SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011969977.1 NCBI__GCF_000017145.1:WP_011969977.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1d7vA Crystal structure of the complex of 2,2-dialkylglycine decarboxylase with nma (see paper)
70% identity, 95% coverage: 4:433/451 of query aligns to 2:431/431 of 1d7vA

query
sites
1d7vA
N
 
N
Q
 
D
D
 
D
P
 
A
A
 
T
F
 
F
W
 
W
A
 
R
A
 
N
A
 
A
G
 
R
R
 
Q
H
 
H
L
 
L
I
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
 
T
F
 
F
D
 
E
P
 
P
A
 
M
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
K
G
 
G
S
 
S
F
 
F
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
G
R
 
R
P
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
D
F
 
F
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
M
 
M
S
 
S
A
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
C
H
 
H
P
 
P
R
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
S
T
 
V
V
 
I
Q
 
G
R
 
E
Q
 
Y
M
 
A
E
 
G
K
 
K
V
 
L
A
 
D
H
|
H
L
|
L
F
|
F
S
|
S
G
 
G
M
 
M
L
 
L
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
N
L
 
I
A
 
T
P
 
P
-
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
A
M
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
|
A
E
 
E
S
 
S
N
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
K
H
 
Y
E
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
G
F
 
F
S
 
A
K
 
Q
S
 
S
W
|
W
H
|
H
G
 
G
M
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
A
S
 
S
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
K
G
 
G
Y
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
A
M
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
F
T
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
F
T
 
T
F
 
Y
R
 
R
P
 
P
R
 
R
F
 
F
R
 
E
H
 
R
G
 
-
D
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
Y
D
 
D
W
 
Y
R
 
L
T
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
S
 
R
Q
 
Q
S
 
S
T
 
S
G
 
G
S
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
A
E
|
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
S
 
S
S
|
S
G
 
G
G
 
G
L
 
I
L
 
I
E
 
E
L
 
L
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
K
E
 
R
K
 
K
C
 
C
R
 
E
E
 
A
R
 
R
G
 
G
M
 
M
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Q
|
Q
T
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
M
 
M
F
 
F
A
 
A
F
 
C
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
D
I
 
I
L
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
S
K
|
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
S
 
A
A
 
A
V
 
I
M
 
V
T
 
T
T
 
S
T
 
A
E
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
R
A
 
A
H
 
H
E
 
E
K
 
L
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
T
 
T
T
|
T
H
|
H
V
|
V
S
|
S
D
|
D
P
 
P
L
 
L
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
Q
E
 
R
E
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
N
H
 
V
I
 
M
G
 
G
G
 
D
E
 
R
L
 
L
F
 
R
D
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
L
Q
 
D
L
 
L
K
 
M
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
D
 
D
C
 
C
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
D
G
 
R
E
 
R
S
 
T
R
 
K
S
 
E
A
 
P
D
 
A
H
 
D
E
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
T
A
 
R
E
 
E
A
 
C
F
 
M
R
 
N
R
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
M
 
M
N
 
N
I
 
I
V
 
V
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
R
|
R
I
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
T
I
 
V
S
 
S
E
 
E
E
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
S
I
 
L
I
 
L
T
 
G
Q
 
Q
S
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
R
S
 
A
L
 
L

1d7uA Crystal structure of the complex of 2,2-dialkylglycine decarboxylase with lcs (see paper)
70% identity, 95% coverage: 4:433/451 of query aligns to 2:431/431 of 1d7uA

query
sites
1d7uA
N
 
N
Q
 
D
D
 
D
P
 
A
A
 
T
F
 
F
W
 
W
A
 
R
A
 
N
A
 
A
G
 
R
R
 
Q
H
 
H
L
 
L
I
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
 
T
F
 
F
D
 
E
P
 
P
A
 
M
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
K
G
 
G
S
 
S
F
 
F
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
G
R
 
R
P
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
D
F
 
F
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
M
 
M
S
 
S
A
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
C
H
 
H
P
 
P
R
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
S
T
 
V
V
 
I
Q
 
G
R
 
E
Q
 
Y
M
 
A
E
 
G
K
 
K
V
 
L
A
 
D
H
|
H
L
|
L
F
|
F
S
|
S
G
 
G
M
 
M
L
 
L
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
N
L
 
I
A
 
T
P
 
P
-
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
A
M
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
|
G
A
|
A
E
 
E
S
 
S
N
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
K
H
 
Y
E
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
G
F
 
F
S
 
A
K
 
Q
S
 
S
W
|
W
H
|
H
G
 
G
M
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
A
S
 
S
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
K
G
 
G
Y
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
A
M
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
F
T
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
F
T
 
T
F
 
Y
R
 
R
P
 
P
R
 
R
F
 
F
R
 
E
H
 
R
G
 
-
D
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
Y
D
 
D
W
 
Y
R
 
L
T
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
S
 
R
Q
 
Q
S
 
S
T
 
S
G
 
G
S
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
A
E
|
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
S
 
S
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
I
L
 
I
E
 
E
L
 
L
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
K
E
 
R
K
 
K
C
 
C
R
 
E
E
 
A
R
 
R
G
 
G
M
 
M
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Q
|
Q
T
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
M
 
M
F
 
F
A
 
A
F
 
C
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
D
I
 
I
L
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
S
K
|
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
S
 
A
A
 
A
V
 
I
M
 
V
T
 
T
T
 
S
T
 
A
E
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
R
A
 
A
H
 
H
E
 
E
K
 
L
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
T
 
T
T
|
T
H
|
H
V
|
V
S
|
S
D
|
D
P
 
P
L
 
L
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
Q
E
 
R
E
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
N
H
 
V
I
 
M
G
 
G
G
 
D
E
 
R
L
 
L
F
 
R
D
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
L
Q
 
D
L
 
L
K
 
M
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
D
 
D
C
 
C
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
D
G
 
R
E
 
R
S
 
T
R
 
K
S
 
E
A
 
P
D
 
A
H
 
D
E
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
T
A
 
R
E
 
E
A
 
C
F
 
M
R
 
N
R
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
M
 
M
N
 
N
I
 
I
V
 
V
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
R
|
R
I
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
T
I
 
V
S
 
S
E
 
E
E
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
S
I
 
L
I
 
L
T
 
G
Q
 
Q
S
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
R
S
 
A
L
 
L

1d7sA Crystal structure of the complex of 2,2-dialkylglycine decarboxylase with dcs (see paper)
70% identity, 95% coverage: 4:433/451 of query aligns to 2:431/431 of 1d7sA

query
sites
1d7sA
N
 
N
Q
 
D
D
 
D
P
 
A
A
 
T
F
 
F
W
 
W
A
 
R
A
 
N
A
 
A
G
 
R
R
 
Q
H
 
H
L
 
L
I
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
 
T
F
 
F
D
 
E
P
 
P
A
 
M
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
K
G
 
G
S
 
S
F
 
F
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
G
R
 
R
P
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
D
F
 
F
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
|
Q
M
 
M
S
 
S
A
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
C
H
 
H
P
 
P
R
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
S
T
 
V
V
 
I
Q
 
G
R
 
E
Q
 
Y
M
 
A
E
 
G
K
 
K
V
 
L
A
 
D
H
|
H
L
|
L
F
|
F
S
|
S
G
 
G
M
 
M
L
 
L
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
N
L
 
I
A
 
T
P
 
P
-
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
A
M
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
|
G
A
|
A
E
 
E
S
 
S
N
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
K
H
 
Y
E
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
G
F
 
F
S
 
A
K
 
Q
S
 
S
W
|
W
H
|
H
G
 
G
M
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
A
S
 
S
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
K
G
 
G
Y
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
A
M
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
F
T
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
F
T
 
T
F
 
Y
R
 
R
P
 
P
R
 
R
F
 
F
R
 
E
H
 
R
G
 
-
D
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
Y
D
 
D
W
 
Y
R
 
L
T
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
S
 
R
Q
 
Q
S
 
S
T
 
S
G
 
G
S
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
A
E
|
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
S
 
S
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
I
L
 
I
E
 
E
L
 
L
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
K
E
 
R
K
 
K
C
 
C
R
 
E
E
 
A
R
 
R
G
 
G
M
 
M
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Q
|
Q
T
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
M
 
M
F
 
F
A
 
A
F
 
C
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
D
I
 
I
L
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
S
K
|
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
S
 
A
A
 
A
V
 
I
M
 
V
T
 
T
T
 
S
T
 
A
E
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
R
A
 
A
H
 
H
E
 
E
K
 
L
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
T
 
T
T
|
T
H
|
H
V
|
V
S
|
S
D
|
D
P
 
P
L
 
L
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
Q
E
 
R
E
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
N
H
 
V
I
 
M
G
 
G
G
 
D
E
 
R
L
 
L
F
 
R
D
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
L
Q
 
D
L
 
L
K
 
M
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
D
 
D
C
 
C
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
D
G
 
R
E
 
R
S
 
T
R
 
K
S
 
E
A
 
P
D
 
A
H
 
D
E
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
T
A
 
R
E
 
E
A
 
C
F
 
M
R
 
N
R
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
M
 
M
N
 
N
I
 
I
V
 
V
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
R
|
R
I
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
T
I
 
V
S
 
S
E
 
E
E
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
S
I
 
L
I
 
L
T
 
G
Q
 
Q
S
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
R
S
 
A
L
 
L

1d7rA Crystal structure of the complex of 2,2-dialkylglycine decarboxylase with 5pa (see paper)
70% identity, 95% coverage: 4:433/451 of query aligns to 2:431/431 of 1d7rA

query
sites
1d7rA
N
 
N
Q
 
D
D
 
D
P
 
A
A
 
T
F
 
F
W
 
W
A
 
R
A
 
N
A
 
A
G
 
R
R
 
Q
H
 
H
L
 
L
I
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
 
T
F
 
F
D
 
E
P
 
P
A
 
M
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
K
G
 
G
S
 
S
F
 
F
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
G
R
 
R
P
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
D
F
 
F
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
M
 
M
S
 
S
A
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
C
H
 
H
P
 
P
R
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
S
T
 
V
V
 
I
Q
 
G
R
 
E
Q
 
Y
M
 
A
E
 
G
K
 
K
V
 
L
A
 
D
H
|
H
L
|
L
F
|
F
S
|
S
G
 
G
M
 
M
L
 
L
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
N
L
 
I
A
 
T
P
 
P
-
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
A
M
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
|
G
A
|
A
E
 
E
S
 
S
N
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
K
H
 
Y
E
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
G
F
 
F
S
 
A
K
 
Q
S
 
S
W
|
W
H
|
H
G
 
G
M
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
A
S
 
S
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
K
G
 
G
Y
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
A
M
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
F
T
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
F
T
 
T
F
 
Y
R
 
R
P
 
P
R
 
R
F
 
F
R
 
E
H
 
R
G
 
-
D
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
Y
D
 
D
W
 
Y
R
 
L
T
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
S
 
R
Q
 
Q
S
 
S
T
 
S
G
 
G
S
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
A
E
|
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
S
 
S
S
|
S
G
 
G
G
 
G
L
 
I
L
 
I
E
 
E
L
 
L
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
K
E
 
R
K
 
K
C
 
C
R
 
E
E
 
A
R
 
R
G
 
G
M
 
M
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Q
|
Q
T
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
M
 
M
F
 
F
A
 
A
F
 
C
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
D
I
 
I
L
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
S
K
|
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
S
 
A
A
 
A
V
 
I
M
 
V
T
 
T
T
 
S
T
 
A
E
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
R
A
 
A
H
 
H
E
 
E
K
 
L
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
T
 
T
T
|
T
H
|
H
V
|
V
S
|
S
D
|
D
P
 
P
L
 
L
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
Q
E
 
R
E
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
N
H
 
V
I
 
M
G
 
G
G
 
D
E
 
R
L
 
L
F
 
R
D
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
L
Q
 
D
L
 
L
K
 
M
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
D
 
D
C
 
C
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
D
G
 
R
E
 
R
S
 
T
R
 
K
S
 
E
A
 
P
D
 
A
H
 
D
E
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
T
A
 
R
E
 
E
A
 
C
F
 
M
R
 
N
R
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
M
 
M
N
 
N
I
 
I
V
 
V
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
R
|
R
I
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
T
I
 
V
S
 
S
E
 
E
E
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
S
I
 
L
I
 
L
T
 
G
Q
 
Q
S
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
R
S
 
A
L
 
L

1dgdA An alkali metal ion size-dependent switch in the active site structure of dialkylglycine decarboxylase (see paper)
70% identity, 95% coverage: 4:433/451 of query aligns to 2:431/431 of 1dgdA

query
sites
1dgdA
N
 
N
Q
 
D
D
 
D
P
 
A
A
 
T
F
 
F
W
 
W
A
 
R
A
 
N
A
 
A
G
 
R
R
 
H
H
 
H
L
 
L
I
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
 
T
F
 
F
D
 
E
P
 
P
A
 
M
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
K
G
 
G
S
 
S
F
 
F
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
G
R
 
R
P
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
D
F
 
F
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
M
 
M
S
 
S
A
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
C
H
 
H
P
 
P
R
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
S
T
 
V
V
 
I
Q
 
G
R
 
E
Q
 
Y
M
 
A
E
 
G
K
 
K
V
 
L
A
 
D
H
 
H
L
 
L
F
 
F
S
 
S
G
 
G
M
 
M
L
 
L
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
N
L
 
I
A
 
T
P
 
P
-
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
A
M
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
S
T
|
T
G
|
G
A
|
A
E
 
E
S
 
S
N
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
K
H
 
Y
E
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
G
F
 
F
S
 
A
K
 
Q
S
 
S
W
|
W
H
|
H
G
 
G
M
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
A
S
 
S
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
K
G
 
G
Y
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
A
M
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
F
T
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
F
T
 
T
F
 
Y
R
 
R
P
 
P
R
 
R
F
 
F
R
 
E
H
 
R
G
 
-
D
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
Y
D
 
D
W
 
Y
R
 
L
T
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
S
 
R
Q
 
Q
S
 
S
T
 
S
G
 
G
S
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
A
E
|
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
S
 
S
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
I
L
 
I
E
 
E
L
 
L
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
K
E
 
R
K
 
K
C
 
C
R
 
E
E
 
A
R
 
R
G
 
G
M
 
M
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Q
|
Q
T
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
M
 
M
F
 
F
A
 
A
F
 
C
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
D
I
 
I
L
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
S
K
|
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
S
 
A
A
 
A
V
 
I
M
 
V
T
 
T
T
 
S
T
 
A
E
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
R
A
 
A
H
 
H
E
 
E
K
 
L
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
T
 
T
T
|
T
H
 
H
V
 
V
S
 
S
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
Q
E
 
R
E
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
N
H
 
V
I
 
M
G
 
G
G
 
D
E
 
R
L
 
L
F
 
R
D
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
L
Q
 
D
L
 
L
K
 
M
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
D
 
D
C
 
C
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
D
G
 
R
E
 
R
S
 
T
R
 
K
S
 
E
A
 
P
D
 
A
H
 
D
E
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
T
A
 
R
E
 
E
A
 
C
F
 
M
R
 
N
R
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
M
 
M
N
 
N
I
 
I
V
 
V
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
R
|
R
I
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
T
I
 
V
S
 
S
E
 
E
E
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
S
I
 
L
I
 
L
T
 
G
Q
 
Q
S
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
R
S
 
A
L
 
L

1zobA Crystal structure of dialkylglycine decarboxylases bound with calcium ion
70% identity, 95% coverage: 4:433/451 of query aligns to 2:431/431 of 1zobA

query
sites
1zobA
N
 
N
Q
 
D
D
 
D
P
 
A
A
 
T
F
 
F
W
 
W
A
 
R
A
 
N
A
 
A
G
 
R
R
 
H
H
 
H
L
 
L
I
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
 
T
F
 
F
D
 
E
P
 
P
A
 
M
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
K
G
 
G
S
 
S
F
 
F
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
G
R
 
R
P
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
D
F
 
F
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
M
 
M
S
 
S
A
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
C
H
 
H
P
 
P
R
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
S
T
 
V
V
 
I
Q
 
G
R
 
E
Q
 
Y
M
 
A
E
 
G
K
 
K
V
 
L
A
 
D
H
 
H
L
|
L
F
 
F
S
|
S
G
 
E
M
 
M
L
 
L
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
N
L
 
I
A
 
T
P
 
P
-
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
A
M
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
S
T
|
T
G
 
G
A
|
A
E
 
E
S
 
S
N
|
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
K
H
 
Y
E
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
G
F
 
F
S
 
A
K
 
Q
S
 
S
W
|
W
H
|
H
G
 
G
M
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
A
S
 
S
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
K
G
 
G
Y
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
A
M
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
F
T
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
F
T
 
T
F
 
Y
R
 
R
P
 
P
R
 
R
F
 
F
R
 
E
H
 
R
G
 
-
D
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
Y
D
 
D
W
 
Y
R
 
L
T
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
S
 
R
Q
 
Q
S
 
S
T
 
S
G
 
G
S
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
A
E
|
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
S
 
S
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
I
L
 
I
E
 
E
L
 
L
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
K
E
 
R
K
 
K
C
 
C
R
 
E
E
 
A
R
 
R
G
 
G
M
 
M
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Q
|
Q
T
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
M
 
M
F
 
F
A
 
A
F
 
C
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
D
I
 
I
L
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
S
K
|
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
S
 
A
A
 
A
V
 
I
M
 
V
T
 
T
T
 
S
T
 
A
E
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
R
A
 
A
H
 
H
E
 
E
K
 
L
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
T
 
T
T
|
T
H
 
H
V
|
V
S
|
S
D
|
D
P
 
P
L
 
L
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
Q
E
 
R
E
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
N
H
 
V
I
 
M
G
 
G
G
 
D
E
 
R
L
 
L
F
 
R
D
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
L
Q
 
D
L
 
L
K
 
M
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
D
 
D
C
 
C
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
D
G
 
R
E
 
R
S
 
T
R
 
K
S
 
E
A
 
P
D
 
A
H
 
D
E
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
T
A
 
R
E
 
E
A
 
C
F
 
M
R
 
N
R
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
M
 
M
N
 
N
I
 
I
V
 
V
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
R
|
R
I
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
T
I
 
V
S
 
S
E
 
E
E
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
S
I
 
L
I
 
L
T
 
G
Q
 
Q
S
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
R
S
 
A
L
 
L

1zc9A The crystal structure of dialkylglycine decarboxylase complex with pyridoxamine 5-phosphate (see paper)
70% identity, 95% coverage: 4:433/451 of query aligns to 2:431/431 of 1zc9A

query
sites
1zc9A
N
 
N
Q
 
D
D
 
D
P
 
A
A
 
T
F
 
F
W
 
W
A
 
R
A
 
N
A
 
A
G
 
R
R
 
H
H
 
H
L
 
L
I
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
 
T
F
 
F
D
 
E
P
 
P
A
 
M
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
K
G
 
G
S
 
S
F
 
F
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
G
R
 
R
P
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
D
F
 
F
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
M
 
M
S
 
S
A
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
C
H
 
H
P
 
P
R
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
S
T
 
V
V
 
I
Q
 
G
R
 
E
Q
 
Y
M
 
A
E
 
G
K
 
K
V
 
L
A
 
D
H
 
H
L
 
L
F
 
F
S
 
S
G
 
E
M
 
M
L
 
L
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
N
L
 
I
A
 
T
P
 
P
-
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
A
M
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
|
G
A
|
A
E
 
E
S
 
S
N
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
K
H
 
Y
E
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
G
F
 
F
S
 
A
K
 
Q
S
 
S
W
|
W
H
|
H
G
 
G
M
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
A
S
 
S
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
K
G
 
G
Y
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
A
M
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
F
T
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
F
T
 
T
F
 
Y
R
 
R
P
 
P
R
 
R
F
 
F
R
 
E
H
 
R
G
 
-
D
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
Y
D
 
D
W
 
Y
R
 
L
T
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
S
 
R
Q
 
Q
S
 
S
T
 
S
G
 
G
S
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
A
E
|
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
S
 
S
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
I
L
 
I
E
 
E
L
 
L
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
K
E
 
R
K
 
K
C
 
C
R
 
E
E
 
A
R
 
R
G
 
G
M
 
M
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Q
|
Q
T
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
M
 
M
F
 
F
A
 
A
F
 
C
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
D
I
 
I
L
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
S
K
|
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
S
 
A
A
 
A
V
 
I
M
 
V
T
 
T
T
 
S
T
 
A
E
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
R
A
 
A
H
 
H
E
 
E
K
 
L
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
T
 
T
T
|
T
H
 
H
V
 
V
S
 
S
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
Q
E
 
R
E
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
N
H
 
V
I
 
M
G
 
G
G
 
D
E
 
R
L
 
L
F
 
R
D
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
L
Q
 
D
L
 
L
K
 
M
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
D
 
D
C
 
C
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
D
G
 
R
E
 
R
S
 
T
R
 
K
S
 
E
A
 
P
D
 
A
H
 
D
E
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
T
A
 
R
E
 
E
A
 
C
F
 
M
R
 
N
R
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
M
 
M
N
 
N
I
 
I
V
 
V
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
R
|
R
I
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
T
I
 
V
S
 
S
E
 
E
E
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
S
I
 
L
I
 
L
T
 
G
Q
 
Q
S
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
R
S
 
A
L
 
L

1m0qA Structure of dialkylglycine decarboxylase complexed with s-1- aminoethanephosphonate (see paper)
70% identity, 95% coverage: 4:433/451 of query aligns to 2:431/431 of 1m0qA

query
sites
1m0qA
N
 
N
Q
 
D
D
 
D
P
 
A
A
 
T
F
 
F
W
 
W
A
 
R
A
 
N
A
 
A
G
 
R
R
 
H
H
 
H
L
 
L
I
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
 
T
F
 
F
D
 
E
P
 
P
A
 
M
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
K
G
 
G
S
 
S
F
 
F
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
G
R
 
R
P
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
D
F
 
F
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
|
Q
M
 
M
S
 
S
A
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
C
H
 
H
P
 
P
R
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
S
T
 
V
V
 
I
Q
 
G
R
 
E
Q
 
Y
M
 
A
E
 
G
K
 
K
V
 
L
A
 
D
H
 
H
L
 
L
F
 
F
S
 
S
G
 
E
M
 
M
L
 
L
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
N
L
 
I
A
 
T
P
 
P
-
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
A
M
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
S
T
|
T
G
 
G
A
|
A
E
 
E
S
 
S
N
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
K
H
 
Y
E
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
G
F
 
F
S
 
A
K
 
Q
S
 
S
W
|
W
H
|
H
G
 
G
M
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
A
S
 
S
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
K
G
 
G
Y
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
A
M
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
F
T
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
F
T
 
T
F
 
Y
R
 
R
P
 
P
R
 
R
F
 
F
R
 
E
H
 
R
G
 
-
D
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
Y
D
 
D
W
 
Y
R
 
L
T
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
S
 
R
Q
 
Q
S
 
S
T
 
S
G
 
G
S
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
A
E
|
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
S
 
S
S
|
S
G
 
G
G
 
G
L
 
I
L
 
I
E
 
E
L
 
L
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
K
E
 
R
K
 
K
C
 
C
R
 
E
E
 
A
R
 
R
G
 
G
M
 
M
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Q
|
Q
T
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
M
 
M
F
 
F
A
 
A
F
 
C
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
D
I
 
I
L
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
S
K
|
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
S
 
A
A
 
A
V
 
I
M
 
V
T
 
T
T
 
S
T
 
A
E
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
R
A
 
A
H
 
H
E
 
E
K
 
L
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
T
 
T
T
|
T
H
 
H
V
 
V
S
 
S
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
Q
E
 
R
E
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
N
H
 
V
I
 
M
G
 
G
G
 
D
E
 
R
L
 
L
F
 
R
D
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
L
Q
 
D
L
 
L
K
 
M
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
D
 
D
C
 
C
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
D
G
 
R
E
 
R
S
 
T
R
 
K
S
 
E
A
 
P
D
 
A
H
 
D
E
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
T
A
 
R
E
 
E
A
 
C
F
 
M
R
 
N
R
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
M
 
M
N
 
N
I
 
I
V
 
V
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
R
|
R
I
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
T
I
 
V
S
 
S
E
 
E
E
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
S
I
 
L
I
 
L
T
 
G
Q
 
Q
S
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
R
S
 
A
L
 
L

1m0pA Structure of dialkylglycine decarboxylase complexed with 1-amino-1- phenylethanephosphonate (see paper)
70% identity, 95% coverage: 4:433/451 of query aligns to 2:431/431 of 1m0pA

query
sites
1m0pA
N
 
N
Q
 
D
D
 
D
P
 
A
A
 
T
F
 
F
W
 
W
A
 
R
A
 
N
A
 
A
G
 
R
R
 
H
H
 
H
L
 
L
I
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
 
T
F
 
F
D
 
E
P
 
P
A
 
M
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
K
G
 
G
S
 
S
F
 
F
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
G
R
 
R
P
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
D
F
 
F
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
|
Q
M
 
M
S
 
S
A
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
C
H
 
H
P
 
P
R
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
S
T
 
V
V
 
I
Q
 
G
R
 
E
Q
 
Y
M
 
A
E
 
G
K
 
K
V
 
L
A
 
D
H
 
H
L
 
L
F
 
F
S
 
S
G
 
E
M
 
M
L
 
L
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
N
L
 
I
A
 
T
P
 
P
-
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
A
M
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
S
T
|
T
G
 
G
A
|
A
E
 
E
S
 
S
N
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
K
H
 
Y
E
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
G
F
 
F
S
 
A
K
 
Q
S
 
S
W
|
W
H
|
H
G
 
G
M
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
A
S
 
S
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
K
G
 
G
Y
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
A
M
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
F
T
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
F
T
 
T
F
 
Y
R
 
R
P
 
P
R
 
R
F
 
F
R
 
E
H
 
R
G
 
-
D
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
Y
D
 
D
W
 
Y
R
 
L
T
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
S
 
R
Q
 
Q
S
 
S
T
 
S
G
 
G
S
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
A
E
|
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
S
 
S
S
|
S
G
 
G
G
 
G
L
 
I
L
 
I
E
 
E
L
 
L
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
K
E
 
R
K
 
K
C
 
C
R
 
E
E
 
A
R
 
R
G
 
G
M
 
M
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Q
|
Q
T
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
M
 
M
F
 
F
A
 
A
F
 
C
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
D
I
 
I
L
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
S
K
|
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
S
 
A
A
 
A
V
 
I
M
 
V
T
 
T
T
 
S
T
 
A
E
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
R
A
 
A
H
 
H
E
 
E
K
 
L
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
T
 
T
T
|
T
H
 
H
V
 
V
S
 
S
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
Q
E
 
R
E
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
N
H
 
V
I
 
M
G
 
G
G
 
D
E
 
R
L
 
L
F
 
R
D
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
L
Q
 
D
L
 
L
K
 
M
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
D
 
D
C
 
C
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
D
G
 
R
E
 
R
S
 
T
R
 
K
S
 
E
A
 
P
D
 
A
H
 
D
E
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
T
A
 
R
E
 
E
A
 
C
F
 
M
R
 
N
R
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
M
 
M
N
 
N
I
 
I
V
 
V
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
R
|
R
I
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
T
I
 
V
S
 
S
E
 
E
E
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
S
I
 
L
I
 
L
T
 
G
Q
 
Q
S
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
R
S
 
A
L
 
L

1m0oA Structure of dialkylglycine decarboxylase complexed with 1-amino-1- methylpropanephosphonate (see paper)
70% identity, 95% coverage: 4:433/451 of query aligns to 2:431/431 of 1m0oA

query
sites
1m0oA
N
 
N
Q
 
D
D
 
D
P
 
A
A
 
T
F
 
F
W
 
W
A
 
R
A
 
N
A
 
A
G
 
R
R
 
H
H
 
H
L
 
L
I
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
 
T
F
 
F
D
 
E
P
 
P
A
 
M
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
K
G
 
G
S
 
S
F
 
F
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
G
R
 
R
P
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
D
F
 
F
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
|
Q
M
 
M
S
 
S
A
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
C
H
 
H
P
 
P
R
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
S
T
 
V
V
 
I
Q
 
G
R
 
E
Q
 
Y
M
 
A
E
 
G
K
 
K
V
 
L
A
 
D
H
 
H
L
 
L
F
 
F
S
 
S
G
 
E
M
 
M
L
 
L
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
N
L
 
I
A
 
T
P
 
P
-
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
A
M
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
|
G
A
|
A
E
 
E
S
 
S
N
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
K
H
 
Y
E
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
G
F
 
F
S
 
A
K
 
Q
S
 
S
W
|
W
H
|
H
G
 
G
M
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
A
S
 
S
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
K
G
 
G
Y
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
A
M
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
F
T
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
F
T
 
T
F
 
Y
R
 
R
P
 
P
R
 
R
F
 
F
R
 
E
H
 
R
G
 
-
D
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
Y
D
 
D
W
 
Y
R
 
L
T
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
S
 
R
Q
 
Q
S
 
S
T
 
S
G
 
G
S
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
A
E
|
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
S
 
S
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
I
L
 
I
E
 
E
L
 
L
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
K
E
 
R
K
 
K
C
 
C
R
 
E
E
 
A
R
 
R
G
 
G
M
 
M
L
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
|
D
E
 
E
A
 
A
Q
|
Q
T
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
M
 
M
F
 
F
A
 
A
F
 
C
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
D
I
 
I
L
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
S
K
|
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
S
 
A
A
 
A
V
 
I
M
 
V
T
 
T
T
 
S
T
 
A
E
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
R
A
 
A
H
 
H
E
 
E
K
 
L
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
T
 
T
T
|
T
H
 
H
V
 
V
S
 
S
D
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
Q
E
 
R
E
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
N
H
 
V
I
 
M
G
 
G
G
 
D
E
 
R
L
 
L
F
 
R
D
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
L
Q
 
D
L
 
L
K
 
M
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
D
 
D
C
 
C
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
V
K
 
K
P
 
D
G
 
R
E
 
R
S
 
T
R
 
K
S
 
E
A
 
P
D
 
A
H
 
D
E
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
T
A
 
R
E
 
E
A
 
C
F
 
M
R
 
N
R
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
M
 
M
N
 
N
I
 
I
V
 
V
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
R
|
R
I
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
T
I
 
V
S
 
S
E
 
E
E
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
S
I
 
L
I
 
L
T
 
G
Q
 
Q
S
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
R
S
 
A
L
 
L

1m0nA Structure of dialkylglycine decarboxylase complexed with 1- amin