V
R
|
R
N
 
N
P
 
S
A
 
A
H
 
H
S
x
T
L
 
L
V
 
A
K
 
K
L
 
L
M
 
A
N
 
T
P
 
P
V
 
F
A
 
A
-
 
E
G
 
G
K
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
R
V
 
L
S
 
S
S
|
S
Y
 
V
T
 
S
H
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
A
 
I
L
 
G
S
 
R
M
 
V
A
 
A
A
 
K
T
 
F
F
 
F
E
 
S
L
 
D
V
 
I
Q
 
G
A
 
G
D
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
M
R
 
H
G
 
G
T
 
T
E
|
E
G
|
G
E
 
E
G
 
V
V
 
Y
A
 
A
D
 
N
P
 
P
R
 
Q
R
 
R
S
 
C
P
 
P
Q
 
Q
M
 
I
Q
 
N
G
 
L
F
 
I
V
 
D
K
 
R
-
 
E
G
 
G
Q
 
M
R
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
Y
H
 
E
E
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
K
G
 
Q
T
 
D
L
 
T
P
 
A
S
 
G
V
 
S
P
 
E
D
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
I
 
K
D
 
D
A
 
P
S
 
E
S
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
Q
Y
 
W
I
 
I
Q
 
E
S
 
R
V
 
C
L
 
L
A
 
A
G
 
G
D
 
S
S
 
E
P
 
P
L
 
I
P
 
P
P
 
E
S
 
S
I
 
L
A
 
K
Q
 
I
Q
 
Q
V
 
M
E
 
A
H
 
C
I
 
C
L
 
L

2gvqD Anthranilate phosphoribosyl-transferase (trpd) from s. Solfataricus in complex with anthranilate (see paper)
25% identity, 74% coverage: 1:223/301 of query aligns to 1:221/345 of 2gvqD

query
sites
2gvqD
M
 
M
S
 
N
I
 
I
S
 
N
H
 
E
Y
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
K
I
 
L
G
 
I
R
 
N
G
 
K
K
 
S
D
 
D
G
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
L
S
 
E
R
 
I
A
 
N
Q
 
E
A
 
A
A
 
E
D
 
E
L
 
L
L
 
A
G
 
K
Q
 
A
V
 
I
L
 
I
D
 
R
G
 
G
V
 
E
V
 
V
T
 
P
D
 
E
L
 
I
E
 
L
I
 
V
G
 
S
G
 
A
F
 
I
C
 
L
L
 
V
A
 
A
M
 
L
R
 
R
I
 
M
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
S
P
 
K
E
 
N
E
 
E
M
 
I
A
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
A
D
 
R
A
 
A
V
 
M
H
 
R
Q
 
E
R
 
-
L
 
-
N
 
-
L
 
L
L
 
A
P
 
I
A
 
K
S
 
I
D
 
D
G
 
V
P
 
P
T
 
N
V
 
A
V
 
I
L
 
D
P
 
T
S
 
A
Y
 
G
N
 
T
G
 
G
A
 
G
R
 
D
K
 
G
L
 
L
P
 
G
V
 
T
L
 
V
-
 
N
-
 
V
T
 
S
P
 
T
L
 
A
L
 
S
A
 
A
L
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
S
R
 
L
E
 
V
G
 
N
L
 
-
S
 
P
V
 
V
L
 
A
V
 
K
H
|
H
G
|
G
T
x
N
P
 
R
T
 
A
E
 
V
S
 
S
S
 
G
R
 
K
V
 
S
F
 
G
S
 
S
S
 
A
E
 
D
V
 
V
L
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
Y
Q
 
N
A
 
I
L
 
I
T
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
E
-
 
R
A
 
A
I
 
K
K
 
E
P
 
L
I
 
V
A
 
N
P
 
K
G
 
T
E
 
N
V
 
F
V
 
V
F
 
F
A
 
L
P
 
F
T
 
A
E
x
Q
L
 
Y
L
 
Y
S
x
H
P
 
P
A
 
A
L
x
M
K
 
K
R
 
N
L
 
V
L
 
A
D
 
N
V
 
V
R
|
R
R
 
K
A
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
R
N
 
T
P
 
I
A
 
F
H
 
N
S
 
I
L
 
L
V
x
G
K
x
P
L
 
L
M
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
A
A
 
N
G
 
A
K
 
K
A
 
Y
L
 
Q
V
 
L
V
 
M
S
 
G
S
 
V
Y
 
F
T
 
S
H
 
K
P
 
D
E
 
H
Y
 
L
A
 
D
L
 
L
S
 
L
M
 
S
A
 
K
A
 
S
T
 
A
F
 
Y
E
 
E
L
 
L
V
 
D
Q
 
F
A
 
N
D
 
K
A
 
I
L
 
I
L
 
L
L
 
V
R
 
Y
G
 
G
T
 
E
E
 
P
G
 
G

P50384 Anthranilate phosphoribosyltransferase; EC 2.4.2.18 from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see 2 papers)
25% identity, 74% coverage: 1:223/301 of query aligns to 1:221/345 of P50384

query
sites
P50384
M
 
M
S
 
N
I
 
I
S
 
N
H
 
E
Y
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
K
I
 
L
G
 
I
R
 
N
G
 
K
K
 
S
D
 
D
G
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
L
S
 
E
R
 
I
A
 
N
Q
 
E
A
 
A
A
 
E
D
 
E
L
 
L
L
 
A
G
 
K
Q
 
A
V
 
I
L
 
I
D
 
R
G
 
G
V
 
E
V
 
V
T
 
P
D
 
E
L
 
I
E
 
L
I
 
V
G
 
S
G
 
A
F
 
I
C
 
L
L
 
V
A
 
A
M
 
L
R
 
R
I
 
M
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
S
P
 
K
E
 
N
E
 
E
M
 
I
A
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
A
D
 
R
A
 
A
V
 
M
H
 
R
Q
 
E
R
 
-
L
 
-
N
 
-
L
 
L
L
 
A
P
 
I
A
 
K
S
 
I
D
 
D
G
 
V
P
 
P
T
 
N
V
 
A
V
 
I
L
 
D
P
 
T
S
 
A
Y
 
G
N
 
T
G
 
G
A
 
G
R
 
D
K
 
G
L
 
L
P
 
G
V
x
T
L
 
V
-
 
N
-
 
V
T
 
S
P
 
T
L
 
A
L
 
S
A
 
A
L
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
S
R
 
L
E
 
V
G
 
N
L
 
-
S
 
P
V
 
V
L
 
A
V
x
K
H
|
H
G
 
G
T
 
N
P
 
R
T
 
A
E
 
V
S
 
S
S
 
G
R
 
K
V
 
S
F
 
G
S
|
S
S
 
A
E
 
D
V
 
V
L
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
Y
Q
 
N
A
 
I
L
 
I
T
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
E
-
 
R
A
 
A
I
 
K
K
 
E
P
 
L
I
 
V
A
 
N
P
 
K
G
 
T
E
 
N
V
 
F
V
 
V
F
 
F
A
 
L
P
 
F
T
 
A
E
 
Q
L
 
Y
L
 
Y
S
x
H
P
 
P
A
 
A
L
 
M
K
 
K
R
 
N
L
 
V
L
 
A
D
 
N
V
 
V
R
|
R
R
 
K
A
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
R
N
 
T
P
 
I
A
 
F
H
 
N
S
 
I
L
 
L
V
 
G
K
 
P
L
 
L
M
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
A
A
 
N
G
 
A
K
 
K
A
 
Y
L
 
Q
V
 
L
V
 
M
S
 
G
S
 
V
Y
 
F
T
 
S
H
 
K
P
 
D
E
 
H
Y
 
L
A
 
D
L
 
L
S
 
L
M
 
S
A
 
K
A
 
S
T
 
A
F
 
Y
E
 
E
L
 
L
V
 
D
Q
 
F
A
 
N
D
 
K
A
 
I
L
 
I
L
 
L
L
 
V
R
 
Y
G
 
G
T
 
E
E
 
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1zxyA Anthranilate phosphoribosyltransferase from sulfolobus solfataricus in complex with prpp and magnesium (see paper)
25% identity, 74% coverage: 1:223/301 of query aligns to 1:221/344 of 1zxyA

query
sites
1zxyA
M
 
M
S
 
N
I
 
I
S
 
N
H
 
E
Y
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
K
I
 
L
G
 
I
R
 
N
G
 
K
K
 
S
D
 
D
G
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
L
S
 
E
R
 
I
A
 
N
Q
 
E
A
 
A
A
 
E
D
 
E
L
 
L
L
 
A
G
 
K
Q
 
A
V
 
I
L
 
I
D
 
R
G
 
G
V
 
E
V
 
V
T
 
P
D
 
E
L
 
I
E
 
L
I
 
V
G
 
S
G
 
A
F
 
I
C
 
L
L
 
V
A
 
A
M
 
L
R
 
R
I
 
M
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
S
P
 
K
E
 
N
E
 
E
M
 
I
A
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
A
D
 
R
A
 
A
V
 
M
H
 
R
Q
 
E
R
 
-
L
 
-
N
 
-
L
 
L
L
 
A
P
 
I
A
 
K
S
 
I
D
 
D
G
 
V
P
 
P
T
 
N
V
 
A
V
 
I
L
 
D
P
 
T
S
x
A
Y
x
G
N
 
T
G
 
G
A
 
G
R
x
D
K
 
G
L
 
L
P
 
G
V
x
T
L
 
V
-
x
N
-
 
V
T
x
S
P
x
T
L
 
A
L
 
S
A
 
A
L
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
S
R
 
L
E
 
V
G
 
N
L
 
-
S
 
P
V
 
V
L
 
A
V
x
K
H
 
H
G
 
G
T
 
N
P
 
R
T
 
A
E
 
V
S
 
S
S
 
G
R
 
K
V
 
S
F
 
G
S
|
S
S
 
A
E
 
D
V
 
V
L
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
Y
Q
 
N
A
 
I
L
 
I
T
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
E
-
 
R
A
 
A
I
 
K
K
 
E
P
 
L
I
 
V
A
 
N
P
 
K
G
 
T
E
 
N
V
 
F
V
 
V
F
 
F
A
 
L
P
 
F
T
 
A
E
 
Q
L
 
Y
L
 
Y
S
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
M
K
 
K
R
 
N
L
 
V
L
 
A
D
 
N
V
 
V
R
 
R
R
 
K
A
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
R
N
 
T
P
 
I
A
 
F
H
 
N
S
 
I
L
 
L
V
 
G
K
 
P
L
 
L
M
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
A
A
 
N
G
 
A
K
 
K
A
 
Y
L
 
Q
V
 
L
V
 
M
S
 
G
S
 
V
Y
 
F
T
 
S
H
 
K
P
 
D
E
 
H
Y
 
L
A
 
D
L
 
L
S
 
L
M
 
S
A
 
K
A
 
S
T
 
A
F
 
Y
E
 
E
L
 
L
V
 
D
Q
 
F
A
 
N
D
 
K
A
 
I
L
 
I
L
 
L
L
 
V
R
 
Y
G
 
G
T
 
E
E
 
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1gxbA Anthranilate phosphoribosyltransferase in complex with pyrophosphate and magnesium (see paper)
24% identity, 74% coverage: 1:223/301 of query aligns to 1:217/339 of 1gxbA

query
sites
1gxbA
M
 
M
S
 
N
I
 
I
S
 
N
H
 
E
Y
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
K
I
 
L
G
 
I
R
 
N
G
 
K
K
 
S
D
 
D
G
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
L
S
 
E
R
 
I
A
 
N
Q
 
E
A
 
A
A
 
E
D
 
E
L
 
L
L
 
A
G
 
K
Q
 
A
V
 
I
L
 
I
D
 
R
G
 
G
V
 
E
V
 
V
T
 
P
D
 
E
L
 
I
E
 
L
I
 
V
G
 
S
G
 
A
F
 
I
C
 
L
L
 
V
A
 
A
M
 
L
R
 
R
I
 
M
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
S
P
 
K
E
 
N
E
 
E
M
 
I
A
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
A
D
 
R
A
 
A
V
 
M
H
 
R
Q
 
E
R
 
L
L
 
A
-
 
I
-
 
K
-
 
I
-
 
D
-
 
V
-
 
P
N
 
N
L
 
A
L
 
I
P
 
D
A
 
T
S
 
A
D
 
G
G
 
G
P
 
L
T
 
G
V
 
T
V
 
V
L
x
N
P
 
V
S
|
S
Y
x
T
N
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
I
K
 
L
L
 
L
P
 
S
V
 
L
L
 
V
T
 
N
P
 
P
L
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
-
V
 
V
L
 
A
V
x
K
H
 
H
G
 
G
T
 
N
P
 
R
T
 
A
E
 
V
S
 
S
S
 
G
R
 
K
V
 
S
F
 
G
S
|
S
S
 
A
E
 
D
V
 
V
L
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
Y
Q
 
N
A
 
I
L
 
I
T
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
E
-
 
R
A
 
A
I
 
K
K
 
E
P
 
L
I
 
V
A
 
N
P
 
K
G
 
T
E
 
N
V
 
F
V
 
V
F
 
F
A
 
L
P
 
F
T
 
A
E
 
Q
L
 
Y
L
 
Y
S
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
M
K
 
K
R
 
N
L
 
V
L
 
A
D
 
N
V
 
V
R
 
R
R
 
K
A
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
R
N
 
T
P
 
I
A
 
F
H
 
N
S
 
I
L
 
L
V
 
G
K
 
P
L
 
L
M
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
A
A
 
N
G
 
A
K
 
K
A
 
Y
L
 
Q
V
 
L
V
 
M
S
 
G
S
 
V
Y
 
F
T
 
S
H
 
K
P
 
D
E
 
H
Y
 
L
A
 
D
L
 
L
S
 
L
M
 
S
A
 
K
A
 
S
T
 
A
F
 
Y
E
 
E
L
 
L
V
 
D
Q
 
F
A
 
N
D
 
K
A
 
I
L
 
I
L
 
L
L
 
V
R
 
Y
G
 
G
T
 
E
E
 
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3gbrA Anthranilate phosphoribosyl-transferase (trpd) double mutant d83g f149s from s. Solfataricus (see paper)
23% identity, 74% coverage: 1:223/301 of query aligns to 1:218/341 of 3gbrA

query
sites
3gbrA
M
 
M
S
 
N
I
 
I
S
 
N
H
 
E
Y
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
K
I
 
L
G
 
I
R
 
N
G
 
K
K
 
S
D
 
D
G
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
L
S
 
E
R
 
I
A
 
N
Q
 
E
A
 
A
A
 
E
D
 
E
L
 
L
L
 
A
G
 
K
Q
 
A
V
 
I
L
 
I
D
 
R
G
 
G
V
 
E
V
 
V
T
 
P
D
 
E
L
 
I
E
 
L
I
 
V
G
 
S
G
 
A
F
 
I
C
 
L
L
 
V
A
 
A
M
 
L
R
 
R
I
 
M
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
S
P
 
K
E
 
N
E
 
E
M
 
I
A
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
A
D
 
R
A
 
A
V
 
M
H
 
R
Q
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
I
R
 
K
L
 
I
N
 
D
L
 
V
L
 
P
P
 
N
A
 
A
S
 
I
D
 
D
G
 
T
P
x
A
T
x
G
V
x
T
V
x
G
L
 
G
P
 
G
S
 
G
Y
 
L
N
 
G
G
 
T
A
 
V
R
x
N
K
x
V
L
x
S
P
x
T
V
 
A
L
 
S
T
 
A
P
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
S
L
 
L
L
 
V
L
 
N
A
 
P
R
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
-
V
 
V
L
 
A
V
x
K
H
 
H
G
 
G
T
 
N
P
 
R
T
 
A
E
 
K
S
 
S
S
x
G
R
 
-
V
 
-
F
 
-
S
 
S
S
 
A
E
 
D
V
 
V
L
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
Y
Q
 
N
A
 
I
L
 
I
T
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
E
-
 
R
A
 
A
I
 
K
K
 
E
P
 
L
I
 
V
A
 
N
P
 
K
G
 
T
E
 
N
V
 
F
V
 
V
F
 
F
A
 
L
P
 
S
T
 
A
E
 
Q
L
 
Y
L
 
Y
S
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
M
K
 
K
R
 
N
L
 
V
L
 
A
D
 
N
V
 
V
R
 
R
R
 
K
A
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
R
N
 
T
P
 
I
A
 
F
H
 
N
S
 
I
L
 
L
V
 
G
K
 
P
L
 
L
M
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
A
A
 
N
G
 
A
K
 
K
A
 
Y
L
 
Q
V
 
L
V
 
M
S
 
G
S
 
V
Y
 
F
T
 
S
H
 
K
P
 
D
E
 
H
Y
 
L
A
 
D
L
 
L
S
 
L
M
 
S
A
 
K
A
 
S
T
 
A
F
 
Y
E
 
E
L
 
L
V
 
D
Q
 
F
A
 
N
D
 
K
A
 
I
L
 
I
L
 
L
L
 
V
R
 
Y
G
 
G
T
 
E
E
 
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5nofA Anthranilate phosphoribosyltransferase from thermococcus kodakaraensis (see paper)
29% identity, 69% coverage: 15:221/301 of query aligns to 9:214/325 of 5nofA

query
sites
5nofA
D
 
D
G
 
G
A
 
-
R
 
K
P
 
N
L
 
L
S
 
S
R
 
F
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
Y
D
 
E
L
 
L
L
 
F
G
 
N
Q
 
E
V
 
L
L
 
K
-
 
G
-
 
S
D
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
L
T
 
-
D
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
I
G
 
G
G
 
A
F
 
Y
C
 
L
L
 
A
A
 
A
M
 
L
R
 
Q
I
 
T
K
 
K
G
 
G
E
 
Y
T
 
T
P
 
G
E
|
E
E
 
E
M
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
L
L
 
A
D
 
R
A
 
A
V
 
M
H
 
R
Q
 
D
-
 
S
-
 
A
-
 
V
R
 
K
L
 
L
N
 
D
L
 
L
L
 
G
P
 
K
A
 
V
S
 
A
D
 
D
G
 
T
P
 
A
T
 
G
V
 
T
V
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
G
Y
 
G
N
x
D
G
 
G
A
 
S
R
 
S
K
 
T
L
 
I
P
 
N
V
 
V
L
 
S
T
 
T
P
 
A
L
 
S
L
 
A
A
 
L
L
 
I
L
 
L
L
 
S
A
 
A
R
 
F
E
 
-
G
 
-
L
 
T
S
 
R
V
 
V
L
 
A
V
 
K
H
 
H
G
 
G
T
 
N
P
 
V
T
 
S
E
 
I
S
 
T
S
 
S
R
 
K
V
 
S
F
 
G
S
 
S
S
 
A
E
 
N
V
 
V
L
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
L
Q
 
N
A
 
-
L
 
-
T
 
I
A
 
R
I
 
V
K
 
S
P
 
P
I
 
E
A
 
R
P
 
A
G
 
R
E
 
E
V
 
M
V
 
V
-
 
E
-
 
S
-
 
T
-
 
N
-
 
F
-
 
T
-
 
F
-
 
I
F
 
F
A
 
A
P
 
P
T
 
A
E
 
-
L
 
-
L
 
Y
S
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
P
L
 
I
L
 
M
D
 
P
V
 
V
R
 
R
R
 
K
A
 
A
V
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
K
N
 
T
P
 
V
A
 
F
H
 
N
S
 
V
L
 
I
V
 
G
K
 
P
L
 
L
M
 
A
N
 
N
P
 
P
V
 
-
A
 
A
G
 
D
K
 
P
A
 
A
L
 
Y
V
 
Q
V
 
V
S
 
V
S
 
G
Y
 
V
T
 
N
H
 
S
P
 
P
E
 
E
Y
 
L
A
 
L
L
 
E
S
 
P
M
 
V
A
 
A
A
x
E
T
 
A
F
 
L
E
 
E
L
 
F
V
 
L
Q
 
G
A
 
V
D
 
E
-
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
L
 
V
R
 
H
G
 
G
T
 
S

Sites not aligning to the query:

4n5vA Alternative substrates of mycobacterium tuberculosis anthranilate phosphoribosyl transferase (see paper)
26% identity, 74% coverage: 2:223/301 of query aligns to 1:227/347 of 4n5vA

query
sites
4n5vA
S
 
S
I
 
V
S
 
P
H
 
S
Y
 
W
I
 
P
K
 
Q
E
 
I
I
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
L
K
 
T
D
 
D
G
 
N
A
 
-
R
 
R
P
 
D
L
 
L
S
 
A
R
 
R
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
D
 
W
L
 
A
L
 
M
G
 
D
Q
 
Q
V
 
I
L
 
M
D
 
T
G
 
G
V
 
N
V
 
A
T
 
R
D
 
P
L
 
A
E
 
Q
I
 
I
G
 
A
G
 
A
F
 
F
C
 
A
L
 
V
A
 
A
M
 
M
R
 
T
I
 
M
K
 
K
G
 
A
E
 
P
T
 
T
P
 
A
E
 
D
E
 
E
M
 
V
A
 
G
G
 
E
F
 
L
L
 
A
D
 
G
A
 
V
V
 
M
H
 
L
Q
 
S
R
 
H
L
 
A
N
 
H
L
 
P
L
 
L
P
 
P
A
 
A
S
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
P
-
 
D
D
 
D
G
 
A
P
 
V
T
 
D
V
 
V
V
|
V
L
x
G
P
 
T
S
x
G
Y
x
G
N
 
D
G
 
G
A
 
V
R
 
N
K
 
T
L
 
V
P
x
N
V
 
-
L
 
L
T
x
S
P
x
T
L
 
M
L
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
V
L
 
V
A
 
A
R
 
A
E
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
P
V
 
V
L
 
V
V
x
K
H
|
H
G
|
G
T
x
N
P
 
R
T
 
A
E
x
A
S
|
S
S
|
S
R
 
L
V
 
S
F
x
G
S
 
G
S
 
A
E
 
D
V
 
T
L
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
V
Q
 
R
-
 
I
-
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
P
A
 
D
L
 
L
T
 
V
A
 
A
I
 
-
K
 
R
P
 
S
I
 
L
A
 
A
P
 
E
G
 
V
E
 
G
V
 
I
V
 
G
F
 
F
A
 
C
P
 
F
T
x
A
E
x
P
L
 
R
L
 
F
S
x
H
P
 
P
A
 
S
L
x
Y
K
x
R
R
 
H
L
 
A
L
x
A
D
 
A
V
 
V
R
|
R
R
 
R
A
 
E
V
 
I
G
 
G
L
 
V
R
 
P
N
 
T
P
 
V
A
 
F
H
 
N
S
 
L
L
 
L
V
x
G
K
 
P
L
 
L
M
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
A
A
 
R
G
 
P
K
 
R
A
 
A
L
 
G
V
 
L
V
 
I
S
 
G
S
 
C
Y
 
-
T
 
A
H
 
F
P
 
A
E
 
D
Y
 
L
A
 
A
L
 
E
S
 
V
M
 
M
A
 
A
A
 
G
T
 
V
F
 
F
E
 
A
L
 
A
V
 
R
Q
 
R
A
 
S
D
 
S
A
 
V
L
 
L
L
 
V
L
 
V
R
 
H
G
 
G
T
 
D
E
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4owoA Anthranilate phosphoribosyl transferase from mycobacterium tuberculosis in complex with 6-fluoroanthranilate, prpp and magnesium (see paper)
26% identity, 74% coverage: 2:223/301 of query aligns to 1:227/348 of 4owoA

query
sites
4owoA
S
 
S
I
 
V
S
 
P
H
 
S
Y
 
W
I
 
P
K
 
Q
E
 
I
I
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
L
K
 
T
D
 
D
G
 
N
A
 
-
R
 
R
P
 
D
L
 
L
S
 
A
R
 
R
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
D
 
W
L
 
A
L
 
M
G
 
D
Q
 
Q
V
 
I
L
 
M
D
 
T
G
 
G
V
 
N
V
 
A
T
 
R
D
 
P
L
 
A
E
 
Q
I
 
I
G
 
A
G
 
A
F
 
F
C
 
A
L
 
V
A
 
A
M
 
M
R
 
T
I
 
M
K
 
K
G
 
A
E
 
P
T
 
T
P
 
A
E
 
D
E
 
E
M
 
V
A
 
G
G
 
E
F
 
L
L
 
A
D
 
G
A
 
V
V
 
M
H
 
L
Q
 
S
R
 
H
L
 
A
N
 
H
L
 
P
L
 
L
P
 
P
A
 
A
S
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
P
-
 
D
D
 
D
G
 
A
P
 
V
T
 
D
V
 
V
V
|
V
L
x
G
P
x
T
S
x
G
Y
x
G
N
 
D
G
 
G
A
 
V
R
 
N
K
 
T
L
 
V
P
x
N
V
 
-
L
 
L
T
x
S
P
x
T
L
 
M
L
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
V
L
 
V
A
 
A
R
 
A
E
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
P
V
 
V
L
 
V
V
x
K
H
|
H
G
 
G
T
x
N
P
 
R
T
x
A
E
x
A
S
|
S
S
|
S
R
 
L
V
 
S
F
x
G
S
 
G
S
 
A
E
 
D
V
 
T
L
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
V
Q
 
R
-
 
I
-
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
P
A
 
D
L
 
L
T
 
V
A
 
A
I
 
-
K
 
R
P
 
S
I
 
L
A
 
A
P
 
E
G
 
V
E
 
G
V
 
I
V
 
G
F
 
F
A
 
C
P
 
F
T
x
A
E
x
P
L
 
R
L
 
F
S
x
H
P
 
P
A
 
S
L
x
Y
K
 
R
R
 
H
L
 
A
L
x
A
D
 
A
V
 
V
R
|
R
R
 
R
A
 
E
V
 
I
G
 
G
L
 
V
R
 
P
N
 
T
P
 
V
A
 
F
H
 
N
S
 
L
L
 
L
V
x
G
K
 
P
L
 
L
M
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
A
A
 
R
G
 
P
K
 
R
A
 
A
L
 
G
V
 
L
V
 
I
S
 
G
S
 
C
Y
 
-
T
 
A
H
 
F
P
 
A
E
 
D
Y
 
L
A
 
A
L
 
E
S
 
V
M
 
M
A
 
A
A
 
G
T
 
V
F
 
F
E
 
A
L
 
A
V
 
R
Q
 
R
A
 
S
D
 
S
A
 
V
L
 
L
L
 
V
L
 
V
R
 
H
G
 
G
T
 
D
E
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P9WFX5 Anthranilate phosphoribosyltransferase; EC 2.4.2.18 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
26% identity, 74% coverage: 2:223/301 of query aligns to 23:249/370 of P9WFX5

query
sites
P9WFX5
S
 
S
I
 
V
S
 
P
H
 
S
Y
 
W
I
 
P
K
 
Q
E
 
I
I
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
L
K
 
T
D
 
D
G
 
N
A
 
-
R
 
R
P
 
D
L
 
L
S
 
A
R
 
R
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
D
 
W
L
 
A
L
 
M
G
 
D
Q
 
Q
V
 
I
L
 
M
D
 
T
G
 
G
V
 
N
V
 
A
T
 
R
D
 
P
L
 
A
E
 
Q
I
 
I
G
 
A
G
 
A
F
 
F
C
 
A
L
 
V
A
 
A
M
 
M
R
 
T
I
 
M
K
 
K
G
 
A
E
 
P
T
 
T
P
 
A
E
 
D
E
 
E
M
 
V
A
 
G
G
 
E
F
 
L
L
 
A
D
 
G
A
 
V
V
 
M
H
 
L
Q
 
S
R
 
H
L
 
A
N
 
H
L
 
P
L
 
L
P
 
P
A
 
A
S
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
P
-
 
D
D
 
D
G
 
A
P
 
V
T
 
D
V
 
V
V
 
V
L
x
G
P
 
T
S
 
G
Y
 
G
N
 
D
G
 
G
A
 
V
R
 
N
K
x
T
L
 
V
P
 
N
V
 
-
L
 
L
T
 
S
P
 
T
L
 
M
L
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
V
L
 
V
A
 
A
R
 
A
E
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
P
V
 
V
L
 
V
V
 
K
H
 
H
G
 
G
T
 
N
P
 
R
T
 
A
E
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
L
V
 
S
F
 
G
S
x
G
S
 
A
E
 
D
V
 
T
L
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
V
Q
 
R
-
 
I
-
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
P
A
 
D
L
 
L
T
 
V
A
 
A
I
 
-
K
 
R
P
 
S
I
 
L
A
 
A
P
 
E
G
 
V
E
 
G
V
 
I
V
 
G
F
 
F
A
 
C
P
 
F
T
 
A
E
 
P
L
 
R
L
 
F
S
 
H
P
 
P
A
 
S
L
 
Y
K
 
R
R
 
H
L
 
A
L
 
A
D
 
A
V
 
V
R
 
R
R
 
R
A
 
E
V
 
I
G
 
G
L
 
V
R
 
P
N
 
T
P
 
V
A
 
F
H
 
N
S
 
L
L
 
L
V
 
G
K
 
P
L
 
L
M
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
A
A
 
R
G
 
P
K
 
R
A
 
A
L
 
G
V
 
L
V
 
I
S
 
G
S
 
C
Y
 
-
T
 
A
H
 
F
P
 
A
E
 
D
Y
 
L
A
 
A
L
 
E
S
 
V
M
 
M
A
 
A
A
 
G
T
 
V
F
 
F
E
 
A
L
 
A
V
 
R
Q
 
R
A
 
S
D
 
S
A
 
V
L
 
L
L
 
V
L
 
V
R
 
H
G
 
G
T
 
D
E
 
D
G
 
G

5c2lA Magnesium soaked into the active site of mycobacterium tuberculosis anthranilate phosphoribosyltransferase (anprt; trpd)
26% identity, 74% coverage: 2:223/301 of query aligns to 1:227/349 of 5c2lA

query
sites
5c2lA
S
 
S
I
 
V
S
 
P
H
 
S
Y
 
W
I
 
P
K
 
Q
E
 
I
I
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
L
K
 
T
D
 
D
G
 
N
A
 
-
R
 
R
P
 
D
L
 
L
S
 
A
R
 
R
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
D
 
W
L
 
A
L
 
M
G
 
D
Q
 
Q
V
 
I
L
 
M
D
 
T
G
 
G
V
 
N
V
 
A
T
 
R
D
 
P
L
 
A
E
 
Q
I
 
I
G
 
A
G
 
A
F
 
F
C
 
A
L
 
V
A
 
A
M
 
M
R
 
T
I
 
M
K
 
K
G
 
A
E
 
P
T
 
T
P
 
A
E
 
D
E
 
E
M
 
V
A
 
G
G
 
E
F
 
L
L
 
A
D
 
G
A
 
V
V
 
M
H
 
L
Q
 
S
R
 
H
L
 
A
N
 
H
L
 
P
L
 
L
P
 
P
A
 
A
S
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
P
-
 
D
D
 
D
G
 
A
P
 
V
T
 
D
V
 
V
V
|
V
L
 
G
P
 
T
S
 
G
Y
 
G
N
 
D
G
 
G
A
 
V
R
 
N
K
 
T
L
 
V
P
 
N
V
 
-
L
 
L
T
 
S
P
 
T
L
 
M
L
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
V
L
 
V
A
 
A
R
 
A
E
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
P
V
 
V
L
 
V
V
 
K
H
 
H
G
 
G
T
 
N
P
 
R
T
 
A
E
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
L
V
 
S
F
 
G
S
 
G
S
 
A
E
 
D
V
 
T
L
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
V
Q
 
R
-
 
I
-
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
P
A
 
D
L
 
L
T
 
V
A
 
A
I
 
-
K
 
R
P
 
S
I
 
L
A
 
A
P
 
E
G
 
V
E
 
G
V
 
I
V
 
G
F
 
F
A
 
C
P
 
F
T
 
A
E
 
P
L
 
R
L
 
F
S
 
H
P
 
P
A
 
S
L
 
Y
K
 
R
R
 
H
L
 
A
L
 
A
D
 
A
V
 
V
R
 
R
R
 
R
A
 
E
V
 
I
G
 
G
L
 
V
R
 
P
N
 
T
P
 
V
A
 
F
H
 
N
S
 
L
L
 
L
V
 
G
K
 
P
L
 
L
M
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
A
A
 
R
G
 
P
K
 
R
A
 
A
L
 
G
V
 
L
V
 
I
S
 
G
S
 
C
Y
 
-
T
 
A
H
 
F
P
 
A
E
 
D
Y
 
L
A
 
A
L
 
E
S
 
V
M
 
M
A
 
A
A
 
G
T
 
V
F
 
F
E
 
A
L
 
A
V
 
R
Q
 
R
A
 
S
D
 
S
A
 
V
L
 
L
L
 
V
L
 
V
R
 
H
G
 
G
T
 
D
E
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4yi7A Anthranilate bound at active site of anthranilate phosphoribosyl transferase from acinetobacter (anprt; trpd)
23% identity, 59% coverage: 20:196/301 of query aligns to 17:184/331 of 4yi7A

query
sites
4yi7A
L
 
L
S
 
T
R
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
M
A
 
E
D
 
D
L
 
V
L
 
M
G
 
R
Q
 
S
V
 
I
L
 
M
D
 
Q
G
 
G
V
 
E
V
 
A
T
 
T
D
 
E
L
 
A
E
 
Q
I
 
I
G
 
G
G
 
A
F
 
L
C
 
M
L
 
M
A
 
G
M
 
L
R
 
R
I
 
M
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
S
P
 
I
E
 
D
E
 
E
M
 
I
A
 
T
G
 
A
F
 
A
L
 
A
D
 
R
A
 
V
V
 
M
H
 
R
Q
 
E
R
 
L
L
 
A
N
 
I
L
 
K
L
 
I
P
 
D
A
 
V
S
 
S
D
 
D
G
 
I
P
 
Q
T
 
Y
V
 
L
V
 
V
L
 
D
P
 
I
S
x
V
Y
x
G
N
 
T
G
 
G
A
 
G
R
 
D
K
 
N
L
 
L
P
 
F
V
 
N
L
 
V
T
 
S
P
 
T
L
 
A
L
 
S
A
 
S
L
 
F
L
 
V
L
 
I
A
 
A
R
 
A
E
 
A
G
 
G
L
 
A
S
 
T
V
 
I
L
 
A
V
 
K
H
|
H
G
 
G
T
 
N
P
 
R
T
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
-
R
 
-
V
 
-
F
 
-
S
 
S
S
 
S
E
 
D
V
 
L
L
 
L
S
 
E
A
 
Q
L
 
A
G
 
G
T
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
D
-
 
L
-
 
D
-
 
M
-
 
Q
Q
 
Q
A
 
T
L
 
E
T
 
R
A
 
C
I
 
I
K
 
R
P
 
E
I
 
M
A
 
G
P
 
V
G
 
G
E
 
-
V
 
F
V
 
L
F
 
F
A
 
A
P
 
M
T
 
K
E
 
Y
L
 
A
L
 
V
S
 
G
P
 
P
A
 
-
L
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
R
|
R
R
 
R
A
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
R
N
 
S
P
 
I
A
 
F
H
 
N
S
 
L
L
 
L
V
x
G
K
 
P
L
 
L
M
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
A
A
 
G
G
 
V
K
 
K
A
 
R
L
 
F
V
 
V
V
 
I
S
 
G
S
 
V
Y
 
F
T
 
S

Query Sequence

>WP_011800804.1 NCBI__GCF_000015505.1:WP_011800804.1
MSISHYIKEIGRGKDGARPLSRAQAADLLGQVLDGVVTDLEIGGFCLAMRIKGETPEEMA
GFLDAVHQRLNLLPASDGPTVVLPSYNGARKLPVLTPLLALLLAREGLSVLVHGTPTESS
RVFSSEVLSALGTQALTAIKPIAPGEVVFAPTELLSPALKRLLDVRRAVGLRNPAHSLVK
LMNPVAGKALVVSSYTHPEYALSMAATFELVQADALLLRGTEGEGVADPRRSPQMQGFVK
GQRVLAHEGVKGTLPSVPDLPKAIDASSTAAYIQSVLAGDSPLPPSIAQQVEHILQLVRQ
L

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory