SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011974176.1 NCBI__GCF_000017185.1:WP_011974176.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 15 hits to proteins with known functional sites (download)

6n2oC 2-oxoglutarate:ferredoxin oxidoreductase from magnetococcus marinus with 2-oxoglutarate, coenzyme a and succinyl-coa bound (see paper)
37% identity, 96% coverage: 15:377/377 of query aligns to 202:567/572 of 6n2oC

query
sites
6n2oC
M
 
M
Q
 
A
G
 
G
N
 
N
E
 
D
A
 
A
C
 
V
A
 
G
E
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
I
S
 
L
A
 
G
G
 
G
C
 
L
N
 
E
F
 
F
F
 
F
G
 
S
G
 
A
Y
 
Y
P
|
P
I
|
I
T
|
T
P
 
P
S
 
A
S
 
T
E
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
K
R
 
Y
L
 
V
S
 
A
K
 
T
R
 
H
L
 
L
P
 
P
Q
 
K
I
 
C
G
 
G
R
 
G
P
 
D
Y
 
L
V
 
V
Q
 
Q
M
 
A
E
 
E
D
 
D
E
|
E
I
 
I
S
 
A
A
 
S
L
 
I
A
 
A
T
 
Q
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
W
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
K
K
 
K
A
 
S
M
 
M
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
F
 
L
S
 
A
L
 
L
M
 
M
Q
 
S
E
 
E
H
 
M
I
 
L
G
 
G
Y
 
M
G
 
A
V
 
H
M
 
M
T
 
S
E
 
E
T
 
T
P
 
P
F
 
C
V
 
L
L
 
V
V
 
V
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
R
|
R
G
 
G
S
 
G
P
 
P
S
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
T
 
T
M
 
K
A
 
H
S
 
E
Q
 
Q
S
 
S
D
 
D
M
 
L
M
 
F
Q
 
L
A
 
A
K
 
I
W
 
H
G
 
G
S
 
G
H
 
H
G
 
G
D
 
D
Y
 
S
Q
 
P
I
 
R
I
 
I
A
 
V
F
 
L
A
 
S
P
 
V
S
 
E
S
 
D
V
 
V
Q
 
K
E
 
D
C
 
C
F
 
I
E
 
S
Y
 
M
T
 
T
I
 
V
K
 
D
A
 
G
F
 
L
N
 
N
M
 
L
S
 
A
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
R
 
Q
V
 
A
P
 
P
A
 
V
F
 
I
V
 
V
M
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
G
I
 
S
V
 
L
G
 
A
H
 
F
M
 
S
R
 
T
E
 
Q
K
 
T
L
 
I
-
 
P
-
 
R
V
 
P
I
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
F
E
 
T
I
 
I
I
 
I
N
 
N
R
 
R
K
 
K
-
 
T
-
 
W
E
 
D
G
 
G
L
 
Q
G
 
G
K
 
T
Y
 
Y
P
 
K
F
 
R
Y
 
Y
P
 
E
-
 
L
E
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
N
I
 
I
P
 
S
K
 
P
M
 
M
P
 
A
T
 
A
F
 
P
G
 
G
N
 
T
G
 
P
W
 
N
N
 
A
T
 
K
H
 
H
V
 
I
-
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
T
 
E
H
 
H
S
 
G
E
 
E
K
 
T
G
 
G
Y
 
A
P
 
P
D
 
N
A
 
Y
A
 
S
S
 
-
K
 
-
P
 
P
A
 
A
E
 
N
H
 
H
H
 
E
K
 
L
L
 
M
V
 
H
K
 
R
R
 
K
L
 
R
N
 
F
D
 
N
K
 
K
I
 
Q
L
 
N
N
 
S
N
 
V
L
 
L
K
 
D
D
 
F
I
 
Y
V
 
K
S
 
N
Y
 
M
E
 
E
E
 
V
K
 
E
Y
 
G
L
 
V
D
 
E
D
 
G
C
 
E
G
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
G
V
 
I
V
 
I
S
 
T
Y
 
W
G
 
G
A
 
S
P
 
T
S
 
I
R
 
G
S
 
V
A
 
V
E
 
R
T
 
E
A
 
A
V
 
M
N
 
Q
E
 
R
L
 
L
R
 
T
E
 
A
K
 
E
G
 
G
V
 
L
S
 
K
A
 
V
G
 
K
I
 
A
L
 
M
R
 
Y
L
 
P
E
 
K
T
 
L
V
 
L
W
 
W
P
 
P
F
 
M
P
 
P
D
 
V
Y
 
A
K
 
D
I
 
Y
L
 
D
E
 
A
I
 
F
A
 
G
K
 
A
K
 
T
T
 
C
E
 
K
K
 
K
I
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
P
E
 
E
M
 
V
N
 
N
F
 
F
-
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
I
 
L
S
 
S
R
 
H
E
 
F
V
 
I
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
K
 
R
G
 
A
H
 
E
C
 
T
E
 
S
V
 
I
S
 
K
L
 
P
V
 
I
G
 
P
K
 
Y
T
 
T
-
 
I
-
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
L
I
 
P
H
 
F
V
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
M
I
 
I
I
 
V
N
 
N
E
 
R
L
 
V

Sites not aligning to the query:

6n2oA 2-oxoglutarate:ferredoxin oxidoreductase from magnetococcus marinus with 2-oxoglutarate, coenzyme a and succinyl-coa bound (see paper)
37% identity, 96% coverage: 15:377/377 of query aligns to 202:567/572 of 6n2oA

query
sites
6n2oA
M
 
M
Q
 
A
G
 
G
N
 
N
E
 
D
A
 
A
C
 
V
A
 
G
E
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
I
S
 
L
A
 
G
G
 
G
C
 
L
N
 
E
F
 
F
F
 
F
G
 
S
G
 
A
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
|
T
P
 
P
S
 
A
S
 
T
E
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
K
R
 
Y
L
 
V
S
 
A
K
 
T
R
 
H
L
 
L
P
 
P
Q
 
K
I
 
C
G
 
G
R
 
G
P
 
D
Y
 
L
V
 
V
Q
 
Q
M
 
A
E
 
E
D
 
D
E
|
E
I
 
I
S
 
A
A
 
S
L
 
I
A
 
A
T
 
Q
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
W
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
K
K
 
K
A
 
S
M
 
M
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
F
 
L
S
 
A
L
 
L
M
 
M
Q
 
S
E
 
E
H
 
M
I
 
L
G
 
G
Y
 
M
G
 
A
V
 
H
M
 
M
T
 
S
E
 
E
T
 
T
P
 
P
F
 
C
V
 
L
L
 
V
V
 
V
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
R
|
R
G
 
G
S
 
G
P
 
P
S
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
T
 
T
M
 
K
A
 
H
S
 
E
Q
 
Q
S
 
S
D
 
D
M
 
L
M
 
F
Q
 
L
A
 
A
K
 
I
W
 
H
G
 
G
S
 
G
H
 
H
G
 
G
D
 
D
Y
 
S
Q
 
P
I
 
R
I
 
I
A
 
V
F
 
L
A
 
S
P
 
V
S
 
E
S
 
D
V
 
V
Q
 
K
E
 
D
C
 
C
F
 
I
E
 
S
Y
 
M
T
 
T
I
 
V
K
 
D
A
 
G
F
 
L
N
 
N
M
 
L
S
 
A
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
R
 
Q
V
 
A
P
 
P
A
 
V
F
 
I
V
 
V
M
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
G
I
 
S
V
 
L
G
 
A
H
 
F
M
 
S
R
 
T
E
 
Q
K
 
T
L
 
I
-
 
P
-
 
R
V
 
P
I
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
F
E
 
T
I
 
I
I
 
I
N
 
N
R
 
R
K
 
K
-
 
T
-
 
W
E
 
D
G
 
G
L
 
Q
G
 
G
K
 
T
Y
 
Y
P
 
K
F
 
R
Y
 
Y
P
 
E
-
 
L
E
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
N
I
 
I
P
 
S
K
 
P
M
 
M
P
 
A
T
 
A
F
 
P
G
 
G
N
 
T
G
 
P
W
 
N
N
 
A
T
 
K
H
 
H
V
 
I
-
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
T
 
E
H
 
H
S
 
G
E
 
E
K
 
T
G
 
G
Y
 
A
P
 
P
D
 
N
A
 
Y
A
 
S
S
 
-
K
 
-
P
 
P
A
 
A
E
 
N
H
 
H
H
 
E
K
 
L
L
 
M
V
 
H
K
 
R
R
 
K
L
 
R
N
 
F
D
 
N
K
 
K
I
 
Q
L
 
N
N
 
S
N
 
V
L
 
L
K
 
D
D
 
F
I
 
Y
V
 
K
S
 
N
Y
 
M
E
 
E
E
 
V
K
 
E
Y
 
G
L
 
V
D
 
E
D
 
G
C
 
E
G
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
G
V
 
I
V
 
I
S
 
T
Y
 
W
G
 
G
A
 
S
P
 
T
S
 
I
R
 
G
S
 
V
A
 
V
E
 
R
T
 
E
A
 
A
V
 
M
N
 
Q
E
 
R
L
 
L
R
 
T
E
 
A
K
 
E
G
 
G
V
 
L
S
 
K
A
 
V
G
 
K
I
 
A
L
 
M
R
 
Y
L
 
P
E
 
K
T
 
L
V
 
L
W
 
W
P
 
P
F
 
M
P
 
P
D
 
V
Y
 
A
K
 
D
I
 
Y
L
 
D
E
 
A
I
 
F
A
 
G
K
 
A
K
 
T
T
 
C
E
 
K
K
 
K
I
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
P
E
 
E
M
 
V
N
 
N
F
 
F
-
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
I
 
L
S
 
S
R
 
H
E
 
F
V
 
I
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
K
 
R
G
 
A
H
 
E
C
 
T
E
 
S
V
 
I
S
 
K
L
 
P
V
 
I
G
 
P
K
 
Y
T
 
T
-
 
I
-
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
L
I
 
P
H
 
F
V
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
M
I
 
I
I
 
V
N
 
N
E
 
R
L
 
V

Sites not aligning to the query:

6n2nA Crystal structure of 2-oxoglutarate:ferredoxin oxidoreductase from magnetococcus marinus (see paper)
37% identity, 96% coverage: 15:377/377 of query aligns to 202:567/572 of 6n2nA

query
sites
6n2nA
M
 
M
Q
 
A
G
 
G
N
 
N
E
 
D
A
 
A
C
 
V
A
 
G
E
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
I
S
 
L
A
 
G
G
 
G
C
 
L
N
 
E
F
 
F
F
 
F
G
 
S
G
 
A
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
S
 
T
E
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
K
R
 
Y
L
 
V
S
 
A
K
 
T
R
 
H
L
 
L
P
 
P
Q
 
K
I
 
C
G
 
G
R
 
G
P
 
D
Y
 
L
V
 
V
Q
 
Q
M
 
A
E
 
E
D
 
D
E
|
E
I
 
I
S
 
A
A
 
S
L
 
I
A
 
A
T
 
Q
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
W
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
K
K
 
K
A
 
S
M
 
M
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
F
 
L
S
 
A
L
 
L
M
 
M
Q
 
S
E
 
E
H
 
M
I
 
L
G
 
G
Y
 
M
G
 
A
V
 
H
M
 
M
T
 
S
E
 
E
T
 
T
P
 
P
F
 
C
V
 
L
L
 
V
V
 
V
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
S
 
G
P
 
P
S
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
T
 
T
M
 
K
A
 
H
S
 
E
Q
 
Q
S
 
S
D
 
D
M
 
L
M
 
F
Q
 
L
A
 
A
K
 
I
W
 
H
G
 
G
S
 
G
H
 
H
G
 
G
D
 
D
Y
 
S
Q
 
P
I
 
R
I
 
I
A
 
V
F
 
L
A
 
S
P
 
V
S
 
E
S
 
D
V
 
V
Q
 
K
E
 
D
C
 
C
F
 
I
E
 
S
Y
 
M
T
 
T
I
 
V
K
 
D
A
 
G
F
 
L
N
 
N
M
 
L
S
 
A
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
R
 
Q
V
 
A
P
 
P
A
 
V
F
 
I
V
 
V
M
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
G
I
 
S
V
 
L
G
 
A
H
 
F
M
 
S
R
 
T
E
 
Q
K
 
T
L
 
I
-
 
P
-
 
R
V
 
P
I
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
F
E
 
T
I
 
I
I
 
I
N
 
N
R
 
R
K
 
K
-
 
T
-
 
W
E
 
D
G
 
G
L
 
Q
G
 
G
K
 
T
Y
 
Y
P
 
K
F
 
R
Y
 
Y
P
 
E
-
 
L
E
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
N
I
 
I
P
 
S
K
 
P
M
 
M
P
 
A
T
 
A
F
 
P
G
 
G
N
 
T
G
 
P
W
 
N
N
 
A
T
 
K
H
 
H
V
 
I
-
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
T
 
E
H
 
H
S
 
G
E
 
E
K
 
T
G
 
G
Y
 
A
P
 
P
D
 
N
A
 
Y
A
 
S
S
 
-
K
 
-
P
 
P
A
 
A
E
 
N
H
 
H
H
 
E
K
 
L
L
 
M
V
 
H
K
 
R
R
 
K
L
 
R
N
 
F
D
 
N
K
 
K
I
 
Q
L
 
N
N
 
S
N
 
V
L
 
L
K
 
D
D
 
F
I
 
Y
V
 
K
S
 
N
Y
 
M
E
 
E
E
 
V
K
 
E
Y
 
G
L
 
V
D
 
E
D
 
G
C
 
E
G
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
G
V
 
I
V
 
I
S
 
T
Y
 
W
G
 
G
A
 
S
P
 
T
S
 
I
R
 
G
S
 
V
A
 
V
E
 
R
T
 
E
A
 
A
V
 
M
N
 
Q
E
 
R
L
 
L
R
 
T
E
 
A
K
 
E
G
 
G
V
 
L
S
 
K
A
 
V
G
 
K
I
 
A
L
 
M
R
 
Y
L
 
P
E
 
K
T
 
L
V
 
L
W
 
W
P
 
P
F
 
M
P
 
P
D
 
V
Y
 
A
K
 
D
I
 
Y
L
 
D
E
 
A
I
 
F
A
 
G
K
 
A
K
 
T
T
 
C
E
 
K
K
 
K
I
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
P
E
 
E
M
 
V
N
 
N
F
 
F
-
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
I
 
L
S
 
S
R
 
H
E
 
F
V
 
I
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
K
 
R
G
 
A
H
 
E
C
 
T
E
 
S
V
 
I
S
 
K
L
 
P
V
 
I
G
 
P
K
 
Y
T
 
T
-
 
I
-
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
L
I
 
P
H
 
F
V
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
M
I
 
I
I
 
V
N
 
N
E
 
R
L
 
V

5b47A 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase 2 from sulfolobus tokodai - pyruvate complex (see paper)
30% identity, 95% coverage: 15:374/377 of query aligns to 232:607/627 of 5b47A

query
sites
5b47A
M
 
V
Q
 
D
G
 
G
N
 
N
E
 
T
A
 
I
C
 
S
A
 
A
E
 
M
G
 
G
A
 
K
L
 
L
S
 
A
A
 
G
G
 
G
C
 
L
N
 
R
F
 
F
F
 
Q
G
 
S
G
 
Y
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
|
T
P
 
P
S
 
A
S
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
Y
-
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
N
E
 
Q
R
 
N
L
 
L
S
 
D
-
 
M
-
 
I
-
 
V
-
 
E
-
 
G
K
 
N
R
 
E
L
 
L
P
 
R
Q
 
K
I
 
G
G
 
G
R
 
V
P
 
V
Y
 
V
V
 
V
Q
 
Q
M
 
A
E
 
E
D
 
D
E
|
E
I
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
N
T
 
M
V
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
A
W
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
V
K
 
R
A
 
S
M
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
G
P
|
P
G
 
G
F
 
F
S
 
S
L
 
L
M
 
M
Q
 
S
E
 
E
H
 
G
I
 
I
G
 
S
Y
 
W
G
 
A
V
 
G
M
 
M
T
 
N
E
 
E
T
 
V
P
 
P
F
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
T
D
 
Y
V
 
Y
Q
 
M
R
|
R
G
 
G
S
 
A
P
 
P
S
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
L
P
|
P
T
 
T
M
 
R
A
 
S
S
 
G
Q
 
Q
S
 
A
D
 
D
M
 
L
M
 
K
Q
 
F
A
 
A
K
 
L
W
 
N
G
 
V
S
 
G
H
 
H
G
 
G
D
 
E
Y
 
F
Q
 
P
I
 
R
I
 
I
A
 
V
F
 
I
A
 
A
P
 
S
S
 
G
S
 
D
V
 
H
Q
 
V
E
 
E
C
 
I
F
 
F
E
 
W
Y
 
D
T
 
A
I
 
I
K
 
W
A
 
A
F
 
L
N
 
N
M
 
L
S
 
A
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
R
 
Q
V
 
T
P
 
P
A
 
V
F
 
I
V
 
H
M
 
I
S
 
I
D
 
E
E
 
K
I
 
T
V
 
L
G
 
A
H
 
N
M
 
A
R
 
Y
E
 
S
K
 
-
L
 
-
V
 
V
I
 
F
P
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
L
E
 
-
I
 
I
I
 
T
N
 
N
R
 
R
K
 
P
E
 
Y
G
 
V
L
 
I
G
 
E
K
 
R
Y
 
G
P
 
K
F
 
I
Y
 
V
-
 
K
P
 
P
E
 
T
E
 
S
D
 
D
L
 
Y
I
 
F
P
 
N
K
 
R
M
 
F
P
 
E
T
 
V
F
 
T
G
 
E
N
 
D
G
 
G
W
 
I
N
 
S
T
 
P
H
 
R
V
 
V
-
 
F
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
F
-
 
Y
T
 
T
G
 
G
L
 
D
T
 
E
H
 
H
S
 
N
E
 
E
K
 
E
G
 
G
Y
 
H
P
 
I
D
 
T
A
 
E
A
 
N
S
 
S
K
 
-
P
 
-
A
 
I
E
 
N
H
 
R
H
 
M
K
 
K
L
 
M
V
 
Y
K
 
E
R
 
K
L
 
R
N
 
N
D
 
K
K
 
K
I
 
L
L
 
E
N
 
T
N
 
A
L
 
D
K
 
K
D
 
E
I
 
I
V
 
P
S
 
-
Y
 
-
E
 
E
E
 
E
K
 
Q
Y
 
R
L
 
V
D
 
N
D
 
I
C
 
V
G
 
G
-
 
D
-
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
V
V
 
L
V
 
L
S
 
T
Y
 
W
G
 
G
A
 
S
P
 
P
S
 
K
R
 
G
S
 
A
A
 
I
E
 
L
T
 
D
A
 
A
V
 
M
N
 
E
E
 
E
L
 
L
R
 
S
E
 
K
K
 
D
G
 
G
V
 
I
S
 
K
A
 
T
G
 
M
I
 
M
L
 
V
R
 
Q
L
 
V
E
 
K
T
 
M
V
 
F
W
 
N
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
D
 
K
Y
 
N
K
 
L
I
 
M
L
 
K
E
 
K
I
 
I
A
 
L
K
 
S
K
 
G
T
 
K
E
 
S
K
 
K
I
 
I
I
 
I
I
 
A
P
 
V
E
 
E
M
 
N
N
 
N
F
 
Y
G
 
N
Q
 
A
I
 
Q
S
 
G
R
 
A
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
R
 
A
A
 
E
S
 
K
K
 
T
G
 
G
H
 
I
C
 
F
E
 
A
V
 
T
S
 
N
L
 
Y
V
 
I
G
 
L
K
 
K
T
 
W
G
 
T
G
 
G
E
 
R
I
 
P
H
 
I
V
 
T
P
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
V
I
 
I

5b46A 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase 2 from sulfolobus tokodai - ligand free form (see paper)
30% identity, 95% coverage: 15:374/377 of query aligns to 232:607/627 of 5b46A

query
sites
5b46A
M
 
V
Q
 
D
G
 
G
N
 
N
E
 
T
A
 
I
C
 
S
A
 
A
E
 
M
G
 
G
A
 
K
L
 
L
S
 
A
A
 
G
G
 
G
C
 
L
N
 
R
F
 
F
F
 
Q
G
 
S
G
 
Y
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
S
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
Y
-
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
N
E
 
Q
R
 
N
L
 
L
S
 
D
-
 
M
-
 
I
-
 
V
-
 
E
-
 
G
K
 
N
R
 
E
L
 
L
P
 
R
Q
 
K
I
 
G
G
 
G
R
 
V
P
 
V
Y
 
V
V
 
V
Q
 
Q
M
 
A
E
 
E
D
 
D
E
|
E
I
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
N
T
 
M
V
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
A
W
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
V
K
 
R
A
 
S
M
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
F
 
F
S
 
S
L
 
L
M
 
M
Q
 
S
E
 
E
H
 
G
I
 
I
G
 
S
Y
 
W
G
 
A
V
 
G
M
 
M
T
 
N
E
 
E
T
 
V
P
 
P
F
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
T
D
 
Y
V
 
Y
Q
 
M
R
 
R
G
 
G
S
 
A
P
 
P
S
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
T
 
T
M
 
R
A
 
S
S
 
G
Q
 
Q
S
 
A
D
 
D
M
 
L
M
 
K
Q
 
F
A
 
A
K
 
L
W
 
N
G
 
V
S
 
G
H
 
H
G
 
G
D
 
E
Y
 
F
Q
 
P
I
 
R
I
 
I
A
 
V
F
 
I
A
 
A
P
 
S
S
 
G
S
 
D
V
 
H
Q
 
V
E
 
E
C
 
I
F
 
F
E
 
W
Y
 
D
T
 
A
I
 
I
K
 
W
A
 
A
F
 
L
N
 
N
M
 
L
S
 
A
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
R
 
Q
V
 
T
P
 
P
A
 
V
F
 
I
V
 
H
M
 
I
S
 
I
D
 
E
E
 
K
I
 
T
V
 
L
G
 
A
H
 
N
M
 
A
R
 
Y
E
 
S
K
 
-
L
 
-
V
 
V
I
 
F
P
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
L
E
 
-
I
 
I
I
 
T
N
 
N
R
 
R
K
 
P
E
 
Y
G
 
V
L
 
I
G
 
E
K
 
R
Y
 
G
P
 
K
F
 
I
Y
 
V
-
 
K
P
 
P
E
 
T
E
 
S
D
 
D
L
 
Y
I
 
F
P
 
N
K
 
R
M
 
F
P
 
E
T
 
V
F
 
T
G
 
E
N
 
D
G
 
G
W
 
I
N
 
S
T
 
P
H
 
R
V
 
V
-
 
F
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
F
-
 
Y
T
 
T
G
 
G
L
 
D
T
 
E
H
 
H
S
 
N
E
 
E
K
 
E
G
 
G
Y
 
H
P
 
I
D
 
T
A
 
E
A
 
N
S
 
S
K
 
-
P
 
-
A
 
I
E
 
N
H
 
R
H
 
M
K
 
K
L
 
M
V
 
Y
K
 
E
R
 
K
L
 
R
N
 
N
D
 
K
K
 
K
I
 
L
L
 
E
N
 
T
N
 
A
L
 
D
K
 
K
D
 
E
I
 
I
V
 
P
S
 
-
Y
 
-
E
 
E
E
 
E
K
 
Q
Y
 
R
L
 
V
D
 
N
D
 
I
C
 
V
G
 
G
-
 
D
-
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
V
V
 
L
V
 
L
S
 
T
Y
 
W
G
 
G
A
 
S
P
 
P
S
 
K
R
 
G
S
 
A
A
 
I
E
 
L
T
 
D
A
 
A
V
 
M
N
 
E
E
 
E
L
 
L
R
 
S
E
 
K
K
 
D
G
 
G
V
 
I
S
 
K
A
 
T
G
 
M
I
 
M
L
 
V
R
 
Q
L
 
V
E
 
K
T
 
M
V
 
F
W
 
N
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
D
 
K
Y
 
N
K
 
L
I
 
M
L
 
K
E
 
K
I
 
I
A
 
L
K
 
S
K
 
G
T
 
K
E
 
S
K
 
K
I
 
I
I
 
I
I
 
A
P
 
V
E
 
E
M
 
N
N
 
N
F
 
Y
G
 
N
Q
 
A
I
 
Q
S
 
G
R
 
A
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
R
 
A
A
 
E
S
 
K
K
 
T
G
 
G
H
 
I
C
 
F
E
 
A
V
 
T
S
 
N
L
 
Y
V
 
I
G
 
L
K
 
K
T
 
W
G
 
T
G
 
G
E
 
R
I
 
P
H
 
I
V
 
T
P
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
V
I
 
I

Q96XT2 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase 2, subunit alpha; OFOR2; EC 1.2.7.11 from Sulfurisphaera tokodaii (strain DSM 16993 / JCM 10545 / NBRC 100140 / 7) (Sulfolobus tokodaii) (see paper)
30% identity, 95% coverage: 15:374/377 of query aligns to 233:608/628 of Q96XT2

query
sites
Q96XT2
M
 
V
Q
 
D
G
 
G
N
 
N
E
 
T
A
 
I
C
 
S
A
 
A
E
 
M
G
 
G
A
 
K
L
 
L
S
 
A
A
 
G
G
 
G
C
 
L
N
 
R
F
 
F
F
 
Q
G
 
S
G
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
T
|
T
P
 
P
S
 
A
S
 
S
E
 
D
-
 
E
-
 
S
V
 
V
A
 
Y
E
 
I
R
 
E
L
 
A
S
 
N
K
 
Q
R
 
N
L
 
L
P
 
D
Q
 
M
I
 
I
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
G
G
 
G
R
 
V
P
 
V
Y
 
V
V
 
V
Q
 
Q
M
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
I
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
N
T
 
M
V
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
A
W
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
V
K
 
R
A
 
S
M
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
F
 
F
S
 
S
L
 
L
M
 
M
Q
 
S
E
 
E
H
 
G
I
 
I
G
 
S
Y
 
W
G
 
A
V
 
G
M
 
M
T
 
N
E
 
E
T
 
V
P
 
P
F
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
T
D
 
Y
V
 
Y
Q
 
M
R
|
R
G
 
G
S
 
A
P
 
P
S
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
T
 
T
M
 
R
A
 
S
S
 
G
Q
 
Q
S
 
A
D
 
D
M
 
L
M
 
K
Q
 
F
A
 
A
K
 
L
W
 
N
G
 
V
S
 
G
H
 
H
G
 
G
D
 
E
Y
 
F
Q
 
P
I
 
R
I
 
I
A
 
V
F
 
I
A
 
A
P
 
S
S
 
G
S
 
D
V
 
H
Q
 
V
E
 
E
C
 
I
F
 
F
E
 
W
Y
 
D
T
 
A
I
 
I
K
 
W
A
 
A
F
 
L
N
 
N
M
 
L
S
 
A
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
R
 
Q
V
 
T
P
 
P
A
 
V
F
 
I
V
 
H
M
 
I
S
 
I
D
 
E
E
 
K
I
 
T
V
 
L
G
 
A
H
 
N
M
 
A
R
 
Y
E
 
S
K
 
-
L
 
-
V
 
V
I
 
F
P
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
L
E
 
-
I
 
I
I
 
T
N
 
N
R
 
R
K
 
P
E
 
Y
G
 
V
L
 
I
G
 
E
K
 
R
Y
 
G
P
 
K
F
 
I
Y
 
V
-
 
K
P
 
P
E
 
T
E
 
S
D
 
D
L
 
Y
I
 
F
P
 
N
K
 
R
M
 
F
P
 
E
T
 
V
F
 
T
G
 
E
N
 
D
G
 
G
W
 
I
N
 
S
T
 
P
H
 
R
V
 
V
-
 
F
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
F
-
 
Y
T
 
T
G
 
G
L
 
D
T
 
E
H
 
H
S
 
N
E
 
E
K
 
E
G
 
G
Y
 
H
P
 
I
D
 
T
A
 
E
A
 
N
S
 
S
K
 
-
P
 
-
A
 
I
E
 
N
H
 
R
H
 
M
K
 
K
L
 
M
V
 
Y
K
 
E
R
 
K
L
 
R
N
 
N
D
 
K
K
 
K
I
 
L
L
 
E
N
 
T
N
 
A
L
 
D
K
 
K
D
 
E
I
 
I
V
 
P
S
 
-
Y
 
-
E
 
E
E
 
E
K
 
Q
Y
 
R
L
 
V
D
 
N
D
 
I
C
 
V
G
 
G
-
 
D
-
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
V
V
 
L
V
 
L
S
 
T
Y
 
W
G
 
G
A
 
S
P
 
P
S
 
K
R
 
G
S
 
A
A
 
I
E
 
L
T
 
D
A
 
A
V
 
M
N
 
E
E
 
E
L
 
L
R
 
S
E
 
K
K
 
D
G
 
G
V
 
I
S
 
K
A
 
T
G
 
M
I
 
M
L
 
V
R
 
Q
L
 
V
E
 
K
T
 
M
V
 
F
W
 
N
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
D
 
K
Y
 
N
K
 
L
I
 
M
L
 
K
E
 
K
I
 
I
A
 
L
K
 
S
K
 
G
T
 
K
E
 
S
K
 
K
I
 
I
I
 
I
I
 
A
P
 
V
E
 
E
M
 
N
N
 
N
F
 
Y
G
 
N
Q
 
A
I
 
Q
S
 
G
R
 
A
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
R
 
A
A
 
E
S
 
K
K
 
T
G
 
G
H
 
I
C
 
F
E
 
A
V
 
T
S
 
N
L
 
Y
V
 
I
G
 
L
K
 
K
T
 
W
G
 
T
G
 
G
E
 
R
I
 
P
H
 
I
V
 
T
P
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
V
I
 
I

Q96Y66 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase 1, subunit alpha; OFOR1; EC 1.2.7.11 from Sulfurisphaera tokodaii (strain DSM 16993 / JCM 10545 / NBRC 100140 / 7) (Sulfolobus tokodaii) (see paper)
30% identity, 88% coverage: 8:340/377 of query aligns to 220:573/627 of Q96Y66

query
sites
Q96Y66
L
 
L
K
 
K
P
 
P
G
 
S
T
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
R
Y
 
F
F
 
W
M
 
L
Q
 
D
G
 
G
N
 
N
E
 
T
A
 
A
C
 
V
A
 
A
E
 
I
G
 
G
A
 
K
L
 
I
S
 
Y
A
 
G
G
 
G
C
 
V
N
 
R
F
 
F
F
 
Q
G
 
S
G
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
S
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
Y
-
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
H
E
 
Q
R
 
D
L
 
V
S
 
L
K
 
M
R
 
E
L
 
D
P
 
P
Q
 
I
I
 
T
G
 
G
R
 
D
P
 
K
-
 
K
-
 
K
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
V
Y
 
V
V
 
V
Q
 
Q
M
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
I
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
N
T
 
M
V
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
A
W
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
V
K
 
R
A
 
A
M
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
F
 
F
S
 
S
L
 
L
M
 
M
Q
 
V
E
 
E
H
 
G
I
 
L
G
 
G
Y
 
W
G
 
A
V
 
G
M
 
M
T
 
N
E
 
E
T
 
V
P
 
P
F
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
T
D
 
Y
V
 
Y
Q
 
I
R
 
R
G
 
G
S
 
G
P
 
P
S
 
S
T
|
T
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
T
 
T
M
 
R
A
 
T
S
 
A
Q
 
Q
S
 
S
D
 
D
M
 
L
M
 
I
Q
 
F
A
 
P
K
 
I
W
 
F
G
 
A
S
 
G
H
 
H
G
 
G
D
 
E
Y
 
F
Q
 
P
I
 
K
I
 
I
A
 
V
F
 
L
A
 
A
P
 
S
S
 
G
S
 
D
V
 
H
Q
 
A
E
 
E
C
 
A
F
 
F
E
 
K
Y
 
D
T
 
A
I
 
I
K
 
W
A
 
A
F
 
L
N
 
N
M
 
L
S
 
A
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
R
 
Q
V
 
T
P
 
P
A
 
V
F
 
I
V
 
H
M
 
L
S
 
V
D
 
E
E
 
K
I
 
T
V
 
L
G
 
A
H
 
N
M
 
S
R
 
Y
E
 
S
K
 
-
L
 
-
V
 
T
I
 
I
P
 
P
-
 
Y
E
 
E
E
 
E
I
 
L
E
 
E
I
 
L
I
 
D
N
 
K
R
 
L
K
 
K
E
 
A
G
 
E
L
 
R
G
 
G
K
 
K
Y
 
I
-
 
V
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
S
-
 
Y
-
 
K
P
 
R
F
 
F
Y
 
K
P
 
F
E
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
G
I
 
I
P
 
S
K
 
P
M
 
R
P
 
A
T
 
F
F
 
L
G
 
G
N
 
K
G
 
A
W
 
-
N
 
T
T
 
M
H
 
Y
V
 
Y
T
 
T
G
 
G
L
x
D
T
 
E
H
 
H
S
 
N
E
 
E
K
 
E
G
 
G
Y
 
H
-
 
I
-
 
S
P
 
E
D
 
D
A
 
V
A
 
V
S
 
N
K
 
R
P
 
T
A
 
M
E
 
M
H
 
Y
H
 
E
K
 
K
L
 
R
V
 
M
K
 
K
R
 
K
L
 
L
N
 
-
D
 
-
K
 
-
I
 
-
L
 
-
N
 
-
N
 
E
L
 
V
K
 
A
D
 
D
I
 
K
V
 
E
S
 
I
Y
 
P
E
 
E
E
 
E
K
 
S
Y
 
R
L
 
V
D
 
K
D
 
I
C
 
Y
G
 
G
D
 
D
V
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
R
-
 
N
V
 
L
V
 
I
V
 
I
S
 
T
Y
 
W
G
 
G
A
 
S
P
 
P
S
 
T
R
 
G
S
 
V
A
 
L
E
 
R
T
 
-
A
 
-
V
 
-
N
 
D
E
 
I
L
 
L
R
 
E
E
 
E
K
 
S
G
 
N
V
 
F
S
 
D
A
 
F
G
 
T
I
 
L
L
 
L
R
 
Q
L
 
I
E
 
R
T
 
M
V
 
F
W
 
S
P
 
P
F
 
F
P
 
P
D
 
K
Y
 
N
K
 
L
I
 
V
L
 
S
E
 
K
I
 
L
A
 
M
K
 
E
K
 
G
T
 
R
E
 
D
K
 
K
I
 
I
I
 
I
I
 
T
P
 
V
E
 
E
M
 
G
N
 
N
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

P72578 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase subunit alpha; OFOR; EC 1.2.7.11 from Sulfolobus sp. (see 2 papers)
30% identity, 88% coverage: 8:340/377 of query aligns to 220:573/632 of P72578

query
sites
P72578
L
 
L
K
 
K
P
 
P
G
 
S
T
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
R
Y
 
F
F
 
W
M
 
L
Q
 
D
G
 
G
N
 
N
E
 
T
A
 
A
C
 
V
A
 
A
E
 
I
G
 
G
A
 
K
L
 
I
S
 
Y
A
 
G
G
 
G
C
 
V
N
 
R
F
 
F
F
 
Q
G
 
S
G
 
Y
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
|
T
P
|
P
S
 
A
S
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
Y
-
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
H
E
 
Q
R
 
D
L
 
V
S
 
L
K
 
M
R
 
E
L
 
D
P
 
P
Q
 
I
I
 
T
G
 
G
R
 
D
P
 
K
-
 
K
-
 
K
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
V
Y
 
V
V
 
V
Q
 
Q
M
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
I
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
N
T
 
M
V
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
A
W
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
V
K
 
R
A
 
A
M
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
F
 
F
S
 
S
L
 
L
M
 
M
Q
 
V
E
 
E
H
 
G
I
 
L
G
 
G
Y
 
W
G
 
A
V
 
G
M
 
M
T
 
N
E
 
E
T
 
V
P
 
P
F
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
T
D
 
Y
V
 
Y
Q
 
I
R
|
R
G
 
G
S
 
G
P
 
P
S
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
T
|
T
M
 
R
A
 
T
S
 
A
Q
 
Q
S
 
S
D
 
D
M
 
L
M
 
I
Q
 
F
A
 
P
K
 
I
W
 
F
G
 
A
S
 
G
H
 
H
G
 
G
D
 
E
Y
 
F
Q
 
P
I
 
K
I
 
I
A
 
V
F
 
L
A
 
A
P
 
S
S
 
G
S
 
D
V
 
H
Q
 
A
E
 
E
C
 
A
F
 
F
E
 
K
Y
 
D
T
 
A
I
 
I
K
 
W
A
 
A
F
 
L
N
 
N
M
 
L
S
 
A
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
R
 
Q
V
 
T
P
 
P
A
 
V
F
 
I
V
 
H
M
 
L
S
 
V
D
 
E
E
 
K
I
 
T
V
 
L
G
 
A
H
 
N
M
 
S
R
 
Y
E
 
S
K
 
-
L
 
-
V
 
T
I
 
I
P
 
P
-
 
Y
E
 
E
E
 
E
I
 
L
E
 
E
I
 
L
I
 
D
N
 
K
R
 
L
K
 
K
E
 
A
G
 
E
L
 
R
G
 
G
K
 
K
Y
 
I
-
 
V
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
S
-
 
Y
-
 
K
P
 
R
F
 
F
Y
 
K
P
 
F
E
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
G
I
 
I
P
 
S
K
 
P
M
 
R
P
 
A
T
 
F
F
 
L
G
 
G
N
 
K
G
 
A
W
 
-
N
 
T
T
 
M
H
 
Y
V
 
Y
T
 
T
G
 
G
L
 
D
T
 
E
H
 
H
S
 
N
E
 
E
K
 
E
G
 
G
Y
 
H
-
 
I
-
 
S
P
 
E
D
 
D
A
 
V
A
 
V
S
 
N
K
 
R
P
 
T
A
 
M
E
 
M
H
 
Y
H
 
E
K
 
K
L
 
R
V
 
M
K
 
K
R
 
K
L
 
L
N
 
-
D
 
-
K
 
-
I
 
-
L
 
-
N
 
-
N
 
E
L
 
V
K
 
A
D
 
D
I
 
K
V
 
E
S
 
I
Y
 
P
E
 
E
E
 
E
K
 
S
Y
 
R
L
 
V
D
 
K
D
 
I
C
 
Y
G
 
G
D
 
D
V
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
R
-
 
N
V
 
L
V
 
I
V
 
I
S
 
T
Y
 
W
G
 
G
A
 
S
P
 
P
S
 
T
R
 
G
S
 
V
A
 
L
E
 
R
T
 
-
A
 
-
V
 
-
N
 
D
E
 
I
L
 
L
R
 
E
E
 
E
K
 
S
G
 
N
V
 
F
S
 
D
A
 
F
G
 
T
I
 
L
L
 
L
R
 
Q
L
 
I
E
 
R
T
 
M
V
 
F
W
 
S
P
 
P
F
 
F
P
 
P
D
 
K
Y
 
N
K
 
L
I
 
V
L
 
S
E
 
K
I
 
L
A
 
M
K
 
E
K
 
G
T
 
R
E
 
D
K
 
K
I
 
I
I
 
I
I
 
T
P
 
V
E
 
E
M
 
G
N
 
N
F
 
Y

5b48A 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase 1 from sulfolobus tokodai (see paper)
30% identity, 87% coverage: 13:340/377 of query aligns to 198:525/576 of 5b48A

query
sites
5b48A
Y
 
F
F
 
W
M
 
L
Q
 
D
G
 
G
N
 
N
E
 
T
A
 
A
C
 
V
A
 
A
E
 
I
G
 
G
A
 
K
L
 
I
S
 
Y
A
 
G
G
 
G
C
 
V
N
 
R
F
 
F
F
 
Q
G
 
S
G
 
Y
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
S
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
Y
-
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
H
E
 
Q
R
 
D
L
 
V
S
 
L
K
 
M
R
 
E
L
 
D
P
 
P
Q
 
I
I
 
T
G
 
G
R
 
D
P
 
K
-
 
K
-
 
K
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
V
Y
 
V
V
 
V
Q
 
Q
M
 
A
E
 
E
D
 
D
E
|
E
I
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
N
T
 
M
V
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
A
W
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
V
K
 
R
A
 
A
M
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
F
 
F
S
 
S
L
 
L
M
 
M
Q
 
V
E
 
E
H
 
G
I
 
L
G
 
G
Y
 
W
G
 
A
V
 
G
M
 
M
T
 
N
E
 
E
T
 
V
P
 
P
F
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
T
D
 
Y
V
 
Y
Q
 
I
R
|
R
G
 
G
S
 
G
P
 
P
S
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
T
 
T
M
 
R
A
 
T
S
 
A
Q
 
Q
S
 
S
D
 
D
M
 
L
M
 
I
Q
 
F
A
 
P
K
 
I
W
 
F
G
 
A
S
 
G
H
 
H
G
 
G
D
 
E
Y
 
F
Q
 
P
I
 
K
I
 
I
A
 
V
F
 
L
A
 
A
P
 
S
S
 
G
S
 
D
V
 
H
Q
 
A
E
 
E
C
 
A
F
 
F
E
 
K
Y
 
D
T
 
A
I
 
I
K
 
W
A
 
A
F
 
L
N
 
N
M
 
L
S
 
A
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
R
 
Q
V
 
T
P
 
P
A
 
V
F
 
I
V
 
H
M
 
L
S
 
V
D
 
E
E
 
K
I
 
T
V
 
L
G
 
A
H
 
N
M
 
S
R
 
Y
E
 
S
K
 
-
L
 
-
V
 
T
I
 
I
P
 
P
E
 
Y
E
 
E
I
 
K
E
 
L
I
 
K
I
 
A
N
 
E
R
 
R
K
 
G
E
 
K
G
 
I
L
 
V
G
 
Y
K
 
K
Y
 
R
P
 
F
F
 
K
Y
 
F
P
 
T
E
 
E
E
 
D
D
 
G
L
 
I
I
 
S
P
 
P
K
 
R
M
 
-
P
 
-
T
 
A
F
 
F
G
 
L
N
 
G
G
 
K
W
 
A
N
 
T
T
 
M
H
 
Y
V
 
Y
T
 
T
G
 
G
L
 
D
T
 
E
H
 
H
S
 
N
E
 
E
K
 
E
G
 
G
Y
 
H
-
 
I
-
 
S
P
 
E
D
 
D
A
 
V
A
 
V
S
 
N
K
 
R
P
 
T
A
 
M
E
 
M
H
 
Y
H
 
E
K
 
K
L
 
R
V
 
M
K
 
K
R
 
K
L
 
L
N
 
-
D
 
-
K
 
-
I
 
-
L
 
-
N
 
-
N
 
E
L
 
V
K
 
A
D
 
D
I
 
K
V
 
E
S
 
I
Y
 
P
E
 
E
E
 
E
K
 
S
Y
 
R
L
 
V
D
 
K
D
 
I
C
 
Y
G
 
G
D
 
D
V
 
L
-
 
N
-
 
S
V
 
L
V
 
I
V
 
I
S
 
T
Y
 
W
G
 
G
A
 
S
P
 
P
S
 
T
R
 
G
S
 
V
A
 
L
E
 
R
T
 
D
A
 
I
V
 
L
N
 
E
E
 
E
L
 
-
R
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
S
A
 
F
G
 
T
I
 
L
L
 
L
R
 
Q
L
 
I
E
 
R
T
 
M
V
 
F
W
 
S
P
 
P
F
 
F
P
 
P
D
 
K
Y
 
N
K
 
L
I
 
V
L
 
S
E
 
K
I
 
L
A
 
M
K
 
E
K
 
G
T
 
R
E
 
D
K
 
K
I
 
I
I
 
I
I
 
T
P
 
V
E
 
E
M
 
G
N
 
N
F
 
Y

9bt4A Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase from methanosarcina acetivorans (see paper)
25% identity, 98% coverage: 9:376/377 of query aligns to 7:379/402 of 9bt4A

query
sites
9bt4A
K
 
K
P
 
A
G
 
K
T
 
M
Y
 
V
F
 
V
M
 
V
Q
 
E
G
 
G
N
 
S
E
 
Y
A
 
A
C
 
V
A
 
A
E
 
H
G
 
A
A
 
A
L
 
K
S
 
V
A
 
S
G
 
R
C
 
P
N
 
N
F
 
V
F
 
I
G
 
S
G
 
A
Y
 
Y
P
|
P
I
|
I
T
 
T
P
 
P
S
 
Q
S
 
T
E
 
H
V
 
I
A
 
V
E
 
E
R
 
D
L
 
L
S
 
S
K
 
Q
R
 
F
L
 
M
P
 
A
Q
 
D
I
 
G
G
 
E
R
 
I
P
 
P
-
 
N
-
 
C
-
 
E
Y
 
Y
V
 
I
Q
 
N
M
 
V
E
 
E
D
 
S
E
|
E
I
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
I
A
 
S
T
 
A
V
 
L
L
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
S
W
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
R
A
 
T
M
 
Y
T
 
S
A
 
A
T
 
T
S
 
T
G
 
S
P
 
Q
G
 
G
F
 
L
S
 
L
L
 
L
M
 
M
Q
 
H
E
 
E
H
 
V
I
 
L
G
 
F
Y
 
N
G
 
A
V
 
A
M
 
G
T
 
M
E
 
R
T
 
L
P
 
P
F
 
I
V
 
V
L
 
M
V
 
T
D
 
V
V
 
A
Q
 
N
R
 
R
G
 
A
S
 
V
P
 
S
S
 
A
T
 
P
G
 
I
Q
 
N
P
 
I
T
 
W
M
 
N
A
 
D
S
 
H
Q
 
Q
S
 
D
D
 
S
M
 
I
M
 
A
Q
 
Q
A
 
R
K
 
D
W
 
T
G
 
G
S
 
W
H
 
L
G
 
Q
D
 
L
Y
 
Y
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
P
 
A
S
 
E
S
 
D
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
C
 
A
F
 
A
E
 
D
Y
 
M
T
 
V
I
 
P
K
 
Q
A
 
I
F
 
F
N
 
K
M
 
I
S
 
A
E
 
E
K
 
D
Y
 
K
R
 
D
V
 
V
-
 
L
-
 
L
P
 
P
A
 
G
F
 
M
V
 
A
M
 
C
S
 
M
D
 
D
E
 
G
-
 
F
I
 
I
V
 
L
G
 
S
H
 
H
M
 
V
R
 
Y
E
 
E
K
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
L
P
 
L
E
 
E
E
 
Q
I
 
-
E
 
D
I
 
L
I
 
T
N
 
D
R
 
-
K
 
-
E
 
E
G
 
F
L
 
L
G
 
P
K
 
K
Y
 
Y
P
 
E
F
 
-
Y
 
-
P
 
P
E
 
E
E
 
Y
D
 
V
L
 
L
I
 
D
P
 
P
K
 
K
M
 
N
P
 
P
-
 
L
T
 
T
F
 
F
G
 
G
N
 
A
G
 
F
W
 
A
N
 
D
-
 
P
-
 
S
T
 
T
H
 
Y
V
 
T
T
 
E
G
 
F
L
 
R
T
 
Y
H
 
L
S
 
Q
E
 
E
K
 
K
G
 
A
Y
 
M
P
 
Q
D
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
P
K
 
K
P
 
I
A
 
E
E
 
A
H
 
V
H
 
S
K
 
K
L
 
E
V
 
F
K
 
A
R
 
E
L
 
I
N
 
Y
D
 
G
K
 
R
I
 
D
L
 
H
N
 
G
N
 
G
L
 
L
K
 
I
D
 
D
I
 
G
V
 
Y
S
 
Q
Y
 
L
E
 
E
E
 
D
K
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
C
 
-
G
 
A
D
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
I
V
 
M
S
 
A
Y
 
M
G
 
G
A
 
S
P
 
L
S
 
V
R
 
G
S
 
T
A
 
L
E
 
K
T
 
D
A
 
V
V
 
V
N
 
D
E
 
R
L
 
Y
R
 
R
E
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
E
S
 
K
A
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
L
R
 
K
L
 
V
E
 
R
T
 
S
V
 
F
W
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
P
D
 
K
Y
 
M
K
 
Q
I
 
I
L
 
R
E
 
K
I
 
A
A
 
L
K
 
A
K
 
N
T
 
A
E
 
N
K
 
A
I
 
V
I
 
V
I
 
V
P
 
L
E
 
D
M
 
K
N
 
N
F
 
I
-
 
S
-
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
N
-
 
E
G
 
G
Q
 
A
I
 
L
S
 
F
R
 
T
E
 
E
V
 
T
Q
 
K
R
 
A
A
 
C
S
 
M
-
 
Y
K
 
N
G
 
S
H
 
R
C
 
C
E
 
D
V
 
I
S
 
P
L
 
I
V
 
I
G
 
G
K
 
Y
T
 
T
-
 
L
-
 
N
-
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
R
-
 
D
-
 
V
-
 
S
I
 
V
H
 
Q
V
 
L
P
 
V
E
 
E
E
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
E
E
 
E

6cioA Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase from moorella thermoacetica with lactyl-tpp bound (see paper)
23% identity, 79% coverage: 36:334/377 of query aligns to 25:321/1164 of 6cioA

query
sites
6cioA
Y
 
Y
P
|
P
I
|
I
T
|
T
P
 
P
S
 
S
S
 
S
E
 
P
V
 
M
A
 
A
E
 
E
R
 
-
L
 
I
S
 
A
K
 
D
R
 
E
L
 
W
P
 
A
Q
 
A
I
 
H
G
 
G
R
 
R
P
 
K
Y
 
N
V
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
Q
-
 
V
-
 
A
Q
 
E
M
 
M
E
 
Q
D
 
S
E
|
E
I
 
A
S
 
G
A
 
A
L
 
A
A
 
G
T
 
A
V
 
V
L
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
L
W
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
L
A
 
T
M
 
T
T
 
T
A
 
F
T
 
T
S
 
A
G
 
S
P
x
Q
G
 
G
F
 
L
S
 
L
L
 
L
M
 
M
Q
 
I
E
 
P
H
 
N
I
 
M
G
 
-
Y
 
Y
G
 
K
V
 
I
M
 
A
T
 
G
E
 
E
T
 
L
-
 
L
P
 
P
F
 
C
V
 
V
L
 
F
V
 
H
D
 
V
V
 
A
Q
 
A
R
|
R
G
 
A
S
 
L
P
 
S
S
 
T
T
 
H
G
 
A
Q
 
L
P
 
S
T
 
I
M
 
F
A
 
G
S
 
D
Q
 
H
S
 
A
D
 
D
M
 
V
M
 
M
Q
 
A
A
 
A
K
 
R
W
 
Q
G
 
T
S
 
G
H
 
F
G
 
A
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
A
 
M
F
 
L
A
 
S
P
 
S
S
 
A
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
C
 
V
F
 
M
E
 
D
Y
 
L
T
 
A
I
 
L
K
 
V
A
 
A
F
 
H
N
 
L
M
 
A
S
 
T
E
 
L
K
 
K
Y
 
A
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
F
F
 
V
V
 
H
M
 
F
S
 
F
D
 
D
E
 
G
I
 
F
-
 
R
V
 
T
G
 
S
H
 
H
M
 
E
R
 
V
E
 
Q
K
 
K
L
 
I
V
 
D
I
 
V
P
 
I
E
 
E
E
 
-
I
 
Y
E
 
E
I
 
D
I
 
M
N
 
A
R
 
K
K
 
L
E
 
V
G
 
D
L
 
W
G
 
D
K
 
A
Y
 
I
P
 
R
F
 
A
Y
 
F
P
 
R
E
 
Q
E
 
R
D
 
A
L
 
L
I
 
N
P
 
P
K
 
E
M
 
H
P
 
P
T
 
-
F
 
-
G
 
-
N
 
-
G
 
-
W
 
-
N
 
-
T
 
-
H
 
H
V
 
Q
T
 
R
G
 
G
L
 
T
T
 
A
H
 
Q
S
 
N
E
 
P
K
 
D
G
 
I
Y
 
Y
P
 
F
D
 
Q
A
 
S
A
 
R
S
 
E
K
 
A
P
 
A
A
 
N
E
 
P
H
 
Y
H
 
Y
K
 
L
L
 
A
V
 
T
K
 
P
R
 
G
L
 
I
N
 
V
D
 
A
K
 
Q
I
 
V
L
 
M
N
 
E
N
 
Q
L
 
V
K
 
A
D
 
G
I
 
L
V
 
T
S
 
G
Y
 
R
E
 
H
E
 
Y
K
 
H
Y
 
L
L
 
F
D
 
D
D
 
Y
C
 
A
G
 
G
-
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
A
D
 
E
V
 
R
V
 
V
V
 
I
V
 
V
S
 
S
Y
 
M
G
 
G
A
 
S
P
 
S
S
 
C
R
 
E
S
 
V
A
 
I
E
 
E
T
 
E
A
 
T
V
 
V
N
 
N
E
 
Y
L
 
L
R
 
V
E
 
E
K
 
K
G
 
G
V
 
E
S
 
K
A
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
I
R
 
K
L
 
V
E
 
R
T
 
L
V
 
F
W
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
S
D
 
A
Y
 
E
K
 
H
I
 
F
L
 
L
E
 
K
I
 
V
A
 
L
K
 
P
K
 
A
T
 
S
E
 
V
K
 
K
I
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

6cipA Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase from moorella thermoacetica with acetyl-tpp bound (see paper)
23% identity, 79% coverage: 36:334/377 of query aligns to 25:321/1165 of 6cipA

query
sites
6cipA
Y
 
Y
P
 
P
I
|
I
T
|
T
P
 
P
S
 
S
S
 
S
E
 
P
V
 
M
A
 
A
E
 
E
R
 
-
L
 
I
S
 
A
K
 
D
R
 
E
L
 
W
P
 
A
Q
 
A
I
 
H
G
 
G
R
 
R
P
 
K
Y
 
N
V
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
Q
-
 
V
-
 
A
Q
 
E
M
 
M
E
 
Q
D
 
S
E
|
E
I
 
A
S
 
G
A
 
A
L
 
A
A
 
G
T
 
A
V
 
V
L
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
L
W
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
L
A
 
T
M
 
T
T
 
T
A
 
F
T
 
T
S
 
A
G
 
S
P
x
Q
G
 
G
F
 
L
S
 
L
L
 
L
M
 
M
Q
 
I
E
 
P
H
 
N
I
 
M
G
 
-
Y
 
Y
G
 
K
V
 
I
M
 
A
T
 
G
E
 
E
T
 
L
-
 
L
P
 
P
F
 
C
V
 
V
L
 
F
V
 
H
D
 
V
V
 
A
Q
 
A
R
|
R
G
 
A
S
 
L
P
 
S
S
 
T
T
 
H
G
 
A
Q
 
L
P
 
S
T
 
I
M
 
F
A
 
G
S
 
D
Q
 
H
S
 
A
D
 
D
M
 
V
M
 
M
Q
 
A
A
 
A
K
 
R
W
 
Q
G
 
T
S
 
G
H
 
F
G
 
A
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
A
 
M
F
 
L
A
 
S
P
 
S
S
 
A
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
C
 
V
F
 
M
E
 
D
Y
 
L
T
 
A
I
 
L
K
 
V
A
 
A
F
 
H
N
 
L
M
 
A
S
 
T
E
 
L
K
 
K
Y
 
A
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
F
F
 
V
V
 
H
M
 
F
S
 
F
D
 
D
E
 
G
I
 
F
-
 
R
V
 
T
G
 
S
H
 
H
M
 
E
R
 
V
E
 
Q
K
 
K
L
 
I
V
 
D
I
 
V
P
 
I
E
 
E
E
 
-
I
 
Y
E
 
E
I
 
D
I
 
M
N
 
A
R
 
K
K
 
L
E
 
V
G
 
D
L
 
W
G
 
D
K
 
A
Y
 
I
P
 
R
F
 
A
Y
 
F
P
 
R
E
 
Q
E
 
R
D
 
A
L
 
L
I
 
N
P
 
P
K
 
E
M
 
H
P
 
P
T
 
-
F
 
-
G
 
-
N
 
-
G
 
-
W
 
-
N
 
-
T
 
-
H
 
H
V
 
Q
T
 
R
G
 
G
L
 
T
T
 
A
H
 
Q
S
 
N
E
 
P
K
 
D
G
 
I
Y
 
Y
P
 
F
D
 
Q
A
 
S
A
 
R
S
 
E
K
 
A
P
 
A
A
 
N
E
 
P
H
 
Y
H
 
Y
K
 
L
L
 
A
V
 
T
K
 
P
R
 
G
L
 
I
N
 
V
D
 
A
K
 
Q
I
 
V
L
 
M
N
 
E
N
 
Q
L
 
V
K
 
A
D
 
G
I
 
L
V
 
T
S
 
G
Y
 
R
E
 
H
E
 
Y
K
 
H
Y
 
L
L
 
F
D
 
D
D
 
Y
C
 
A
G
 
G
-
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
A
D
 
E
V
 
R
V
 
V
V
 
I
V
 
V
S
 
S
Y
 
M
G
 
G
A
 
S
P
 
S
S
 
C
R
 
E
S
 
V
A
 
I
E
 
E
T
 
E
A
 
T
V
 
V
N
 
N
E
 
Y
L
 
L
R
 
V
E
 
E
K
 
K
G
 
G
V
 
E
S
 
K
A
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
I
R
 
K
L
 
V
E
 
R
T
 
L
V
 
F
W
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
S
D
 
A
Y
 
E
K
 
H
I
 
F
L
 
L
E
 
K
I
 
V
A
 
L
K
 
P
K
 
A
T
 
S
E
 
V
K
 
K
I
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

6ciqA Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase from moorella thermoacetica with coenzyme a bound (see paper)
23% identity, 79% coverage: 36:334/377 of query aligns to 25:321/1169 of 6ciqA

query
sites
6ciqA
Y
 
Y
P
|
P
I
|
I
T
|
T
P
 
P
S
 
S
S
 
S
E
 
P
V
 
M
A
 
A
E
 
E
R
 
-
L
 
I
S
 
A
K
 
D
R
 
E
L
 
W
P
 
A
Q
 
A
I
 
H
G
 
G
R
 
R
P
 
K
Y
 
N
V
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
Q
-
 
V
-
 
A
Q
 
E
M
 
M
E
 
Q
D
 
S
E
|
E
I
 
A
S
 
G
A
 
A
L
 
A
A
 
G
T
 
A
V
 
V
L
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
L
W
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
L
A
 
T
M
 
T
T
 
T
A
 
F
T
 
T
S
 
A
G
 
S
P
x
Q
G
 
G
F
 
L
S
 
L
L
 
L
M
 
M
Q
 
I
E
 
P
H
 
N
I
 
M
G
 
-
Y
 
Y
G
 
K
V
 
I
M
 
A
T
 
G
E
 
E
T
 
L
-
 
L
P
 
P
F
 
C
V
 
V
L
 
F
V
 
H
D
 
V
V
 
A
Q
 
A
R
|
R
G
 
A
S
 
L
P
 
S
S
 
T
T
 
H
G
 
A
Q
 
L
P
 
S
T
 
I
M
 
F
A
 
G
S
 
D
Q
 
H
S
 
A
D
 
D
M
 
V
M
 
M
Q
 
A
A
 
A
K
 
R
W
 
Q
G
 
T
S
 
G
H
 
F
G
 
A
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
A
 
M
F
 
L
A
 
S
P
 
S
S
 
A
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
C
 
V
F
 
M
E
 
D
Y
 
L
T
 
A
I
 
L
K
 
V
A
 
A
F
 
H
N
 
L
M
 
A
S
 
T
E
 
L
K
 
K
Y
 
A
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
F
F
 
V
V
 
H
M
 
F
S
 
F
D
 
D
E
 
G
I
 
F
-
 
R
V
 
T
G
 
S
H
 
H
M
 
E
R
 
V
E
 
Q
K
 
K
L
 
I
V
 
D
I
 
V
P
 
I
E
 
E
E
 
-
I
 
Y
E
 
E
I
 
D
I
 
M
N
 
A
R
 
K
K
 
L
E
 
V
G
 
D
L
 
W
G
 
D
K
 
A
Y
 
I
P
 
R
F
 
A
Y
 
F
P
 
R
E
 
Q
E
 
R
D
 
A
L
 
L
I
 
N
P
 
P
K
 
E
M
 
H
P
 
P
T
 
-
F
 
-
G
 
-
N
 
-
G
 
-
W
 
-
N
 
-
T
 
-
H
 
H
V
 
Q
T
 
R
G
 
G
L
 
T
T
 
A
H
 
Q
S
 
N
E
 
P
K
 
D
G
 
I
Y
 
Y
P
 
F
D
 
Q
A
 
S
A
 
R
S
 
E
K
 
A
P
 
A
A
 
N
E
 
P
H
 
Y
H
 
Y
K
 
L
L
 
A
V
 
T
K
 
P
R
 
G
L
 
I
N
 
V
D
 
A
K
 
Q
I
 
V
L
 
M
N
 
E
N
 
Q
L
 
V
K
 
A
D
 
G
I
 
L
V
 
T
S
 
G
Y
 
R
E
 
H
E
 
Y
K
 
H
Y
 
L
L
 
F
D
 
D
D
 
Y
C
 
A
G
 
G
-
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
A
D
 
E
V
 
R
V
 
V
V
 
I
V
 
V
S
 
S
Y
 
M
G
 
G
A
 
S
P
 
S
S
 
C
R
 
E
S
 
V
A
 
I
E
 
E
T
 
E
A
 
T
V
 
V
N
 
N
E
 
Y
L
 
L
R
 
V
E
 
E
K
 
K
G
 
G
V
 
E
S
 
K
A
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
I
R
 
K
L
 
V
E
 
R
T
 
L
V
 
F
W
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
S
D
 
A
Y
 
E
K
 
H
I
 
F
L
 
L
E
 
K
I
 
V
A
 
L
K
 
P
K
 
A
T
 
S
E
 
V
K
 
K
I
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

6cinB Crystal structure of pyruvate:ferredoxin oxidoreductase from moorella thermoacetica (see paper)
23% identity, 79% coverage: 36:334/377 of query aligns to 25:321/1169 of 6cinB

query
sites
6cinB
Y
 
Y
P
|
P
I
|
I
T
|
T
P
 
P
S
 
S
S
 
S
E
 
P
V
 
M
A
 
A
E
 
E
R
 
-
L
 
I
S
 
A
K
 
D
R
 
E
L
 
W
P
 
A
Q
 
A
I
 
H
G
 
G
R
 
R
P
 
K
Y
 
N
V
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
Q
-
 
V
-
 
A
Q
 
E
M
 
M
E
 
Q
D
 
S
E
|
E
I
 
A
S
 
G
A
 
A
L
 
A
A
 
G
T
 
A
V
 
V
L
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
L
W
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
L
A
 
T
M
 
T
T
 
T
A
 
F
T
 
T
S
 
A
G
 
S
P
 
Q
G
 
G
F
 
L
S
 
L
L
 
L
M
 
M
Q
 
I
E
 
P
H
 
N
I
 
M
G
 
-
Y
 
Y
G
 
K
V
 
I
M
 
A
T
 
G
E
 
E
T
 
L
-
 
L
P
 
P
F
 
C
V
 
V
L
 
F
V
 
H
D
 
V
V
 
A
Q
 
A
R
|
R
G
 
A
S
 
L
P
 
S
S
 
T
T
 
H
G
 
A
Q
 
L
P
 
S
T
 
I
M
 
F
A
 
G
S
 
D
Q
 
H
S
 
A
D
 
D
M
 
V
M
 
M
Q
 
A
A
 
A
K
 
R
W
 
Q
G
 
T
S
 
G
H
 
F
G
 
A
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
A
 
M
F
 
L
A
 
S
P
 
S
S
 
A
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
C
 
V
F
 
M
E
 
D
Y
 
L
T
 
A
I
 
L
K
 
V
A
 
A
F
 
H
N
 
L
M
 
A
S
 
T
E
 
L
K
 
K
Y
 
A
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
F
F
 
V
V
 
H
M
 
F
S
 
F
D
 
D
E
 
G
I
 
F
-
 
R
V
 
T
G
 
S
H
 
H
M
 
E
R
 
V
E
 
Q
K
 
K
L
 
I
V
 
D
I
 
V
P
 
I
E
 
E
E
 
-
I
 
Y
E
 
E
I
 
D
I
 
M
N
 
A
R
 
K
K
 
L
E
 
V
G
 
D
L
 
W
G
 
D
K
 
A
Y
 
I
P
 
R
F
 
A
Y
 
F
P
 
R
E
 
Q
E
 
R
D
 
A
L
 
L
I
 
N
P
 
P
K
 
E
M
 
H
P
 
P
T
 
-
F
 
-
G
 
-
N
 
-
G
 
-
W
 
-
N
 
-
T
 
-
H
 
H
V
 
Q
T
 
R
G
 
G
L
 
T
T
 
A
H
 
Q
S
 
N
E
 
P
K
 
D
G
 
I
Y
 
Y
P
 
F
D
 
Q
A
 
S
A
 
R
S
 
E
K
 
A
P
 
A
A
 
N
E
 
P
H
 
Y
H
 
Y
K
 
L
L
 
A
V
 
T
K
 
P
R
 
G
L
 
I
N
 
V
D
 
A
K
 
Q
I
 
V
L
 
M
N
 
E
N
 
Q
L
 
V
K
 
A
D
 
G
I
 
L
V
 
T
S
 
G
Y
 
R
E
 
H
E
 
Y
K
 
H
Y
 
L
L
 
F
D
 
D
D
 
Y
C
 
A
G
 
G
-
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
A
D
 
E
V
 
R
V
 
V
V
 
I
V
 
V
S
 
S
Y
 
M
G
 
G
A
 
S
P
 
S
S
 
C
R
 
E
S
 
V
A
 
I
E
 
E
T
 
E
A
 
T
V
 
V
N
 
N
E
 
Y
L
 
L
R
 
V
E
 
E
K
 
K
G
 
G
V
 
E
S
 
K
A
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
I
R
 
K
L
 
V
E
 
R
T
 
L
V
 
F
W
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
S
D
 
A
Y
 
E
K
 
H
I
 
F
L
 
L
E
 
K
I
 
V
A
 
L
K
 
P
K
 
A
T
 
S
E
 
V
K
 
K
I
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Q2RMD6 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase; PFOR; Pyruvate synthase; EC 1.2.7.1 from Moorella thermoacetica (strain ATCC 39073 / JCM 9320) (see paper)
23% identity, 79% coverage: 36:334/377 of query aligns to 26:322/1171 of Q2RMD6

query
sites
Q2RMD6
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
S
S
 
S
E
 
P
V
 
M
A
 
A
E
 
E
R
 
-
L
 
I
S
 
A
K
 
D
R
 
E
L
 
W
P
 
A
Q
 
A
I
 
H
G
 
G
R
 
R
P
 
K
Y
 
N
V
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
Q
-
 
V
-
 
A
Q
 
E
M
 
M
E
 
Q
D
 
S
E
 
E
I
 
A
S
 
G
A
 
A
L
 
A
A
 
G
T
 
A
V
 
V
L
 
H
G
 
G
A
 
S
S
 
L
W
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
L
A
 
T
M
 
T
T
 
T
A
 
F
T
 
T
S
 
A
G
 
S
P
 
Q
G
 
G
F
 
L
S
 
L
L
 
L
M
 
M
Q
 
I
E
 
P
H
 
N
I
 
M
G
 
-
Y
 
Y
G
 
K
V
 
I
M
 
A
T
 
G
E
 
E
T
 
L
-
 
L
P
 
P
F
 
C
V
 
V
L
 
F
V
 
H
D
 
V
V
 
A
Q
 
A
R
 
R
G
 
A
S
 
L
P
 
S
S
 
T
T
 
H
G
 
A
Q
 
L
P
 
S
T
 
I
M
 
F
A
 
G
S
 
D
Q
 
H
S
 
A
D
 
D
M
 
V
M
 
M
Q
 
A
A
 
A
K
 
R
W
 
Q
G
 
T
S
 
G
H
 
F
G
 
A
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
A
 
M
F
 
L
A
 
S
P
 
S
S
 
A
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
C
 
V
F
 
M
E
 
D
Y
 
L
T
 
A
I
 
L
K
 
V
A
 
A
F
 
H
N
 
L
M
 
A
S
 
T
E
 
L
K
 
K
Y
 
A
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
F
F
 
V
V
 
H
M
 
F
S
 
F
D
 
D
E
 
G
I
 
F
-
 
R
V
 
T
G
 
S
H
 
H
M
 
E
R
 
V
E
 
Q
K
 
K
L
 
I
V
 
D
I
 
V
P
 
I
E
 
E
E
 
-
I
 
Y
E
 
E
I
 
D
I
 
M
N
 
A
R
 
K
K
 
L
E
 
V
G
 
D
L
 
W
G
 
D
K
 
A
Y
 
I
P
 
R
F
 
A
Y
 
F
P
 
R
E
 
Q
E
 
R
D
 
A
L
 
L
I
 
N
P
 
P
K
 
E
M
 
H
P
 
P
T
 
-
F
 
-
G
 
-
N
 
-
G
 
-
W
 
-
N
 
-
T
 
-
H
 
H
V
 
Q
T
 
R
G
 
G
L
 
T
T
 
A
H
 
Q
S
 
N
E
 
P
K
 
D
G
 
I
Y
 
Y
P
 
F
D
 
Q
A
 
S
A
 
R
S
 
E
K
 
A
P
 
A
A
 
N
E
 
P
H
 
Y
H
 
Y
K
 
L
L
 
A
V
 
T
K
 
P
R
 
G
L
 
I
N
 
V
D
 
A
K
 
Q
I
 
V
L
 
M
N
 
E
N
 
Q
L
 
V
K
 
A
D
 
G
I
 
L
V
 
T
S
 
G
Y
 
R
E
 
H
E
 
Y
K
 
H
Y
 
L
L
 
F
D
 
D
D
 
Y
C
 
A
G
 
G
-
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
A
D
 
E
V
 
R
V
 
V
V
 
I
V
 
V
S
 
S
Y
 
M
G
 
G
A
 
S
P
 
S
S
 
C
R
 
E
S
 
V
A
 
I
E
 
E
T
 
E
A
 
T
V
 
V
N
 
N
E
 
Y
L
 
L
R
 
V
E
 
E
K
 
K
G
 
G
V
 
E
S
 
K
A
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
I
R
 
K
L
 
V
E
 
R
T
 
L
V
 
F
W
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
S
D
 
A
Y
 
E
K
 
H
I
 
F
L
 
L
E
 
K
I
 
V
A
 
L
K
 
P
K
 
A
T
 
S
E
 
V
K
 
K
I
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011974176.1 NCBI__GCF_000017185.1:WP_011974176.1
MIGKDGKLKPGTYFMQGNEACAEGALSAGCNFFGGYPITPSSEVAERLSKRLPQIGRPYV
QMEDEISALATVLGASWAGAKAMTATSGPGFSLMQEHIGYGVMTETPFVLVDVQRGSPST
GQPTMASQSDMMQAKWGSHGDYQIIAFAPSSVQECFEYTIKAFNMSEKYRVPAFVMSDEI
VGHMREKLVIPEEIEIINRKEGLGKYPFYPEEDLIPKMPTFGNGWNTHVTGLTHSEKGYP
DAASKPAEHHKLVKRLNDKILNNLKDIVSYEEKYLDDCGDVVVVSYGAPSRSAETAVNEL
REKGVSAGILRLETVWPFPDYKILEIAKKTEKIIIPEMNFGQISREVQRASKGHCEVSLV
GKTGGEIHVPEEIINEL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory