SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011801510.1 NCBI__GCF_000015505.1:WP_011801510.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
40% identity, 99% coverage: 1:253/255 of query aligns to 2:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
K
 
S
K
 
R
L
 
L
K
 
Q
N
 
D
K
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
G
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
 
L
A
 
E
T
 
A
C
 
A
R
 
R
R
 
V
F
 
F
A
 
M
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
A
D
|
D
M
x
F
N
 
N
V
 
-
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
G
R
 
K
V
 
E
A
 
A
D
 
-
E
 
-
I
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
N
G
 
P
G
 
G
I
 
V
A
 
V
Q
 
-
A
 
F
F
 
I
K
 
R
C
x
V
N
x
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
R
 
R
A
 
E
E
 
S
V
 
V
D
 
H
A
 
R
A
 
L
V
 
V
A
 
E
A
 
N
A
 
V
E
 
A
A
 
E
A
 
R
L
 
F
G
 
G
P
 
K
I
 
I
A
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
x
D
K
 
S
P
 
M
F
 
L
V
 
S
K
|
K
T
 
M
V
 
T
P
 
V
A
 
D
E
 
Q
W
 
F
D
 
Q
K
 
Q
L
 
V
I
 
I
A
 
N
I
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
V
L
 
F
H
 
H
M
 
C
H
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
Y
M
 
M
A
 
A
E
 
E
R
 
Q
K
 
G
Y
 
K
G
 
G
H
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
T
A
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
T
A
 
G
R
 
T
G
 
Y
G
 
G
S
x
N
S
x
V
G
 
G
E
x
Q
A
 
T
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
M
S
 
T
K
 
K
T
 
T
L
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
P
x
F
T
|
T
D
 
E
T
|
T
A
 
A
L
x
M
L
 
V
A
 
A
G
 
E
V
 
V
A
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
E
K
 
K
L
 
V
I
 
I
E
 
E
A
x
K
F
 
M
K
 
K
S
 
A
A
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
I
 
Y
V
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
H
D
 
E
A
 
S
A
 
D
F
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
V
 
V
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
M
M
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
38% identity, 98% coverage: 3:253/255 of query aligns to 5:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
K
 
K
L
 
L
K
 
A
N
 
S
K
 
K
T
 
T
V
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
 
F
A
 
G
T
 
I
C
 
A
R
 
Q
R
 
V
F
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
V
A
 
I
V
 
I
F
 
A
D
|
D
M
x
R
N
 
D
V
 
A
E
 
H
A
 
G
A
 
-
Q
 
E
R
 
A
V
 
A
A
 
A
D
 
A
E
 
S
I
 
L
K
 
R
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
A
I
 
Q
A
 
A
Q
 
L
A
 
F
F
 
I
K
 
S
C
|
C
N
 
N
I
|
I
T
 
A
D
 
E
R
 
K
A
 
T
E
 
Q
V
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
L
V
 
F
A
 
S
A
 
Q
A
 
A
E
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
A
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
W
x
I
D
 
N
V
 
R
F
 
D
K
 
A
P
 
M
F
 
L
V
 
H
K
 
K
T
 
L
V
 
T
P
 
E
A
 
A
E
 
D
W
 
W
D
 
D
K
 
T
L
 
V
I
 
I
A
 
D
I
x
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
-
 
F
L
 
L
H
 
C
M
 
M
H
 
Q
H
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
I
P
 
R
G
 
-
M
 
M
A
 
R
E
 
E
R
 
R
K
 
G
Y
 
A
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
 
S
D
 
-
A
 
A
A
 
S
R
 
W
G
 
L
G
 
G
S
 
N
S
 
V
G
 
G
E
 
Q
A
 
T
V
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
C
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
A
 
G
L
 
M
S
 
T
K
 
K
T
 
T
L
 
A
A
 
C
R
 
R
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
K
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
x
I
D
 
D
T
|
T
A
 
D
L
 
M
L
x
T
A
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
E
K
 
N
L
 
V
I
 
W
E
 
Q
A
 
I
F
 
M
K
 
V
S
 
S
A
 
K
I
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
Y
L
 
A
G
 
G
Q
 
E
P
 
A
D
 
K
D
 
D
L
 
V
A
 
G
S
 
E
A
 
C
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
A
A
 
R
F
 
Y
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
I
 
I
S
 
N
V
 
V
S
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
V
M
 
L

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
38% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 3:245/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
K
 
Q
N
 
N
K
 
R
T
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
A
G
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
G
 
K
A
 
Q
T
 
T
C
 
A
R
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
A
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
N
D
|
D
M
 
I
N
 
D
V
 
A
E
 
E
A
 
K
A
 
V
Q
 
R
R
 
A
V
 
T
A
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
F
K
 
S
A
 
A
A
 
R
G
 
G
G
 
H
I
 
R
A
 
V
Q
 
L
A
 
G
F
 
A
K
 
V
C
 
A
N
x
D
I
|
I
T
 
G
D
 
N
R
 
K
A
 
A
E
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
A
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
Q
A
 
T
E
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
R
I
 
I
A
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
W
 
M
D
 
E
V
 
R
F
 
A
K
 
G
P
 
A
F
 
L
V
 
R
K
 
K
T
 
L
V
 
S
P
 
E
A
 
A
E
 
D
W
 
W
D
 
D
K
 
V
L
 
T
I
 
I
A
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
L
 
F
H
 
L
M
 
C
H
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
H
P
 
G
G
 
H
M
 
M
A
 
V
E
 
E
R
 
N
K
 
K
Y
 
H
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
 
S
D
 
R
A
 
A
A
 
W
R
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
-
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
T
V
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
A
 
G
L
 
M
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
H
 
L
A
 
G
R
 
R
Q
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
C
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
L
T
 
I
D
 
H
T
 
T
A
 
P
L
 
M
L
 
W
A
 
D
G
 
E
V
 
L
A
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
E
K
 
K
L
 
D
I
 
Q
E
 
Q
A
 
F
F
 
L
K
 
L
S
 
S
A
 
R
I
 
Q
P
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
D
 
D
D
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
T
I
 
L
V
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
S
A
 
G
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
I
 
L
S
 
Y
V
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
R
T
 
S
M
 
L

Sites not aligning to the query:

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
38% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 2:244/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
K
 
Q
N
 
N
K
 
R
T
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
A
G
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
G
 
K
A
 
Q
T
 
T
C
 
A
R
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
A
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
N
D
|
D
M
x
I
N
 
D
V
 
A
E
 
E
A
 
K
A
 
V
Q
 
R
R
 
A
V
 
T
A
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
F
K
 
S
A
 
A
A
 
R
G
 
G
G
 
H
I
 
R
A
 
V
Q
 
L
A
 
G
F
 
A
K
 
V
C
 
A
N
 
D
I
|
I
T
 
G
D
 
N
R
 
K
A
 
A
E
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
A
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
Q
A
 
T
E
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
R
I
 
I
A
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
W
 
M
D
 
E
V
 
R
F
 
A
K
 
G
P
 
A
F
 
L
V
 
R
K
 
K
T
 
L
V
 
S
P
 
E
A
 
A
E
 
D
W
 
W
D
 
D
K
 
V
L
 
T
I
 
I
A
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
T
L
 
F
H
 
L
M
 
C
H
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
H
P
 
G
G
 
H
M
 
M
A
 
V
E
 
E
R
 
N
K
 
K
Y
 
H
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
D
 
R
A
 
A
A
 
W
R
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
-
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
T
V
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
A
 
G
L
 
M
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
H
 
L
A
 
G
R
 
R
Q
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
C
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
L
T
x
I
D
 
H
T
 
T
A
 
P
L
 
M
L
 
W
A
 
D
G
 
E
V
 
L
A
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
E
K
 
K
L
 
D
I
 
Q
E
 
Q
A
 
F
F
 
L
K
 
L
S
 
S
A
 
R
I
 
Q
P
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
D
 
D
D
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
T
I
 
L
V
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
S
A
 
G
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
I
 
L
S
 
Y
V
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
R
T
 
S
M
 
L

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
36% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 3:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
L
 
F
K
 
E
N
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
F
 
T
D
 
A
M
x
T
N
 
S
V
 
E
E
 
S
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
V
 
I
A
 
S
D
 
D
E
 
Y
I
 
L
K
 
G
A
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
K
A
 
G
F
 
L
K
 
M
C
x
L
N
|
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
A
 
A
E
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
V
E
 
R
A
 
A
A
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
I
 
V
A
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
K
 
R
T
 
M
V
 
K
P
 
D
A
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
N
K
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
A
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
Y
 
H
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
G
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
E
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
A
 
R
G
 
A
V
 
L
A
 
T
E
 
D
G
 
E
A
 
Q
R
 
R
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
A
A
 
G
F
 
T
K
 
L
S
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
D
 
N
D
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
35% identity, 98% coverage: 3:253/255 of query aligns to 2:243/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
K
 
N
L
 
F
K
 
E
N
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
x
A
G
x
S
G
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
F
 
T
D
 
A
M
x
T
N
 
S
V
 
E
E
 
N
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
V
 
I
A
 
S
D
 
D
E
 
Y
I
 
L
K
 
G
A
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
K
A
 
G
F
 
L
K
 
M
C
 
L
N
|
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
A
 
A
E
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
K
A
 
I
E
 
R
A
 
A
A
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
I
 
V
A
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
W
 
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
K
 
R
T
 
M
V
 
K
P
 
D
A
 
E
E
 
E
W
 
W
D
 
N
K
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
A
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
Y
 
H
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
 
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
G
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
|
A
A
|
A
C
x
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
x
I
D
 
E
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
A
 
R
G
 
A
V
 
L
A
 
S
E
 
D
G
 
D
A
 
Q
R
 
R
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
A
A
 
G
F
 
I
K
 
L
S
 
A
A
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
D
 
Q
D
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
x
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:253/255 of query aligns to 1:242/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
K
 
N
L
 
F
K
 
E
N
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
F
 
T
D
 
A
M
x
T
N
 
S
V
 
E
E
 
N
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
V
 
I
A
 
S
D
 
D
E
 
Y
I
 
L
K
 
G
A
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
K
A
 
G
F
 
L
K
 
M
C
 
L
N
|
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
A
 
A
E
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
K
A
 
I
E
 
R
A
 
A
A
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
I
 
V
A
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
K
 
R
T
 
M
V
 
K
P
 
D
A
 
E
E
|
E
W
 
W
D
 
N
K
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
A
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
Y
 
H
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
G
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
G
G
 
G
E
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
T
x
I
D
 
E
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
A
 
R
G
 
A
V
 
L
A
 
S
E
 
D
G
 
D
A
 
Q
R
 
R
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
A
A
 
G
F
 
I
K
 
L
S
 
A
A
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
D
 
Q
D
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
x
E
V
x
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
38% identity, 97% coverage: 7:253/255 of query aligns to 5:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
T
 
S
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
S
G
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
S
T
 
I
C
 
A
R
 
L
R
 
Q
F
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
K
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
-
 
N
F
 
Y
D
 
A
M
 
G
N
 
S
V
 
K
E
 
E
A
 
K
A
 
A
Q
 
E
R
 
A
V
 
V
A
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
K
G
 
G
G
 
V
I
 
D
A
 
S
Q
 
F
A
 
A
F
 
I
K
 
Q
C
 
A
N
 
N
I
 
V
T
 
A
D
 
D
R
 
A
A
 
D
E
 
E
V
 
V
D
 
K
A
 
A
A
 
M
V
 
I
A
 
K
A
 
E
A
 
V
E
 
V
A
 
S
A
 
Q
L
 
F
G
 
G
P
 
S
I
 
L
A
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
W
 
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
K
 
R
T
 
M
V
 
K
P
 
E
A
 
Q
E
 
E
W
 
W
D
 
D
K
 
D
L
 
V
I
 
I
A
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
F
H
 
N
M
 
C
H
 
I
H
 
Q
A
 
K
V
 
A
L
 
T
P
 
P
G
 
Q
M
 
M
A
 
L
E
 
R
R
 
Q
K
 
R
Y
 
S
G
 
G
H
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
L
A
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
A
G
 
V
G
 
G
S
 
N
S
 
P
G
 
G
E
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
C
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
-
T
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
F
L
 
I
L
 
V
A
 
S
G
 
D
V
 
M
A
 
T
E
 
D
G
 
A
A
 
L
R
 
S
D
 
D
P
 
E
A
 
L
K
 
K
L
 
-
I
 
-
E
 
E
A
 
Q
F
 
M
K
 
L
S
 
T
A
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
 
D
D
 
T
D
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
T
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
A
 
K
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
I
 
I
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 2:242/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
L
 
F
K
 
E
N
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
F
A
 
V
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
F
 
T
D
 
A
M
x
T
N
 
S
V
 
E
E
 
S
A
 
G
A
 
A
Q
 
E
R
 
A
V
 
I
A
 
S
D
 
G
E
 
Y
I
 
L
K
 
G
A
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
K
A
 
G
F
 
F
K
 
M
C
 
L
N
|
N
I
x
V
T
 
K
D
 
D
R
 
A
A
 
Q
E
 
S
V
 
I
D
 
D
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
S
A
 
I
E
 
R
A
 
A
A
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
I
 
I
A
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
K
 
R
T
 
M
V
 
K
P
 
D
A
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
E
K
 
D
L
 
I
I
 
L
A
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
C
G
 
A
M
 
M
A
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
Y
 
F
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
 
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
G
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
Y
T
 
I
D
 
E
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
A
 
R
G
 
A
V
 
L
A
 
T
E
 
D
G
 
D
A
 
Q
R
 
R
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
A
A
 
G
F
 
I
K
 
L
S
 
S
A
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
N
R
 
R
L
 
P
G
 
G
Q
 
D
P
 
A
D
 
K
D
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
G
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
36% identity, 98% coverage: 2:252/255 of query aligns to 3:259/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
K
 
K
K
 
L
L
 
L
K
 
D
N
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
A
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
 
L
A
 
E
T
 
I
C
 
A
R
 
K
R
 
K
F
 
F
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
S
D
|
D
M
|
M
N
 
N
V
 
A
E
 
E
A
 
K
A
 
C
Q
 
Q
R
 
E
V
 
T
A
 
A
D
 
N
E
 
S
I
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
G
 
F
I
 
D
A
 
A
Q
 
L
A
 
S
F
 
A
K
 
P
C
 
C
N
x
D
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
E
A
 
D
E
 
A
V
 
Y
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
E
A
 
L
A
 
T
E
 
Q
A
 
K
A
 
T
L
 
F
G
 
G
P
 
T
I
 
V
A
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
 
F
D
x
Q
V
 
H
F
 
V
K
 
A
P
 
P
F
 
I
V
 
E
K
 
E
T
 
F
V
 
P
P
 
T
A
 
A
E
 
V
W
 
F
D
 
Q
K
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
Q
I
 
V
N
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
F
H
 
I
M
 
G
H
 
I
H
 
K
A
 
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
M
A
 
K
E
 
A
R
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
M
A
|
A
S
|
S
D
 
I
A
x
N
A
 
G
R
 
L
G
 
I
G
 
G
S
 
F
S
 
A
G
 
G
E
x
K
A
 
A
V
 
G
Y
|
Y
A
 
N
A
 
S
C
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
V
L
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
E
H
 
C
A
 
A
R
 
R
Q
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
L
C
 
C
P
|
P
G
|
G
P
 
Y
T
x
V
D
 
D
T
|
T
A
 
P
L
|
L
L
 
V
A
 
R
G
 
G
-
x
Q
V
 
I
A
 
A
E
 
D
G
 
L
A
 
A
R
 
K
D
 
T
-
 
R
-
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
L
P
 
D
A
 
S
K
 
A
L
 
L
I
 
E
E
 
D
A
 
V
F
 
I
K
 
L
S
 
A
A
 
M
I
 
V
P
 
P
L
 
Q
G
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
L
Q
 
S
P
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
D
A
 
Y
I
 
A
V
 
I
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
S
D
 
K
A
 
A
A
 
G
F
 
G
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
I
 
V
S
 
V
V
 
M
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
36% identity, 98% coverage: 2:252/255 of query aligns to 2:258/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
K
 
K
K
 
L
L
 
L
K
 
D
N
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
A
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
 
L
A
 
E
T
 
I
C
 
A
R
 
K
R
 
K
F
 
F
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
S
D
|
D
M
|
M
N
 
N
V
 
A
E
 
E
A
 
K
A
 
C
Q
 
Q
R
 
E
V
 
T
A
 
A
D
 
N
E
 
S
I
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
G
 
F
I
 
D
A
 
A
Q
 
L
A
 
S
F
 
A
K
 
P
C
 
C
N
x
D
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
E
A
 
D
E
 
A
V
 
Y
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
E
A
 
L
A
 
T
E
 
Q
A
 
K
A
 
T
L
 
F
G
 
G
P
 
T
I
 
V
A
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
 
F
D
x
Q
V
 
H
F
 
V
K
 
A
P
 
P
F
 
I
V
 
E
K
 
E
T
 
F
V
 
P
P
 
T
A
 
A
E
 
V
W
 
F
D
 
Q
K
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
Q
I
 
V
N
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
F
H
 
I
M
 
G
H
 
I
H
 
K
A
 
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
M
A
 
K
E
 
A
R
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
M
A
|
A
S
|
S
D
 
I
A
 
N
A
 
G
R
 
L
G
 
I
G
 
G
S
 
F
S
 
A
G
 
G
E
x
K
A
 
A
V
 
G
Y
|
Y
A
 
N
A
 
S
C
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
V
L
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
E
H
 
C
A
 
A
R
 
R
Q
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
P
x
Y
T
x
V
D
 
D
T
|
T
A
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
R
G
 
G
-
x
Q
V
 
I
A
 
A
E
 
D
G
 
L
A
 
A
R
 
K
D
 
T
-
 
R
-
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
L
P
 
D
A
 
S
K
 
A
L
 
L
I
 
E
E
 
D
A
 
V
F
 
I
K
 
L
S
 
A
A
 
M
I
 
V
P
 
P
L
 
Q
G
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
L
Q
 
S
P
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
D
A
 
Y
I
 
A
V
 
I
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
S
D
 
K
A
 
A
A
 
G
F
 
G
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
I
 
V
S
 
V
V
 
M
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:253/255 of query aligns to 1:242/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
K
 
N
L
 
F
K
 
E
N
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
F
 
T
D
x
A
M
x
T
N
 
S
V
 
E
E
 
N
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
V
 
I
A
 
S
D
 
D
E
 
Y
I
 
L
K
 
G
A
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
K
A
 
G
F
 
L
K
 
M
C
x
L
N
|
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
A
 
A
E
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
K
A
 
I
E
 
R
A
 
A
A
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
I
 
V
A
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
K
 
R
T
 
M
V
 
K
P
 
D
A
 
E
E
 
E
W
 
W
D
 
N
K
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
 
M
A
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
Y
 
H
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
G
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
G
G
 
G
E
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
x
F
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
E
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
A
 
R
G
 
A
V
 
L
A
 
S
E
 
D
G
 
D
A
 
Q
R
 
R
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
A
A
 
G
F
 
I
K
 
L
S
 
A
A
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
D
 
Q
D
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

9febA Short-chain dehydrogenase/reductase (sdr) from thermus caliditerrae in complex with NADP
37% identity, 100% coverage: 2:255/255 of query aligns to 4:261/261 of 9febA

query
sites
9febA
K
 
K
K
 
S
L
 
L
K
 
V
N
 
G
K
 
K
T
 
H
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
L
A
 
T
V
 
L
F
 
V
D
 
A
M
x
R
N
x
K
V
 
L
E
 
Q
A
 
D
A
 
L
Q
 
E
R
 
E
V
 
R
A
 
V
D
 
E
E
 
R
I
 
L
K
 
R
A
 
A
A
 
W
G
 
T
G
 
E
I
 
V
A
 
-
Q
 
Q
A
 
G
F
 
E
K
 
V
C
 
G
N
x
D
I
 
V
T
 
A
D
 
D
R
 
P
A
 
Q
E
 
A
V
 
M
D
 
E
A
 
S
A
 
L
V
 
V
A
 
H
A
 
R
A
 
A
E
 
Q
A
 
E
A
 
R
L
 
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
A
 
A
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
W
 
F
D
x
V
V
 
L
F
 
T
K
 
A
P
 
P
F
 
F
V
 
L
K
 
E
T
 
I
V
 
N
P
 
E
A
 
E
E
 
L
W
 
W
D
 
Q
K
 
R
L
 
H
I
 
I
A
 
E
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
G
G
 
A
A
 
A
L
 
Y
H
 
R
M
 
L
H
 
I
H
 
R
A
 
L
V
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
A
 
L
E
 
E
R
 
M
K
 
G
Y
 
W
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
S
S
 
S
D
 
T
A
 
A
A
 
G
R
 
L
G
 
T
G
 
G
S
 
Y
S
 
P
G
 
Y
E
 
A
A
 
V
V
 
P
Y
 
Y
A
 
C
A
 
A
C
 
A
K
 
K
G
 
H
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
L
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
Q
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
T
D
 
D
T
 
T
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
G
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
R
V
 
V
A
 
A
E
 
Q
-
 
R
G
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
A
P
 
P
A
 
E
K
 
A
L
 
V
I
 
L
E
 
E
A
 
L
F
 
F
K
 
A
S
 
R
A
 
R
I
 
N
P
 
P
L
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
V
Q
 
R
P
 
P
D
 
E
D
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
W
A
 
A
I
 
V
V
 
V
F
 
W
F
 
L
G
 
C
S
 
S
D
 
E
D
 
K
A
 
A
A
 
A
F
 
A
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
I
 
I
S
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
E
T
 
V
M
 
M
H
 
V
G
 
G

9fe6B Short-chain dehydrogenase/reductase (sdr) from thermus caliditerrae
37% identity, 100% coverage: 2:255/255 of query aligns to 4:261/261 of 9fe6B

query
sites
9fe6B
K
 
K
K
 
S
L
 
L
K
 
V
N
 
G
K
 
K
T
 
H
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
S
G
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
L
A
 
T
V
 
L
F
 
V
D
 
A
M
 
R
N
 
K
V
x
L
E
 
Q
A
 
D
A
 
L
Q
 
E
R
 
E
V
 
R
A
 
V
D
 
E
E
 
R
I
 
L
K
x
R
A
 
A
A
 
W
G
 
T
G
 
E
I
x
V
A
 
-
Q
 
Q
A
x
G
F
 
E
K
 
V
C
 
G
N
 
D
I
 
V
T
 
A
D
 
D
R
 
P
A
 
Q
E
 
A
V
 
M
D
 
E
A
 
S
A
 
L
V
 
V
A
 
H
A
 
R
A
 
A
E
 
Q
A
 
E
A
x
R
L
 
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
A
 
A
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
W
 
F
D
 
V
V
 
L
F
 
T
K
 
A
P
 
P
F
 
F
V
 
L
K
 
E
T
 
I
V
 
N
P
 
E
A
 
E
E
 
L
W
 
W
D
 
Q
K
 
R
L
 
H
I
 
I
A
 
E
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
G
G
 
A
A
 
A
L
 
Y
H
 
R
M
 
L
H
 
I
H
 
R
A
 
L
V
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
A
 
L
E
 
E
R
 
M
K
 
G
Y
 
W
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
S
S
 
S
D
 
T
A
 
A
A
 
G
R
 
L
G
 
T
G
 
G
S
 
Y
S
 
P
G
 
Y
E
 
A
A
 
V
V
 
P
Y
 
Y
A
 
C
A
 
A
C
 
A
K
 
K
G
 
H
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
L
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
Q
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
T
D
 
D
T
 
T
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
G
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
R
V
 
V
A
 
A
E
 
Q
-
 
R
G
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
A
P
 
P
A
 
E
K
 
A
L
 
V
I
 
L
E
 
E
A
 
L
F
 
F
K
 
A
S
 
R
A
 
R
I
 
N
P
 
P
L
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
V
Q
 
R
P
 
P
D
 
E
D
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
W
A
 
A
I
 
V
V
 
V
F
 
W
F
 
L
G
 
C
S
 
S
D
 
E
D
 
K
A
 
A
A
 
A
F
 
A
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
I
 
I
S
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
E
T
 
V
M
 
M
H
 
V
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:253/255 of query aligns to 2:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
T
 
S
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
G
 
R
A
 
S
T
 
I
C
 
A
R
 
L
R
 
Q
F
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
K
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
-
x
N
F
x
Y
D
x
A
M
x
G
N
x
S
V
 
K
E
 
E
A
 
K
A
 
A
Q
 
E
R
 
A
V
 
V
A
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
K
G
 
G
G
 
V
I
 
D
A
 
S
Q
 
F
A
 
A
F
 
I
K
 
Q
C
x
A
N
|
N
I
x
V
T
 
A
D
 
D
R
 
A
A
 
D
E
 
E
V
 
V
D
 
K
A
 
A
A
 
M
V
 
I
A
 
K
A
 
E
A
 
V
E
 
V
A
 
S
A
 
Q
L
 
F
G
 
G
P
 
S
I
 
L
A
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
W
 
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
K
 
R
T
 
M
V
 
K
P
 
E
A
 
Q
E
 
E
W
 
W
D
 
D
K
 
D
L
 
V
I
 
I
A
 
D
I
x
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
F
H
 
N
M
 
C
H
 
I
H
 
Q
A
 
K
V
 
A
L
 
T
P
 
P
G
 
Q
M
 
M
A
 
L
E
 
R
R
 
Q
K
 
R
Y
 
S
G
 
G
H
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
L
A
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
A
G
 
V
G
 
G
S
 
N
S
 
P
G
 
G
E
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
C
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
T
 
I
D
 
V
T
 
S
A
 
D
L
 
M
L
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
T
A
 
D
K
 
E
L
 
L
I
 
K
E
 
E
A
 
Q
F
 
M
K
 
L
S
 
T
A
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
 
D
D
 
T
D
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
T
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
A
 
K
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
I
 
I
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 3:243/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
L
 
F
K
 
E
N
 
G
K
 
K
T
 
I
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
S
G
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
T
F
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
F
 
T
D
 
A
M
 
T
N
 
S
V
 
E
E
 
N
A
 
G
A
 
A
Q
 
K
R
 
N
V
 
I
A
 
S
D
 
D
E
 
Y
I
 
L
K
 
G
A
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
K
A
 
G
F
 
L
K
 
M
C
 
L
N
 
N
I
 
V
T
 
T
D
 
D
R
 
P
A
 
A
E
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
I
E
 
R
A
 
A
A
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
E
I
 
V
A
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
W
 
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
K
 
R
T
 
M
V
 
K
P
 
D
A
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
N
K
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
G
 
A
M
|
M
A
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
Y
 
C
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
 
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
G
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
E
T
 
T
A
 
D
L
 
M
L
 
T
A
 
R
G
 
A
V
 
L
A
 
S
E
 
D
G
 
D
A
 
Q
R
 
R
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
A
A
 
G
F
 
I
K
 
L
S
 
A
A
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
D
 
Q
D
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
x
A
S
|
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:253/255 of query aligns to 5:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
K
 
N
L
 
L
K
 
E
N
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
G
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
G
 
K
A
 
A
T
 
I
C
 
A
R
 
E
R
 
L
F
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
F
 
T
D
 
A
M
x
T
N
 
S
V
 
E
E
 
S
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
V
 
I
A
 
S
D
 
D
E
 
Y
I
 
L
K
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
D
I
 
N
A
 
G
Q
 
K
A
 
G
F
 
M
K
 
A
C
 
L
N
|
N
I
x
V
T
 
T
D
 
N
R
 
P
A
 
E
E
 
S
V
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
I
E
 
T
A
 
D
A
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
G
I
 
V
A
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
K
 
R
T
 
M
V
 
K
P
 
E
A
 
E
E
 
E
W
 
W
D
 
S
K
 
D
L
 
I
I
 
M
A
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
A
 
I
L
 
F
H
 
R
M
 
L
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
R
G
 
G
M
 
M
A
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
Y
 
Q
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
|
V
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
G
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
F
S
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
T
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
T
x
I
D
 
E
T
|
T
A
 
D
L
x
M
L
 
T
A
 
K
G
 
A
V
 
L
A
 
N
E
 
D
G
 
E
A
 
Q
R
 
R
D
 
T
P
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
A
F
 
T
K
 
L
S
 
A
A
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
P
 
P
D
 
R
D
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
F
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
P
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
Y
M
 
M

A7IQH5 2-(S)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase 3; S-HPCDH 3; 2-[(S)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase 3; Aliphatic epoxide carboxylation component IV; Epoxide carboxylase component IV; SHPCDH3; EC 1.1.1.269 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 2 papers)
39% identity, 88% coverage: 29:252/255 of query aligns to 30:253/255 of A7IQH5

query
sites
A7IQH5
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
F
 
I
D
|
D
M
 
L
N
 
D
V
 
Q
E
 
G
A
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
V
 
S
A
 
A
D
 
A
E
 
M
I
 
L
K
 
S
A
 
T
A
 
G
G
 
G
G
 
A
I
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
G
F
 
F
K
 
G
C
 
A
N
x
D
I
x
V
T
 
T
D
 
K
R
 
A
A
 
A
E
 
D
V
 
I
D
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
T
A
 
S
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
A
 
T
L
 
I
G
 
G
P
 
S
I
 
L
A
 
T
V
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
W
 
I
D
 
A
V
 
G
F
 
F
K
 
G
P
 
S
F
 
V
V
 
H
K
 
D
T
 
A
V
 
D
P
 
A
A
 
A
E
 
A
W
 
W
D
 
D
K
 
R
L
 
I
I
 
M
A
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
T
L
 
F
H
 
L
M
 
A
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
A
G
 
G
M
 
M
A
 
L
E
 
E
R
 
R
K
 
H
Y
 
K
G
 
G
H
 
T
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
F
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
A
A
 
G
R
 
L
G
 
V
G
 
G
S
 
I
S
 
P
G
 
T
E
 
M
A
 
A
V
 
A
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
N
L
 
L
S
 
T
K
 
R
T
 
Q
L
 
M
A
 
A
R
 
A
E
 
D
H
 
Y
A
 
S
R
 
G
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
P
 
-
T
|
T
D
x
V
T
|
T
A
x
S
L
x
T
L
x
G
A
 
M
G
 
G
V
 
Q
A
 
Q
E
 
L
G
 
L
A
 
G
R
 
S
D
 
D
P
 
T
A
 
S
K
 
P
L
 
E
I
 
V
E
 
Q
A
 
A
F
 
R
K
x
R
S
 
L
A
 
A
-
x
K
I
x
Y
P
 
P
L
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
E
A
 
A
I
 
V
V
 
I
F
 
F
F
 
L
G
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
A
I
 
F
S
 
A
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

4ituA Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) bound to s-hpc and nadh (see paper)
39% identity, 88% coverage: 29:252/255 of query aligns to 28:251/253 of 4ituA

query
sites
4ituA
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
F
 
I
D
|
D
M
x
L
N
 
D
V
 
Q
E
 
G
A
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
V
 
S
A
 
A
D
 
A
E
 
M
I
 
L
K
 
S
A
 
T
A
 
G
G
 
G
G
 
A
I
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
G
F
 
F
K
 
G
C
 
A
N
x
D
I
x
V
T
 
T
D
 
K
R
 
A
A
 
A
E
 
D
V
 
I
D
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
T
A
 
S
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
A
 
T
L
 
I
G
 
G
P
 
S
I
 
L
A
 
T
V
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
W
 
I
D
 
A
V
 
G
F
 
F
K
 
G
P
 
S
F
 
V
V
 
H
K
 
D
T
 
A
V
 
D
P
 
A
A
 
A
E
 
A
W
 
W
D
 
D
K
 
R
L
 
I
I
 
M
A
 
A
I
x
V
N
|
N
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
T
L
 
F
H
 
L
M
 
A
H
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
A
G
 
G
M
 
M
A
 
L
E
 
E
R
 
R
K
 
H
Y
 
K
G
 
G
H
 
T
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
F
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
A
A
 
G
R
 
L
G
 
V
G
 
G
S
 
I
S
 
P
G
 
T
E
 
M
A
 
A
V
 
A
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
N
L
 
L
S
 
T
K
 
R
T
 
Q
L
 
M
A
 
A
R
 
A
E
 
D
H
 
Y
A
 
S
R
 
G
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
C
 
C
P
|
P
G
 
G
P
 
-
T
|
T
D
x
V
T
 
T
A
 
S
L
x
T
L
 
G
A
x
M
G
 
G
V
 
Q
A
 
Q
E
 
L
G
 
L
A
 
G
R
 
S
D
 
D
P
 
T
A
 
S
K
 
P
L
 
E
I
 
V
E
 
Q
A
 
A
F
 
R
K
x
R
S
 
L
A
 
A
-
 
K
I
x
Y
P
 
P
L
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
E
A
 
A
I
 
V
V
 
I
F
 
F
F
 
L
G
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
A
I
 
F
S
 
A
V
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

4k6fB X-ray crystal structure of a putative acetoacetyl-coa reductase from burkholderia cenocepacia bound to the co-factor NADP
35% identity, 97% coverage: 7:254/255 of query aligns to 2:245/245 of 4k6fB

query
sites
4k6fB
K
 
R
T
 
I
V
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
M
G
 
G
G
|
G
I
 
L
G
 
G
G
 
E
A
 
A
T
 
V
C
 
S
R
 
I
R
 
R
F
 
L
A
 
N
A
 
D
E
 
A
G
 
G
A
 
H
K
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
V
-
 
T
F
x
Y
D
x
S
M
 
P
N
 
N
V
x
N
E
 
T
A
 
G
A
 
A
Q
 
D
R
 
R
V
 
W
A
 
L
D
 
T
E
 
E
I
 
M
K
 
H
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
R
I
 
E
A
 
F
Q
 
H
A
 
A
F
 
Y
K
 
P
C
x
V
N
x
D
I
x
V
T
 
A
D
 
D
R
 
H
A
 
D
E
 
S
V
 
C
D
 
Q
A
 
Q
A
 
C
V
 
I
A
 
E
A
 
K
A
 
I
E
 
V
A
 
R
A
 
D
L
 
V
G
 
G
P
 
P
I
 
V
A
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
D
 
T
V
 
R
F
 
D
K
 
M
P
 
T
F
 
L
V
 
R
K
 
K
T
 
L
V
 
D
P
 
K
A
 
V
E
x
N
W
 
W
D
 
D
K
 
A
L
 
V
I
 
I
A
 
R
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
D
G
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
N
M
 
M
H
 
T
H
 
K
A
 
P
V
 
V
L
 
C
P
 
D
G
 
G
M
 
M
A
 
V
E
 
E
R
 
R
K
 
G
Y
 
W
G
 
G
H
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
N
A
 
G
R
 
S
G
 
K
G
 
G
S
 
S
S
 
V
G
 
G
E
 
Q
A
 
T
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
M
V
 
H
A
 
G
L
 
F
S
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
L
E
 
E
H
 
I
A
 
A
R
 
R
Q
 
K
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
T
V
 
V
C
 
S
P
 
P
G
 
G
P
 
Y
T
 
L
D
 
A
T
 
T
A
 
K
L
 
M
L
 
V
A
 
T
G
 
A
V
 
I
A
 
P
E
 
Q
G
 
D
A
 
I
R
 
L
D
 
D
P
 
T
A
 
K
K
 
I
L
 
L
I
 
P
E
 
Q
A
 
-
F
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
-
I
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
D
 
E
D
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
L
I
 
V
V
 
A
F
 
Y
F
 
L
G
 
C
S
 
S
D
 
E
D
 
E
A
 
A
A
 
G
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
N
I
 
I
S
 
A
V
 
I
S
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
Q
T
 
H
M
 
M
H
 
H

Query Sequence

>WP_011801510.1 NCBI__GCF_000015505.1:WP_011801510.1
MKKLKNKTVIVTGGGGGIGGATCRRFAAEGAKVAVFDMNVEAAQRVADEIKAAGGIAQAF
KCNITDRAEVDAAVAAAEAALGPIAVLVNNAGWDVFKPFVKTVPAEWDKLIAINLTGALH
MHHAVLPGMAERKYGHIVNVASDAARGGSSGEAVYAACKGGLVALSKTLAREHARQGITV
NVVCPGPTDTALLAGVAEGARDPAKLIEAFKSAIPLGRLGQPDDLASAIVFFGSDDAAFI
TGQVISVSGGLTMHG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory