SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011913248.1 NCBI__GCF_000013785.1:WP_011913248.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7pn0A Crystal structure of the phosphorybosylpyrophosphate synthetase ii from thermus thermophilus at r32 space group
35% identity, 94% coverage: 4:301/317 of query aligns to 1:286/312 of 7pn0A

query
sites
7pn0A
R
 
R
P
 
P
P
 
L
L
 
L
L
 
I
F
 
F
A
 
S
L
 
G
H
 
Q
G
 
S
T
 
N
Q
 
R
E
 
P
Y
 
L
A
 
A
A
 
Q
R
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
E
H
 
A
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
L
 
L
A
 
G
E
 
K
L
 
S
E
 
T
E
 
T
R
 
L
A
 
R
F
 
F
E
 
A
D
 
N
G
 
D
E
 
N
H
 
L
K
 
F
T
 
V
R
 
R
A
 
Y
L
 
E
T
 
E
S
 
S
V
 
L
E
 
R
S
 
E
R
 
G
N
 
D
A
 
V
V
 
F
V
 
I
F
 
V
H
 
Q
A
 
S
L
 
F
Y
 
V
G
 
P
D
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
P
V
 
V
N
 
Q
D
 
D
K
 
H
L
 
L
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
L
F
 
M
F
 
M
C
 
V
G
 
D
A
 
A
L
 
A
K
 
K
D
 
G
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
A
H
 
R
V
 
V
Q
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
C
 
S
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
K
x
S
E
 
D
R
 
K
R
 
K
T
 
D
Q
 
A
F
 
P
Q
 
R
D
 
I
P
 
S
I
 
I
I
 
T
T
 
A
R
 
R
Y
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
D
L
 
L
F
 
L
E
 
Q
A
 
T
C
 
A
R
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
V
T
 
L
T
 
T
L
 
M
E
 
T
V
 
L
H
|
H
N
 
S
L
 
-
A
 
P
A
 
Q
F
 
V
D
 
H
N
 
G
A
 
F
F
 
F
R
 
K
I
 
I
P
 
P
T
 
V
R
 
D
H
 
H
I
 
L
E
 
S
S
 
A
A
 
E
E
 
P
L
 
V
F
 
I
A
 
A
E
 
N
H
 
Y
F
 
F
A
 
A
R
 
T
L
 
R
A
 
V
G
 
D
D
 
L
D
 
E
E
 
N
L
 
A
V
 
V
A
 
V
V
 
V
S
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
D
A
 
L
K
 
K
R
 
R
A
 
A
E
 
S
S
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
A
L
 
L
E
 
A
R
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
R
 
L
A
 
P
V
 
L
G
 
-
S
 
-
A
 
A
Y
 
F
M
 
I
E
 
D
K
 
K
Y
 
E
R
 
R
S
 
V
N
 
S
D
 
D
I
 
T
-
 
E
V
 
V
T
 
R
G
 
V
T
 
R
M
 
M
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
E
E
 
G
R
 
K
I
 
T
A
 
A
I
 
L
I
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
E
I
 
I
S
 
S
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
S
L
 
L
L
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
V
E
 
E
A
 
A
C
 
L
R
 
M
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
V
 
V
H
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
T
H
 
H
G
 
G
L
 
V
F
 
Y
T
 
V
G
 
G
G
 
P
P
 
A
-
 
L
-
 
D
E
 
R
I
 
I
L
 
A
E
 
K
S
 
S
P
 
P
V
 
V
F
 
-
D
 
K
Q
 
E
L
 
V
V
 
A
I
 
A
A
 
T
D
 
D
T
 
T
V
 
C
P
 
P
P
 
P
F
 
-
R
 
K
L
 
E
P
 
G
P
 
P
E
 
K
L
 
L
V
 
-
S
 
-
R
 
R
R
 
T
L
 
L
T
 
T
V
 
V

5t3oA Crystal structure of the phosphorybosylpyrophosphate synthetase ii from thermus thermophilus (see paper)
34% identity, 94% coverage: 5:301/317 of query aligns to 1:285/307 of 5t3oA

query
sites
5t3oA
P
 
P
P
 
L
L
 
L
L
 
I
F
 
F
A
 
S
L
 
G
H
 
Q
G
 
S
T
 
N
Q
 
R
E
 
P
Y
 
L
A
 
A
A
 
Q
R
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
E
H
 
A
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
P
L
 
L
A
 
G
E
 
K
L
 
S
E
 
T
E
 
T
R
 
L
A
 
R
F
 
F
E
 
A
D
 
N
G
 
D
E
 
N
H
 
L
K
 
F
T
 
V
R
 
R
A
 
Y
L
 
E
T
 
E
S
|
S
V
 
L
E
x
R
S
 
E
R
 
G
N
 
D
A
 
V
V
 
F
V
 
I
F
 
V
H
 
Q
A
 
S
L
 
F
Y
 
V
G
 
P
D
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
P
V
 
V
N
 
Q
D
 
D
K
 
H
L
 
L
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
L
F
 
M
F
 
M
C
 
V
G
 
D
A
 
A
L
 
A
K
 
K
D
 
G
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
A
H
 
R
V
 
V
Q
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
C
 
S
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
K
x
S
E
 
D
R
 
K
R
 
K
T
x
D
Q
 
A
F
 
P
Q
 
R
D
 
I
P
 
S
I
 
I
I
 
T
T
 
A
R
 
R
Y
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
D
L
 
L
F
 
L
E
 
Q
A
 
T
C
 
A
R
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
V
T
 
L
T
 
T
L
 
M
E
 
T
V
 
L
H
|
H
N
 
S
L
 
-
A
 
P
A
 
Q
F
 
V
D
 
H
N
 
G
A
 
F
F
 
F
R
 
K
I
 
I
P
 
P
T
 
V
R
 
D
H
 
H
I
 
L
E
 
S
S
 
A
A
 
E
E
 
P
L
 
V
F
 
I
A
 
A
E
 
N
H
 
Y
F
 
F
A
 
A
R
 
T
L
 
R
A
 
V
G
 
D
D
 
L
D
 
E
E
 
N
L
 
A
V
 
V
A
 
V
V
 
V
S
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
D
A
 
L
K
 
K
R
 
R
A
 
A
E
 
S
S
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
A
L
 
L
E
 
A
R
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
R
 
L
A
 
P
V
 
L
G
 
-
S
 
-
A
 
A
Y
 
F
M
 
I
E
 
D
K
 
K
Y
 
E
R
|
R
S
 
V
N
 
S
D
 
D
I
 
T
-
 
E
V
 
V
T
 
R
G
 
V
T
 
R
M
 
M
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
E
E
 
G
R
 
K
I
 
T
A
 
A
I
 
L
I
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
E
I
 
I
S
 
S
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
S
L
 
L
L
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
V
E
 
E
A
 
A
C
 
L
R
 
M
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
V
 
V
H
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
T
H
 
H
G
 
G
L
 
V
F
 
Y
T
 
V
G
 
G
G
 
P
P
 
A
-
 
L
-
 
D
E
 
R
I
 
I
L
 
A
E
 
K
S
 
S
P
 
P
V
 
V
F
 
-
D
 
K
Q
 
E
L
 
V
V
 
A
I
 
A
A
 
T
D
 
D
T
 
T
V
 
C
P
 
P
P
 
P
F
 
-
R
 
K
L
 
E
P
 
G
P
 
P
E
 
K
L
 
L
V
 
-
S
 
-
R
 
R
R
 
T
L
 
L
T
 
T
V
 
V

4s2uA Crystal structure of the phosphorybosylpyrophosphate synthetase from e. Coli
32% identity, 97% coverage: 8:313/317 of query aligns to 5:300/308 of 4s2uA

query
sites
4s2uA
L
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
G
H
 
N
G
 
A
T
 
T
Q
 
P
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
A
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
R
 
N
H
 
R
M
 
L
G
 
Y
L
 
T
E
 
S
L
 
L
A
 
G
E
 
D
L
 
A
E
 
A
E
 
V
R
 
G
A
 
R
F
 
F
E
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
H
 
V
K
 
S
T
 
V
R
 
Q
A
 
I
L
 
N
T
 
E
S
 
N
V
 
V
E
 
R
S
 
G
R
 
G
N
 
D
A
 
I
V
 
F
V
 
I
F
 
I
H
 
Q
A
 
S
L
 
T
Y
 
C
G
 
A
D
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
P
V
 
T
N
 
N
D
 
D
K
 
N
L
 
L
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
V
F
 
V
F
 
M
C
 
V
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
R
D
 
R
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
G
H
 
R
V
 
I
Q
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
C
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
Q
E
 
D
R
 
R
R
 
R
T
 
V
Q
 
R
F
 
S
-
 
A
Q
 
R
D
 
V
P
 
P
I
 
I
I
 
T
T
 
A
R
 
K
Y
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
F
F
 
L
E
 
S
A
 
S
C
 
V
R
 
G
V
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
V
T
 
L
T
 
T
L
 
V
E
 
D
V
 
L
H
 
H
-
 
A
-
 
E
N
 
Q
L
 
I
A
 
Q
A
 
G
F
 
F
D
 
-
N
 
-
A
 
-
F
 
F
R
 
D
I
 
V
P
 
P
T
 
V
R
 
D
H
 
N
I
 
V
E
 
F
S
 
G
A
 
S
E
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
L
E
 
E
H
 
D
F
 
M
A
 
L
R
 
Q
L
 
L
A
 
N
G
 
L
D
 
D
D
 
N
E
 
P
L
 
I
V
 
V
A
 
-
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
A
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
V
K
 
V
R
 
R
A
 
A
E
 
R
S
 
A
F
 
I
R
 
A
R
 
K
A
 
L
L
 
L
E
 
N
R
 
D
R
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
T
G
 
D
S
 
M
A
 
A
Y
 
I
M
 
I
E
 
D
K
 
K
Y
 
R
R
 
R
S
 
P
N
 
R
D
 
A
I
 
N
V
 
V
T
 
S
G
 
Q
T
 
V
M
 
M
-
 
H
L
 
I
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
A
E
 
G
R
 
R
I
 
D
A
 
C
I
 
V
I
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
M
I
 
I
S
x
D
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
L
L
 
C
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
C
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
V
 
V
H
 
F
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
I
F
 
F
T
 
S
G
 
G
G
 
N
-
 
A
P
 
A
E
 
N
I
 
N
L
 
L
E
 
R
S
 
N
P
 
S
V
 
V
F
 
I
D
 
D
Q
 
E
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
C
D
 
D
T
 
T
V
 
I
P
 
P
P
 
-
F
 
-
R
 
-
L
 
L
P
 
S
P
 
D
E
 
E
L
 
I
V
 
K
S
 
S
-
 
L
-
 
P
-
 
N
-
 
V
R
 
R
R
 
T
L
 
L
T
 
T
V
 
L
L
 
-
D
 
-
S
 
-
S
 
S
A
 
G
M
 
M
V
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
R

6asvC E. Coli prpp synthetase (see paper)
32% identity, 97% coverage: 8:313/317 of query aligns to 4:299/311 of 6asvC

query
sites
6asvC
L
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
G
H
 
N
G
 
A
T
 
T
Q
 
P
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
A
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
R
 
N
H
 
R
M
 
L
G
 
Y
L
 
T
E
 
S
L
 
L
A
 
G
E
 
D
L
 
A
E
 
A
E
 
V
R
 
G
A
 
R
F
 
F
E
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
H
 
V
K
 
S
T
 
V
R
 
Q
A
 
I
L
 
N
T
 
E
S
 
N
V
 
V
E
 
R
S
 
G
R
 
G
N
 
D
A
 
I
V
 
F
V
 
I
F
 
I
H
 
Q
A
 
S
L
 
T
Y
 
C
G
 
A
D
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
P
V
 
T
N
 
N
D
 
D
K
 
N
L
 
L
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
V
F
 
V
F
 
M
C
 
V
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
R
D
 
R
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
G
H
 
R
V
 
I
Q
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
C
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
Q
E
 
D
R
 
R
R
 
R
T
 
V
Q
 
R
F
 
S
-
 
A
Q
 
R
D
 
V
P
 
P
I
 
I
I
 
T
T
 
A
R
 
K
Y
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
F
F
 
L
E
 
S
A
 
S
C
 
V
R
 
G
V
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
V
T
 
L
T
 
T
L
 
V
E
 
D
V
 
L
H
 
H
-
 
A
-
 
E
N
 
Q
L
 
I
A
 
Q
A
 
G
F
 
F
D
 
-
N
 
-
A
 
-
F
 
F
R
 
D
I
 
V
P
 
P
T
 
V
R
 
D
H
 
N
I
 
V
E
 
F
S
 
G
A
 
S
E
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
L
E
 
E
H
 
D
F
 
M
A
 
L
R
 
Q
L
 
L
A
 
N
G
 
L
D
 
D
D
 
N
E
 
P
L
 
I
V
 
V
A
 
-
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
|
D
A
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
V
K
 
V
R
 
R
A
 
A
E
 
R
S
 
A
F
 
I
R
 
A
R
 
K
A
 
L
L
 
L
E
 
N
R
 
D
R
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
T
G
 
D
S
 
M
A
 
A
Y
 
I
M
 
I
E
 
D
K
 
K
Y
 
R
R
 
R
S
 
P
N
 
R
D
 
A
I
 
N
V
 
V
T
 
S
G
 
Q
T
 
V
M
 
M
-
 
H
L
 
I
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
A
E
 
G
R
 
R
I
 
D
A
 
C
I
 
V
I
 
L
V
 
V
D
|
D
D
|
D
L
 
M
I
 
I
S
x
D
T
|
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
L
|
L
L
 
C
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
C
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
V
 
V
H
 
F
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
I
F
 
F
T
 
S
G
 
G
G
 
N
-
 
A
P
 
A
E
 
N
I
 
N
L
 
L
E
 
R
S
 
N
P
 
S
V
 
V
F
 
I
D
 
D
Q
 
E
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
C
D
 
D
T
 
T
V
 
I
P
 
P
P
 
-
F
 
-
R
 
-
L
 
L
P
 
S
P
 
D
E
 
E
L
 
I
V
 
K
S
 
S
-
 
L
-
 
P
-
 
N
-
 
V
R
 
R
R
 
T
L
 
L
T
 
T
V
 
L
L
 
-
D
 
-
S
 
-
S
 
S
A
 
G
M
 
M
V
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
R

P0A717 Ribose-phosphate pyrophosphokinase; RPPK; 5-phospho-D-ribosyl alpha-1-diphosphate synthase; Phosphoribosyl diphosphate synthase; Phosphoribosyl pyrophosphate synthase; P-Rib-PP synthase; PRPP synthase; PRPPase; EC 2.7.6.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
32% identity, 97% coverage: 8:313/317 of query aligns to 6:301/315 of P0A717

query
sites
P0A717
L
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
G
H
 
N
G
 
A
T
 
T
Q
 
P
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
A
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
R
 
N
H
 
R
M
 
L
G
 
Y
L
 
T
E
 
S
L
 
L
A
 
G
E
 
D
L
 
A
E
 
A
E
 
V
R
 
G
A
 
R
F
 
F
E
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
H
 
V
K
 
S
T
 
V
R
 
Q
A
 
I
L
 
N
T
 
E
S
 
N
V
 
V
E
 
R
S
 
G
R
 
G
N
 
D
A
 
I
V
 
F
V
 
I
F
 
I
H
 
Q
A
 
S
L
 
T
Y
 
C
G
 
A
D
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
P
V
 
T
N
 
N
D
 
D
K
 
N
L
 
L
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
V
F
 
V
F
 
M
C
 
V
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
R
D
 
R
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
G
H
 
R
V
 
I
Q
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
C
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
Q
E
 
D
R
 
R
R
 
R
T
 
V
Q
 
R
F
 
S
-
 
A
Q
 
R
D
 
V
P
 
P
I
 
I
I
 
T
T
 
A
R
 
K
Y
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
F
F
 
L
E
 
S
A
 
S
C
 
V
R
 
G
V
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
V
T
 
L
T
 
T
L
 
V
E
x
D
V
 
L
H
 
H
-
 
A
-
 
E
N
 
Q
L
 
I
A
 
Q
A
 
G
F
 
F
D
 
-
N
 
-
A
 
-
F
 
F
R
 
D
I
 
V
P
 
P
T
 
V
R
 
D
H
 
N
I
 
V
E
 
F
S
 
G
A
 
S
E
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
L
E
 
E
H
 
D
F
 
M
A
 
L
R
 
Q
L
 
L
A
 
N
G
 
L
D
 
D
D
 
N
E
 
P
L
 
I
V
 
V
A
 
-
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
A
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
V
K
 
V
R
 
R
A
 
A
E
 
R
S
 
A
F
 
I
R
 
A
R
 
K
A
 
L
L
 
L
E
 
N
R
 
D
R
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
T
G
 
D
S
 
M
A
 
A
Y
 
I
M
 
I
E
 
D
K
 
K
Y
 
R
R
 
R
S
 
P
N
 
R
D
 
A
I
 
N
V
 
V
T
 
S
G
 
Q
T
 
V
M
 
M
-
 
H
L
 
I
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
A
E
 
G
R
 
R
I
 
D
A
 
C
I
 
V
I
 
L
V
 
V
D
|
D
D
|
D
L
 
M
I
 
I
S
x
D
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
C
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
C
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
V
 
V
H
 
F
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
I
F
 
F
T
 
S
G
 
G
G
 
N
-
 
A
P
 
A
E
 
N
I
 
N
L
 
L
E
 
R
S
 
N
P
 
S
V
 
V
F
 
I
D
 
D
Q
 
E
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
C
D
 
D
T
 
T
V
 
I
P
 
P
P
 
-
F
 
-
R
 
-
L
 
L
P
 
S
P
 
D
E
 
E
L
 
I
V
 
K
S
 
S
-
 
L
-
 
P
-
 
N
-
 
V
R
 
R
R
 
T
L
 
L
T
 
T
V
 
L
L
 
-
D
 
-
S
 
-
S
 
S
A
 
G
M
 
M
V
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
R

Sites not aligning to the query:

7xmvA E.Coli phosphoribosylpyrophosphate (prpp) synthetase type a(amp/adp) filament bound with adp, amp and r5p (see paper)
32% identity, 97% coverage: 8:313/317 of query aligns to 4:293/307 of 7xmvA

query
sites
7xmvA
L
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
G
H
 
N
G
 
A
T
 
T
Q
 
P
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
A
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
R
 
N
H
 
R
M
 
L
G
 
Y
L
 
T
E
 
S
L
 
L
A
 
G
E
 
D
L
 
A
E
 
A
E
 
V
R
 
G
A
 
R
F
|
F
E
 
S
D
|
D
G
 
G
E
|
E
H
 
V
K
 
S
T
 
V
R
 
Q
A
 
I
L
 
N
T
 
E
S
 
N
V
 
V
E
 
R
S
 
G
R
 
G
N
 
D
A
 
I
V
 
F
V
 
I
F
 
I
H
 
Q
A
 
S
L
 
T
Y
 
C
G
 
A
D
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
P
V
 
T
N
 
N
D
 
D
K
 
N
L
 
L
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
V
F
 
V
F
 
M
C
 
V
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
R
D
 
R
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
G
H
 
R
V
 
I
Q
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
C
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
K
 
Q
E
 
D
R
|
R
R
 
R
T
x
V
Q
x
R
F
 
S
-
 
A
Q
 
R
D
 
V
P
 
P
I
 
I
I
 
T
T
 
A
R
 
K
Y
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
F
F
 
L
E
 
S
A
 
S
C
 
V
R
 
G
V
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
V
T
 
L
T
 
T
L
 
V
E
 
D
V
 
L
H
|
H
-
 
A
-
x
E
N
 
Q
L
 
I
A
 
Q
A
 
G
F
 
F
D
 
-
N
 
-
A
 
-
F
 
F
R
 
D
I
 
V
P
 
P
T
 
V
R
 
D
H
 
N
I
 
V
E
x
F
S
 
G
A
x
S
E
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
L
E
 
E
H
 
D
F
 
M
A
 
L
R
 
Q
L
 
L
A
 
N
G
 
L
D
 
D
D
 
N
E
 
P
L
 
I
V
 
V
A
 
-
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
A
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
V
K
x
V
R
 
R
A
 
A
E
 
R
S
x
A
F
 
I
R
 
A
R
 
K
A
 
L
L
 
L
E
 
N
R
 
D
R
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
T
G
 
D
S
 
M
A
 
A
Y
 
I
M
 
I
E
 
D
K
 
K
Y
 
R
R
 
R
S
 
Q
N
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
V
T
 
M
M
 
H
L
 
I
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
A
E
 
G
R
 
R
I
 
D
A
 
C
I
 
V
I
 
L
V
 
V
D
|
D
D
|
D
L
x
M
I
 
I
S
x
D
T
|
T
G
 
G
G
|
G
T
|
T
L
 
L
L
 
C
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
C
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
V
 
V
H
 
F
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
I
F
 
F
T
 
S
G
 
G
G
 
N
-
 
A
P
 
A
E
 
N
I
 
N
L
 
L
E
 
R
S
 
N
P
 
S
V
 
V
F
 
I
D
 
D
Q
 
E
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
C
D
 
D
T
 
T
V
 
I
P
 
P
P
 
-
F
 
-
R
 
-
L
 
L
P
 
S
P
 
D
E
 
E
L
 
I
V
 
K
S
 
S
-
 
L
-
 
P
-
 
N
-
 
V
R
 
R
R
 
T
L
 
L
T
 
T
V
 
L
L
 
-
D
 
-
S
 
-
S
 
S
A
 
G
M
 
M
V
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
R

7xmuA E.Coli phosphoribosylpyrophosphate (prpp) synthetase type a filament bound with adp, pi and r5p (see paper)
32% identity, 97% coverage: 8:313/317 of query aligns to 4:293/307 of 7xmuA

query
sites
7xmuA
L
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
G
H
 
N
G
 
A
T
 
T
Q
 
P
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
A
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
R
 
N
H
 
R
M
 
L
G
 
Y
L
 
T
E
 
S
L
 
L
A
 
G
E
 
D
L
 
A
E
 
A
E
 
V
R
 
G
A
 
R
F
|
F
E
 
S
D
|
D
G
 
G
E
|
E
H
 
V
K
 
S
T
 
V
R
 
Q
A
 
I
L
 
N
T
 
E
S
 
N
V
 
V
E
 
R
S
 
G
R
 
G
N
 
D
A
 
I
V
 
F
V
 
I
F
 
I
H
 
Q
A
 
S
L
 
T
Y
 
C
G
 
A
D
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
P
V
 
T
N
 
N
D
 
D
K
 
N
L
 
L
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
V
F
 
V
F
 
M
C
 
V
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
R
D
 
R
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
G
H
 
R
V
 
I
Q
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
C
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
K
x
Q
E
 
D
R
|
R
R
 
R
T
 
V
Q
x
R
F
 
S
-
 
A
Q
 
R
D
 
V
P
 
P
I
 
I
I
 
T
T
 
A
R
 
K
Y
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
F
F
 
L
E
 
S
A
 
S
C
 
V
R
 
G
V
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
V
T
 
L
T
 
T
L
 
V
E
 
D
V
 
L
H
|
H
-
 
A
-
x
E
N
 
Q
L
 
I
A
 
Q
A
 
G
F
 
F
D
 
-
N
 
-
A
 
-
F
 
F
R
 
D
I
 
V
P
 
P
T
 
V
R
 
D
H
 
N
I
 
V
E
x
F
S
 
G
A
x
S
E
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
L
E
 
E
H
 
D
F
 
M
A
 
L
R
 
Q
L
 
L
A
 
N
G
 
L
D
 
D
D
 
N
E
 
P
L
 
I
V
 
V
A
 
-
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
|
D
A
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
V
K
x
V
R
 
R
A
 
A
E
 
R
S
 
A
F
 
I
R
 
A
R
 
K
A
 
L
L
 
L
E
 
N
R
 
D
R
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
T
G
 
D
S
 
M
A
 
A
Y
 
I
M
 
I
E
 
D
K
 
K
Y
 
R
R
 
R
S
 
Q
N
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
V
T
 
M
M
 
H
L
 
I
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
A
E
 
G
R
 
R
I
 
D
A
 
C
I
 
V
I
 
L
V
 
V
D
|
D
D
 
D
L
x
M
I
 
I
S
x
D
T
|
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
C
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
C
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
V
 
V
H
 
F
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
I
F
 
F
T
 
S
G
 
G
G
 
N
-
 
A
P
 
A
E
 
N
I
 
N
L
 
L
E
 
R
S
 
N
P
 
S
V
 
V
F
 
I
D
 
D
Q
 
E
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
C
D
 
D
T
 
T
V
 
I
P
 
P
P
 
-
F
 
-
R
 
-
L
 
L
P
 
S
P
 
D
E
 
E
L
 
I
V
 
K
S
 
S
-
 
L
-
 
P
-
 
N
-
 
V
R
 
R
R
 
T
L
 
L
T
 
T
V
 
L
L
 
-
D
 
-
S
 
-
S
 
S
A
 
G
M
 
M
V
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
R

P14193 Ribose-phosphate pyrophosphokinase; RPPK; 5-phospho-D-ribosyl alpha-1-diphosphate synthase; Phosphoribosyl diphosphate synthase; Phosphoribosyl pyrophosphate synthase; P-Rib-PP synthase; PPRibP synthase; PRPP synthase; PRPPase; EC 2.7.6.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 4 papers)
29% identity, 96% coverage: 8:312/317 of query aligns to 12:303/317 of P14193

query
sites
P14193
L
 
I
F
 
F
A
 
S
L
 
L
H
 
N
G
 
S
T
 
N
Q
 
P
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
A
 
K
R
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
D
H
 
I
M
 
V
G
 
G
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
A
 
G
E
 
K
L
 
C
E
 
S
E
 
V
R
 
T
A
 
R
F
 
F
E
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
H
 
V
K
 
Q
T
 
I
R
 
N
A
 
I
L
 
E
T
 
E
S
 
S
V
 
I
E
 
R
S
 
G
R
 
C
N
 
D
A
 
C
V
 
Y
V
 
I
F
 
I
H
 
Q
A
 
S
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
D
 
-
D
 
T
E
 
S
R
 
D
S
 
P
V
 
V
N
 
N
D
 
E
K
 
H
L
 
I
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
L
F
 
I
F
 
M
C
 
V
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
R
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
K
H
 
T
V
 
I
Q
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
Y
C
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
K
x
Q
E
 
D
R
 
R
R
 
K
T
 
A
Q
 
R
F
 
S
Q
 
R
D
 
E
P
 
P
I
 
I
I
 
T
T
 
A
R
 
K
Y
 
L
V
 
F
A
 
A
A
 
N
L
 
L
F
 
L
E
 
E
A
 
T
C
 
A
R
 
G
V
 
A
D
 
T
R
 
R
L
 
V
T
 
I
T
 
A
L
 
L
E
 
D
V
 
L
H
 
H
N
 
-
L
 
A
A
 
P
A
 
Q
F
 
I
D
 
Q
N
 
G
A
 
F
F
 
F
R
 
D
I
 
I
P
 
P
T
 
I
R
 
D
H
 
H
I
 
L
E
 
M
S
 
G
A
 
V
E
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
G
E
 
E
H
 
Y
F
 
F
A
 
E
R
 
G
L
 
K
A
 
N
G
 
L
D
 
E
D
 
D
E
 
-
L
 
I
V
 
V
A
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
A
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
V
K
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
R
A
 
K
L
 
L
E
 
A
R
 
D
R
 
R
I
 
L
G
 
K
R
 
A
A
 
P
V
 
I
G
 
-
S
 
-
A
 
A
Y
 
I
M
 
I
E
 
D
K
|
K
Y
 
R
R
|
R
S
 
P
N
x
R
D
 
P
I
x
N
V
 
V
T
 
A
G
x
E
T
 
V
M
 
M
-
 
N
L
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
N
V
 
I
R
 
E
E
 
G
R
 
K
I
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
L
V
 
I
D
 
D
D
 
D
L
 
I
I
 
I
S
x
D
T
|
T
G
x
A
G
|
G
T
|
T
L
 
I
L
 
T
R
 
L
A
 
A
G
 
A
E
 
N
A
 
A
C
 
L
R
 
V
K
 
E
A
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
V
 
V
H
 
Y
A
 
A
A
 
C
A
 
C
A
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
V
F
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
P
G
 
A
P
 
V
E
 
E
I
 
R
L
 
I
E
 
N
S
 
N
P
 
S
V
 
T
F
 
I
D
 
K
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
I
 
V
A
 
T
D
 
N
T
 
S
V
 
I
P
 
-
P
 
-
F
 
-
R
 
K
L
 
L
P
 
P
P
 
E
E
 
E
L
 
K
V
 
K
S
 
I
R
 
E
R
 
R
L
 
F
T
 
K
V
 
Q
L
 
L
D
 
S
S
 
V
S
 
G
A
 
P
M
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
I

Sites not aligning to the query:

O94413 Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2; Phosphoribosyl pyrophosphate synthase 2; EC 2.7.6.1 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
30% identity, 88% coverage: 8:286/317 of query aligns to 8:279/321 of O94413

query
sites
O94413
L
 
I
F
 
F
A
 
A
L
 
G
H
 
N
G
 
S
T
 
H
Q
 
P
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
A
 
E
R
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
R
H
 
R
M
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
S
L
 
L
A
 
G
E
 
K
L
 
V
E
 
A
E
 
V
R
 
V
A
 
Q
F
 
Y
E
 
S
D
 
N
G
 
R
E
 
E
H
 
T
K
 
S
T
 
V
R
 
T
A
 
I
L
 
G
T
 
E
S
 
S
V
 
V
E
 
R
S
 
D
R
 
E
N
 
D
A
 
V
V
 
F
V
 
I
F
 
L
H
 
Q
A
 
T
L
 
G
Y
 
C
G
 
G
D
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
S
V
 
I
N
 
N
D
 
D
K
 
H
L
 
L
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
L
F
 
I
F
 
M
C
 
I
G
 
N
A
 
A
L
 
C
K
 
R
D
 
S
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
R
H
 
R
V
 
I
Q
 
T
V
 
A
V
 
I
A
 
I
P
 
P
Y
 
C
L
 
F
C
 
P
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
Q
E
 
D
R
 
K
R
 
K
T
 
D
Q
 
K
F
 
S
Q
 
R
D
 
A
P
 
P
I
 
I
I
 
T
T
 
A
R
 
R
Y
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
N
L
 
M
F
 
L
E
 
Q
A
 
T
C
 
A
R
 
G
V
 
C
D
 
N
R
 
H
L
 
I
T
 
I
T
 
T
L
 
M
E
 
D
V
 
L
H
 
H
N
 
-
L
 
A
A
 
S
A
 
Q
F
 
I
D
 
Q
N
 
G
A
 
F
F
 
F
R
 
N
I
 
V
P
 
P
T
 
V
R
 
D
H
 
N
I
 
L
E
 
Y
S
 
-
A
 
A
E
 
E
L
 
P
F
 
S
A
 
V
E
 
L
H
 
R
F
 
Y
A
 
I
R
 
R
L
 
E
A
 
N
G
 
I
D
 
D
-
 
T
-
 
T
-
 
V
D
 
N
E
 
P
L
 
T
V
 
V
A
 
I
V
 
V
S
|
S
P
 
P
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
A
E
 
T
S
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
A
L
 
L
E
 
A
R
 
D
R
 
R
I
 
L
G
 
D
R
 
L
A
 
D
V
 
F
G
 
A
S
 
L
A
 
I
Y
 
H
M
 
K
E
 
E
K
 
R
Y
 
Q
R
 
K
S
 
A
N
 
N
D
 
E
I
 
-
V
 
V
T
 
S
G
 
R
T
 
M
M
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
E
 
D
R
 
K
I
 
L
A
 
A
I
 
I
I
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
M
I
 
A
S
 
D
T
 
T
G
 
C
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
G
R
 
L
A
 
A
G
 
A
E
 
K
A
 
T
C
 
L
R
 
K
K
 
D
A
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
V
 
V
H
 
Y
A
 
A
A
 
I
A
 
V
A
 
T
H
 
H
G
 
G
L
 
I
F
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
K
G
 
A
P
 
I
E
 
K
I
 
V
L
 
I
E
 
N
S
 
E
P
 
S
V
 
A
F
 
L
D
 
E
Q
 
K
L
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
T
D
 
N
T
 
T
V
 
I
P
 
P

7yk1A Structural basis of human prps2 filaments (see paper)
30% identity, 97% coverage: 7:313/317 of query aligns to 4:291/306 of 7yk1A

query
sites
7yk1A
L
 
V
L
 
L
F
 
F
A
 
S
L
 
G
H
 
S
G
 
S
T
 
H
Q
 
Q
E
 
D
Y
 
L
A
 
S
A
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
R
 
D
H
 
R
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
G
E
 
K
L
 
V
E
 
V
E
 
T
R
 
K
A
 
K
F
|
F
E
 
S
D
x
N
G
 
Q
E
|
E
H
 
T
K
 
S
T
 
V
R
 
E
A
 
I
L
 
G
T
 
E
S
|
S
V
 
V
E
x
R
S
 
G
R
 
E
N
 
D
A
 
V
V
 
Y
V
 
I
F
 
I
H
 
Q
A
 
S
L
 
G
Y
 
C
G
 
G
D
 
E
D
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
I
N
 
N
D
 
D
K
 
N
L
 
L
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
L
F
 
I
F
 
M
C
 
I
G
 
N
A
 
A
L
 
C
K
 
K
D
 
I
A
 
A
G
 
S
A
 
S
R
 
S
H
 
R
V
 
V
Q
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
C
L
 
F
C
 
P
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
K
 
Q
E
 
D
R
 
K
R
x
K
T
x
D
Q
x
K
F
x
S
Q
x
R
D
 
A
P
 
P
I
 
I
I
 
S
T
 
A
R
 
K
Y
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
N
L
 
M
F
 
L
E
 
S
A
 
V
C
 
A
R
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
H
L
 
I
T
 
I
T
 
T
L
 
M
E
 
D
V
 
L
H
|
H
N
 
-
L
 
A
A
 
S
A
 
Q
F
 
I
D
 
Q
N
 
G
A
 
F
F
 
F
R
 
D
I
 
I
P
 
P
T
 
V
R
x
D
H
 
N
I
 
L
E
 
-
S
 
Y
A
 
A
E
 
E
L
 
P
F
 
A
A
 
V
E
 
L
H
 
Q
F
 
W
A
 
I
R
 
R
-
 
E
-
 
N
L
 
I
A
 
A
G
 
E
D
 
W
D
 
K
E
 
N
L
 
C
V
 
I
A
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
V
E
 
T
S
 
S
F
 
I
R
 
A
R
 
D
A
 
R
L
 
L
E
 
N
R
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
V
G
 
E
S
 
F
A
 
A
Y
 
L
M
 
I
E
 
H
K
 
K
Y
 
E
R
 
-
S
 
-
N
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
M
M
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
K
E
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
M
I
 
A
S
x
D
T
 
T
G
x
C
G
 
G
T
|
T
L
 
I
L
 
C
R
 
H
A
 
A
G
 
A
E
 
D
A
 
K
C
 
L
R
 
L
K
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
T
Q
 
K
V
 
V
H
 
Y
A
 
A
A
 
I
A
 
L
A
 
T
H
 
H
G
 
G
L
 
I
F
 
F
T
 
S
G
 
-
G
 
G
P
 
P
E
 
A
I
 
I
-
 
S
-
 
R
L
 
I
E
 
N
S
 
N
P
 
A
V
 
A
F
 
F
D
 
E
Q
 
A
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
T
D
 
N
T
 
T
V
 
I
P
 
P
P
 
Q
F
 
E
R
 
D
L
 
K
P
 
M
P
 
K
E
 
H
L
 
C
V
 
T
S
 
-
R
 
-
R
 
K
L
 
I
T
 
Q
V
 
V
L
 
I
D
 
D
S
 
I
S
 
S
A
 
M
M
 
I
V
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
R

Sites not aligning to the query:

P60891 Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1; PPRibP; Phosphoribosyl pyrophosphate synthase I; PRS-I; EC 2.7.6.1 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
29% identity, 97% coverage: 8:313/317 of query aligns to 6:301/318 of P60891

query
sites
P60891
L
 
I
F
 
F
A
 
S
L
 
G
H
 
S
G
 
S
T
 
H
Q
 
Q
E
 
D
Y
 
L
A
x
S
A
 
Q
R
 
K
V
 
I
A
 
A
R
 
D
H
 
R
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
G
E
 
K
L
 
V
E
 
V
E
 
T
R
 
K
A
 
K
F
 
F
E
 
S
D
 
N
G
 
Q
E
 
E
H
 
T
K
 
C
T
 
V
R
 
E
A
 
I
L
 
G
T
 
E
S
 
S
V
 
V
E
 
R
S
 
G
R
 
E
N
x
D
A
 
V
V
 
Y
V
 
I
F
 
V
H
 
Q
A
 
S
L
 
G
Y
 
C
G
 
G
D
 
E
D
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
I
N
 
N
D
 
D
K
 
N
L
 
L
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
L
F
 
I
F
 
M
C
 
I
G
 
N
A
 
A
L
 
C
K
 
K
D
 
I
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
S
H
 
R
V
 
V
Q
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
C
L
 
F
C
 
P
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
Q
E
 
D
R
 
K
R
 
K
T
 
D
Q
 
K
F
 
S
Q
 
R
D
 
A
P
 
P
I
 
I
I
 
S
T
 
A
R
 
K
Y
 
L
V
 
V
A
 
A
A
x
N
L
 
M
F
 
L
E
 
S
A
 
V
C
 
A
R
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
H
L
 
I
T
 
I
T
 
T
L
 
M
E
 
D
V
x
L
H
 
H
N
 
-
L
 
A
A
x
S
A
 
Q
F
 
I
D
 
Q
N
 
G
A
 
F
F
 
F
R
 
D
I
 
I
P
 
P
T
x
V
R
 
D
H
x
N
I
 
L
E
 
-
S
x
Y
A
 
A
E
 
E
L
 
P
F
 
A
A
 
V
E
 
L
H
 
K
F
 
W
A
 
I
R
 
R
-
 
E
-
 
N
L
 
I
A
 
S
G
 
E
D
 
W
D
 
R
E
 
N
L
 
C
V
 
T
A
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
V
E
 
T
S
 
S
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
I
E
 
A
R
x
D
R
 
R
I
 
L
G
 
N
R
 
V
A
 
D
V
 
F
G
x
A
S
 
L
A
 
I
Y
x
H
M
 
K
E
 
E
K
 
R
Y
 
K
R
 
K
S
 
A
N
 
N
D
 
E
I
 
-
V
 
V
T
x
D
G
 
R
T
 
M
M
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
K
E
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
L
V
|
V
D
 
D
D
 
D
L
 
M
I
 
A
S
 
D
T
 
T
G
 
C
G
 
G
T
 
T
L
 
I
L
 
C
R
x
H
A
 
A
G
 
A
E
 
D
A
 
K
C
 
L
R
 
L
K
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
T
Q
 
R
V
 
V
H
 
Y
A
 
A
A
 
I
A
 
L
A
 
T
H
 
H
G
 
G
L
 
I
F
 
F
T
 
S
G
 
-
G
 
G
P
 
P
E
 
A
I
 
I
-
 
S
-
 
R
L
 
I
E
 
N
S
 
N
P
 
A
V
 
C
F
 
F
D
 
E
Q
 
A
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
T
D
 
N
T
 
T
V
 
I
P
 
P
P
 
Q
F
 
E
R
 
D
L
 
K
P
 
M
P
 
K
E
 
H
L
 
-
V
 
-
S
 
C
R
 
S
R
 
K
L
 
I
T
 
Q
V
 
V
L
 
I
D
 
D
S
 
I
S
 
S
A
 
M
M
 
I
V
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
R

Sites not aligning to the query:

8dbkB Human prps1 with phosphate, atp, and r5p; hexamer with resolved catalytic loops (see paper)
29% identity, 97% coverage: 8:313/317 of query aligns to 5:300/316 of 8dbkB

query
sites
8dbkB
L
 
I
F
 
F
A
 
S
L
 
G
H
 
S
G
 
S
T
 
H
Q
 
Q
E
 
D
Y
 
L
A
 
S
A
 
Q
R
 
K
V
 
I
A
 
A
R
 
D
H
 
R
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
G
E
 
K
L
 
V
E
 
V
E
 
T
R
 
K
A
 
K
F
|
F
E
 
S
D
x
N
G
 
Q
E
|
E
H
 
T
K
 
C
T
 
V
R
 
E
A
 
I
L
 
G
T
 
E
S
|
S
V
 
V
E
x
R
S
 
G
R
 
E
N
 
D
A
 
V
V
 
Y
V
 
I
F
 
V
H
 
Q
A
 
S
L
 
G
Y
 
C
G
 
G
D
 
E
D
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
I
N
 
N
D
 
D
K
 
N
L
 
L
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
L
F
 
I
F
 
M
C
 
I
G
 
N
A
 
A
L
 
C
K
 
K
D
 
I
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
S
H
 
R
V
 
V
Q
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
C
L
 
F
C
 
P
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
K
x
Q
E
 
D
R
 
K
R
 
K
T
 
D
Q
 
K
F
 
S
Q
 
R
D
 
A
P
 
P
I
 
I
I
 
S
T
 
A
R
 
K
Y
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
N
L
 
M
F
 
L
E
 
S
A
 
V
C
 
A
R
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
H
L
 
I
T
 
I
T
 
T
L
 
M
E
 
D
V
 
L
H
|
H
N
 
-
L
 
A
A
 
S
A
 
Q
F
 
I
D
 
Q
N
 
G
A
 
F
F
 
F
R
 
D
I
 
I
P
 
P
T
 
V
R
 
D
H
 
N
I
 
L
E
 
-
S
 
Y
A
 
A
E
 
E
L
 
P
F
 
A
A
 
V
E
 
L
H
 
K
F
 
W
A
 
I
R
 
R
-
 
E
-
 
N
L
 
I
A
 
S
G
 
E
D
 
W
D
 
R
E
 
N
L
 
C
V
 
T
A
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
|
D
A
 
A
G
|
G
G
 
G
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
V
E
 
T
S
 
S
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
I
E
 
A
R
 
D
R
 
R
I
 
L
G
 
N
R
 
V
A
 
D
V
 
F
G
 
A
S
 
L
A
 
I
Y
 
H
M
x
K
E
 
E
K
x
R
Y
 
K
R
 
K
S
 
A
N
|
N
D
 
E
I
 
-
V
 
V
T
 
D
G
 
R
T
 
M
M
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
K
E
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
L
V
 
V
D
|
D
D
|
D
L
 
M
I
 
A
S
x
D
T
|
T
G
x
C
G
|
G
T
|
T
L
 
I
L
 
C
R
 
H
A
 
A
G
 
A
E
 
D
A
 
K
C
 
L
R
 
L
K
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
T
Q
 
R
V
 
V
H
 
Y
A
 
A
A
 
I
A
 
L
A
 
T
H
 
H
G
 
G
L
 
I
F
 
F
T
 
S
G
 
-
G
 
G
P
 
P
E
 
A
I
 
I
-
 
S
-
 
R
L
 
I
E
 
N
S
 
N
P
 
A
V
 
C
F
 
F
D
 
E
Q
 
A
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
T
D
 
N
T
 
T
V
 
I
P
 
P
P
 
Q
F
 
E
R
 
D
L
 
K
P
 
M
P
 
K
E
 
H
L
 
-
V
 
-
S
 
C
R
 
S
R
 
K
L
 
I
T
 
Q
V
 
V
L
 
I
D
 
D
S
 
I
S
 
S
A
 
M
M
 
I
V
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
R

8dbeA Human prps1 with adp; hexamer (see paper)
29% identity, 97% coverage: 8:313/317 of query aligns to 5:300/316 of 8dbeA

query
sites
8dbeA
L
 
I
F
 
F
A
 
S
L
 
G
H
 
S
G
 
S
T
 
H
Q
 
Q
E
 
D
Y
 
L
A
 
S
A
 
Q
R
 
K
V
 
I
A
 
A
R
 
D
H
 
R
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
G
E
 
K
L
 
V
E
 
V
E
 
T
R
 
K
A
 
K
F
|
F
E
 
S
D
x
N
G
 
Q
E
|
E
H
 
T
K
 
C
T
 
V
R
 
E
A
 
I
L
 
G
T
 
E
S
 
S
V
 
V
E
 
R
S
 
G
R
 
E
N
 
D
A
 
V
V
 
Y
V
 
I
F
 
V
H
 
Q
A
 
S
L
 
G
Y
 
C
G
 
G
D
 
E
D
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
I
N
 
N
D
 
D
K
 
N
L
 
L
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
L
F
 
I
F
 
M
C
 
I
G
 
N
A
 
A
L
 
C
K
 
K
D
 
I
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
S
H
 
R
V
 
V
Q
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
C
L
 
F
C
 
P
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
K
x
Q
E
 
D
R
x
K
R
x
K
T
x
D
Q
 
K
F
x
S
Q
x
R
D
 
A
P
 
P
I
 
I
I
 
S
T
 
A
R
 
K
Y
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
N
L
 
M
F
 
L
E
 
S
A
 
V
C
 
A
R
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
H
L
 
I
T
 
I
T
 
T
L
 
M
E
 
D
V
 
L
H
|
H
N
 
-
L
 
A
A
 
S
A
 
Q
F
 
I
D
 
Q
N
 
G
A
 
F
F
 
F
R
 
D
I
 
I
P
 
P
T
 
V
R
x
D
H
 
N
I
 
L
E
 
-
S
x
Y
A
 
A
E
 
E
L
 
P
F
 
A
A
 
V
E
 
L
H
 
K
F
 
W
A
 
I
R
 
R
-
 
E
-
 
N
L
 
I
A
 
S
G
 
E
D
 
W
D
 
R
E
 
N
L
 
C
V
 
T
A
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
|
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
V
E
 
T
S
 
S
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
I
E
 
A
R
 
D
R
 
R
I
 
L
G
 
N
R
 
V
A
 
D
V
 
F
G
 
A
S
 
L
A
 
I
Y
 
H
M
 
K
E
 
E
K
 
R
Y
 
K
R
 
K
S
 
A
N
 
N
D
 
E
I
 
-
V
 
V
T
 
D
G
 
R
T
 
M
M
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
K
E
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
L
V
 
V
D
|
D
D
|
D
L
 
M
I
 
A
S
x
D
T
|
T
G
 
C
G
|
G
T
|
T
L
 
I
L
 
C
R
 
H
A
 
A
G
 
A
E
 
D
A
 
K
C
 
L
R
 
L
K
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
T
Q
 
R
V
 
V
H
 
Y
A
 
A
A
 
I
A
 
L
A
 
T
H
 
H
G
 
G
L
 
I
F
 
F
T
 
S
G
 
-
G
 
G
P
 
P
E
 
A
I
 
I
-
 
S
-
 
R
L
 
I
E
 
N
S
 
N
P
 
A
V
 
C
F
 
F
D
 
E
Q
 
A
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
T
D
 
N
T
 
T
V
 
I
P
 
P
P
 
Q
F
 
E
R
 
D
L
 
K
P
 
M
P
 
K
E
 
H
L
 
-
V
 
-
S
 
C
R
 
S
R
 
K
L
 
I
T
 
Q
V
 
V
L
 
I
D
 
D
S
 
I
S
 
S
A
 
M
M
 
I
V
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
R

Sites not aligning to the query:

2hcrA Crystal structure of human phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1 in complex with amp(atp), cadmium and sulfate ion (see paper)
29% identity, 97% coverage: 8:313/317 of query aligns to 4:293/305 of 2hcrA

query
sites
2hcrA
L
 
I
F
 
F
A
 
S
L
 
G
H
 
S
G
 
S
T
 
H
Q
 
Q
E
 
D
Y
 
L
A
 
S
A
 
Q
R
 
K
V
 
I
A
 
A
R
 
D
H
 
R
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
G
E
 
K
L
 
V
E
 
V
E
 
T
R
 
K
A
 
K
F
 
F
E
 
S
D
 
N
G
 
Q
E
 
E
H
 
T
K
 
C
T
 
V
R
 
E
A
 
I
L
 
G
T
 
E
S
 
S
V
 
V
E
 
R
S
 
G
R
 
E
N
 
D
A
 
V
V
 
Y
V
 
I
F
 
V
H
 
Q
A
 
S
L
 
G
Y
 
C
G
 
G
D
 
E
D
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
I
N
 
N
D
 
D
K
 
N
L
 
L
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
L
F
 
I
F
 
M
C
 
I
G
 
N
A
 
A
L
 
C
K
 
K
D
 
I
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
S
H
 
R
V
 
V
Q
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
C
L
 
F
C
 
P
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
K
x
Q
E
 
D
R
x
K
R
 
K
T
 
D
Q
 
K
F
 
S
Q
 
R
D
 
A
P
 
P
I
 
I
I
 
S
T
 
A
R
 
K
Y
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
N
L
 
M
F
 
L
E
 
S
A
 
V
C
 
A
R
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
H
L
 
I
T
 
I
T
 
T
L
 
M
E
 
D
V
 
L
H
|
H
N
 
-
L
 
A
A
 
S
A
 
Q
F
 
I
D
 
Q
N
 
G
A
 
F
F
 
F
R
 
D
I
 
I
P
 
P
T
 
V
R
 
D
H
 
N
I
 
L
E
 
-
S
 
Y
A
 
A
E
 
E
L
 
P
F
 
A
A
 
V
E
 
L
H
 
K
F
 
W
A
 
I
R
 
R
-
 
E
-
 
N
L
 
I
A
 
S
G
 
E
D
 
W
D
 
R
E
 
N
L
 
C
V
 
T
A
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
V
E
 
T
S
 
S
F
 
I
R
 
A
R
 
D
A
 
R
L
 
L
E
 
N
R
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
V
G
 
D
S
 
F
A
 
A
Y
 
L
M
 
I
E
 
H
K
 
K
Y
 
E
R
 
R
S
 
D
N
 
R
D
 
-
I
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
M
M
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
K
E
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
M
I
 
A
S
 
D
T
 
T
G
 
C
G
 
G
T
 
T
L
 
I
L
 
C
R
 
H
A
 
A
G
 
A
E
 
D
A
 
K
C
 
L
R
 
L
K
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
T
Q
 
R
V
 
V
H
 
Y
A
 
A
A
 
I
A
 
L
A
 
T
H
 
H
G
 
G
L
 
I
F
 
F
T
 
S
G
 
-
G
 
G
P
 
P
E
 
A
I
 
I
-
 
S
-
 
R
L
 
I
E
 
N
S
 
N
P
 
A
V
 
C
F
 
F
D
 
E
Q
 
A
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
T
D
 
N
T
 
T
V
 
I
P
 
P
P
 
Q
F
 
E
R
 
D
L
 
K
P
 
M
P
 
K
E
 
H
L
 
-
V
 
-
S
 
C
R
 
S
R
 
K
L
 
I
T
 
Q
V
 
V
L
 
I
D
 
D
S
 
I
S
 
S
A
 
M
M
 
I
V
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
R

1ibsA Phosphoribosyldiphosphate synthetase in complex with cadmium ions (see paper)
28% identity, 96% coverage: 8:312/317 of query aligns to 4:284/297 of 1ibsA

query
sites
1ibsA
L
 
I
F
 
F
A
 
S
L
 
L
H
 
N
G
 
S
T
 
N
Q
 
P
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
A
 
K
R
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
D
H
 
I
M
 
V
G
 
G
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
A
 
G
E
 
K
L
 
C
E
 
S
E
 
V
R
 
T
A
 
R
F
 
F
E
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
H
 
V
K
 
Q
T
 
I
R
 
N
A
 
I
L
 
E
T
 
E
S
 
S
V
 
I
E
 
R
S
 
G
R
 
C
N
 
D
A
 
C
V
 
Y
V
 
I
F
 
I
H
 
Q
A
 
S
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
D
 
-
D
 
T
E
 
S
R
 
D
S
 
P
V
 
V
N
 
N
D
 
E
K
 
H
L
 
I
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
L
F
 
I
F
 
M
C
 
V
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
R
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
K
H
 
T
V
 
I
Q
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
Y
C
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
K
x
Q
E
 
D
R
|
R
R
 
K
T
 
S
Q
 
R
F
 
-
Q
 
-
D
 
E
P
 
P
I
 
I
I
 
T
T
 
A
R
 
K
Y
 
L
V
 
F
A
 
A
A
 
N
L
 
L
F
 
L
E
 
E
A
 
T
C
 
A
R
 
G
V
 
A
D
 
T
R
 
R
L
 
V
T
 
I
T
 
A
L
 
L
E
 
D
V
 
L
H
|
H
N
 
-
L
 
A
A
 
P
A
 
Q
F
 
I
D
 
Q
N
 
G
A
 
F
F
 
F
R
 
D
I
 
I
P
 
P
T
 
I
R
 
D
H
 
H
I
 
L
E
 
M
S
 
G
A
 
V
E
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
G
E
 
E
H
 
Y
F
 
F
A
 
E
R
 
G
L
 
K
A
 
N
G
 
L
D
 
E
D
 
D
E
 
-
L
 
I
V
 
V
A
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
A
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
V
K
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
R
A
 
K
L
 
L
E
 
A
R
 
D
R
 
R
I
 
L
G
 
K
R
 
A
A
 
P
V
 
I
G
 
-
S
 
-
A
 
A
Y
 
I
M
 
I
E
 
D
K
 
K
Y
 
-
R
 
R
S
 
M
N
 
N
D
 
-
I
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
-
M
 
-
L
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
N
V
 
I
R
 
E
E
 
G
R
 
K
I
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
L
V
 
I
D
 
D
D
 
D
L
 
I
I
 
I
S
x
D
T
|
T
G
x
A
G
 
G
T
|
T
L
 
I
L
 
T
R
 
L
A
 
A
G
 
A
E
 
N
A
 
A
C
 
L
R
 
V
K
 
E
A
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
V
 
V
H
 
Y
A
 
A
A
 
C
A
 
C
A
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
V
F
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
P
G
 
A
P
 
V
E
 
E
I
 
R
L
 
I
E
 
N
S
 
N
P
 
S
V
 
T
F
 
I
D
 
K
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
I
 
V
A
 
T
D
 
N
T
 
S
V
 
I
P
 
-
P
 
-
F
 
-
R
 
K
L
 
L
P
 
P
P
 
E
E
 
E
L
 
K
V
 
K
S
 
I
R
 
E
R
 
R
L
 
F
T
 
K
V
 
Q
L
 
L
D
 
S
S
 
V
S
 
G
A
 
P
M
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
I

1ibsB Phosphoribosyldiphosphate synthetase in complex with cadmium ions (see paper)
28% identity, 96% coverage: 8:312/317 of query aligns to 6:286/299 of 1ibsB

query
sites
1ibsB
L
 
I
F
 
F
A
 
S
L
 
L
H
 
N
G
 
S
T
 
N
Q
 
P
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
A
 
K
R
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
D
H
 
I
M
 
V
G
 
G
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
A
 
G
E
 
K
L
 
C
E
 
S
E
 
V
R
 
T
A
 
R
F
 
F
E
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
H
 
V
K
 
Q
T
 
I
R
 
N
A
 
I
L
 
E
T
 
E
S
 
S
V
 
I
E
 
R
S
 
G
R
 
C
N
 
D
A
 
C
V
 
Y
V
 
I
F
 
I
H
 
Q
A
 
S
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
D
 
-
D
 
T
E
 
S
R
 
D
S
 
P
V
 
V
N
 
N
D
 
E
K
 
H
L
 
I
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
L
F
 
I
F
 
M
C
 
V
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
R
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
K
H
 
T
V
 
I
Q
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
Y
C
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
K
x
Q
E
 
D
R
|
R
R
 
K
T
 
S
Q
 
R
F
 
-
Q
 
-
D
 
E
P
 
P
I
 
I
I
 
T
T
 
A
R
 
K
Y
 
L
V
 
F
A
 
A
A
 
N
L
 
L
F
 
L
E
 
E
A
 
T
C
 
A
R
 
G
V
 
A
D
 
T
R
 
R
L
 
V
T
 
I
T
 
A
L
 
L
E
 
D
V
 
L
H
 
H
N
 
-
L
 
A
A
 
P
A
 
Q
F
 
I
D
 
Q
N
 
G
A
 
F
F
 
F
R
 
D
I
 
I
P
 
P
T
 
I
R
 
D
H
 
H
I
 
L
E
 
M
S
 
G
A
 
V
E
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
G
E
 
E
H
 
Y
F
 
F
A
 
E
R
 
G
L
 
K
A
 
N
G
 
L
D
 
E
D
 
D
E
 
-
L
 
I
V
 
V
A
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
A
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
V
K
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
R
A
 
K
L
 
L
E
 
A
R
 
D
R
 
R
I
 
L
G
 
K
R
 
A
A
 
P
V
 
I
G
 
-
S
 
-
A
 
A
Y
 
I
M
 
I
E
 
D
K
 
K
Y
 
-
R
 
R
S
 
M
N
 
N
D
 
-
I
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
-
M
 
-
L
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
N
V
 
I
R
 
E
E
 
G
R
 
K
I
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
L
V
 
I
D
 
D
D
 
D
L
 
I
I
 
I
S
 
D
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
I
L
 
T
R
 
L
A
 
A
G
 
A
E
 
N
A
 
A
C
 
L
R
 
V
K
 
E
A
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
V
 
V
H
 
Y
A
 
A
A
 
C
A
 
C
A
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
V
F
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
P
G
 
A
P
 
V
E
 
E
I
 
R
L
 
I
E
 
N
S
 
N
P
 
S
V
 
T
F
 
I
D
 
K
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
I
 
V
A
 
T
D
 
N
T
 
S
V
 
I
P
 
-
P
 
-
F
 
-
R
 
K
L
 
L
P
 
P
P
 
E
E
 
E
L
 
K
V
 
K
S
 
I
R
 
E
R
 
R
L
 
F
T
 
K
V
 
Q
L
 
L
D
 
S
S
 
V
S
 
G
A
 
P
M
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
I

8dbgA Human prps1 with phosphate and atp; hexamer (see paper)
29% identity, 97% coverage: 8:313/317 of query aligns to 5:293/309 of 8dbgA

query
sites
8dbgA
L
 
I
F
 
F
A
 
S
L
 
G
H
 
S
G
 
S
T
 
H
Q
 
Q
E
 
D
Y
 
L
A
 
S
A
 
Q
R
 
K
V
 
I
A
 
A
R
 
D
H
 
R
M
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
G
E
 
K
L
 
V
E
 
V
E
 
T
R
 
K
A
 
K
F
|
F
E
 
S
D
x
N
G
 
Q
E
|
E
H
 
T
K
 
C
T
 
V
R
 
E
A
 
I
L
 
G
T
 
E
S
|
S
V
 
V
E
x
R
S
 
G
R
 
E
N
 
D
A
 
V
V
 
Y
V
 
I
F
 
V
H
 
Q
A
 
S
L
 
G
Y
 
C
G
 
G
D
 
E
D
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
I
N
 
N
D
 
D
K
 
N
L
 
L
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
L
F
 
I
F
 
M
C
 
I
G
 
N
A
 
A
L
 
C
K
 
K
D
 
I
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
S
H
 
R
V
 
V
Q
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
C
L
 
F
C
 
P
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
K
x
Q
E
 
D
R
x
K
R
 
K
T
 
D
Q
 
K
F
 
S
Q
 
R
D
 
A
P
 
P
I
 
I
I
 
S
T
 
A
R
 
K
Y
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
N
L
 
M
F
 
L
E
 
S
A
 
V
C
 
A
R
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
H
L
 
I
T
 
I
T
 
T
L
 
M
E
 
D
V
 
L
H
|
H
N
 
-
L
 
A
A
 
S
A
 
Q
F
 
I
D
 
Q
N
 
G
A
 
F
F
 
F
R
 
D
I
 
I
P
 
P
T
 
V
R
 
D
H
 
N
I
 
L
E
 
-
S
 
Y
A
 
A
E
 
E
L
 
P
F
 
A
A
 
V
E
 
L
H
 
K
F
 
W
A
 
I
R
 
R
-
 
E
-
 
N
L
 
I
A
 
S
G
 
E
D
 
W
D
 
R
E
 
N
L
 
C
V
 
T
A
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
V
E
 
T
S
 
S
F
 
I
R
 
A
R
 
D
A
 
R
L
 
L
E
 
N
R
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
V
G
 
D
S
 
F
A
 
A
Y
 
L
M
 
I
E
 
H
K
 
K
Y
 
E
R
 
D
S
 
R
N
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
M
M
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
K
E
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
M
I
 
A
S
x
D
T
|
T
G
x
C
G
 
G
T
|
T
L
 
I
L
 
C
R
 
H
A
 
A
G
 
A
E
 
D
A
 
K
C
 
L
R
 
L
K
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
T
Q
 
R
V
 
V
H
 
Y
A
 
A
A
 
I
A
 
L
A
 
T
H
 
H
G
 
G
L
 
I
F
 
F
T
 
S
G
 
-
G
 
G
P
 
P
E
 
A
I
 
I
-
 
S
-
 
R
L
 
I
E
 
N
S
 
N
P
 
A
V
 
C
F
 
F
D
 
E
Q
 
A
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
T
D
 
N
T
 
T
V
 
I
P
 
P
P
 
Q
F
 
E
R
 
D
L
 
K
P
 
M
P
 
K
E
 
H
L
 
-
V
 
-
S
 
C
R
 
S
R
 
K
L
 
I
T
 
Q
V
 
V
L
 
I
D
 
D
S
 
I
S
 
S
A
 
M
M
 
I
V
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
R

1dkuA Crystal structures of bacillus subtilis phosphoribosylpyrophosphate synthetase: molecular basis of allosteric inhibition and activation. (see paper)
29% identity, 88% coverage: 8:285/317 of query aligns to 4:262/295 of 1dkuA

query
sites
1dkuA
L
 
I
F
 
F
A
 
S
L
 
L
H
 
N
G
 
S
T
 
N
Q
 
P
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
A
 
K
R
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
D
H
 
I
M
 
V
G
 
G
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
A
 
G
E
 
K
L
 
C
E
 
S
E
 
V
R
 
T
A
 
R
F
 
F
E
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
H
 
V
K
 
Q
T
 
I
R
 
N
A
 
I
L
 
E
T
 
E
S
 
S
V
 
I
E
 
R
S
 
G
R
 
C
N
 
D
A
 
C
V
 
Y
V
 
I
F
 
I
H
 
Q
A
 
S
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
D
 
-
D
 
T
E
 
S
R
 
D
S
 
P
V
 
V
N
 
N
D
 
E
K
 
H
L
 
I
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
L
F
 
I
F
 
M
C
 
V
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
R
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
K
H
 
T
V
 
I
Q
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
Y
C
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
K
 
Q
E
 
D
R
 
R
R
x
K
T
 
A
Q
 
R
F
x
S
Q
x
R
D
 
E
P
 
P
I
 
I
I
 
T
T
 
A
R
 
K
Y
 
L
V
 
F
A
 
A
A
 
N
L
 
L
F
 
L
E
 
E
A
 
T
C
 
A
R
 
G
V
 
A
D
 
T
R
 
R
L
 
V
T
 
I
T
 
A
L
 
L
E
 
D
V
 
L
H
|
H
N
 
-
L
 
A
A
 
P
A
 
Q
F
 
I
D
 
Q
N
 
G
A
 
F
F
 
F
R
 
D
I
 
I
P
 
P
T
 
I
R
x
D
H
 
H
I
 
L
E
 
M
S
 
G
A
 
V
E
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
G
E
 
E
H
 
Y
F
 
F
A
 
E
R
 
G
L
 
K
A
 
N
G
 
L
D
 
E
D
 
D
E
 
-
L
 
I
V
 
V
A
 
I
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
A
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
V
K
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
R
A
 
K
L
 
L
E
 
A
R
 
D
R
 
R
I
 
L
G
 
K
R
 
A
A
 
P
V
 
I
G
 
-
S
 
-
A
 
A
Y
 
I
M
 
I
E
 
D
K
 
K
Y
 
-
R
 
R
S
 
M
N
 
N
D
 
-
I
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
-
M
 
-
L
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
N
V
 
I
R
 
E
E
 
G
R
 
K
I
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
L
V
 
I
D
 
D
D
 
D
L
 
I
I
 
I
S
 
D
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
I
L
 
T
R
 
L
A
 
A
G
 
A
E
 
N
A
 
A
C
 
L
R
 
V
K
 
E
A
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
V
 
V
H
 
Y
A
 
A
A
 
C
A
 
C
A
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
V
F
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
P
G
 
A
P
 
V
E
 
E
I
 
R
L
 
I
E
 
N
S
 
N
P
 
S
V
 
T
F
 
I
D
 
K
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
I
 
V
A
 
T
D
 
N
T
 
S
V
 
I

Sites not aligning to the query:

Q63XL8 Ribose-phosphate pyrophosphokinase; RPPK; 5-phospho-D-ribosyl alpha-1-diphosphate synthase; Phosphoribosyl diphosphate synthase; Phosphoribosyl pyrophosphate synthase; P-Rib-PP synthase; PRPP synthase; PRPPase; EC 2.7.6.1 from Burkholderia pseudomallei (strain K96243) (see paper)
29% identity, 88% coverage: 7:286/317 of query aligns to 8:278/318 of Q63XL8

query
sites
Q63XL8
L
 
M
L
 
V
F
 
F
A
 
T
L
 
G
H
 
N
G
 
A
T
 
N
Q
 
P
E
 
A
Y
 
L
A
 
A
A
 
Q
R
 
E
V
 
V
A
 
V
R
 
K
H
 
I
M
 
L
G
 
G
L
 
I
E
 
P
L
 
L
A
 
G
E
 
K
L
 
A
E
 
M
E
 
V
R
 
S
A
 
R
F
 
F
E
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
H
 
I
K
 
Q
T
 
V
R
 
E
A
 
I
L
 
Q
T
 
E
S
 
N
V
 
V
E
 
R
S
 
G
R
 
K
N
 
D
A
 
V
V
 
F
V
 
V
F
 
L
H
 
Q
A
 
S
L
 
T
Y
 
C
G
 
A
D
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
P
V
 
T
N
 
N
D
 
D
K
 
N
L
 
L
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
M
F
 
I
F
 
M
C
 
V
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
R
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
G
H
 
R
V
 
I
Q
 
T
V
 
A
V
 
A
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
C
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
K
x
Q
E
 
D
R
 
R
R
 
R
T
 
P
Q
 
R
F
 
S
Q
 
A
D
 
R
P
 
V
I
 
A
I
 
I
T
 
S
-
 
A
R
 
K
Y
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
N
L
 
M
F
 
L
E
 
E
A
 
I
C
 
A
R
 
G
V
 
V
D
 
E
R
 
R
L
 
I
T
 
I
T
 
T
L
 
M
E
 
D
V
 
L
H
 
H
-
 
A
-
 
D
N
 
Q
L
 
I
A
 
Q
A
 
G
F
 
F
D
 
-
N
 
-
A
 
-
F
 
F
R
 
D
I
 
I
P
 
P
T
 
V
R
 
D
H
 
N
I
 
I
E
 
Y
S
 
A
A
 
T
E
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
L
E
 
G
H
 
D
F
 
L
A
 
-
R
 
R
L
 
K
A
 
Q
G
 
N
D
 
Y
D
 
P
E
 
D
L
 
L
V
 
L
A
 
V
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
A
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
V
K
 
V
R
 
R
A
 
A
E
 
R
S
 
A
F
 
L
R
 
A
R
 
K
A
 
Q
L
 
L
E
 
N
R
 
C
R
 
D
I
 
L
G
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
A
Y
 
I
M
 
I
E
 
D
K
 
K
Y
 
R
R
 
R
S
 
P
N
 
K
D
 
A
I
 
N
V
 
V
T
 
A
G
 
E
T
 
V
M
 
M
-
 
N
L
 
I
V
 
I
G
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
E
E
 
G
R
 
R
I
 
T
A
 
C
I
 
V
I
 
I
V
 
M
D
 
D
D
 
D
L
 
M
I
 
V
S
 
D
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
C
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
Q
A
 
V
C
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
Q
V
 
V
H
 
F
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
V
F
 
L
T
 
S
G
 
G
G
 
G
-
 
A
P
 
A
E
 
D
I
 
R
L
 
I
E
 
A
S
 
A
P
 
S
V
 
A
F
 
L
D
 
D
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
I
 
V
A
 
T
D
 
D
T
 
T
V
 
I
P
 
P

3dahC 2.3 a crystal structure of ribose-phosphate pyrophosphokinase from burkholderia pseudomallei (see paper)
29% identity, 88% coverage: 7:286/317 of query aligns to 3:266/300 of 3dahC

query
sites
3dahC
L
 
M
L
 
V
F
 
F
A
 
T
L
 
G
H
 
N
G
 
A
T
 
N
Q
 
P
E
 
A
Y
 
L
A
 
A
A
 
Q
R
 
E
V
 
V
A
 
V
R
 
K
H
 
I
M
 
L
G
 
G
L
 
I
E
 
P
L
 
L
A
 
G
E
 
K
L
 
A
E
 
M
E
 
V
R
 
S
A
 
R
F
|
F
E
 
S
D
|
D
G
 
G
E
|
E
H
 
I
K
 
Q
T
 
V
R
 
E
A
 
I
L
 
Q
T
 
E
S
 
N
V
 
V
E
 
R
S
 
G
R
 
K
N
 
D
A
 
V
V
 
F
V
 
V
F
 
L
H
 
Q
A
 
S
L
 
T
Y
 
C
G
 
A
D
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
P
V
 
T
N
 
N
D
 
D
K
 
N
L
 
L
C
 
M
R
 
E
L
 
L
L
 
M
F
 
I
F
 
M
C
 
V
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
R
A
 
A
G
 
S
A
 
A
R
 
G
H
 
R
V
 
I
Q
 
T
V
 
A
V
 
A
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
C
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
K
x
Q
E
 
D
R
 
R
R
 
R
T
 
P
Q
 
R
F
 
S
Q
 
A
D
 
R
P
 
V
I
 
A
I
 
I
T
 
S
-
 
A
R
 
K
Y
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
N
L
 
M
F
 
L
E
 
E
A
 
I
C
 
A
R
 
G
V
 
V
D
 
E
R
 
R
L
 
I
T
 
I
T
 
T
L
 
M
E
 
D
V
 
L
H
 
H
-
 
A
-
 
D
N
 
Q
L
 
I
A
 
Q
A
 
G
F
 
F
D
 
-
N
 
-
A
 
-
F
 
F
R
 
D
I
 
I
P
 
P
T
 
V
R
 
D
H
 
N
I
 
I
E
 
Y
S
 
A
A
 
T
E
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
L
E
 
G
H
 
D
F
 
L
A
 
-
R
 
R
L
 
K
A
 
Q
G
 
N
D
 
Y
D
 
P
E
 
D
L
 
L
V
 
L
A
 
V
V
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
A
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
V
K
 
V
R
 
R
A
 
A
E
 
R
S
 
A
F
 
L
R
 
A
R
 
K
A
 
Q
L
 
L
E
 
N
R
 
C
R
 
D
I
 
L
G
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
A
Y
 
I
M
 
I
E
 
D
K
 
K
Y
 
R
R
 
R
S
 
V
N
 
M
D
 
N
I
 
I
V
 
I
T
 
-
G
 
-
T
 
-
M
 
-
L
 
-
V
 
-
G
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
E
E
 
G
R
 
R
I
 
T
A
 
C
I
 
V
I
 
I
V
 
M
D
 
D
D
 
D
L
 
M
I
 
V
S
 
D
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
C
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
Q
A
 
V
C
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
Q
V
 
V
H
 
F
A
 
A
A
 
Y
A
 
A
A
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
V
F
 
L
T
 
S
G
 
G
G
 
G
-
 
A
P
 
A
E
 
D
I
 
R
L
 
I
E
 
A
S
 
A
P
 
S
V
 
A
F
 
L
D
 
D
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
I
 
V
A
 
T
D
 
D
T
 
T
V
 
I
P
 
P

Query Sequence

>WP_011913248.1 NCBI__GCF_000013785.1:WP_011913248.1
MNTRPPLLFALHGTQEYAARVARHMGLELAELEERAFEDGEHKTRALTSVESRNAVVFHA
LYGDDERSVNDKLCRLLFFCGALKDAGARHVQVVAPYLCYARKERRTQFQDPIITRYVAA
LFEACRVDRLTTLEVHNLAAFDNAFRIPTRHIESAELFAEHFARLAGDDELVAVSPDAGG
AKRAESFRRALERRIGRAVGSAYMEKYRSNDIVTGTMLVGDVRERIAIIVDDLISTGGTL
LRAGEACRKAGARQVHAAAAHGLFTGGPEILESPVFDQLVIADTVPPFRLPPELVSRRLT
VLDSSAMVAAALKSEYG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory