SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011840076.1 NCBI__GCF_000015985.1:WP_011840076.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8y46B SDR family oxidoreductase (see paper)
59% identity, 98% coverage: 4:235/236 of query aligns to 5:247/248 of 8y46B

query
sites
8y46B
K
 
K
T
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
S
A
 
T
E
 
E
R
 
L
F
 
F
L
 
A
A
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
I
A
 
A
S
 
T
D
 
D
L
 
I
D
 
S
A
 
K
R
 
T
L
 
H
L
 
L
D
 
E
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
S
-
 
I
-
 
A
-
 
G
-
 
V
E
 
E
G
 
T
H
 
H
A
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
T
D
 
D
G
 
D
A
 
D
A
 
A
V
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
K
L
 
V
G
 
G
P
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
F
N
 
N
C
 
C
A
 
A
G
 
G
V
 
Y
V
 
V
H
 
A
G
 
A
G
 
G
T
 
N
I
 
I
L
 
L
D
 
E
Q
 
C
T
 
D
E
 
D
A
 
K
E
 
A
L
 
W
D
 
D
L
 
F
A
 
S
L
 
F
D
 
N
I
 
L
N
 
N
L
 
A
R
 
K
G
 
A
T
 
M
I
 
F
R
 
H
T
 
T
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
K
G
 
K
S
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
V
 
A
S
 
S
S
 
S
L
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
V
P
 
A
D
 
N
R
|
R
C
 
F
V
 
A
Y
|
Y
G
 
G
T
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
V
S
 
S
R
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
 
P
G
|
G
T
 
T
V
 
I
E
 
E
S
 
S
P
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
N
E
 
Q
R
|
R
L
 
I
G
 
S
A
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
K
-
 
E
T
 
T
G
 
G
D
 
K
A
 
S
E
 
E
-
 
D
A
 
E
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
A
 
A
R
|
R
Q
 
Q
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
K
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
W
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
S
-
 
D
-
 
E
S
 
S
G
 
N
Y
 
F
T
 
T
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
A
 
I
I
 
H
A
 
M
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
S

8y46A SDR family oxidoreductase (see paper)
59% identity, 98% coverage: 4:235/236 of query aligns to 8:250/251 of 8y46A

query
sites
8y46A
K
 
K
T
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
S
A
 
T
E
 
E
R
 
L
F
 
F
L
 
A
A
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
I
A
 
A
S
 
T
D
 
D
L
 
I
D
 
S
A
 
K
R
 
T
L
 
H
L
 
L
D
 
E
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
S
-
 
I
-
 
A
-
 
G
-
 
V
E
 
E
G
 
T
H
 
H
A
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
T
D
 
D
G
 
D
A
 
D
A
 
A
V
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
K
L
 
V
G
 
G
P
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
F
N
 
N
C
 
C
A
 
A
G
 
G
V
 
Y
V
 
V
H
 
A
G
 
A
G
 
G
T
 
N
I
 
I
L
 
L
D
 
E
Q
 
C
T
 
D
E
 
D
A
 
K
E
 
A
L
 
W
D
 
D
L
 
F
A
 
S
L
 
F
D
 
N
I
 
L
N
 
N
L
 
A
R
 
K
G
 
A
T
 
M
I
 
F
R
 
H
T
 
T
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
K
G
 
K
S
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
V
 
A
V
 
A
S
 
S
S
 
S
L
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
V
P
 
A
D
 
N
R
|
R
C
 
F
V
 
A
Y
|
Y
G
 
G
T
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
V
S
 
S
R
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
T
V
 
I
E
 
E
S
 
S
P
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
N
E
 
Q
R
|
R
L
 
I
G
 
S
A
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
K
-
 
E
T
 
T
G
 
G
D
 
K
A
 
S
E
 
E
-
 
D
A
 
E
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
A
 
A
R
|
R
Q
 
Q
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
K
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
W
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
S
-
 
D
-
 
E
S
 
S
G
 
N
Y
 
F
T
 
T
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
A
 
I
I
 
H
A
 
M
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
|
W
T
 
S

8y4jA SDR family oxidoreductase (see paper)
59% identity, 98% coverage: 4:235/236 of query aligns to 6:248/249 of 8y4jA

query
sites
8y4jA
K
 
K
T
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
S
A
 
T
E
 
E
R
 
L
F
 
F
L
 
A
A
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
I
A
 
A
S
 
T
D
 
D
L
 
I
D
 
S
A
 
K
R
 
T
L
 
H
L
 
L
D
 
E
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
S
-
 
I
-
 
A
-
 
G
-
 
V
E
 
E
G
 
T
H
 
H
A
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
T
D
 
D
G
 
D
A
 
D
A
 
A
V
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
K
L
 
V
G
 
G
P
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
F
N
 
N
C
 
C
A
 
A
G
 
G
V
 
Y
V
 
V
H
 
A
G
 
A
G
 
G
T
 
N
I
 
I
L
 
L
D
 
E
Q
 
C
T
 
D
E
 
D
A
 
K
E
 
A
L
 
W
D
 
D
L
 
F
A
 
S
L
 
F
D
 
N
I
 
L
N
 
N
L
 
A
R
 
K
G
 
A
T
 
M
I
 
F
R
 
H
T
 
T
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
K
G
 
K
S
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
V
 
A
V
 
A
S
 
S
S
 
S
L
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
V
P
 
A
D
 
N
R
|
R
C
 
F
V
 
A
Y
|
Y
G
 
G
T
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
V
S
 
S
R
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
 
P
G
|
G
T
 
T
V
 
I
E
 
E
S
 
S
P
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
N
E
 
Q
R
|
R
L
 
I
G
 
S
A
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
K
-
 
E
T
 
T
G
 
G
D
 
K
A
 
S
E
 
E
-
 
D
A
 
E
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
A
 
A
R
|
R
Q
 
Q
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
K
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
W
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
S
-
 
D
-
 
E
S
 
S
G
 
N
Y
 
F
T
 
T
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
A
 
I
I
 
H
A
 
M
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
S

8y11A Crystal structure of l-2-keto-3-deoxyfuconate 4-dehydrogenase bound to NAD(h) and sulfate ion (see paper)
59% identity, 98% coverage: 4:235/236 of query aligns to 6:248/249 of 8y11A

query
sites
8y11A
K
 
K
T
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
|
A
A
 
A
G
 
A
Q
|
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
S
A
 
T
E
 
E
R
 
L
F
 
F
L
 
A
A
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
I
A
 
A
S
 
T
D
|
D
L
x
I
D
 
S
A
 
K
R
 
T
L
 
H
L
 
L
D
 
E
G
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
S
-
 
I
-
 
A
-
 
G
-
 
V
E
 
E
G
 
T
H
 
H
A
 
L
L
 
L
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
D
G
 
D
A
 
D
A
 
A
V
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
K
L
 
V
G
 
G
P
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
F
N
 
N
C
|
C
A
 
A
G
 
G
V
 
Y
V
 
V
H
 
A
G
 
A
G
 
G
T
 
N
I
 
I
L
 
L
D
 
E
Q
 
C
T
 
D
E
 
D
A
 
K
E
 
A
L
 
W
D
 
D
L
 
F
A
 
S
L
 
F
D
 
N
I
 
L
N
 
N
L
 
A
R
 
K
G
 
A
T
 
M
I
 
F
R
 
H
T
 
T
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
K
G
 
K
S
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
 
S
V
 
A
V
 
A
S
 
S
S
 
S
L
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
V
P
 
A
D
 
N
R
 
R
C
 
F
V
 
A
Y
|
Y
G
 
G
T
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
V
S
 
S
R
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
|
T
V
x
I
E
 
E
S
|
S
P
|
P
S
|
S
L
 
L
R
 
N
E
 
Q
R
|
R
L
 
I
G
 
S
A
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
K
-
 
E
T
 
T
G
 
G
D
 
K
A
 
S
E
 
E
-
 
D
A
 
E
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
K
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
W
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
S
-
 
D
-
 
E
S
 
S
G
 
N
Y
 
F
T
 
T
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
A
 
I
I
 
H
A
 
M
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
S

D4A1J4 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
47% identity, 100% coverage: 1:236/236 of query aligns to 4:245/245 of D4A1J4

query
sites
D4A1J4
M
 
L
Q
 
E
E
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
I
L
 
V
I
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
S
A
 
A
E
 
L
R
 
A
F
 
F
L
 
A
A
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
S
 
T
D
 
D
L
 
I
D
 
N
A
 
E
R
 
A
L
 
K
L
 
L
D
 
Q
G
 
E
L
 
L
A
 
E
A
 
N
-
 
Y
-
 
P
-
 
G
-
 
I
E
 
Q
G
 
T
H
 
R
A
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
T
D
 
K
G
 
K
A
 
R
A
 
Q
V
 
I
E
 
D
A
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
S
G
 
E
L
 
I
G
 
E
P
 
K
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
F
N
 
N
C
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
F
V
 
V
H
 
H
G
 
H
G
 
G
T
 
T
I
 
I
L
 
L
D
 
D
Q
 
C
T
 
E
E
 
E
A
 
K
E
 
D
L
 
W
D
 
D
L
 
F
A
 
S
L
 
M
D
 
N
I
 
L
N
 
N
L
 
V
R
 
R
G
 
S
T
 
M
I
 
Y
R
 
L
T
 
M
I
 
I
R
 
K
A
 
A
V
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
G
 
K
S
 
S
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
S
S
 
S
V
 
V
V
 
A
S
 
S
S
 
S
L
 
I
K
 
K
G
 
G
A
 
V
P
 
E
D
 
N
R
 
R
C
 
C
V
 
V
Y
|
Y
G
 
S
T
 
A
S
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
S
 
Q
R
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
T
V
 
V
E
 
D
S
 
T
P
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
R
 
R
L
 
I
G
 
Q
A
 
A
T
 
R
G
 
D
D
 
D
A
 
P
E
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
L
A
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
L
A
 
N
R
 
R
Q
 
Q
P
 
K
M
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
A
T
 
S
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
L
L
 
L
A
 
C
L
 
V
W
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
S
-
 
D
-
 
E
S
 
S
G
 
A
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
A
 
P
I
 
V
A
 
V
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
S
I
 
L

Q8JZV9 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
47% identity, 99% coverage: 4:236/236 of query aligns to 7:245/245 of Q8JZV9

query
sites
Q8JZV9
K
 
K
T
 
V
V
 
I
L
 
V
I
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
S
A
 
A
E
 
L
R
 
A
F
 
F
L
 
A
A
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
S
 
T
D
 
D
L
 
I
D
 
N
A
 
E
R
 
S
L
 
K
L
 
L
D
 
Q
G
 
E
L
 
L
A
 
E
A
 
S
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
-
 
I
E
 
Q
G
 
T
H
 
R
A
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
T
D
 
K
G
 
K
A
 
R
A
 
Q
V
 
I
E
 
D
A
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
S
G
 
E
L
 
I
G
 
E
P
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
F
N
 
N
C
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
F
V
 
V
H
 
H
G
 
H
G
 
G
T
 
T
I
 
I
L
 
L
D
 
D
Q
 
C
T
 
E
E
 
E
A
 
K
E
 
D
L
 
W
D
 
D
L
 
F
A
 
S
L
 
M
D
 
N
I
 
L
N
 
N
L
 
V
R
 
R
G
 
S
T
 
M
I
 
F
R
 
L
T
 
M
I
 
I
R
 
K
A
 
A
V
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
G
 
K
S
 
S
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
S
S
 
S
V
 
V
V
 
A
S
 
S
S
 
S
L
 
I
K
 
K
G
 
G
A
 
V
P
 
E
D
 
N
R
 
R
C
 
C
V
 
V
Y
|
Y
G
 
S
T
 
A
S
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
S
 
Q
R
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
T
V
 
V
E
 
D
S
 
T
P
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
R
 
R
L
 
I
G
 
Q
A
 
A
T
 
R
G
 
D
D
 
N
A
 
P
E
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
L
A
 
K
A
 
T
F
 
F
V
 
L
A
 
N
R
 
R
Q
 
Q
P
 
K
M
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
A
T
 
S
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
L
L
 
L
A
 
C
L
 
V
W
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
S
-
 
D
-
 
E
S
 
S
G
 
A
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
N
A
 
P
I
 
V
A
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
S
I
 
L

Q9BUT1 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
48% identity, 91% coverage: 23:236/236 of query aligns to 26:245/245 of Q9BUT1

query
sites
Q9BUT1
F
 
F
L
 
A
A
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
S
 
T
D
|
D
L
 
I
D
 
N
A
 
E
R
 
S
L
 
K
L
 
L
D
 
Q
G
 
E
L
 
L
A
 
E
A
 
K
-
 
Y
-
 
P
-
 
G
-
 
I
E
 
Q
G
 
T
H
 
R
A
 
V
L
 
L
D
|
D
V
 
V
R
 
T
D
 
K
G
 
K
A
 
K
A
 
Q
V
 
I
E
 
D
A
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
x
N
G
 
E
L
 
V
G
 
E
P
 
R
V
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
F
N
 
N
C
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
F
V
 
V
H
 
H
G
 
H
G
 
G
T
 
T
I
 
V
L
 
L
D
 
D
Q
 
C
T
 
E
E
 
E
A
 
K
E
 
D
L
 
W
D
 
D
L
 
F
A
 
S
L
 
M
D
 
N
I
 
L
N
 
N
L
 
V
R
 
R
G
 
S
T
 
M
I
 
Y
R
 
L
T
 
M
I
 
I
R
 
K
A
 
A
V
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
G
 
K
S
 
S
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
S
S
 
S
V
 
V
V
 
A
S
 
S
S
 
S
L
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
V
P
 
V
D
 
N
R
 
R
C
 
C
V
 
V
Y
 
Y
G
 
S
T
 
T
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
S
 
Q
R
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
T
V
|
V
E
x
D
S
x
T
P
|
P
S
|
S
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
R
 
R
L
 
I
G
 
Q
A
 
A
T
 
R
G
 
G
D
 
N
A
 
P
E
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
N
A
 
D
F
 
F
V
 
L
A
 
K
R
 
R
Q
 
Q
P
 
K
M
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
M
L
 
L
A
 
C
L
 
V
W
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
S
-
 
D
-
 
E
S
 
S
G
 
A
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
N
A
 
P
I
 
V
A
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
S
I
 
L

Sites not aligning to the query:

2ag5A Crystal structure of human dhrs6 (see paper)
48% identity, 91% coverage: 23:236/236 of query aligns to 26:245/246 of 2ag5A

query
sites
2ag5A
F
 
F
L
 
A
A
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
S
 
T
D
|
D
L
x
I
D
 
N
A
 
E
R
 
S
L
 
K
L
 
L
D
 
Q
G
 
E
L
 
L
A
 
E
A
 
K
-
 
Y
-
 
P
-
 
G
-
 
I
E
 
Q
G
 
T
H
 
R
A
 
V
L
 
L
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
K
G
 
K
A
 
K
A
 
Q
V
 
I
E
 
D
A
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
N
G
 
E
L
 
V
G
 
E
P
 
R
V
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
F
N
 
N
C
x
V
A
 
A
G
|
G
V
 
F
V
 
V
H
 
H
G
 
H
G
 
G
T
 
T
I
 
V
L
 
L
D
 
D
Q
 
C
T
 
E
E
 
E
A
 
K
E
 
D
L
 
W
D
 
D
L
 
F
A
 
S
L
 
M
D
 
N
I
x
L
N
 
N
L
 
V
R
 
R
G
 
S
T
 
M
I
 
Y
R
 
L
T
 
M
I
 
I
R
 
K
A
 
A
V
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
G
 
K
S
 
S
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
S
S
|
S
V
 
V
V
 
A
S
 
S
S
 
S
L
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
V
P
 
V
D
 
N
R
|
R
C
 
C
V
 
V
Y
|
Y
G
 
S
T
 
T
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
S
 
Q
R
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
 
G
T
 
T
V
|
V
E
 
D
S
x
T
P
 
P
S
|
S
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
R
|
R
L
 
I
G
 
Q
A
 
A
T
x
R
G
 
G
D
 
N
A
 
P
E
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
N
A
 
D
F
|
F
V
 
L
A
 
K
R
|
R
Q
 
Q
P
 
K
M
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
M
L
 
L
A
 
C
L
 
V
W
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
S
-
 
D
-
 
E
S
 
S
G
 
A
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
N
A
 
P
I
 
V
A
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
S
I
 
L

Sites not aligning to the query:

2cfcA Structural basis for stereo selectivity in the (r)- and (s)- hydroxypropylethane thiosulfonate dehydrogenases (see paper)
41% identity, 98% coverage: 4:235/236 of query aligns to 3:248/250 of 2cfcA

query
sites
2cfcA
K
 
R
T
 
V
V
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
A
G
 
S
Q
x
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
R
 
L
A
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
T
R
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
A
A
 
A
S
 
L
D
|
D
L
|
L
D
 
S
A
 
A
R
 
E
L
 
T
L
 
L
D
 
E
G
 
E
L
 
T
A
 
A
-
 
R
A
 
T
E
 
H
G
 
W
H
 
H
A
 
A
L
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
V
-
 
R
-
x
A
D
|
D
V
|
V
R
 
A
D
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
D
-
 
V
G
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
I
E
 
A
A
 
A
L
 
T
V
 
M
A
 
E
G
 
Q
L
 
F
G
 
G
P
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
V
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
S
H
 
E
G
 
A
G
 
G
T
 
V
I
 
L
L
 
H
D
 
T
Q
 
T
T
 
P
E
 
V
A
 
E
E
 
Q
L
 
F
D
 
D
L
 
K
A
 
V
L
 
M
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
V
R
 
R
G
 
G
T
 
I
I
 
F
R
 
L
T
 
G
I
 
C
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
M
L
 
L
A
 
L
A
 
Q
G
 
G
S
 
A
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
V
 
V
V
 
-
S
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
V
G
 
A
A
x
F
P
 
P
D
 
G
R
|
R
C
 
S
V
 
A
Y
|
Y
G
 
T
T
 
T
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
V
D
 
D
F
 
Y
V
 
A
S
 
G
R
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
x
M
V
x
I
E
 
E
S
x
T
P
|
P
S
x
M
L
x
T
R
 
Q
E
x
W
R
|
R
L
 
L
G
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
D
A
 
Q
E
 
P
A
 
E
A
 
L
R
 
R
A
 
D
A
 
Q
F
 
V
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
I
P
 
P
M
 
Q
G
 
K
R
 
E
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
A
E
 
A
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
A
A
 
V
L
 
M
W
 
F
L
 
L
A
 
A
C
 
G
-
 
E
-
 
D
S
 
A
G
 
T
Y
 
Y
T
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
W
 
Y
T
 
T

Q56840 2-(R)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase; R-HPCDH; 2-[(R)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase; Aliphatic epoxide carboxylation component III; Epoxide carboxylase component III; RHPCDH1; EC 1.1.1.268 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 4 papers)
41% identity, 98% coverage: 4:235/236 of query aligns to 3:248/250 of Q56840

query
sites
Q56840
K
 
R
T
 
V
V
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
A
 
G
A
 
A
G
 
S
Q
x
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
R
 
L
A
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
T
R
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
A
A
 
A
S
 
L
D
|
D
L
 
L
D
 
S
A
 
A
R
 
E
L
 
T
L
 
L
D
 
E
G
 
E
L
 
T
A
 
A
-
 
R
A
 
T
E
 
H
G
 
W
H
 
H
A
 
A
L
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
V
-
 
R
-
 
A
D
|
D
V
|
V
R
 
A
D
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
D
-
 
V
G
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
I
E
 
A
A
 
A
L
 
T
V
 
M
A
 
E
G
 
Q
L
 
F
G
 
G
P
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
S
H
 
E
G
 
A
G
 
G
T
 
V
I
 
L
L
 
H
D
 
T
Q
 
T
T
 
P
E
 
V
A
 
E
E
 
Q
L
 
F
D
 
D
L
 
K
A
 
V
L
 
M
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
V
R
 
R
G
 
G
T
 
I
I
 
F
R
 
L
T
 
G
I
 
C
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
M
L
 
L
A
 
L
A
 
Q
G
 
G
S
 
A
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
V
V
 
-
S
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
V
G
 
A
A
 
F
P
 
P
D
 
G
R
|
R
C
 
S
V
 
A
Y
|
Y
G
 
T
T
 
T
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
V
D
 
D
F
 
Y
V
 
A
S
 
G
R
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
M
V
x
I
E
|
E
S
x
T
P
|
P
S
x
M
L
 
T
R
 
Q
E
x
W
R
|
R
L
 
L
G
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
D
A
 
Q
E
 
P
A
 
E
A
 
L
R
|
R
A
 
D
A
 
Q
F
 
V
V
 
L
A
 
A
R
|
R
Q
 
I
P
 
P
M
 
Q
G
 
K
R
 
E
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
A
E
 
A
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
A
A
 
V
L
 
M
W
 
F
L
 
L
A
 
A
C
 
G
-
 
E
-
 
D
S
 
A
G
 
T
Y
 
Y
T
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
W
 
Y
T
 
T

Sites not aligning to the query:

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:235/236 of query aligns to 5:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
L
Q
 
T
E
 
D
K
 
K
T
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
x
G
A
 
G
G
 
A
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
C
 
A
A
 
V
E
 
Q
R
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
G
A
 
Q
G
 
Q
A
 
A
R
 
N
V
 
V
L
 
V
A
 
V
S
 
A
D
|
D
L
x
I
D
 
D
A
 
E
R
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
H
 
E
A
 
A
L
 
M
-
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
E
-
 
N
-
 
N
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
H
-
 
F
-
 
V
-
 
Q
-
x
T
D
 
D
V
x
I
R
 
T
D
 
D
G
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
C
-
 
Q
-
 
H
-
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
S
L
 
A
V
 
V
A
 
H
G
 
T
L
 
F
G
 
G
P
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
V
 
E
H
 
I
G
 
V
G
 
A
T
 
P
I
 
I
L
 
H
D
 
E
Q
 
M
T
 
E
E
 
L
A
 
S
E
 
D
L
 
W
D
 
N
L
 
K
A
 
V
L
 
L
D
 
Q
I
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
M
I
 
F
R
 
L
T
 
M
I
 
S
R
 
K
A
 
H
V
 
A
L
 
L
P
 
K
G
 
H
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
V
 
V
V
 
-
S
 
G
S
 
G
L
 
L
K
 
V
G
 
A
A
 
W
P
 
P
D
 
D
R
 
I
C
 
P
V
 
A
Y
|
Y
G
 
N
T
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
M
A
 
A
A
 
V
D
 
D
F
 
Y
V
 
A
S
 
K
R
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
x
I
V
x
I
E
 
D
S
 
T
P
 
P
S
 
-
L
 
L
R
 
N
E
 
E
R
 
K
-
 
S
-
 
F
-
 
L
L
 
E
G
 
N
A
 
N
T
 
E
G
 
G
D
 
T
A
 
L
E
 
E
A
 
E
A
 
I
R
 
K
A
 
K
A
 
E
F
 
K
V
 
A
A
 
K
R
 
V
Q
 
N
P
 
P
M
 
L
G
 
L
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
N
L
 
V
A
 
M
L
 
L
W
 
F
L
 
L
A
 
A
C
 
S
-
 
D
-
 
L
S
 
S
G
 
S
Y
 
Y
T
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
T
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
T
 
T

6qheA Alcohol dehydrogenase from arthrobacter sp. Ts-15 in complex with NAD+
34% identity, 100% coverage: 1:236/236 of query aligns to 5:256/261 of 6qheA

query
sites
6qheA
M
 
M
Q
 
R
E
 
N
K
 
R
T
 
V
V
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
G
G
 
A
Q
x
M
G
|
G
I
x
M
G
 
G
R
 
N
A
 
G
C
 
C
A
 
A
E
 
R
R
 
K
F
 
L
L
 
A
A
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
Y
A
 
L
S
 
I
D
|
D
-
x
R
-
 
S
-
 
N
-
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
A
L
 
Q
D
 
D
A
 
M
R
 
R
L
 
E
L
 
A
D
 
-
G
 
G
L
 
L
A
 
N
A
 
A
E
 
N
G
 
H
H
 
V
A
 
Q
L
 
V
D
|
D
V
x
I
R
 
T
D
 
D
G
 
Q
-
 
E
-
 
S
-
 
L
-
 
T
A
 
S
A
 
A
V
 
Y
E
 
D
A
 
G
L
 
I
V
 
A
A
 
A
G
 
E
L
 
S
G
 
G
P
 
R
V
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
V
 
G
H
 
D
G
 
S
G
 
R
T
 
M
I
 
F
L
 
L
D
 
D
Q
 
V
T
 
D
E
 
D
A
 
A
E
 
H
L
 
Y
D
 
K
L
 
K
A
 
V
L
 
I
D
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
V
R
 
R
G
 
G
T
 
T
I
 
W
R
 
N
T
 
S
I
 
C
R
 
R
A
 
A
V
 
A
L
 
V
P
 
P
G
 
H
M
 
M
L
 
L
A
 
S
A
 
N
G
 
K
S
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
F
A
 
G
S
|
S
V
 
I
V
 
S
S
 
G
S
 
P
L
 
I
K
 
V
G
 
A
A
 
D
P
 
P
D
 
G
R
 
W
C
 
T
V
 
V
Y
|
Y
G
 
A
T
 
L
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
F
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
E
F
 
F
V
 
A
S
 
G
R
 
Q
G
 
N
I
 
I
R
 
L
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
L
P
|
P
G
|
G
T
 
S
V
x
M
E
 
D
S
x
T
P
|
P
S
x
M
L
 
M
R
 
R
E
 
A
R
 
A
L
 
A
G
 
A
A
 
D
T
 
T
G
 
N
-
 
P
-
 
A
D
 
D
A
 
P
E
 
Q
A
 
S
A
 
V
R
 
I
A
 
D
A
 
E
F
 
I
V
 
A
A
 
A
R
 
A
Q
 
V
P
 
P
M
 
L
G
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
I
E
 
D
E
 
D
I
 
A
A
 
G
D
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
L
W
 
F
L
 
L
A
 
A
C
 
S
-
 
D
-
 
L
S
 
A
G
 
S
Y
 
Y
T
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
V
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
W
 
F
T
 
T
I
 
L

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
37% identity, 99% coverage: 1:233/236 of query aligns to 3:236/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
M
 
L
Q
 
E
E
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
A
x
G
A
 
G
G
 
A
Q
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
L
R
 
A
F
 
Y
L
 
A
A
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
S
 
G
D
|
D
L
|
L
D
 
G
A
 
D
R
 
L
L
 
T
L
 
Y
D
 
S
G
 
H
L
 
P
A
 
N
A
 
V
E
 
E
G
 
G
H
 
M
A
 
Y
L
|
L
D
x
N
V
|
V
R
 
T
D
 
D
G
 
V
A
 
T
A
 
G
V
 
V
E
 
E
-
 
K
-
 
F
-
 
Y
-
 
Q
A
 
S
L
 
V
V
 
I
A
 
D
G
 
K
L
 
Y
G
 
G
P
 
K
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
V
 
T
H
 
K
G
 
D
G
 
A
T
 
M
I
 
T
L
 
R
D
 
K
Q
 
M
T
 
T
E
 
E
A
 
A
E
 
Q
L
 
W
D
 
D
L
 
A
A
 
V
L
 
I
D
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
V
I
 
F
R
 
N
T
 
L
I
 
T
R
 
R
A
 
L
V
 
V
L
 
G
P
 
P
G
 
Q
M
 
M
L
 
Q
A
 
T
A
 
N
G
 
G
S
 
Y
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
V
 
V
V
 
V
S
 
G
S
 
V
L
 
F
K
 
-
G
 
G
A
 
N
P
 
I
D
 
G
R
 
Q
C
 
A
V
 
N
Y
|
Y
G
 
A
T
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
M
S
 
T
V
 
W
A
 
A
A
 
K
D
 
E
F
 
F
V
 
A
S
 
L
R
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
N
I
 
V
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
A
P
|
P
G
|
G
T
 
Y
V
x
I
E
 
M
S
x
T
P
 
D
S
 
I
L
 
L
R
 
K
E
 
T
R
 
V
L
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
P
E
 
Q
A
 
D
A
 
L
R
 
L
A
 
D
A
 
K
F
 
F
V
 
A
A
 
A
R
 
L
Q
 
T
P
 
M
M
 
L
G
 
N
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
F
L
 
L
A
 
A
C
 
S
-
 
D
-
 
D
S
 
A
G
 
S
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
I
 
I
A
 
N
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
34% identity, 99% coverage: 1:233/236 of query aligns to 3:242/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
M
 
I
Q
 
Q
E
 
N
K
 
R
T
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
G
A
 
S
G
 
A
Q
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
C
 
T
A
 
A
E
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
A
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
I
S
 
N
D
|
D
L
 
I
D
 
D
A
 
A
R
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
R
-
 
A
L
 
T
L
 
V
D
 
D
G
 
E
L
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
R
G
 
G
H
 
H
A
 
R
L
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
A
D
|
D
V
x
I
R
 
G
D
 
N
G
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
D
A
 
G
L
 
M
V
 
V
A
 
K
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
-
 
D
G
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
V
 
M
V
 
E
H
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
A
I
 
L
L
 
R
D
 
K
Q
 
L
T
 
S
E
 
E
A
 
A
E
 
D
L
 
W
D
 
D
L
 
V
A
 
T
L
 
I
D
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
F
R
 
L
T
 
C
I
 
T
R
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
H
P
 
G
G
 
H
M
 
M
L
 
V
A
 
E
A
 
N
G
 
K
S
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
V
 
-
V
 
-
S
 
R
S
 
A
L
 
W
K
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
A
D
 
G
R
 
Q
C
 
T
V
 
P
Y
|
Y
G
 
S
T
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
R
S
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
I
D
 
E
F
 
L
V
 
G
S
 
R
R
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
L
V
 
I
E
 
H
S
 
T
P
 
P
S
 
M
L
 
W
R
 
D
E
 
E
R
 
L
L
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
P
E
 
E
A
 
K
A
 
D
R
 
Q
A
 
Q
A
 
F
F
 
L
V
 
L
A
 
S
R
 
R
Q
 
Q
P
 
P
M
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
N
L
 
T
A
 
L
L
 
L
W
 
F
L
 
L
A
 
A
-
 
D
-
 
D
C
 
D
S
 
S
G
 
G
Y
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
V
I
 
L
A
 
Y
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
34% identity, 99% coverage: 1:233/236 of query aligns to 2:241/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
M
 
I
Q
 
Q
E
 
N
K
 
R
T
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
x
G
A
 
S
G
 
A
Q
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
C
 
T
A
 
A
E
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
A
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
I
S
 
N
D
|
D
L
x
I
D
 
D
A
 
A
R
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
R
-
 
A
L
 
T
L
 
V
D
 
D
G
 
E
L
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
R
G
 
G
H
 
H
A
 
R
L
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
A
D
 
D
V
x
I
R
 
G
D
 
N
G
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
D
A
 
G
L
 
M
V
 
V
A
 
K
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
-
 
D
G
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
|
G
V
 
M
V
 
E
H
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
A
I
 
L
L
 
R
D
 
K
Q
 
L
T
 
S
E
 
E
A
 
A
E
 
D
L
 
W
D
 
D
L
 
V
A
 
T
L
 
I
D
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
F
R
 
L
T
 
C
I
 
T
R
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
H
P
 
G
G
 
H
M
 
M
L
 
V
A
 
E
A
 
N
G
 
K
S
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
V
 
-
V
 
-
S
 
R
S
 
A
L
 
W
K
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
A
D
 
G
R
 
Q
C
 
T
V
 
P
Y
|
Y
G
 
S
T
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
R
S
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
I
D
 
E
F
 
L
V
 
G
S
 
R
R
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
L
V
x
I
E
 
H
S
 
T
P
 
P
S
 
M
L
 
W
R
 
D
E
 
E
R
 
L
L
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
P
E
 
E
A
 
K
A
 
D
R
 
Q
A
 
Q
A
 
F
F
 
L
V
 
L
A
 
S
R
 
R
Q
 
Q
P
 
P
M
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
N
L
 
T
A
 
L
L
 
L
W
 
F
L
 
L
A
 
A
-
 
D
-
 
D
C
 
D
S
 
S
G
 
G
Y
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
V
I
 
L
A
 
Y
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

5ts3A Crystal structure of a 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase with bound NAD from brucella melitensis
39% identity, 98% coverage: 2:233/236 of query aligns to 18:261/265 of 5ts3A

query
sites
5ts3A
Q
 
K
E
 
E
K
 
R
T
 
N
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
x
G
A
 
A
G
 
A
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
Q
R
 
A
F
 
F
L
 
V
A
 
E
A
 
R
G
 
S
A
 
A
R
 
T
V
 
V
L
 
G
A
 
I
S
 
C
D
|
D
L
|
L
D
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
T
-
 
C
-
 
E
-
 
E
L
 
L
D
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
R
A
 
A
E
 
V
G
 
P
H
 
I
A
 
A
L
 
C
D
|
D
V
|
V
R
 
S
D
 
D
G
 
Y
A
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
I
A
 
D
G
 
D
L
 
T
G
 
G
P
 
L
V
 
V
-
 
F
D
 
D
V
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
S
-
 
P
-
 
K
H
 
H
G
 
N
G
 
G
T
 
V
-
 
A
-
 
H
-
 
K
I
 
V
L
 
W
D
 
E
Q
 
M
T
 
A
E
 
P
A
 
D
E
 
E
L
 
W
D
 
R
L
 
R
A
 
V
L
 
V
D
 
D
I
x
V
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
T
I
 
F
R
 
N
T
 
T
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
L
L
 
T
P
 
P
G
 
G
M
 
M
L
 
V
A
 
E
A
 
A
G
 
R
S
 
R
G
 
G
S
 
W
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
S
S
|
S
V
 
V
V
 
A
S
 
G
S
 
K
L
 
T
K
 
Y
G
 
S
A
 
P
P
 
I
D
x
V
R
 
A
C
 
C
V
 
H
Y
|
Y
G
 
A
T
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
S
A
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
H
V
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
E
F
 
L
V
 
G
S
 
P
R
 
Y
G
 
S
I
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
M
C
 
A
P
|
P
G
 
G
T
 
R
V
x
I
E
 
A
S
x
T
P
 
P
S
 
M
L
 
V
R
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
A
G
 
G
D
 
V
A
 
A
E
 
P
A
 
E
A
 
V
R
 
N
A
 
A
A
 
E
F
 
Q
V
 
V
A
 
K
R
 
L
Q
 
T
P
 
P
M
 
M
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
E
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
A
 
T
C
 
S
-
 
T
-
 
E
S
 
S
G
 
S
Y
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
I
 
V
A
 
D
I
 
V
D
 
A
G
 
G
G
 
G

7djsD Crystal structure of isopiperitenol dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa complexed with NAD
40% identity, 98% coverage: 4:235/236 of query aligns to 6:249/251 of 7djsD

query
sites
7djsD
K
 
Q
T
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
G
G
 
A
Q
 
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
T
A
 
A
E
 
Q
R
 
A
F
 
F
L
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
V
R
 
K
V
 
V
L
 
V
A
 
V
S
 
A
D
|
D
L
|
L
D
 
D
A
 
S
R
 
A
L
 
G
L
 
G
D
 
E
G
 
G
L
 
T
A
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
R
-
 
Q
A
 
A
E
 
G
G
 
G
H
 
E
A
 
A
L
 
V
-
 
F
-
 
I
-
 
R
-
x
C
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
R
G
 
D
A
 
A
A
 
E
V
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
E
G
 
G
-
 
C
-
 
A
-
 
A
-
 
A
L
 
Y
G
 
G
P
 
R
V
 
L
D
 
D
V
 
Y
L
 
A
V
 
F
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
-
 
E
V
 
I
H
 
E
G
 
Q
G
 
G
T
 
K
I
 
L
L
 
A
D
 
D
Q
 
G
T
 
N
E
 
E
A
 
A
E
 
E
L
 
F
D
 
D
L
 
A
A
 
I
L
 
M
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
V
R
 
K
G
 
G
T
 
V
I
 
W
R
 
L
T
 
C
I
 
M
R
 
K
A
 
H
V
 
Q
L
 
I
P
 
P
G
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
S
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
V
 
V
V
 
-
S
 
A
S
 
G
L
 
L
K
 
G
G
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
K
R
 
M
C
 
S
V
 
I
Y
|
Y
G
 
A
T
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
I
D
 
E
F
 
Y
V
 
A
S
 
K
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
x
A
T
x
V
V
 
I
E
 
D
S
 
T
P
 
D
S
 
M
L
 
F
R
 
R
E
 
R
R
 
A
L
 
Y
G
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
E
A
 
A
E
 
D
A
 
P
A
 
R
R
 
K
A
 
A
A
 
E
F
 
F
-
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
M
Q
 
H
P
 
P
M
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
V
G
 
G
T
 
R
P
 
V
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
A
L
 
A
A
 
V
L
 
L
W
 
Y
L
 
L
A
 
-
C
 
C
S
 
S
-
 
D
-
 
N
-
 
A
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
T
 
T
G
 
G
Q
 
I
A
 
A
I
 
L
A
 
P
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
A
T
 
T

A7IQH5 2-(S)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase 3; S-HPCDH 3; 2-[(S)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase 3; Aliphatic epoxide carboxylation component IV; Epoxide carboxylase component IV; SHPCDH3; EC 1.1.1.269 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 2 papers)
36% identity, 90% coverage: 24:235/236 of query aligns to 28:253/255 of A7IQH5

query
sites
A7IQH5
L
 
L
A
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
A
A
 
L
S
 
I
D
|
D
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
R
 
G
L
 
L
L
 
A
D
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
T
-
 
G
G
 
G
L
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
K
G
 
G
H
 
F
A
 
G
L
 
A
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
K
G
 
A
A
 
A
A
 
D
V
 
I
E
 
T
A
 
A
L
 
A
V
 
I
A
 
T
G
 
S
-
 
A
-
 
E
-
 
Q
-
 
T
L
 
I
G
 
G
P
 
S
V
 
L
D
 
T
V
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
A
H
 
G
G
 
F
G
 
G
T
 
S
I
 
V
L
 
H
D
 
D
Q
 
A
T
 
D
E
 
A
A
 
A
E
 
A
L
 
W
D
 
D
L
 
R
A
 
I
L
 
M
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
V
R
 
T
G
 
G
T
 
T
I
 
F
R
 
L
T
 
A
I
 
S
R
 
K
A
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
A
G
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
E
A
 
R
G
 
H
S
 
K
G
 
G
S
 
T
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
F
A
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
-
S
 
A
S
 
G
L
 
L
K
 
V
G
 
G
A
 
I
P
 
P
D
 
T
R
 
M
C
 
A
V
 
A
Y
|
Y
G
 
C
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
Q
V
 
M
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
Y
V
 
S
S
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
|
T
V
|
V
E
x
T
S
|
S
P
x
T
S
x
G
L
 
M
R
 
G
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
G
 
L
A
 
G
T
 
S
G
 
D
D
 
T
A
 
S
E
 
P
A
 
E
A
 
V
R
 
Q
A
 
A
A
 
R
F
x
R
V
 
L
A
 
A
R
x
K
Q
x
Y
P
 
P
M
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
E
L
 
A
A
 
V
L
 
I
W
 
F
L
 
L
A
 
L
C
 
S
-
 
D
-
 
Q
S
 
A
G
 
A
Y
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
I
 
F
A
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

4ituA Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) bound to s-hpc and nadh (see paper)
36% identity, 90% coverage: 24:235/236 of query aligns to 26:251/253 of 4ituA

query
sites
4ituA
L
 
L
A
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
A
A
 
L
S
 
I
D
|
D
L
|
L
D
 
D
A
 
Q
R
 
G
L
 
L
L
 
A
D
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
T
-
 
G
G
 
G
L
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
K
G
 
G
H
 
F
A
 
G
L
 
A
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
K
G
 
A
A
 
A
A
 
D
V
 
I
E
 
T
A
 
A
L
 
A
V
 
I
A
 
T
G
 
S
-
 
A
-
 
E
-
 
Q
-
 
T
L
 
I
G
 
G
P
 
S
V
 
L
D
 
T
V
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
A
H
 
G
G
 
F
G
 
G
T
 
S
I
 
V
L
 
H
D
 
D
Q
 
A
T
 
D
E
 
A
A
 
A
E
 
A
L
 
W
D
 
D
L
 
R
A
 
I
L
 
M
D
 
A
I
x
V
N
|
N
L
 
V
R
 
T
G
 
G
T
 
T
I
 
F
R
 
L
T
 
A
I
 
S
R
 
K
A
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
A
G
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
E
A
 
R
G
 
H
S
 
K
G
 
G
S
 
T
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
F
A
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
-
S
 
A
S
 
G
L
 
L
K
 
V
G
 
G
A
 
I
P
 
P
D
 
T
R
 
M
C
 
A
V
 
A
Y
|
Y
G
 
C
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
Q
V
 
M
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
Y
V
 
S
S
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
 
G
T
|
T
V
|
V
E
 
T
S
 
S
P
x
T
S
 
G
L
x
M
R
 
G
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
G
 
L
A
 
G
T
 
S
G
 
D
D
 
T
A
 
S
E
 
P
A
 
E
A
 
V
R
 
Q
A
 
A
A
 
R
F
x
R
V
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
x
Y
P
 
P
M
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
E
L
 
A
A
 
V
L
 
I
W
 
F
L
 
L
A
 
L
C
 
S
-
 
D
-
 
Q
S
 
A
G
 
A
Y
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
I
 
F
A
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
34% identity, 100% coverage: 1:236/236 of query aligns to 6:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
M
 
L
Q
 
E
E
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
A
G
x
S
Q
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
E
R
 
L
F
 
L
L
 
A
A
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
A
x
T
S
 
S
D
 
E
L
 
S
D
 
G
A
 
A
R
 
Q
L
 
A
L
 
I
D
 
S
-
 
D
-
 
Y
-
 
L
G
 
G
L
 
D
A
 
N
A
 
G
E
 
K
G
 
G
H
 
M
A
 
A
L
 
L
D
x
N
V
|
V
R
 
T
D
 
N
G
 
P
A
 
E
A
 
S
V
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
V
V
 
L
A
 
K
G
 
A
L
 
I
-
 
T
-
 
D
-
 
E
-
 
F
G
 
G
P
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
V
 
T
H
 
R
G
 
D
G
 
N
T
 
L
I
 
L
L
 
M
D
 
R
Q
 
M
T
 
K
E
 
E
A
 
E
E
 
E
L
 
W
D
 
S
L
 
D
A
 
I
L
 
M
D
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
S
T
 
I
I
 
F
R
 
R
T
 
L
I
 
S
R
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
R
G
 
G
M
 
M
L
 
M
A
 
K
A
 
K
G
 
R
S
 
Q
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
V
A
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
S
 
G
S
 
T
L
 
M
K
 
-
G
 
G
A
 
N
P
 
A
D
 
G
R
 
Q
C
 
A
V
 
N
Y
|
Y
G
 
A
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
M
A
 
A
A
 
R
D
 
E
F
 
V
V
 
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
T
 
F
V
x
I
E
 
E
S
x
T
P
 
D
S
x
M
L
 
T
R
 
K
E
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
A
T
 
L
G
 
N
D
 
D
A
 
E
E
 
Q
A
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
T
A
 
A
F
 
T
V
 
L
A
 
A
R
 
Q
Q
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
S
L
 
A
A
 
V
L
 
A
W
 
F
L
 
L
A
 
A
C
 
S
-
 
P
-
 
E
S
 
A
G
 
A
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
A
 
T
I
 
L
A
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
W
 
M
T
 
Y
I
 
M

Query Sequence

>WP_011840076.1 NCBI__GCF_000015985.1:WP_011840076.1
MQEKTVLITAAGQGIGRACAERFLAAGARVLASDLDARLLDGLAAEGHALDVRDGAAVEA
LVAGLGPVDVLVNCAGVVHGGTILDQTEAELDLALDINLRGTIRTIRAVLPGMLAAGSGS
IVNIASVVSSLKGAPDRCVYGTSKAAVIGLTKSVAADFVSRGIRCNAICPGTVESPSLRE
RLGATGDAEAARAAFVARQPMGRLGTPEEIADLALWLACSGYTTGQAIAIDGGWTI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory