SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011974077.1 NCBI__GCF_000017185.1:WP_011974077.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q57658 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase; ASA dehydrogenase; ASADH; Aspartate-beta-semialdehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.11 from Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440) (Methanococcus jannaschii) (see paper)
76% identity, 100% coverage: 2:349/349 of query aligns to 9:354/354 of Q57658

query
sites
Q57658
I
 
I
K
 
K
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
|
T
G
|
G
N
x
S
V
|
V
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
M
 
V
Q
 
Q
M
 
L
L
 
L
E
 
A
N
 
D
H
 
H
P
 
P
I
 
M
F
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
T
V
 
A
L
 
L
G
 
A
A
 
A
S
|
S
S
x
E
R
|
R
S
|
S
A
 
A
G
 
G
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
A
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
C
Y
 
Y
W
 
W
Y
 
F
Q
 
Q
T
 
D
E
 
R
P
 
D
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
N
Y
 
I
A
 
K
N
 
D
K
 
M
M
 
V
V
 
V
Q
 
I
T
 
P
T
 
T
D
 
D
P
 
P
T
 
K
D
 
H
K
 
E
A
 
E
Y
 
F
E
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
V
F
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
P
 
P
S
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
F
E
 
E
P
 
P
E
 
E
F
 
F
A
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
I
F
 
F
S
 
S
N
 
N
A
 
A
S
 
S
A
 
A
M
 
Y
R
 
R
M
 
M
E
 
E
N
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
N
Y
 
A
D
 
D
H
 
H
F
 
L
E
 
E
M
 
L
L
 
I
D
 
E
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
N
 
K
R
 
R
N
 
G
Y
 
W
D
 
D
G
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
T
N
 
N
P
 
P
N
 
N
C
 
C
S
 
S
T
 
T
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
L
 
L
K
 
K
P
 
P
I
 
I
M
 
M
D
 
D
K
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
L
D
 
E
L
 
A
V
 
V
N
 
F
I
 
I
T
 
A
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
S
|
S
G
|
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
G
 
G
V
 
V
P
 
P
S
 
S
M
 
M
A
 
A
I
 
I
I
 
L
D
 
D
N
 
N
L
 
L
V
 
I
P
 
P
Y
 
F
I
 
I
G
 
K
S
 
N
E
 
E
E
 
E
E
 
E
K
 
K
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
S
 
S
L
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
T
I
 
L
D
 
-
K
 
-
E
 
K
N
 
D
N
 
G
K
 
K
F
 
V
T
 
E
D
 
L
A
 
A
N
 
N
F
 
F
K
 
K
I
 
I
G
 
S
V
 
A
S
 
S
C
 
C
N
 
N
R
 
R
V
 
V
S
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
G
 
G
H
 
H
T
 
T
E
 
E
S
 
S
I
 
I
F
 
F
V
 
V
K
 
K
T
 
T
T
 
K
E
 
E
E
 
G
A
 
A
T
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
K
K
 
E
V
 
V
M
 
M
D
 
D
K
 
K
F
 
F
D
 
D
P
 
P
L
 
L
K
 
K
E
 
D
Y
 
L
N
 
N
L
 
L
P
 
P
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
P
 
P
I
 
I
V
 
V
I
 
I
R
 
R
E
 
E
E
 
E
M
 
I
D
 
D
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
D
R
 
R
D
 
N
A
 
E
G
 
G
N
 
N
G
 
G
M
 
M
S
 
S
I
 
I
S
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
E
 
K
D
 
D
P
 
P
V
 
I
F
 
F
G
 
D
I
 
V
K
 
K
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
H
 
H
N
|
N
T
|
T
I
 
I
R
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
E
 
E
L
 
Y
Y
 
F
V
 
V
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
L
 
I

1ys4A Structure of aspartate-semialdehyde dehydrogenase from methanococcus jannaschii (see paper)
76% identity, 100% coverage: 2:349/349 of query aligns to 3:348/348 of 1ys4A

query
sites
1ys4A
I
 
I
K
 
K
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
|
G
A
 
A
T
|
T
G
|
G
N
x
S
V
|
V
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
M
 
V
Q
 
Q
M
 
L
L
 
L
E
 
A
N
 
D
H
 
H
P
 
P
I
 
M
F
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
T
V
 
A
L
 
L
G
 
A
A
|
A
S
|
S
S
 
E
R
 
R
S
|
S
A
 
A
G
 
G
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
A
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
C
Y
 
Y
W
 
W
Y
 
F
Q
 
Q
T
 
D
E
 
R
P
 
D
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
N
Y
 
I
A
 
K
N
 
D
K
 
M
M
 
V
V
 
V
Q
 
I
T
 
P
T
 
T
D
 
D
P
 
P
T
 
K
D
 
H
K
 
E
A
 
E
Y
 
F
E
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
V
F
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
P
 
P
S
 
S
D
 
D
L
|
L
A
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
F
E
 
E
P
 
P
E
 
E
F
 
F
A
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
I
F
 
F
S
 
S
N
|
N
A
 
A
S
 
S
A
 
A
M
 
Y
R
 
R
M
 
M
E
 
E
N
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
N
Y
 
A
D
 
D
H
 
H
F
 
L
E
 
E
M
 
L
L
 
I
D
 
E
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
N
 
K
R
 
R
N
 
G
Y
 
W
D
 
D
G
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
T
N
 
N
P
 
P
N
 
N
C
 
C
S
 
S
T
 
T
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
L
 
L
K
 
K
P
 
P
I
 
I
M
 
M
D
 
D
K
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
L
D
 
E
L
 
A
V
 
V
N
 
F
I
 
I
T
 
A
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
Y
 
Y
N
 
N
G
 
G
V
 
V
P
 
P
S
 
S
M
 
M
A
 
A
I
 
I
I
 
L
D
 
D
N
 
N
L
 
L
V
 
I
P
 
P
Y
 
F
I
 
I
G
 
K
S
 
N
E
 
E
E
 
E
E
 
E
K
 
K
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
S
 
S
L
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
T
I
 
L
D
 
-
K
 
-
E
 
K
N
 
D
N
 
G
K
 
K
F
 
V
T
 
E
D
 
L
A
 
A
N
 
N
F
 
F
K
 
K
I
 
I
G
 
S
V
 
A
S
 
S
C
 
C
N
 
N
R
 
R
V
 
V
S
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
G
 
G
H
 
H
T
 
T
E
 
E
S
 
S
I
 
I
F
 
F
V
 
V
K
 
K
T
 
T
T
 
K
E
 
E
E
 
G
A
 
A
T
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
K
K
 
E
V
 
V
M
 
M
D
 
D
K
 
K
F
 
F
D
 
D
P
 
P
L
 
L
K
 
K
E
 
D
Y
 
L
N
 
N
L
 
L
P
 
P
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
P
 
P
I
 
I
V
 
V
I
 
I
R
 
R
E
 
E
E
 
E
M
 
I
D
 
D
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
D
R
 
R
D
 
N
A
 
E
G
 
G
N
 
N
G
 
G
M
 
M
S
 
S
I
 
I
S
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
E
 
K
D
 
D
P
 
P
V
 
I
F
 
F
G
 
D
I
 
V
K
 
K
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
H
 
H
N
|
N
T
|
T
I
 
I
R
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
E
 
E
L
 
Y
Y
 
F
V
 
V
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
L
 
I

P78780 Probable aspartate-semialdehyde dehydrogenase; ASA dehydrogenase; ASADH; Aspartate-beta-semialdehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.11 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
47% identity, 99% coverage: 3:349/349 of query aligns to 5:356/357 of P78780

query
sites
P78780
K
 
K
V
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
T
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
M
 
I
Q
 
T
M
 
L
L
 
L
E
 
S
N
 
D
H
 
H
P
 
P
I
 
E
F
 
F
E
 
K
L
 
I
E
 
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
A
R
 
R
S
 
S
A
 
A
G
 
G
K
 
K
K
 
P
Y
 
Y
A
 
A
D
 
V
A
 
A
C
 
T
Y
 
K
W
 
W
Y
 
K
Q
 
Q
T
 
S
E
 
I
P
 
A
I
 
M
P
 
P
E
 
K
E
 
E
Y
 
I
A
 
S
N
 
Q
K
 
M
M
 
S
V
 
V
Q
 
K
T
 
A
T
 
C
D
 
D
P
 
P
T
 
-
D
 
-
K
 
K
A
 
E
Y
 
F
E
 
S
D
 
E
V
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
V
F
 
F
S
 
S
A
 
G
L
 
L
P
 
D
S
 
A
D
 
D
L
 
F
A
 
A
K
 
G
K
 
E
L
 
I
E
 
E
P
 
K
E
 
S
F
 
F
A
 
R
K
 
D
E
 
A
G
 
N
K
 
L
L
 
V
V
 
I
F
 
V
S
 
S
N
 
N
A
 
A
S
 
K
A
 
N
M
 
Y
R
 
R
M
 
R
E
 
E
N
 
P
D
 
T
V
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
V
I
 
V
P
 
P
E
 
T
V
 
V
N
 
N
Y
 
T
D
 
D
H
 
H
F
 
L
E
 
D
M
 
V
L
 
I
D
 
K
I
 
Y
Q
 
Q
R
 
R
E
 
Q
N
 
E
R
 
N
N
 
K
Y
 
L
D
 
D
-
 
R
G
 
G
A
 
C
I
 
I
I
 
I
T
 
T
N
 
N
P
 
S
N
 
N
C
 
C
S
 
S
T
 
T
I
 
A
C
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
P
L
 
L
K
 
K
P
 
A
I
 
L
M
 
Q
D
 
D
K
 
A
F
 
F
G
 
G
-
 
P
I
 
I
D
 
A
L
 
Q
V
 
T
N
 
N
I
 
V
T
 
V
T
 
S
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
N
 
P
G
 
G
V
 
V
P
 
S
S
 
S
M
 
L
A
 
D
I
 
I
I
 
L
D
 
D
N
 
N
L
 
I
V
 
V
P
 
P
Y
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
G
E
 
E
E
 
E
E
 
E
K
 
K
M
 
I
Q
 
E
T
 
W
E
 
E
S
 
T
L
 
R
K
 
K
L
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
S
I
 
V
D
 
N
K
 
S
E
 
T
N
 
I
N
 
S
K
 
G
F
 
Y
T
 
E
D
 
L
A
 
T
N
 
D
F
 
N
K
 
V
I
 
V
G
 
S
V
 
A
S
 
Q
C
 
C
N
 
N
R
 
R
V
 
V
S
 
P
V
 
V
I
 
I
D
 
D
G
 
G
H
 
H
T
 
L
E
 
M
S
 
C
I
 
I
F
 
S
V
 
V
K
 
K
T
 
F
T
 
A
E
 
K
E
 
T
A
 
S
-
 
P
T
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
K
 
R
K
 
E
V
 
V
M
 
L
D
 
A
K
 
N
F
 
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
P
D
 
Q
P
 
K
L
 
L
K
 
G
E
 
C
Y
 
Y
N
 
S
L
 
A
P
 
P
T
 
K
Y
 
Q
A
 
A
K
 
I
P
 
Y
I
 
V
V
 
F
I
 
D
R
 
D
E
 
S
E
 
T
M
 
P
D
 
D
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
D
R
 
R
D
 
N
A
 
N
G
 
E
N
 
N
G
 
G
M
 
Y
S
 
A
I
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
E
 
S
D
 
D
P
x
S
V
 
I
F
 
F
G
 
D
I
 
I
K
 
K
Y
 
F
T
 
V
A
 
S
L
 
L
E
 
V
H
 
H
N
 
N
T
 
T
I
 
V
R
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
G
V
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
A
E
 
E
L
 
V
Y
 
A
V
 
V
K
 
K
K
 
K
Y
 
G
L
 
L

4zicC Crystal structure of aspartate semialdehyde dehydrogenase with NADP from trichophyton rubrum (see paper)
43% identity, 99% coverage: 3:347/349 of query aligns to 3:354/357 of 4zicC

query
sites
4zicC
K
 
R
V
 
C
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
|
T
G
|
G
N
x
A
V
|
V
G
 
G
Q
 
T
R
 
R
F
 
F
M
 
I
Q
 
L
M
 
L
L
 
L
E
 
S
N
 
Q
H
 
H
P
 
P
I
 
L
F
 
L
E
 
E
L
 
L
E
 
V
V
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
A
S
|
S
S
 
D
R
 
R
S
 
S
A
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
A
 
R
D
 
D
A
 
A
C
 
V
Y
 
R
W
 
W
Y
 
K
Q
 
Q
T
 
S
E
 
A
P
 
P
I
 
M
P
 
P
E
 
A
E
 
K
Y
 
V
A
 
A
N
 
D
K
 
L
M
 
T
V
 
V
Q
 
R
T
 
C
T
 
C
D
 
D
P
 
P
T
 
A
D
 
E
K
 
-
A
 
-
Y
 
F
E
 
S
D
 
D
V
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
I
F
 
F
S
 
S
A
 
G
L
|
L
P
x
D
S
x
P
D
 
D
L
x
A
A
 
A
K
 
G
K
 
E
L
 
I
E
 
E
P
 
M
E
 
A
F
 
F
A
 
L
K
 
K
E
 
A
G
 
N
K
 
F
L
 
A
V
 
V
F
 
F
S
 
S
N
|
N
A
|
A
S
 
K
A
 
N
M
 
Y
R
 
R
M
 
L
E
 
D
N
 
P
D
 
M
V
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
V
I
 
V
P
 
P
E
 
L
V
 
V
N
 
N
Y
 
A
D
 
G
H
 
H
F
 
I
E
 
D
M
 
V
L
 
I
D
 
P
I
 
A
Q
 
Q
R
 
R
E
 
K
N
 
H
R
 
F
N
 
G
Y
 
L
D
 
D
-
 
K
G
 
G
A
 
M
I
 
L
I
 
V
T
 
C
N
 
N
P
 
S
N
 
N
C
|
C
S
 
A
T
 
V
I
 
V
C
 
G
A
 
L
V
 
V
I
 
V
T
 
P
L
 
A
K
 
K
P
 
A
I
 
L
M
 
I
D
 
Q
K
 
K
F
 
F
G
 
G
-
 
P
I
 
I
D
 
E
L
 
S
V
 
V
N
 
S
I
 
M
T
 
V
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
Y
 
Y
N
 
P
G
 
G
V
 
V
P
 
S
S
 
S
M
 
M
A
 
D
I
 
I
I
 
F
D
 
D
N
 
N
L
 
I
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
G
 
P
S
 
G
E
 
E
E
 
E
E
 
G
K
 
K
M
 
I
Q
 
S
T
 
S
E
 
E
S
 
A
L
 
R
K
 
K
L
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
D
I
 
L
D
 
N
K
 
S
E
 
D
N
 
L
N
 
A
K
 
G
F
 
F
T
 
S
D
 
D
A
 
Q
N
 
K
-
 
P
F
 
L
K
 
Q
I
 
I
G
 
S
V
 
V
S
 
A
C
 
C
N
 
N
R
 
R
V
 
V
S
 
P
V
 
V
I
 
L
D
 
D
G
 
G
H
 
H
T
 
T
E
 
V
S
 
C
I
 
A
F
 
S
V
 
L
K
 
R
T
 
F
T
 
V
E
 
N
E
 
R
A
 
P
T
 
P
P
 
P
-
 
T
-
 
A
E
 
S
E
 
Q
I
 
V
K
 
R
K
 
E
V
 
A
M
 
L
D
 
R
K
 
E
F
 
Y
D
 
K
P
 
P
-
 
E
L
 
V
K
 
Q
E
 
T
Y
 
L
N
 
G
L
 
C
P
 
P
T
 
S
Y
 
A
A
 
P
K
 
K
-
 
M
P
 
S
I
 
I
V
 
H
I
 
V
R
 
M
E
 
D
E
 
E
M
 
V
D
 
D
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
D
R
 
R
D
 
E
A
 
T
G
 
E
N
 
G
G
 
G
M
 
Y
S
 
A
I
 
C
S
 
T
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
-
 
D
-
 
S
P
 
D
V
 
V
F
 
F
G
 
D
I
 
I
K
 
Q
Y
 
F
T
 
V
A
 
A
L
 
L
E
 
S
H
 
H
N
 
N
T
 
T
I
 
V
R
 
L
G
 
G
A
|
A
A
 
S
G
 
G
A
 
S
S
 
S
V
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
A
E
 
E
L
 
S
Y
 
A
V
 
I
K
 
L
K
 
K

3hskA Crystal structure of aspartate semialdehyde dehydrogenase with NADP from candida albicans (see paper)
44% identity, 99% coverage: 3:349/349 of query aligns to 4:357/358 of 3hskA

query
sites
3hskA
K
 
K
V
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
|
G
A
 
A
T
|
T
G
|
G
N
 
S
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
M
 
I
Q
 
L
M
 
L
L
 
L
E
 
S
N
 
K
H
 
H
P
 
P
I
 
E
F
 
F
E
 
E
L
 
I
E
 
H
V
 
A
L
 
L
G
 
G
A
|
A
S
|
S
S
 
S
R
 
R
S
|
S
A
 
A
G
 
G
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
A
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
A
Y
 
S
W
 
W
Y
 
K
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
P
 
T
I
 
L
P
 
P
E
 
E
E
 
T
Y
 
E
A
 
Q
N
 
D
K
 
I
M
 
V
V
 
V
Q
 
Q
T
 
E
T
 
C
D
 
K
P
 
P
T
 
-
D
 
E
K
 
G
A
 
N
Y
 
F
E
 
L
D
 
E
V
 
C
D
 
D
I
 
V
V
 
V
F
 
F
S
 
S
A
 
G
L
 
L
P
x
D
S
 
A
D
 
D
L
x
V
A
 
A
K
 
G
K
 
D
L
 
I
E
 
E
P
 
K
E
 
S
F
 
F
A
 
V
K
 
E
E
 
A
G
 
G
K
 
L
L
 
A
V
 
V
F
 
V
S
 
S
N
 
N
A
 
A
S
 
K
A
 
N
M
 
Y
R
 
R
M
 
R
E
 
E
N
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
V
I
 
V
P
 
P
E
 
I
V
 
V
N
 
N
Y
 
P
D
 
E
H
 
H
F
 
I
E
 
D
M
 
V
L
 
V
D
 
E
I
 
N
Q
 
K
R
 
V
E
 
K
N
 
Q
R
 
A
N
 
V
Y
 
S
D
 
K
G
 
G
A
 
G
-
 
K
-
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
F
I
 
I
I
 
I
T
 
C
N
 
I
P
 
S
N
 
N
C
 
C
S
 
S
T
 
T
I
 
A
C
 
G
A
 
L
V
 
V
I
 
A
T
 
P
L
 
L
K
 
K
P
 
P
I
 
L
M
 
V
D
 
E
K
 
K
F
 
F
G
 
G
-
 
P
I
 
I
D
 
D
L
 
A
V
 
L
N
 
T
I
 
T
T
 
T
T
 
T
M
 
L
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
S
 
S
G
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
-
N
 
-
G
 
G
V
 
V
P
 
S
S
 
G
M
 
M
A
 
D
I
 
I
I
 
L
D
 
D
N
 
N
L
 
I
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
G
 
S
S
 
G
E
 
E
E
 
E
E
 
D
K
 
K
M
 
L
Q
 
E
T
 
W
E
 
E
S
 
T
L
 
K
K
 
K
L
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
G
I
 
V
D
 
N
K
 
A
E
 
E
N
 
G
N
 
T
K
 
E
F
 
F
T
 
V
-
 
P
-
 
I
-
 
P
D
 
E
A
 
S
N
 
E
F
 
M
K
 
K
I
 
V
G
 
S
V
 
A
S
 
Q
C
 
C
N
 
N
R
 
R
V
 
V
S
 
P
V
 
V
I
 
I
D
 
D
G
 
G
H
 
H
T
 
T
E
 
E
S
 
C
I
 
I
F
 
S
V
 
L
K
 
R
T
 
F
T
 
A
E
 
N
E
 
R
A
 
P
T
 
A
P
 
P
-
 
S
-
 
V
E
 
E
E
 
D
I
 
V
K
 
K
K
 
Q
V
 
C
M
 
L
D
 
R
K
 
E
F
 
Y
D
 
E
P
 
-
L
 
C
K
 
A
E
 
A
Y
 
S
N
 
K
L
 
L
P
 
G
T
 
C
Y
 
H
A
 
S
K
 
A
P
 
P
-
 
K
-
 
Q
-
 
T
I
 
I
V
 
H
I
 
V
R
 
L
E
 
D
E
 
Q
M
 
P
D
 
D
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
R
G
 
D
N
 
S
G
 
G
M
 
Y
S
 
G
I
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
P
 
S
V
 
L
F
 
L
G
 
D
I
 
F
K
 
K
Y
 
M
T
 
V
A
 
V
L
 
L
E
 
S
H
 
H
N
 
N
T
 
T
I
 
I
R
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
G
V
 
I
L
 
L
N
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
I
Y
 
L
V
 
K
K
 
A
K
 
K
Y
 
N
L
 
I

6c8wA Crystal structure of aspartate semialdehyde dehydrogenase with NADP from blastomyces dermatitidis (see paper)
44% identity, 99% coverage: 3:347/349 of query aligns to 4:354/357 of 6c8wA

query
sites
6c8wA
K
 
R
V
 
C
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
|
G
A
 
A
T
|
T
G
|
G
N
x
A
V
|
V
G
 
G
Q
 
T
R
 
R
F
 
F
M
 
I
Q
 
L
M
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
Q
H
 
S
P
 
P
I
 
L
F
 
L
E
 
E
L
 
L
E
 
V
V
 
A
L
 
V
G
 
G
A
|
A
S
|
S
S
 
E
R
 
R
S
|
S
A
 
A
G
 
G
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
A
 
R
D
 
D
A
 
A
C
 
V
Y
 
R
W
 
W
Y
 
K
Q
 
Q
T
 
A
E
 
S
P
 
P
I
 
M
P
 
P
E
 
A
E
 
S
Y
 
V
A
 
A
N
 
D
K
 
L
M
 
T
V
 
V
Q
 
R
T
 
R
T
 
C
D
 
A
P
 
P
T
 
S
D
 
E
K
 
-
A
 
-
Y
 
F
E
 
S
D
 
D
V
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
I
F
 
F
S
 
S
A
x
G
L
|
L
P
 
D
S
x
P
D
 
V
L
 
A
A
 
A
K
 
G
K
 
D
L
 
I
E
 
E
P
 
M
E
 
A
F
 
F
A
 
L
K
 
K
E
 
A
G
 
N
K
 
F
L
 
A
V
 
V
F
 
F
S
 
S
N
|
N
A
 
A
S
 
K
A
 
N
M
 
Y
R
 
R
M
 
L
E
 
D
N
 
P
D
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
V
I
 
V
P
 
P
E
 
L
V
 
V
N
 
N
Y
 
A
D
 
G
H
 
H
F
 
I
E
 
D
M
 
V
L
 
I
D
 
P
I
 
A
Q
 
Q
R
 
R
E
 
K
N
 
H
R
 
Y
N
 
G
Y
 
L
D
 
D
-
 
K
G
 
G
A
 
L
I
 
I
I
 
V
T
 
C
N
 
N
P
 
S
N
 
N
C
|
C
S
 
A
T
 
V
I
 
V
C
 
G
A
 
L
V
 
V
I
 
I
T
 
P
L
 
A
K
 
K
P
 
A
I
 
L
M
 
I
D
 
Q
K
 
K
F
 
F
G
 
G
-
 
P
I
 
I
D
 
E
L
 
S
V
 
V
N
 
S
I
 
M
T
 
V
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
Y
 
-
N
 
P
G
 
G
V
 
V
P
 
S
S
 
S
M
 
M
A
 
D
I
 
I
I
 
F
D
 
D
N
 
N
L
 
I
V
 
V
P
 
P
Y
 
F
I
 
I
G
 
P
S
 
G
E
 
E
E
 
E
E
 
G
K
 
K
M
 
I
Q
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
S
L
 
R
K
 
K
L
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
N
I
 
L
D
 
N
K
 
P
E
 
D
N
 
L
N
 
A
K
 
G
F
 
F
T
 
S
D
 
D
A
 
Q
N
 
Q
-
 
P
F
 
L
K
 
Q
I
 
V
G
 
S
V
 
V
S
 
A
C
 
C
N
 
N
R
 
R
V
 
V
S
 
P
V
 
V
I
 
L
D
 
D
G
 
G
H
 
H
T
 
T
E
 
V
S
 
C
I
 
A
F
 
S
V
 
L
K
 
R
T
 
F
T
 
V
E
 
N
E
 
R
A
 
P
T
 
A
P
 
P
E
 
T
E
 
A
I
 
-
K
 
S
K
 
Q
V
 
V
M
 
R
D
 
D
K
 
A
F
 
-
D
 
-
P
 
-
L
 
L
K
 
R
E
 
E
Y
 
Y
-
 
K
-
 
S
-
 
E
-
 
V
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
N
 
G
L
 
C
P
 
P
T
 
S
Y
 
A
A
 
P
K
 
R
-
 
Q
P
 
A
I
 
I
V
 
H
I
 
V
R
 
L
E
 
D
E
 
D
M
 
V
D
 
D
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
T
G
 
E
N
 
A
G
 
G
M
 
Y
S
 
A
I
 
C
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
-
 
D
-
 
S
P
 
G
V
 
V
F
 
F
G
 
D
I
 
I
K
 
Q
Y
 
F
T
 
V
A
 
A
L
 
L
E
 
S
H
 
H
N
|
N
T
 
T
I
 
V
R
 
L
G
 
G
A
|
A
A
 
S
G
 
G
A
 
S
S
 
S
V
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
A
E
 
E
L
 
S
Y
 
A
V
 
I
K
 
L
K
 
K

6c85A Crystal structure of aspartate semialdehyde dehydrogenase from blastomyces dermatitidis with p-benzoquinone (see paper)
44% identity, 99% coverage: 3:347/349 of query aligns to 4:351/354 of 6c85A

query
sites
6c85A
K
 
R
V
 
C
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
A
V
 
V
G
 
G
Q
 
T
R
 
R
F
 
F
M
 
I
Q
 
L
M
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
Q
H
 
S
P
 
P
I
 
L
F
 
L
E
 
E
L
 
L
E
 
V
V
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
E
R
 
R
S
 
S
A
 
A
G
 
G
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
A
 
R
D
 
D
A
 
A
C
 
V
Y
 
R
W
 
W
Y
 
K
Q
 
Q
T
 
A
E
 
S
P
 
P
I
 
M
P
 
P
E
 
A
E
 
S
Y
 
V
A
 
A
N
 
D
K
 
L
M
 
T
V
 
V
Q
 
R
T
 
R
T
 
C
D
 
A
P
 
P
T
 
S
D
 
E
K
 
-
A
 
-
Y
 
F
E
 
S
D
 
D
V
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
I
F
 
F
S
 
S
A
 
G
L
 
L
P
 
-
S
 
-
D
 
D
L
 
P
A
 
A
K
 
G
K
 
D
L
 
I
E
 
E
P
 
M
E
 
A
F
 
F
A
 
L
K
 
K
E
 
A
G
 
N
K
 
F
L
 
A
V
 
V
F
 
F
S
 
S
N
 
N
A
 
A
S
 
K
A
 
N
M
 
Y
R
|
R
M
 
L
E
 
D
N
 
P
D
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
V
I
 
V
P
 
P
E
 
L
V
 
V
N
 
N
Y
 
A
D
 
G
H
 
H
F
 
I
E
 
D
M
 
V
L
 
I
D
 
P
I
 
A
Q
 
Q
R
 
R
E
 
K
N
 
H
R
 
Y
N
 
G
Y
 
L
D
 
D
-
 
K
G
 
G
A
 
L
I
 
I
I
 
V
T
 
C
N
 
N
P
 
S
N
|
N
C
|
C
S
 
A
T
 
V
I
 
V
C
 
G
A
 
L
V
 
V
I
 
I
T
 
P
L
 
A
K
 
K
P
 
A
I
 
L
M
 
I
D
 
Q
K
 
K
F
 
F
G
 
G
-
 
P
I
 
I
D
 
E
L
 
S
V
 
V
N
 
S
I
 
M
T
 
V
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
-
N
 
-
G
 
G
V
 
V
P
 
S
S
 
S
M
 
M
A
 
D
I
 
I
I
 
F
D
 
D
N
 
N
L
 
I
V
 
V
P
 
P
Y
 
F
I
 
I
G
 
P
S
 
G
E
 
E
E
 
E
E
 
G
K
 
K
M
 
I
Q
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
S
L
 
R
K
 
K
L
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
N
I
 
L
D
 
N
K
 
P
E
 
D
N
 
L
N
 
A
K
 
G
F
 
F
T
 
S
D
 
D
A
 
Q
N
 
Q
-
 
P
F
 
L
K
 
Q
I
 
V
G
 
S
V
 
V
S
 
A
C
 
C
N
 
N
R
 
R
V
 
V
S
 
P
V
 
V
I
 
L
D
 
D
G
 
G
H
 
H
T
 
T
E
 
V
S
 
C
I
 
A
F
 
S
V
 
L
K
 
R
T
 
F
T
 
V
E
 
N
E
 
R
A
 
P
T
 
A
P
 
P
E
 
T
E
 
A
I
 
S
K
 
Q
K
 
-
V
 
-
M
 
-
D
 
-
K
 
V
F
 
R
D
 
D
P
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
E
Y
 
Y
-
 
K
-
 
S
-
 
E
-
 
V
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
N
 
G
L
 
C
P
 
P
T
 
S
Y
 
A
A
 
P
K
 
R
-
 
Q
P
 
A
I
 
I
V
 
H
I
 
V
R
 
L
E
 
D
E
 
D
M
 
V
D
 
D
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
T
G
 
E
N
 
A
G
 
G
M
 
Y
S
 
A
I
 
C
S
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
-
 
D
-
 
S
P
 
G
V
 
V
F
 
F
G
 
D
I
 
I
K
 
Q
Y
 
F
T
 
V
A
 
A
L
 
L
E
 
S
H
 
H
N
 
N
T
 
T
I
 
V
R
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
S
S
 
S
V
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
A
E
 
E
L
 
S
Y
 
A
V
 
I
K
 
L
K
 
K

4dpmA Structure of malonyl-coenzyme a reductase from crenarchaeota in complex with coa (see paper)
38% identity, 99% coverage: 2:347/349 of query aligns to 3:349/354 of 4dpmA

query
sites
4dpmA
I
 
L
K
 
K
V
 
A
G
 
A
V
 
I
L
 
L
G
|
G
A
 
A
T
|
T
G
|
G
N
x
L
V
 
V
G
 
G
Q
 
I
R
 
E
F
 
Y
M
 
V
Q
 
R
M
 
M
L
 
L
E
 
S
N
 
N
H
 
H
P
 
P
I
 
Y
F
 
I
E
 
K
L
 
P
E
 
A
V
 
Y
L
 
L
G
 
-
A
 
A
S
x
G
S
x
K
R
x
G
S
|
S
A
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
P
Y
 
Y
A
 
G
D
 
E
A
 
V
C
 
V
Y
 
R
W
 
W
Y
 
Q
Q
 
T
T
 
V
E
 
G
P
 
Q
I
 
V
P
 
P
E
 
K
E
 
E
Y
 
I
A
 
A
N
 
D
K
 
M
M
 
E
V
 
I
Q
 
K
T
 
P
T
 
T
D
 
D
P
 
P
T
 
-
D
 
-
K
 
K
A
 
L
Y
 
M
E
 
D
D
 
D
V
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
I
F
 
F
S
 
S
A
 
P
L
|
L
P
 
P
S
 
Q
D
 
G
L
 
A
A
 
A
K
 
G
K
 
P
L
 
V
E
 
E
P
 
E
E
 
Q
F
 
F
A
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
F
L
 
P
V
 
V
F
 
I
S
 
S
N
|
N
A
 
S
S
 
P
A
 
D
M
 
H
R
 
R
M
 
F
E
 
D
N
 
P
D
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
L
I
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
L
N
 
N
Y
 
P
D
 
H
H
 
T
F
 
I
E
 
S
M
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
E
Q
 
Q
R
 
R
E
 
K
N
 
R
R
 
R
N
 
E
Y
 
W
D
 
K
G
 
G
A
 
F
I
 
I
I
 
V
T
 
T
N
 
T
P
 
P
N
 
L
C
|
C
S
 
T
T
 
A
I
 
Q
C
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
I
T
 
P
L
 
L
K
 
G
P
 
A
I
 
I
M
 
F
D
 
K
K
 
D
F
 
Y
G
 
K
I
 
M
D
 
D
L
 
G
V
 
A
N
 
F
I
 
I
T
 
T
T
 
T
M
 
I
Q
 
Q
A
 
S
I
 
L
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
Y
|
Y
N
 
P
G
 
G
V
 
I
P
 
P
S
 
S
M
 
L
A
 
D
I
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
I
V
 
L
P
 
P
Y
 
L
I
 
G
G
 
D
S
 
G
E
 
Y
E
 
D
E
 
A
K
 
K
M
 
T
Q
 
I
T
 
K
E
 
E
S
 
I
L
 
F
K
 
R
L
 
I
L
 
L
G
 
S
A
 
E
I
 
V
D
 
K
K
 
R
E
 
N
N
 
V
N
 
D
K
 
E
F
 
P
T
 
K
D
 
L
A
 
E
N
 
D
F
 
V
K
 
S
I
 
L
G
 
A
V
 
A
S
 
T
C
 
T
N
 
H
R
 
R
V
 
I
S
 
A
V
 
T
I
 
I
D
 
H
G
 
G
H
 
H
T
 
Y
E
 
E
S
 
V
I
 
L
F
 
Y
V
 
V
K
 
S
T
 
F
T
 
K
E
 
E
E
 
E
A
 
T
T
 
A
P
 
A
E
 
E
E
 
K
I
 
V
K
 
K
K
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
E
K
 
N
F
 
F
-
 
R
-
 
G
D
 
E
P
 
P
L
 
-
K
 
Q
E
 
D
Y
 
L
N
 
K
L
 
L
P
 
P
T
 
T
Y
 
A
-
 
P
A
 
S
K
 
K
P
 
P
I
 
I
V
 
I
I
 
V
R
 
M
E
 
N
E
 
E
M
 
D
D
 
T
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
P
 
V
R
 
Y
L
 
F
D
 
D
R
 
R
D
 
W
A
 
A
G
 
G
N
 
D
-
 
I
-
 
P
G
 
G
M
 
M
S
 
S
I
 
V
S
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
K
E
 
Q
D
 
V
P
 
N
V
 
K
F
 
R
G
 
M
I
 
I
K
 
R
Y
 
L
T
 
V
A
 
S
L
 
L
E
 
I
H
 
H
N
|
N
T
 
T
I
 
V
R
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
G
S
 
G
V
 
I
L
 
L
N
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
Y
 
L
V
 
V
K
 
E
K
 
K

4dplA Structure of malonyl-coenzyme a reductase from crenarchaeota in complex with NADP (see paper)
38% identity, 99% coverage: 2:347/349 of query aligns to 3:349/354 of 4dplA

query
sites
4dplA
I
 
L
K
 
K
V
 
A
G
 
A
V
 
I
L
 
L
G
|
G
A
 
A
T
 
T
G
|
G
N
x
L
V
|
V
G
 
G
Q
 
I
R
 
E
F
 
Y
M
 
V
Q
 
R
M
 
M
L
 
L
E
 
S
N
 
N
H
 
H
P
 
P
I
 
Y
F
 
I
E
 
K
L
 
P
E
 
A
V
 
Y
L
 
L
G
 
-
A
 
A
S
 
G
S
x
K
R
x
G
S
|
S
A
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
P
Y
 
Y
A
 
G
D
 
E
A
 
V
C
 
V
Y
 
R
W
 
W
Y
 
Q
Q
 
T
T
 
V
E
 
G
P
 
Q
I
 
V
P
 
P
E
 
K
E
 
E
Y
 
I
A
 
A
N
 
D
K
 
M
M
 
E
V
 
I
Q
 
K
T
 
P
T
 
T
D
 
D
P
 
P
T
 
-
D
 
-
K
 
K
A
 
L
Y
 
M
E
 
D
D
 
D
V
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
I
F
 
F
S
 
S
A
x
P
L
|
L
P
|
P
S
 
Q
D
 
G
L
 
A
A
 
A
K
 
G
K
 
P
L
 
V
E
 
E
P
 
E
E
 
Q
F
 
F
A
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
F
L
 
P
V
 
V
F
 
I
S
 
S
N
|
N
A
 
S
S
 
P
A
 
D
M
 
H
R
 
R
M
 
F
E
 
D
N
 
P
D
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
L
I
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
L
N
 
N
Y
 
P
D
 
H
H
 
T
F
 
I
E
 
S
M
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
E
Q
 
Q
R
 
R
E
 
K
N
 
R
R
 
R
N
 
E
Y
 
W
D
 
K
G
 
G
A
 
F
I
 
I
I
 
V
T
 
T
N
 
T
P
 
P
N
 
L
C
|
C
S
 
T
T
 
A
I
 
Q
C
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
I
T
 
P
L
 
L
K
 
G
P
 
A
I
 
I
M
 
F
D
 
K
K
 
D
F
 
Y
G
 
K
I
 
M
D
 
D
L
 
G
V
 
A
N
 
F
I
 
I
T
 
T
T
 
T
M
 
I
Q
 
Q
A
 
S
I
 
L
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
Y
|
Y
N
 
P
G
 
G
V
 
I
P
 
P
S
 
S
M
 
L
A
 
D
I
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
I
V
 
L
P
 
P
Y
 
L
I
 
G
G
 
D
S
 
G
E
 
Y
E
 
D
E
 
A
K
 
K
M
 
T
Q
 
I
T
 
K
E
 
E
S
 
I
L
 
F
K
 
R
L
 
I
L
 
L
G
 
S
A
 
E
I
 
V
D
 
K
K
 
R
E
 
N
N
 
V
N
 
D
K
 
E
F
 
P
T
 
K
D
 
L
A
 
E
N
 
D
F
 
V
K
 
S
I
 
L
G
 
A
V
 
A
S
 
T
C
 
T
N
 
H
R
 
R
V
 
I
S
 
A
V
 
T
I
 
I
D
 
H
G
 
G
H
 
H
T
 
Y
E
 
E
S
 
V
I
 
L
F
 
Y
V
 
V
K
 
S
T
 
F
T
 
K
E
 
E
E
 
E
A
 
T
T
 
A
P
 
A
E
 
E
E
 
K
I
 
V
K
 
K
K
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
E
K
 
N
F
 
F
-
 
R
-
 
G
D
 
E
P
 
P
L
 
-
K
 
Q
E
 
D
Y
 
L
N
 
K
L
 
L
P
 
P
T
 
T
Y
 
A
-
 
P
A
 
S
K
 
K
P
 
P
I
 
I
V
 
I
I
 
V
R
 
M
E
 
N
E
 
E
M
 
D
D
 
T
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
P
 
V
R
 
Y
L
 
F
D
 
D
R
 
R
D
 
W
A
 
A
G
 
G
N
 
D
-
 
I
-
 
P
G
 
G
M
 
M
S
 
S
I
 
V
S
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
K
E
 
Q
D
 
V
P
 
N
V
 
K
F
 
R
G
 
M
I
 
I
K
 
R
Y
 
L
T
 
V
A
 
S
L
 
L
E
 
I
H
 
H
N
|
N
T
|
T
I
 
V
R
 
R
G
 
G
A
|
A
A
 
A
G
 
G
A
 
G
S
 
G
V
 
I
L
 
L
N
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
Y
 
L
V
 
V
K
 
E
K
 
K

4dpkA Structure of malonyl-coenzyme a reductase from crenarchaeota (see paper)
38% identity, 99% coverage: 2:347/349 of query aligns to 3:349/354 of 4dpkA

query
sites
4dpkA
I
 
L
K
 
K
V
 
A
G
 
A
V
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
|
T
G
|
G
N
x
L
V
 
V
G
 
G
Q
 
I
R
 
E
F
 
Y
M
 
V
Q
 
R
M
 
M
L
 
L
E
 
S
N
 
N
H
 
H
P
 
P
I
 
Y
F
 
I
E
 
K
L
 
P
E
 
A
V
 
Y
L
 
L
G
 
-
A
 
A
S
x
G
S
x
K
R
x
G
S
|
S
A
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
P
Y
 
Y
A
 
G
D
 
E
A
 
V
C
 
V
Y
 
R
W
 
W
Y
 
Q
Q
 
T
T
 
V
E
 
G
P
 
Q
I
 
V
P
 
P
E
 
K
E
 
E
Y
 
I
A
 
A
N
 
D
K
 
M
M
 
E
V
 
I
Q
 
K
T
 
P
T
 
T
D
 
D
P
 
P
T
 
-
D
 
-
K
 
K
A
 
L
Y
 
M
E
 
D
D
 
D
V
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
I
F
 
F
S
 
S
A
 
P
L
 
L
P
 
P
S
 
Q
D
 
G
L
 
A
A
 
A
K
 
G
K
 
P
L
 
V
E
 
E
P
 
E
E
 
Q
F
 
F
A
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
F
L
 
P
V
 
V
F
 
I
S
 
S
N
 
N
A
 
S
S
 
P
A
 
D
M
 
H
R
 
R
M
 
F
E
 
D
N
 
P
D
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
L
I
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
L
N
 
N
Y
 
P
D
 
H
H
 
T
F
 
I
E
 
S
M
 
L
L
 
I
D
 
D
I
 
E
Q
 
Q
R
 
R
E
 
K
N
 
R
R
 
R
N
 
E
Y
 
W
D
 
K
G
 
G
A
 
F
I
 
I
I
 
V
T
 
T
N
 
T
P
 
P
N
 
L
C
|
C
S
x
T
T
 
A
I
 
Q
C
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
I
T
 
P
L
 
L
K
 
G
P
 
A
I
 
I
M
 
F
D
 
K
K
 
D
F
 
Y
G
 
K
I
 
M
D
 
D
L
 
G
V
 
A
N
 
F
I
 
I
T
 
T
T
 
T
M
 
I
Q
 
Q
A
 
S
I
 
L
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
Y
|
Y
N
 
P
G
 
G
V
 
I
P
 
P
S
 
S
M
 
L
A
 
D
I
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
I
V
 
L
P
 
P
Y
 
L
I
 
G
G
 
D
S
 
G
E
x
Y
E
 
D
E
 
A
K
 
K
M
 
T
Q
 
I
T
 
K
E
 
E
S
 
I
L
 
F
K
 
R
L
 
I
L
 
L
G
 
S
A
 
E
I
 
V
D
 
K
K
 
R
E
 
N
N
 
V
N
 
D
K
 
E
F
 
P
T
 
K
D
 
L
A
 
E
N
 
D
F
 
V
K
 
S
I
 
L
G
 
A
V
 
A
S
 
T
C
 
T
N
 
H
R
|
R
V
 
I
S
 
A
V
 
T
I
 
I
D
 
H
G
 
G
H
|
H
T
 
Y
E
 
E
S
 
V
I
 
L
F
 
Y
V
 
V
K
 
S
T
 
F
T
 
K
E
 
E
E
 
E
A
 
T
T
 
A
P
 
A
E
 
E
E
 
K
I
 
V
K
 
K
K
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
E
K
 
N
F
 
F
-
 
R
-
 
G
D
 
E
P
 
P
L
 
-
K
 
Q
E
 
D
Y
 
L
N
 
K
L
 
L
P
 
P
T
 
T
Y
 
A
-
 
P
A
 
S
K
 
K
P
 
P
I
 
I
V
 
I
I
 
V
R
 
M
E
 
N
E
 
E
M
 
D
D
 
T
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
P
 
V
R
 
Y
L
 
F
D
 
D
R
 
R
D
 
W
A
 
A
G
 
G
N
 
D
-
 
I
-
 
P
G
 
G
M
 
M
S
 
S
I
 
V
S
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
K
E
 
Q
D
 
V
P
 
N
V
 
K
F
 
R
G
 
M
I
 
I
K
 
R
Y
 
L
T
 
V
A
 
S
L
 
L
E
 
I
H
 
H
N
 
N
T
 
T
I
 
V
R
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
G
S
 
G
V
 
I
L
 
L
N
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
Y
 
L
V
 
V
K
 
E
K
 
K

2r00C Crystal structure of aspartate semialdehyde dehydrogenase ii complexed with asa from vibrio cholerae (see paper)
30% identity, 99% coverage: 4:349/349 of query aligns to 6:336/336 of 2r00C

query
sites
2r00C
V
 
V
G
 
A
V
 
I
L
 
F
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
A
V
|
V
G
 
G
Q
 
E
R
 
T
F
 
M
M
 
L
Q
 
E
M
 
V
L
 
L
E
 
Q
N
 
E
H
 
R
-
 
E
-
 
F
P
 
P
I
 
V
F
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
F
V
 
L
L
 
L
G
 
-
A
 
A
S
 
S
S
 
E
R
 
R
S
 
S
A
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
T
Y
 
Y
A
 
-
D
 
-
A
 
-
C
 
-
Y
 
-
W
 
-
Y
 
-
Q
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
-
E
 
R
Y
 
F
A
 
N
N
 
G
K
 
K
M
 
T
V
 
V
Q
 
R
T
 
V
T
 
Q
D
 
N
P
 
V
T
 
E
D
 
E
K
 
F
A
 
D
Y
 
W
E
 
S
D
 
Q
V
 
V
D
 
H
I
 
I
V
 
A
F
 
L
S
 
F
A
 
S
L
 
A
P
 
G
S
 
G
D
 
E
L
 
L
A
 
S
K
 
A
K
 
K
L
 
W
E
 
A
P
 
P
E
 
I
F
 
A
A
 
A
K
 
E
E
 
A
G
 
G
K
 
V
L
 
V
V
 
V
F
 
I
S
 
D
N
|
N
A
 
T
S
 
S
A
 
H
M
 
F
R
 
R
M
 
Y
E
 
D
N
 
Y
D
 
D
V
 
I
P
 
P
L
 
L
M
 
V
I
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
N
Y
 
P
D
 
E
H
 
A
F
 
I
E
 
A
M
 
-
L
 
-
D
 
-
I
 
-
Q
 
E
R
 
F
E
 
R
N
 
N
R
 
R
N
 
N
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
I
I
 
I
T
 
A
N
 
N
P
 
P
N
 
N
C
|
C
S
 
S
T
 
T
I
 
I
C
 
Q
A
 
M
V
 
L
I
 
V
T
 
A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
I
 
I
M
 
Y
D
 
D
K
 
A
F
 
V
G
 
G
I
 
I
D
 
E
L
 
R
V
 
I
N
 
N
I
 
V
T
 
T
T
 
T
M
 
Y
Q
|
Q
A
 
S
I
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
K
N
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
D
S
 
E
M
 
L
A
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
 
T
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
Y
-
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
T
-
 
N
-
 
T
-
 
F
-
 
S
-
 
Q
-
 
Q
I
 
I
I
 
A
D
 
F
N
 
N
L
 
C
V
 
I
P
 
P
Y
 
Q
I
 
I
G
 
D
S
 
Q
-
 
F
-
 
M
-
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
K
E
 
E
E
 
E
E
 
M
K
 
K
M
 
M
Q
 
V
T
 
W
E
 
E
S
 
T
L
 
Q
K
 
K
L
 
I
L
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
D
 
-
K
 
-
E
 
-
N
 
-
N
 
-
K
 
-
F
 
F
T
 
N
D
 
D
A
 
P
N
 
S
F
 
I
K
 
M
I
 
V
G
 
N
V
 
P
S
 
T
C
 
C
N
 
V
R
|
R
V
 
V
S
 
P
V
 
V
I
 
F
D
 
Y
G
 
G
H
|
H
T
 
A
E
 
E
S
 
A
I
 
V
F
 
H
V
 
V
K
 
E
T
 
T
T
 
R
E
 
A
E
 
P
A
 
I
T
 
D
P
 
A
E
 
E
E
 
Q
I
 
V
K
 
M
K
 
D
V
 
M
M
 
L
D
 
E
K
 
Q
F
 
T
D
 
D
P
 
G
L
 
I
K
 
E
E
 
L
Y
 
F
N
 
R
L
 
G
P
 
A
T
 
D
Y
 
F
A
 
-
K
 
-
P
 
-
I
 
-
V
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
M
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
-
Q
 
-
P
 
P
R
 
T
L
 
Q
D
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
N
 
G
G
 
K
M
 
D
S
 
H
I
 
V
S
 
L
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
V
R
 
R
E
 
N
D
 
D
P
 
I
V
 
S
F
 
H
-
 
H
-
 
S
G
 
G
I
 
I
K
 
N
Y
 
L
T
 
W
A
 
V
L
 
V
E
 
A
H
 
D
N
|
N
T
 
V
I
 
R
R
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
N
S
 
A
V
 
V
L
 
Q
N
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
L
Y
 
L
V
 
V
K
 
R
K
 
D
Y
 
Y
L
 
F

P23247 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase 2; ASA dehydrogenase 2; ASADH 2; Aspartate-beta-semialdehyde dehydrogenase 2; EC 1.2.1.11 from Vibrio cholerae serotype O1 (strain ATCC 39315 / El Tor Inaba N16961) (see paper)
30% identity, 99% coverage: 4:349/349 of query aligns to 7:337/337 of P23247

query
sites
P23247
V
 
V
G
 
A
V
 
I
L
 
F
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
A
V
 
V
G
 
G
Q
 
E
R
 
T
F
 
M
M
 
L
Q
 
E
M
 
V
L
 
L
E
 
Q
N
 
E
H
 
R
-
 
E
-
 
F
P
 
P
I
 
V
F
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
F
V
 
L
L
 
L
G
 
-
A
 
A
S
 
S
S
 
E
R
 
R
S
 
S
A
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
T
Y
 
Y
A
 
-
D
 
-
A
 
-
C
 
-
Y
 
-
W
 
-
Y
 
-
Q
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
-
E
 
R
Y
 
F
A
 
N
N
 
G
K
 
K
M
 
T
V
 
V
Q
 
R
T
 
V
T
 
Q
D
 
N
P
 
V
T
 
E
D
 
E
K
 
F
A
 
D
Y
 
W
E
 
S
D
 
Q
V
 
V
D
 
H
I
 
I
V
 
A
F
 
L
S
 
F
A
 
S
L
 
A
P
 
G
S
 
G
D
 
E
L
 
L
A
 
S
K
 
A
K
 
K
L
 
W
E
 
A
P
 
P
E
 
I
F
 
A
A
 
A
K
 
E
E
 
A
G
 
G
K
 
V
L
 
V
V
 
V
F
 
I
S
 
D
N
 
N
A
 
T
S
 
S
A
 
H
M
 
F
R
 
R
M
 
Y
E
 
D
N
 
Y
D
 
D
V
 
I
P
 
P
L
 
L
M
 
V
I
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
N
Y
 
P
D
 
E
H
 
A
F
 
I
E
 
A
M
 
-
L
 
-
D
 
-
I
 
-
Q
 
E
R
 
F
E
 
R
N
 
N
R
 
R
N
 
N
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
I
I
 
I
T
 
A
N
 
N
P
 
P
N
 
N
C
|
C
S
 
S
T
 
T
I
 
I
C
 
Q
A
 
M
V
 
L
I
 
V
T
 
A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
I
 
I
M
 
Y
D
 
D
K
 
A
F
 
V
G
 
G
I
 
I
D
 
E
L
 
R
V
 
I
N
 
N
I
 
V
T
 
T
T
 
T
M
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
I
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
K
N
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
D
S
 
E
M
 
L
A
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
 
T
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
Y
-
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
T
-
 
N
-
 
T
-
 
F
-
 
S
-
 
Q
-
 
Q
I
 
I
I
 
A
D
 
F
N
 
N
L
 
C
V
 
I
P
 
P
Y
 
Q
I
 
I
G
 
D
S
 
Q
-
 
F
-
 
M
-
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
K
E
 
E
E
 
E
E
 
M
K
 
K
M
 
M
Q
 
V
T
 
W
E
 
E
S
 
T
L
 
Q
K
 
K
L
 
I
L
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
D
 
-
K
 
-
E
 
-
N
 
-
N
 
-
K
 
-
F
 
F
T
 
N
D
 
D
A
 
P
N
 
S
F
 
I
K
 
M
I
 
V
G
 
N
V
 
P
S
 
T
C
 
C
N
 
V
R
 
R
V
 
V
S
 
P
V
 
V
I
 
F
D
 
Y
G
 
G
H
 
H
T
 
A
E
 
E
S
 
A
I
 
V
F
 
H
V
 
V
K
 
E
T
 
T
T
 
R
E
 
A
E
 
P
A
 
I
T
 
D
P
 
A
E
 
E
E
 
Q
I
 
V
K
 
M
K
 
D
V
 
M
M
 
L
D
 
E
K
 
Q
F
 
T
D
 
D
P
 
G
L
 
I
K
 
E
E
 
L
Y
 
F
N
 
R
L
 
G
P
 
A
T
 
D
Y
 
F
A
 
-
K
 
-
P
 
-
I
 
-
V
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
M
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
-
Q
 
-
P
 
P
R
 
T
L
 
Q
D
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
N
 
G
G
 
K
M
 
D
S
 
H
I
 
V
S
 
L
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
V
R
 
R
E
 
N
D
 
D
P
 
I
V
 
S
F
 
H
-
 
H
-
 
S
G
 
G
I
 
I
K
 
N
Y
 
L
T
 
W
A
 
V
L
 
V
E
 
A
H
 
D
N
 
N
T
 
V
I
 
R
R
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
N
S
 
A
V
 
V
L
 
Q
N
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
L
Y
 
L
V
 
V
K
 
R
K
 
D
Y
 
Y
L
 
F

8jusA Crystal structure of aspartate semialdehyde dehydrogenase from porphyromonas gingivalis complexed with 2',5'adenosine diphosphate
29% identity, 99% coverage: 2:347/349 of query aligns to 1:332/335 of 8jusA

query
sites
8jusA
I
 
M
K
 
K
V
 
I
G
 
A
V
 
I
L
 
V
G
|
G
A
 
V
T
x
S
G
|
G
N
 
A
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
R
 
E
F
 
F
M
 
L
Q
 
R
M
 
V
L
 
L
-
 
S
-
 
Q
E
 
R
N
 
D
H
 
F
P
 
P
I
 
I
F
 
D
E
 
G
L
 
L
E
 
Y
V
 
L
L
 
F
G
|
G
A
 
-
S
|
S
S
 
S
R
|
R
S
|
S
A
 
A
G
 
G
K
 
S
K
 
V
Y
 
Y
A
 
S
D
 
F
A
 
K
C
 
G
Y
 
-
W
 
-
Y
 
-
Q
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
K
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
N
 
V
K
 
R
M
 
E
V
 
L
Q
 
K
T
 
D
T
 
N
D
 
D
P
 
D
T
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
Y
 
F
E
 
K
D
 
G
V
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
A
F
 
F
S
 
C
A
x
S
L
x
A
P
 
G
S
 
G
D
 
D
L
x
T
A
 
S
K
 
I
K
 
A
L
 
F
E
 
A
P
 
D
E
 
T
F
 
I
A
 
T
K
 
R
E
 
H
G
 
G
K
 
T
L
 
L
V
 
M
F
 
I
S
 
D
N
 
N
A
 
S
S
 
S
A
 
A
M
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
Q
N
 
E
D
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
V
I
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
N
Y
 
G
D
 
D
H
 
-
F
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
-
D
 
D
I
 
A
Q
 
L
R
 
V
E
 
H
N
 
P
R
 
R
N
 
N
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
I
I
 
I
T
 
S
N
 
N
P
 
P
N
 
N
C
 
C
S
 
T
T
 
T
I
 
I
C
 
Q
A
 
M
V
 
V
I
 
V
T
 
A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
I
 
I
M
 
E
D
 
D
K
 
L
F
 
S
G
 
H
I
 
I
D
 
R
L
 
R
V
 
V
N
 
H
I
 
V
T
 
A
T
 
T
M
 
Y
Q
 
Q
A
 
A
I
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
A
N
 
L
G
 
G
V
 
M
P
 
A
S
 
E
M
 
L
A
 
V
-
 
Q
-
 
Q
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
F
-
 
A
-
 
Y
-
 
Q
I
 
L
I
 
M
D
 
Y
N
 
N
L
 
L
V
 
I
P
 
P
Y
 
Q
I
 
I
G
 
D
S
 
V
E
 
F
E
 
T
E
 
D
K
 
N
M
 
D
Q
 
Y
T
 
T
-
 
K
E
 
E
S
 
E
L
 
M
K
 
K
L
 
M
L
 
Y
G
 
-
A
 
-
I
 
-
D
 
-
K
 
R
E
 
E
N
 
T
N
 
K
K
 
R
F
 
I
T
 
M
D
 
H
A
 
S
N
 
D
F
 
V
K
 
M
I
 
V
G
 
S
V
 
A
S
 
T
C
 
C
N
 
V
R
 
R
V
 
V
S
 
P
V
 
V
I
 
M
D
 
R
G
 
A
H
 
H
T
 
S
E
 
E
S
 
A
I
 
I
F
 
W
V
 
V
K
 
E
T
 
T
T
 
E
E
 
R
E
 
P
A
 
I
T
 
A
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
A
K
 
R
K
 
A
V
 
A
M
 
F
D
 
A
K
 
K
F
 
A
D
 
P
P
 
G
L
 
V
K
 
L
E
 
L
Y
 
C
N
 
D
L
 
E
P
 
P