SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012066689.1 NCBI__GCF_000017145.1:WP_012066689.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2eklA Structure of st1218 protein from sulfolobus tokodaii
34% identity, 98% coverage: 5:307/310 of query aligns to 2:308/312 of 2eklA

query
sites
2eklA
L
 
I
V
 
Y
T
 
T
P
 
V
R
 
K
S
 
A
L
 
L
S
 
I
L
 
T
D
 
D
P
 
P
P
 
I
P
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
L
-
 
I
E
 
K
P
 
T
L
 
L
R
 
R
Q
 
E
A
 
K
G
 
G
F
 
I
E
 
Q
L
 
V
V
 
D
F
 
Y
P
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
M
P
 
P
-
 
E
-
 
I
S
 
S
E
 
K
A
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
L
G
 
N
L
 
I
V
 
I
P
 
G
G
 
N
C
 
Y
-
 
D
I
 
I
G
 
I
W
 
V
L
 
V
A
 
R
G
 
S
V
 
R
E
 
T
P
 
K
V
 
V
S
 
T
D
 
K
K
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
E
A
 
K
A
 
G
D
 
K
S
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
I
I
 
I
S
 
A
R
 
R
N
 
A
G
 
G
T
x
I
G
 
G
I
 
L
D
 
D
N
 
N
L
 
I
P
 
D
L
 
T
P
 
E
L
 
E
L
 
A
K
 
E
E
 
K
R
 
R
G
 
N
I
 
I
G
 
K
I
 
V
L
 
V
K
 
Y
A
 
A
E
 
P
G
 
G
A
 
A
N
x
S
A
 
T
V
 
D
G
 
S
V
 
A
A
 
V
E
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
M
L
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
A
R
 
R
H
 
K
I
 
M
P
 
Y
A
 
T
E
 
S
T
 
M
A
 
A
G
 
L
I
 
A
R
 
K
A
 
S
G
 
G
G
 
I
W
 
F
P
 
K
R
 
K
S
 
I
R
 
E
G
 
G
R
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
V
G
|
G
C
 
F
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
T
R
 
K
V
 
V
A
 
G
R
 
I
A
 
I
V
 
A
S
 
N
A
 
A
M
 
M
R
 
G
A
 
M
S
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
A
C
x
Y
D
|
D
-
x
I
-
x
L
P
 
D
F
 
I
R
 
R
P
 
E
N
 
K
V
 
A
E
 
E
V
 
K
Y
 
I
G
 
N
P
 
A
F
 
-
K
 
K
W
 
A
A
 
V
S
 
S
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
L
F
 
L
A
 
K
G
 
N
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
H
|
H
C
x
V
P
x
T
A
 
V
P
 
S
A
 
K
D
 
D
G
 
A
K
 
K
P
 
P
I
|
I
V
 
I
D
 
D
A
 
Y
P
 
P
R
 
Q
L
 
F
A
 
E
T
 
L
V
 
M
P
 
K
P
 
D
H
 
N
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
T
|
T
A
x
S
R
|
R
A
 
A
T
 
V
L
 
A
V
 
V
D
 
N
E
 
G
D
 
K
A
 
A
V
 
L
R
 
L
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
D
 
K
E
 
K
G
 
G
R
 
K
L
 
V
Q
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
D
|
D
V
 
V
F
 
F
T
 
W
T
 
N
E
|
E
P
 
P
P
 
P
A
 
K
P
 
E
G
 
E
-
 
W
-
 
E
-
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
L
S
 
K
H
 
H
P
 
E
R
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
V
T
 
T
S
 
T
H
|
H
I
 
I
G
|
G
G
 
A
L
 
Q
T
 
T
D
 
K
E
 
E
S
 
A
V
 
Q
G
 
K
K
 
R
A
 
V
T
 
A
K
 
E
I
 
M
A
 
T
V
 
T
A
 
Q
N
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
N
A
 
A
L
 
M
V
 
K
E
 
E

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
30% identity, 95% coverage: 1:293/310 of query aligns to 1:290/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
M
 
L
K
 
R
R
 
K
I
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
S
P
 
D
R
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
P
P
 
C
P
 
C
E
 
R
L
 
-
E
 
K
P
 
I
L
 
L
R
 
Q
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
F
 
L
E
 
Q
L
 
V
V
 
V
F
 
-
P
 
-
T
 
-
P
 
E
G
 
K
R
 
Q
M
 
N
P
 
L
S
 
S
E
 
K
A
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
A
L
 
E
V
 
L
P
 
Q
G
 
D
C
 
C
I
 
E
G
 
G
W
 
L
L
 
I
A
 
V
-
 
R
G
 
S
V
 
A
E
 
T
P
 
K
V
 
V
S
 
T
D
 
A
K
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
S
 
G
R
 
R
N
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
V
P
 
D
L
 
L
P
 
E
L
 
A
L
 
A
K
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
L
I
 
V
L
 
M
K
 
N
A
 
T
E
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
V
 
L
G
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
S
I
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
S
 
K
R
 
K
-
 
F
-
 
M
G
 
G
R
 
T
E
 
E
I
 
L
A
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
I
x
L
G
 
G
C
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
A
 
R
V
 
M
S
 
Q
A
 
S
M
 
F
R
 
G
A
 
M
S
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
C
x
Y
D
|
D
P
|
P
-
 
I
F
x
I
R
 
S
P
 
P
N
 
E
V
 
V
E
 
S
V
 
A
Y
 
S
G
 
F
P
 
G
F
 
V
K
 
Q
W
 
Q
A
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
W
A
 
P
G
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
A
 
L
P
 
L
A
 
P
D
 
S
G
 
T
K
 
T
P
 
G
I
x
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
P
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
T
 
Q
V
 
C
P
 
K
P
 
K
H
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
G
T
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
E
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
Q
 
A
A
 
G
Y
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
T
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
A
 
R
P
 
D
G
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
V
S
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
S
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
D
 
K
E
 
E
S
 
A
V
 
Q
G
 
S
K
 
R
A
 
C

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
30% identity, 95% coverage: 1:293/310 of query aligns to 2:291/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
M
 
L
K
 
R
R
 
K
I
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
S
P
 
D
R
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
P
P
x
C
P
 
C
E
 
R
L
 
-
E
x
K
P
x
I
L
 
L
R
 
Q
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
F
 
L
E
 
Q
L
 
V
V
 
V
F
 
-
P
 
-
T
 
-
P
 
E
G
 
K
R
 
Q
M
 
N
P
 
L
S
 
S
E
 
K
A
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
A
L
 
E
V
 
L
P
 
Q
G
 
D
C
 
C
I
 
E
G
 
G
W
 
L
L
 
I
A
 
V
-
 
R
G
 
S
V
 
A
E
 
T
P
 
K
V
 
V
S
 
T
D
 
A
K
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
S
 
G
R
 
R
N
 
A
G
 
G
T
|
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
V
P
 
D
L
 
L
P
 
E
L
 
A
L
 
A
K
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
L
I
 
V
L
 
M
K
 
N
A
 
T
E
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
V
 
L
G
 
S
V
x
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
S
I
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
S
 
K
R
 
K
-
 
F
-
 
M
G
 
G
R
 
T
E
 
E
I
 
L
A
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
L
G
|
G
C
 
L
G
 
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
A
 
R
V
 
M
S
 
Q
A
 
S
M
 
F
R
 
G
A
 
M
S
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
C
x
Y
D
|
D
P
|
P
-
x
I
F
 
I
R
 
S
P
 
P
N
 
E
V
 
V
E
 
S
V
 
A
Y
 
S
G
 
F
P
 
G
F
 
V
K
 
Q
W
 
Q
A
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
W
A
 
P
G
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
A
 
L
P
 
L
A
 
P
D
 
S
G
x
T
K
 
T
P
 
G
I
 
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
P
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
T
 
Q
V
 
C
P
 
K
P
 
K
H
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
A
 
G
T
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
E
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
Q
 
A
A
 
G
Y
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
T
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
A
 
R
P
 
D
G
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
V
S
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
S
 
P
H
|
H
I
 
L
G
|
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
D
 
K
E
 
E
S
 
A
V
 
Q
G
 
S
K
 
R
A
 
C

Sites not aligning to the query:

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
30% identity, 95% coverage: 1:293/310 of query aligns to 1:290/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
M
 
L
K
 
R
R
 
K
I
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
S
P
 
D
R
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
P
P
 
C
P
 
C
E
 
R
L
 
-
E
 
K
P
 
I
L
 
L
R
 
Q
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
F
 
L
E
 
Q
L
 
V
V
 
V
F
 
-
P
 
-
T
 
-
P
 
E
G
 
K
R
 
Q
M
 
N
P
 
L
S
 
S
E
 
K
A
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
A
L
 
E
V
 
L
P
 
Q
G
 
D
C
 
C
I
 
E
G
 
G
W
 
L
L
 
I
A
 
V
-
 
R
G
 
S
V
 
A
E
 
T
P
 
K
V
 
V
S
 
T
D
 
A
K
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
S
 
G
R
 
R
N
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
V
P
 
D
L
 
L
P
 
E
L
 
A
L
 
A
K
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
L
I
 
V
L
 
M
K
 
N
A
 
T
E
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
V
 
L
G
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
S
I
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
S
 
K
R
 
K
-
 
F
-
 
M
G
 
G
R
 
T
E
 
E
I
 
L
A
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
I
x
L
G
|
G
C
x
L
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
|
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
A
 
R
V
 
M
S
 
Q
A
 
S
M
 
F
R
 
G
A
 
M
S
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
C
 
Y
D
|
D
P
 
P
-
 
I
F
 
I
R
 
S
P
 
P
N
 
E
V
 
V
E
 
S
V
 
A
Y
 
S
G
 
F
P
 
G
F
 
V
K
 
Q
W
 
Q
A
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
W
A
 
P
G
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
A
 
L
P
 
L
A
 
P
D
 
S
G
 
T
K
 
T
P
 
G
I
 
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
P
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
T
 
Q
V
 
C
P
 
K
P
 
K
H
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
G
T
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
E
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
Q
 
A
A
 
G
Y
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
T
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
A
 
R
P
 
D
G
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
V
S
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
S
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
D
 
K
E
 
E
S
 
A
V
 
Q
G
 
S
K
 
R
A
 
C

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
30% identity, 95% coverage: 1:293/310 of query aligns to 1:290/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
M
 
L
K
 
R
R
 
K
I
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
S
P
 
D
R
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
P
P
 
C
P
 
C
E
 
R
L
 
-
E
 
K
P
 
I
L
 
L
R
 
Q
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
F
 
L
E
 
Q
L
 
V
V
 
V
F
 
-
P
 
-
T
 
-
P
 
E
G
 
K
R
 
Q
M
 
N
P
 
L
S
 
S
E
 
K
A
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
A
L
 
E
V
 
L
P
 
Q
G
 
D
C
 
C
I
 
E
G
 
G
W
 
L
L
 
I
A
 
V
-
 
R
G
 
S
V
 
A
E
 
T
P
 
K
V
 
V
S
 
T
D
 
A
K
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
S
 
G
R
 
R
N
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
V
P
 
D
L
 
L
P
 
E
L
 
A
L
 
A
K
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
L
I
 
V
L
 
M
K
 
N
A
 
T
E
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
V
 
L
G
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
S
I
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
S
 
K
R
 
K
-
 
F
-
 
M
G
 
G
R
 
T
E
 
E
I
 
L
A
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
C
 
L
G
|
G
A
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
A
 
R
V
 
M
S
 
Q
A
 
S
M
 
F
R
 
G
A
 
M
S
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
C
x
Y
D
|
D
P
|
P
-
x
I
F
x
I
R
 
S
P
 
P
N
 
E
V
 
V
E
 
S
V
 
A
Y
 
S
G
 
F
P
 
G
F
 
V
K
 
Q
W
 
Q
A
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
W
A
 
P
G
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
C
x
T
P
|
P
A
 
L
P
 
L
A
 
P
D
 
S
G
 
T
K
 
T
P
 
G
I
x
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
P
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
T
 
Q
V
 
C
P
 
K
P
 
K
H
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
G
T
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
E
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
Q
 
A
A
 
G
Y
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
T
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
A
 
R
P
 
D
G
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
V
S
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
S
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
D
 
K
E
 
E
S
 
A
V
 
Q
G
 
S
K
 
R
A
 
C

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
30% identity, 95% coverage: 1:293/310 of query aligns to 1:290/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
M
 
L
K
 
R
R
 
K
I
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
S
P
 
D
R
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
P
P
 
C
P
 
C
E
 
R
L
 
-
E
 
K
P
 
I
L
 
L
R
 
Q
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
F
 
L
E
 
Q
L
 
V
V
 
V
F
 
-
P
 
-
T
 
-
P
 
E
G
 
K
R
 
Q
M
 
N
P
 
L
S
 
S
E
 
K
A
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
A
L
 
E
V
 
L
P
 
Q
G
 
D
C
 
C
I
 
E
G
 
G
W
 
L
L
 
I
A
 
V
-
 
R
G
 
S
V
 
A
E
 
T
P
 
K
V
 
V
S
 
T
D
 
A
K
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
S
 
G
R
 
R
N
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
V
P
 
D
L
 
L
P
 
E
L
 
A
L
 
A
K
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
L
I
 
V
L
 
M
K
 
N
A
 
T
E
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
V
 
L
G
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
S
I
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
S
 
K
R
 
K
-
 
F
-
 
M
G
 
G
R
 
T
E
 
E
I
 
L
A
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
C
 
L
G
|
G
A
x
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
A
 
R
V
 
M
S
 
Q
A
 
S
M
 
F
R
 
G
A
 
M
S
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
C
 
Y
D
|
D
P
|
P
-
x
I
F
x
I
R
 
S
P
 
P
N
 
E
V
 
V
E
 
S
V
 
A
Y
 
S
G
 
F
P
 
G
F
 
V
K
 
Q
W
 
Q
A
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
W
A
 
P
G
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
 
P
A
 
L
P
x
L
A
 
P
D
 
S
G
 
T
K
 
T
P
 
G
I
 
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
P
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
T
 
Q
V
 
C
P
 
K
P
 
K
H
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
G
T
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
E
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
Q
 
A
A
 
G
Y
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
T
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
A
 
R
P
 
D
G
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
V
S
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
S
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
D
 
K
E
 
E
S
 
A
V
 
Q
G
 
S
K
 
R
A
 
C

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
31% identity, 93% coverage: 1:289/310 of query aligns to 2:287/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
M
 
L
K
 
R
R
 
K
I
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
S
P
 
D
R
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
P
P
 
C
P
 
C
E
 
R
L
 
-
E
 
K
P
 
I
L
 
L
R
 
Q
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
F
 
L
E
 
Q
L
 
V
V
 
V
F
 
-
P
 
-
T
 
-
P
 
E
G
 
K
R
 
Q
M
 
N
P
 
L
S
 
S
E
 
K
A
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
A
L
 
E
V
 
L
P
 
Q
G
 
D
C
 
C
I
 
E
G
 
G
W
 
L
L
 
I
A
 
V
-
 
R
G
 
S
V
 
A
E
 
T
P
 
K
V
 
V
S
 
T
D
 
A
K
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
S
 
G
R
 
R
N
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
V
P
 
D
L
 
L
P
 
E
L
 
A
L
 
A
K
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
L
I
 
V
L
 
M
K
 
N
A
 
T
E
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
V
 
L
G
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
S
I
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
S
 
K
R
 
K
-
 
F
-
 
M
G
 
G
R
 
T
E
 
E
I
 
L
A
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
C
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
A
 
R
V
 
M
S
 
Q
A
 
S
M
 
F
R
 
G
A
 
M
S
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
C
x
Y
D
|
D
P
|
P
-
 
I
F
 
I
R
 
S
P
 
P
N
 
E
V
 
V
E
 
S
V
 
A
Y
 
S
G
 
F
P
 
G
F
 
V
K
 
Q
W
 
Q
A
 
L
S
 
P
L
|
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
W
A
 
P
G
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
A
 
L
P
 
L
A
 
P
D
 
S
G
 
T
K
 
T
P
 
G
I
x
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
P
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
T
 
Q
V
 
C
P
 
K
P
 
K
H
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
G
T
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
E
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
Q
 
A
A
 
G
Y
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
T
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
A
 
R
P
 
D
G
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
V
S
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
S
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
D
 
K
E
 
E
S
 
A

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
30% identity, 94% coverage: 2:293/310 of query aligns to 1:289/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
K
 
R
R
 
K
I
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
S
P
 
D
R
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
P
P
 
C
P
 
C
E
 
R
L
 
-
E
 
K
P
 
I
L
 
L
R
 
Q
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
F
 
L
E
 
Q
L
 
V
V
 
V
F
 
-
P
 
-
T
 
-
P
 
E
G
 
K
R
 
Q
M
 
N
P
 
L
S
 
S
E
 
K
A
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
A
L
 
E
V
 
L
P
 
Q
G
 
D
C
 
C
I
 
E
G
 
G
W
 
L
L
 
I
A
 
V
-
 
R
G
 
S
V
 
A
E
 
T
P
 
K
V
 
V
S
 
T
D
 
A
K
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
S
 
G
R
 
R
N
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
V
P
 
D
L
 
L
P
 
E
L
 
A
L
 
A
K
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
L
I
 
V
L
 
M
K
 
N
A
 
T
E
 
P
G
 
N
A
 
G
N
|
N
A
 
S
V
 
L
G
 
S
V
x
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
S
I
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
S
 
K
R
 
K
-
 
F
-
 
M
G
 
G
R
 
T
E
 
E
I
 
L
A
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
C
 
L
G
 
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
A
 
R
V
 
M
S
 
Q
A
 
S
M
 
F
R
 
G
A
 
M
S
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
C
x
Y
D
|
D
P
|
P
-
x
I
F
 
I
R
 
S
P
 
P
N
 
E
V
 
V
E
 
S
V
 
A
Y
 
S
G
 
F
P
 
G
F
 
V
K
 
Q
W
 
Q
A
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
W
A
 
P
G
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
A
 
L
P
 
L
A
 
P
D
 
S
G
x
T
K
 
T
P
 
G
I
 
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
P
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
T
 
Q
V
 
C
P
 
K
P
 
K
H
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
A
 
G
T
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
E
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
Q
 
A
A
 
G
Y
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
T
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
A
 
R
P
 
D
G
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
V
S
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
S
 
P
H
|
H
I
 
L
G
|
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
D
 
K
E
 
E
S
 
A
V
 
Q
G
 
S
K
 
R
A
 
C

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
31% identity, 93% coverage: 1:289/310 of query aligns to 6:291/533 of O43175

query
sites
O43175
M
 
L
K
 
R
R
 
K
I
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
S
P
 
D
R
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
P
P
 
C
P
 
C
E
 
R
L
 
-
E
 
K
P
 
I
L
 
L
R
 
Q
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
F
 
L
E
 
Q
L
 
V
V
 
V
F
 
-
P
 
-
T
 
-
P
 
E
G
 
K
R
 
Q
M
 
N
P
 
L
S
 
S
E
 
K
A
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
A
L
 
E
V
 
L
P
 
Q
G
 
D
C
 
C
I
 
E
G
 
G
W
 
L
L
 
I
A
 
V
-
 
R
G
 
S
V
 
A
E
 
T
P
 
K
V
 
V
S
 
T
D
 
A
K
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
S
 
G
R
 
R
N
 
A
G
 
G
T
|
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
V
P
 
D
L
 
L
P
 
E
L
 
A
L
 
A
K
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
L
I
 
V
L
 
M
K
 
N
A
 
T
E
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
V
 
L
G
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
S
I
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
P
 
E
R
|
R
S
 
K
R
 
K
-
 
F
-
 
M
G
 
G
R
 
T
E
 
E
I
 
L
A
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
C
 
L
G
 
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
A
 
R
V
 
M
S
 
Q
A
 
S
M
 
F
R
 
G
A
 
M
S
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
C
 
Y
D
|
D
P
 
P
-
 
I
F
 
I
R
 
S
P
 
P
N
 
E
V
 
V
E
 
S
V
 
A
Y
 
S
G
 
F
P
 
G
F
 
V
K
 
Q
W
 
Q
A
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
W
A
 
P
G
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
C
x
T
P
 
P
A
 
L
P
 
L
A
 
P
D
 
S
G
 
T
K
 
T
P
 
G
I
 
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
P
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
T
 
Q
V
 
C
P
 
K
P
 
K
H
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
A
 
G
T
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
E
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
Q
 
A
A
 
G
Y
 
A
A
 
A
T
 
L
D
|
D
V
|
V
F
 
F
T
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
A
 
R
P
 
D
G
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
V
S
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
S
 
P
H
|
H
I
x
L
G
|
G
G
x
A
L
 
S
T
 
T
D
 
K
E
 
E
S
 
A

Sites not aligning to the query:

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
30% identity, 94% coverage: 2:293/310 of query aligns to 1:289/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
K
 
R
R
 
K
I
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
S
P
 
D
R
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
P
P
 
C
P
 
C
E
 
R
L
 
-
E
 
K
P
 
I
L
 
L
R
 
Q
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
F
 
L
E
 
Q
L
 
V
V
 
V
F
 
-
P
 
-
T
 
-
P
 
E
G
 
K
R
 
Q
M
 
N
P
 
L
S
 
S
E
 
K
A
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
A
L
 
E
V
 
L
P
 
Q
G
 
D
C
 
C
I
 
E
G
 
G
W
 
L
L
 
I
A
 
V
-
 
R
G
 
S
V
 
A
E
 
T
P
 
K
V
 
V
S
 
T
D
 
A
K
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
S
 
G
R
 
R
N
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
V
P
 
D
L
 
L
P
 
E
L
 
A
L
 
A
K
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
L
I
 
V
L
 
M
K
 
N
A
 
T
E
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
V
 
L
G
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
S
I
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
S
 
K
R
 
K
-
 
F
-
 
M
G
 
G
R
 
T
E
 
E
I
 
L
A
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
I
x
L
G
 
G
C
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
A
 
R
V
 
M
S
 
Q
A
 
S
M
 
F
R
 
G
A
 
M
S
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
C
x
Y
D
|
D
P
|
P
-
x
I
F
x
I
R
 
S
P
 
P
N
 
E
V
 
V
E
 
S
V
 
A
Y
 
S
G
 
F
P
 
G
F
 
V
K
 
Q
W
 
Q
A
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
W
A
 
P
G
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
A
 
L
P
 
L
A
 
P
D
 
S
G
 
T
K
 
T
P
 
G
I
x
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
P
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
T
 
Q
V
 
C
P
 
K
P
 
K
H
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
G
T
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
E
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
Q
 
A
A
 
G
Y
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
T
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
A
 
R
P
 
D
G
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
V
S
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
S
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
D
 
K
E
 
E
S
 
A
V
 
Q
G
 
S
K
 
R
A
 
C

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
31% identity, 92% coverage: 10:293/310 of query aligns to 4:287/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
S
 
S
L
 
D
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
P
P
 
C
P
 
C
E
 
R
L
 
-
E
 
K
P
 
I
L
 
L
R
 
Q
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
F
 
L
E
 
Q
L
 
V
V
 
V
F
 
-
P
 
-
T
 
-
P
 
E
G
 
K
R
 
Q
M
 
N
P
 
L
S
 
S
E
 
K
A
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
A
L
 
E
V
 
L
P
 
Q
G
 
D
C
 
C
I
 
E
G
 
G
W
 
L
L
 
I
A
 
V
-
 
R
G
 
S
V
 
A
E
 
T
P
 
K
V
 
V
S
 
T
D
 
A
K
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
S
 
G
R
 
R
N
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
V
P
 
D
L
 
L
P
 
E
L
 
A
L
 
A
K
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
L
I
 
V
L
 
M
K
 
N
A
 
T
E
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
V
 
L
G
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
S
I
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
S
 
K
R
 
K
-
 
F
-
 
M
G
 
G
R
 
T
E
 
E
I
 
L
A
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
C
 
L
G
|
G
A
 
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
A
 
R
V
 
M
S
 
Q
A
 
S
M
 
F
R
 
G
A
 
M
S
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
C
x
Y
D
|
D
P
|
P
-
x
I
F
x
I
R
 
S
P
 
P
N
 
E
V
 
V
E
 
S
V
 
A
Y
 
S
G
 
F
P
 
G
F
 
V
K
 
Q
W
 
Q
A
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
W
A
 
P
G
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
 
P
A
 
L
P
 
L
A
 
P
D
 
S
G
 
T
K
 
T
P
 
G
I
x
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
P
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
T
 
Q
V
 
C
P
 
K
P
 
K
H
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
|
R
A
 
G
T
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
E
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
Q
 
A
A
 
G
Y
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
T
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
A
 
R
P
 
D
G
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
V
S
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
S
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
D
 
K
E
 
E
S
 
A
V
 
Q
G
 
S
K
 
R
A
 
C

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
30% identity, 94% coverage: 2:293/310 of query aligns to 1:281/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
K
 
R
R
 
K
I
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
S
P
 
D
R
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
P
P
 
C
P
 
C
E
 
R
L
 
-
E
 
K
P
 
I
L
 
L
R
 
Q
Q
 
D
A
 
G
G
 
G
F
 
L
E
 
Q
L
 
V
V
 
V
F
 
-
P
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
P
 
E
S
 
K
E
 
Q
A
 
N
E
 
L
L
 
L
I
 
I
G
 
A
L
 
E
V
 
L
P
 
Q
G
 
D
C
 
C
I
 
E
G
 
G
W
 
L
L
 
I
A
 
-
G
 
-
V
 
V
E
 
R
P
 
S
V
 
A
S
 
A
D
 
D
K
 
-
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
S
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
S
 
G
R
 
R
N
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
V
P
 
D
L
 
L
P
 
E
L
 
A
L
 
A
K
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
L
I
 
V
L
 
M
K
 
N
A
 
T
E
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
V
 
L
G
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
C
G
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
S
I
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
S
 
K
R
 
K
-
 
F
-
 
M
G
 
G
R
 
T
E
 
E
I
 
L
A
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
C
 
L
G
 
G
A
x
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
A
 
R
V
 
M
S
 
Q
A
 
S
M
 
F
R
 
G
A
 
M
S
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
C
x
Y
D
|
D
P
|
P
-
 
I
F
x
I
R
 
S
P
 
P
N
 
E
V
 
V
E
 
S
V
 
A
Y
 
S
G
 
F
P
 
G
F
 
V
K
 
Q
W
 
Q
A
 
L
S
 
P
L
|
L
D
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
W
A
 
P
G
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
C
x
T
P
|
P
A
 
L
P
 
L
A
 
P
D
x
S
G
 
T
K
 
T
P
 
G
I
x
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
P
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
T
 
Q
V
 
C
P
 
K
P
 
K
H
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
G
T
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
E
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
Q
 
A
A
 
G
Y
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
T
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
A
 
R
P
 
D
G
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
V
S
 
D
H
 
H
P
 
E
R
 
N
V
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
S
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
D
 
K
E
 
E
S
 
A
V
 
Q
G
 
S
K
 
R
A
 
C

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
34% identity, 89% coverage: 19:293/310 of query aligns to 14:290/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
L
 
I
E
 
Q
P
 
V
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
A
 
A
G
 
G
F
 
L
E
 
E
L
 
V
V
 
I
F
 
Y
P
 
E
T
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
E
M
 
Y
P
 
P
S
 
D
E
 
E
A
 
D
E
 
R
L
 
L
I
 
V
G
 
E
L
 
L
V
 
V
P
 
K
G
 
D
C
 
V
I
 
E
G
 
A
W
 
I
L
 
I
A
 
V
G
 
R
V
 
S
E
 
K
P
 
P
-
 
K
V
 
V
S
 
T
D
 
R
K
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
E
A
 
S
A
 
A
D
 
P
S
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
V
I
 
I
S
 
A
R
 
R
N
 
A
G
 
G
T
 
V
G
 
G
I
 
L
D
 
D
N
 
N
L
 
I
P
 
D
L
 
V
P
 
E
L
 
A
L
 
A
K
 
K
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
E
I
 
V
L
 
V
K
 
N
A
 
A
E
 
P
G
 
A
A
 
A
N
x
S
A
 
S
V
 
R
G
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
M
L
 
F
A
 
S
A
 
V
L
 
A
R
 
R
H
 
K
I
 
I
P
 
A
A
 
F
E
 
A
T
 
D
A
 
R
G
 
K
I
 
M
R
 
R
A
 
E
G
 
G
G
 
V
W
 
W
P
 
A
R
 
K
S
 
K
R
 
E
-
 
A
-
 
M
G
 
G
R
 
I
E
 
E
I
 
L
A
 
E
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
|
G
C
x
F
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
Y
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
I
V
 
A
S
 
N
A
 
A
M
 
L
R
 
G
A
 
M
S
 
N
V
 
I
I
 
L
A
 
L
C
x
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
Y
R
 
-
P
 
P
N
 
N
-
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
A
V
 
K
E
 
E
V
 
V
Y
 
N
G
 
G
P
 
K
F
 
F
K
 
-
W
 
-
A
 
V
S
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
T
V
 
L
F
 
L
A
 
K
G
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
V
S
 
T
L
 
I
H
 
H
C
x
V
P
|
P
A
 
L
P
 
V
A
 
E
D
 
S
G
x
T
K
 
Y
P
 
H
I
 
L
V
 
I
D
 
N
A
 
E
P
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
K
T
 
L
V
 
M
P
 
K
P
 
K
H
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
S
R
|
R
A
 
G
T
 
P
L
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
D
 
N
A
 
A
V
 
L
R
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
Q
 
A
A
 
G
Y
 
A
A
 
G
T
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
T
 
E
T
 
E
E
|
E
P
 
P
-
 
L
P
 
P
A
 
K
P
 
D
G
 
H
S
 
P
L
 
L
A
 
T
S
 
K
H
 
F
P
 
D
R
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
L
T
 
T
S
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
D
 
V
E
 
E
S
 
A
V
 
Q
G
 
E
K
 
R
A
 
A

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
36% identity, 83% coverage: 38:293/310 of query aligns to 31:290/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
P
 
P
S
 
D
E
 
R
A
 
D
E
 
K
L
 
L
I
 
L
G
 
A
L
 
A
V
 
V
P
 
P
G
 
E
C
 
A
I
 
D
G
 
A
W
 
L
L
 
L
A
 
V
-
 
R
G
 
S
V
 
A
E
 
T
P
 
T
V
 
V
S
 
D
D
 
A
K
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
P
S
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
I
I
 
V
S
 
A
R
|
R
N
 
A
G
 
G
T
x
V
G
 
G
I
 
L
D
 
D
N
 
N
L
 
V
P
 
D
L
 
V
P
 
D
L
 
A
L
 
A
K
 
T
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
G
 
L
I
 
V
L
 
V
K
 
N
A
 
A
E
 
P
G
 
T
A
 
S
N
|
N
A
 
I
V
 
H
G
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
H
S
 
A
V
 
L
G
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
S
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
A
E
 
A
T
 
D
A
 
A
G
 
S
I
 
L
R
 
R
A
 
E
G
 
H
G
 
T
W
 
W
P
 
K
R
 
R
S
 
S
R
 
S
-
 
F
-
 
S
G
 
G
R
 
T
E
 
E
I
 
I
A
 
F
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
C
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
Q
A
 
R
V
 
I
S
 
A
A
 
A
M
 
F
R
 
G
A
 
A
S
 
Y
V
 
V
I
 
V
A
 
A
C
 
Y
D
 
D
P
 
P
F
 
Y
-
 
V
R
 
S
P
 
P
N
 
A
V
 
R
E
 
A
V
 
A
Y
 
Q
G
 
L
P
 
G
F
 
I
K
 
E
W
 
L
A
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
V
 
L
F
 
L
A
 
A
G
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
C
 
L
P
 
P
A
 
K
P
 
T
A
 
P
D
 
E
G
 
T
K
 
A
P
 
G
I
 
L
V
 
I
D
 
D
A
 
K
P
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
K
V
 
T
P
 
K
P
 
P
H
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
A
 
G
T
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
A
V
 
L
R
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
I
D
 
T
E
 
G
G
 
G
R
 
H
L
 
V
Q
 
R
A
 
A
Y
 
A
A
 
G
T
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
T
 
A
T
 
T
E
|
E
P
 
P
P
 
C
A
 
T
P
 
D
G
 
S
S
 
P
L
 
L
A
 
F
S
 
E
H
 
L
P
 
A
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
A
 
V
T
 
T
S
 
P
H
|
H
I
 
L
G
 
G
G
x
A
L
 
S
T
 
T
D
 
A
E
 
E
S
 
A
V
x
Q
G
 
D
K
 
R
A
 
A

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
36% identity, 83% coverage: 38:293/310 of query aligns to 30:289/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
P
 
P
S
 
D
E
 
R
A
 
D
E
 
K
L
 
L
I
 
L
G
 
A
L
 
A
V
 
V
P
 
P
G
 
E
C
 
A
I
 
D
G
 
A
W
 
L
L
 
L
A
 
V
-
 
R
G
 
S
V
 
A
E
 
T
P
 
T
V
 
V
S
 
D
D
 
A
K
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
P
S
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
I
I
 
V
S
 
A
R
 
R
N
 
A
G
 
G
T
 
V
G
 
G
I
 
L
D
 
D
N
 
N
L
 
V
P
 
D
L
 
V
P
 
D
L
 
A
L
 
A
K
 
T
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
G
 
L
I
 
V
L
 
V
K
 
N
A
 
A
E
 
P
G
 
T
A
 
S
N
|
N
A
 
I
V
 
H
G
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
H
S
 
A
V
 
L
G
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
S
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
A
E
 
A
T
 
D
A
 
A
G
 
S
I
 
L
R
 
R
A
 
E
G
 
H
G
 
T
W
 
W
P
 
K
R
 
R
S
 
S
R
 
S
-
 
F
-
 
S
G
 
G
R
 
T
E
 
E
I
 
I
A
 
F
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
C
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
Q
A
 
R
V
 
I
S
 
A
A
 
A
M
 
F
R
 
G
A
 
A
S
 
Y
V
 
V
I
 
V
A
 
A
C
 
Y
D
 
D
P
 
P
F
 
Y
-
 
V
R
 
S
P
 
P
N
 
A
V
 
R
E
 
A
V
 
A
Y
 
Q
G
 
L
P
 
G
F
 
I
K
 
E
W
 
L
A
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
V
 
L
F
 
L
A
 
A
G
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
C
 
L
P
 
P
A
 
K
P
 
T
A
 
P
D
 
E
G
 
T
K
 
A
P
 
G
I
 
L
V
 
I
D
 
D
A
 
K
P
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
K
V
 
T
P
 
K
P
 
P
H
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
A
 
G
T
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
A
V
 
L
R
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
I
D
 
T
E
 
G
G
 
G
R
 
H
L
 
V
Q
 
R
A
 
A
Y
 
A
A
 
G
T
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
T
 
A
T
 
T
E
|
E
P
 
P
P
 
C
A
 
T
P
 
D
G
 
S
S
 
P
L
 
L
A
 
F
S
 
E
H
 
L
P
 
A
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
A
 
V
T
 
T
S
 
P
H
|
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
D
 
A
E
 
E
S
 
A
V
 
Q
G
 
D
K
 
R
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4njmA Crystal structure of phosphoglycerate bound 3-phosphoglycerate dehydrogenase in entamoeba histolytica (see paper)
26% identity, 93% coverage: 1:289/310 of query aligns to 3:273/303 of 4njmA

query
sites
4njmA
M
 
M
K
 
K
R
 
I
I
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
P
 
E
R
x
K
S
 
P
L
 
F
S
 
A
L
 
E
D
 
N
P
 
A
P
 
V
P
 
K
E
 
G
L
 
I
-
 
R
E
 
E
P
 
I
L
 
L
R
 
E
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
F
 
H
E
 
E
L
 
V
V
 
V
F
 
M
P
 
I
T
 
E
P
 
-
G
 
-
R
 
K
M
 
Y
P
 
K
S
 
K
E
 
K
A
 
E
E
 
D
L
 
V
I
 
I
G
 
E
L
 
R
V
 
I
P
 
K
G
 
D
C
 
A
I
 
D
G
 
G
W
 
V
L
 
I
A
 
V
G
x
R
V
x
S
E
 
D
P
 
K
V
 
I
S
 
D
D
 
E
K
 
E
V
 
I
I
 
I
A
 
K
A
 
A
A
 
G
D
 
E
S
 
K
L
 
V
R
 
K
A
 
I
I
 
I
S
 
V
R
|
R
N
 
A
G
|
G
T
x
A
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
I
P
 
D
L
 
I
P
 
E
L
 
A
L
 
C
K
 
N
E
 
Q
R
 
G
G
 
K
I
 
I
G
 
V
I
 
V
L
 
M
K
 
N
A
 
T
E
 
P
G
 
G
A
 
Q
N
|
N
A
 
R
V
 
N
G
 
G
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
C
V
 
I
G
 
G
L
 
M
M
 
M
L
 
I
A
 
F
A
 
G
L
 
F
R
 
R
H
 
K
I
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
W
 
F
P
 
K
R
 
E
S
 
G
R
 
K
G
 
G
R
 
R
E
 
E
I
 
L
A
 
K
E
 
D
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
C
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
Y
I
 
V
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
A
 
K
R
 
E
A
 
I
V
 
A
S
 
E
A
 
G
M
 
I
R
 
G
A
 
M
S
 
K
V
 
I
I
 
K
A
 
V
C
 
Y
D
 
D
P
 
P
F
 
F
R
 
-
P
 
-
N
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
I
Y
 
T
G
 
T
P
 
E
F
 
N
K
 
Q
W
 
V
A
 
K
S
 
K
L
 
I
D
 
E
E
 
E
V
 
L
F
 
F
A
 
E
G
 
E
A
 
C
D
 
Q
I
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
H
 
H
C
 
L
P
 
P
A
 
L
P
 
T
A
 
K
D
 
E
G
 
T
K
 
K
P
 
G
I
 
K
V
 
I
D
 
G
A
 
Y
P
 
E
R
 
L
L
 
I
A
 
K
T
 
K
V
 
L
P
 
P
P
 
Y
H
 
G
A
 
G
I
 
M
L
 
I
I
 
C
N
 
N
T
 
T
A
 
A
R
|
R
A
 
K
T
 
E
L
 
I
V
 
I
D
 
D
E
 
E
D
 
E
A
 
G
V
 
L
R
 
I
A
 
R
A
 
I
L
 
M
D
 
R
E
 
E
G
 
R
R
 
E
L
 
D
Q
 
L
A
 
I
Y
 
Y
A
 
I
T
 
T
D
|
D
V
 
V
F
 
A
T
 
P
T
 
T
E
x
S
P
 
K
P
 
V
A
 
F
P
 
N
G
 
N
S
 
E
L
 
F
A
 
K
S
 
G
H
 
-
P
 
-
R
 
R
V
 
F
I
 
F
A
 
A
T
 
T
-
 
P
S
 
I
H
x
K
I
 
I
G
 
G
G
x
A
L
 
E
T
 
T
D
 
E
E
 
E
S
 
S

4njoA Crystal structure of cofactor(NAD+) bound 3-phosphoglycerate dehydrogenase in entamoeba histolytica (see paper)
26% identity, 93% coverage: 1:289/310 of query aligns to 3:273/302 of 4njoA

query
sites
4njoA
M
 
M
K
 
K
R
 
I
I
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
P
 
E
R
 
K
S
 
P
L
 
F
S
 
A
L
 
E
D
 
N
P
 
A
P
 
V
P
 
K
E
 
G
L
 
I
-
 
R
E
 
E
P
 
I
L
 
L
R
 
E
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
F
 
H
E
 
E
L
 
V
V
 
V
F
 
M
P
 
I
T
 
E
P
 
-
G
 
-
R
 
K
M
 
Y
P
 
K
S
 
K
E
 
K
A
 
E
E
 
D
L
 
V
I
 
I
G
 
E
L
 
R
V
 
I
P
 
K
G
 
D
C
 
A
I
 
D
G
 
G
W
 
V
L
 
I
A
 
V
G
 
R
V
 
S
E
 
D
P
 
K
V
 
I
S
 
D
D
 
E
K
 
E
V
 
I
I
 
I
A
 
K
A
 
A
A
 
G
D
 
E
S
 
K
L
 
V
R
 
K
A
 
I
I
 
I
S
 
V
R
 
R
N
 
A
G
 
G
T
x
A
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
I
P
 
D
L
 
I
P
 
E
L
 
A
L
 
C
K
 
N
E
 
Q
R
 
G
G
 
K
I
 
I
G
 
V
I
 
V
L
 
M
K
 
N
A
 
T
E
 
P
G
 
G
A
 
Q
N
|
N
A
 
R
V
 
N
G
 
G
V
|
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
C
V
 
I
G
 
G
L
 
M
M
 
M
L
 
I
A
 
F
A
 
G
L
 
F
R
 
R
H
 
K
I
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
W
 
F
P
 
K
R
 
E
S
 
G
R
 
K
G
 
G
R
 
R
E
 
E
I
 
L
A
 
K
E
 
D
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
C
G
 
G
C
 
C
G
|
G
A
x
Y
I
x
V
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
A
 
K
R
 
E
A
 
I
V
 
A
S
 
E
A
 
G
M
 
I
R
 
G
A
 
M
S
 
K
V
 
I
I
 
K
A
 
V
C
 
Y
D
|
D
P
 
P
F
|
F
R
 
-
P
 
-
N
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
I
Y
 
T
G
 
T
P
 
E
F
 
N
K
 
Q
W
 
V
A
 
K
S
 
K
L
 
I
D
 
E
E
 
E
V
 
L
F
 
F
A
 
E
G
 
E
A
 
C
D
 
Q
I
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
H
|
H
C
x
L
P
|
P
A
 
L
P
 
T
A
 
K
D
 
E
G
 
T
K
 
K
P
 
G
I
 
K
V
 
I
D
 
G
A
 
Y
P
 
E
R
 
L
L
 
I
A
 
K
T
 
K
V
 
L
P
 
P
P
 
Y
H
 
G
A
 
G
I
 
M
L
 
I
I
 
C
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
A
 
K
T
 
E
L
 
I
V
 
I
D
 
D
E
 
E
D
 
E
A
 
G
V
 
L
R
 
I
A
 
R
A
 
I
L
 
M
D
 
R
E
 
E
G
 
R
R
 
E
L
 
D
Q
 
L
A
 
I
Y
 
Y
A
 
I
T
 
T
D
|
D
V
 
V
F
 
A
T
 
P
T
 
T
E
x
S
P
 
K
P
 
V
A
 
F
P
 
N
G
 
N
S
 
E
L
 
F
A
 
K
S
 
G
H
 
-
P
 
-
R
 
R
V
 
F
I
 
F
A
 
A
T
 
T
-
 
P
S
 
I
H
x
K
I
 
I
G
|
G
G
 
A
L
 
E
T
 
T
D
 
E
E
 
E
S
 
S

6ttbA Crystal structure of NAD-dependent formate dehydrogenase from staphylococcus aureus in complex with NAD
31% identity, 73% coverage: 65:289/310 of query aligns to 73:300/331 of 6ttbA

query
sites
6ttbA
I
 
I
A
 
E
A
 
K
A
 
A
D
 
P
S
 
N
L
 
L
R
 
K
A
 
L
I
 
A
S
 
I
R
 
T
N
 
A
G
 
G
T
x
V
G
 
G
I
 
S
D
 
D
N
 
H
L
 
V
P
 
D
L
 
L
P
 
A
L
 
A
L
 
A
K
 
S
E
 
E
R
 
H
G
 
N
I
 
I
G
 
G
I
 
V
L
 
V
K
 
E
A
 
V
E
 
T
G
 
G
A
 
S
N
|
N
A
 
T
V
 
V
G
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
L
 
H
S
 
A
V
 
V
G
 
M
L
 
D
M
 
L
L
 
L
A
 
I
A
 
L
L
 
L
R
 
R
H
 
N
I
 
Y
P
 
E
A
 
E
E
 
G
T
 
H
A
 
R
G
 
Q
I
 
S
R
 
V
A
 
E
G
 
G
G
 
E
W
 
W
P
 
N
R
 
L
S
 
S
R
 
Q
-
 
V
-
 
G
-
 
N
-
 
H
G
 
A
R
 
H
E
 
E
I
 
L
A
 
Q
E
 
H
R
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
I
x
F
G
 
G
C
 
F
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
E
A
 
R
V
 
L
S
 
A
A
 
P
M
 
F
R
 
N
A
 
V
S
 
T
V
 
L
I
 
Q
A
 
H
C
x
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
I
R
 
-
P
 
-
N
 
N
V
 
Q
E
 
Q
V
 
D
Y
 
H
G
 
K
P
 
L
F
 
S
K
 
K
W
 
F
A
 
V
S
 
S
L
 
F
D
 
D
E
 
E
V
 
L
F
 
V
A
 
S
G
 
S
A
 
S
D
 
D
I
 
A
V
 
I
S
 
T
L
 
I
H
|
H
C
x
A
P
|
P
A
 
L
P
 
T
A
 
P
D
 
E
G
x
T
K
 
D
P
 
N
I
 
L
V
 
F
D
 
D
A
 
K
P
 
D
R
 
V
L
 
L
A
 
S
T
 
R
V
 
M
P
 
K
P
 
K
H
 
H
A
 
S
I
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
A
 
G
T
 
K
L
 
I
V
 
V
D
 
N
E
 
R
D
 
D
A
 
A
V
 
L
R
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
A
E
 
S
G
 
E
R
 
H
L
 
L
Q
 
Q
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
T
 
G
D
 
D
V
 
V
F
 
W
T
 
Y
T
 
P
E
 
Q
P
 
P
-
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
D
G
 
H
S
 
P
L
 
W
A
 
R
S
 
T
H
 
M
P
 
P
R
 
R
V
 
N
I
 
A
A
 
M
T
 
T
S
 
V
H
|
H
I
 
Y
G
x
S
G
|
G
L
 
M
T
 
T
D
 
L
E
 
E
S
 
A

P87228 Putative D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
30% identity, 87% coverage: 19:289/310 of query aligns to 69:352/466 of P87228

query
sites
P87228
L
 
L
E
 
S
P
 
N
L
 
L
R
 
K
Q
 
D
A
 
E
G
 
G
F
 
Y
E
 
Q
L
 
V
V
 
E
F
 
F
P
 
L
T
 
K
P
 
T
G
 
S
R
 
M
M
 
-
P
 
-
S
|
S
E
 
E
A
 
D
E
 
D
L
 
L
I
 
V
G
 
E
L
 
K
V
 
I
P
 
K
G
 
G
C
 
V
-
 
H
-
 
A
I
 
I
G
 
G
W
 
I
L
 
R
A
 
S
G
 
K
V
 
T
E
 
R
P
 
-
V
 
L
S
 
T
D
 
R
K
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
D
S
 
S
L
 
L
R
 
I
A
 
V
I
 
I
S
 
G
R
 
C
N
 
F
G
 
C
T
 
I
G
 
G
I
 
T
D
 
N
N
 
Q
L
 
V
P
 
D
L
 
L
P
 
D
L
 
F
L
 
A
K
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
A
I
 
V
L
 
F
K
 
N
A
 
S
E
 
P
G
 
Y
A
 
A
N
 
N
A
 
S
V
 
R
G
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
Y
M
 
I
L
 
I
A
 
S
A
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
V
P
 
G
A
 
D
E
 
R
T
 
S
A
 
L
G
 
E
I
 
L
R
 
H
A
 
R
G
 
G
G
 
E
W
 
W
P
 
N
R
 
K
-
 
V
-
 
S
S
 
S
R
 
G
G
 
C
R
 
W
E
 
E
I
 
I
A
 
R
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
C
 
Y
G
 
G
A
 
H
I
 
I
G
 
G
K
 
S
R
 
Q
V
 
L
A
 
S
R
 
V
A
 
L
V
 
A
S
 
E
A
 
A
M
 
M
R
 
G
A
 
L
S
 
H
V
 
V
I
 
V
A
 
Y
C
 
Y
D
 
D
P
 
I
F
 
L
R
 
-
P
 
P
N
 
I
V
 
M
E
 
P
V
 
L
Y
 
G
G
 
S
P
 
A
F
 
K
K
 
Q
W
 
L
A
 
S
S
 
S
L
 
L
D
 
P
E
 
E
V
 
L
F
 
L
A
 
H
G
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
F
V
 
V
S
 
S
L
 
L
H
 
H
C
 
V
P
 
P
A
 
A
P
x
S
A
 
P
D
 
E
G
 
T
K
 
K
P
 
N
I
 
M
V
 
I
D
 
S
A
 
S
P
 
K
R
 
E
L
 
F
A
 
A
T
 
A
V
 
M
P
 
K
P
 
E
H
 
G
A
 
S
I
 
Y
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
A
A
 
S
R
 
R
A
 
G
T
 
T
L
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
I
D
 
P
A
 
A
V
 
L
R
 
V
A
 
D
A
 
A
L
 
S
D
 
K
E
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
I
Q
 
A
A
 
G
Y
 
A
A
 
A
T
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
T
 
P
T
 
S
E
 
E
P
 
P
P
 
A
A
 
G
P
 
N
G
 
G
S
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
S
-
 
E
L
 
L
A
 
T
S
 
H
H
 
C
P
 
K
R
 
N
V
 
I
I
 
I
A
 
L
T
 
T
S
 
P
H
 
H
I
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
S
T
 
T
D
 
E
E
 
E
S
 
A

4e5mA Thermostable phosphite dehydrogenase e175a/a176r in complex with NADP (see paper)
33% identity, 81% coverage: 58:308/310 of query aligns to 55:319/329 of 4e5mA

query
sites
4e5mA
E
 
D
P
 
R
V
 
V
S
 
D
D
 
A
K
 
D
V
 
F
I
 
L
A
 
Q
A
 
A
A
 
C
D
 
P
S
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
V
I
 
I
S
 
G
R
 
C
N
 
A
G
 
L
T
x
K
G
 
G
I
 
F
D
 
D
N
 
N
L
 
F
P
 
D
L
 
V
P
 
D
L
 
A
L
 
C
K
 
T
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
G
 
W
I
 
L
L
 
T
K
 
F
A
 
V
E
 
P
G
 
D
A
 
L
N
x
L
A
 
T
V
 
V
G
 
P
V
x
T
A
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
A
L
 
V
A
 
G
A
 
L
L
 
G
R
 
R
H
 
H
I
 
L
P
 
R
A
 
A
E
 
A
T
 
D
A
 
A
G
 
F
I
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
-
 
Q
-
 
F
-
 
R
G
 
G
W
 
W
-
 
Q
P
 
P
R
 
R
S
 
F
R
 
Y
G
 
G
R
 
T
E
 
G
I
 
L
A
 
D
E
 
N
R
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
L
G
 
G
C
 
M
G
|
G
A
|
A
I
|
I
G
 
G
K
 
L
R
 
A
V
 
M
A
 
A
R
 
D
A
 
R
V
 
L
S
 
Q
A
 
G
M
 
W
R
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
L
I
 
Q
-
 
Y
-
 
H
A
 
A
C
x
R
D
 
K
P
 
A
F
 
L
R
 
D
P
 
T
N
 
Q
V
 
T
E
 
E
V
 
Q
Y
 
R
G
 
L
P
 
G
F
 
L
K
 
R
W
 
Q
A
 
V
S
 
A
L
 
C
D
 
S
E
 
E
V
 
L
F
 
F
A
 
A
G
 
S
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
L
L
 
L
H
 
A
C
x
L
P
|
P
A
 
L
P
 
N
A
 
A
D
 
D
G
x
T
K
 
L
P
 
H
I
 
L
V
 
V
D
 
N
A
 
A
P
 
E
R
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
L
V
 
V
P
 
R
P
 
P
H
 
G
A
 
A
I
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
N
T
x
P
A
x
C
R
|
R
A
 
G
T
 
S
L
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
E
E
 
R
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
Q
 
G
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
T
 
A
D
|
D
V
 
V
F
 
F
T
 
E
T
 
M
E
|
E
P
 
D
P
 
W
A
 
A
P
 
R
G
 
A
-
 
D
-
 
R
-
 
P
-
 
Q
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
P
S
 
A
L
 
L
A
 
L
S
 
A
H
 
H
P
 
P
R
 
N
V
 
T
I
 
L
A
 
F
T
 
T
S
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
G
 
S
L
 
A
T
 
V
D
 
R
E
 
A
S
 
V
V
 
R
G
 
L
K
 
E
A
 
I
T
 
E
K
 
R
I
 
C
A
 
A
V
 
A
A
 
Q
N
 
N
L
 
I
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
V
 
A
E
 
G
E
 
E

Query Sequence

>WP_012066689.1 NCBI__GCF_000017145.1:WP_012066689.1
MKRILVTPRSLSLDPPPELEPLRQAGFELVFPTPGRMPSEAELIGLVPGCIGWLAGVEPV
SDKVIAAADSLRAISRNGTGIDNLPLPLLKERGIGILKAEGANAVGVAELSVGLMLAALR
HIPAETAGIRAGGWPRSRGREIAERTVGIIGCGAIGKRVARAVSAMRASVIACDPFRPNV
EVYGPFKWASLDEVFAGADIVSLHCPAPADGKPIVDAPRLATVPPHAILINTARATLVDE
DAVRAALDEGRLQAYATDVFTTEPPAPGSLASHPRVIATSHIGGLTDESVGKATKIAVAN
LLSALVEETA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory