SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012101872.1 NCBI__GCF_000016505.1:WP_012101872.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 9 hits to proteins with known functional sites (download)

P54968 IAA-amino acid hydrolase ILR1; EC 3.5.1.- from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
39% identity, 95% coverage: 19:389/390 of query aligns to 55:427/442 of P54968

query
sites
P54968
I
 
I
R
 
R
R
 
R
D
 
K
L
 
I
H
 
H
R
 
E
H
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
T
G
 
G
Y
 
F
E
 
Q
E
|
E
E
 
F
R
 
K
T
 
T
S
 
S
F
 
Q
K
 
L
I
 
V
K
 
R
E
 
D
F
 
E
L
 
L
K
 
D
K
 
S
I
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
K
Y
 
Y
-
 
K
M
 
Y
E
 
P
T
 
V
A
 
A
G
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
V
C
 
V
G
 
A
I
 
W
I
 
I
R
 
G
G
 
S
K
 
C
G
 
S
N
 
K
K
 
P
T
 
V
I
 
F
G
 
G
I
 
L
R
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
E
 
Q
D
 
E
H
 
L
K
 
V
N
 
E
C
 
W
S
 
E
Y
 
S
S
 
K
S
 
S
K
 
K
V
 
V
K
 
D
G
 
G
K
 
K
M
 
M
H
 
H
A
 
A
C
 
C
G
|
G
H
 
H
D
 
D
A
 
T
H
 
H
T
 
V
T
 
A
I
 
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
L
L
 
L
N
 
Q
S
 
T
V
 
T
K
 
K
D
 
H
E
 
L
L
 
I
K
 
K
G
 
G
T
 
T
V
 
V
K
 
K
L
 
L
F
 
V
F
 
F
E
 
Q
P
 
P
A
 
G
E
 
E
E
 
E
T
 
G
T
 
Y
G
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
Y
L
 
E
M
 
M
V
 
L
K
 
K
E
 
D
G
 
E
A
 
I
L
 
L
E
 
D
N
 
D
P
 
-
R
 
-
V
 
L
D
 
D
R
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
S
L
 
V
H
 
H
V
 
V
D
 
F
E
 
P
N
 
S
I
 
I
E
 
P
V
 
S
G
 
G
N
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
S
K
 
R
L
 
P
G
 
G
V
 
T
V
 
V
N
 
L
A
 
A
A
 
G
S
 
A
N
 
G
P
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
V
K
 
T
I
 
V
K
 
H
G
 
G
V
 
Q
G
 
G
A
 
S
H
 
H
G
 
A
A
 
A
R
 
T
P
 
P
H
 
H
M
 
F
G
 
S
V
 
K
D
 
D
P
 
P
I
 
V
V
 
L
I
 
A
S
 
A
S
 
S
H
 
S
V
 
A
I
 
V
L
 
V
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
L
P
 
D
P
 
P
T
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
T
 
T
V
 
V
G
 
G
S
 
Y
I
 
I
H
 
E
G
 
G
G
 
G
T
 
H
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
Q
E
 
S
V
 
A
V
 
K
I
 
F
A
 
G
G
 
G
T
 
T
M
 
F
R
 
R
T
 
S
M
 
L
R
 
S
T
 
N
E
 
D
H
 
G
R
 
L
E
 
L
Y
 
F
V
 
I
K
 
Q
E
 
R
R
 
R
L
 
I
R
 
K
E
 
E
I
 
I
T
 
S
F
 
E
G
 
A
V
 
Q
V
 
A
N
 
S
S
 
V
M
 
Y
R
 
R
G
 
C
K
 
K
Y
 
A
E
 
E
I
 
V
D
 
N
I
 
F
E
 
E
E
 
E
S
 
K
Y
 
K
P
 
P
C
 
S
L
 
L
Y
 
H
-
 
P
-
 
V
-
 
M
-
 
N
N
 
N
D
 
D
D
 
E
D
 
G
V
 
L
I
 
Y
K
 
E
D
 
H
I
 
G
L
 
K
K
 
K
A
 
V
A
 
A
Y
 
E
K
 
A
E
 
M
I
 
I
G
 
G
E
 
K
E
 
N
H
 
N
V
 
F
K
 
H
M
 
D
L
 
F
E
 
P
S
 
V
P
 
-
S
 
T
M
 
M
G
 
G
V
 
G
E
 
E
S
 
D
F
 
F
A
 
S
Y
 
F
F
 
F
S
 
T
M
 
Q
E
 
K
R
 
T
P
 
K
S
 
A
A
 
A
F
 
I
Y
 
F
Y
 
V
L
 
L
G
 
G
C
 
V
R
 
K
N
 
N
E
 
E
S
 
T
K
 
L
N
 
G
I
 
A
I
 
G
Y
 
K
P
 
P
A
 
L
H
 
H
G
 
S
S
 
P
L
 
Y
F
 
F
D
 
F
I
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
E
C
 
A
L
 
L
P
 
P
I
 
V
G
|
G
V
 
A
S
 
A
I
 
L
Q
 
H
C
 
A
R
 
A
A
 
M
A
 
A
Y
 
V
D
 
S
F
 
Y
L
 
L

O04373 IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 4; jasmonoyl-L-amino acid hydrolase; EC 3.5.1.-; EC 3.5.1.127 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
38% identity, 99% coverage: 4:389/390 of query aligns to 43:423/440 of O04373

query
sites
O04373
D
 
D
F
 
F
F
 
F
N
 
D
M
 
W
A
 
-
Q
 
-
S
 
-
I
 
-
K
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
M
I
 
V
D
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
R
D
 
R
L
 
I
H
 
H
R
 
E
H
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
E
 
E
E
 
V
R
 
E
T
 
T
S
 
S
F
 
K
K
 
L
I
 
V
K
 
R
E
 
A
F
 
E
L
 
L
K
 
E
K
 
K
I
 
M
G
 
G
I
 
V
E
 
S
Y
 
Y
-
 
K
M
 
Y
E
 
P
T
 
V
A
 
A
G
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
V
C
 
V
G
 
G
I
 
Y
I
 
V
R
 
G
G
 
T
K
 
G
G
 
H
N
 
A
K
 
P
T
 
F
I
 
V
G
 
A
I
 
L
R
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
A
L
 
M
E
 
Q
D
 
E
H
 
M
K
 
V
N
 
E
C
 
W
S
 
E
Y
 
H
S
 
K
S
 
S
K
 
K
V
 
V
K
 
P
G
 
G
K
 
K
M
 
M
H
 
H
A
 
A
C
 
C
G
 
G
H
 
H
D
 
D
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
T
I
 
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
L
L
 
L
N
 
K
S
 
E
V
 
H
K
 
E
D
 
E
E
 
E
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
T
 
T
V
 
V
K
 
V
L
 
L
F
 
V
F
 
F
E
 
Q
P
 
P
A
 
A
E
 
E
E
 
E
T
 
G
T
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
K
M
 
I
V
 
V
K
 
E
E
 
A
G
 
G
A
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
P
 
-
R
 
-
V
 
V
D
 
S
R
 
A
V
 
I
I
 
F
G
 
G
L
 
L
H
 
H
V
 
V
D
 
T
E
 
N
N
 
Q
I
 
L
E
 
A
V
 
L
G
 
G
N
 
Q
I
 
V
G
 
S
V
x
S
K
 
R
L
 
E
G
 
G
V
 
P
V
 
M
N
 
L
A
 
A
A
 
G
S
 
S
N
 
G
P
 
F
F
 
F
T
 
K
I
 
A
K
 
K
I
 
I
K
 
S
G
|
G
V
 
K
G
|
G
A
 
G
H
 
H
G
 
A
A
|
A
R
 
L
P
 
P
H
 
Q
M
 
H
G
 
T
V
 
I
D
 
D
P
 
P
I
 
I
V
 
L
I
 
A
S
 
A
S
 
S
H
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
V
A
 
S
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
H
I
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
A
P
 
D
P
 
P
T
 
L
D
 
D
A
 
S
A
 
Q
V
 
V
I
 
V
T
 
T
V
 
V
G
 
A
S
 
K
I
 
F
H
 
E
G
 
G
G
 
G
T
 
G
A
 
A
Q
 
F
N
 
N
I
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
D
E
 
S
V
 
V
V
 
T
I
 
I
A
 
G
G
 
G
T
 
T
M
 
F
R
 
R
T
 
A
M
 
F
R
 
S
T
 
T
E
 
K
H
 
S
R
 
F
E
 
M
Y
 
Q
V
 
L
K
 
K
E
 
K
R
 
R
L
 
I
R
 
E
E
 
Q
I
 
V
T
 
I
F
 
T
-
 
R
-
 
Q
G
 
A
V
 
S
V
 
V
N
 
N
S
 
M
M
 
C
R
 
N
G
 
A
K
 
T
Y
 
V
E
 
D
I
 
F
D
 
I
I
 
E
E
 
E
E
 
E
S
 
K
-
 
P
-
 
F
Y
 
F
P
 
P
C
 
P
L
 
T
Y
 
V
N
 
N
D
 
D
D
 
K
D
 
A
V
 
L
I
 
H
K
 
Q
D
 
F
I
 
F
L
 
K
K
 
N
A
 
V
A
 
S
Y
 
G
K
 
D
E
 
M
I
 
L
G
 
G
-
 
I
E
 
E
E
 
N
H
 
Y
V
 
V
K
 
E
M
 
M
L
 
-
E
 
-
S
 
Q
P
 
P
S
 
L
M
 
M
G
 
G
V
 
S
E
 
E
S
 
D
F
 
F
A
 
S
Y
 
F
F
 
Y
S
 
Q
M
 
Q
E
 
A
R
 
I
P
 
P
S
 
G
A
 
H
F
 
F
Y
 
S
Y
 
F
L
 
V
G
 
G
C
 
M
R
 
Q
N
 
N
E
 
K
S
 
A
K
 
R
N
 
S
I
 
P
I
 
M
Y
 
A
P
 
S
A
 
P
H
 
H
G
 
S
S
 
P
L
 
Y
F
 
F
D
 
E
I
 
V
D
 
N
E
 
E
D
 
E
C
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
Y
G
 
G
V
 
A
S
 
S
I
 
L
Q
 
H
C
 
A
R
 
S
A
 
M
A
 
A
Y
 
T
D
 
R
F
 
Y
L
 
L

P54955 N-acetylcysteine deacetylase; S-(2-succino)cysteine metabolism operon protein P; EC 3.5.1.- from Bacillus subtilis (strain 168)
37% identity, 94% coverage: 10:377/390 of query aligns to 4:364/380 of P54955

query
sites
P54955
Q
 
K
S
 
A
I
 
F
K
 
H
K
 
T
E
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
N
I
 
M
R
 
R
R
 
R
D
 
D
L
 
L
H
 
H
R
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
L
G
 
S
Y
 
F
E
 
Q
E
 
E
E
 
V
R
 
E
T
 
T
S
 
T
F
 
K
K
 
K
I
 
I
K
 
R
E
 
R
F
 
W
L
 
L
K
 
E
K
 
E
I
 
E
G
 
Q
I
 
I
E
 
E
Y
 
I
M
 
L
E
 
D
T
 
V
A
 
P
G
 
Q
-
 
L
-
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
V
C
 
I
G
 
A
I
 
E
I
 
I
R
 
K
G
 
G
K
 
R
G
 
E
N
 
D
-
 
G
K
 
P
T
 
V
I
 
I
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
I
E
 
Q
D
 
E
H
 
Q
K
 
T
N
 
N
C
 
L
S
 
P
Y
 
F
S
 
A
S
 
S
K
 
K
V
 
V
K
 
D
G
 
G
K
 
T
M
 
M
H
 
H
A
 
A
C
|
C
G
 
G
H
|
H
D
 
D
A
 
F
H
 
H
T
 
T
T
 
A
I
 
S
L
 
I
L
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
K
 
M
V
 
L
L
 
L
N
 
N
S
 
Q
V
 
R
K
 
R
D
 
A
E
 
E
L
 
L
K
 
K
G
 
G
T
 
T
V
 
V
K
 
R
L
 
F
F
 
I
F
 
F
E
 
Q
P
 
P
A
 
A
E
 
E
E
|
E
T
 
I
T
 
A
G
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
K
M
 
V
V
 
L
K
 
E
E
 
A
G
 
G
A
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
G
P
 
-
R
 
-
V
 
V
D
 
S
R
 
A
V
 
I
I
 
F
G
 
G
L
 
M
H
|
H
V
 
N
D
 
K
E
 
P
N
 
D
I
 
L
E
 
P
V
 
V
G
 
G
N
 
T
I
 
I
G
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
E
G
 
G
V
 
P
V
 
L
N
 
M
A
 
A
A
 
S
S
 
V
N
 
D
P
 
R
F
 
F
T
 
E
I
 
I
K
 
V
I
 
I
K
 
K
G
 
G
V
 
K
G
 
G
A
 
G
H
 
H
G
 
A
A
 
G
R
 
I
P
 
P
H
 
N
M
 
N
G
 
S
V
 
I
D
 
D
P
 
P
I
 
I
V
 
A
I
 
A
S
 
A
S
 
G
H
 
Q
V
 
I
I
 
I
L
 
S
A
 
G
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
S
I
 
V
V
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
N
L
 
I
P
 
S
P
 
S
T
 
L
D
 
Q
A
 
N
A
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
S
V
 
I
G
 
T
S
 
R
I
 
V
H
 
Q
G
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
S
Q
 
W
N
 
N
I
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
D
E
 
Q
V
 
A
V
 
E
I
 
M
A
 
E
G
 
G
T
 
T
M
 
V
R
 
R
T
 
T
M
 
F
R
 
Q
T
 
K
E
 
E
H
 
A
R
 
R
E
 
Q
Y
 
A
V
 
V
K
 
P
E
 
E
R
 
H
L
 
M
R
 
R
E
 
R
I
 
V
T
 
A
F
 
E
G
 
G
V
 
I
V
 
A
N
 
A
S
 
G
M
 
Y
R
 
G
G
 
A
K
 
Q
Y
 
A
E
 
E
I
 
F
D
 
K
I
 
W
E
 
F
E
 
P
S
 
Y
Y
 
L
P
 
P
C
 
S
L
 
V
Y
 
Q
N
 
N
D
 
D
D
 
G
D
 
T
V
 
F
I
 
L
K
 
N
D
 
A
I
 
A
L
 
S
K
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
A
K
 
R
E
 
-
I
 
L
G
 
G
E
 
Y
E
 
Q
H
 
T
V
 
V
K
 
H
M
 
A
L
 
E
E
 
Q
S
 
S
P
 
P
S
 
-
M
 
-
G
 
G
V
 
G
E
 
E
S
 
D
F
 
F
A
 
A
Y
 
L
F
 
Y
S
 
Q
M
 
E
E
 
K
R
 
I
P
 
P
S
 
G
A
 
F
F
 
F
Y
 
V
Y
 
W
L
 
M
G
 
G
C
 
T
R
 
-
N
 
N
E
 
G
S
 
T
K
 
E
N
 
E
I
 
W
I
x
H
Y
 
H
P
 
P
A
 
A
H
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
F
 
F
D
 
T
I
 
L
D
 
D
E
 
E
D
 
E
C
 
A
L
 
L
P
 
T
I
 
V
G
 
A

4ewtA The crystal structure of a putative aminohydrolase from methicillin resistant staphylococcus aureus (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:390/390 of query aligns to 1:389/389 of 4ewtA

query
sites
4ewtA
M
 
M
A
 
N
R
 
Q
D
 
Q
F
 
L
F
 
I
N
 
E
M
 
T
A
 
L
Q
 
K
S
 
S
I
 
K
K
 
E
K
 
G
E
 
K
L
 
M
I
 
I
D
 
E
I
 
I
R
 
R
R
 
R
D
 
Y
L
 
L
H
 
H
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
L
G
 
S
Y
 
F
E
 
H
E
 
E
E
 
D
R
 
E
T
 
T
S
 
A
F
 
K
K
 
Y
I
 
I
K
 
A
E
 
E
F
 
F
L
 
Y
K
 
K
K
 
G
I
 
K
G
 
D
I
 
V
E
 
E
Y
 
V
M
 
E
E
 
T
T
 
N
A
 
V
G
 
G
T
 
P
-
 
R
G
 
G
V
 
I
-
 
K
C
 
V
G
 
T
I
 
I
I
 
D
R
 
S
G
 
G
K
 
K
G
 
P
N
 
G
K
 
K
T
 
T
I
 
L
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
I
E
 
T
D
 
E
H
 
D
K
 
T
N
 
G
C
 
L
S
 
S
Y
 
F
S
 
A
S
 
S
K
 
Q
V
 
N
K
 
K
G
 
G
K
 
V
M
 
M
H
 
H
A
 
A
C
|
C
G
 
G
H
|
H
D
 
D
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
A
I
 
Y
L
 
M
L
 
L
G
 
V
T
 
L
A
 
A
K
 
E
V
 
T
L
 
L
N
 
A
S
 
E
V
 
M
K
 
K
D
 
D
E
 
S
L
 
F
K
 
T
G
 
G
T
 
K
V
 
V
K
 
V
L
 
V
F
 
I
F
 
H
E
 
Q
P
 
P
A
 
A
E
 
E
E
|
E
T
 
V
T
 
P
-
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
T
M
 
M
V
 
I
K
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
V
L
 
L
E
 
D
N
 
G
P
 
-
R
 
-
V
 
V
D
 
D
R
 
H
V
 
V
I
 
L
G
 
G
L
 
V
H
|
H
V
 
V
D
 
M
E
 
S
N
 
T
I
 
M
E
 
K
V
 
T
G
 
G
N
 
K
I
 
V
G
 
Y
V
 
Y
K
 
R
L
 
P
G
 
G
V
 
Y
V
 
V
N
 
Q
A
 
T
A
 
G
S
 
R
N
 
A
P
 
F
F
 
F
T
 
K
I
 
L
K
 
K
I
 
V
K
 
Q
G
 
G
V
 
K
G
 
G
A
 
G
H
 
H
G
 
G
A
 
S
R
 
S
P
 
P
H
 
H
M
 
M
G
 
A
V
 
N
D
 
D
P
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
A
S
 
G
S
 
S
H
 
Y
V
 
F
I
 
V
L
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
T
I
 
V
V
 
V
S
 
S
R
 
R
E
x
R
L
 
L
P
 
S
P
 
P
T
 
F
D
 
E
A
 
T
A
 
G
V
 
V
I
 
V
T
 
T
V
 
I
G
 
G
S
 
S
I
 
F
H
 
D
G
 
G
G
 
K
T
 
G
A
 
Q
Q
 
F
N
 
N
I
 
V
I
 
I
P
 
K
E
 
D
E
 
V
V
 
V
V
 
E
I
 
I
A
 
E
G
 
G
T
 
D
M
 
V
R
 
R
T
 
G
M
 
L
R
 
T
T
 
D
E
 
A
H
 
T
R
 
K
E
 
A
Y
 
T
V
 
I
K
 
E
E
 
K
R
 
E
L
 
I
R
 
K
E
x
R
I
 
L
T
 
S
F
 
K
G
 
G
V
 
L
V
 
E
N
 
D
S
 
M
M
 
Y
R
 
G
G
 
V
K
 
T
Y
 
C
E
 
T
I
 
L
D
 
E
I
 
Y
E
 
N
E
 
D
S
 
D
Y
 
Y
P
 
P
C
 
A
L
 
L
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
D
 
P
D
 
E
V
 
F
-
 
T
-
 
E
-
 
Y
I
 
V
K
 
A
D
 
K
I
 
T
L
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
A
Y
 
N
K
 
L
E
 
D
I
 
F
G
 
G
E
 
-
E
 
-
H
 
-
V
 
V
K
 
E
M
 
M
L
 
C
E
 
E
S
 
-
P
 
P
S
 
Q
M
 
P
G
 
P
V
 
S
E
 
E
S
 
D
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
F
 
Y
S
 
A
M
 
K
E
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
S
A
 
A
F
 
F
Y
 
I
Y
 
Y
L
 
T
G
 
G
C
 
A
R
 
A
N
 
V
E
 
E
S
 
N
K
 
G
N
 
E
I
 
-
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
A
 
H
H
|
H
G
 
H
S
 
P
L
 
K
F
 
F
D
 
N
I
 
I
D
 
S
E
 
E
D
 
K
C
 
S
L
 
L
P
 
L
I
 
I
G
 
S
V
 
A
S
 
E
I
 
A
Q
 
V
C
 
G
R
 
T
A
 
V
A
 
V
Y
 
L
D
 
D
F
 
Y
L
 
L
K
 
K

6slfA Nalpha-acylglutamine aminoacylase from corynebacterium sp.Releasing human axilla odorants co-crystallised with high affinity inhibitor (see paper)
35% identity, 86% coverage: 10:346/390 of query aligns to 13:348/398 of 6slfA

query
sites
6slfA
Q
 
E
S
 
S
I
 
S
K
 
R
K
 
A
E
 
E
L
 
R
I
 
E
D
 
E
I
 
L
R
 
Y
R
 
K
D
 
W
L
 
F
H
 
H
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
M
G
 
S
Y
 
M
E
 
Q
E
 
E
E
 
H
R
 
E
T
 
T
S
 
S
F
 
K
K
 
R
I
 
I
K
 
A
E
 
E
F
 
E
L
 
L
K
 
E
K
 
K
I
 
L
G
 
G
I
 
L
E
 
E
Y
 
P
M
 
Q
E
 
N
T
 
I
A
 
G
G
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
C
 
V
G
 
A
I
 
V
I
 
I
R
 
K
G
 
N
K
 
G
G
 
E
N
 
G
K
 
P
T
 
S
I
 
V
G
 
A
I
 
F
R
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
I
E
 
T
D
 
E
H
 
N
K
 
T
N
 
G
C
 
L
S
 
D
Y
 
Y
S
 
S
S
 
A
K
 
D
V
 
P
K
 
E
-
 
L
G
 
G
K
 
M
M
 
M
H
 
H
A
 
A
C
|
C
G
 
G
H
|
H
D
 
D
A
 
L
H
 
H
T
 
T
T
 
T
I
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
V
K
 
R
V
 
A
L
 
L
N
 
V
S
 
E
V
 
N
K
 
K
D
 
D
E
 
L
L
 
W
K
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
F
K
 
I
L
 
A
F
 
V
F
 
H
E
 
Q
P
 
P
A
 
G
E
|
E
E
|
E
T
 
G
T
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
H
M
 
M
V
 
V
K
 
D
E
 
D
G
 
G
A
 
L
L
 
A
E
 
E
N
 
K
-
 
I
P
 
A
R
 
A
V
 
P
D
 
D
R
 
V
V
 
C
I
 
F
G
 
A
L
 
Q
H
|
H
V
 
V
-
 
F
D
 
N
E
 
E
N
 
D
I
 
P
E
 
A
V
 
F
G
 
G
N
 
Y
I
 
V
G
 
F
V
 
T
K
 
P
L
 
G
G
 
R
V
 
F
V
 
L
N
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
S
N
 
N
P
 
-
F
 
W
T
 
R
I
 
I
K
 
H
I
 
I
K
 
H
G
 
G
V
 
E
G
 
G
A
 
G
H
|
H
G
 
G
A
x
S
R
|
R
P
 
P
H
 
H
M
 
L
G
 
T
V
 
K
D
 
D
P
 
P
I
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
A
S
 
A
H
 
S
V
 
I
I
 
I
L
 
T
A
 
K
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
T
I
 
I
V
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
V
P
 
D
P
 
P
T
 
N
D
 
E
A
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
V
 
V
G
 
G
S
 
S
I
 
I
H
 
E
G
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
S
Q
 
T
N
|
N
I
 
S
I
 
I
P
 
P
E
 
Y
E
 
T
V
 
V
V
 
T
I
 
L
A
 
G
G
 
V
T
 
N
M
 
T
R
|
R
T
 
A
M
 
S
R
 
N
T
 
D
E
 
E
H
 
L
R
 
S
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
K
 
Q
E
 
N
R
 
A
L
 
I
R
 
K
E
 
R
I
 
I
T
 
V
F
 
I
G
 
A
V
 
E
V
 
C
N
 
Q
S
 
A
M
 
A
R
 
G
G
 
I
K
 
E
Y
 
Q
E
 
E
I
 
P
D
 
E
I
 
F
E
 
E
-
 
Y
-
 
L
E
 
D
S
 
S
Y
 
V
P
 
P
C
 
A
L
 
V
Y
 
I
N
 
N
D
 
D
D
 
E
D
 
D
V
 
L
I
 
T
K
 
E
D
 
Q
I
 
L
L
 
M
K
 
-
A
 
A
A
 
Q
Y
 
F
K
 
R
E
 
E
I
 
F
G
 
F
E
 
G
E
 
E
H
 
D
V
 
Q
K
 
A
M
 
V
L
 
E
E
 
I
S
 
P
P
 
P
S
 
L
M
 
S
G
|
G
V
x
S
E
 
E
S
 
D
F
 
Y
A
 
P
Y
 
F
F
 
I
S
 
-
M
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
P
S
 
N
A
 
A
F
 
W

Sites not aligning to the query:

5vo3A Crystal structure of dape in complex with the products (succinic acid and diaminopimelic acid) (see paper)
23% identity, 79% coverage: 9:318/390 of query aligns to 2:318/380 of 5vo3A

query
sites
5vo3A
A
 
S
Q
 
N
S
 
A
I
 
M
K
 
K
K
 
E
E
 
K
L
 
V
I
 
V
D
 
S
I
 
L
R
 
A
R
 
Q
D
 
D
L
 
L
H
 
I
R
 
R
H
 
R
P
 
P
E
 
S
L
 
I
G
 
S
Y
 
P
E
 
N
E
 
D
E
 
E
R
 
G
T
 
C
S
 
Q
F
 
Q
K
 
I
I
 
I
K
 
A
E
 
E
F
 
R
L
 
L
K
 
E
K
 
K
I
 
L
G
 
G
-
 
F
-
 
Q
I
 
I
E
 
E
Y
 
W
M
 
M
E
 
P
T
 
F
A
 
N
G
 
D
T
 
T
G
 
L
V
 
N
C
 
L
G
 
W
I
 
A
I
 
K
R
 
H
G
 
G
K
 
T
G
 
S
N
 
E
K
 
P
T
 
V
I
 
I
G
 
A
I
 
F
R
 
A
A
 
G
D
x
H
I
 
T
D
 
D
A
 
V
L
 
V
P
 
P
L
 
T
E
 
G
D
 
D
H
 
E
K
 
N
N
 
Q
C
 
W
S
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
P
Y
 
F
S
 
S
S
 
A
K
 
E
V
 
I
K
 
I
G
 
D
K
 
G
M
 
M
-
 
L
-
 
Y
-
 
G
-
 
R
H
 
G
A
 
A
C
 
A
G
x
D
H
 
M
D
 
K
A
 
G
H
 
S
T
 
L
T
 
A
I
 
A
L
 
M
L
 
I
G
 
V
T
 
A
A
 
A
K
 
E
V
 
E
L
 
Y
N
 
V
S
 
K
V
 
A
K
 
N
D
 
P
E
 
N
L
 
H
K
 
K
G
 
G
T
 
T
V
 
I
K
 
A
L
 
L
F
 
L
F
 
I
E
 
T
P
 
S
A
 
D
E
|
E
E
|
E
T
x
A
T
 
T
G
 
A
-
 
K
G
 
D
A
 
G
K
 
T
L
 
I
M
 
H
V
 
V
K
 
V
E
 
E
G
 
T
A
 
L
L
 
M
E
 
A
N
 
-
P
 
-
R
 
R
V
 
D
D
 
E
R
 
K
V
 
I
I
 
T
G
 
Y
L
 
C
H
 
M
V
 
V
D
 
G
E
|
E
N
 
P
I
 
S
E
 
S
V
 
A
G
 
K
N
 
N
I
 
L
G
 
G
V
 
D
K
 
V
L
 
V
G
 
K
V
 
N
V
 
G
N
x
R
A
 
R
A
 
G
S
|
S
N
 
I
P
 
T
F
 
G
T
 
N
I
 
L
K
 
Y
I
 
I
K
 
Q
G
 
G
V
 
I
G
 
Q
A
 
G
H
 
H
G
 
V
A
 
A
R
 
Y
P
 
P
H
 
H
M
 
L
G
 
A
V
 
E
D
 
N
P
 
P
I
 
I
V
 
-
I
 
-
S
 
-
S
 
H
H
 
K
V
 
A
I
 
A
L
 
L
A
 
F
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
I
 
L
V
 
T
S
 
T
R
 
Y
E
 
Q
-
 
W
-
 
D
-
 
K
-
 
G
-
 
N
-
 
E
-
 
F
L
 
F
P
 
P
P
 
P
T
 
T
D
 
S
A
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
L
T
 
Q
V
 
I
G
 
A
S
 
N
I
 
I
H
 
H
G
 
A
G
 
G
T
 
T
-
 
G
A
 
S
Q
 
N
N
 
N
I
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
A
E
 
E
V
 
L
V
 
Y
I
 
I
A
 
Q
G
 
F
T
 
N
M
 
L
R
|
R
T
 
Y
M
 
C
R
 
T
T
 
E
E
 
V
H
 
T
R
 
D
E
 
E
Y
 
I
V
 
I
K
 
K
E
 
Q
R
 
K
L
 
V
R
 
A
E
 
E
I
 
M
T
 
-
F
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
L
N
 
E
S
 
K
M
 
H
R
 
N
G
 
L
K
 
K
Y
 
Y
E
 
R
I
 
I
D
 
E
I
 
W
E
 
N
E
 
L
S
|
S
-
 
G
Y
 
K
P
 
P
C
 
F
L
 
L
Y
 
T
N
 
K
D
 
P
D
 
G
D
 
K
V
 
L
I
 
L
K
 
D
D
 
S
I
 
I
L
 
T
K
 
S
A
 
A
A
 
I
Y
 
E
K
 
E
E
 
T
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P44514 Succinyl-diaminopimelate desuccinylase; SDAP desuccinylase; N-succinyl-LL-2,6-diaminoheptanedioate amidohydrolase; EC 3.5.1.18 from Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) (see 3 papers)
24% identity, 79% coverage: 12:318/390 of query aligns to 1:314/377 of P44514

query
sites
P44514
I
 
M
K
 
K
K
 
E
E
 
K
L
 
V
I
 
V
D
 
S
I
 
L
R
 
A
R
 
Q
D
 
D
L
 
L
H
 
I
R
 
R
H
 
R
P
 
P
E
 
S
L
 
I
G
 
S
Y
 
P
E
 
N
E
 
D
E
 
E
R
 
G
T
 
C
S
 
Q
F
 
Q
K
 
I
I
 
I
K
 
A
E
 
E
F
 
R
L
 
L
K
 
E
K
 
K
I
 
L
G
 
G
-
 
F
-
 
Q
I
 
I
E
 
E
Y
 
W
M
 
M
E
 
P
T
 
F
A
 
N
G
 
D
T
 
T
G
 
L
V
 
N
C
 
L
G
 
W
I
 
A
I
 
K
R
 
H
G
 
G
K
 
T
G
 
S
N
 
E
K
 
P
T
 
V
I
 
I
G
 
A
I
 
F
R
 
A
A
 
G
D
x
H
I
 
T
D
 
D
A
 
V
L
 
V
P
 
P
L
 
T
E
 
G
D
 
D
H
 
E
K
 
N
N
 
Q
C
 
W
S
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
P
Y
 
F
S
 
S
S
 
A
K
 
E
V
 
I
K
 
I
G
 
D
K
 
G
M
 
M
-
 
L
-
 
Y
-
 
G
-
 
R
H
 
G
A
 
A
C
 
A
G
x
D
H
 
M
D
 
K
A
 
G
H
 
S
T
 
L
T
 
A
I
 
A
L
 
M
L
 
I
G
 
V
T
 
A
A
 
A
K
 
E
V
 
E
L
 
Y
N
 
V
S
 
K
V
 
A
K
 
N
D
 
P
E
 
N
L
 
H
K
 
K
G
 
G
T
 
T
V
 
I
K
 
A
L
 
L
F
 
L
F
 
I
E
 
T
P
 
S
A
 
D
E
|
E
E
|
E
T
 
A
T
 
T
G
 
A
-
 
K
G
 
D
A
 
G
K
 
T
L
 
I
M
 
H
V
 
V
K
 
V
E
 
E
G
 
T
A
 
L
L
 
M
E
 
A
N
 
-
P
 
-
R
 
R
V
 
D
D
 
E
R
 
K
V
 
I
I
 
T
G
 
Y
L
 
C
H
 
M
V
 
V
D
 
G
E
|
E
N
 
P
I
 
S
E
 
S
V
 
A
G
 
K
N
 
N
I
 
L
G
 
G
V
 
D
K
 
V
L
 
V
G
 
K
V
 
N
V
 
G
N
 
R
A
 
R
A
 
G
S
 
S
N
 
I
P
 
T
F
 
G
T
 
N
I
 
L
K
 
Y
I
 
I
K
 
Q
G
 
G
V
 
I
G
 
Q
A
 
G
H
 
H
G
 
V
A
 
A
R
 
Y
P
 
P
H
 
H
M
 
L
G
 
A
V
 
E
D
 
N
P
 
P
I
 
I
V
 
-
I
 
-
S
 
-
S
 
H
H
 
K
V
 
A
I
 
A
L
 
L
A
 
F
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
I
 
L
V
 
T
S
 
T
R
 
Y
E
 
Q
-
 
W
-
 
D
-
 
K
-
 
G
-
 
N
-
 
E
-
 
F
L
 
F
P
 
P
P
 
P
T
 
T
D
 
S
A
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
L
T
 
Q
V
 
I
G
 
A
S
 
N
I
 
I
H
 
H
G
 
A
G
 
G
T
 
T
-
 
G
A
 
S
Q
 
N
N
 
N
I
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
A
E
 
E
V
 
L
V
 
Y
I
 
I
A
 
Q
G
 
F
T
 
N
M
 
L
R
 
R
T
 
Y
M
 
C
R
 
T
T
 
E
E
 
V
H
 
T
R
 
D
E
 
E
Y
 
I
V
 
I
K
 
K
E
 
Q
R
 
K
L
 
V
R
 
A
E
 
E
I
 
M
T
 
-
F
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
L
N
 
E
S
 
K
M
 
H
R
 
N
G
 
L
K
 
K
Y
 
Y
E
 
R
I
 
I
D
 
E
I
 
W
E
 
N
E
 
L
S
 
S
-
 
G
Y
 
K
P
 
P
C
 
F
L
 
L
Y
 
T
N
 
K
D
 
P
D
 
G
D
 
K
V
 
L
I
 
L
K
 
D
D
 
S
I
 
I
L
 
T
K
 
S
A
 
A
A
 
I
Y
 
E
K
 
E
E
 
T
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3rzaA Crystal structure of a tripeptidase (sav1512) from staphylococcus aureus subsp. Aureus mu50 at 2.10 a resolution
26% identity, 43% coverage: 151:318/390 of query aligns to 151:310/373 of 3rzaA

query
sites
3rzaA
L
 
L
E
 
N
N
 
S
P
 
E
R
 
L
V
 
L
D
 
D
R
 
A
V
 
D
I
 
F
G
 
G
L
 
Y
H
 
A
V
 
I
D
|
D
E
 
A
N
 
S
I
 
A
E
 
D
V
 
V
G
 
G
N
 
T
I
 
T
G
 
-
V
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
V
V
 
V
N
 
G
A
 
A
A
 
P
S
 
T
N
 
Q
P
 
M
F
 
L
-
 
I
T
 
S
I
 
A
K
 
K
I
 
I
K
 
I
G
 
G
V
 
K
G
 
T
A
 
A
H
 
H
G
 
A
A
 
S
R
 
T
P
 
P
H
 
K
M
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
S
P
 
A
I
 
I
V
 
N
I
 
I
S
 
A
S
 
A
H
 
K
V
 
A
I
 
I
-
 
S
-
 
R
L
 
M
A
 
K
L
 
L
Q
 
G
Q
 
Q
I
 
V
V
 
-
S
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
T
 
D
D
 
E
A
 
I
A
 
T
V
 
T
I
 
A
T
 
N
V
 
I
G
 
G
S
 
K
I
 
F
H
 
H
G
 
G
G
 
G
T
 
S
A
 
A
Q
 
T
N
 
N
I
 
I
I
 
V
P
 
A
E
 
D
E
 
E
V
 
V
V
 
I
I
 
L
A
 
E
G
 
A
T
 
E
M
 
A
R
 
R
T
 
S
M
 
H
R
 
D
T
 
P
E
 
E
H
 
R
R
 
I
E
 
K
Y
 
T
V
 
Q
K
 
V
E
 
K
R
 
H
L
 
M
R
 
T
E
 
D
I
 
V
T
 
F
F
 
E
G
 
T
V
 
T
V
 
A
N
 
S
S
 
E
M
 
L
R
 
G
G
 
G
K
 
K
Y
 
A
E
 
E
I
 
V
D
 
T
I
 
V
E
 
E
E
 
Q
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
C
 
G
L
 
F
-
 
K
Y
 
I
N
 
N
D
 
D
D
 
N
D
 
E
V
 
A
I
 
V
K
 
V
D
 
K
I
 
I
L
 
A
K
 
Q
A
 
E
A
 
S
Y
 
A
K
 
R
E
 
N
I
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3ramA Crystal structure of hmra (see paper)
26% identity, 74% coverage: 3:290/390 of query aligns to 5:274/391 of 3ramA

query
sites
3ramA
R
 
Q
D
 
Q
F
 
I
F
 
L
N
 
D
M
 
Y
A
 
I
Q
 
E
S
 
T
I
 
N
K
 
K
K
 
Y
E
 
S
L
 
Y
I
 
I
D
 
E
I
 
I
R
 
S
R
 
H
D
 
R
L
 
I
H
 
H
R
 
E
H
 
R
P
 
P
E
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
N
E
 
E
E
 
E
E
 
I
R
 
F
T
 
A
S
 
S
F
 
R
K
 
T
I
 
L
K
 
I
E
 
D
F
 
R
L
 
L
K
 
K
K
 
E
I
 
H
G
 
D
I
 
F
E
 
E
Y
 
I
M
 
E
E
 
T
T
 
E
A
 
I
G
 
A
T
 
G
G
 
H
V
 
A
C
 
T
G
 
G
I
 
F
I
 
I
-
 
A
-
 
T
-
 
Y
-
 
D
R
 
S
G
 
G
K
 
L
G
 
D
N
 
G
K
 
P
T
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
F
R
 
L
A
 
A
D
 
E
I
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
K
 
-
N
 
-
C
 
-
S
 
-
Y
 
-
S
 
-
S
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
G
K
 
L
M
 
G
H
 
H
A
 
A
C
|
C
G
 
G
H
|
H
D
 
N
A
 
-
H
 
-
T
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
I
L
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
K
 
S
V
 
V
L
 
L
N
 
G
S
 
A
V
 
I
K
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
Q
-
 
V
-
 
I
D
 
D
E
 
Q
L
 
I
K
 
G
G
 
G
T
 
K
V
 
V
K
 
V
L
 
V
F
 
L
F
 
G
E
 
C
P
 
P
A
 
A
E
 
E
E
|
E
-
 
G
-
 
G
T
 
E
T
 
N
G
 
G
G
 
S
A
 
A
K
 
K
L
 
A
-
 
S
M
 
Y
V
 
V
K
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
V
L
 
I
E
 
D
N
 
-
P
 
-
R
 
Q
V
 
I
D
 
D
R
 
I
V
 
A
I
 
L
G
 
M
L
 
I
H
|
H
V
 
-
D
 
-
E
 
-
N
 
-
I
 
-
E
 
-
V
 
P
G
 
G
N
 
N
I
 
E
G
 
T
V
 
Y
K
 
K
L
 
T
G
 
-
V
 
I
V
 
D
N
 
T
A
 
L
A
 
A
S
 
V
N
 
D
P
 
V
F
 
L
T
 
D
I
 
V
K
 
K
I
 
F
K
 
Y
G
 
G
V
 
K
G
 
S
A
 
A
H
 
H
G
 
A
A
 
S
-
 
E
-
 
N
-
 
A
-
 
D
R
 
E
P
 
A
H
 
L
M
 
N
G
 
A
V
 
L
D
 
D
P
 
A
I
 
M
V
 
I
I
 
S
S
 
Y
S
 
F
H
 
N
V
 
G
I
 
V
L
 
A
A
 
Q
L
 
L
Q
 
R
Q
 
Q
I
 
H
V
 
I
S
 
K
R
 
K
E
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
T
 
-
D
 
D
A
 
Q
A
 
R
V
 
V
I
 
H
T
 
G
V
 
V
G
 
-
S
 
I
I
 
L
H
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
Q
 
A
N
 
N
I
 
I
I
 
I
P
 
P
E
 
D
E
 
Y
V
 
T
V
 
H
I
 
A
A
 
R
G
 
F
T
 
Y
M
 
T
R
 
R
T
 
A
M
 
M
R
 
T
T
 
R
E
 
K
H
 
E
R
 
L
E
 
D
Y
 
I
V
 
L
K
 
T
E
 
E
R
 
K
L
 
V
R
 
N
E
 
Q
I
 
I
T
 
A
F
 
R
G
 
G
V
 
A
V
 
A
N
 
I
S
 
Q
M
 
T
R
 
G
G
 
C
K
 
D
Y
 
Y
E
 
E
I
 
F

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012101872.1 NCBI__GCF_000016505.1:WP_012101872.1
MARDFFNMAQSIKKELIDIRRDLHRHPELGYEEERTSFKIKEFLKKIGIEYMETAGTGVC
GIIRGKGNKTIGIRADIDALPLEDHKNCSYSSKVKGKMHACGHDAHTTILLGTAKVLNSV
KDELKGTVKLFFEPAEETTGGAKLMVKEGALENPRVDRVIGLHVDENIEVGNIGVKLGVV
NAASNPFTIKIKGVGAHGARPHMGVDPIVISSHVILALQQIVSRELPPTDAAVITVGSIH
GGTAQNIIPEEVVIAGTMRTMRTEHREYVKERLREITFGVVNSMRGKYEIDIEESYPCLY
NDDDVIKDILKAAYKEIGEEHVKMLESPSMGVESFAYFSMERPSAFYYLGCRNESKNIIY
PAHGSLFDIDEDCLPIGVSIQCRAAYDFLK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory