SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011988726.1 NCBI__GCF_000016505.1:WP_011988726.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3ng0A Crystal structure of glutamine synthetase from synechocystis sp. Pcc 6803
33% identity, 44% coverage: 205:479/632 of query aligns to 186:436/465 of 3ng0A

query
sites
3ng0A
T
 
T
R
 
D
T
 
T
K
 
A
G
 
Q
A
 
D
V
 
I
R
 
R
T
 
T
A
 
E
L
 
M
E
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
L
S
 
L
T
 
T
M
 
M
E
 
A
L
 
A
Y
 
F
G
 
G
L
 
V
E
 
P
P
 
I
E
 
E
M
x
K
G
 
H
H
 
H
K
 
H
E
|
E
V
 
V
G
 
A
G
 
S
I
 
G
K
 
G
S
 
Q
N
 
N
I
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
N
 
-
H
 
-
I
 
-
M
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
E
|
E
I
 
L
D
 
G
W
x
I
K
 
K
Y
x
F
S
 
D
T
 
K
A
 
L
V
 
V
Q
 
N
S
 
S
V
 
A
D
 
D
N
 
N
E
 
L
L
 
M
L
 
I
V
 
Y
K
 
K
S
 
Y
I
 
V
V
 
I
K
 
K
E
 
N
T
 
V
F
 
A
R
 
K
N
 
K
N
 
Y
G
 
G
L
 
K
E
 
T
V
 
V
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
I
D
 
F
G
 
N
V
 
D
A
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
|
H
T
 
V
H
|
H
I
 
Q
G
x
S
M
 
L
A
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
W
K
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
Q
M
 
-
I
 
-
N
 
P
L
 
L
F
 
F
S
 
A
S
 
G
T
 
D
K
 
K
N
 
Y
H
 
A
F
 
G
L
 
F
S
 
S
I
 
Q
F
 
M
G
 
G
Y
 
L
A
 
W
S
 
Y
V
 
I
M
 
G
G
 
G
I
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
H
Y
 
A
E
 
P
V
 
A
I
 
L
N
 
L
P
 
A
F
 
F
V
 
T
S
 
N
S
 
P
T
 
T
T
 
T
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
 
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
F
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
C
 
N
I
 
L
V
 
A
T
 
Y
S
 
S
I
 
Q
G
 
G
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
-
N
 
N
R
|
R
T
 
S
V
 
A
L
 
S
I
 
V
G
x
R
V
 
I
V
 
P
R
 
L
D
 
S
L
 
G
E
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
K
G
 
A
T
 
K
R
|
R
F
 
L
E
|
E
L
 
F
R
|
R
A
 
C
P
 
P
N
 
D
P
 
A
R
 
T
T
 
S
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
F
T
 
A
G
 
A
L
 
M
Y
 
L
M
 
C
A
 
A
M
 
G
L
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
K
Y
 
N
A
 
Q
I
 
I
-
 
D
T
 
P
G
 
G
S
 
E
K
 
P
T
 
L
E
 
D
D
 
V
D
 
D
L
 
I
-
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
I
S
 
P
K
 
S
K
 
T
P
 
P
G
 
G
-
 
S
-
 
L
E
 
E
D
 
A
A
 
A
-
 
L
S
 
E
Y
 
A
L
 
L
E
 
E
K
 
K
D
 
D
R
 
H
A
 
E
Y
 
F
R
 
L
S
 
T
E
 
G
E
 
T
D
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
S
-
 
P
D
 
D
F
 
F
T
 
V
D
 
E

Sites not aligning to the query:

A0R079 Glutamine synthetase; GS; Glutamate--ammonia ligase; Glutamine synthetase I beta; GSI beta; EC 6.3.1.2 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
27% identity, 71% coverage: 29:474/632 of query aligns to 18:443/478 of A0R079

query
sites
A0R079
I
 
V
K
 
E
F
 
Y
V
 
V
S
 
D
L
 
I
V
 
R
G
 
F
I
 
C
D
 
D
L
 
L
S
 
P
G
 
G
N
 
V
D
 
V
T
 
Q
D
 
H
E
 
F
K
 
S
I
 
I
P
 
P
I
 
A
K
 
S
I
 
A
F
 
F
L
 
-
K
 
-
D
 
D
I
 
E
S
 
S
G
 
V
F
 
F
L
 
E
K
 
D
G
 
G
S
 
-
I
 
L
Q
 
A
T
 
F
D
 
D
G
 
G
S
 
S
S
 
S
V
 
V
V
 
R
L
 
-
P
 
-
G
 
G
I
 
F
A
 
Q
T
 
S
L
 
I
N
 
H
N
 
E
A
 
S
K
 
D
V
 
M
D
 
M
M
 
L
V
 
L
C
 
P
D
 
D
C
 
P
D
 
-
V
 
-
N
 
-
W
 
-
Y
 
-
I
 
-
D
 
-
Y
 
-
N
 
N
T
 
T
N
 
A
N
 
R
I
 
I
D
 
D
P
 
P
E
 
F
T
 
-
D
 
-
K
 
R
P
 
A
V
 
A
G
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
N
I
 
M
P
 
N
C
 
F
F
 
F
-
 
V
-
 
H
-
 
D
-
 
P
F
 
F
Y
 
T
H
 
R
E
 
E
H
 
A
K
 
Y
A
 
S
V
 
R
D
 
D
S
 
P
R
 
R
Y
 
N
V
 
V
L
 
A
K
 
R
N
 
K
C
 
A
I
 
E
Q
 
N
H
 
Y
F
 
L
K
 
A
T
 
S
N
 
T
L
 
G
L
 
I
N
 
A
L
 
D
F
 
T
K
 
A
E
 
F
Y
 
F
P
 
G
N
 
A
S
 
E
L
 
A
S
 
E
S
 
F
F
 
Y
G
 
I
L
 
F
K
 
D
Y
 
S
E
 
V
D
 
S
I
 
F
D
 
D
D
 
S
V
 
K
V
 
I
A
 
N
T
 
G
C
 
T
A
 
F
T
 
Y
E
 
E
L
 
V
E
 
D
F
 
S
-
 
E
-
 
S
-
 
G
W
 
W
V
 
W
N
 
N
T
 
T
P
 
G
N
 
-
N
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
E
E
 
P
L
 
F
S
 
E
T
 
S
S
 
D
Q
 
G
T
 
S
L
 
A
Q
 
N
E
 
R
Q
 
G
Y
 
Y
W
 
K
T
 
V
R
 
R
T
 
P
K
 
K
G
 
G
A
 
G
V
 
Y
R
 
F
T
 
P
A
 
V
L
 
A
-
 
P
-
 
Y
-
 
D
-
 
H
-
 
Y
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
R
E
 
D
Q
 
Q
T
 
M
L
 
A
S
 
T
T
 
N
M
 
L
E
 
Q
L
 
N
Y
 
A
G
 
G
L
 
F
E
 
T
P
 
L
E
 
E
M
 
R
G
 
G
H
 
H
K
 
H
E
 
E
V
 
V
G
 
G
G
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
N
 
-
H
 
-
I
 
T
M
 
A
E
 
G
Q
 
Q
L
 
A
E
 
E
I
 
I
D
 
N
W
 
Y
K
 
K
Y
 
F
S
 
N
T
 
T
A
 
L
V
 
L
Q
 
A
S
 
A
V
 
A
D
 
D
N
 
D
E
 
V
L
 
L
L
 
L
V
 
F
K
 
K
S
 
Y
I
 
I
V
 
I
K
 
K
E
 
N
T
 
T
F
 
A
R
 
W
N
 
Q
N
 
A
G
 
G
L
 
K
E
 
T
V
 
V
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
L
D
 
F
G
 
G
V
 
D
A
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
 
H
T
 
A
H
 
H
I
 
Q
G
 
S
M
 
L
A
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
W
K
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
Q
M
 
-
I
 
-
N
 
P
L
 
L
F
 
F
S
 
H
S
 
D
T
 
E
K
 
S
N
 
G
H
 
Y
F
 
A
-
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
D
F
 
I
G
 
A
Y
 
R
A
 
H
S
 
Y
V
 
I
M
 
G
G
 
G
I
 
I
L
 
L
K
 
H
N
 
H
Y
 
A
E
 
P
V
 
S
I
 
L
N
 
L
P
 
A
F
 
F
V
 
T
S
 
N
S
 
P
T
 
T
T
 
V
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
 
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
I
C
 
N
I
 
L
V
 
V
T
 
Y
S
 
S
I
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
Q
R
 
R
N
 
N
R
 
R
T
 
S
V
 
A
L
 
C
I
 
V
G
 
R
V
 
I
V
 
P
R
 
I
D
 
T
L
 
G
E
 
N
N
 
N
P
 
P
L
 
K
G
 
A
T
 
K
R
 
R
F
 
L
E
 
E
L
 
F
R
 
R
A
 
C
P
 
P
N
 
D
P
 
S
R
 
S
T
 
G
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
F
T
 
A
G
 
A
L
 
M
Y
 
L
M
 
M
A
 
A
M
 
G
L
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
K
Y
 
K
A
 
K
I
 
I
T
 
E
G
 
P
S
 
L
K
 
Q
T
 
P
E
 
V
D
 
D
D
 
K
L
 
D
L
 
L
A
 
Y
E
 
E
L
 
L
S
 
-
K
 
-
K
 
P
P
 
P
G
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
A
S
 
A
Y
 
I
-
 
P
-
 
Q
-
 
A
-
 
P
-
 
T
-
 
S
-
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
V
-
 
I
-
 
D
-
 
K
L
 
L
E
 
E
K
 
E
D
 
D
R
 
H
A
 
E
Y
 
Y
R
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
G
D
 
G
V
 
V
F
 
F

Sites not aligning to the query:

2wgsA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis glutamine synthetase in complex with a purine analogue inhibitor. (see paper)
31% identity, 39% coverage: 230:474/632 of query aligns to 207:428/463 of 2wgsA

query
sites
2wgsA
E
 
E
M
 
K
G
 
G
H
 
H
K
 
H
E
|
E
V
 
V
G
 
G
G
 
S
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
N
 
-
H
 
-
I
 
-
M
 
G
E
 
G
Q
 
Q
L
 
A
E
|
E
I
 
I
D
x
N
W
 
Y
K
 
Q
Y
x
F
S
 
N
T
 
S
A
 
L
V
 
L
Q
 
H
S
 
A
V
 
A
D
 
D
N
 
D
E
 
M
L
 
Q
L
 
L
V
 
Y
K
 
K
S
 
Y
I
 
I
V
 
I
K
 
K
E
 
N
T
 
T
F
 
A
R
 
W
N
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
K
E
 
T
V
 
V
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
L
D
 
F
G
 
G
V
 
D
A
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
|
H
T
 
C
H
|
H
I
 
Q
G
x
S
M
 
L
A
 
-
L
 
-
K
 
-
L
x
W
K
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
A
M
 
P
I
 
L
N
 
-
L
 
M
F
 
Y
S
 
D
S
 
E
T
 
T
K
 
G
N
 
Y
H
 
A
F
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
D
F
 
T
G
 
A
Y
 
R
A
 
H
S
 
Y
V
 
I
M
 
G
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
H
N
 
H
Y
 
A
E
 
P
V
 
S
I
 
L
N
 
L
P
 
A
F
 
F
V
 
T
S
 
N
S
 
P
T
 
T
T
 
V
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
 
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
I
C
 
N
I
 
L
V
 
V
T
 
Y
S
 
S
I
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
Q
R
 
R
N
 
N
R
|
R
T
 
S
V
 
A
L
 
C
I
 
V
G
 
R
V
 
I
V
 
P
R
 
I
D
 
T
L
 
G
E
 
S
N
 
N
P
 
P
L
x
K
G
 
A
T
 
K
R
|
R
F
 
L
E
|
E
L
 
F
R
|
R
A
 
S
P
 
P
N
 
D
P
 
S
R
 
S
T
 
G
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
F
T
 
S
G
 
A
L
 
M
Y
 
L
M
 
M
A
 
A
M
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
K
Y
 
N
A
 
K
I
 
I
T
 
E
G
 
P
S
 
Q
K
 
A
T
 
P
E
 
V
D
 
D
D
 
K
L
 
D
L
 
A
A
 
A
E
 
S
L
 
I
S
 
P
K
 
Q
K
 
T
P
 
P
G
 
T
E
 
Q
D
 
L
A
 
S
S
 
D
Y
 
V
-
 
I
-
 
D
-
 
R
L
 
L
E
 
E
K
 
A
D
 
D
R
 
H
A
 
E
Y
 
Y
R
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
G
D
 
G
V
 
V
F
 
F

Sites not aligning to the query:

2whiA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis glutamine synthetase in complex with a purine analogue inhibitor and l-methionine-s- sulfoximine phosphate. (see paper)
32% identity, 39% coverage: 230:474/632 of query aligns to 212:441/476 of 2whiA

query
sites
2whiA
E
 
E
M
 
K
G
 
G
H
 
H
K
 
H
E
|
E
V
 
V
G
 
G
G
 
S
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
N
 
-
H
 
-
I
 
-
M
 
G
E
 
G
Q
 
Q
L
 
A
E
|
E
I
 
I
D
 
N
W
 
Y
K
 
Q
Y
x
F
S
 
N
T
 
S
A
 
L
V
 
L
Q
 
H
S
 
A
V
 
A
D
 
D
N
 
D
E
 
M
L
 
Q
L
 
L
V
 
Y
K
 
K
S
 
Y
I
 
I
V
 
I
K
 
K
E
 
N
T
 
T
F
 
A
R
 
W
N
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
K
E
 
T
V
 
V
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
L
D
 
F
G
 
G
V
 
D
A
 
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
|
H
T
 
C
H
|
H
I
 
Q
G
x
S
M
 
L
A
 
-
L
 
-
K
 
-
L
x
W
K
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
A
M
 
P
I
 
L
N
 
-
L
 
M
F
 
Y
S
 
D
S
 
E
T
 
T
K
 
G
N
 
Y
H
 
A
F
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
D
F
 
T
G
 
A
Y
 
R
A
 
H
S
 
Y
V
 
I
M
 
G
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
H
N
 
H
Y
 
A
E
 
P
V
 
S
I
 
L
N
 
L
P
 
A
F
 
F
V
 
T
S
 
N
S
 
P
T
 
T
T
 
V
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
|
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
E
|
E
A
 
A
P
 
P
V
 
I
C
 
N
I
 
L
V
 
V
T
 
Y
S
 
S
I
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
Q
R
 
R
N
 
N
R
|
R
T
 
S
V
 
A
L
 
C
I
 
V
G
x
R
V
 
I
V
 
P
R
 
I
D
 
T
L
 
G
E
 
S
N
 
N
P
 
P
L
x
K
G
 
A
T
 
K
R
|
R
F
 
L
E
|
E
L
 
F
R
|
R
A
 
S
P
 
P
N
 
D
P
 
S
R
 
S
T
 
G
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
F
T
 
S
G
 
A
L
 
M
Y
 
L
M
 
M
A
 
A
M
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
K
Y
 
N
A
 
K
I
 
I
T
 
E
G
 
P
S
 
Q
K
 
A
T
 
P
E
 
V
D
 
D
D
 
K
L
 
D
L
 
L
A
 
Y
E
 
E
L
 
L
S
 
-
K
 
-
K
 
P
P
 
P
G
 
E
E
 
E
D
 
A
A
 
A
S
 
S
-
 
I
-
 
P
-
 
Q
-
 
T
-
 
P
-
 
T
-
 
Q
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
D
Y
 
R
L
 
L
E
 
E
K
 
A
D
 
D
R
 
H
A
 
E
Y
 
Y
R
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
G
D
 
G
V
 
V
F
 
F

Sites not aligning to the query:

1htoA Crystallographic structure of a relaxed glutamine synthetase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
32% identity, 39% coverage: 230:474/632 of query aligns to 213:442/477 of 1htoA

query
sites
1htoA
E
 
E
M
 
K
G
 
G
H
 
H
K
 
H
E
|
E
V
 
V
G
 
G
G
 
S
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
N
 
-
H
 
-
I
 
-
M
 
G
E
 
G
Q
 
Q
L
 
A
E
|
E
I
 
I
D
 
N
W
 
Y
K
 
Q
Y
x
F
S
 
N
T
 
S
A
 
L
V
 
L
Q
 
H
S
 
A
V
 
A
D
 
D
N
 
D
E
 
M
L
 
Q
L
 
L
V
 
Y
K
 
K
S
 
Y
I
 
I
V
 
I
K
 
K
E
 
N
T
 
T
F
 
A
R
 
W
N
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
K
E
 
T
V
 
V
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
L
D
 
F
G
 
G
V
 
D
A
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
|
H
T
 
C
H
|
H
I
 
Q
G
x
S
M
 
L
A
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
W
K
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
A
M
 
P
I
 
L
N
 
-
L
 
M
F
 
Y
S
 
D
S
 
E
T
 
T
K
 
G
N
 
Y
H
 
A
F
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
D
F
 
T
G
 
A
Y
 
R
A
 
H
S
 
Y
V
 
I
M
 
G
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
H
N
 
H
Y
 
A
E
 
P
V
 
S
I
 
L
N
 
L
P
 
A
F
 
F
V
 
T
S
 
N
S
 
P
T
 
T
T
 
V
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
 
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
I
C
 
N
I
 
L
V
 
V
T
 
Y
S
 
S
I
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
Q
R
 
R
N
 
N
R
|
R
T
 
S
V
 
A
L
 
C
I
 
V
G
 
R
V
 
I
V
 
P
R
 
I
D
 
T
L
 
G
E
 
S
N
 
N
P
 
P
L
 
K
G
 
A
T
 
K
R
|
R
F
 
L
E
|
E
L
 
F
R
|
R
A
 
S
P
 
P
N
 
D
P
 
S
R
 
S
T
 
G
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
F
T
 
S
G
 
A
L
 
M
Y
 
L
M
 
M
A
 
A
M
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
K
Y
 
N
A
 
K
I
 
I
T
 
E
G
 
P
S
 
Q
K
 
A
T
 
P
E
 
V
D
 
D
D
 
K
L
 
D
L
 
L
A
 
Y
E
 
E
L
 
L
S
 
-
K
 
-
K
 
P
P
 
P
G
 
E
E
 
E
D
 
A
A
 
A
S
 
S
-
 
I
-
 
P
-
 
Q
-
 
T
-
 
P
-
 
T
-
 
Q
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
D
Y
 
R
L
 
L
E
 
E
K
 
A
D
 
D
R
 
H
A
 
E
Y
 
Y
R
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
G
D
 
G
V
 
V
F
 
F

Sites not aligning to the query:

4acfA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis glutamine synthetase in complex with imidazopyridine inhibitor ((4-(6-bromo-3- (butylamino)imidazo(1,2-a)pyridin-2-yl)phenoxy) acetic acid) and l- methionine-s-sulfoximine phosphate.
32% identity, 39% coverage: 230:474/632 of query aligns to 211:440/475 of 4acfA

query
sites
4acfA
E
 
E
M
 
K
G
 
G
H
 
H
K
 
H
E
|
E
V
 
V
G
 
G
G
 
S
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
N
 
-
H
 
-
I
 
-
M
 
G
E
 
G
Q
 
Q
L
 
A
E
|
E
I
 
I
D
 
N
W
 
Y
K
 
Q
Y
x
F
S
 
N
T
 
S
A
 
L
V
 
L
Q
 
H
S
 
A
V
 
A
D
 
D
N
 
D
E
 
M
L
 
Q
L
 
L
V
 
Y
K
 
K
S
 
Y
I
 
I
V
 
I
K
 
K
E
 
N
T
 
T
F
 
A
R
 
W
N
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
K
E
 
T
V
 
V
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
L
D
 
F
G
 
G
V
 
D
A
 
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
|
H
T
 
C
H
|
H
I
x
Q
G
 
S
M
 
L
A
 
-
L
 
-
K
 
-
L
x
W
K
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
A
M
 
P
I
 
L
N
 
-
L
 
M
F
 
Y
S
 
D
S
 
E
T
 
T
K
 
G
N
 
Y
H
 
A
F
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
D
F
 
T
G
 
A
Y
 
R
A
 
H
S
 
Y
V
 
I
M
 
G
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
H
N
 
H
Y
 
A
E
 
P
V
 
S
I
 
L
N
 
L
P
 
A
F
 
F
V
 
T
S
 
N
S
 
P
T
 
T
T
 
V
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
|
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
E
|
E
A
 
A
P
 
P
V
 
I
C
 
N
I
 
L
V
 
V
T
 
Y
S
 
S
I
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
Q
R
 
R
N
 
N
R
|
R
T
 
S
V
 
A
L
 
C
I
 
V
G
 
R
V
 
I
V
 
P
R
 
I
D
 
T
L
 
G
E
 
S
N
|
N
P
 
P
L
x
K
G
 
A
T
 
K
R
|
R
F
 
L
E
|
E
L
 
F
R
|
R
A
 
S
P
 
P
N
 
D
P
 
S
R
 
S
T
 
G
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
F
T
 
S
G
 
A
L
 
M
Y
 
L
M
 
M
A
 
A
M
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
K
Y
 
N
A
 
K
I
 
I
T
 
E
G
 
P
S
 
Q
K
 
A
T
 
P
E
 
V
D
 
D
D
 
K
L
 
D
L
 
L
A
 
Y
E
 
E
L
 
L
S
 
-
K
 
-
K
 
P
P
 
P
G
 
E
E
 
E
D
 
A
A
 
A
S
 
S
-
 
I
-
 
P
-
 
Q
-
 
T
-
 
P
-
 
T
-
 
Q
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
D
Y
 
R
L
 
L
E
 
E
K
 
A
D
 
D
R
 
H
A
 
E
Y
 
Y
R
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
G
D
 
G
V
 
V
F
 
F

Sites not aligning to the query:

3zxvA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis glutamine synthetase in complex with tri-substituted imidazole inhibitor (4-(2-tert-butyl- 4-(6-methoxynaphthalen-2-yl)-1h-imidazol-5-yl)pyridin-2-amine) and l- methionine-s-sulfoximine phosphate (see paper)
32% identity, 39% coverage: 230:474/632 of query aligns to 211:440/475 of 3zxvA

query
sites
3zxvA
E
 
E
M
 
K
G
 
G
H
 
H
K
 
H
E
|
E
V
 
V
G
 
G
G
 
S
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
N
 
-
H
 
-
I
 
-
M
 
G
E
 
G
Q
 
Q
L
 
A
E
|
E
I
 
I
D
 
N
W
 
Y
K
 
Q
Y
x
F
S
 
N
T
 
S
A
 
L
V
 
L
Q
 
H
S
 
A
V
 
A
D
 
D
N
 
D
E
 
M
L
 
Q
L
 
L
V
 
Y
K
 
K
S
 
Y
I
 
I
V
 
I
K
 
K
E
 
N
T
 
T
F
 
A
R
 
W
N
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
K
E
 
T
V
 
V
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
L
D
 
F
G
 
G
V
 
D
A
 
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
|
H
T
 
C
H
|
H
I
 
Q
G
x
S
M
 
L
A
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
W
K
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
A
M
 
P
I
 
L
N
 
-
L
 
M
F
 
Y
S
 
D
S
 
E
T
 
T
K
 
G
N
 
Y
H
 
A
F
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
D
F
 
T
G
 
A
Y
 
R
A
 
H
S
 
Y
V
 
I
M
 
G
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
H
N
 
H
Y
 
A
E
 
P
V
 
S
I
 
L
N
 
L
P
 
A
F
 
F
V
 
T
S
 
N
S
 
P
T
 
T
T
 
V
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
|
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
E
|
E
A
 
A
P
 
P
V
 
I
C
 
N
I
 
L
V
 
V
T
 
Y
S
 
S
I
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
Q
R
 
R
N
 
N
R
|
R
T
 
S
V
 
A
L
 
C
I
 
V
G
 
R
V
 
I
V
 
P
R
 
I
D
 
T
L
 
G
E
 
S
N
 
N
P
 
P
L
x
K
G
 
A
T
 
K
R
|
R
F
 
L
E
|
E
L
 
F
R
|
R
A
 
S
P
 
P
N
 
D
P
 
S
R
 
S
T
 
G
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
F
T
 
S
G
 
A
L
 
M
Y
 
L
M
 
M
A
 
A
M
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
K
Y
 
N
A
 
K
I
 
I
T
 
E
G
 
P
S
 
Q
K
 
A
T
 
P
E
 
V
D
 
D
D
 
K
L
 
D
L
 
L
A
 
Y
E
 
E
L
 
L
S
 
-
K
 
-
K
 
P
P
 
P
G
 
E
E
 
E
D
 
A
A
 
A
S
 
S
-
 
I
-
 
P
-
 
Q
-
 
T
-
 
P
-
 
T
-
 
Q
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
D
Y
 
R
L
 
L
E
 
E
K
 
A
D
 
D
R
 
H
A
 
E
Y
 
Y
R
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
G
D
 
G
V
 
V
F
 
F

Sites not aligning to the query:

3zxrA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis glutamine synthetase in complex with tri-substituted imidazole inhibitor (3-(2-tert-butyl- 5-(pyridin-4-yl)-1h-imidazol-4-yl)quinoline) and l-methionine-s- sulfoximine phosphate. (see paper)
32% identity, 39% coverage: 230:474/632 of query aligns to 211:440/475 of 3zxrA

query
sites
3zxrA
E
 
E
M
 
K
G
 
G
H
 
H
K
 
H
E
|
E
V
 
V
G
 
G
G
 
S
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
N
 
-
H
 
-
I
 
-
M
 
G
E
 
G
Q
 
Q
L
 
A
E
|
E
I
 
I
D
 
N
W
 
Y
K
 
Q
Y
x
F
S
 
N
T
 
S
A
 
L
V
 
L
Q
 
H
S
 
A
V
 
A
D
 
D
N
 
D
E
 
M
L
 
Q
L
 
L
V
 
Y
K
 
K
S
 
Y
I
 
I
V
 
I
K
 
K
E
 
N
T
 
T
F
 
A
R
 
W
N
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
K
E
 
T
V
 
V
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
L
D
 
F
G
 
G
V
 
D
A
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
|
H
T
 
C
H
|
H
I
 
Q
G
x
S
M
 
L
A
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
W
K
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
A
M
 
P
I
 
L
N
 
-
L
 
M
F
 
Y
S
 
D
S
 
E
T
 
T
K
 
G
N
 
Y
H
 
A
F
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
D
F
 
T
G
 
A
Y
 
R
A
 
H
S
 
Y
V
 
I
M
 
G
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
H
N
 
H
Y
 
A
E
 
P
V
 
S
I
 
L
N
 
L
P
 
A
F
 
F
V
 
T
S
 
N
S
 
P
T
 
T
T
 
V
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
|
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
E
|
E
A
 
A
P
 
P
V
 
I
C
 
N
I
 
L
V
 
V
T
 
Y
S
 
S
I
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
Q
R
 
R
N
 
N
R
|
R
T
 
S
V
 
A
L
 
C
I
 
V
G
 
R
V
 
I
V
 
P
R
 
I
D
 
T
L
 
G
E
 
S
N
 
N
P
 
P
L
 
K
G
 
A
T
 
K
R
|
R
F
 
L
E
|
E
L
 
F
R
|
R
A
 
S
P
 
P
N
 
D
P
 
S
R
 
S
T
 
G
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
F
T
 
S
G
 
A
L
 
M
Y
 
L
M
 
M
A
 
A
M
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
K
Y
 
N
A
 
K
I
 
I
T
 
E
G
 
P
S
 
Q
K
 
A
T
 
P
E
 
V
D
 
D
D
 
K
L
 
D
L
 
L
A
 
Y
E
 
E
L
 
L
S
 
-
K
 
-
K
 
P
P
 
P
G
 
E
E
 
E
D
 
A
A
 
A
S
 
S
-
 
I
-
 
P
-
 
Q
-
 
T
-
 
P
-
 
T
-
 
Q
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
D
Y
 
R
L
 
L
E
 
E
K
 
A
D
 
D
R
 
H
A
 
E
Y
 
Y
R
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
G
D
 
G
V
 
V
F
 
F

Sites not aligning to the query:

2bvcA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis glutamine synthetase in complex with a transition state mimic (see paper)
32% identity, 39% coverage: 230:474/632 of query aligns to 211:440/475 of 2bvcA

query
sites
2bvcA
E
|
E
M
x
K
G
 
G
H
 
H
K
 
H
E
|
E
V
 
V
G
 
G
G
 
S
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
N
 
-
H
 
-
I
 
-
M
 
G
E
 
G
Q
 
Q
L
 
A
E
|
E
I
 
I
D
x
N
W
 
Y
K
 
Q
Y
x
F
S
 
N
T
 
S
A
 
L
V
 
L
Q
 
H
S
 
A
V
 
A
D
 
D
N
 
D
E
 
M
L
 
Q
L
 
L
V
 
Y
K
 
K
S
 
Y
I
 
I
V
 
I
K
 
K
E
 
N
T
 
T
F
 
A
R
 
W
N
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
K
E
 
T
V
 
V
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
L
D
 
F
G
 
G
V
 
D
A
 
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
|
H
T
 
C
H
|
H
I
 
Q
G
x
S
M
 
L
A
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
W
K
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
A
M
 
P
I
 
L
N
 
-
L
 
M
F
 
Y
S
 
D
S
 
E
T
 
T
K
 
G
N
 
Y
H
 
A
F
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
D
F
 
T
G
 
A
Y
 
R
A
 
H
S
 
Y
V
 
I
M
 
G
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
H
N
 
H
Y
 
A
E
 
P
V
 
S
I
 
L
N
 
L
P
 
A
F
 
F
V
 
T
S
 
N
S
 
P
T
 
T
T
 
V
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
|
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
E
|
E
A
 
A
P
 
P
V
 
I
C
 
N
I
 
L
V
 
V
T
 
Y
S
 
S
I
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
Q
R
 
R
N
 
N
R
|
R
T
 
S
V
 
A
L
 
C
I
 
V
G
x
R
V
 
I
V
 
P
R
 
I
D
 
T
L
 
G
E
 
S
N
 
N
P
 
P
L
 
K
G
 
A
T
 
K
R
|
R
F
 
L
E
|
E
L
 
F
R
|
R
A
 
S
P
 
P
N
 
D
P
 
S
R
 
S
T
 
G
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
F
T
 
S
G
 
A
L
 
M
Y
 
L
M
 
M
A
 
A
M
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
K
Y
 
N
A
 
K
I
 
I
T
 
E
G
 
P
S
 
Q
K
 
A
T
 
P
E
 
V
D
 
D
D
 
K
L
 
D
L
 
L
A
 
Y
E
 
E
L
 
L
S
 
-
K
 
-
K
 
P
P
 
P
G
 
E
E
 
E
D
 
A
A
 
A
S
 
S
-
 
I
-
 
P
-
 
Q
-
 
T
-
 
P
-
 
T
-
 
Q
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
D
Y
 
R
L
 
L
E
 
E
K
 
A
D
 
D
R
 
H
A
 
E
Y
 
Y
R
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
G
D
 
G
V
 
V
F
 
F

Sites not aligning to the query:

4xycA Nanomolar inhibitors of mycobacterium tuberculosis glutamine synthetase 1: synthesis, biological evaluation and x-ray crystallographic studies (see paper)
32% identity, 39% coverage: 230:474/632 of query aligns to 202:431/466 of 4xycA

query
sites
4xycA
E
 
E
M
 
K
G
 
G
H
 
H
K
 
H
E
|
E
V
 
V
G
 
G
G
 
S
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
N
 
-
H
 
-
I
 
-
M
 
G
E
 
G
Q
 
Q
L
 
A
E
|
E
I
 
I
D
 
N
W
 
Y
K
 
Q
Y
x
F
S
 
N
T
 
S
A
 
L
V
 
L
Q
 
H
S
 
A
V
 
A
D
 
D
N
 
D
E
 
M
L
 
Q
L
 
L
V
 
Y
K
 
K
S
 
Y
I
 
I
V
 
I
K
 
K
E
 
N
T
 
T
F
 
A
R
 
W
N
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
K
E
 
T
V
 
V
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
L
D
 
F
G
 
G
V
 
D
A
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
|
H
T
 
C
H
|
H
I
 
Q
G
x
S
M
 
L
A
 
-
L
 
-
K
 
-
L
x
W
K
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
A
M
 
P
I
 
L
N
 
-
L
 
M
F
 
Y
S
 
D
S
 
E
T
 
T
K
 
G
N
 
Y
H
 
A
F
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
D
F
 
T
G
 
A
Y
 
R
A
 
H
S
 
Y
V
 
I
M
 
G
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
H
N
 
H
Y
 
A
E
 
P
V
 
S
I
 
L
N
 
L
P
 
A
F
 
F
V
 
T
S
 
N
S
 
P
T
 
T
T
 
V
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
 
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
I
C
 
N
I
 
L
V
 
V
T
 
Y
S
 
S
I
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
Q
R
 
R
N
 
N
R
|
R
T
 
S
V
 
A
L
 
C
I
 
V
G
 
R
V
 
I
V
 
P
R
 
I
D
 
T
L
 
G
E
 
S
N
 
N
P
 
P
L
x
K
G
x
A
T
 
K
R
|
R
F
 
L
E
|
E
L
 
F
R
|
R
A
 
S
P
 
P
N
 
D
P
 
S
R
 
S
T
 
G
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
F
T
 
S
G
 
A
L
 
M
Y
 
L
M
 
M
A
 
A
M
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
K
Y
 
N
A
 
K
I
 
I
T
 
E
G
 
P
S
 
Q
K
 
A
T
 
P
E
 
V
D
 
D
D
 
K
L
 
D
L
 
L
A
 
Y
E
 
E
L
 
L
S
 
-
K
 
-
K
 
P
P
 
P
G
 
E
E
 
E
D
 
A
A
 
A
S
 
S
-
 
I
-
 
P
-
 
Q
-
 
T
-
 
P
-
 
T
-
 
Q
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
D
Y
 
R
L
 
L
E
 
E
K
 
A
D
 
D
R
 
H
A
 
E
Y
 
Y
R
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
G
D
 
G
V
 
V
F
 
F

Sites not aligning to the query:

P9WN39 Glutamine synthetase; GS; Glutamate--ammonia ligase; Glutamine synthetase I beta; GSI beta; EC 6.3.1.2 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 5 papers)
32% identity, 39% coverage: 230:474/632 of query aligns to 214:443/478 of P9WN39

query
sites
P9WN39
E
 
E
M
 
K
G
 
G
H
 
H
K
 
H
E
|
E
V
 
V
G
 
G
G
 
S
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
N
 
-
H
 
-
I
 
-
M
 
G
E
 
G
Q
 
Q
L
 
A
E
|
E
I
 
I
D
 
N
W
 
Y
K
 
Q
Y
 
F
S
 
N
T
 
S
A
 
L
V
 
L
Q
 
H
S
 
A
V
 
A
D
 
D
N
 
D
E
 
M
L
 
Q
L
 
L
V
 
Y
K
 
K
S
 
Y
I
 
I
V
 
I
K
 
K
E
 
N
T
 
T
F
 
A
R
 
W
N
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
K
E
 
T
V
 
V
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
L
D
 
F
G
 
G
V
 
D
A
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
|
H
T
 
C
H
 
H
I
 
Q
G
 
S
M
 
L
A
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
W
K
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
A
M
 
P
I
 
L
N
 
-
L
 
M
F
 
Y
S
 
D
S
 
E
T
 
T
K
 
G
N
 
Y
H
 
A
F
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
D
F
 
T
G
 
A
Y
 
R
A
 
H
S
 
Y
V
 
I
M
 
G
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
H
N
 
H
Y
 
A
E
 
P
V
 
S
I
 
L
N
 
L
P
 
A
F
 
F
V
 
T
S
 
N
S
 
P
T
 
T
T
 
V
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
 
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
I
C
 
N
I
 
L
V
 
V
T
 
Y
S
 
S
I
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
Q
R
 
R
N
 
N
R
 
R
T
 
S
V
 
A
L
 
C
I
 
V
G
 
R
V
 
I
V
 
P
R
 
I
D
 
T
L
 
G
E
 
S
N
 
N
P
 
P
L
 
K
G
 
A
T
 
K
R
 
R
F
 
L
E
|
E
L
 
F
R
 
R
A
 
S
P
 
P
N
 
D
P
 
S
R
 
S
T
 
G
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
F
T
 
S
G
 
A
L
 
M
Y
 
L
M
 
M
A
 
A
M
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
K
Y
 
N
A
 
K
I
 
I
T
 
E
G
 
P
S
 
Q
K
 
A
T
 
P
E
 
V
D
 
D
D
 
K
L
 
D
L
 
L
A
x
Y
E
 
E
L
 
L
S
 
-
K
 
-
K
 
P
P
 
P
G
 
E
E
 
E
D
 
A
A
 
A
S
 
S
-
 
I
-
 
P
-
 
Q
-
 
T
-
 
P
-
 
T
-
 
Q
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
D
Y
 
R
L
 
L
E
 
E
K
 
A
D
 
D
R
 
H
A
 
E
Y
 
Y
R
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
G
D
 
G
V
 
V
F
 
F

Sites not aligning to the query:

P0A1P6 Glutamine synthetase; GS; Glutamate--ammonia ligase; Glutamine synthetase I beta; GSI beta; EC 6.3.1.2 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 4 papers)
32% identity, 40% coverage: 222:476/632 of query aligns to 200:437/469 of P0A1P6

query
sites
P0A1P6
M
 
M
E
 
E
L
 
Q
Y
 
M
G
 
G
L
 
L
E
 
V
P
 
V
E
|
E
M
 
A
G
 
H
H
 
H
K
 
H
E
|
E
V
 
V
G
 
A
G
 
T
I
 
A
K
 
G
S
 
Q
N
 
N
I
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
N
 
-
H
 
-
I
 
-
M
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
E
|
E
I
 
V
D
 
A
W
 
T
K
 
R
Y
 
F
S
 
N
T
 
T
A
 
M
V
 
T
Q
 
K
S
 
K
V
 
A
D
 
D
N
 
E
E
 
I
L
 
Q
L
 
I
V
 
Y
K
 
K
S
 
Y
I
 
V
V
 
V
K
 
H
E
 
N
T
 
V
F
 
A
R
 
H
N
 
R
N
 
F
G
 
G
L
 
K
E
 
T
V
 
A
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
M
D
 
F
G
 
G
V
 
D
A
x
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
|
H
T
 
C
H
|
H
I
x
M
G
x
S
M
 
L
A
 
A
L
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
K
S
 
N
G
 
G
K
 
-
M
 
-
I
 
T
N
 
N
L
 
L
F
 
F
S
 
S
S
 
G
T
 
D
K
 
K
N
 
Y
H
 
A
F
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
E
F
 
Q
G
 
A
Y
 
L
A
 
Y
S
 
Y
V
 
I
M
 
G
G
 
G
I
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
H
Y
 
A
E
 
K
V
 
A
I
 
I
N
 
N
P
 
A
F
 
L
V
 
A
S
 
N
S
 
P
T
 
T
T
 
T
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
|
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
C
 
M
I
 
L
V
 
A
T
 
Y
S
 
S
I
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
A
R
 
R
N
 
N
R
 
R
T
 
S
V
 
A
L
 
S
I
 
I
G
 
R
V
 
I
V
 
P
R
 
V
D
 
-
L
 
V
E
 
A
N
 
S
P
 
P
L
 
K
G
 
A
T
 
R
R
 
R
F
 
I
E
|
E
L
 
V
R
|
R
A
 
F
P
 
P
N
 
D
P
 
P
R
 
A
T
 
A
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
C
V
 
F
T
 
A
G
 
A
L
 
L
Y
 
L
M
 
M
A
 
A
M
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
K
Y
 
N
A
 
K
I
 
I
T
 
H
G
 
P
S
 
G
K
 
E
T
 
A
E
 
M
D
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
L
-
 
Y
D
 
D
L
 
L
L
 
P
A
 
P
E
 
E
L
 
E
S
 
A
K
 
K
K
 
E
P
 
I
G
 
P
E
 
Q
D
 
V
A
 
A
S
 
G
Y
 
S
L
 
L
E
 
E
K
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
E
Y
 
F
R
 
L
S
 
K
E
 
A
E
 
G
D
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
T
D
 
D

Sites not aligning to the query:

1fpyA Crystal structure of glutamine synthetase from salmonella typhimurium with inhibitor phosphinothricin (see paper)
32% identity, 40% coverage: 222:476/632 of query aligns to 199:436/468 of 1fpyA

query
sites
1fpyA
M
 
M
E
 
E
L
 
Q
Y
 
M
G
 
G
L
 
L
E
 
V
P
 
V
E
|
E
M
 
A
G
 
H
H
 
H
K
 
H
E
|
E
V
 
V
G
 
A
G
 
T
I
 
A
K
 
G
S
 
Q
N
 
N
I
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
N
 
-
H
 
-
I
 
-
M
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
E
|
E
I
 
V
D
 
A
W
x
T
K
 
R
Y
x
F
S
 
N
T
 
T
A
 
M
V
 
T
Q
 
K
S
 
K
V
 
A
D
 
D
N
 
E
E
 
I
L
 
Q
L
 
I
V
 
Y
K
 
K
S
 
Y
I
 
V
V
 
V
K
 
H
E
 
N
T
 
V
F
 
A
R
 
H
N
 
R
N
 
F
G
 
G
L
 
K
E
 
T
V
 
A
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
M
D
 
F
G
 
G
V
 
D
A
 
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
|
H
T
 
C
H
|
H
I
 
M
G
x
S
M
 
L
A
 
A
L
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
K
S
 
N
G
 
G
K
 
-
M
 
-
I
 
T
N
 
N
L
 
L
F
 
F
S
 
S
S
 
G
T
 
D
K
 
K
N
 
Y
H
 
A
F
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
E
F
 
Q
G
 
A
Y
 
L
A
 
Y
S
 
Y
V
 
I
M
 
G
G
 
G
I
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
H
Y
 
A
E
 
K
V
 
A
I
 
I
N
 
N
P
 
A
F
 
L
V
 
A
S
 
N
S
 
P
T
 
T
T
 
T
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
|
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
E
|
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
C
 
M
I
 
L
V
 
A
T
 
Y
S
 
S
I
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
A
R
 
R
N
 
N
R
 
R
T
 
S
V
 
A
L
 
S
I
 
I
G
 
R
V
 
I
V
 
P
R
 
V
D
 
-
L
 
V
E
 
A
N
 
S
P
 
P
L
 
K
G
 
A
T
 
R
R
|
R
F
 
I
E
|
E
L
 
V
R
|
R
A
 
F
P
 
P
N
 
D
P
 
P
R
 
A
T
 
A
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
C
V
 
F
T
 
A
G
 
A
L
 
L
Y
 
L
M
 
M
A
 
A
M
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
K
Y
 
N
A
 
K
I
 
I
T
 
H
G
 
P
S
 
G
K
 
E
T
 
P
E
 
M
D
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
L
-
 
Y
D
 
D
L
 
L
L
 
P
A
 
P
E
 
E
L
 
E
S
 
A
K
 
K
K
 
E
P
 
I
G
 
P
E
 
Q
D
 
V
A
 
A
S
 
G
Y
 
S
L
 
L
E
 
E
K
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
E
Y
 
F
R
 
L
S
 
K
E
 
A
E
 
G
D
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
T
D
 
D

Sites not aligning to the query:

1f1hA Crystal structure of glutamine synthetase from salmonella typhimurium with thallium ions (see paper)
32% identity, 40% coverage: 222:476/632 of query aligns to 199:436/468 of 1f1hA

query
sites
1f1hA
M
 
M
E
 
E
L
 
Q
Y
 
M
G
 
G
L
 
L
E
 
V
P
 
V
E
|
E
M
 
A
G
 
H
H
|
H
K
 
H
E
|
E
V
 
V
G
 
A
G
 
T
I
 
A
K
 
G
S
 
Q
N
 
N
I
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
N
 
-
H
 
-
I
 
-
M
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
E
|
E
I
 
V
D
 
A
W
x
T
K
 
R
Y
x
F
S
 
N
T
 
T
A
 
M
V
 
T
Q
 
K
S
 
K
V
 
A
D
 
D
N
 
E
E
 
I
L
 
Q
L
 
I
V
 
Y
K
 
K
S
 
Y
I
 
V
V
 
V
K
 
H
E
 
N
T
 
V
F
 
A
R
 
H
N
 
R
N
 
F
G
 
G
L
 
K
E
 
T
V
 
A
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
M
D
 
F
G
 
G
V
 
D
A
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
|
H
T
 
C
H
|
H
I
 
M
G
x
S
M
 
L
A
 
A
L
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
K
S
 
N
G
 
G
K
 
-
M
 
-
I
 
T
N
 
N
L
 
L
F
 
F
S
 
S
S
 
G
T
 
D
K
 
K
N
 
Y
H
 
A
F
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
E
F
 
Q
G
 
A
Y
 
L
A
 
Y
S
 
Y
V
 
I
M
 
G
G
 
G
I
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
H
Y
 
A
E
 
K
V
 
A
I
 
I
N
 
N
P
 
A
F
 
L
V
 
A
S
 
N
S
 
P
T
 
T
T
 
T
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
 
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
C
 
M
I
 
L
V
 
A
T
 
Y
S
 
S
I
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
A
R
 
R
N
 
N
R
 
R
T
 
S
V
 
A
L
 
S
I
 
I
G
 
R
V
 
I
V
 
P
R
 
V
D
 
-
L
 
V
E
 
A
N
 
S
P
 
P
L
 
K
G
 
A
T
 
R
R
|
R
F
 
I
E
|
E
L
 
V
R
 
R
A
 
F
P
 
P
N
 
D
P
 
P
R
 
A
T
 
A
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
C
V
 
F
T
 
A
G
 
A
L
 
L
Y
 
L
M
 
M
A
 
A
M
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
K
Y
 
N
A
 
K
I
 
I
T
 
H
G
 
P
S
 
G
K
 
E
T
 
P
E
 
M
D
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
L
-
 
Y
D
 
D
L
 
L
L
 
P
A
 
P
E
 
E
L
 
E
S
 
A
K
 
K
K
 
E
P
 
I
G
 
P
E
 
Q
D
 
V
A
 
A
S
 
G
Y
 
S
L
 
L
E
 
E
K
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
E
Y
 
F
R
 
L
S
 
K
E
 
A
E
 
G
D
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
T
D
 
D

Sites not aligning to the query:

P77961 Glutamine synthetase; GS; Glutamate--ammonia ligase; Glutamine synthetase I beta; GSI beta; EC 6.3.1.2 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa)
34% identity, 36% coverage: 255:479/632 of query aligns to 221:444/473 of P77961

query
sites
P77961
Q
 
Q
L
 
N
E
|
E
I
 
L
D
 
G
W
 
I
K
 
K
Y
 
F
S
 
D
T
 
K
A
 
L
V
 
V
Q
 
N
S
 
S
V
 
A
D
 
D
N
 
N
E
 
L
L
 
M
L
 
I
V
 
Y
K
 
K
S
 
Y
I
 
V
V
 
I
K
 
K
E
 
N
T
 
V
F
 
A
R
 
K
N
 
K
N
 
Y
G
 
G
L
 
K
E
 
T
V
 
V
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
I
D
 
F
G
 
N
V
 
D
A
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
 
H
T
 
V
H
 
H
I
 
Q
G
 
S
M
 
L
A
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
W
K
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
Q
M
 
-
I
 
-
N
 
P
L
 
L
F
 
F
S
 
A
S
 
G
T
 
D
K
 
K
N
 
Y
H
 
A
F
 
G
L
 
F
S
 
S
I
 
Q
F
 
M
G
 
G
Y
 
L
A
 
W
S
 
Y
V
 
I
M
 
G
G
 
G
I
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
H
Y
 
A
E
 
P
V
 
A
I
 
L
N
 
L
P
 
A
F
 
F
V
 
T
S
 
N
S
 
P
T
 
T
T
 
T
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
 
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
F
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
C
 
N
I
 
L
V
 
A
T
 
Y
S
 
S
I
 
Q
G
 
G
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
-
N
 
N
R
 
R
T
 
S
V
 
A
L
 
S
I
 
V
G
 
R
V
 
I
V
 
P
R
 
L
D
 
S
L
 
G
E
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
K
G
 
A
T
 
K
R
 
R
F
 
L
E
|
E
L
 
F
R
 
R
A
 
C
P
 
P
N
 
D
P
 
A
R
 
T
T
 
S
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
F
T
 
A
G
 
A
L
 
M
Y
 
L
M
 
C
A
 
A
M
 
G
L
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
K
Y
 
N
A
 
Q
I
 
I
T
 
D
G
 
P
S
 
G
K
 
E
T
 
P
E
 
L
D
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
I
-
 
Y
D
 
D
L
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
I
S
 
P
K
 
S
K
 
T
P
 
P
G
 
G
-
 
S
-
 
L
E
 
E
D
 
A
A
 
A
-
 
L
S
 
E
Y
 
A
L
 
L
E
 
E
K
 
K
D
 
D
R
 
H
A
 
E
Y
 
F
R
 
L
S
 
T
E
 
G
E
 
T
D
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
S
-
 
P
D
 
D
F
 
F
T
 
V
D
 
E

Sites not aligning to the query:

P0A9C5 Glutamine synthetase; GS; Glutamate--ammonia ligase; Glutamine synthetase I beta; GSI beta; EC 6.3.1.2 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
31% identity, 40% coverage: 222:476/632 of query aligns to 200:437/469 of P0A9C5

query
sites
P0A9C5
M
 
M
E
 
E
L
 
Q
Y
 
M
G
 
G
L
 
L
E
 
V
P
 
V
E
 
E
M
 
A
G
 
H
H
 
H
K
 
H
E
 
E
V
 
V
G
 
A
G
 
T
I
 
A
K
 
G
S
 
Q
N
 
N
I
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
N
 
-
H
 
-
I
 
-
M
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
E
 
E
I
 
V
D
 
A
W
 
T
K
 
R
Y
 
F
S
 
N
T
 
T
A
 
M
V
 
T
Q
 
K
S
 
K
V
 
A
D
 
D
N
 
E
E
 
I
L
 
Q
L
 
I
V
 
Y
K
 
K
S
 
Y
I
 
V
V
 
V
K
 
H
E
 
N
T
 
V
F
 
A
R
 
H
N
 
R
N
 
F
G
 
G
L
 
K
E
 
T
V
 
A
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
M
D
 
F
G
 
G
V
 
D
A
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
 
H
T
 
C
H
 
H
I
 
M
G
 
S
M
 
L
A
 
S
L
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
K
S
 
N
G
 
G
K
 
-
M
 
-
I
 
V
N
 
N
L
 
L
F
 
F
S
 
A
S
 
G
T
 
D
K
 
K
N
 
Y
H
 
A
F
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
E
F
 
Q
G
 
A
Y
 
L
A
 
Y
S
 
Y
V
 
I
M
 
G
G
 
G
I
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
H
Y
 
A
E
 
K
V
 
A
I
 
I
N
 
N
P
 
A
F
 
L
V
 
A
S
 
N
S
 
P
T
 
T
T
 
T
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
 
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
C
 
M
I
 
L
V
 
A
T
 
Y
S
 
S
I
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
A
R
 
R
N
 
N
R
 
R
T
 
S
V
 
A
L
 
S
I
 
I
G
 
R
V
 
I
V
 
P
R
 
V
D
 
-
L
 
V
E
 
S
N
 
S
P
 
P
L
 
K
G
 
A
T
 
R
R
 
R
F
 
I
E
 
E
L
 
V
R
 
R
A
 
F
P
 
P
N
 
D
P
 
P
R
 
A
T
 
A
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
C
V
 
F
T
 
A
G
 
A
L
 
L
Y
 
L
M
 
M
A
 
A
M
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
K
Y
 
N
A
 
K
I
 
I
T
 
H
G
 
P
S
 
G
K
 
E
T
 
A
E
 
M
D
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
L
-
x
Y
D
 
D
L
 
L
L
 
P
A
 
P
E
 
E
L
 
E
S
 
A
K
 
K
K
 
E
P
 
I
G
 
P
E
 
Q
D
 
V
A
 
A
S
 
G
Y
 
S
L
 
L
E
 
E
K
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
D
-
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
E
Y
 
F
R
 
L
S
 
K
E
 
A
E
 
G
D
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
T
D
 
D

Sites not aligning to the query:

8oozA Glutamine synthetase (see paper)
31% identity, 44% coverage: 221:497/632 of query aligns to 161:382/430 of 8oozA

query
sites
8oozA
T
 
V
M
 
L
E
 
E
L
 
E
Y
 
M
G
 
G
L
 
F
E
 
E
P
 
V
E
|
E
M
 
A
G
 
A
H
 
H
K
 
H
E
 
E
V
 
V
G
 
A
G
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
N
 
-
H
 
-
I
 
-
M
 
F
E
 
G
Q
 
Q
L
 
H
E
 
E
I
 
I
D
 
D
W
x
F
K
|
K
Y
|
Y
S
 
D
T
 
N
A
 
A
V
 
L
Q
 
A
S
 
T
V
 
A
D
 
D
N
 
N
E
 
V
L
 
I
L
 
T
V
 
L
K
 
K
S
 
Y
I
 
V
V
 
A
K
 
K
E
 
T
T
 
L
F
 
A
R
 
L
N
 
Q
N
 
H
G
 
G
L
 
L
E
 
H
V
 
A
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
I
D
 
F
G
 
G
V
 
V
A
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
|
H
T
 
T
H
x
N
I
 
T
G
x
S
M
 
L
A
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
F
K
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
M
 
N
I
 
A
N
 
F
L
 
Y
F
 
D
S
 
P
S
 
D
T
 
A
K
 
P
N
 
D
H
 
Q
F
 
I
L
 
S
S
 
D
I
 
T
F
 
L
G
 
R
Y
 
Y
A
 
-
S
 
F
V
 
V
M
 
G
G
 
G
I
 
V
L
 
L
K
 
K
N
 
H
Y
 
I
E
 
R
V
 
A
I
 
I
N
 
T
P
 
A
F
 
I
V
 
T
S
 
N
S
 
P
T
 
L
T
 
V
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
 
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
C
 
Y
I
 
I
V
 
T
T
 
W
S
 
S
I
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
G
R
 
P
N
 
N
R
 
R
T
 
S
V
 
S
L
 
L
I
 
I
G
 
R
V
 
V
V
 
P
R
 
A
D
 
P
L
 
R
E
 
G
N
 
N
P
 
-
L
 
-
G
x
S
T
 
T
R
|
R
F
 
I
E
|
E
L
 
I
R
 
R
A
 
S
P
 
P
N
 
D
P
 
P
R
 
S
T
 
C
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
F
T
 
A
G
 
A
L
 
I
Y
 
L
M
 
A
A
 
A
M
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
V
T
 
K
Y
 
N
A
 
K
I
 
I
T
 
-
G
 
-
S
 
-
K
 
-
T
 
-
E
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
K
 
-
K
 
E
P
 
P
G
 
P
E
 
E
D
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
Y
 
-
R
 
R
S
 
V
E
 
E
E
 
K
D
 
N
V
 
I
F
 
Y
E
 
K
D
 
-
F
 
L
T
 
T
D
 
E
E
 
E
E
 
E
R
 
R
A
 
E
K
 
K
F
 
L
-
 
G
F
 
I
G
 
G
T
 
M
A
 
L
P
 
P
A
 
G
T
 
T
V
 
L
Y
 
K
E
 
E
N
 
A
L
 
I

Sites not aligning to the query:

8ooxB Glutamine synthetase (see paper)
31% identity, 44% coverage: 221:497/632 of query aligns to 169:390/438 of 8ooxB

query
sites
8ooxB
T
 
V
M
 
L
E
 
E
L
 
E
Y
 
M
G
 
G
L
 
F
E
 
E
P
 
V
E
 
E
M
 
A
G
 
A
H
 
H
K
 
H
E
|
E
V
 
V
G
 
A
G
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
N
 
-
H
 
-
I
 
-
M
 
F
E
 
G
Q
 
Q
L
 
H
E
|
E
I
 
I
D
 
D
W
 
F
K
 
K
Y
 
Y
S
 
D
T
 
N
A
 
A
V
 
L
Q
 
A
S
 
T
V
 
A
D
 
D
N
 
N
E
 
V
L
 
I
L
 
T
V
 
L
K
 
K
S
 
Y
I
 
V
V
 
A
K
 
K
E
 
T
T
 
L
F
 
A
R
 
L
N
 
Q
N
 
H
G
 
G
L
 
L
E
 
H
V
 
A
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
I
D
 
F
G
 
G
V
 
V
A
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
 
H
T
 
T
H
 
N
I
 
T
G
 
S
M
 
L
A
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
F
K
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
K
M
 
N
I
 
A
N
 
F
L
 
Y
F
 
D
S
 
P
S
 
D
T
 
A
K
 
P
N
 
D
H
 
Q
F
 
I
L
 
S
S
 
D
I
 
T
F
 
L
G
 
R
Y
 
Y
A
 
-
S
 
F
V
 
V
M
 
G
G
 
G
I
 
V
L
 
L
K
 
K
N
 
H
Y
 
I
E
 
R
V
 
A
I
 
I
N
 
T
P
 
A
F
 
I
V
 
T
S
 
N
S
 
P
T
 
L
T
 
V
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
 
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
C
 
Y
I
 
I
V
 
T
T
 
W
S
 
S
I
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
G
R
 
P
N
 
N
R
 
R
T
 
S
V
 
S
L
 
L
I
 
I
G
 
R
V
 
V
V
 
P
R
 
A
D
 
P
L
 
R
E
 
G
N
 
N
P
 
-
L
 
-
G
 
S
T
 
T
R
 
R
F
 
I
E
 
E
L
 
I
R
 
R
A
 
S
P
 
P
N
 
D
P
 
P
R
 
S
T
 
C
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
F
T
 
A
G
 
A
L
 
I
Y
 
L
M
 
A
A
 
A
M
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
V
T
 
K
Y
 
N
A
 
K
I
 
I
T
 
-
G
 
-
S
 
-
K
 
-
T
 
-
E
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
K
 
-
K
 
E
P
 
P
G
 
P
E
 
E
D
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
Y
 
-
R
 
R
S
 
V
E
 
E
E
 
K
D
 
N
V
 
I
F
 
Y
E
 
K
D
 
-
F
 
L
T
 
T
D
 
E
E
 
E
E
 
E
R
 
R
A
 
E
K
 
K
F
 
L
-
 
G
F
 
I
G
 
G
T
 
M
A
 
L
P
 
P
A
 
G
T
 
T
V
 
L
Y
 
K
E
 
E
N
 
A
L
 
I

Sites not aligning to the query:

8ooqB Glutamine synthetase from Methanothermococcus thermolithotrophicus (see paper)
34% identity, 28% coverage: 255:433/632 of query aligns to 197:361/446 of 8ooqB

query
sites
8ooqB
Q
 
Q
L
 
H
E
|
E
I
 
V
D
 
D
W
 
F
K
 
K
Y
 
F
S
 
D
T
 
D
A
 
A
V
 
L
Q
 
K
S
 
T
V
 
A
D
 
D
N
 
S
E
 
V
L
 
I
L
 
T
V
 
F
K
 
K
S
 
T
I
 
T
V
 
I
K
 
K
E
 
T
T
 
I
F
 
A
R
 
E
N
 
Q
N
 
H
G
 
G
L
 
L
E
 
K
V
 
A
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
F
D
 
F
G
 
G
V
 
M
A
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
 
H
T
 
C
H
 
H
I
 
Q
G
 
S
M
 
I
A
 
W
L
 
L
K
 
N
L
 
G
K
 
E
S
 
P
G
 
-
K
 
-
M
 
-
I
 
-
N
 
S
L
 
F
F
 
Y
S
 
D
S
 
E
T
 
N
K
 
A
N
 
P
H
 
Y
F
 
Q
L
 
L
S
 
S
I
 
E
F
 
T
G
 
C
Y
 
M
A
 
N
S
 
Y
V
 
V
M
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
H
Y
 
A
E
 
K
V
 
A
I
 
I
N
 
V
P
 
A
F
 
I
V
 
T
S
 
N
S
 
P
T
 
T
T
 
V
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
 
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
C
 
N
I
 
I
V
 
A
T
 
W
S
 
A
I
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
N
R
 
S
N
 
N
R
 
R
T
 
S
V
 
A
L
 
I
I
 
I
G
 
R
V
 
V
V
 
-
R
 
-
D
 
P
L
 
A
E
 
A
N
 
R
P
 
G
L
 
K
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
I
E
 
E
L
 
F
R
 
R
A
 
A
P
 
P
N
 
D
P
 
P
R
 
S
T
 
C
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
F
T
 
T
G
 
V
L
 
M
Y
 
L
M
 
A
A
 
A
M
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8oooA Glutamine synthetase from methanothermococcus thermolithotrophicus in complex with 2-oxoglutarate and mgatp at 2.15 a resolution (see paper)
34% identity, 28% coverage: 255:433/632 of query aligns to 198:362/447 of 8oooA

query
sites
8oooA
Q
 
Q
L
 
H
E
 
E
I
 
V
D
 
D
W
x
F
K
|
K
Y
x
F
S
 
D
T
 
D
A
 
A
V
 
L
Q
 
K
S
 
T
V
 
A
D
 
D
N
 
S
E
 
V
L
 
I
L
 
T
V
 
F
K
 
K
S
 
T
I
 
T
V
 
I
K
 
K
E
 
T
T
 
I
F
 
A
R
 
E
N
 
Q
N
 
H
G
 
G
L
 
L
E
 
K
V
 
A
T
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
F
D
 
F
G
 
G
V
 
M
A
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
M
H
 
H
T
 
C
H
|
H
I
 
Q
G
x
S
M
 
I
A
 
W
L
 
L
K
 
N
L
 
G
K
 
E
S
 
P
G
 
-
K
 
-
M
 
-
I
 
-
N
 
S
L
 
F
F
 
Y
S
 
D
S
 
E
T
 
N
K
 
A
N
 
P
H
 
Y
F
 
Q
L
 
L
S
 
S
I
 
E
F
 
T
G
 
C
Y
 
M
A
 
N
S
 
Y
V
 
V
M
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
H
Y
 
A
E
 
K
V
 
A
I
 
I
N
 
V
P
 
A
F
 
I
V
 
T
S
 
N
S
 
P
T
 
T
T
 
V
D
 
N
S
 
S
L
 
Y
R
 
K
R
 
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
C
 
N
I
 
I
V
 
A
T
 
W
S
 
A
I
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
N
R
 
S
N
 
N
R
 
R
T
 
S
V
 
A
L
 
I
I
 
I
G
x
R
V
 
V
V
 
-
R
 
-
D
 
P
L
 
A
E
 
A
N
 
R
P
 
G
L
 
K
G
 
G
T
 
T
R
|
R
F
 
I
E
 
E
L
 
F
R
 
R
A
 
A
P
 
P
N
 
D
P
 
P
R
 
S
T
 
C
N
 
N
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
F
T
 
T
G
 
V
L
 
M
Y
 
L
M
 
A
A
 
A
M
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011988726.1 NCBI__GCF_000016505.1:WP_011988726.1
MLKDLIYVIPKTMQSEDSLKELLTSHPEIKFVSLVGIDLSGNDTDEKIPIKIFLKDISGF
LKGSIQTDGSSVVLPGIATLNNAKVDMVCDCDVNWYIDYNTNNIDPETDKPVGTLRIPCF
FYHEHKAVDSRYVLKNCIQHFKTNLLNLFKEYPNSLSSFGLKYEDIDDVVATCATELEFW
VNTPNNPAEIEELSTSQTLQEQYWTRTKGAVRTALEQTLSTMELYGLEPEMGHKEVGGIK
SNIDDKGRFNHIMEQLEIDWKYSTAVQSVDNELLVKSIVKETFRNNGLEVTFLAKPIDGV
AGSGEHTHIGMALKLKSGKMINLFSSTKNHFLSIFGYASVMGILKNYEVINPFVSSTTDS
LRRLKPGFEAPVCIVTSIGHTVEIPSRNRTVLIGVVRDLENPLGTRFELRAPNPRTNTYL
AVTGLYMAMLDGITYAITGSKTEDDLLAELSKKPGEDASYLEKDRAYRSEEDVFEDFTDE
ERAKFFGTAPATVYENLTAIDKYPEKKAVLTKDDVLNDKLINSFKLGAIKRWLVELNHRI
LNEYIDEIRGYKLLHSVDKALDLDVATWMKIDALKCYLMKDSYSNKSLFSKIRIASEEKN
YEEVSNLQIEVEEKMSELRELYSIYKKNLLDI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory