SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011975053.1 NCBI__GCF_000017145.1:WP_011975053.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 5 hits to proteins with known functional sites (download)

7npjB Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argc in complex with 6-phenoxy-3-pyridinamine
25% identity, 89% coverage: 34:308/310 of query aligns to 56:329/344 of 7npjB

query
sites
7npjB
P
 
P
E
 
L
A
 
A
E
 
H
R
 
R
R
 
V
N
 
V
A
 
E
A
 
P
M
 
T
R
 
E
E
 
A
D
 
A
L
 
V
L
 
L
N
 
G
S
 
G
A
 
H
D
 
D
I
 
A
A
 
V
I
 
F
L
 
L
C
 
A
L
 
L
P
 
P
-
 
H
-
 
G
-
 
H
-
 
S
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
A
D
 
Q
D
 
Q
A
 
L
S
 
S
R
 
P
E
 
E
A
 
T
V
 
L
A
 
I
M
 
I
V
 
D
A
 
C
G
 
G
N
 
A
N
 
D
R
 
-
V
 
F
R
 
R
I
 
L
I
 
T
D
 
D
T
 
A
S
 
A
T
 
V
A
 
W
H
 
E
R
 
R
V
 
F
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
H
A
 
A
P
 
G
D
 
S
W
 
W
A
 
P
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
A
 
P
E
 
E
M
 
L
D
 
P
K
 
G
A
 
A
Q
 
R
P
 
-
R
 
D
K
 
Q
I
 
L
R
 
R
D
 
G
A
 
T
R
 
R
H
 
R
V
 
I
A
 
A
N
 
V
P
 
P
G
 
G
C
 
C
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
L
L
 
A
I
 
L
R
 
F
P
 
P
L
 
A
R
 
L
Q
 
A
A
 
A
G
 
D
I
 
L
L
 
I
P
 
E
D
 
P
G
 
A
Y
 
-
P
 
-
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
V
A
 
A
V
 
V
S
 
S
G
 
G
Y
 
T
T
 
S
G
 
G
G
 
A
G
|
G
K
x
R
Q
 
A
M
 
A
I
 
T
A
 
T
Q
 
D
I
 
L
E
 
L
D
 
G
D
 
A
K
 
E
S
 
V
P
 
I
D
 
G
H
 
S
I
 
A
R
 
R
A
 
A
P
 
-
H
 
-
F
 
-
L
 
-
Y
 
Y
G
 
N
L
 
I
T
 
A
L
 
G
K
 
V
H
 
H
K
 
R
H
 
H
V
 
T
P
 
P
E
 
E
M
 
I
K
 
A
-
 
Q
-
 
G
M
 
L
H
 
R
G
 
A
L
 
V
L
 
T
E
 
D
R
 
R
-
 
D
-
 
V
A
 
S
P
 
V
V
 
S
F
 
F
S
 
T
P
 
P
S
 
V
V
 
L
G
 
I
K
 
P
F
 
A
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
M
 
I
I
 
L
V
 
A
Q
 
T
V
 
C
P
 
T
L
 
A
Y
 
R
V
 
T
D
 
R
D
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
S
T
 
P
I
 
L
E
 
S
S
 
Q
I
 
L
H
 
R
R
 
A
A
 
A
L
 
Y
V
 
E
D
 
K
H
 
A
Y
 
Y
A
 
H
G
 
A
Q
 
E
S
 
P
I
 
F
V
 
I
E
 
Y
V
 
L
V
 
M
P
 
P
L
 
-
E
 
-
E
 
-
S
 
E
A
 
G
K
 
Q
L
 
L
A
 
P
R
 
R
I
 
T
D
 
G
A
 
A
T
 
-
E
 
-
L
 
V
A
 
I
G
 
G
K
 
S
D
 
N
T
 
A
M
 
A
K
 
H
L
 
I
F
 
A
V
 
V
F
 
A
G
 
V
T
 
D
D
 
E
G
 
D
G
 
A
A
 
Q
H
 
T
V
 
F
N
 
V
M
 
A
V
 
I
A
 
A
L
 
A
L
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
x
T
S
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
S
M
 
M
D
 
N
L
 
L
M
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7nphC Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argc in complex with 5-methoxy-1,3-benzoxazole-2-carboxylic acid
25% identity, 89% coverage: 34:308/310 of query aligns to 56:329/344 of 7nphC

query
sites
7nphC
P
 
P
E
 
L
A
 
A
E
 
H
R
 
R
R
 
V
N
 
V
A
 
E
A
 
P
M
 
T
R
 
E
E
 
A
D
 
A
L
 
V
L
 
L
N
 
G
S
 
G
A
 
H
D
 
D
I
 
A
A
 
V
I
 
F
L
 
L
C
 
A
L
|
L
P
 
P
-
 
H
-
 
G
-
 
H
-
 
S
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
A
D
 
Q
D
 
Q
A
 
L
S
 
S
R
 
P
E
 
E
A
 
T
V
 
L
A
 
I
M
 
I
V
 
D
A
 
C
G
 
G
N
 
A
N
 
D
R
 
-
V
 
F
R
 
R
I
 
L
I
 
T
D
 
D
T
 
A
S
 
A
T
 
V
A
 
W
H
 
E
R
 
R
V
 
F
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
H
A
 
A
P
 
G
D
 
S
W
 
W
A
 
P
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
A
 
P
E
 
E
M
 
L
D
 
P
K
 
G
A
 
A
Q
 
R
P
 
-
R
 
D
K
 
Q
I
 
L
R
 
R
D
 
G
A
 
T
R
 
R
H
 
R
V
 
I
A
 
A
N
 
V
P
 
P
G
 
G
C
 
C
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
L
L
 
A
I
 
L
R
 
F
P
 
P
L
 
A
R
 
L
Q
 
A
A
 
A
G
 
D
I
 
L
L
 
I
P
 
E
D
 
P
G
 
A
Y
 
-
P
 
-
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
V
A
 
A
V
 
V
S
 
S
G
 
G
Y
 
T
T
 
S
G
 
G
G
 
A
G
|
G
K
x
R
Q
 
A
M
 
A
I
 
T
A
 
T
Q
 
D
I
 
L
E
 
L
D
 
G
D
 
A
K
 
E
S
 
V
P
 
I
D
 
G
H
 
S
I
 
A
R
 
R
A
 
A
P
 
-
H
 
-
F
 
-
L
 
-
Y
 
Y
G
 
N
L
 
I
T
 
A
L
 
G
K
 
V
H
 
H
K
 
R
H
 
H
V
 
T
P
 
P
E
 
E
M
 
I
K
 
A
-
 
Q
-
 
G
M
 
L
H
 
R
G
 
A
L
 
V
L
 
T
E
 
D
R
 
R
-
 
D
-
 
V
A
 
S
P
 
V
V
 
S
F
 
F
S
 
T
P
 
P
S
 
V
V
 
L
G
 
I
K
 
P
F
 
A
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
M
 
I
I
 
L
V
 
A
Q
 
T
V
 
C
P
 
T
L
 
A
Y
 
R
V
 
T
D
 
R
D
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
S
T
 
P
I
 
L
E
 
S
S
 
Q
I
 
L
H
 
R
R
 
A
A
 
A
L
 
Y
V
 
E
D
 
K
H
 
A
Y
 
Y
A
 
H
G
 
A
Q
 
E
S
 
P
I
 
F
V
 
I
E
 
Y
V
 
L
V
 
M
P
 
P
L
 
-
E
 
-
E
 
-
S
 
E
A
 
G
K
 
Q
L
 
L
A
 
P
R
 
R
I
 
T
D
 
G
A
 
A
T
 
-
E
 
-
L
 
V
A
 
I
G
 
G
K
 
S
D
 
N
T
 
A
M
 
A
K
 
H
L
 
I
F
 
A
V
 
V
F
 
A
G
 
V
T
 
D
D
 
E
G
 
D
G
 
A
A
 
Q
H
 
T
V
 
F
N
 
V
M
 
A
V
 
I
A
 
A
L
 
A
L
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
T
S
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
S
M
 
M
D
 
N
L
 
L
M
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7notA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argc in complex with nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADP+) and 5-methoxy-3- indoleacetic acid
25% identity, 89% coverage: 34:308/310 of query aligns to 56:329/344 of 7notA

query
sites
7notA
P
 
P
E
 
L
A
 
A
E
 
H
R
 
R
R
 
V
N
 
V
A
 
E
A
 
P
M
 
T
R
 
E
E
 
A
D
 
A
L
 
V
L
 
L
N
 
G
S
 
G
A
 
H
D
 
D
I
 
A
A
 
V
I
 
F
L
 
L
C
 
A
L
 
L
P
 
P
-
 
H
-
 
G
-
 
H
-
 
S
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
A
D
 
Q
D
 
Q
A
 
L
S
 
S
R
 
P
E
 
E
A
 
T
V
 
L
A
 
I
M
 
I
V
 
D
A
 
C
G
 
G
N
 
A
N
 
D
R
 
-
V
 
F
R
 
R
I
 
L
I
 
T
D
 
D
T
 
A
S
 
A
T
 
V
A
 
W
H
 
E
R
 
R
V
 
F
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
H
A
 
A
P
 
G
D
 
S
W
 
W
A
 
P
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
A
 
P
E
 
E
M
 
L
D
 
P
K
 
G
A
 
A
Q
 
R
P
 
-
R
 
D
K
 
Q
I
 
L
R
 
R
D
 
G
A
 
T
R
 
R
H
 
R
V
 
I
A
 
A
N
 
V
P
 
P
G
 
G
C
 
C
Y
|
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
L
L
 
A
I
 
L
R
 
F
P
 
P
L
 
A
R
 
L
Q
 
A
A
 
A
G
 
D
I
 
L
L
 
I
P
 
E
D
 
P
G
 
A
Y
 
-
P
 
-
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
V
A
 
A
V
 
V
S
 
S
G
 
G
Y
 
T
T
 
S
G
|
G
G
x
A
G
 
G
K
 
R
Q
 
A
M
 
A
I
 
T
A
 
T
Q
 
D
I
 
L
E
 
L
D
 
G
D
 
A
K
 
E
S
 
V
P
 
I
D
 
G
H
 
S
I
 
A
R
 
R
A
 
A
P
 
-
H
 
-
F
 
-
L
 
-
Y
|
Y
G
 
N
L
 
I
T
 
A
L
 
G
K
 
V
H
|
H
K
 
R
H
 
H
V
 
T
P
 
P
E
 
E
M
 
I
K
 
A
-
 
Q
-
 
G
M
 
L
H
 
R
G
 
A
L
 
V
L
 
T
E
 
D
R
 
R
-
 
D
-
 
V
A
 
S
P
 
V
V
 
S
F
 
F
S
 
T
P
 
P
S
 
V
V
x
L
G
 
I
K
 
P
F
 
A
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
M
 
I
I
 
L
V
 
A
Q
 
T
V
 
C
P
 
T
L
 
A
Y
 
R
V
 
T
D
 
R
D
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
S
T
 
P
I
 
L
E
 
S
S
 
Q
I
 
L
H
 
R
R
 
A
A
 
A
L
 
Y
V
 
E
D
 
K
H
 
A
Y
 
Y
A
 
H
G
 
A
Q
 
E
S
 
P
I
 
F
V
 
I
E
 
Y
V
 
L
V
 
M
P
 
P
L
 
-
E
 
-
E
 
-
S
 
E
A
 
G
K
 
Q
L
 
L
A
 
P
R
 
R
I
 
T
D
 
G
A
 
A
T
 
-
E
 
-
L
 
V
A
 
I
G
 
G
K
 
S
D
 
N
T
 
A
M
 
A
K
 
H
L
 
I
F
 
A
V
 
V
F
 
A
G
 
V
T
 
D
D
 
E
G
 
D
G
 
A
A
 
Q
H
 
T
V
 
F
N
 
V
M
 
A
V
 
I
A
 
A
L
 
A
L
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
T
S
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
S
M
 
M
D
 
N
L
 
L
M
 
A
L
 
L

7nnrA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argc in complex with xanthene-9-carboxylic acid
25% identity, 89% coverage: 34:308/310 of query aligns to 56:329/344 of 7nnrA

query
sites
7nnrA
P
 
P
E
 
L
A
 
A
E
 
H
R
 
R
R
 
V
N
 
V
A
 
E
A
 
P
M
 
T
R
 
E
E
 
A
D
 
A
L
 
V
L
 
L
N
 
G
S
 
G
A
 
H
D
 
D
I
 
A
A
 
V
I
 
F
L
 
L
C
 
A
L
 
L
P
 
P
-
x
H
-
 
G
-
 
H
-
 
S
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
A
D
 
Q
D
 
Q
A
 
L
S
 
S
R
 
P
E
 
E
A
 
T
V
 
L
A
 
I
M
 
I
V
 
D
A
 
C
G
 
G
N
 
A
N
 
D
R
 
-
V
 
F
R
 
R
I
 
L
I
 
T
D
 
D
T
 
A
S
 
A
T
 
V
A
 
W
H
 
E
R
 
R
V
 
F
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
H
A
 
A
P
 
G
D
 
S
W
 
W
A
 
P
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
A
 
P
E
 
E
M
 
L
D
 
P
K
 
G
A
 
A
Q
 
R
P
 
-
R
 
D
K
 
Q
I
 
L
R
 
R
D
 
G
A
 
T
R
 
R
H
 
R
V
 
I
A
 
A
N
 
V
P
 
P
G
 
G
C
 
C
Y
|
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
L
L
 
A
I
 
L
R
 
F
P
 
P
L
 
A
R
 
L
Q
 
A
A
 
A
G
 
D
I
 
L
L
 
I
P
 
E
D
 
P
G
 
A
Y
 
-
P
 
-
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
V
A
 
A
V
 
V
S
|
S
G
 
G
Y
 
T
T
 
S
G
|
G
G
x
A
G
 
G
K
 
R
Q
 
A
M
 
A
I
 
T
A
 
T
Q
 
D
I
 
L
E
 
L
D
 
G
D
 
A
K
 
E
S
 
V
P
 
I
D
 
G
H
 
S
I
 
A
R
 
R
A
 
A
P
 
-
H
 
-
F
 
-
L
 
-
Y
|
Y
G
 
N
L
 
I
T
 
A
L
 
G
K
 
V
H
|
H
K
 
R
H
 
H
V
 
T
P
 
P
E
 
E
M
 
I
K
 
A
-
 
Q
-
 
G
M
 
L
H
 
R
G
 
A
L
 
V
L
 
T
E
 
D
R
 
R
-
 
D
-
 
V
A
 
S
P
 
V
V
 
S
F
 
F
S
 
T
P
 
P
S
 
V
V
x
L
G
 
I
K
 
P
F
 
A
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
M
 
I
I
 
L
V
 
A
Q
 
T
V
 
C
P
 
T
L
 
A
Y
 
R
V
 
T
D
 
R
D
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
S
T
 
P
I
 
L
E
 
S
S
 
Q
I
 
L
H
 
R
R
 
A
A
 
A
L
 
Y
V
 
E
D
 
K
H
 
A
Y
 
Y
A
 
H
G
 
A
Q
 
E
S
 
P
I
 
F
V
 
I
E
 
Y
V
 
L
V
 
M
P
 
P
L
 
-
E
 
-
E
 
-
S
 
E
A
 
G
K
 
Q
L
 
L
A
 
P
R
 
R
I
 
T
D
 
G
A
 
A
T
 
-
E
 
-
L
 
V
A
 
I
G
 
G
K
 
S
D
 
N
T
 
A
M
 
A
K
 
H
L
 
I
F
 
A
V
 
V
F
 
A
G
 
V
T
 
D
D
 
E
G
 
D
G
 
A
A
 
Q
H
 
T
V
 
F
N
 
V
M
 
A
V
 
I
A
 
A
L
 
A
L
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
T
S
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
S
M
 
M
D
 
N
L
 
L
M
 
A
L
 
L

2i3gA Crystal structure of n-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase (rv1652) from mycobacterium tuberculosis in complex with NADP+. (see paper)
26% identity, 75% coverage: 77:308/310 of query aligns to 109:332/347 of 2i3gA

query
sites
2i3gA
R
 
R
I
 
L
I
 
T
D
 
D
T
 
A
S
 
A
T
 
V
A
 
W
H
 
E
R
 
R
V
 
F
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
H
A
 
A
P
 
G
D
 
S
W
 
W
A
 
P
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
A
 
P
E
 
E
M
 
L
D
 
P
K
 
G
A
 
A
Q
 
R
P
 
-
R
 
D
K
 
Q
I
 
L
R
 
R
D
 
G
A
 
T
R
 
R
H
 
R
V
 
I
A
 
A
N
 
V
P
 
P
G
 
G
C
 
C
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
L
L
 
A
I
 
L
R
 
F
P
 
P
L
 
A
R
 
L
Q
 
A
A
 
A
G
 
D
I
 
L
L
 
I
P
 
E
D
 
P
G
 
A
Y
 
-
P
 
-
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
V
A
 
A
V
 
V
S
 
S
G
 
G
Y
 
T
T
 
S
G
|
G
G
 
A
G
|
G
K
x
R
Q
 
A
M
 
A
I
 
T
A
 
T
Q
 
D
I
 
L
E
 
L
D
 
G
D
 
A
K
 
E
S
 
V
P
 
I
D
 
G
H
 
S
I
 
A
R
 
R
A
 
A
P
 
-
H
 
-
F
 
-
L
 
-
Y
 
Y
G
 
N
L
 
I
T
 
A
L
 
G
K
 
V
H
 
H
K
 
R
H
 
H
V
 
T
P
 
P
E
 
E
M
 
I
K
 
A
-
 
Q
-
 
G
M
 
L
H
 
R
G
 
A
L
 
V
L
 
T
E
 
D
R
 
R
-
 
D
-
 
V
A
 
S
P
 
V
V
 
S
F
 
F
S
 
T
P
 
P
S
 
V
V
 
L
G
 
I
K
 
P
F
 
A
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
M
 
I
I
 
L
V
 
A
Q
 
T
V
 
C
P
 
T
L
 
A
Y
 
R
V
 
T
D
 
R
D
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
S
T
 
P
I
 
L
E
 
S
S
 
Q
I
 
L
H
 
R
R
 
A
A
 
A
L
 
Y
V
 
E
D
 
K
H
 
A
Y
 
Y
A
 
H
G
 
A
Q
 
E
S
 
P
I
 
F
V
 
I
E
 
Y
V
 
L
V
 
M
P
 
P
L
 
-
E
 
-
E
 
-
S
 
E
A
 
G
K
 
Q
L
 
L
A
 
P
R
 
R
I
 
T
D
 
G
A
 
A
T
 
-
E
 
-
L
 
V
A
 
I
G
 
G
K
 
S
D
 
N
T
 
A
M
 
A
K
 
H
L
 
I
F
 
A
V
 
V
F
 
A
G
 
V
T
 
D
D
 
E
G
 
D
G
 
A
A
 
Q
H
 
T
V
 
F
N
 
V
M
 
A
V
 
I
A
 
A
L
 
A
L
 
I
D
 
D
N
 
N
L
|
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
x
T
S
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
S
M
 
M
D
 
N
L
 
L
M
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011975053.1 NCBI__GCF_000017145.1:WP_011975053.1
MKPKIFIDGEHGTTGLQIRTRMAGRTDLELLSIPEAERRNAAMREDLLNSADIAILCLPD
DASREAVAMVAGNNRVRIIDTSTAHRVAPDWAYGFAEMDKAQPRKIRDARHVANPGCYPT
GAIALIRPLRQAGILPDGYPVTVNAVSGYTGGGKQMIAQIEDDKSPDHIRAPHFLYGLTL
KHKHVPEMKMHGLLERAPVFSPSVGKFAQGMIVQVPLYVDDLAAGATIESIHRALVDHYA
GQSIVEVVPLEESAKLARIDATELAGKDTMKLFVFGTDGGAHVNMVALLDNLGKGASGAA
VQNMDLMLSA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory