SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011813799.1 NCBI__GCF_000015585.1:WP_011813799.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P12282 Molybdopterin-synthase adenylyltransferase; MoaD protein adenylase; Molybdopterin-converting factor subunit 1 adenylase; Sulfur carrier protein MoaD adenylyltransferase; EC 2.7.7.80 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
48% identity, 99% coverage: 1:245/247 of query aligns to 4:249/249 of P12282

query
sites
P12282
M
 
L
N
 
S
D
 
D
E
 
Q
Q
 
E
L
 
M
M
 
L
R
 
R
Y
 
Y
S
 
N
R
|
R
Q
 
Q
I
 
I
M
 
I
L
 
L
P
 
R
E
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
F
T
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
D
S
 
S
R
 
R
A
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
x
C
P
 
A
V
 
A
A
 
S
L
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
A
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
N
L
 
L
R
 
T
I
 
L
A
 
L
D
 
D
D
 
F
D
 
D
V
 
T
V
 
V
D
 
S
L
 
L
S
 
S
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
R
|
R
Q
 
Q
I
 
T
A
 
L
H
 
H
R
 
S
Q
 
D
D
 
A
A
 
T
L
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
K
 
K
A
 
V
A
 
E
S
 
S
A
 
A
T
 
R
R
 
D
A
 
A
V
 
L
T
 
T
A
 
R
R
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
H
I
 
I
T
 
A
V
 
I
T
 
T
P
 
P
L
 
V
E
 
N
E
 
A
R
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
D
E
 
A
R
 
E
L
 
L
G
 
A
A
 
A
E
 
L
V
 
I
G
 
A
A
 
E
A
 
H
D
 
D
V
 
L
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
x
C
T
 
T
D
|
D
N
 
N
F
 
V
A
 
A
T
 
V
R
 
R
F
 
N
A
 
Q
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
G
C
|
C
V
 
F
A
 
A
A
 
A
H
 
K
R
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
S
 
S
A
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
I
R
 
R
W
 
M
E
 
E
L
 
G
Q
 
Q
V
 
I
S
 
T
A
 
V
F
 
F
-
 
T
R
 
Y
P
 
Q
G
 
D
G
 
G
R
 
E
P
 
P
C
|
C
Y
 
Y
R
 
R
C
|
C
I
 
L
Y
 
S
A
 
R
E
 
L
G
 
F
D
 
G
E
 
E
P
 
N
Q
 
A
L
 
L
T
 
T
C
|
C
S
 
V
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
M
G
 
A
P
 
P
L
 
L
P
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
I
G
 
G
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
M
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
M
L
 
L
T
 
A
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
T
 
K
P
 
P
L
 
A
F
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
I
L
 
V
V
 
M
V
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
M
R
 
T
M
x
C
R
 
Q
L
 
F
R
 
R
T
 
E
L
 
M
T
 
K
V
 
L
N
 
M
G
 
R
D
 
N
P
 
P
H
 
G
C
|
C
P
 
E
V
 
V
C
|
C
A
 
G
E
 
Q

1jwbB Structure of the covalent acyl-adenylate form of the moeb-moad protein complex (see paper)
47% identity, 98% coverage: 1:243/247 of query aligns to 3:239/240 of 1jwbB

query
sites
1jwbB
M
 
L
N
 
S
D
 
D
E
 
Q
Q
 
E
L
 
M
M
 
L
R
 
R
Y
 
Y
S
 
N
R
|
R
Q
 
Q
I
 
I
M
 
I
L
 
L
P
 
R
E
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
F
T
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
D
S
 
S
R
 
R
A
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
V
G
|
G
A
 
L
G
|
G
G
|
G
L
 
L
G
 
G
S
 
C
P
 
A
V
 
A
A
 
S
L
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
A
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
N
L
 
L
R
 
T
I
 
L
A
 
L
D
|
D
D
x
F
D
 
D
V
 
T
V
 
V
D
 
S
L
 
L
S
 
S
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
I
 
T
A
 
L
H
 
H
R
 
S
Q
 
D
D
 
A
A
 
T
L
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
K
|
K
A
 
V
A
 
E
S
 
S
A
 
A
T
 
R
R
 
D
A
 
A
V
 
L
T
 
T
A
 
R
R
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
H
I
 
I
T
 
A
V
 
I
T
 
T
P
 
P
L
 
V
E
 
N
E
 
A
R
x
L
L
 
L
D
 
D
G
 
D
E
 
A
R
 
E
L
 
L
G
 
A
A
 
A
E
 
L
V
 
I
G
 
A
A
 
E
A
 
H
D
 
D
V
 
L
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
x
C
T
|
T
D
|
D
N
|
N
F
 
V
A
 
A
T
x
V
R
 
R
F
 
N
A
 
Q
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
G
C
 
C
V
 
F
A
 
A
A
 
A
H
 
K
R
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
S
 
S
A
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
I
R
 
R
W
 
M
E
 
E
L
 
G
Q
 
Q
V
 
I
S
 
T
A
 
V
F
 
F
-
 
T
R
 
Y
P
 
Q
G
 
D
G
 
G
R
 
E
P
 
P
C
|
C
Y
 
Y
R
 
R
C
 
C
I
 
L
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
-
Q
 
S
L
 
R
T
 
L
C
 
F
S
 
G
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
M
G
 
A
P
 
P
L
 
L
P
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
I
G
 
G
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
M
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
M
L
 
L
T
 
A
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
T
 
K
P
 
P
L
 
A
F
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
I
L
 
V
V
 
M
V
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
M
R
 
T
M
 
C
R
 
Q
L
 
F
R
 
R
T
 
E
L
 
M
T
 
K
V
 
L
N
 
M
G
 
R
D
 
N
P
 
P
H
 
G
C
|
C
P
 
E
V
 
V
C
|
C

1jw9B Structure of the native moeb-moad protein complex (see paper)
47% identity, 98% coverage: 1:243/247 of query aligns to 3:239/240 of 1jw9B

query
sites
1jw9B
M
 
L
N
 
S
D
 
D
E
 
Q
Q
 
E
L
 
M
M
 
L
R
 
R
Y
 
Y
S
 
N
R
|
R
Q
 
Q
I
 
I
M
 
I
L
 
L
P
 
R
E
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
F
T
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
D
S
 
S
R
 
R
A
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
C
P
 
A
V
 
A
A
 
S
L
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
A
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
N
L
 
L
R
 
T
I
 
L
A
 
L
D
 
D
D
 
F
D
 
D
V
 
T
V
 
V
D
 
S
L
 
L
S
 
S
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
I
 
T
A
 
L
H
 
H
R
 
S
Q
 
D
D
 
A
A
 
T
L
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
K
 
K
A
 
V
A
 
E
S
 
S
A
 
A
T
 
R
R
 
D
A
 
A
V
 
L
T
 
T
A
 
R
R
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
H
I
 
I
T
 
A
V
 
I
T
 
T
P
 
P
L
 
V
E
 
N
E
 
A
R
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
D
E
 
A
R
 
E
L
 
L
G
 
A
A
 
A
E
 
L
V
 
I
G
 
A
A
 
E
A
 
H
D
 
D
V
 
L
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
C
T
 
T
D
|
D
N
 
N
F
 
V
A
 
A
T
 
V
R
 
R
F
 
N
A
 
Q
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
G
C
 
C
V
 
F
A
 
A
A
 
A
H
 
K
R
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
S
 
S
A
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
I
R
 
R
W
 
M
E
 
E
L
 
G
Q
 
Q
V
 
I
S
 
T
A
 
V
F
 
F
-
 
T
R
 
Y
P
 
Q
G
 
D
G
 
G
R
 
E
P
 
P
C
|
C
Y
 
Y
R
 
R
C
 
C
I
 
L
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
-
Q
 
S
L
 
R
T
 
L
C
 
F
S
 
G
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
M
G
 
A
P
 
P
L
 
L
P
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
I
G
 
G
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
M
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
M
L
 
L
T
 
A
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
T
 
K
P
 
P
L
 
A
F
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
I
L
 
V
V
 
M
V
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
M
R
 
T
M
 
C
R
 
Q
L
 
F
R
 
R
T
 
E
L
 
M
T
 
K
V
 
L
N
 
M
G
 
R
D
 
N
P
 
P
H
 
G
C
|
C
P
 
E
V
 
V
C
|
C

1zfnA Structural analysis of escherichia coli thif (see paper)
47% identity, 98% coverage: 1:243/247 of query aligns to 1:243/244 of 1zfnA

query
sites
1zfnA
M
 
M
N
 
N
D
 
D
E
 
R
Q
 
D
L
 
F
M
 
M
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
|
R
Q
 
Q
I
 
I
M
 
L
L
 
L
P
 
D
E
 
D
L
 
I
D
 
A
I
 
L
T
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
Q
R
 
K
L
 
L
A
 
L
A
 
D
S
 
S
R
 
Q
A
 
V
L
 
L
I
 
I
V
x
I
G
|
G
A
 
L
G
|
G
G
|
G
L
 
L
G
 
G
S
 
T
P
 
P
V
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
L
R
 
V
I
 
L
A
 
A
D
|
D
D
 
D
D
 
D
V
 
D
V
 
V
D
 
H
L
 
L
S
 
S
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
R
|
R
Q
|
Q
I
 
I
A
 
L
H
 
F
R
 
T
Q
 
T
D
 
E
A
 
D
L
 
I
G
 
D
Q
 
R
P
 
P
K
|
K
A
 
S
A
 
Q
S
 
V
A
 
S
T
 
Q
R
 
Q
A
 
R
V
 
L
T
 
T
A
 
Q
R
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
D
I
 
I
T
 
Q
V
 
L
T
 
T
P
 
A
L
 
L
E
 
Q
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
D
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
D
E
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
R
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
C
T
|
T
D
|
D
N
 
N
F
 
M
A
 
A
T
|
T
R
 
R
F
 
Q
A
 
E
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
C
 
C
V
 
V
A
 
A
A
 
L
H
 
N
R
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
I
S
 
T
A
 
A
A
 
S
V
 
A
I
 
V
R
 
G
W
 
F
E
 
G
L
 
G
Q
 
Q
V
 
L
S
 
M
A
 
V
F
 
L
R
 
T
-
 
P
P
 
P
G
 
W
G
 
E
R
 
Q
P
 
G
C
|
C
Y
 
Y
R
 
R
C
|
C
I
 
L
Y
 
W
A
 
P
E
 
D
G
 
N
D
 
Q
E
 
E
P
 
P
Q
 
E
L
 
R
T
 
N
C
 
C
S
 
R
E
 
T
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
V
G
 
G
P
 
P
L
 
V
P
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
M
G
 
G
S
 
T
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
L
L
 
L
T
 
S
G
 
G
A
 
I
G
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
-
F
 
A
G
 
G
R
 
E
L
 
L
L
 
R
V
 
L
V
 
F
D
 
D
A
 
G
L
 
K
R
 
S
M
 
S
R
 
Q
L
 
W
R
 
R
T
 
S
L
 
L
T
 
A
V
 
L
N
 
R
G
 
R
D
 
A
P
 
S
H
 
G
C
|
C
P
 
P
V
 
V
C
|
C

P30138 Sulfur carrier protein ThiS adenylyltransferase; EC 2.7.7.73 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
47% identity, 98% coverage: 1:243/247 of query aligns to 1:243/251 of P30138

query
sites
P30138
M
 
M
N
 
N
D
 
D
E
 
R
Q
 
D
L
 
F
M
 
M
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
M
 
L
L
 
L
P
 
D
E
 
D
L
 
I
D
 
A
I
 
L
T
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
Q
R
 
K
L
 
L
A
 
L
A
 
D
S
 
S
R
 
Q
A
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
I
G
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
T
P
 
P
V
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
L
R
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
D
D
 
D
D
 
D
V
 
D
V
 
V
D
 
H
L
 
L
S
 
S
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
A
 
L
H
 
F
R
 
T
Q
 
T
D
 
E
A
 
D
L
 
I
G
 
D
Q
 
R
P
 
P
K
 
K
A
 
S
A
 
Q
S
 
V
A
 
S
T
 
Q
R
 
Q
A
 
R
V
 
L
T
 
T
A
 
Q
R
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
D
I
 
I
T
 
Q
V
 
L
T
 
T
P
 
A
L
 
L
E
 
Q
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
D
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
D
E
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
R
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
C
T
 
T
D
 
D
N
 
N
F
 
M
A
 
A
T
 
T
R
 
R
F
 
Q
A
 
E
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
C
 
C
V
 
V
A
 
A
A
 
L
H
 
N
R
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
I
S
 
T
A
 
A
A
 
S
V
 
A
I
 
V
R
 
G
W
 
F
E
 
G
L
 
G
Q
 
Q
V
 
L
S
 
M
A
 
V
F
 
L
R
 
T
-
 
P
P
 
P
G
 
W
G
 
E
R
 
Q
P
 
G
C
|
C
Y
 
Y
R
 
R
C
|
C
I
 
L
Y
x
W
A
 
P
E
 
D
G
 
N
D
 
Q
E
 
E
P
 
P
Q
 
E
L
 
R
T
 
N
C
|
C
S
 
R
E
 
T
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
V
G
 
G
P
 
P
L
 
V
P
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
M
G
 
G
S
 
T
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
L
L
 
L
T
 
S
G
 
G
A
 
I
G
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
-
F
 
A
G
 
G
R
 
E
L
 
L
L
 
R
V
 
L
V
 
F
D
 
D
A
 
G
L
 
K
R
 
S
M
 
S
R
 
Q
L
 
W
R
 
R
T
 
S
L
 
L
T
 
A
V
 
L
N
 
R
G
 
R
D
 
A
P
 
S
H
 
G
C
|
C
P
 
P
V
 
V
C
|
C

D4GSF3 SAMP-activating enzyme E1; Ubiquitin-like activating enzyme of archaea; Ubl-activating enzyme; EC 2.7.7.- from Haloferax volcanii (strain ATCC 29605 / DSM 3757 / JCM 8879 / NBRC 14742 / NCIMB 2012 / VKM B-1768 / DS2) (Halobacterium volcanii) (see paper)
48% identity, 98% coverage: 5:245/247 of query aligns to 9:250/270 of D4GSF3

query
sites
D4GSF3
Q
 
Q
L
 
L
M
 
D
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
Q
 
H
I
 
I
M
 
I
L
 
M
P
 
D
E
 
E
L
 
V
D
 
G
I
 
P
T
 
E
G
 
G
Q
 
Q
E
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
L
A
 
S
S
 
S
R
 
R
A
 
V
L
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
A
P
 
P
V
 
A
A
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
L
R
 
V
I
 
V
A
 
V
D
 
D
D
 
D
D
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
E
L
 
R
S
 
S
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
I
 
V
A
 
V
H
 
H
R
 
C
Q
 
D
D
 
D
A
 
D
L
 
V
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
K
 
K
A
 
A
A
 
E
S
 
S
A
 
A
T
 
A
R
 
A
A
 
F
V
 
V
T
 
R
A
 
G
R
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
D
I
 
V
T
 
S
V
 
V
T
 
E
P
 
P
L
 
V
E
 
E
E
 
A
R
 
R
L
 
V
D
 
D
G
 
K
E
 
S
R
 
N
L
 
V
G
 
H
A
 
E
E
 
V
V
 
V
G
 
A
A
 
G
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
V
D
 
D
A
 
A
T
 
S
D
 
D
N
 
N
F
 
F
A
 
P
T
 
T
R
 
R
F
 
Y
A
 
L
L
 
L
N
 
N
A
 
D
A
 
V
C
 
C
V
 
R
A
 
F
A
 
E
H
 
G
R
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
V
S
 
H
A
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
Y
R
 
K
W
 
F
E
 
E
L
 
G
Q
 
Q
V
 
A
S
 
T
A
 
T
F
 
L
R
 
V
P
 
P
G
 
D
G
 
G
R
 
-
P
 
P
C
 
C
Y
 
Y
R
 
R
C
 
C
I
 
L
Y
 
F
A
 
P
E
 
E
G
 
A
D
 
P
E
 
E
P
 
P
Q
 
G
L
 
T
T
 
V
-
 
P
-
 
D
C
|
C
S
 
A
E
 
T
S
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
T
A
 
V
G
 
G
S
 
C
L
 
I
E
 
Q
A
 
A
V
 
T
E
 
E
A
 
A
I
 
M
K
 
K
I
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
D
A
 
E
G
 
G
T
 
E
P
 
A
L
 
L
F
 
D
G
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
F
V
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
M
R
 
D
M
 
M
R
 
T
L
 
F
R
 
E
T
 
T
L
 
V
T
 
P
V
 
Y
N
 
R
G
 
T
D
 
N
P
 
P
H
 
D
C
 
C
P
 
P
V
 
V
C
 
C
A
 
G
E
 
E

1zud3 Structure of this-thif protein complex (see paper)
46% identity, 98% coverage: 1:243/247 of query aligns to 1:238/240 of 1zud3

query
sites
1zud3
M
 
M
N
 
N
D
 
D
E
 
R
Q
 
D
L
 
F
M
 
M
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
|
R
Q
 
Q
I
 
I
M
x
L
L
 
L
P
x
D
E
 
D
L
 
I
D
 
A
I
 
L
T
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
Q
R
 
K
L
 
L
A
 
L
A
 
D
S
 
S
R
 
Q
A
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
I
G
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
T
P
 
P
V
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
L
R
 
V
I
 
L
A
 
A
D
 
D
D
 
D
D
 
D
V
 
D
V
 
V
D
 
H
L
 
L
S
 
S
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
A
 
L
H
 
F
R
 
T
Q
 
T
D
 
E
A
 
D
L
 
I
G
 
D
Q
 
R
P
 
P
K
 
K
A
 
S
A
 
Q
S
 
V
A
 
S
T
 
Q
R
 
Q
A
 
R
V
 
L
T
 
T
A
 
Q
R
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
D
I
 
I
T
 
Q
V
 
L
T
 
T
P
 
A
L
 
L
E
 
Q
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
D
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
D
E
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
R
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
C
T
 
T
D
|
D
N
 
N
F
 
M
A
 
A
T
 
T
R
 
R
F
 
Q
A
 
E
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
C
 
C
V
 
V
A
 
A
A
 
L
H
 
N
R
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
I
S
 
T
A
 
A
A
 
S
V
 
A
I
 
V
R
 
G
W
 
F
E
 
G
L
 
G
Q
 
Q
V
 
L
S
 
M
A
 
V
F
 
L
R
 
T
-
 
P
P
 
P
G
 
W
G
 
E
R
 
Q
P
 
G
C
|
C
Y
 
Y
R
 
R
C
 
C
I
 
L
Y
 
W
A
 
P
E
 
D
G
 
N
D
 
Q
E
 
E
P
 
P
Q
 
-
L
 
-
T
 
-
C
 
-
S
 
-
E
 
T
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
V
G
 
G
P
 
P
L
 
V
P
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
M
G
 
G
S
 
T
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
L
L
 
L
T
 
S
G
 
G
A
 
I
G
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
-
F
 
A
G
 
G
R
 
E
L
 
L
L
 
R
V
 
L
V
 
F
D
 
D
A
 
G
L
 
K
R
 
S
M
 
S
R
 
Q
L
 
W
R
 
R
T
 
S
L
 
L
T
 
A
V
 
L
N
 
R
G
 
R
D
 
A
P
 
S
H
 
G
C
|
C
P
 
P
V
 
V
C
|
C

1jwaB Structure of the atp-bound moeb-moad protein complex (see paper)
44% identity, 95% coverage: 1:234/247 of query aligns to 3:215/217 of 1jwaB

query
sites
1jwaB
M
 
L
N
 
S
D
 
D
E
 
Q
Q
 
E
L
 
M
M
 
L
R
 
R
Y
 
Y
S
 
N
R
|
R
Q
 
Q
I
 
I
M
 
I
L
 
L
P
 
R
E
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
F
T
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
D
S
 
S
R
 
R
A
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
L
G
|
G
G
|
G
L
 
L
G
 
G
S
 
C
P
 
A
V
 
A
A
 
S
L
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
A
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
N
L
 
L
R
 
T
I
 
L
A
 
L
D
|
D
D
x
F
D
 
D
V
 
T
V
 
V
D
 
S
L
 
L
S
 
S
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
R
|
R
Q
 
Q
I
 
T
A
 
L
H
 
H
R
 
S
Q
 
D
D
 
A
A
 
T
L
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
K
|
K
A
 
V
A
 
E
S
 
S
A
 
A
T
 
R
R
 
D
A
 
A
V
 
L
T
 
T
A
 
R
R
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
H
I
 
I
T
 
A
V
 
I
T
 
T
P
 
P
L
 
V
E
 
N
E
 
A
R
x
L
L
 
L
D
 
D
G
 
D
E
 
A
R
 
E
L
 
L
G
 
A
A
 
A
E
 
L
V
 
I
G
 
A
A
 
E
A
 
H
D
 
D
V
 
L
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
C
T
 
T
D
|
D
N
|
N
F
 
V
A
 
A
T
x
V
R
 
R
F
 
N
A
 
Q
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
G
C
 
C
V
 
F
A
 
A
A
 
A
H
 
K
R
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
S
 
S
A
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
I
R
 
R
W
 
M
E
 
E
L
 
G
Q
 
Q
V
 
I
S
 
T
A
 
V
F
 
F
R
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
C
 
-
Y
 
-
R
 
-
C
 
-
I
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
-
Q
 
-
L
 
-
T
 
-
C
 
T
S
 
Y
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
M
G
 
A
P
 
P
L
 
L
P
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
I
G
 
G
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
M
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
M
L
 
L
T
 
A
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
T
 
K
P
 
P
L
 
A
F
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
I
L
 
V
V
 
M
V
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
M
R
 
T
M
 
C
R
 
Q
L
 
F
R
 
R
T
 
E
L
 
M
T
 
K
V
 
L

Q9VLJ8 Adenylyltransferase and sulfurtransferase MOCS3; Molybdenum cofactor synthesis protein 3; Ubiquitin activating enzyme 4; EC 2.7.7.80; EC 2.8.1.11 from Drosophila melanogaster (Fruit fly) (see paper)
39% identity, 100% coverage: 1:247/247 of query aligns to 64:313/453 of Q9VLJ8

query
sites
Q9VLJ8
M
 
L
N
 
T
D
 
N
E
 
D
Q
 
D
L
 
I
M
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
Q
 
Q
I
 
L
M
 
I
L
 
L
P
 
P
E
 
D
L
 
F
D
 
G
I
 
V
T
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
E
 
L
R
 
K
L
 
L
A
 
K
A
 
N
S
 
S
R
 
S
A
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
C
P
 
P
V
 
A
A
 
A
L
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
C
G
 
G
E
 
H
L
 
L
R
 
G
I
 
L
A
 
V
D
 
D
D
 
Y
D
 
D
V
 
E
V
 
V
D
 
E
L
 
R
S
 
S
N
 
N
L
 
F
Q
 
H
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
A
 
L
H
 
H
R
 
S
Q
 
E
D
 
D
A
 
R
L
 
C
G
 
G
Q
 
M
P
 
S
K
 
K
A
 
A
A
 
E
S
 
S
A
 
A
T
 
R
R
 
I
A
 
A
V
 
L
T
 
L
A
 
E
R
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
H
I
 
C
T
 
E
V
 
I
T
 
Q
P
 
C
L
 
H
E
 
S
E
 
R
R
 
M
L
 
L
D
 
Y
G
 
P
E
 
H
R
 
N
L
 
A
G
 
M
A
 
H
E
 
I
V
 
I
G
 
R
A
 
G
A
 
Y
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
C
T
 
T
D
 
D
N
 
N
F
 
V
A
 
P
T
 
T
R
 
R
F
 
Y
A
 
L
L
 
L
N
 
S
A
 
D
A
 
A
C
 
C
V
 
V
A
 
M
A
 
L
H
 
S
R
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
V
S
 
S
A
 
G
A
 
S
V
 
A
I
 
L
R
 
K
W
 
M
E
 
D
L
 
G
Q
 
Q
V
 
L
S
 
T
A
 
V
F
 
Y
R
 
N
P
 
Y
G
 
A
G
 
N
R
 
G
P
 
P
C
 
C
Y
 
Y
R
 
R
C
 
C
I
 
I
Y
 
F
A
 
P
E
 
V
G
 
P
D
 
P
E
 
P
P
 
P
Q
 
E
-
 
A
-
 
V
L
 
T
T
 
N
C
 
C
S
 
G
E
 
D
S
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
A
L
 
V
P
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
I
G
 
G
S
 
A
L
 
M
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
V
L
 
I
T
 
V
G
 
G
A
 
M
G
 
G
T
 
D
P
 
V
L
 
L
F
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
I
V
 
F
D
 
D
A
 
G
L
 
G
R
 
S
M
 
G
R
 
V
L
 
F
R
 
R
T
 
N
L
 
I
T
 
R
V
 
I
N
 
R
G
 
S
D
 
K
-
 
R
P
 
P
H
 
N
C
 
C
P
 
H
V
 
M
C
 
C
A
 
S
E
 
A
A
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Q72J02 Sulfur carrier protein adenylyltransferase; E1-like protein TtuC; Sulfur carrier protein MoaD adenylyltransferase; Sulfur carrier protein ThiS adenylyltransferase; Sulfur carrier protein TtuB adenylyltransferase; tRNA two-thiouridine-synthesizing protein C; EC 2.7.7.80; EC 2.7.7.73; EC 2.7.7.- from Thermus thermophilus (strain ATCC BAA-163 / DSM 7039 / HB27) (see paper)
43% identity, 100% coverage: 2:247/247 of query aligns to 4:256/271 of Q72J02

query
sites
Q72J02
N
 
T
D
 
K
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
M
 
D
R
 
R
Y
 
Y
S
 
H
R
 
R
Q
 
Q
I
 
M
M
 
I
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
L
 
V
D
 
G
I
 
P
T
 
E
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
R
S
 
A
R
 
S
A
 
V
L
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
L
L
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
G
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
R
L
 
V
R
 
G
I
 
V
A
 
V
D
 
E
D
 
M
D
 
D
V
 
R
V
 
V
D
 
E
L
 
V
S
 
S
N
 
N
L
 
L
Q
 
H
R
 
R
Q
 
Q
I
 
V
A
 
L
H
 
Y
R
 
T
Q
 
T
D
 
E
A
 
D
L
 
V
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
A
 
A
A
 
L
S
 
V
A
 
A
T
 
Q
R
 
K
A
 
R
V
 
L
T
 
Q
A
 
A
R
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
L
I
 
V
T
 
R
V
 
V
T
 
E
P
 
A
L
 
Y
E
 
P
E
 
V
R
 
R
L
 
L
D
 
T
G
 
S
E
 
E
R
 
N
L
 
A
G
 
L
A
 
E
E
 
I
V
 
L
G
 
R
A
 
P
A
 
Y
D
 
D
V
 
L
V
 
V
I
 
V
D
 
D
A
 
A
T
 
S
D
 
D
N
 
N
F
 
F
A
 
P
T
 
T
R
 
R
F
 
Y
A
 
L
L
 
V
N
 
N
A
 
D
A
 
A
C
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
L
H
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
V
S
 
F
A
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
Y
R
 
Q
W
 
F
E
 
D
L
 
G
Q
 
Q
V
 
V
S
 
A
A
 
V
F
 
F
R
 
H
P
 
H
G
 
P
G
 
T
R
 
L
-
 
H
-
 
G
-
 
E
-
 
M
-
 
G
P
 
P
C
 
C
Y
 
Y
R
 
R
C
 
C
I
 
L
Y
 
F
-
 
P
-
 
K
-
 
P
-
 
P
A
 
P
E
 
P
G
 
G
D
 
A
E
 
V
P
 
P
Q
 
-
L
 
-
T
 
S
C
|
C
S
 
A
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
F
G
 
G
P
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
A
V
 
V
A
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
L
E
 
M
A
 
A
V
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
L
K
 
K
I
 
V
L
 
L
T
 
L
G
 
G
A
 
I
G
 
G
T
 
K
P
 
P
L
 
L
F
 
A
G
 
G
R
 
H
L
 
L
L
 
L
V
 
L
V
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
E
M
 
A
R
 
S
L
 
F
R
 
R
T
 
K
L
 
L
T
 
T
V
 
V
N
 
R
G
 
R
D
 
N
P
 
P
H
 
R
C
 
C
P
 
P
V
 
V
C
 
C
A
 
G
E
 
D
A
 
E
P
 
P

Sites not aligning to the query:

O95396 Adenylyltransferase and sulfurtransferase MOCS3; Molybdenum cofactor synthesis protein 3; Molybdopterin synthase sulfurylase; MPT synthase sulfurylase; EC 2.7.7.80; EC 2.8.1.11 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
43% identity, 100% coverage: 1:247/247 of query aligns to 55:304/460 of O95396

query
sites
O95396
M
 
L
N
 
S
D
 
R
E
 
D
Q
 
E
L
 
I
M
 
L
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
Q
 
Q
I
 
L
M
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
L
D
 
G
I
 
V
T
 
H
G
 
G
Q
 
Q
E
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
T
S
 
A
R
 
C
A
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
C
P
 
P
V
 
L
A
 
A
L
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
R
L
 
L
R
 
G
I
 
L
A
 
V
D
 
D
D
 
Y
D
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
E
L
 
M
S
 
S
N
 
N
L
 
L
Q
 
A
R
 
R
Q
 
Q
I
 
V
A
 
L
H
 
H
R
 
G
Q
 
E
D
 
A
A
 
L
L
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
F
S
 
S
A
 
A
T
 
A
R
 
A
A
 
S
V
 
L
T
 
R
A
 
R
R
 
L
N
 
N
P
 
S
E
 
A
I
 
V
T
 
E
V
 
C
T
 
V
P
 
P
L
 
Y
E
x
T
E
x
Q
R
x
A
L
|
L
D
x
T
G
x
P
E
x
A
R
x
T
L
x
A
G
x
L
A
x
D
E
x
L
V
|
V
G
x
R
A
x
R
A
x
Y
D
|
D
V
|
V
V
|
V
I
x
A
D
|
D
A
x
C
T
x
S
D
|
D
N
|
N
F
x
V
A
x
P
T
|
T
R
|
R
F
x
Y
A
x
L
L
x
V
N
|
N
A
x
D
A
|
A
C
|
C
V
|
V
A
x
L
A
|
A
H
x
G
R
|
R
P
|
P
L
|
L
V
|
V
S
|
S
A
|
A
A
x
S
V
x
A
I
x
L
R
|
R
W
x
F
E
|
E
L
x
G
Q
|
Q
V
x
I
S
x
T
A
x
V
F
x
Y
R
x
H
P
x
Y
G
x
D
G
|
G
R
x
G
P
|
P
C
|
C
Y
|
Y
R
|
R
C
|
C
I
|
I
Y
x
F
A
x
P
E
x
Q
G
x
P
D
x
P
-
x
P
-
x
A
E
|
E
P
x
T
Q
x
V
L
x
T
T
x
N
C
|
C
S
 
A
E
 
D
S
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
V
L
 
V
P
 
T
G
 
G
V
 
V
A
 
L
G
 
G
S
 
C
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
E
 
E
A
 
V
I
 
L
K
 
K
I
 
I
L
 
A
T
 
A
G
 
G
A
 
L
G
 
G
T
 
P
P
 
S
L
 
Y
F
 
S
G
 
G
R
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
L
V
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
R
M
 
G
R
 
H
L
 
F
-
 
R
R
 
S
T
 
I
L
 
R
T
 
L
V
 
R
N
 
S
G
 
R
D
 
R
P
 
L
H
 
D
C
 
C
P
 
A
V
 
A
C
 
C
A
 
G
E
 
E
A
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

O59954 Adenylyltransferase and sulfurtransferase uba4; Common component for nitrate reductase and xanthine dehydrogenase protein F; Ubiquitin-like protein activator 4; EC 2.7.7.80; EC 2.8.1.11 from Emericella nidulans (strain FGSC A4 / ATCC 38163 / CBS 112.46 / NRRL 194 / M139) (Aspergillus nidulans) (see paper)
37% identity, 99% coverage: 1:244/247 of query aligns to 61:319/482 of O59954

query
sites
O59954
M
 
L
N
 
H
D
 
G
E
 
E
Q
 
E
L
 
Y
M
 
R
R
 
R
Y
 
Y
S
 
G
R
 
R
Q
 
Q
I
 
M
M
 
I
L
 
V
P
 
P
E
 
Q
L
 
F
D
 
G
I
 
L
T
 
Q
G
|
G
Q
 
Q
E
 
L
R
 
K
L
 
L
A
 
R
A
 
D
S
 
A
R
 
K
A
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
|
G
S
 
C
P
 
P
V
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
I
R
 
G
I
 
L
A
 
V
D
 
D
D
 
G
D
 
D
V
 
T
V
 
V
D
 
E
L
 
A
S
 
S
N
 
N
L
 
L
Q
 
H
R
|
R
Q
 
Q
I
 
V
A
 
L
H
 
H
R
 
R
Q
 
S
D
 
R
A
 
N
L
 
V
G
 
G
Q
 
K
P
 
L
K
 
K
A
 
V
A
 
D
S
 
S
A
 
A
T
 
I
R
 
E
A
 
Y
V
 
L
T
 
R
A
 
E
R
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
H
I
 
P
T
 
T
V
 
Y
T
 
I
P
 
A
L
 
H
E
 
Q
E
 
A
R
 
H
L
 
L
D
 
T
G
 
P
E
 
R
R
 
E
L
 
A
G
 
P
A
 
D
E
 
I
V
 
F
G
 
K
A
 
D
A
 
Y
D
 
D
V
 
L
V
 
I
I
 
L
D
 
D
A
x
C
T
 
T
D
 
D
N
 
N
F
 
P
A
 
A
T
 
T
R
 
R
F
 
Y
A
 
L
L
 
I
N
 
S
A
 
D
A
 
T
C
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
L
H
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
S
V
 
A
I
 
L
R
 
R
W
 
T
E
|
E
L
 
G
Q
 
Q
V
 
L
S
 
M
A
 
V
F
 
L
R
 
N
-
 
N
-
 
P
-
 
P
-
 
Q
-
 
P
P
 
P
G
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
T
G
 
G
R
 
G
P
 
P
C
 
C
Y
 
Y
R
 
R
C
 
C
I
 
V
Y
 
F
A
 
P
E
 
K
G
 
P
D
 
P
E
 
P
P
 
A
Q
 
N
-
 
S
-
 
V
L
 
T
T
 
S
C
 
C
S
 
A
E
 
D
S
 
G
G
 
G
V
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
P
L
 
V
P
 
V
G
|
G
V
 
T
A
 
M
G
 
G
S
 
V
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
E
P
 
S
L
 
V
F
 
E
G
 
A
-
 
T
-
 
P
-
 
P
R
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
I
V
 
F
D
 
S
A
 
A
L
 
Y
R
 
S
M
 
S
-
 
P
R
 
Q
L
 
F
R
 
R
T
 
T
L
 
I
T
 
K
V
 
L
N
 
R
G
 
S
-
 
R
D
 
R
P
 
P
H
 
N
C
 
C
P
 
A
V
 
V
C
 
C
A
 
S

6yubB Crystal structure of uba4 from chaetomium thermophilum (see paper)
38% identity, 84% coverage: 1:208/247 of query aligns to 7:212/289 of 6yubB

query
sites
6yubB
M
 
L
N
 
S
D
 
K
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
M
 
E
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
Q
 
Q
I
 
M
M
 
I
L
 
V
P
 
P
E
 
G
L
 
M
D
 
G
I
 
K
T
 
E
G
 
G
Q
 
Q
E
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
M
A
 
N
S
 
A
R
 
K
A
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
C
P
 
P
V
 
A
A
 
A
L
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
I
R
 
G
I
 
I
A
 
V
D
 
D
D
 
G
D
 
D
V
 
S
V
 
V
D
 
E
L
 
T
S
 
S
N
 
N
L
 
L
Q
 
H
R
 
R
Q
 
Q
I
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
A
Q
 
T
D
 
K
A
 
R
L
 
V
G
 
G
Q
 
M
P
 
L
K
 
K
A
 
V
A
 
D
S
 
S
A
 
L
T
 
I
R
 
T
A
 
H
V
 
L
T
 
I
A
 
E
R
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
L
I
 
P
T
 
V
V
 
Y
T
 
V
P
 
P
L
 
Y
E
 
R
E
 
F
R
 
D
L
 
L
D
 
T
G
 
P
E
 
Q
R
 
N
L
 
A
G
 
A
A
 
Q
E
 
I
V
 
I
G
 
K
A
 
P
A
 
W
D
 
D
V
 
V
V
 
I
I
 
L
D
 
D
A
 
C
T
 
T
D
 
D
N
 
N
F
 
P
A
 
A
T
 
T
R
 
R
F
 
Y
A
 
L
L
 
I
N
 
S
A
 
D
A
 
V
C
 
C
V
 
V
A
 
L
A
 
L
H
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
S
I
 
V
R
 
Q
W
 
K
E
 
S
L
 
G
Q
 
Q
V
 
L
S
 
I
A
 
V
F
 
L
R
 
N
-
 
C
-
 
P
-
 
P
-
 
T
P
 
P
G
 
Q
G
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
N
-
 
K
-
 
K
-
 
A
R
 
A
P
 
P
C
|
C
Y
 
Y
R
 
R
C
|
C
I
 
C
Y
 
F
A
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
-
Q
 
-
L
 
-
T
 
-
C
 
-
S
 
-
E
 
-
S
 
K
G
 
G
V
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
V
P
 
V
G
 
G
V
 
M
A
 
M
G
 
G
S
 
V
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
V
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
I
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6yubA Crystal structure of uba4 from chaetomium thermophilum (see paper)
38% identity, 84% coverage: 1:208/247 of query aligns to 6:213/423 of 6yubA

query
sites
6yubA
M
 
L
N
 
S
D
 
K
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
M
 
E
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
Q
 
Q
I
 
M
M
 
I
L
 
V
P
 
P
E
 
G
L
 
M
D
 
G
I
 
K
T
 
E
G
 
G
Q
 
Q
E
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
M
A
 
N
S
 
A
R
 
K
A
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
C
P
 
P
V
 
A
A
 
A
L
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
T
L
 
I
R
 
G
I
 
I
A
 
V
D
 
D
D
 
G
D
 
D
V
 
S
V
 
V
D
 
E
L
 
T
S
 
S
N
 
N
L
 
L
Q
 
H
R
 
R
Q
 
Q
I
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
A
Q
 
T
D
 
K
A
 
R
L
 
V
G
 
G
Q
 
M
P
 
L
K
 
K
A
 
V
A
 
D
S
 
S
A
 
L
T
 
I
R
 
T
A
 
H
V
 
L
T
 
I
A
 
E
R
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
L
I
 
P
T
 
V
V
 
Y
T
 
V
P
 
P
L
 
Y
E
 
R
E
 
F
R
 
D
L
 
L
D
 
T
G
 
P
E
 
Q
R
 
N
L
 
A
G
 
A
A
 
Q
E
 
I
V
 
I
G
 
K
A
 
P
A
 
W
D
 
D
V
 
V
V
 
I
I
 
L
D
 
D
A
 
C
T
 
T
D
 
D
N
 
N
F
 
P
A
 
A
T
 
T
R
 
R
F
 
Y
A
 
L
L
 
I
N
 
S
A
 
D
A
 
V
C
 
C
V
 
V
A
 
L
A
 
L
H
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
S
I
 
V
R
 
Q
W
 
K
E
 
S
L
 
G
Q
 
Q
V
 
L
S
 
I
A
 
V
F
 
L
R
 
N
-
 
C
-
 
P
-
 
P
-
 
T
P
 
P
G
 
Q
G
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
N
-
 
K
-
 
K
-
 
A
R
 
A
P
 
P
C
|
C
Y
 
Y
R
 
R
C
|
C
I
 
C
Y
 
F
A
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
-
Q
 
-
L
 
-
T
 
-
C
 
-
S
 
K
E
 
K
S
 
P
G
 
G
V
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
V
P
 
V
G
 
G
V
 
M
A
 
M
G
 
G
S
 
V
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
V
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
I
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P38820 Adenylyltransferase and sulfurtransferase UBA4; Needs CLA4 to survive protein 3; Ubiquitin-like protein activator 4; EC 2.7.7.-; EC 2.8.1.- from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 4 papers)
37% identity, 85% coverage: 4:213/247 of query aligns to 42:255/440 of P38820

query
sites
P38820
E
 
E
Q
 
E
L
 
Y
M
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
S
 
G
R
 
R
Q
 
Q
I
 
M
M
 
I
L
 
V
P
 
E
E
 
E
L
 
T
D
 
G
-
 
G
I
 
V
T
 
A
G
 
G
Q
 
Q
E
 
V
R
 
K
L
 
L
A
 
K
A
 
N
S
 
T
R
 
K
A
 
V
L
 
L
I
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
C
P
 
P
V
 
A
A
 
L
L
 
P
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
R
 
G
I
 
I
A
 
V
D
 
D
D
 
N
D
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
E
L
 
T
S
 
S
N
 
N
L
 
L
Q
 
H
R
 
R
Q
 
Q
I
 
V
A
 
L
H
 
H
R
 
D
Q
 
S
D
 
S
A
 
R
L
 
V
G
 
G
Q
 
M
P
 
L
K
 
K
A
 
C
A
 
E
S
 
S
A
 
A
T
 
R
R
 
Q
A
 
Y
V
 
I
T
 
T
A
 
K
R
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
H
I
 
I
T
 
N
V
 
V
T
 
V
P
 
T
L
 
Y
E
 
P
E
 
V
R
 
R
L
 
L
D
 
N
G
 
S
E
 
S
R
 
N
L
 
A
G
 
F
A
 
D
E
 
I
V
 
F
G
 
K
A
 
G
A
 
Y
D
 
N
V
 
Y
V
 
I
I
 
L
D
 
D
A
 
C
T
 
T
D
 
D
N
 
S
F
 
P
A
 
L
T
 
T
R
 
R
F
 
Y
A
 
L
L
 
V
N
 
S
A
 
D
A
 
V
C
 
A
V
 
V
A
 
N
A
 
L
H
 
G
R
 
I
P
 
T
L
 
V
V
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
S
V
 
G
I
 
L
R
 
G
W
 
T
E
 
E
L
 
G
Q
 
Q
V
 
L
S
 
T
-
 
I
-
 
L
A
 
N
F
 
F
R
 
N
P
 
N
G
 
I
G
 
G
R
 
-
P
 
P
C
 
C
Y
 
Y
R
 
R
C
 
C
I
 
F
Y
 
Y
A
 
P
E
 
T
G
 
P
D
 
P
E
 
P
P
 
P
Q
 
N
-
 
A
-
 
V
L
 
T
T
 
S
C
|
C
S
 
Q
E
 
E
S
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
C
P
 
I
G
 
G
V
 
L
A
 
V
G
 
G
S
 
T
L
 
M
E
 
M
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
T
I
 
L
K
 
K
I
 
L
L
 
I
T
 
L
G
 
G
A
 
I
G
 
Y
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3h9jA Crystal structure of e. Coli mccb + ampcpp + semet mcca (see paper)
25% identity, 98% coverage: 2:243/247 of query aligns to 85:337/339 of 3h9jA

query
sites
3h9jA
N
 
N
D
 
S
E
 
T
Q
 
E
L
 
N
M
 
N
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
Q
 
N
I
 
F
M
 
L
L
 
H
P
 
Y
E
 
Q
L
 
S
D
 
Y
-
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
P
I
 
V
T
 
L
G
 
V
Q
 
Q
E
 
D
R
 
K
L
 
L
A
 
K
A
 
N
S
 
A
R
 
K
A
 
V
L
 
V
I
 
I
V
 
L
G
 
G
A
 
C
G
|
G
G
|
G
L
 
I
G
 
G
S
 
N
P
 
H
V
 
V
A
 
S
L
 
V
Y
 
I
L
 
L
G
 
A
A
 
T
A
 
S
G
 
G
V
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
I
R
 
I
I
 
L
A
 
I
D
|
D
D
 
N
D
|
D
V
 
Q
V
 
I
D
 
E
L
 
N
S
 
T
N
 
N
L
 
L
Q
 
T
R
|
R
Q
 
Q
I
 
V
A
 
L
H
 
F
R
 
S
Q
 
E
D
 
D
A
 
D
L
 
V
G
 
G
Q
 
K
P
 
N
K
|
K
A
 
T
A
 
E
S
 
V
A
 
I
T
 
K
R
 
R
A
 
E
V
 
L
T
 
L
A
 
K
R
 
R
N
 
N
P
 
S
E
 
E
I
 
I
T
 
S
V
 
V
T
 
S
P
 
E
L
 
I
E
 
A
E
 
L
R
x
N
L
x
I
D
 
N
G
 
D
E
 
Y
R
 
T
L
 
D
G
 
L
A
 
H
E
 
K
V
 
V
G
 
P
A
 
E
A
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
W
I
 
V
D
 
V
A
 
S
T
x
A
D
|
D
N
x
H
-
 
P
F
 
F
A
 
N
T
 
L
R
 
I
F
 
N
A
 
W
L
 
V
N
 
N
A
 
K
A
 
Y
C
 
C
V
 
V
A
 
R
A
 
A
H
 
N
R
 
Q
P
 
P
L
 
Y
V
 
I
S
 
N
A
 
A
A
 
G
V
 
Y
I
 
V
R
 
N
W
 
-
E
 
D
L
 
I
Q
 
A
V
 
V
S
 
F
A
 
G
-
 
P
-
 
L
F
 
Y
R
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
K
R
 
T
P
 
G
C
|
C
Y
 
Y
R
 
E
C
 
C
I
 
Q
Y
 
K
A
 
K
E
 
E
G
 
N
D
 
I
E
 
D
P
 
H
Q
 
K
L
 
I
T
 
K
C
 
L
S
 
I
E
 
N
S
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
K
-
 
P
G
 
A
V
 
T
L
 
F
G
 
A
P
 
P
L
 
V
P
 
N
G
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
A
S
 
A
L
 
L
E
 
C
A
 
A
V
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
I
K
 
K
I
 
F
L
 
I
T
 
G
G
 
K
A
 
Y
G
 
S
T
 
E
P
 
P
L
 
L
-
 
S
F
 
L
G
 
N
R
 
K
L
x
R
L
 
I
V
x
G
V
 
I
D
 
W
A
 
S
L
 
D
R
 
E
M
 
I
R
 
K
L
 
I
R
 
H
T
 
S
L
 
Q
T
 
N
V
 
M
N
 
G
G
 
R
D
 
S
P
 
P
H
 
V
C
|
C
P
 
S
V
 
V
C
|
C

3h5nA Crystal structure of e. Coli mccb + atp (see paper)
25% identity, 98% coverage: 2:243/247 of query aligns to 85:337/338 of 3h5nA

query
sites
3h5nA
N
 
N
D
 
S
E
 
T
Q
 
E
L
 
N
M
 
N
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
Q
 
N
I
 
F
M
 
L
L
 
H
P
 
Y
E
 
Q
L
 
S
D
 
Y
-
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
P
I
 
V
T
 
L
G
 
V
Q
 
Q
E
 
D
R
 
K
L
 
L
A
 
K
A
 
N
S
 
A
R
 
K
A
 
V
L
 
V
I
 
I
V
 
L
G
 
G
A
 
C
G
|
G
G
 
G
L
 
I
G
 
G
S
 
N
P
 
H
V
 
V
A
 
S
L
 
V
Y
 
I
L
 
L
G
 
A
A
 
T
A
 
S
G
 
G
V
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
I
R
 
I
I
 
L
A
 
I
D
|
D
D
 
N
D
 
D
V
 
Q
V
 
I
D
 
E
L
 
N
S
 
T
N
|
N
L
 
L
Q
 
T
R
|
R
Q
|
Q
I
 
V
A
 
L
H
 
F
R
 
S
Q
 
E
D
 
D
A
 
D
L
 
V
G
 
G
Q
 
K
P
 
N
K
|
K
A
 
T
A
 
E
S
 
V
A
 
I
T
 
K
R
 
R
A
 
E
V
 
L
T
 
L
A
 
K
R
 
R
N
 
N
P
 
S
E
 
E
I
 
I
T
 
S
V
 
V
T
 
S
P
 
E
L
 
I
E
 
A
E
 
L
R
x
N
L
x
I
D
 
N
G
 
D
E
 
Y
R
 
T
L
 
D
G
 
L
A
 
H
E
 
K
V
 
V
G
 
P
A
 
E
A
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
W
I
 
V
D
 
V
A
 
S
T
x
A
D
|
D
N
x
H
-
 
P
F
 
F
A
 
N
T
 
L
R
 
I
F
 
N
A
 
W
L
 
V
N
 
N
A
 
K
A
 
Y
C
 
C
V
 
V
A
 
R
A
 
A
H
 
N
R
 
Q
P
 
P
L
 
Y
V
 
I
S
 
N
A
 
A
A
 
G
V
 
Y
I
 
V
R
 
N
W
 
-
E
 
D
L
 
I
Q
 
A
V
 
V
S
 
F
A
 
G
-
 
P
-
 
L
F
 
Y
R
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
K
R
 
T
P
 
G
C
|
C
Y
 
Y
R
 
E
C
|
C
I
 
Q
Y
 
K
A
 
K
E
 
E
G
 
N
D
 
I
E
 
D
P
 
H
Q
 
K
L
 
I
T
 
K
C
 
L
S
 
I
E
 
N
S
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
K
-
 
P
G
 
A
V
 
T
L
 
F
G
 
A
P
 
P
L
 
V
P
 
N
G
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
A
S
 
A
L
 
L
E
 
C
A
 
A
V
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
I
K
 
K
I
 
F
L
 
I
T
 
G
G
 
K
A
 
Y
G
 
S
T
 
E
P
 
P
L
 
L
-
 
S
F
 
L
G
 
N
R
 
K
L
 
R
L
 
I
V
 
G
V
 
I
D
 
W
A
 
S
L
 
D
R
 
E
M
 
I
R
 
K
L
 
I
R
 
H
T
 
S
L
 
Q
T
 
N
V
 
M
N
 
G
G
 
R
D
 
S
P
 
P
H
 
V
C
|
C
P
 
S
V
 
V
C
|
C

3h5rA Crystal structure of e. Coli mccb + succinimide (see paper)
25% identity, 98% coverage: 2:243/247 of query aligns to 85:338/340 of 3h5rA

query
sites
3h5rA
N
 
N
D
 
S
E
 
T
Q
 
E
L
 
N
M
 
N
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
Q
 
N
I
 
F
M
 
L
L
 
H
P
 
Y
E
 
Q
L
 
S
D
 
Y
-
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
P
I
 
V
T
 
L
G
 
V
Q
 
Q
E
 
D
R
 
K
L
 
L
A
 
K
A
 
N
S
 
A
R
 
K
A
 
V
L
 
V
I
 
I
V
 
L
G
 
G
A
 
C
G
 
G
G
 
G
L
x
I
G
 
G
S
 
N
P
 
H
V
 
V
A
 
S
L
 
V
Y
 
I
L
 
L
G
 
A
A
 
T
A
 
S
G
 
G
V
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
I
R
 
I
I
 
L
A
 
I
D
 
D
D
 
N
D
 
D
V
 
Q
V
 
I
D
 
E
L
 
N
S
 
T
N
 
N
L
 
L
Q
 
T
R
|
R
Q
 
Q
I
 
V
A
 
L
H
 
F
R
 
S
Q
 
E
D
 
D
A
 
D
L
 
V
G
 
G
Q
 
K
P
 
N
K
 
K
A
 
T
A
 
E
S
 
V
A
 
I
T
 
K
R
 
R
A
 
E
V
 
L
T
 
L
A
 
K
R
 
R
N
 
N
P
 
S
E
 
E
I
 
I
T
 
S
V
 
V
T
 
S
P
 
E
L
 
I
E
 
A
E
 
L
R
 
N
L
 
I
D
 
N
G
 
D
E
 
Y
R
 
T
L
 
D
G
 
L
A
 
H
E
 
K
V
 
V
G
 
P
A
 
E
A
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
W
I
 
V
D
 
V
A
x
S
T
x
A
D
 
D
N
 
H
-
 
P
F
 
F
A
 
N
T
 
L
R
 
I
F
 
N
A
 
W
L
 
V
N
 
N
A
 
K
A
 
Y
C
 
C
V
 
V
A
 
R
A
 
A
H
 
N
R
 
Q
P
 
P
L
 
Y
V
 
I
S
 
N
A
|
A
A
x
G
V
x
Y
I
 
V
R
 
N
W
 
-
E
 
D
L
 
I
Q
 
A
V
|
V
S
 
F
A
 
G
-
 
P
-
 
L
F
 
Y
R
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
K
R
 
T
P
 
G
C
|
C
Y
 
Y
R
 
E
C
|
C
-
 
Q
I
 
K
Y
 
V
A
 
K
E
 
E
G
 
N
D
 
I
E
 
D
P
 
H
Q
 
K
L
 
I
T
 
K
C
 
L
S
 
I
E
 
N
S
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
K
-
x
P
G
 
A
V
 
T
L
 
F
G
 
A
P
 
P
L
 
V
P
 
N
G
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
A
S
 
A
L
 
L
E
 
C
A
 
A
V
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
I
K
 
K
I
 
F
L
 
I
T
 
G
G
 
K
A
 
Y
G
 
S
T
 
E
P
 
P
L
 
L
-
 
S
F
 
L
G
 
N
R
 
K
L
x
R
L
 
I
V
x
G
V
 
I
D
 
W
A
 
S
L
 
D
R
 
E
M
 
I
R
 
K
L
 
I
R
 
H
T
 
S
L
 
Q
T
 
N
V
 
M
N
 
G
G
 
R
D
 
S
P
 
P
H
 
V
C
|
C
P
 
S
V
 
V
C
|
C

Sites not aligning to the query:

3h5aC Crystal structure of e. Coli mccb (see paper)
25% identity, 98% coverage: 2:243/247 of query aligns to 85:346/358 of 3h5aC

query
sites
3h5aC
N
 
N
D
 
S
E
 
T
Q
 
E
L
 
N
M
 
N
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
Q
 
N
I
 
F
M
 
L
L
 
H
P
 
Y
E
 
Q
L
 
S
D
 
Y
-
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
P
I
 
V
T
 
L
G
 
V
Q
 
Q
E
 
D
R
 
K
L
 
L
A
 
K
A
 
N
S
 
A
R
 
K
A
 
V
L
 
V
I
 
I
V
 
L
G
 
G
A
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
G
S
 
N
P
 
H
V
 
V
A
 
S
L
 
V
Y
 
I
L
 
L
G
 
A
A
 
T
A
 
S
G
 
G
V
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
I
R
 
I
I
 
L
A
 
I
D
 
D
D
 
N
D
 
D
V
 
Q
V
 
I
D
 
E
L
 
N
S
 
T
N
 
N
L
 
L
Q
 
T
R
|
R
Q
 
Q
I
 
V
A
 
L
H
 
F
R
 
S
Q
 
E
D
 
D
A
 
D
L
 
V
G
 
G
Q
 
K
P
 
N
K
 
K
A
 
T
A
 
E
S
 
V
A
 
I
T
 
K
R
 
R
A
 
E
V
 
L
T
 
L
A
 
K
R
 
R
N
 
N
P
 
S
E
 
E
I
 
I
T
 
S
V
 
V
T
 
S
P
 
E
L
 
I
E
 
A
E
 
L
R
 
N
L
 
I
D
 
N
G
 
D
E
 
Y
R
 
T
L
 
D
G
 
L
A
 
H
E
 
K
V
 
V
G
 
P
A
 
E
A
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
W
I
 
V
D
 
V
A
 
S
T
 
A
D
 
D
N
 
H
-
 
P
F
 
F
A
 
N
T
 
L
R
 
I
F
 
N
A
 
W
L
 
V
N
 
N
A
 
K
A
 
Y
C
 
C
V
 
V
A
 
R
A
 
A
H
 
N
R
 
Q
P
 
P
L
 
Y
V
 
I
S
 
N
A
 
A
A
 
G
V
 
Y
I
 
V
R
 
N
W
 
-
E
 
D
L
 
I
Q
 
A
V
 
V
S
 
F
A
 
G
-
 
P
-
 
L
F
 
Y
R
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
K
R
 
T
P
 
G
C
|
C
Y
 
Y
R
 
E
C
|
C
-
 
Q
-
 
K
-
 
V
-
 
V
-
 
A
-
 
D
I
 
L
Y
 
Y
A
 
G
E
 
S
G
 
E
D
 
K
E
 
E
P
 
N
-
 
I
-
 
D
-
 
H
-
 
K
-
 
I
Q
 
K
L
 
L
T
 
I
C
 
N
S
 
S
-
 
R
-
 
F
E
 
K
S
 
P
G
 
A
V
 
T
L
 
F
G
 
A
P
 
P
L
 
V
P
 
N
G
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
A
S
 
A
L
 
L
E
 
C
A
 
A
V
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
I
K
 
K
I
 
F
L
 
I
T
 
G
G
 
K
A
 
Y
G
 
S
T
 
E
P
 
P
L
 
L
-
 
S
F
 
L
G
 
N
R
 
K
L
 
R
L
 
I
V
 
G
V
 
I
D
 
W
A
 
S
L
 
D
R
 
E
M
 
I
R
 
K
L
 
I
R
 
H
T
 
S
L
 
Q
T
 
N
V
 
M
N
 
G
G
 
R
D
 
S
P
 
P
H
 
V
C
|
C
P
 
S
V
 
V
C
 
C

6om4B The structure of microcin c7 biosynthetic enzyme mccb in complex with n-formylated mcca (see paper)
25% identity, 89% coverage: 23:243/247 of query aligns to 107:343/344 of 6om4B

query
sites
6om4B
Q
 
Q
E
 
D
R
 
K
L
 
L
A
 
K
A
 
N
S
 
A
R
 
K
A
 
V
L
 
V
I
 
I
V
 
L
G
 
G
A
 
C
G
|
G
G
 
G
L
x
I
G
 
G
S
 
N
P
 
H
V
 
V
A
 
S
L
 
V
Y
 
I
L
 
L
G
 
A
A
 
T
A
 
S
G
 
G
V
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
I
R
 
I
I
 
L
A
 
I
D
|
D
D
x
N
D
|
D
V
 
Q
V
 
I
D
x
E
L
 
N
S
 
T
N
|
N
L
 
L
Q
 
T
R
|
R
Q
|
Q
I
 
V
A
 
L
H
 
F
R
 
S
Q
 
E
D
 
D
A
 
D
L
 
V
G
 
G
Q
 
K
P
 
N
K
|
K
A
 
T
A
 
E
S
 
V
A
 
I
T
 
K
R
 
R
A
 
E
V
 
L
T
 
L
A
 
K
R
 
R
N
 
N
P
 
S
E
 
E
I
 
I
T
 
S
V
 
V
T
 
S
P
 
E
L
 
I
E
 
A
E
 
L
R
 
N
L
x
I
D
 
N
G
 
D
E
 
Y
R
 
T
L
 
D
G
 
L
A
 
H
E
 
K
V
 
V
G
 
P
A
 
E
A
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
W
I
 
V
D
 
V
A
x
S
T
x
A
D
|
D
N
x
H
-
 
P
F
 
F
A
 
N
T
 
L
R
 
I
F
 
N
A
 
W
L
 
V
N
 
N
A
 
K
A
 
Y
C
 
C
V
 
V
A
 
R
A
 
A
H
 
N
R
 
Q
P
 
P
L
 
Y
V
 
I
S
x
N
A
|
A
A
x
G
V
x
Y
I
x
V
R
 
N
W
 
-
E
 
D
L
 
I
Q
 
A
V
|
V
S
 
F
A
 
G
-
 
P
-
 
L
F
 
Y
R
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
K
R
 
T
P
 
G
C
|
C
Y
 
Y
R
 
E
C
|
C
-
 
Q
-
 
K
-
 
V
-
x
V
-
x
A
-
 
D
I
 
L
Y
|
Y
-
 
G
-
 
A
-
 
E
A
 
K
E
 
E
G
 
N
D
 
I
E
 
D
P
 
H
Q
 
K
L
 
I
T
 
K
C
 
L
S
 
I
E
 
N
S
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
K
-
 
P
G
 
A
V
 
T
L
 
F
G
 
A
P
 
P
L
 
V
P
 
N
G
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
A
S
 
A
L
 
L
E
 
C
A
 
A
V
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
I
K
 
K
I
 
F
L
 
I
T
 
G
G
 
K
A
 
Y
G
 
S
T
 
E
P
 
P
L
 
L
-
 
S
F
 
L
G
 
N
R
 
K
L
x
R
L
 
I
V
x
G
V
 
I
D
x
W
A
 
S
L
 
D
R
 
E
M
 
I
R
 
K
L
 
I
R
 
H
T
 
S
L
x
Q
T
 
N
V
 
M
N
 
G
G
 
R
D
 
S
P
 
P
H
 
V
C
|
C
P
 
S
V
 
V
C
|
C

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011813799.1 NCBI__GCF_000015585.1:WP_011813799.1
MNDEQLMRYSRQIMLPELDITGQERLAASRALIVGAGGLGSPVALYLGAAGVGELRIADD
DVVDLSNLQRQIAHRQDALGQPKAASATRAVTARNPEITVTPLEERLDGERLGAEVGAAD
VVIDATDNFATRFALNAACVAAHRPLVSAAVIRWELQVSAFRPGGRPCYRCIYAEGDEPQ
LTCSESGVLGPLPGVAGSLEAVEAIKILTGAGTPLFGRLLVVDALRMRLRTLTVNGDPHC
PVCAEAP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory