SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011937432.1 NCBI__GCF_000016745.1:WP_011937432.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6yakDDD C-terminal component of the split chain transketolase (see paper)
59% identity, 99% coverage: 5:312/312 of query aligns to 3:310/311 of 6yakDDD

query
sites
6yakDDD
I
 
I
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
E
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
E
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
Q
E
 
E
N
 
N
K
 
P
N
 
K
V
 
I
V
 
V
A
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
D
|
D
L
 
L
S
 
S
G
 
K
S
 
S
T
 
T
K
 
K
T
 
T
G
 
S
V
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
K
 
A
F
 
F
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
F
F
 
F
N
 
N
M
 
M
G
 
G
I
|
I
A
 
A
E
|
E
A
 
Q
N
 
N
M
 
L
V
 
M
G
 
G
T
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
T
V
 
V
G
 
G
K
 
K
I
 
I
P
 
P
F
 
F
L
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
A
I
 
V
F
|
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
A
W
 
F
E
 
E
Q
 
I
I
 
I
R
 
R
Q
 
N
S
 
S
A
 
I
A
 
C
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
A
 
L
N
 
N
V
 
V
K
 
K
I
 
I
V
 
A
A
 
A
T
 
T
H
 
H
G
 
A
G
 
G
V
 
L
T
 
T
V
 
V
G
 
G
E
 
E
D
 
D
G
 
G
G
 
A
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
S
 
A
V
 
I
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
A
I
 
L
M
 
M
R
 
R
A
 
V
I
 
L
P
 
P
N
 
N
I
 
M
T
 
Q
V
 
V
I
 
F
V
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
A
V
 
A
E
 
Q
T
 
T
K
 
R
G
 
A
A
 
I
I
 
V
R
 
K
A
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
E
M
 
I
K
 
E
G
 
G
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
V
 
I
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
N
 
S
K
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
E
I
 
V
F
 
F
P
 
S
E
 
P
D
 
D
H
 
I
R
 
R
F
 
F
E
 
E
I
 
P
G
 
G
K
 
R
G
 
G
A
 
T
E
 
V
L
 
L
V
 
K
A
 
E
G
 
G
S
 
K
H
 
D
M
 
V
T
 
T
F
 
I
V
 
V
T
 
A
T
 
L
G
 
G
L
 
I
M
 
M
T
 
T
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
K
S
 
M
L
 
L
K
 
E
K
 
A
D
 
E
G
 
G
I
 
I
S
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
V
H
 
D
I
 
M
G
 
A
T
 
S
I
 
L
K
 
K
P
 
P
L
 
I
D
 
D
Q
 
R
E
 
E
I
 
L
I
 
L
L
 
V
K
 
E
A
 
S
A
 
A
R
 
R
E
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
A
E
 
E
E
 
E
H
 
H
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
V
L
 
L
G
 
S
E
 
E
N
 
E
C
 
Y
P
 
P
T
 
I
P
 
P
M
 
V
K
 
V
R
 
K
I
 
V
G
 
G
I
 
V
N
 
N
D
 
D
R
 
V
F
 
F
G
 
G
T
 
E
S
 
S
G
 
G
K
 
T
A
 
P
E
 
Q
E
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
E
Y
 
K
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
A
D
 
R
C
 
D
L
 
V
V
 
V
D
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
Q
E
 
K
I
 
A
L
 
L
S
 
T
R
 
L
K
 
K

6rjbB Human transketolase variant t382e (see paper)
41% identity, 98% coverage: 5:311/312 of query aligns to 314:621/622 of 6rjbB

query
sites
6rjbB
I
 
I
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
E
 
Q
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
H
E
 
A
N
 
S
K
 
D
N
 
R
V
 
I
V
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
G
D
|
D
L
 
T
S
 
K
G
 
N
S
 
S
T
 
T
K
 
F
T
 
S
G
 
E
V
 
I
F
 
F
A
 
K
K
 
K
K
 
E
F
 
H
P
 
P
E
 
D
R
 
R
F
 
F
F
 
I
N
 
E
M
 
C
G
 
Y
I
|
I
A
 
A
E
|
E
A
 
Q
N
 
N
M
 
M
V
 
V
G
 
S
T
 
I
A
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
C
A
 
A
A
 
T
V
 
R
G
 
N
K
 
R
-
 
E
I
 
V
P
 
P
F
 
F
L
 
C
S
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
A
I
 
A
F
|
F
A
 
F
A
 
T
G
 
-
R
|
R
A
 
A
W
 
F
E
 
D
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
Q
 
M
S
 
-
A
 
A
A
 
A
Y
 
I
P
 
S
K
 
E
A
 
S
N
 
N
V
 
I
K
 
N
I
 
L
V
 
C
A
 
G
T
 
S
H
 
H
G
 
C
G
 
G
V
 
V
T
 
S
V
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
D
G
 
G
G
 
P
S
 
S
H
x
Q
Q
 
M
S
 
A
V
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
A
I
 
M
M
 
F
R
 
R
A
 
S
I
 
V
P
 
P
N
 
T
I
 
S
T
 
T
V
 
V
I
 
F
V
 
Y
P
 
P
A
 
S
D
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
A
T
 
T
K
 
E
G
 
K
A
 
A
I
 
V
R
 
E
A
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
N
M
 
T
K
 
K
G
 
G
P
 
I
V
 
C
Y
 
F
V
 
I
R
 
R
L
 
T
G
 
S
R
 
R
N
 
P
K
 
E
V
 
N
P
 
A
T
 
I
I
 
I
F
 
Y
P
 
N
E
 
N
D
 
N
H
 
E
R
 
D
F
 
F
E
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
Q
G
 
-
A
 
A
E
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
L
G
 
K
S
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
D
H
 
Q
M
 
V
T
 
T
F
 
V
V
 
I
T
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
V
M
 
T
T
 
L
A
 
H
Q
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
K
D
 
E
G
 
K
I
 
I
S
 
N
A
 
I
R
 
R
V
 
V
V
 
L
H
 
D
I
 
P
G
 
F
T
 
T
I
 
I
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
E
 
K
I
 
L
I
 
I
L
 
L
K
 
D
A
 
S
A
 
A
R
 
R
E
 
A
T
 
T
-
 
K
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
L
T
 
T
A
 
V
E
 
E
E
 
D
H
 
H
S
 
Y
V
 
Y
I
 
E
G
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
S
E
 
S
-
 
A
L
 
V
L
 
V
G
 
G
E
 
E
N
 
P
C
 
G
P
 
I
T
 
T
P
 
-
M
 
V
K
 
T
R
 
H
I
 
L
G
 
A
I
 
V
N
 
N
D
 
-
R
 
R
F
 
V
G
 
P
T
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
P
E
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
Y
 
M
F
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
D
P
 
R
D
 
D
C
 
A
L
 
I
V
 
A
D
 
Q
A
 
A
A
 
V
K
 
R
E
 
G
I
 
L
L
 
I
S
 
T
R
 
K

Sites not aligning to the query:

4kxxA Human transketolase in covalent complex with donor ketose d- sedoheptulose-7-phosphate (see paper)
41% identity, 98% coverage: 5:310/312 of query aligns to 315:621/621 of 4kxxA

query
sites
4kxxA
I
 
I
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
E
 
Q
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
H
E
 
A
N
 
S
K
 
D
N
 
R
V
 
I
V
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
G
D
 
D
L
 
T
S
 
K
G
 
N
S
 
S
T
 
T
K
 
F
T
 
S
G
 
E
V
 
I
F
 
F
A
 
K
K
 
K
K
 
E
F
 
H
P
 
P
E
 
D
R
 
R
F
 
F
F
 
I
N
 
E
M
 
C
G
 
Y
I
 
I
A
 
A
E
|
E
A
 
Q
N
 
N
M
 
M
V
 
V
G
 
S
T
 
I
A
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
C
A
 
A
A
 
T
V
 
R
G
 
N
K
 
R
-
 
T
I
 
V
P
 
P
F
 
F
L
 
C
S
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
A
I
 
A
F
 
F
A
 
F
A
 
T
G
 
-
R
|
R
A
 
A
W
 
F
E
 
D
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
Q
 
M
S
 
-
A
 
A
A
 
A
Y
 
I
P
 
S
K
 
E
A
 
S
N
 
N
V
 
I
K
 
N
I
 
L
V
 
C
A
 
G
T
 
S
H
 
H
G
 
C
G
 
G
V
 
V
T
 
S
V
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
D
G
 
G
G
 
P
S
 
S
H
x
Q
Q
 
M
S
 
A
V
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
A
I
 
M
M
 
F
R
 
R
A
 
S
I
 
V
P
 
P
N
 
T
I
 
S
T
 
T
V
 
V
I
 
F
V
 
Y
P
 
P
A
 
S
D
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
A
T
 
T
K
 
E
G
 
K
A
 
A
I
 
V
R
 
E
A
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
N
M
 
T
K
 
K
G
 
G
P
 
I
V
 
C
Y
 
F
V
 
I
R
 
R
L
 
T
G
 
S
R
 
R
N
 
P
K
 
E
V
 
N
P
 
A
T
 
I
I
 
I
F
 
Y
P
 
N
E
 
N
D
 
N
H
 
E
R
 
D
F
 
F
E
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
Q
G
 
-
A
 
A
E
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
L
G
 
K
S
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
D
H
 
Q
M
 
V
T
 
T
F
 
V
V
 
I
T
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
V
M
 
T
T
 
L
A
 
H
Q
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
K
D
 
E
G
 
K
I
 
I
S
 
N
A
 
I
R
 
R
V
 
V
V
 
L
H
 
D
I
 
P
G
 
F
T
 
T
I
 
I
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
E
 
K
I
 
L
I
 
I
L
 
L
K
 
D
A
 
S
A
 
A
R
 
R
E
 
A
T
 
T
-
 
K
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
L
T
 
T
A
 
V
E
 
E
E
 
D
H
 
H
S
 
Y
V
 
Y
I
 
E
G
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
S
E
 
S
-
 
A
L
 
V
L
 
V
G
 
G
E
 
E
N
 
P
C
 
G
P
 
I
T
 
T
P
 
-
M
 
V
K
 
T
R
 
H
I
 
L
G
 
A
I
 
V
N
 
N
D
 
-
R
 
R
F
 
V
G
 
P
T
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
P
E
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
Y
 
M
F
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
D
P
 
R
D
 
D
C
 
A
L
 
I
V
 
A
D
 
Q
A
 
A
A
 
V
K
 
R
E
 
G
I
 
L
L
 
I
S
 
T

Sites not aligning to the query:

6ha3A Human transketolase variant e160q in covalent complex with donor ketose d-fructose-6-phosphate (see paper)
41% identity, 98% coverage: 5:310/312 of query aligns to 314:620/620 of 6ha3A

query
sites
6ha3A
I
 
I
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
E
 
Q
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
H
E
 
A
N
 
S
K
 
D
N
 
R
V
 
I
V
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
G
D
 
D
L
 
T
S
 
K
G
 
N
S
 
S
T
 
T
K
 
F
T
 
S
G
 
E
V
 
I
F
 
F
A
 
K
K
 
K
K
 
E
F
 
H
P
 
P
E
 
D
R
 
R
F
 
F
F
 
I
N
 
E
M
 
C
G
 
Y
I
 
I
A
 
A
E
|
E
A
 
Q
N
 
N
M
 
M
V
 
V
G
 
S
T
 
I
A
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
C
A
 
A
A
 
T
V
 
R
G
 
N
K
 
R
-
 
T
I
 
V
P
 
P
F
 
F
L
 
C
S
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
A
I
 
A
F
 
F
A
 
F
A
 
T
G
 
-
R
|
R
A
 
A
W
 
F
E
 
D
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
Q
 
M
S
 
-
A
 
A
A
 
A
Y
 
I
P
 
S
K
 
E
A
 
S
N
 
N
V
 
I
K
 
N
I
 
L
V
 
C
A
 
G
T
 
S
H
 
H
G
 
C
G
 
G
V
 
V
T
 
S
V
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
D
G
 
G
G
 
P
S
 
S
H
x
Q
Q
 
M
S
 
A
V
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
A
I
 
M
M
 
F
R
 
R
A
 
S
I
 
V
P
 
P
N
 
T
I
 
S
T
 
T
V
 
V
I
 
F
V
 
Y
P
 
P
A
 
S
D
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
A
T
 
T
K
 
E
G
 
K
A
 
A
I
 
V
R
 
E
A
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
N
M
 
T
K
 
K
G
 
G
P
 
I
V
 
C
Y
 
F
V
 
I
R
 
R
L
 
T
G
 
S
R
 
R
N
 
P
K
 
E
V
 
N
P
 
A
T
 
I
I
 
I
F
 
Y
P
 
N
E
 
N
D
 
N
H
 
E
R
 
D
F
 
F
E
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
Q
G
 
-
A
 
A
E
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
L
G
 
K
S
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
D
H
 
Q
M
 
V
T
 
T
F
 
V
V
 
I
T
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
V
M
 
T
T
 
L
A
 
H
Q
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
K
D
 
E
G
 
K
I
 
I
S
 
N
A
 
I
R
 
R
V
 
V
V
 
L
H
 
D
I
 
P
G
 
F
T
 
T
I
 
I
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
E
 
K
I
 
L
I
 
I
L
 
L
K
 
D
A
 
S
A
 
A
R
 
R
E
 
A
T
 
T
-
 
K
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
L
T
 
T
A
 
V
E
 
E
E
 
D
H
 
H
S
 
Y
V
 
Y
I
 
E
G
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
S
E
 
S
-
 
A
L
 
V
L
 
V
G
 
G
E
 
E
N
 
P
C
 
G
P
 
I
T
 
T
P
 
-
M
 
V
K
 
T
R
 
H
I
 
L
G
 
A
I
 
V
N
 
N
D
 
-
R
 
R
F
 
V
G
 
P
T
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
P
E
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
Y
 
M
F
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
D
P
 
R
D
 
D
C
 
A
L
 
I
V
 
A
D
 
Q
A
 
A
A
 
V
K
 
R
E
 
G
I
 
L
L
 
I
S
 
T

Sites not aligning to the query:

8waaA Human transketolase soaked with donor ketose d-xylulose
41% identity, 98% coverage: 5:310/312 of query aligns to 314:620/620 of 8waaA

query
sites
8waaA
I
 
I
A
 
A
T
 
T
R
|
R
D
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
E
 
Q
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
H
E
 
A
N
 
S
K
 
D
N
 
R
V
 
I
V
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
G
D
|
D
L
 
T
S
 
K
G
 
N
S
|
S
T
 
T
K
 
F
T
 
S
G
 
E
V
 
I
F
 
F
A
 
K
K
 
K
K
 
E
F
 
H
P
 
P
E
 
D
R
 
R
F
 
F
F
 
I
N
 
E
M
 
C
G
 
Y
I
|
I
A
 
A
E
|
E
A
 
Q
N
 
N
M
 
M
V
 
V
G
 
S
T
 
I
A
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
C
A
 
A
A
 
T
V
 
R
G
 
N
K
 
R
-
 
T
I
 
V
P
 
P
F
 
F
L
 
C
S
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
A
I
 
A
F
|
F
A
 
F
A
 
T
G
 
-
R
 
R
A
 
A
W
 
F
E
 
D
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
Q
 
M
S
 
-
A
 
A
A
 
A
Y
 
I
P
 
S
K
 
E
A
 
S
N
 
N
V
 
I
K
 
N
I
 
L
V
 
C
A
 
G
T
 
S
H
|
H
G
 
C
G
 
G
V
 
V
T
 
S
V
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
D
G
 
G
G
 
P
S
 
S
H
x
Q
Q
 
M
S
 
A
V
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
A
I
 
M
M
 
F
R
 
R
A
 
S
I
 
V
P
 
P
N
 
T
I
 
S
T
 
T
V
 
V
I
 
F
V
 
Y
P
 
P
A
 
S
D
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
A
T
 
T
K
 
E
G
 
K
A
 
A
I
 
V
R
 
E
A
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
N
M
 
T
K
 
K
G
 
G
P
 
I
V
 
C
Y
 
F
V
 
I
R
 
R
L
 
T
G
 
S
R
|
R
N
 
P
K
 
E
V
 
N
P
 
A
T
 
I
I
 
I
F
 
Y
P
 
N
E
 
N
D
 
N
H
 
E
R
 
D
F
 
F
E
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
Q
G
 
-
A
 
A
E
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
L
G
 
K
S
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
D
H
 
Q
M
 
V
T
 
T
F
 
V
V
 
I
T
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
V
M
 
T
T
 
L
A
 
H
Q
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
K
D
 
E
G
 
K
I
 
I
S
 
N
A
 
I
R
 
R
V
 
V
V
 
L
H
 
D
I
 
P
G
 
F
T
 
T
I
 
I
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
E
 
K
I
 
L
I
 
I
L
 
L
K
 
D
A
 
S
A
 
A
R
 
R
E
 
A
T
 
T
-
 
K
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
L
T
 
T
A
 
V
E
 
E
E
 
D
H
 
H
S
 
Y
V
 
Y
I
 
E
G
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
S
E
 
S
-
 
A
L
 
V
L
 
V
G
 
G
E
 
E
N
 
P
C
 
G
P
 
I
T
 
T
P
 
-
M
 
V
K
 
T
R
 
H
I
 
L
G
 
A
I
 
V
N
 
N
D
 
-
R
 
R
F
 
V
G
 
P
T
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
P
E
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
Y
 
M
F
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
D
P
 
R
D
 
D
C
 
A
L
 
I
V
 
A
D
 
Q
A
 
A
A
 
V
K
 
R
E
 
G
I
 
L
L
 
I
S
 
T

Sites not aligning to the query:

8wa9A Human transketolase soaked with donor ketose d-fructose
41% identity, 98% coverage: 5:310/312 of query aligns to 314:620/620 of 8wa9A

query
sites
8wa9A
I
 
I
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
E
 
Q
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
H
E
 
A
N
 
S
K
 
D
N
 
R
V
 
I
V
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
G
D
|
D
L
 
T
S
 
K
G
 
N
S
 
S
T
 
T
K
 
F
T
 
S
G
 
E
V
 
I
F
 
F
A
 
K
K
 
K
K
 
E
F
 
H
P
 
P
E
 
D
R
 
R
F
 
F
F
 
I
N
 
E
M
 
C
G
 
Y
I
|
I
A
 
A
E
|
E
A
 
Q
N
 
N
M
 
M
V
 
V
G
 
S
T
 
I
A
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
C
A
 
A
A
 
T
V
 
R
G
 
N
K
 
R
-
 
T
I
 
V
P
 
P
F
 
F
L
 
C
S
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
A
I
 
A
F
|
F
A
 
F
A
 
T
G
 
-
R
 
R
A
 
A
W
 
F
E
 
D
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
Q
 
M
S
 
-
A
 
A
A
 
A
Y
 
I
P
 
S
K
 
E
A
 
S
N
 
N
V
 
I
K
 
N
I
 
L
V
 
C
A
 
G
T
 
S
H
 
H
G
 
C
G
 
G
V
 
V
T
 
S
V
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
D
G
 
G
G
 
P
S
 
S
H
x
Q
Q
 
M
S
 
A
V
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
A
I
 
M
M
 
F
R
 
R
A
 
S
I
 
V
P
 
P
N
 
T
I
 
S
T
 
T
V
 
V
I
 
F
V
 
Y
P
 
P
A
 
S
D
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
A
T
 
T
K
 
E
G
 
K
A
 
A
I
 
V
R
 
E
A
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
N
M
 
T
K
 
K
G
 
G
P
 
I
V
 
C
Y
 
F
V
 
I
R
 
R
L
 
T
G
 
S
R
 
R
N
 
P
K
 
E
V
 
N
P
 
A
T
 
I
I
 
I
F
 
Y
P
 
N
E
 
N
D
 
N
H
 
E
R
 
D
F
 
F
E
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
Q
G
 
-
A
 
A
E
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
L
G
 
K
S
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
D
H
 
Q
M
 
V
T
 
T
F
 
V
V
 
I
T
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
V
M
 
T
T
 
L
A
 
H
Q
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
K
D
 
E
G
 
K
I
 
I
S
 
N
A
 
I
R
 
R
V
 
V
V
 
L
H
 
D
I
 
P
G
 
F
T
 
T
I
 
I
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
E
 
K
I
 
L
I
 
I
L
 
L
K
 
D
A
 
S
A
 
A
R
 
R
E
 
A
T
 
T
-
 
K
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
L
T
 
T
A
 
V
E
 
E
E
 
D
H
 
H
S
 
Y
V
 
Y
I
 
E
G
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
S
E
 
S
-
 
A
L
 
V
L
 
V
G
 
G
E
 
E
N
 
P
C
 
G
P
 
I
T
 
T
P
 
-
M
 
V
K
 
T
R
 
H
I
 
L
G
 
A
I
 
V
N
 
N
D
 
-
R
 
R
F
 
V
G
 
P
T
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
P
E
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
Y
 
M
F
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
D
P
 
R
D
 
D
C
 
A
L
 
I
V
 
A
D
 
Q
A
 
A
A
 
V
K
 
R
E
 
G
I
 
L
L
 
I
S
 
T

Sites not aligning to the query:

4kxyA Human transketolase in complex with thdp analogue (r)-2-(1,2- dihydroxyethyl)-3-deaza-thdp (see paper)
41% identity, 98% coverage: 5:310/312 of query aligns to 314:620/620 of 4kxyA

query
sites
4kxyA
I
 
I
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
E
 
Q
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
H
E
 
A
N
 
S
K
 
D
N
 
R
V
 
I
V
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
G
D
 
D
L
 
T
S
 
K
G
 
N
S
 
S
T
 
T
K
 
F
T
 
S
G
 
E
V
 
I
F
 
F
A
 
K
K
 
K
K
 
E
F
 
H
P
 
P
E
 
D
R
 
R
F
 
F
F
 
I
N
 
E
M
 
C
G
 
Y
I
|
I
A
 
A
E
|
E
A
 
Q
N
 
N
M
 
M
V
 
V
G
 
S
T
 
I
A
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
C
A
 
A
A
 
T
V
 
R
G
 
N
K
 
R
-
 
T
I
 
V
P
 
P
F
 
F
L
 
C
S
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
A
I
 
A
F
|
F
A
 
F
A
 
T
G
 
-
R
|
R
A
 
A
W
 
F
E
 
D
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
Q
 
M
S
 
-
A
 
A
A
 
A
Y
 
I
P
 
S
K
 
E
A
 
S
N
 
N
V
 
I
K
 
N
I
 
L
V
 
C
A
 
G
T
 
S
H
 
H
G
 
C
G
 
G
V
 
V
T
 
S
V
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
D
G
 
G
G
 
P
S
 
S
H
x
Q
Q
 
M
S
 
A
V
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
A
I
 
M
M
 
F
R
 
R
A
 
S
I
 
V
P
 
P
N
 
T
I
 
S
T
 
T
V
 
V
I
 
F
V
 
Y
P
 
P
A
 
S
D
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
A
T
 
T
K
 
E
G
 
K
A
 
A
I
 
V
R
 
E
A
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
N
M
 
T
K
 
K
G
 
G
P
 
I
V
 
C
Y
 
F
V
 
I
R
 
R
L
 
T
G
 
S
R
 
R
N
 
P
K
 
E
V
 
N
P
 
A
T
 
I
I
 
I
F
 
Y
P
 
N
E
 
N
D
 
N
H
 
E
R
 
D
F
 
F
E
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
Q
G
 
-
A
 
A
E
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
L
G
 
K
S
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
D
H
 
Q
M
 
V
T
 
T
F
 
V
V
 
I
T
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
V
M
 
T
T
 
L
A
 
H
Q
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
K
D
 
E
G
 
K
I
 
I
S
 
N
A
 
I
R
 
R
V
 
V
V
 
L
H
 
D
I
 
P
G
 
F
T
 
T
I
 
I
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
E
 
K
I
 
L
I
 
I
L
 
L
K
 
D
A
 
S
A
 
A
R
 
R
E
 
A
T
 
T
-
 
K
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
L
T
 
T
A
 
V
E
 
E
E
 
D
H
 
H
S
 
Y
V
 
Y
I
 
E
G
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
S
E
 
S
-
 
A
L
 
V
L
 
V
G
 
G
E
 
E
N
 
P
C
 
G
P
 
I
T
 
T
P
 
-
M
 
V
K
 
T
R
 
H
I
 
L
G
 
A
I
 
V
N
 
N
D
 
-
R
 
R
F
 
V
G
 
P
T
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
P
E
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
Y
 
M
F
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
D
P
 
R
D
 
D
C
 
A
L
 
I
V
 
A
D
 
Q
A
 
A
A
 
V
K
 
R
E
 
G
I
 
L
L
 
I
S
 
T

Sites not aligning to the query:

4kxvA Human transketolase in covalent complex with donor ketose d-xylulose- 5-phosphate, crystal 1 (see paper)
41% identity, 98% coverage: 5:310/312 of query aligns to 314:620/620 of 4kxvA

query
sites
4kxvA
I
 
I
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
E
 
Q
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
H
E
 
A
N
 
S
K
 
D
N
 
R
V
 
I
V
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
G
D
 
D
L
 
T
S
 
K
G
 
N
S
 
S
T
 
T
K
 
F
T
 
S
G
 
E
V
 
I
F
 
F
A
 
K
K
 
K
K
 
E
F
 
H
P
 
P
E
 
D
R
 
R
F
 
F
F
 
I
N
 
E
M
 
C
G
 
Y
I
 
I
A
 
A
E
|
E
A
 
Q
N
 
N
M
 
M
V
 
V
G
 
S
T
 
I
A
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
C
A
 
A
A
 
T
V
 
R
G
 
N
K
 
R
-
 
T
I
 
V
P
 
P
F
 
F
L
 
C
S
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
A
I
 
A
F
 
F
A
 
F
A
 
T
G
 
-
R
|
R
A
 
A
W
 
F
E
 
D
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
Q
 
M
S
 
-
A
 
A
A
 
A
Y
 
I
P
 
S
K
 
E
A
 
S
N
 
N
V
 
I
K
 
N
I
 
L
V
 
C
A
 
G
T
 
S
H
 
H
G
 
C
G
 
G
V
 
V
T
 
S
V
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
D
G
 
G
G
 
P
S
 
S
H
x
Q
Q
 
M
S
 
A
V
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
A
I
 
M
M
 
F
R
 
R
A
 
S
I
 
V
P
 
P
N
 
T
I
 
S
T
 
T
V
 
V
I
 
F
V
 
Y
P
 
P
A
 
S
D
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
A
T
 
T
K
 
E
G
 
K
A
 
A
I
 
V
R
 
E
A
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
N
M
 
T
K
 
K
G
 
G
P
 
I
V
 
C
Y
 
F
V
 
I
R
 
R
L
 
T
G
 
S
R
 
R
N
 
P
K
 
E
V
 
N
P
 
A
T
 
I
I
 
I
F
 
Y
P
 
N
E
 
N
D
 
N
H
 
E
R
 
D
F
 
F
E
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
Q
G
 
-
A
 
A
E
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
L
G
 
K
S
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
D
H
 
Q
M
 
V
T
 
T
F
 
V
V
 
I
T
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
V
M
 
T
T
 
L
A
 
H
Q
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
K
D
 
E
G
 
K
I
 
I
S
 
N
A
 
I
R
 
R
V
 
V
V
 
L
H
 
D
I
 
P
G
 
F
T
 
T
I
 
I
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
E
 
K
I
 
L
I
 
I
L
 
L
K
 
D
A
 
S
A
 
A
R
 
R
E
 
A
T
 
T
-
 
K
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
L
T
 
T
A
 
V
E
 
E
E
 
D
H
 
H
S
 
Y
V
 
Y
I
 
E
G
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
S
E
 
S
-
 
A
L
 
V
L
 
V
G
 
G
E
 
E
N
 
P
C
 
G
P
 
I
T
 
T
P
 
-
M
 
V
K
 
T
R
 
H
I
 
L
G
 
A
I
 
V
N
 
N
D
 
-
R
 
R
F
 
V
G
 
P
T
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
P
E
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
Y
 
M
F
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
D
P
 
R
D
 
D
C
 
A
L
 
I
V
 
A
D
 
Q
A
 
A
A
 
V
K
 
R
E
 
G
I
 
L
L
 
I
S
 
T

Sites not aligning to the query:

4kxuA Human transketolase in covalent complex with donor ketose d-fructose- 6-phosphate (see paper)
41% identity, 98% coverage: 5:310/312 of query aligns to 314:620/620 of 4kxuA

query
sites
4kxuA
I
 
I
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
E
 
Q
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
H
E
 
A
N
 
S
K
 
D
N
 
R
V
 
I
V
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
G
D
 
D
L
 
T
S
 
K
G
 
N
S
 
S
T
 
T
K
 
F
T
 
S
G
 
E
V
 
I
F
 
F
A
 
K
K
 
K
K
 
E
F
 
H
P
 
P
E
 
D
R
 
R
F
 
F
F
 
I
N
 
E
M
 
C
G
 
Y
I
 
I
A
 
A
E
|
E
A
 
Q
N
 
N
M
 
M
V
 
V
G
 
S
T
 
I
A
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
C
A
 
A
A
 
T
V
 
R
G
 
N
K
 
R
-
 
T
I
 
V
P
 
P
F
 
F
L
 
C
S
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
A
I
 
A
F
 
F
A
 
F
A
 
T
G
 
-
R
|
R
A
 
A
W
 
F
E
 
D
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
Q
 
M
S
 
-
A
 
A
A
 
A
Y
 
I
P
 
S
K
 
E
A
 
S
N
 
N
V
 
I
K
 
N
I
 
L
V
 
C
A
 
G
T
 
S
H
 
H
G
 
C
G
 
G
V
 
V
T
 
S
V
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
D
G
 
G
G
 
P
S
 
S
H
x
Q
Q
 
M
S
 
A
V
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
A
I
 
M
M
 
F
R
 
R
A
 
S
I
 
V
P
 
P
N
 
T
I
 
S
T
 
T
V
 
V
I
 
F
V
 
Y
P
 
P
A
 
S
D
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
A
T
 
T
K
 
E
G
 
K
A
 
A
I
 
V
R
 
E
A
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
N
M
 
T
K
 
K
G
 
G
P
 
I
V
 
C
Y
 
F
V
 
I
R
 
R
L
 
T
G
 
S
R
 
R
N
 
P
K
 
E
V
 
N
P
 
A
T
 
I
I
 
I
F
 
Y
P
 
N
E
 
N
D
 
N
H
 
E
R
 
D
F
 
F
E
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
Q
G
 
-
A
 
A
E
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
L
G
 
K
S
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
D
H
 
Q
M
 
V
T
 
T
F
 
V
V
 
I
T
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
V
M
 
T
T
 
L
A
 
H
Q
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
K
D
 
E
G
 
K
I
 
I
S
 
N
A
 
I
R
 
R
V
 
V
V
 
L
H
 
D
I
 
P
G
 
F
T
 
T
I
 
I
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
E
 
K
I
 
L
I
 
I
L
 
L
K
 
D
A
 
S
A
 
A
R
 
R
E
 
A
T
 
T
-
 
K
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
L
T
 
T
A
 
V
E
 
E
E
 
D
H
 
H
S
 
Y
V
 
Y
I
 
E
G
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
S
E
 
S
-
 
A
L
 
V
L
 
V
G
 
G
E
 
E
N
 
P
C
 
G
P
 
I
T
 
T
P
 
-
M
 
V
K
 
T
R
 
H
I
 
L
G
 
A
I
 
V
N
 
N
D
 
-
R
 
R
F
 
V
G
 
P
T
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
P
E
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
Y
 
M
F
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
D
P
 
R
D
 
D
C
 
A
L
 
I
V
 
A
D
 
Q
A
 
A
A
 
V
K
 
R
E
 
G
I
 
L
L
 
I
S
 
T

Sites not aligning to the query:

8a4dA 1-deoxy-d-xylulose 5-phosphate synthase from pseudomonas aeruginosa with a thiamine analog inhibitor (see paper)
31% identity, 96% coverage: 11:311/312 of query aligns to 268:564/564 of 8a4dA

query
sites
8a4dA
Y
 
F
G
 
G
E
 
Q
T
 
W
L
 
L
A
 
C
E
 
D
L
 
M
G
 
A
A
 
A
E
 
Q
N
 
D
K
 
A
N
 
R
V
 
L
V
 
L
A
 
G
L
 
I
D
 
T
A
 
P
D
x
A
L
x
M
S
 
K
G
 
E
S
 
G
T
 
S
K
 
D
T
 
L
G
 
V
V
 
A
F
 
F
A
 
S
K
 
E
K
 
R
F
 
Y
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
F
 
F
N
 
D
M
 
V
G
 
A
I
|
I
A
 
A
E
|
E
A
 
Q
N
 
H
M
 
A
V
 
V
G
 
T
T
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
C
V
 
E
G
 
G
K
 
M
I
 
K
P
 
P
F
 
V
L
 
V
S
 
A
T
 
I
F
 
Y
A
 
S
I
 
T
F
|
F
A
 
L
A
 
Q
G
 
-
R
|
R
A
 
A
W
 
Y
E
 
D
Q
 
Q
I
 
L
R
 
I
Q
 
H
S
 
D
A
 
V
A
 
A
Y
 
V
P
 
Q
K
 
H
A
 
L
N
 
D
V
 
V
K
 
L
I
 
F
V
 
A
A
 
I
T
 
D
H
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
L
T
 
-
V
 
V
G
 
G
E
 
E
D
 
D
G
 
G
G
 
P
S
 
T
H
 
H
Q
 
A
S
 
G
V
 
S
E
 
F
D
 
D
I
 
I
A
 
S
I
 
Y
M
 
L
R
 
R
A
 
C
I
 
I
P
 
P
N
 
G
I
 
M
T
 
L
V
 
V
I
 
M
V
 
T
P
 
P
A
 
S
D
 
D
G
 
E
V
 
D
E
 
E
T
 
L
K
 
R
G
 
K
A
 
L
I
 
L
R
 
T
A
 
T
A
 
G
A
 
Y
A
 
L
M
 
F
K
 
D
G
 
G
P
 
P
V
 
A
Y
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
Y
G
 
P
R
 
R
N
 
G
K
 
S
V
 
G
P
 
P
T
 
N
-
 
H
-
 
P
I
 
I
F
 
D
P
 
P
E
 
D
D
 
L
H
 
Q
R
 
P
F
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
V
E
 
V
L
 
R
V
 
R
A
 
R
G
 
G
S
 
G
H
 
R
M
 
V
T
 
A
F
 
L
V
 
L
T
 
V
T
 
F
G
 
G
L
 
V
M
 
Q
T
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
I
 
M
A
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
L
K
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
D
A
 
A
R
 
T
V
 
V
V
 
V
H
 
D
I
 
M
G
 
R
T
 
F
I
 
V
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
E
 
A
I
 
L
I
 
V
L
 
R
K
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
G
E
 
S
T
 
H
G
 
E
A
 
L
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
I
E
 
E
E
 
E
H
 
N
S
 
A
V
 
V
I
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
G
E
 
E
L
 
F
L
 
L
-
 
A
G
 
S
E
 
E
N
 
G
C
 
L
P
 
E
T
 
V
P
 
P
M
 
L
K
 
L
R
 
Q
I
 
L
G
 
G
I
 
L
N
 
P
D
 
D
R
 
Y
F
 
Y
G
 
V
T
 
E
S
 
H
G
 
A
K
 
K
A
 
P
E
 
S
E
 
E
L
 
M
L
 
L
K
 
A
Y
 
E
F
 
C
G
 
G
L
 
L
T
 
D
P
 
A
D
 
A
C
 
G
L
 
I
V
 
E
D
 
K
A
 
A
A
 
V
K
 
R
E
 
Q
I
 
R
L
 
L
S
 
D
R
 
R

Sites not aligning to the query:

2o1sB 1-deoxy-d-xylulose 5-phosphate synthase (dxs) from escherichia coli (see paper)
31% identity, 95% coverage: 1:296/312 of query aligns to 187:478/493 of 2o1sB

query
sites
2o1sB
M
 
M
S
 
T
T
 
K
M
 
L
I
 
P
A
 
S
T
 
Y
R
 
S
D
 
K
A
 
I
Y
 
F
G
 
G
E
 
D
T
 
W
L
 
L
A
 
C
E
 
E
L
 
T
G
 
A
A
 
A
E
 
K
N
 
D
K
 
N
N
 
K
V
 
L
V
 
M
A
 
A
L
 
I
D
 
T
A
 
P
D
 
A
L
 
M
S
 
R
G
 
E
S
 
G
T
 
S
K
 
G
T
 
M
G
 
V
V
 
E
F
 
F
A
 
S
K
 
R
K
 
K
F
 
F
P
 
P
E
 
D
R
 
R
F
 
Y
F
 
F
N
 
D
M
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
E
|
E
A
 
Q
N
 
H
M
 
A
V
 
V
G
 
T
T
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
I
V
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
K
P
 
P
F
 
I
L
 
V
S
 
A
T
 
I
F
 
Y
A
 
S
I
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
Q
G
 
-
R
|
R
A
 
A
W
 
Y
E
 
D
Q
 
Q
I
 
V
R
 
L
Q
 
H
S
 
D
A
 
V
A
 
A
Y
 
I
P
 
Q
K
 
K
A
 
L
N
 
P
V
 
V
K
 
L
I
 
F
V
 
A
A
 
I
T
 
D
H
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
-
V
 
V
G
 
G
E
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
Q
S
 
T
H
|
H
Q
 
Q
S
 
G
V
 
A
E
 
F
D
 
D
I
 
L
A
 
S
I
 
Y
M
 
L
R
 
R
A
 
C
I
 
I
P
 
P
N
 
E
I
 
M
T
 
V
V
 
I
I
 
M
V
 
T
P
 
P
A
 
S
D
 
D
G
 
E
V
 
N
E
 
E
T
 
C
K
 
R
G
 
Q
A
 
M
I
 
L
R
 
Y
A
 
T
A
 
G
A
 
Y
A
 
H
M
 
Y
K
 
N
-
 
D
G
 
G
P
 
P
V
 
S
Y
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
Y
G
 
P
R
 
R
-
 
G
N
 
N
K
 
A
V
 
V
P
 
G
T
 
V
I
 
E
F
 
L
P
 
T
E
 
P
D
 
L
H
 
E
R
 
K
F
 
L
E
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
I
E
 
V
L
 
K
V
 
R
A
 
R
G
 
G
S
 
E
H
 
K
M
 
L
T
 
A
F
 
I
V
 
L
T
 
N
T
 
F
G
 
G
L
 
T
M
 
L
T
 
M
A
 
P
Q
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
L
K
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
N
A
 
A
R
 
T
V
 
L
V
 
V
H
 
D
I
 
M
G
 
R
T
 
F
I
 
V
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
E
 
A
I
 
L
I
 
I
L
 
L
K
 
E
A
 
M
A
 
A
R
 
A
E
 
S
T
 
H
G
 
E
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
V
E
 
E
E
 
E
H
 
N
S
 
A
V
 
I
I
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
 
S
A
 
G
V
 
V
A
 
N
E
 
E
-
 
V
L
 
L
L
 
M
G
 
A
E
 
H
N
 
R
C
 
K
P
 
P
T
 
V
P
 
P
M
 
V
K
 
L
R
 
N
I
 
I
G
 
G
I
 
L
N
 
P
D
 
D
R
 
F
F
 
F
G
 
I
T
 
P
S
 
Q
G
 
G
K
 
T
A
 
Q
E
 
E
E
 
E
L
 
M
L
 
R
K
 
A
Y
 
E
F
 
L
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8a5kA Structural analysis of 1-deoxy-d-xylulose 5-phosphate synthase from pseudomonas aeruginosa and klebsiella pneumoniae reveals conformational changes upon cofactor binding (see paper)
31% identity, 92% coverage: 11:296/312 of query aligns to 268:549/562 of 8a5kA

query
sites
8a5kA
Y
 
F
G
 
G
E
 
Q
T
 
W
L
 
L
A
 
C
E
 
D
L
 
M
G
 
A
A
 
A
E
 
Q
N
 
D
K
 
A
N
 
R
V
 
L
V
 
L
A
 
G
L
 
I
D
 
T
A
 
P
D
 
A
L
 
M
S
 
K
G
 
E
S
 
G
T
 
S
K
 
D
T
 
L
G
 
V
V
 
A
F
 
F
A
 
S
K
 
E
K
 
R
F
 
Y
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
F
 
F
N
 
D
M
 
V
G
 
A
I
|
I
A
 
A
E
|
E
A
 
Q
N
 
H
M
 
A
V
 
V
G
 
T
T
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
C
V
 
E
G
 
G
K
 
M
I
 
K
P
 
P
F
 
V
L
 
V
S
 
A
T
 
I
F
 
Y
A
 
S
I
 
T
F
|
F
A
 
L
A
 
Q
G
 
-
R
|
R
A
 
A
W
 
Y
E
 
D
Q
 
Q
I
 
L
R
 
I
Q
 
H
S
 
D
A
 
V
A
 
A
Y
 
V
P
 
Q
K
 
H
A
 
L
N
 
D
V
 
V
K
 
L
I
 
F
V
 
A
A
 
I
T
 
D
H
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
L
T
 
-
V
 
V
G
 
G
E
 
E
D
 
D
G
 
G
G
 
P
S
 
T
H
 
H
Q
 
A
S
 
G
V
 
S
E
 
F
D
 
D
I
 
I
A
 
S
I
 
Y
M
 
L
R
 
R
A
 
C
I
 
I
P
 
P
N
 
G
I
 
M
T
 
L
V
 
V
I
 
M
V
 
T
P
 
P
A
 
S
D
 
D
G
 
E
V
 
D
E
 
E
T
 
L
K
 
R
G
 
K
A
 
L
I
 
L
R
 
T
A
 
T
A
 
G
A
 
Y
A
 
L
M
 
F
K
 
D
G
 
G
P
 
P
V
 
A
Y
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
Y
G
 
P
R
 
R
N
 
G
K
 
S
V
 
G
P
 
P
T
 
N
-
 
H
-
 
P
I
 
I
F
 
D
P
 
P
E
 
D
D
 
L
H
 
Q
R
 
P
F
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
V
E
 
V
L
 
R
V
 
R
A
 
R
G
 
G
S
 
G
H
 
R
M
 
V
T
 
A
F
 
L
V
 
L
T
 
V
T
 
F
G
 
G
L
 
V
M
 
Q
T
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
I
 
M
A
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
L
K
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
D
A
 
A
R
 
T
V
 
V
V
 
V
H
 
D
I
 
M
G
 
R
T
 
F
I
 
V
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
E
 
A
I
 
L
I
 
V
L
 
R
K
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
G
E
 
S
T
 
H
G
 
E
A
 
L
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
I
E
 
E
E
 
E
H
 
N
S
 
A
V
 
V
I
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
G
E
 
E
L
 
F
L
 
L
-
 
A
G
 
S
E
 
E
N
 
G
C
 
L
P
 
E
T
 
V
P
 
P
M
 
L
K
 
L
R
 
Q
I
 
L
G
 
G
I
 
L
N
 
P
D
 
D
R
 
Y
F
 
Y
G
 
V
T
 
E
S
 
H
G
 
A
K
 
K
A
 
P
E
 
S
E
 
E
L
 
M
L
 
L
K
 
A
Y
 
E
F
 
C
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8a45F Structural analysis of 1-deoxy-d-xylulose 5-phosphate synthase from pseudomonas aeruginosa with 2-acetyl thiamine diphosphate (see paper)
31% identity, 92% coverage: 11:296/312 of query aligns to 279:560/573 of 8a45F

query
sites
8a45F
Y
 
F
G
 
G
E
 
Q
T
 
W
L
 
L
A
 
C
E
 
D
L
 
M
G
 
A
A
 
A
E
 
Q
N
 
D
K
 
A
N
 
R
V
 
L
V
 
L
A
 
G
L
 
I
D
 
T
A
 
P
D
 
A
L
 
M
S
 
K
G
 
E
S
 
G
T
 
S
K
 
D
T
 
L
G
 
V
V
 
A
F
 
F
A
 
S
K
 
E
K
 
R
F
 
Y
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
F
 
F
N
 
D
M
 
V
G
 
A
I
|
I
A
 
A
E
|
E
A
 
Q
N
 
H
M
 
A
V
 
V
G
 
T
T
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
C
V
 
E
G
 
G
K
 
M
I
 
K
P
 
P
F
 
V
L
 
V
S
 
A
T
 
I
F
 
Y
A
 
S
I
 
T
F
|
F
A
 
L
A
 
Q
G
 
-
R
|
R
A
 
A
W
 
Y
E
 
D
Q
 
Q
I
 
L
R
 
I
Q
 
H
S
 
D
A
 
V
A
 
A
Y
 
V
P
 
Q
K
 
H
A
 
L
N
x
D
V
 
V
K
 
L
I
 
F
V
 
A
A
 
I
T
 
D
H
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
L
T
 
-
V
 
V
G
 
G
E
 
E
D
 
D
G
 
G
G
 
P
S
 
T
H
 
H
Q
 
A
S
 
G
V
 
S
E
 
F
D
 
D
I
 
I
A
 
S
I
 
Y
M
 
L
R
 
R
A
 
C
I
 
I
P
 
P
N
 
G
I
 
M
T
 
L
V
 
V
I
 
M
V
 
T
P
 
P
A
 
S
D
 
D
G
 
E
V
 
D
E
 
E
T
 
L
K
 
R
G
 
K
A
 
L
I
 
L
R
 
T
A
 
T
A
x
G
A
x
Y
A
 
L
M
x
F
K
 
D
G
 
G
P
 
P
V
 
A
Y
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
Y
G
 
P
R
 
R
N
 
G
K
 
S
V
 
G
P
 
P
T
 
N
-
 
H
-
 
P
I
 
I
F
x
D
P
 
P
E
x
D
D
 
L
H
 
Q
R
 
P
F
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
V
E
 
V
L
 
R
V
 
R
A
 
R
G
 
G
S
 
G
H
 
R
M
 
V
T
 
A
F
 
L
V
 
L
T
 
V
T
 
F
G
 
G
L
 
V
M
 
Q
T
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
I
 
M
A
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
L
K
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
D
A
 
A
R
 
T
V
 
V
V
 
V
H
 
D
I
 
M
G
 
R
T
 
F
I
 
V
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
E
 
A
I
 
L
I
 
V
L
 
R
K
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
G
E
 
S
T
 
H
G
 
E
A
 
L
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
I
E
 
E
E
 
E
H
 
N
S
 
A
V
 
V
I
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
G
E
 
E
L
 
F
L
 
L
-
 
A
G
 
S
E
 
E
N
 
G
C
 
L
P
 
E
T
 
V
P
 
P
M
 
L
K
 
L
R
 
Q
I
 
L
G
 
G
I
 
L
N
 
P
D
 
D
R
 
Y
F
 
Y
G
 
V
T
 
E
S
 
H
G
 
A
K
 
K
A
 
P
E
 
S
E
 
E
L
 
M
L
 
L
K
 
A
Y
 
E
F
 
C
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

2o1sA 1-deoxy-d-xylulose 5-phosphate synthase (dxs) from escherichia coli (see paper)
32% identity, 92% coverage: 11:296/312 of query aligns to 241:522/536 of 2o1sA

query
sites
2o1sA
Y
 
F
G
 
G
E
 
D
T
 
W
L
 
L
A
 
C
E
 
E
L
 
T
G
 
A
A
 
A
E
 
K
N
 
D
K
 
N
N
 
K
V
 
L
V
 
M
A
 
A
L
 
I
D
 
T
A
 
P
D
 
A
L
x
M
S
 
R
G
 
E
S
 
G
T
 
S
K
 
G
T
 
M
G
 
V
V
 
E
F
 
F
A
 
S
K
 
R
K
 
K
F
 
F
P
 
P
E
 
D
R
 
R
F
 
Y
F
 
F
N
 
D
M
 
V
G
 
A
I
|
I
A
 
A
E
|
E
A
 
Q
N
 
H
M
 
A
V
 
V
G
 
T
T
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
I
V
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
K
P
 
P
F
 
I
L
 
V
S
 
A
T
 
I
F
 
Y
A
 
S
I
 
T
F
|
F
A
 
L
A
 
Q
G
 
-
R
|
R
A
 
A
W
 
Y
E
 
D
Q
 
Q
I
 
V
R
 
L
Q
 
H
S
 
D
A
 
V
A
 
A
Y
 
I
P
 
Q
K
 
K
A
 
L
N
 
P
V
 
V
K
 
L
I
 
F
V
 
A
A
 
I
T
 
D
H
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
-
V
 
V
G
 
G
E
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
Q
S
 
T
H
|
H
Q
 
Q
S
 
G
V
 
A
E
 
F
D
 
D
I
 
L
A
 
S
I
 
Y
M
 
L
R
 
R
A
 
C
I
 
I
P
 
P
N
 
E
I
 
M
T
 
V
V
 
I
I
 
M
V
 
T
P
 
P
A
 
S
D
 
D
G
 
E
V
 
N
E
 
E
T
 
C
K
 
R
G
 
Q
A
 
M
I
 
L
R
 
Y
A
 
T
A
 
G
A
 
Y
A
 
H
M
 
Y
K
 
N
-
 
D
G
 
G
P
 
P
V
 
S
Y
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
Y
G
 
P
R
 
R
-
 
G
N
 
N
K
 
A
V
 
V
P
 
G
T
 
V
I
 
E
F
 
L
P
 
T
E
 
P
D
 
L
H
 
E
R
 
K
F
 
L
E
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
I
E
 
V
L
 
K
V
 
R
A
 
R
G
 
G
S
 
E
H
 
K
M
 
L
T
 
A
F
 
I
V
 
L
T
 
N
T
 
F
G
 
G
L
 
T
M
 
L
T
 
M
A
 
P
Q
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
L
K
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
N
A
 
A
R
 
T
V
 
L
V
 
V
H
 
D
I
 
M
G
 
R
T
 
F
I
 
V
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
E
 
A
I
 
L
I
 
I
L
 
L
K
 
E
A
 
M
A
 
A
R
 
A
E
 
S
T
 
H
G
 
E
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
V
E
 
E
E
 
E
H
 
N
S
 
A
V
 
I
I
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
 
S
A
 
G
V
 
V
A
 
N
E
 
E
-
 
V
L
 
L
L
 
M
G
 
A
E
 
H
N
 
R
C
 
K
P
 
P
T
 
V
P
 
P
M
 
V
K
 
L
R
 
N
I
 
I
G
 
G
I
 
L
N
 
P
D
 
D
R
 
F
F
 
F
G
 
I
T
 
P
S
 
Q
G
 
G
K
 
T
A
 
Q
E
 
E
E
 
E
L
 
M
L
 
R
K
 
A
Y
 
E
F
 
L
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P77488 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase; 1-deoxyxylulose-5-phosphate synthase; DXP synthase; DXPS; EC 2.2.1.7 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
32% identity, 92% coverage: 11:296/312 of query aligns to 325:606/620 of P77488

query
sites
P77488
Y
 
F
G
 
G
E
 
D
T
 
W
L
 
L
A
 
C
E
 
E
L
 
T
G
 
A
A
 
A
E
 
K
N
 
D
K
 
N
N
 
K
V
 
L
V
 
M
A
 
A
L
 
I
D
 
T
A
 
P
D
 
A
L
 
M
S
 
R
G
 
E
S
 
G
T
 
S
K
 
G
T
 
M
G
 
V
V
 
E
F
 
F
A
 
S
K
 
R
K
 
K
F
 
F
P
 
P
E
 
D
R
 
R
F
 
Y
F
 
F
N
 
D
M
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
E
|
E
A
 
Q
N
 
H
M
 
A
V
 
V
G
 
T
T
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
I
V
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
K
P
 
P
F
 
I
L
 
V
S
 
A
T
 
I
F
x
Y
A
 
S
I
 
T
F
 
F
A
 
L
A
 
Q
G
 
-
R
|
R
A
 
A
W
 
Y
E
 
D
Q
 
Q
I
 
V
R
 
L
Q
 
H
S
 
D
A
 
V
A
 
A
Y
 
I
P
 
Q
K
 
K
A
 
L
N
 
P
V
 
V
K
 
L
I
 
F
V
 
A
A
 
I
T
 
D
H
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
-
V
 
V
G
 
G
E
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
Q
S
 
T
H
|
H
Q
 
Q
S
 
G
V
 
A
E
 
F
D
 
D
I
 
L
A
 
S
I
 
Y
M
 
L
R
 
R
A
 
C
I
 
I
P
 
P
N
 
E
I
 
M
T
 
V
V
 
I
I
 
M
V
 
T
P
 
P
A
 
S
D
 
D
G
 
E
V
 
N
E
 
E
T
 
C
K
 
R
G
 
Q
A
 
M
I
 
L
R
 
Y
A
 
T
A
 
G
A
 
Y
A
 
H
M
 
Y
K
 
N
-
 
D
G
 
G
P
 
P
V
 
S
Y
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
Y
G
 
P
R
|
R
-
 
G
N
 
N
K
 
A
V
 
V
P
 
G
T
 
V
I
 
E
F
 
L
P
 
T
E
 
P
D
 
L
H
 
E
R
 
K
F
 
L
E
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
I
E
 
V
L
 
K
V
 
R
A
 
R
G
 
G
S
 
E
H
 
K
M
 
L
T
 
A
F
 
I
V
 
L
T
 
N
T
 
F
G
 
G
L
 
T
M
 
L
T
 
M
A
 
P
Q
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
L
K
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
N
A
 
A
R
 
T
V
 
L
V
 
V
H
 
D
I
 
M
G
 
R
T
 
F
I
 
V
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
E
 
A
I
 
L
I
 
I
L
 
L
K
 
E
A
 
M
A
 
A
R
 
A
E
 
S
T
 
H
G
 
E
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
V
E
 
E
E
 
E
H
 
N
S
 
A
V
 
I
I
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
 
S
A
 
G
V
 
V
A
 
N
E
 
E
-
 
V
L
 
L
L
 
M
G
 
A
E
 
H
N
 
R
C
 
K
P
 
P
T
 
V
P
 
P
M
 
V
K
 
L
R
 
N
I
 
I
G
 
G
I
 
L
N
 
P
D
 
D
R
 
F
F
 
F
G
 
I
T
 
P
S
 
Q
G
 
G
K
 
T
A
 
Q
E
 
E
E
 
E
L
 
M
L
 
R
K
 
A
Y
 
E
F
 
L
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8bzxB 1-deoxy-d-xylulose 5-phosphate synthase from klebsiella pneumoniae (kpdxps),co-crystal with thiamine monophosphate analog (see paper)
31% identity, 94% coverage: 3:296/312 of query aligns to 265:554/568 of 8bzxB

query
sites
8bzxB
T
 
T
M
 
L
I
 
P
A
 
S
T
 
Y
R
 
S
D
 
K
A
 
I
Y
 
F
G
 
G
E
 
D
T
 
W
L
 
L
A
 
C
E
 
E
L
 
T
G
 
A
A
 
A
E
 
K
N
 
D
K
 
N
N
 
K
V
 
L
V
 
M
A
 
A
L
 
I
D
 
T
A
 
P
D
 
A
L
x
M
S
 
R
G
 
E
S
 
G
T
 
S
K
 
G
T
 
M
G
 
V
V
 
E
F
 
F
A
 
S
K
 
K
K
 
K
F
 
F
P
 
P
E
 
D
R
 
R
F
 
Y
F
 
F
N
 
D
M
 
V
G
 
A
I
|
I
A
 
A
E
|
E
A
 
Q
N
 
H
M
 
A
V
 
V
G
 
T
T
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
I
V
 
G
G
 
D
K
 
Y
I
 
K
P
 
P
F
 
V
L
 
V
S
 
A
T
 
I
F
 
Y
A
 
S
I
 
T
F
|
F
A
 
L
A
 
Q
G
 
-
R
|
R
A
 
A
W
 
Y
E
 
D
Q
 
Q
I
 
V
R
 
I
Q
 
H
S
 
D
A
 
V
A
 
A
Y
 
I
P
 
Q
K
 
K
A
 
L
N
 
P
V
 
V
K
 
L
I
 
F
V
 
A
A
 
I
T
 
D
H
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
-
V
 
V
G
 
G
E
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
Q
S
 
T
H
 
H
Q
 
Q
S
 
G
V
 
A
E
 
F
D
 
D
I
 
L
A
 
S
I
 
F
M
 
L
R
 
R
A
 
C
I
 
I
P
 
P
N
 
D
I
 
M
T
 
V
V
 
V
I
 
M
V
 
T
P
 
P
A
 
S
D
 
D
G
 
E
V
 
N
E
 
E
T
 
C
K
 
R
G
 
Q
A
 
M
I
 
L
R
 
Y
A
 
T
A
 
G
A
 
Y
A
 
H
M
 
Y
K
 
S
-
 
D
G
 
G
P
 
P
V
 
C
Y
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
Y
G
 
P
R
 
R
N
 
G
K
 
S
V
 
G
P
 
T
-
 
G
-
 
A
T
 
T
I
 
L
F
 
E
P
 
P
E
 
L
D
 
-
H
 
A
R
 
S
F
 
L
E
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
V
E
 
V
L
 
K
V
 
R
A
 
Q
G
 
G
S
 
E
H
 
K
M
 
I
T
 
A
F
 
I
V
 
L
T
 
N
T
 
F
G
 
G
L
 
T
M
 
L
T
 
L
A
 
P
Q
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
-
S
 
-
L
 
-
K
 
-
K
 
-
D
 
D
G
 
K
I
 
L
S
 
N
A
 
A
R
 
T
V
 
L
V
 
V
H
 
D
I
 
M
G
 
R
T
 
F
I
 
V
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
T
E
 
A
I
 
L
I
 
I
L
 
L
K
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
G
E
 
E
T
 
H
G
 
D
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
L
E
 
E
E
 
E
H
 
N
S
 
A
V
 
I
I
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
 
S
A
 
G
V
 
V
A
 
N
E
 
E
-
 
V
L
 
L
L
 
M
G
 
A
E
 
H
N
 
R
C
 
R
P
 
A
T
 
V
P
 
P
M
 
V
K
 
L
R
 
N
I
 
I
G
 
G
I
 
L
N
 
P
D
 
D
R
 
Y
F
 
F
G
 
I
T
 
P
S
 
Q
G
 
G
K
 
T
A
 
Q
E
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
R
K
 
A
Y
 
D
F
 
L
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8a9cB Structure of truncated 1-deoxy-d-xylulose 5-phosphate synthase (dxs) from klebsiella pneumoniae in complex with cofactor tpp
32% identity, 92% coverage: 11:296/312 of query aligns to 226:507/520 of 8a9cB

query
sites
8a9cB
Y
 
F
G
 
G
E
 
D
T
 
W
L
 
L
A
 
C
E
 
E
L
 
T
G
 
A
A
 
A
E
 
K
N
 
D
K
 
N
N
 
K
V
 
L
V
 
M
A
 
A
L
 
I
D
 
T
A
 
P
D
 
A
L
 
M
S
 
R
G
 
E
S
 
G
T
 
S
K
 
G
T
 
M
G
 
V
V
 
E
F
 
F
A
 
S
K
 
K
K
 
K
F
 
F
P
 
P
E
 
D
R
 
R
F
 
Y
F
 
F
N
 
D
M
 
V
G
 
A
I
|
I
A
 
A
E
|
E
A
 
Q
N
 
H
M
 
A
V
 
V
G
 
T
T
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
I
V
 
G
G
 
D
K
 
Y
I
 
K
P
 
P
F
 
V
L
 
V
S
 
A
T
 
I
F
 
Y
A
 
S
I
 
T
F
|
F
A
 
L
A
 
Q
G
 
-
R
|
R
A
 
A
W
 
Y
E
 
D
Q
 
Q
I
 
V
R
 
I
Q
 
H
S
 
D
A
 
V
A
 
A
Y
 
I
P
 
Q
K
 
K
A
 
L
N
 
P
V
 
V
K
 
L
I
 
F
V
 
A
A
 
I
T
 
D
H
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
-
V
 
V
G
 
G
E
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
Q
S
 
T
H
 
H
Q
 
Q
S
 
G
V
 
A
E
 
F
D
 
D
I
 
L
A
 
S
I
 
F
M
 
L
R
 
R
A
 
C
I
 
I
P
 
P
N
 
D
I
 
M
T
 
V
V
 
V
I
 
M
V
 
T
P
 
P
A
 
S
D
 
D
G
 
E
V
 
N
E
 
E
T
 
C
K
 
R
G
 
Q
A
 
M
I
 
L
R
 
Y
A
 
T
A
 
G
A
 
Y
A
 
H
M
 
Y
-
 
S
K
 
D
G
 
G
P
 
P
V
 
C
Y
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
Y
G
 
P
R
 
R
N
 
G
K
 
S
V
 
G
P
 
T
-
 
G
-
 
A
T
 
T
I
 
L
F
 
E
P
 
P
E
 
L
D
 
-
H
 
A
R
 
S
F
 
L
E
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
V
E
 
V
L
 
K
V
 
R
A
 
Q
G
 
G
S
 
E
H
 
K
M
 
I
T
 
A
F
 
I
V
 
L
T
 
N
T
 
F
G
 
G
L
 
T
M
 
L
T
 
L
A
 
P
Q
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
-
S
 
-
L
 
-
K
 
-
K
 
-
D
 
D
G
 
K
I
 
L
S
 
N
A
 
A
R
 
T
V
 
L
V
 
V
H
 
D
I
 
M
G
 
R
T
 
F
I
 
V
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
T
E
 
A
I
 
L
I
 
I
L
 
L
K
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
G
E
 
E
T
 
H
G
 
D
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
L
E
 
E
E
 
E
H
 
N
S
 
A
V
 
I
I
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
 
S
A
 
G
V
 
V
A
 
N
E
 
E
-
 
V
L
 
L
L
 
M
G
 
A
E
 
H
N
 
R
C
 
R
P
 
A
T
 
V
P
 
P
M
 
V
K
 
L
R
 
N
I
 
I
G
 
G
I
 
L
N
 
P
D
 
D
R
 
Y
F
 
F
G
 
I
T
 
P
S
 
Q
G
 
G
K
 
T
A
 
Q
E
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
R
K
 
A
Y
 
D
F
 
L
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8bzxA 1-deoxy-d-xylulose 5-phosphate synthase from klebsiella pneumoniae (kpdxps),co-crystal with thiamine monophosphate analog (see paper)
32% identity, 92% coverage: 11:296/312 of query aligns to 251:532/546 of 8bzxA

query
sites
8bzxA
Y
 
F
G
 
G
E
 
D
T
 
W
L
 
L
A
 
C
E
 
E
L
 
T
G
 
A
A
 
A
E
 
K
N
 
D
K
 
N
N
 
K
V
 
L
V
 
M
A
 
A
L
 
I
D
 
T
A
 
P
D
 
A
L
x
M
S
 
R
G
 
E
S
 
G
T
 
S
K
 
G
T
 
M
G
 
V
V
 
E
F
 
F
A
 
S
K
 
K
K
 
K
F
 
F
P
 
P
E
 
D
R
 
R
F
 
Y
F
 
F
N
 
D
M
 
V
G
 
A
I
|
I
A
 
A
E
|
E
A
 
Q
N
 
H
M
 
A
V
 
V
G
 
T
T
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
I
V
 
G
G
 
D
K
 
Y
I
 
K
P
 
P
F
 
V
L
 
V
S
 
A
T
 
I
F
 
Y
A
 
S
I
 
T
F
|
F
A
 
L
A
 
Q
G
 
-
R
|
R
A
 
A
W
 
Y
E
 
D
Q
 
Q
I
 
V
R
 
I
Q
 
H
S
 
D
A
 
V
A
 
A
Y
 
I
P
 
Q
K
 
K
A
 
L
N
 
P
V
 
V
K
 
L
I
 
F
V
 
A
A
 
I
T
 
D
H
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
-
V
 
V
G
 
G
E
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
Q
S
 
T
H
|
H
Q
 
Q
S
 
G
V
 
A
E
 
F
D
 
D
I
 
L
A
 
S
I
 
F
M
 
L
R
 
R
A
 
C
I
 
I
P
 
P
N
 
D
I
 
M
T
 
V
V
 
V
I
 
M
V
 
T
P
 
P
A
 
S
D
 
D
G
 
E
V
 
N
E
 
E
T
 
C
K
 
R
G
 
Q
A
 
M
I
 
L
R
 
Y
A
 
T
A
 
G
A
 
Y
A
 
H
M
 
Y
K
 
S
-
 
D
G
 
G
P
 
P
V
 
C
Y
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
Y
G
 
P
R
 
R
N
 
G
K
 
S
V
 
G
P
 
T
-
 
G
-
 
A
T
 
T
I
 
L
F
 
E
P
 
P
E
 
L
D
 
-
H
 
A
R
 
S
F
 
L
E
 
P
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
V
E
 
V
L
 
K
V
 
R
A
 
Q
G
 
G
S
 
E
H
 
K
M
 
I
T
 
A
F
 
I
V
 
L
T
 
N
T
 
F
G
 
G
L
 
T
M
 
L
T
 
L
A
 
P
Q
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
-
S
 
-
L
 
-
K
 
-
K
 
-
D
 
D
G
 
K
I
 
L
S
 
N
A
 
A
R
 
T
V
 
L
V
 
V
H
 
D
I
 
M
G
 
R
T
 
F
I
 
V
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
T
E
 
A
I
 
L
I
 
I
L
 
L
K
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
G
E
 
E
T
 
H
G
 
D
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
L
E
 
E
E
 
E
H
 
N
S
 
A
V
 
I
I
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
 
S
A
 
G
V
 
V
A
 
N
E
 
E
-
 
V
L
 
L
L
 
M
G
 
A
E
 
H
N
 
R
C
 
R
P
 
A
T
 
V
P
 
P
M
 
V
K
 
L
R
 
N
I
 
I
G
 
G
I
 
L
N
 
P
D
 
D
R
 
Y
F
 
F
G
 
I
T
 
P
S
 
Q
G
 
G
K
 
T
A
 
Q
E
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
R
K
 
A
Y
 
D
F
 
L
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6xxgBBB 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase,1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase (see paper)
30% identity, 90% coverage: 10:290/312 of query aligns to 239:515/539 of 6xxgBBB

query
sites
6xxgBBB
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
A
L
 
V
A
 
T
E
 
E
L
 
W
G
 
A
A
 
K
E
 
T
N
 
D
K
 
P
N
 
R
V
 
T
V
 
F
A
 
V
L
 
V
D
 
T
A
 
P
D
 
A
L
 
M
S
 
R
G
 
E
S
 
G
T
 
S
K
 
G
T
 
L
G
 
V
V
 
E
F
 
F
A
 
S
K
 
R
K
 
V
F
 
H
P
 
P
E
 
H
R
 
R
F
 
Y
F
 
L
N
 
D
M
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
|
E
A
 
E
N
 
V
M
 
A
V
 
V
G
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
L
V
 
Q
G
 
G
K
 
M
I
 
R
P
 
P
F
 
V
L
 
V
S
 
A
T
 
I
F
 
Y
A
 
S
I
 
T
F
|
F
A
 
L
A
 
Q
G
 
-
R
|
R
A
 
A
W
 
Y
E
x
D
Q
|
Q
I
 
V
R
 
L
Q
x
H
S
x
D
A
 
V
A
 
A
Y
 
I
P
 
E
K
 
H
A
 
L
N
|
N
V
 
V
K
 
T
I
 
F
V
 
C
A
 
I
T
 
D
H
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
-
V
 
V
G
 
G
E
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
A
S
 
T
H
 
H
Q
 
N
S
 
G
V
 
V
E
 
F
D
 
D
I
 
L
A
 
S
I
 
F
M
 
L
R
 
R
A
 
S
I
 
I
P
 
P
N
 
G
I
 
V
T
 
R
V
 
I
I
 
G
V
 
L
P
 
P
A
x
K
D
 
D
G
 
A
V
 
A
E
|
E
T
 
L
K
 
R
G
 
G
A
 
M
I
 
L
R
 
K
A
 
Y
A
|
A
A
 
Q
A
 
T
M
x
H
K
x
D
G
|
G
P
 
P
V
x
F
Y
 
A
V
 
I
R
 
R
L
 
Y
G
 
P
R
 
R
N
 
G
-
 
N
-
 
T
-
 
A
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
T
 
A
-
 
G
I
 
T
F
 
W
P
 
P
E
 
D
D
 
-
H
 
-
R
 
-
F
 
L
E
 
K
I
 
W
G
 
G
K
 
E
G
 
W
A
x
E
E
 
R
L
 
L
V
 
K
A
 
G
G
 
G
S
 
D
H
 
D
M
 
V
T
 
V
F
 
I
V
 
L
T
 
A
T
 
G
G
 
G
L
 
K
M
 
A
T
 
L
A
 
D
Q
 
Y
A
 
A
I
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
D
L
 
L
K
 
P
K
 
G
D
 
V
G
 
G
I
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
V
V
 
V
H
x
N
I
 
A
G
 
R
T
 
F
I
 
V
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
E
 
E
I
 
M
I
 
L
L
 
R
K
 
E
A
 
V
A
 
G
R
 
G
E
 
R
T
 
A
G
 
R
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
A
 
V
E
 
E
E
 
D
H
 
N
S
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
L
E
 
E
L
 
A
L
 
L
G
 
N
E
 
S
N
 
M
C
 
N
P
 
L
T
 
H
P
 
P
M
 
T
K
 
V
R
 
R
I
 
V
-
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
P
D
 
D
R
 
E
F
|
F
G
 
Q
T
x
E
S
 
H
G
 
A
K
 
T
A
 
A
E
 
E
E
 
S
L
 
V

Sites not aligning to the query:

8v9iA 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase (see paper)
30% identity, 90% coverage: 10:290/312 of query aligns to 293:569/595 of 8v9iA

query
sites
8v9iA
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
A
L
 
V
A
 
T
E
 
E
L
 
W
G
 
A
A
 
K
E
 
T
N
 
D
K
 
P
N
 
R
V
 
T
V
 
F
A
 
V
L
 
V
D
 
T
A
 
P
D
 
A
L
x
M
S
 
R
G
 
E
S
 
G
T
 
S
K
 
G
T
 
L
G
 
V
V
 
E
F
 
F
A
 
S
K
 
R
K
 
V
F
 
H
P
 
P
E
 
H
R
 
R
F
 
Y
F
 
L
N
 
D
M
 
V
G
 
G
I
|
I
A
 
A
E
|
E
A
 
E
N
 
V
M
 
A
V
 
V
G
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
L
V
 
Q
G
 
G
K
 
M
I
 
R
P
 
P
F
 
V
L
 
V
S
 
A
T
 
I
F
x
Y
A
 
S
I
 
T
F
|
F
A
 
L
A
 
Q
G
 
-
R
 
R
A
 
A
W
 
Y
E
 
D
Q
 
Q
I
 
V
R
 
L
Q
 
H
S
 
D
A
 
V
A
 
A
Y
 
I
P
 
E
K
 
H
A
 
L
N
 
N
V
 
V
K
 
T
I
 
F
V
 
C
A
 
I
T
 
D
H
x
R
G
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
-
V
 
V
G
 
G
E
 
A
D
|
D
G
 
G
G
 
A
S
 
T
H
|
H
Q
 
N
S
 
G
V
 
V
E
 
F
D
 
D
I
 
L
A
 
S
I
 
F
M
 
L
R
 
R
A
 
S
I
 
I
P
 
P
N
 
G
I
 
V
T
 
R
V
 
I
I
 
G
V
 
L
P
 
P
A
 
K
D
 
D
G
 
A
V
 
A
E
 
E
T
 
L
K
 
R
G
 
G
A
 
M
I
 
L
R
 
K
A
 
Y
A
 
A
A
 
Q
A
 
T
M
 
H
K
 
D
G
 
G
P
 
P
V
 
F
Y
 
A
V
 
I
R
 
R
L
 
Y
G
 
P
R
|
R
N
 
G
-
 
N
-
 
T
-
 
A
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
T
 
A
-
 
G
I
 
T
F
 
W
P
 
P
E
 
D
D
 
-
H
 
-
R
 
-
F
 
L
E
 
K
I
 
W
G
 
G
K
 
E
G
 
W
A
 
E
E
 
R
L
 
L
V
 
K
A
 
G
G
 
G
S
 
D
H
 
D
M
 
V
T
 
V
F
 
I
V
 
L
T
 
A
T
 
G
G
 
G
L
 
K
M
 
A
T
 
L
A
 
D
Q
 
Y
A
 
A
I
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
D
L
 
L
K
 
P
K
 
G
D
 
V
G
 
G
I
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
V
V
 
V
H
 
N
I
 
A
G
 
R
T
 
F
I
 
V
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
E
 
E
I
 
M
I
 
L
L
 
R
K
 
E
A
 
V
A
 
G
R
 
G
E
 
R
T
 
A
G
 
R
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
A
 
V
E
 
E
E
 
D
H
 
N
S
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
L
E
 
E
L
 
A
L
 
L
G
 
N
E
 
S
N
 
M
C
 
N
P
 
L
T
 
H
P
 
P
M
 
T
K
 
V
R
 
R
I
 
V
-
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
P
D
 
D
R
 
E
F
 
F
G
 
Q
T
 
E
S
 
H
G
 
A
K
 
T
A
 
A
E
 
E
E
 
S
L
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011937432.1 NCBI__GCF_000016745.1:WP_011937432.1
MSTMIATRDAYGETLAELGAENKNVVALDADLSGSTKTGVFAKKFPERFFNMGIAEANMV
GTAAGLAAVGKIPFLSTFAIFAAGRAWEQIRQSAAYPKANVKIVATHGGVTVGEDGGSHQ
SVEDIAIMRAIPNITVIVPADGVETKGAIRAAAAMKGPVYVRLGRNKVPTIFPEDHRFEI
GKGAELVAGSHMTFVTTGLMTAQAIAAAESLKKDGISARVVHIGTIKPLDQEIILKAARE
TGAIVTAEEHSVIGGLGGAVAELLGENCPTPMKRIGINDRFGTSGKAEELLKYFGLTPDC
LVDAAKEILSRK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory