SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011842358.1 NCBI__GCF_000015985.1:WP_011842358.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7uoiA Crystallographic structure of dape from enterococcus faecium (see paper)
28% identity, 97% coverage: 9:360/364 of query aligns to 11:378/383 of 7uoiA

query
sites
7uoiA
V
 
I
A
 
A
L
 
I
T
 
L
R
 
Q
A
 
E
L
 
I
I
 
I
G
 
R
F
 
I
D
 
K
T
 
S
I
 
V
N
 
N
P
 
-
P
 
-
G
 
G
R
 
N
E
 
E
A
 
G
P
 
E
A
 
V
M
 
A
R
 
A
F
 
Y
C
 
L
Q
 
N
E
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
R
A
 
H
G
 
D
F
 
I
A
 
T
C
 
G
R
 
E
L
 
I
I
 
V
D
 
S
H
 
Y
G
 
R
K
 
D
D
 
G
R
 
R
A
 
D
S
 
N
L
 
L
I
 
I
A
 
A
-
 
R
-
 
Y
V
 
Q
R
 
K
G
 
G
P
 
Q
G
 
S
G
 
G
G
 
K
-
 
V
L
 
L
C
 
G
F
 
L
S
 
S
G
 
G
H
|
H
L
 
M
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
A
L
 
A
G
 
G
-
 
D
R
 
E
A
 
S
P
 
S
W
 
W
S
 
T
R
 
Y
E
 
A
A
 
P
H
 
F
G
 
A
G
 
A
A
 
E
V
 
I
E
 
H
G
 
G
D
 
N
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
T
D
|
D
M
 
M
K
 
K
G
 
S
G
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
M
L
 
V
V
 
I
A
 
A
A
 
M
-
 
I
-
 
E
-
 
L
A
 
K
R
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
K
P
 
P
-
 
F
-
 
N
-
 
G
-
 
T
V
 
V
T
 
K
V
 
L
L
 
L
L
 
A
T
 
T
A
 
V
G
 
G
E
 
E
E
 
E
T
 
V
G
 
G
C
 
E
D
 
L
G
 
G
A
 
G
R
 
E
W
 
Q
L
 
L
A
 
T
E
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
Y
L
 
V
P
 
D
R
 
D
V
 
L
R
 
D
A
 
A
M
 
L
I
 
I
V
 
I
G
 
G
E
|
E
S
 
P
T
 
T
G
 
N
N
 
Y
R
 
S
P
 
L
L
 
M
A
 
Y
G
 
T
H
 
H
K
 
M
G
 
G
A
 
S
L
 
I
W
 
N
L
 
Y
K
 
T
L
 
V
S
 
T
T
 
S
E
 
H
G
 
G
R
 
K
T
 
E
A
 
A
H
 
H
G
 
S
A
 
S
A
 
M
P
 
P
H
 
D
L
 
Q
G
 
G
I
 
Y
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
N
-
 
H
-
 
L
-
 
N
-
 
E
L
 
F
M
 
I
A
 
T
P
 
K
T
 
A
L
 
N
A
 
A
R
 
E
L
 
M
T
 
N
G
 
H
W
 
L
Q
 
A
P
 
E
A
 
T
A
 
I
H
 
E
H
 
N
P
 
P
R
 
V
M
 
L
G
 
G
R
 
K
A
 
T
T
 
I
A
 
H
N
 
N
L
 
V
G
 
T
T
 
L
I
 
I
R
 
S
A
 
G
G
 
G
I
 
N
N
 
Q
V
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
I
P
 
P
D
 
S
L
 
H
C
 
A
E
 
Q
L
 
L
T
 
Q
V
 
G
D
 
N
L
 
I
R
 
R
S
 
S
V
 
I
E
 
P
G
 
E
V
 
Y
D
 
P
H
 
N
A
 
D
A
 
K
L
 
I
A
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
L
R
 
Q
G
 
S
L
 
I
C
 
V
D
 
N
P
 
E
A
 
L
-
 
N
-
 
Q
-
 
E
-
 
T
-
 
D
V
 
Y
R
 
H
V
 
L
E
 
E
T
 
L
L
 
M
L
 
I
D
 
D
L
 
Y
P
 
N
A
 
K
-
 
I
-
 
P
V
 
V
W
 
K
T
 
A
E
 
D
P
 
P
E
 
D
D
 
S
P
 
P
W
 
L
F
 
I
A
 
H
C
 
S
A
 
I
A
 
Q
A
 
Q
Q
 
Q
V
 
F
R
 
S
A
 
Q
-
 
P
-
 
L
-
 
P
V
 
L
T
 
V
G
 
G
P
 
A
A
 
A
E
 
A
G
 
T
P
 
T
D
 
D
C
 
A
A
 
A
T
 
E
Y
 
-
F
 
F
T
 
T
D
 
K
A
 
A
S
 
N
I
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
A
 
-
M
 
-
G
 
H
D
 
S
P
 
F
A
 
D
V
 
F
M
 
V
I
 
V
L
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
V
V
 
V
D
 
T
Q
 
L
P
 
P
H
 
H
G
 
Q
T
 
V
D
 
D
E
 
E
H
 
Y
V
 
V
L
 
E
V
 
I
S
 
D
R
 
N
L
 
Y
A
 
L
E
 
D
A
 
M
V
 
I
E
 
E
I
 
K
Y
 
Y
A
 
Q
A
 
G
L
 
I
I
 
I

8uw6B Acetylornithine deacetylase from escherichia coli, di-zinc form. (see paper)
29% identity, 85% coverage: 52:360/364 of query aligns to 57:375/381 of 8uw6B

query
sites
8uw6B
K
 
R
D
 
N
R
 
K
A
 
F
S
 
N
L
 
M
I
 
L
A
 
A
V
 
S
R
 
T
G
 
G
P
 
Q
G
 
G
-
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
C
 
L
F
 
L
S
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
T
V
 
V
P
 
P
L
 
F
G
 
D
R
 
D
A
 
G
P
 
R
W
 
W
S
 
T
R
 
R
E
 
D
A
 
P
H
 
F
G
 
T
G
 
L
A
 
T
V
 
E
E
 
H
G
 
D
D
 
G
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
L
G
 
G
S
 
T
S
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
G
 
G
G
 
F
V
 
F
A
 
A
A
 
F
F
 
I
L
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
D
V
 
V
A
 
D
A
 
V
A
 
T
R
 
K
S
 
L
G
 
K
A
 
K
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
V
 
I
L
 
L
L
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
D
E
 
E
E
|
E
T
 
T
G
 
S
C
 
M
D
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
R
W
 
Y
L
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
T
G
 
T
L
 
A
L
 
L
P
 
-
R
 
R
V
 
P
R
 
D
A
 
C
M
 
A
I
 
I
V
 
I
G
 
G
E
|
E
S
 
P
T
 
T
G
 
S
N
 
L
R
 
Q
P
 
P
L
 
V
A
 
R
G
 
A
H
 
H
K
 
K
G
 
G
A
 
H
L
 
I
W
 
S
L
 
N
K
 
A
L
 
I
S
 
R
T
 
I
E
 
Q
G
 
G
R
 
Q
T
 
S
A
 
G
H
 
H
G
 
S
A
 
S
A
 
D
P
 
P
H
 
A
L
 
R
G
 
G
I
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
E
L
 
L
M
 
M
A
 
H
P
 
D
T
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
H
L
 
I
-
 
L
-
 
Q
-
 
L
-
 
R
T
 
D
G
 
N
W
 
L
Q
 
K
P
 
E
A
 
R
A
 
Y
H
 
H
H
 
Y
P
 
E
R
 
A
M
 
F
G
 
T
-
 
V
-
 
P
R
 
Y
A
 
P
T
 
T
A
 
L
N
 
N
L
 
L
G
 
G
T
 
H
I
 
I
R
 
H
A
 
G
G
 
G
I
 
D
N
 
A
V
 
S
N
 
N
S
 
R
V
 
I
P
 
C
D
 
A
L
 
W
C
 
C
E
 
E
L
 
L
T
 
H
V
 
M
D
 
D
L
 
I
R
 
R
S
 
P
V
 
L
E
 
P
G
 
G
V
 
M
D
 
T
H
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
L
A
 
N
E
 
E
A
 
L
R
 
N
G
 
G
L
 
L
C
 
L
D
 
N
P
 
D
A
 
A
V
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
A
D
 
P
L
 
V
P
 
S
A
 
E
V
 
R
W
 
W
-
 
P
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
D
-
 
E
T
 
L
E
 
H
P
 
P
E
 
P
D
 
I
P
 
P
W
 
G
F
 
Y
A
 
E
C
 
C
A
 
P
A
 
P
A
 
N
-
 
H
Q
 
Q
V
 
L
R
 
V
A
 
E
V
 
V
T
 
V
G
 
E
P
 
K
A
 
L
E
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
K
P
 
T
D
 
E
C
 
V
A
 
V
T
 
N
Y
 
Y
F
 
C
T
 
T
D
 
E
A
 
A
S
 
P
I
 
F
L
 
I
K
 
Q
P
 
T
A
 
L
M
 
C
G
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
P
V
 
T
M
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
S
V
 
I
D
 
N
Q
 
Q
P
 
A
H
|
H
G
 
Q
T
 
P
D
 
D
E
 
E
H
 
Y
V
 
L
L
 
E
V
 
T
S
 
R
R
 
F
L
 
I
A
 
K
E
 
P
A
 
T
V
 
R
E
 
E
I
 
L
Y
 
I
A
 
T
A
 
Q
L
 
V
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Q8P8J5 N-acetyl-L-citrulline deacetylase; ACDase; Acetylcitrulline deacetylase; EC 3.5.1.- from Xanthomonas campestris pv. campestris (strain ATCC 33913 / DSM 3586 / NCPPB 528 / LMG 568 / P 25) (see paper)
30% identity, 99% coverage: 1:360/364 of query aligns to 1:362/366 of Q8P8J5

query
sites
Q8P8J5
M
 
M
T
 
T
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
A
D
 
S
V
 
T
V
 
L
A
 
E
L
 
H
T
 
L
R
 
E
A
 
T
L
 
L
I
 
V
G
 
S
F
 
F
D
 
D
T
 
T
I
 
R
N
 
N
P
 
P
P
 
P
-
 
R
-
 
A
-
 
I
G
 
A
R
 
A
E
 
E
A
 
G
P
 
G
A
 
I
M
 
F
R
 
D
F
 
Y
C
 
L
Q
 
R
E
 
A
L
 
Q
L
 
L
E
 
P
R
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
C
 
V
R
 
E
L
 
V
I
 
I
D
 
D
H
 
H
G
 
G
K
 
D
D
 
G
R
 
A
A
 
V
S
 
S
L
 
L
I
 
Y
A
 
A
V
 
V
R
 
R
G
 
G
P
 
T
G
 
P
G
 
K
G
 
Y
L
 
L
C
 
-
F
 
F
S
 
N
G
 
V
H
|
H
L
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
V
P
 
P
L
 
-
G
 
D
R
 
S
A
 
P
P
 
H
W
 
W
S
 
S
R
 
A
E
 
D
A
 
P
H
 
H
G
 
V
G
 
M
A
 
R
V
 
R
E
 
T
G
 
E
D
 
D
R
 
R
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
R
 
L
G
 
G
S
 
V
S
 
C
D
|
D
M
 
I
K
 
K
G
 
G
G
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
L
L
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
N
R
 
A
S
 
G
G
 
D
A
 
G
P
 
D
V
 
A
T
 
A
V
 
F
L
 
L
L
 
F
T
 
S
A
 
S
G
 
D
E
 
E
E
 
E
T
 
A
G
 
N
-
 
D
-
 
P
-
 
R
C
 
C
D
 
I
G
 
A
A
 
A
R
 
-
W
 
F
L
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
G
G
 
-
L
 
-
L
 
L
P
 
P
R
 
-
V
 
Y
R
 
D
A
 
A
M
 
V
I
 
L
V
 
V
G
 
A
E
|
E
S
 
P
T
 
T
G
 
M
N
 
S
R
 
E
P
 
A
L
 
V
A
 
L
G
 
A
H
 
H
K
 
R
G
 
G
A
 
I
L
 
S
W
 
S
L
 
V
K
 
L
L
 
M
S
 
R
T
 
F
E
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
A
A
 
G
H
 
H
G
 
A
A
 
S
A
 
-
P
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
G
I
 
K
N
 
Q
A
 
D
I
 
P
G
 
A
L
 
A
M
 
S
A
 
A
P
 
L
T
 
H
L
 
Q
A
 
A
R
 
M
L
 
R
T
 
W
G
 
G
W
 
G
Q
 
K
P
 
A
A
 
L
A
 
D
H
 
H
-
 
V
-
 
E
-
 
S
-
 
L
-
 
A
H
 
H
P
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
R
 
G
A
 
L
T
 
T
A
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
F
N
 
N
L
 
I
G
 
G
T
 
R
I
 
V
R
 
D
A
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
K
V
 
A
N
 
N
S
 
M
V
 
I
P
 
A
D
 
P
L
 
A
C
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
R
V
 
F
D
 
G
L
 
F
R
 
R
S
 
P
V
 
L
E
 
P
G
 
S
V
 
M
D
 
D
H
 
V
A
 
D
A
 
G
L
 
L
A
 
L
A
 
A
E
 
T
A
 
F
R
 
A
G
 
G
L
 
F
C
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
A
V
 
A
R
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
A
D
 
H
L
 
F
P
 
E
A
 
E
V
 
T
W
 
F
T
 
R
E
 
G
P
 
P
E
 
S
D
 
L
P
 
P
W
 
S
F
 
G
A
 
D
C
 
I
A
 
A
A
 
R
A
 
A
Q
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
L
-
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
D
V
 
V
T
 
A
G
 
D
P
 
A
A
 
L
E
 
D
G
 
L
P
 
P
-
 
I
-
 
G
D
 
N
C
 
A
A
 
V
T
 
D
Y
 
F
F
 
W
T
 
T
D
 
E
A
 
A
S
 
S
I
 
L
L
 
F
K
 
-
P
 
-
A
 
S
M
 
A
G
 
G
D
 
G
P
 
Y
A
 
T
V
 
A
M
 
L
I
 
V
L
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
D
V
 
I
D
 
A
Q
 
Q
P
 
A
H
 
H
G
 
T
T
 
A
D
 
D
E
 
E
H
 
F
V
 
V
L
 
T
V
 
L
S
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
Q
E
 
R
A
 
Y
V
 
V
E
 
E
I
 
S
Y
 
V
A
 
N
A
 
R
L
 
I
I
 
I

2f7vA Structure of acetylcitrulline deacetylase complexed with one co (see paper)
30% identity, 99% coverage: 1:360/364 of query aligns to 2:357/360 of 2f7vA

query
sites
2f7vA
M
 
M
T
 
T
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
A
D
 
S
V
 
T
V
 
L
A
 
E
L
 
H
T
 
L
R
 
E
A
 
T
L
 
L
I
 
V
G
 
S
F
 
F
D
 
D
T
 
T
I
 
R
N
 
N
P
 
P
P
 
P
-
 
R
-
 
A
-
 
I
G
 
A
R
 
A
E
 
E
A
 
G
P
 
G
A
 
I
M
 
F
R
 
D
F
 
Y
C
 
L
Q
 
R
E
 
A
L
 
Q
L
 
L
E
 
P
R
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
C
 
V
R
 
E
L
 
V
I
 
I
D
 
D
H
 
H
G
 
G
K
 
D
D
 
G
R
 
A
A
 
V
S
 
S
L
 
L
I
 
Y
A
 
A
V
 
V
R
 
R
G
 
G
P
 
T
G
 
P
G
 
K
G
 
Y
L
 
L
C
 
-
F
 
F
S
 
N
G
 
V
H
|
H
L
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
V
P
 
P
L
 
-
G
 
D
R
 
S
A
 
P
P
 
H
W
 
W
S
 
S
R
 
A
E
 
D
A
 
P
H
 
H
G
 
V
G
 
M
A
 
R
V
 
R
E
 
T
G
 
E
D
 
D
R
 
R
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
R
 
L
G
 
G
S
 
V
S
 
C
D
|
D
M
 
I
K
 
K
G
 
G
G
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
L
L
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
N
R
 
A
S
 
G
G
 
D
A
 
G
P
 
D
V
 
A
T
 
A
V
 
F
L
 
L
L
 
F
T
 
S
A
 
S
G
 
D
E
|
E
E
 
E
T
 
A
G
 
N
-
 
D
-
 
P
-
 
R
C
 
C
D
 
I
G
 
A
A
 
A
R
 
-
W
 
F
L
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
G
G
 
-
L
 
-
L
 
L
P
 
P
R
 
-
V
 
Y
R
 
D
A
 
A
M
 
V
I
 
L
V
 
V
G
 
A
E
|
E
S
 
P
T
 
T
G
 
M
N
 
S
R
 
E
P
 
A
L
 
V
A
 
L
G
 
A
H
 
H
K
 
R
G
 
G
A
 
I
L
 
S
W
 
S
L
 
V
K
 
L
L
 
M
S
 
R
T
 
F
E
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
A
A
 
G
H
 
D
G
 
P
A
 
A
A
 
A
P
 
S
H
 
A
L
 
L
G
 
H
I
 
-
N
 
Q
A
 
A
I
 
M
G
 
R
L
 
W
M
 
G
A
 
G
P
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
D
R
 
H
L
 
V
T
 
E
G
 
S
W
 
L
Q
 
A
P
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
H
 
H
P
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
R
 
G
A
 
L
T
 
T
A
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
F
N
 
N
L
 
I
G
 
G
T
 
R
I
 
V
R
 
D
A
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
K
V
 
A
N
 
N
S
 
M
V
 
I
P
 
A
D
 
P
L
 
A
C
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
R
V
 
F
D
 
G
L
 
F
R
 
R
S
 
P
V
 
L
E
 
P
G
 
S
V
 
M
D
 
D
H
 
V
A
 
D
A
 
G
L
 
L
A
 
L
A
 
A
E
 
T
A
 
F
R
 
A
G
 
G
L
 
F
C
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
A
V
 
A
R
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
A
D
 
H
L
 
F
P
 
E
A
 
E
V
 
T
W
 
F
T
 
R
E
 
G
P
 
P
E
 
S
D
 
L
P
 
P
W
 
S
F
 
G
A
 
D
C
 
I
A
 
A
A
 
R
A
 
A
Q
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
L
-
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
D
V
 
V
T
 
A
G
 
D
P
 
A
A
 
L
E
 
D
G
 
L
P
 
P
-
 
I
-
 
G
D
 
N
C
 
A
A
 
V
T
 
D
Y
 
F
F
 
W
T
 
T
D
 
E
A
 
A
S
 
S
I
 
L
L
 
F
K
 
-
P
 
-
A
 
S
M
 
A
G
 
G
D
 
G
P
 
Y
A
 
T
V
 
A
M
 
L
I
 
V
L
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
D
V
 
I
D
 
A
Q
 
Q
P
 
A
H
 
H
G
 
T
T
 
A
D
 
D
E
 
E
H
 
F
V
 
V
L
 
T
V
 
L
S
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
Q
E
 
R
A
 
Y
V
 
V
E
 
E
I
 
S
Y
 
V
A
 
N
A
 
R
L
 
I
I
 
I

7t1qA Crystal structure of the succinyl-diaminopimelate desuccinylase (dape) from acinetobacter baumannii in complex with succinic acid
27% identity, 91% coverage: 29:360/364 of query aligns to 20:371/377 of 7t1qA

query
sites
7t1qA
P
 
P
A
 
I
M
 
D
R
 
H
F
 
T
C
 
C
Q
 
Q
E
 
T
L
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
D
-
 
R
L
 
L
E
 
A
R
 
K
A
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
H
C
 
I
R
 
E
L
 
P
I
 
M
D
 
R
H
 
F
G
 
G
K
 
-
D
 
D
R
 
V
A
 
D
S
 
N
L
 
L
I
 
W
A
 
A
V
 
R
R
 
R
G
 
G
P
 
T
G
 
E
G
 
G
G
 
P
-
 
V
L
 
F
C
 
C
F
 
F
S
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
L
P
 
D
-
 
A
W
 
W
S
 
N
R
 
S
E
 
D
A
 
P
H
 
F
G
 
A
G
 
P
A
 
E
V
 
I
E
 
R
G
 
D
D
 
G
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
S
S
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
G
 
T
G
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
M
L
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
S
A
 
E
R
 
R
S
 
F
G
 
V
A
 
A
P
 
K
-
 
H
-
 
P
-
 
N
-
 
H
-
 
K
-
 
G
-
 
S
V
 
I
T
 
A
V
 
F
L
 
L
L
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
D
E
 
E
E
|
E
-
 
G
T
 
P
G
 
A
C
 
V
D
 
N
G
 
G
A
 
T
R
 
V
W
 
K
L
 
V
A
 
I
E
 
E
A
 
T
-
 
L
-
 
E
G
 
K
L
 
R
L
 
N
P
 
E
R
 
K
V
 
I
R
 
T
A
 
W
M
 
C
I
 
L
V
 
V
G
 
G
E
|
E
S
 
P
T
 
S
G
 
S
N
 
T
R
 
H
P
 
K
L
 
L
A
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
V
-
 
K
-
 
N
G
 
G
H
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
S
L
 
L
W
 
N
L
 
A
K
 
V
L
 
L
S
 
K
T
 
V
E
 
Q
G
 
G
R
 
K
T
 
Q
A
 
G
H
 
H
G
 
V
A
 
A
A
 
Y
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
A
I
 
R
N
 
N
A
 
P
I
 
I
G
 
H
L
 
E
M
 
A
A
 
S
P
 
P
T
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
E
L
 
L
-
 
C
-
 
Q
T
 
T
G
 
V
W
 
W
Q
 
D
P
 
N
A
 
G
A
 
N
H
 
E
H
 
Y
P
 
-
R
 
-
M
 
F
G
 
P
R
 
A
A
 
T
T
 
S
A
 
F
N
 
Q
L
 
I
G
 
S
T
 
N
I
 
I
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
T
N
 
G
-
 
A
V
 
T
N
 
N
S
 
V
V
 
I
P
 
P
D
 
G
L
 
A
C
 
L
E
 
E
L
 
V
T
 
T
V
 
F
D
 
N
L
 
F
R
 
R
S
 
Y
V
 
S
E
 
T
G
 
E
V
 
V
D
 
T
H
 
A
A
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
K
A
 
Q
E
 
R
A
 
V
R
 
H
G
 
E
L
 
I
C
 
L
D
 
D
P
 
K
-
 
H
A
 
G
V
 
L
R
 
Q
V
 
Y
E
 
E
T
 
I
L
 
V
L
 
W
D
 
N
L
 
L
P
 
S
A
 
G
V
 
L
-
 
P
W
 
F
T
 
L
E
 
T
P
 
P
E
 
V
D
 
G
P
 
E
W
 
L
F
 
V
A
 
N
C
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
T
Q
 
A
V
 
I
R
 
L
A
 
N
V
 
V
T
 
T
G
 
G
P
 
T
A
 
E
E
 
T
G
 
E
P
 
L
D
 
S
C
 
T
A
 
S
T
 
G
Y
 
G
F
 
T
T
 
S
D
 
D
A
 
G
S
 
R
I
 
F
L
 
I
K
 
A
P
 
P
A
 
T
M
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
G
V
 
A
M
 
Q
I
 
V
L
 
L
G
 
E
P
 
L
G
 
G
S
 
V
V
 
L
D
 
N
Q
 
A
P
 
T
-
 
I
H
|
H
G
 
Q
T
 
I
D
 
N
E
 
E
H
 
H
V
 
V
L
 
D
V
 
V
S
 
H
R
 
D
L
 
L
A
 
D
E
 
P
A
 
L
V
 
T
E
 
D
I
 
I
Y
 
Y
A
 
E
A
 
Q
L
 
I
I
 
L

4o23A Crystal structure of mono-zinc form of succinyl diaminopimelate desuccinylase from neisseria meningitidis mc58 (see paper)
32% identity, 55% coverage: 6:205/364 of query aligns to 3:216/376 of 4o23A

query
sites
4o23A
T
 
T
D
 
Q
V
 
S
V
 
L
A
 
E
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
S
F
 
R
D
 
P
T
 
S
I
 
V
N
 
T
P
 
P
P
 
D
G
 
D
R
 
R
E
 
D
A
 
C
P
 
-
A
 
-
M
 
Q
R
 
K
F
 
L
C
 
L
Q
 
A
E
 
E
L
 
R
L
 
L
E
 
H
R
 
K
A
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
C
 
A
R
 
E
L
 
E
I
 
L
D
 
H
H
 
F
G
 
G
K
 
-
D
 
D
R
 
T
A
 
K
S
 
N
L
 
I
I
 
W
A
 
L
V
 
R
R
 
R
G
 
G
P
 
T
G
 
K
G
 
A
G
 
P
L
 
V
-
 
V
C
 
C
F
 
F
S
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
P
A
 
V
-
 
E
P
 
K
W
 
W
S
 
D
R
 
S
E
 
P
A
 
P
H
 
F
G
 
E
G
 
P
A
 
A
V
 
E
E
 
R
G
 
D
D
 
G
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
G
 
T
G
 
S
V
 
I
A
 
A
A
 
C
F
 
F
L
 
V
V
 
T
A
 
A
A
 
C
A
 
E
R
 
R
S
 
F
G
 
V
A
 
A
P
 
K
-
 
H
-
 
P
-
 
N
-
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
S
V
 
I
T
 
A
V
 
L
L
 
L
L
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
D
E
 
E
E
 
E
-
 
G
T
 
D
G
 
A
C
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
T
R
 
T
W
 
K
L
 
V
A
 
V
E
 
D
A
 
V
G
 
-
L
 
L
L
 
K
P
 
A
R
 
R
-
 
D
-
 
E
-
 
L
V
 
I
R
 
D
A
 
Y
M
 
C
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
|
E
S
 
P
T
 
T
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
L
G
 
G
N
 
D
R
 
M
P
 
I
L
 
K
A
 
N
G
 
G
H
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
S
L
 
L
W
 
S
L
 
G
K
 
N
L
 
L
S
 
T
T
 
V
E
 
K
G
 
G
R
 
K
T
 
Q
A
 
G
H
 
H
G
 
I
A
 
A
A
 
Y
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
A
I
 
I
N
 
N
A
 
P
I
 
V
G
 
H
L
 
T
M
 
F
A
 
A
P
 
P
T
 
A
L
 
L
A
 
L
R
 
E
L
 
L
T
 
T

4pqaA Crystal structure of succinyl-diaminopimelate desuccinylase from neisseria meningitidis mc58 in complex with the inhibitor captopril (see paper)
32% identity, 55% coverage: 6:205/364 of query aligns to 3:216/375 of 4pqaA

query
sites
4pqaA
T
 
T
D
 
Q
V
 
S
V
 
L
A
 
E
L
 
L
T
 
A
R
 
K
A
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
S
F
 
R
D
 
P
T
 
S
I
 
V
N
 
T
P
 
P
P
 
D
G
 
D
R
 
R
E
 
D
A
 
C
P
 
-
A
 
-
M
 
Q
R
 
K
F
 
L
C
 
L
Q
 
A
E
 
E
L
 
R
L
 
L
E
 
H
R
 
K
A
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
C
 
A
R
 
E
L
 
E
I
 
L
D
 
H
H
 
F
G
 
G
K
 
-
D
 
D
R
 
T
A
 
K
S
 
N
L
 
I
I
 
W
A
 
L
V
 
R
R
 
R
G
 
G
P
 
T
G
 
K
G
 
A
G
 
P
L
 
V
-
 
V
C
 
C
F
 
F
S
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
P
A
 
V
-
 
E
P
 
K
W
 
W
S
 
D
R
 
S
E
 
P
A
 
P
H
 
F
G
 
E
G
 
P
A
 
A
V
 
E
E
 
R
G
 
D
D
 
G
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
G
 
T
G
 
S
V
 
I
A
 
A
A
 
C
F
 
F
L
 
V
V
 
T
A
 
A
A
 
C
A
 
E
R
 
R
S
 
F
G
 
V
A
 
A
P
 
K
-
 
H
-
 
P
-
 
N
-
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
S
V
 
I
T
 
A
V
 
L
L
 
L
L
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
D
E
|
E
E
|
E
-
 
G
T
 
D
G
 
A
C
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
T
R
 
T
W
 
K
L
 
V
A
 
V
E
 
D
A
 
V
G
 
-
L
 
L
L
 
K
P
 
A
R
 
R
-
 
D
-
 
E
-
 
L
V
 
I
R
 
D
A
 
Y
M
 
C
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
|
E
S
 
P
T
 
T
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
L
G
 
G
N
 
D
R
 
M
P
 
I
L
 
K
A
 
N
G
 
G
H
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
S
L
 
L
W
 
S
L
 
G
K
 
N
L
 
L
S
 
T
T
 
V
E
 
K
G
 
G
R
 
K
T
 
Q
A
 
G
H
 
H
G
 
I
A
 
A
A
 
Y
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
A
I
 
I
N
 
N
A
 
P
I
 
V
G
 
H
L
 
T
M
 
F
A
 
A
P
 
P
T
 
A
L
 
L
A
 
L
R
 
E
L
 
L
T
 
T

Sites not aligning to the query:

7lgpB Dape enzyme from shigella flexneri
30% identity, 63% coverage: 8:235/364 of query aligns to 7:247/377 of 7lgpB

query
sites
7lgpB
V
 
V
V
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
T
R
 
Q
A
 
Q
L
 
L
I
 
I
G
 
R
F
 
R
D
 
P
T
 
S
I
 
L
N
 
S
P
 
P
P
 
D
G
 
-
R
 
-
E
 
D
A
 
A
P
 
G
A
 
C
M
 
Q
R
 
A
F
 
L
C
 
L
Q
 
I
E
 
E
L
 
R
L
 
L
E
 
Q
R
 
A
A
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
T
C
 
V
R
 
E
L
 
R
I
 
M
D
 
D
H
 
F
G
 
A
K
 
-
D
 
D
R
 
T
A
 
Q
S
 
N
L
 
F
I
 
W
A
 
A
V
 
W
R
 
R
G
 
G
P
 
Q
G
 
G
G
 
E
G
 
T
L
 
L
C
 
A
F
 
F
S
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
P
G
 
G
R
 
D
A
 
A
P
 
D
-
 
R
W
 
W
S
 
I
R
 
N
E
 
P
A
 
P
H
 
F
G
 
E
G
 
P
A
 
T
V
 
I
E
 
R
G
 
D
D
 
G
R
 
M
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
G
 
G
G
 
S
V
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
M
L
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
E
R
 
R
S
 
F
G
 
V
A
 
A
P
 
Q
-
 
H
-
 
P
-
 
N
-
 
H
-
 
T
-
 
G
-
 
R
V
 
L
T
 
A
V
 
F
L
 
L
L
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
D
E
 
E
E
 
E
-
 
A
T
 
S
G
 
A
C
 
H
D
 
N
G
 
G
A
 
T
R
 
V
W
 
K
L
 
V
A
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
L
L
 
M
L
 
A
-
 
R
-
 
N
P
 
E
R
 
R
V
 
L
R
 
D
A
 
Y
M
 
C
I
 
L
V
 
V
G
 
G
E
|
E
S
 
P
T
 
S
-
 
S
-
 
I
-
 
E
-
 
V
-
 
V
G
 
G
N
 
D
R
 
V
P
 
V
L
 
K
A
 
N
G
 
G
H
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
S
L
 
L
W
 
T
L
 
C
K
 
N
L
 
L
S
 
T
T
 
I
E
 
H
G
 
G
R
 
V
T
 
Q
A
 
G
H
 
H
G
 
V
A
 
A
A
 
Y
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
A
I
 
D
N
 
N
A
 
P
I
 
V
G
 
H
L
 
R
M
 
A
A
 
A
P
 
P
T
 
F
L
 
L
A
 
N
R
 
E
L
 
L
T
 
V
G
 
A
W
 
I
Q
 
E
P
 
W
A
 
D
A
 
Q
H
 
G
H
 
N
P
 
E
R
 
F
M
 
F
G
 
P
R
 
A
A
 
T
T
 
S
A
 
M
N
 
Q
L
 
I
G
 
A
T
 
N
I
 
I
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
T
N
 
G
V
 
S
N
 
N
S
 
N
V
 
V

P44514 Succinyl-diaminopimelate desuccinylase; SDAP desuccinylase; N-succinyl-LL-2,6-diaminoheptanedioate amidohydrolase; EC 3.5.1.18 from Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) (see 3 papers)
29% identity, 66% coverage: 8:246/364 of query aligns to 5:258/377 of P44514

query
sites
P44514
V
 
V
V
 
V
A
 
S
L
 
L
T
 
A
R
 
Q
A
 
D
L
 
L
I
 
I
G
 
R
F
 
R
D
 
P
T
 
S
I
 
I
N
 
S
P
 
P
P
 
-
G
 
-
R
 
N
E
 
D
A
 
E
P
 
G
A
 
C
M
 
Q
R
 
Q
F
 
I
C
 
I
Q
 
A
E
 
E
L
 
R
L
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
C
 
I
R
 
E
L
 
W
I
 
M
D
 
P
H
 
F
G
 
N
K
 
-
D
 
D
R
 
T
A
 
L
S
 
N
L
 
L
I
 
W
A
 
A
V
 
K
R
 
H
G
 
G
P
 
T
G
 
S
G
 
E
G
 
P
-
 
V
L
 
I
C
 
A
F
 
F
S
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
T
G
 
G
-
 
D
R
 
E
A
 
N
P
 
Q
W
 
W
S
 
S
R
 
S
E
 
P
A
 
P
H
 
F
G
 
S
G
 
A
A
 
E
V
 
I
E
 
I
G
 
D
D
 
G
R
 
M
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
G
 
G
G
 
S
V
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
M
L
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
E
-
 
E
-
 
Y
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
N
-
 
P
R
 
N
S
 
H
G
 
K
A
 
G
P
 
T
V
 
I
T
 
A
V
 
L
L
 
L
L
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
D
E
|
E
E
|
E
-
 
A
T
 
T
G
 
A
C
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
T
R
 
I
W
 
H
L
 
V
A
 
V
E
 
E
A
 
T
G
 
L
L
 
M
L
 
A
-
 
R
-
 
D
P
 
E
R
 
K
V
 
I
R
 
T
A
 
Y
M
 
C
I
 
M
V
 
V
G
 
G
E
|
E
S
 
P
T
 
S
G
 
S
N
 
A
R
 
K
P
 
N
L
 
L
A
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
K
-
 
N
G
 
G
H
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
S
L
 
I
W
 
T
L
 
G
K
 
N
L
 
L
S
 
Y
T
 
I
E
 
Q
G
 
G
R
 
I
T
 
Q
A
 
G
H
 
H
G
 
V
A
 
A
A
 
Y
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
A
I
 
E
N
 
N
A
 
P
I
 
I
G
 
H
L
 
K
M
 
A
A
 
A
P
 
L
T
 
F
L
 
L
A
 
Q
R
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
T
W
 
Y
Q
 
Q
P
 
W
A
 
D
A
 
K
H
 
G
H
 
N
P
 
E
R
 
F
M
 
F
G
 
P
R
 
P
A
 
T
T
 
S
A
 
L
N
 
Q
L
 
I
G
 
A
T
 
N
I
 
I
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
T
N
 
G
V
 
S
N
 
N
S
 
N
V
 
V
-
 
I
P
 
P
D
 
A
L
 
E
C
 
L
E
 
Y
L
 
I
T
 
Q
V
 
F
D
 
N
L
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

5vo3A Crystal structure of dape in complex with the products (succinic acid and diaminopimelic acid) (see paper)
29% identity, 66% coverage: 8:246/364 of query aligns to 9:262/380 of 5vo3A

query
sites
5vo3A
V
 
V
V
 
V
A
 
S
L
 
L
T
 
A
R
 
Q
A
 
D
L
 
L
I
 
I
G
 
R
F
 
R
D
 
P
T
 
S
I
 
I
N
 
S
P
 
P
P
 
-
G
 
-
R
 
N
E
 
D
A
 
E
P
 
G
A
 
C
M
 
Q
R
 
Q
F
 
I
C
 
I
Q
 
A
E
 
E
L
 
R
L
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
C
 
I
R
 
E
L
 
W
I
 
M
D
 
P
H
 
F
G
 
N
K
 
-
D
 
D
R
 
T
A
 
L
S
 
N
L
 
L
I
 
W
A
 
A
V
 
K
R
 
H
G
 
G
P
 
T
G
 
S
G
 
E
G
 
P
-
 
V
L
 
I
C
 
A
F
 
F
S
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
T
G
 
G
-
 
D
R
 
E
A
 
N
P
 
Q
W
 
W
S
 
S
R
 
S
E
 
P
A
 
P
H
 
F
G
 
S
G
 
A
A
 
E
V
 
I
E
 
I
G
 
D
D
 
G
R
 
M
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
G
 
G
G
 
S
V
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
M
L
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
E
-
 
E
-
 
Y
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
N
-
 
P
R
 
N
S
 
H
G
 
K
A
 
G
P
 
T
V
 
I
T
 
A
V
 
L
L
 
L
L
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
D
E
|
E
E
|
E
-
x
A
T
 
T
G
 
A
C
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
T
R
 
I
W
 
H
L
 
V
A
 
V
E
 
E
A
 
T
G
 
L
L
 
M
L
 
A
-
 
R
-
 
D
P
 
E
R
 
K
V
 
I
R
 
T
A
 
Y
M
 
C
I
 
M
V
 
V
G
 
G
E
|
E
S
 
P
T
 
S
G
 
S
N
 
A
R
 
K
P
 
N
L
 
L
A
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
K
-
 
N
G
 
G
H
x
R
K
 
R
G
 
G
A
x
S
L
 
I
W
 
T
L
 
G
K
 
N
L
 
L
S
 
Y
T
 
I
E
 
Q
G
 
G
R
 
I
T
 
Q
A
 
G
H
 
H
G
 
V
A
 
A
A
 
Y
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
A
I
 
E
N
 
N
A
 
P
I
 
I
G
 
H
L
 
K
M
 
A
A
 
A
P
 
L
T
 
F
L
 
L
A
 
Q
R
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
T
W
 
Y
Q
 
Q
P
 
W
A
 
D
A
 
K
H
 
G
H
 
N
P
 
E
R
 
F
M
 
F
G
 
P
R
 
P
A
 
T
T
 
S
A
 
L
N
 
Q
L
 
I
G
 
A
T
 
N
I
 
I
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
T
N
 
G
V
 
S
N
 
N
S
 
N
V
 
V
-
 
I
P
 
P
D
 
A
L
 
E
C
 
L
E
 
Y
L
 
I
T
 
Q
V
 
F
D
 
N
L
 
L
R
|
R

Sites not aligning to the query:

P37111 Aminoacylase-1; ACY-1; N-acyl-L-amino-acid amidohydrolase; EC 3.5.1.14 from Sus scrofa (Pig) (see paper)
22% identity, 97% coverage: 9:362/364 of query aligns to 13:396/407 of P37111

query
sites
P37111
V
 
V
A
 
T
L
 
L
T
 
F
R
 
R
A
 
Q
L
 
Y
I
 
L
G
 
R
F
 
I
D
 
R
T
 
T
I
 
V
N
 
Q
P
 
P
P
 
E
G
 
P
R
 
D
E
 
Y
A
 
G
P
 
A
A
 
A
M
 
V
R
 
A
F
 
F
C
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
R
L
 
A
E
 
R
R
 
Q
A
 
L
G
 
G
F
 
L
A
 
G
C
 
C
R
 
Q
L
 
K
I
 
V
D
 
E
H
 
V
G
 
V
K
 
P
D
 
G
R
 
H
A
 
V
S
 
-
L
 
V
I
 
T
A
 
V
V
 
L
R
 
T
G
 
W
P
 
P
G
 
G
-
 
T
-
 
N
-
 
P
-
 
T
-
 
L
G
 
S
G
 
S
L
 
I
C
 
L
F
 
L
S
 
N
G
 
S
H
 
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
F
R
 
K
A
 
E
P
 
H
W
 
W
S
 
S
R
 
H
E
 
D
A
 
P
H
 
F
G
 
E
G
 
G
A
 
F
V
 
K
E
 
D
G
 
A
D
 
D
-
 
G
R
 
Y
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
Q
D
 
D
M
 
M
K
 
K
G
 
C
G
 
V
V
 
S
A
 
I
A
 
Q
F
 
Y
L
 
L
V
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
R
R
 
R
-
 
L
-
 
K
-
 
V
-
 
E
-
 
G
S
 
H
G
 
H
A
 
F
P
 
P
V
 
R
T
 
T
V
 
I
L
 
H
L
 
M
T
 
T
A
 
F
G
 
V
E
 
P
E
 
D
T
 
E
G
 
E
C
 
V
D
 
G
G
 
G
A
 
H
R
 
Q
W
 
G
L
 
M
A
 
E
E
 
L
A
 
F
G
 
V
L
 
K
L
 
R
P
 
P
R
 
E
V
 
F
R
 
Q
A
 
A
M
 
L
I
 
R
V
 
A
G
 
G
-
 
F
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
S
E
 
P
S
 
T
T
 
D
G
 
A
N
 
F
R
 
T
P
 
V
L
 
F
A
 
Y
G
 
S
H
 
E
K
 
R
G
 
S
A
 
P
L
 
W
W
 
W
L
 
L
K
 
R
L
 
V
S
 
T
T
 
S
E
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
P
A
 
G
H
 
H
G
 
G
A
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
E
A
 
K
P
 
L
H
 
H
L
 
K
G
 
V
I
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
I
-
 
L
G
 
A
L
 
F
M
 
R
A
 
E
P
 
K
T
 
E
L
 
K
A
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
Q
G
 
S
W
 
N
Q
 
Q
-
 
L
-
 
K
P
 
P
A
 
G
A
 
A
H
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
-
R
 
V
A
 
T
T
 
S
A
 
V
N
 
N
L
 
L
G
 
T
T
 
M
I
 
L
R
 
E
A
 
G
G
 
G
I
 
V
N
 
A
V
 
Y
N
 
N
S
 
V
V
 
V
P
 
P
D
 
A
L
 
T
C
 
M
E
 
S
L
 
A
T
 
C
V
 
F
D
 
D
L
 
F
R
 
R
S
 
V
V
 
A
E
 
P
G
 
D
V
 
V
D
 
D
H
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
F
A
 
E
A
 
E
E
 
Q
A
 
L
R
 
Q
G
 
S
L
 
W
C
 
C
D
 
Q
P
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
T
-
 
F
V
 
E
R
 
F
V
 
V
E
 
Q
T
 
K
L
 
W
L
 
M
D
 
E
L
 
T
P
 
Q
A
 
V
V
 
T
W
 
S
T
 
T
E
 
D
P
 
D
E
 
S
D
 
D
P
 
P
W
 
W
F
 
W
A
 
A
C
 
A
A
 
F
A
 
S
A
 
G
Q
 
V
V
 
F
R
 
K
A
 
D
V
 
M
T
 
K
G
 
L
P
 
A
A
 
L
E
 
E
G
 
L
P
 
E
D
 
I
C
 
C
A
 
P
T
 
A
Y
 
S
F
 
-
T
 
T
D
 
D
A
 
A
S
 
R
I
 
Y
L
 
I
K
 
R
P
 
-
A
 
A
M
 
A
G
 
G
D
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
-
M
 
-
I
 
-
L
 
L
G
 
G
P
 
F
G
 
S
S
 
P
V
 
M
D
 
N
Q
 
H
P
 
T
-
 
P
-
 
V
-
 
L
-
 
L
H
 
H
G
 
D
T
 
H
D
 
D
E
 
E
H
 
R
V
 
L
L
 
H
V
 
E
S
 
A
R
 
V
L
 
F
A
 
L
E
 
R
A
 
G
V
 
V
E
 
D
I
 
I
Y
 
Y
A
 
T
A
 
Q
L
 
L
I
 
L
A
 
S
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P06621 Carboxypeptidase G2; CPDG2; Folate hydrolase G2; Glutamate carboxypeptidase; Pteroylmonoglutamic acid hydrolase G2; Glucarpidase; EC 3.4.17.11 from Pseudomonas sp. (strain RS-16) (see paper)
31% identity, 54% coverage: 60:255/364 of query aligns to 99:297/415 of P06621

query
sites
P06621
V
 
I
R
 
K
G
 
G
P
 
R
G
 
G
G
 
G
-
 
K
G
 
N
L
 
L
C
 
L
F
 
L
S
 
M
G
 
S
H
|
H
L
 
M
D
 
D
T
 
T
V
 
V
P
 
Y
L
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
L
G
 
A
R
 
K
A
 
A
P
 
P
W
 
F
S
 
R
R
 
-
E
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
R
 
K
L
 
A
Y
 
Y
G
 
G
R
 
P
G
 
G
S
 
I
S
 
A
D
|
D
M
 
D
K
 
K
G
 
G
G
 
G
V
 
N
A
 
A
A
 
V
F
 
I
L
 
L
-
 
H
-
 
T
-
 
L
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
K
V
 
E
A
 
Y
A
 
G
A
 
V
R
 
R
S
 
D
G
 
Y
A
 
G
P
 
T
V
 
I
T
 
T
V
 
V
L
 
L
L
 
F
T
 
N
A
 
T
G
 
D
E
|
E
E
|
E
T
 
K
G
 
G
C
 
S
D
 
F
G
 
G
A
 
S
R
 
R
W
 
D
L
 
L
-
 
I
-
 
Q
A
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
K
L
 
L
L
 
A
P
 
D
R
 
Y
V
 
V
R
 
L
A
 
S
M
 
F
I
 
-
V
x
E
G
 
P
E
 
T
S
 
S
T
 
A
G
 
G
N
 
D
R
 
E
P
 
K
L
 
L
A
 
S
-
 
L
G
 
G
H
 
T
K
 
S
G
 
G
A
 
I
L
 
A
W
 
Y
L
 
V
K
 
Q
L
 
V
S
 
N
T
 
I
E
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
A
A
 
S
H
 
H
-
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
P
 
P
H
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
G
 
V
L
 
E
M
 
A
A
 
S
P
 
D
T
 
L
L
 
V
A
 
L
R
 
R
L
 
T
T
 
M
G
 
N
W
 
I
Q
 
D
P
 
D
A
 
K
A
 
A
H
 
K
H
 
N
P
 
L
R
 
R
M
 
F
G
 
N
R
 
W
A
 
T
T
 
I
A
 
A
N
 
K
L
 
A
G
 
G
T
 
N
I
 
V
R
 
S
A
 
-
G
 
-
I
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
N
S
 
I
V
 
I
P
 
P
D
 
A
L
 
S
C
 
A
E
 
T
L
 
L
T
 
N
V
 
A
D
 
D
L
 
V
R
 
R
S
 
Y
V
 
A
E
 
R
G
 
N
V
 
E
D
 
D
H
 
F
A
 
D
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1cg2A Carboxypeptidase g2 (see paper)
31% identity, 54% coverage: 60:255/364 of query aligns to 74:272/389 of 1cg2A

query
sites
1cg2A
V
 
I
R
 
K
G
 
G
P
 
R
G
 
G
G
 
G
-
 
K
G
 
N
L
 
L
C
 
L
F
 
L
S
 
M
G
 
S
H
|
H
L
 
M
D
 
D
T
 
T
V
 
V
P
 
Y
L
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
L
G
 
A
R
 
K
A
 
A
P
 
P
W
 
F
S
 
R
R
 
-
E
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
R
 
K
L
 
A
Y
 
Y
G
 
G
R
 
P
G
 
G
S
 
I
S
 
A
D
|
D
M
 
D
K
 
K
G
 
G
G
 
G
V
 
N
A
 
A
A
 
V
F
 
I
L
 
L
-
 
H
-
 
T
-
 
L
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
K
V
 
E
A
 
Y
A
 
G
A
 
V
R
 
R
S
 
D
G
 
Y
A
 
G
P
 
T
V
 
I
T
 
T
V
 
V
L
 
L
L
 
F
T
 
N
A
 
T
G
 
D
E
|
E
E
|
E
T
 
K
G
 
G
C
 
S
D
 
F
G
 
G
A
 
S
R
 
R
W
 
D
L
 
L
-
 
I
-
 
Q
A
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
K
L
 
L
L
 
A
P
 
D
R
 
Y
V
 
V
R
 
L
A
 
S
M
 
F
I
 
-
V
x
E
G
 
P
E
 
T
S
 
S
T
 
A
G
 
G
N
 
D
R
 
E
P
 
K
L
 
L
A
 
S
-
 
L
G
 
G
H
 
T
K
 
S
G
 
G
A
 
I
L
 
A
W
 
Y
L
 
V
K
 
Q
L
 
V
S
 
N
T
 
I
E
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
A
A
 
S
H
 
H
-
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
P
 
P
H
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
G
 
V
L
 
E
M
 
A
A
 
S
P
 
D
T
 
L
L
 
V
A
 
L
R
 
R
L
 
T
T
 
M
G
 
N
W
 
I
Q
 
D
P
 
D
A
 
K
A
 
A
H
 
K
H
 
N
P
 
L
R
 
R
M
 
F
G
 
N
R
 
W
A
 
T
T
 
I
A
 
A
N
 
K
L
 
A
G
 
G
T
 
N
I
 
V
R
 
S
A
 
-
G
 
-
I
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
N
S
 
I
V
 
I
P
 
P
D
 
A
L
 
S
C
 
A
E
 
T
L
 
L
T
 
N
V
 
A
D
 
D
L
 
V
R
 
R
S
 
Y
V
 
A
E
 
R
G
 
N
V
 
E
D
 
D
H
 
F
A
 
D
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7m6uB Crystal structure of a circular permutation and computationally designed pro-enzyme of carboxypeptidase g2 (see paper)
31% identity, 54% coverage: 60:255/364 of query aligns to 9:207/392 of 7m6uB

query
sites
7m6uB
V
 
I
R
 
K
G
 
G
P
 
R
G
 
G
G
 
G
-
 
K
G
 
N
L
 
L
C
 
L
F
 
L
S
 
M
G
 
S
H
|
H
L
 
M
D
 
D
T
 
T
V
 
V
P
 
Y
L
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
L
G
 
A
R
 
K
A
 
A
P
 
P
W
 
F
S
 
R
R
 
-
E
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
R
 
K
L
 
A
Y
 
Y
G
 
G
R
 
P
G
 
G
S
 
I
S
 
A
D
|
D
M
 
D
K
 
K
G
 
G
G
 
G
V
 
N
A
 
A
A
 
V
F
 
I
L
 
L
-
 
H
-
 
T
-
 
L
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
K
V
 
E
A
 
Y
A
 
G
A
 
V
R
 
R
S
 
D
G
 
Y
A
 
G
P
 
T
V
 
I
T
 
T
V
 
V
L
 
L
L
 
F
T
 
N
A
 
T
G
 
D
E
 
E
E
|
E
T
 
A
G
 
G
C
 
S
D
 
F
G
 
G
A
 
S
R
 
R
W
 
D
L
 
L
-
 
I
-
 
Q
A
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
K
L
 
L
L
 
A
P
 
D
R
 
Y
V
 
V
R
 
L
A
 
S
M
 
F
I
 
-
V
x
E
G
 
P
E
 
T
S
 
S
T
 
A
G
 
G
N
 
D
R
 
E
P
 
K
L
 
L
A
 
S
-
 
L
G
 
G
H
 
T
K
 
S
G
 
G
A
 
I
L
 
A
W
 
Y
L
 
V
K
 
Q
L
 
V
S
 
N
T
 
I
E
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
A
A
 
S
H
 
H
-
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
P
 
P
H
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
G
 
V
L
 
E
M
 
A
A
 
S
P
 
D
T
 
L
L
 
V
A
 
L
R
 
R
L
 
T
T
 
M
G
 
N
W
 
I
Q
 
D
P
 
D
A
 
K
A
 
A
H
 
K
H
 
N
P
 
L
R
 
R
M
 
F
G
 
N
R
 
W
A
 
T
T
 
I
A
 
A
N
 
K
L
 
A
G
 
G
T
 
N
I
 
V
R
 
S
A
 
-
G
 
-
I
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
N
S
 
I
V
 
I
P
 
P
D
 
A
L
 
S
C
 
A
E
 
T
L
 
L
T
 
N
V
 
A
D
 
D
L
 
V
R
 
R
S
 
Y
V
 
A
E
 
R
G
 
N
V
 
E
D
 
D
H
 
F
A
 
D
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3pfoA Crystal structure of a putative acetylornithine deacetylase (rpa2325) from rhodopseudomonas palustris cga009 at 1.90 a resolution
26% identity, 98% coverage: 5:361/364 of query aligns to 18:418/426 of 3pfoA

query
sites
3pfoA
L
 
F
T
 
N
D
 
D
V
 
Q
V
 
V
A
 
A
L
 
F
T
 
L
R
 
Q
A
 
R
L
 
M
I
 
V
G
 
Q
F
 
F
D
 
R
T
 
S
I
 
V
N
 
R
P
 
-
P
 
-
G
 
G
R
 
E
E
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
Q
M
 
Q
R
 
E
F
 
W
C
 
L
Q
 
A
E
 
Q
L
 
Q
L
 
F
E
 
A
R
 
D
A
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
K
C
 
V
R
 
D
-
 
T
-
 
F
-
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
D
L
 
I
I
 
A
D
 
S
H
 
H
G
 
P
K
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
M
-
 
D
-
 
T
-
 
I
D
 
D
R
 
P
A
 
A
S
 
G
L
 
S
I
 
M
A
 
Q
V
 
V
-
 
V
-
 
A
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
S
R
 
D
G
 
G
P
 
K
G
 
G
G
 
R
G
 
S
L
 
L
C
 
I
F
 
L
S
 
Q
G
 
G
H
|
H
L
 
I
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
E
G
 
G
R
 
P
A
 
V
P
 
D
-
 
L
W
 
W
S
 
S
R
 
D
E
 
P
A
 
P
H
 
Y
G
 
E
G
 
A
A
 
K
V
 
V
E
 
R
G
 
D
D
 
G
R
 
W
L
 
M
Y
 
I
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
Q
D
|
D
M
 
M
K
 
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
S
A
 
A
F
 
M
L
 
I
V
 
F
A
 
A
-
 
L
-
 
D
A
 
A
A
 
I
R
 
R
S
 
T
G
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
P
-
 
D
A
 
A
P
 
R
V
 
V
T
 
H
V
 
V
L
 
Q
L
 
T
T
 
V
A
 
T
G
 
E
E
 
E
E
|
E
T
 
S
G
 
T
C
 
G
D
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
L
W
 
S
L
 
T
A
 
L
E
 
M
A
 
R
G
 
G
L
 
Y
L
 
-
P
 
-
R
 
R
V
 
A
R
 
D
A
 
A
M
 
C
I
 
L
V
 
I
G
 
P
E
|
E
S
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
H
R
 
T
P
 
L
L
 
T
A
 
R
G
 
A
H
 
Q
K
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
V
W
 
W
L
 
F
K
 
R
L
 
L
S
 
R
T
 
V
E
 
R
G
 
G
R
 
T
T
 
P
A
 
V
H
 
H
G
 
V
A
 
A
A
 
Y
P
 
S
H
 
E
L
 
T
G
 
G
I
 
T
N
 
S
A
 
A
I
 
I
G
 
-
L
 
L
M
 
S
A
 
A
P
 
M
T
 
H
L
 
L
A
 
I
R
 
R
L
 
A
T
 
F
G
 
E
W
 
E
Q
 
Y
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
A
P
 
Q
A
 
A
A
 
V
H
 
R
H
 
D
P
 
P
R
 
W
M
 
F
G
 
G
R
 
Q
A
 
V
T
 
K
A
 
N
-
 
P
-
 
I
-
 
K
-
 
F
N
 
N
L
 
V
G
 
G
T
 
I
I
 
I
R
 
K
A
 
G
G
 
G
I
 
D
N
 
W
V
 
A
N
 
S
S
 
S
V
 
T
P
 
A
D
 
A
L
 
W
C
 
C
E
 
E
L
 
L
T
 
D
V
 
C
D
 
R
L
 
L
R
 
G
S
 
L
V
 
L
E
 
T
G
 
G
-
 
D
V
 
T
D
 
P
H
 
Q
A
 
E
A
 
A
L
 
M
A
 
R
A
 
G
E
 
I
A
 
E
R
 
K
G
 
C
L
 
L
C
 
A
D
 
D
P
 
A
A
 
Q
V
 
A
R
 
T
V
 
D
E
 
S
T
 
F
L
 
L
L
 
S
D
 
E
L
 
N
P
 
P
A
 
A
-
 
E
-
 
L
V
 
V
W
 
W
T
 
S
-
 
G
-
 
F
-
 
Q
-
 
A
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
V
-
 
C
E
 
E
P
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
-
W
 
-
F
 
-
A
 
V
C
 
L
A
 
T
A
 
A
A
 
A
Q
 
H
V
 
K
R
 
A
A
 
A
V
 
F
T
 
N
G
 
A
P
 
P
A
 
L
E
 
D
G
 
A
P
 
-
D
 
R
C
 
L
A
 
S
T
 
T
Y
 
A
F
 
V
T
 
N
D
 
D
A
 
T
S
 
R
I
 
Y
L
 
Y
K
 
S
P
 
V
A
 
D
M
 
Y
G
 
G
D
 
I
P
 
P
A
 
A
V
 
-
M
 
L
I
 
C
L
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
Y
S
 
G
V
 
-
D
 
Q
Q
 
G
P
 
P
H
|
H
G
 
A
T
 
F
D
 
D
E
 
E
H
 
R
V
 
I
L
 
D
V
 
L
S
 
E
R
 
S
L
 
L
A
 
R
E
 
K
A
 
T
V
 
T
E
 
L
I
 
S
Y
 
I
A
 
A
A
 
L
L
 
F
I
 
V
A
 
A

5k8pA Zn2+/tetrahedral intermediate-bound r289a 5-nitroanthranilate aminohydrolase (see paper)
28% identity, 62% coverage: 23:246/364 of query aligns to 30:297/421 of 5k8pA

query
sites
5k8pA
P
 
P
P
 
T
G
 
G
R
 
R
E
 
E
A
 
G
P
 
A
A
 
A
M
 
G
R
 
D
F
 
Y
C
 
V
Q
 
Y
E
 
E
L
 
W
L
 
M
E
 
A
R
 
R
A
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
G
C
 
P
R
 
E
L
 
R
I
 
V
D
 
G
H
 
V
G
 
F
K
 
D
D
 
D
R
 
R
A
 
F
S
 
N
L
 
V
I
 
V
A
 
G
-
 
R
V
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
A
-
 
S
L
 
L
C
 
S
F
 
F
S
 
N
G
 
S
H
|
H
L
 
L
D
 
D
T
 
T
V
x
I
P
 
-
L
 
M
G
 
A
R
 
R
A
 
E
P
 
D
W
 
T
S
 
A
R
 
R
E
 
F
A
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
N
-
 
D
-
 
R
-
 
I
-
 
Y
H
 
H
G
 
E
G
 
A
A
 
W
V
 
H
E
 
E
G
 
E
D
 
G
R
 
R
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Y
G
 
S
S
 
V
S
 
V
D
x
N
M
 
C
K
 
K
G
 
G
G
 
P
V
 
M
A
 
A
A
 
C
F
 
W
L
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
L
A
 
K
R
 
E
S
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
A
V
 
L
T
 
K
-
 
G
-
 
D
V
 
V
L
 
V
L
 
L
T
 
T
A
 
A
-
 
V
-
 
C
-
 
G
-
x
E
-
 
I
-
 
D
-
 
C
-
 
E
-
 
P
-
 
V
G
 
D
E
 
E
E
 
F
T
 
Q
G
 
G
C
 
H
D
 
D
-
 
Y
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
R
W
 
Y
L
 
A
A
 
I
E
 
S
A
 
H
G
 
G
L
 
A
L
 
I
P
 
S
R
 
D
V
 
Y
R
 
-
A
 
-
M
 
A
I
 
L
V
 
V
G
 
A
E
|
E
S
 
A
T
 
T
G
 
N
N
 
F
R
 
K
P
 
P
L
 
A
A
 
W
G
 
V
H
 
E
K
 
A
G
 
G
A
 
K
L
 
V
W
 
F
L
 
L
K
 
K
L
 
V
S
 
T
T
 
V
-
 
F
-
 
A
-
 
G
-
 
P
E
 
S
G
 
R
R
 
Y
T
 
T
A
 
P
H
 
Y
G
 
V
A
 
P
A
 
R
P
 
P
H
 
V
L
 
A
G
 
A
I
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
P
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
V
L
 
R
M
 
M
A
 
A
P
 
K
T
 
L
L
 
V
A
 
E
R
 
A
L
 
L
T
 
E
G
 
E
W
 
W
Q
 
A
P
 
D
A
 
-
A
 
N
H
 
Y
H
 
E
P
 
K
R
 
R
M
 
Y
G
 
T
R
 
R
A
 
E
-
 
Y
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
V
-
 
P
T
 
K
A
 
V
N
 
A
L
 
I
G
 
G
T
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
G
G
 
G
I
 
V
-
 
P
-
 
Y
N
 
K
V
 
I
N
 
Y
S
 
A
V
 
F
P
 
P
D
 
E
L
 
L
C
 
C
E
 
S
L
 
I
T
 
Y
V
 
M
D
 
D
L
 
I
R
 
R

Sites not aligning to the query:

5k8nA 5naa-bound 5-nitroanthranilate aminohydrolase (see paper)
28% identity, 62% coverage: 23:246/364 of query aligns to 29:296/420 of 5k8nA

query
sites
5k8nA
P
 
P
P
 
T
G
 
G
R
 
R
E
 
E
A
 
G
P
 
A
A
 
A
M
 
G
R
 
D
F
 
Y
C
 
V
Q
 
Y
E
 
E
L
 
W
L
 
M
E
 
A
R
 
R
A
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
G
C
 
P
R
 
E
L
 
R
I
 
V
D
 
G
H
 
V
G
 
F
K
 
D
D
 
D
R
 
R
A
 
F
S
 
N
L
 
V
I
 
V
A
 
G
-
 
R
V
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
A
-
 
S
L
 
L
C
 
S
F
 
F
S
 
N
G
 
S
H
 
H
L
 
L
D
 
D
T
 
T
V
x
I
P
 
-
L
 
M
G
 
A
R
 
R
A
 
E
P
 
D
W
 
T
S
 
A
R
 
R
E
 
F
A
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
N
-
 
D
-
 
R
-
 
I
-
 
Y
H
 
H
G
 
E
G
 
A
A
 
W
V
 
H
E
 
E
G
 
E
D
 
G
R
 
R
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Y
G
 
S
S
 
V
S
 
V
D
 
N
M
 
C
K
 
K
G
 
G
G
 
P
V
 
M
A
 
A
A
 
C
F
 
W
L
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
L
A
 
K
R
 
E
S
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
A
V
 
L
T
 
K
-
 
G
-
 
D
V
 
V
L
 
V
L
 
L
T
 
T
A
 
A
-
 
V
-
 
C
-
 
G
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
C
-
 
E
-
 
P
-
 
V
G
 
D
E
 
E
E
 
F
T
 
Q
G
 
G
C
 
H
D
 
D
-
 
Y
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
R
W
 
Y
L
 
A
A
 
I
E
 
S
A
 
H
G
 
G
L
 
A
L
 
I
P
 
S
R
 
D
V
 
Y
R
 
-
A
 
-
M
 
A
I
 
L
V
 
V
G
 
A
E
 
E
S
 
A
T
 
T
G
 
N
N
 
F
R
 
K
P
 
P
L
 
A
A
 
W
G
 
V
H
 
E
K
 
A
G
 
G
A
 
K
L
 
V
W
 
F
L
 
L
K
 
K
L
 
V
S
 
T
T
 
V
-
 
F
-
 
A
-
 
G
-
 
P
E
 
S
G
 
R
R
x
Y
T
 
T
A
 
P
H
 
Y
G
 
V
A
 
P
A
 
R
P
 
P
H
 
V
L
 
A
G
 
A
I
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
P
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
V
L
 
R
M
 
M
A
 
A
P
 
K
T
 
L
L
 
V
A
 
E
R
 
A
L
 
L
T
 
E
G
 
E
W
 
W
Q
 
A
P
 
D
A
 
-
A
 
N
H
 
Y
H
 
E
P
 
K
R
 
R
M
 
Y
G
 
T
R
 
R
A
 
E
-
 
Y
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
V
-
 
P
T
 
K
A
 
V
N
 
A
L
 
I
G
 
G
T
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
G
G
 
G
I
 
V
-
 
P
-
 
Y
N
 
K
V
 
I
N
x
Y
S
 
R
V
 
F
P
 
P
D
 
E
L
 
L
C
 
C
E
 
S
L
 
I
T
 
Y
V
 
M
D
 
D
L
 
I
R
 
R

Sites not aligning to the query:

5k8oB Mn2+/5nsa-bound 5-nitroanthranilate aminohydrolase (see paper)
28% identity, 62% coverage: 23:246/364 of query aligns to 34:301/425 of 5k8oB

query
sites
5k8oB
P
 
P
P
 
T
G
 
G
R
 
R
E
 
E
A
 
G
P
 
A
A
 
A
M
 
G
R
 
D
F
 
Y
C
 
V
Q
 
Y
E
 
E
L
 
W
L
 
M
E
 
A
R
 
R
A
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
G
C
 
P
R
 
E
L
 
R
I
 
V
D
 
G
H
 
V
G
 
F
K
 
D
D
 
D
R
 
R
A
 
F
S
 
N
L
 
V
I
 
V
A
 
G
-
 
R
V
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
A
-
 
S
L
 
L
C
 
S
F
 
F
S
 
N
G
 
S
H
|
H
L
 
L
D
 
D
T
 
T
V
x
I
P
 
-
L
 
M
G
 
A
R
 
R
A
 
E
P
 
D
W
 
T
S
 
A
R
 
R
E
 
F
A
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
N
-
 
D
-
 
R
-
 
I
-
 
Y
H
 
H
G
 
E
G
 
A
A
 
W
V
 
H
E
 
E
G
 
E
D
 
G
R
 
R
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Y
G
 
S
S
 
V
S
 
V
D
x
N
M
 
C
K
 
K
G
 
G
G
 
P
V
 
M
A
 
A
A
 
C
F
 
W
L
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
L
A
 
K
R
 
E
S
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
A
V
 
L
T
 
K
-
 
G
-
 
D
V
 
V
L
 
V
L
 
L
T
 
T
A
 
A
-
 
V
-
 
C
-
 
G
-
x
E
-
 
I
-
 
D
-
 
C
-
 
E
-
 
P
-
 
V
G
 
D
E
 
E
E
 
F
T
 
Q
G
 
G
C
 
H
D
 
D
-
 
Y
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
R
W
 
Y
L
 
A
A
 
I
E
 
S
A
 
H
G
 
G
L
 
A
L
 
I
P
 
S
R
 
D
V
 
Y
R
 
-
A
 
-
M
 
A
I
 
L
V
 
V
G
 
A
E
|
E
S
 
A
T
 
T
G
 
N
N
 
F
R
 
K
P
 
P
L
 
A
A
 
W
G
 
V
H
 
E
K
 
A
G
 
G
A
 
K
L
 
V
W
 
F
L
 
L
K
 
K
L
 
V
S
 
T
T
 
V
-
 
F
-
 
A
-
 
G
-
 
P
E
 
S
G
 
R
R
x
Y
T
 
T
A
 
P
H
 
Y
G
 
V
A
 
P
A
 
R
P
 
P
H
 
V
L
 
A
G
 
A
I
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
P
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
V
L
 
R
M
 
M
A
 
A
P
 
K
T
 
L
L
 
V
A
 
E
R
 
A
L
 
L
T
 
E
G
 
E
W
 
W
Q
 
A
P
 
D
A
 
-
A
 
N
H
 
Y
H
 
E
P
 
K
R
 
R
M
 
Y
G
 
T
R
 
R
A
 
E
-
 
Y
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
V
-
 
P
T
 
K
A
 
V
N
 
A
L
 
I
G
 
G
T
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
G
G
 
G
I
 
V
-
 
P
-
 
Y
N
 
K
V
 
I
N
x
Y
S
x
R
V
 
F
P
 
P
D
 
E
L
 
L
C
 
C
E
 
S
L
 
I
T
 
Y
V
 
M
D
 
D
L
 
I
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4h2kA Crystal structure of the catalytic domain of succinyl-diaminopimelate desuccinylase from haemophilus influenzae (see paper)
30% identity, 43% coverage: 8:164/364 of query aligns to 7:172/258 of 4h2kA

query
sites
4h2kA
V
 
V
V
 
V
A
 
S
L
 
L
T
 
A
R
 
Q
A
 
D
L
 
L
I
 
I
G
 
R
F
 
R
D
 
P
T
 
S
I
 
I
N
 
S
P
 
P
P
 
-
G
 
-
R
 
N
E
 
D
A
 
E
P
 
G
A
 
C
M
 
Q
R
 
Q
F
 
I
C
 
I
Q
 
A
E
 
E
L
 
R
L
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
C
 
I
R
 
E
L
 
W
I
 
M
D
 
P
H
 
F
G
 
N
K
 
-
D
 
D
R
 
T
A
 
L
S
 
N
L
 
L
I
 
W
A
 
A
V
 
K
R
 
H
G
 
G
P
 
T
G
 
S
G
 
E
-
 
P
G
 
V
L
 
I
C
 
A
F
 
F
S
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
T
G
 
G
-
 
D
R
 
E
A
 
N
P
 
Q
W
 
W
S
 
S
R
 
S
E
 
P
A
 
P
H
 
F
G
 
S
G
 
A
A
 
E
V
 
I
E
 
I
G
 
D
D
 
G
R
 
M
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
G
 
G
G
 
S
V
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
M
L
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
E
-
 
E
-
 
Y
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
N
-
 
P
R
 
N
S
 
H
G
 
K
A
 
G
P
 
T
V
 
I
T
 
A
V
 
L
L
 
L
L
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
D
E
 
E
E
|
E
-
 
A
T
 
T
G
 
A
C
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
T
R
 
I
W
 
H
L
 
V
A
 
V
E
 
E
A
 
T
G
 
L
L
 
M
L
 
A
-
 
R
-
 
D
P
 
E
R
 
K
V
 
I
R
 
T
A
 
Y
M
 
C
I
 
M
V
 
V
G
 
G
E
|
E
S
 
P
T
 
S
G
 
S
N
 
A
R
 
K
P
 
N
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5xoyA Crystal structure of lysk from thermus thermophilus in complex with lysine (see paper)
26% identity, 92% coverage: 22:355/364 of query aligns to 15:329/341 of 5xoyA

query
sites
5xoyA
N
 
S
P
 
P
P
 
S
G
 
G
R
 
K
E
 
E
A
 
R
P
 
L
A
 
V
M
 
A
R
 
E
F
 
Y
C
 
L
Q
 
A
E
 
E
L
 
G
L
 
M
E
 
Q
R
 
K
A
 
L
G
 
G
F
 
L
A
 
K
C
 
G
R
 
-
L
 
F
I
 
V
D
 
D
H
 
E
G
 
A
K
 
-
D
 
D
R
 
N
A
 
A
S
 
R
L
 
G
I
 
Q
A
 
V
V
 
G
R
 
E
G
 
G
P
 
P
G
 
V
G
 
Q
G
 
-
L
 
V
C
 
V
F
 
L
S
 
L
G
 
G
H
 
H
L
 
I
D
 
D
T
 
T
V
 
V
P
 
P
L
 
-
G
 
G
R
 
Q
A
 
I
P
 
P
W
 
V
S
 
R
R
 
-
E
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
L
E
 
E
G
 
G
D
 
G
R
 
R
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
V
D
 
D
M
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
P
V
 
F
A
 
V
A
 
A
F
 
M
L
 
I
V
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
S
-
 
E
R
 
E
S
 
A
G
 
R
A
 
K
P
 
R
V
 
L
T
 
T
V
 
V
L
 
H
L
 
L
-
 
V
-
 
G
-
 
A
T
 
T
A
 
E
G
x
E
E
 
E
E
 
A
T
 
P
G
 
S
C
x
S
D
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
R
W
 
F
L
 
V
A
 
A
E
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
P
R
 
R
V
 
L
R
 
K
A
 
P
M
 
H
-
 
Y
-
 
A
I
 
V
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
P
T
 
S
G
 
G
N
 
W
R
 
E
P
 
G
L
 
I
A
 
T
-
 
L
G
 
G
H
 
Y
K
 
K
G
 
G
A
 
R
L
 
L
W
 
L
L
 
V
K
 
K
L
 
A
S
 
R
T
 
R
E
 
E
G
 
K
R
 
D
T
 
H
A
 
E
H
 
P
G
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
H
 
E
L
 
L
G
 
I
I
 
S
N
 
Y
A
 
F
I
 
V
G
 
A
L
 
I
M
 
K
A
 
A
P
 
W
T
 
A
L
 
E
A
 
A
R
 
M
L
 
N
T
 
V
G
 
G
W
 
Q
Q
 
R
P
 
P
A
 
-
A
 
-
H
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
M
 
F
G
 
D
R
 
Q
A
 
V
T
 
Q
A
 
Y
N
 
T
L
 
L
G
 
R
T
 
D
I
 
F
R
 
R
A
 
V
G
 
H
I
 
P
N
 
R
V
 
-
N
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
Q
L
 
V
C
 
A
E
 
E
L
 
M
T
 
F
V
 
F
D
 
D
L
 
L
R
|
R
S
 
L
V
 
P
E
 
P
G
 
R
V
 
L
D
 
P
H
 
P
A
 
E
A
 
E
L
 
A
A
 
I
A
 
R
E
 
H
A
 
L
R
 
T
G
 
A
L
 
Y
C
 
A
D
 
P
P
 
P
A
 
T
V
 
I
R
 
E
V
 
L
E
 
E
T
 
F
L
 
F
-
 
G
L
 
R
D
 
E
L
 
V
P
 
P
A
 
-
V
 
-
W
 
Y
T
 
Q
E
 
G
P
 
P
E
 
K
D
 
D
P
 
T
W
 
P
F
 
L
A
 
T
C
 
R
A
 
A
A
 
F
A
 
R
Q
 
Q
V
 
A
R
 
I
A
 
R
V
 
K
T
 
A
G
 
G
P
 
G
A
 
R
E
 
P
G
 
V
P
 
F
D
 
K
C
 
L
A
 
K
T
 
T
Y
 
G
F
x
T
T
 
S
D
 
D
A
 
M
S
 
N
I
 
V
L
 
L
K
 
A
P
 
P
A
 
H
M
 
W
G
 
P
D
 
V
P
 
P
A
 
M
V
 
V
M
 
A
I
 
-
L
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
D
V
 
S
D
 
T
Q
 
L
P
 
D
H
 
H
G
 
T
T
 
P
D
 
Y
E
 
E
H
 
H
V
 
V
L
 
E
V
 
V
S
 
A
R
 
E
L
 
F
A
 
L
E
 
K
A
 
G
V
 
I
E
 
E
I
 
V

Query Sequence

>WP_011842358.1 NCBI__GCF_000015985.1:WP_011842358.1
MTDLLTDVVALTRALIGFDTINPPGREAPAMRFCQELLERAGFACRLIDHGKDRASLIAV
RGPGGGLCFSGHLDTVPLGRAPWSREAHGGAVEGDRLYGRGSSDMKGGVAAFLVAAARSG
APVTVLLTAGEETGCDGARWLAEAGLLPRVRAMIVGESTGNRPLAGHKGALWLKLSTEGR
TAHGAAPHLGINAIGLMAPTLARLTGWQPAAHHPRMGRATANLGTIRAGINVNSVPDLCE
LTVDLRSVEGVDHAALAAEARGLCDPAVRVETLLDLPAVWTEPEDPWFACAAAQVRAVTG
PAEGPDCATYFTDASILKPAMGDPAVMILGPGSVDQPHGTDEHVLVSRLAEAVEIYAALI
AAGG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory