SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011814644.1 NCBI__GCF_000015585.1:WP_011814644.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 18 hits to proteins with known functional sites (download)

P97084 Threonine-phosphate decarboxylase; L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase; EC 4.1.1.81 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 2 papers)
31% identity, 77% coverage: 13:274/341 of query aligns to 8:286/364 of P97084

query
sites
P97084
H
|
H
G
|
G
G
 
G
N
 
N
L
 
I
D
 
R
Q
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
T
R
 
V
F
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
S
R
 
P
E
 
D
G
 
Q
W
 
L
V
 
L
D
 
D
L
 
F
S
 
S
T
 
A
G
x
N
I
 
I
N
 
N
P
 
P
T
 
L
P
 
G
F
 
M
P
 
P
L
 
V
T
 
S
P
 
V
A
 
K
P
 
R
D
 
A
A
 
L
-
 
I
-
 
D
-
 
N
-
 
L
-
 
D
A
 
C
W
 
I
H
 
E
R
 
R
L
 
Y
P
 
P
E
 
D
A
 
A
D
 
D
-
 
Y
-
 
F
D
 
H
L
 
L
E
 
H
A
 
Q
R
 
A
A
 
L
A
 
A
E
 
R
H
 
H
Y
 
H
R
 
Q
A
 
V
G
 
P
N
 
A
N
 
S
A
 
W
A
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
G
P
 
N
G
 
G
S
 
E
Q
 
T
A
 
E
A
 
S
I
 
I
S
 
F
L
 
T
L
 
V
P
 
A
A
 
S
L
 
G
E
 
L
P
 
K
P
 
P
G
 
R
Y
 
R
V
 
A
A
 
M
I
 
I
P
 
V
A
 
T
P
 
P
E
 
G
Y
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
Y
A
 
G
R
 
R
A
 
A
W
 
L
Q
 
A
R
 
Q
W
 
S
G
 
G
H
 
C
R
 
E
V
 
I
E
 
R
R
 
R
-
 
W
-
 
S
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
W
-
 
Q
L
 
L
T
 
T
A
 
D
D
 
A
C
 
I
I
 
L
A
 
E
A
 
A
G
 
L
P
 
T
P
 
P
R
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
D
W
 
L
Q
 
D
T
 
C
M
 
L
V
 
F
L
 
L
S
 
C
H
 
T
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
L
R
 
L
H
 
P
S
 
E
A
 
R
A
 
P
T
 
L
L
 
L
L
 
Q
A
 
A
W
 
I
C
 
A
D
 
D
A
 
R
L
 
C
A
 
K
A
 
S
E
 
L
G
 
N
G
 
I
Q
 
N
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
F
 
F
C
 
I
D
 
D
A
 
F
E
 
I
P
 
P
-
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
G
L
 
F
A
 
I
P
 
P
S
 
A
-
 
L
A
 
K
G
 
D
R
 
N
P
 
P
G
 
H
L
 
I
V
 
W
L
 
V
L
 
L
R
 
R
S
 
S
L
 
L
G
 
T
K
|
K
F
 
F
Y
 
Y
G
 
A
L
 
I
A
 
P
G
 
G
A
 
L
R
 
R
V
 
L
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
L
 
V
G
 
N
P
 
S
-
 
D
Q
 
D
A
 
A
L
 
A
R
 
M
Q
 
A
R
 
R
L
 
M
A
 
R
D
 
R
L
 
Q
L
 
Q
G
 
M
P
 
P
W
 
W
P
 
S
V
 
V
A
 
N
G
 
A
P
 
L
A
 
A
R
 
A
H
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
E
Q
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
S
 
S
A
 
A
W
 
W
Q
 
Q
D
 
Q
R
 
A
Q
 
T
R
 
W
H
 
H
V
 
W
L
 
L
A
 
R
A
 
E
S
 
E
S
 
G
E
 
A
R
 
R
L
 
F
D
 
Y
H
 
Q
L
 
A
L
 
L
T
 
C
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

1lkcA Crystal structure of l-threonine-o-3-phosphate decarboxylase from salmonella enterica (see paper)
30% identity, 77% coverage: 13:274/341 of query aligns to 1:279/355 of 1lkcA

query
sites
1lkcA
H
|
H
G
|
G
G
 
G
N
 
N
L
 
I
D
 
R
Q
 
E
A
 
P
T
 
A
A
 
T
R
 
V
F
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
S
R
 
P
E
 
D
G
 
Q
W
 
L
V
 
L
D
 
D
L
 
F
S
 
S
T
 
A
G
 
N
I
 
I
N
 
N
P
 
P
T
 
L
P
 
G
F
 
M
P
 
P
L
 
V
T
 
S
P
 
V
A
 
K
P
 
R
D
 
A
A
 
L
-
 
I
-
 
D
-
 
N
-
 
L
-
 
D
A
 
C
W
 
I
H
 
E
R
 
R
L
 
Y
P
 
P
E
 
D
A
 
A
D
 
D
-
 
Y
-
 
F
D
 
H
L
 
L
E
 
H
A
 
Q
R
 
A
A
 
L
A
 
A
E
 
R
H
 
H
Y
 
H
R
 
Q
A
 
V
G
 
P
N
 
A
N
 
S
A
 
W
A
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
G
P
 
N
G
|
G
S
x
E
Q
x
T
A
 
E
A
 
S
I
 
I
S
 
F
L
 
T
L
 
V
P
 
A
A
 
S
L
 
G
E
 
L
P
 
K
P
 
P
G
 
R
Y
 
R
V
 
A
A
 
M
I
 
I
P
 
V
A
 
T
P
 
P
E
 
G
Y
x
F
A
 
A
E
 
E
H
 
Y
A
 
G
R
 
R
A
 
A
W
 
L
Q
 
A
R
 
Q
W
 
S
G
 
G
H
 
C
R
 
E
V
 
I
E
 
R
R
 
R
-
 
W
-
 
S
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
W
-
 
Q
L
 
L
T
 
T
A
 
D
D
 
A
C
 
I
I
 
L
A
 
E
A
 
A
G
 
L
P
 
T
P
 
P
R
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
D
W
 
L
Q
 
D
T
 
C
M
 
L
V
 
F
L
 
L
S
 
C
H
 
T
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
L
R
 
L
H
 
P
S
 
E
A
 
R
A
 
P
T
 
L
L
 
L
L
 
Q
A
 
A
W
 
I
C
 
A
D
 
D
A
 
R
L
 
C
A
 
K
A
 
S
E
 
L
G
 
N
G
 
I
Q
 
N
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
|
D
E
 
E
A
|
A
F
|
F
C
 
I
D
 
D
A
 
F
E
 
I
P
 
P
-
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
G
L
 
F
A
 
I
P
 
P
S
 
A
-
 
L
A
 
K
G
 
D
R
 
N
P
 
P
G
 
H
L
 
I
V
 
W
L
 
V
L
 
L
R
 
R
S
|
S
L
 
L
G
x
T
K
|
K
F
 
F
Y
 
Y
G
 
A
L
 
I
A
 
P
G
 
G
A
 
L
R
|
R
V
 
L
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
L
 
V
G
 
N
P
 
S
-
 
D
Q
 
D
A
 
A
L
 
A
R
 
M
Q
 
A
R
 
R
L
 
M
A
 
R
D
 
R
L
 
Q
L
 
Q
G
 
M
P
 
P
W
 
W
P
 
S
V
 
V
A
 
N
G
 
A
P
 
L
A
 
A
R
 
A
H
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
E
Q
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
S
 
S
A
 
A
W
 
W
Q
 
Q
D
 
Q
R
 
A
Q
 
T
R
 
W
H
 
H
V
 
W
L
 
L
A
 
R
A
 
E
S
 
E
S
 
G
E
 
A
R
 
R
L
 
F
D
 
Y
H
 
Q
L
 
A
L
 
L
T
 
C
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

1lc8A Crystal structure of l-threonine-o-3-phosphate decarboxylase from s. Enterica complexed with its reaction intermediate (see paper)
30% identity, 77% coverage: 13:274/341 of query aligns to 2:280/356 of 1lc8A

query
sites
1lc8A
H
|
H
G
|
G
G
 
G
N
 
N
L
 
I
D
 
R
Q
 
E
A
 
P
T
 
A
A
 
T
R
 
V
F
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
S
R
 
P
E
 
D
G
 
Q
W
 
L
V
 
L
D
 
D
L
 
F
S
 
S
T
 
A
G
 
N
I
 
I
N
 
N
P
 
P
T
 
L
P
 
G
F
 
M
P
 
P
L
 
V
T
 
S
P
 
V
A
 
K
P
 
R
D
 
A
A
 
L
-
 
I
-
 
D
-
 
N
-
 
L
-
 
D
A
 
C
W
 
I
H
 
E
R
 
R
L
 
Y
P
 
P
E
 
D
A
 
A
D
 
D
-
 
Y
-
 
F
D
 
H
L
 
L
E
 
H
A
 
Q
R
 
A
A
 
L
A
 
A
E
 
R
H
 
H
Y
 
H
R
 
Q
A
 
V
G
 
P
N
 
A
N
 
S
A
 
W
A
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
G
P
 
N
G
|
G
S
x
E
Q
x
T
A
 
E
A
 
S
I
 
I
S
 
F
L
 
T
L
 
V
P
 
A
A
 
S
L
 
G
E
 
L
P
 
K
P
 
P
G
 
R
Y
 
R
V
 
A
A
 
M
I
 
I
P
 
V
A
 
T
P
 
P
E
 
G
Y
x
F
A
 
A
E
 
E
H
 
Y
A
 
G
R
 
R
A
 
A
W
 
L
Q
 
A
R
 
Q
W
 
S
G
 
G
H
 
C
R
 
E
V
 
I
E
 
R
R
 
R
-
 
W
-
 
S
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
W
-
 
Q
L
 
L
T
 
T
A
 
D
D
 
A
C
 
I
I
 
L
A
 
E
A
 
A
G
 
L
P
 
T
P
 
P
R
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
D
W
 
L
Q
 
D
T
 
C
M
 
L
V
 
F
L
 
L
S
 
C
H
 
T
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
L
R
 
L
H
 
P
S
 
E
A
 
R
A
 
P
T
 
L
L
 
L
L
 
Q
A
 
A
W
 
I
C
 
A
D
 
D
A
 
R
L
 
C
A
 
K
A
 
S
E
 
L
G
 
N
G
 
I
Q
 
N
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
|
D
E
 
E
A
|
A
F
 
F
C
 
I
D
 
D
A
 
F
E
 
I
P
 
P
-
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
G
L
 
F
A
 
I
P
 
P
S
 
A
-
 
L
A
 
K
G
 
D
R
 
N
P
 
P
G
 
H
L
 
I
V
 
W
L
 
V
L
 
L
R
 
R
S
|
S
L
 
L
G
x
T
K
|
K
F
 
F
Y
 
Y
G
 
A
L
 
I
A
 
P
G
 
G
A
 
L
R
|
R
V
 
L
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
L
 
V
G
 
N
P
 
S
-
 
D
Q
 
D
A
 
A
L
 
A
R
 
M
Q
 
A
R
 
R
L
 
M
A
 
R
D
 
R
L
 
Q
L
 
Q
G
 
M
P
 
P
W
 
W
P
 
S
V
 
V
A
 
N
G
 
A
P
 
L
A
 
A
R
 
A
H
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
E
Q
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
S
 
S
A
 
A
W
 
W
Q
 
Q
D
 
Q
R
 
A
Q
 
T
R
 
W
H
 
H
V
 
W
L
 
L
A
 
R
A
 
E
S
 
E
S
 
G
E
 
A
R
 
R
L
 
F
D
 
Y
H
 
Q
L
 
A
L
 
L
T
 
C
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

1lc7A Crystal structure of l-threonine-o-3-phosphate decarboxylase from s. Enterica complexed with a substrate (see paper)
30% identity, 77% coverage: 13:274/341 of query aligns to 5:283/358 of 1lc7A

query
sites
1lc7A
H
|
H
G
|
G
G
 
G
N
 
N
L
 
I
D
 
R
Q
 
E
A
 
P
T
 
A
A
 
T
R
 
V
F
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
S
R
 
P
E
 
D
G
 
Q
W
 
L
V
 
L
D
 
D
L
 
F
S
 
S
T
x
A
G
x
N
I
 
I
N
 
N
P
 
P
T
 
L
P
 
G
F
 
M
P
 
P
L
 
V
T
 
S
P
 
V
A
 
K
P
 
R
D
 
A
A
 
L
-
 
I
-
 
D
-
 
N
-
 
L
-
 
D
A
 
C
W
 
I
H
 
E
R
 
R
L
 
Y
P
 
P
E
 
D
A
 
A
D
 
D
-
 
Y
-
 
F
D
 
H
L
 
L
E
 
H
A
 
Q
R
 
A
A
 
L
A
 
A
E
 
R
H
 
H
Y
 
H
R
 
Q
A
 
V
G
 
P
N
 
A
N
 
S
A
 
W
A
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
G
P
 
N
G
|
G
S
x
E
Q
x
T
A
 
E
A
 
S
I
 
I
S
 
F
L
 
T
L
 
V
P
 
A
A
 
S
L
 
G
E
 
L
P
 
K
P
 
P
G
 
R
Y
 
R
V
 
A
A
 
M
I
 
I
P
 
V
A
 
T
P
 
P
E
 
G
Y
x
F
A
 
A
E
 
E
H
 
Y
A
 
G
R
 
R
A
 
A
W
 
L
Q
 
A
R
 
Q
W
 
S
G
 
G
H
 
C
R
 
E
V
 
I
E
 
R
R
 
R
-
 
W
-
 
S
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
W
-
 
Q
L
 
L
T
 
T
A
 
D
D
 
A
C
 
I
I
 
L
A
 
E
A
 
A
G
 
L
P
 
T
P
 
P
R
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
D
W
 
L
Q
 
D
T
 
C
M
 
L
V
 
F
L
 
L
S
 
C
H
 
T
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
L
R
 
L
H
 
P
S
 
E
A
 
R
A
 
P
T
 
L
L
 
L
L
 
Q
A
 
A
W
 
I
C
 
A
D
 
D
A
 
R
L
 
C
A
 
K
A
 
S
E
 
L
G
 
N
G
 
I
Q
 
N
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
F
 
F
C
 
I
D
 
D
A
 
F
E
 
I
P
 
P
-
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
G
L
 
F
A
 
I
P
 
P
S
 
A
-
 
L
A
 
K
G
 
D
R
 
N
P
 
P
G
 
H
L
 
I
V
 
W
L
 
V
L
 
L
R
 
R
S
|
S
L
 
L
G
x
T
K
|
K
F
 
F
Y
 
Y
G
 
A
L
 
I
A
 
P
G
 
G
A
 
L
R
|
R
V
 
L
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
L
 
V
G
 
N
P
 
S
-
 
D
Q
 
D
A
 
A
L
 
A
R
 
M
Q
 
A
R
 
R
L
 
M
A
 
R
D
 
R
L
 
Q
L
 
Q
G
 
M
P
 
P
W
 
W
P
 
S
V
 
V
A
 
N
G
 
A
P
 
L
A
 
A
R
 
A
H
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
E
Q
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
S
 
S
A
 
A
W
 
W
Q
 
Q
D
 
Q
R
 
A
Q
 
T
R
 
W
H
 
H
V
 
W
L
 
L
A
 
R
A
 
E
S
 
E
S
 
G
E
 
A
R
 
R
L
 
F
D
 
Y
H
 
Q
L
 
A
L
 
L
T
 
C
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

4wbtA Crystal structure of histidinol-phosphate aminotransferase from sinorhizobium meliloti in complex with pyridoxal-5'-phosphate
31% identity, 50% coverage: 141:309/341 of query aligns to 158:333/369 of 4wbtA

query
sites
4wbtA
M
 
V
V
 
Y
L
 
L
S
 
A
H
 
N
P
 
P
N
 
D
N
|
N
P
 
P
T
 
M
G
 
G
T
 
S
R
 
W
H
 
W
S
 
P
A
 
A
A
 
E
T
 
R
L
 
V
L
 
V
A
 
A
W
 
F
C
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
P
A
 
-
E
 
E
G
 
T
G
 
T
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
V
 
L
D
|
D
E
 
E
A
|
A
F
x
Y
C
 
C
D
 
E
A
 
T
E
 
A
P
 
P
E
 
R
T
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
P
P
 
P
S
 
I
A
 
E
G
 
S
-
 
L
-
 
I
-
 
D
R
 
K
P
 
P
G
 
N
L
 
V
V
 
I
L
 
R
L
 
A
R
 
R
S
x
T
L
 
F
G
x
S
K
|
K
F
 
A
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
|
R
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
L
 
T
L
 
L
G
 
S
P
 
T
Q
 
P
A
 
G
L
 
T
R
 
A
Q
 
Q
R
 
A
L
 
F
A
 
D
D
 
K
L
 
I
L
 
R
G
 
N
P
 
H
W
 
F
P
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
G
P
 
M
A
 
S
R
 
R
H
 
I
A
 
G
A
 
V
R
 
A
Q
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
A
S
 
L
A
 
A
W
 
D
Q
 
Q
D
 
D
R
 
Y
Q
 
L
R
 
K
H
 
E
V
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
N
S
 
S
S
 
R
E
 
Q
R
 
R
L
 
I
D
 
G
H
 
R
L
 
I
L
 
A
T
 
A
R
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
L
G
 
P
G
 
S
T
 
A
A
 
T
L
 
N
F
 
F
R
 
V
W
 
A
T
 
V
P
 
D
C
 
C
-
 
G
H
 
K
D
 
D
A
 
A
R
 
S
Q
 
Y
R
 
A
Q
 
R
A
 
A
E
 
I
L
 
V
A
 
D
R
 
R
A
 
L
-
 
M
-
 
S
-
 
D
-
 
H
G
 
G
I
 
I
W
 
F
V
 
I
R
 
R

Sites not aligning to the query:

7szpA Crystal structure of histidinol-phosphate aminotransferase from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae (strain hs11286)
34% identity, 33% coverage: 139:249/341 of query aligns to 146:256/353 of 7szpA

query
sites
7szpA
Q
 
K
T
 
V
M
 
V
V
 
F
L
 
V
S
 
C
H
 
S
P
 
P
N
 
N
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
R
 
I
H
 
I
S
 
D
A
 
P
A
 
Q
T
 
S
L
 
M
L
 
R
A
 
-
W
 
-
C
 
-
D
 
D
A
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
M
E
 
T
G
 
R
G
 
G
Q
 
K
L
 
A
I
 
I
V
 
V
-
 
V
-
 
A
D
|
D
E
 
E
A
|
A
F
x
Y
C
 
I
D
 
E
A
 
F
E
 
C
P
 
P
E
 
Q
T
 
A
S
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
G
-
 
W
S
 
L
A
 
S
G
 
D
R
 
Y
P
 
P
G
 
H
L
 
L
V
 
V
L
 
V
L
 
L
R
 
R
S
x
T
L
 
L
G
x
S
K
|
K
F
 
A
Y
 
F
G
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
L
R
|
R
V
 
C
G
 
G
F
 
F
L
 
T
L
 
L
G
 
A
P
 
N
Q
 
A
A
 
E
L
 
V
R
 
I
Q
 
N
R
 
V
L
 
L
A
 
L
D
 
K
L
 
V
L
 
I
G
 
A
P
 
P
W
 
Y
P
 
P
V
 
L
A
 
S
G
 
T
P
 
P
A
 
V
R
 
A
H
 
D
A
 
I
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
S

Sites not aligning to the query:

1geyA Crystal structure of histidinol-phosphate aminotransferase complexed with n-(5'-phosphopyridoxyl)-l-glutamate (see paper)
34% identity, 33% coverage: 139:249/341 of query aligns to 132:242/335 of 1geyA

query
sites
1geyA
Q
 
K
T
 
V
M
 
V
V
 
Y
L
 
V
S
 
C
H
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
R
 
L
-
 
I
-
 
N
-
 
P
H
 
Q
S
 
D
A
 
F
A
 
R
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
E
W
 
L
C
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
T
E
 
R
G
 
G
G
 
K
Q
 
A
L
 
I
I
 
V
V
 
V
-
 
A
D
|
D
E
 
E
A
|
A
F
x
Y
C
 
I
D
 
E
A
 
F
E
 
C
P
 
P
E
 
Q
T
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
G
-
 
W
S
 
L
A
 
A
G
 
E
R
 
Y
P
 
P
G
 
H
L
 
L
V
 
A
L
 
I
L
 
L
R
 
R
S
x
T
L
 
L
G
x
S
K
|
K
F
 
A
Y
 
F
G
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
L
R
|
R
V
 
C
G
 
G
F
 
F
L
 
T
L
 
L
G
 
A
P
 
N
Q
 
E
A
 
E
L
 
V
R
 
I
Q
 
N
R
 
L
L
 
L
A
 
M
D
 
K
L
 
V
L
 
I
G
 
A
P
 
P
W
 
Y
P
 
P
V
 
L
A
 
S
G
 
T
P
 
P
A
 
V
R
 
A
H
 
D
A
 
I
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
S

Sites not aligning to the query:

1fg7A Crystal structure of l-histidinol phosphate aminotransferase with pyridoxal-5'-phosphate (see paper)
34% identity, 33% coverage: 139:249/341 of query aligns to 146:256/354 of 1fg7A

query
sites
1fg7A
Q
 
K
T
 
V
M
 
V
V
 
Y
L
 
V
S
 
C
H
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
R
 
L
-
 
I
-
 
N
-
 
P
H
 
Q
S
 
D
A
 
F
A
 
R
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
E
W
 
-
C
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
L
A
 
T
A
 
R
E
 
G
G
 
K
G
 
A
Q
 
I
L
 
V
I
 
V
V
 
A
D
|
D
E
 
E
A
|
A
F
x
Y
C
 
I
D
 
E
A
 
F
E
 
C
P
 
P
E
 
Q
T
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
G
-
 
W
S
 
L
A
 
A
G
 
E
R
 
Y
P
 
P
G
 
H
L
 
L
V
 
A
L
 
I
L
 
L
R
 
R
S
x
T
L
 
L
G
x
S
K
|
K
F
 
A
Y
 
F
G
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
L
R
|
R
V
 
C
G
 
G
F
 
F
L
 
T
L
 
L
G
 
A
P
 
N
Q
 
E
A
 
E
L
 
V
R
 
I
Q
 
N
R
 
L
L
 
L
A
 
M
D
 
K
L
 
V
L
 
I
G
 
A
P
 
P
W
 
Y
P
 
P
V
 
L
A
 
S
G
 
T
P
 
P
A
 
V
R
 
A
H
 
D
A
 
I
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
S

Sites not aligning to the query:

1fg3A Crystal structure of l-histidinol phosphate aminotransferase complexed with l-histidinol (see paper)
34% identity, 33% coverage: 139:249/341 of query aligns to 146:256/354 of 1fg3A

query
sites
1fg3A
Q
 
K
T
 
V
M
 
V
V
 
Y
L
 
V
S
 
C
H
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
R
 
L
-
 
I
-
 
N
-
 
P
H
 
Q
S
 
D
A
 
F
A
 
R
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
E
W
 
-
C
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
L
A
 
T
A
 
R
E
 
G
G
 
K
G
 
A
Q
 
I
L
 
V
I
 
V
V
 
A
D
|
D
E
 
E
A
|
A
F
x
Y
C
 
I
D
 
E
A
 
F
E
 
C
P
 
P
E
 
Q
T
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
G
-
 
W
S
 
L
A
 
A
G
 
E
R
 
Y
P
 
P
G
 
H
L
 
L
V
 
A
L
 
I
L
 
L
R
 
R
S
x
T
L
 
L
G
x
S
K
|
K
F
 
A
Y
 
F
G
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
L
R
|
R
V
 
C
G
 
G
F
 
F
L
 
T
L
 
L
G
 
A
P
 
N
Q
 
E
A
 
E
L
 
V
R
 
I
Q
 
N
R
 
L
L
 
L
A
 
M
D
 
K
L
 
V
L
 
I
G
 
A
P
 
P
W
 
Y
P
 
P
V
 
L
A
 
S
G
 
T
P
 
P
A
 
V
R
 
A
H
 
D
A
 
I
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
S

Sites not aligning to the query:

3ly1D Crystal structure of putative histidinol-phosphate aminotransferase (yp_050345.1) from erwinia carotovora atroseptica scri1043 at 1.80 a resolution
25% identity, 67% coverage: 110:338/341 of query aligns to 119:335/354 of 3ly1D

query
sites
3ly1D
A
 
V
R
 
K
A
 
M
W
 
L
Q
 
D
R
 
N
W
 
W
G
 
A
H
 
F
R
 
D
V
 
I
E
 
E
R
 
G
L
 
L
T
 
K
A
 
A
D
 
A
C
 
V
I
 
A
A
 
A
A
 
Y
G
 
S
P
 
G
P
 
P
R
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
W
 
-
Q
 
S
T
 
I
M
 
V
V
 
Y
L
 
L
S
 
V
H
 
N
P
 
P
N
 
N
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
I
H
 
T
S
 
P
A
 
A
A
 
D
T
 
V
L
 
I
L
 
E
A
 
P
W
 
W
C
 
I
D
 
A
A
 
S
L
 
K
A
 
P
A
 
A
E
 
-
G
 
N
G
 
T
Q
 
M
L
 
F
I
 
I
V
 
V
D
|
D
E
 
E
A
 
A
F
x
Y
C
 
A
D
 
E
A
 
F
E
 
V
P
 
N
E
 
D
-
 
P
-
 
R
-
 
F
T
 
R
S
 
S
L
 
I
A
 
S
P
 
P
-
 
M
-
 
I
S
 
T
A
 
Q
G
 
G
R
 
A
P
 
E
G
 
N
L
 
I
V
 
I
L
 
L
L
 
L
R
 
K
S
x
T
L
 
F
G
x
S
K
|
K
F
 
I
Y
 
H
G
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
M
R
|
R
V
 
V
G
 
G
F
 
Y
L
 
A
L
 
V
G
 
A
P
 
H
Q
 
P
A
 
T
L
 
V
R
 
I
Q
 
A
R
 
L
L
 
M
A
 
G
D
 
R
L
 
Y
L
 
V
G
 
A
P
 
G
W
 
E
P
 
K
V
 
I
A
 
N
G
 
F
P
 
S
A
 
G
R
 
V
H
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
L
Q
 
A
A
 
S
L
 
M
A
 
N
D
 
D
S
 
S
A
 
A
W
 
F
-
 
I
-
 
T
-
 
Y
-
 
S
-
 
K
-
 
K
-
 
S
Q
 
N
D
 
D
R
 
V
Q
 
S
R
 
R
H
 
Q
V
 
I
L
 
L
A
 
L
A
 
K
S
 
A
S
 
L
E
 
E
R
 
D
L
 
L
D
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
K
A
 
L
G
 
P
L
 
Y
A
 
L
P
 
P
T
 
S
G
 
E
G
 
G
T
 
N
A
 
F
L
 
V
F
 
F
R
 
H
W
 
Q
-
 
L
-
 
V
T
 
V
P
 
P
C
 
L
H
 
K
D
 
D
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
R
 
Y
Q
 
Q
A
 
T
E
 
H
L
 
M
A
 
A
R
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
V
W
 
L
V
 
I
-
 
G
R
 
R
A
 
A
F
 
F
D
 
P
A
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
P
E
 
A
S
 
D
D
 
N
W
 
W
Q
 
C
R
 
R
L
 
I
A
 
-
A
 
-
A
 
S
L
 
L
G
 
G
C
 
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

2o1bA Structure of aminotransferase from staphylococcus aureus
26% identity, 66% coverage: 80:303/341 of query aligns to 87:330/376 of 2o1bA

query
sites
2o1bA
L
 
L
P
 
Y
G
 
G
S
x
T
Q
x
K
A
 
N
A
 
G
I
 
L
S
 
V
L
 
A
L
 
V
P
 
P
-
 
T
-
 
C
A
 
V
L
 
I
E
 
N
P
 
P
P
 
G
G
 
D
Y
 
Y
V
 
V
A
 
L
I
 
L
P
 
P
A
 
D
P
 
P
E
 
G
Y
|
Y
A
 
T
E
 
D
H
 
Y
A
 
L
R
 
A
A
 
G
W
 
V
Q
 
-
R
 
-
W
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
L
T
 
L
A
 
A
D
 
D
C
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
V
-
 
P
I
 
L
A
 
N
A
 
L
G
 
E
P
 
P
P
 
P
R
 
H
R
 
Y
L
 
L
P
 
P
-
 
D
W
 
W
-
 
S
-
 
K
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
Q
-
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
K
-
 
T
Q
 
K
T
 
L
M
 
I
V
 
Y
L
 
L
S
 
T
H
 
Y
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
-
R
 
-
H
 
-
S
 
S
A
 
T
A
 
A
T
 
T
L
 
K
L
 
E
A
 
V
W
 
F
C
 
D
D
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
K
E
 
F
G
 
K
G
 
G
-
 
T
-
 
D
-
 
T
Q
 
K
L
 
I
I
 
V
V
 
H
D
|
D
E
 
F
A
|
A
F
x
Y
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
G
C
 
F
D
 
D
A
 
A
E
 
K
P
 
N
E
 
P
T
 
S
S
 
I
L
 
L
A
 
A
P
 
S
S
 
E
A
 
N
G
 
G
R
 
K
P
 
D
G
 
V
L
 
A
V
 
I
L
 
E
L
 
I
R
 
Y
S
|
S
L
 
L
G
x
S
K
|
K
F
 
G
Y
 
Y
G
 
N
L
 
M
A
 
S
G
 
G
A
 
F
R
|
R
V
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
A
L
 
V
G
 
G
P
 
N
Q
 
K
A
 
D
L
 
M
R
 
I
Q
 
Q
R
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
K
L
 
Y
L
 
Q
G
 
T
P
 
H
W
 
T
P
 
N
-
 
A
-
 
G
V
 
M
A
 
F
G
 
G
P
 
A
A
 
L
R
 
Q
H
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
I
Q
 
Y
A
 
A
L
 
L
A
 
N
D
 
H
-
 
Y
S
 
D
A
 
D
W
 
F
Q
 
L
D
 
E
R
 
E
Q
 
Q
R
 
S
H
 
N
V
 
V
L
 
F
A
 
K
A
 
T
S
 
R
S
 
R
E
 
D
R
 
R
L
 
F
D
 
E
H
 
A
L
 
M
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
A
G
 
D
L
 
L
-
 
P
-
 
F
-
 
V
A
 
H
P
 
A
T
 
K
G
 
G
G
 
G
T
 
I
A
 
Y
L
 
V
F
 
W
R
 
L
W
 
E
T
 
T
-
 
P
P
 
P
C
 
G
H
 
Y
D
 
D
A
 
S
R
 
E
Q
 
Q
R
 
F
Q
 
E
A
 
Q
E
 
F
L
 
L
A
 
V
R
 
Q

5yhvA Crystal structure of an aminotransferase from mycobacterium tuberculosis
26% identity, 72% coverage: 87:330/341 of query aligns to 112:382/394 of 5yhvA

query
sites
5yhvA
I
 
L
S
 
A
L
 
F
L
 
L
P
 
A
A
 
C
L
 
F
E
 
D
P
 
A
P
 
G
G
 
D
Y
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
M
P
 
A
A
 
S
P
 
P
E
 
G
Y
|
Y
A
 
P
E
 
C
H
 
Y
A
 
R
R
 
N
A
 
I
W
 
L
Q
 
S
R
 
A
W
 
L
G
 
G
H
 
C
R
 
E
V
 
V
E
 
V
R
 
E
L
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
C
 
-
I
 
I
A
 
P
A
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
Q
R
 
T
R
 
R
L
 
F
-
 
Q
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
M
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
P
P
 
P
W
 
L
Q
 
R
T
 
G
M
 
V
V
 
V
L
 
V
S
 
A
H
 
S
P
 
P
N
 
A
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
P
H
 
E
S
 
E
A
 
L
A
 
A
T
 
A
L
 
I
L
 
A
A
 
S
W
 
W
C
 
C
D
 
D
A
 
A
L
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
S
G
 
D
G
 
V
Q
 
R
L
 
L
I
 
I
V
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
V
F
x
Y
-
x
H
-
 
G
-
 
L
-
 
V
C
 
Y
D
 
Q
A
 
G
E
 
A
P
 
P
E
 
Q
T
 
T
S
 
S
L
 
C
A
 
A
P
 
W
S
 
Q
A
 
T
G
 
S
R
 
R
P
 
N
G
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
-
R
 
N
S
|
S
L
 
F
G
x
S
K
|
K
F
 
Y
Y
 
Y
G
 
A
L
 
M
A
 
T
G
 
G
A
 
W
R
|
R
V
 
L
G
 
G
F
 
W
L
 
L
L
 
L
G
 
V
P
 
P
Q
 
T
A
 
V
L
 
L
R
 
R
Q
 
R
R
 
A
L
 
V
A
 
D
D
 
C
L
 
L
L
 
T
G
 
G
P
 
N
W
 
F
P
 
T
V
x
I
A
 
C
G
 
P
P
 
P
-
 
V
-
 
L
A
 
S
R
 
Q
H
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
V
Q
 
S
A
 
A
L
 
F
A
 
T
D
 
P
S
 
E
A
 
A
W
 
T
Q
 
A
D
 
E
R
 
A
Q
 
D
R
 
G
H
 
N
V
 
L
L
 
A
A
 
S
A
 
Y
S
 
A
S
 
I
E
 
N
R
 
R
-
 
S
-
 
L
L
 
L
D
 
L
H
 
D
L
 
G
L
 
L
T
 
R
R
 
R
A
 
I
G
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
T
G
 
D
G
 
G
T
 
-
A
 
A
L
 
F
F
 
Y
R
 
V
W
 
Y
T
 
A
P
 
D
C
 
V
H
 
S
D
 
D
A
 
F
R
 
T
Q
 
S
R
 
D
Q
 
S
A
 
L
E
 
A
-
 
F
-
 
C
-
 
S
-
 
K
-
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
D
A
 
T
G
 
G
I
 
V
W
 
A
V
 
I
R
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
I
A
 
D
F
 
F
D
 
D
A
 
T
P
 
A
A
 
R
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
F
L
 
V
R
 
R
F
 
I
G
 
S
L
 
F
P
 
A
G
 
G
P
 
P
E
 
S
S
 
G
D
 
D
W
 
I
Q
 
E
R
 
E

Sites not aligning to the query:

P96847 Valine--pyruvate aminotransferase; Alanine--valine transaminase; EC 2.6.1.66 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv)
26% identity, 72% coverage: 87:330/341 of query aligns to 106:376/388 of P96847

query
sites
P96847
I
 
L
S
 
A
L
 
F
L
 
L
P
 
A
A
 
C
L
 
F
E
 
D
P
 
A
P
 
G
G
 
D
Y
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
M
P
 
A
A
 
S
P
 
P
E
 
G
Y
 
Y
A
 
P
E
 
C
H
 
Y
A
 
R
R
 
N
A
 
I
W
 
L
Q
 
S
R
 
A
W
 
L
G
 
G
H
 
C
R
 
E
V
 
V
E
 
V
R
 
E
L
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
C
 
-
I
 
I
A
 
P
A
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
Q
R
 
T
R
 
R
L
 
F
-
 
Q
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
M
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
P
P
 
P
W
 
L
Q
 
R
T
 
G
M
 
V
V
 
V
L
 
V
S
 
A
H
 
S
P
 
P
N
 
A
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
P
H
 
E
S
 
E
A
 
L
A
 
A
T
 
A
L
 
I
L
 
A
A
 
S
W
 
W
C
 
C
D
 
D
A
 
A
L
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
S
G
 
D
G
 
V
Q
 
R
L
 
L
I
 
I
V
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
V
F
 
Y
-
 
H
-
 
G
-
 
L
-
 
V
C
 
Y
D
 
Q
A
 
G
E
 
A
P
 
P
E
 
Q
T
 
T
S
 
S
L
 
C
A
 
A
P
 
W
S
 
Q
A
 
T
G
 
S
R
 
R
P
 
N
G
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
-
R
 
N
S
 
S
L
 
F
G
 
S
K
|
K
F
 
Y
Y
 
Y
G
 
A
L
 
M
A
 
T
G
 
G
A
 
W
R
 
R
V
 
L
G
 
G
F
 
W
L
 
L
L
 
L
G
 
V
P
 
P
Q
 
T
A
 
V
L
 
L
R
 
R
Q
 
R
R
 
A
L
 
V
A
 
D
D
 
C
L
 
L
L
 
T
G
 
G
P
 
N
W
 
F
P
 
T
V
 
I
A
 
C
G
 
P
P
 
P
-
 
V
-
 
L
A
 
S
R
 
Q
H
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
V
Q
 
S
A
 
A
L
 
F
A
 
T
D
 
P
S
 
E
A
 
A
W
 
T
Q
 
A
D
 
E
R
 
A
Q
 
D
R
 
G
H
 
N
V
 
L
L
 
A
A
 
S
A
 
Y
S
 
A
S
 
I
E
 
N
R
 
R
-
 
S
-
 
L
L
 
L
D
 
L
H
 
D
L
 
G
L
 
L
T
 
R
R
 
R
A
 
I
G
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
T
G
 
D
G
 
G
T
 
-
A
 
A
L
 
F
F
 
Y
R
 
V
W
 
Y
T
 
A
P
 
D
C
 
V
H
 
S
D
 
D
A
 
F
R
 
T
Q
 
S
R
 
D
Q
 
S
A
 
L
E
 
A
-
 
F
-
 
C
-
 
S
-
 
K
-
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
D
A
 
T
G
 
G
I
 
V
W
 
A
V
 
I
R
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
I
A
 
D
F
 
F
D
 
D
A
 
T
P
 
A
A
 
R
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
F
L
 
V
R
 
R
F
 
I
G
 
S
L
 
F
P
 
A
G
 
G
P
 
P
E
 
S
S
 
G
D
 
D
W
 
I
Q
 
E
R
 
E

5yhvB Crystal structure of an aminotransferase from mycobacterium tuberculosis
26% identity, 72% coverage: 87:330/341 of query aligns to 105:375/387 of 5yhvB

query
sites
5yhvB
I
 
L
S
 
A
L
 
F
L
 
L
P
 
A
A
 
C
L
 
F
E
 
D
P
 
A
P
 
G
G
 
D
Y
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
M
P
 
A
A
 
S
P
 
P
E
 
G
Y
|
Y
A
 
P
E
 
C
H
 
Y
A
 
R
R
 
N
A
 
I
W
 
L
Q
 
S
R
 
A
W
 
L
G
 
G
H
 
C
R
 
E
V
 
V
E
 
V
R
 
E
L
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
C
 
-
I
 
I
A
 
P
A
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
Q
R
 
T
R
 
R
L
 
F
-
 
Q
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
M
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
P
P
 
P
W
 
L
Q
 
R
T
 
G
M
 
V
V
 
V
L
 
V
S
 
A
H
 
S
P
 
P
N
 
A
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
P
H
 
E
S
 
E
A
 
L
A
 
A
T
 
A
L
 
I
L
 
A
A
 
S
W
 
W
C
 
C
D
 
D
A
 
A
L
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
S
G
 
D
G
 
V
Q
 
R
L
 
L
I
 
I
V
 
S
D
|
D
E
 
E
A
x
V
F
x
Y
-
x
H
-
 
G
-
 
L
-
 
V
C
 
Y
D
 
Q
A
 
G
E
 
A
P
 
P
E
 
Q
T
|
T
S
 
S
L
 
C
A
 
A
P
 
W
S
 
Q
A
 
T
G
 
S
R
 
R
P
 
N
G
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
-
R
x
N
S
|
S
L
 
F
G
x
S
K
|
K
F
 
Y
Y
 
Y
G
 
A
L
 
M
A
 
T
G
 
G
A
 
W
R
|
R
V
 
L
G
 
G
F
 
W
L
 
L
L
 
L
G
 
V
P
 
P
Q
 
T
A
 
V
L
 
L
R
 
R
Q
 
R
R
 
A
L
 
V
A
 
D
D
 
C
L
 
L
L
 
T
G
 
G
P
 
N
W
 
F
P
 
T
V
x
I
A
 
C
G
 
P
P
 
P
-
 
V
-
 
L
A
 
S
R
 
Q
H
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
V
Q
 
S
A
 
A
L
 
F
A
 
T
D
 
P
S
 
E
A
 
A
W
 
T
Q
 
A
D
 
E
R
 
A
Q
 
D
R
 
G
H
 
N
V
 
L
L
 
A
A
 
S
A
 
Y
S
 
A
S
 
I
E
 
N
R
 
R
-
 
S
-
 
L
L
 
L
D
 
L
H
 
D
L
 
G
L
 
L
T
 
R
R
 
R
A
 
I
G
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
T
G
 
D
G
 
G
T
 
-
A
 
A
L
 
F
F
 
Y
R
 
V
W
 
Y
T
 
A
P
 
D
C
 
V
H
 
S
D
 
D
A
 
F
R
 
T
Q
 
S
R
 
D
Q
 
S
A
 
L
E
 
A
-
 
F
-
 
C
-
 
S
-
 
K
-
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
D
A
 
T
G
 
G
I
 
V
W
 
A
V
 
I
R
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
I
A
 
D
F
 
F
D
 
D
A
 
T
P
 
A
A
 
R
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
F
L
 
V
R
 
R
F
 
I
G
 
S
L
 
F
P
 
A
G
 
G
P
 
P
E
 
S
S
 
G
D
 
D
W
 
I
Q
 
E
R
 
E

Sites not aligning to the query:

Q0ZQ41 CMP-5'-(3-aminopropyl)phosphonate synthase; EC 2.7.7.-; EC 4.1.1.- from Streptomyces rubellomurinus (strain ATCC 31215) (see paper)
30% identity, 52% coverage: 82:257/341 of query aligns to 337:525/628 of Q0ZQ41

query
sites
Q0ZQ41
G
 
G
S
 
S
Q
 
S
A
 
E
A
 
I
I
 
I
S
 
K
L
 
I
L
 
L
P
 
A
A
 
R
L
 
L
E
 
R
P
 
-
P
 
-
G
 
G
Y
 
N
V
 
W
A
 
T
I
 
V
P
 
P
A
 
V
P
 
P
E
 
G
Y
 
F
A
 
N
E
 
E
H
 
Y
A
 
E
R
 
N
A
 
V
W
 
V
Q
 
-
R
 
-
W
 
G
G
 
A
H
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
H
R
 
R
L
 
Y
T
 
Q
A
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
P
P
 
D
R
 
F
R
 
R
L
 
L
P
 
P
W
 
V
Q
 
E
-
 
D
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
F
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
V
-
 
D
T
 
T
M
 
A
V
 
V
L
 
V
S
 
V
H
 
S
P
 
P
N
 
N
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
S
T
 
V
R
 
G
H
 
V
S
 
P
A
 
L
A
 
A
T
 
D
L
 
L
L
 
R
A
 
R
W
 
L
C
 
A
D
 
D
A
 
-
L
 
L
A
 
V
A
 
G
E
 
P
G
 
D
G
 
V
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
A
 
S
F
 
F
C
 
V
D
 
D
A
 
F
E
 
A
P
 
P
E
 
A
-
 
P
-
 
I
T
 
A
S
 
S
L
 
I
A
 
G
P
 
P
S
 
F
A
 
L
G
 
D
R
 
R
-
 
H
P
 
R
G
 
N
L
 
V
V
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
K
S
 
S
L
 
I
G
 
S
K
|
K
F
 
V
Y
 
Y
G
 
G
L
 
V
A
 
G
G
 
G
A
 
I
R
 
R
V
 
L
G
 
G
F
 
Y
-
 
A
L
 
A
L
 
T
G
 
A
P
 
D
Q
 
T
A
 
E
L
 
L
R
 
A
Q
 
R
R
 
T
L
 
L
A
 
R
D
 
A
L
 
E
L
 
L
G
 
P
P
 
I
W
 
W
P
 
D
V
 
I
A
 
N
G
 
G
P
 
F
A
 
A
R
 
E
H
 
E
A
 
F
A
 
L
-
 
R
-
 
V
-
 
L
-
 
P
-
 
H
-
 
F
R
 
R
Q
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
A
D
 
D
S
 
S
A
 
C
W
 
R
Q
 
Q
D
 
M
R
 
R
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

4r8dA Crystal structure of rv1600 encoded aminotransferase in complex with plp-mes from mycobacterium tuberculosis
28% identity, 54% coverage: 139:323/341 of query aligns to 163:339/369 of 4r8dA

query
sites
4r8dA
Q
 
D
T
 
V
M
 
V
V
 
F
L
 
I
S
 
A
H
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
S
G
 
G
T
 
-
R
 
-
H
 
-
S
 
Q
A
 
S
A
 
V
T
 
S
L
 
L
L
 
P
A
 
D
W
 
L
C
 
C
D
 
K
A
 
L
L
 
L
A
 
D
A
 
V
E
 
A
G
 
P
G
 
G
Q
 
I
L
 
A
I
 
I
V
 
V
D
|
D
E
 
E
A
|
A
F
x
Y
C
 
G
D
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
-
E
 
E
T
 
F
S
 
S
L
 
S
A
 
Q
P
 
P
S
 
S
A
 
A
G
 
V
R
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
Y
-
 
P
P
 
S
G
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
V
L
 
T
R
 
R
S
x
T
L
 
M
G
x
S
K
|
K
F
 
A
Y
 
F
G
 
A
L
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
G
R
|
R
V
 
L
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
L
 
I
G
 
A
P
 
T
Q
 
P
A
 
A
L
 
V
R
 
I
Q
 
D
R
 
A
L
 
M
A
 
L
D
 
L
L
 
V
L
 
R
G
 
L
P
 
P
W
 
Y
P
 
H
V
 
L
A
 
S
G
 
S
P
 
V
A
 
T
R
 
Q
H
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
R
D
 
H
S
 
S
A
 
D
W
 
D
Q
 
T
D
 
L
R
 
S
Q
 
S
R
 
V
H
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
A
S
 
E
S
 
R
E
 
E
R
 
R
L
 
V
D
 
T
H
 
T
L
 
S
L
 
L
T
 
N
R
 
D
A
 
M
G
 
G
L
 
-
A
 
-
P
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
F
R
 
R
W
 
V
T
 
I
P
 
P
C
 
S
H
 
D
D
 
A
A
 
N
R
 
F
Q
 
V
R
 
L
Q
 
F
A
 
G
E
 
E
L
 
F
A
 
A
R
 
D
A
 
A
-
 
P
G
 
A
I
 
A
W
 
W
V
 
R
R
 
R
A
 
Y
F
 
L
D
 
E
A
 
A
P
 
G
A
 
I
G
 
L
L
 
I
R
 
R
-
 
D
F
 
V
G
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4r5zA Crystal structure of rv3772 encoded aminotransferase (see paper)
28% identity, 55% coverage: 141:327/341 of query aligns to 150:339/353 of 4r5zA

query
sites
4r5zA
M
 
I
V
 
F
L
 
V
S
 
C
H
 
N
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
S
T
 
T
R
 
V
H
 
V
S
 
G
A
 
P
A
 
D
T
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
R
W
 
F
C
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
P
A
 
A
E
 
H
G
 
I
G
 
-
Q
 
L
L
 
I
I
 
A
V
 
I
D
|
D
E
 
E
A
|
A
F
x
Y
C
 
V
-
 
E
-
 
Y
-
 
I
-
 
R
D
 
D
A
 
G
E
 
M
P
 
R
E
 
P
T
 
D
S
 
S
L
 
L
A
 
G
P
 
L
S
 
V
A
 
R
G
 
A
R
 
H
P
 
N
G
 
N
L
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
L
R
 
R
S
x
T
L
 
F
G
x
S
K
|
K
F
 
A
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
L
R
|
R
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
L
 
A
L
 
I
G
 
G
P
 
H
Q
 
P
A
 
D
L
 
V
R
 
I
Q
 
T
R
 
A
L
 
L
A
 
D
D
 
K
L
 
V
L
 
Y
G
 
V
P
 
P
W
 
F
P
 
T
V
 
V
A
 
S
G
 
S
P
 
I
A
 
G
R
 
Q
H
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
I
Q
 
A
A
 
S
L
 
L
A
 
D
D
 
A
S
 
A
A
 
D
W
 
E
Q
 
L
D
 
L
R
 
A
Q
 
R
R
 
T
H
 
D
V
 
T
L
 
V
A
 
V
A
 
A
S
 
E
S
 
R
E
 
A
R
 
R
L
 
V
D
 
S
H
 
A
L
 
E
L
 
L
T
 
R
R
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
F
A
 
T
P
 
L
T
 
P
G
 
P
G
 
S
T
 
Q
A
 
A
L
 
N
F
 
F
R
 
V
W
 
W
T
 
L
P
 
P
C
 
L
H
 
G
D
 
S
A
 
R
R
 
T
Q
 
Q
R
 
D
Q
 
F
A
 
V
E
 
E
-
 
Q
L
 
A
A
 
A
R
 
D
A
 
A
G
 
R
I
 
I
W
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
P
F
 
Y
D
 
G
A
 
T
P
 
D
A
 
-
G
 
G
L
 
V
R
 
R
F
 
V
G
 
T
L
 
V
P
 
A
G
 
A
P
 
P
E
 
E
S
 
E
D
 
N

Sites not aligning to the query:

4r2nA Crystal structure of rv3772 in complex with its substrate (see paper)
28% identity, 55% coverage: 141:327/341 of query aligns to 150:339/353 of 4r2nA

query
sites
4r2nA
M
 
I
V
 
F
L
 
V
S
 
C
H
 
N
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
S
T
 
T
R
 
V
H
 
V
S
 
G
A
 
P
A
 
D
T
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
R
W
 
F
C
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
P
A
 
A
E
 
H
G
 
I
G
 
-
Q
 
L
L
 
I
I
 
A
V
 
I
D
|
D
E
 
E
A
|
A
F
x
Y
C
 
V
-
 
E
-
 
Y
-
 
I
-
 
R
D
 
D
A
 
G
E
 
M
P
 
R
E
 
P
T
 
D
S
 
S
L
 
L
A
 
G
P
 
L
S
 
V
A
 
R
G
 
A
R
 
H
P
 
N
G
 
N
L
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
L
R
 
R
S
x
T
L
 
F
G
x
S
K
|
K
F
 
A
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
L
R
|
R
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
L
 
A
L
 
I
G
 
G
P
 
H
Q
 
P
A
 
D
L
 
V
R
 
I
Q
 
T
R
 
A
L
 
L
A
 
D
D
 
K
L
 
V
L
 
Y
G
 
V
P
|
P
W
x
F
P
 
T
V
 
V
A
 
S
G
 
S
P
 
I
A
 
G
R
 
Q
H
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
I
Q
 
A
A
 
S
L
 
L
A
 
D
D
 
A
S
 
A
A
 
D
W
 
E
Q
 
L
D
 
L
R
 
A
Q
 
R
R
 
T
H
 
D
V
 
T
L
 
V
A
 
V
A
 
A
S
 
E
S
 
R
E
 
A
R
 
R
L
 
V
D
 
S
H
 
A
L
 
E
L
 
L
T
 
R
R
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
F
A
 
T
P
 
L
T
 
P
G
 
P
G
 
S
T
 
Q
A
 
A
L
 
N
F
 
F
R
 
V
W
 
W
T
 
L
P
 
P
C
 
L
H
 
G
D
 
S
A
 
R
R
 
T
Q
 
Q
R
 
D
Q
 
F
A
 
V
E
 
E
-
 
Q
L
 
A
A
 
A
R
 
D
A
 
A
G
 
R
I
 
I
W
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
P
F
 
Y
D
 
G
A
 
T
P
 
D
A
 
-
G
 
G
L
 
V
R
|
R
F
 
V
G
 
T
L
 
V
P
 
A
G
 
A
P
 
P
E
 
E
S
 
E
D
 
N

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011814644.1 NCBI__GCF_000015585.1:WP_011814644.1
MAEQHPLPRMEEHGGNLDQATARFGLPREGWVDLSTGINPTPFPLTPAPDAAWHRLPEAD
DLEARAAEHYRAGNNAALALPGSQAAISLLPALEPPGYVAIPAPEYAEHARAWQRWGHRV
ERLTADCIAAGPPRRLPWQTMVLSHPNNPTGTRHSAATLLAWCDALAAEGGQLIVDEAFC
DAEPETSLAPSAGRPGLVLLRSLGKFYGLAGARVGFLLGPQALRQRLADLLGPWPVAGPA
RHAARQALADSAWQDRQRHVLAASSERLDHLLTRAGLAPTGGTALFRWTPCHDARQRQAE
LARAGIWVRAFDAPAGLRFGLPGPESDWQRLAAALGCPPGD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory