SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011841248.1 NCBI__GCF_000015985.1:WP_011841248.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

Q9A9Z2 D-xylonate dehydratase; XyDHT; Gluconate dehydratase; EC 4.2.1.82; EC 4.2.1.39 from Caulobacter vibrioides (strain ATCC 19089 / CB15) (Caulobacter crescentus) (see 2 papers)
66% identity, 99% coverage: 6:593/593 of query aligns to 9:595/595 of Q9A9Z2

query
sites
Q9A9Z2
T
 
T
G
 
P
R
 
R
R
 
R
F
 
F
R
 
R
S
 
S
Q
 
R
A
 
D
W
 
W
F
 
F
D
 
D
N
 
N
P
 
P
D
 
D
N
 
H
P
 
I
G
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
V
 
L
E
 
E
R
 
R
Y
 
F
Q
 
M
N
 
N
Q
 
Y
G
 
G
F
 
I
T
 
T
R
 
P
R
 
E
E
 
E
L
 
L
Q
 
R
G
 
S
D
 
G
R
 
K
P
 
P
I
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
S
D
 
D
L
 
I
A
 
S
P
 
P
C
|
C
N
 
N
K
 
R
I
 
I
H
 
H
L
 
L
F
 
D
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
R
 
R
V
 
V
K
 
R
A
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
I
P
 
P
M
 
M
E
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
V
H
 
H
P
 
P
I
 
I
Q
 
F
E
|
E
T
 
N
G
 
C
R
 
R
R
 
R
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
R
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
T
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
T
 
T
G
 
G
C
|
C
D
|
D
K
 
K
T
 
T
T
 
T
P
 
P
A
 
A
Q
 
G
L
 
I
M
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
T
T
 
T
V
 
V
D
 
N
L
 
I
P
 
P
S
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
G
P
 
P
M
 
M
L
 
L
D
 
D
G
 
G
W
 
W
W
 
H
E
 
E
G
 
N
K
 
E
L
 
L
A
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
V
I
 
I
W
 
W
E
 
R
S
 
S
R
 
R
R
 
R
L
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
D
 
T
Y
 
E
P
 
E
E
 
E
F
 
F
M
 
I
E
 
D
R
 
R
A
 
A
C
 
A
A
 
S
S
 
S
A
 
A
P
 
P
S
 
S
L
 
A
G
 
G
H
 
H
C
|
C
N
 
N
T
 
T
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
M
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
L
S
 
S
L
 
L
P
 
T
G
 
G
C
 
C
S
 
A
A
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
E
 
E
R
 
R
M
 
G
N
 
Q
M
 
M
A
 
A
Y
 
Y
A
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
I
 
I
V
 
V
E
 
D
M
 
L
V
 
A
L
 
Y
A
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
K
P
 
P
S
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
I
 
I
R
 
A
V
 
L
N
 
V
S
 
A
A
 
A
I
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
P
 
Q
P
 
P
H
 
H
L
 
I
Q
 
V
A
 
A
I
 
M
A
 
A
R
 
R
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
T
V
 
A
E
 
D
D
 
D
W
 
W
Q
 
R
T
 
-
V
 
A
G
 
A
F
 
Y
D
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
M
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
K
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E
S
 
R
F
 
F
F
 
H
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
A
P
 
P
A
 
A
V
 
V
M
 
L
G
 
W
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
A
 
Q
G
 
G
L
 
R
L
 
L
H
 
H
A
 
G
E
 
D
A
 
V
L
 
L
T
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
K
S
 
T
I
 
M
G
 
S
H
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
E
 
R
R
 
E
S
 
T
R
 
S
D
 
D
R
 
R
R
 
E
V
 
V
I
 
I
R
 
F
S
 
P
V
 
Y
E
 
H
D
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
A
G
 
G
F
 
F
L
 
L
V
 
V
L
 
L
R
 
K
G
 
G
N
 
N
L
 
L
F
 
F
D
 
D
S
 
F
A
 
A
L
 
I
M
 
M
K
 
K
T
 
S
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
G
A
 
E
E
 
E
F
 
F
R
 
R
H
 
K
R
 
R
F
 
Y
L
 
L
A
 
S
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
V
H
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
I
V
 
V
F
 
F
E
 
D
G
 
G
P
 
S
E
 
D
D
 
D
Y
 
Y
H
 
H
A
 
K
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
D
 
A
L
 
L
G
 
E
I
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
R
T
x
C
I
 
I
L
 
L
F
 
V
I
 
I
R
 
R
G
 
G
V
 
A
G
 
G
C
 
P
V
 
I
G
 
G
Y
 
W
P
 
P
G
 
G
S
 
S
A
 
A
E
|
E
V
 
V
V
 
V
N
 
N
M
 
M
Q
 
Q
P
 
P
P
 
P
D
 
D
G
 
H
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
M
H
 
S
L
 
L
P
 
P
T
 
T
V
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
A
E
 
D
S
 
S
P
 
P
S
 
S
I
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
A
S
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
S
A
 
A
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
S
L
 
W
L
 
L
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
R
 
T
V
 
I
R
 
R
L
 
I
D
 
D
L
 
L
N
 
N
A
 
T
C
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
T
W
 
I
E
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
K
A
 
Q
A
 
D
W
 
G
T
 
I
P
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
P
H
 
A
H
 
T
Q
 
M
T
 
T
P
 
P
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
I
 
I
Y
 
Y
R
 
R
R
 
A
L
 
H
V
 
A
G
 
S
Q
 
Q
L
 
L
A
 
D
D
 
T
G
 
G
G
 
G
C
 
V
L
 
L
E
 
E
L
 
F
A
 
A
T
 
V
A
 
K
Y
 
Y
H
 
Q
R
 
D
V
 
L
A
 
A
R
 
A
D
 
K
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
H
N
 
N
H
 
H

5oynA Crystal structure of d-xylonate dehydratase in holo-form (see paper)
66% identity, 99% coverage: 6:593/593 of query aligns to 3:589/589 of 5oynA

query
sites
5oynA
T
 
T
G
 
P
R
 
R
R
 
R
F
 
F
R
 
R
S
 
S
Q
 
R
A
 
D
W
 
W
F
 
F
D
 
D
N
 
N
P
 
P
D
 
D
N
 
H
P
 
I
G
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
V
 
L
E
 
E
R
 
R
Y
 
F
Q
 
M
N
 
N
Q
 
Y
G
 
G
F
 
I
T
 
T
R
 
P
R
 
E
E
 
E
L
 
L
Q
 
R
G
 
S
D
 
G
R
 
K
P
 
P
I
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
S
D
 
D
L
 
I
A
 
S
P
 
P
C
|
C
N
 
N
K
 
R
I
 
I
H
 
H
L
 
L
F
 
D
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
R
 
R
V
 
V
K
 
R
A
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
I
P
 
P
M
 
M
E
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
V
H
 
H
P
 
P
I
 
I
Q
 
F
E
|
E
T
x
N
G
 
C
R
 
R
R
 
R
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
R
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
T
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
T
 
T
G
 
G
C
|
C
D
|
D
K
|
K
T
 
T
T
 
T
P
 
P
A
 
A
Q
 
G
L
 
I
M
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
T
T
 
T
V
 
V
D
 
N
L
 
I
P
 
P
S
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
G
P
 
P
M
 
M
L
 
L
D
 
D
G
 
G
W
 
W
W
 
H
E
 
E
G
 
N
K
 
E
L
 
L
A
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
V
I
 
I
W
 
W
E
 
R
S
 
S
R
 
R
R
 
R
L
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
D
 
T
Y
 
E
P
 
E
E
 
E
F
 
F
M
 
I
E
 
D
R
 
R
A
 
A
C
 
A
A
 
S
S
 
S
A
 
A
P
 
P
S
 
S
L
 
A
G
 
G
H
 
H
C
|
C
N
 
N
T
 
T
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
M
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
L
S
 
S
L
 
L
P
 
T
G
 
G
C
 
C
S
 
A
A
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
E
 
E
R
 
R
M
 
G
N
 
Q
M
 
M
A
 
A
Y
 
Y
A
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
I
 
I
V
 
V
E
 
D
M
 
L
V
 
A
L
 
Y
A
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
K
P
 
P
S
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
I
 
I
R
 
A
V
 
L
N
 
V
S
 
A
A
 
A
I
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
P
 
Q
P
 
P
H
 
H
L
 
I
Q
 
V
A
 
A
I
 
M
A
 
A
R
 
R
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
T
V
 
A
E
 
D
D
 
D
W
 
W
Q
 
R
T
 
-
V
 
A
G
 
A
F
 
Y
D
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
M
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
K
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E
S
 
R
F
 
F
F
 
H
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
A
P
 
P
A
 
A
V
 
V
M
 
L
G
 
W
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
A
 
Q
G
 
G
L
 
R
L
 
L
H
 
H
A
 
G
E
 
D
A
 
V
L
 
L
T
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
K
S
 
T
I
 
M
G
 
S
H
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
E
 
R
R
 
E
S
 
T
R
 
S
D
 
D
R
 
R
R
 
E
V
 
V
I
 
I
R
 
F
S
 
P
V
 
Y
E
 
H
D
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
A
G
 
G
F
 
F
L
 
L
V
 
V
L
 
L
R
 
K
G
 
G
N
 
N
L
 
L
F
 
F
D
 
D
S
 
F
A
 
A
L
 
I
M
 
M
K
 
K
T
 
S
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
G
A
 
E
E
 
E
F
 
F
R
 
R
H
 
K
R
 
R
F
 
Y
L
 
L
A
 
S
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
V
H
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
I
V
 
V
F
 
F
E
 
D
G
 
G
P
 
S
E
 
D
D
 
D
Y
 
Y
H
 
H
A
 
K
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
P
D
 
A
L
 
L
G
 
E
I
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
R
T
 
C
I
 
I
L
 
L
F
 
V
I
 
I
R
 
R
G
 
G
V
 
A
G
 
G
C
 
P
V
 
I
G
 
G
Y
 
W
P
 
P
G
 
G
S
 
S
A
 
A
E
|
E
V
 
V
V
 
V
N
 
N
M
 
M
Q
 
Q
P
 
P
P
 
P
D
 
D
G
 
H
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
M
H
 
S
L
 
L
P
 
P
T
 
T
V
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
A
E
 
D
S
 
S
P
 
P
S
 
S
I
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
A
S
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
S
A
 
A
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
S
L
 
W
L
 
L
R
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
R
 
T
V
 
I
R
 
R
L
 
I
D
 
D
L
 
L
N
 
N
A
 
T
C
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
T
W
 
I
E
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
K
A
 
Q
A
 
D
W
 
G
T
 
I
P
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
P
H
 
A
H
 
T
Q
 
M
T
 
T
P
 
P
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
I
 
I
Y
 
Y
R
 
R
R
 
A
L
 
H
V
 
A
G
 
S
Q
 
Q
L
 
L
A
 
D
D
 
T
G
 
G
G
 
G
C
 
V
L
 
L
E
 
E
L
 
F
A
 
A
T
 
V
A
 
K
Y
 
Y
H
 
Q
R
 
D
V
 
L
A
 
A
R
 
A
D
 
K
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
H
N
 
N
H
 
H

7m3kA Crystal structure of galactonate dehydratase from brucella melitensis biovar abortus 2308
63% identity, 98% coverage: 9:589/593 of query aligns to 1:587/587 of 7m3kA

query
sites
7m3kA
R
 
K
F
 
L
R
 
R
S
 
S
Q
 
R
A
 
A
W
 
W
F
 
F
D
 
D
N
 
N
P
 
P
D
 
D
N
 
D
P
 
V
G
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
V
 
L
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
M
N
 
N
Q
 
Y
G
 
G
F
 
L
T
 
S
R
 
Q
R
 
E
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
D
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
S
 
T
G
 
G
S
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
S
P
 
P
C
|
C
N
 
N
K
 
R
I
 
H
H
 
H
L
 
L
F
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
R
V
 
V
K
 
R
A
 
D
G
 
G
I
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
I
P
 
V
M
 
I
E
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
V
H
 
H
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
G
 
G
R
 
K
R
 
R
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
L
H
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
T
 
I
G
 
G
C
|
C
D
 
D
K
 
K
T
 
T
T
 
T
P
 
P
A
 
A
Q
 
C
L
 
L
M
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
V
D
 
N
L
 
I
P
 
P
S
 
A
I
 
I
V
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
V
W
 
G
P
 
P
M
 
M
L
 
L
D
 
N
G
 
G
W
 
W
W
 
F
E
 
R
G
 
G
K
 
E
L
 
R
A
 
T
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
I
I
 
V
W
 
W
E
 
K
S
 
A
R
 
R
R
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
P
 
Q
E
 
G
F
 
F
M
 
V
E
 
K
R
 
L
A
 
V
C
 
A
A
 
S
S
 
S
A
 
A
P
 
P
S
 
S
L
 
T
G
 
G
H
 
Y
C
 
C
N
 
N
T
 
T
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
S
 
T
T
 
T
L
 
M
N
 
N
A
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
Q
L
 
L
P
 
P
G
 
G
C
 
S
S
 
A
A
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
E
 
D
R
 
R
M
 
Q
N
 
E
M
 
V
A
 
A
Y
 
Y
A
 
L
T
 
M
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
V
 
V
E
 
E
M
 
M
V
 
V
L
 
H
A
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
E
A
 
A
F
 
F
E
 
I
N
 
N
A
 
A
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
S
A
 
A
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
P
 
P
P
 
I
H
 
H
L
 
L
Q
 
N
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
H
A
 
I
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
T
V
 
V
E
 
D
D
 
D
W
 
W
Q
 
Q
T
 
K
V
 
Y
G
 
G
F
 
E
D
 
E
L
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
M
 
L
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E
S
 
D
F
 
Y
F
 
Y
R
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
V
M
 
V
G
 
N
E
 
Q
L
 
L
L
 
M
A
 
G
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
L
 
I
H
 
H
A
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
I
T
 
T
V
 
V
T
 
N
G
 
G
E
 
K
S
 
T
I
 
I
G
 
G
H
 
E
N
 
N
L
 
C
A
 
K
G
 
N
E
 
A
R
 
T
S
 
I
R
 
E
D
 
D
R
 
G
R
 
N
V
 
V
I
 
I
R
 
K
S
 
T
V
 
Y
E
 
D
D
 
Q
P
 
P
L
 
L
R
 
K
E
 
K
K
 
H
A
 
A
G
 
G
F
 
F
L
 
R
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
N
 
N
L
 
L
F
 
F
D
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
I
M
 
M
K
 
K
T
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
A
 
D
E
 
E
F
 
F
R
 
R
H
 
N
R
 
R
F
 
Y
L
 
L
A
 
S
Q
 
D
P
 
A
G
 
K
R
 
D
E
 
P
G
 
N
I
 
A
H
 
F
E
 
E
A
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
F
E
 
D
G
 
G
P
 
P
E
 
E
D
 
D
Y
 
Y
H
 
H
A
 
H
R
 
R
I
 
I
N
 
D
D
 
D
P
 
P
D
 
A
L
 
L
G
 
E
I
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
H
T
 
T
I
 
V
L
 
L
F
 
F
I
 
M
R
 
R
G
 
G
V
 
A
G
 
G
C
 
P
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
S
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
V
N
 
N
M
 
M
Q
 
R
P
 
A
P
 
P
D
 
D
G
 
Y
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
T
H
 
S
L
 
L
P
 
P
T
 
C
V
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
S
E
 
G
S
 
S
P
 
P
S
 
S
I
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
A
S
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
I
L
 
L
R
 
K
T
 
T
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
R
 
R
L
 
I
D
 
D
L
 
L
N
 
G
A
 
R
C
 
G
R
 
T
L
 
A
D
 
D
A
 
I
L
 
L
V
 
I
D
 
S
E
 
D
A
 
E
E
 
E
W
 
L
E
 
A
A
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
K
A
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
G
W
 
Y
T
 
K
P
 
Y
P
 
P
V
 
-
L
 
-
H
 
E
H
 
S
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
I
 
I
Y
 
Q
R
 
R
R
 
A
L
 
V
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
L
 
M
A
 
E
D
 
T
G
 
G
G
 
A
C
 
V
L
 
L
E
 
E
L
 
N
A
 
A
T
 
V
A
 
K
Y
 
Y
H
 
Q
R
 
D
V
 
I
A
 
A
-
 
H
-
 
T
R
 
R
D
 
G
L
 
L
P
 
P

B5ZZ34 L-arabinonate dehydratase; ArDHT; D-fuconate dehydratase; Galactonate dehydratase; L-arabonate dehydratase; EC 4.2.1.25; EC 4.2.1.67; EC 4.2.1.6 from Rhizobium leguminosarum bv. trifolii (strain WSM2304) (see 2 papers)
46% identity, 93% coverage: 8:557/593 of query aligns to 9:542/579 of B5ZZ34

query
sites
B5ZZ34
R
 
R
R
 
K
F
 
L
R
 
R
S
 
S
Q
 
Q
A
 
E
W
 
W
F
 
Y
D
 
G
N
 
G
P
 
T
D
 
S
N
 
R
P
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
D
A
 
V
L
 
I
Y
 
Y
V
 
H
E
 
R
R
 
G
Y
 
W
-
 
L
Q
 
K
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
F
 
Y
T
 
P
R
 
H
R
 
D
E
 
L
L
 
F
Q
 
D
G
 
G
D
 
-
R
 
R
P
 
P
I
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
L
Q
 
N
S
 
T
G
 
W
S
 
S
D
 
D
L
 
M
A
 
T
P
 
P
C
|
C
N
 
N
K
 
G
I
 
H
H
 
L
L
 
R
F
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
K
V
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
R
 
W
D
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
F
P
 
P
M
 
L
E
 
E
F
 
V
P
 
P
V
 
V
H
 
F
P
 
S
I
 
A
Q
 
S
E
|
E
T
 
N
G
 
T
R
 
F
R
 
R
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
M
L
 
M
D
 
Y
R
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
A
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
V
V
 
E
E
 
E
V
 
A
L
 
I
H
 
R
G
 
G
Y
 
Q
P
 
P
I
 
M
D
 
D
G
 
G
V
 
C
V
 
V
L
 
L
T
 
L
T
 
V
G
 
G
C
|
C
D
|
D
K
 
K
T
 
T
T
 
T
P
 
P
A
 
S
Q
 
L
L
 
L
M
 
M
A
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
S
V
 
C
D
 
D
L
 
L
P
 
P
S
 
S
I
 
I
V
 
V
L
 
V
S
 
T
G
 
G
W
 
G
P
 
P
M
 
M
L
 
L
D
 
N
G
 
G
W
 
Y
W
 
F
E
 
R
G
 
G
K
 
E
L
 
R
A
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
H
I
 
L
W
 
W
E
 
K
S
 
F
R
 
S
R
 
E
L
 
M
L
 
V
A
 
K
E
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
M
D
 
T
Y
 
Q
P
 
A
E
 
E
F
 
F
M
 
L
E
 
E
R
 
A
A
 
E
C
 
A
A
 
S
S
 
M
A
 
S
P
 
R
S
 
S
L
 
S
G
 
G
H
 
T
C
|
C
N
 
N
T
 
T
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
M
N
 
A
A
 
S
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
A
L
 
L
P
 
S
G
 
G
C
 
N
S
 
A
A
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
G
P
 
V
F
 
D
R
 
S
E
 
R
R
 
R
M
 
K
N
 
V
M
 
M
A
 
A
Y
 
Q
A
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
V
 
V
E
 
Q
M
 
M
V
 
V
L
 
K
A
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
D
 
E
I
 
I
L
 
M
T
 
T
R
 
K
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
I
 
I
R
 
R
V
 
T
N
 
N
S
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
P
 
V
P
 
I
H
 
H
L
 
L
Q
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
G
H
 
R
A
 
V
G
 
G
V
 
I
E
 
D
L
 
L
A
 
S
V
 
L
E
 
D
D
 
D
W
 
W
Q
 
D
T
 
R
V
 
C
G
 
G
F
 
R
D
 
D
L
 
V
P
 
P
L
 
T
L
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
L
Q
 
M
P
 
P
A
 
S
G
 
G
E
 
K
Y
 
Y
L
 
L
G
 
M
E
 
E
S
 
E
F
 
F
F
 
F
R
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
P
A
 
V
V
 
V
M
 
L
G
 
K
E
 
R
L
 
L
L
 
G
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
K
E
 
D
A
 
A
L
 
L
T
 
T
V
 
V
T
 
S
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
V
G
 
W
H
 
D
N
 
E
L
 
V
A
 
K
G
 
D
E
 
V
R
 
V
S
 
N
R
 
W
D
 
N
R
 
E
R
 
D
V
 
V
I
 
I
R
 
L
S
 
P
V
 
A
E
 
E
D
 
K
P
 
A
L
 
L
R
 
T
E
 
S
K
 
S
A
 
G
G
 
G
F
 
I
L
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
N
 
N
L
 
L
F
 
A
-
 
P
D
 
K
S
 
G
A
 
A
L
 
V
M
 
L
K
 
K
T
 
P
S
 
S
V
 
A
I
 
A
S
 
S
A
 
P
E
 
H
F
 
L
R
 
L
H
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
I
 
V
H
 
H
E
 
K
A
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
F
E
 
E
G
 
D
P
 
I
E
 
D
D
 
D
Y
 
Y
H
 
K
A
 
A
R
 
K
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
D
D
 
N
L
 
L
G
 
D
I
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
N
T
x
C
I
 
I
L
 
M
F
 
V
I
 
M
R
 
K
G
 
N
V
x
C
G
 
G
C
 
P
V
 
K
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
S
 
M
A
 
A
E
|
E
V
 
V
V
 
G
N
 
N
M
 
M
Q
 
G
P
 
L
P
 
P
D
 
P
G
 
K
L
 
V
L
 
L
R
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
L
H
 
D
L
 
M
P
 
V
T
 
R
V
 
I
G
 
S
D
 
D
G
 
A
R
 
R
Q
 
M
S
|
S
G
 
G
T
 
T
S
 
A
E
 
Y
S
 
G
P
 
T
S
 
V
I
 
V
L
 
L
N
 
H
A
 
T
S
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
P
L
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
V
R
 
K
T
 
N
G
 
G
D
 
D
R
 
M
V
 
I
R
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
V
N
 
P
A
 
N
C
 
R
R
 
R
L
 
L
D
 
H
A
 
L
L
 
D
V
 
I
D
 
S
E
 
D
A
 
E
E
 
E
W
 
L
E
 
A
A
 
R
R
 
R
R
 
L
A
 
A
A
 
E
W
 
W
T
 
Q
P
 
P
P
 
-
V
 
-
L
 
-
H
 
N
H
 
H
Q
 
D
T
 
L
P
 
P

5j85A Ser480ala mutant of l-arabinonate dehydratase (see paper)
46% identity, 93% coverage: 8:557/593 of query aligns to 6:539/576 of 5j85A

query
sites
5j85A
R
 
R
R
 
K
F
 
L
R
 
R
S
 
S
Q
 
Q
A
 
E
W
 
W
F
 
Y
D
 
G
N
 
G
P
 
T
D
 
S
N
 
R
P
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
D
A
 
V
L
 
I
Y
 
Y
V
 
H
E
 
R
R
 
G
Y
 
W
-
 
L
Q
 
K
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
F
 
Y
T
 
P
R
 
H
R
 
D
E
 
L
L
 
F
Q
 
D
G
 
G
D
 
-
R
 
R
P
 
P
I
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
L
Q
 
N
S
 
T
G
 
W
S
 
S
D
 
D
L
 
M
A
 
T
P
 
P
C
|
C
N
 
N
K
 
G
I
 
H
H
 
L
L
 
R
F
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
K
V
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
R
 
W
D
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
F
P
 
P
M
 
L
E
 
E
F
 
V
P
 
P
V
 
V
H
 
F
P
 
S
I
 
A
Q
 
S
E
|
E
T
x
N
G
 
T
R
 
F
R
 
R
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
M
L
 
M
D
 
Y
R
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
A
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
V
V
 
E
E
 
E
V
 
A
L
 
I
H
 
R
G
 
G
Y
 
Q
P
 
P
I
 
M
D
 
D
G
 
G
V
 
C
V
 
V
L
 
L
T
 
L
T
 
V
G
 
G
C
|
C
D
|
D
K
|
K
T
 
T
T
 
T
P
 
P
A
 
S
Q
 
L
L
 
L
M
 
M
A
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
S
V
 
C
D
 
D
L
 
L
P
 
P
S
 
S
I
 
I
V
 
V
L
 
V
S
 
T
G
 
G
W
 
G
P
 
P
M
 
M
L
 
L
D
 
N
G
 
G
W
 
Y
W
 
F
E
 
R
G
 
G
K
 
E
L
 
R
A
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
H
I
 
L
W
 
W
E
 
K
S
 
F
R
 
S
R
 
E
L
 
M
L
 
V
A
 
K
E
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
M
D
 
T
Y
 
Q
P
 
A
E
 
E
F
 
F
M
 
L
E
 
E
R
 
A
A
 
E
C
 
A
A
 
S
S
 
M
A
 
S
P
 
R
S
 
S
L
 
S
G
 
G
H
x
T
C
|
C
N
 
N
T
 
T
M
 
M
G
 
G
T
|
T
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
M
N
 
A
A
 
S
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
A
L
 
L
P
 
S
G
 
G
C
 
N
S
 
A
A
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
G
P
 
V
F
 
D
R
 
S
E
 
R
R
 
R
M
 
K
N
 
V
M
 
M
A
 
A
Y
 
Q
A
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
V
 
V
E
 
Q
M
 
M
V
 
V
L
 
K
A
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
D
 
E
I
 
I
L
 
M
T
 
T
R
 
K
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
I
 
I
R
 
R
V
 
T
N
 
N
S
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
P
 
V
P
 
I
H
 
H
L
 
L
Q
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
G
H
 
R
A
 
V
G
 
G
V
 
I
E
 
D
L
 
L
A
 
S
V
 
L
E
 
D
D
 
D
W
 
W
Q
 
D
T
 
R
V
 
C
G
 
G
F
 
R
D
 
D
L
 
V
P
 
P
L
 
T
L
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
L
Q
 
M
P
 
P
A
 
S
G
 
G
E
 
K
Y
 
Y
L
 
L
G
 
M
E
 
E
S
 
E
F
 
F
F
 
F
R
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
P
A
 
V
V
 
V
M
 
L
G
 
K
E
 
R
L
 
L
L
 
G
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
K
E
 
D
A
 
A
L
 
L
T
 
T
V
 
V
T
 
S
G
 
G
E
 
E
S
 
T
I
 
V
G
 
W
H
 
D
N
 
E
L
 
V
A
 
K
G
 
D
E
 
V
R
 
V
S
 
N
R
 
W
D
 
N
R
 
E
R
 
D
V
 
V
I
 
I
R
 
L
S
 
P
V
 
A
E
 
E
D
 
K
P
 
A
L
 
L
R
 
T
E
 
S
K
 
S
A
 
G
G
 
G
F
 
I
L
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
N
 
N
L
 
L
F
 
A
-
 
P
D
 
K
S
 
G
A
 
A
L
 
V
M
 
L
K
 
K
T
 
P
S
 
S
V
 
A
I
 
A
S
 
S
A
 
P
E
 
H
F
 
L
R
 
L
H
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
I
 
V
H
 
H
E
 
K
A
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
F
E
 
E
G
 
D
P
 
I
E
 
D
D
 
D
Y
 
Y
H
 
K
A
 
A
R
 
K
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
D
D
 
N
L
 
L
G
 
D
I
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
N
T
 
C
I
 
I
L
 
M
F
 
V
I
 
M
R
 
K
G
 
N
V
 
C
G
 
G
C
 
P
V
 
K
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
S
 
M
A
 
A
E
|
E
V
 
V
V
 
G
N
 
N
M
 
M
Q
 
G
P
 
L
P
 
P
D
 
P
G
 
K
L
 
V
L
 
L
R
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
L
H
 
D
L
 
M
P
 
V
T
 
R
V
 
I
G
 
S
D
 
D
G
 
A
R
 
R
Q
 
M
S
 
A
G
 
G
T
 
T
S
 
A
E
 
Y
S
 
G
P
 
T
S
 
V
I
 
V
L
 
L
N
 
H
A
 
T
S
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
P
L
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
V
R
 
K
T
 
N
G
 
G
D
 
D
R
 
M
V
 
I
R
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
V
N
 
P
A
 
N
C
 
R
R
 
R
L
 
L
D
 
H
A
 
L
L
 
D
V
 
I
D
 
S
E
 
D
A
 
E
E
 
E
W
 
L
E
 
A
A
 
R
R
 
R
R
 
L
A
 
A
A
 
E
W
 
W
T
 
Q
P
 
P
P
 
-
V
 
-
L
 
-
H
 
N
H
 
H
Q
 
D
T
 
L
P
 
P

8ej0A Crystal structure of fe-s cluster-dependent dehydratase from paralcaligenes ureilyticus in complex with mg
45% identity, 98% coverage: 11:593/593 of query aligns to 3:568/568 of 8ej0A

query
sites
8ej0A
R
 
R
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
W
 
W
F
 
F
D
 
G
N
 
R
P
 
L
D
 
D
N
 
R
P
 
D
G
 
G
M
 
F
T
 
-
A
 
-
L
 
I
Y
 
Y
V
 
R
E
 
S
R
 
W
Y
 
M
Q
 
K
N
 
N
Q
 
R
G
 
G
F
 
I
T
 
P
R
 
H
R
 
D
E
 
Q
L
 
F
Q
 
D
G
 
G
D
 
-
R
 
R
P
 
P
I
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
C
Q
 
N
S
 
T
G
 
F
S
 
S
D
 
E
L
 
L
A
 
T
P
 
P
C
|
C
N
 
N
K
 
S
I
 
H
H
 
F
L
 
R
F
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
I
G
 
G
I
 
V
R
 
W
D
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
P
 
P
M
 
L
E
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
V
H
 
M
P
 
S
I
 
L
Q
 
G
E
|
E
T
 
T
G
 
M
R
 
L
R
 
R
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
M
L
 
L
D
 
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
A
Y
 
S
L
 
M
G
 
D
L
 
V
V
 
E
E
 
E
V
 
S
L
 
I
H
 
R
G
 
G
Y
 
N
P
 
P
I
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
L
T
 
M
G
 
G
C
|
C
D
|
D
K
|
K
T
 
T
T
 
T
P
 
P
A
 
S
Q
 
L
L
 
M
M
 
M
A
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
S
V
 
C
D
 
D
L
 
L
P
 
P
S
 
T
I
 
I
V
 
G
L
 
V
S
 
S
G
 
G
W
 
G
P
 
P
M
 
M
L
 
L
D
 
S
G
 
G
W
 
K
W
 
F
E
 
R
G
 
G
K
 
R
L
 
E
A
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
D
I
 
V
W
|
W
E
 
K
S
 
M
R
 
S
R
 
E
L
 
E
L
 
V
A
 
R
E
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
M
D
 
S
Y
 
Q
P
 
E
E
 
E
F
 
F
M
 
F
E
 
E
R
 
A
A
 
E
C
 
S
A
 
C
S
 
M
A
 
H
P
 
R
S
 
S
L
 
H
G
 
G
H
 
H
C
|
C
N
 
M
T
 
T
M
 
M
G
 
G
T
|
T
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
M
N
 
A
A
 
S
L
 
M
A
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
G
C
 
N
S
 
A
A
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
V
F
 
D
R
 
A
E
 
R
R
 
R
M
 
N
N
 
L
M
 
L
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
T
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
V
 
V
E
 
Q
M
 
M
V
 
V
L
 
K
A
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
V
P
 
M
S
 
S
D
 
K
I
 
I
L
 
L
T
 
T
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
P
 
V
P
 
I
H
 
H
L
 
L
Q
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
G
H
 
R
A
 
I
G
 
G
V
 
V
E
 
D
L
 
L
A
 
T
V
 
L
E
 
A
D
 
D
W
 
W
Q
 
D
T
 
A
V
 
L
G
 
G
F
 
H
D
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
C
L
 
L
V
 
V
N
 
D
M
 
L
Q
 
Q
P
 
P
A
 
S
G
 
G
E
 
T
Y
 
H
L
 
L
G
 
M
E
 
E
S
 
D
F
 
F
F
 
Y
R
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
V
M
 
I
G
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
-
A
 
-
A
 
G
G
 
D
L
 
V
L
 
I
H
 
A
A
 
R
E
 
D
A
 
A
L
 
L
T
 
T
V
 
V
T
 
N
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
I
 
L
G
 
W
H
 
D
N
 
N
L
 
C
A
 
K
G
 
D
E
 
A
R
 
P
S
 
N
R
 
W
D
 
N
R
 
R
R
 
E
V
 
V
I
 
I
R
 
H
S
 
A
V
 
F
E
 
N
D
 
E
P
 
P
L
 
F
R
 
K
E
 
T
K
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
I
L
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
N
 
N
L
 
L
F
 
C
-
 
P
D
 
D
S
 
G
A
 
A
L
 
V
M
 
I
K
 
K
T
 
P
S
 
S
V
 
A
I
 
A
S
 
T
A
 
P
E
 
A
F
 
L
R
 
L
H
 
K
R
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
I
 
-
H
 
H
E
 
K
A
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
F
E
 
E
G
 
N
P
 
S
E
 
E
D
 
H
Y
 
M
H
 
H
A
 
E
R
 
R
I
 
M
N
 
D
D
 
D
P
 
E
D
 
N
L
 
L
G
 
D
I
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
N
T
 
C
I
 
V
L
 
L
F
 
V
I
 
L
R
 
K
G
 
N
V
 
C
G
 
G
C
 
P
V
 
R
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
S
 
M
A
 
A
E
|
E
V
 
A
V
 
G
N
 
N
M
 
M
Q
 
P
P
 
L
P
 
P
D
 
P
G
 
K
L
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
T
H
 
D
L
 
M
P
 
V
T
 
R
V
 
V
G
 
S
D
 
D
G
 
A
R
 
R
Q
 
M
S
|
S
G
|
G
T
 
T
S
 
A
E
 
Y
S
 
G
P
 
T
S
 
V
I
 
V
L
 
L
N
 
H
A
 
V
S
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
P
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
V
R
 
Q
T
 
D
G
 
G
D
 
D
R
 
I
V
 
I
R
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
V
N
 
A
A
 
A
C
 
R
R
 
K
L
 
L
D
 
H
A
 
L
L
 
H
V
 
V
D
 
S
E
 
D
A
 
E
E
 
E
W
 
L
E
 
A
A
 
R
R
 
R
R
 
R
A
 
E
A
 
A
W
 
W
T
 
Q
P
 
A
P
 
P
V
 
P
L
 
A
H
 
P
H
 
M
Q
 
A
T
 
R
P
 
G
W
 
W
Q
 
V
E
 
K
I
 
L
Y
 
Y
R
 
V
R
 
E
L
 
H
V
 
V
G
 
Q
Q
 
Q
L
 
A
A
 
N
D
 
L
G
 
G
G
 
A
C
 
D
L
 
L
E
 
D
L
 
F
A
 
L
T
 
R
A
 
G
Y
 
-
H
 
-
R
 
K
V
 
S
A
 
G
R
 
A
D
 
G
L
 
I
P
 
P
R
 
K
D
 
D
N
 
N
H
 
H

8epzA Crystal structure of fe-s cluster-dependent dehydratase from paralcaligenes ureilyticus in complex with mn
45% identity, 98% coverage: 11:593/593 of query aligns to 4:569/569 of 8epzA

query
sites
8epzA
R
 
R
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
W
 
W
F
 
F
D
 
G
N
 
R
P
 
L
D
 
D
N
 
R
P
 
D
G
 
G
M
 
F
T
 
-
A
 
-
L
 
I
Y
 
Y
V
 
R
E
 
S
R
 
W
Y
 
M
Q
 
K
N
 
N
Q
 
R
G
 
G
F
 
I
T
 
P
R
 
H
R
 
D
E
 
Q
L
 
F
Q
 
D
G
 
G
D
 
-
R
 
R
P
 
P
I
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
C
Q
 
N
S
 
T
G
 
F
S
 
S
D
 
E
L
 
L
A
 
T
P
 
P
C
|
C
N
 
N
K
 
S
I
 
H
H
 
F
L
 
R
F
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
I
G
 
G
I
 
V
R
 
W
D
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
F
P
 
P
M
 
L
E
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
V
H
 
M
P
 
S
I
 
L
Q
 
G
E
|
E
T
 
T
G
 
M
R
 
L
R
 
R
P
 
P
T
 
T
A
 
A
A
 
M
L
 
L
D
 
F
R
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
A
Y
 
S
L
 
M
G
 
D
L
 
V
V
 
E
E
 
E
V
 
S
L
 
I
H
 
R
G
 
G
Y
 
N
P
 
P
I
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
L
T
 
M
G
 
G
C
|
C
D
|
D
K
|
K
T
 
T
T
 
T
P
 
P
A
 
S
Q
 
L
L
 
M
M
 
M
A
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
S
V
 
C
D
 
D
L
 
L
P
 
P
S
 
T
I
 
I
V
 
G
L
 
V
S
 
S
G
 
G
W
 
G
P
 
P
M
 
M
L
 
L
D
 
S
G
 
G
W
 
K
W
 
F
E
 
R
G
 
G
K
 
R
L
 
E
A
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
D
I
 
V
W
 
W
E
 
K
S
 
M
R
 
S
R
 
E
L
 
E
L
 
V
A
 
R
E
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
M
D
 
S
Y
 
Q
P
 
E
E
 
E
F
 
F
M
 
F
E
 
E
R
 
A
A
 
E
C
 
S
A
 
C
S
 
M
A
 
H
P
 
R
S
 
S
L
 
H
G
 
G
H
 
H
C
|
C
N
 
M
T
 
T
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
M
N
 
A
A
 
S
L
 
M
A
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
G
C
 
N
S
 
A
A
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
V
F
 
D
R
 
A
E
 
R
R
 
R
M
 
N
N
 
L
M
 
L
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
T
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
I
V
 
V
E
 
Q
M
 
M
V
 
V
L
 
K
A
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
V
P
 
M
S
 
S
D
 
K
I
 
I
L
 
L
T
 
T
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
P
 
V
P
 
I
H
 
H
L
 
L
Q
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
G
H
 
R
A
 
I
G
 
G
V
 
V
E
 
D
L
 
L
A
 
T
V
 
L
E
 
A
D
 
D
W
 
W
Q
 
D
T
 
A
V
 
L
G
 
G
F
 
H
D
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
C
L
 
L
V
 
V
N
 
D
M
 
L
Q
 
Q
P
 
P
A
 
S
G
 
G
E
 
T
Y
 
H
L
 
L
G
 
M
E
 
E
S
 
D
F
 
F
F
 
Y
R
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
V
M
 
I
G
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
-
A
 
-
A
 
G
G
 
D
L
 
V
L
 
I
H
 
A
A
 
R
E
 
D
A
 
A
L
 
L
T
 
T
V
 
V
T
 
N
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
I
 
L
G
 
W
H
 
D
N
 
N
L
 
C
A
 
K
G
 
D
E
 
A
R
 
P
S
 
N
R
 
W
D
 
N
R
 
R
R
 
E
V
 
V
I
 
I
R
 
H
S
 
A
V
 
F
E
 
N
D
 
E
P
 
P
L
 
F
R
 
K
E
 
T
K
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
I
L
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
N
 
N
L
 
L
F
 
C
-
 
P
D
 
D
S
 
G
A
 
A
L
 
V
M
 
I
K
 
K
T
 
P
S
 
S
V
 
A
I
 
A
S
 
T
A
 
P
E
 
A
F
 
L
R
 
L
H
 
K
R
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
I
 
-
H
 
H
E
 
K
A
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
F
E
 
E
G
 
N
P
 
S
E
 
E
D
 
H
Y
 
M
H
 
H
A
 
E
R
 
R
I
 
M
N
 
D
D
 
D
P
 
E
D
 
N
L
 
L
G
 
D
I
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
N
T
 
C
I
 
V
L
 
L
F
 
V
I
 
L
R
 
K
G
 
N
V
 
C
G
 
G
C
 
P
V
 
R
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
S
 
M
A
 
A
E
|
E
V
 
A
V
 
G
N
 
N
M
 
M
Q
 
P
P
 
L
P
 
P
D
 
P
G
 
K
L
 
I
L
 
L
R
 
R
E
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
T
H
 
D
L
 
M
P
 
V
T
 
R
V
 
V
G
 
S
D
 
D
G
 
A
R
 
R
Q
 
M
S
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
A
E
 
Y
S
 
G
P
 
T
S
 
V
I
 
V
L
 
L
N
 
H
A
 
V
S
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
P
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
V
R
 
Q
T
 
D
G
 
G
D
 
D
R
 
I
V
 
I
R
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
V
N
 
A
A
 
A
C
 
R
R
 
K
L
 
L
D
 
H
A
 
L
L
 
H
V
 
V
D
 
S
E
 
D
A
 
E
E
 
E
W
 
L
E
 
A
A
 
R
R
 
R
R
 
R
A
 
E
A
 
A
W
 
W
T
 
Q
P
 
A
P
 
P
V
 
P
L
 
A
H
 
P
H
 
M
Q
 
A
T
 
R
P
 
G
W
 
W
Q
 
V
E
 
K
I
 
L
Y
 
Y
R
 
V
R
 
E
L
 
H
V
 
V
G
 
Q
Q
 
Q
L
 
A
A
 
N
D
 
L
G
 
G
G
 
A
C
 
D
L
 
L
E
 
D
L
 
F
A
 
L
T
 
R
A
 
G
Y
 
-
H
 
-
R
 
K
V
 
S
A
 
G
R
 
A
D
 
G
L
 
I
P
 
P
R
 
K
D
 
D
N
 
N
H
 
H

Q1JUQ1 L-arabonate dehydratase; L-arabinonate dehydratase; EC 4.2.1.25 from Azospirillum brasilense (see paper)
46% identity, 92% coverage: 4:549/593 of query aligns to 2:535/583 of Q1JUQ1

query
sites
Q1JUQ1
T
 
S
P
 
A
T
 
T
G
 
K
R
 
P
R
 
R
F
 
L
R
 
R
S
 
S
Q
 
T
A
 
Q
W
 
W
F
 
F
D
 
G
N
 
T
P
 
N
D
 
D
N
 
K
P
 
N
G
 
G
M
 
F
T
 
-
A
 
-
L
 
M
Y
 
Y
V
 
R
E
 
S
R
 
W
Y
 
M
Q
 
K
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
F
 
I
T
 
P
R
 
D
R
 
H
E
 
E
L
 
F
Q
 
D
G
 
G
D
 
-
R
 
R
P
 
P
I
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
x
C
Q
 
N
S
 
T
G
 
W
S
 
S
D
 
E
L
 
L
A
 
T
P
 
P
C
|
C
N
 
N
K
 
A
I
 
H
H
 
F
L
 
R
F
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
H
V
 
V
K
 
K
A
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
S
D
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
F
P
 
P
M
 
V
E
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
V
H
 
F
P
 
S
I
 
N
Q
 
G
E
 
E
T
 
S
G
 
N
R
 
L
R
 
R
P
 
P
T
 
S
A
 
A
A
 
M
L
 
L
D
 
T
R
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
A
Y
 
S
L
 
M
G
 
D
L
 
V
V
 
E
E
 
E
V
 
A
L
 
I
H
 
R
G
 
G
Y
 
N
P
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
L
T
 
A
G
 
G
C
|
C
D
 
D
K
 
K
T
 
T
T
 
T
P
 
P
A
 
A
Q
 
L
L
 
L
M
 
M
A
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
S
V
 
C
D
 
D
L
 
V
P
 
P
S
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
V
S
 
S
G
 
G
W
 
G
P
 
P
M
 
M
L
 
L
D
 
N
G
 
G
W
 
K
W
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
N
A
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
A
I
 
V
W
 
W
E
 
Q
S
 
L
R
 
H
R
 
E
L
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
D
 
D
Y
 
V
P
 
H
E
 
H
F
 
F
M
 
L
E
 
S
R
 
A
A
 
E
C
 
A
A
 
G
S
 
M
A
 
S
P
 
R
S
 
S
L
 
A
G
 
G
H
 
T
C
|
C
N
 
N
T
 
T
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
M
N
 
A
A
 
C
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
V
S
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
C
 
N
S
 
A
A
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
V
F
 
D
R
 
S
E
 
R
R
 
R
M
 
Y
N
 
V
M
 
L
A
 
A
Y
 
H
A
 
M
T
 
S
G
 
G
R
 
I
R
 
R
I
 
I
V
 
V
E
 
E
M
 
M
V
 
A
L
 
L
A
 
E
D
 
G
L
 
L
K
 
V
P
 
L
S
 
S
D
 
K
I
 
I
L
 
L
T
 
T
R
 
R
Q
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
N
 
N
A
 
A
I
 
I
R
 
R
V
 
A
N
 
N
S
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
P
 
V
P
 
I
H
 
H
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
G
H
 
R
A
 
I
G
 
G
V
 
V
E
 
P
L
 
L
A
 
E
V
 
L
E
 
E
D
 
D
W
 
W
Q
 
M
T
 
R
V
 
I
G
 
G
F
 
R
D
 
D
L
 
T
P
 
P
L
 
T
L
 
I
V
 
V
N
 
D
M
 
L
Q
 
M
P
 
P
A
 
S
G
 
G
E
 
R
Y
 
F
L
 
P
G
 
M
E
 
E
S
 
E
F
 
F
F
 
Y
R
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
P
A
 
A
V
 
V
M
 
L
G
 
R
E
 
R
L
 
L
L
 
G
A
 
E
A
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
-
 
P
H
 
N
A
 
P
E
 
D
A
 
A
L
 
L
T
 
T
V
 
V
T
 
N
G
 
G
E
 
K
S
 
S
I
 
L
G
 
W
H
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
R
G
 
E
E
 
A
R
 
P
S
 
N
R
 
Y
D
 
D
R
 
E
R
 
E
V
 
V
I
 
I
R
 
R
S
 
P
V
 
L
E
 
D
D
 
R
P
 
P
L
 
L
R
 
I
E
 
A
K
 
D
A
 
G
G
 
G
F
 
I
L
 
R
V
 
I
L
 
L
R
 
R
G
 
G
N
 
N
L
 
L
F
 
A
-
 
P
D
 
R
S
 
G
A
 
A
L
 
V
M
 
L
K
 
K
T
 
P
S
 
S
V
 
A
I
 
A
S
 
S
A
 
P
E
 
E
F
 
L
R
 
L
H
 
K
R
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
I
 
-
H
 
H
E
 
R
A
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
F
E
 
E
G
 
N
P
 
L
E
 
D
D
 
H
Y
 
Y
H
 
K
A
 
A
R
 
T
I
 
I
N
 
N
D
 
D
P
 
E
D
 
A
L
 
L
G
 
D
I
 
I
D
 
D
E
 
A
T
 
S
T
 
S
I
 
V
L
 
M
F
 
V
I
 
L
R
 
K
G
 
N
V
x
C
G
 
G
C
 
P
V
 
R
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
S
 
M
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
G
N
 
N
M
 
M
Q
 
G
P
 
L
P
 
P
D
 
P
G
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
K
H
 
D
L
 
M
P
 
V
T
 
R
V
 
I
G
 
S
D
 
D
G
 
A
R
 
R
Q
 
M
S
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
A
E
 
Y
S
 
G
P
 
T
S
 
V
I
 
V
L
 
L
N
 
H
A
 
V
S
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
P
L
 
L
A
 
A
L
 
A
L
 
V
R
 
R
T
 
N
G
 
G
D
 
D
R
 
W
V
 
I
R
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
C
N
 
E
A
 
A
C
 
G
R
 
T
L
 
L
D
 
H
A
 
L
L
 
D
V
 
I
D
 
T
E
 
D
A
 
D
E
 
E
W
 
L
E
 
H
A
 
R
R
 
R
R
 
L
A
 
S
A
 
D
W
 
V
T
 
D
P
 
P

6ovtA Crystal structure of ilvd from mycobacterium tuberculosis (see paper)
35% identity, 89% coverage: 46:572/593 of query aligns to 36:558/562 of 6ovtA

query
sites
6ovtA
R
 
K
P
 
P
I
 
Q
I
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
A
Q
 
S
S
 
S
G
 
W
S
 
N
D
 
E
L
 
I
A
 
T
P
 
P
C
|
C
N
 
N
K
 
L
I
 
S
H
 
L
L
 
D
F
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
N
R
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
E
G
 
G
I
 
V
R
 
F
D
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
P
 
P
M
 
L
E
 
E
F
 
F
P
 
G
V
 
T
H
 
I
P
 
S
I
 
V
Q
 
S
E
x
D
T
x
G
G
 
I
R
 
S
R
 
M
P
 
G
T
 
H
A
 
E
A
 
G
L
 
M
D
 
H
R
 
F
N
 
S
L
 
L
A
 
V
Y
 
S
L
 
R
G
 
E
L
 
V
V
 
I
E
 
A
-
 
D
-
 
S
-
 
V
-
 
E
-
 
V
V
 
V
L
 
M
H
 
Q
G
 
A
Y
 
E
P
 
R
I
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
L
T
 
A
G
 
G