SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011913318.1 NCBI__GCF_000013785.1:WP_011913318.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 19 hits to proteins with known functional sites (download)

4wjmA Crystal structure of fructokinase from brucella abortus 2308 with bound amppnp
35% identity, 100% coverage: 1:309/310 of query aligns to 7:312/312 of 4wjmA

query
sites
4wjmA
M
 
M
Y
 
I
L
 
L
V
 
C
C
 
C
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
I
D
 
D
V
 
M
F
 
L
T
 
P
G
 
R
P
 
E
G
 
-
A
 
T
S
 
T
G
 
G
N
 
G
R
 
E
L
 
T
N
 
A
L
 
F
E
 
Q
A
 
P
V
 
F
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
V
Y
 
F
N
 
N
V
 
T
A
 
A
V
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
G
V
 
V
K
 
P
A
 
T
A
 
G
L
 
F
L
 
F
G
 
S
G
 
G
L
 
I
S
 
S
N
 
S
D
 
D
H
 
F
F
 
F
G
 
G
Q
 
D
R
 
V
L
 
L
L
 
R
G
 
D
L
 
T
L
 
L
Q
 
A
K
 
R
E
 
S
G
 
N
V
 
V
D
 
D
T
 
Y
G
 
S
Q
 
F
L
 
A
V
 
A
I
 
I
F
 
S
D
 
N
A
 
R
P
 
P
T
 
T
T
 
T
L
 
L
A
 
A
M
 
F
V
 
V
A
 
R
L
 
L
G
 
-
S
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
Q
P
 
A
V
 
R
Y
 
Y
S
 
A
F
 
F
R
 
Y
G
 
D
D
 
E
G
 
N
C
 
T
A
 
A
D
 
G
R
 
R
L
 
M
L
 
L
Q
 
S
P
 
R
E
 
N
Q
 
D
L
 
M
R
 
P
P
 
Y
L
 
V
P
 
D
D
 
E
R
 
T
V
 
I
R
 
S
G
 
A
I
 
M
H
 
L
F
 
F
G
 
G
S
 
C
Y
 
I
S
 
S
L
 
L
V
 
I
A
 
S
S
 
E
P
 
P
I
 
C
A
 
G
E
 
S
T
 
V
L
 
Y
L
 
E
E
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
A
R
 
R
E
 
E
Q
 
A
A
 
P
Q
 
N
R
 
R
L
 
V
I
 
M
S
 
F
L
 
L
D
 
D
P
 
P
N
 
N
V
 
I
R
 
R
L
 
A
N
 
N
V
 
L
E
 
I
P
 
T
D
 
V
L
 
R
A
 
K
R
 
T
W
 
H
R
 
L
E
 
T
R
 
R
V
 
M
E
 
K
A
 
R
F
 
M
A
 
I
E
 
A
Q
 
L
A
 
A
H
 
D
L
 
I
I
 
V
K
 
K
V
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
D
L
 
W
L
 
F
Y
 
G
P
 
E
G
 
K
V
 
G
E
 
S
P
 
H
H
 
D
G
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
A
R
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
K
N
 
L
H
 
G
A
 
P
E
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
T
|
T
R
 
K
G
|
G
R
x
A
D
 
H
G
|
G
A
 
A
Q
 
V
L
 
A
F
 
Y
S
 
T
R
 
-
Q
 
N
H
 
H
G
 
A
Q
 
T
L
 
V
A
 
P
I
 
V
A
 
P
A
 
G
Q
 
V
P
 
K
A
 
V
T
 
D
V
 
V
C
 
V
D
 
D
S
 
T
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
T
F
x
V
Q
 
N
A
 
A
A
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
A
Y
 
S
L
 
L
T
 
H
E
 
S
Q
 
Q
R
 
G
L
 
L
D
 
L
S
 
T
P
 
K
A
 
D
G
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
M
 
L
S
 
S
P
 
E
A
 
D
Q
 
Q
L
 
I
Q
 
H
A
 
S
M
 
A
L
 
V
E
 
A
F
 
L
A
 
G
S
x
V
K
 
R
A
 
A
A
|
A
A
 
A
I
 
V
T
 
T
C
 
V
S
 
S
R
 
R
R
 
A
G
 
G
P
 
A
E
 
N
L
 
P
P
 
P
Y
 
W
R
 
A
Y
 
H
E
 
E
I
 
M

7fcaD Pfkb(mycobacterium marinum) (see paper)
34% identity, 96% coverage: 3:300/310 of query aligns to 5:281/282 of 7fcaD

query
sites
7fcaD
L
 
L
V
 
V
C
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
I
D
 
D
V
 
I
F
 
V
T
 
D
G
 
G
P
 
P
G
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
N
 
D
L
 
P
E
 
A
A
 
E
V
 
Y
A
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
Y
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
G
V
 
R
K
 
D
A
 
V
A
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
T
G
 
H
L
 
I
S
 
G
N
x
R
D
 
D
H
 
A
F
 
R
G
 
G
Q
 
R
R
 
R
L
 
I
L
 
A
G
 
E
L
 
Y
L
 
I
Q
 
E
K
 
S
E
 
S
G
 
G
V
 
V
D
 
Q
-
 
L
-
 
V
T
x
S
G
|
G
Q
 
S
L
 
Q
V
 
T
I
 
A
F
 
D
D
 
R
A
 
T
P
 
P
T
 
T
T
 
A
L
 
T
A
 
A
M
 
R
V
 
T
A
 
-
L
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
Y
 
Y
S
 
A
F
 
F
R
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
-
D
 
D
R
 
L
L
 
E
L
 
W
Q
 
Q
P
 
I
E
 
P
Q
 
D
L
 
T
R
 
P
P
 
P
L
 
V
P
 
A
D
 
P
R
 
P
V
 
L
R
 
L
G
 
-
I
 
V
H
 
H
F
 
T
G
 
G
S
 
S
Y
 
I
S
 
A
L
 
A
V
 
A
A
 
R
S
 
E
P
 
P
I
 
G
A
 
C
E
 
L
T
 
A
L
 
V
L
 
A
E
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
D
R
 
A
E
 
Y
Q
 
R
A
 
A
Q
 
A
R
 
A
L
 
T
I
 
V
S
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
V
 
V
R
 
R
-
 
P
-
 
S
L
 
L
N
 
S
V
 
A
E
 
D
P
 
P
D
 
D
L
 
L
A
 
T
R
 
-
W
 
-
R
 
R
E
 
R
R
 
R
V
 
I
E
 
Q
A
 
R
F
 
L
A
 
V
E
 
E
Q
 
R
A
 
S
H
 
D
L
 
I
I
 
I
K
 
K
V
 
A
S
 
S
D
 
A
E
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
H
L
 
W
L
 
I
Y
 
D
P
 
P
G
 
T
V
 
Q
E
 
P
P
 
P
H
 
E
G
 
Q
I
 
T
A
 
A
E
 
R
R
 
A
W
 
W
L
 
L
G
 
A
N
 
C
H
 
G
A
 
P
E
 
A
L
 
I
V
 
V
V
 
A
I
 
L
T
 
T
R
 
L
G
 
G
R
 
D
D
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
V
L
 
A
F
 
F
S
 
C
R
 
-
Q
 
A
H
 
A
G
 
G
Q
 
P
L
 
A
A
 
S
I
 
V
A
 
P
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
A
 
-
T
 
-
V
 
V
C
 
V
D
 
D
S
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
A
F
 
F
Q
 
M
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
D
Y
 
T
L
 
L
T
 
W
E
 
E
Q
 
Q
R
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
A
D
 
D
S
 
R
P
 
R
A
 
T
G
 
E
L
 
L
A
 
R
Q
 
K
M
 
I
S
 
G
P
 
V
A
 
S
Q
 
A
L
 
L
Q
 
T
A
 
S
M
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
V
A
 
A
S
 
A
K
 
L
A
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
L
T
 
T
C
 
V
S
 
A
R
 
R
R
 
A
G
 
G

3gbuA Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with atp
28% identity, 95% coverage: 5:300/310 of query aligns to 5:282/302 of 3gbuA

query
sites
3gbuA
C
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
L
L
 
L
F
 
I
D
 
D
V
 
L
F
 
I
T
 
S
G
 
V
P
 
E
G
 
E
A
 
G
S
 
D
G
 
L
N
 
K
R
 
D
L
 
V
N
 
R
L
 
L
-
 
F
E
 
E
A
 
K
V
 
H
A
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
P
Y
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
V
A
 
S
R
 
R
L
 
L
D
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
S
A
 
S
L
 
L
L
 
I
G
 
S
G
 
K
L
 
V
S
 
G
N
 
N
D
 
D
H
 
P
F
 
F
G
 
G
Q
 
E
R
 
Y
L
 
L
L
 
I
G
 
E
L
 
E
L
 
L
Q
 
S
K
 
K
E
 
E
G
 
N
V
 
V
D
 
D
T
 
T
G
 
R
Q
 
G
L
 
I
V
 
V
I
 
K
F
 
D
D
 
E
A
 
K
P
 
K
T
 
H
T
 
T
L
 
G
A
 
I
M
 
V
V
 
F
A
 
V
L
 
Q
G
 
L
S
 
K
D
 
G
G
 
A
A
 
S
P
 
P
V
 
S
Y
 
F
S
 
L
F
 
L
R
 
Y
G
 
D
D
 
D
G
 
V
C
 
A
A
 
Y
D
 
F
R
 
N
L
 
M
L
 
T
Q
 
L
P
 
N
E
 
D
Q
 
I
L
 
N
R
 
W
P
 
D
L
 
I
P
 
V
D
 
E
R
 
E
V
 
A
R
 
K
G
 
I
I
 
V
H
 
N
F
 
F
G
 
G
S
 
S
Y
 
V
S
 
I
L
 
L
V
 
A
A
 
R
S
 
N
P
 
P
I
 
S
A
 
R
E
 
E
T
 
T
L
 
V
L
 
M
E
 
K
L
 
V
L
 
I
R
 
K
R
 
K
E
 
I
Q
 
K
A
 
G
Q
 
S
R
 
S
L
 
L
I
 
I
S
 
A
L
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
R
L
 
L
N
 
D
V
 
L
E
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
W
 
W
R
 
R
-
 
G
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
E
 
E
R
 
M
V
 
I
E
 
K
A
 
V
F
 
L
A
 
E
E
 
E
Q
 
S
-
 
I
-
 
K
-
 
L
A
 
A
H
 
D
L
 
I
I
 
V
K
|
K
V
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
-
 
V
L
 
L
R
 
Y
L
 
L
L
 
E
Y
 
N
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
E
 
E
P
 
V
H
 
K
G
 
G
I
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
-
H
 
-
A
 
S
E
 
M
L
 
L
V
 
T
V
 
A
I
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
R
 
P
D
 
K
G
 
G
A
 
F
Q
 
R
L
 
L
F
 
I
S
 
-
R
 
K
Q
 
N
H
 
E
G
 
T
Q
 
V
L
 
V
A
 
D
I
 
V
A
 
P
A
 
S
Q
 
Y
P
 
N
A
x
V
T
 
N
V
x
P
C
 
L
D
 
D
S
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
Q
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
-
P
 
-
A
 
V
G
 
G
L
 
I
A
 
L
Q
 
K
M
 
L
S
 
K
P
 
G
A
 
L
Q
 
D
L
 
L
Q
 
L
A
 
K
M
 
L
L
 
G
E
 
K
F
 
F
A
 
A
S
 
N
K
 
L
A
 
V
A
|
A
A
 
A
I
 
L
T
 
S
C
 
T
S
 
Q
R
 
K
R
 
R
G
 
G

3ih0A Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with amp-pnp
28% identity, 95% coverage: 5:300/310 of query aligns to 6:283/304 of 3ih0A

query
sites
3ih0A
C
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
L
L
 
L
F
 
I
D
 
D
V
 
L
F
 
I
T
 
S
G
 
V
P
 
E
G
 
E
A
 
G
S
 
D
G
 
L
N
 
K
R
 
D
L
 
V
N
 
R
L
 
L
-
 
F
E
 
E
A
 
K
V
 
H
A
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
P
Y
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
V
A
 
S
R
 
R
L
 
L
D
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
S
A
 
S
L
 
L
L
 
I
G
 
S
G
 
K
L
 
V
S
 
G
N
 
N
D
 
D
H
 
P
F
 
F
G
 
G
Q
 
E
R
 
Y
L
 
L
L
 
I
G
 
E
L
 
E
L
 
L
Q
 
S
K
 
K
E
 
E
G
 
N
V
 
V
D
 
D
T
 
T
G
 
R
Q
 
G
L
 
I
V
 
V
I
 
K
F
 
D
D
 
E
A
 
K
P
 
K
T
 
H
T
 
T
L
 
G
A
 
I
M
 
V
V
 
F
A
 
V
L
 
Q
G
 
L
S
 
K
D
 
G
G
 
A
A
 
S
P
 
P
V
 
S
Y
 
F
S
 
L
F
 
L
R
 
Y
G
 
D
D
 
D
G
 
V
C
 
A
A
 
Y
D
 
F
R
 
N
L
 
M
L
 
T
Q
 
L
P
 
N
E
 
D
Q
 
I
L
 
N
R
 
W
P
 
D
L
 
I
P
 
V
D
 
E
R
 
E
V
 
A
R
 
K
G
 
I
I
 
V
H
 
N
F
 
F
G
 
G
S
 
S
Y
 
V
S
 
I
L
 
L
V
 
A
A
 
R
S
 
N
P
 
P
I
 
S
A
 
R
E
 
E
T
 
T
L
 
V
L
 
M
E
 
K
L
 
V
L
 
I
R
 
K
R
 
K
E
 
I
Q
 
K
A
 
G
Q
 
S
R
 
S
L
 
L
I
 
I
S
 
A
L
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
R
L
 
L
N
 
D
V
 
L
E
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
W
 
W
R
 
R
-
 
G
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
E
 
E
R
 
M
V
 
I
E
 
K
A
 
V
F
 
L
A
 
E
E
 
E
Q
 
S
-
 
I
-
 
K
-
 
L
A
 
A
H
 
D
L
 
I
I
 
V
K
 
K
V
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
-
 
V
L
 
L
R
 
Y
L
 
L
L
 
E
Y
 
N
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
E
 
E
P
 
V
H
 
K
G
 
G
I
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
-
H
 
-
A
 
S
E
 
M
L
 
L
V
 
T
V
 
A
I
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
R
 
P
D
 
K
G
 
G
A
 
F
Q
 
R
L
 
L
F
 
I
S
 
-
R
 
K
Q
 
N
H
 
E
G
 
T
Q
 
V
L
 
V
A
 
D
I
 
V
A
 
P
A
 
S
Q
 
Y
P
 
N
A
x
V
T
 
N
V
 
P
C
 
L
D
 
D
S
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
Q
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
-
P
 
-
A
 
V
G
 
G
L
 
I
A
 
L
Q
 
K
M
 
L
S
 
K
P
 
G
A
 
L
Q
 
D
L
 
L
Q
 
L
A
 
K
M
 
L
L
 
G
E
 
K
F
 
F
A
 
A
S
 
N
K
 
L
A
 
V
A
|
A
A
 
A
I
 
L
T
 
S
C
 
T
S
 
Q
R
 
K
R
 
R
G
 
G

5eynA Crystal structure of fructokinase from vibrio cholerae o395 in fructose, adp, beryllium trifluoride and calcium ion bound form
30% identity, 75% coverage: 30:263/310 of query aligns to 27:260/306 of 5eynA

query
sites
5eynA
G
 
G
G
|
G
S
x
A
P
 
P
Y
 
A
N
|
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
S
V
 
G
K
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
F
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
V
S
 
G
N
 
N
D
 
D
H
 
P
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
R
 
F
L
 
M
L
 
Q
G
 
Q
L
 
T
L
 
L
Q
 
T
K
 
D
E
 
E
G
 
Q
V
 
V
D
 
D
T
 
C
G
 
-
Q
 
Q
L
 
H
V
 
L
I
 
H
F
 
F
D
 
D
A
 
P
P
 
V
-
 
H
-
 
R
T
 
T
T
 
S
L
 
T
A
 
V
M
 
V
V
 
V
A
 
D
L
 
L
G
 
D
S
 
E
D
x
H
G
 
G
A
 
E
P
 
R
V
 
S
Y
x
F
S
 
T
F
|
F
R
 
M
G
 
V
D
 
K
G
 
P
C
 
S
A
 
A
D
 
D
R
 
Q
L
 
F
L
 
L
Q
 
-
P
 
-
E
 
-
Q
 
Q
L
 
L
R
 
S
P
 
D
L
 
I
P
 
P
D
 
S
R
 
F
V
 
Q
R
 
K
G
 
G
-
 
E
-
 
W
I
 
L
H
 
H
F
 
V
G
 
C
S
 
S
Y
 
I
S
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
N
S
 
Q
P
 
P
I
 
S
-
 
R
A
 
S
E
 
S
T
 
T
L
 
F
L
 
A
E
 
A
L
 
I
L
 
A
R
 
Q
R
 
M
E
 
K
Q
 
E
A
 
V
Q
 
G
R
 
G
L
 
Y
I
 
V
S
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
V
 
L
R
|
R
L
 
E
N
 
E
V
 
V
E
 
W
P
 
S
D
 
E
L
 
P
A
 
Q
R
 
E
W
 
L
R
 
Q
E
 
A
R
 
T
V
 
V
E
 
M
A
 
R
F
 
A
A
 
V
E
 
G
Q
 
L
A
 
A
H
 
D
L
 
V
I
 
V
K
 
K
V
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
L
R
 
Q
L
 
F
L
 
L
Y
 
T
P
 
G
G
 
T
V
 
Q
E
 
S
P
 
I
H
 
E
G
 
E
I
 
G
A
 
L
E
 
Q
R
 
A
W
 
I
L
 
A
G
 
D
N
 
F
H
 
Q
A
 
I
E
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
V
T
|
T
R
 
L
G
|
G
R
x
A
D
 
K
G
 
G
A
 
A
Q
 
-
L
 
L
F
 
V
S
 
A
R
 
T
Q
 
P
H
 
N
G
 
S
Q
 
Q
L
 
Q
A
 
I
I
 
V
A
 
S
A
 
G
Q
 
K
P
x
A
A
x
V
T
 
K
V
 
P
C
 
I
D
 
D
S
x
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
Q
 
V
A
 
G
A
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
Y
Y
 
R
L
 
L
T
 
S

Sites not aligning to the query:

5yggA Crystal structure of fructokinase double-mutant (t261c-h108c) from vibrio cholerae o395 in fructose, adp and potassium ion bound form (see paper)
30% identity, 75% coverage: 30:263/310 of query aligns to 31:264/310 of 5yggA

query
sites
5yggA
G
 
G
G
|
G
S
x
A
P
 
P
Y
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
S
V
 
G
K
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
F
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
V
S
 
G
N
 
N
D
 
D
H
 
P
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
R
 
F
L
 
M
L
 
Q
G
 
Q
L
 
T
L
 
L
Q
 
T
K
 
D
E
 
E
G
 
Q
V
 
V
D
 
D
T
 
C
G
 
-
Q
 
Q
L
 
H
V
 
L
I
 
H
F
 
F
D
 
D
A
 
P
P
 
V
-
 
H
-
 
R
T
 
T
T
 
S
L
 
T
A
 
V
M
 
V
V
 
V
A
 
D
L
 
L
G
 
D
S
 
E
D
 
C
G
 
G
A
 
E
P
 
R
V
 
S
Y
x
F
S
 
T
F
|
F
R
 
M
G
 
V
D
 
K
G
 
P
C
 
S
A
 
A
D
 
D
R
 
Q
L
 
F
L
 
L
Q
 
-
P
 
-
E
 
-
Q
 
Q
L
 
L
R
 
S
P
 
D
L
 
I
P
 
P
D
 
S
R
 
F
V
 
Q
R
 
K
G
 
G
-
 
E
-
 
W
I
 
L
H
 
H
F
 
V
G
 
C
S
 
S
Y
 
I
S
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
N
S
 
Q
P
 
P
I
 
S
-
 
R
A
 
S
E
 
S
T
 
T
L
 
F
L
 
A
E
 
A
L
 
I
L
 
A
R
 
Q
R
 
M
E
 
K
Q
 
E
A
 
V
Q
 
G
R
 
G
L
 
Y
I
 
V
S
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
V
 
L
R
|
R
L
 
E
N
 
E
V
 
V
E
 
W
P
 
S
D
 
E
L
 
P
A
 
Q
R
 
E
W
 
L
R
 
Q
E
 
A
R
 
T
V
 
V
E
 
M
A
 
R
F
 
A
A
 
V
E
 
G
Q
 
L
A
 
A
H
 
D
L
 
V
I
 
V
K
|
K
V
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
L
R
 
Q
L
 
F
L
 
L
Y
 
T
P
 
G
G
 
T
V
 
Q
E
 
S
P
 
I
H
 
E
G
 
E
I
 
G
A
 
L
E
 
Q
R
 
A
W
 
I
L
 
A
G
 
D
N
 
F
H
 
Q
A
 
I
E
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
V
T
|
T
R
 
L
G
|
G
R
 
A
D
 
K
G
 
G
A
 
A
Q
 
-
L
 
L
F
 
V
S
 
A
R
 
T
Q
 
P
H
 
N
G
 
S
Q
 
Q
L
 
Q
A
 
I
I
 
V
A
 
S
A
 
G
Q
 
K
P
x
A
A
x
V
T
 
K
V
 
P
C
 
I
D
 
D
S
 
C
V
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
Q
 
V
A
 
G
A
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
Y
Y
 
R
L
 
L
T
 
S

Sites not aligning to the query:

3lkiB Crystal structure of fructokinase with bound atp from xylella fastidiosa
32% identity, 96% coverage: 3:300/310 of query aligns to 6:302/322 of 3lkiB

query
sites
3lkiB
L
 
L
V
 
C
C
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
I
D
 
D
V
 
M
F
 
L
T
 
A
G
 
Q
P
 
P
G
 
L
A
 
P
S
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
R
L
 
A
N
 
F
L
 
L
E
 
Q
A
 
-
V
 
C
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
P
Y
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
G
V
 
G
K
 
A
A
 
V
A
 
Q
L
 
F
L
 
V
G
 
G
G
 
M
L
 
L
S
 
G
N
 
S
D
 
D
H
 
M
F
 
F
G
 
G
Q
 
D
R
 
F
L
 
L
L
 
F
G
 
D
L
 
S
L
 
F
Q
 
A
K
 
E
E
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
V
T
 
T
G
 
D
Q
 
G
L
 
I
V
 
V
-
 
R
I
 
T
F
 
S
D
 
T
A
 
A
P
 
K
T
 
T
T
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
F
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
-
S
 
-
D
 
D
G
 
G
A
 
E
P
 
R
V
 
S
Y
 
F
S
 
S
F
 
F
R
 
Y
G
 
R
D
 
P
G
 
P
C
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
L
L
 
L
L
 
F
Q
 
R
P
 
V
E
 
E
Q
 
H
L
 
F
R
 
Q
-
 
D
-
 
A
P
 
S
L
 
F
P
 
S
D
 
D
R
 
A
V
 
L
R
 
I
G
 
-
I
 
F
H
 
H
F
 
A
G
 
C
S
 
S
Y
 
N
S
 
S
L
 
M
V
 
T
A
 
D
S
 
A
P
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
V
L
 
T
L
 
F
E
 
E
L
 
G
L
 
M
R
 
R
R
 
R
E
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
A
-
 
G
R
 
A
L
 
I
I
 
V
S
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
L
N
 
N
V
 
F
R
 
R
L
 
P
N
 
M
V
 
L
E
 
W
P
 
P
D
 
N
L
 
G
A
 
E
R
 
N
W
 
P
R
 
A
E
 
S
R
 
R
V
 
L
E
 
W
A
 
K
F
 
G
A
 
L
E
 
S
Q
 
L
A
 
A
H
 
D
L
 
V
I
 
V
K
 
K
V
 
L
S
 
S
D
 
S
E
 
E
D
 
E
L
 
L
R
 
D
L
 
Y
L
 
L
Y
 
A
P
 
N
G
 
T
V
 
L
E
 
A
P
 
A
H
 
D
G
 
A
-
 
N
-
 
A
-
 
V
I
 
I
A
 
Q
E
 
Q
R
 
L
W
 
W
L
 
Q
G
 
G
N
 
-
H
 
R
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
V
 
L
V
 
L
I
 
V
T
|
T
R
x
D
G
 
A
R
 
A
D
 
G
G
 
P
A
 
V
Q
 
H
L
 
W
F
 
Y
S
 
T
R
 
R
Q
 
T
H
 
A
G
 
G
Q
 
G
L
 
-
A
 
E
I
 
V
A
 
P
A
x
T
Q
 
F
P
 
R
A
 
V
T
 
Q
V
 
V
C
 
Q
D
 
D
S
 
S
V
 
N
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
Q
 
V
A
 
G
A
 
G
L
 
M
L
 
L
A
 
-
Y
 
Y
L
 
T
T
 
F
E
 
A
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
F
D
 
D
S
 
D
P
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
I
Q
 
D
M
 
F
-
 
C
-
 
H
S
 
D
P
 
P
A
 
E
Q
 
S
L
 
I
Q
 
V
A
 
S
M
 
T
L
 
L
E
 
R
F
 
F
A
 
A
S
x
A
K
 
A
A
 
V
A
 
G
A
 
A
I
 
L
T
 
A
C
 
V
S
 
T
R
 
R
R
 
Q
G
 
G

Q8ZKR2 Aminoimidazole riboside kinase; AIRs kinase; EC 2.7.1.223 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
29% identity, 85% coverage: 30:292/310 of query aligns to 30:293/319 of Q8ZKR2

query
sites
Q8ZKR2
G
 
G
G
|
G
S
 
A
P
 
S
Y
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
G
V
 
V
G
 
C
L
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
G
V
 
G
K
 
E
A
 
C
A
 
G
L
 
F
L
 
I
G
 
G
G
 
C
L
 
L
S
 
G
N
 
D
D
 
D
H
 
D
F
 
A
G
 
G
Q
 
R
R
 
F
L
 
L
L
 
R
G
 
Q
L
 
V
L
 
F
Q
 
Q
K
 
D
E
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
T
 
V
G
 
T
Q
 
F
L
 
L
V
 
R
I
 
L
-
 
D
F
 
A
D
 
D
A
 
L
P
 
T
T
 
S
T
 
A
L
 
V
A
 
L
M
 
I
V
 
V
A
 
N
L
 
L
G
 
T
S
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
E
P
 
R
V
 
S
Y
 
F
S
 
T
F
x
Y
R
 
L
G
 
V
D
 
H
G
 
P
C
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
T
L
 
Y
L
 
V
Q
 
S
P
 
P
E
 
Q
Q
 
D
L
 
L
R
 
P
P
 
P
L
 
F
P
 
R
D
 
-
R
 
Q
V
 
Y
R
 
E
G
 
W
I
 
F
H
 
Y
F
 
F
G
 
S
S
 
S
Y
 
I
S
 
G
L
 
L
V
 
T
A
 
D
S
 
R
P
 
P
I
 
A
A
 
R
E
 
E
T
 
A
L
 
C
L
 
L
E
 
E
L
 
G
L
 
A
R
 
R
R
 
R
-
 
M
E
 
R
Q
 
E
A
 
A
Q
 
G
R
 
G
L
 
Y
I
 
V
S
 
L
L
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
V
 
L
R
|
R
L
 
S
N
 
K
V
 
M
E
 
W
P
 
G
D
 
N
L
 
T
A
 
D
R
 
E
W
 
I
R
 
P
E
 
E
R
 
L
V
 
I
E
 
A
A
 
R
F
 
S
A
|
A
E
x
A
Q
 
L
A
|
A
H
 
S
L
 
I
I
 
C
K
 
K
V
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
 
E
L
 
L
R
 
C
L
 
Q
L
 
L
Y
 
-
P
 
S
G
 
G
V
 
A
E
 
S
P
 
H
H
 
W
G
 
Q
I
 
D
A
 
A
E
 
R
R
 
Y
W
 
Y
L
 
L
G
 
R
N
 
D
-
 
L
H
x
G
A
 
C
E
 
D
L
 
T
V
 
T
V
 
I
I
 
I
T
 
S
R
 
L
G
 
G
R
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
L
 
L
F
 
I
S
 
T
R
 
A
Q
 
E
H
 
-
G
 
G
Q
 
E
L
 
F
A
 
H
I
 
F
A
 
P
A
 
A
Q
 
P
P
 
R
A
 
V
T
 
D
V
 
V
C
 
V
D
|
D
S
 
T
V
x
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
Q
 
V
A
 
G
A
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
F
Y
 
T
L
 
L
T
 
S
E
 
R
Q
 
A
R
 
N
L
 
C
D
 
W
S
 
D
P
 
H
A
 
A
G
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
-
 
A
M
 
I
S
 
S
P
 
N
A
 
A
Q
 
N
L
 
A
Q
 
C
A
 
G
M
 
A
L
 
M
E
x
A
F
 
V
A
 
T
S
x
A
K
 
K
A
x
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1tz3A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase complexed with aminoimidazole riboside (see paper)
29% identity, 85% coverage: 30:292/310 of query aligns to 26:282/299 of 1tz3A

query
sites
1tz3A
G
 
G
G
|
G
S
 
A
P
 
S
Y
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
G
V
 
V
G
 
C
L
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
G
V
 
G
K
 
E
A
 
C
A
 
G
L
 
F
L
 
I
G
 
G
G
 
C
L
 
L
S
 
G
N
 
D
D
 
D
H
 
D
F
 
A
G
 
G
Q
 
R
R
 
F
L
 
L
L
 
R
G
 
Q
L
 
V
L
 
F
Q
 
Q
K
 
D
E
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
T
 
V
G
 
T
Q
 
F
L
 
L
V
 
R
I
 
L
F
 
-
D
 
D
A
 
A
P
 
D
T
 
L
T
 
T
L
 
S
A
 
A
M
 
V
V
x
L
A
 
I
L
 
V
G
 
N
S
 
S
D
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
Y
x
F
S
 
T
F
x
Y
R
 
L
G
 
V
D
 
H
G
 
P
C
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
T
L
 
Y
L
 
V
Q
 
S
P
 
P
E
 
Q
Q
 
D
L
 
L
R
 
P
P
 
P
L
 
F
P
 
R
D
 
-
R
 
Q
V
 
Y
R
 
E
G
 
W
I
 
F
H
 
Y
F
 
F
G
 
S
S
 
S
Y
 
I
S
 
G
L
 
L
V
 
T
A
 
D
S
 
R
P
 
P
I
 
A
A
 
R
E
 
E
T
 
A
L
 
C
L
 
L
E
 
E
L
 
G
L
 
A
R
 
R
R
 
R
-
 
M
E
 
R
Q
 
E
A
 
A
Q
 
G
R
 
G
L
 
Y
I
 
V
S
 
L
L
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
V
 
L
R
|
R
L
 
S
N
 
K
V
x
M
E
 
W
P
 
G
D
 
N
L
 
T
A
 
D
R
 
E
W
 
I
R
 
P
E
 
E
R
 
L
V
 
I
E
 
A
A
 
R
F
 
S
A
 
A
E
 
A
Q
 
L
A
 
A
H
 
S
L
 
I
I
 
C
K
 
K
V
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
 
E
L
 
L
R
 
C
L
 
Q
L
 
L
Y
 
-
P
 
S
G
 
G
V
 
A
E
 
S
P
 
H
H
 
W
G
 
Q
I
 
D
A
 
A
E
 
R
R
 
Y
W
 
Y
L
 
L
G
 
R
N
 
D
-
 
L
H
 
G
A
 
C
E
 
D
L
 
T
V
 
T
V
 
I
I
 
I
T
 
S
R
 
L
G
 
G
R
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
L
 
L
F
 
I
S
 
T
R
 
A
Q
 
E
H
 
-
G
 
G
Q
 
E
L
 
F
A
 
H
I
 
F
A
 
P
A
 
A
Q
 
P
P
 
R
A
 
V
T
 
D
V
 
V
C
 
V
D
 
D
S
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
Q
 
V
A
 
G
A
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
F
Y
 
T
L
 
L
T
 
S
E
 
R
Q
 
A
R
 
N
L
 
C
D
 
W
S
 
D
P
 
H
A
 
A
G
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
-
 
A
M
 
I
S
 
S
P
 
N
A
 
A
Q
 
N
L
 
A
Q
 
C
A
 
G
M
 
A
L
 
M
E
 
A
F
 
V
A
 
T
S
 
A
K
 
K
A
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1tz6A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase from salmonella enterica complexed with aminoimidazole riboside and atp analog (see paper)
29% identity, 85% coverage: 30:292/310 of query aligns to 26:282/297 of 1tz6A

query
sites
1tz6A
G
 
G
G
|
G
S
 
A
P
 
S
Y
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
G
V
 
V
G
 
C
L
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
G
V
 
G
K
 
E
A
 
C
A
 
G
L
 
F
L
 
I
G
 
G
G
 
C
L
 
L
S
 
G
N
 
D
D
 
D
H
 
D
F
 
A
G
 
G
Q
 
R
R
 
F
L
 
L
L
 
R
G
 
Q
L
 
V
L
 
F
Q
 
Q
K
 
D
E
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
T
 
V
G
 
T
Q
 
F
L
 
L
V
 
R
I
 
L
F
 
-
D
 
D
A
 
A
P
 
D
T
 
L
T
 
T
L
 
S
A
 
A
M
 
V
V
 
L
A
 
I
L
 
V
G
 
N
S
 
S
D
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
Y
x
F
S
 
T
F
x
Y
R
 
L
G
 
V
D
 
H
G
 
P
C
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
T
L
 
Y
L
 
V
Q
 
S
P
 
P
E
 
Q
Q
 
D
L
 
L
R
 
P
P
 
P
L
 
F
P
 
R
D
 
-
R
 
Q
V
 
Y
R
 
E
G
 
W
I
 
F
H
 
Y
F
 
F
G
 
S
S
 
S
Y
 
I
S
 
G
L
 
L
V
 
T
A
 
D
S
 
R
P
 
P
I
 
A
A
 
R
E
 
E
T
 
A
L
 
C
L
 
L
E
 
E
L
 
G
L
 
A
R
 
R
R
 
R
-
 
M
E
 
R
Q
 
E
A
 
A
Q
 
G
R
 
G
L
 
Y
I
 
V
S
 
L
L
 
F
D
 
D
P
 
V
N
|
N
V
 
L
R
|
R
L
 
S
N
 
K
V
x
M
E
 
W
P
 
G
D
 
N
L
 
T
A
 
D
R
 
E
W
 
I
R
 
P
E
 
E
R
 
L
V
 
I
E
 
A
A
 
R
F
 
S
A
 
A
E
 
A
Q
 
L
A
 
A
H
 
S
L
 
I
I
 
C
K
|
K
V
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
x
E
L
 
L
R
 
C
L
 
Q
L
 
L
Y
 
-
P
 
S
G
 
G
V
 
A
E
 
S
P
 
H
H
 
W
G
 
Q
I
 
D
A
 
A
E
 
R
R
 
Y
W
 
Y
L
 
L
G
 
R
N
 
D
-
 
L
H
 
G
A
 
C
E
 
D
L
 
T
V
 
T
V
 
I
I
 
I
T
x
S
R
 
L
G
|
G
R
x
A
D
 
D
G
|
G
A
 
A
Q
 
L
L
 
L
F
 
I
S
 
T
R
 
A
Q
 
E
H
 
-
G
 
G
Q
 
E
L
 
F
A
 
H
I
 
F
A
 
P
A
 
A
Q
 
P
P
 
R
A
 
V
T
 
D
V
 
V
C
 
V
D
 
D
S
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
Q
 
V
A
 
G
A
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
F
Y
 
T
L
 
L
T
 
S
E
 
R
Q
 
A
R
 
N
L
 
C
D
 
W
S
 
D
P
 
H
A
 
A
G
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
-
 
A
M
 
I
S
 
S
P
 
N
A
 
A
Q
x
N
L
 
A
Q
 
C
A
x
G
M
x
A
L
 
M
E
 
A
F
 
V
A
 
T
S
 
A
K
 
K
A
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1v1aA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound 2- keto-3-deoxygluconate and adp (see paper)
33% identity, 78% coverage: 20:260/310 of query aligns to 24:259/301 of 1v1aA

query
sites
1v1aA
G
 
G
N
 
K
R
 
R
L
 
L
N
 
-
L
 
L
E
 
E
A
 
V
V
 
Y
A
 
V
G
 
G
G
|
G
S
x
A
P
 
E
Y
 
V
N
|
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
V
A
 
G
L
 
F
L
 
V
G
 
G
G
 
R
L
 
V
S
 
G
N
 
E
D
 
D
H
 
E
F
 
L
G
 
G
Q
 
A
R
 
M
L
 
V
L
 
E
G
 
E
L
 
R
L
 
L
Q
 
R
K
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
T
 
L
G
 
T
Q
 
H
L
 
F
V
 
R
I
 
R
F
 
A
D
 
P
A
 
G
P
 
F
T
 
T
T
 
G
L
 
L
A
x
Y
M
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
Y
V
 
L
A
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
Q
D
 
-
G
 
-
A
 
G
P
 
R
V
 
V
Y
 
F
S
 
Y
F
 
Y
R
|
R
G
 
-
D
 
K
G
 
G
C
 
S
A
 
A
D
 
G
R
 
S
L
 
A
L
 
L
Q
 
A
P
 
P
E
 
G
Q
 
A
L
 
F
R
 
D
P
 
P
-
 
D
L
 
Y
P
 
L
D
 
E
R
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
F
I
 
L
H
 
H
F
 
L
G
 
S
S
 
G
Y
 
I
S
 
T
L
 
P
V
 
A
A
 
L
S
 
S
P
 
P
I
 
E
A
 
A
E
 
R
T
 
A
L
 
-
L
 
F
E
 
S
L
 
L
L
 
W
R
 
A
R
 
M
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
V
L
 
R
I
 
V
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
V
 
Y
R
|
R
L
 
Q
N
 
T
V
 
L
-
 
W
E
 
S
P
 
P
D
 
E
L
 
E
A
 
A
R
 
R
W
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
G
F
 
F
A
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
V
H
 
D
L
 
L
I
 
L
K
 
F
V
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
R
 
E
L
 
L
L
 
L
Y
 
F
P
 
G
G
 
R
V
 
V
E
 
E
P
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
E
 
E
R
 
A
W
 
L
L
 
R
G
 
A
N
 
L
H
 
S
A
 
A
E
 
P
L
 
E
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
x
K
R
 
R
G
|
G
R
x
A
D
 
K
G
 
G
A
 
A
Q
 
W
L
 
A
F
 
F
S
 
V
R
 
D
Q
 
G
H
 
R
G
 
-
Q
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
G
A
 
S
A
 
A
Q
 
F
P
 
A
A
 
V
T
 
E
V
 
A
C
 
V
D
 
D
S
 
P
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
Q
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
Y
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q53W83 2-dehydro-3-deoxygluconokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; EC 2.7.1.45 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
33% identity, 78% coverage: 20:260/310 of query aligns to 24:259/309 of Q53W83

query
sites
Q53W83
G
 
G
N
 
K
R
 
R
L
 
L
N
 
-
L
 
L
E
 
E
A
 
V
V
 
Y
A
 
V
G
 
G
G
|
G
S
x
A
P
x
E
Y
x
V
N
|
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
V
A
 
G
L
 
F
L
 
V
G
 
G
G
 
R
L
 
V
S
 
G
N
 
E
D
 
D
H
 
E
F
 
L
G
 
G
Q
 
A
R
 
M
L
 
V
L
 
E
G
 
E
L
 
R
L
 
L
Q
 
R
K
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
T
 
L
G
 
T
Q
 
H
L
 
F
V
 
R
I
 
R
F
 
A
D
 
P
A
 
G
P
 
F
T
 
T
T
 
G
L
 
L
A
 
Y
M
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
Y
V
 
L
A
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
Q
D
 
-
G
 
-
A
 
G
P
 
R
V
 
V
Y
 
F
S
x
Y
F
x
Y
R
|
R
G
 
-
D
 
K
G
 
G
C
 
S
A
 
A
D
 
G
R
 
S
L
 
A
L
 
L
Q
 
A
P
 
P
E
 
G
Q
 
A
L
 
F
R
 
D
P
 
P
-
 
D
L
 
Y
P
 
L
D
 
E
R
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
F
I
 
L
H
 
H
F
 
L
G
 
S
S
 
G
Y
 
I
S
 
T
L
 
P
V
 
A
A
 
L
S
 
S
P
 
P
I
 
E
A
 
A
E
 
R
T
 
A
L
 
-
L
 
F
E
 
S
L
 
L
L
 
W
R
 
A
R
 
M
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
V
L
 
R
I
 
V
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
V
 
Y
R
|
R
L
 
Q
N
 
T
V
 
L
-
 
W
E
 
S
P
 
P
D
 
E
L
 
E
A
 
A
R
 
R
W
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
G
F
 
F
A
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
V
H
 
D
L
 
L
I
 
L
K
 
F
V
 
L
S
|
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
R
 
E
L
 
L
L
 
L
Y
 
F
P
 
G
G
 
R
V
 
V
E
 
E
P
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
E
 
E
R
 
A
W
 
L
L
 
R
G
 
A
N
 
L
H
 
S
A
 
A
E
 
P
L
 
E
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
x
K
R
|
R
G
|
G
R
x
A
D
x
K
G
|
G
A
|
A
Q
 
W
L
 
A
F
 
F
S
 
V
R
 
D
Q
 
G
H
 
R
G
 
-
Q
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
G
A
 
S
A
 
A
Q
 
F
P
 
A
A
 
V
T
 
E
V
 
A
C
 
V
D
 
D
S
 
P
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
Q
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
Y
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1v1bA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound atp (see paper)
33% identity, 78% coverage: 20:260/310 of query aligns to 24:259/300 of 1v1bA

query
sites
1v1bA
G
 
G
N
 
K
R
 
R
L
 
L
N
 
-
L
 
L
E
 
E
A
 
V
V
 
Y
A
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
A
P
 
E
Y
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
V
A
 
G
L
 
F
L
 
V
G
 
G
G
 
R
L
 
V
S
 
G
N
 
E
D
 
D
H
 
E
F
 
L
G
 
G
Q
 
A
R
 
M
L
 
V
L
 
E
G
 
E
L
 
R
L
 
L
Q
 
R
K
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
T
 
L
G
 
T
Q
 
H
L
 
F
V
 
R
I
 
R
F
 
A
D
 
P
A
 
G
P
 
F
T
 
T
T
 
G
L
 
L
A
 
Y
M
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
Y
V
 
L
A
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
Q
D
 
-
G
 
-
A
 
G
P
 
R
V
 
V
Y
 
F
S
 
Y
F
 
Y
R
 
R
G
 
-
D
 
K
G
 
G
C
 
S
A
 
A
D
 
G
R
 
S
L
 
A
L
 
L
Q
 
A
P
 
P
E
 
G
Q
 
A
L
 
F
R
 
D
P
 
P
-
 
D
L
 
Y
P
 
L
D
 
E
R
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
F
I
 
L
H
 
H
F
 
L
G
 
S
S
 
G
Y
 
I
S
 
T
L
 
P
V
 
A
A
 
L
S
 
S
P
 
P
I
 
E
A
 
A
E
 
R
T
 
A
L
 
-
L
 
F
E
 
S
L
 
L
L
 
W
R
 
A
R
 
M
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
V
L
 
R
I
 
V
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
V
 
Y
R
 
R
L
 
Q
N
 
T
V
 
L
-
 
W
E
 
S
P
 
P
D
 
E
L
 
E
A
 
A
R
 
R
W
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
G
F
 
F
A
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
V
H
 
D
L
 
L
I
 
L
K
 
F
V
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
R
 
E
L
 
L
L
 
L
Y
 
F
P
 
G
G
 
R
V
 
V
E
 
E
P
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
E
 
E
R
 
A
W
 
L
L
 
R
G
 
A
N
 
L
H
 
S
A
 
A
E
 
P
L
 
E
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
x
K
R
 
R
G
|
G
R
 
A
D
 
K
G
 
G
A
 
A
Q
 
W
L
 
A
F
 
F
S
 
V
R
 
D
Q
 
G
H
 
R
G
 
-
Q
 
R
L
 
V
A
 
E
I
 
G
A
 
S
A
|
A
Q
x
F
P
 
A
A
x
V
T
 
E
V
 
A
C
 
V
D
 
D
S
 
P
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
Q
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
Y
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3iq0B Crystal structure of a putative ribokinase ii in complex with atp and mg+2 from e.Coli
24% identity, 87% coverage: 31:301/310 of query aligns to 36:291/308 of 3iq0B

query
sites
3iq0B
G
 
G
S
 
A
P
 
P
Y
 
A
N
 
I
V
 
F
A
 
I
V
 
D
G
 
Q
L
 
V
A
 
T
R
 
R
L
 
L
D
 
G
V
 
V
K
 
P
A
 
C
A
 
G
L
 
I
L
 
I
G
 
S
G
 
C
L
 
V
S
 
G
N
 
N
D
 
D
H
 
G
F
 
F
G
 
G
Q
 
D
R
 
I
L
 
N
L
 
I
G
 
H
L
 
R
L
 
L
Q
 
A
K
 
A
E
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
D
T
 
I
G
 
R
Q
 
G
L
 
I
V
 
S
I
 
V
F
 
L
D
 
P
A
 
L
P
 
E
T
 
A
T
 
T
L
 
G
A
 
S
M
 
A
V
 
F
A
 
V
L
 
T
G
 
Y
S
 
G
D
 
D
G
 
R
A
 
D
P
 
F
V
 
I
Y
 
F
S
 
N
F
 
I
R
 
K
G
 
N
D
 
A
G
 
A
C
 
C
A
 
G
D
 
K
R
 
L
L
 
S
L
 
A
Q
 
Q
P
 
H
E
 
V
Q
 
D
L
 
E
R
 
N
P
 
I
L
 
L
P
 
K
D
 
D
R
 
C
V
 
T
R
 
H
G
 
-
I
 
F
H
 
H
F
 
I
G
 
M
S
 
G
Y
 
S
S
 
S
L
 
L
V
 
F
A
 
S
S
 
F
P
 
H
I
 
M
A
 
V
E
 
D
T
 
A
L
 
V
L
 
K
E
 
K
L
 
A
L
 
V
R
 
T
R
 
I
E
 
V
Q
 
K
A
 
A
Q
 
N
R
 
G
-
 
G
L
 
V
I
 
I
S
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
V
 
I
R
 
R
L
 
K
N
 
E
V
 
M
E
 
L
P
 
-
D
 
D
L
 
I
A
 
P
R
 
E
W
 
M
R
 
R
E
 
D
R
 
A
V
 
L
E
 
H
A
 
F
F
 
V
A
 
L
E
 
E
Q
 
L
A
 
T
H
 
D
L
 
I
I
 
Y
K
 
M
V
 
P
S
|
S
D
 
E
E
 
G
D
 
E
L
 
V
R
 
L
L
 
L
L
 
L
Y
 
S
P
 
P
G
 
H
V
 
S
E
 
T
P
 
P
H
 
E
G
 
R
I
 
A
A
 
I
E
 
A
R
 
G
W
 
F
L
 
L
G
 
E
N
 
E
H
 
G
A
 
V
E
 
K
L
 
E
V
 
V
V
 
I
I
 
V
T
x
K
R
 
R
G
|
G
R
 
N
D
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
S
L
 
Y
F
 
Y
S
 
S
R
 
A
Q
 
N
H
 
E
G
 
-
Q
 
Q
L
 
F
A
 
H
I
 
V
A
 
E
A
 
S
Q
 
Y
P
 
P
A
 
V
T
 
E
V
x
E
C
 
V
D
 
D
S
 
P
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
C
F
|
F
Q
 
G
A
 
G
A
 
A
L
 
W
L
 
I
A
 
A
Y
 
C
L
 
-
T
 
-
E
 
-
Q
 
R
R
 
Q
L
 
L
D
 
G
S
 
F
P
 
D
A
 
A
G
 
H
L
 
R
A
 
A
Q
 
-
M
 
-
S
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
L
 
L
E
 
Q
F
 
Y
A
 
A
S
x
N
K
 
A
A
 
C
A
x
G
A
 
A
I
 
L
T
 
A
C
 
V
S
 
T
R
 
R
R
 
R
G
 
G
P
 
P

Q9M394 Fructokinase-like 1, chloroplastic; PEP-associated protein 6; pfkB-type carbohydrate kinase family protein 2 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
23% identity, 75% coverage: 30:263/310 of query aligns to 148:416/471 of Q9M394

query
sites
Q9M394
G
 
G
G
 
G
S
 
P
P
 
P
Y
 
S
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
I
G
 
S
L
 
H
A
 
V
R
 
R
L
 
L
D
 
G
V
 
G
K
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
K
L
 
V
S
 
G
N
 
E
D
 
D
H
 
D
F
 
F
G
 
G
Q
 
D
R
 
E
L
 
L
L
 
V
G
 
L
L
 
M
L
 
M
Q
 
N
K
 
Q
E
 
E
G
 
R
V
 
V
D
 
Q
T
 
T
G
 
-
Q
 
R
L
 
A
V
 
V
I
 
K
F
 
F
D
 
D
A
 
E
P
 
N
T
 
S
T
 
K
L
 
T
A
 
A
M
 
C
V
 
T
A
 
R
L
 
V
G
 
K
-
 
I
-
 
K
-
 
F
S
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
P
 
M
V
 
M
Y
 
A
S
 
E
F
 
T
R
 
V
G
 
K
D
 
E
G
 
P
C
 
P
A
 
E
D
 
D
R
 
S
L
 
L
L
 
F
Q
 
A
P
 
S
E
 
E
Q
 
L
L
 
N
R
 
L
P
 
A
L
 
V
P
 
L
D
 
K
R
 
E
V
 
A
R
 
R
G
 
I
I
 
F
H
 
H
F
 
F
G
 
N
S
 
S
Y
 
E
S
 
V
L
 
L
V
 
T
A
 
S
S
 
P
P
 
T
I
 
M
A
 
Q
E
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
F
E
 
T
L
 
A
L
 
I
R
 
Q
-
 
W
R
 
S
E
 
K
Q
 
K
A
 
F
Q
 
G
R
 
G
L
 
L
I
 
I
S
 
F
L
 
F
D
 
D
P
 
L
N
 
N
V
 
L
R
 
P
L
 
L
N
 
P
V
 
L
E
 
W
P
 
R
D
 
S
L
 
R
A
 
N
R
 
E
W
 
T
R
 
R
E
 
K
R
 
L
V
 
I
E
 
K
A
 
K
F
 
A
A
 
W
E
 
N
Q
 
E
A
 
A
H
 
N
L
 
I
I
 
I
K
 
E
V
 
V
S
 
S
D
 
Q
E
 
Q
D
 
E
L
 
L
R
 
E
L
 
F
L
 
L
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
Y
-
 
Y
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
R
-
 
N
-
 
Y
-
 
T
-
 
P
-
 
Q
-
 
Y
-
 
F
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
F
-
 
D
-
 
Q
-
 
T
-
 
K
-
 
N
-
 
R
-
 
R
-
 
D
Y
 
Y
P
 
Y
G
 
H
V
 
Y
E
 
T
P
 
P
H
 
E
G
 
E
I
 
I
A
 
K
E
 
S
R
 
L
W
 
W
L
 
-
G
 
H
N
 
D
H
 
K
A
 
L
E
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
V
I
 
V
T
 
T
R
 
D
G
 
G
R
 
T
D
 
L
G
 
R
A
 
L
Q
 
H
L
 
Y
F
 
Y
S
 
T
R
 
P
Q
 
T
H
 
F
G
 
D
Q
 
G
L
 
V
A
 
V
I
 
I
A
 
G
A
 
T
Q
 
E
P
 
D
A
 
V
T
 
L
V
 
I
-
 
T
-
 
P
-
 
F
-
 
T
C
 
C
D
 
D
S
 
R
V
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
A
F
 
V
Q
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
I
L
 
M
A
 
R
Y
 
K
L
 
L
T
 
T

Sites not aligning to the query:

4xckA Vibrio cholerae o395 ribokinase complexed with adp, ribose and cesium ion. (see paper)
26% identity, 96% coverage: 13:309/310 of query aligns to 21:298/306 of 4xckA

query
sites
4xckA
F
 
F
T
 
P
G
 
R
P
 
P
G
 
G
A
 
E
S
 
T
G
 
L
N
 
H
R
 
G
L
 
R
N
 
N
L
 
Y
E
 
Q
A
 
V
V
 
I
A
 
P
G
 
G
G
|
G
S
x
K
P
 
G
Y
 
A
N
|
N
V
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
M
D
 
Q
V
 
A
K
 
D
A
 
V
A
 
G
L
 
F
L
 
I
G
 
A
G
 
C
L
 
V
S
 
G
N
 
D
D
 
D
H
 
S
F
 
F
G
 
G
Q
 
I
R
 
N
L
 
I
L
 
R
G
 
E
L
 
S
L
 
F
Q
 
K
K
 
L
E
 
D
G
 
G
V
 
I
D
 
N
T
 
T
-
 
A
G
 
G
Q
 
V
L
 
K
V
 
L
I
 
Q
F
 
P
D
 
N
A
 
C
P
 
P
T
 
T
T
 
G
L
 
I
A
|
A
M
 
M
V
 
I
A
 
Q
L
 
V
G
 
S
S
 
D
D
 
S
G
 
G
A
 
E
P
 
N
V
 
S
Y
x
I
S
 
C
F
x
I
R
 
S
G
 
A
D
 
E
G
 
-
C
 
-
A
 
A
D
 
N
R
 
A
L
 
K
L
 
L
Q
 
T
P
 
A
E
 
A
Q
 
A
L
 
I
R
 
E
P
 
P
L
 
D
P
 
L
D
 
A
R
 
A
V
 
I
R
 
R
G
 
D
I
 
A
H
 
R
F
 
Y
G
 
L
S
 
L
Y
 
M
S
 
Q
L
 
L
V
 
-
A
 
-
S
 
-
P
 
-
I
 
-
A
 
-
E
|
E
T
 
T
L
 
P
L
 
L
E
 
D
L
 
G
L
 
I
R
 
L
R
 
K
E
 
-
Q
 
A
A
 
A
Q
 
Q
R
 
E
L
 
A
I
 
K
S
 
T
L
 
A
D
 
K
P
 
T
N
 
N
V
 
V
R
 
I
L
 
L
N
 
N
V
 
P
E
 
A
P
 
P
D
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
W
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
L
V
 
P
E
 
D
A
 
E
F
 
L
A
 
L
E
 
K
Q
 
C
A
 
V
H
 
D
L
 
L
I
 
I
K
 
T
V
 
P
S
 
N
D
 
E
E
 
T
D
 
E
L
 
A
R
 
E
L
 
V
L
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
V
Y
 
Y
P
 
D
G
 
D
V
 
S
E
 
S
P
 
A
H
 
Q
G
 
Q
I
 
A
A
 
A
E
 
D
R
 
A
W
 
L
L
 
H
G
 
C
N
 
K
H
 
G
A
 
I
E
 
E
L
 
I
V
 
V
V
 
I
I
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
R
x
S
D
 
K
G
 
G
A
 
V
Q
 
W
L
 
L
F
 
S
S
 
Q
R
 
N
Q
 
G
H
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
-
A
 
R
I
 
I
A
 
P
A
 
G
Q
 
F
P
 
V
A
x
V
T
 
K
V
 
A
C
 
T
D
 
D
S
x
T
V
x
T
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
T
F
|
F
Q
 
N
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
-
P
 
-
A
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
L
Q
 
Q
M
 
E
S
 
M
P
 
P
A
 
-
Q
 
-
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
M
 
A
L
 
I
E
 
K
F
 
F
A
 
A
S
x
H
K
 
A
A
 
A
A
|
A
A
 
A
I
 
I
T
 
S
C
x
V
S
 
T
R
 
R
R
 
F
G
 
G
P
 
A
E
 
Q
-
 
T
-
 
S
L
 
I
P
 
P
Y
 
T
R
 
R
Y
 
A
E
 
E
I
 
V

Sites not aligning to the query:

3in1A Crystal structure of a putative ribokinase in complex with adp from e.Coli
24% identity, 93% coverage: 9:295/310 of query aligns to 23:288/312 of 3in1A

query
sites
3in1A
L
 
I
F
 
F
D
 
D
V
 
V
F
 
D
T
 
S
G
 
Y
P
 
P
G
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
N
 
-
L
 
L
E
 
E
A
 
R
V
 
I
A
 
A
-
 
M
-
 
T
-
 
T
G
 
G
G
 
G
S
 
D
P
 
A
Y
 
I
N
 
N
V
 
E
A
 
A
V
 
T
G
 
I
L
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
D
 
G
V
 
H
K
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
M
G
 
S
G
 
R
L
 
I
S
 
G
N
 
K
D
 
D
H
 
A
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
F
L
 
I
L
 
L
G
 
D
L
 
H
L
 
C
Q
 
R
K
 
K
E
 
E
G
 
N
V
 
I
D
 
D
T
 
I
G
 
Q
Q
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
Q
-
 
D
V
 
V
I
 
S
F
 
I
D
 
D
A
 
T
P
 
S
T
 
I
T
 
N
L
 
V
A
 
G
M
 
L
V
 
V
A
 
T
L
 
-
G
 
-
S
 
E
D
 
D
G
 
G
A
 
E
P
x
R
V
 
T
Y
 
F
S
 
V
F
 
T
R
 
N
G
 
R
D
 
N
G
 
G
C
 
S
A
 
L
D
 
W
R
 
K
L
 
L
L
 
-
Q
 
-
P
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
R
 
N
V
 
I
R
 
D
G
 
D
I
 
V
H
 
D
F
 
F
G
 
A
S
 
R
Y
 
F
-
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
A
S
 
S
L
 
I
V
 
F
A
 
N
S
 
S
P
 
P
I
 
L
-
 
L
-
 
D
A
 
G
E
 
K
T
 
A
L
 
L
L
 
T
E
 
E
L
 
I
L
 
F
R
 
T
R
 
Q
E
 
A
Q
 
K
A
 
A
Q
 
R
R
 
Q
L
 
M
I
 
I
S
 
I
L
 
C
D
 
A
P
 
D
N
 
M
V
 
I
-
 
K
-
 
P
R
 
R
L
 
L
N
 
N
V
 
E
E
 
T
P
 
L
D
 
D
L
 
-
A
 
-
R
 
-
W
 
-
R
 
-
E
 
D
R
 
I
V
 
C
E
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
S
E
 
Y
Q
 
V
A
 
D
H
 
Y
L
 
L
I
 
F
K
 
P
V
x
N
S
 
F
D
 
A
E
 
E
D
 
-
L
 
A
R
 
K
L
 
L
L
 
L
Y
 
T
P
 
G
G
 
K
V
 
E
E
 
T
P
 
L
H
 
D
G
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
D
R
 
C
W
 
F
L
 
L
G
 
A
N
 
C
H
 
G
A
 
V
E
 
K
L
 
T
V
 
V
V
 
V
I
 
I
T
x
K
R
 
T
G
|
G
R
 
K
D
 
D
G
|
G
A
 
C
Q
 
F
L
 
I
F
 
K
S
 
R
R
 
G
Q
 
D
H
 
M
G
 
T
Q
 
M
L
 
K
A
 
V
I
 
P
A
|
A
A
 
V
Q
 
A
P
 
G
A
 
I
T
 
T
V
 
A
C
 
I
D
 
D
S
x
T
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
N
F
 
F
Q
 
A
A
 
S
A
 
G
L
 
F
L
 
I
A
 
A
Y
 
A
L
 
L
T
 
L
E
 
E
Q
 
G
R
 
K
L
 
-
D
 
-
S
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
M
 
-
S
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
N
L
 
L
Q
 
R
A
 
E
M
 
C
L
 
A
E
 
R
F
 
F
A
 
A
S
x
N
K
 
A
A
 
T
A
|
A
A
 
A
I
 
I
T
 
S

F4I0K2 Fructokinase-like 2, chloroplastic; pfkB-type carbohydrate kinase family protein 1 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
23% identity, 76% coverage: 30:265/310 of query aligns to 251:509/614 of F4I0K2

query
sites
F4I0K2
G
 
G
G
 
G
S
 
C
P
 
A
Y
 
G
N
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
S
L
 
L
D
 
G
V
 
G
K
 
K
A
 
V
A
 
A
L
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
K
L
 
L
S
 
G
N
 
A
D
 
D
H
 
D
F
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
L
 
M
L
 
L
G
 
Y
L
 
Y
L
 
L
Q
 
N
K
 
V
E
 
C
G
 
K
V
 
V
D
 
Q
T
 
T
G
 
R
Q
 
S
L
 
V
V
 
K
I
 
I
F
 
D
D
 
G
A
 
K
P
 
R
T
 
V
T
 
T
L
 
A
A
 
C
M
 
S
V
 
T
A
 
M
L
 
K
G
 
I
S
 
S
D
 
K
G
 
R
A
 
G
P
 
R
V
 
L
Y
 
K
S
 
S
F
 
T
R
 
C
G
 
I
D
 
K
G
 
P
C
 
C
A
 
A
-
 
E
D
 
D
R
 
S
L
 
L
L
 
S
Q
 
K
P
 
S
E
 
E
Q
 
I
L
 
N
R
 
V
P
 
D
L
 
V
P
 
L
D
 
K
R
 
E
V
 
A
R
 
K
G
 
M
I
 
F
H
 
Y
F
 
F
G
 
S
S
 
T
Y
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
L
A
 
D
S
 
K
P
 
K
I
 
M
A
 
M
E
 
S
T
 
T
L
 
T
L
 
I
E
 
Q
L
 
A
L
 
I
R
 
K
-
 
I
R
 
S
E
 
K
Q
 
Q
A
 
L
Q
 
G
R
 
N
L
 
V
I
 
I
S
 
F
L
 
Y
D
 
D
P
 
L
N
 
N
V
 
L
R
 
P
L
 
L
N
 
P
V
 
L
E
 
W
P
 
H
D
 
S
L
 
S
A
 
E
R
 
E
W
 
T
R
 
K
E
 
S
R
 
F
V
 
I
E
 
Q
A
 
E
F
 
V
A
 
W
E
 
N
Q
 
L
A
 
A
H
 
D
L
 
V
I
 
I
K
 
E
V
 
I
S
 
T
D
 
K
E
 
Q
D
 
E
L
 
L
R
 
E
L
 
F
L
 
L
Y
 
C
P
 
-
G
 
G
V
 
I
E
 
E
-
 
P
-
 
T
-
 
E
-
 
E
-
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
E
-
 
N
-
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
H
-
 
Y
-
 
P
P
 
P
H
 
E
G
 
T
I
 
V
A
 
E
E
 
Q
R
 
L
W
 
W
L
 
H
G
 
E
N
 
N
H
 
-
A
 
L
E
 
K
L
 
V
V
 
L
V
 
F
I
 
V
T
 
T
R
 
N
G
 
G
R
 
T
D
 
S
G
 
K
A
 
I
Q
 
H
L
 
Y
F
 
Y
S
 
T
R
 
K
Q
 
E
H
 
H
-
 
N
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
S
G
 
G
Q
 
M
L
 
E
A
 
D
I
 
V
A
 
P
A
 
I
Q
 
T
P
 
P
A
 
F
T
 
T
V
 
R
C
 
-
D
 
D
S
 
M
V
 
S
G
 
A
A
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
G
F
 
I
Q
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
R
Y
 
M
L
 
L
T
 
T
E
 
V
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

2varA Crystal structure of sulfolobus solfataricus 2-keto-3-deoxygluconate kinase complexed with 2-keto-3-deoxygluconate (see paper)
20% identity, 76% coverage: 25:260/310 of query aligns to 27:265/311 of 2varA

query
sites
2varA
L
 
F
E
 
E
A
 
K
V
 
H
A
 
V
G
 
A
G
|
G
S
|
S
P
 
E
Y
 
L
N
 
N
V
 
F
A
 
C
V
 
I
G
 
A
L
 
V
A
 
V
R
 
R
L
 
N
D
 
H
V
 
L
K
 
S
A
 
C
A
 
S
L
 
L
L
 
I
G
 
A
G
 
R
L
 
V
S
 
G
N
 
N
D
 
D
H
 
E
F
 
F
G
 
G
Q
 
K
R
 
N
L
 
I
L
 
I
G
 
E
L
 
Y
L
 
S
Q
 
R
K
 
A
E
 
Q
G
 
G
V
 
I
D
 
D
T
 
T
G
 
S
Q
 
H
L
 
I
V
 
K
I
 
V
F
 
D
D
 
N
A
 
E
P
 
S
T
 
F
T
 
T
L
 
G
A
 
I
M
x
Y
V
 
F
A
 
I
L
 
Q
G
 
R
S
 
G
D
 
Y
G
 
P
A
 
I
P
 
P
V
 
M
Y
 
K
S
 
S
-
 
E
-
x
L
-
 
V
F
x
Y
R
 
Y
G
x
R
D
 
K
G
 
G
C
 
S
A
 
A
D
 
G
R
 
S
L
 
R
L
 
L
Q
 
S
P
 
P
E
 
E
Q
 
D
L
 
I
R
 
N
P
 
E
L
 
N
P
 
Y
D
 
V
R
 
R
-
 
N
V
 
S
R
 
R
G
 
L
I
 
V
H
 
H
F
 
S
G
 
T
S
 
G
Y
x
I
S
 
T
L
 
L
V
 
A
A
 
I
S
 
S
P
 
D
I
 
N
A
 
A
E
 
K
T
 
E
L
 
-
L
 
-
E
 
A
L
 
V
L
 
I
R
 
K
R
 
A
E
 
F
Q
 
E
A
 
L
Q
 
A
R
 
K
L
 
S
I
 
R
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
T
N
 
N
V
 
I
R
|
R
L
 
P
N
 
K
V
 
L
E
 
W
P
 
S
D
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
K
W
 
A
R
 
K
E
 
E
R
 
T
V
 
I
E
 
L
A
 
S
F
 
I
A
 
L
E
 
K
Q
 
K
A
 
Y
H
 
D
L
 
I
-
 
E
I
 
V
K
 
L
V
 
I
S
 
T
D
 
D
-
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
T
R
 
K
L
 
I
L
 
L
Y
 
L
P
 
D
G
 
V
V
 
T
E
 
D
P
 
P
H
 
D
G
 
E
I
 
A
A
 
Y
E
 
R
R
 
K
W
 
Y
L
 
K
G
 
E
N
 
L
H
 
G
A
 
V
E
 
K
L
 
V
V
 
L
V
 
L
I
 
Y
T
x
K
R
 
L
G
|
G
R
x
S
D
 
K
G
|
G
A
 
A
Q
 
I
L
 
A
F
 
Y
S
 
-
R
 
K
Q
 
D
H
 
N
G
 
V
Q
 
K
L
 
A
A
 
F
I
 
K
A
 
D
A
 
A
Q
 
Y
P
 
K
A
 
V
T
 
P
V
 
V
C
 
E
D
 
D
S
 
P
V
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
x
M
Q
 
A
A
 
G
A
 
T
L
 
F
L
 
V
A
 
S

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011913318.1 NCBI__GCF_000013785.1:WP_011913318.1
MYLVCGEALFDVFTGPGASGNRLNLEAVAGGSPYNVAVGLARLDVKAALLGGLSNDHFGQ
RLLGLLQKEGVDTGQLVIFDAPTTLAMVALGSDGAPVYSFRGDGCADRLLQPEQLRPLPD
RVRGIHFGSYSLVASPIAETLLELLRREQAQRLISLDPNVRLNVEPDLARWRERVEAFAE
QAHLIKVSDEDLRLLYPGVEPHGIAERWLGNHAELVVITRGRDGAQLFSRQHGQLAIAAQ
PATVCDSVGAGDTFQAALLAYLTEQRLDSPAGLAQMSPAQLQAMLEFASKAAAITCSRRG
PELPYRYEIA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory