SitesBLAST

SitesBLAST – Find functional sites

SitesBLAST

Comparing WP_011869271.1 NCBI__GCF_000016125.1:WP_011869271.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5jrhA Crystal structure of salmonella enterica acetyl-coa synthetase (acs) in complex with camp and coenzyme a (see paper)
48% identity, 97% coverage: 11:629/636 of query aligns to 18:637/640 of 5jrhA

query
sites
5jrhA

E

E

K

Q

Y

Y

S

E

E

T

M

K

Q

Y

Q

K

K

Q

A

S

L

I

E

N

D

D

P

P

E

D

K

T

F

F

W

W

G

G

E

E

Q

Q

A

G

K

K

C

I

L

L

E

D

W

W

D

I

K

T

T

P

W

Y

D

Q

N

K

V

V

L

K

E

-

W

-

N

N

P

T

P

S

Y

F

A

A

-

P

-

G

-

N

-

V

-

S

-

I

K

K

W

W

F

Y

K

E

S

D

G

G

S

T

L

L

N

N

A

L

S

A

Y

A

N

N

C

C

V

L

D

D

R

R

H

H

I

L

K

Q

G

E

N

N

R

G

R

-

N

D

K

R

A

T

A

A

I

I

I

I

C
x
W

E

E

K

G

E

D

D

D

G

T

S

S

-

Q

C

S

G

K

I

H

L

I

T

S

Y

Y

Y

R

E

E

L

L

Y

H

R

R

E

D

I

V

N

C

K

R

F

F

A

A

N

N

V

T

L

L

E

L

N

D

L

L

G

G

V

I

E

K

K

K

G

G

D

D

V

V

V

V

T

A

I

I

Y

Y

M

M

P

P

M

M

M

V

T

P

E
|
E

A

A

I

A

I

V

A

A

M

M

L

L

A

A

C

C

S

A

R

R

I

I

G

G

V

A

I

V

H

H

N

S

V

V

V

I

F
|
F

S
x
G

G
|
G

F

F

S

S

S

P

D

E

A

A

L

V

A

A

D
x
G

R

R

I

I

N

I

D

D

S

S

K

S

S

S

K

R

I

L

L

V

V

I

T

T

T

A

N

D

L

E

L

G

Y

V

R
|
R

R

A

G

G

K

R

E

S

I

I

E

P

L

L

K

K

K

K

I

N

L

V

D

D

K

D

A

A

L

L

L

K

N

N

C

P

N

N

-

V

-

T

S

S

I

V

K

E

H

H

V

V

V

I

Y

V

V

L

K

K

R

R

G

T

I

G

E

S

E

D

F

I

N

D

L

W

V

Q

S

E

G

G

K

R

E

D

Y

L

F

W

W

W

D

R

E

D

L

L

M

I

G

E

G

K

A

A

K

S

S

P

Y

E

V

H

E

Q

P

P

V

E

P

A

V

M

E

N

S

A

D

E

H

D

P

P

L

L

F

F

I

I

L

L

Y

Y

T
|
T

S

S

G

G

T

S

T

T

G

G

S
x
K

P
|
P

K

K

G

G

V

V

V

L

H

H

S

T

T

T

G

G

G

G

Y

Y

L

L

T

V

Y

Y

A

A

T

A

K

T

T

T

M

F

D

K

W

Y

T

V

W

F

G

D

L

Y

N

H

E

P

M

G

D

D

V

I

F

Y

W

W

C

C

T

T

A

A

D

D

I

V

G

G

W

W

I

V

T

T

G

G

H

H

T

S

Y

Y

V

L

V

L

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

A

L

C

G

G

A

A

T

T

I

T

V

L

L

M

Y

F

E

E

G

G

A

V

I

P

D

N

Y

W

P

P

E

T

P

P

D

A

R

R

L

M

W

C

G

Q

I

V

V

V

E

D

N

K

H

H

G

Q

V

V

T

N

L

I

L

L

Y

Y

T

T

A

A

P

P

T

T

A

A

I

I

R

R

M

A

L

L

M

M

M

A

Y

E

G

G

E

D

K

K

W

A

V

I

N

E

T

G

H

T

D

D

L

R

S

S

T

S

L

L

R

R

L

I

L

L

G

G

S

S

V

V

G
|
G

E
|
E

P
|
P

I

I

N

N

P

P

R

E

A

A

W

W

K

E

W

W

Y

Y

Y

W

K

K

V

K

I

I

G

G

K

K

E

E

K

K

C

C

P

P

I

V

C

V

D

D

C
x
T

Y
x
W

W
|
W

Q
|
Q

T
|
T

E
|
E

T

T

G

G

G

G

H

F

M

M

I

I

Y

T

P

P

A

L

I

P

G

G

I

-

Q

-

S

A

V

I

P

E

L

L

K

K

P

A

G

G

S

S

A

A

T

T

F

R

P

P

G

F

I

F

G

G

I

V

D

Q

V

P

D

A

V

L

V

V

D

D

N

N

E

E

G

G

N

H

P

P

V

Q

E

E

A

G

N

A

I

T

K

E

G

G

N

N

L

L

I

V

I

I

K

T

R

D

P

S

W

W

P

P

G

G

M

Q

L

A

A

R

G

T

L

L

W

F

N

G

N

D

D

H

E

E

R

R

Y

F

R

E

A

Q

A

T

Y

Y

W

F

D

S

R

T

F

F

K

K

N

N

N

M

F

Y

S

F

T

S

S

G

D
|
D

Y

G

A

A

I

R

K

R

D

D

Q

E

D

D

G

G

Y

Y

I

Y

W

W

V
x
I

L

T

G

G

R

R

S

V

D

D

E

D

V

V

L

L

N
|
N

V

V

S
|
S

G

G

H

H

R
|
R

I

L

G

G

T

T

A

A

E

E

L

I

E

E

H

S

E

A

L

L

V
|
V

S

A

N
x
H

K

P

M

K

V
x
I

A

A

E

E

S

A

A

A

V

V

V

V

G

G

K

I

P

P

D

H

D

A

V

I

K

K

G

G

E

Q

V

A

P

I

V

Y

A

A

F

Y

V

V

I

T

L

L

N

N

E

-

R

-

Y

H

R

G

E

E

L

E

P

P

S

S

N

P

E

E

V

L

K

Y

A

A

T

E

L

V

I

R

R

N

H

W

I

V

R
|
R

D

K

T

E

V

I

G

G

P
|
P

I

L

G

A

T

T

P

P

A

D

M

V

I

L

F

H

F

W

V

T

N

D

K

S

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K
|
K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

I

L

L

K

R

K

K

L

I

I

A

I

A

G

G

E

-

E

D

I

L

G

G

D

D

V

T

T

S

T

T

L

L

E

A

D

D

N

P

T

G

S

V

L

V

E

E

D

K

V

L

K

L

K

E

E

E

active site: T260 (= T247), T412 (= T399), E413 (= E400), N517 (= N506), R522 (= R511), K605 (= K596)
binding (r,r)-2,3-butanediol: W93 (≠ C83), E140 (= E129), G169 (≠ D158), K266 (≠ S253), P267 (= P254)
binding adenosine-3',5'-cyclic-monophosphate: G383 (= G370), E384 (= E371), P385 (= P372), T408 (≠ C395), W409 (≠ Y396), W410 (= W397), Q411 (= Q398), T412 (= T399), D496 (= D485), I508 (≠ V497), N517 (= N506), R522 (= R511)
binding coenzyme a: F159 (= F148), G160 (≠ S149), G161 (= G150), R187 (= R176), S519 (= S508), R580 (= R571), P585 (= P576)
binding magnesium ion: V533 (= V522), H535 (≠ N524), I538 (≠ V527)

Q8ZKF6 Acetyl-coenzyme A synthetase; AcCoA synthetase; Acs; Acetate--CoA ligase; Acyl-activating enzyme; EC 6.2.1.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 4 papers)
47% identity, 97% coverage: 11:629/636 of query aligns to 22:644/652 of Q8ZKF6

query
sites
Q8ZKF6

E

E

K

Q

Y

Y

S

E

E

T

M

K

Q

Y

Q

K

K

Q

A

S

L

I

E

N

D

D

P

P

E

D

K

T

F

F

W

W

G

G

E

E

Q

Q

A

G

K

K

C

I

L

L

E

D

W

W

D

I

K

T

T

P

W

Y

D

Q

N

K

V

V

L

K

E

-

W

-

N

N

P

T

P

S

Y

F

A

A

-

P

-

G

-

N

-

V

-

S

-

I

K

K

W

W

F

Y

K

E

S

D

G

G

S

T

L

L

N

N

A

L

S

A

Y

A

N

N

C

C

V

L

D

D

R

R

H

H

I

L

K

Q

G

E

N

N

R

G

R

-

N

D

K

R

A

T

A

A

I

I

I

I

C

W

E

E

K

G

E

D

D

D

G

T

S

S

-

Q

C

S

G

K

I

H

L

I

T

S

Y

Y

Y

R

E

E

L

L

Y

H

R

R

E

D

I

V

N

C

K

R

F

F

A

A

N

N

V

T

L

L

E

L

N

D

L

L

G

G

V

I

E

K

K

K

G

G

D

D

V

V

V

V

T

A

I

I

Y

Y

M

M

P

P

M

M

M

V

T

P

E

E

A

A

I

A

I

V

A

A

M

M

L

L

A

A

C

C

S

A

R

R

I

I

G

G

V

A

I

V

H

H

N

S

V

V

V

I

F

F

S

G

G

G

F

F

S

S

S

P

D

E

A

A

L

V

A

A

D

G

R

R

I

I

N

I

D

D

S

S

K

S

S

S

K

R

I

L

L

V

V

I

T

T

T

A

N

D

L

E

L

G

Y

V

R

R

R

A

G

G

K
x
R

E

S

I

I

E

P

L

L

K

K

K

K

I

N

L

V

D

D

K

D

A

A

L

L

L

K

N

N

C

P

N

N

-

V

-

T

S

S

I

V

K

E

H

H

V

V

V

I

Y

V

V

L

K

K

R

R

G

T

I

G

E

S

E

D

F

I

N

D

L

W

V

Q

S

E

G

G

K

R

E

D

Y

L

F

W

W

W

D

R

E

D

L

L

M

I

G

E

G

K

A

A

K

S

S

P

Y

E

V

H

E

Q

P

P

V

E

P

A

V

M

E

N

S

A

D

E

H

D

P

P

L

L

F

F

I

I

L

L

Y

Y

T

T

S

S

G

G

T

S

T

T

G

G

S

K

P

P

K

K

G

G

V

V

V

L

H

H

S

T

T

T

G

G

G

G

Y

Y

L

L

T

V

Y

Y

A

A

T

A

K

T

T

T

M

F

D

K

W

Y

T

V

W

F

G

D

L

Y

N

H

E

P

M

G

D

D

V

I

F

Y

W

W

C

C

T

T

A

A

D

D

I

V

G

G

W

W

I

V

T
|
T

G

G

H

H

T

S

Y

Y

V

L

V

L

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

A

L

C

G

G

A

A

T

T

I

T

V

L

L

M

Y

F

E

E

G

G

A

V

I

P

D
x
N

Y

W

P

P

E

T

P

P

D

A

R

R

L

M

W

C

G

Q

I

V

V

V

E

D

N

K

H

H

G

Q

V

V

T

N

L

I

L

L

Y

Y

T

T

A
|
A

P

P

T

T

A

A

I

I

R

R

M

A

L

L

M

M

M

A

Y

E

G

G

E

D

K

K

W

A

V

I

N

E

T

G

H

T

D

D

L

R

S

S

T

S

L

L

R

R

L

I

L

L

G

G

S

S

V

V

G

G

E

E

P

P

I

I

N

N

P

P

R

E

A

A

W

W

K

E

W

W

Y

Y

Y

W

K

K

V

K

I

I

G

G

K

K

E

E

K

K

C

C

P

P

I

V

C

V

D

D

C

T

Y

W

W

W

Q

Q

T

T

E

E

T

T

G

G

G

G

H

F

M

M

I

I

Y

T

P

P

A

L

I

P

G

G

I

-

Q

-

S

A

V

I

P

E

L

L

K

K

P

A

G

G

S

S

A

A

T

T

F

R

P

P

G

F

I

F

G

G

I

V

D

Q

V

P

D

A

V

L

V

V

D

D

N

N

E

E

G

G

N

H

P

P

V

Q

E

E

A

G

N

A

I

T

K

E

G

G

N

N

L

L

I

V

I

I

K

T

R

D

P

S

W

W

P

P

G

G

M

Q

L

A

A

R

G

T

L

L

W

F

N

G

N

D

D

H

E

E

R

R

Y

F

R

E

A

Q

A

T

Y

Y

W

F

D

S

R

T

F

F

K

K

N

N

N

M

F

Y

S

F

T

S

S

G

D

D

Y

G

A

A

I

R

K

R

D

D

Q

E

D

D

G

G

Y

Y

I

Y

W

W

V

I

L

T

G

G

R

R

S

V

D
|
D

E

D

V

V

L

L

N

N

V

V

S
|
S

G
|
G

H

H

R
|
R

I

L

G

G

T

T

A

A

E

E

L

I

E

E

H

S

E

A

L

L

V

V

S

A

N

H

K

P

M

K

V

I

A

A

E

E

S

A

A

A

V

V

V

V

G

G

K

I

P

P

D

H

D

A

V

I

K

K

G

G

E

Q

V

A

P

I

V

Y

A

A

F

Y

V

V

I

T

L

L

N

N

E

-

R

-

Y

H

R

G

E

E

L

E

P

P

S

S

N

P

E

E

V

L

K

Y

A

A

T

E

L

V

I

R

R

N

H

W

I

V

R
|
R

D

K

T

E

V

I

G

G

P

P

I

L

G

A

T

T

P

P

A

D

M

V

I

L

F

H

F

W

V

T

N

D

K

S

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K
|
K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

I

L

L

K

R

K

K

L

I

I

A

I

A

G

G

E

D

-

T

-

S

E

N

I

L

G

G

D

D

V

T

T

S

T

T

L

L

E

A

D

D

N

P

T

G

S

V

L

V

E

E

D

K

V

L

K

L

K

E

E

E

R194 (≠ K179) mutation to A: Results in a 2-fold reduction in the catalytic efficiency for both ATP and CoA. 2-fold increase in the affinity for ATP and 3-fold reduction for CoA.; mutation to E: Results in a 2-fold reduction in the catalytic efficiency for both ATP and CoA. 2-fold increase in the affinity for ATP and 2-fold reduction for CoA.
T311 (= T294) binding CoA
N335 (≠ D318) binding CoA
A357 (= A340) mutation to V: Results in a 2-fold reduction in the catalytic efficiency for both ATP and CoA. 3-fold increase in the affinity for ATP and 3-fold reduction for CoA.
D517 (= D502) mutation to G: Results in a 2-fold reduction in the catalytic efficiency for both ATP and CoA. 2-fold increase in the affinity for ATP and 10-fold reduction for CoA.; mutation to P: Results in a 2-fold reduction in the catalytic efficiency for both ATP and CoA. 3-fold reduction in the affinity for ATP and 4.5-fold reduction for CoA.
S523 (= S508) binding CoA
G524 (= G509) mutation to L: No acetyl-coenzyme A synthetase activity.; mutation to S: Results in a 2-fold reduction in the catalytic efficiency for both ATP and CoA. Almost the same affinity as the wild-type for ATP, but 9-fold reduction in the affinity for CoA.
R526 (= R511) mutation to A: Results in a 2-fold reduction in the catalytic efficiency for both ATP and CoA. 3-fold increase in the affinity for ATP and 4-fold reduction for CoA.
R584 (= R571) binding CoA; mutation to A: Results in a 2-fold reduction in the catalytic efficiency for both ATP and CoA. 2-fold increase in the affinity for ATP and 7-fold reduction for CoA.; mutation to E: Results in a 2-fold reduction in the catalytic efficiency for both ATP and CoA. 3-fold increase in the affinity for ATP and 8-fold reduction for CoA.
K609 (= K596) modified: N6-acetyllysine; by Pat; mutation to A: No acetyl-coenzyme A synthetase activity.

2p20A Acetyl-coa synthetase, r584a mutation (see paper)
47% identity, 97% coverage: 11:629/636 of query aligns to 18:638/641 of 2p20A

query
sites
2p20A

E

E

K

Q

Y

Y

S

E

E

T

M

K

Q

Y

Q

K

K

Q

A

S

L

I

E

N

D

D

P

P

E

D

K

T

F

F

W

W

G

G

E

E

Q

Q

A

G

K

K

C

I

L

L

E

D

W

W

D

I

K

T

T

P

W

Y

D

Q

N

K

V

V

L

K

E

-

W

-

N

N

P

T

P

S

Y

F

A

A

-

P

-

G

-

N

-

V

-

S

-

I

K

K

W

W

F

Y

K

E

S

D

G

G

S

T

L

L

N

N

A

L

S

A

Y

A

N

N

C

C

V

L

D

D

R

R

H

H

I

L

K

Q

G

E

N

N

R

G

R

-

N

D

K

R

A

T

A

A

I

I

I

I

C

W

E

E

K

G

E

D

D

D

G

T

S

S

-

Q

C

S

G

K

I

H

L

I

T

S

Y

Y

Y

R

E

E

L

L

Y

H

R

R

E

D

I

V

N

C

K

R

F

F

A

A

N

N

V

T

L

L

E

L

N

D

L

L

G

G

V

I

E

K

K

K

G

G

D

D

V

V

V

V

T

A

I

I

Y

Y

M

M

P

P

M

M

M

V

T

P

E

E

A

A

I

A

I

V

A

A

M

M

L

L

A

A

C

C

S

A

R

R

I

I

G

G

V

A

I

V

H

H

N

S

V

V

V

I

F

F

S

G

G

G

F

F

S

S

S

P

D

E

A

A

L

V

A

A

D

G

R

R

I

I

N

I

D

D

S

S

K

S

S

S

K

R

I

L

L

V

V

I

T

T

T

A

N

D

L

E

L

G

Y

V

R

R

R

A

G

G

K

R

E

S

I

I

E

P

L

L

K

K

K

K

I

N

L

V

D

D

K

D

A

A

L

L

L

K

N

N

C

P

N

N

-

V

-

T

S

S

I

V

K

E

H

H

V

V

V

I

Y

V

V

L

K

K

R

R

G

T

I

G

E

S

E

D

F

I

N

D

L

W

V

Q

S

E

G

G

K

R

E

D

Y

L

F

W

W

W

D

R

E

D

L

L

M

I

G

E

G

K

A

A

K

S

S

P

Y

E

V

H

E

Q

P

P

V

E

P

A

V

M

E

N

S

A

D

E

H

D

P

P

L

L

F

F

I

I

L

L

Y

Y

T
|
T

S

S

G

G

T

S

T

T

G

G

S

K

P

P

K

K

G

G

V

V

V

L

H

H

S

T

T

T

G

G

G

G

Y

Y

L

L

T

V

Y

Y

A

A

T

A

K

T

T

T

M

F

D

K

W

Y

T

V

W

F

G

D

L

Y

N

H

E

P

M

G

D

D

V

I

F

Y

W

W

C

C

T

T

A

A

D

D

I

V

G

G

W

W

I

V

T

T

G

G

H

H

T

S

Y

Y

V

L

V

L

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

A

L

C

G

G

A

A

T

T

I

T

V

L

L

M

Y

F

E

E

G

G

A

V

I

P

D

N

Y

W

P

P

E

T

P

P

D

A

R

R

L

M

W

C

G

Q

I

V

V

V

E

D

N

K

H

H

G

Q

V

V

T

N

L

I

L

L

Y

Y

T

T

A

A

P

P

T

T

A

A

I

I

R

R

M

A

L

L

M

M

M

A

Y

E

G

G

E

D

K

K

W

A

V

I

N

E

T

G

H

T

D

D

L

R

S

S

T

S

L

L

R

R

L

I

L

L

G

G

S

S

V

V

G
|
G

E
|
E

P
|
P

I

I

N

N

P

P

R

E

A

A

W

W

K

E

W

W

Y

Y

Y

W

K

K

V

K

I

I

G

G

K

K

E

E

K

K

C

C

P

P

I

V

C

V

D

D

C
x
T

Y
x
W

W
|
W

Q
|
Q

T
|
T

E
|
E

T

T

G

G

G

G

H

F

M

M

I

I

Y

T

P

P

A

L

I

P

G

G

I

-

Q

-

S

A

V

I

P

E

L

L

K

K

P

A

G

G

S

S

A

A

T

T

F

R

P

P

G

F

I

F

G

G

I

V

D

Q

V

P

D

A

V

L

V

V

D

D

N

N

E

E

G

G

N

H

P

P

V

Q

E

E

A

G

N

A

I

T

K

E

G

G

N

N

L

L

I

V

I

I

K

T

R

D

P

S

W

W

P

P

G

G

M

Q

L

A

A

R

G

T

L

L

W

F

N

G

N

D

D

H

E

E

R

R

Y

F

R

E

A

Q

A

T

Y

Y

W

F

D

S

R

T

F

F

K

K

N

N

N

M

F

Y

S

F

T

S

S

G

D
|
D

Y

G

A

A

I

R

K

R

D

D

Q

E

D

D

G

G

Y

Y

I

Y

W

W

V
x
I

L

T

G

G

R
|
R

S

V

D

D

E

D

V

V

L

L

N
|
N

V

V

S

S

G

G

H

H

R
|
R

I

L

G

G

T

T

A

A

E

E

L

I

E

E

H

S

E

A

L

L

V

V

S

A

N

H

K

P

M

K

V

I

A

A

E

E

S

A

A

A

V

V

V

V

G

G

K

I

P

P

D

H

D

A

V

I

K

K

G

G

E

Q

V

A

P

I

V

Y

A

A

F

Y

V

V

I

T

L

L

N

N

E

-

R

-

Y

H

R

G

E

E

L

E

P

P

S

S

N

P

E

E

V

L

K

Y

A

A

T

E

L

V

I

R

R

N

H

W

I

V

R

A

D

K

T

E

V

I

G

G

P

P

I

L

G

A

T

T

P

P

A

D

M

V

I

L

F

H

F

W

V

T

N

D

K

S

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K
|
K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

I

L

L

K

R

K

K

L

I

I

A

I

A

G

G

E

D

E

T

I

S

G

N

D

D

V

T

T

S

T

T

L

L

E

A

D

D

N

P

T

G

S

V

L

V

E

E

D

K

V

L

K

L

K

E

E

E

active site: T260 (= T247), T412 (= T399), E413 (= E400), N517 (= N506), R522 (= R511), K605 (= K596)
binding adenosine-5'-monophosphate-propyl ester: G383 (= G370), E384 (= E371), P385 (= P372), T408 (≠ C395), W409 (≠ Y396), W410 (= W397), Q411 (= Q398), T412 (= T399), D496 (= D485), I508 (≠ V497), R511 (= R500), R522 (= R511)

P27550 Acetyl-coenzyme A synthetase; AcCoA synthetase; Acs; Acetate--CoA ligase; Acyl-activating enzyme; EC 6.2.1.1 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
47% identity, 97% coverage: 11:629/636 of query aligns to 22:644/652 of P27550

query
sites
P27550

E

Q

K

Q

Y

Y

S

E

E

A

M

M

Q

Y

Q

Q

K

Q

A

S

L

I

E

N

D

V

P

P

E

D

K

T

F

F

W

W

G

G

E

E

Q

Q

A

G

K

K

C

I

L

L

E

D

W

W

D

I

K

K

T

P

W

Y

D

Q

N

K

V

V

L

K

E

-

W

-

N

N

P

T

P

S

Y

F

A

A

-

P

-

G

-

N

-

V

-

S

-

I

K

K

W

W

F

Y

K

E

S

D

G

G

S

T

L

L

N

N

A

L

S

A

Y

A

N

N

C

C

V

L

D

D

R

R

H

H

I

L

K

Q

G

E

N

N

R

G

R

-

N

D

K

R

A

T

A

A

I

I

I

I

C

W

E

E

K

G

E

D

D

D

G

A

S

S

-

Q

C

S

G

K

I

H

L

I

T

S

Y

Y

Y

K

E

E

L

L

Y

H

R

R

E

D

I

V

N

C

K

R

F

F

A

A

N

N

V

T

L

L

E

L

N

E

L

L

G

G

V

I

E

K

K

K

G

G

D

D

V

V

V

V

T

A

I

I

Y

Y

M

M

P

P

M

M

M

V

T

P

E

E

A

A

I

A

I

V

A

A

M

M

L

L

A

A

C

C

S

A

R

R

I

I

G

G

V

A

I

V

H

H

N

S

V

V

V

I

F

F

S

G

G

G

F

F

S

S

S

P

D

E

A

A

L

V

A

A

D

G

R

R

I

I

N

I

D

D

S

S

K

N

S

S

K

R

I

L

L

V

V

I

T

T

T

S

N

D

L

E

L

G

Y

V

R

R

R

A

G

G

K

R

E

S

I

I

E

P

L

L

K

K

K

K

I

N

L

V

D

D

K

D

A

A

L

L

L

K

N

N

C

P

N

N

-

V

-

T

S

S

I

V

K

E

H

H

V

V

V

V

Y

V

V

L

K

K

R

R

G

T

I

G

E

G

E

K

F

I

N

D

L

W

V

Q

S

E

G

G

K

R

E

D

Y

L

F

W

W

W

D

H

E

D

L

L

M

V

G

E

G

Q

A

A

K

S

S

D

Y

Q

V

H

E

Q

P

A

V

E

P

E

V

M

E

N

S

A

D

E

H

D

P

P

L

L

F

F

I

I

L

L

Y

Y

T

T

S

S

G

G

T

S

T

T

G

G

S

K

P

P

K

K

G

G

V

V

V

L

H

H

S

T

T

T

G

G

G

G

Y

Y

L

L

T

V

Y

Y

A

A

T

A

K

L

T

T

M

F

D

K

W

Y

T

V

W

F

G

D

L

Y

N

H

E

P

M

G

D

D

V

I

F

Y

W

W

C

C

T

T

A

A

D

D

I

V

G

G

W

W

I

V

T

T

G

G

H

H

T

S

Y

Y

V

L

V

L

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

A

L

C

G

G

A

A

T

T

I

T

V

L

L

M

Y

F

E

E

G

G

A

V

I

P

D

N

Y

W

P

P

E

T

P

P

D

A

R

R

L

M

W

A

G

Q

I

V

V

V

E

D

N

K

H

H

G

Q

V

V

T

N

L

I

L

L

Y

Y

T

T

A

A

P

P

T

T

A

A

I

I

R

R

M

A

L

L

M

M

M

A

Y

E

G

G

E

D

K

K

W

A

V

I

N

E

T

G

H

T

D

D

L

R

S

S

T

S

L

L

R

R

L

I

L

L

G

G

S

S

V

V

G

G

E

E

P

P

I

I

N

N

P

P

R

E

A

A

W

W

K

E

W

W

Y

Y

Y

W

K

K

V

K

I

I

G

G

K

N

E

E

K

K

C

C

P

P

I

V

C

V

D

D

C

T

Y

W

W

W

Q

Q

T

T

E

E

T

T

G

G

G

G

H

F

M

M

I

I

Y

T

P

P

A

L

I

P

G

G

I

-

Q

-

S

A

V

T

P

E

L

L

K

K

P

A

G

G

S

S

A

A

T

T

F

R

P

P

G

F

I

F

G

G

I

V

D

Q

V

P

D

A

V

L

V

V

D

D

N

N

E

E

G

G

N

N

P

P

V

L

E

E

A

G

N

A

I

T

K

E

G

G

N

S

L

L

I

V

I

I

K

T

R

D

P

S

W

W

P

P

G

G

M

Q

L

A

A

R

G

T

L

L

W

F

N

G

N

D

D

H

E

E

R

R

Y

F

R

E

A

Q

A

T

Y

Y

W

F

D

S

R

T

F

F

K

K

N

N

N

M

F

Y

S

F

T

S

S

G

D

D

Y

G

A

A

I

R

K

R

D

D

Q

E

D

D

G

G

Y

Y

I

Y

W

W

V

I

L

T

G

G

R

R

S

V

D

D

E

D

V

V

L

L

N

N

V

V

S

S

G

G

H

H

R

R

I

L

G

G

T

T

A

A

E

E

L

I

E

E

H

S

E

A

L

L

V

V

S

A

N

H

K

P

M

K

V

I

A

A

E

E

S

A

A

A

V

V

V

V

G

G

K

I

P

P

D

H

D

N

V

I

K

K

G

G

E

Q

V

A

P

I

V

Y

A

A

F

Y

V

V

I

T

L

L

N

N

E

-

R

-

Y

H

R

G

E

E

L

E

P

P

S

S

N

P

E

E

V

L

K

Y

A

A

T

E

L

V

I

R

R

N

H

W

I

V

R

R

D

K

T

E

V

I

G

G

P

P

I

L

G

A

T

T

P

P

A

D

M

V

I

L

F

H

F

W

V

T

N

D

K

S

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K
|
K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

I

L

L

K

R

K

K

L

I

I

A

I

A

G

G

E

D

-

T

-

S

E

N

I

L

G

G

D

D

V

T

T

S

T

T

L

L

E

A

D

D

N

P

T

G

S

V

L

V

E

E

D

K

V

L

K

L

K

E

E

E

K609 (= K596) modified: N6-acetyllysine; by autocatalysis

2p2fA Acetyl-coa synthetase, wild-type with acetate, amp, and coa bound (see paper)
47% identity, 97% coverage: 11:629/636 of query aligns to 17:634/637 of 2p2fA

query
sites
2p2fA

E

E

K

Q

Y

Y

S

E

E

T

M

K

Q

Y

Q

K

K

Q

A

S

L

I

E

N

D

D

P

P

E

D

K

T

F

F

W

W

G

G

E

E

Q

Q

A

G

K

K

C

I

L

L

E

D

W

W

D

I

K

T

T

P

W

Y

D

Q

N

K

V

V

L

K

E

-

W

-

N

N

P

T

P

S

Y

F

A

A

-

P

-

G

-

N

-

V

-

S

-

I

K

K

W

W

F

Y

K

E

S

D

G

G

S

T

L

L

N

N

A

L

S

A

Y

A

N

N

C

C

V

L

D

D

R

R

H

H

I

L

K

Q

G

E

N

N

R

G

R

-

N

D

K

R

A

T

A

A

I

I

I

I

C

W

E

E

K

G

E

D

D

D

G

T

S

S

-

Q

C

S

G

K

I

H

L

I

T

S

Y

Y

Y

R

E

E

L

L

Y

H

R

R

E

D

I

V

N

C

K

R

F

F

A

A

N

N

V

T

L

L

E

L

N

D

L

L

G

G

V

I

E

K

K

K

G

G

D

D

V

V

V

V

T

A

I

I

Y

Y

M

M

P

P

M

M

M

V

T

P

E

E

A

A

I

A

I

V

A

A

M

M

L

L

A

A

C

C

S

A

R

R

I

I

G

G

V

A

I

V

H

H

N

S

V

V

V

I

F
|
F

S

G

G

G

F

F

S

S

S

P

D

E

A

A

L

V

A

A

D

G

R

R

I

I

N

I

D

D

S

S

K

S

S

S

K

R

I

L

L

V

V

I

T

T

T

A

N

D

L

E

L

G

Y

V

R
|
R

R

A

G

G

K

R

E

S

I

I

E

P

L

L

K

K

K

K

I

N

L

V

D

D

K

D

A

A

L

L

L

K

N

N

C

P

N

N

-

V

-

T

S

S

I

V

K

E

H

H

V

V

V

I

Y

V

V

L

K

K

R

R

G

T

I

G

E

S

E

D

F

I

N

D

L

W

V

Q

S

E

G

G

K

R

E

D

Y

L

F

W

W

W

D

R

E

D

L

L

M

I

G

E

G

K

A

A

K

S

S

P

Y

E

V

H

E

Q

P

P

V

E

P

A

V

M

E

N

S

A

D

E

H

D

P

P

L

L

F

F

I

I

L

L

Y

Y

T
|
T

S

S

G

G

T

S

T

T

G

G

S

K

P

P

K

K

G

G

V

V

V

L

H

H

S

T

T

T

G

G

G

G

Y

Y

L

L

T

V

Y

Y

A

A

T

A

K

T

T

T

M

F

D

K

W

Y

T

V

W

F

G

D

L

Y

N

H

E

P

M

G

D

D

V

I

F

Y

W

W

C

C

T

T

A

A

D

D

I

V

G

G

W
|
W

I

V

T
|
T

G

G

H

H

T

S

Y

Y

V

L

V

L

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

A

L

C

G

G

A

A

T

T

I

T

V

L

L

M

Y

F

E

E

G

G

A

V

I
x
P

D

N

Y

W

P

P

E

T

P

P

D

A

R

R

L

M

W

C

G

Q

I

V

V

V

E

D

N

K

H

H

G

Q

V

V

T

N

L

I

L

L

Y

Y

T

T

A
|
A

P

P

T

T

A
|
A

I

I

R

R

M

A

L

L

M

M

M

A

Y

E

G

G

E

D

K

K

W

A

V

I

N

E

T

G

H

T

D

D

L

R

S

S

T

S

L

L

R

R

L

I

L

L

G

G

S

S

V

V

G
|
G

E
|
E

P
|
P

I

I

N

N

P

P

R

E

A

A

W

W

K

E

W

W

Y

Y

Y

W

K

K

V

K

I

I

G

G

K

K

E

E

K

K

C

C

P

P

I

V

C

V

D

D

C
x
T

Y
x
W

W
|
W

Q
|
Q

T
|
T

E
|
E

T

T

G

G

G

G

H

F

M

M

I

I

Y

T

P

P

A

L

I

P

G

G

I

-

Q

-

S

A

V

I

P

E

L

L

K

K

P

A

G

G

S

S

A

A

T

T

F

R

P

P

G

F

I

F

G

G

I

V

D

Q

V

P

D

A

V

L

V

V

D

D

N

N

E

E

G

G

N

H

P

P

V

Q

E

E

A

G

N

A

I

T

K

E

G

G

N

N

L

L

I

V

I

I

K

T

R

D

P

S

W

W

P

P

G

G

M

Q

L

A

A

R

G

T

L

L

W

F

N

G

N

D

D

H

E

E

R

R

Y

F

R

E

A

Q

A

T

Y

Y

W

F

D

S

R

T

F

F

K

K

N

N

N

M

F

Y

S

F

T

S

S

G

D
|
D

Y

G

A

A

I

R

K

R

D

D

Q

E

D

D

G

G

Y

Y

I

Y

W

W

V
x
I

L

T

G

G

R
|
R

S

V

D

D

E

D

V

V

L

L

N
|
N

V

V

S
|
S

G

G

H

H

R
|
R

I

L

G

G

T

T

A

A

E

E

L

I

E

E

H

S

E

A

L

L

V

V

S

A

N

H

K

P

M

K

V

I

A

A

E

E

S

A

A

A

V

V

V

V

G

G

K

I

P

P

D

H

D

A

V

I

K

K

G

G

E

Q

V

A

P

I

V

Y

A

A

F

Y

V

V

I

T

L

L

N

N

E

-

R

-

Y

H

R

G

E

E

L

E

P

P

S

S

N

P

E

E

V

L

K

Y

A

A

T

E

L

V

I

R

R

N

H

W

I

V

R
|
R

D

K

T

E

V

I

G

G

P
|
P

I

L

G

A

T

T

P

P

A

D

M

V

I

L

F

H

F

W

V

T

N

D

K

S

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K
|
K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

I

L

L

K

R

K

K

L

I

I

A

I

A

G

G

E

D

E

T

I

-

G

-

D

-

V

S

T

S

T

T

L

L

E

A

D

D

N

P

T

G

S

V

L

V

E

E

D

K

V

L

K

L

K

E

E

E

active site: T259 (= T247), T411 (= T399), E412 (= E400), N516 (= N506), R521 (= R511), K604 (= K596)
binding adenosine monophosphate: G382 (= G370), E383 (= E371), P384 (= P372), T407 (≠ C395), W408 (≠ Y396), W409 (= W397), Q410 (= Q398), T411 (= T399), D495 (= D485), I507 (≠ V497), R510 (= R500), N516 (= N506), R521 (= R511)
binding coenzyme a: F158 (= F148), R186 (= R176), W304 (= W292), T306 (= T294), P329 (≠ I317), A352 (= A340), A355 (= A343), S518 (= S508), R579 (= R571), P584 (= P576)

1pg3A Acetyl coa synthetase, acetylated on lys609 (see paper)
48% identity, 94% coverage: 11:609/636 of query aligns to 18:618/634 of 1pg3A

query
sites
1pg3A

E

E

K

Q

Y

Y

S

E

E

T

M

K

Q

Y

Q

K

K

Q

A

S

L

I

E

N

D

D

P

P

E

D

K

T

F

F

W

W

G

G

E

E

Q

Q

A

G

K

K

C

I

L

L

E

D

W

W

D

I

K

T

T

P

W

Y

D

Q

N

K

V

V

L

K

E

-

W

-

N

N

P

T

P

S

Y

F

A

A

-

P

-

G

-

N

-

V

-

S

-

I

K

K

W

W

F

Y

K

E

S

D

G

G

S

T

L

L

N

N

A

L

S

A

Y

A

N

N

C

C

V

L

D

D

R

R

H

H

I

L

K

Q

G

E

N

N

R

G

R

-

N

D

K

R

A

T

A

A

I

I

I

I

C

W

E

E

K

G

E

D

D

D

G

T

S

S

-

Q

C

S

G

K

I

H

L

I

T

S

Y

Y

Y

R

E

E

L

L

Y

H

R

R

E

D

I

V

N

C

K

R

F

F

A

A

N

N

V

T

L

L

E

L

N

D

L

L

G

G

V

I

E

K

K

K

G

G

D

D

V

V

V

V

T

A

I

I

Y

Y

M

M

P

P

M

M

M

V

T

P

E

E

A

A

I

A

I

V

A

A

M

M

L

L

A

A

C

C

S

A

R

R

I

I

G

G

V

A

I

V

H

H

N

S

V

V

V

I

F
|
F

S
x
G

G

G

F

F

S

S

S

P

D

E

A

A

L

V

A

A

D

G

R

C

I

I

N

I

D

D

S

S

K

S

S

S

K

R

I

L

L

V

V

I

T

T

T

A

N

D

L

E

L

G

Y

V

R
|
R

R

A

G

G

K
x
R

E

S

I

I

E

P

L

L

K

K

K

K

I

N

L

V

D

D

K

D

A

A

L

L

L

K

N

N

C

P

N

N

-

V

-

T

S

S

I

V

K

E

H

H

V

V

V

I

Y

V

V

L

K

K

R

R

G

T

I

G

E

S

E

D

F

I

N

D

L

W

V

Q

S

E

G

G

K

R

E

D

Y

L

F

W

W

W

D

R

E

D

L

L

M

I

G

E

G

K

A

A

K

S

S

P

Y

E

V

H

E

Q

P

P

V

E

P

A

V

M

E

N

S

A

D

E

H

D

P

P

L

L

F

F

I

I

L

L

Y

Y

T
|
T

S

S

G

G

T

S

T

T

G

G

S

K

P

P

K

K

G

G

V

V

V

L

H

H

S

T

T

T

G

G

G

G

Y

Y

L

L

T

V

Y

Y

A

A

T

A

K

T

T

T

M

F

D

K

W

Y

T

V

W

F

G

D

L

Y

N

H

E

P

M

G

D

D

V

I

F

Y

W

W

C

C

T

T

A
|
A

D

D

I

V

G

G

W

W

I

V

T
|
T

G

G

H

H

T

S

Y

Y

V

L

V

L

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

A

L

C

G

G

A

A

T

T

I

T

V

L

L

M

Y

F

E

E

G

G

A

V

I
x
P

D

N

Y

W

P

P

E

T

P

P

D

A

R

R

L

M

W

C

G

Q

I

V

V

V

E

D

N

K

H

H

G

Q

V

V

T

N

L

I

L

L

Y

Y

T

T

A

A

P

P

T

T

A
|
A

I

I

R

R

M

A

L

L

M

M

M

A

Y

E

G

G

E

D

K

K

W

A

V

I

N

E

T

G

H

T

D

D

L

R

S

S

T

S

L

L

R

R

L

I

L

L

G

G

S

S

V

V

G
|
G

E
|
E

P
|
P

I

I

N

N

P

P

R

E

A

A

W

W

K

E

W

W

Y

Y

Y

W

K

K

V

K

I

I

G

G

K

K

E

E

K

K

C

C

P

P

I

V

C

V

D

D

C
x
T

Y
x
W

W
|
W

Q
|
Q

T
|
T

E
|
E

T

T

G

G

G

G

H

F

M

M

I

I

Y

T

P

P

A

L

I

P

G

G

I

-

Q

-

S

A

V

I

P

E

L

L

K

K

P

A

G

G

S

S

A

A

T

T

F

R

P

P

G

F

I

F

G

G

I

V

D

Q

V

P

D

A

V

L

V

V

D

D

N

N

E

E

G

G

N

H

P

P

V

Q

E

E

A

G

N

A

I

T

K

E

G

G

N

N

L

L

I

V

I

I

K

T

R

D

P

S

W

W

P

P

G

G

M

Q

L

A

A

R

G

T

L

L

W

F

N

G

N

D

D

H

E

E

R

R

Y

F

R

E

A

Q

A

T

Y

Y

W

F

D

S

R

T

F

F

K

K

N

N

N

M

F

Y

S

F

T

S

S

G

D
|
D

Y

G

A

A

I

R

K

R

D

D

Q

E

D

D

G

G

Y

Y

I

Y

W

W

V

I

L

T

G

G

R
|
R

S

V

D

D

E

D

V

V

L

L

N
|
N

V

V

S
|
S

G

G

H

H

R
|
R

I

L

G

G

T

T

A

A

E

E

L

I

E

E

H

S

E

A

L

L

V
|
V

S

A

N
x
H

K

P

M

K

V
x
I

A

A

E

E

S

A

A

A

V

V

V

V

G

G

K

I

P

P

D

H

D

A

V

I

K

K

G

G

E

Q

V

A

P

I

V

Y

A

A

F

Y

V

V

I

T

L

L

N

N

E

-

R

-

Y

H

R

G

E

E

L

E

P

P

S

S

N

P

E

E

V

L

K

Y

A

A

T

E

L

V

I

R

R

N

H

W

I

V

R
|
R

D

K

T

E

V

I

G

G

P
|
P

I

L

G

A

T

T

P

P

A

D

M

V

I

L

F

H

F

W

V

T

N

D

K

S

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K
|
K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

I

L

L

K

R

K

K

L

I

I

A

I

A

G

G

E

D

active site: T260 (= T247), T412 (= T399), E413 (= E400), N517 (= N506), R522 (= R511), K605 (= K596)
binding coenzyme a: F159 (= F148), G160 (≠ S149), R187 (= R176), R190 (≠ K179), A301 (= A288), T307 (= T294), P330 (≠ I317), A356 (= A343), S519 (= S508), R580 (= R571), P585 (= P576)
binding magnesium ion: V533 (= V522), H535 (≠ N524), I538 (≠ V527)
binding adenosine-5'-monophosphate-propyl ester: G383 (= G370), E384 (= E371), P385 (= P372), T408 (≠ C395), W409 (≠ Y396), W410 (= W397), Q411 (= Q398), T412 (= T399), D496 (= D485), R511 (= R500), R522 (= R511)

Q89WV5 Acetyl-coenzyme A synthetase; AcCoA synthetase; Acs; Acetate--CoA ligase; Acyl-activating enzyme; EC 6.2.1.1 from Bradyrhizobium diazoefficiens (strain JCM 10833 / BCRC 13528 / IAM 13628 / NBRC 14792 / USDA 110) (see paper)
45% identity, 98% coverage: 12:634/636 of query aligns to 22:646/648 of Q89WV5

query
sites
Q89WV5

K

K

Y

Y

S

K

E

E

M

M

Q

Y

Q

A

K

R

A

S

L

I

E

S

D

D

P

P

E

N

K

G

F

F

W

W

G

A

E

E

Q

Q

A

A

K

K

C

R

L

I

E

D

W

W

D

M

K

K

T

A

W

P

D

T

N

K

V

I

-

E

-

N

L

V

E

S

W

F

N

A

P

P

P

G

Y

N

A

V

-

S

-

I

K

K

W

W

F

F

K

E

S

D

G

G

S

V

L

L

N

N

A

V

S

A

Y

H

N

N

C

C

V

I

D

D

R

R

H

H

I

L

K

H

G

-

N

K

R

R

R

A

N

N

K

Q

A

T

A

A

I

I

I

I

C

W

E

E

K

G

E

D

D

D

G

P

S

S

C

Q

G

S

I

R

-

H

L

I

T

T

Y

Y

Y

K

E

E

L

L

Y

H

R

D

E

E

I

V

N

C

K

R

F

M

A

A

N

N

V

I

L

L

E

R

N

T

L

R

G

N

V

V

E

K

K

K

G

G

D

D

V

R

V

V

T

T

I

I

Y

Y

M

L

P

P

M

M

M

I

T

P

E

E

A

A

I

A

I

Y

A

A

M

M

L

L

A

A

C

C

S

A

R

R

I

I

G

G

V

A

I

I

H

H

N

S

V

V

V

V

F

F

S

A

G

G

F

F

S

S

S

P

D

D

A

S

L

L

A

A

D

Q

R

R

I

I

N

N

D

D

S

C

K

Q

S

S

K

K

I

V

L

I

V

I

T

T

T

A

N

D

L

E

L

G

Y

L

R

R

R

G

G

G

K

K

E

K

I

V

E

P

L

L

K

K

K

A

I

N

L

V

D

D

K

A

A

A

L

L

L

A

N

K

C

A

N

D

S

G

I

V

K

D

H

W

V

V

V

V

Y

V

V

V

K

K

R

R

G

T

I

G

E

G

E

K

F

I

N

D

L

M

V

N

S

P

G

T

K

R

E

D

Y

L

F

W

W

Y

D

H

E

E

L

-

M

-

G

-

G

A

A

A

K

A

S

M

Y

V

V

T

E

T

P

E

V

C

P

P

V

V

E

E

S

H

D

M

H

H

-

A

-

E

-

D

P

P

L

L

F

F

I

I

L

L

Y

Y

T

T

S

S

G
|
G

T

S

T

T

G
|
G

S

Q

P

P

K
|
K

G

G

V

V

V

L

H

H

S

T

T

S

G

A

G

G

Y

Y

L

L

T

V

Y

Y

A

A

T

A

K

M

T

T

M

H

D

Q

W

Y

T

V

W

F

G

D

L

Y

N

H

E

D

M

G

D

D

V

I

F

Y

W

W

C

C

T

T

A

A

D

D

I

V

G

G

W

W

I

V

T

T

G

G

H

H

T

S

Y

Y

V

I

V

L

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

A

L

N

G

G

A

A

T

T

I

T

V

L

L

M

Y

F

E

E

G

G

A

V

I

P

D

N

Y

Y

P

P

E

D

P

N

D

S

R

R

L

F

W

W

G

N

I

V

V

I

E

D

N

K

H

H

G

K

V

V

T

N

L

T

L

F

Y

Y

T

T

A

A

P

P

T

T

A

A

I

I

R

R

M

A

L

L

M

M

M

Q

Y

G

G

G

E

D

K

E

W

P

V

V

N

K

T

K

H

T

D

S

L

R

S

A

T

S

L

L

R

R

L

L

L

L

G

G

S

S

V

V

G

G

E

E

P

P

I

I

N

N

P

P

R

E

A

A

W

W

K

E

W

W

Y

Y

Y

H

K

R

V

V

I

V

G

G

K

E

E

D

K

R

C

C

P

P

I

I

C

V

D

D

C

T

Y

W

W

W

Q

Q

T

T

E
|
E

T

T

G

G

G

G

H

I

M

L

I

I

Y

T

P

P

A

L

I

P

G

G

I

-

Q

-

S

A

V

T

P

K

L

L

K

K

P

P

G

G

S

S

A

A

T

T

F

Q

P

P

G

F

I

F

G

G

I

V

D

V

V

P

D

E

V

I

V

V

D

D

N

A

E

D

G

G

N

K

P

V

V

L

E

E

A

G

N

E

I

T

K

T

G

G

N

N

L

L

I

C

I

L

K

T

R

R

P

A

W

W

P

P

G

G

M

M

L

M

A

R

G

T

L

V

W

Y

N

G

N

D

D

H

E

A

R

R

Y

F

R

E

A

Q

A

T

Y

Y

W

F

D

S

R

T

F

Y

K

K

N

G

N

K

F

Y

S

F

T

T

S

G

D

D

Y

G

A

C

I

R

K

R

D

D

Q

A

D

D

G

G

Y

Y

I

Y

W

W

V

I

L

T

G

G

R

R

S

V

D

D

E

D

V

V

L

I

N

N

V

V

S

S

G

G

H

H

R

R

I

M

G

G

T

T

A

A

E

E

L

V

E

E

H

S

E

A

L

L

V

V

S

A

N

H

K

E

M

K

V

V

A

S

E

E

S

A

A

A

V

V

V

V

G

G

K

F

P

P

D

H

D

D

V

I

K

K

G

G

E

Q

V

G

P

I

V

Y

A

A

F

Y

V

V

I

T

L

L

N

M

E

A

R

G

Y

V

R

Q

E

-

L

-

P

P

S

T

N

E

E

D

V

L

K

R

A

K

T

E

L

L

I

V

R

T

H

W

I

V

R

R

D

K

T

E

V

I

G

G

P

P

I

I

G

A

T

S

P

P

A

D

M

Q

I

I

F

Q

F

F

V

A

N

P

K

G

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K

K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

I

L

L

K

R

K

K

L

I

I

A

I

E

G

D

E

E

-

P

-

G

E

S

I

L

G

G

D

D

V

T

T

S

T

T

L

L

E

A

D

D

N

P

T

A

S

V

L

V

E

D

D

D

V

L

K

V

K

K

E

N

L

R

E

Q

D

N

F

K

K

K

G263 (= G249) mutation to I: Loss of activity.
G266 (= G252) mutation to I: Great decrease in activity.
K269 (= K255) mutation to G: Great decrease in activity.
E414 (= E400) mutation to Q: Great decrease in activity.

P9WQD1 Acetyl-coenzyme A synthetase; AcCoA synthetase; Acs; Acetate--CoA ligase; Acyl-activating enzyme; EC 6.2.1.1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
47% identity, 97% coverage: 14:627/636 of query aligns to 26:648/651 of P9WQD1

query
sites
P9WQD1

S

A

E

E

M

L

Q

Y

Q

R

K

E

A

A

L

E

E

E

D

D

P

R

E

L

K

A

F

F

W

W

G

A

E

K

Q

Q

A

A

K

N

C

R

L

L

E

S

W

W

D

T

K

T

T

P

W

F

D

T

N

E

V

V

L

L

E

D

W

W

N

S

-

G

P

A

P

P

Y

F

A

A

K

K

W

W

F

F

K

V

S

G

G

G

S

E

L

L

N

N

A

V

S

A

Y

Y

N

N

C

C

V

V

D

D

R

R

H

H

I

V

K

E

G

A

N

G

R

H

R

G

N

D

K

R

A

V

A

A

I

I

I

H

C

W

E

E

K

G

E

E

D

P

-

V

G

G

S

D

C

R

G

R

I

T

L

L

T

T

Y

Y

Y

S

E

D

L

L

Y

L

R

A

E

E

I

V

N

S

K

K

F

A

A

A

N

N

V

A

L

L

E

T

N

D

L

L

G

G

V

L

E

V

K

A

G

G

D

D

V

R

V

V

T

A

I

I

Y

Y

M

L

P

P

M

L

M

I

T

P

E

E

A

A

I

V

I

I

A

A

M

M

L

L

A

A

C

C

S

A

R

R

I

L

G

G

V

I

I

M

H

H

N

S

V

V

V

V

F

F

S

G

G

G

F

F

S

T

S

A

D

A

A

A

L

L

A

Q

D

A

R

R

I

I

N

V

D

D

S

A

K

Q

S

A

K

K

I

L

L

L

V

I

T

T

T

A

N

D

L

G

L

Q

Y

F

R

R

R

R

G

G

K

K

E

P

I

S

E

P

L

L

K

K

K

A

I

A

L

A

D

D

K

E

A

A

-

L

-

A

-

A

L

I

L

P

N

D

C

C

N

-

S

S

I

V

K

E

H

H

V

V

V

L

Y

V

V

V

K

R

R

R

G

T

I

G

E

I

E

E

F

M

N

A

L

W

V

S

S

E

G

G

K

R

E

D

Y

L

F

W

W

W

D

H

E

H

L

V

M

V

G

G

G

S

A

A

K

S

S

P

Y

A

V

H

E

T

P

P

V

E

P

P

V

F

E

D

S

S

D

E

H

H

P

P

L

L

F

F

I

L

L

L

Y

Y

T

T

S

S

G

G

T

T

T

T

G

G

S

K

P

P

K

K

G

G

V

I

V

M

H

H

S

T

T

S

G

G

G

G

Y

Y

L

L

T

T

Y

Q

A

C

T

C

K

Y

T

T

M

M

D

R

W

T

T

I

W

F

G

D

L

V

N

K

-

P

E

D

M

S

D

D

V

V

F

F

W

W

C

C

T

T

A

A

D

D

I

I

G

G

W

W

I

V

T

T

G

G

H

H

T

T

Y

Y

V

G

V

V

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

C

L

N

G

G

A

V

T

T

I

E

V

V

L

L

Y

Y

E

E

G

G

A

T

I

P

D

D

Y

T

P

P

E

D

P

R

D

H

R

R

L

H

W

F

G

Q

I

I

V

I

E

E

N

K

H

Y

G

G

V

V

T

T

L

I

L

Y

Y

Y

T

T

A

A

P

P

T

T

A

L

I

I

R

R

M

M

L

F

M

M

M

K

Y

W

G

G

E

R

K

E

W

I

V

P

N

D

T

S

H

H

D

D

L

L

S

S

T

S

L

L

R

R

L

L

L

L

G

G

S

S

V

V

G

G

E

E

P

P

I

I

N

N

P

P

R

E

A

A

W

W

K

R

W

W

Y

Y

Y

R

K

D

V

V

I

I

G

G

K

G

E

G

K

R

C

T

P

P

I

L

C

V

D

D

C

T

Y

W

W

W

Q

Q

T

T

E

E

T

T

G

G

G

S

H

A

M

M

I

I

Y

S

P

P

A

L

I

P

G

G

I

I

Q

A

S

A

V

A

P

-

L

-

K

K

P

P

G

G

S

S

A

A

T

M

F

T

P

P

G

L

I

P

G

G

I

I

D

S

V

A

D

K

V

I

V

V

D

D

N

D

E

H

G

G

N

D

P

P

V

L

-

P

-

P

-

H

-

T

-

E

-

G

E

A

A

Q

N

H

I

V

K

T

G

G

N

Y

L

L

I

V

I

L

K

D

R

Q

P

P

W

W

P

P

G

S

M

M

L

L

A

R

G

G

L

I

W

W

N

G

N

D

D

P

E

A

R

R

Y

Y

R

W

A

H

A

S

Y

Y

W

W

D

S

R

K

F

F

-

S

-

D

K

K

N

G

N

Y

F

Y

S

F

T

A

S

G

D

D

Y

G

A

A

I

R

K

I

D

D

Q

P

D

D

G

G

Y

A

I

I

W

W

V

V

L

L

G

G

R

R

S

I

D

D

E

D

V

V

L

M

N

N

V

V

S

S

G

G

H

H

R

R

I

I

G

S

T

T

A

A

E

E

L

V

E

E

H

S

E

A

L

L

V

V

S

A

N

H

K

S

M

G

V

V

A

A

E

E

S

A

A

A

V

V

V

V

G

G

K

V

P

T

D

D

D

E

V

T

K

T

G

T

E

Q

V

A

P

I

V

C

A

A

F

F

V

V

I

V

L

L

N

R

E

A

R

N

Y

Y

R

-

E

-

L

A

P

P

S

H

N

D

E

R

V

T

K

A

A

E

T

E

L

L

I

R

R

T

H

E

I

V

R

A

D

R

T

V

V

I

G

S

P

P

I

I

G

A

T

R

P

P

A

R

M

D

I

V

F

H

F

V

V

V

N

P

K

E

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K
|
K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

L

L

L

K

R

K

D

L

V

I

A

I

E

G

N

E

R

E

E

I

L

G

G

D

D

V

T

T

S

T

T

L

L

E

L

D

D

N

P

T

T

S

V

L

F

E

D

D

A

V

I

K

R

K617 (= K596) modified: N6-acetyllysine; mutation to R: Complete loss of acetyl-coenzyme A synthetase activity.

8w0dA Crystal structure of acetyl-coa synthetase 2 from candida albicans in complex with an isopropyl amp ester inhibitor
45% identity, 97% coverage: 10:626/636 of query aligns to 34:656/666 of 8w0dA

query
sites
8w0dA

L

V

E

N

K

Q

Y

Y

S

K

E

Q

M

M

Q

Y

Q

E

K

Q

A

S

L

I

E

K

D

D

P

P

E

Q

K

G

F

F

W

F

G

G

E

P

Q

L

A

A

K

K

-

E

C

L

L

L

E

S

W

W

D

D

K

H

T

D

W

F

D

H

N

T

V

V

L

K

E

S

W

G

N

T

P

L

P

K

Y

N

-

G

-

D

A

A

K

A

W

W

F

F

K

L

S

G

G

G

S

E

L

L

N

N

A

A

S

S

Y

Y

N

N

C

C

V

V

D

D

R

R

H

H

I

A

K

F

G

A

N

N

R

P

R

-

N

D

K

K

A

P

A

A

I

L

I

I

C

C

E

E

K

A

E

D

D

D

-

E

G

K

S

D

C

S

G

H

I

I

L

L

T

T

Y

Y

Y

G

E

D

L

L

Y

L

R

R

E

E

I

V

N

S

K

K

F

V

A

A

N

G

V

V

L

L

E

Q

N

S

L

W

G

G

V

I

E

K

K

K

G

G

D

D

V

T

V

V

T

A

I

V

Y

Y

M

L

P

P

M

M

M

N

T

A

E

Q

A

A

I

I

I

I

A

A

M

M

L

L

A

A

C

I

S

A

R

R

I

L

G

G

V

A

I

A

H

H

N

S

V

V

V

I

F

F

S

A

G

G

F

F

S

S

S

A

D

G

A

S

L

I

A

K

D

D

R

R

I

V

N

N

D

D

S

A

K

S

S

C

K

K

I

A

L

L

V

I

T

T

T

C

N

D

L

E

L

G

Y

K

R

R

R

G

G

G

K

R

E

T

I

T

E

N

L

I

K

K

K

K

I

L

L

C

D

D

K

E

A

A

L

L

L

V

N

D

C

C

N

P

S

T

I

V

K

E

H

K

V

V

-

L

V

V

Y

Y

V

K

K

R

R

T

G

N

I

N

E

P

E

E

F

I

N

H

L

L

V

T

S

E

G

G

K

R

E

D

Y

Y

F

Y

W

W

D

D

E

V

L

E

M

T

G

A

G

K

A

F

K

P

S

G

Y

Y

V

L

E

P

P

P

V

V

P

S

V

V

E

N

S

S

D

E

H

D

P

P

L

L

F

F

I

L

L

L

Y

Y

T

T

S

S

G

G

T

S

T

T

G

G

S

T

P

P

K

K

G

G

V

V

V

V

H

H

S

S

T

T

G

A

G

G

Y

Y

L

L

T

L

Y

G

A

A

T

A

K

L

T

S

M

T

D

K

W

Y

T

I

W

F

G

D

L

I

N

H

E

P

M

E

D

D

V

I

F

L

W

F

C

T

T

A

A

G

D

D

I

V

G

G

W

W

I

I

T

T

G

G

H

H

T

T

Y

Y

V

A

V

L

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

L

L

L

G

G

A

V

T

P

I

T

V

I

L

I

Y

F

E

E

G

G

A

T

I

P

D

A

Y

Y

P

P

E

D

P

Y

D

G

R

R

L

F

W

W

G

Q

I

I

V

V

E

E

N

K

H

H

G

K

V

A

T

T

L

H

L

F

Y

Y

T

V

A

A

P

P

T

T

A

A

I

L

R

R

M

L

L

L

M

R

M

K

Y

A

G

G

E

E

K

Q

W

E

V

I

N

A

T

K

H

Y

D

D

L

L

S

S

T

S

L

L

R

R

L

T

L

L

G

G

S

S

V

V

G
|
G

E
|
E

P
|
P

I

I

N

S

P

P

R

D

A

I

W

W

K

E

W

W

Y

Y

Y

N

K

E

V

F

I

V

G

G

K

K

E

N

K

Q

C

C

P

H

I

I

C

S

D

D

C
x
T

Y
|
Y

W
|
W

Q
|
Q

T
|
T

E

E

T

S

G

G

G

S

H

H

M

L

I

I

Y

A

P

P

A

L

I

A

G

G

I

V

Q

-

S

-

V

V

P

P

L

N

K

K

P

P

G

G

S

S

A

A

T

S

F

Y

P

P

G

F

I

F

G

G

I

I

D

D

V

A

D

A

V

L

V

I

D

D

N

P

-

V

E

T

G

G

N

V

P

E

V

I

E

E

A

G

N

N

-

D

I

A

K

E

G

G

N

V

L

L

I

A

I

I

K

K

R

D

P

H

W

W

P

P

G

S

M

M

L

A

A

R

G

T

L

V

W

Y

N

K

N

N

D

H

E

T

R

K

Y

Y

R

M

A

D

A

T

Y

Y

W

M

D

N

R

P

F

Y

K

P

N

G

N

Y

F

Y

S

F

T

T

S

G

D
|
D

Y

G

A

A

I

A

K

R

D

D

Q

H

D

D

G

G

Y

Y

I

Y

W

W

V
x
I

L

R

G

G

R
|
R

S

V

D

D

E

D

V

V

L

V

N

N

V

V

S

S

G

G

H

H

R
|
R

I

L

G

S

T

T

A

A

E

E

L

I

E

E

H

A

E

A

L

L

V

I

S

E

N

D

K

K

M

K

V

V

A

S

E

E

S

A

A

A

V

V

V

V

G

G

K

I

P

H

D

D

D

D

V

I

K

T

G

G

E

Q

V

A

P

V

V

I

A

A

F

Y

V

V

I

A

L

L

N

K

E

E

R

G

Y

N

R

S

E

D

L

E

P

D

S

S

N

E

E

G

V

L

K

R

A

K

T

E

L

L

I

V

R

L

H

Q

I

V

R

R

D

K

T

T

V

I

G

G

P

P

I

F

G

A

T

A

P

P

A

K

M

S

I

V

F

I

F

I

V

V

N

Q

K

D

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K

K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

I

L

L

K

R

K

K

L

V

I

S

I

S

G

N

E

E

-

A

-

D

E

Q

I

L

G

G

D

D

V

I

T

S

T

T

L

L

E

S

D

N

N

P

T

Q

S

S

L

V

E

E

D

G

V

I

binding 5'-O-{(R)-hydroxy[(propan-2-yl)oxy]phosphoryl}adenosine: G398 (= G370), E399 (= E371), P400 (= P372), T423 (≠ C395), Y424 (= Y396), W425 (= W397), Q426 (= Q398), T427 (= T399), D513 (= D485), I525 (≠ V497), R528 (= R500), R539 (= R511)

8v4rA Crystal structure of acetyl-coa synthetase 2 in complex with amp and coa from candida albicans (see paper)
45% identity, 97% coverage: 10:626/636 of query aligns to 34:656/666 of 8v4rA

query
sites
8v4rA

L

V

E

N

K

Q

Y

Y

S

K

E

Q

M

M

Q

Y

Q

E

K

Q

A

S

L

I

E

K

D

D

P

P

E

Q

K

G

F

F

W

F

G

G

E

P

Q

L

A

A

K

K

-

E

C

L

L

L

E

S

W

W

D

D

K

H

T

D

W

F

D

H

N

T

V

V

L

K

E

S

W

G

N

T

P

L

P

K

Y

N

-

G

-

D

A

A

K

A

W

W

F

F

K

L

S

G

G

G

S

E

L

L

N

N

A

A

S

S

Y

Y

N

N

C

C

V

V

D

D

R

R

H

H

I

A

K

F

G

A

N

N

R

P

R

-

N

D

K

K

A

P

A

A

I

L

I

I

C

C

E

E

K

A

E

D

D

D

-

E

G

K

S

D

C

S

G

H

I

I

L

L

T

T

Y

Y

Y

G

E

D

L

L

Y

L

R

R

E

E

I

V

N

S

K

K

F

V

A

A

N

G

V

V

L

L

E

Q

N

S

L

W

G

G

V

I

E

K

K

K

G

G

D

D

V

T

V

V

T

A

I

V

Y

Y

M

L

P

P

M

M

M

N

T

A

E

Q

A

A

I

I

I

I

A

A

M

M

L

L

A

A

C

I

S

A

R

R

I

L

G

G

V

A

I

A

H

H

N

S

V

V

V

I

F
|
F

S

A

G

G

F

F

S

S

S

A

D

G

A

S

L

I

A

K

D

D

R

R

I

V

N

N

D

D

S

A

K

S

S

C

K

K

I

A

L

L

V

I

T

T

T

C

N

D

L

E

L

G

Y

K

R
|
R

R

G

G

G

K
x
R

E

T

I

T

E

N

L

I

K

K

K

K

I

L

L

C

D

D

K

E

A

A

L

L

L

V

N

D

C

C

N

P

S

T

I

V

K

E

H

K

V

V

-

L

V

V

Y

Y

V

K

K

R

R

T

G

N

I

N

E

P

E

E

F

I

N

H

L

L

V

T

S

E

G

G

K

R

E

D

Y

Y

F

Y

W

W

D

D

E

V

L

E

M

T

G

A

G

K

A

F

K

P

S

G

Y

Y

V

L

E

P

P

P

V

V

P

S

V

V

E

N

S

S

D

E

H

D

P

P

L

L

F

F

I

L

L

L

Y

Y

T

T

S

S

G

G

T

S

T

T

G

G

S

T

P

P

K

K

G

G

V

V

V

V

H

H

S

S

T

T

G

A

G

G

Y

Y

L

L

T

L

Y

G

A

A

T

A

K

L

T

S

M

T

D

K

W

Y

T

I

W

F

G

D

L

I

N

H

E

P

M

E

D

D

V

I

F

L

W

F

C

T

T

A

A
x
G

D

D

I

V

G

G

W

W

I

I

T

T

G

G

H

H

T

T

Y

Y

V

A

V

L

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

L

L

L

G

G

A

V

T

P

I

T

V

I

L

I

Y

F

E

E

G

G

A

T

I

P

D

A

Y

Y

P

P

E

D

P

Y

D

G

R

R

L

F

W

W

G

Q

I

I

V

V

E

E

N

K

H

H

G

K

V

A

T

T

L

H

L

F

Y

Y

T

V

A

A

P

P

T

T

A

A

I

L

R

R

M

L

L

L

M

R

M

K

Y

A

G

G

E

E

K

Q

W

E

V

I

N

A

T

K

H

Y

D

D

L

L

S

S

T

S

L

L

R

R

L

T

L

L

G

G

S

S

V

V

G
|
G

E
|
E

P
|
P

I

I

N

S

P

P

R

D

A

I

W

W

K

E

W

W

Y

Y

Y

N

K

E

V

F

I

V

G

G

K

K

E

N

K

Q

C

C

P

H

I

I

C

S

D

D

C
x
T

Y
|
Y

W

W

Q
|
Q

T
|
T

E

E

T

S

G

G

G

S

H

H

M

L

I

I

Y

A

P

P

A

L

I

A

G

G

I

V

Q

-

S

-

V

V

P

P

L

N

K

K

P

P

G

G

S

S

A

A

T

S

F

Y

P

P

G

F

I

F

G

G

I

I

D

D

V

A

D

A

V

L

V

I

D

D

N

P

-

V

E

T

G

G

N

V

P

E

V

I

E

E

A

G

N

N

-

D

I

A

K

E

G

G

N

V

L

L

I

A

I

I

K

K

R

D

P

H

W

W

P

P

G

S

M

M

L

A

A

R

G

T

L

V

W

Y

N

K

N

N

D

H

E

T

R

K

Y

Y

R

M

A

D

A

T

Y

Y

W

M

D

N

R

P

F

Y

K

P

N

G

N

Y

F

Y

S

F

T

T

S

G

D
|
D

Y

G

A

A

I

A

K

R

D

D

Q

H

D

D

G

G

Y

Y

I

Y

W

W

V
x
I

L

R

G

G

R
|
R

S

V

D

D

E

D

V

V

L

V

N

N

V

V

S

S

G

G

H
|
H

R
|
R

I

L

G

S

T

T

A

A

E

E

L

I

E

E

H

A

E

A

L

L

V

I

S

E

N

D

K

K

M

K

V

V

A

S

E

E

S

A

A

A

V

V

V

V

G

G

K

I

P

H

D

D

D

D

V

I

K

T

G

G

E

Q

V

A

P

V

V

I

A

A

F

Y

V

V

I

A

L

L

N

K

E

E

R

G

Y

N

R

S

E

D

L

E

P

D

S

S

N

E

E

G

V

L

K

R

A

K

T

E

L

L

I

V

R

L

H

Q

I

V

R
|
R

D

K

T

T

V

I

G

G

P

P

I
x
F

G

A

T

A

P

P

A

K

M

S

I

V

F

I

F

I

V

V

N

Q

K

D

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K

K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

I

L

L

K

R

K

K

L

V

I

S

I

S

G

N

E

E

-

A

-

D

E

Q

I

L

G

G

D

D

V

I

T

S

T

T

L

L

E

S

D

N

N

P

T

Q

S

S

L

V

E

E

D

G

V

I

binding adenosine monophosphate: G398 (= G370), E399 (= E371), P400 (= P372), T423 (≠ C395), Y424 (= Y396), Q426 (= Q398), T427 (= T399), D513 (= D485), I525 (≠ V497), R528 (= R500), R539 (= R511)
binding coenzyme a: F175 (= F148), R203 (= R176), R206 (≠ K179), G316 (≠ A288), H538 (= H510), R599 (= R571), F605 (≠ I577)

8w0cA Crystal structure of acetyl-coa synthetase 2 from candida albicans in complex with a cyclopentyl ester amp inhibitor
45% identity, 97% coverage: 10:626/636 of query aligns to 35:657/667 of 8w0cA

query
sites
8w0cA

L

V

E

N

K

Q

Y

Y

S

K

E

Q

M

M

Q

Y

Q

E

K

Q

A

S

L

I

E

K

D

D

P

P

E

Q

K

G

F

F

W

F

G

G

E

P

Q

L

A

A

K

K

-

E

C

L

L

L

E

S

W

W

D

D

K

H

T

D

W

F

D

H

N

T

V

V

L

K

E

S

W

G

N

T

P

L

P

K

Y

N

-

G

-

D

A

A

K

A

W

W

F

F

K

L

S

G

G

G

S

E

L

L

N

N

A

A

S

S

Y

Y

N

N

C

C

V

V

D

D

R

R

H

H

I

A

K

F

G

A

N

N

R

P

R

-

N

D

K

K

A

P

A

A

I

L

I

I

C

C

E

E

K

A

E

D

D

D

-

E

G

K

S

D

C

S

G

H

I

I

L

L

T

T

Y

Y

Y

G

E

D

L

L

Y

L

R

R

E

E

I

V

N

S

K

K

F

V

A

A

N

G

V

V

L

L

E

Q

N

S

L

W

G

G

V

I

E

K

K

K

G

G

D

D

V

T

V

V

T

A

I

V

Y

Y

M

L

P

P

M

M

M

N

T

A

E

Q

A

A

I

I

I

I

A

A

M

M

L

L

A

A

C

I

S

A

R

R

I

L

G

G

V

A

I

A

H

H

N

S

V

V

V

I

F

F

S

A

G

G

F

F

S

S

S

A

D

G

A

S

L

I

A

K

D

D

R

R

I

V

N

N

D

D

S

A

K

S

S

C

K

K

I

A

L

L

V

I

T

T

T

C

N

D

L

E

L

G

Y

K

R

R

R

G

G

G

K

R

E

T

I

T

E

N

L

I

K

K

K

K

I

L

L

C

D

D

K

E

A

A

L

L

L

V

N

D

C

C

N

P

S

T

I

V

K

E

H

K

V

V

-

L

V

V

Y

Y

V

K

K

R

R

T

G

N

I

N

E

P

E

E

F

I

N

H

L

L

V

T

S

E

G

G

K

R

E

D

Y

Y

F

Y

W

W

D

D

E

V

L

E

M

T

G

A

G

K

A

F

K

P

S

G

Y

Y

V

L

E

P

P

P

V

V

P

S

V

V

E

N

S

S

D

E

H

D

P

P

L

L

F

F

I

L

L

L

Y

Y

T

T

S

S

G

G

T

S

T

T

G

G

S

T

P

P

K

K

G

G

V

V

V

V

H

H

S

S

T

T

G

A

G

G

Y

Y

L

L

T

L

Y

G

A

A

T

A

K

L

T

S

M

T

D

K

W

Y

T

I

W

F

G

D

L

I

N

H

E

P

M

E

D

D

V

I

F

L

W

F

C

T

T

A

A

G

D

D

I

V

G

G

W

W

I

I

T

T

G

G

H

H

T

T

Y

Y

V

A

V

L

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

L

L

L

G

G

A

V

T

P

I

T

V

I

L

I

Y

F

E

E

G

G

A

T

I

P

D

A

Y

Y

P

P

E

D

P

Y

D

G

R

R

L

F

W

W

G

Q

I

I

V

V

E

E

N

K

H

H

G

K

V

A

T

T

L

H

L

F

Y

Y

T

V

A

A

P

P

T

T

A

A

I

L

R

R

M

L

L

L

M

R

M

K

Y

A

G

G

E

E

K

Q

W

E

V

I

N

A

T

K

H

Y

D

D

L

L

S

S

T

S

L

L

R

R

L

T

L

L

G

G

S

S

V

V

G
|
G

E
|
E

P
|
P

I

I

N

S

P

P

R

D

A

I

W

W

K

E

W

W

Y

Y

Y

N

K

E

V

F

I

V

G

G

K

K

E

N

K

Q

C

C

P

H

I

I

C

S

D

D

C
x
T

Y
|
Y

W
|
W

Q
|
Q

T
|
T

E

E

T

S

G

G

G

S

H

H

M

L

I

I

Y

A

P

P

A

L

I

A

G

G

I

V

Q

-

S

-

V

V

P

P

L

N

K

K

P

P

G

G

S

S

A

A

T

S

F

Y

P

P

G

F

I

F

G

G

I

I

D

D

V

A

D

A

V

L

V

I

D

D

N

P

-

V

E

T

G

G

N

V

P

E

V

I

E

E

A

G

N

N

-

D

I

A

K

E

G

G

N

V

L

L

I

A

I

I

K

K

R

D

P

H

W

W

P

P

G

S

M

M

L

A

A

R

G

T

L

V

W

Y

N

K

N

N

D

H

E

T

R

K

Y

Y

R

M

A

D

A

T

Y

Y

W

M

D

N

R

P

F

Y

K

P

N

G

N

Y

F

Y

S

F

T

T

S

G

D
|
D

Y

G

A

A

I

A

K

R

D

D

Q

H

D

D

G

G

Y

Y

I

Y

W

W

V

I

L

R

G

G

R
|
R

S

V

D

D

E

D

V

V

L

V

N

N

V

V

S

S

G

G

H

H

R
|
R

I

L

G

S

T

T

A

A

E

E

L

I

E

E

H

A

E

A

L

L

V

I

S

E

N

D

K

K

M

K

V

V

A

S

E

E

S

A

A

A

V

V

V

V

G

G

K

I

P

H

D

D

D

D

V

I

K

T

G

G

E

Q

V

A

P

V

V

I

A

A

F

Y

V

V

I

A

L

L

N

K

E

E

R

G

Y

N

R

S

E

D

L

E

P

D

S

S

N

E

E

G

V

L

K

R

A

K

T

E

L

L

I

V

R

L

H

Q

I

V

R

R

D

K

T

T

V

I

G

G

P

P

I

F

G

A

T

A

P

P

A

K

M

S

I

V

F

I

F

I

V

V

N

Q

K

D

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K

K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

I

L

L

K

R

K

K

L

V

I

S

I

S

G

N

E

E

-

A

-

D

E

Q

I

L

G

G

D

D

V

I

T

S

T

T

L

L

E

S

D

N

N

P

T

Q

S

S

L

V

E

E

D

G

V

I

binding 5'-O-[(S)-(cyclopentyloxy)(hydroxy)phosphoryl]adenosine: G399 (= G370), E400 (= E371), P401 (= P372), T424 (≠ C395), Y425 (= Y396), W426 (= W397), Q427 (= Q398), T428 (= T399), D514 (= D485), R529 (= R500), R540 (= R511)

8w0bA Crystal structure of acetyl-coa synthetase 2 from candida albicans in complex with a cyclopropyl amp ester inhibitor
45% identity, 97% coverage: 10:626/636 of query aligns to 35:657/667 of 8w0bA

query
sites
8w0bA

L

V

E

N

K

Q

Y

Y

S

K

E

Q

M

M

Q

Y

Q

E

K

Q

A

S

L

I

E

K

D

D

P

P

E

Q

K

G

F

F

W

F

G

G

E

P

Q

L

A

A

K

K

-

E

C

L

L

L

E

S

W

W

D

D

K

H

T

D

W

F

D

H

N

T

V

V

L

K

E

S

W

G

N

T

P

L

P

K

Y

N

-

G

-

D

A

A

K

A

W

W

F

F

K

L

S

G

G

G

S

E

L

L

N

N

A

A

S

S

Y

Y

N

N

C

C

V

V

D

D

R

R

H

H

I

A

K

F

G

A

N

N

R

P

R

-

N

D

K

K

A

P

A

A

I

L

I

I

C

C

E

E

K

A

E

D

D

D

-

E

G

K

S

D

C

S

G

H

I

I

L

L

T

T

Y

Y

Y

G

E

D

L

L

Y

L

R

R

E

E

I

V

N

S

K

K

F

V

A

A

N

G

V

V

L

L

E

Q

N

S

L

W

G

G

V

I

E

K

K

K

G

G

D

D

V

T

V

V

T

A

I

V

Y

Y

M

L

P

P

M

M

M

N

T

A

E

Q

A

A

I

I

I

I

A

A

M

M

L

L

A

A

C

I

S

A

R

R

I

L

G

G

V

A

I

A

H

H

N

S

V

V

V

I

F

F

S

A

G

G

F

F

S

S

S

A

D

G

A

S

L

I

A

K

D

D

R

R

I

V

N

N

D

D

S

A

K

S

S

C

K

K

I

A

L

L

V

I

T

T

T

C

N

D

L

E

L

G

Y

K

R

R

R

G

G

G

K

R

E

T

I

T

E

N

L

I

K

K

K

K

I

L

L

C

D

D

K

E

A

A

L

L

L

V

N

D

C

C

N

P

S

T

I

V

K

E

H

K

V

V

-

L

V

V

Y

Y

V

K

K

R

R

T

G

N

I

N

E

P

E

E

F

I

N

H

L

L

V

T

S

E

G

G

K

R

E

D

Y

Y

F

Y

W

W

D

D

E

V

L

E

M

T

G

A

G

K

A

F

K

P

S

G

Y

Y

V

L

E

P

P

P

V

V

P

S

V

V

E

N

S

S

D

E

H

D

P

P

L

L

F

F

I

L

L

L

Y

Y

T

T

S

S

G

G

T

S

T

T

G

G

S

T

P

P

K

K

G

G

V

V

V

V

H

H

S

S

T

T

G

A

G

G

Y

Y

L

L

T

L

Y

G

A

A

T

A

K

L

T

S

M

T

D

K

W

Y

T

I

W

F

G

D

L

I

N

H

E

P

M

E

D

D

V

I

F

L

W

F

C

T

T

A

A

G

D

D

I

V

G

G

W

W

I

I

T

T

G

G

H

H

T

T

Y

Y

V

A

V

L

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

L

L

L

G

G

A

V

T

P

I

T

V

I

L

I

Y

F

E

E

G

G

A

T

I

P

D

A

Y

Y

P

P

E

D

P

Y

D

G

R

R

L

F

W

W

G

Q

I

I

V

V

E

E

N

K

H

H

G

K

V

A

T

T

L

H

L

F

Y

Y

T

V

A

A

P

P

T

T

A

A

I

L

R

R

M

L

L

L

M

R

M

K

Y

A

G

G

E

E

K

Q

W

E

V

I

N

A

T

K

H

Y

D

D

L

L

S

S

T

S

L

L

R

R

L

T

L

L

G

G

S

S

V
|
V

G
|
G

E
|
E

P
|
P

I

I

N

S

P

P

R

D

A

I

W

W

K

E

W

W

Y

Y

Y

N

K

E

V

F

I

V

G

G

K

K

E

N

K

Q

C

C

P

H

I

I

C

S

D

D

C
x
T

Y
|
Y

W
|
W

Q
|
Q

T
|
T

E

E

T

S

G

G

G

S

H

H

M

L

I

I

Y

A

P

P

A

L

I

A

G

G

I

V

Q

-

S

-

V

V

P

P

L

N

K

K

P

P

G

G

S

S

A

A

T

S

F

Y

P

P

G

F

I

F

G

G

I

I

D

D

V

A

D

A

V

L

V

I

D

D

N

P

-

V

E

T

G

G

N

V

P

E

V

I

E

E

A

G

N

N

-

D

I

A

K

E

G

G

N

V

L

L

I

A

I

I

K

K

R

D

P

H

W

W

P

P

G

S

M

M

L

A

A

R

G

T

L

V

W

Y

N

K

N

N

D

H

E

T

R

K

Y

Y

R

M

A

D

A

T

Y

Y

W

M

D

N

R

P

F

Y

K

P

N

G

N

Y

F

Y

S

F

T

T

S

G

D
|
D

Y

G

A

A

I

A

K

R

D

D

Q

H

D

D

G

G

Y

Y

I

Y

W

W

V
x
I

L

R

G

G

R
|
R

S

V

D

D

E

D

V

V

L

V

N

N

V

V

S

S

G

G

H

H

R
|
R

I

L

G

S

T

T

A

A

E

E

L

I

E

E

H

A

E

A

L

L

V

I

S

E

N

D

K

K

M

K

V

V

A

S

E

E

S

A

A

A

V

V

V

V

G

G

K

I

P

H

D

D

D

D

V

I

K

T

G

G

E

Q

V

A

P

V

V

I

A

A

F

Y

V

V

I

A

L

L

N

K

E

E

R

G

Y

N

R

S

E

D

L

E

P

D

S

S

N

E

E

G

V

L

K

R

A

K

T

E

L

L

I

V

R

L

H

Q

I

V

R

R

D

K

T

T

V

I

G

G

P

P

I

F

G

A

T

A

P

P

A

K

M

S

I

V

F

I

F

I

V

V

N

Q

K

D

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K

K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

I

L

L

K

R

K

K

L

V

I

S

I

S

G

N

E

E

-

A

-

D

E

Q

I

L

G

G

D

D

V

I

T

S

T

T

L

L

E

S

D

N

N

P

T

Q

S

S

L

V

E

E

D

G

V

I

binding 5'-O-[(R)-(cyclopropyloxy)(hydroxy)phosphoryl]adenosine: V398 (= V369), G399 (= G370), E400 (= E371), P401 (= P372), T424 (≠ C395), Y425 (= Y396), W426 (= W397), Q427 (= Q398), T428 (= T399), D514 (= D485), I526 (≠ V497), R529 (= R500), R540 (= R511)

8w0jA Crystal structure of acetyl-coa synthetase 2 from candida albicans in complex with a propyne amp ester inhibitor
45% identity, 97% coverage: 10:626/636 of query aligns to 35:652/662 of 8w0jA

query
sites
8w0jA

L

V

E

N

K

Q

Y

Y

S

K

E

Q

M

M

Q

Y

Q

E

K

Q

A

S

L

I

E

K

D

D

P

P

E

Q

K

G

F

F

W

F

G

G

E

P

Q

L

A

A

K

K

-

E

C

L

L

L

E

S

W

W

D

D

K

H

T

D

W

F

D

H

N

T

V

V

L

K

E

S

W

G

N

T

P

L

P

K

Y

N

-

G

-

D

A

A

K

A

W

W

F

F

K

L

S

G

G

G

S

E

L

L

N

N

A

A

S

S

Y

Y

N

N

C

C

V

V

D

D

R

R

H

H

I

A

K

F

G

A

N

N

R

P

R

-

N

D

K

K

A

P

A

A

I

L

I

I

C

C

E

E

K

A

E

D

D

D

-

E

G

K

S

D

C

S

G

H

I

I

L

L

T

T

Y

Y

Y

G

E

D

L

L

Y

L

R

R

E

E

I

V

N

S

K

K

F

V

A

A

N

G

V

V

L

L

E

Q

N

S

L

W

G

G

V

I

E

K

K

K

G

G

D

D

V

T

V

V

T

A

I

V

Y

Y

M

L

P

P

M

M

M

N

T

A

E

Q

A

A

I

I

I

I

A

A

M

M

L

L

A

A

C

I

S

A

R

R

I

L

G

G

V

A

I

A

H

H

N

S

V

V

V

I

F

F

S

A

G

G

F

F

S

S

S

A

D

G

A

S

L

I

A

K

D

D

R

R

I

V

N

N

D

D

S

A

K

S

S

C

K

K

I

A

L

L

V

I

T

T

T

C

N

D

L

E

L

G

Y

K

R

R

R

G

G

G

K

R

E

T

I

T

E

N

L

I

K

K

K

K

I

L

L

C

D

D

K

E

A

A

L

L

L

V

N

D

C

C

N

P

S

T

I

V

K

E

H

K

V

V

-

L

V

V

Y

Y

V

K

K

R

R

T

G

N

I

N

E

P

E

E

F

I

N

H

L

L

V

T

S

E

G

G

K

R

E

D

Y

Y

F

Y

W

W

D

D

E

V

L

E

M

T

G

A

G

K

A

F

K

P

S

G

Y

Y

V

L

E

P

P

P

V

V

P

S

V

V

E

N

S

S

D

E

H

D

P

P

L

L

F

F

I

L

L

L

Y

Y

T

T

S

S

G

G

T

S

T

T

G

G

S

T

P

P

K

K

G

G

V

V

V

V

H

H

S

S

T

T

G

A

G

G

Y

Y

L

L

T

L

Y

G

A

A

T

A

K

L

T

S

M

T

D

K

W

Y

T

I

W

F

G

D

L

I

N

H

E

P

M

E

D

D

V

I

F

L

W

F

C

T

T

A

A

G

D

D

I

V

G

G

W

W

I

I

T

T

G

G

H

H

T

T

Y

Y

V

A

V

L

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

L

L

L

G

G

A

V

T

P

I

T

V

I

L

I

Y

F

E

E

G

G

A

T

I

P

D

A

Y

Y

P

P

E

D

P

Y

D

G

R

R

L

F

W

W

G

Q

I

I

V

V

E

E

N

K

H

H

G

K

V

A

T

T

L

H

L

F

Y

Y

T

V

A

A

P

P

T

T

A

A

I

L

R

R

M

L

L

L

M

R

M

K

Y

A

G

G

E

E

K

Q

W

E

V

I

N

A

T

K

H

Y

D

D

L

L

S

S

T

S

L

L

R

R

L

T

L

L

G

G

S

S

V

V

G
|
G

E
|
E

P
|
P

I

I

N

S

P

P

R

D

A

I

W

W

K

E

W

W

Y

Y

Y

N

K

E

V

F

I

V

G

G

K

K

E

N

K

Q

C

C

P

H

I

I

C

S

D

D

C
x
T

Y
|
Y

W
|
W

Q
|
Q

T
|
T

E

E

T

S

G

G

G

S

H

H

M

L

I

I

Y

A

P

P

A

L

I

A

G

G

I

V

Q

-

S

-

V

V

P

P

L

N

K

K

P

P

G

G

S

S

A

A

T

S

F

Y

P

P

G

F

I

F

G

G

I

I

D

D

V

A

D

A

V

L

V

I

D

D

N

P

-

V

E

T

G

G

N

V

P

E

V

I

E

E

A

G

N

N

-

D

I

A

K

E

G

G

N

V

L

L

I

A

I

I

K

K

R

D

P

H

W

W

P

P

G

S

M

M

L

A

A

R

G

T

L

V

W

Y

N

K

N

N

D

H

E

T

R

K

Y

Y

R

M

A

D

A

T

Y

Y

W

M

D

N

R

P

F

Y

K

P

N

G

N

Y

F

Y

S

F

T

T

S

G

D
|
D

Y

G

A

A

I

A

K

R

D

D

Q

H

D

D

G

G

Y

Y

I

Y

W

W

V
x
I

L

R

G

G

R
|
R

S

V

D

D

E

D

V

V

L

V

N

N

V

V

S

S

G

G

H

H

R
|
R

I

L

G

S

T

T

A

A

E

E

L

I

E

E

H

A

E

A

L

L

V

I

S

E

N

D

K

K

M

K

V

V

A

S

E

E

S

A

A

A

V

V

V

V

G

G

K

I

P

H

D

D

D

D

V

I

K

T

G

G

E

Q

V

A

P

V

V

I

A

A

F

Y

V

V

I

A

L

L

N

K

E

E

R

D

Y

-

R

-

E

-

L

-

P

-

S

S

N

E

E

G

V

L

K

R

A

K

T

E

L

L

I

V

R

L

H

Q

I

V

R

R

D

K

T

T

V

I

G

G

P

P

I

F

G

A

T

A

P

P

A

K

M

S

I

V

F

I

F

I

V

V

N

Q

K

D

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K

K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

I

L

L

K

R

K

K

L

V

I

S

I

S

G

N

E

E

-

A

-

D

E

Q

I

L

G

G

D

D

V

I

T

S

T

T

L

L

E

S

D

N

N

P

T

Q

S

S

L

V

E

E

D

G

V

I

binding 5'-O-{(S)-hydroxy[(prop-2-yn-1-yl)oxy]phosphoryl}adenosine: G399 (= G370), E400 (= E371), P401 (= P372), T424 (≠ C395), Y425 (= Y396), W426 (= W397), Q427 (= Q398), T428 (= T399), D514 (= D485), I526 (≠ V497), R529 (= R500), R540 (= R511)

8v4pA Crystal structure of acetyl-coa synthetase 2 in complex with adenosine-5'-allylphosphate from candida albicans
45% identity, 97% coverage: 10:626/636 of query aligns to 34:651/660 of 8v4pA

query
sites
8v4pA

L

V

E

N

K

Q

Y

Y

S

K

E

Q

M

M

Q

Y

Q

E

K

Q

A

S

L

I

E

K

D

D

P

P

E

Q

K

G

F

F

W

F

G

G

E

P

Q

L

A

A

K

K

-

E

C

L

L

L

E

S

W

W

D

D

K

H

T

D

W

F

D

H

N

T

V

V

L

K

E

S

W

G

N

T

P

L

P

K

Y

N

-

G

-

D

A

A

K

A

W

W

F

F

K

L

S

G

G

G

S

E

L

L

N

N

A

A

S

S

Y

Y

N

N

C

C

V

V

D

D

R

R

H

H

I

A

K

F

G

A

N

N

R

P

R

-

N

D

K

K

A

P

A

A

I

L

I

I

C

C

E

E

K

A

E

D

D

D

-

E

G

K

S

D

C

S

G

H

I

I

L

L

T

T

Y

Y

Y

G

E

D

L

L

Y

L

R

R

E

E

I

V

N

S

K

K

F

V

A

A

N

G

V

V

L

L

E

Q

N

S

L

W

G

G

V

I

E

K

K

K

G

G

D

D

V

T

V

V

T

A

I

V

Y

Y

M

L

P
|
P

M

M

M

N

T

A

E

Q

A

A

I

I

I

I

A

A

M

M

L

L

A

A

C

I

S

A

R

R

I

L

G

G

V

A

I

A

H

H

N

S

V

V

V

I

F

F

S
x
A

G
|
G

F

F

S

S

S

A

D

G

A

S

L

I

A

K

D

D

R

R

I

V

N

N

D

D

S

A

K

S

S

C

K

K

I

A

L

L

V

I

T

T

T

C

N

D

L

E

L

G

Y

K

R
|
R

R

G

G

G

K

R

E

T

I
x
T

E

N

L

I

K

K

K

K

I

L

L

C

D

D

K

E

A

A

L

L

L

V

N

D

C

C

N

P

S

T

I

V

K

E

H

K

V

V

-

L

V

V

Y

Y

V

K

K

R

R

T

G

N

I

N

E

P

E

E

F

I

N

H

L

L

V

T

S

E

G

G

K

R

E

D

Y

Y

F

Y

W

W

D

D

E

V

L

E

M

T

G

A

G

K

A

F

K

P

S

G

Y

Y

V

L

E

P

P

P

V

V

P

S

V

V

E

N

S

S

D

E

H

D

P

P

L

L

F

F

I

L

L

L

Y

Y

T

T

S

S

G

G

T

S

T

T

G

G

S

T

P

P

K

K

G

G

V

V

V

V

H

H

S

S

T

T

G

A

G

G

Y

Y

L

L

T

L

Y

G

A

A

T

A

K

L

T

S

M

T

D

K

W

Y

T

I

W

F

G

D

L

I

N

H

E

P

M

E

D

D

V

I

F

L

W

F

C

T

T

A

A

G

D
|
D

I

V

G

G

W

W

I

I

T

T

G

G

H

H

T

T

Y

Y

V

A

V

L

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

L

L

L

G

G

A

V

T

P

I

T

V

I

L

I

Y

F

E
|
E

G
|
G

A

T

I
x
P

D

A

Y

Y

P

P

E

D

P

Y

D

G

R

R

L

F

W

W

G

Q

I

I

V

V

E

E

N

K

H

H

G

K

V

A

T

T

L

H

L

F

Y

Y

T

V

A

A

P

P

T

T

A

A

I

L

R

R

M

L

L

L

M

R

M

K

Y

A

G

G

E

E

K

Q

W

E

V

I

N

A

T

K

H

Y

D

D

L

L

S

S

T

S

L

L

R

R

L

T

L

L

G

G

S

S

V

V

G
|
G

E
|
E

P
|
P

I

I

N

S

P

P

R

D

A

I

W

W

K

E

W

W

Y

Y

Y

N

K

E

V

F

I

V

G

G

K

K

E

N

K

Q

C

C

P

H

I

I

C

S

D

D

C
x
T

Y

Y

W
|
W

Q
|
Q

T
|
T

E

E

T

S

G

G

G

S

H

H

M

L

I

I

Y

A

P

P

A

L

I

A

G

G

I

V

Q

-

S

-

V

V

P

P

L

N

K

K

P

P

G

G

S

S

A

A

T

S

F

Y

P

P

G

F

I

F

G

G

I

I

D

D

V

A

D

A

V

L

V

I

D

D

N

P

-

V

E

T

G

G

N

V

P

E

V

I

E

E

A

G

N

N

-

D

I

A

K

E

G

G

N

V

L

L

I

A

I

I

K

K

R

D

P

H

W

W

P

P

G

S

M

M

L

A

A

R

G

T

L

V

W

Y

N

K

N

N

D

H

E

T

R

K

Y

Y

R

M

A

D

A

T

Y

Y

W

M

D

N

R

P

F

Y

K

P

N

G

N

Y

F

Y

S

F

T

T

S

G

D
|
D

Y

G

A

A

I

A

K

R

D

D

Q

H

D

D

G

G

Y

Y

I

Y

W

W

V
x
I

L

R

G

G

R
|
R

S

V

D

D

E

D

V

V

L

V

N

N

V

V

S

S

G

G

H

H

R
|
R

I

L

G

S

T

T

A

A

E

E

L

I

E

E

H

A

E

A

L

L

V

I

S

E

N

D

K

K

M

K

V

V

A

S

E

E

S

A

A

A

V

V

V

V

G

G

K

I

P

H

D

D

D

D

V

I

K

T

G

G

E

Q

V

A

P

V

V

I

A

A

F

Y

V

V

I

A

L

L

N

K

E

E

R

D

Y

-

R

-

E

-

L

-

P

-

S

S

N

E

E

G

V

L

K

R

A

K

T

E

L

L

I

V

R

L

H

Q

I

V

R

R

D

K

T

T

V

I

G

G

P

P

I

F

G

A

T

A

P

P

A

K

M

S

I

V

F

I

F

I

V

V

N

Q

K

D

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K

K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

I

L

L

K

R

K

K

L

V

I

S

I

S

G

N

E

E

-

A

-

D

E

Q

I

L

G

G

D

D

V

I

T

S

T

T

L

L

E

S

D

N

N

P

T

Q

S

S

L

V

E

E

D

G

V

I

binding 5'-O-{(S)-hydroxy[(prop-2-en-1-yl)oxy]phosphoryl}adenosine: P152 (= P125), A176 (≠ S149), G177 (= G150), R203 (= R176), T208 (≠ I181), D317 (= D289), E342 (= E314), G343 (= G315), P345 (≠ I317), G398 (= G370), E399 (= E371), P400 (= P372), T423 (≠ C395), W425 (= W397), Q426 (= Q398), T427 (= T399), D513 (= D485), I525 (≠ V497), R528 (= R500), R539 (= R511)

8v4oA Crystal structure of acetyl-coa synthetase 2 in complex with amp from candida albicans
45% identity, 97% coverage: 10:626/636 of query aligns to 34:651/660 of 8v4oA

query
sites
8v4oA

L

V

E

N

K

Q

Y

Y

S

K

E

Q

M

M

Q

Y

Q

E

K

Q

A

S

L

I

E

K

D

D

P

P

E

Q

K

G

F

F

W

F

G

G

E

P

Q

L

A

A

K

K

-

E

C

L

L

L

E

S

W

W

D

D

K

H

T

D

W

F

D

H

N

T

V

V

L

K

E

S

W

G

N

T

P

L

P

K

Y

N

-

G

-

D

A

A

K

A

W

W

F

F

K

L

S

G

G

G

S

E

L

L

N

N

A

A

S

S

Y

Y

N

N

C

C

V

V

D

D

R

R

H

H

I

A

K

F

G

A

N

N

R

P

R

-

N

D

K

K

A

P

A

A

I

L

I

I

C

C

E

E

K

A

E

D

D

D

-

E

G

K

S

D

C

S

G

H

I

I

L

L

T

T

Y

Y

Y

G

E

D

L

L

Y

L

R

R

E

E

I

V

N

S

K

K

F

V

A

A

N

G

V

V

L

L

E

Q

N

S

L

W

G

G

V

I

E

K

K

K

G

G

D

D

V

T

V

V

T

A

I

V

Y

Y

M

L

P

P

M

M

M

N

T

A

E

Q

A

A

I

I

I

I

A

A

M

M

L

L

A

A

C

I

S

A

R

R

I

L

G

G

V

A

I

A

H

H

N

S

V

V

V

I

F

F

S

A

G

G

F

F

S

S

S

A

D

G

A

S

L

I

A

K

D

D

R

R

I

V

N

N

D

D

S

A

K

S

S

C

K

K

I

A

L

L

V

I

T

T

T

C

N

D

L

E

L

G

Y

K

R

R

R

G

G

G

K

R

E

T

I

T

E

N

L

I

K

K

K

K

I

L

L

C

D

D

K

E

A

A

L

L

L

V

N

D

C

C

N

P

S

T

I

V

K

E

H

K

V

V

-

L

V

V

Y

Y

V

K

K

R

R

T

G

N

I

N

E

P

E

E

F

I

N

H

L

L

V

T

S

E

G

G

K

R

E

D

Y

Y

F

Y

W

W

D

D

E

V

L

E

M

T

G

A

G

K

A

F

K

P

S

G

Y

Y

V

L

E

P

P

P

V

V

P

S

V

V

E

N

S

S

D

E

H

D

P

P

L

L

F

F

I

L

L

L

Y

Y

T

T

S

S

G

G

T

S

T

T

G

G

S

T

P

P

K

K

G

G

V

V

V

V

H

H

S

S

T

T

G

A

G

G

Y

Y

L

L

T

L

Y

G

A

A

T

A

K

L

T

S

M

T

D

K

W

Y

T

I

W

F

G

D

L

I

N

H

E

P

M

E

D

D

V

I

F

L

W

F

C

T

T

A

A

G

D

D

I

V

G

G

W

W

I

I

T

T

G

G

H

H

T

T

Y

Y

V

A

V

L

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

L

L

L

G

G

A

V

T

P

I

T

V

I

L

I

Y

F

E

E

G

G

A

T

I

P

D

A

Y

Y

P

P

E

D

P

Y

D

G

R

R

L

F

W

W

G

Q

I

I

V

V

E

E

N

K

H

H

G

K

V

A

T

T

L

H

L

F

Y

Y

T

V

A

A

P

P

T

T

A

A

I

L

R

R

M

L

L

L

M

R

M

K

Y

A

G

G

E

E

K

Q

W

E

V

I

N

A

T

K

H

Y

D

D

L

L

S

S

T

S

L

L

R

R

L

T

L

L

G

G

S

S

V

V

G
|
G

E
|
E

P
|
P

I

I

N

S

P

P

R

D

A

I

W

W

K

E

W

W

Y

Y

Y

N

K

E

V

F

I

V

G

G

K

K

E

N

K

Q

C

C

P

H

I

I

C

S

D

D

C
x
T

Y
|
Y

W
|
W

Q
|
Q

T
|
T

E

E

T

S

G

G

G

S

H

H

M

L

I

I

Y

A

P

P

A

L

I

A

G

G

I

V

Q

-

S

-

V

V

P

P

L

N

K

K

P

P

G

G

S

S

A

A

T

S

F

Y

P

P

G

F

I

F

G

G

I

I

D

D

V

A

D

A

V

L

V

I

D

D

N

P

-

V

E

T

G

G

N

V

P

E

V

I

E

E

A

G

N

N

-

D

I

A

K

E

G

G

N

V

L

L

I

A

I

I

K

K

R

D

P

H

W

W

P

P

G

S

M

M

L

A

A

R

G

T

L

V

W

Y

N

K

N

N

D

H

E

T

R

K

Y

Y

R

M

A

D

A

T

Y

Y

W

M

D

N

R

P

F

Y

K

P

N

G

N

Y

F

Y

S

F

T

T

S

G

D
|
D

Y

G

A

A

I

A

K

R

D

D

Q

H

D

D

G

G

Y

Y

I

Y

W

W

V
x
I

L

R

G

G

R
|
R

S

V

D

D

E

D

V

V

L

V

N

N

V

V

S

S

G

G

H

H

R
|
R

I

L

G

S

T

T

A

A

E

E

L

I

E

E

H

A

E

A

L

L

V

I

S

E

N

D

K

K

M

K

V

V

A

S

E

E

S

A

A

A

V

V

V

V

G

G

K

I

P

H

D

D

D

D

V

I

K

T

G

G

E

Q

V

A

P

V

V

I

A

A

F

Y

V

V

I

A

L

L

N

K

E

E

R

D

Y

-

R

-

E

-

L

-

P

-

S

S

N

E

E

G

V

L

K

R

A

K

T

E

L

L

I

V

R

L

H

Q

I

V

R

R

D

K

T

T

V

I

G

G

P

P

I

F

G

A

T

A

P

P

A

K

M

S

I

V

F

I

F

I

V

V

N

Q

K

D

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K

K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

I

L

L

K

R

K

K

L

V

I

S

I

S

G

N

E

E

-

A

-

D

E

Q

I

L

G

G

D

D

V

I

T

S

T

T

L

L

E

S

D

N

N

P

T

Q

S

S

L

V

E

E

D

G

V

I

binding adenosine monophosphate: G398 (= G370), E399 (= E371), P400 (= P372), T423 (≠ C395), Y424 (= Y396), W425 (= W397), Q426 (= Q398), T427 (= T399), D513 (= D485), I525 (≠ V497), R528 (= R500), R539 (= R511)

8rwjD Cryoem structure of acs1 filament determined by filamentid (see paper)
46% identity, 96% coverage: 10:619/636 of query aligns to 36:663/676 of 8rwjD

query
sites
8rwjD

L

L

E

Q

K

D

Y

Y

S

Q

E

R

M

L

Q

H

Q

K

K

E

A

S

L

I

E

E

D

D

P

P

E

A

K

K

F

F

W

F

G

G

E

S

Q

K

A

A

-

T

K

Q

C

F

L

L

E

N

W

W

D

S

K

K

T

P

W

F

D

D

N

K

V

V

L

F

-

I

-

P

-

D

-

S

-

K

E

T

W

G

N

R

P

P

P

S

Y

F

A

Q

K

N

-

N

-

A

W

W

F

F

K

L

S

N

G

G

S

Q

L

L

N

N

A

A

S

C

Y

Y

N

N

C

C

V

V

D

D

R

R

H

H

I

A

K

L

G

K

N

T

R

P

R

N

N

K

K

K

A

A

A

I

I

I

I

F

C

E

E

G

K

D

E

E

D

P

G

G

S

Q

C

G

G

Y

I

S

L

I

T

T

Y

Y

Y

K

E

E

L

L

Y

L

R

E

E

E

I

V

N

C

K

Q

F

V

A

A

N

Q

V

V

L

L

E

T

-

Y

N

S

L

M

G

G

V

V

E

R

K

K

G

G

D

D

V

T

V

V

T

A

I

V

Y

Y

M

M

P

P

M

M

M

V

T

P

E

E

A

A

I

I

I

I

A

T

M

L

L

L

A

A

C

I

S

S

R

R

I

I

G

G

V

A

I

I

H

H

N

S

V

V

V

V

F

F

S

A

G

G

F

F

S

S

S

S

D

N

A

S

L

L

A

R

D

D

R

R

I

I

N

N

D

D

S

G

K

D

S

S

K

K

I

V

L

V

V

I

T

T

T

T

N

D

L

E

L

S

Y

N

R

R

R

G

G

G

K

K

E

V

I

I

E

E

L

T

K

K

K

R

I

I

L

V

D

D

K

D

A

A

L

L

L

R

N

E

C

T

N

P

S

G

I

V

K

R

H

H

V

V

-

L

V

V

Y

Y

V

R

K

K

R

T

G

N

I

N

E

P

E

S

F

V

N

A

L

F

V

H

S

A

G

P

K

R

E

D

Y

L

F

D

W

W

D

A

E

T

L

E

M

K

G

K

G

K

A

Y

K

K

S

T

Y

Y

V

Y

E

P

P

C

V

T

P

P

V

V

E

D

S

S

D

E

H

D

P

P

L

L

F

F

I

L

L

L

Y

Y

T

T

S

S

G

G

T

S

T

T

G

G

S

A

P

P

K

K

G

G

V

V

V

Q

H

H

S

S

T

T

G

A

G

G

Y

Y

L

L

T

L

Y

G

A

A

T

L

K

L

T

T

M

M

D

R

W

Y

T

T

W

F

G

D

L

T

N

H

E

Q

M

E

D

D

V

V

F

F

W

F

C

T

T

A

A

G

D

D

I

I

G

G

W

W

I

I

T

T

G

G

H

H

T

T

Y

Y

V

V

V

V

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

L

L

Y

G

G

A

C

T

A

I

T

V

L

L

V

Y

F

E

E

G

G

A

T

I

P

D

A

Y

Y

P

P

E

N

P

Y

D

S

R

R

L

Y

W

W

G

D

I

I

V

I

E

D

N

E

H

H

G

K

V

V

T

T

L

Q

L

F

Y

Y

T

V

A

A

P

P

T

T

A

A

I

L

R

R

M

L

L

L

M

K

M

R

Y

A

G

G

E

D

K

S

W

Y

V

I

N

E

T

N

H

H

D

S

L

L

S

K

T

S

L

L

R

R

L

C

L

L

G

G

S

S

V

V

G
|
G

E

E

P
|
P

I

I

N

A

P

A

R

E

A

V

W

W

K

E

W

W

Y

Y

Y

S

K

E

V

K

I

I

G

G

K

K

E

N

K

E

C

I

P

P

I

I

C

V

D

D

C
x
T

Y
|
Y

W

W

Q
|
Q

T
|
T

E

E

T

S

G

G

G

S

H

H

M

L

I

V

Y

T

P

P

A

L

I

A

G

G

I

-

Q

G

S

V

V

T

P

P

L

M

K

K

P

P

G

G

S

S

A

A

T

S

F

F

P

P

G

F

I

F

G

G

I

I

D

D

V

A

D

V

V

V

V

L

D

D

-

P

N

N

E

T

G

G

N

E

P

E

V

L

E

N

-

T

A

S

N

H

I

A

K

E

G

G

N

V

L

L

I

A

I

V

K

K

R

A

P

A

W

W

P

P

G

S

M

F

L

A

A

R

G

T

L

I

W

W

N

K

N

N

D

H

E

D

R

R

Y

Y

R

L

A

D

A

T

Y

Y

W

L

D

N

R

P

F

Y

K

P

N

G

N

Y

F

Y

S

F

T

T

S

G

D
|
D

Y

G

A

A

I

A

K

K

D

D

Q

K

D

D

G

G

Y

Y

I

I

W

W

V

I

L

L

G

G

R
|
R

S

V

D

D

E

D

V

V

L

V

N

N

V

V

S

S

G

G

H

H

R

R

I

L

G

S

T

T

A

A

E

E

L

I

E

E

H

A

E

A

L

I

V

I

S

E

N

D

K

P

M

I

V

V

A

A

E

E

S

C

A

A

V

V

V

V

G

G

K

F

P

N

D

D

D

D

V

L

K

T

G

G

E

Q

V

A

P

V

V

A

A

A

F

F

V

V

I

V

L

L

N

K

E

N

R

K

Y

S

R

N

-

W

-

S

-

T

-

A

-

T

-

D

-

D

E

E

L

L

P

-

S

-

N

Q

E

D

V

I

K

K

A

K

T

H

L

L

I

V

R

F

H

T

I

V

R

R

D

K

T

D

V

I

G

G

P

P

I

F

G

A

T

A

P

P

A

K

M

L

I

I

F

I

F

L

V

V

N

D

K

D

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K
|
K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

I

L

L

K

R

K

K

L

I

I

L

I

A

G

G

E

E

-

S

-

D

E

Q

I

L

G

G

D

D

V

V

T

S

T

T

L

L

E

S

D

N

binding [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] ethanoate: G406 (= G370), P408 (= P372), T431 (≠ C395), Y432 (= Y396), Q434 (= Q398), T435 (= T399), D522 (= D485), R537 (= R500), K638 (= K596)

P78773 Probable acetyl-coenzyme A synthetase; Acetate--CoA ligase; Acyl-activating enzyme; EC 6.2.1.1 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
44% identity, 97% coverage: 10:626/636 of query aligns to 32:650/662 of P78773

query
sites
P78773

L

L

E

D

K

E

Y

Y

S

K

E

R

M

M

Q

Y

Q

E

K

E

A

S

L

I

E

N

D

D

P

P

E

S

K

T

F

F

W

W

G

G

E

N

Q

M

A

A

K

R

-

D

C

M

L

M

E

T

W

W

D

D

K

K

T

Q

W

F

D

S

N

T

V

V

L

V

E

Q

W

G

N

S

P

I

P

D

Y

K

A

A

-

D

-

S

K

A

W

W

F

F

K

A

S

D

G

G

S

A

L

I

N

S

A

P

S

C

Y

Y

N

N

C

L

V

V

D

D

R

R

H

H

I

A

K

I

G

A

N

-

R

R

R

P

N

D

K

A

A

V

A

A

I

L

I

I

C

Y

E

E

K

A

E

D

D

E

G

P

S

N

C

Q

G

G

-

R

I

Y

L

I

T

T

Y

Y

Y

R

E

E

L

L

Y

L

R

A

E

S

I

V

N

S

K

Q

F

C

A

A

N

G

V

A

L

L

E

Q

N

S

L

M

G

G

V

V

E

G

K

M

G

G

D

D

V

R

V

V

T

A

I

I

Y

Y

M

M

P

P

M

M

M

I

T

P

E

E

A

T

I

I

I

I

A

A

M

M

L

L

A

A

C

I

S

V

R

R

I

L

G

G

V

A

I

I

H

H

N

S

V

V

V

I

F

F

S

A

G

G

F

F

S

S

S

A

D

E

A

S

L

V

A

A

D

D

R

R

I

V

N

N

D

D

S

S

K

E

S

C

K

K

I

V

L

I

V

I

T

T

T

A

N

D

L

E

L

S

Y

H

R

R

R

G

G

G

K

K

E

R

I

I

E

P

L

L

K

K

K

G

I

V

L

V

D

N

K

K

A

A

L

L

L

T

N

E

C

C

N

P

S

T

I

I

K

K

H

K

V

V

V

L

Y

V

V

F

K

Q

R

R

G

S

I

A

E

E

E

P

-

T

F

A

N

S

L

M

V

V

S

E

G

G

K

R

E

D

Y

V

F

W

W

W

D

H

E

D

L

I

M

I

G

P

G

K

A

F

K

P

S

R

Y

Y

V

C

E

P

P

P

V

A

P

V

V

V

E

N

S

P

D

E

H

H

P

P

L

L

F

F

I

L

L

L

Y

Y

T

T

S

S

G

G

T

S

T

T

G

G

S

K

P

P

K

K

G

G

V

V

V

V

H

H

S

C

T

T

G

G

G

G

Y

Y

L

L

T

L

Y

G

A

A

T

A

K

A

T

T

M

C

D

K

W

Y

T

V

W

F

G

D

L

L

N

H

E

P

M

T

D

D

V

R

F

M

W

G

C

C

T

A

A

G

D

D

I

V

G

G

W

W

I

I

T

T

G

G

H

H

T

T

Y

Y

V

I

V

V

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

M

L

L

G

G

A

A

T

A

I

T

V

L

L

V

Y

F

E

E

G

S

A

T

I

P

D

A

Y

Y

P

P

E

D

P

Y

D

S

R

R

L

Y

W

W

G

S

I

V

V

V

E

E

N

R

H

H

G

R

V

L

T

T

L

Q

L

W

Y

Y

T

I

A

A

P

P

T

T

A

A

I

I

R

R

M

L

L

L

M

Q

M

R

Y

A

G

G

E

N

K

E

W

F

V

V

N

K

T

-

H

H

D

D

L

R

S

S

T

S

L

L

R

R

L

V

L

L

G

G

S

S

V

V

G

G

E

E

P

P

I

I

N

A

P

P

R

E

A

S

W

F

K

M

W

W

Y

Y

Y

Y

K

E

V

V

I

V

G

G

K

E

E

K

K

R

C

C

P

A

I

V

C

A

D

D

C

T

Y

Y

W

W

Q

Q

T

T

E

E

T

T

G

G

G

S

H

H

M

I

I

V

Y

T

P

-

A

S

I

L

G

G

I

-

Q

P

S

V

V

T

P

P

L

M

K

K

P

P

G

G

S

S

A

A

T

T

F

L

P

P

G

F

I

F

G

G

I

I

D

D

V

A

D

V

V

I

V

I

D

D

N

P

-

L

E

T

G

G

N

K

P

I

V

I

E

E

A

G

N

N

-

D

I

V

K

E

G

G

N

V

L

L

I

A

I

I

K

R

R

S

P

P

W

W

P

P

G

S

M

A

L

A

A

R

G

T

L

V

W

W

N

R

N

G

D

H

E

D

R

R

Y

Y

R

I

A

D

A

T

Y

Y

W

L

D

K

R

P

F

Y

K

P

N

G

N

F

F

Y

S

F

T

T

S

G

D

D

Y

G

A

A

I

T

K

R

D

D

Q

K

D

D

G

G

Y

Y

I

I

W

W

V

I

L

R

G

G

R

R

S

V

D

D

E

D

V

V

L

V

N

N

V

I

S

S

G

G

H

H

R

R

I

L

G

S

T

T

A

A

E

E

L

I

E

E

H

A

E

A

L

L

V

L

S

S

N

H

K

D

M

A

V

V

A

A

E

E

S

S

A

A

V

V

V

V

G

G

K

V

P

H

D

D

D

E

V

L

K

T

G

G

E

Q

V

A

P

V

V

N

A

A

F

F

V

I

I

L

L

L

N

K

E

P

R

G

Y

Y

R

E

E

A

L

-

P

-

S

T

N

V

E

E

V

L

K

E

A

K

T

E

L

L

I

I

R

M

H

A

I

V

R

R

D

S

T
|
T

V

I

G

G

P

P

I

F

G

A

T

S

P

P

A

R

M

K

I

L

F

I

F

F

V

-

N

S

K

D

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K

K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

I

L

L

K

R

K

K

L

I

I

L

I

A

G

G

E

E

-

V

-

D

E

Q

I

I

G

G

D

D

V

L

T

S

T

T

L

L

E

A

D

D

N

P

T

K

S

V

L

V

E

E

D

H

V

I

T596 (= T573) modified: Phosphothreonine

7kdsA Crystal structure of acetyl-coa synthetase 2 in complex with adenosine-5'-propylphosphate from candida albicans
44% identity, 97% coverage: 10:626/636 of query aligns to 34:646/654 of 7kdsA

query
sites
7kdsA

L

V

E

N

K

Q

Y

Y

S

K

E

Q

M

M

Q

Y

Q

E

K

Q

A

S

L

I

E

K

D

D

P

P

E

Q

K

G

F

F

W

F

G

G

E

P

Q

L

A

A

K

K

-

E

C

L

L

L

E

S

W

W

D

D

K

H

T

D

W

F

D

H

N

T

V

V

L

K

E

S

W

G

N

T

P

L

P

K

Y

N

-

G

-

D

A

A

K

A

W

W

F

F

K

L

S

G

G

G

S

E

L

L

N

N

A

A

S

S

Y

Y

N

N

C

C

V

V

D

D

R

R

H

H

I

A

K

F

G

A

N

N

R

P

R

-

N

D

K

K

A

P

A

A

I

L

I

I

C

C

E

E

K

A

E

D

D

D

-

E

G

K

S

D

C

S

G

H

I

I

L

L

T

T

Y

Y

Y

G

E

D

L

L

Y

L

R

R

E

E

I

V

N

S

K

K

F

V

A

A

N

G

V

V

L

L

E

Q

N

S

L

W

G

G

V

I

E

K

K

K

G

G

D

D

V

T

V

V

T

A

I

V

Y

Y

M

L

P

P

M

M

M

N

T

A

E

Q

A

A

I

I

I

I

A

A

M

M

L

L

A

A

C

I

S

A

R

R

I

L

G

G

V

A

I

A

H

H

N

S

V

V

V

I

F

F

S

A

G

G

F

F

S

S

S

A

D

G

A

S

L

I

A

K

D

D

R

R

I

V

N

N

D

D

S

A

K

S

S

C

K

K

I

A

L

L

V

I

T

T

T

C

N

D

L

E

L

G

Y

K

R

R

R

G

G

G

K

R

E

T

I

T

E

N

L

I

K

K

K

K

I

L

L

C

D

D

K

E

A

A

L

L

L

V

N

D

C

C

N

P

S

T

I

V

K

E

H

K

V

V

-

L

V

V

Y

Y

V

K

K

R

R

T

G

N

I

N

E

P

E

E

F

I

N

H

L

L

V

T

S

E

G

G

K

R

E

D

Y

Y

F

Y

W

W

D

D

E

V

L

E

M

T

G

A

G

K

A

F

K

P

S

G

Y

Y

V

L

E

P

P

P

V

V

P

S

V

V

E

N

S

S

D

E

H

D

P

P

L

L

F

F

I

L

L

L

Y

Y

T
|
T

S

S

G

G

T

S

T

T

G

G

S

T

P

P

K

K

G

G

V

V

V

V

H

H

S

S

T

T

G

A

G

G

Y

Y

L

L

T

L

Y

G

A

A

T

A

K

L

T

S

M

T

D

K

W

Y

T

I

W

F

G

D

L

I

N

H

E

P

M

E

D

D

V

I

F

L

W

F

C

T

T

A

A

G

D

D

I

V

G

G

W

W

I
|
I

T

T

G

G

H

H

T

T

Y

Y

V

A

V

L

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

L

L

L

G

G

A

V

T

P

I

T

V

I

L

I

Y

F

E

E

G

G

A

T

I

P

D

A

Y

Y

P

P

E

D

P

Y

D

G

R

R

L

F

W

W

G

Q

I

I

V

V

E

E

N

K

H

H

G

K

V

A

T

T

L

H

L

F

Y

Y

T

V

A

A

P

P

T

T

A

A

I

L

R

R

M

L

L

L

M

R

M

K

Y

A

G

G

E

E

K

Q

W

E

V

I

N

A

T

K

H

Y

D

D

L

L

S

S

T

S

L

L

R

R

L

T

L

L

G

G

S

S

V

V

G
|
G

E
|
E

P
|
P

I

I

N

S

P

P

R

D

A

I

W

W

K

E

W

W

Y

Y

Y

N

K

E

V

F

I

V

G

G

K

K

E

N

K

Q

C

C

P

H

I

I

C

S

D
|
D

C
x
T

Y
|
Y

W
|
W

Q
|
Q

T
|
T

E
|
E

T

S

G

G

G

S

H

H

M

L

I

I

Y

A

P

P

A

L

I

A

G

G

I

V

Q

-

S

-

V

V

P

P

L

N

K

K

P

P

G

G

S

S

A

A

T

S

F

Y

P

P

G

F

I

F

G

G

I

I

D

D

V

A

D

A

V

L

V

I

D

D

N

P

-

V

E

T

G

G

N

V

P

E

V

I

E

E

A

G

N

N

-

D

I

A

K

E

G

G

N

V

L

L

I

A

I

I

K

K

R

D

P

H

W

W

P

P

G

S

M

M

L

A

A

R

G

T

L

V

W

Y

N

K

N

N

D

H

E

T

R

K

Y

Y

R

M

A

D

A

T

Y

Y

W

M

D

N

R

P

F

Y

K

P

N

G

N

Y

F

Y

S

F

T

T

S

G

D
|
D

Y

G

A

A

I

A

K

R

D

D

Q

H

D

D

G

G

Y

Y

I

Y

W

W

V

I

L

R

G

G

R
|
R

S

V

D

D

E

D

V

V

L

V

N
|
N

V

V

S

S

G

G

H

H

R
|
R

I

L

G

S

T

T

A

A

E

E

L

I

E

E

H

A

E

A

L

L

V

I

S

E

N

D

K

K

M

K

V

V

A

S

E

E

S

A

A

A

V

V

V

V

G

G

K

I

P

H

D

D

D

D

V

I

K

T

G

G

E

Q

V

A

P

V

V

I

A

A

F

Y

V

V

I

A

L

L

N

K

E

E

R

E

Y

-

R

-

E

-

L

-

P

D

S

S

N

E

E

G

V

L

K

R

A

K

T

E

L

L

I

V

R

L

H

Q

I

V

R

R

D

K

T

T

V

I

G

G

P

P

I

F

G

A

T

A

P

P

A

K

M

S

I

V

F

I

F

I

V

V

N

Q

K

D

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K
|
K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

I

L

L

K

R

K

K

L

V

I

S

I

S

G

N

E

E

E

-

I

-

G

-

D

-

V

A

T

S

T

T

L

L

E

S

D

N

N

P

T

Q

S

S

L

V

E

E

D

G

V

I

active site: T275 (= T247), T427 (= T399), E428 (= E400), N534 (= N506), R539 (= R511), K620 (= K596)
binding adenosine-5'-monophosphate-propyl ester: I321 (= I293), G398 (= G370), E399 (= E371), P400 (= P372), D422 (= D394), T423 (≠ C395), Y424 (= Y396), W425 (= W397), Q426 (= Q398), T427 (= T399), D513 (= D485), R528 (= R500), N534 (= N506), R539 (= R511)

8rplB Amp-forming acetyl-coa synthetase from chloroflexota bacterium with bound acetyl amp (see paper)
46% identity, 95% coverage: 10:615/636 of query aligns to 28:630/630 of 8rplB

query
sites
8rplB

L

F

E

D

K

D

Y

Y

S

E

E

A

M

F

Q

Y

Q

R

K

W

A

S

L

L

E

A

D

N

P

R

E

F

K

E

F

F

W

W

G

N

E

D

Q

M

A

A

K

K

C

E

L

L

E

H

W

W

D

F

K

E

T

P

W

W

D

K

N

S

V

T

L

F

E

E

W

W

-

T

N

D

P

K

P

P

Y

F

A

F

K

K

W

W

F

F

K

T

S

D

G

G

S

K

L

F

N

N

A

I

S

A

Y

Y

N

N

C

C

V

L

D

D

R

R

H

Y

I

M

K

G

G

T

N

P

R

I

R

E

N

D

K

K

A

V

A

A

I

F

I

Y

C

W

E

E

K

G

E

D

D

D

G

G

S

S

C

S

G

R

I

A

L

Y

T

T

Y

Y

Y

K

E

E

L

M

Y

Y

R

V

E

L

I

T

N

N

K

R

F

V

A

A

N

K

V

V

L

L

E

Q

N

N

L

Q

G

G

V

V

E

K

K

K

G

G

D

D

V

R

V

V

T

A

I

I

Y

Y

M

M

P

P

M

M

M

I

T

P

E

E

A

M

I

A

I

A

A

S

M

V

L

L

A

A

C

C

S

A

R

R

I

L

G

G

V

A

I

P

H

H

N

M

V

V

V

V

F

F

S

G

G

G

F

F

S

A

S

A

D

S

A

S

L

L

A

R

D

D

R

R

I

M

N

N

D

D

S

C

K

D

S

A

K

K

I

V

L

L

V

I

T

T

T

A

N

D

L

G

L

G

Y

Y

R

R

R

G

G

G

K

K

E

V

I

I

E

E

L

L

K

K

K

K

I

I

L

A

D

D

K

E

A

A

L

V

L

A

N

E

C

T

N

P

S

T

I

I

K

E

H

K

V

V

V

F

Y

V

V

Q

K

R

R

H

G

T

I

G

E

F

E

E

F

V

N

P

L

M

V

A

S

E

G

G

K

R

E

D

Y

V

F

Y

W

L

D

D

E

V

L

L

M

L

G

N

G

D

-

I

-

P

A

E

K

D

S

T

Y

V

V

V

E

P

P

C

V

E

P

P

V

V

E

D

S

S

D

E

H

D

P

M

L

L

F

Y

I

I

L

L

Y

Y

T

T

S

S

G

G

T

S

T

T

G

G

S

K

P

P

K

K

G

G

V

V

V

V

H

H

S

V

T

H

G

G

G

G

Y

Y

L

A

T

V

Y

G

A

C

T

Y

K

A

T

T

M

T

D

K

W

F

T

V

W

F

G

D

L

I

N

K

E

P

M

S

D

D

V

V

F

F

W

W

C

C

T

T

A

A

D

D

I

I

G

G

W

W

I

V

T

T

G

G

H

H

T

S

Y

Y

V

T

V

I

Y

Y

G

G

P

P

L

M

S

M

L

N

G

A

A

A

T

S

I

I

V

V

L

L

Y

F

E

E

G

G

A

I

I

P

D

T

Y

Y

P

P

E

A

P

A

D

D

R

R

L

F

W

W

G

S

I

I

V

V

E

E

N

K

H

Y

G

K

V

V

T

N

L

I

L

I

Y

Y

T

T

A

A

P

P

T

T

A

A

I

I

R

R

M

S

L

L

M

M

M

R

Y

F

G

G

E

E

K

E

W

L

V

P

N

A

T

R

H

H

D

D

L

L

S

S

T

S

L

L

R

R

L

I

L

L

G

G

S

T

V

V

G
|
G

E
|
E

P
|
P

I

I

N

N

P

P

R

E

A

A

W

W

K

M

W

W

Y

Y

Y

R

K

K

V

N

I

I

G

G

K

H

E

N

K

E

C

L

P

P

I

I

C

M

D

D

C
x
T

Y
x
W

W
|
W

Q
|
Q

T
|
T

E

E

T

T

G

G

G

M

H

I

M

L

I

I

Y

S

P

P

A

T

I

-

G

-

I

-

Q

P

S

I

V

L

P

P

L

L

K

K

P

P

G

G

S

S

A

A

T

S

F

R

P

P

G

L

I

P

G

T

I

I

D

E

V

A

D

D

V

V

V

V

D

N

N

K

E

D

G

G

N

K

P

P

V

V

E

G

A

P

N

E

I

H

K

G

G

G

N

F

L

L

I

I

I

I

K

R

R

H

P

P

W

W

P

P

G

A

M

Q

L

M

A

R

G

T

L

I

W

F

N

G

N

D

D

P

E

D

R

R

Y

Y

R

K

A

-

A

T

Y

Y

W

W

D

E

R

T

F

I

K

P

N

D

N

V

F

Y

S

F

T

A

S

G

D
|
D

Y

A

A

A

I

T

K

M

D

D

Q

K

D

M

G

G

Y

Y

I

F

W

R

V

I

L

Q

G

G

R
|
R

S

V

D

D

E

D

V

V

L

I

N
x
K

V

V

S

S

G

G

H

H

R
|
R

I

L

G

G

T

S

A

M

E

E

L

I

E

E

H

S

E

S

L

L

V
|
V

S

S

N
x
H

K

P

M

A

V

V

A

A

E

E

S

A

A

A

V

A

V

I

G

G

K

K

P

P

D

D

D

E

V

V

K

K

G

G

E

E

V

H

P

V

V

K

A

V

F

F

V

V

I

I

L

L

N

-

E

-

R

R

Y

N

R

G

E

V

L

E

P

P

S

T

N

E

E

S

V

L

K

A

A

V

T

E

L

L

I

K

R

R

H

H

I

V

R

R

D

T

T

L

V

V

G

G

P

P

I

L

G

A

T

T

P

P

A

D

M

E

I

L

F

E

F

F

V

V

N

T

K

S

L

L

P

P

K

K

T

T

R

R

S

S

G

G

K

K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

V

L

V

K

R

K

A

L

R

I

E

I

L

G

G

E

E

E

P

I

V

G

G

D

D

V

I

T

T

binding [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] ethanoate: G391 (= G370), E392 (= E371), P393 (= P372), T416 (≠ C395), W417 (≠ Y396), W418 (= W397), Q419 (= Q398), T420 (= T399), D502 (= D485), R517 (= R500), K523 (≠ N506), R528 (= R511)
binding magnesium ion: V539 (= V522), H541 (≠ N524)

P52910 Acetyl-coenzyme A synthetase 2; Acetate--CoA ligase 2; Acyl-activating enzyme 2; EC 6.2.1.1 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
43% identity, 97% coverage: 2:619/636 of query aligns to 28:662/683 of P52910

query
sites
P52910

K

Q

T

P

G

G

D

K

K

G

Y

Y

I

V

L

T

-

D

L

M

E

Q

K

H

Y

Y

S

Q

E

E

M

M

Q

Y

Q

Q

K

Q

A

S

L

I

E

N

D

E

P

P

E

E

K

K

F

F

W

F

G

D

E

K

Q

M

A

A

K

K

-

E

C

Y

L

L

E

H

W

W

D

D

K

A

T

P

W

Y

D

T

N

K

V

V

L

Q

E

S

-

G

-

S

W

L

N

N

P

N

P

G

Y

D

A

V

K

A

W

W

F

F

K

L

S

N

G

G

S

K

L

L

N

N

A

A

S

S

Y

Y

N

N

C

C

V

V

D

D

R

R

H

H

I

A

K

F

G

A

N

N

R

P

R

-

N

D

K

K

A

P

A

A

I

L

I

I

C

Y

E

E

K

A

E

D

D

D

G

E

S

S

C

D

G

N

-

K

I

I

L

I

T

T

Y

F

Y

G

E

E

L

L

Y

L

R

R

E

K

I

V

N

S

K

Q

F

I

A

A

N

G

V

V

L

L

E

K

N

S

L

W

G

G

V

V

E

K

K

K

G

G

D

D

V

T

V

V

T

A

I

I

Y

Y

M

L

P

P

M

M

M

I

T

P

E

E

A

A

I

V

I

I

A

A

M

M

L

L

A

A

C

V

S

A

R

R

I

I

G

G

V

A

I

I

H

H

N

S

V

V

V

V

F

F

S

A

G

G

F

F

S

S

S

A

D

G

A

S

L

L

A

K

D

D

R

R

I

V

N

V

D

D

S

A

K

N

S

S

K

K

I

V

L

V

V

I

T

T

T

C

N

D

L

E

L

G

Y

K

R

R

R

G

G

G

K

K

E

T

I

I

E

N

L

T

K

K

K

K

I

I

L

V

D

D

K

E

A

G

L

L

L

N

N

G

C

V

N

D

S

L

I

V

K

S

H

R

V

I

V

L

Y

V

V

F

K

Q

R

R

-

T

G

G

I

T

E

E

E

G

F

I

N

P

L

M

V

K

S

A

G

G

K

R

E

D

Y

Y

F

W

W

W

D

H

E

E

L

E

M

A

G

A

G

K

A

Q

K

R

S

T

Y

Y

V

L

E

P

P

P

V

V

P

S

V

C

E

D

S

A

D

E

H

D

P

P

L

L

F

F

I

L

L

L

Y

Y

T

T

S

S

G

G

T

S

T

T

G

G

S

S

P

P

K

K

G

G

V

V

V

V

H

H

S

T

T

T

G

G

G

G

Y

Y

L

L

T

L

Y

G

A

A

T

A

K

L

T

T

M

T

D

R

W

Y

T

V

W

F

G

D

L

I

N

H

E

P

M

E

D

D

V

V

F

L

W

F

C

T

T

A

A

G

D

D

I

V

G

G

W

W

I

I

T

T

G

G

H

H

T

T

Y

Y

V

A

V

L

Y

Y

G

G

P

P

L

L

S

T

L

L

G

G

A

T

T

A

I

S

V

I

L

I

Y

F

E

E

G

S

A

T

I

P

D

A

Y

Y

P

P

E

D

P

Y

D

G

R

R

L

Y

W

W

G

R

I

I

V

I

E

Q

N

R

H

H

G

K

V

A

T

T

L

H

L

F

Y

Y

T

V

A

A

P

P

T

T

A

A

I

L

R

R

M

L

L

I

M

K

M

R

Y

V

G

G

E

E

K

A

W

E

V

I

N

A

T

K

H

Y

D

D

L

T

S

S

T

S

L

L

R

R

L

V

L

L

G

G

S

S

V

V

G

G

E

E

P

P

I

I

N

S

P

P

R

D

A

L

W

W

K

E

W

W

Y

Y

Y

H

K

E

V

K

I

V

G

G

K

N

E

K

K

N

C

C

P

V

I

I

C

C

D

D

C

T

Y

M

W

W

Q

Q

T

T

E

E

T

S

G

G

G

S

H

H

M

L

I

I

Y

A

P

P

A

L

I

A

G

G

I

-

Q

-

S

A

V

V

P

P

L

T

K

K

P

P

G

G

S

S

A

A

T

T

F

V

P

P

G

F

I

F

G

G

I

I

D

N

V

A

D

C

V

I

V

I

D

D

N

P

-

V

-

T

-

G

-

V

-

E

-

L

E

E

G

G

N

N

P

D

V

V

E

E

A

-

N

-

I

-

K

-

G

G

N

V

L

L

I

A

I

V

K

K

R

S

P

P

W

W

P

P

G

S

M

M

L

A

A

R

G

S

L

V

W

W

N

N

N

H

D

H

E

D

R

R

Y

Y

R

M

A

D

A

T

Y

Y

W

L

D
x
K

R

P

F

Y

K

P

N

G

N

H

F

Y

S

F

T

T

S

G

D

D

Y

G

A

A

I

G

K

R

D

D

Q

H

D

D

G

G

Y

Y

I

Y

W

W

V

I

L

R

G

G

R

R

S

V

D

D

E

D

V

V

L

V

N

N

V

V

S

S

G

G

H

H

R

R

I

L

G

S

T

T

A

S

E

E

L

I

E

E

H

A

E

S

L

I

V

S

S

N

N

H

K

E

M

N

V

V

A

S

E

E

S

A

A

A

V

V

V

V

G

G

K

I

P

P

D

D

D

E

V

L

K

T

G

G

E

Q

V

T

P

V

V

V

A

A

F

Y

V

V

I

S

L

L

N

K

E

D

R

G

Y

Y

R

L

E

Q

-

N

-

N

-

A

-

T

-

E

-

G

-

D

-

A

-

E

-

H

L

I

P

T

S

P

N

D

E

N

V

L

K

R

A

R

T

E

L

L

I

I

R

L

H

Q

I

V

R

R

D

G

T

E

V

I

G

G

P

P

I

F

G

A

T

S

P

P

A

K

M

T

I

I

F

I

F

L

V

V

N

R

K

D

L

L

P

P

K

R

T

T

R

R

S

S

G

G

K

K

I

I

M

M

R

R

R

R

I

V

L

L

K

R

K

K

L

V

I

A

I

S

-

N

-

E

G

A

E

E

E

Q

I

L

G

G

D

D

V

L

T

T

T

T

L

L

E

A

D

N

K506 (≠ D475) modified: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin)

Query Sequence

>WP_011869271.1 NCBI__GCF_000016125.1:WP_011869271.1
MKTGDKYILLEKYSEMQQKALEDPEKFWGEQAKCLEWDKTWDNVLEWNPPYAKWFKSGSL
NASYNCVDRHIKGNRRNKAAIICEKEDGSCGILTYYELYREINKFANVLENLGVEKGDVV
TIYMPMMTEAIIAMLACSRIGVIHNVVFSGFSSDALADRINDSKSKILVTTNLLYRRGKE
IELKKILDKALLNCNSIKHVVYVKRGIEEFNLVSGKEYFWDELMGGAKSYVEPVPVESDH
PLFILYTSGTTGSPKGVVHSTGGYLTYATKTMDWTWGLNEMDVFWCTADIGWITGHTYVV
YGPLSLGATIVLYEGAIDYPEPDRLWGIVENHGVTLLYTAPTAIRMLMMYGEKWVNTHDL
STLRLLGSVGEPINPRAWKWYYKVIGKEKCPICDCYWQTETGGHMIYPAIGIQSVPLKPG
SATFPGIGIDVDVVDNEGNPVEANIKGNLIIKRPWPGMLAGLWNNDERYRAAYWDRFKNN
FSTSDYAIKDQDGYIWVLGRSDEVLNVSGHRIGTAELEHELVSNKMVAESAVVGKPDDVK
GEVPVAFVILNERYRELPSNEVKATLIRHIRDTVGPIGTPAMIFFVNKLPKTRSGKIMRR
ILKKLIIGEEIGDVTTLEDNTSLEDVKKELEDFKYD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory