SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012050501.1 NCBI__GCF_000016765.1:WP_012050501.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
39% identity, 96% coverage: 10:306/309 of query aligns to 11:309/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
P
 
P
A
 
M
P
 
S
R
 
T
Q
 
Y
P
 
L
S
 
E
E
 
Q
L
 
E
L
 
L
D
 
D
R
 
K
P
 
R
V
 
F
P
 
K
I
 
L
F
 
F
D
 
R
R
 
Y
L
 
W
D
 
T
D
 
Q
P
 
P
-
 
A
-
 
Q
E
 
R
G
 
D
W
 
F
L
 
L
A
 
A
E
 
L
H
 
Q
G
 
A
G
 
E
S
 
S
V
 
I
Q
 
R
C
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
G
H
 
N
A
 
S
M
 
N
R
 
A
G
 
G
P
 
A
P
 
D
A
 
A
G
 
E
L
 
L
L
 
I
A
 
D
R
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
K
L
 
L
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
S
N
 
S
F
 
F
G
 
S
A
 
V
G
 
G
I
 
L
D
 
D
L
 
K
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
I
T
 
K
A
 
C
R
 
E
A
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
A
 
R
V
 
V
T
 
T
A
 
N
S
 
T
G
 
P
D
 
D
L
 
V
L
 
L
T
 
T
H
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
I
W
 
G
Q
 
L
M
 
I
L
 
L
T
 
A
L
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
R
L
 
I
G
 
C
G
 
E
A
 
C
D
 
D
G
 
K
F
 
Y
V
 
V
R
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
A
W
 
W
S
 
K
K
 
F
G
 
G
P
 
D
P
 
F
P
 
K
L
 
L
G
 
T
R
 
T
S
 
K
A
 
F
R
 
S
G
 
G
R
 
K
K
 
R
L
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
I
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
E
R
 
R
G
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
F
G
 
D
M
 
C
E
 
P
I
 
I
A
 
S
Y
 
Y
H
 
F
S
|
S
R
|
R
R
x
S
P
 
K
V
 
K
A
 
P
E
 
N
V
 
T
A
 
N
D
 
Y
R
 
T
Y
 
Y
E
 
Y
S
 
G
D
 
S
P
 
V
L
 
V
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
W
 
N
A
 
S
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
C
P
 
P
G
 
L
G
 
T
G
 
P
A
 
E
T
 
T
Q
 
T
S
 
H
L
 
I
V
 
I
D
 
N
R
 
R
A
 
E
F
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
P
V
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
P
A
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
V
D
 
E
G
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
N
 
R
E
 
E
P
 
P
T
 
E
I
 
V
A
 
P
P
 
E
A
 
K
L
 
L
L
 
F
E
 
G
A
 
L
P
 
E
N
 
N
L
 
V
L
 
V
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
 
H
V
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
G
T
 
T
H
 
V
D
 
E
V
 
T
R
 
R
L
 
K
A
 
V
M
 
M
A
 
A
D
 
D
H
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
G
N
 
N
I
 
L
R
 
E
A
 
A
F
 
H
L
 
F
E
 
S
G
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
L

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
39% identity, 96% coverage: 10:306/309 of query aligns to 9:307/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
P
 
P
A
 
M
P
 
S
R
 
T
Q
 
Y
P
 
L
S
 
E
E
 
Q
L
 
E
L
 
L
D
 
D
R
 
K
P
 
R
V
 
F
P
 
K
I
 
L
F
 
F
D
 
R
R
 
Y
L
 
W
D
 
T
D
 
Q
P
 
P
-
 
A
-
 
Q
E
 
R
G
 
D
W
 
F
L
 
L
A
 
A
E
 
L
H
 
Q
G
 
A
G
 
E
S
 
S
V
 
I
Q
 
R
C
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
G
H
 
N
A
 
S
M
 
N
R
 
A
G
 
G
P
 
A
P
 
D
A
 
A
G
 
E
L
 
L
L
 
I
A
 
D
R
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
K
L
 
L
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
S
N
 
S
F
 
F
G
 
S
A
x
V
G
 
G
I
 
L
D
 
D
L
 
K
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
I
T
 
K
A
 
C
R
 
E
A
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
A
 
R
V
 
V
T
 
T
A
 
N
S
 
T
G
 
P
D
 
D
L
 
V
L
|
L
T
 
T
H
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
I
W
 
G
Q
 
L
M
 
I
L
 
L
T
 
A
L
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
R
L
 
I
G
 
C
G
 
E
A
 
C
D
 
D
G
 
K
F
 
Y
V
 
V
R
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
A
W
 
W
S
 
K
K
 
F
G
 
G
P
 
D
P
 
F
P
 
K
L
 
L
G
 
T
R
 
T
S
 
K
A
 
F
R
 
S
G
 
G
R
 
K
K
 
R
L
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
I
G
|
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
E
R
 
R
G
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
F
G
 
D
M
 
C
E
 
P
I
 
I
A
 
S
Y
 
Y
H
 
F
S
|
S
R
|
R
R
x
S
P
 
K
V
 
K
A
 
P
E
 
N
V
 
T
A
 
N
D
 
Y
R
 
T
Y
 
Y
E
 
Y
S
 
G
D
 
S
P
 
V
L
 
V
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
W
 
N
A
 
S
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
I
 
V
A
 
A
L
x
C
P
|
P
G
 
L
G
 
T
G
 
P
A
 
E
T
|
T
Q
 
T
S
 
H
L
 
I
V
 
I
D
 
N
R
 
R
A
 
E
F
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
P
V
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
P
A
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
V
D
 
E
G
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
G
 
G
A
|
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
N
 
R
E
|
E
P
 
P
T
 
E
I
 
V
A
 
P
P
 
E
A
 
K
L
 
L
L
 
F
E
 
G
A
 
L
P
 
E
N
 
N
L
 
V
L
 
V
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
|
G
S
 
S
A
 
G
T
 
T
H
 
V
D
 
E
V
 
T
R
 
R
L
 
K
A
 
V
M
 
M
A
 
A
D
 
D
H
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
G
N
 
N
I
 
L
R
 
E
A
 
A
F
 
H
L
 
F
E
 
S
G
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
L

5v6qB Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and malonate (see paper)
46% identity, 80% coverage: 55:301/309 of query aligns to 54:302/319 of 5v6qB

query
sites
5v6qB
P
 
P
A
 
V
G
 
P
L
 
L
L
 
M
A
 
D
R
 
A
L
 
F
P
 
P
A
 
S
L
 
L
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
F
 
F
G
 
G
A
x
V
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
L
 
G
I
 
V
D
 
D
L
 
V
D
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
N
S
 
T
G
 
P
D
 
D
L
 
V
L
|
L
T
 
T
H
 
E
D
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
L
 
I
W
 
G
Q
 
L
M
 
L
L
 
L
T
 
N
L
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
L
L
 
L
G
 
P
G
 
Q
A
 
A
D
 
E
G
 
Q
F
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
S
 
V
K
 
R
-
 
E
G
 
G
P
 
A
P
 
F
P
 
P
L
 
L
G
 
S
-
 
P
R
 
L
S
 
S
A
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
R
K
 
T
L
 
V
G
 
G
V
 
L
L
x
F
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
F
G
 
G
M
 
V
E
 
S
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
S
x
T
R
|
R
R
 
T
P
 
P
V
 
R
A
 
E
E
 
G
V
 
L
A
 
G
D
 
F
R
 
T
Y
 
Y
E
 
H
S
 
P
D
 
T
P
 
L
L
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
W
 
A
A
 
V
D
 
D
I
 
T
V
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
I
L
x
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
G
 
A
A
x
S
T
|
T
Q
 
L
S
 
K
L
 
A
V
 
V
D
 
N
R
 
A
A
 
D
F
 
V
L
 
L
D
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
x
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
D
 
N
G
 
G
R
 
T
V
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
N
 
N
E
|
E
P
 
P
T
 
N
I
 
V
A
 
P
P
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
S
A
 
F
P
 
P
N
 
N
L
 
V
L
 
S
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
x
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
V
D
 
V
V
 
T
R
 
R
L
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
D
 
D
H
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
D
N
 
N
I
 
L
R
 
K
A
 
A
F
 
W
L
 
F
E
 
S

5v7nA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and 2-keto-d-gluconic acid (see paper)
46% identity, 80% coverage: 55:301/309 of query aligns to 53:301/319 of 5v7nA

query
sites
5v7nA
P
 
P
A
 
V
G
 
P
L
 
L
L
 
M
A
 
D
R
 
A
L
 
F
P
 
P
A
 
S
L
 
L
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
F
 
F
G
|
G
A
x
V
G
|
G
I
 
Y
D
 
D
L
 
G
I
 
V
D
 
D
L
 
V
D
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
N
S
 
T
G
 
P
D
 
D
L
 
V
L
|
L
T
 
T
H
 
E
D
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
L
 
I
W
 
G
Q
 
L
M
 
L
L
 
L
T
 
N
L
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
L
L
 
L
G
 
P
G
 
Q
A
 
A
D
 
E
G
 
Q
F
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
S
 
V
K
 
R
-
 
E
G
 
G
P
 
A
P
 
F
P
 
P
L
 
L
G
 
S
-
 
P
R
 
L
S
 
S
A
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
R
K
 
T
L
 
V
G
 
G
V
 
L
L
 
F
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
F
G
 
G
M
 
V
E
 
S
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
S
x
T
R
|
R
R
 
T
P
 
P
V
 
R
A
 
E
E
 
G
V
 
L
A
 
G
D
 
F
R
 
T
Y
 
Y
E
 
H
S
 
P
D
 
T
P
 
L
L
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
W
 
A
A
 
V
D
 
D
I
 
T
V
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
I
L
x
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
G
 
A
A
x
S
T
|
T
Q
 
L
S
 
K
L
 
A
V
 
V
D
 
N
R
 
A
A
 
D
F
 
V
L
 
L
D
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
x
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
D
 
N
G
 
G
R
 
T
V
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
N
 
N
E
|
E
P
 
P
T
 
N
I
 
V
A
 
P
P
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
S
A
 
F
P
 
P
N
 
N
L
 
V
L
 
S
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
x
A
S
|
S
A
 
A
T
 
S
H
 
V
D
 
V
V
 
T
R
|
R
L
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
D
 
D
H
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
D
N
 
N
I
 
L
R
 
K
A
 
A
F
 
W
L
 
F
E
 
S

5j23A Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with 2'-phospho-adp-ribose (see paper)
46% identity, 80% coverage: 55:301/309 of query aligns to 52:300/318 of 5j23A

query
sites
5j23A
P
 
P
A
 
V
G
 
P
L
 
L
L
 
M
A
 
D
R
 
A
L
 
F
P
 
P
A
 
S
L
 
L
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
F
 
F
G
 
G
A
x
V
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
L
 
G
I
 
V
D
 
D
L
 
V
D
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
N
S
 
T
G
 
P
D
 
D
L
 
V
L
|
L
T
 
T
H
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
L
 
I
W
 
G
Q
 
L
M
 
L
L
 
L
T
 
N
L
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
L
L
 
L
G
 
P
G
 
Q
A
 
A
D
 
E
G
 
Q
F
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
S
 
V
K
 
R
-
 
E
G
 
G
P
 
A
P
 
F
P
 
P
L
 
L
G
 
S
-
 
P
R
 
L
S
 
S
A
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
R
K
 
T
L
 
V
G
 
G
V
 
L
L
 
F
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
F
G
 
G
M
 
V
E
 
S
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
S
x
T
R
|
R
R
 
T
P
 
P
V
 
R
A
 
E
E
 
G
V
 
L
A
 
G
D
 
F
R
 
T
Y
 
Y
E
 
H
S
 
P
D
 
T
P
 
L
L
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
W
 
A
A
 
V
D
 
D
I
 
T
V
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
I
L
 
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
G
 
A
A
x
S
T
|
T
Q
 
L
S
 
K
L
 
A
V
 
V
D
 
N
R
 
A
A
 
D
F
 
V
L
 
L
D
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
 
V
A
 
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
D
 
N
G
 
G
R
 
T
V
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
N
 
N
E
|
E
P
 
P
T
 
N
I
 
V
A
 
P
P
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
S
A
 
F
P
 
P
N
 
N
L
 
V
L
 
S
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
 
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
V
D
 
V
V
 
T
R
 
R
L
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
D
 
D
H
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
D
N
 
N
I
 
L
R
 
K
A
 
A
F
 
W
L
 
F
E
 
S

5v7gA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
46% identity, 80% coverage: 55:301/309 of query aligns to 52:300/317 of 5v7gA

query
sites
5v7gA
P
 
P
A
 
V
G
 
P
L
 
L
L
 
M
A
 
D
R
 
A
L
 
F
P
 
P
A
 
S
L
 
L
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
F
 
F
G
|
G
A
x
V
G
|
G
I
 
Y
D
 
D
L
 
G
I
 
V
D
 
D
L
 
V
D
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
N
S
 
T
G
 
P
D
 
D
L
 
V
L
|
L
T
 
T
H
 
E
D
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
L
 
I
W
 
G
Q
 
L
M
 
L
L
 
L
T
 
N
L
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
L
L
 
L
G
 
P
G
 
Q
A
 
A
D
 
E
G
 
Q
F
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
S
 
V
K
 
R
-
 
E
G
 
G
P
 
A
P
 
F
P
 
P
L
 
L
G
 
S
-
 
P
R
 
L
S
 
S
A
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
R
K
 
T
L
 
V
G
 
G
V
 
L
L
x
F
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
F
G
 
G
M
 
V
E
 
S
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
S
x
T
R
|
R
R
 
T
P
 
P
V
 
R
A
 
E
E
 
G
V
 
L
A
 
G
D
 
F
R
 
T
Y
 
Y
E
 
H
S
 
P
D
 
T
P
 
L
L
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
W
 
A
A
 
V
D
 
D
I
 
T
V
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
I
L
x
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
G
 
A
A
x
S
T
|
T
Q
 
L
S
 
K
L
 
A
V
 
V
D
 
N
R
 
A
A
 
D
F
 
V
L
 
L
D
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
x
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
D
 
N
G
 
G
R
 
T
V
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
N
 
N
E
|
E
P
 
P
T
 
N
I
 
V
A
 
P
P
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
S
A
 
F
P
 
P
N
 
N
L
 
V
L
 
S
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
G
x
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
V
D
 
V
V
 
T
R
 
R
L
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
D
 
D
H
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
D
N
 
N
I
 
L
R
 
K
A
 
A
F
 
W
L
 
F
E
 
S

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
39% identity, 88% coverage: 32:302/309 of query aligns to 35:314/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
P
 
P
E
 
R
G
 
E
W
 
K
L
 
L
A
 
L
E
 
E
H
 
K
G
 
V
G
 
K
S
 
D
V
 
V
Q
 
D
C
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
H
x
M
A
x
L
M
 
S
R
 
E
G
 
R
P
 
I
P
 
D
A
 
Q
G
 
E
L
 
V
L
 
F
A
 
E
R
 
N
L
 
A
P
 
P
A
 
R
L
 
L
K
 
R
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
F
x
Y
G
x
A
A
x
V
G
|
G
I
 
Y
D
 
D
L
 
N
I
 
I
D
 
D
L
 
V
D
 
E
T
 
E
A
 
A
R
 
T
A
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
V
 
V
T
 
T
A
 
N
S
 
T
G
 
P
D
 
D
L
 
V
L
|
L
T
 
T
H
 
N
D
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
L
 
H
A
 
A
L
 
F
W
 
A
Q
 
L
M
 
L
L
 
L
T
 
A
L
 
T
L
 
A
R
 
R
G
 
H
L
 
V
G
 
V
G
 
K
A
 
G
D
 
D
G
 
K
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
S
 
K
K
 
R
G
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
P
 
H
P
 
P
P
 
K
-
 
W
-
 
F
L
 
L
G
 
G
R
 
Y
S
 
E
A
 
L
R
 
Y
G
 
G
R
 
K
K
 
T
L
 
I
G
 
G
V
 
I
L
 
V
G
 
G
F
|
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
A
E
 
K
A
 
G
V
 
F
G
 
N
M
 
M
E
 
R
I
 
I
A
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
S
|
S
R
|
R
-
 
T
-
 
R
R
 
K
P
 
S
V
 
Q
A
 
A
E
 
E
V
 
K
A
 
E
D
 
L
R
 
G
Y
 
A
E
 
E
S
 
Y
D
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
E
-
 
E
L
 
V
A
 
L
R
 
K
W
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
V
V
 
I
I
 
L
A
|
A
L
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
G
 
K
A
 
E
T
|
T
Q
 
M
S
 
Y
L
 
M
V
 
I
D
 
N
R
 
E
A
 
E
F
 
R
L
 
L
D
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
D
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
E
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
W
V
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
T
 
Y
I
 
Y
A
 
N
P
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
F
E
 
S
A
 
L
P
 
D
N
 
N
L
 
V
L
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
H
 
F
D
 
E
V
 
A
R
 
R
L
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
A
D
 
E
H
 
L
V
 
V
V
 
A
T
 
R
N
 
N
I
 
L
R
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
K
E
 
R
G
 
G

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
40% identity, 88% coverage: 32:302/309 of query aligns to 34:313/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
P
 
P
E
 
R
G
 
E
W
 
V
L
 
L
A
 
L
E
 
E
H
 
K
G
 
V
G
 
K
S
 
D
V
 
V
Q
 
D
C
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
H
 
M
A
 
L
M
 
S
R
 
E
G
 
K
P
 
I
P
 
D
A
 
R
G
 
E
L
 
V
L
 
F
A
 
D
R
 
A
L
 
A
P
 
P
A
 
R
L
 
L
K
 
R
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
F
 
Y
G
 
A
A
x
V
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
L
 
N
I
 
I
D
 
D
L
 
I
D
 
E
T
 
E
A
 
A
R
 
T
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
V
 
V
T
 
T
A
 
N
S
 
T
G
 
P
D
 
D
L
 
V
L
|
L
T
 
T
H
 
D
D
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
W
W
 
A
Q
 
L
M
 
L
L
 
L
T
 
A
L
 
A
L
 
A
R
 
R
G
 
H
L
 
V
G
 
V
G
 
K
A
 
G
D
 
D
G
 
K
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
S
 
K
K
 
R
G
 
R
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
P
 
K
P
 
M
P
 
F
L
 
L
G
 
G
R
 
Y
S
 
D
A
 
V
R
 
Y
G
 
G
R
 
K
K
 
T
L
 
I
G
 
G
V
 
I
L
 
V
G
|
G
F
|
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
A
E
 
K
A
 
G
V
 
F
G
 
G
M
 
M
E
 
R
I
 
I
A
 
L
Y
 
Y
-
 
T
-
x
A
H
x
R
S
|
S
R
 
R
R
x
K
P
 
P
V
 
E
A
 
A
E
 
E
V
 
K
A
 
E
D
 
L
R
 
G
Y
 
A
E
 
E
S
 
F
D
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
E
-
 
E
L
 
L
A
 
L
R
 
R
W
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
L
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
G
 
K
A
x
E
T
|
T
Q
 
Y
S
 
H
L
 
M
V
 
I
D
 
N
R
 
E
A
 
E
F
 
R
L
 
L
D
 
R
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
D
 
T
G
 
A
L
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
I
x
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
E
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
W
V
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
T
 
Y
I
 
Y
A
 
D
P
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
F
E
 
A
A
 
L
P
 
D
N
 
N
L
 
V
L
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
H
 
F
D
 
G
V
 
A
R
 
R
L
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
D
 
E
H
 
L
V
 
V
V
 
A
T
 
K
N
 
N
I
 
L
R
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
K
E
 
N
G
 
G

2dbqA Crystal structure of glyoxylate reductase (ph0597) from pyrococcus horikoshii ot3, complexed with NADP (i41) (see paper)
39% identity, 89% coverage: 27:302/309 of query aligns to 30:314/333 of 2dbqA

query
sites
2dbqA
D
 
D
R
 
E
L
 
K
D
 
E
D
 
I
P
 
P
E
 
R
G
 
E
W
 
I
L
 
L
A
 
L
E
 
K
H
 
K
G
 
V
G
 
K
S
 
E
V
 
V
Q
 
D
C
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
H
 
M
A
 
L
M
 
S
R
 
E
G
 
R
P
 
I
P
 
D
A
 
K
G
 
E
L
 
V
L
 
F
A
 
E
R
 
N
L
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
K
 
R
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
F
 
Y
G
 
A
A
x
V
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
L
 
N
I
 
I
D
 
D
L
 
I
D
 
E
T
 
E
A
 
A
R
 
T
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
V
 
V
T
 
T
A
 
N
S
 
T
G
 
P
D
 
D
L
 
V
L
|
L
T
 
T
H
 
D
D
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
F
W
 
A
Q
 
L
M
 
L
L
 
L
T
 
A
L
 
T
L
 
A
R
 
R
G
 
H
L
 
V
G
 
V
G
 
K
A
 
G
D
 
D
G
 
R
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
S
 
K
K
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
V
-
 
A
G
 
W
P
 
H
P
 
P
P
 
K
-
 
W
-
 
F
L
 
L
G
 
G
R
 
Y
S
 
D
A
 
V
R
 
Y
G
 
G
R
 
K
K
 
T
L
 
I
G
 
G
V
 
I
L
 
I
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
A
E
 
K
A
 
G
V
 
F
G
 
N
M
 
M
E
 
R
I
 
I
A
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
S
|
S
R
|
R
R
x
T
P
 
R
V
 
K
A
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
E
D
 
R
R
 
E
Y
 
L
-
 
N
-
 
A
E
 
E
S
 
F
D
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
E
-
 
D
L
 
L
A
 
L
R
 
R
W
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
V
V
 
V
I
 
L
A
|
A
L
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
G
 
R
A
 
E
T
|
T
Q
 
Y
S
 
H
L
 
L
V
 
I
D
 
N
R
 
E
A
 
E
F
 
R
L
 
L
D
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
D
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
E
 
N
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
W
V
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
T
 
Y
I
 
Y
A
 
N
P
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
F
E
 
K
A
 
L
P
 
D
N
 
N
L
 
V
L
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
F
D
 
G
V
 
A
R
 
R
L
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
D
 
E
H
 
L
V
 
V
V
 
A
T
 
K
N
 
N
I
 
L
R
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
K
E
 
R
G
 
G

O58320 Glyoxylate reductase; EC 1.1.1.26 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3)
39% identity, 89% coverage: 27:302/309 of query aligns to 30:314/334 of O58320

query
sites
O58320
D
 
D
R
 
E
L
 
K
D
 
E
D
 
I
P
 
P
E
 
R
G
 
E
W
 
I
L
 
L
A
 
L
E
 
K
H
 
K
G
 
V
G
 
K
S
 
E
V
 
V
Q
 
D
C
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
H
 
M
A
 
L
M
 
S
R
 
E
G
 
R
P
 
I
P
 
D
A
 
K
G
 
E
L
 
V
L
 
F
A
 
E
R
 
N
L
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
K
 
R
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
F
 
Y
G
 
A
A
 
V
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
L
 
N
I
 
I
D
 
D
L
 
I
D
 
E
T
 
E
A
 
A
R
 
T
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
V
 
V
T
 
T
A
 
N
S
 
T
G
 
P
D
 
D
L
 
V
L
 
L
T
 
T
H
 
D
D
 
A
V
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
F
W
 
A
Q
 
L
M
 
L
L
 
L
T
 
A
L
 
T
L
 
A
R
 
R
G
 
H
L
 
V
G
 
V
G
 
K
A
 
G
D
 
D
G
 
R
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
S
 
K
K
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
V
-
 
A
G
 
W
P
 
H
P
 
P
P
 
K
-
 
W
-
 
F
L
 
L
G
 
G
R
 
Y
S
 
D
A
 
V
R
 
Y
G
 
G
R
 
K
K
 
T
L
 
I
G
 
G
V
 
I
L
 
I
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
A
E
 
K
A
 
G
V
 
F
G
 
N
M
 
M
E
 
R
I
 
I
A
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
S
|
S
R
|
R
R
x
T
P
 
R
V
 
K
A
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
E
D
 
R
R
 
E
Y
 
L
-
 
N
-
 
A
E
 
E
S
 
F
D
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
E
-
 
D
L
 
L
A
 
L
R
 
R
W
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
L
 
V
P
 
P
G
 
L
G
 
T
G
 
R
A
 
E
T
 
T
Q
 
Y
S
 
H
L
 
L
V
 
I
D
 
N
R
 
E
A
 
E
F
 
R
L
 
L
D
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
D
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
E
 
N
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
W
V
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
N
 
E
E
 
E
P
 
P
T
 
Y
I
 
Y
A
 
N
P
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
F
E
 
K
A
 
L
P
 
D
N
 
N
L
 
V
L
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
x
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
F
D
 
G
V
 
A
R
 
R
L
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
D
 
E
H
 
L
V
 
V
V
 
A
T
 
K
N
 
N
I
 
L
R
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
K
E
 
R
G
 
G

2gcgA Ternary crystal structure of human glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase (see paper)
36% identity, 78% coverage: 65:305/309 of query aligns to 71:318/324 of 2gcgA

query
sites
2gcgA
L
 
L
K
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
S
N
 
T
F
 
M
G
x
S
A
x
V
G
|
G
I
 
I
D
 
D
L
 
H
I
 
L
D
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
E
A
 
I
R
 
K
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
R
V
 
V
T
 
G
A
 
Y
S
 
T
G
 
P
D
 
D
L
 
V
L
|
L
T
 
T
H
 
D
D
 
T
V
x
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
V
W
 
S
Q
 
L
M
 
L
L
 
L
T
 
T
L
 
T
L
 
C
R
 
R
G
 
R
L
 
L
G
 
P
G
 
E
A
 
A
D
 
I
G
 
E
F
 
E
V
 
V
R
 
K
A
 
N
G
 
G
Q
 
G
W
 
W
S
 
T
K
 
S
G
 
W
P
 
K
P
 
P
P
 
L
-
 
W
-
 
L
L
 
C
G
 
G
R
 
Y
S
 
G
A
 
L
R
 
T
G
 
Q
R
 
S
K
 
T
L
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
I
G
|
G
F
 
L
G
|
G
R
 
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
E
 
K
A
 
P
V
 
F
G
 
G
M
 
V
E
 
Q
-
 
R
I
 
F
A
 
L
Y
 
Y
H
 
T
S
x
G
R
|
R
R
 
Q
P
 
P
V
x
R
A
 
P
E
 
E
V
 
E
A
 
A
D
 
A
R
 
E
Y
 
F
E
 
Q
S
 
A
D
 
E
P
 
F
L
 
V
A
 
S
-
 
T
-
 
P
-
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
A
W
 
Q
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
V
I
 
V
A
 
A
L
x
C
P
x
S
G
 
L
G
 
T
G
 
P
A
 
A
T
|
T
Q
 
E
S
 
G
L
 
L
V
 
C
D
 
N
R
 
K
A
 
D
F
 
F
L
 
F
D
 
Q
A
 
K
L
 
M
G
 
K
P
 
E
D
 
T
G
 
A
L
 
V
L
 
F
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
R
|
R
G
 
G
S
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
E
 
D
A
 
D
L
 
L
V
 
Y
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
T
R
 
S
N
 
P
E
|
E
-
 
P
-
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
N
A
 
H
P
 
P
A
 
-
L
 
L
L
 
L
E
 
T
A
 
L
P
 
K
N
 
N
L
 
C
L
 
V
L
 
I
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
R
V
 
T
R
 
R
L
 
N
A
 
T
M
 
M
A
 
S
D
 
L
H
 
L
V
 
A
V
 
A
T
 
N
N
 
N
I
 
L
R
 
L
A
 
A
F
 
G
L
 
L
E
 
R
G
 
G
R
 
E
P
 
P
L
 
M

Sites not aligning to the query:

Q9UBQ7 Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase; EC 1.1.1.79; EC 1.1.1.81 from Homo sapiens (Human) (see paper)
36% identity, 78% coverage: 65:305/309 of query aligns to 75:322/328 of Q9UBQ7

query
sites
Q9UBQ7
L
 
L
K
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
S
N
 
T
F
 
M
G
 
S
A
x
V
G
|
G
I
 
I
D
 
D
L
 
H
I
 
L
D
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
E
A
 
I
R
 
K
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
R
V
 
V
T
 
G
A
 
Y
S
 
T
G
 
P
D
 
D
L
 
V
L
 
L
T
 
T
H
 
D
D
 
T
V
 
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
V
W
 
S
Q
 
L
M
 
L
L
 
L
T
 
T
L
 
T
L
 
C
R
 
R
G
 
R
L
 
L
G
 
P
G
 
E
A
 
A
D
 
I
G
 
E
F
 
E
V
 
V
R
 
K
A
 
N
G
 
G
Q
 
G
W
 
W
S
 
T
K
 
S
G
 
W
P
 
K
P
 
P
P
 
L
-
 
W
-
 
L
L
 
C
G
 
G
R
 
Y
S
 
G
A
 
L
R
 
T
G
 
Q
R
 
S
K
 
T
L
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
I
G
 
G
F
 
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
E
 
K
A
 
P
V
 
F
G
 
G
M
 
V
E
 
Q
-
 
R
I
 
F
A
 
L
Y
 
Y
H
 
T
S
 
G
R
|
R
R
x
Q
P
|
P
V
x
R
A
 
P
E
 
E
V
 
E
A
 
A
D
 
A
R
 
E
Y
 
F
E
 
Q
S
 
A
D
 
E
P
 
F
L
 
V
A
 
S
-
 
T
-
 
P
-
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
A
W
 
Q
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
C
P
x
S
G
 
L
G
 
T
G
 
P
A
 
A
T
 
T
Q
 
E
S
 
G
L
 
L
V
 
C
D
 
N
R
 
K
A
 
D
F
 
F
L
 
F
D
 
Q
A
 
K
L
 
M
G
 
K
P
 
E
D
 
T
G
 
A
L
 
V
L
 
F
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
R
|
R
G
 
G
S
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
E
 
D
A
 
D
L
 
L
V
 
Y
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
T
R
 
S
N
 
P
E
 
E
-
 
P
-
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
N
A
 
H
P
 
P
A
 
-
L
 
L
L
 
L
E
 
T
A
 
L
P
 
K
N
 
N
L
 
C
L
 
V
L
 
I
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
x
I
G
|
G
S
|
S
A
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
R
V
 
T
R
 
R
L
 
N
A
 
T
M
 
M
A
 
S
D
 
L
H
 
L
V
 
A
V
 
A
T
 
N
N
 
N
I
 
L
R
 
L
A
 
A
F
 
G
L
 
L
E
 
R
G
 
G
R
 
E
P
 
P
L
 
M

4e5mA Thermostable phosphite dehydrogenase e175a/a176r in complex with NADP (see paper)
39% identity, 81% coverage: 56:305/309 of query aligns to 59:322/329 of 4e5mA

query
sites
4e5mA
A
 
A
G
 
D
L
 
F
L
 
L
A
 
Q
R
 
A
L
 
C
P
 
P
A
 
E
L
 
L
K
 
R
L
 
V
I
 
I
A
 
G
N
 
C
F
 
A
G
 
L
A
x
K
G
 
G
I
 
F
D
 
D
L
 
N
I
 
F
D
 
D
L
 
V
D
 
D
T
 
A
A
 
C
R
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
W
V
 
L
T
 
T
A
 
F
S
 
V
G
 
P
D
 
D
L
 
L
L
|
L
T
 
T
H
 
V
D
 
P
V
x
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
I
W
 
G
Q
 
L
M
 
A
L
 
V
T
 
G
L
 
L
L
 
G
R
 
R
G
 
H
L
 
L
G
 
R
G
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
W
 
F
S
 
R
K
 
G
G
 
W
P
 
Q
P
 
P
P
 
R
L
 
F
-
 
Y
G
 
G
R
 
T
S
 
G
A
 
L
R
 
D
G
 
N
R
 
A
K
 
T
L
 
V
G
 
G
V
 
F
L
 
L
G
 
G
F
 
M
G
|
G
R
x
A
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
I
 
M
A
 
A
R
 
D
R
 
R
G
 
L
E
 
Q
A
 
G
V
 
W
G
 
G
M
 
A
E
 
T
I
 
L
A
 
Q
Y
 
Y
H
 
H
S
 
A
R
|
R
R
 
K
P
 
A
V
 
L
-
 
D
A
 
T
E
 
Q
V
 
T
A
 
E
D
 
Q
R
 
R
Y
 
L
E
 
G
S
 
L
D
 
R
P
 
Q
L
 
V
A
 
A
L
 
C
A
 
S
R
 
E
W
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
S
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
L
I
 
L
A
 
A
L
|
L
P
|
P
G
 
L
G
 
N
G
 
A
A
 
D
T
|
T
Q
 
L
S
 
H
L
 
L
V
 
V
D
 
N
R
 
A
A
 
E
F
 
L
L
 
L
D
 
A
A
 
L
L
 
V
G
 
R
P
 
P
D
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
I
x
P
A
x
C
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
E
D
 
R
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
A
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
N
 
M
E
|
E
-
 
D
-
 
W
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
R
-
 
P
P
 
Q
T
 
Q
I
 
I
A
 
D
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
A
A
 
H
P
 
P
N
 
N
L
 
T
L
 
L
L
 
F
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
V
H
 
R
D
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
E
M
 
I
A
 
E
D
 
R
H
 
C
V
 
A
V
 
A
T
 
Q
N
 
N
I
 
I
R
 
L
A
 
Q
F
 
A
L
 
L
E
 
A
G
 
G
-
 
E
R
 
R
P
 
P
L
 
I

4e5pA Thermostable phosphite dehydrogenase a176r variant in complex with nad (see paper)
39% identity, 81% coverage: 56:305/309 of query aligns to 59:322/332 of 4e5pA

query
sites
4e5pA
A
 
A
G
 
D
L
 
F
L
 
L
A
 
Q
R
 
A
L
 
C
P
 
P
A
 
E
L
 
L
K
 
R
L
 
V
I
 
I
A
 
G
N
 
C
F
 
A
G
 
L
A
x
K
G
 
G
I
 
F
D
 
D
L
 
N
I
 
F
D
 
D
L
 
V
D
 
D
T
 
A
A
 
C
R
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
W
V
 
L
T
 
T
A
 
F
S
 
V
G
 
P
D
 
D
L
 
L
L
|
L
T
 
T
H
 
V
D
 
P
V
x
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
I
W
 
G
Q
 
L
M
 
A
L
 
V
T
 
G
L
 
L
L
 
G
R
 
R
G
 
H
L
 
L
G
 
R
G
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
W
 
F
S
 
R
K
 
G
G
 
W
P
 
Q
P
 
P
P
 
R
L
 
F
-
 
Y
G
 
G
R
 
T
S
 
G
A
 
L
R
 
D
G
 
N
R
 
A
K
 
T
L
 
V
G
 
G
V
 
F
L
 
L
G
 
G
F
 
M
G
|
G
R
x
A
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
I
 
M
A
 
A
R
 
D
R
 
R
G
 
L
E
 
Q
A
 
G
V
 
W
G
 
G
M
 
A
E
 
T
I
 
L
A
 
Q
Y
 
Y
H
 
H
S
x
A
R
|
R
R
 
K
P
 
A
V
 
L
-
 
D
A
 
T
E
 
Q
V
 
T
A
 
E
D
 
Q
R
 
R
Y
 
L
E
 
G
S
 
L
D
 
R
P
 
Q
L
 
V
A
 
A
L
 
C
A
 
S
R
 
E
W
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
S
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
L
I
 
L
A
 
A
L
|
L
P
|
P
G
 
L
G
 
N
G
 
A
A
 
D
T
|
T
Q
 
L
S
 
H
L
 
L
V
 
V
D
 
N
R
 
A
A
 
E
F
 
L
L
 
L
D
 
A
A
 
L
L
 
V
G
 
R
P
 
P
D
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
I
x
P
A
x
C
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
E
D
 
R
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
A
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
N
 
M
E
|
E
-
 
D
-
 
W
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
R
-
 
P
P
 
Q
T
 
Q
I
 
I
A
 
D
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
A
A
 
H
P
 
P
N
 
N
L
 
T
L
 
L
L
 
F
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
 
G
S
 
S
A
 
A
T
 
V
H
 
R
D
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
E
M
 
I
A
 
E
D
 
R
H
 
C
V
 
A
V
 
A
T
 
Q
N
 
N
I
 
I
R
 
L
A
 
Q
F
 
A
L
 
L
E
 
A
G
 
G
-
 
E
R
 
R
P
 
P
L
 
I

4e5kA Thermostable phosphite dehydrogenase in complex with NAD and sulfite (see paper)
38% identity, 81% coverage: 56:305/309 of query aligns to 59:322/329 of 4e5kA

query
sites
4e5kA
A
 
A
G
 
D
L
 
F
L
 
L
A
 
Q
R
 
A
L
 
C
P
 
P
A
 
E
L
 
L
K
 
R
L
 
V
I
 
I
A
 
G
N
 
C
F
 
A
G
x
L
A
x
K
G
|
G
I
 
F
D
 
D
L
 
N
I
 
F
D
 
D
L
 
V
D
 
D
T
 
A
A
 
C
R
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
W
V
 
L
T
 
T
A
 
F
S
 
V
G
 
P
D
 
D
L
 
L
L
|
L
T
 
T
H
 
V
D
 
P
V
x
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
I
W
 
G
Q
 
L
M
 
A
L
 
V
T
 
G
L
 
L
L
 
G
R
 
R
G
 
H
L
 
L
G
 
R
G
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
K
W
 
F
S
 
R
K
 
G
G
 
W
P
 
Q
P
 
P
P
 
R
L
 
F
-
 
Y
G
 
G
R
 
T
S
 
G
A
 
L
R
 
D
G
 
N
R
 
A
K
 
T
L
 
V
G
 
G
V
 
F
L
 
L
G
|
G
F
 
M
G
|
G
R
x
A
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
I
 
M
A
 
A
R
 
D
R
 
R
G
 
L
E
 
Q
A
 
G
V
 
W
G
 
G
M
 
A
E
 
T
I
 
L
A
 
Q
Y
 
Y
H
|
H
S
x
E
R
x
A
R
 
K
P
 
A
V
 
L
-
 
D
A
 
T
E
 
Q
V
 
T
A
 
E
D
 
Q
R
 
R
Y
 
L
E
 
G
S
 
L
D
 
R
P
 
Q
L
 
V
A
 
A
L
 
C
A
 
S
R
 
E
W
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
S
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
L
I
 
L
A
|
A
L
|
L
P
|
P
G
 
L
G
 
N
G
 
A
A
 
D
T
 
T
Q
 
L
S
 
H
L
 
L
V
 
V
D
 
N
R
 
A
A
 
E
F
 
L
L
 
L
D
 
A
A
 
L
L
 
V
G
 
R
P
 
P
D
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
I
x
P
A
x
C
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
E
D
 
R
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
A
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
N
 
M
E
|
E
-
 
D
-
 
W
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
R
-
 
P
P
 
Q
T
 
Q
I
 
I
A
 
D
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
A
A
 
H
P
 
P
N
 
N
L
 
T
L
 
L
L
 
F
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
V
H
 
R
D
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
E
M
 
I
A
 
E
D
 
R
H
 
C
V
 
A
V
 
A
T
 
Q
N
 
N
I
 
I
R
 
L
A
 
Q
F
 
A
L
 
L
E
 
A
G
 
G
-
 
E
R
 
R
P
 
P
L
 
I

Sites not aligning to the query:

2w2lA Crystal structure of the holo forms of rhodotorula graminis d- mandelate dehydrogenase at 2.5a.
35% identity, 81% coverage: 56:306/309 of query aligns to 71:335/346 of 2w2lA

query
sites
2w2lA
A
 
A
G
 
D
L
 
L
L
 
I
A
 
S
R
 
H
L
 
L
P
 
P
A
 
S
-
 
S
L
 
L
K
 
K
L
 
V
I
 
F
A
 
A
N
 
A
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
F
D
 
D
L
 
W
I
 
L
D
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
A
A
 
L
R
 
N
A
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
A
V
 
F
T
 
A
A
 
N
S
 
S
-
 
R
-
 
G
-
 
A
G
|
G
D
 
D
L
 
T
L
 
A
T
|
T
H
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
L
W
 
Y
Q
 
L
M
 
I
L
 
L
T
 
S
L
 
V
L
 
F
R
 
R
G
 
L
L
 
A
G
 
S
G
 
Y
A
 
S
D
 
E
G
 
R
F
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
T
G
 
G
Q
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
T
W
 
F
S
 
N
K
 
R
G
 
V
P
 
H
P
 
L
P
 
E
L
 
I
G
 
G
R
 
K
S
 
S
A
 
A
-
 
H
-
 
N
-
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
H
K
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
A
L
 
V
G
 
G
F
 
L
G
|
G
R
x
A
I
|
I
G
 
Q
Q
 
K
A
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
K
G
 
A
-
 
V
E
 
H
A
 
G
V
 
L
G
 
G
M
 
M
E
 
K
I
 
L
A
 
V
Y
 
Y
H
 
Y
S
x
D
R
 
V
R
 
A
P
 
P
V
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
R
A
 
V
D
 
D
R
 
S
Y
 
L
E
 
E
S
 
E
D
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
L
A
 
A
R
 
R
W
 
R
A
 
S
D
 
D
I
 
C
V
 
V
V
 
S
I
 
V
A
 
S
L
x
V
P
|
P
G
 
Y
G
 
M
G
 
K
A
 
L
T
|
T
Q
 
H
S
 
H
L
 
L
V
 
I
D
 
D
R
 
E
A
 
A
F
 
F
L
 
F
D
 
A
A
 
A
L
 
M
G
 
K
P
 
P
D
 
G
G
 
S
L
 
R
L
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
P
V
 
V
V
 
I
D
 
S
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
L
G
 
L
G
 
S
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
H
R
 
E
N
 
F
E
|
E
P
 
P
T
 
Q
I
 
V
A
 
S
P
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
E
A
 
M
P
 
K
N
 
H
L
 
V
L
 
T
L
 
L
T
 
T
P
 
T
H
|
H
V
 
I
G
|
G
S
x
G
A
 
V
T
 
A
H
 
I
D
 
E
V
 
T
R
 
F
L
 
H
A
 
E
M
 
F
A
 
E
D
 
R
H
 
L
V
 
T
V
 
M
T
 
T
N
 
N
I
 
I
-
 
D
R
 
R
A
 
F
F
 
L
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
L

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
32% identity, 90% coverage: 25:302/309 of query aligns to 25:304/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
I
 
I
F
 
Y
D
 
E
R
 
E
L
 
Y
D
 
P
D
 
D
P
 
-
E
 
E
G
 
D
W
 
R
L
 
L
A
 
V
E
 
E
H
 
L
G
 
V
G
 
K
S
 
D
V
 
V
Q
 
E
C
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
V
H
 
R
A
 
S
M
 
K
R
 
P
G
 
K
P
 
V
P
 
T
A
 
R
G
 
R
L
 
V
L
 
I
A
 
E
R
 
S
L
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
R
F
 
A
G
 
G
A
 
V
G
 
G
I
 
L
D
 
D
L
 
N
I
 
I
D
 
D
L
 
V
D
 
E
T
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
E
V
 
V
T
 
V
A
 
N
S
 
A
G
 
P
D
 
A
L
 
A
L
x
S
T
 
S
H
 
R
D
 
S
V
|
V
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
V
W
 
G
Q
 
L
M
 
M
L
 
F
T
 
S
L
 
V
L
 
A
R
 
R
G
 
K
L
 
I
G
 
A
G
 
F
A
 
A
D
 
D
G
 
R
F
 
K
V
 
M
R
 
R
A
 
E
G
 
G
Q
 
V
W
 
W
S
 
A
K
 
K
G
 
-
P
 
K
P
 
E
P
 
A
L
 
M
G
 
G
R
 
I
S
 
E
A
 
L
R
 
E
G
 
G
R
 
K
K
 
T
L
 
I
G
 
G
V
 
I
L
 
I
G
|
G
F
|
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Y
A
 
Q
I
 
V
A
 
A
R
 
K
R
 
I
G
 
A
E
 
N
A
 
A
V
 
L
G
 
G
M
 
M
E
 
N
I
 
I
A
 
L
Y
 
L
H
x
Y
S
x
D
R
x
P
R
 
Y
P
 
P
V
 
N
A
 
E
E
 
E
V
 
R
A
 
A
D
 
K
R
 
E
Y
 
V
E
 
N
S
 
G
-
 
K
-
 
F
-
 
V
D
 
D
P
 
L
L
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
L
R
 
K
W
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
V
V
 
T
I
 
I
A
 
H
L
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
V
G
 
E
A
 
S
T
|
T
Q
 
Y
S
 
H
L
 
L
V
 
I
D
 
N
R
 
E
A
 
E
F
 
R
L
 
L
D
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
D
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
S
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
E
 
N
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
W
V
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
T
 
L
I
 
-
A
 
-
P
 
P
A
 
K
-
 
D
-
 
H
-
 
P
L
 
L
L
 
T
E
 
K
A
 
F
P
 
D
N
 
N
L
 
V
L
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
V
D
 
E
V
 
A
R
 
Q
L
 
E
A
 
R
M
 
A
A
 
G
D
 
V
H
 
E
V
 
V
V
 
A
T
 
E
N
 
K
I
 
V
R
 
V
A
 
K
F
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G

P87228 Putative D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
30% identity, 80% coverage: 64:309/309 of query aligns to 119:377/466 of P87228

query
sites
P87228
A
 
S
L
 
L
K
 
I
L
 
V
I
 
I
A
 
G
N
 
C
F
 
F
G
 
C
A
 
I
G
 
G
I
 
T
D
 
N
L
 
Q
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
F
A
 
A
R
 
A
A
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
V
T
 
F
A
 
N
S
 
S
G
 
P
D
 
Y
L
 
A
L
 
N
T
 
S
H
 
R
D
 
S
V
 
V
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
V
L
 
I
W
 
G
Q
 
Y
M
 
I
L
 
I
T
 
S
L
 
L
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
L
 
V
G
 
G
G
 
D
A
 
R
D
 
S
G
 
L
F
 
E
V
 
L
R
 
H
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
S
 
N
K
 
K
G
 
V
P
 
S
P
 
S
P
 
G
L
 
C
G
 
W
R
 
E
S
 
-
A
 
I
R
 
R
G
 
G
R
 
K
K
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
R
 
H
I
 
I
G
 
G
Q
 
S
A
 
Q
I
 
L
A
 
S
R
 
V
R
 
L
G
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
M
G
 
G
M
 
L
E
 
H
I
 
V
A
 
V
Y
 
Y
H
 
Y
S
 
D
R
 
I
R
 
L
P
 
P
V
 
I
A
 
M
E
 
P
V
 
L
-
 
G
-
 
S
A
 
A
D
 
K
R
 
Q
Y
 
L
E
 
S
S
 
S
D
 
L
P
 
P
L
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
H
R
 
R
W
 
-
A
 
A
D
 
D
I
 
F
V
 
V
V
 
S
I
 
L
A
 
H
L
 
V
P
 
P
G
 
A
G
x
S
G
 
P
A
 
E
T
 
T
Q
 
K
S
 
N
L
 
M
V
 
I
D
 
S
R
 
S
A
 
K
F
 
E
L
 
F
D
 
A
A
 
A
L
 
M
G
 
K
P
 
E
D
 
G
G
 
S
L
 
Y
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
 
A
A
 
S
R
 
R
G
 
G
S
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
I
E
 
P
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
D
A
 
A
L
 
S
R
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
R
 
P
N
 
S
E
 
E
P
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
L
-
 
N
T
 
S
I
 
W
A
 
T
P
 
S
A
 
E
L
 
L
L
 
T
E
 
H
A
 
C
P
 
K
N
 
N
L
 
I
L
 
I
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
 
H
V
 
I
G
 
G
S
 
G
A
 
S
T
 
T
H
 
E
D
 
E
V
 
A
R
 
Q
L
 
Y
A
 
N
M
 
I
A
 
G
D
 
I
H
 
E
V
 
V
V
 
S
T
 
E
N
 
A
I
 
L
R
 
T
A
 
R
F
 
Y
L
 
I
E
 
N
G
 
E
R
 
G
P
 
N
L
 
S
I
 
I
G
 
G
L
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
28% identity, 85% coverage: 46:309/309 of query aligns to 51:316/533 of O43175

query
sites
O43175
L
 
L
I
 
I
T
 
V
H
 
R
A
 
S
M
 
A
R
 
T
G
 
K
P
 
V
P
 
T
A
 
A
G
 
D
L
 
V
L
 
I
A
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
F
 
A
G
 
G
A
x
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
L
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
E
T
 
A
A
 
A
R
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
L
V
 
V
T
 
M
A
 
N
S
 
T
G
 
P
D
 
N
L
 
G
L
 
N
T
 
S
H
 
L
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
T
L
 
C
W
 
G
Q
 
M
M
 
I
L
 
M
T
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
L
 
I
G
 
P
G
 
Q
A
 
A
D
 
T
G
 
A
F
 
S
V
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
S
 
E
K
x
R
G
 
-
P
 
K
P
 
K
P
 
F
L
 
M
G
 
G
R
 
T
S
 
E
A
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
K
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
L
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
G
 
M
E
 
Q
A
 
S
V
 
F
G
 
G
M
 
M
E
 
K
I
 
T
A
 
I
Y
 
G
H
 
Y
S
x
D
R
 
P
R
 
I
P
 
I
V
 
S
A
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
S
D
 
A
R
 
S
Y
 
F
E
 
G
S
 
V
D
 
Q
P
 
Q
L
 
L
A
 
P
L
 
L
A
 
E
R
 
E
-
 
I
W
 
W
-
 
P
-
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
T
I
 
V
A
 
H
L
x
T
P
 
P
G
 
L
G
 
L
G
 
P
A
 
S
T
 
T
Q
 
T
S
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
N
R
 
D
A
 
N
F
 
T
L
 
F
D
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
L
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
I
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
D
 
S
G
 
G
R
 
Q
V
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
|
D
V
|
V
F
 
F
R
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
T
 
P
I
 
R
A
 
D
P
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
E
 
D
A
 
H
P
 
E
N
 
N
L
 
V
L
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
x
L
G
|
G
S
x
A
A
 
S
T
 
T
H
 
K
D
 
E
V
 
A
R
 
Q
L
 
S
A
 
R
M
 
C
A
 
G
D
 
E
H
 
E
V
 
I
V
 
A
T
 
V
N
 
Q
I
 
F
R
 
V
A
 
D
F
 
M
L
 
V
E
 
K
G
 
G
R
 
K
P
 
S
L
 
L
I
 
T
G
 
G
L
 
V
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
35% identity, 80% coverage: 56:303/309 of query aligns to 56:305/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
A
 
A
G
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
A
L
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
x
R
F
 
A
G
 
G
A
x
V
G
 
G
I
 
L
D
 
D
L
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
V
D
 
D
T
 
A
A
 
A
R
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
L
V
 
V
T
 
V
A
 
N
S
 
A
G
 
P
D
 
T
L
 
S
L
x
N
T
 
I
H
 
H
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
L
 
H
A
 
A
L
 
L
W
 
A
Q
 
L
M
 
L
L
 
L
T
 
A
L
 
A
L
 
S
R
 
R
G
 
Q
L
 
I
G
 
P
G
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
A
F
 
S
V
 
L
R
 
R
A
 
E
G
 
H
Q
 
T
W
 
W
S
 
K
K
 
R
G
 
S
P
 
S
P
 
F
P
 
S
L
 
-
G
 
G
R
 
T
S
 
E
A
 
I
R
 
F
G
 
G
R
 
K
K
 
T
L
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
V
G
 
G
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
L
I
 
V
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
G
 
I
E
 
A
A
 
A
V
 
F
G
 
G
M
 
A
E
 
Y
I
 
V
A
 
V
-
 
A
-
 
Y
-
 
D
-
 
P
Y
 
Y
H
 
V
S
 
S
R
 
P
R
 
A
P
 
R
V
 
A
A
 
A
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
D
 
I
R
 
E
Y
 
L
E
 
L
S
 
S
D
 
L
P
 
D
L
 
D
A
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
R
W
 
-
A
 
A
D
 
D
I
 
F
V
 
I
V
 
S
I
 
V
A
 
H
L
 
L
P
 
P
G
 
K
G
 
T
G
 
P
A
 
E
T
 
T
Q
 
A
S
 
G
L
 
L
V
 
I
D
 
D
R
 
K
A
 
E
F
 
A
L
 
L
D
 
A
A
 
K
L
 
T
G
 
K
P
 
P
D
 
G
G
 
V
L
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
S
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
T
D
 
G
G
 
G
R
 
H
V
 
V
G
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
R
 
A
N
 
T
E
|
E
P
 
P
T
 
C
I
 
T
A
 
D
P
 
S
A
 
P
L
 
L
L
 
F
E
 
E
A
 
L
P
 
A
N
 
Q
L
 
V
L
 
V
L
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
 
G
S
x
A
A
 
S
T
 
T
H
 
A
D
 
E
V
 
A
R
x
Q
L
 
D
A
 
R
M
 
A
A
 
G
D
 
T
H
 
D
V
 
V
V
 
A
T
 
E
N
 
S
I
 
V
R
 
R
A
 
L
F
 
A
L
 
L
E
 
A
G
 
G
R
 
E

Query Sequence

>WP_012050501.1 NCBI__GCF_000016765.1:WP_012050501.1
MTILQVTPLPAPRQPSELLDRPVPIFDRLDDPEGWLAEHGGSVQCLITHAMRGPPAGLLA
RLPALKLIANFGAGIDLIDLDTARARGIAVTASGDLLTHDVADLALWQMLTLLRGLGGAD
GFVRAGQWSKGPPPLGRSARGRKLGVLGFGRIGQAIARRGEAVGMEIAYHSRRPVAEVAD
RYESDPLALARWADIVVIALPGGGATQSLVDRAFLDALGPDGLLVNIARGSVVDEEALVA
ALRDGRVGGAALDVFRNEPTIAPALLEAPNLLLTPHVGSATHDVRLAMADHVVTNIRAFL
EGRPLIGLV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory