SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011840632.1 NCBI__GCF_000015985.1:WP_011840632.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

4g09A The crystal structure of the c366s mutant of hdh from brucella suis in complex with a substituted benzyl ketone (see paper)
39% identity, 90% coverage: 35:431/441 of query aligns to 28:418/432 of 4g09A

query
sites
4g09A
V
 
V
G
 
R
P
 
E
I
 
I
L
 
V
E
 
D
A
 
R
V
 
V
R
 
R
T
 
R
E
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
L
R
 
D
F
 
Y
G
 
S
R
 
R
E
 
R
L
 
F
D
 
D
R
 
R
A
 
I
K
 
D
G
 
-
L
 
L
T
 
E
R
 
K
E
 
T
G
 
G
L
 
I
K
 
A
V
 
V
T
 
T
E
 
E
A
 
A
E
 
E
F
 
I
D
 
D
E
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
D
L
 
A
V
 
A
E
 
P
P
 
A
E
 
S
I
 
T
V
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
K
F
 
L
A
 
A
I
 
R
G
 
D
N
 
R
I
 
I
R
 
E
T
 
K
F
 
H
H
 
H
E
 
A
E
 
R
Q
 
Q
A
 
L
P
 
P
-
 
K
E
 
D
P
 
D
M
 
R
W
 
Y
L
 
T
K
 
D
E
 
A
L
 
L
R
 
-
P
 
-
G
 
G
A
 
V
F
 
E
A
 
L
G
 
G
D
 
S
R
 
R
F
 
W
T
 
T
P
 
A
I
 
I
R
 
E
S
 
A
V
 
V
A
 
G
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
P
|
P
R
 
G
G
 
G
K
 
T
G
x
A
S
 
S
F
x
Y
P
 
P
S
|
S
V
 
S
T
 
V
M
 
L
M
 
M
T
 
N
S
 
A
V
 
M
P
 
P
A
 
A
V
 
K
V
 
V
A
 
A
K
 
G
V
 
V
P
 
D
Q
 
R
I
 
I
A
 
-
I
 
V
F
 
M
T
 
V
P
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
 
D
G
 
G
K
 
N
V
 
L
D
 
N
A
 
P
A
 
L
T
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
S
T
 
E
V
 
I
Y
 
Y
K
 
R
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
D
 
E
T
 
T
V
 
I
T
 
R
P
 
P
A
 
V
L
 
A
K
 
K
I
 
I
V
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
N
P
 
A
W
 
Y
V
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
R
L
 
I
L
 
V
A
 
F
G
 
G
V
 
T
I
 
V
D
 
G
P
 
I
G
 
D
L
 
M
P
 
I
A
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
S
E
 
E
S
 
V
I
 
L
I
 
I
L
 
V
A
 
A
D
 
D
E
 
K
T
 
D
V
 
N
H
 
N
G
 
P
G
 
D
L
 
W
A
 
I
A
 
A
L
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
I
 
A
E
x
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
G
 
D
P
 
T
D
 
A
S
 
A
S
 
Q
A
 
S
W
 
I
L
 
L
V
 
M
T
 
T
H
 
N
S
 
D
R
 
E
Q
 
A
V
 
F
A
 
A
-
 
H
-
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
V
E
 
E
E
 
R
A
 
Q
L
 
L
A
 
H
A
 
T
L
 
L
P
 
A
S
 
R
H
 
T
W
 
E
A
 
T
A
 
A
M
 
S
T
 
A
P
 
S
Q
 
W
R
 
R
V
 
-
D
 
D
F
 
F
S
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
C
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
A
I
 
V
V
 
I
L
 
L
T
 
V
G
 
K
S
x
D
A
 
F
E
 
E
E
x
D
S
 
A
H
 
I
A
 
P
F
 
L
V
 
A
N
 
N
D
 
R
Y
 
I
A
 
A
P
 
A
E
|
E
H
|
H
L
 
L
Q
 
E
I
 
I
L
 
A
S
 
V
E
 
A
K
 
D
P
 
A
F
 
E
E
 
A
H
 
F
L
 
V
G
 
P
R
 
R
I
 
I
T
 
R
E
 
N
A
 
A
A
 
G
E
 
S
V
 
I
L
 
F
M
 
I
G
 
G
P
 
G
H
 
Y
T
 
T
P
 
P
I
 
E
T
 
V
I
 
I
A
 
G
N
x
D
F
x
Y
C
 
V
L
 
G
G
 
G
P
 
S
N
 
N
A
x
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
S
 
A
R
 
R
G
 
S
A
 
A
R
 
R
T
 
F
W
 
S
G
 
S
P
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
V
H
 
L
D
 
D
F
 
Y
L
 
M
R
 
K
R
 
R
S
 
T
S
 
S
V
 
L
G
 
L
Y
 
K
V
 
L
T
 
G
A
 
S
P
 
E
A
 
Q
Y
 
L
P
 
R
E
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
P
V
 
A
A
 
A
K
 
I
R
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
R
Y
 
A
E
 
E
G
 
G
F
 
L
S
 
D
S
 
A
H
|
H
G
 
A
N
 
Q
A
 
S
V
 
V

6an0A Crystal structure of histidinol dehydrogenase from elizabethkingia anophelis
33% identity, 89% coverage: 38:431/441 of query aligns to 38:424/433 of 6an0A

query
sites
6an0A
I
 
V
L
 
F
E
 
E
A
 
D
V
 
I
R
 
K
T
 
N
E
 
E
G
 
K
D
 
D
A
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
I
R
 
N
F
 
Y
G
 
T
R
 
K
E
 
K
L
 
F
D
 
D
R
 
K
A
 
A
K
 
Y
G
 
-
L
 
L
T
 
T
R
 
-
E
 
-
G
 
D
L
 
I
K
 
R
V
 
V
T
 
S
E
 
S
A
 
D
E
 
E
F
 
I
D
 
T
E
 
A
A
 
A
F
 
I
G
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
S
P
 
D
E
 
E
I
 
L
V
 
I
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
R
 
Q
F
 
M
A
 
A
I
 
A
G
 
S
N
 
N
I
 
I
R
 
E
T
 
K
F
 
F
H
 
H
E
 
A
E
 
S
Q
 
Q
A
 
-
P
 
K
E
|
E
P
x
N
M
x
K
W
 
N
L
 
I
K
 
I
E
 
E
L
 
T
R
 
T
P
 
E
G
 
G
A
 
V
F
 
N
A
 
C
G
 
W
D
x
R
R
x
E
F
x
A
T
 
R
P
 
P
I
 
I
R
 
E
S
 
N
V
 
I
A
 
G
L
 
I
Y
 
Y
V
 
I
P
 
P
R
 
G
G
 
G
K
 
S
G
 
A
S
 
P
F
 
L
P
 
F
S
 
S
V
 
T
T
 
V
M
 
L
M
 
M
T
 
L
S
 
G
V
 
I
P
 
P
A
 
A
V
 
Q
V
 
L
A
 
A
K
 
G
V
 
C
P
 
K
Q
 
N
I
 
I
A
 
T
I
 
L
F
 
C
T
 
T
P
 
P
P
 
P
A
 
D
P
 
E
D
 
S
G
 
G
K
 
N
V
 
I
D
 
N
A
 
P
A
 
A
T
 
I
L
 
L
V
 
Y
A
 
T
A
 
A
R
 
N
L
 
L
A
 
I
G
 
G
V
 
I
E
 
K
T
 
N
V
 
I
Y
 
Y
K
 
K
V
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
G
A
 
A
A
 
M
A
 
T
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
E
T
 
T
V
 
I
T
 
E
P
 
K
A
 
A
L
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
N
P
 
Q
W
 
Y
V
 
V
V
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
Q
L
 
I
L
 
A
A
 
Q
G
 
N
V
 
F
-
 
G
I
 
V
D
 
A
P
 
I
G
 
D
L
 
M
P
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
S
E
 
E
S
 
V
I
 
L
I
 
V
L
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
T
T
 
T
V
 
A
H
 
N
G
 
P
G
 
E
L
 
F
A
 
V
A
 
A
L
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
I
 
S
E
x
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
G
 
G
P
 
A
D
 
D
S
 
S
S
 
Q
A
 
V
W
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
T
H
 
T
S
 
D
R
 
E
Q
 
N
V
 
I
A
 
L
E
 
Q
E
 
Q
A
 
T
L
 
L
A
 
M
A
 
Q
L
 
V
P
 
E
S
 
N
H
 
Q
W
 
L
A
 
T
A
 
Q
M
 
L
T
 
-
P
 
P
Q
 
R
R
 
K
V
 
S
D
 
I
F
 
A
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
L
 
L
C
 
Q
G
 
S
R
 
R
A
 
-
G
 
-
G
 
G
I
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
-
G
 
D
S
 
S
A
 
I
E
 
E
E
 
K
S
 
C
H
 
I
A
 
A
F
 
F
V
 
S
N
 
N
D
 
L
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
E
|
E
H
|
H
L
 
L
Q
 
I
I
 
L
L
 
A
S
 
I
E
 
E
K
 
N
P
 
T
F
 
E
E
 
N
H
 
Y
L
 
T
G
 
D
R
 
K
I
 
I
T
 
T
E
 
S
A
 
A
A
 
G
E
 
S
V
 
V
L
 
F
M
 
L
G
 
G
P
 
N
H
 
F
T
 
S
P
 
C
I
 
E
T
 
S
I
 
A
A
 
G
N
x
D
F
 
Y
C
 
A
L
 
S
G
 
G
P
 
T
N
 
N
A
 
H
V
 
T
L
 
L
P
 
P
T
 
T
S
 
N
R
 
G
G
 
Y
A
 
A
R
 
R
T
 
N
W
 
Y
G
 
S
P
 
G
L
 
V
S
 
S
V
 
L
H
 
D
D
 
S
F
 
F
L
 
I
R
 
K
R
x
K
S
 
I
S
 
T
V
 
F
G
 
Q
Y
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
K
P
 
K
A
 
G
Y
 
I
P
 
Q
E
 
N
L
 
I
A
 
G
E
 
P
V
 
G
A
 
I
K
 
E
R
 
K
L
 
M
A
 
A
E
 
E
Y
 
A
E
 
E
G
 
E
F
 
L
S
 
F
S
 
A
H
|
H
G
 
K
N
 
H
A
 
A
V
 
V

P10370 Histidinol dehydrogenase; HDH; EC 1.1.1.23 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 2 papers)
33% identity, 94% coverage: 17:431/441 of query aligns to 18:423/434 of P10370

query
sites
P10370
R
 
R
A
 
A
A
 
L
L
 
L
L
 
T
R
 
R
R
 
P
S
 
A
E
 
I
T
 
S
D
 
A
L
 
S
S
 
D
M
 
S
F
 
I
L
 
T
E
 
R
K
 
T
V
 
V
G
 
S
P
 
D
I
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
N
V
 
V
R
 
K
T
 
T
E
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
R
R
 
E
F
 
Y
G
 
S
R
 
A
E
 
K
L
 
F
D
 
D
R
 
K
A
 
T
K
 
E
G
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
V
E
 
T
G
 
A
L
 
L
K
 
R
V
 
V
T
 
T
E
 
P
A
 
E
E
 
E
F
 
I
D
 
A
E
 
A
A
 
A
F
 
G
G
 
A
L
 
R
V
 
L
E
 
S
P
 
D
E
 
E
I
 
L
V
 
K
E
 
Q
A
 
A
I
 
M
R
 
T
F
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
K
N
 
N
I
 
I
R
 
E
T
 
T
F
 
F
H
|
H
E
 
S
E
 
A
Q
 
Q
A
 
T
P
 
L
E
 
P
P
 
P
M
 
V
W
 
D
L
 
V
K
 
-
E
 
E
L
 
T
R
 
Q
P
 
P
G
 
G
A
 
V
F
 
R
A
x
C
G
 
Q
D
 
Q
R
 
V
F
 
T
T
 
R
P
 
P
I
 
V
R
 
S
S
 
S
V
 
V
A
 
G
L
 
L
Y
 
Y
V
 
I
P
 
P
R
 
G
G
 
G
K
 
S
G
 
A
S
 
P
F
 
L
P
 
F
S
 
S
V
 
T
T
 
V
M
 
L
M
 
M
T
 
L
S
 
A
V
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
R
V
 
I
A
 
A
K
 
G
V
x
C
P
 
Q
Q
 
K
I
 
V
A
 
V
I
 
L
F
 
C
T
 
S
P
 
P
P
 
P
A
 
P
P
 
I
D
 
A
G
 
D
K
 
E
V
 
I
D
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
L
V
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
C
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
T
 
E
V
 
I
Y
 
F
K
 
N
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
T
 
S
D
 
E
T
 
S
V
 
V
T
 
P
P
 
K
A
 
V
L
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
N
P
 
A
W
 
F
V
 
V
V
 
T
A
 
E
A
 
A
K
 
K
R
 
R
L
 
Q
L
 
V
A
 
S
G
 
Q
V
 
R
I
 
L
D
 
D
P
 
G
G
 
A
-
 
A
-
 
I
-
 
D
L
 
M
P
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
S
E
 
E
S
 
V
I
 
L
I
 
V
L
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
S
T
 
G
V
 
A
H
 
T
G
 
P
G
 
D
L
 
F
A
 
V
A
 
A
L
 
S
D
 
D
L
 
L
L
 
L
I
 
S
E
 
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
S
S
 
Q
A
 
V
W
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
T
H
 
P
S
 
D
R
 
A
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
R
E
 
K
A
 
V
L
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
V
P
 
E
S
 
R
H
 
Q
W
 
L
A
 
A
A
 
E
M
 
L
T
 
P
P
 
-
Q
 
-
R
 
R
V
 
A
D
 
D
F
 
T
S
 
A
Q
 
R
A
 
Q
V
 
A
L
 
L
C
 
-
G
 
-
R
 
S
A
 
A
G
 
S
G
 
R
I
 
L
V
 
I
L
 
V
T
 
T
G
 
K
S
 
D
A
 
L
E
 
A
E
 
Q
S
 
C
H
 
V
A
 
A
F
 
I
V
 
S
N
 
N
D
 
Q
Y
 
Y
A
 
G
P
 
P
E
 
E
H
|
H
L
 
L
Q
 
I
I
 
I
L
 
Q
S
 
T
E
 
R
K
 
N
P
 
A
F
 
R
E
 
D
H
 
L
L
 
V
G
 
D
R
 
A
I
 
I
T
 
T
E
 
S
A
 
A
A
 
G
E
 
S
V
 
V
L
 
F
M
 
L
G
 
G
P
 
D
H
 
W
T
 
S
P
 
P
I
 
E
T
 
S
I
 
A
A
 
G
N
 
D
F
 
Y
C
 
A
L
 
S
G
 
G
P
 
T
N
 
N
A
x
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
S
 
Y
R
 
G
G
 
Y
A
 
T
R
 
A
T
 
T
W
 
C
G
 
S
P
 
S
L
 
L
S
 
G
V
 
L
H
 
A
D
 
D
F
 
F
L
 
Q
R
 
K
R
 
R
S
 
M
S
 
T
V
 
V
G
 
Q
Y
 
E
V
 
L
T
 
S
A
 
K
P
 
A
A
 
G
Y
 
F
P
 
S
E
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
S
V
 
T
A
 
I
K
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Y
 
A
E
 
E
G
 
R
F
 
L
S
 
T
S
 
A
H
|
H
G
 
K
N
 
N
A
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1karA L-histidinol dehydrogenase (hisd) structure complexed with histamine (inhibitor), zinc and NAD (cofactor) (see paper)
33% identity, 94% coverage: 17:431/441 of query aligns to 15:420/431 of 1karA

query
sites
1karA
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
L
 
L
L
 
M
R
 
R
R
 
P
S
 
A
E
 
I
T
 
S
D
 
A
L
 
S
S
 
E
M
 
S
F
 
I
L
 
T
E
 
R
K
 
T
V
 
V
G
 
N
P
 
D
I
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
N
V
 
V
R
 
K
T
 
A
E
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
R
R
 
E
F
 
Y
G
 
S
R
 
A
E
 
K
L
 
F
D
 
D
R
 
K
A
 
T
K
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
T
R
 
V
E
 
T
G
 
A
L
 
L
K
 
K
V
 
V
T
 
S
E
 
A
A
 
E
E
 
E
F
 
I
D
 
A
E
 
A
A
 
A
F
 
S
G
 
E
L
 
R
V
 
L
E
 
S
P
 
D
E
 
E
I
 
L
V
 
K
E
 
Q
A
 
A
I
 
M
R
 
A
F
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
K
N
 
N
I
 
I
R
 
E
T
 
T
F
 
F
H
 
H
E
 
T
E
 
A
Q
 
Q
A
 
K
P
 
L
E
 
P
P
 
P
M
 
V
W
 
D
L
 
V
K
 
-
E
 
E
L
 
T
R
 
Q
P
 
P
G
 
G
A
 
V
F
 
R
A
 
C
G
 
Q
D
 
Q
R
 
V
F
 
T
T
 
R
P
 
P
I
 
V
R
 
A
S
 
S
V
 
V
A
 
G
L
 
L
Y
 
Y
V
 
I
P
 
P
R
 
G
G
 
G
K
 
S
G
 
A
S
 
P
F
 
L
P
 
F
S
|
S
V
 
T
T
 
V
M
 
L
M
 
M
T
 
L
S
 
A
V
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
S
V
 
I
A
 
A
K
 
G
V
 
C
P
 
K
Q
 
K
I
 
V
A
 
V
I
 
L
F
 
C
T
 
S
P
 
P
P
 
P
A
 
P
P
 
I
D
 
A
G
 
D
K
 
E
V
 
I
D
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
L
V
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
C
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
T
 
D
V
 
V
Y
 
F
K
 
N
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
E
T
 
S
V
 
V
T
 
P
P
 
K
A
 
V
L
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
N
P
 
A
W
 
F
V
 
V
V
 
T
A
 
E
A
 
A
K
 
K
R
 
R
L
 
Q
L
 
V
A
 
S
G
 
Q
V
 
R
I
 
L
D
 
D
P
 
G
G
 
A
-
 
A
-
 
I
-
 
D
L
 
M
P
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
S
E
 
E
S
 
V
I
 
L
I
 
V
L
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
S
T
 
G
V
 
A
H
 
T
G
 
P
G
 
D
L
 
F
A
 
V
A
 
A
L
 
S
D
 
D
L
 
L
L
 
L
I
 
S
E
x
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
S
S
 
Q
A
 
V
W
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
T
H
 
P
S
 
A
R
 
A
Q
 
D
V
 
M
A
 
A
E
 
R
E
 
R
A
 
V
L
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
V
P
 
E
S
 
R
H
 
Q
W
 
L
A
 
A
A
 
E
M
 
L
T
 
-
P
 
P
Q
 
R
R
 
A
V
 
E
D
 
T
F
 
A
S
 
R
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
L
 
N
C
 
A
G
 
S
R
 
R
A
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
L
V
 
I
L
 
V
T
 
T
G
 
K
S
 
D
A
 
L
E
 
A
E
 
Q
S
 
C
H
 
V
A
 
E
F
 
I
V
 
S
N
 
N
D
 
Q
Y
 
Y
A
 
G
P
 
P
E
|
E
H
|
H
L
 
L
Q
 
I
I
 
I
L
 
Q
S
 
T
E
 
R
K
 
N
P
 
A
F
 
R
E
 
E
H
 
L
L
 
V
G
 
D
R
 
S
I
 
I
T
 
T
E
 
S
A
 
A
A
 
G
E
 
S
V
 
V
L
 
F
M
 
L
G
 
G
P
 
D
H
 
W
T
 
S
P
 
P
I
 
E
T
 
S
I
 
A
A
 
G
N
x
D
F
x
Y
C
 
A
L
 
S
G
 
G
P
 
T
N
 
N
A
x
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
S
 
Y
R
 
G
G
 
Y
A
 
T
R
 
A
T
 
T
W
 
C
G
 
S
P
 
S
L
 
L
S
 
G
V
 
L
H
 
A
D
 
D
F
 
F
L
 
Q
R
 
K
R
 
R
S
 
M
S
 
T
V
 
V
G
 
Q
Y
 
E
V
 
L
T
 
S
A
 
K
P
 
E
A
 
G
Y
 
F
P
 
S
E
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
S
V
 
T
A
 
I
K
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Y
 
A
E
 
E
G
 
R
F
 
L
S
 
T
S
 
A
H
|
H
G
 
K
N
 
N
A
 
A
V
 
V

1kahA L-histidinol dehydrogenase (hisd) structure complexed with l-histidine (product), zn and NAD (cofactor) (see paper)
33% identity, 94% coverage: 17:431/441 of query aligns to 15:420/431 of 1kahA

query
sites
1kahA
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
L
 
L
L
 
M
R
 
R
R
 
P
S
 
A
E
 
I
T
 
S
D
 
A
L
 
S
S
 
E
M
 
S
F
 
I
L
 
T
E
 
R
K
 
T
V
 
V
G
 
N
P
 
D
I
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
N
V
 
V
R
 
K
T
 
A
E
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
R
R
 
E
F
 
Y
G
 
S
R
 
A
E
 
K
L
 
F
D
 
D
R
 
K
A
 
T
K
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
T
R
 
V
E
 
T
G
 
A
L
 
L
K
 
K
V
 
V
T
 
S
E
 
A
A
 
E
E
 
E
F
 
I
D
 
A
E
 
A
A
 
A
F
 
S
G
 
E
L
 
R
V
 
L
E
 
S
P
 
D
E
 
E
I
 
L
V
 
K
E
 
Q
A
 
A
I
 
M
R
 
A
F
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
K
N
 
N
I
 
I
R
 
E
T
 
T
F
 
F
H
 
H
E
 
T
E
 
A
Q
 
Q
A
 
K
P
 
L
E
 
P
P
 
P
M
 
V
W
 
D
L
 
V
K
 
-
E
 
E
L
 
T
R
 
Q
P
 
P
G
 
G
A
 
V
F
 
R
A
 
C
G
 
Q
D
 
Q
R
 
V
F
 
T
T
 
R
P
 
P
I
 
V
R
 
A
S
 
S
V
 
V
A
 
G
L
 
L
Y
 
Y
V
 
I
P
 
P
R
 
G
G
 
G
K
 
S
G
 
A
S
 
P
F
x
L
P
 
F
S
 
S
V
 
T
T
 
V
M
 
L
M
 
M
T
 
L
S
 
A
V
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
S
V
 
I
A
 
A
K
 
G
V
 
C
P
 
K
Q
 
K
I
 
V
A
 
V
I
 
L
F
 
C
T
 
S
P
 
P
P
 
P
A
 
P
P
 
I
D
 
A
G
 
D
K
 
E
V
 
I
D
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
L
V
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
C
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
T
 
D
V
 
V
Y
 
F
K
 
N
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
E
T
 
S
V
 
V
T
 
P
P
 
K
A
 
V
L
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
N
P
 
A
W
 
F
V
 
V
V
 
T
A
 
E
A
 
A
K
 
K
R
 
R
L
 
Q
L
 
V
A
 
S
G
 
Q
V
 
R
I
 
L
D
 
D
P
 
G
G
 
A
-
 
A
-
 
I
-
 
D
L
 
M
P
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
S
E
 
E
S
 
V
I
 
L
I
 
V
L
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
S
T
 
G
V
 
A
H
 
T
G
 
P
G
 
D
L
 
F
A
 
V
A
 
A
L
 
S
D
 
D
L
 
L
L
 
L
I
 
S
E
x
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
S
S
 
Q
A
 
V
W
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
T
H
 
P
S
 
A
R
 
A
Q
 
D
V
 
M
A
 
A
E
 
R
E
 
R
A
 
V
L
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
V
P
 
E
S
 
R
H
 
Q
W
 
L
A
 
A
A
 
E
M
 
L
T
 
-
P
 
P
Q
 
R
R
 
A
V
 
E
D
 
T
F
 
A
S
 
R
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
L
 
N
C
 
A
G
 
S
R
 
R
A
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
L
V
 
I
L
 
V
T
 
T
G
 
K
S
 
D
A
 
L
E
 
A
E
 
Q
S
 
C
H
 
V
A
 
E
F
 
I
V
 
S
N
 
N
D
 
Q
Y
 
Y
A
 
G
P
 
P
E
|
E
H
|
H
L
 
L
Q
 
I
I
 
I
L
 
Q
S
 
T
E
 
R
K
 
N
P
 
A
F
 
R
E
 
E
H
 
L
L
 
V
G
 
D
R
 
S
I
 
I
T
 
T
E
 
S
A
 
A
A
 
G
E
 
S
V
 
V
L
 
F
M
 
L
G
 
G
P
 
D
H
 
W
T
 
S
P
 
P
I
 
E
T
 
S
I
 
A
A
 
G
N
x
D
F
x
Y
C
 
A
L
 
S
G
 
G
P
 
T
N
 
N
A
x
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
S
 
Y
R
 
G
G
 
Y
A
 
T
R
 
A
T
 
T
W
 
C
G
 
S
P
 
S
L
 
L
S
 
G
V
 
L
H
 
A
D
 
D
F
 
F
L
 
Q
R
 
K
R
 
R
S
 
M
S
 
T
V
 
V
G
 
Q
Y
 
E
V
 
L
T
 
S
A
 
K
P
 
E
A
 
G
Y
 
F
P
 
S
E
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
S
V
 
T
A
 
I
K
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Y
 
A
E
|
E
G
 
R
F
x
L
S
 
T
S
 
A
H
|
H
G
 
K
N
 
N
A
 
A
V
 
V

1kaeA L-histidinol dehydrogenase (hisd) structure complexed with l- histidinol (substrate), zinc and NAD (cofactor) (see paper)
33% identity, 94% coverage: 17:431/441 of query aligns to 18:423/434 of 1kaeA

query
sites
1kaeA
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
L
 
L
L
 
M
R
 
R
R
 
P
S
 
A
E
 
I
T
 
S
D
 
A
L
 
S
S
 
E
M
 
S
F
 
I
L
 
T
E
 
R
K
 
T
V
 
V
G
 
N
P
 
D
I
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
N
V
 
V
R
 
K
T
 
A
E
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
R
R
 
E
F
 
Y
G
 
S
R
 
A
E
 
K
L
x
F
D
 
D
R
 
K
A
 
T
K
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
T
R
 
V
E
 
T
G
 
A
L
 
L
K
 
K
V
 
V
T
 
S
E
 
A
A
 
E
E
 
E
F
 
I
D
 
A
E
 
A
A
 
A
F
 
S
G
 
E
L
 
R
V
 
L
E
 
S
P
 
D
E
 
E
I
 
L
V
 
K
E
 
Q
A
 
A
I
 
M
R
 
A
F
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
K
N
 
N
I
 
I
R
 
E
T
 
T
F
 
F
H
 
H
E
 
T
E
 
A
Q
 
Q
A
 
K
P
 
L
E
 
P
P
 
P
M
 
V
W
 
D
L
 
V
K
 
-
E
 
E
L
 
T
R
 
Q
P
 
P
G
 
G
A
 
V
F
 
R
A
 
C
G
 
Q
D
 
Q
R
 
V
F
 
T
T
 
R
P
 
P
I
 
V
R
 
A
S
 
S
V
 
V
A
 
G
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
P
|
P
R
 
G
G
 
G
K
 
S
G
 
A
S
 
P
F
 
L
P
 
F
S
 
S
V
 
T
T
 
V
M
 
L
M
 
M
T
 
L
S
 
A
V
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
S
V
 
I
A
 
A
K
 
G
V
 
C
P
 
K
Q
 
K
I
 
V
A
 
V
I
 
L
F
 
C
T
 
S
P
|
P
P
 
P
A
 
P
P
 
I
D
 
A
G
 
D
K
 
E
V
 
I
D
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
L
V
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
C
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
T
 
D
V
 
V
Y
 
F
K
 
N
V
 
V
G
 
G
G
|
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
E
T
 
S
V
 
V
T
 
P
P
 
K
A
 
V
L
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
F
G
 
G
P
|
P
G
|
G
S
x
N
P
 
A
W
x
F
V
 
V
V
 
T
A
 
E
A
 
A
K
 
K
R
 
R
L
 
Q
L
 
V
A
 
S
G
 
Q
V
 
R
I
 
L
D
 
D
P
 
G
G
 
A
-
 
A
-
 
I
-
 
D
L
 
M
P
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
S
E
 
E
S
 
V
I
 
L
I
 
V
L
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
S
T
 
G
V
 
A
H
 
T
G
 
P
G
 
D
L
 
F
A
 
V
A
 
A
L
 
S
D
 
D
L
 
L
L
 
L
I
 
S
E
x
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
S
S
 
Q
A
 
V
W
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
T
H
 
P
S
 
A
R
 
A
Q
 
D
V
 
M
A
 
A
E
 
R
E
 
R
A
 
V
L
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
V
P
 
E
S
 
R
H
 
Q
W
 
L
A
 
A
A
 
E
M
 
L
T
 
-
P
 
P
Q
 
R
R
 
A
V
 
E
D
 
T
F
 
A
S
 
R
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
L
 
N
C
 
A
G
 
S
R
 
R
A
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
L
V
 
I
L
 
V
T
 
T
G
 
K
S
 
D
A
 
L
E
 
A
E
 
Q
S
 
C
H
 
V
A
 
E
F
 
I
V
 
S
N
 
N
D
 
Q
Y
 
Y
A
 
G
P
 
P
E
|
E
H
|
H
L
 
L
Q
 
I
I
 
I
L
 
Q
S
 
T
E
 
R
K
 
N
P
 
A
F
 
R
E
 
E
H
 
L
L
 
V
G
 
D
R
 
S
I
 
I
T
 
T
E
 
S
A
 
A
A
 
G
E
 
S
V
 
V
L
 
F
M
 
L
G
 
G
P
 
D
H
 
W
T
 
S
P
 
P
I
 
E
T
 
S
I
 
A
A
 
G
N
x
D
F
x
Y
C
 
A
L
 
S
G
 
G
P
 
T
N
 
N
A
x
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
S
 
Y
R
 
G
G
 
Y
A
 
T
R
 
A
T
 
T
W
 
C
G
 
S
P
 
S
L
 
L
S
 
G
V
 
L
H
 
A
D
 
D
F
 
F
L
 
Q
R
 
K
R
 
R
S
 
M
S
 
T
V
 
V
G
 
Q
Y
 
E
V
 
L
T
 
S
A
 
K
P
 
E
A
 
G
Y
 
F
P
 
S
E
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
S
V
 
T
A
 
I
K
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Y
 
A
E
 
E
G
 
R
F
 
L
S
 
T
S
 
A
H
|
H
G
 
K
N
 
N
A
 
A
V
 
V

P06988 Histidinol dehydrogenase; HDH; EC 1.1.1.23 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
33% identity, 94% coverage: 17:431/441 of query aligns to 18:423/434 of P06988

query
sites
P06988
R
 
R
A
 
Q
A
 
L
L
 
L
L
 
M
R
 
R
R
 
P
S
 
A
E
 
I
T
 
S
D
 
A
L
 
S
S
 
E
M
 
S
F
 
I
L
 
T
E
 
R
K
 
T
V
 
V
G
 
N
P
 
D
I
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
N
V
 
V
R
 
K
T
 
A
E
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
R
R
 
E
F
 
Y
G
 
S
R
 
A
E
 
K
L
 
F
D
 
D
R
 
K
A
 
T
K
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
T
R
 
V
E
 
T
G
 
A
L
 
L
K
 
K
V
 
V
T
 
S
E
 
A
A
 
E
E
 
E
F
 
I
D
 
A
E
 
A
A
 
A
F
 
S
G
 
E
L
 
R
V
 
L
E
 
S
P
 
D
E
 
E
I
 
L
V
 
K
E
 
Q
A
 
A
I
 
M
R
 
A
F
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
K
N
 
N
I
 
I
R
 
E
T
 
T
F
 
F
H
 
H
E
 
T
E
 
A
Q
 
Q
A
 
K
P
 
L
E
 
P
P
 
P
M
 
V
W
 
D
L
 
V
K
 
-
E
 
E
L
 
T
R
 
Q
P
 
P
G
 
G
A
 
V
F
 
R
A
 
C
G
 
Q
D
 
Q
R
 
V
F
 
T
T
 
R
P
 
P
I
 
V
R
 
A
S
 
S
V
 
V
A
 
G
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
P
 
P
R
 
G
G
 
G
K
 
S
G
 
A
S
 
P
F
 
L
P
 
F
S
 
S
V
 
T
T
 
V
M
 
L
M
 
M
T
 
L
S
 
A
V
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
S
V
 
I
A
 
A
K
 
G
V
 
C
P
 
K
Q
 
K
I
 
V
A
 
V
I
 
L
F
 
C
T
 
S
P
 
P
P
 
P
A
 
P
P
 
I
D
 
A
G
 
D
K
 
E
V
 
I
D
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
L
V
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
C
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
T
 
D
V
 
V
Y
 
F
K
 
N
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
|
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
E
T
 
S
V
 
V
T
 
P
P
 
K
A
 
V
L
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
x
N
P
 
A
W
 
F
V
 
V
V
 
T
A
 
E
A
 
A
K
 
K
R
 
R
L
 
Q
L
 
V
A
 
S
G
 
Q
V
 
R
I
 
L
D
 
D
P
 
G
G
 
A
-
 
A
-
 
I
-
 
D
L
 
M
P
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
S
E
 
E
S
 
V
I
 
L
I
 
V
L
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
S
T
 
G
V
 
A
H
 
T
G
 
P
G
 
D
L
 
F
A
 
V
A
 
A
L
 
S
D
 
D
L
 
L
L
 
L
I
 
S
E
x
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
S
S
 
Q
A
 
V
W
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
T
H
 
P
S
 
A
R
 
A
Q
 
D
V
 
M
A
 
A
E
 
R
E
 
R
A
 
V
L
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
V
P
 
E
S
 
R
H
 
Q
W
 
L
A
 
A
A
 
E
M
 
L
T
 
-
P
 
P
Q
 
R
R
 
A
V
 
E
D
 
T
F
 
A
S
 
R
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
L
 
N
C
 
A
G
 
S
R
 
R
A
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
L
V
 
I
L
 
V
T
 
T
G
 
K
S
 
D
A
 
L
E
 
A
E
 
Q
S
 
C
H
 
V
A
 
E
F
 
I
V
 
S
N
 
N
D
 
Q
Y
 
Y
A
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
L
 
L
Q
 
I
I
 
I
L
 
Q
S
 
T
E
 
R
K
 
N
P
 
A
F
 
R
E
 
E
H
 
L
L
 
V
G
 
D
R
 
S
I
 
I
T
 
T
E
 
S
A
 
A
A
 
G
E
 
S
V
 
V
L
 
F
M
 
L
G
 
G
P
 
D
H
 
W
T
 
S
P
 
P
I
 
E
T
 
S
I
 
A
A
 
G
N
x
D
F
 
Y
C
 
A
L
 
S
G
 
G
P
 
T
N
 
N
A
 
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
S
 
Y
R
 
G
G
 
Y
A
 
T
R
 
A
T
 
T
W
 
C
G
 
S
P
 
S
L
 
L
S
 
G
V
 
L
H
 
A
D
 
D
F
 
F
L
 
Q
R
 
K
R
 
R
S
 
M
S
 
T
V
 
V
G
 
Q
Y
 
E
V
 
L
T
 
S
A
 
K
P
 
E
A
 
G
Y
 
F
P
 
S
E
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
S
V
 
T
A
 
I
K
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Y
 
A
E
 
E
G
 
R
F
 
L
S
 
T
S
 
A
H
|
H
G
 
K
N
 
N
A
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5vldF Crystal structure of medicago truncatula l-histidinol dehydrogenase in complex with l-histidine and NAD+ (see paper)
33% identity, 96% coverage: 9:431/441 of query aligns to 7:423/435 of 5vldF

query
sites
5vldF
L
 
L
A
 
S
E
 
N
L
 
L
D
 
T
A
 
Q
A
 
T
G
 
E
R
 
L
A
 
L
A
 
S
L
 
L
L
 
K
R
 
S
R
 
R
S
 
P
E
 
R
T
 
I
D
 
D
L
 
F
S
 
S
M
 
S
F
 
V
L
 
F
E
 
D
K
 
I
V
 
V
G
 
N
P
 
P
I
 
I
L
 
V
E
 
D
A
 
D
V
 
V
R
 
H
T
 
A
E
 
H
G
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
K
R
 
Q
F
 
Y
G
 
T
R
 
S
E
 
K
L
x
F
D
|
D
R
 
K
A
 
V
K
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
D
G
 
L
L
 
E
K
 
N
V
 
I
T
 
V
E
 
E
A
 
L
E
 
V
F
 
S
D
 
D
E
 
L
A
 
P
F
 
D
G
 
P
L
 
V
V
 
L
E
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
I
V
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
F
R
 
D
F
 
V
A
 
A
I
 
Y
G
 
S
N
 
N
I
 
I
R
 
Y
T
 
A
F
 
F
H
 
H
E
 
A
E
 
A
Q
 
Q
A
 
K
P
 
S
E
 
P
P
 
E
M
 
K
W
 
S
L
 
V
K
 
E
E
 
N
L
 
M
R
 
K
P
 
-
G
 
G
A
 
V
F
 
Q
A
 
C
G
 
K
D
 
R
R
 
V
F
 
A
T
 
R
P
 
S
I
 
I
R
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
G
L
 
L
Y
|
Y
V
 
V
P
|
P
R
 
G
G
|
G
K
x
T
G
 
A
S
 
V
F
 
L
P
 
P
S
|
S
V
 
T
T
 
A
M
 
L
M
 
M
T
 
L
S
 
A
V
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
Q
V
 
I
A
 
A
K
 
G
V
 
C
P
 
K
Q
 
T
I
 
I
A
 
V
I
 
L
F
 
A
T
 
N
P
 
P
P
 
P
A
 
T
P
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
T
V
 
T
D
 
C
A
 
K
A
 
E
T
 
V
L
 
L
V
 
Y
A
 
C
A
 
A
R
 
K
L
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
T
T
 
H
V
 
L
Y
 
L
K
 
K
V
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
|
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
A
A
 
M
A
 
A
Y
 
W
G
 
G
T
 
T
D
 
E
T
 
T
V
 
C
T
 
P
P
 
K
A
 
V
L
 
E
K
 
K
I
 
I
V
 
F
G
 
G
P
|
P
G
|
G
S
x
N
P
 
Q
W
x
Y
V
 
V
V
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
M
L
 
I
L
 
L
A
 
Q
G
 
N
-
 
S
-
 
E
-
 
A
V
 
M
I
 
V
D
 
S
P
 
I
G
 
D
L
 
M
P
 
P
A
|
A
G
|
G
P
 
P
S
|
S
E
 
E
S
 
V
I
 
L
I
 
V
L
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
K
T
 
H
V
 
A
H
 
I
G
 
P
G
 
S
L
 
H
A
 
V
A
 
A
L
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
I
 
S
E
x
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
S
S
 
Q
A
 
V
W
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
I
H
 
A
S
 
G
R
 
D
Q
 
G
V
 
V
A
 
D
E
 
Q
E
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
Q
A
 
E
L
 
E
P
 
V
S
 
S
H
 
K
W
 
Q
A
 
C
A
 
Q
M
 
S
T
 
L
P
 
P
Q
 
-
R
 
R
V
 
G
D
 
E
F
 
F
S
 
A
Q
 
A
A
 
K
V
 
A
L
 
L
C
 
-
G
 
-
R
 
S
A
 
H
G
 
S
G
 
F
I
 
I
V
 
V
L
 
H
T
 
A
G
 
R
S
 
D
A
 
M
E
 
L
E
 
E
S
 
A
H
 
I
A
 
T
F
 
F
V
 
S
N
 
N
D
 
M
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
E
|
E
H
|
H
L
 
L
Q
 
I
I
 
I
L
 
N
S
 
V
E
 
K
K
 
D
P
 
A
F
 
E
E
 
K
H
 
W
L
 
E
G
 
S
R
 
F
I
 
I
T
 
E
E
 
N
A
 
A
A
 
G
E
 
S
V
 
V
L
 
F
M
 
L
G
 
G
P
 
S
H
 
W
T
 
T
P
 
P
I
 
E
T
 
S
I
 
V
A
 
G
N
x
D
F
x
Y
C
 
A
L
 
S
G
 
G
P
 
T
N
 
N
A
x
H
V
|
V
L
|
L
P
 
P
T
 
T
S
 
Y
R
 
G
G
 
Y
A
 
A
R
 
R
T
 
M
W
 
Y
G
 
S
P
 
G
L
 
V
S
 
S
V
 
L
H
 
D
D
 
S
F
 
F
L
 
L
R
 
K
R
 
Y
S
 
I
S
 
T
V
 
V
G
 
Q
Y
 
S
V
 
L
T
 
T
A
 
E
P
 
E
A
 
G
Y
 
L
P
 
R
E
 
K
L
 
L
A
 
G
E
 
P
V
 
Y
A
 
V
K
 
E
R
 
T
L
 
M
A
 
A
E
 
E
Y
 
V
E
|
E
G
 
G
F
 
L
S
 
E
S
 
A
H
|
H
G
 
K
N
 
R
A
 
A
V
 
V

5vlbA Crystal structure of medicago truncatula l-histidinol dehydrogenase in complex with imidazole (see paper)
33% identity, 96% coverage: 9:431/441 of query aligns to 6:422/434 of 5vlbA

query
sites
5vlbA
L
 
L
A
 
S
E
 
N
L
 
L
D
 
T
A
 
Q
A
 
T
G
 
E
R
 
L
A
 
L
A
 
S
L
 
L
L
 
K
R
 
S
R
 
R
S
 
P
E
 
R
T
 
I
D
 
D
L
 
F
S
 
S
M
 
S
F
 
V
L
 
F
E
 
D
K
 
I
V
 
V
G
 
N
P
 
P
I
 
I
L
 
V
E
 
D
A
 
D
V
 
V
R
 
H
T
 
A
E
 
H
G
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
K
R
 
Q
F
 
Y
G
 
T
R
 
S
E
 
K
L
 
F
D
 
D
R
 
K
A
 
V
K
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
D
G
 
L
L
 
E
K
 
N
V
 
I
T
 
V
E
 
E
A
 
L
E
 
V
F
 
S
D
 
D
E
 
L
A
 
P
F
 
D
G
 
P
L
 
V
V
 
L
E
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
I
V
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
F
R
 
D
F
 
V
A
 
A
I
 
Y
G
 
S
N
 
N
I
 
I
R
 
Y
T
 
A
F
 
F
H
 
H
E
 
A
E
 
A
Q
 
Q
A
 
K
P
 
S
E
 
P
P
 
E
M
 
K
W
 
S
L
 
V
K
 
E
E
 
N
L
 
M
R
 
K
P
 
-
G
 
G
A
 
V
F
 
Q
A
 
C
G
 
K
D
 
R
R
 
V
F
 
A
T
 
R
P
 
S
I
 
I
R
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
G
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
R
 
G
G
 
G
K
 
T
G
 
A
S
 
V
F
 
L
P
 
P
S
 
S
V
 
T
T
 
A
M
 
L
M
 
M
T
 
L
S
 
A
V
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
Q
V
 
I
A
 
A
K
 
G
V
 
C
P
 
K
Q
 
T
I
 
I
A
 
V
I
 
L
F
 
A
T
 
N
P
 
P
P
 
P
A
 
T
P
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
T
V
 
T
D
 
C
A
 
K
A
 
E
T
 
V
L
 
L
V
 
Y
A
 
C
A
 
A
R
 
K
L
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
T
T
 
H
V
 
L
Y
 
L
K
 
K
V
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
A
A
 
M
A
 
A
Y
 
W
G
 
G
T
 
T
D
 
E
T
 
T
V
 
C
T
 
P
P
 
K
A
 
V
L
 
E
K
 
K
I
 
I
V
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
N
P
 
Q
W
 
Y
V
 
V
V
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
M
L
 
I
L
 
L
A
 
Q
G
 
N
-
 
S
-
 
E
-
 
A
V
 
M
I
 
V
D
 
S
P
 
I
G
 
D
L
 
M
P
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
S
E
 
E
S
 
V
I
 
L
I
 
V
L
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
K
T
 
H
V
 
A
H
 
I
G
 
P
G
 
S
L
 
H
A
 
V
A
 
A
L
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
I
 
S
E
x
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
S
S
 
Q
A
 
V
W
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
I
H
 
A
S
 
G
R
 
D
Q
 
G
V
 
V
A
 
D
E
 
Q
E
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
Q
A
 
E
L
 
E
P
 
V
S
 
S
H
 
K
W
 
Q
A
 
C
A
 
Q
M
 
S
T
 
L
P
 
P
Q
 
-
R
 
R
V
 
G
D
 
E
F
 
F
S
 
A
Q
 
A
A
 
K
V
 
A
L
 
L
C
 
-
G
 
-
R
 
S
A
 
H
G
 
S
G
 
F
I
 
I
V
 
V
L
 
H
T
 
A
G
 
R
S
 
D
A
 
M
E
 
L
E
 
E
S
 
A
H
 
I
A
 
T
F
 
F
V
 
S
N
 
N
D
 
M
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
E
|
E
H
|
H
L
 
L
Q
 
I
I
 
I
L
 
N
S
 
V
E
 
K
K
 
D
P
 
A
F
 
E
E
 
K
H
 
W
L
 
E
G
 
S
R
 
F
I
 
I
T
 
E
E
 
N
A
 
A
A
 
G
E
 
S
V
 
V
L
 
F
M
 
L
G
 
G
P
 
S
H
 
W
T
 
T
P
 
P
I
 
E
T
 
S
I
 
V
A
 
G
N
x
D
F
 
Y
C
 
A
L
 
S
G
 
G
P
 
T
N
 
N
A
 
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
S
 
Y
R
 
G
G
 
Y
A
 
A
R
 
R
T
 
M
W
 
Y
G
 
S
P
 
G
L
 
V
S
 
S
V
 
L
H
 
D
D
 
S
F
 
F
L
 
L
R
 
K
R
 
Y
S
 
I
S
 
T
V
 
V
G
 
Q
Y
 
S
V
 
L
T
 
T
A
 
E
P
 
E
A
 
G
Y
 
L
P
 
R
E
 
K
L
 
L
A
 
G
E
 
P
V
 
Y
A
 
V
K
 
E
R
 
T
L
 
M
A
 
A
E
 
E
Y
 
V
E
 
E
G
 
G
F
 
L
S
 
E
S
 
A
H
|
H
G
 
K
N
 
R
A
 
A
V
 
V

5vlcA Crystal structure of medicago truncatula l-histidinol dehydrogenase in complex with l-histidinol (see paper)
33% identity, 93% coverage: 23:431/441 of query aligns to 19:420/431 of 5vlcA

query
sites
5vlcA
R
 
K
S
 
S
E
 
R
T
 
P
D
 
R
L
 
I
S
 
S
M
 
V
F
 
F
L
 
-
E
 
D
K
 
I
V
 
V
G
 
N
P
 
P
I
 
I
L
 
V
E
 
D
A
 
D
V
 
V
R
 
H
T
 
A
E
 
H
G
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
K
R
 
Q
F
 
Y
G
 
T
R
 
S
E
 
K
L
 
F
D
 
D
R
 
K
A
 
V
K
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
D
G
 
L
L
 
E
K
 
N
V
 
I
T
 
V
E
 
E
A
 
L
E
 
V
F
 
S
D
 
D
E
 
L
A
 
P
F
 
D
G
 
P
L
 
V
V
 
L
E
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
I
V
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
F
R
 
D
F
 
V
A
 
A
I
 
Y
G
 
S
N
 
N
I
 
I
R
 
Y
T
 
A
F
 
F
H
 
H
E
 
A
E
 
A
Q
 
Q
A
 
K
P
 
S
E
 
P
P
 
E
M
 
K
W
 
S
L
 
V
K
 
E
E
 
N
L
 
M
R
 
K
P
 
-
G
 
G
A
 
V
F
 
Q
A
 
C
G
 
K
D
 
R
R
 
V
F
 
A
T
 
R
P
 
S
I
 
I
R
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
G
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
R
 
G
G
 
G
K
 
T
G
 
A
S
 
V
F
 
L
P
 
P
S
 
S
V
 
T
T
 
A
M
 
L
M
 
M
T
 
L
S
 
A
V
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
Q
V
 
I
A
 
A
K
 
G
V
 
C
P
 
K
Q
 
T
I
 
I
A
 
V
I
 
L
F
 
A
T
 
N
P
 
P
P
 
P
A
 
T
P
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
T
V
 
T
D
 
C
A
 
K
A
 
E
T
 
V
L
 
L
V
 
Y
A
 
C
A
 
A
R
 
K
L
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
T
T
 
H
V
 
L
Y
 
L
K
 
K
V
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
A
A
 
M
A
 
A
Y
 
W
G
 
G
T
 
T
D
 
E
T
 
T
V
 
C
T
 
P
P
 
K
A
 
V
L
 
E
K
 
K
I
 
I
V
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
N
P
 
Q
W
 
Y
V
 
V
V
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
M
L
 
I
L
 
L
A
 
Q
G
 
N
-
 
S
-
 
E
-
 
A
V
 
M
I
 
V
D
 
S
P
 
I
G
 
D
L
 
M
P
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
S
E
 
E
S
 
V
I
 
L
I
 
V
L
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
K
T
 
H
V
 
A
H
 
I
G
 
P
G
 
S
L
 
H
A
 
V
A
 
A
L
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
I
 
S
E
x
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
S
S
 
Q
A
 
V
W
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
I
H
 
A
S
 
G
R
 
D
Q
 
G
V
 
V
A
 
D
E
 
Q
E
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
Q
A
 
E
L
 
E
P
 
V
S
 
S
H
 
K
W
 
Q
A
 
C
A
 
Q
M
 
S
T
 
L
P
 
P
Q
 
-
R
 
R
V
 
G
D
 
E
F
 
F
S
 
A
Q
 
A
A
 
K
V
 
A
L
 
L
C
 
-
G
 
-
R
 
S
A
 
H
G
 
S
G
 
F
I
 
I
V
 
V
L
 
H
T
 
A
G
 
R
S
 
D
A
 
M
E
 
L
E
 
E
S
 
A
H
 
I
A
 
T
F
 
F
V
 
S
N
 
N
D
 
M
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
E
|
E
H
|
H
L
 
L
Q
 
I
I
 
I
L
 
N
S
 
V
E
 
K
K
 
D
P
 
A
F
 
E
E
 
K
H
 
W
L
 
E
G
 
S
R
 
F
I
 
I
T
 
E
E
 
N
A
 
A
A
 
G
E
 
S
V
 
V
L
 
F
M
 
L
G
 
G
P
 
S
H
 
W
T
 
T
P
 
P
I
 
E
T
 
S
I
 
V
A
 
G
N
x
D
F
x
Y
C
 
A
L
 
S
G
 
G
P
 
T
N
 
N
A
x
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
S
 
Y
R
 
G
G
 
Y
A
 
A
R
 
R
T
 
M
W
 
Y
G
 
S
P
 
G
L
 
V
S
 
S
V
 
L
H
 
D
D
 
S
F
 
F
L
 
L
R
 
K
R
 
Y
S
 
I
S
 
T
V
 
V
G
 
Q
Y
 
S
V
 
L
T
 
T
A
 
E
P
 
E
A
 
G
Y
 
L
P
 
R
E
 
K
L
 
L
A
 
G
E
 
P
V
 
Y
A
 
V
K
 
E
R
 
T
L
 
M
A
 
A
E
 
E
Y
 
V
E
|
E
G
 
G
F
 
L
S
 
E
S
 
A
H
|
H
G
 
K
N
 
R
A
 
A
V
 
V

Query Sequence

>WP_011840632.1 NCBI__GCF_000015985.1:WP_011840632.1
MVQVNFQVLAELDAAGRAALLRRSETDLSMFLEKVGPILEAVRTEGDAALVRFGRELDRA
KGLTREGLKVTEAEFDEAFGLVEPEIVEAIRFAIGNIRTFHEEQAPEPMWLKELRPGAFA
GDRFTPIRSVALYVPRGKGSFPSVTMMTSVPAVVAKVPQIAIFTPPAPDGKVDAATLVAA
RLAGVETVYKVGGAQAVAAAAYGTDTVTPALKIVGPGSPWVVAAKRLLAGVIDPGLPAGP
SESIILADETVHGGLAALDLLIEAEHGPDSSAWLVTHSRQVAEEALAALPSHWAAMTPQR
VDFSQAVLCGRAGGIVLTGSAEESHAFVNDYAPEHLQILSEKPFEHLGRITEAAEVLMGP
HTPITIANFCLGPNAVLPTSRGARTWGPLSVHDFLRRSSVGYVTAPAYPELAEVAKRLAE
YEGFSSHGNAVGPMRDAYLKR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory