SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011973217.1 NCBI__GCF_000017185.1:WP_011973217.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 9 hits to proteins with known functional sites (download)

2qmxA The crystal structure of l-phe inhibited prephenate dehydratase from chlorobium tepidum tls (see paper)
35% identity, 98% coverage: 1:273/278 of query aligns to 3:275/278 of 2qmxA

query
sites
2qmxA
M
 
L
I
 
I
Y
 
A
C
 
Y
L
 
Q
G
 
G
P
 
E
K
 
P
G
 
G
S
 
A
Y
 
Y
T
 
S
E
 
E
E
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
L
I
 
R
F
 
F
S
 
G
K
 
E
I
 
P
I
 
L
K
 
P
D
 
-
K
 
-
N
 
-
I
 
-
E
 
-
Y
 
-
C
 
C
N
 
E
S
 
S
I
 
F
Y
 
D
E
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
S
R
 
A
V
 
V
E
 
T
Q
 
E
G
 
Q
N
 
K
N
 
A
N
 
D
C
 
-
Y
 
Y
G
 
A
V
 
V
V
 
I
P
 
P
S
 
I
E
 
E
N
 
N
S
 
S
I
 
L
E
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
I
S
 
H
L
 
Q
T
 
N
M
 
Y
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
R
F
 
R
P
 
P
V
 
V
K
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
A
E
 
E
V
 
T
D
 
F
I
 
V
N
 
K
I
 
V
N
 
E
H
 
H
C
 
C
L
 
L
I
 
L
G
 
G
Y
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
A
S
 
S
K
 
V
D
 
E
K
 
T
I
 
A
K
 
T
K
 
K
I
 
A
L
 
M
A
 
S
H
 
H
P
 
P
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
C
 
C
R
 
H
K
 
N
Y
 
F
I
 
F
K
 
A
K
 
T
H
 
H
D
 
P
W
 
Q
-
 
I
E
 
R
T
 
A
E
 
E
S
 
A
V
 
A
L
 
Y
S
 
D
N
 
T
S
 
A
M
 
G
A
 
S
V
 
A
K
 
K
K
 
M
V
 
V
Y
 
A
D
 
E
M
 
S
K
 
R
N
 
D
E
 
K
E
 
S
L
 
A
G
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
S
K
 
K
K
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
E
L
 
L
Y
 
Y
N
 
G
L
 
L
N
 
D
I
 
I
L
 
L
D
 
K
T
 
E
N
 
N
I
 
L
Q
 
A
D
 
D
Y
 
E
P
 
E
N
 
W
N
 
N
T
 
I
T
|
T
R
 
R
F
|
F
I
 
F
L
 
C
I
 
I
G
 
A
K
 
H
D
 
-
C
 
-
E
 
E
D
 
N
S
 
N
N
 
P
D
 
D
I
 
I
S
 
S
F
 
H
-
 
L
-
 
K
T
 
V
N
 
R
N
 
P
D
 
D
T
 
V
T
 
A
K
 
R
K
 
Q
S
 
K
T
 
T
I
 
S
I
 
I
I
 
V
E
 
F
L
 
A
I
 
L
G
 
P
N
|
N
K
x
E
P
 
Q
G
 
G
A
 
S
L
|
L
Y
 
F
N
 
R
I
 
A
L
 
L
K
 
A
E
 
T
F
 
F
N
 
A
K
 
L
K
 
R
N
 
G
I
 
I
N
x
D
L
|
L
T
|
T
R
x
K
I
 
I
E
 
E
S
|
S
R
 
R
P
 
P
S
 
S
K
 
R
T
 
K
K
 
K
L
 
A
G
 
F
S
 
E
Y
|
Y
I
 
L
F
|
F
Y
 
Y
I
 
A
D
 
D
Y
 
F
E
 
I
T
 
G
P
 
H
E
 
R
N
 
E
E
 
D
K
 
Q
E
 
N
L
 
V
I
 
H
N
 
N
S
 
A
L
 
L
K
 
E
N
 
N
-
 
L
-
 
R
-
 
E
Y
 
F
V
 
A
S
 
T
N
 
M
I
 
V
K
 
K
Y
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
S
S
 
Y
N
 
G
I
 
V

P0A9J8 Bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase; Chorismate mutase-prephenate dehydratase; P-protein; EC 5.4.99.5; EC 4.2.1.51 from Escherichia coli (strain K12)
31% identity, 96% coverage: 2:269/278 of query aligns to 106:373/386 of P0A9J8

query
sites
P0A9J8
I
 
I
Y
 
A
C
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
K
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
T
 
S
E
 
H
E
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
R
I
 
Q
F
 
Y
S
 
A
K
 
A
I
 
R
I
 
H
K
 
F
D
 
E
K
 
Q
N
 
F
I
 
I
E
 
E
Y
 
S
-
 
G
C
 
C
N
 
A
S
 
K
I
 
F
Y
 
A
E
 
D
V
 
I
F
 
F
E
 
N
R
 
Q
V
 
V
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
N
 
Q
N
 
A
N
 
D
C
 
-
Y
 
Y
G
 
A
V
 
V
V
 
V
P
 
P
S
 
I
E
 
E
N
 
N
S
 
T
I
 
S
E
 
S
G
 
G
S
 
A
V
 
I
S
 
N
L
 
D
T
 
V
M
 
Y
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
Q
E
 
H
F
 
T
P
 
S
V
 
L
K
 
S
I
 
I
L
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
M
D
 
T
I
 
L
N
 
T
I
 
I
N
 
D
H
 
H
C
 
C
L
 
L
I
 
L
-
 
V
-
 
S
G
 
G
Y
 
T
S
 
T
K
 
D
-
 
L
D
 
S
K
 
T
I
 
I
K
 
N
K
 
T
I
 
V
L
 
Y
A
 
S
H
 
H
P
 
P
Q
 
Q
A
 
P
L
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
C
 
C
R
 
S
K
 
K
Y
 
F
I
 
L
K
 
N
K
 
R
H
 
Y
-
 
P
D
 
H
W
 
W
E
 
K
T
 
I
E
 
E
S
 
Y
V
 
T
L
 
E
S
 
S
N
 
T
S
 
S
M
 
A
A
 
A
V
 
M
K
 
E
K
 
K
V
 
V
Y
 
A
D
 
Q
M
 
A
K
 
K
N
 
S
E
 
P
E
 
H
L
 
V
G
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
G
S
 
S
K
 
E
K
 
A
A
 
G
G
 
G
K
 
T
L
 
L
Y
 
Y
N
 
G
L
 
L
N
 
Q
I
 
V
L
 
L
D
 
E
T
 
R
N
 
I
I
 
E
Q
 
A
D
 
N
Y
 
Q
P
 
R
N
 
Q
N
 
N
T
 
F
T
 
T
R
 
R
F
 
F
I
 
V
L
 
V
I
 
L
G
 
A
K
 
R
D
 
K
C
 
A
E
 
I
D
 
N
S
 
V
N
 
S
D
 
D
I
 
-
S
 
-
F
 
-
T
 
-
N
 
-
N
 
-
D
 
Q
T
 
V
T
 
P
K
 
A
K
 
K
S
 
T
T
 
T
I
 
L
I
 
L
I
 
M
E
 
A
L
 
-
I
 
T
G
 
G
N
 
Q
K
 
Q
P
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
V
N
 
E
I
 
A
L
 
L
K
 
L
E
 
V
F
 
L
N
 
R
K
 
N
K
 
H
N
 
N
I
 
L
N
 
I
L
 
M
T
 
T
R
 
R
I
 
L
E
 
E
S
 
S
R
 
R
P
 
P
S
 
I
K
 
H
T
 
G
K
 
N
L
 
P
G
 
W
S
 
E
Y
 
E
I
 
M
F
 
F
Y
 
Y
I
 
L
D
 
D
Y
 
I
E
 
Q
T
 
A
P
 
N
E
 
L
N
 
E
E
 
S
K
 
A
E
 
E
L
 
M
I
 
Q
N
 
K
S
 
A
L
 
L
K
 
K
N
 
E
Y
 
L
-
 
G
-
 
E
-
 
I
V
 
T
S
 
R
N
 
S
I
 
M
K
 
K
Y
 
V
L
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3mwbA The crystal structure of prephenate dehydratase in complex with l-phe from arthrobacter aurescens to 2.0a
31% identity, 96% coverage: 5:270/278 of query aligns to 6:273/306 of 3mwbA

query
sites
3mwbA
L
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
Q
G
 
G
S
 
T
Y
 
F
T
 
T
E
 
E
E
 
-
A
 
A
A
 
A
E
 
L
I
 
M
F
 
Q
S
 
V
K
 
P
I
 
G
I
 
A
K
 
A
D
 
D
K
 
A
N
 
T
I
 
R
E
 
I
Y
 
P
C
 
C
N
 
T
S
 
N
I
 
V
Y
 
N
E
 
T
V
 
A
F
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
R
Q
 
A
G
 
G
N
 
E
N
 
A
N
 
D
C
 
A
Y
 
-
G
 
A
V
 
M
V
 
V
P
 
P
S
 
I
E
 
E
N
 
N
S
 
S
I
 
V
E
 
E
G
 
G
S
 
G
V
 
V
S
 
T
L
 
A
T
 
T
M
 
L
D
 
D
L
 
A
L
 
I
L
 
A
E
 
T
F
 
G
P
 
Q
-
 
E
V
 
L
K
 
R
I
 
I
L
 
I
G
 
R
E
 
E
V
 
A
D
 
L
I
 
V
N
 
P
I
 
I
N
 
T
H
 
F
C
 
V
L
 
L
I
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
P
G
 
G
Y
 
V
S
 
E
K
 
L
D
 
S
K
 
D
I
 
I
K
 
K
K
 
R
I
 
I
L
 
S
A
 
T
H
 
H
P
 
G
Q
 
H
A
 
A
L
 
W
A
 
A
Q
 
Q
C
 
C
R
 
R
K
 
L
Y
 
W
I
 
V
K
 
D
K
 
E
H
 
H
D
 
L
W
 
P
E
 
N
T
 
A
E
 
D
S
 
Y
V
 
V
L
 
P
S
 
G
N
 
S
S
 
S
M
 
T
A
 
A
V
 
A
K
 
S
K
 
A
V
 
M
Y
 
G
D
 
L
M
 
L
K
 
E
N
 
D
E
 
D
-
 
A
-
 
P
-
 
Y
E
 
E
L
 
A
G
 
A
A
 
I
I
 
C
A
 
A
S
 
P
K
 
L
K
 
I
A
 
A
G
 
A
K
 
E
L
 
Q
Y
 
P
N
 
G
L
 
L
N
 
N
I
 
V
L
 
L
D
 
A
T
 
E
N
 
D
I
 
I
Q
 
G
D
 
D
Y
 
N
P
 
P
N
 
D
N
 
A
T
 
V
T
|
T
R
 
R
F
|
F
I
 
I
L
 
L
I
 
V
G
 
-
K
 
-
D
 
-
C
 
-
E
 
-
D
 
-
S
 
S
N
 
R
D
 
P
I
 
G
S
 
A
F
 
L
T
 
P
N
 
E
N
 
R
D
 
T
T
 
G
T
 
A
K
 
D
K
 
K
S
 
T
T
 
T
I
 
V
I
 
V
I
 
V
E
 
P
L
 
L
I
 
P
G
 
E
N
x
D
K
x
H
P
 
P
G
 
G
A
 
A
L
|
L
Y
 
M
N
 
E
I
 
I
L
 
L
K
 
D
E
 
Q
F
 
F
N
 
A
K
 
S
K
 
R
N
 
G
I
 
V
N
|
N
L
|
L
T
x
S
R
|
R
I
 
I
E
 
E
S
|
S
R
 
R
P
 
P
S
 
T
K
 
G
T
 
Q
K
 
Y
L
 
L
G
 
G
S
 
H
Y
 
Y
I
 
F
F
|
F
Y
 
S
I
 
I
D
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
G
Y
 
H
E
 
A
T
 
T
P
 
D
E
 
S
N
 
R
E
 
V
K
 
A
E
 
D
L
 
A
I
 
L
N
 
A
S
 
G
L
 
L
K
 
H
N
 
R
Y
 
I
V
 
S
S
 
P
N
 
A
I
 
T
K
 
R
Y
 
F
L
 
L
G
 
G
S
 
S

3mwbB The crystal structure of prephenate dehydratase in complex with l-phe from arthrobacter aurescens to 2.0a
31% identity, 96% coverage: 5:270/278 of query aligns to 6:270/303 of 3mwbB

query
sites
3mwbB
L
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
Q
G
 
G
S
 
T
Y
 
F
T
 
T
E
 
E
E
 
-
A
 
A
A
 
A
E
 
L
I
 
M
F
 
Q
S
 
V
K
 
P
I
 
G
I
 
A
K
 
A
D
 
D
K
 
A
N
 
T
I
 
R
E
 
I
Y
 
P
C
 
C
N
 
T
S
 
N
I
 
V
Y
 
N
E
 
T
V
 
A
F
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
R
Q
 
A
G
 
G
N
 
E
N
 
A
N
 
D
C
 
A
Y
 
-
G
 
A
V
 
M
V
 
V
P
 
P
S
 
I
E
 
E
N
 
N
S
 
S
I
 
V
E
 
E
G
 
G
S
 
G
V
 
V
S
 
T
L
 
A
T
 
T
M
 
L
D
 
D
L
 
A
L
 
I
L
 
A
E
 
T
F
 
G
P
 
Q
-
 
E
V
 
L
K
 
R
I
 
I
L
 
I
G
 
R
E
 
E
V
 
A
D
 
L
I
 
V
N
 
P
I
 
I
N
 
T
H
 
F
C
 
V
L
 
L
I
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
P
G
 
G
Y
 
V
S
 
E
K
 
L
D
 
S
K
 
D
I
 
I
K
 
K
K
 
R
I
 
I
L
 
S
A
 
T
H
 
H
P
 
G
Q
 
H
A
 
A
L
 
W
A
 
A
Q
 
Q
C
 
C
R
 
R
K
 
L
Y
 
W
I
 
V
K
 
D
K
 
E
H
 
H
D
 
L
W
 
P
E
 
N
T
 
A
E
 
D
S
 
Y
V
 
V
L
 
P
S
 
G
N
 
S
S
 
S
M
 
T
A
 
A
V
 
A
K
 
S
K
 
A
V
 
M
Y
 
G
D
 
L
M
 
L
K
 
E
N
 
D
E
 
D
-
 
A
-
 
P
-
 
Y
E
 
E
L
 
A
G
 
A
A
 
I
I
 
C
A
 
A
S
 
P
K
 
L
K
 
I
A
|
A
G
 
A
K
 
E
L
x
Q
Y
 
P
N
 
G
L
|
L
N
 
N
I
 
V
L
 
L
D
 
A
T
 
E
N
 
D
I
 
I
Q
 
G
D
 
D
Y
 
N
P
 
P
N
 
D
N
 
A
T
 
V
T
|
T
R
 
R
F
|
F
I
 
I
L
 
L
I
 
V
G
 
-
K
 
-
D
 
-
C
 
-
E
 
-
D
 
-
S
 
S
N
 
R
D
 
P
I
 
G
S
 
A
F
 
L
T
 
P
N
 
E
N
 
R
D
 
T
T
 
G
T
 
A
K
 
D
K
 
K
S
 
T
T
 
T
I
 
V
I
 
V
I
 
V
E
 
P
L
 
L
I
 
P
G
 
E
N
x
D
K
x
H
P
 
P
G
 
G
A
 
A
L
|
L
Y
 
M
N
 
E
I
 
I
L
 
L
K
 
D
E
 
Q
F
 
F
N
 
A
K
 
S
K
 
R
N
 
G
I
 
V
N
|
N
L
|
L
T
x
S
R
|
R
I
|
I
E
 
E
S
 
S
R
 
R
P
 
P
S
 
T
K
 
-
T
 
-
K
 
-
L
 
L
G
 
G
S
 
H
Y
|
Y
I
 
F
F
|
F
Y
 
S
I
 
I
D
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
G
Y
 
H
E
 
A
T
 
T
P
 
D
E
 
S
N
 
R
E
 
V
K
 
A
E
 
D
L
 
A
I
 
L
N
 
A
S
 
G
L
 
L
K
 
H
N
 
R
Y
 
I
V
 
S
S
 
P
N
 
A
I
 
T
K
 
R
Y
 
F
L
 
L
G
 
G
S
 
S

6vh5D Crystal structure of prephenate dehydratase from brucella melitensis biovar abortus 2308 in complex with phenylalanine
29% identity, 86% coverage: 31:269/278 of query aligns to 35:274/282 of 6vh5D

query
sites
6vh5D
C
 
C
N
 
P
S
 
T
I
 
F
Y
 
E
E
 
D
V
 
A
F
 
F
E
 
N
R
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
N
 
A
N
 
A
N
 
D
C
 
L
Y
 
-
G
 
A
V
 
M
V
 
I
P
 
P
S
 
I
E
 
E
N
 
N
S
 
T
I
 
L
E
 
A
G
 
G
S
 
R
V
 
V
S
 
A
L
 
D
T
 
I
M
 
H
D
 
Y
L
 
L
L
 
L
L
 
P
E
 
L
F
 
A
P
 
D
V
 
M
K
 
H
I
 
I
L
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
Y
D
 
F
I
 
L
N
 
P
I
 
I
N
 
H
H
 
F
C
 
Q
L
 
L
I
 
M
-
 
V
-
 
L
-
 
P
G
 
G
Y
 
V
S
 
R
K
 
R
D
 
E
K
 
E
I
 
I
K
 
K
K
 
T
I
 
V
L
 
H
A
 
S
H
 
H
P
 
I
Q
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
G
Q
 
Q
C
 
C
R
 
R
K
 
N
Y
 
V
I
 
I
K
 
R
K
 
Q
H
 
N
D
 
G
W
 
W
E
 
K
T
 
G
E
 
V
S
 
I
V
 
A
L
 
G
S
 
D
N
 
T
S
 
A
M
 
G
A
 
A
V
 
A
K
 
R
K
 
L
V
 
V
Y
 
A
D
 
D
M
 
V
K
 
K
N
 
D
E
 
R
E
 
S
L
 
M
G
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
P
K
 
R
K
 
L
A
 
A
G
 
A
K
 
D
L
 
L
Y
 
Y
N
 
G
L
 
L
N
 
D
I
 
I
L
 
L
D
 
E
T
 
E
N
 
N
I
 
V
Q
 
E
D
 
D
Y
 
S
P
 
E
N
 
N
N
 
N
T
 
V
T
 
T
R
 
R
F
 
F
I
 
V
L
 
V
I
 
L
G
 
S
K
 
K
D
 
N
C
 
K
E
 
Q
D
 
W
S
 
A
N
 
-
D
 
-
I
 
-
S
 
A
F
 
R
T
 
P
N
 
E
N
 
N
D
 
D
T
 
E
T
 
R
K
 
I
K
 
V
S
 
T
T
 
T
I
 
F
I
 
V
I
 
F
E
 
R
L
 
-
I
 
V
G
 
R
N
|
N
K
x
V
P
 
P
G
 
A
A
 
A
L
|
L
Y
 
Y
N
 
K
I
 
A
L
 
L
K
 
G
E
 
G
F
 
F
N
 
A
K
 
T
K
 
N
N
 
G
I
 
V
N
|
N
L
x
M
T
|
T
R
x
K
I
 
L
E
 
E
S
|
S
R
 
Y
P
 
Q
S
 
L
K
 
G
T
 
G
K
 
R
L
 
F
G
 
I
S
 
A
Y
x
T
I
 
Q
F
|
F
Y
 
Y
I
 
A
D
 
D
Y
 
I
E
 
E
T
 
G
P
 
H
E
 
P
N
 
E
E
 
E
K
 
R
E
 
S
L
 
V
-
 
Q
-
 
L
-
 
A
I
 
L
N
 
E
S
 
E
L
 
L
K
 
R
N
 
F
Y
 
F
V
 
T
S
 
K
N
 
E
I
 
V
K
 
R
Y
 
I
L
 
L
G
 
G

3luyA Putative chorismate mutase from bifidobacterium adolescentis
25% identity, 92% coverage: 2:258/278 of query aligns to 6:267/326 of 3luyA

query
sites
3luyA
I
 
L
Y
 
F
C
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
Q
G
 
G
S
 
T
Y
 
F
T
 
T
E
 
H
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
E
 
E
I
 
L
F
 
A
S
 
R
K
 
F
I
 
E
I
 
P
K
 
Q
D
 
G
K
 
F
N
 
D
I
 
L
E
 
M
Y
 
P
C
 
M
N
 
D
S
 
D
I
 
V
Y
 
P
E
 
Q
V
 
I
F
 
L
E
 
D
R
 
A
V
 
A
E
 
Q
Q
 
H
G
 
G
N
 
D
N
 
G
N
 
-
C
 
-
Y
 
W
G
 
G
V
 
I
V
 
V
P
 
A
S
 
W
E
 
E
N
 
N
S
 
N
I
 
V
E
 
E
G
 
G
S
 
Y
V
 
V
S
 
V
L
 
P
T
 
N
M
 
L
D
 
D
L
 
A
L
 
L
L
 
I
E
 
D
F
 
A
P
 
-
V
 
K
K
 
D
I
 
L
L
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
A
D
 
R
I
 
V
N
 
G
I
 
V
N
 
N
-
 
V
-
 
E
-
 
F
-
 
D
-
 
A
H
 
Y
C
 
V
L
 
A
I
 
Q
G
 
G
Y
 
A
S
 
D
K
 
P
D
 
A
K
 
E
I
 
A
K
 
R
K
 
I
I
 
A
L
 
T
A
 
A
H
 
H
P
 
P
Q
 
H
A
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
C
 
C
R
 
K
K
 
R
Y
 
F
I
 
I
K
 
A
K
 
E
H
 
H
D
 
R
W
 
L
E
 
S
T
 
T
E
 
Q
S
 
P
V
 
A
L
 
T
S
 
S
N
 
N
S
 
A
M
 
A
A
 
A
V
 
C
K
 
R
K
 
-
V
 
-
Y
 
-
D
 
D
M
 
L
K
 
I
N
 
P
E
 
G
E
 
E
L
 
I
G
 
-
A
 
A
I
 
F
A
 
G
S
 
P
K
 
A
K
 
I
A
 
C
G
 
G
K
 
E
L
 
L
Y
 
Y
N
 
D
L
 
I
N
 
T
I
 
R
L
 
I
D
 
G
T
 
T
N
 
A
I
 
I
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
P
 
Q
N
 
G
N
 
A
T
 
A
T
|
T
R
 
D
F
 
F
I
 
L
L
 
V
I
 
L
G
 
S
K
 
P
D
 
R
C
 
A
E
 
E
D
 
V
S
 
A
N
 
R
D
 
L
I
 
L
S
 
A
F
 
K
T
 
P
N
 
R
N
 
A
D
 
E
T
 
A
T
 
N
K
 
V
K
 
E
S
 
Y
T
 
E
I
 
S
I
 
V
I
 
L
E
 
T
L
 
L
I
 
I
G
 
P
-
 
L
-
 
V
N
 
T
K
x
G
P
 
P
G
 
G
A
 
V
L
|
L
Y
 
A
N
 
N
I
 
L
L
 
L
K
 
D
E
 
V
F
 
F
N
 
R
K
 
D
K
 
A
N
 
G
I
 
L
N
 
N
L
 
M
T
 
T
R
 
S
I
 
F
E
 
I
S
 
S
R
 
R
P
 
P
S
 
I
K
 
K
T
 
G
K
 
R
L
 
T
G
 
G
S
 
T
Y
|
Y
I
 
S
F
|
F
Y
 
I
I
 
V
D
 
T
Y
 
L
E
 
D
T
 
A
P
 
A
E
 
P
N
 
W
E
 
E
K
 
E
E
 
R
L
 
F
I
 
R
N
 
D
S
 
A
L
 
L

7am0B Gqqa- a novel type of quorum quenching acylases (see paper)
27% identity, 82% coverage: 31:258/278 of query aligns to 30:253/278 of 7am0B

query
sites
7am0B
C
 
C
N
 
Q
S
 
T
I
 
F
Y
 
A
E
 
Q
V
 
T
F
 
I
E
 
A
R
 
A
V
 
V
E
 
H
Q
 
D
G
 
G
N
 
R
N
 
A
N
 
E
C
 
-
Y
 
L
G
 
A
V
 
M
V
 
L
P
 
A
S
 
C
E
 
E
N
 
N
S
 
S
I
 
L
E
 
A
G
 
G
S
 
R
V
 
V
S
 
P
L
 
D
T
 
I
M
 
H
D
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
P
E
 
E
F
 
A
P
 
G
V
 
L
K
 
F
I
 
I
L
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
H
D
 
F
I
 
Q
N
 
R
I
 
V
N
 
E
H
 
H
C
 
C
L
 
L
I
 
L
G
 
G
Y
 
I
S
 
P
K
 
G
D
 
S
K
 
T
I
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
A
K
 
R
K
 
R
I
 
I
L
 
H
A
 
T
H
 
H
P
 
P
Q
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
A
Q
 
Q
C
 
V
R
 
R
K
 
G
Y
 
I
I
 
I
K
 
T
K
 
E
H
 
L
D
 
G
W
 
L
E
 
D
T
 
P
E
 
V
S
 
V
V
 
E
L
 
F
S
 
D
N
 
T
S
 
A
M
 
G
A
 
A
V
 
A
K
 
E
K
 
M
V
 
V
Y
 
R
D
 
E
M
 
W
K
 
G
N
 
R
E
 
K
E
 
E
L
 
D
G
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
S
 
S
K
 
A
K
 
L
A
 
A
G
 
A
K
 
E
L
 
L
Y
 
N
N
 
G
L
 
L
N
 
E
I
 
I
L
 
L
D
 
R
T
 
R
N
 
N
I
 
V
Q
 
E
D
 
D
Y
 
A
P
 
T
N
 
H
N
 
N
T
 
T
T
 
T
R
 
R
F
 
F
I
 
Y
L
 
I
I
 
A
G
 
S
K
 
R
D
 
-
C
 
-
E
 
-
D
 
-
S
 
-
N
 
R
D
 
P
I
 
A
S
 
T
F
 
L
T
 
P
N
 
P
N
 
P
D
 
G
T
 
P
T
 
G
K
 
F
K
 
M
S
 
T
T
 
T
I
 
L
I
 
L
I
 
F
E
 
R
L
 
-
I
 
V
G
x
N
N
|
N
K
x
Q
P
|
P
G
 
G
A
 
A
L
|
L
Y
 
Y
N
 
K
I
 
A
L
 
L
K
 
G
E
 
G
F
 
L
N
 
A
K
 
T
K
 
A
N
 
G
I
 
V
N
|
N
L
x
M
T
|
T
R
|
R
I
 
L
E
 
E
S
 
S
R
 
Y
P
 
M
S
 
L
K
 
E
T
 
G
K
 
S
L
 
F
G
 
S
S
 
A
Y
x
T
I
 
Q
F
|
F
Y
 
L
I
 
M
D
 
D
Y
 
V
E
 
E
T
 
G
P
 
H
E
 
P
N
 
E
E
 
A
K
 
P
E
 
P
L
 
L
I
 
A
N
 
R
S
 
A
L
 
L

5jk8A Phenylalanine hydroxylase from dictyostelium - bh2, norleucine complex
49% identity, 20% coverage: 205:260/278 of query aligns to 16:72/390 of 5jk8A

query
sites
5jk8A
N
 
D
K
 
K
P
 
I
G
 
G
A
 
G
L
 
L
Y
 
L
N
 
E
I
 
Y
L
 
L
K
 
E
E
 
I
F
 
I
N
 
K
K
 
K
K
 
H
N
 
N
I
 
I
N
 
N
L
 
I
T
 
T
R
 
R
I
 
I
E
 
E
S
 
S
R
 
R
P
 
P
S
 
S
K
|
K
T
 
T
K
 
E
L
 
K
G
 
K
S
 
D
Y
 
Y
I
 
D
F
 
F
Y
 
F
I
 
L
D
 
D
Y
 
L
E
 
E
T
 
Y
P
 
P
-
 
T
E
 
E
N
 
N
E
 
N
K
 
K
E
 
E
L
 
V
I
 
E
N
 
K
S
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
D

Sites not aligning to the query:

5jk5A Phenylalanine hydroxylase from dictyostelium - bh2 complex
49% identity, 20% coverage: 205:260/278 of query aligns to 16:72/400 of 5jk5A

query
sites
5jk5A
N
 
D
K
 
K
P
 
I
G
 
G
A
 
G
L
 
L
Y
 
L
N
 
E
I
 
Y
L
 
L
K
 
E
E
 
I
F
 
I
N
 
K
K
 
K
K
 
H
N
 
N
I
 
I
N
 
N
L
 
I
T
 
T
R
 
R
I
 
I
E
 
E
S
 
S
R
 
R
P
 
P
S
 
S
K
 
K
T
 
T
K
 
E
L
 
K
G
 
K
S
 
D
Y
 
Y
I
 
D
F
 
F
Y
 
F
I
 
L
D
 
D
Y
 
L
E
 
E
T
 
Y
P
 
P
-
 
T
E
 
E
N
 
N
E
 
N
K
 
K
E
 
E
L
 
V
I
 
E
N
 
K
S
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
D

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011973217.1 NCBI__GCF_000017185.1:WP_011973217.1
MIYCLGPKGSYTEEAAEIFSKIIKDKNIEYCNSIYEVFERVEQGNNNCYGVVPSENSIEG
SVSLTMDLLLEFPVKILGEVDININHCLIGYSKDKIKKILAHPQALAQCRKYIKKHDWET
ESVLSNSMAVKKVYDMKNEELGAIASKKAGKLYNLNILDTNIQDYPNNTTRFILIGKDCE
DSNDISFTNNDTTKKSTIIIELIGNKPGALYNILKEFNKKNINLTRIESRPSKTKLGSYI
FYIDYETPENEKELINSLKNYVSNIKYLGSSNIFSKFL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory