SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011911644.1 NCBI__GCF_000013785.1:WP_011911644.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 5 hits to proteins with known functional sites (download)

O53289 Phosphoserine phosphatase SerB2; PSP; PSPase; O-phosphoserine phosphohydrolase; Protein-serine/threonine phosphatase; EC 3.1.3.3; EC 3.1.3.16 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
24% identity, 94% coverage: 2:207/218 of query aligns to 180:369/409 of O53289

query
sites
O53289
R
 
R
L
 
L
A
 
I
L
 
V
F
 
F
D
|
D
L
x
V
D
|
D
N
x
S
T
 
T
L
 
L
L
 
V
A
 
Q
G
 
G
D
 
E
S
 
V
D
 
I
H
 
-
A
 
-
W
 
-
G
 
-
E
 
E
Y
 
M
L
 
L
C
 
A
Q
 
A
R
 
R
G
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
A
H
 
G
Y
 
A
R
 
Q
A
 
G
R
 
Q
N
 
V
D
 
A
A
 
A
F
 
I
Y
 
T
Q
 
E
D
 
A
Y
 
A
L
 
M
A
 
R
G
 
G
N
 
E
L
 
L
D
 
D
V
 
-
H
 
-
A
 
-
Y
 
-
Q
 
-
N
 
-
F
 
F
C
 
A
Q
 
E
E
 
S
I
 
L
L
 
Q
G
 
R
R
 
R
-
 
V
S
 
A
E
 
T
M
 
L
T
 
A
Q
 
G
L
 
L
Q
 
P
A
 
A
W
 
T
H
 
V
E
 
I
E
 
D
F
 
D
M
 
V
R
 
A
E
 
E
H
 
Q
I
 
L
E
 
E
P
 
-
I
 
-
V
 
L
L
 
M
S
 
P
K
 
G
G
 
A
E
 
R
A
 
T
L
 
T
L
 
I
R
 
R
Q
 
T
H
 
L
L
 
R
E
 
R
A
 
L
G
 
G
D
 
F
K
 
R
V
 
C
A
 
G
I
 
V
V
 
V
T
x
S
A
 
G
T
 
G
N
 
F
R
 
R
F
 
R
I
 
I
T
 
I
G
 
E
P
 
P
I
 
L
A
 
A
A
 
R
R
 
E
L
 
L
G
 
M
V
 
L
D
 
D
T
 
F
L
 
V
L
 
A
A
 
S
T
 
N
E
 
E
C
 
L
E
 
E
M
 
I
R
 
V
D
 
D
G
 
G
R
 
I
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
V
T
 
V
D
 
G
I
 
P
P
 
I
C
 
V
F
 
D
Q
 
R
E
 
P
G
 
G
K
|
K
V
 
A
Q
 
K
R
 
A
I
 
L
E
 
R
R
 
D
W
 
F
L
 
A
A
 
S
E
 
Q
T
 
Y
E
 
G
Q
 
V
S
 
P
L
 
M
E
 
E
G
 
Q
S
 
T
Y
 
V
F
 
A
Y
 
V
S
 
G
D
|
D
S
 
G
R
 
A
N
 
N
D
|
D
L
 
I
P
 
D
L
 
M
L
 
L
E
 
G
R
 
A
V
 
A
D
 
G
H
 
L
P
 
G
V
 
I
A
 
A
V
 
F
D
 
N
P
 
A
D
 
K
P
 
P
V
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
D

Sites not aligning to the query:

5jlpA Crystal structure of mycobacterium avium serb2 in complex with serine at act domain
24% identity, 94% coverage: 2:207/218 of query aligns to 178:367/396 of 5jlpA

query
sites
5jlpA
R
 
R
L
 
L
A
 
I
L
 
V
F
 
F
D
|
D
L
x
V
D
|
D
N
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
V
A
 
Q
G
 
G
D
 
E
S
 
V
D
 
I
H
 
E
A
 
M
W
 
L
G
 
A
E
 
A
Y
 
K
L
 
A
C
 
G
Q
 
A
R
 
E
G
 
G
I
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
H
 
Q
Y
 
V
R
 
A
A
 
A
R
 
I
N
 
T
D
 
D
A
 
A
F
 
A
Y
 
M
Q
 
R
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
G
N
 
E
L
 
L
D
 
D
V
 
-
H
 
-
A
 
-
Y
 
-
Q
 
-
N
 
-
F
 
F
C
 
A
Q
 
Q
E
 
S
I
 
L
L
 
Q
G
 
Q
R
 
R
-
 
V
S
 
A
E
 
T
M
 
L
T
 
A
Q
 
G
L
 
L
Q
 
P
A
 
A
W
 
T
H
 
V
E
 
I
E
 
D
F
 
E
M
 
V
R
 
A
E
 
G
H
 
Q
I
 
L
E
 
E
P
 
-
I
 
-
V
 
L
L
 
M
S
 
P
K
 
G
G
 
A
E
 
R
A
 
T
L
 
T
L
 
L
R
 
R
Q
 
T
H
 
L
L
 
R
E
 
R
A
 
L
G
 
G
D
 
Y
K
 
A
V
 
C
A
 
G
I
 
V
V
 
V
T
 
S
A
x
G
T
 
G
N
 
F
R
 
R
F
 
R
I
 
I
T
 
I
G
 
E
P
 
P
I
 
L
A
 
A
A
 
E
R
 
E
L
 
L
G
 
M
V
 
L
D
 
D
T
 
Y
L
 
V
L
 
A
A
 
A
T
 
N
E
 
E
C
 
L
E
 
E
M
 
I
R
 
V
D
 
D
G
 
G
R
 
T
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
V
T
 
V
D
 
G
I
 
P
P
 
I
C
 
I
F
 
D
Q
 
R
E
 
A
G
 
G
K
|
K
V
 
A
Q
 
T
R
 
A
I
 
L
E
 
R
R
 
E
W
 
F
L
 
A
A
 
Q
E
 
R
T
 
A
E
 
G
Q
 
V
S
 
P
L
 
M
E
 
A
G
 
Q
S
 
T
Y
 
V
F
 
A
Y
 
V
S
 
G
D
|
D
S
 
G
R
 
A
N
 
N
D
|
D
L
 
I
P
 
D
L
 
M
L
 
L
E
 
A
R
 
A
V
 
A
D
 
G
H
 
L
P
 
G
V
 
I
A
 
A
V
 
F
D
 
N
P
 
A
D
 
K
P
 
P
V
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
D

Sites not aligning to the query:

8a21A Crystal structure of phosphoserine phosphatase serb from mycobacterium avium in complex with phenylimidazole (see paper)
24% identity, 94% coverage: 2:207/218 of query aligns to 178:367/396 of 8a21A

query
sites
8a21A
R
 
R
L
 
L
A
 
I
L
 
V
F
 
F
D
|
D
L
 
V
D
|
D
N
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
V
A
 
Q
G
 
G
D
x
E
S
x
V
D
x
I
H
 
E
A
 
M
W
 
L
G
 
A
E
 
A
Y
 
K
L
 
A
C
 
G
Q
 
A
R
 
E
G
 
G
I
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
H
 
Q
Y
 
V
R
 
A
A
 
A
R
 
I
N
x
T
D
 
D
A
 
A
F
 
A
Y
x
M
Q
 
R
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
G
N
 
E
L
 
L
D
 
D
V
 
-
H
 
-
A
 
-
Y
 
-
Q
 
-
N
 
-
F
|
F
C
 
A
Q
 
Q
E
 
S
I
 
L
L
 
Q
G
 
Q
R
|
R
-
 
V
S
 
A
E
 
T
M
 
L
T
 
A
Q
 
G
L
 
L
Q
 
P
A
 
A
W
 
T
H
 
V
E
 
I
E
 
D
F
 
E
M
 
V
R
 
A
E
 
G
H
 
Q
I
 
L
E
 
E
P
 
-
I
 
-
V
 
L
L
 
M
S
 
P
K
 
G
G
 
A
E
 
R
A
 
T
L
 
T
L
 
L
R
 
R
Q
 
T
H
 
L
L
 
R
E
 
R
A
 
L
G
 
G
D
 
Y
K
 
A
V
 
C
A
 
G
I
 
V
V
 
V
T
 
S
A
 
G
T
x
G
N
 
F
R
 
R
F
 
R
I
 
I
T
 
I
G
 
E
P
 
P
I
 
L
A
 
A
A
 
E
R
 
E
L
 
L
G
 
M
V
 
L
D
 
D
T
 
Y
L
 
V
L
 
A
A
 
A
T
 
N
E
 
E
C
 
L
E
 
E
M
 
I
R
 
V
D
 
D
G
 
G
R
 
T
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
V
T
 
V
D
 
G
I
 
P
P
 
I
C
 
I
F
 
D
Q
 
R
E
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
A
Q
 
T
R
 
A
I
 
L
E
 
R
R
 
E
W
 
F
L
 
A
A
 
Q
E
 
R
T
 
A
E
 
G
Q
 
V
S
 
P
L
 
M
E
 
A
G
 
Q
S
 
T
Y
 
V
F
 
A
Y
 
V
S
 
G
D
|
D
S
 
G
R
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
I
P
 
D
L
 
M
L
 
L
E
 
A
R
 
A
V
 
A
D
 
G
H
 
L
P
 
G
V
 
I
A
 
A
V
 
F
D
 
N
P
 
A
D
 
K
P
 
P
V
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
D

Sites not aligning to the query:

8a1zA Crystal structure of phosphoserine phosphatase serb from mycobacterium avium in complex with 1-(2,4-dichlorophenyl)-3-hydroxyurea (see paper)
24% identity, 94% coverage: 2:207/218 of query aligns to 178:367/396 of 8a1zA

query
sites
8a1zA
R
 
R
L
 
L
A
 
I
L
 
V
F
 
F
D
|
D
L
 
V
D
|
D
N
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
V
A
 
Q
G
 
G
D
x
E
S
 
V
D
 
I
H
 
E
A
 
M
W
 
L
G
 
A
E
 
A
Y
 
K
L
 
A
C
 
G
Q
 
A
R
 
E
G
 
G
I
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
H
 
Q
Y
 
V
R
 
A
A
 
A
R
 
I
N
 
T
D
 
D
A
 
A
F
 
A
Y
x
M
Q
 
R
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
G
N
 
E
L
 
L
D
 
D
V
 
-
H
 
-
A
 
-
Y
 
-
Q
 
-
N
 
-
F
|
F
C
 
A
Q
 
Q
E
 
S
I
x
L
L
 
Q
G
 
Q
R
|
R
-
 
V
S
 
A
E
 
T
M
 
L
T
 
A
Q
 
G
L
 
L
Q
 
P
A
 
A
W
 
T
H
 
V
E
 
I
E
 
D
F
 
E
M
 
V
R
 
A
E
 
G
H
 
Q
I
 
L
E
 
E
P
 
-
I
 
-
V
 
L
L
 
M
S
 
P
K
 
G
G
 
A
E
 
R
A
 
T
L
 
T
L
 
L
R
 
R
Q
 
T
H
 
L
L
 
R
E
 
R
A
 
L
G
 
G
D
 
Y
K
 
A
V
 
C
A
 
G
I
 
V
V
 
V
T
 
S
A
x
G
T
 
G
N
x
F
R
 
R
F
 
R
I
 
I
T
 
I
G
 
E
P
 
P
I
 
L
A
 
A
A
 
E
R
 
E
L
 
L
G
 
M
V
 
L
D
 
D
T
 
Y
L
 
V
L
 
A
A
 
A
T
 
N
E
 
E
C
 
L
E
 
E
M
 
I
R
 
V
D
 
D
G
 
G
R
 
T
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
V
T
 
V
D
 
G
I
 
P
P
 
I
C
 
I
F
 
D
Q
 
R
E
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
A
Q
 
T
R
 
A
I
 
L
E
 
R
R
 
E
W
 
F
L
 
A
A
 
Q
E
 
R
T
 
A
E
 
G
Q
 
V
S
 
P
L
 
M
E
 
A
G
 
Q
S
 
T
Y
 
V
F
 
A
Y
 
V
S
 
G
D
|
D
S
 
G
R
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
I
P
 
D
L
 
M
L
 
L
E
 
A
R
 
A
V
 
A
D
 
G
H
 
L
P
 
G
V
 
I
A
 
A
V
 
F
D
 
N
P
 
A
D
 
K
P
 
P
V
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
D

A0QJI1 Phosphoserine phosphatase; PSP; PSPase; O-phosphoserine phosphohydrolase; EC 3.1.3.3 from Mycobacterium avium (strain 104) (see paper)
24% identity, 94% coverage: 2:207/218 of query aligns to 182:371/411 of A0QJI1

query
sites
A0QJI1
R
 
R
L
 
L
A
 
I
L
 
V
F
 
F
D
|
D
L
 
V
D
|
D
N
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
V
A
 
Q
G
 
G
D
 
E
S
 
V
D
 
I
H
 
E
A
 
M
W
 
L
G
 
A
E
 
A
Y
 
K
L
 
A
C
 
G
Q
 
A
R
 
E
G
 
G
I
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
H
 
Q
Y
 
V
R
 
A
A
 
A
R
 
I
N
 
T
D
 
D
A
 
A
F
 
A
Y
 
M
Q
 
R
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
G
N
 
E
L
 
L
D
 
D
V
 
-
H
 
-
A
 
-
Y
 
-
Q
 
-
N
 
-
F
 
F
C
 
A
Q
 
Q
E
 
S
I
 
L
L
 
Q
G
 
Q
R
 
R
-
 
V
S
 
A
E
 
T
M
 
L
T
 
A
Q
 
G
L
 
L
Q
 
P
A
 
A
W
 
T
H
 
V
E
 
I
E
 
D
F
 
E
M
 
V
R
 
A
E
 
G
H
 
Q
I
 
L
E
 
E
P
 
-
I
 
-
V
 
L
L
 
M
S
 
P
K
 
G
G
 
A
E
 
R
A
 
T
L
 
T
L
 
L
R
 
R
Q
 
T
H
 
L
L
 
R
E
 
R
A
 
L
G
 
G
D
 
Y
K
 
A
V
 
C
A
 
G
I
 
V
V
 
V
T
 
S
A
 
G
T
 
G
N
 
F
R
 
R
F
 
R
I
 
I
T
 
I
G
 
E
P
 
P
I
 
L
A
 
A
A
 
E
R
 
E
L
 
L
G
 
M
V
 
L
D
 
D
T
 
Y
L
 
V
L
 
A
A
 
A
T
 
N
E
 
E
C
 
L
E
 
E
M
 
I
R
 
V
D
 
D
G
 
G
R
 
T
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
V
T
 
V
D
 
G
I
 
P
P
 
I
C
 
I
F
 
D
Q
 
R
E
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
A
Q
 
T
R
 
A
I
 
L
E
 
R
R
 
E
W
 
F
L
 
A
A
 
Q
E
 
R
T
 
A
E
 
G
Q
 
V
S
 
P
L
 
M
E
 
A
G
 
Q
S
 
T
Y
 
V
F
 
A
Y
 
V
S
 
G
D
|
D
S
 
G
R
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
I
P
 
D
L
 
M
L
 
L
E
 
A
R
 
A
V
 
A
D
 
G
H
 
L
P
 
G
V
 
I
A
 
A
V
 
F
D
 
N
P
 
A
D
 
K
P
 
P
V
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
D

Query Sequence

>WP_011911644.1 NCBI__GCF_000013785.1:WP_011911644.1
MRLALFDLDNTLLAGDSDHAWGEYLCQRGIVDASHYRARNDAFYQDYLAGNLDVHAYQNF
CQEILGRSEMTQLQAWHEEFMREHIEPIVLSKGEALLRQHLEAGDKVAIVTATNRFITGP
IAARLGVDTLLATECEMRDGRYTGRLTDIPCFQEGKVQRIERWLAETEQSLEGSYFYSDS
RNDLPLLERVDHPVAVDPDPVLRAIAEERGWQVISLRP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory