SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012050222.1 NCBI__GCF_000016765.1:WP_012050222.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

1ct9A Crystal structure of asparagine synthetase b from escherichia coli (see paper)
31% identity, 62% coverage: 3:392/633 of query aligns to 2:364/497 of 1ct9A

query
sites
1ct9A
G
 
S
I
 
I
A
 
F
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
H
 
D
L
 
I
Q
 
K
T
 
T
A
 
D
K
 
A
P
 
V
V
 
E
E
 
L
D
 
R
A
 
K
R
 
K
V
 
A
R
 
L
A
 
E
M
 
L
T
 
S
D
 
R
M
 
L
I
 
M
A
 
R
H
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
W
S
 
S
G
 
G
V
 
I
W
 
Y
T
 
A
G
 
S
P
 
D
G
 
N
V
 
A
G
 
I
L
 
L
G
 
A
H
 
H
R
 
E
R
|
R
L
|
L
S
 
S
I
|
I
I
x
V
D
 
D
L
 
V
A
 
N
G
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
M
 
L
A
 
Y
S
 
N
A
 
Q
D
 
Q
G
 
K
Q
 
T
A
 
H
M
 
V
L
 
L
S
 
A
Y
 
V
N
|
N
G
|
G
E
|
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
H
R
 
Q
A
 
A
V
 
L
R
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
Y
E
 
-
A
 
G
L
 
D
G
 
R
R
 
Y
A
 
Q
F
 
F
R
 
Q
T
 
T
S
 
G
S
 
S
D
|
D
S
 
C
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
 
A
A
 
L
W
 
Y
R
 
Q
Q
 
E
W
 
K
G
 
G
P
 
P
D
 
E
C
 
F
L
 
L
S
 
D
R
 
D
L
 
L
N
 
Q
G
 
G
M
 
M
F
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
A
I
 
L
H
 
Y
D
 
D
R
 
S
E
 
E
R
 
K
G
 
D
C
 
A
L
 
Y
F
 
L
L
 
I
A
 
G
R
 
R
D
 
D
R
 
H
L
 
L
G
 
G
V
 
I
K
 
I
P
 
P
L
 
L
F
 
Y
Y
 
M
A
 
G
E
 
Y
L
 
D
S
 
E
D
 
H
G
 
G
S
 
Q
V
 
L
A
 
Y
F
 
V
G
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
V
L
 
C
R
 
R
R
 
T
S
 
I
P
 
K
D
 
E
F
 
F
S
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
S
 
-
I
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
P
A
 
A
G
 
G
H
 
S
Y
 
Y
L
 
L
L
 
W
L
 
S
R
 
Q
R
 
D
G
 
G
A
 
E
P
 
I
L
 
R
P
 
S
R
 
Y
P
 
Y
V
 
H
Q
 
R
W
 
D
W
 
W
D
 
-
V
 
-
S
 
-
F
 
F
A
 
D
D
 
Y
R
 
D
A
 
A
K
 
V
G
 
K
S
 
D
R
 
N
A
 
V
A
 
T
L
 
D
E
 
K
E
 
N
E
 
E
L
 
L
V
 
R
G
 
Q
I
 
A
M
 
L
R
 
E
A
 
D
A
 
S
V
 
V
T
 
K
D
 
S
R
 
H
M
 
L
V
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
A
 
V
F
x
L
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
D
S
|
S
S
 
S
A
 
I
V
 
I
V
 
S
A
 
A
L
 
I
M
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
T
S
 
K
R
 
K
Q
 
Y
A
 
A
V
 
L
K
 
H
T
 
S
C
 
F
S
x
A
I
x
V
G
 
G
F
 
L
D
 
-
H
 
-
P
 
P
D
 
G
F
 
S
D
 
P
E
x
D
T
 
L
R
 
K
Y
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
N
R
 
H
F
 
L
A
 
G
T
 
T
D
 
V
H
 
H
R
 
H
T
 
E
R
 
I
I
 
H
V
 
F
S
 
T
A
 
V
D
 
Q
D
 
E
H
 
-
G
 
G
L
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
I
-
 
R
-
 
D
V
 
V
D
 
I
T
 
Y
L
 
H
V
 
I
A
 
E
A
 
T
F
 
Y
D
 
D
E
 
V
P
x
T
F
 
T
A
 
I
D
x
R
A
 
A
S
 
S
A
 
T
L
 
-
P
 
P
T
 
M
Y
 
Y
R
 
L
V
x
M
A
 
S
-
 
R
E
 
K
L
 
I
A
 
K
R
 
A
E
 
M
T
 
G
V
 
I
T
 
K
V
 
M
A
 
V
L
 
L
S
|
S
G
|
G
D
x
E
G
 
G
A
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
V
F
 
F
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
R
 
-
R
 
-
L
 
L
T
 
Y
F
 
F
F
 
H
Q
 
K
A
 
A
-
 
P
-
 
N
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
H
E
 
E
E
 
E
R
 
T
V
 
V
R
 
R
G
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P22106 Asparagine synthetase B [glutamine-hydrolyzing]; AS-B; EC 6.3.5.4 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
30% identity, 62% coverage: 1:392/633 of query aligns to 1:381/554 of P22106

query
sites
P22106
M
|
M
C
|
C
G
 
S
I
 
I
A
 
F
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
H
 
D
L
 
I
Q
 
K
T
 
T
A
 
D
K
 
A
P
 
V
V
 
E
E
 
L
D
 
R
A
 
K
R
 
K
V
 
A
R
 
L
A
 
E
M
 
L
T
 
S
D
 
R
M
 
L
I
 
M
A
 
R
H
|
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
|
D
G
 
W
S
 
S
G
 
G
V
 
I
W
 
Y
T
 
A
G
 
S
P
 
D
G
 
N
V
 
A
G
 
I
L
 
L
G
 
A
H
 
H
R
 
E
R
 
R
L
 
L
S
 
S
I
 
I
I
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
N
G
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
M
 
L
A
 
Y
S
 
N
A
 
Q
D
 
Q
G
 
K
Q
 
T
A
 
H
M
 
V
L
 
L
S
 
A
Y
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
x
H
R
 
Q
A
 
A
V
 
L
R
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
Y
E
 
-
A
 
G
L
 
D
G
 
R
R
 
Y
A
 
Q
F
 
F
R
 
Q
T
 
T
S
 
G
S
 
S
D
 
D
S
 
C
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
x
A
A
 
L
W
 
Y
R
 
Q
Q
 
E
W
 
K
G
 
G
P
 
P
D
 
E
C
 
F
L
 
L
S
 
D
R
 
D
L
 
L
N
 
Q
G
 
G
M
 
M
F
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
A
I
 
L
H
 
Y
D
 
D
R
 
S
E
 
E
R
 
K
G
 
D
C
 
A
L
 
Y
F
 
L
L
 
I
A
 
G
R
 
R
D
 
D
R
 
H
L
 
L
G
 
G
V
 
I
K
 
I
P
 
P
L
 
L
F
 
Y
Y
 
M
A
 
G
E
 
Y
L
 
D
S
 
E
D
 
H
G
 
G
S
 
Q
V
 
L
A
 
Y
F
 
V
G
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
V
L
 
C
R
 
R
R
 
T
S
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
S
 
-
I
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
I
N
 
K
K
 
E
L
 
F
P
 
P
A
 
A
G
 
G
H
 
S
Y
 
Y
L
 
L
L
 
W
L
 
S
R
 
Q
R
 
D
G
 
G
A
 
E
P
 
I
L
 
R
P
 
S
R
 
Y
P
 
Y
V
 
H
Q
 
R
W
 
D
W
 
W
D
 
-
V
 
-
S
 
-
F
 
F
A
 
D
D
 
Y
R
 
D
A
 
A
K
 
V
G
 
K
S
 
D
R
 
N
A
 
V
A
 
T
L
 
D
E
 
K
E
 
N
E
 
E
L
 
L
V
 
R
G
 
Q
I
 
A
M
 
L
R
 
E
A
 
D
A
 
S
V
 
V
T
 
K
D
 
S
R
 
H
M
 
L
V
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
A
 
V
F
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
D
S
 
S
S
 
S
A
 
I
V
 
I
V
 
S
A
 
A
L
 
I
M
 
T
-
 
K
-
 
K
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
Q
-
 
E
-
 
R
A
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
W
R
 
W
Q
 
P
A
 
Q
V
 
L
K
 
H
T
 
S
C
 
F
S
 
A
I
 
V
G
 
G
F
 
L
D
 
-
H
 
-
P
 
P
D
 
G
F
 
S
D
 
P
E
 
D
T
 
L
R
 
K
Y
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
N
R
 
H
F
 
L
A
 
G
T
 
T
D
 
V
H
 
H
R
 
H
T
 
E
R
 
I
I
 
H
V
 
F
S
 
T
A
 
V
D
 
Q
D
 
E
H
 
-
G
 
G
L
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
I
-
 
R
-
 
D
V
 
V
D
 
I
T
 
Y
L
 
H
V
 
I
A
 
E
A
 
T
F
 
Y
D
 
D
E
 
V
P
 
T
F
 
T
A
 
I
D
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
T
L
 
-
P
 
P
T
 
M
Y
 
Y
R
 
L
V
 
M
A
 
S
-
 
R
E
 
K
L
 
I
A
 
K
R
 
A
E
 
M
T
 
G
V
 
I
T
 
K
V
 
M
A
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
D
x
E
G
 
G
A
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
V
F
 
F
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
R
 
-
R
 
-
L
 
L
T
 
Y
F
 
F
F
 
H
Q
 
K
A
 
A
-
 
P
-
 
N
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
H
E
 
E
E
 
E
R
 
T
V
 
V
R
 
R
G
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
A
L
 
L

P78753 Probable asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]; Glutamine-dependent asparagine synthetase; EC 6.3.5.4 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
30% identity, 61% coverage: 1:385/633 of query aligns to 1:374/557 of P78753

query
sites
P78753
M
 
M
C
 
C
G
 
G
I
 
I
A
 
L
G
 
A
L
 
V
Y
 
H
H
 
H
L
 
V
Q
 
-
T
 
-
A
 
A
K
 
E
P
 
D
V
 
I
E
 
E
D
 
A
A
 
F
R
 
K
V
 
P
R
 
K
A
 
A
M
 
L
-
 
H
-
 
L
T
 
S
D
 
K
M
 
Q
I
 
L
A
 
R
H
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
W
S
 
S
G
 
G
V
 
K
W
 
A
T
 
I
G
 
R
P
 
N
G
 
Q
V
 
T
G
 
I
L
 
L
G
 
C
H
 
H
R
 
E
R
 
R
L
 
L
S
 
A
I
 
I
I
 
V
D
 
G
L
 
V
A
 
E
G
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
M
 
L
A
 
V
S
 
S
A
 
D
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
A
 
L
M
 
V
L
 
L
S
 
T
Y
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
H
R
 
L
A
 
K
V
 
L
R
 
R
A
 
E
E
 
N
L
 
L
E
 
K
A
 
G
L
 
-
G
 
N
R
 
Y
A
 
K
F
 
F
R
 
K
T
 
T
S
 
Y
S
 
S
D
 
D
S
 
C
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
 
Y
A
 
L
W
 
Y
R
 
R
Q
 
E
W
 
H
G
 
G
P
 
P
D
 
A
C
 
C
L
 
A
S
 
N
R
 
M
L
 
L
N
 
D
G
 
G
M
 
M
F
 
F
A
 
S
F
 
W
A
 
V
I
 
L
H
 
Y
D
 
D
R
 
Q
E
 
D
R
 
K
G
 
D
C
 
K
L
 
V
F
 
V
L
 
A
A
 
A
R
 
R
D
 
D
R
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
I
K
 
T
P
 
T
L
 
L
F
 
Y
Y
 
Q
A
 
G
E
 
F
L
 
S
S
 
S
D
 
D
G
 
S
-
 
P
-
 
D
S
 
T
V
 
A
A
 
Y
F
 
F
G
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
-
A
 
-
H
 
H
P
 
P
L
 
V
L
 
C
R
 
D
R
 
K
S
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
S
 
-
I
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
-
V
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
F
P
 
P
A
 
P
G
 
G
H
 
H
Y
 
Y
L
 
Y
L
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
D
A
 
S
P
 
E
L
 
T
P
 
K
R
 
Q
P
 
T
V
 
V
Q
 
R
W
 
Y
W
 
F
D
 
K
V
 
P
S
 
S
F
 
W
A
 
W
D
 
D
R
 
E
A
 
N
K
 
K
G
 
I
S
 
P
R
 
S
A
 
N
A
 
P
L
 
V
E
 
D
E
 
Y
E
 
K
L
 
L
V
 
L
-
 
R
G
 
E
I
 
T
M
 
L
R
 
E
A
 
A
A
 
S
V
 
V
T
 
R
D
 
K
R
 
R
M
 
L
V
 
M
S
 
A
D
 
E
V
 
V
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
A
 
V
F
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
D
S
 
S
S
 
S
A
 
L
V
 
I
V
 
A
A
 
S
L
 
I
M
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
E
S
 
T
R
 
E
Q
 
K
A
 
L
V
 
A
K
 
N
T
 
S
C
 
T
S
 
S
-
 
Q
-
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
T
-
 
A
-
 
W
-
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
H
-
 
S
-
 
F
-
 
A
I
 
I
G
 
G
F
 
L
D
 
P
-
 
G
H
 
S
P
 
P
D
 
D
F
 
L
D
 
L
E
 
A
T
 
A
R
 
R
Y
 
K
A
 
V
A
 
A
A
 
D
I
 
F
A
 
L
E
 
H
R
 
T
F
 
F
A
 
H
T
 
H
D
 
E
H
 
H
R
 
T
T
 
F
R
 
T
I
 
I
V
 
D
S
 
E
A
 
G
D
 
L
D
 
D
H
 
-
G
 
A
L
 
L
V
 
R
D
 
D
T
 
V
L
 
I
-
 
Y
-
 
H
V
 
L
A
 
E
A
 
T
F
 
Y
D
 
D
E
 
V
P
 
T
F
 
T
A
 
I
D
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
T
L
 
-
P
 
P
T
 
M
Y
 
Y
R
 
L
V
 
L
A
 
S
-
 
R
E
 
K
L
 
I
A
 
K
R
 
A
E
 
Q
T
 
G
V
 
V
T
 
K
V
 
M
A
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
D
 
E
G
 
G
A
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
I
F
 
F
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
R
 
-
R
 
-
L
 
L
T
 
Y
F
 
F
F
 
G
Q
 
N
A
 
A
E
 
P
E
 
S
R
 
R

Sites not aligning to the query:

P08243 Asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]; Cell cycle control protein TS11; Glutamine-dependent asparagine synthetase; EC 6.3.5.4 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
28% identity, 59% coverage: 1:374/633 of query aligns to 1:374/561 of P08243

query
sites
P08243
M
 
M
C
|
C
G
 
G
I
 
I
A
 
W
G
x
A
L
 
L
Y
 
F
H
 
G
L
 
S
Q
 
D
T
 
D
A
 
C
K
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
A
 
L
R
 
S
V
 
V
R
 
Q
A
 
C
M
 
L
T
 
S
D
 
A
M
 
M
-
 
K
I
 
I
A
 
A
H
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
F
S
 
E
G
 
N
V
 
V
W
 
N
T
 
G
G
 
Y
P
 
T
G
 
N
V
 
C
G
 
C
L
 
F
G
 
G
H
 
F
R
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
A
I
 
V
I
 
V
D
 
D
L
 
P
A
 
L
G
 
F
G
 
G
A
 
M
Q
 
Q
P
 
P
M
 
I
A
 
R
S
 
V
A
 
K
D
 
K
G
 
Y
Q
 
P
A
 
Y
M
 
L
-
 
W
L
 
L
S
 
C
Y
 
Y
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
H
R
 
K
A
 
K
V
 
M
R
 
Q
A
 
Q
E
 
H
L
 
F
E
 
E
A
 
F
L
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
E
F
 
Y
R
 
Q
T
 
T
S
 
K
S
 
V
D
 
D
S
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
I
V
 
L
E
 
H
A
 
L
W
 
Y
R
 
D
Q
 
K
W
 
G
G
 
G
P
 
I
D
 
E
-
 
Q
C
 
T
L
 
I
S
 
C
R
 
M
L
 
L
N
 
D
G
 
G
M
 
V
F
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
V
I
 
L
H
 
L
D
 
D
R
 
T
E
 
A
R
 
N
G
 
K
C
 
K
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
G
R
 
R
D
 
D
R
 
T
L
 
Y
G
 
G
V
 
V
K
 
R
P
 
P
L
 
L
F
 
F
Y
 
K
A
 
A
E
 
M
L
 
T
S
 
E
D
 
D
G
 
G
S
 
F
V
 
L
A
 
A
F
 
V
G
 
C
S
 
S
E
 
E
L
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
L
L
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
K
-
 
H
-
 
S
A
 
A
H
 
T
P
 
P
L
 
F
L
 
L
R
 
K
R
 
V
S
 
E
P
 
P
D
 
F
F
 
L
S
 
P
A
 
G
V
 
H
D
 
Y
D
 
E
Y
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L
G
 
K
Y
 
-
V
 
-
P
 
P
D
 
N
D
 
G
T
 
K
S
 
-
I
 
-
V
 
V
A
 
A
G
 
S
V
 
V
N
 
E
K
 
M
L
 
V
P
 
K
A
 
Y
G
 
H
H
 
H
Y
 
C
L
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
R
G
 
D
A
x
V
P
 
P
L
 
L
P
 
H
R
 
-
P
 
-
V
 
-
Q
 
-
W
 
-
W
 
-
D
 
-
V
 
-
S
 
A
F
 
L
A
 
Y
D
 
D
R
 
N
A
 
V
K
 
E
G
 
K
S
 
L
R
 
F
A
 
P
A
 
G
L
 
F
E
 
E
E
 
I
E
 
E
L
 
T
V
 
V
G
 
K
-
 
N
-
 
N
-
 
L
-
 
R
-
 
I
I
 
L
M
 
F
R
 
N
A
 
N
A
 
A
V
 
V
T
 
K
D
 
K
R
 
R
M
 
L
V
 
M
S
 
T
D
 
D
V
 
R
P
 
R
L
 
I
G
 
G
A
 
C
F
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
D
S
 
S
S
 
S
A
 
L
V
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
T
M
 
L
A
 
L
E
 
K
A
 
Q
S
 
L
R
 
K
Q
 
E
A
 
A
-
 
Q
-
 
V
-
 
Q
-
 
Y
-
 
P
V
 
L
K
 
Q
T
 
T
C
 
F
S
 
A
I
 
I
G
 
G
F
 
M
-
 
E
D
 
D
H
 
S
P
 
P
D
 
D
F
 
L
D
 
L
E
 
A
T
 
A
R
 
R
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
K
I
 
V
A
 
A
E
 
D
R
 
H
F
 
I
A
 
G
T
 
S
D
 
E
H
 
H
R
 
Y
T
 
E
R
 
V
I
 
L
V
 
F
S
 
N
A
 
S
D
 
E
D
 
E
-
 
G
-
 
I
H
 
Q
G
 
A
L
 
L
V
 
D
D
 
E
T
 
V
L
 
I
V
 
F
A
 
S
-
 
L
-
 
E
A
 
T
F
 
Y
D
 
D
E
 
I
P
 
T
F
 
T
A
 
V
D
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
-
L
 
V
P
 
G
T
 
M
Y
 
Y
R
 
L
V
 
I
A
 
S
E
 
K
L
 
Y
A
 
I
R
 
R
E
 
K
T
 
N
V
 
T
-
 
D
-
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
I
L
x
F
S
 
S
G
 
G
D
 
E
G
 
G
A
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
L
F
 
T
A
 
Q
G
 
G
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

6gq3A Human asparagine synthetase (asns) in complex with 6-diazo-5-oxo-l- norleucine (don) at 1.85 a resolution (see paper)
28% identity, 56% coverage: 21:374/633 of query aligns to 15:361/509 of 6gq3A

query
sites
6gq3A
V
 
V
R
 
Q
A
 
C
M
 
L
T
 
S
D
 
A
M
 
M
-
 
K
I
 
I
A
 
A
H
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
F
S
 
E
G
 
N
V
 
V
W
 
N
T
 
G
G
 
Y
P
 
T
G
 
N
V
 
C
G
 
C
L
 
F
G
 
G
H
 
F
R
 
H
R
|
R
L
|
L
S
 
A
I
x
V
I
x
V
D
 
D
L
 
P
A
 
L
G
 
F
G
 
G
A
 
M
Q
 
Q
P
 
P
M
 
I
A
 
R
S
 
V
A
 
K
D
 
K
G
 
Y
Q
 
P
A
 
Y
M
 
L
-
 
W
L
 
L
S
 
C
Y
|
Y
N
|
N
G
|
G
E
|
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
H
R
 
K
A
 
K
V
 
M
R
 
Q
A
 
Q
E
 
H
L
 
F
E
 
E
A
 
F
L
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
E
F
 
Y
R
 
Q
T
 
T
S
 
K
S
x
V
D
|
D
S
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
I
V
 
L
E
 
H
A
 
L
W
 
Y
R
 
D
Q
 
K
W
 
G
G
 
G
P
 
I
D
 
E
-
 
Q
C
 
T
L
 
I
S
 
C
R
 
M
L
 
L
N
 
D
G
 
G
M
 
V
F
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
V
I
 
L
H
 
L
D
 
D
R
 
T
E
 
A
R
 
N
G
 
K
C
 
K
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
G
R
 
R
D
 
D
R
 
T
L
 
Y
G
 
G
V
 
V
K
 
R
P
 
P
L
 
L
F
 
F
Y
 
K
A
 
A
E
 
M
L
 
T
S
 
E
D
 
D
G
 
G
S
 
F
V
 
L
A
 
A
F
 
V
G
 
C
S
 
S
E
 
E
L
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
L
L
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
K
-
 
H
-
 
S
A
 
A
H
 
T
P
 
P
L
 
F
L
 
L
R
 
K
R
 
V
S
 
E
P
 
P
D
 
F
F
 
L
S
 
P
A
 
G
V
 
H
D
 
Y
D
 
E
Y
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L
G
 
K
Y
 
-
V
 
-
P
 
P
D
 
N
D
 
G
T
 
K
S
 
-
I
 
-
V
 
V
A
 
A
G
 
S
V
 
V
N
 
E
K
 
M
L
 
V
P
 
K
A
 
Y
G
 
H
H
 
H
Y
 
C
L
 
R
L
 
D
L
 
V
R
 
F
R
 
P
G
 
G
A
 
F
P
 
E
L
 
I
P
 
-
R
 
-
P
 
-
V
 
-
Q
 
-
W
 
-
W
 
-
D
 
-
V
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
E
A
 
T
L
 
V
E
 
K
E
 
N
E
 
N
L
 
L
V
 
R
G
 
I
I
 
L
M
 
F
R
 
N
A
 
N
A
 
A
V
 
V
T
 
K
D
 
K
R
 
R
M
 
L
V
 
M
S
 
T
D
 
D
V
 
R
P
 
R
L
 
I
G
 
G
A
 
C
F
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
D
S
 
S
S
 
S
A
 
L
V
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
T
M
 
L
A
 
L
E
 
K
A
 
Q
S
 
L
R
 
K
Q
 
E
A
 
A
-
 
Q
-
 
V
-
 
Q
-
 
Y
-
 
P
V
 
L
K
 
Q
T
 
T
C
 
F
S
 
A
I
 
I
G
 
G
F
 
M
-
 
E
D
 
D
H
 
S
P
 
P
D
 
D
F
 
L
D
 
L
E
 
A
T
 
A
R
 
R
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
K
I
 
V
A
 
A
E
 
D
R
 
H
F
 
I
A
 
G
T
 
S
D
 
E
H
 
H
R
 
Y
T
 
E
R
 
V
I
 
L
V
 
F
S
 
N
A
 
S
D
 
E
D
 
E
-
 
G
-
 
I
H
 
Q
G
 
A
L
 
L
V
 
D
D
 
E
T
 
V
L
 
I
V
 
F
A
 
S
-
 
L
-
 
E
A
 
T
F
 
Y
D
 
D
E
 
I
P
x
T
F
 
T
A
 
V
D
x
R
A
 
A
S
 
S
A
 
-
L
 
V
P
 
G
T
 
M
Y
 
Y
R
 
L
V
 
I
A
 
S
E
 
K
L
 
Y
A
 
I
R
 
R
E
 
K
T
 
N
V
 
T
-
 
D
-
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
I
L
 
F
S
 
S
G
 
G
D
 
E
G
 
G
A
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
L
F
 
T
A
 
Q
G
 
G
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

6lbpA Structure of the glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase from arabidopsis thaliana (see paper)
28% identity, 26% coverage: 2:166/633 of query aligns to 1:199/460 of 6lbpA

query
sites
6lbpA
C
|
C
G
 
G
I
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
Y
H
 
G
L
 
D
Q
 
S
T
 
E
A
 
A
K
 
S
P
 
R
V
 
L
E
 
C
D
 
Y
A
 
L
R
 
A
V
 
L
R
 
H
A
 
A
M
 
L
T
 
Q
D
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
-
H
 
H
R
 
R
G
|
G
P
 
Q
D
 
E
G
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
I
-
 
V
-
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
L
W
 
Q
T
 
T
G
 
I
P
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
-
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
V
-
 
F
-
 
S
-
 
E
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
I
G
 
G
H
 
H
R
 
V
R
 
R
L
 
Y
S
 
S
I
 
T
I
 
A
-
 
G
-
 
S
D
 
S
L
 
M
A
 
L
G
 
K
G
 
N
A
 
V
Q
 
Q
P
 
P
M
 
F
A
 
V
S
 
A
A
 
G
D
 
Y
-
 
R
-
 
F
G
 
G
Q
 
S
A
 
V
M
 
G
L
 
V
S
 
A
Y
 
H
N
|
N
G
|
G
E
 
N
V
 
L
Y
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
T
A
 
K
V
 
L
R
 
R
A
 
A
E
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
N
G
 
G
R
 
S
A
 
I
F
 
F
R
 
N
T
 
T
S
 
S
S
 
S
D
 
D
S
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
V
V
 
L
E
 
H
-
 
L
-
 
I
A
 
A
W
 
I
R
 
S
Q
 
K
W
 
A
G
 
R
P
 
P
-
 
F
-
 
F
-
 
M
-
 
R
-
 
I
-
 
V
D
 
D
C
 
A
L
 
C
S
 
E
R
 
K
L
 
L
N
 
Q
G
 
G
M
 
A
F
 
Y
A
 
S
F
 
M
A
 
V
I
 
F
H
 
V
D
 
T
R
 
E
E
 
D
R
 
K
G
 
-
C
 
-
L
 
L
F
 
V
L
 
A
A
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
P
L
 
H
G
 
G
V
 
F
K
 
R
P
 
P
L
 
L
F
 
V
Y
 
M
A
 
G
E
 
R
L
 
R
S
 
S
D
 
N
G
 
G
S
 
A
V
 
V
A
 
V
F
 
F
G
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
T
K
 
C
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9STG9 Amidophosphoribosyltransferase 2, chloroplastic; AtATase2; AtPURF2; PRPP2; Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase 2; AtGPRAT2; Protein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 1; Protein DIFFERENTIAL DEVELOPMENT OF VASCULAR ASSOCIATED CELLS; EC 2.4.2.14 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
28% identity, 26% coverage: 2:166/633 of query aligns to 87:285/561 of Q9STG9

query
sites
Q9STG9
C
 
C
G
 
G
I
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
Y
H
 
G
L
 
D
Q
 
S
T
 
E
A
 
A
K
 
S
P
 
R
V
 
L
E
 
C
D
 
Y
A
 
L
R
 
A
V
 
L
R
 
H
A
 
A
M
 
L
T
 
Q
D
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
-
H
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
Q
D
 
E
G
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
I
-
 
V
-
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
L
W
 
Q
T
 
T
G
 
I
P
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
-
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
V
-
 
F
-
 
S
-
 
E
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
I
G
 
G
H
 
H
R
 
V
R
 
R
L
 
Y
S
 
S
I
 
T
I
 
A
-
 
G
-
 
S
D
 
S
L
 
M
A
 
L
G
 
K
G
 
N
A
 
V
Q
 
Q
P
 
P
M
 
F
A
 
V
S
 
A
A
 
G
D
 
Y
-
 
R
-
 
F
G
 
G
Q
 
S
A
 
V
M
 
G
L
 
V
S
 
A
Y
x
H
N
 
N
G
 
G
E
 
N
V
 
L
Y
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
T
A
 
K
V
 
L
R
 
R
A
 
A
E
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
N
G
 
G
R
 
S
A
 
I
F
 
F
R
 
N
T
 
T
S
 
S
S
 
S
D
 
D
S
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
V
V
 
L
E
 
H
-
 
L
-
 
I
A
 
A
W
 
I
R
 
S
Q
 
K
W
 
A
G
 
R
P
 
P
-
 
F
-
 
F
-
 
M
-
 
R
-
 
I
-
 
V
D
 
D
C
 
A
L
 
C
S
 
E
R
 
K
L
 
L
N
 
Q
G
 
G
M
 
A
F
 
Y
A
 
S
F
 
M
A
 
V
I
 
F
H
 
V
D
 
T
R
 
E
E
 
D
R
 
K
G
 
-
C
 
-
L
 
L
F
 
V
L
 
A
A
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
P
L
 
H
G
 
G
V
 
F
K
x
R
P
|
P
L
 
L
F
 
V
Y
 
M
A
 
G
E
 
R
L
 
R
S
 
S
D
 
N
G
 
G
S
 
A
V
 
V
A
 
V
F
 
F
G
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
T
K
 
C
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P00497 Amidophosphoribosyltransferase; ATase; Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase; GPATase; EC 2.4.2.14 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 5 papers)
24% identity, 25% coverage: 2:157/633 of query aligns to 12:201/476 of P00497

query
sites
P00497
C
|
C
G
 
G
I
 
V
A
 
F
G
 
G
L
 
I
Y
 
W
H
 
G
L
 
H
Q
 
E
T
 
E
A
 
A
K
 
P
P
 
Q
V
 
I
E
 
T
D
 
Y
A
 
Y
R
 
G
V
 
L
R
 
H
A
 
S
M
 
L
T
 
-
D
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
Q
H
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
Q
D
 
E
G
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
I
-
 
V
-
 
A
-
 
T
-
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
A
W
 
H
T
 
K
G
 
G
P
 
Q
G
 
G
V
 
L
-
 
I
-
 
T
-
 
E
-
 
V
-
 
F
-
 
Q
-
 
N
-
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
S
-
 
K
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
K
-
 
G
G
 
A
L
 
I
G
 
G
H
 
H
R
 
V
R
 
R
L
 
Y
S
 
A
I
 
T
I
 
A
D
 
G
L
 
G
A
 
G
G
 
G
-
 
Y
-
 
E
G
 
N
A
 
V
Q
 
Q
P
 
P
M
 
L
-
 
L
-
 
F
-
 
R
A
 
S
S
 
Q
A
 
N
D
 
N
G
 
G
Q
 
S
A
 
L
M
 
A
L
 
L
S
 
A
Y
 
H
N
 
N
G
 
G
E
 
N
V
 
L
Y
 
V
N
 
N
Y
 
A
R
 
T
A
 
Q
V
 
L
R
 
K
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
E
 
E
A
 
N
L
 
Q
G
 
G
R
 
S
A
 
I
F
 
F
R
 
Q
T
 
T
S
 
S
S
 
S
D
 
D
S
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
L
V
 
A
E
 
H
A
 
L
W
 
I
R
 
K
Q
 
R
W
 
S
G
 
G
-
 
H
-
 
F
-
 
T
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
Q
-
 
I
P
 
K
D
 
N
C
 
S
L
 
L
S
 
S
R
 
M
L
 
L
N
 
K
G
 
G
M
 
A
F
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
L
I
 
I
H
 
M
D
 
T
R
 
E
E
 
T
R
 
E
G
 
-
C
 
-
L
 
M
F
 
I
L
 
V
A
 
A
R
 
L
D
 
D
R
 
P
L
 
N
G
 
G
V
 
L
K
 
R
P
 
P
L
 
L
F
 
S
Y
 
I
A
 
G
E
 
M
L
 
M
S
 
G
D
 
D
G
 
A
S
 
Y
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1gph1 Structure of the allosteric regulatory enzyme of purine biosynthesis (see paper)
29% identity, 18% coverage: 46:157/633 of query aligns to 68:190/465 of 1gph1

query
sites
1gph1
L
 
I
G
 
G
H
 
H
R
 
V
R
 
R
L
 
Y
S
 
A
I
 
T
I
 
A
D
 
G
L
 
G
A
 
G
G
 
G
-
 
Y
-
 
E
G
 
N
A
 
V
Q
 
Q
P
 
P
M
 
L
-
 
L
-
 
F
-
 
R
A
 
S
S
 
Q
A
 
N
D
 
N
G
 
G
Q
 
S
A
 
L
M
 
A
L
 
L
S
 
A
Y
 
H
N
 
N
G
 
G
E
 
N
V
 
L
Y
 
V
N
 
N
Y
 
A
R
 
T
A
 
Q
V
 
L
R
 
K
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
E
 
E
A
 
N
L
 
Q
G
 
G
R
 
S
A
 
I
F
 
F
R
 
Q
T
 
T
S
 
S
S
 
S
D
 
D
S
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
L
V
 
A
E
 
H
A
 
L
W
 
I
R
 
K
Q
 
R
W
 
S
G
 
G
-
 
H
-
 
F
-
 
T
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
Q
-
 
I
P
 
K
D
 
N
C
 
S
L
 
L
S
 
S
R
 
M
L
 
L
N
 
K
G
 
G
M
 
A
F
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
L
I
 
I
H
 
M
D
 
T
R
 
E
E
 
T
R
 
E
G
 
-
C
 
-
L
 
M
F
 
I
L
 
V
A
 
A
R
 
L
D
 
D
R
 
P
L
 
N
G
 
G
V
 
L
K
 
R
P
 
P
L
 
L
F
 
S
Y
 
I
A
 
G
E
 
M
L
 
M
S
 
G
D
 
D
G
 
A
S
 
Y
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1ao0A Glutamine phosphoribosylpyrophosphate (prpp) amidotransferase from b. Subtilis complexed with adp and gmp (see paper)
24% identity, 25% coverage: 2:157/633 of query aligns to 1:186/455 of 1ao0A

query
sites
1ao0A
C
|
C
G
 
G
I
 
V
A
 
F
G
 
G
L
 
I
Y
 
W
H
 
G
L
 
H
Q
 
E
T
 
E
A
 
A
K
 
P
P
 
Q
V
 
I
E
 
T
D
 
Y
A
 
Y
R
 
G
V
 
L
R
 
H
A
 
S
M
 
L
T
 
-
D
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
Q
H
|
H
R
 
R
G
|
G
P
 
Q
D
 
E
G
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
I
W
 
V
T
 
A
G
 
T
P
 
D
G
 
G
V
 
E
G
 
K
L
 
L
-
 
T
G
 
A
H
 
H
R
 
K
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
I
-
 
T
-
 
E
-
 
V
-
 
F
-
 
Q
-
 
N
-
 
G
R
 
E
L
 
L
S
 
S
I
 
K
I
 
V
D
 
K
L
 
G
A
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
G
-
 
H
-
 
V
-
 
R
-
 
Y
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
-
 
E
G
 
N
A
 
V
Q
 
Q
P
 
P
M
 
L
-
 
L
-
 
F
-
 
R
A
 
S
S
 
Q
A
 
N
D
 
N
G
 
G
Q
 
S
A
 
L
M
 
A
L
 
L
S
 
A
Y
 
H
N
|
N
G
|
G
E
 
N
V
 
L
Y
 
V
N
 
N
Y
 
A
R
 
T
A
 
Q
V
 
L
R
 
K
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
E
 
E
A
 
N
L
 
Q
G
 
G
R
 
S
A
 
I
F
 
F
R
 
Q
T
 
T
S
 
S
S
 
S
D
 
D
S
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
L
V
 
A
E
 
H
A
 
L
W
 
I
R
 
K
Q
 
R
W
 
S
G
 
G
-
 
H
-
 
F
-
 
T
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
Q
-
 
I
P
 
K
D
 
N
C
 
S
L
 
L
S
 
S
R
 
M
L
 
L
N
 
K
G
 
G
M
 
A
F
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
L
I
 
I
H
 
M
D
 
T
R
 
E
E
 
T
R
 
E
G
 
-
C
 
-
L
 
M
F
 
I
L
 
V
A
 
A
R
 
L
D
 
D
R
 
P
L
 
N
G
 
G
V
 
L
K
 
R
P
 
P
L
 
L
F
 
S
Y
 
I
A
 
G
E
 
M
L
 
M
S
 
G
D
 
D
G
 
A
S
 
Y
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012050222.1 NCBI__GCF_000016765.1:WP_012050222.1
MCGIAGLYHLQTAKPVEDARVRAMTDMIAHRGPDGSGVWTGPGVGLGHRRLSIIDLAGGA
QPMASADGQAMLSYNGEVYNYRAVRAELEALGRAFRTSSDSEVIVEAWRQWGPDCLSRLN
GMFAFAIHDRERGCLFLARDRLGVKPLFYAELSDGSVAFGSELKALLAHPLLRRSPDFSA
VDDYLGLGYVPDDTSIVAGVNKLPAGHYLLLRRGAPLPRPVQWWDVSFADRAKGSRAALE
EELVGIMRAAVTDRMVSDVPLGAFLSGGVDSSAVVALMAEASRQAVKTCSIGFDHPDFDE
TRYAAAIAERFATDHRTRIVSADDHGLVDTLVAAFDEPFADASALPTYRVAELARETVTV
ALSGDGADEAFAGYRRLTFFQAEERVRGLLPLGFRRGLFGTLGRVYPKLDRAPQMLRAKS
TLEGLGRSSEEAYALAVGVTGPALRRRLYTDRAVRELQGHRAEDRYIAAMRAAPARDALD
RAQYADLKIWLPGDILTKVDRTSMAVGLEAREPLLDYRLVEFAARLPVRMRVRGTTGKWL
LKQAMRRYLPDDILFRRKMGFVTPISAWFRGPLAEEARRIARASSLVETSWFDPAALDAV
VAEHQAGRFDHGRLLWQLMMLDRSLGRLFGAGR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory