SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012061729.1 NCBI__GCF_000017145.1:WP_012061729.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

G3XD01 UDP-2-acetamido-3-amino-2,3-dideoxy-D-glucuronate N-acetyltransferase; UDP-D-GlcNAc3NA N-acetyltransferase; UDP-2-acetamido-3-amino-2,3-dideoxy-alpha-D-glucuronic acid 3-N-acetyltransferase; EC 2.3.1.201 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
41% identity, 80% coverage: 24:156/166 of query aligns to 32:157/191 of G3XD01

query
sites
G3XD01
G
 
G
C
 
A
T
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
G
T
 
V
R
 
S
I
 
L
G
 
G
T
 
Q
F
 
N
V
 
V
E
 
F
I
 
V
Q
 
G
K
 
N
N
 
K
T
 
V
T
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
R
C
 
C
K
 
K
I
 
I
S
 
Q
S
 
N
H
 
N
S
 
V
F
 
S
L
 
V
C
 
Y
E
 
D
G
 
N
V
 
V
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
E
G
 
G
V
 
V
F
 
F
I
 
C
G
 
G
H
 
P
G
 
S
V
 
M
M
 
V
F
 
F
T
 
T
N
 
N
D
 
V
L
 
Y
Y
 
N
P
 
P
R
 
R
A
 
S
I
 
L
-
 
I
-
 
E
N
 
R
A
 
K
D
 
D
G
 
Q
G
 
Y
R
 
R
Q
 
N
S
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
T
R
 
L
V
 
V
K
 
K
Q
 
K
R
 
G
V
 
A
S
 
T
I
 
L
G
 
G
S
 
A
N
 
N
A
 
C
T
 
T
I
 
I
L
 
V
A
 
C
G
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
Y
A
 
A
Q
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
N
R
x
K
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
S
Y
 
Y
T
 
A
I
 
L
V
 
M
A
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
R
 
R
M
 
Q
I
 
I
G
 
G
H
 
W
T
 
M
K
 
S
D
 
E

7s42A Crystal structure of an n-acetyltransferase from helicobacter pullorum in the presence of coenzyme a and dtdp-3-acetamido-3,6-dideoxy-d- galactose (see paper)
42% identity, 72% coverage: 19:137/166 of query aligns to 7:135/145 of 7s42A

query
sites
7s42A
L
 
L
V
 
A
N
 
D
L
 
V
Y
 
Q
G
 
S
C
 
K
T
 
N
I
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I
G
 
W
T
 
Q
F
 
F
V
 
C
E
 
V
I
 
V
Q
 
L
K
 
P
N
 
S
T
 
A
T
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
E
N
 
N
C
 
C
K
 
N
I
 
I
S
 
C
S
 
S
H
 
H
S
 
C
F
|
F
L
 
I
-
x
E
-
 
N
-
 
D
-
 
V
-
 
K
-
 
I
-
 
G
-
 
N
-
 
N
-
 
V
-
 
T
-
 
I
-
 
K
C
 
C
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
-
 
I
-
x
W
E
 
D
G
 
G
V
 
I
T
 
E
L
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
D
V
 
V
F
 
F
I
 
I
G
 
G
H
 
P
G
 
N
V
 
V
M
 
T
F
 
F
T
x
C
N
|
N
D
|
D
L
x
K
Y
|
Y
P
|
P
R
 
R
A
 
S
I
 
-
N
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
K
Q
 
Q
S
x
Y
E
 
P
G
 
K
D
 
E
W
 
F
T
 
S
V
 
-
V
 
-
P
 
K
T
 
T
R
 
I
V
 
I
K
 
K
Q
 
K
R
 
G
V
 
A
S
 
S
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
|
L
A
 
P
G
 
G
I
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
N
A
 
A
Q
 
M
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
V
 
V

7s41A Crystal structure of an n-acetyltransferase from helicobacter pullorum in the presence of coenzyme a and dtdp-3-acetamido-3,6-dideoxy-d- glucose (see paper)
42% identity, 72% coverage: 19:137/166 of query aligns to 7:135/145 of 7s41A

query
sites
7s41A
L
 
L
V
 
A
N
 
D
L
 
V
Y
 
Q
G
 
S
C
 
K
T
 
N
I
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I
G
 
W
T
 
Q
F
 
F
V
 
C
E
 
V
I
 
V
Q
 
L
K
 
P
N
 
S
T
 
A
T
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
E
N
 
N
C
 
C
K
 
N
I
 
I
S
 
C
S
 
S
H
 
H
S
 
C
F
|
F
L
 
I
-
x
E
-
 
N
-
 
D
-
 
V
-
 
K
-
 
I
-
 
G
-
 
N
-
 
N
-
 
V
-
 
T
-
 
I
-
 
K
C
 
C
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
-
 
I
-
x
W
E
 
D
G
 
G
V
 
I
T
 
E
L
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
D
V
 
V
F
 
F
I
 
I
G
 
G
H
 
P
G
 
N
V
 
V
M
 
T
F
 
F
T
x
C
N
|
N
D
|
D
L
x
K
Y
|
Y
P
|
P
R
 
R
A
 
S
I
 
-
N
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
K
Q
 
Q
S
x
Y
E
 
P
G
 
K
D
 
E
W
 
F
T
 
S
V
 
-
V
 
-
P
 
K
T
 
T
R
 
I
V
 
I
K
 
K
Q
 
K
R
 
G
V
 
A
S
 
S
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
|
L
A
 
P
G
 
G
I
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
N
A
 
A
Q
 
M
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
V
 
V

7s3wA Crystal structure of an n-acetyltransferase from helicobacter pullorum in the presence of coenzyme a and dtdp-3-amino-3,6-dideoxy-d- galactose (see paper)
42% identity, 72% coverage: 19:137/166 of query aligns to 7:135/145 of 7s3wA

query
sites
7s3wA
L
 
L
V
 
A
N
 
D
L
 
V
Y
 
Q
G
 
S
C
 
K
T
 
N
I
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I
G
 
W
T
 
Q
F
 
F
V
 
C
E
 
V
I
 
V
Q
 
L
K
 
P
N
 
S
T
 
A
T
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
E
N
 
N
C
 
C
K
 
N
I
 
I
S
 
C
S
 
S
H
 
H
S
 
C
F
|
F
L
 
I
-
x
E
-
 
N
-
 
D
-
 
V
-
 
K
-
 
I
-
 
G
-
 
N
-
 
N
-
 
V
-
 
T
-
 
I
-
 
K
C
 
C
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
-
 
I
-
 
W
E
 
D
G
 
G
V
 
I
T
 
E
L
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
D
V
 
V
F
 
F
I
 
I
G
 
G
H
 
P
G
 
N
V
 
V
M
 
T
F
 
F
T
x
C
N
 
N
D
|
D
L
x
K
Y
|
Y
P
|
P
R
 
R
A
 
S
I
 
-
N
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
K
Q
 
Q
S
x
Y
E
 
P
G
 
K
D
 
E
W
 
F
T
 
S
V
 
-
V
 
-
P
 
K
T
 
T
R
 
I
V
 
I
K
 
K
Q
 
K
R
 
G
V
 
A
S
 
S
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
|
L
A
 
P
G
 
G
I
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
N
A
 
A
Q
 
M
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
V
 
V

7s3uA Crystal structure of an n-acetyltransferase from helicobacter pullorum in the presence of coenzyme a and dtdp-3-amino-3,6-dideoxy-d-glucose (see paper)
42% identity, 72% coverage: 19:137/166 of query aligns to 7:135/145 of 7s3uA

query
sites
7s3uA
L
 
L
V
 
A
N
 
D
L
 
V
Y
 
Q
G
 
S
C
 
K
T
 
N
I
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I
G
 
W
T
 
Q
F
 
F
V
 
C
E
 
V
I
 
V
Q
 
L
K
 
P
N
 
S
T
 
A
T
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
E
N
 
N
C
 
C
K
 
N
I
 
I
S
 
C
S
 
S
H
 
H
S
 
C
F
|
F
L
 
I
-
x
E
-
 
N
-
 
D
-
 
V
-
 
K
-
 
I
-
 
G
-
 
N
-
 
N
-
 
V
-
 
T
-
 
I
-
 
K
C
 
C
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
-
 
I
-
 
W
E
 
D
G
 
G
V
 
I
T
 
E
L
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
D
V
 
V
F
 
F
I
 
I
G
 
G
H
 
P
G
 
N
V
 
V
M
 
T
F
 
F
T
x
C
N
|
N
D
|
D
L
x
K
Y
|
Y
P
|
P
R
 
R
A
 
S
I
 
-
N
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
K
Q
 
Q
S
x
Y
E
 
P
G
 
K
D
 
E
W
 
F
T
 
S
V
 
-
V
 
-
P
 
K
T
 
T
R
 
I
V
 
I
K
 
K
Q
 
K
R
 
G
V
 
A
S
 
S
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
|
L
A
 
P
G
 
G
I
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
N
A
 
A
Q
 
M
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
V
 
V

7s45A Crystal structure of an n-acetyltransferase, c80t mutant, from helicobacter pullorum in the presence of acetyl coenzyme a and dtdp (see paper)
42% identity, 72% coverage: 19:137/166 of query aligns to 7:131/141 of 7s45A

query
sites
7s45A
L
 
L
V
 
A
N
 
D
L
 
V
Y
 
Q
G
 
S
C
 
K
T
 
N
I
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I
G
 
W
T
 
Q
F
 
F
V
 
C
E
 
V
I
 
V
Q
 
L
K
 
P
N
 
S
T
 
A
T
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
E
N
 
N
C
 
C
K
 
N
I
 
I
S
 
C
S
 
S
H
 
H
S
 
C
F
|
F
L
 
I
-
x
E
-
 
N
-
 
D
-
 
V
-
 
K
-
 
I
-
 
G
-
 
N
-
 
N
-
 
V
-
 
T
-
 
I
-
 
K
-
 
C
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
-
 
I
C
x
W
E
 
D
G
 
G
V
 
I
T
 
E
L
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
D
V
 
V
F
 
F
I
 
I
G
 
G
H
 
P
G
 
N
V
 
V
M
 
T
F
 
F
T
|
T
N
|
N
D
|
D
L
x
K
Y
|
Y
P
|
P
R
 
R
A
 
S
I
 
-
N
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
K
Q
 
Q
S
 
F
E
 
S
G
 
-
D
 
-
W
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
K
T
 
T
R
 
I
V
 
I
K
 
K
Q
 
K
R
 
G
V
 
A
S
 
S
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
|
L
A
 
P
G
 
G
I
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
N
A
 
A
Q
 
M
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
V
 
V

4mzuB Crystal structure of fdtd, a bifunctional ketoisomerase/n- acetyltransferase from shewanella denitrificans (see paper)
37% identity, 83% coverage: 19:155/166 of query aligns to 5:144/290 of 4mzuB

query
sites
4mzuB
L
 
L
V
 
A
N
 
D
L
 
V
Y
 
Q
G
 
S
C
 
Q
T
 
N
I
 
I
G
 
G
S
 
D
G
 
N
T
 
T
R
 
K
I
 
V
G
x
W
T
x
Q
F
 
F
V
 
C
E
 
V
I
 
I
Q
 
L
K
 
A
N
 
G
T
 
A
T
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
N
C
 
C
K
 
N
I
 
I
S
x
C
S
x
A
H
 
N
S
 
S
F
 
L
L
 
I
-
 
E
-
 
N
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
N
-
 
V
-
 
T
-
 
I
-
 
K
-
 
S
-
x
G
-
 
V
-
 
Q
-
 
I
C
 
W
E
 
D
G
 
G
V
 
I
T
 
H
L
 
I
E
 
Q
D
 
D
G
 
D
V
 
V
F
|
F
I
 
I
G
 
G
H
 
P
G
x
N
V
 
V
M
 
T
F
 
F
T
|
T
N
|
N
D
|
D
L
x
K
Y
 
Q
P
|
P
R
 
R
A
 
S
I
 
L
N
 
K
A
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
T
R
 
I
V
 
V
K
 
K
Q
 
K
R
 
G
V
 
A
S
 
S
I
 
I
G
|
G
S
x
A
N
 
N
A
 
S
T
 
T
I
 
I
L
 
L
A
 
P
G
 
G
I
 
I
T
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
N
A
 
A
Q
 
M
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
I
T
|
T
R
x
K
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
D
Y
 
N
T
 
A
I
 
I
V
 
V
A
x
I
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
G
R
|
R
M
 
I
I
 
T
G
 
G
H
 
Y
T
 
V
K
 
E

Sites not aligning to the query:

4mzuF Crystal structure of fdtd, a bifunctional ketoisomerase/n- acetyltransferase from shewanella denitrificans (see paper)
37% identity, 83% coverage: 19:155/166 of query aligns to 5:145/294 of 4mzuF

query
sites
4mzuF
L
 
L
V
 
A
N
 
D
L
 
V
Y
 
Q
G
 
S
C
 
Q
T
 
N
I
 
I
G
 
G
S
 
D
G
 
N
T
 
T
R
 
K
I
 
V
G
x
W
T
x
Q
F
 
F
V
 
C
E
 
V
I
 
I
Q
 
L
K
 
A
N
 
G
T
 
A
T
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
N
C
 
C
K
 
N
I
 
I
S
x
C
S
 
A
H
 
N
S
 
S
F
 
L
L
 
I
-
 
E
-
 
N
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
N
-
 
V
-
 
T
-
 
I
-
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
-
 
I
C
 
W
E
 
D
G
 
G
V
 
I
T
 
H
L
 
I
E
 
Q
D
 
D
G
 
D
V
 
V
F
 
F
I
 
I
G
 
G
H
 
P
G
 
N
V
 
V
M
 
T
F
 
F
T
 
T
N
|
N
D
|
D
L
x
K
Y
 
Q
P
 
P
R
 
R
A
 
-
I
 
-
N
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
T
 
S
V
 
K
V
 
I
P
 
K
T
 
T
R
 
I
V
 
V
K
 
K
Q
 
K
R
 
G
V
 
A
S
 
S
I
 
I
G
|
G
S
x
A
N
 
N
A
 
S
T
 
T
I
 
I
L
|
L
A
 
P
G
 
G
I
 
I
T
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
N
A
 
A
Q
 
M
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
I
T
|
T
R
x
K
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
D
Y
 
N
T
 
A
I
 
I
V
 
V
A
x
I
G
 
G
V
x
N
P
 
P
A
 
G
R
|
R
M
 
I
I
 
T
G
 
G
H
 
Y
T
 
V
K
 
E

Sites not aligning to the query:

3mqhA Crystal structure of the 3-n-acetyl transferase wlbb from bordetella petrii in complex with coa and udp-3-amino-2-acetamido-2,3-dideoxy glucuronic acid (see paper)
43% identity, 78% coverage: 24:152/166 of query aligns to 32:153/191 of 3mqhA

query
sites
3mqhA
G
 
G
C
 
A
T
 
E
I
 
I
G
 
G
S
 
E
G
 
G
T
 
C
R
 
S
I
 
L
G
 
G
T
 
Q
F
 
N
V
 
V
E
x
F
I
 
V
Q
 
G
K
 
N
N
 
R
T
 
V
T
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
N
N
 
R
C
 
V
K
 
K
I
 
I
S
x
Q
S
x
N
H
 
N
S
 
V
F
 
S
L
 
V
C
x
Y
E
 
D
G
 
N
V
 
V
T
 
F
L
 
L
E
 
E
D
 
D
G
 
D
V
 
V
F
|
F
I
 
C
G
 
G
H
 
P
G
 
S
V
 
M
M
 
V
F
 
F
T
|
T
N
|
N
D
x
V
L
x
Y
Y
 
N
P
|
P
R
 
R
A
 
A
I
 
A
N
 
I
A
 
E
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
|
R
Q
 
K
S
 
S
E
 
E
G
x
Y
D
 
R
W
 
D
T
 
T
V
 
I
V
 
V
P
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
-
K
 
R
Q
 
Q
R
 
G
V
 
A
S
 
T
I
 
L
G
|
G
S
x
A
N
 
N
A
 
C
T
 
T
I
 
V
L
 
V
A
 
C
G
 
G
I
 
A
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
R
S
 
Y
A
 
A
Q
 
F
V
 
V
G
 
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
x
N
R
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
D
Y
 
F
T
 
A
I
 
L
V
 
V
A
x
V
G
 
G
V
 
V
P
|
P
A
 
A
R
|
R
M
 
Q
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3mqgC Crystal structure of the 3-n-acetyl transferase wlbb from bordetella petrii in complex with acetyl-coa (see paper)
43% identity, 78% coverage: 24:152/166 of query aligns to 33:154/192 of 3mqgC

query
sites
3mqgC
G
 
G
C
 
A
T
 
E
I
 
I
G
 
G
S
 
E
G
 
G
T
 
C
R
x
S
I
 
L
G
 
G
T
 
Q
F
 
N
V
 
V
E
x
F
I
 
V
Q
 
G
K
 
N
N
 
R
T
 
V
T
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
N
N
 
R
C
 
V
K
 
K
I
 
I
S
 
Q
S
x
N
H
 
N
S
 
V
F
 
S
L
 
V
C
x
Y
E
 
D
G
 
N
V
 
V
T
 
F
L
 
L
E
 
E
D
 
D
G
 
D
V
 
V
F
|
F
I
 
C
G
 
G
H
x
P
G
 
S
V
 
M
M
 
V
F
 
F
T
|
T
N
|
N
D
x
V
L
x
Y
Y
 
N
P
|
P
R
 
R
A
 
A
I
 
A
N
 
I
A
 
E
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
R
Q
 
K
S
 
S
E
 
E
G
 
Y
D
 
R
W
 
D
T
 
T
V
 
I
V
 
V
P
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
-
K
 
R
Q
 
Q
R
 
G
V
 
A
S
 
T
I
 
L
G
|
G
S
x
A
N
 
N
A
 
C
T
 
T
I
 
V
L
 
V
A
 
C
G
 
G
I
 
A
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
R
S
 
Y
A
 
A
Q
x
F
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
x
N
R
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
D
Y
 
F
T
 
A
I
 
L
V
 
V
A
x
V
G
 
G
V
 
V
P
|
P
A
 
A
R
|
R
M
 
Q
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3fsbA Crystal structure of qdtc, the dtdp-3-amino-3,6-dideoxy-d-glucose n- acetyl transferase from thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum in complex with coa and dtdp-3-amino-quinovose (see paper)
37% identity, 75% coverage: 27:151/166 of query aligns to 107:219/260 of 3fsbA

query
sites
3fsbA
I
 
I
G
 
G
S
 
N
G
 
N
T
 
V
R
 
K
I
 
I
G
|
G
T
 
T
F
 
L
V
 
S
E
 
D
I
 
I
Q
 
Q
K
 
H
N
 
H
T
 
V
T
 
Y
I
 
I
G
 
G
R
 
N
N
 
Y
C
 
V
K
 
N
I
 
I
S
x
H
S
 
S
H
 
N
S
 
V
F
 
F
L
 
V
C
 
G
E
 
E
G
 
K
V
 
S
T
 
I
L
 
I
E
 
K
D
 
D
G
 
F
V
 
V
F
 
W
I
 
L
G
x
F
H
 
P
G
 
H
V
 
V
M
 
V
F
 
L
T
 
T
N
 
N
D
 
D
L
 
P
Y
 
T
P
 
P
R
 
P
A
 
S
I
 
N
N
 
E
A
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
V
R
 
T
V
 
I
K
 
E
Q
 
L
R
 
F
V
 
A
S
 
V
I
 
I
G
x
A
S
x
A
N
 
R
A
 
S
T
 
V
I
 
V
L
 
L
A
 
P
G
 
G
I
 
I
T
 
H
I
 
I
G
 
N
E
 
E
S
 
D
A
 
A
Q
 
L
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
K
Y
 
E
T
 
T
I
 
V
V
 
V
A
x
V
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R
M
 
E
I
 
I

Sites not aligning to the query:

3fscA Crystal structure of qdtc, the dtdp-3-amino-3,6-dideoxy-d-glucose n- acetyl transferase from thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum in complex with coa and dtdp-3-amino-fucose (see paper)
37% identity, 75% coverage: 27:151/166 of query aligns to 107:219/259 of 3fscA

query
sites
3fscA
I
 
I
G
 
G
S
 
N
G
 
N
T
 
V
R
x
K
I
 
I
G
|
G
T
|
T
F
 
L
V
 
S
E
 
D
I
 
I
Q
 
Q
K
 
H
N
 
H
T
 
V
T
 
Y
I
 
I
G
 
G
R
 
N
N
 
Y
C
 
V
K
 
N
I
 
I
S
x
H
S
|
S
H
 
N
S
 
V
F
 
F
L
 
V
C
 
G
E
 
E
G
 
K
V
 
S
T
 
I
L
 
I
E
 
K
D
 
D
G
 
F
V
 
V
F
 
W
I
 
L
G
x
F
H
 
P
G
 
H
V
 
V
M
 
V
F
 
L
T
 
T
N
 
N
D
 
D
L
 
P
Y
 
T
P
 
P
R
 
P
A
 
S
I
 
N
N
 
E
A
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
V
R
 
T
V
 
I
K
 
E
Q
 
L
R
 
F
V
 
A
S
 
V
I
 
I
G
x
A
S
x
A
N
 
R
A
 
S
T
 
V
I
 
V
L
 
L
A
 
P
G
 
G
I
 
I
T
 
H
I
 
I
G
 
N
E
 
E
S
 
D
A
 
A
Q
 
L
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
K
Y
 
E
T
 
T
I
 
V
V
 
V
A
x
V
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R
M
 
E
I
 
I

Sites not aligning to the query:

3fs8A Crystal structure of qdtc, the dtdp-3-amino-3,6-dideoxy-d-glucose n- acetyl transferase from thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum in complex with acetyl-coa (see paper)
37% identity, 75% coverage: 27:151/166 of query aligns to 107:219/259 of 3fs8A

query
sites
3fs8A
I
 
I
G
 
G
S
 
N
G
 
N
T
 
V
R
 
K
I
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
L
V
 
S
E
 
D
I
 
I
Q
 
Q
K
 
H
N
 
H
T
 
V
T
 
Y
I
 
I
G
 
G
R
 
N
N
 
Y
C
 
V
K
 
N
I
 
I
S
 
H
S
 
S
H
 
N
S
 
V
F
 
F
L
 
V
C
 
G
E
 
E
G
 
K
V
 
S
T
 
I
L
 
I
E
 
K
D
 
D
G
 
F
V
 
V
F
 
W
I
 
L
G
x
F
H
x
P
G
 
H
V
 
V
M
 
V
F
 
L
T
 
T
N
 
N
D
 
D
L
 
P
Y
 
T
P
 
P
R
 
P
A
 
S
I
 
N
N
 
E
A
 
L
D
 
L
G
 
G
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
V
R
 
T
V
 
I
K
 
E
Q
 
L
R
 
F
V
 
A
S
 
V
I
 
I
G
x
A
S
x
A
N
 
R
A
 
S
T
 
V
I
 
V
L
 
L
A
 
P
G
 
G
I
 
I
T
 
H
I
 
I
G
 
N
E
 
E
S
 
D
A
 
A
Q
 
L
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
K
Y
 
E
T
 
T
I
 
V
V
 
V
A
x
V
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R
M
 
E
I
 
I

Sites not aligning to the query:

5u2kA Crystal structure of galactoside o-acetyltransferase complex with coa (h3 space group)
29% identity, 66% coverage: 42:151/166 of query aligns to 74:181/190 of 5u2kA

query
sites
5u2kA
N
 
N
T
 
V
T
 
K
I
 
L
G
 
G
R
 
K
N
 
N
C
 
V
K
 
Y
I
 
V
S
 
N
S
 
T
H
 
N
S
 
C
F
 
Y
L
 
F
C
x
M
E
 
D
G
 
G
-
 
G
-
 
Q
V
 
I
T
 
T
L
 
I
E
 
G
D
 
D
G
 
N
V
 
V
F
 
F
I
 
I
G
 
G
H
 
P
G
 
N
V
 
C
M
 
G
F
 
F
T
x
Y
N
 
T
D
x
A
L
 
T
Y
x
H
P
 
P
R
 
L
A
 
N
I
 
F
N
 
H
A
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
H
Q
 
R
S
 
N
E
 
E
G
 
G
D
 
F
W
 
E
T
 
K
V
 
A
V
 
G
P
 
P
T
 
I
R
 
H
V
 
I
K
 
G
Q
 
S
R
 
N
V
 
T
S
 
W
I
 
F
G
 
G
S
 
G
N
 
H
A
 
V
T
 
A
I
 
V
L
|
L
A
 
P
G
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
G
A
 
S
Q
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
P
Y
 
H
T
 
S
I
 
L
V
 
A
A
 
V
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
C
R
 
K
M
 
V
I
 
V

3ectA Crystal structure of the hexapeptide-repeat containing- acetyltransferase vca0836 from vibrio cholerae
33% identity, 67% coverage: 45:156/166 of query aligns to 61:176/176 of 3ectA

query
sites
3ectA
I
 
F
G
 
G
R
 
K
N
 
T
C
 
I
K
 
R
I
 
I
S
 
G
S
 
D
H
 
H
S
 
T
F
 
F
L
 
I
C
 
N
E
 
M
G
 
N
V
 
V
T
 
V
L
 
M
E
 
L
D
 
D
G
 
G
-
 
A
-
 
P
V
 
I
F
 
T
I
 
I
G
 
G
H
 
D
G
 
H
V
 
V
M
 
L
F
 
I
-
 
G
-
 
P
T
 
S
N
 
T
D
 
Q
L
 
F
Y
 
Y
P
 
T
R
 
A
A
 
S
I
 
H
N
 
S
A
 
L
D
 
D
G
 
Y
G
 
R
R
 
R
Q
 
R
S
 
Q
E
 
A
G
 
W
D
 
E
W
 
T
T
 
I
V
 
C
V
 
K
P
 
P
T
 
I
R
 
V
V
 
I
K
 
E
Q
 
D
R
 
D
V
 
V
S
 
W
I
 
I
G
 
G
S
 
G
N
 
N
A
 
V
T
 
V
I
 
I
L
 
N
A
 
Q
G
|
G
I
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
A
S
 
R
A
 
S
Q
 
V
V
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
N
R
 
Q
D
|
D
V
 
V
P
 
P
A
 
P
Y
 
D
T
 
T
I
 
L
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
T
P
 
P
A
 
A
R
 
R
M
 
I
I
 
L
G
 
R
H
 
S
T
 
L
K
 
K
D
 
D

3nz2C Crystal structure of hexapeptide-repeat containing-acetyltransferase vca0836 complexed with acetyl co enzyme a from vibrio cholerae o1 biovar eltor
33% identity, 67% coverage: 45:156/166 of query aligns to 68:183/183 of 3nz2C

query
sites
3nz2C
I
 
F
G
 
G
R
 
K
N
 
T
C
 
I
K
 
R
I
 
I
S
 
G
S
 
D
H
 
H
S
 
T
F
 
F
L
 
I
C
 
N
E
 
M
G
 
N
V
 
V
T
 
V
L
 
M
E
 
L
D
 
D
G
 
G
-
 
A
-
 
P
V
 
I
F
 
T
I
 
I
G
 
G
H
 
D
G
 
H
V
 
V
M
 
L
F
 
I
-
 
G
-
 
P
T
 
S
N
 
T
D
 
Q
L
 
F
Y
|
Y
P
 
T
R
 
A
A
 
S
I
x
H
N
 
S
A
 
L
D
 
D
G
 
Y
G
 
R
R
 
R
Q
 
R
S
 
Q
E
 
A
G
 
W
D
 
E
W
 
T
T
 
I
V
 
C
V
 
K
P
 
P
T
 
I
R
 
V
V
 
I
K
 
E
Q
 
D
R
 
D
V
 
V
S
 
W
I
 
I
G
|
G
S
 
G
N
 
N
A
 
V
T
 
V
I
 
I
L
 
N
A
 
Q
G
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
A
S
 
R
A
 
S
Q
 
V
V
 
V
G
x
A
A
|
A
G
x
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
N
R
 
Q
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
P
Y
 
D
T
 
T
I
 
L
V
 
V
A
x
G
G
 
G
V
x
T
P
|
P
A
 
A
R
 
R
M
 
I
I
x
L
G
x
R
H
 
S
T
 
L
K
 
K
D
 
D

3gvdI Crystal structure of serine acetyltransferase cyse from yersinia pestis
29% identity, 80% coverage: 24:155/166 of query aligns to 120:251/272 of 3gvdI

query
sites
3gvdI
G
 
G
C
 
H
T
 
W
I
 
L
G
 
W
S
 
A
G
 
Q
T
 
D
R
 
R
I
 
K
G
 
A
T
 
L
F
 
A
V
 
I
E
 
Y
I
 
L
Q
 
Q
K
 
N
N
 
Q
T
 
V
T
 
S
I
 
V
G
 
A
R
 
F
N
 
G
C
 
V
K
 
D
I
 
I
S
 
H
S
 
P
H
 
A
S
 
A
F
 
T
L
 
I
C
 
G
E
 
C
G
 
G
V
 
I
T
 
M
L
 
L
E
x
D
D
 
H
-
 
A
-
 
T
G
 
G
V
 
I
F
 
V
I
 
I
G
 
G
H
 
E
G
 
T
V
 
A
M
 
V
F
 
V
T
 
E
N
 
N
D
 
D
L
 
V
-
 
S
Y
 
I
P
 
L
R
 
Q
A
 
S
I
 
V
N
 
T
A
 
L
D
x
G
G
|
G
G
 
T
R
 
G
Q
 
K
S
 
T
E
 
S
G
 
G
D
 
D
W
x
R
T
 
H
V
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
P
R
 
K
V
 
I
K
 
R
Q
 
E
R
 
G
V
 
V
S
 
M
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
G
G
 
N
I
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
E
 
R
S
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
L
R
 
Q
D
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
A
Y
 
H
T
 
T
I
 
T
V
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
R
 
R
M
 
I
I
 
V
G
 
G
H
 
K
T
 
P
K
 
E

Sites not aligning to the query:

3nz2J Crystal structure of hexapeptide-repeat containing-acetyltransferase vca0836 complexed with acetyl co enzyme a from vibrio cholerae o1 biovar eltor
32% identity, 67% coverage: 45:155/166 of query aligns to 71:185/185 of 3nz2J

query
sites
3nz2J
I
 
F
G
 
G
R
 
K
N
 
T
C
 
I
K
 
R
I
 
I
S
 
G
S
 
D
H
 
H
S
 
T
F
 
F
L
 
I
C
 
N
E
 
M
G
 
N
V
 
V
T
 
V
L
 
M
E
 
L
D
 
D
G
 
G
-
 
A
-
 
P
V
 
I
F
 
T
I
 
I
G
 
G
H
 
D
G
 
H
V
 
V
M
 
L
F
 
I
-
x
G
-
 
P
T
 
S
N
 
T
D
 
Q
L
 
F
Y
|
Y
P
 
T
R
 
A
A
 
S
I
x
H
N
 
S
A
 
L
D
 
D
G
 
Y
G
 
R
R
 
R
Q
 
R
S
 
Q
E
 
A
G
 
W
D
 
E
W
 
T
T
 
I
V
 
C
V
 
K
P
 
P
T
 
I
R
 
V
V
 
I
K
 
E
Q
 
D
R
 
D
V
 
V
S
x
W
I
 
I
G
|
G
S
 
G
N
 
N
A
 
V
T
 
V
I
 
I
L
 
N
A
 
Q
G
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
A
S
 
R
A
 
S
Q
 
V
V
 
V
G
x
A
A
|
A
G
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
N
R
 
Q
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
P
Y
 
D
T
 
T
I
 
L
V
 
V
A
x
G
G
 
G
V
x
T
P
|
P
A
 
A
R
 
R
M
 
I
I
 
L
G
x
R
H
 
S
T
 
L
K
 
K

1t3dA Crystal structure of serine acetyltransferase from e.Coli at 2.2a (see paper)
31% identity, 69% coverage: 39:152/166 of query aligns to 132:245/262 of 1t3dA

query
sites
1t3dA
I
 
L
Q
 
Q
K
 
N
N
 
Q
T
 
V
T
 
S
I
 
V
G
 
T
R
 
F
N
 
Q
C
 
V
K
 
D
I
 
I
S
 
H
S
 
P
H
 
A
S
 
A
F
 
K
L
 
I
C
 
G
E
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
M
L
 
L
E
x
D
D
 
H
-
 
A
-
 
T
G
 
G
V
 
I
F
 
V
I
 
V
G
 
G
H
 
E
G
 
T
V
 
A
M
 
V
F
 
I
T
 
E
N
 
N
D
 
D
L
 
V
-
 
S
Y
 
I
P
 
L
R
 
Q
A
 
S
I
 
V
N
 
T
A
 
L
D
 
G
G
|
G
G
 
T
R
 
G
Q
 
K
S
 
S
E
 
G
G
 
G
D
 
D
W
x
R
T
x
H
V
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
P
R
 
K
V
 
I
K
 
R
Q
 
E
R
 
G
V
 
V
S
 
M
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
G
G
 
N
I
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
E
 
R
S
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
L
R
 
Q
D
 
P
V
 
V
P
 
P
A
 
P
Y
 
H
T
 
T
I
 
T
V
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
R
 
R
M
 
I
I
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P07464 Galactoside O-acetyltransferase; GAT; Acetyl-CoA:galactoside 6-O-acetyltransferase; Thiogalactoside acetyltransferase; Thiogalactoside transacetylase; EC 2.3.1.18 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
28% identity, 89% coverage: 9:156/166 of query aligns to 40:187/203 of P07464

query
sites
P07464
H
 
H
D
 
P
G
 
S
V
 
E
V
 
V
V
 
E
H
 
K
H
 
R
P
 
E
D
 
S
L
 
L
V
 
I
N
 
K
L
 
E
Y
 
M
G
 
F
C
 
A
T
 
T
I
 
V
G
 
G
S
 
E
G
 
N
T
 
A
R
 
W
I
 
V
-
 
E
-
 
P
G
 
P
T
 
V
F
 
Y
V
 
F
E
x
S
I
 
Y
Q
 
G
K
 
S
N
 
N
T
 
I
T
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
N
C
 
F
K
 
Y
I
 
A
S
x
N
S
 
F
H
 
N
S
 
L
F
 
T
L
 
I
C
 
V
E
 
D
G
x
D
-
 
Y
-
 
T
V
 
V
T
 
T
L
 
I
E
 
G
D
 
D
G
 
N
V
 
V
F
 
L
I
 
I
G
 
A
H
 
P
G
 
N
V
 
V
M
 
T
F
 
L
T
 
S
N
 
V
D
 
T
L
 
G
Y
x
H
P
 
P
R
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
A
 
V
D
 
H
G
 
H
G
 
E
R
 
L
Q
 
R
S
 
K
E
 
N
G
 
G
D
 
E
W
 
M
T
 
Y
V
 
S
V
 
F
P
 
P
T
 
I
R
 
T
V
 
I
K
 
G
Q
 
N
R
 
N
V
 
V
S
 
W
I
 
I
G
 
G
S
|
S
N
 
H
A
 
V
T
 
V
I
 
I
L
 
N
A
 
P
G
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
S
 
N
A
 
S
Q
 
V
V
 
I
G
 
G
A
|
A
G
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
P
Y
 
N
T
 
V
I
 
V
V
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
C
R
|
R
M
 
V
I
 
I
G
x
R
H
 
E
T
 
I
K
 
N
D
 
D

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012061729.1 NCBI__GCF_000017145.1:WP_012061729.1
MIANDVTLHDGVVVHHPDLVNLYGCTIGSGTRIGTFVEIQKNTTIGRNCKISSHSFLCEG
VTLEDGVFIGHGVMFTNDLYPRAINADGGRQSEGDWTVVPTRVKQRVSIGSNATILAGIT
IGESAQVGAGAVVTRDVPAYTIVAGVPARMIGHTKDAAVNTVRAGA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory