SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012170490.1 NCBI__GCF_000010525.1:WP_012170490.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3daaA Crystallographic structure of d-amino acid aminotransferase inactivated by pyridoxyl-d-alanine (see paper)
38% identity, 94% coverage: 8:275/284 of query aligns to 6:272/277 of 3daaA

query
sites
3daaA
N
 
N
G
 
D
D
 
Q
F
 
I
V
 
V
P
 
K
L
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
K
I
 
I
S
 
D
P
 
K
L
 
E
D
 
D
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
L
 
Q
F
 
F
A
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
V
Y
|
Y
E
 
E
V
|
V
S
 
V
A
 
K
V
 
V
L
 
Y
D
 
N
G
 
G
K
 
E
L
 
M
V
 
F
D
 
T
N
 
V
D
 
N
S
 
E
H
 
H
L
 
I
A
 
D
R
|
R
L
 
L
K
 
Y
R
 
A
S
 
S
V
 
A
G
 
E
E
 
K
I
 
I
A
 
R
L
 
I
D
 
T
L
 
I
P
 
P
V
 
Y
T
 
T
L
 
K
E
 
D
E
 
K
L
 
F
V
 
H
E
 
Q
L
 
L
E
 
L
R
 
H
E
 
E
L
 
L
V
 
V
R
 
E
R
 
K
N
 
N
S
 
E
L
 
L
T
 
N
E
 
T
G
 
G
V
 
H
V
 
I
Y
 
Y
M
 
F
Q
 
Q
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
T
A
 
S
D
 
P
R
 
R
D
 
A
F
 
H
T
 
Q
F
 
F
P
 
P
K
 
E
D
 
N
A
 
T
-
 
V
K
 
K
P
 
P
T
 
V
L
 
I
F
 
I
M
 
G
F
 
Y
T
 
T
Q
 
K
E
 
E
K
 
-
N
 
N
I
 
P
L
 
R
A
 
P
S
 
L
K
 
E
A
 
N
A
 
L
E
 
E
T
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
K
V
 
A
K
 
T
S
 
F
V
 
V
P
 
E
D
 
D
L
 
I
R
 
R
W
 
W
A
 
L
R
 
R
R
 
C
D
 
D
I
 
I
K
|
K
S
 
S
V
 
L
A
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
G
Q
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
A
 
E
A
 
A
A
 
H
E
 
E
A
 
K
G
 
G
C
 
C
Q
 
Y
E
 
E
A
 
A
W
 
I
M
 
L
V
 
H
Q
 
R
D
 
N
G
 
N
F
 
T
I
 
V
T
 
T
E
|
E
G
 
G
G
 
S
S
|
S
S
|
S
S
 
N
A
 
V
F
 
F
I
 
G
I
 
I
T
 
-
A
 
K
N
 
D
D
 
G
V
 
I
V
 
L
V
 
Y
T
 
T
R
 
H
P
 
P
N
 
A
S
 
N
T
 
N
A
 
M
V
 
I
L
|
L
P
 
K
G
|
G
C
x
I
T
|
T
R
 
R
R
 
D
A
 
V
L
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
C
A
 
A
A
 
N
E
 
E
G
 
I
T
 
N
I
 
M
T
 
P
V
 
V
E
 
K
E
 
E
R
 
I
L
 
P
F
 
F
T
 
T
L
 
T
D
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
M
K
 
D
E
 
E
A
 
L
F
 
F
I
 
V
A
 
T
S
|
S
A
x
T
S
 
T
S
 
S
F
 
E
V
 
I
Q
 
T
A
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
E
I
 
I
D
 
D
D
 
G
K
 
K
P
 
L
I
 
I
G
 
R
T
 
D
G
 
G
T
 
K
P
 
V
G
 
G
P
 
E
L
 
W
T
 
T
K
 
R
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
E
 
K
L
 
Q
Y
 
F

2daaA Crystallographic structure of d-amino acid aminotransferase inactivated by d-cycloserine
38% identity, 94% coverage: 8:275/284 of query aligns to 6:272/277 of 2daaA

query
sites
2daaA
N
 
N
G
 
D
D
 
Q
F
 
I
V
 
V
P
 
K
L
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
K
I
 
I
S
 
D
P
 
K
L
 
E
D
 
D
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
L
 
Q
F
 
F
A
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
V
Y
|
Y
E
 
E
V
|
V
S
 
V
A
 
K
V
 
V
L
 
Y
D
 
N
G
 
G
K
 
E
L
 
M
V
 
F
D
 
T
N
 
V
D
 
N
S
 
E
H
 
H
L
 
I
A
 
D
R
|
R
L
 
L
K
 
Y
R
 
A
S
 
S
V
 
A
G
 
E
E
 
K
I
 
I
A
 
R
L
 
I
D
 
T
L
 
I
P
 
P
V
 
Y
T
 
T
L
 
K
E
 
D
E
 
K
L
 
F
V
 
H
E
 
Q
L
 
L
E
 
L
R
 
H
E
 
E
L
 
L
V
 
V
R
 
E
R
 
K
N
 
N
S
 
E
L
 
L
T
 
N
E
 
T
G
 
G
V
 
H
V
 
I
Y
 
Y
M
 
F
Q
 
Q
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
T
A
 
S
D
 
P
R
|
R
D
 
A
F
x
H
T
 
Q
F
 
F
P
 
P
K
 
E
D
 
N
A
 
T
-
 
V
K
 
K
P
 
P
T
 
V
L
 
I
F
 
I
M
 
G
F
 
Y
T
 
T
Q
 
K
E
 
E
K
 
-
N
 
N
I
 
P
L
 
R
A
 
P
S
 
L
K
 
E
A
 
N
A
 
L
E
 
E
T
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
K
V
 
A
K
 
T
S
 
F
V
 
V
P
 
E
D
 
D
L
 
I
R
 
R
W
 
W
A
 
L
R
 
R
R
 
C
D
 
D
I
 
I
K
|
K
S
 
S
V
 
L
A
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
G
Q
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
A
 
E
A
 
A
A
 
H
E
 
E
A
 
K
G
 
G
C
 
C
Q
 
Y
E
 
E
A
 
A
W
 
I
M
 
L
V
 
H
Q
 
R
D
 
N
G
 
N
F
 
T
I
 
V
T
 
T
E
|
E
G
 
G
G
 
S
S
|
S
S
|
S
S
x
N
A
 
V
F
 
F
I
 
G
I
 
I
T
 
-
A
 
K
N
 
D
D
 
G
V
 
I
V
 
L
V
 
Y
T
 
T
R
 
H
P
 
P
N
 
A
S
 
N
T
 
N
A
 
M
V
 
I
L
|
L
P
 
K
G
|
G
C
x
I
T
|
T
R
 
R
R
 
D
A
 
V
L
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
C
A
 
A
A
 
N
E
 
E
G
 
I
T
 
N
I
 
M
T
 
P
V
 
V
E
 
K
E
 
E
R
 
I
L
 
P
F
 
F
T
 
T
L
 
T
D
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
M
K
 
D
E
 
E
A
 
L
F
 
F
I
 
V
A
 
T
S
 
S
A
x
T
S
 
T
S
 
S
F
 
E
V
 
I
Q
 
T
A
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
E
I
 
I
D
 
D
D
 
G
K
 
K
P
 
L
I
 
I
G
 
R
T
 
D
G
 
G
T
 
K
P
 
V
G
 
G
P
 
E
L
 
W
T
 
T
K
 
R
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
E
 
K
L
 
Q
Y
 
F

1daaA Crystallographic structure of d-amino acid aminotransferase complexed with pyridoxal-5'-phosphate (see paper)
38% identity, 94% coverage: 8:275/284 of query aligns to 6:272/277 of 1daaA

query
sites
1daaA
N
 
N
G
 
D
D
 
Q
F
 
I
V
 
V
P
 
K
L
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
K
I
 
I
S
 
D
P
 
K
L
 
E
D
 
D
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
L
 
Q
F
 
F
A
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
V
Y
|
Y
E
 
E
V
|
V
S
 
V
A
 
K
V
 
V
L
 
Y
D
 
N
G
 
G
K
 
E
L
 
M
V
 
F
D
 
T
N
 
V
D
 
N
S
 
E
H
 
H
L
 
I
A
 
D
R
|
R
L
 
L
K
 
Y
R
 
A
S
 
S
V
 
A
G
 
E
E
 
K
I
 
I
A
 
R
L
 
I
D
 
T
L
 
I
P
 
P
V
 
Y
T
 
T
L
 
K
E
 
D
E
 
K
L
 
F
V
 
H
E
 
Q
L
 
L
E
 
L
R
 
H
E
 
E
L
 
L
V
 
V
R
 
E
R
 
K
N
 
N
S
 
E
L
 
L
T
 
N
E
 
T
G
 
G
V
 
H
V
 
I
Y
 
Y
M
 
F
Q
 
Q
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
T
A
 
S
D
 
P
R
 
R
D
 
A
F
 
H
T
 
Q
F
 
F
P
 
P
K
 
E
D
 
N
A
 
T
-
 
V
K
 
K
P
 
P
T
 
V
L
 
I
F
 
I
M
 
G
F
 
Y
T
 
T
Q
 
K
E
 
E
K
 
-
N
 
N
I
 
P
L
 
R
A
 
P
S
 
L
K
 
E
A
 
N
A
 
L
E
 
E
T
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
K
V
 
A
K
 
T
S
 
F
V
 
V
P
 
E
D
 
D
L
 
I
R
 
R
W
 
W
A
 
L
R
 
R
R
 
C
D
 
D
I
 
I
K
|
K
S
 
S
V
 
L
A
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
G
Q
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
A
 
E
A
 
A
A
 
H
E
 
E
A
 
K
G
 
G
C
 
C
Q
 
Y
E
 
E
A
 
A
W
 
I
M
 
L
V
 
H
Q
 
R
D
 
N
G
 
N
F
 
T
I
 
V
T
 
T
E
|
E
G
 
G
G
 
S
S
|
S
S
|
S
S
 
N
A
 
V
F
 
F
I
 
G
I
 
I
T
 
-
A
 
K
N
 
D
D
 
G
V
 
I
V
 
L
V
 
Y
T
 
T
R
 
H
P
 
P
N
 
A
S
 
N
T
 
N
A
 
M
V
 
I
L
|
L
P
 
K
G
|
G
C
x
I
T
|
T
R
 
R
R
 
D
A
 
V
L
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
C
A
 
A
A
 
N
E
 
E
G
 
I
T
 
N
I
 
M
T
 
P
V
 
V
E
 
K
E
 
E
R
 
I
L
 
P
F
 
F
T
 
T
L
 
T
D
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
M
K
 
D
E
 
E
A
 
L
F
 
F
I
 
V
A
 
T
S
|
S
A
x
T
S
 
T
S
 
S
F
 
E
V
 
I
Q
 
T
A
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
E
I
 
I
D
 
D
D
 
G
K
 
K
P
 
L
I
 
I
G
 
R
T
 
D
G
 
G
T
 
K
P
 
V
G
 
G
P
 
E
L
 
W
T
 
T
K
 
R
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
E
 
K
L
 
Q
Y
 
F

3lqsA Complex structure of d-amino acid aminotransferase and 4-amino-4,5- dihydro-thiophenecarboxylic acid (adta) (see paper)
38% identity, 94% coverage: 8:275/284 of query aligns to 6:272/280 of 3lqsA

query
sites
3lqsA
N
 
N
G
 
D
D
 
Q
F
 
I
V
 
V
P
 
K
L
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
K
I
 
I
S
 
D
P
 
K
L
 
E
D
 
D
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
L
 
Q
F
 
F
A
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
V
Y
|
Y
E
 
E
V
|
V
S
 
V
A
 
K
V
 
V
L
 
Y
D
 
N
G
 
G
K
 
E
L
 
M
V
 
F
D
 
T
N
 
V
D
 
N
S
 
E
H
 
H
L
 
I
A
 
D
R
|
R
L
 
L
K
 
Y
R
 
A
S
 
S
V
 
A
G
 
E
E
 
K
I
 
I
A
 
R
L
 
I
D
 
T
L
 
I
P
 
P
V
 
Y
T
 
T
L
 
K
E
 
D
E
 
K
L
 
F
V
 
H
E
 
Q
L
 
L
E
 
L
R
 
H
E
 
E
L
 
L
V
 
V
R
 
E
R
 
K
N
 
N
S
 
E
L
 
L
T
 
N
E
 
T
G
 
G
V
 
H
V
 
I
Y
 
Y
M
 
F
Q
 
Q
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
T
A
 
S
D
 
P
R
 
R
D
 
A
F
 
H
T
 
Q
F
 
F
P
 
P
K
 
E
D
 
N
A
 
T
-
 
V
K
 
K
P
 
P
T
 
V
L
 
I
F
 
I
M
 
G
F
 
Y
T
 
T
Q
 
K
E
 
E
K
 
-
N
 
N
I
 
P
L
 
R
A
 
P
S
 
L
K
 
E
A
 
N
A
 
L
E
 
E
T
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
K
V
 
A
K
 
T
S
 
F
V
 
V
P
 
E
D
 
D
L
 
I
R
 
R
W
 
W
A
 
L
R
 
R
R
 
C
D
 
D
I
 
I
K
|
K
S
 
S
V
 
L
A
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
G
Q
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
A
 
E
A
 
A
A
 
H
E
 
E
A
 
K
G
 
G
C
 
C
Q
 
Y
E
 
E
A
 
A
W
 
I
M
 
L
V
 
H
Q
 
R
D
 
N
G
 
N
F
 
T
I
 
V
T
 
T
E
|
E
G
 
G
G
 
S
S
|
S
S
|
S
S
x
N
A
 
V
F
 
F
I
 
G
I
 
I
T
 
-
A
 
K
N
 
D
D
 
G
V
 
I
V
 
L
V
 
Y
T
 
T
R
 
H
P
 
P
N
 
A
S
 
N
T
 
N
A
 
M
V
 
I
L
|
L
P
 
K
G
|
G
C
x
I
T
|
T
R
 
R
R
 
D
A
 
V
L
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
C
A
 
A
A
 
N
E
 
E
G
 
I
T
 
N
I
 
M
T
 
P
V
 
V
E
 
K
E
 
E
R
 
I
L
 
P
F
 
F
T
 
T
L
 
T
D
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
M
K
 
D
E
 
E
A
 
L
F
 
F
I
 
V
A
 
T
S
|
S
A
x
T
S
x
T
S
 
S
F
 
E
V
 
I
Q
 
T
A
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
E
I
 
I
D
 
D
D
 
G
K
 
K
P
 
L
I
 
I
G
 
R
T
 
D
G
 
G
T
 
K
P
 
V
G
 
G
P
 
E
L
 
W
T
 
T
K
 
R
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
E
 
K
L
 
Q
Y
 
F

P19938 D-alanine aminotransferase; D-amino acid aminotransferase; D-amino acid transaminase; DAAT; D-aspartate aminotransferase; EC 2.6.1.21 from Bacillus sp. (strain YM-1) (see 5 papers)
38% identity, 94% coverage: 8:275/284 of query aligns to 7:273/283 of P19938

query
sites
P19938
N
 
N
G
 
D
D
 
Q
F
 
I
V
 
V
P
 
K
L
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
K
I
 
I
S
 
D
P
 
K
L
 
E
D
 
D
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
L
 
Q
F
 
F
A
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
V
Y
|
Y
E
 
E
V
 
V
S
 
V
A
 
K
V
 
V
L
 
Y
D
 
N
G
 
G
K
 
E
L
 
M
V
 
F
D
 
T
N
 
V
D
 
N
S
 
E
H
 
H
L
 
I
A
 
D
R
|
R
L
 
L
K
 
Y
R
 
A
S
 
S
V
 
A
G
 
E
E
 
K
I
 
I
A
 
R
L
 
I
D
 
T
L
 
I
P
 
P
V
 
Y
T
 
T
L
 
K
E
 
D
E
 
K
L
 
F
V
 
H
E
 
Q
L
 
L
E
 
L
R
 
H
E
 
E
L
 
L
V
 
V
R
 
E
R
 
K
N
 
N
S
 
E
L
 
L
T
 
N
E
 
T
G
 
G
V
 
H
V
 
I
Y
 
Y
M
 
F
Q
 
Q
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
T
A
 
S
D
 
P
R
|
R
D
 
A
F
x
H
T
 
Q
F
 
F
P
 
P
K
 
E
D
 
N
A
 
T
-
 
V
K
 
K
P
 
P
T
 
V
L
 
I
F
 
I
M
 
G
F
 
Y
T
 
T
Q
 
K
E
 
E
K
 
-
N
 
N
I
 
P
L
 
R
A
 
P
S
 
L
K
 
E
A
 
N
A
 
L
E
 
E
T
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
K
V
 
A
K
 
T
S
 
F
V
 
V
P
 
E
D
 
D
L
 
I
R
 
R
W
 
W
A
 
L
R
 
R
R
 
C
D
 
D
I
 
I
K
|
K
S
 
S
V
 
L
A
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
G
Q
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
A
 
E
A
 
A
A
 
H
E
 
E
A
 
K
G
 
G
C
 
C
Q
 
Y
E
 
E
A
 
A
W
 
I
M
 
L
V
 
H
Q
 
R
D
 
N
G
 
N
F
 
T
I
 
V
T
 
T
E
|
E
G
 
G
G
 
S
S
 
S
S
 
S
S
 
N
A
 
V
F
 
F
I
 
G
I
 
I
T
 
-
A
 
K
N
 
D
D
 
G
V
 
I
V
 
L
V
 
Y
T
 
T
R
 
H
P
 
P
N
 
A
S
 
N
T
 
N
A
 
M
V
 
I
L
|
L
P
 
K
G
 
G
C
 
I
T
 
T
R
 
R
R
 
D
A
 
V
L
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
C
A
 
A
A
 
N
E
 
E
G
 
I
T
 
N
I
 
M
T
 
P
V
 
V
E
 
K
E
 
E
R
 
I
L
 
P
F
 
F
T
 
T
L
 
T
D
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
M
K
 
D
E
 
E
A
 
L
F
 
F
I
 
V
A
 
T
S
 
S
A
 
T
S
 
T
S
 
S
F
 
E
V
 
I
Q
 
T
A
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
E
I
 
I
D
 
D
D
 
G
K
 
K
P
 
L
I
 
I
G
 
R
T
 
D
G
 
G
T
 
K
P
 
V
G
 
G
P
 
E
L
 
W
T
 
T
K
 
R
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
E
 
K
L
 
Q
Y
 
F

Sites not aligning to the query:

1a0gB L201a mutant of d-amino acid aminotransferase complexed with pyridoxamine-5'-phosphate (see paper)
38% identity, 94% coverage: 8:275/284 of query aligns to 6:272/282 of 1a0gB

query
sites
1a0gB
N
 
N
G
 
D
D
 
Q
F
 
I
V
 
V
P
 
K
L
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
K
I
 
I
S
 
D
P
 
K
L
 
E
D
 
D
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
L
 
Q
F
 
F
A
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
V
Y
|
Y
E
 
E
V
|
V
S
 
V
A
 
K
V
 
V
L
 
Y
D
 
N
G
 
G
K
 
E
L
 
M
V
 
F
D
 
T
N
 
V
D
 
N
S
 
E
H
 
H
L
 
I
A
 
D
R
|
R
L
 
L
K
 
Y
R
 
A
S
 
S
V
 
A
G
 
E
E
 
K
I
 
I
A
 
R
L
 
I
D
 
T
L
 
I
P
 
P
V
 
Y
T
 
T
L
 
K
E
 
D
E
 
K
L
 
F
V
 
H
E
 
Q
L
 
L
E
 
L
R
 
H
E
 
E
L
 
L
V
 
V
R
 
E
R
 
K
N
 
N
S
 
E
L
 
L
T
 
N
E
 
T
G
 
G
V
 
H
V
 
I
Y
 
Y
M
 
F
Q
 
Q
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
T
A
 
S
D
 
P
R
 
R
D
 
A
F
 
H
T
 
Q
F
 
F
P
 
P
K
 
E
D
 
N
A
 
T
-
 
V
K
 
K
P
 
P
T
 
V
L
 
I
F
 
I
M
 
G
F
 
Y
T
 
T
Q
 
K
E
 
E
K
 
-
N
 
N
I
 
P
L
 
R
A
 
P
S
 
L
K
 
E
A
 
N
A
 
L
E
 
E
T
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
K
V
 
A
K
 
T
S
 
F
V
 
V
P
 
E
D
 
D
L
 
I
R
 
R
W
 
W
A
 
L
R
 
R
R
 
C
D
 
D
I
 
I
K
|
K
S
 
S
V
 
L
A
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
G
Q
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
A
 
E
A
 
A
A
 
H
E
 
E
A
 
K
G
 
G
C
 
C
Q
 
Y
E
 
E
A
 
A
W
 
I
M
 
L
V
 
H
Q
 
R
D
 
N
G
 
N
F
 
T
I
 
V
T
 
T
E
|
E
G
 
G
G
 
S
S
|
S
S
|
S
S
 
N
A
 
V
F
 
F
I
 
G
I
 
I
T
 
-
A
 
K
N
 
D
D
 
G
V
 
I
V
 
L
V
 
Y
T
 
T
R
 
H
P
 
P
N
 
A
S
 
N
T
 
N
A
 
M
V
 
I
L
x
A
P
 
K
G
|
G
C
x
I
T
|
T
R
 
R
R
 
D
A
 
V
L
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
C
A
 
A
A
 
N
E
 
E
G
 
I
T
 
N
I
 
M
T
 
P
V
 
V
E
 
K
E
 
E
R
 
I
L
 
P
F
 
F
T
 
T
L
 
T
D
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
M
K
 
D
E
 
E
A
 
L
F
 
F
I
 
V
A
 
T
S
|
S
A
x
T
S
 
T
S
 
S
F
 
E
V
 
I
Q
 
T
A
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
E
I
 
I
D
 
D
D
 
G
K
 
K
P
 
L
I
 
I
G
 
R
T
 
D
G
 
G
T
 
K
P
 
V
G
 
G
P
 
E
L
 
W
T
 
T
K
 
R
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
E
 
K
L
 
Q
Y
 
F

5mr0D Thermophilic archaeal branched-chain amino acid transaminases from geoglobus acetivorans and archaeoglobus fulgidus: biochemical and structural characterisation (see paper)
29% identity, 98% coverage: 6:284/284 of query aligns to 5:286/290 of 5mr0D

query
sites
5mr0D
Y
 
Y
V
 
M
N
 
D
G
 
G
D
 
E
F
 
F
V
 
V
P
 
P
L
 
E
A
 
N
E
 
E
A
 
A
R
 
K
I
 
V
S
 
S
P
 
I
L
 
F
D
 
D
R
 
H
G
 
G
F
 
F
L
 
L
F
 
Y
A
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
V
Y
x
F
E
 
E
V
x
G
S
 
I
A
 
R
V
 
A
L
 
Y
D
 
N
G
 
G
K
 
R
L
 
V
V
 
F
D
 
R
N
 
L
D
 
K
S
 
E
H
 
H
L
 
I
A
 
D
R
|
R
L
 
L
K
 
Y
R
 
D
S
 
S
V
 
A
G
 
K
E
 
A
I
 
I
A
 
D
L
 
L
D
 
E
L
 
I
P
 
P
V
 
I
T
 
T
L
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
F
V
 
M
E
 
E
L
 
I
E
 
I
R
 
L
E
 
E
L
 
T
V
 
L
R
 
R
R
 
K
N
 
N
S
 
N
L
 
L
T
 
R
E
 
D
G
 
A
V
 
Y
V
 
I
Y
 
R
M
 
P
Q
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
G
D
 
D
R
 
L
D
x
G
F
x
L
T
 
D
F
 
P
P
 
R
K
 
K
D
 
C
A
 
Q
K
 
N
P
 
P
T
 
S
L
 
I
F
 
I
M
 
V
F
 
I
T
 
T
Q
 
K
E
 
P
K
 
W
N
 
G
I
 
K
L
 
L
A
 
Y
S
 
G
K
 
D
A
 
L
A
 
Y
E
 
E
T
 
K
G
 
G
I
 
L
R
 
T
V
 
A
K
 
I
S
 
T
V
 
V
P
 
A
D
 
V
L
 
R
R
 
R
W
 
N
A
 
S
-
 
F
-
 
D
-
 
A
-
 
L
R
 
P
R
 
P
D
 
N
I
 
I
K
|
K
S
 
S
V
 
L
A
 
N
L
x
Y
L
 
L
A
 
N
Q
 
N
V
 
I
L
 
L
A
 
A
K
 
K
-
 
I
Q
 
E
A
 
A
A
 
N
A
 
A
E
 
K
A
 
G
G
 
G
C
 
D
Q
 
E
E
 
A
A
 
I
W
 
F
M
 
L
V
 
D
Q
 
R
D
 
N
G
 
G
F
 
Y
I
 
V
T
 
S
E
|
E
G
 
G
G
 
S
S
x
G
S
x
D
S
 
N
A
 
I
F
 
F
I
 
V
I
 
V
T
 
K
A
 
-
N
 
-
D
 
N
V
 
G
V
 
A
V
 
I
T
 
T
R
 
T
P
 
P
N
 
P
S
 
T
T
 
I
A
 
N
V
 
N
L
|
L
P
 
R
G
 
G
C
x
I
T
|
T
R
 
R
R
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
I
A
 
E
L
 
I
A
 
I
A
 
N
E
 
R
G
 
L
T
 
G
I
 
I
T
 
P
V
 
F
E
 
K
E
 
E
R
 
T
L
 
N
F
 
I
T
 
G
L
 
L
D
 
Y
E
 
D
A
 
L
L
 
Y
A
 
T
A
 
A
K
 
D
E
 
E
A
 
V
F
 
F
I
 
V
A
 
T
S
x
G
A
x
T
S
 
A
S
 
A
F
 
E
V
 
I
Q
 
A
A
 
P
V
 
I
V
 
V
A
 
V
I
 
I
D
 
D
D
 
G
K
 
R
P
 
K
I
 
I
G
 
G
T
 
D
G
 
G
T
 
K
P
 
P
G
 
G
P
 
E
L
 
I
T
 
T
K
 
R
R
 
K
L
 
L
R
 
M
E
 
E
L
 
E
Y
 
F
I
 
S
A
 
K
F
 
L
A
 
T
R
 
E
Q
 
S
T
 
E
A
 
G
V
 
V

5e25A Crystal structure of branched-chain aminotransferase from thermophilic archaea geoglobus acetivorans complexed with alpha-ketoglutarate (see paper)
31% identity, 96% coverage: 4:275/284 of query aligns to 4:278/290 of 5e25A

query
sites
5e25A
I
 
L
A
 
V
Y
 
Y
V
 
M
N
 
N
G
 
G
D
 
E
F
 
F
V
 
V
P
 
P
L
 
E
A
 
S
E
 
Q
A
 
A
R
 
K
I
 
V
S
 
S
P
 
V
L
 
F
D
 
D
R
 
H
G
 
G
F
 
F
L
 
L
F
 
Y
A
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
V
Y
x
F
E
 
E
V
x
G
S
 
I
A
 
R
V
 
A
L
 
Y
D
 
N
G
 
G
K
 
K
L
 
V
V
 
F
D
 
K
N
 
L
D
 
Y
S
 
E
H
 
H
L
 
I
A
 
D
R
|
R
L
 
L
K
 
Y
R
 
D
S
 
C
V
 
A
G
 
R
E
 
V
I
 
I
A
 
D
L
 
L
D
 
K
L
 
I
P
 
P
V
 
L
T
 
S
L
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
F
V
 
A
E
 
E
L
 
A
E
 
I
R
 
L
E
 
E
L
 
T
V
 
L
R
 
R
R
 
R
N
 
N
S
 
N
L
 
L
T
 
R
E
 
D
G
 
A
V
x
Y
V
 
I
Y
 
R
M
 
P
Q
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
A
A
 
G
D
 
D
R
 
L
D
 
G
F
 
L
T
 
D
F
 
P
P
 
R
K
 
K
D
 
C
A
 
P
K
 
S
P
 
P
T
 
N
L
 
V
F
 
I
M
 
I
F
 
I
T
 
T
Q
 
K
E
 
P
K
 
W
N
 
G
I
 
K
L
 
L
A
 
Y
S
 
G
K
 
D
A
 
L
A
 
Y
E
 
E
T
 
K
G
 
G
I
 
L
R
 
K
V
 
A
K
 
I
S
 
T
V
 
V
P
 
A
D
 
I
L
 
R
R
 
R
W
 
N
A
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
S
-
 
L
R
 
P
R
 
P
D
 
N
I
 
I
K
|
K
S
 
S
V
 
L
A
 
N
L
x
Y
L
 
L
A
 
N
Q
 
N
V
 
I
L
 
L
A
 
A
K
 
K
-
 
I
Q
 
E
A
 
A
A
 
N
A
 
A
E
 
K
A
 
G
G
 
G
C
 
D
Q
 
E
E
 
A
A
 
I
W
 
F
M
 
L
V
 
D
Q
 
H
D
 
N
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
T
 
S
E
|
E
G
 
G
G
 
S
S
x
G
S
x
D
S
 
N
A
 
I
F
 
F
I
 
I
I
 
V
T
 
K
A
 
-
N
 
-
D
 
N
V
 
G
V
 
T
V
 
I
T
 
T
R
 
T
P
 
P
N
 
P
S
 
T
T
 
L
A
 
N
V
 
N
L
|
L
P
 
K
G
|
G
C
x
I
T
|
T
R
 
R
R
 
Q
A
 
V
L
 
V
L
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
I
A
 
N
E
 
E
G
 
L
T
 
E
I
 
I
T
 
P
V
 
F
E
 
R
E
 
E
R
 
A
L
 
N
F
 
I
T
 
G
L
 
L
D
 
F
E
 
D
A
 
L
L
 
Y
A
 
S
A
 
A
K
 
D
E
 
E
A
 
I
F
 
F
I
 
V
A
 
T
S
x
G
A
x
T
S
x
A
S
 
A
F
 
E
V
 
I
Q
 
A
A
 
P
V
 
V
V
 
T
A
 
Y
I
 
I
D
 
D
D
 
G
K
 
R
P
 
T
I
 
V
G
 
G
T
 
N
G
 
G
T
 
K
P
 
P
G
 
G
P
 
K
L
 
V
T
 
T
K
 
K
R
 
M
L
 
L
R
 
M
E
 
E
L
 
K
Y
 
F

7p3tB Transaminase of gamma-proteobacterium (see paper)
32% identity, 98% coverage: 4:282/284 of query aligns to 5:285/299 of 7p3tB

query
sites
7p3tB
I
 
I
A
 
I
Y
 
Y
V
 
I
N
 
N
G
 
G
D
 
D
F
 
Y
V
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
S
E
 
Q
A
 
A
R
 
R
I
 
V
S
 
S
P
 
P
L
 
V
D
 
D
R
 
Q
G
 
G
F
 
F
L
 
L
F
 
L
A
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
V
Y
 
F
E
 
D
V
 
V
S
 
V
A
 
S
V
 
A
L
 
W
D
 
K
G
 
G
K
 
N
L
 
I
V
 
F
D
 
K
N
 
L
D
 
D
S
 
A
H
 
H
L
 
L
A
 
D
R
|
R
L
 
F
K
 
F
R
 
D
S
 
S
V
 
I
G
 
Q
E
 
A
I
 
A
A
 
R
L
 
L
D
 
N
L
 
H
P
 
D
V
 
M
T
 
S
L
 
R
E
 
D
E
 
A
L
 
W
V
 
K
E
 
E
L
 
A
E
 
I
R
 
I
E
 
E
L
 
T
V
 
T
R
 
R
R
 
R
N
 
N
S
 
G
L
 
L
T
 
D
E
 
D
G
 
A
V
 
S
V
 
I
Y
 
R
M
 
F
Q
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
E
A
 
P
D
 
K
R
 
G
D
 
V
F
 
V
T
 
A
F
 
D
P
 
P
K
 
R
D
 
D
A
 
F
K
 
K
P
 
P
T
 
T
L
 
C
F
 
I
M
 
V
F
 
W
T
 
V
Q
 
A
E
 
P
K
 
Y
N
 
I
I
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
K
 
E
A
 
E
A
 
K
-
 
R
E
 
R
T
 
N
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
L
-
 
M
-
 
I
-
 
S
-
 
A
-
 
T
K
 
R
S
 
G
V
 
F
P
 
P
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
L
D
 
D
L
 
P
R
 
R
W
 
Y
A
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
-
I
 
-
K
|
K
S
 
C
V
 
L
A
 
D
L
x
R
L
 
L
A
 
H
Q
 
S
V
 
Q
L
 
L
A
 
I
K
 
R
Q
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
C
 
Y
Q
 
D
E
 
D
A
 
A
-
 
L
W
 
W
M
 
L
V
 
D
Q
 
H
D
 
S
G
 
G
F
 
H
I
 
V
T
 
S
E
|
E
G
x
S
G
x
A
S
x
A
S
|
S
S
 
N
A
 
L
F
 
F
I
 
I
I
 
V
T
 
K
A
 
-
N
 
N
D
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
Y
T
 
T
R
 
-
P
 
-
N
 
P
S
 
S
T
 
A
A
 
G
V
 
I
L
 
L
P
 
R
G
|
G
C
x
I
T
|
T
R
 
R
R
 
D
A
 
T
L
 
I
L
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
T
E
 
E
G
 
L
T
 
D
I
 
I
T
 
P
V
 
W
E
 
K
E
 
E
R
 
R
L
 
Q
F
 
L
T
 
S
L
 
A
D
 
F
E
 
D
A
 
V
L
 
Y
A
 
I
A
 
A
K
 
D
E
 
E
A
 
V
F
 
F
I
 
T
A
 
C
S
 
S
A
x
T
S
 
A
S
 
G
F
 
G
V
 
A
Q
 
L
A
 
P
V
 
V
V
 
R
A
 
E
I
 
V
D
 
A
D
 
G
K
 
R
P
 
T
I
 
I
G
 
R
T
 
G
G
 
T
T
 
T
P
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
I
T
 
T
K
 
Q
R
 
A
L
 
I
R
 
D
E
 
N
L
 
A
Y
 
Y
I
 
W
A
 
A
F
 
M
A
 
-
R
 
R
Q
 
E
T
 
T

6snlD (R)-selective amine transaminase from exophiala sideris (see paper)
30% identity, 99% coverage: 4:283/284 of query aligns to 28:312/320 of 6snlD

query
sites
6snlD
I
 
I
A
 
A
Y
 
W
V
 
V
N
 
F
G
 
G
D
 
E
F
 
L
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
R
I
 
I
S
 
P
P
 
L
L
 
M
D
 
D
R
 
Q
G
 
G
F
 
F
L
 
M
F
 
H
A
 
S
D
 
D
G
 
L
I
 
T
Y
|
Y
E
 
D
V
 
V
S
 
P
A
 
S
V
 
V
L
 
W
D
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
F
V
 
F
D
 
R
N
 
L
D
 
D
S
 
D
H
 
H
L
 
I
A
 
A
R
|
R
L
 
L
K
 
E
R
 
A
S
 
S
V
 
C
G
 
A
E
 
K
I
 
M
A
 
R
L
 
L
D
 
Q
L
 
L
P
 
P
V
 
L
T
 
P
L
 
R
E
 
E
E
 
E
L
 
V
V
 
K
E
 
Q
L
 
I
E
 
L
R
 
V
E
 
D
L
 
M
V
 
V
R
 
A
R
 
K
N
 
S
S
 
E
L
 
I
T
 
K
E
 
D
G
 
A
V
 
F
V
 
V
Y
 
E
M
 
L
Q
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
L
A
 
K
D
 
G
-
 
V
R
 
R
D
 
G
F
 
H
T
 
T
F
 
P
P
 
G
K
 
E
D
 
T
A
 
F
K
 
K
P
 
N
T
 
H
L
 
L
F
 
Y
M
 
M
F
 
F
T
 
V
Q
 
Q
E
 
P
K
 
Y
-
 
V
N
 
W
I
 
V
L
 
M
A
 
D
S
 
P
K
 
D
A
 
I
A
 
Q
E
 
K
T
 
T
G
 
G
I
 
G
R
 
K
-
 
A
-
 
I
-
 
I
-
 
A
-
 
R
-
 
T
V
 
V
K
 
R
S
 
R
V
 
I
P
 
P
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
D
-
 
P
-
 
T
-
 
V
-
x
K
D
 
N
L
 
L
R
 
Q
W
 
W
A
 
G
R
 
D
R
 
-
D
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
L
A
 
T
Q
 
R
V
 
G
L
 
L
A
 
F
K
 
E
Q
 
-
A
 
-
A
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
R
G
 
G
C
 
A
Q
 
T
E
 
Y
A
 
P
W
 
F
M
 
L
V
 
T
Q
 
D
-
 
G
D
 
D
G
 
A
F
 
N
I
 
L
T
 
T
E
|
E
G
 
G
G
 
S
S
x
G
S
x
F
S
 
N
A
 
V
F
 
L
I
 
L
I
 
V
T
 
-
A
 
-
N
 
K
D
 
D
V
 
G
V
 
V
V
 
I
T
 
Y
R
 
T
P
 
P
N
 
D
S
 
R
T
 
-
A
 
G
V
 
V
L
|
L
P
 
Q
G
|
G
C
x
V
T
|
T
R
 
R
R
 
K
A
 
S
L
 
C
L
 
I
A
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
K
E
 
S
G
 
L
T
 
G
I
 
I
T
 
E
V
 
V
E
 
R
E
 
V
R
 
Q
L
 
F
F
 
V
T
 
P
L
 
I
D
 
Q
E
 
M
A
 
A
L
 
Y
A
 
D
A
 
A
K
 
D
E
 
E
A
 
I
F
 
F
I
 
M
A
 
A
S
 
T
A
x
T
S
 
A
S
 
G
F
 
G
V
 
I
Q
 
M
A
 
P
V
 
I
V
 
T
A
 
T
I
 
L
D
 
D
D
 
D
K
 
K
P
 
P
I
 
I
G
 
Q
T
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
V
G
 
G
P
 
P
L
 
I
T
 
T
K
 
K
R
 
K
L
 
I
R
 
W
E
 
D
L
 
G
Y
 
Y
I
 
W
A
 
A
F
 
I
A
 
H
R
 
Y
Q
 
D
T
 
D
A
 
A

4ce5B First crystal structure of an (r)-selective omega-transaminase from aspergillus terreus (see paper)
28% identity, 99% coverage: 4:283/284 of query aligns to 31:314/325 of 4ce5B

query
sites
4ce5B
I
 
I
A
 
A
Y
 
W
V
 
V
N
 
E
G
 
G
D
 
E
F
 
L
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
R
I
 
I
S
 
P
P
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
Q
G
 
G
F
 
F
L
 
M
F
 
H
A
 
S
D
 
D
G
 
L
I
 
T
Y
|
Y
E
 
D
V
|
V
S
 
P
A
 
S
V
 
V
L
 
W
D
|
D
G
 
G
K
x
R
L
 
F
V
 
F
D
 
R
N
 
L
D
 
D
S
 
D
H
 
H
L
 
I
A
 
T
R
|
R
L
 
L
K
 
E
R
 
A
S
 
S
V
 
C
G
 
T
E
 
K
I
 
L
A
 
R
L
 
L
D
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
L
T
 
P
L
 
R
E
 
D
E
 
Q
L
 
V
V
 
K
E
 
Q
L
 
I
E
 
L
R
 
V
E
 
E
L
 
M
V
 
V
R
 
A
R
 
K
N
 
S
S
 
G
L
 
I
T
 
R
E
 
D
G
 
A
V
 
F
V
 
V
Y
 
E
M
 
L
Q
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
L
A
 
K
D
 
G
R
 
V
D
 
R
F
 
G
T
 
T
F
 
R
P
 
P
K
 
E
D
 
D
A
 
I
K
 
V
P
 
N
T
 
N
L
 
L
F
 
Y
M
 
M
F
 
F
T
 
V
Q
 
Q
E
 
P
K
 
Y
N
 
V
I
 
W
L
 
V
A
 
M
-
 
E
-
 
P
-
 
D
-
 
M
S
 
Q
K
 
R
A
 
V
A
 
G
E
 
G
T
 
S
G
 
A
I
 
V
R
 
V
V
 
A
K
 
R
S
 
T
V
 
V
P
 
R
D
 
R
L
 
V
R
 
P
W
 
P
A
 
G
R
 
A
R
 
I
D
 
D
-
 
P
-
 
T
I
 
V
K
|
K
S
 
N
V
 
L
A
 
Q
L
x
W
L
 
G
A
 
D
Q
 
L
V
 
V
L
 
R
A
 
G
K
 
M
Q
 
F
A
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
R
G
 
G
C
 
A
Q
 
T
E
 
Y
A
 
P
W
 
F
M
 
L
V
 
T
Q
 
D
-
 
G
D
 
D
G
 
A
F
 
H
I
 
L
T
 
T
E
|
E
G
 
G
G
 
-
S
 
-
S
 
S
S
x
G
A
x
F
F
x
N
I
 
I
I
 
V
T
 
L
A
 
V
N
 
K
D
 
D
V
 
G
V
 
V
V
 
L
T
 
Y
R
 
T
P
 
P
N
 
D
S
 
R
T
 
-
A
 
G
V
 
V
L
|
L
P
 
Q
G
|
G
C
x
V
T
|
T
R
 
R
R
 
K
A
 
S
L
 
V
L
 
I
A
 
N
L
 
A
A
 
A
A
 
E
E
 
A
G
 
F
T
 
G
I
 
I
T
 
E
V
 
V
E
 
R
E
 
V
R
 
E
L
 
F
F
 
V
T
 
P
L
 
V
D
 
E
E
 
L
A
 
A
L
 
Y
A
 
R
A
 
C
K
 
D
E
 
E
A
 
I
F
 
F
I
 
M
A
 
C
S
x
T
A
x
T
S
x
A
S
 
G
F
 
G
V
 
I
Q
 
M
A
 
P
V
 
I
V
 
T
A
 
T
I
 
L
D
 
D
D
 
G
K
 
M
P
 
P
I
 
V
G
 
N
T
 
G
G
 
G
T
 
Q
P
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
I
T
 
T
K
 
K
R
 
K
L
 
I
R
 
W
E
 
D
L
 
G
Y
 
Y
I
 
W
A
 
A
F
 
M
A
 
H
R
 
Y
Q
 
D
T
 
A
A
 
A

4ce5A First crystal structure of an (r)-selective omega-transaminase from aspergillus terreus (see paper)
28% identity, 99% coverage: 4:283/284 of query aligns to 31:314/325 of 4ce5A

query
sites
4ce5A
I
 
I
A
 
A
Y
 
W
V
 
V
N
 
E
G
 
G
D
 
E
F
 
L
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
R
I
 
I
S
 
P
P
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
Q
G
 
G
F
 
F
L
 
M
F
 
H
A
 
S
D
 
D
G
 
L
I
 
T
Y
|
Y
E
 
D
V
|
V
S
 
P
A
 
S
V
 
V
L
 
W
D
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
F
V
 
F
D
 
R
N
 
L
D
 
D
S
 
D
H
 
H
L
 
I
A
 
T
R
|
R
L
 
L
K
 
E
R
 
A
S
 
S
V
 
C
G
 
T
E
 
K
I
 
L
A
 
R
L
 
L
D
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
L
T
 
P
L
 
R
E
 
D
E
 
Q
L
 
V
V
 
K
E
 
Q
L
 
I
E
 
L
R
 
V
E
 
E
L
 
M
V
 
V
R
 
A
R
 
K
N
 
S
S
 
G
L
 
I
T
 
R
E
 
D
G
 
A
V
 
F
V
 
V
Y
 
E
M
 
L
Q
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
L
A
 
K
D
 
G
R
 
V
D
 
R
F
 
G
T
 
T
F
 
R
P
 
P
K
 
E
D
 
D
A
 
I
K
 
V
P
 
N
T
 
N
L
 
L
F
 
Y
M
 
M
F
 
F
T
 
V
Q
 
Q
E
 
P
K
 
Y
N
 
V
I
 
W
L
 
V
A
 
M
-
 
E
-
 
P
-
 
D
-
 
M
S
 
Q
K
 
R
A
 
V
A
 
G
E
 
G
T
 
S
G
 
A
I
 
V
R
 
V
V
 
A
K
 
R
S
 
T
V
 
V
P
 
R
D
 
R
L
 
V
R
 
P
W
 
P
A
 
G
R
 
A
R
 
I
D
 
D
-
 
P
-
 
T
I
 
V
K
|
K
S
 
N
V
 
L
A
 
Q
L
x
W
L
 
G
A
 
D
Q
 
L
V
 
V
L
 
R
A
 
G
K
 
M
Q
 
F
A
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
R
G
 
G
C
 
A
Q
 
T
E
 
Y
A
 
P
W
 
F
M
 
L
V
 
T
Q
 
D
-
 
G
D
 
D
G
 
A
F
 
H
I
 
L
T
 
T
E
|
E
G
 
G
G
 
-
S
 
-
S
 
S
S
x
G
A
x
F
F
x
N
I
 
I
I
 
V
T
 
L
A
 
V
N
 
K
D
 
D
V
 
G
V
 
V
V
 
L
T
 
Y
R
 
T
P
 
P
N
 
D
S
 
R
T
 
-
A
 
G
V
 
V
L
|
L
P
 
Q
G
|
G
C
x
V
T
|
T
R
 
R
R
 
K
A
 
S
L
 
V
L
 
I
A
 
N
L
 
A
A
 
A
A
 
E
E
 
A
G
 
F
T
 
G
I
 
I
T
 
E
V
 
V
E
 
R
E
 
V
R
 
E
L
 
F
F
 
V
T
 
P
L
 
V
D
 
E
E
 
L
A
 
A
L
 
Y
A
 
R
A
 
C
K
 
D
E
 
E
A
 
I
F
 
F
I
 
M
A
 
C
S
x
T
A
x
T
S
 
A
S
 
G
F
 
G
V
 
I
Q
 
M
A
 
P
V
 
I
V
 
T
A
 
T
I
 
L
D
 
D
D
 
G
K
 
M
P
 
P
I
 
V
G
 
N
T
 
G
G
 
G
T
 
Q
P
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
I
T
 
T
K
 
K
R
 
K
L
 
I
R
 
W
E
 
D
L
 
G
Y
 
Y
I
 
W
A
 
A
F
 
M
A
 
H
R
 
Y
Q
 
D
T
 
A
A
 
A

7z79B Crystal structure of aminotransferase-like protein from variovorax paradoxus
31% identity, 97% coverage: 4:278/284 of query aligns to 17:294/306 of 7z79B

query
sites
7z79B
I
 
L
A
 
V
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
G
D
 
Q
F
 
F
V
 
V
P
 
P
L
 
R
A
 
H
E
 
Q
A
 
A
R
 
V
I
 
V
S
 
S
P
 
V
L
 
F
D
 
D
R
 
A
G
 
G
F
 
Y
L
 
V
F
 
C
A
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
V
Y
x
W
E
 
E
V
 
G
S
 
V
A
 
R
V
 
L
L
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
I
V
 
V
D
 
S
N
 
F
D
 
D
S
 
A
H
 
H
L
 
I
A
 
D
R
|
R
L
 
M
K
 
Y
R
 
E
S
 
G
V
 
A
G
 
K
E
 
S
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
I
P
 
G
V
 
M
T
 
T
L
 
R
E
 
A
E
 
Q
L
 
T
V
 
K
E
 
Q
L
 
V
E
 
V
R
 
V
E
 
D
L
 
T
V
 
F
R
 
L
R
 
R
N
 
N
S
 
G
L
 
M
T
 
R
E
 
D
G
 
G
V
 
A
-
 
H
V
 
A
Y
 
R
M
 
L
Q
 
M
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
K
D
 
K
R
 
T
D
 
P
F
 
N
T
 
Q
F
 
D
P
 
P
K
 
R
-
 
F
-
 
I
D
 
I
A
 
G
K
 
G
P
 
A
T
 
T
L
 
V
F
 
V
M
 
C
F
 
V
T
 
A
Q
 
E
E
 
H
K
 
K
N
 
-
I
 
V
L
 
V
A
 
T
S
 
P
K
 
E
A
 
A
A
 
K
E
 
R
T
 
N
G
 
G
I
 
L
R
 
K
V
 
L
-
 
F
-
 
T
-
 
S
-
 
T
-
 
L
-
 
R
K
 
C
S
 
S
V
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
V
R
 
F
W
 
D
A
 
L
R
 
R
R
 
L
D
x
N
I
 
S
K
 
H
S
 
S
V
 
R
A
 
L
L
 
N
L
 
L
A
 
I
Q
 
Q
V
 
A
L
 
L
A
 
I
K
 
Q
Q
 
-
A
 
-
A
 
A
A
 
I
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
C
 
A
Q
 
D
E
 
E
A
 
A
W
 
L
M
 
M
V
 
L
Q
 
D
-
 
P
D
 
N
G
 
G
F
 
F
I
 
V
T
 
S
E
 
S
G
 
C
G
 
N
S
|
S
S
x
T
S
 
N
A
 
F
F
 
F
I
 
A
I
 
V
T
 
R
A
 
-
N
 
N
D
 
G
V
 
A
V
 
L
V
 
W
T
 
T
R
 
-
P
 
S
N
 
S
S
 
G
T
 
R
A
 
Y
V
 
C
L
x
F
P
 
N
G
|
G
C
x
I
T
|
T
R
 
R
R
 
A
A
 
T
L
 
V
L
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
A
T
 
G
I
 
I
T
 
P
V
 
V
E
 
H
E
 
E
R
 
G
L
 
D
F
 
F
T
 
T
L
 
L
D
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
K
 
D
E
 
E
A
 
A
F
 
F
I
 
V
A
 
T
S
x
G
A
x
T
S
 
L
S
 
A
F
 
G
V
 
L
Q
 
T
A
 
P
V
 
V
V
 
S
A
 
S
I
 
V
D
 
D
D
 
G
K
 
R
P
 
A
I
 
L
G
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
V
P
 
P
-
 
L
G
 
G
P
 
P
L
 
L
T
 
T
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
R
 
D
E
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
R
A
 
A
F
 
Y

6xwbA Crystal structure of an r-selective transaminase from thermomyces stellatus. (see paper)
29% identity, 96% coverage: 4:275/284 of query aligns to 29:304/319 of 6xwbA

query
sites
6xwbA
I
 
I
A
 
A
Y
 
W
V
 
V
N
 
E
G
 
G
D
 
E
F
 
M
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
H
E
 
E
A
 
A
R
 
R
I
 
I
S
 
P
P
 
M
L
 
L
D
 
D
R
 
E
G
 
G
F
 
F
L
 
M
F
 
R
A
 
S
D
 
D
G
 
L
I
 
T
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
S
 
P
A
 
S
V
 
V
L
 
W
D
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
F
V
 
F
D
 
R
N
 
L
D
 
D
S
 
D
H
 
H
L
 
L
A
 
S
R
|
R
L
 
L
K
 
E
R
 
A
S
 
S
V
 
C
G
 
A
E
 
K
I
 
L
A
 
R
L
 
L
D
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
L
T
 
P
L
 
R
E
 
E
E
 
E
L
 
V
V
 
K
E
 
K
L
 
I
E
 
L
R
 
V
E
 
E
L
 
M
V
 
V
R
 
A
R
 
K
N
 
S
S
 
G
L
 
I
T
 
R
E
 
D
G
 
A
V
 
F
V
 
V
Y
 
E
M
 
I
Q
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
L
A
 
K
D
 
G
R
 
V
D
 
R
F
 
G
T
 
S
F
 
R
P
 
P
K
 
E
D
 
E
A
 
I
K
 
V
P
 
N
T
 
R
L
 
L
F
 
Y
M
 
M
F
 
L
T
 
V
Q
 
Q
E
 
P
K
 
Y
-
 
V
N
 
W
I
 
V
L
 
M
A
 
E
S
 
P
K
 
E
A
 
V
A
 
Q
E
 
P
T
 
V
G
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
I
-
 
A
I
 
R
R
 
T
V
 
V
K
 
R
S
 
R
V
 
V
P
 
P
D
 
P
L
 
G
R
 
S
W
 
-
A
 
I
R
 
D
R
 
P
D
 
T
I
 
V
K
|
K
S
 
N
V
 
L
A
 
Q
L
 
W
L
 
G
A
 
D
Q
x
F
V
 
V
L
 
R
A
 
G
K
 
L
Q
 
F
A
 
E
A
 
A
A
 
S
E
 
D
A
 
R
G
 
G
C
 
A
Q
 
T
E
 
Y
A
 
P
W
 
F
M
 
L
V
 
T
Q
 
D
-
 
G
D
 
D
G
 
A
F
 
N
I
 
L
T
 
T
E
|
E
G
 
G
G
 
-
S
 
-
S
 
S
S
x
G
A
x
F
F
x
N
I
 
I
I
 
V
T
 
L
A
 
V
N
 
K
D
 
D
V
 
G
V
 
V
V
 
L
T
 
Y
R
 
T
P
 
P
N
 
D
S
 
R
T
 
-
A
 
G
V
 
V
L
|
L
P
 
Q
G
|
G
C
x
V
T
|
T
R
 
R
R
 
K
A
 
S
L
 
V
L
 
I
A
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
N
E
 
A
G
 
K
T
 
G
I
 
F
T
 
E
V
 
V
E
 
R
E
 
V
R
 
E
L
 
Y
F
 
V
T
 
P
L
 
V
D
 
E
E
 
A
A
 
A
L
 
Y
A
 
H
A
 
A
K
 
D
E
 
E
A
 
I
F
 
F
I
 
M
A
 
C
S
 
T
A
x
T
S
 
A
S
 
G
F
 
G
V
 
I
Q
 
M
A
 
P
V
 
I
V
 
R
A
 
S
I
 
L
D
 
D
D
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
V
G
 
N
T
 
D
G
 
G
T
 
K
P
 
V
G
 
G
P
 
P
L
 
I
T
 
T
K
 
K
R
 
A
L
 
I
R
 
W
E
 
D
L
 
G
Y
 
Y

7dbeB Structure of a novel transaminase
30% identity, 95% coverage: 5:275/284 of query aligns to 41:316/332 of 7dbeB

query
sites
7dbeB
A
 
A
Y
 
W
V
 
I
N
 
E
G
 
G
D
 
A
F
 
F
V
 
V
P
 
P
L
 
A
A
 
A
E
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
I
S
 
S
P
 
I
L
 
F
D
 
D
R
 
A
G
 
G
F
 
F
L
 
G
F
 
H
A
 
S
D
 
D
G
 
V
I
 
T
Y
 
Y
E
 
T
V
 
V
S
 
A
A
 
H
V
 
V
L
 
W
D
 
H
G
 
G
K
 
N
L
 
F
V
 
F
D
 
R
N
 
L
D
 
E
S
 
D
H
 
H
L
 
V
A
 
E
R
|
R
L
 
F
K
 
L
R
 
A
S
 
G
V
 
A
G
 
E
E
 
K
I
 
M
A
 
R
L
 
I
D
 
P
L
 
M
P
 
P
V
 
A
T
 
T
L
 
K
E
 
A
E
 
E
L
 
I
V
 
M
E
 
D
L
 
L
E
 
M
R
 
R
E
 
G
L
 
C
V
 
V
R
 
S
R
 
K
N
 
S
S
 
G
L
 
L
T
 
R
E
 
E
G
 
A
V
 
Y
V
 
V
Y
 
N
M
 
V
Q
 
C
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
Y
A
 
G
D
 
R
R
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
L
D
 
E
F
 
S
T
 
Q
F
 
L
P
 
Y
K
 
V
D
 
Y
A
 
A
K
 
I
P
 
P
T
 
Y
L
 
L
F
 
W
M
 
V
F
 
F
T
 
S
Q
 
P
E
 
I
K
 
R
N
 
Q
I
 
I
L
 
E
A
 
G
S
 
I
K
 
D
A
 
A
-
 
V
-
 
I
A
 
A
E
 
Q
T
 
S
G
 
V
I
 
R
R
 
R
V
 
S
K
 
P
S
 
A
V
 
N
P
 
V
D
 
M
L
 
D
R
 
P
W
 
W
A
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
-
I
 
I
K
|
K
S
 
N
V
 
Y
A
 
Q
L
 
W
L
 
G
A
 
D
Q
 
L
V
 
V
L
 
R
A
 
A
K
 
T
Q
 
F
A
 
E
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
A
 
R
G
 
G
C
 
A
Q
 
R
E
 
T
A
 
A
W
 
F
M
 
L
V
 
L
-
 
D
Q
 
S
D
 
D
G
 
G
F
 
F
I
 
V
T
 
T
E
|
E
G
 
G
G
 
P
S
x
G
S
x
F
S
x
N
A
 
V
F
 
L
I
 
M
I
 
V
T
 
K
A
 
D
N
 
G
D
 
T
V
 
V
V
 
F
V
 
T
T
 
A
R
 
A
P
 
R
N
 
N
S
 
-
T
 
-
A
 
-
V
 
V
L
|
L
P
 
P
G
|
G
C
x
I
T
|
T
R
 
R
R
 
R
A
 
T
L
 
A
L
 
L
A
 
E
L
 
I
A
 
A
A
 
R
E
 
D
G
 
F
T
 
G
I
 
L
T
 
Q
V
 
T
E
 
V
E
 
I
R
 
G
L
 
D
F
 
V
T
 
T
L
 
P
D
 
E
E
 
M
A
 
L
L
 
R
A
 
G
A
 
A
K
 
D
E
 
E
A
 
I
F
 
F
I
 
A
A
 
A
S
 
T
A
x
T
S
 
A
S
 
G
F
 
G
V
 
V
Q
 
T
A
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
I
 
L
D
 
D
D
 
G
K
 
A
P
 
P
I
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
T
 
V
P
 
P
G
 
G
P
 
D
L
 
W
T
 
T
K
 
R
R
 
K
L
 
I
R
 
R
E
 
T
L
 
R
Y
 
Y

8onjA Crystal structure of d-amino acid aminotransferase from aminobacterium colombiense point mutant r88l (see paper)
30% identity, 96% coverage: 4:277/284 of query aligns to 5:270/277 of 8onjA

query
sites
8onjA
I
 
L
A
 
C
Y
 
Y
V
 
I
N
 
D
G
 
G
D
 
K
F
 
F
V
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
K
I
 
L
S
 
P
P
 
V
L
 
T
D
 
D
R
 
L
G
 
I
F
 
I
L
 
Q
F
 
R
A
 
G
D
 
V
G
 
G
I
 
V
Y
 
F
E
 
E
V
 
T
S
 
I
A
 
S
V
 
T
L
 
H
D
 
S
G
 
R
K
 
R
L
 
P
V
 
L
D
 
M
N
 
L
D
 
T
S
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
K
R
|
R
L
 
L
K
 
E
R
 
G
S
 
S
V
 
A
G
 
T
E
 
A
I
 
S
A
 
S
L
 
I
D
 
V
L
 
M
P
 
P
V
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
D
E
 
E
L
 
M
V
 
A
E
 
R
L
 
I
E
 
I
R
 
R
E
 
E
L
 
G
V
 
I
R
 
K
R
 
K
N
 
M
S
 
G
L
 
-
T
 
C
E
 
E
G
 
T
V
 
M
V
 
V
Y
 
L
M
 
P
Q
 
Y
V
 
I
T
 
T
R
 
G
G
 
G
V
 
D
A
 
S
-
 
F
D
 
G
R
 
K
D
 
D
F
 
H
T
 
L
F
 
F
P
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
S
K
 
S
P
 
S
T
 
R
L
 
Y
F
 
F
M
 
V
F
 
I
T
 
F
Q
 
E
E
 
E
K
 
I
N
 
R
I
 
K
L
 
P
A
 
D
S
 
P
K
 
I
A
 
L
A
 
Y
E
 
E
T
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
A
V
 
L
K
 
H
S
 
P
V
 
I
P
 
N
D
 
A
L
 
E
R
|
R
W
 
Y
A
 
L
R
 
P
R
 
-
D
 
S
I
 
T
K
|
K
S
 
S
V
 
I
A
 
N
L
 
Y
L
 
M
A
 
L
Q
 
S
V
 
F
L
 
T
A
 
G
K
 
Q
Q
 
R
A
 
D
A
 
S
A
 
K
E
 
-
A
 
-
G
 
G
C
 
A
Q
 
Y
E
 
E
A
 
I
W
 
L
M
 
Y
V
 
C
Q
 
P
D
 
E
G
 
G
F
 
E
I
 
I
T
 
V
E
|
E
G
 
G
G
 
-
S
 
S
S
x
H
S
|
S
A
 
T
F
 
F
I
 
F
I
 
L
T
 
I
A
 
K
N
 
N
D
 
G
V
 
H
V
 
L
V
 
I
T
 
T
R
 
A
P
 
P
N
 
T
S
 
S
T
 
R
A
 
A
V
 
-
L
|
L
P
 
S
G
 
G
C
x
T
T
|
T
R
 
R
R
 
Q
A
 
I
L
 
V
L
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
R
G
 
G
T
 
N
I
 
I
T
 
Q
V
 
V
E
 
E
E
 
E
R
 
R
L
 
C
F
 
P
T
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
P
A
 
E
A
 
A
K
 
E
E
 
E
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
T
S
x
G
A
x
T
S
 
V
S
 
K
F
 
E
V
 
L
Q
 
L
A
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
R
I
 
I
D
 
G
D
 
D
K
 
Q
P
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
N
G
 
G
T
 
V
P
 
P
G
 
G
P
 
K
L
 
L
T
 
T
K
 
K
R
 
H
L
 
L
R
 
H
E
 
Q
L
 
V
Y
 
Y
I
 
L
A
 
S

8aieB Crystal structure of d-amino acid aminotransferase from aminobacterium colombiense complexed with d-cycloserine
30% identity, 96% coverage: 4:277/284 of query aligns to 3:268/275 of 8aieB

query
sites
8aieB
I
 
L
A
 
C
Y
 
Y
V
 
I
N
 
D
G
 
G
D
 
K
F
 
F
V
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
K
I
 
L
S
 
P
P
 
V
L
 
T
D
 
D
R
 
L
G
 
I
F
 
I
L
 
Q
F
 
R
A
 
G
D
 
V
G
 
G
I
 
V
Y
 
F
E
 
E
V
x
T
S
 
I
A
 
S
V
 
T
L
 
H
D
 
S
G
 
R
K
 
R
L
 
P
V
 
L
D
 
M
N
 
L
D
 
T
S
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
K
R
|
R
L
 
L
K
 
E
R
 
G
S
 
S
V
 
A
G
 
T
E
 
A
I
 
S
A
 
S
L
 
I
D
 
V
L
 
M
P
 
P
V
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
D
E
 
E
L
 
M
V
 
A
E
 
R
L
 
I
E
 
I
R
 
R
E
 
E
L
 
G
V
 
I
R
 
K
R
 
K
N
 
M
S
 
G
L
 
-
T
 
C
E
 
E
G
 
T
V
 
M
V
 
V
Y
 
R
M
 
P
Q
 
Y
V
 
I
T
 
T
R
 
G
G
 
G
V
 
D
A
 
S
-
 
F
D
 
G
R
 
K
D
 
D
F
 
H
T
 
L
F
 
F
P
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
S
K
 
S
P
 
S
T
 
R
L
 
Y
F
 
F
M
 
V
F
 
I
T
 
F
Q
 
E
E
 
E
K
 
I
N
 
R
I
 
K
L
 
P
A
 
D
S
 
P
K
 
I
A
 
L
A
 
Y
E
 
E
T
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
A
V
 
L
K
 
H
S
 
P
V
 
I
P
 
N
D
 
A
L
 
E
R
 
R
W
 
Y
A
 
L
R
 
P
R
 
-
D
 
S
I
 
T
K
|
K
S
 
S
V
 
I
A
 
N
L
x
Y
L
 
M
A
 
L
Q
 
S
V
 
F
L
 
T
A
 
G
K
 
Q
Q
 
R
A
 
D
A
 
S
A
 
K
E
 
-
A
 
-
G
 
G
C
 
A
Q
 
Y
E
 
E
A
 
I
W
 
L
M
 
Y
V
 
C
Q
 
P
D
 
E
G
 
G
F
 
E
I
 
I
T
 
V
E
|
E
G
 
G
G
 
-
S
|
S
S
x
H
S
|
S
A
 
T
F
 
F
I
 
F
I
 
L
T
 
I
A
 
K
N
 
N
D
 
G
V
 
H
V
 
L
V
 
I
T
 
T
R
 
A
P
 
P
N
 
T
S
 
S
T
 
R
A
 
A
V
 
-
L
|
L
P
 
S
G
 
G
C
x
T
T
|
T
R
 
R
R
 
Q
A
 
I
L
 
V
L
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
R
G
 
G
T
 
N
I
 
I
T
 
Q
V
 
V
E
 
E
E
 
E
R
 
R
L
 
C
F
 
P
T
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
P
A
 
E
A
 
A
K
 
E
E
 
E
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
T
S
x
G
A
x
T
S
x
V
S
x
K
F
 
E
V
 
L
Q
 
L
A
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
R
I
 
I
D
 
G
D
 
D
K
 
Q
P
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
N
G
 
G
T
 
V
P
 
P
G
 
G
P
 
K
L
 
L
T
 
T
K
 
K
R
 
H
L
 
L
R
 
H
E
 
Q
L
 
V
Y
 
Y
I
 
L
A
 
S

8aykA Crystal structure of d-amino acid aminotrensferase from aminobacterium colombiense complexed with d-glutamate (see paper)
30% identity, 96% coverage: 4:277/284 of query aligns to 4:269/276 of 8aykA

query
sites
8aykA
I
 
L
A
 
C
Y
 
Y
V
 
I
N
 
D
G
 
G
D
 
K
F
 
F
V
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
K
I
 
L
S
 
P
P
 
V
L
 
T
D
 
D
R
 
L
G
 
I
F
 
I
L
 
Q
F
 
R
A
 
G
D
 
V
G
 
G
I
 
V
Y
 
F
E
 
E
V
x
T
S
 
I
A
 
S
V
 
T
L
 
H
D
 
S
G
 
R
K
 
R
L
 
P
V
 
L
D
 
M
N
 
L
D
 
T
S
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
K
R
|
R
L
 
L
K
 
E
R
 
G
S
 
S
V
 
A
G
 
T
E
 
A
I
 
S
A
 
S
L
 
I
D
 
V
L
 
M
P
 
P
V
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
D
E
 
E
L
 
M
V
 
A
E
 
R
L
 
I
E
 
I
R
 
R
E
 
E
L
 
G
V
 
I
R
 
K
R
 
K
N
 
M
S
 
G
L
 
-
T
 
C
E
 
E
G
 
T
V
 
M
V
 
V
Y
 
R
M
 
P
Q
 
Y
V
 
I
T
 
T
R
 
G
G
 
G
V
 
D
A
 
S
-
 
F
D
 
G
R
 
K
D
 
D
F
 
H
T
 
L
F
 
F
P
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
S
K
 
S
P
 
S
T
 
R
L
 
Y
F
 
F
M
 
V
F
 
I
T
 
F
Q
 
E
E
 
E
K
 
I
N
 
R
I
 
K
L
 
P
A
 
D
S
 
P
K
 
I
A
 
L
A
 
Y
E
 
E
T
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
A
V
 
L
K
 
H
S
 
P
V
 
I
P
 
N
D
 
A
L
 
E
R
|
R
W
 
Y
A
 
L
R
 
P
R
 
-
D
 
S
I
 
T
K
|
K
S
 
S
V
 
I
A
 
N
L
 
Y
L
 
M
A
 
L
Q
 
S
V
 
F
L
 
T
A
 
G
K
 
Q
Q
 
R
A
 
D
A
 
S
A
 
K
E
 
-
A
 
-
G
 
G
C
 
A
Q
 
Y
E
 
E
A
 
I
W
 
L
M
 
Y
V
 
C
Q
 
P
D
 
E
G
 
G
F
 
E
I
 
I
T
 
V
E
|
E
G
 
G
G
 
-
S
|
S
S
x
H
S
|
S
A
 
T
F
 
F
I
 
F
I
 
L
T
 
I
A
 
K
N
 
N
D
 
G
V
 
H
V
 
L
V
 
I
T
 
T
R
 
A
P
 
P
N
 
T
S
 
S
T
 
R
A
 
A
V
 
-
L
|
L
P
 
S
G
|
G
C
x
T
T
|
T
R
 
R
R
 
Q
A
 
I
L
 
V
L
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
R
G
 
G
T
 
N
I
 
I
T
 
Q
V
 
V
E
 
E
E
 
E
R
 
R
L
 
C
F
 
P
T
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
P
A
 
E
A
 
A
K
 
E
E
 
E
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
T
S
x
G
A
x
T
S
x
V
S
x
K
F
 
E
V
 
L
Q
 
L
A
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
R
I
 
I
D
 
G
D
 
D
K
 
Q
P
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
N
G
 
G
T
 
V
P
 
P
G
 
G
P
 
K
L
 
L
T
 
T
K
 
K
R
 
H
L
 
L
R
 
H
E
 
Q
L
 
V
Y
 
Y
I
 
L
A
 
S

8ayjA Crystal structure of d-amino acid aminotransferase from aminobacterium colombiens complexed with 3-aminooxypropionic acid (see paper)
30% identity, 96% coverage: 4:277/284 of query aligns to 4:269/276 of 8ayjA

query
sites
8ayjA
I
 
L
A
 
C
Y
 
Y
V
 
I
N
 
D
G
 
G
D
 
K
F
 
F
V
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
K
I
 
L
S
 
P
P
 
V
L
 
T
D
 
D
R
 
L
G
 
I
F
 
I
L
 
Q
F
 
R
A
 
G
D
 
V
G
 
G
I
 
V
Y
 
F
E
 
E
V
x
T
S
 
I
A
 
S
V
 
T
L
 
H
D
 
S
G
 
R
K
 
R
L
 
P
V
 
L
D
 
M
N
 
L
D
 
T
S
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
K
R
|
R
L
 
L
K
 
E
R
 
G
S
 
S
V
 
A
G
 
T
E
 
A
I
 
S
A
 
S
L
 
I
D
 
V
L
 
M
P
 
P
V
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
D
E
 
E
L
 
M
V
 
A
E
 
R
L
 
I
E
 
I
R
 
R
E
 
E
L
 
G
V
 
I
R
 
K
R
 
K
N
 
M
S
 
G
L
 
-
T
 
C
E
 
E
G
 
T
V
x
M
V
 
V
Y
x
R
M
 
P
Q
 
Y
V
 
I
T
 
T
R
 
G
G
 
G
V
 
D
A
 
S
-
 
F
D
 
G
R
 
K
D
 
D
F
 
H
T
 
L
F
 
F
P
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
S
K
 
S
P
 
S
T
 
R
L
 
Y
F
 
F
M
 
V
F
 
I
T
 
F
Q
 
E
E
 
E
K
 
I
N
 
R
I
 
K
L
 
P
A
 
D
S
 
P
K
 
I
A
 
L
A
 
Y
E
 
E
T
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
A
V
 
L
K
 
H
S
 
P
V
 
I
P
 
N
D
 
A
L
 
E
R
|
R
W
 
Y
A
 
L
R
 
P
R
 
-
D
 
S
I
 
T
K
|
K
S
 
S
V
 
I
A
 
N
L
x
Y
L
 
M
A
 
L
Q
 
S
V
 
F
L
 
T
A
 
G
K
 
Q
Q
 
R
A
 
D
A
 
S
A
 
K
E
 
-
A
 
-
G
 
G
C
 
A
Q
 
Y
E
 
E
A
 
I
W
 
L
M
 
Y
V
 
C
Q
 
P
D
 
E
G
 
G
F
 
E
I
 
I
T
 
V
E
|
E
G
 
G
G
 
-
S
|
S
S
x
H
S
|
S
A
 
T
F
 
F
I
 
F
I
 
L
T
 
I
A
 
K
N
 
N
D
 
G
V
 
H
V
 
L
V
 
I
T
 
T
R
 
A
P
 
P
N
 
T
S
 
S
T
 
R
A
 
A
V
 
-
L
|
L
P
 
S
G
|
G
C
x
T
T
|
T
R
 
R
R
 
Q
A
 
I
L
 
V
L
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
R
G
 
G
T
 
N
I
 
I
T
 
Q
V
 
V
E
 
E
E
 
E
R
 
R
L
 
C
F
 
P
T
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
P
A
 
E
A
 
A
K
 
E
E
 
E
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
T
S
x
G
A
x
T
S
x
V
S
x
K
F
 
E
V
 
L
Q
 
L
A
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
R
I
 
I
D
 
G
D
 
D
K
 
Q
P
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
N
G
 
G
T
 
V
P
 
P
G
 
G
P
 
K
L
 
L
T
 
T
K
 
K
R
 
H
L
 
L
R
 
H
E
 
Q
L
 
V
Y
 
Y
I
 
L
A
 
S

8aieA Crystal structure of d-amino acid aminotransferase from aminobacterium colombiense complexed with d-cycloserine
30% identity, 96% coverage: 4:277/284 of query aligns to 4:269/276 of 8aieA

query
sites
8aieA
I
 
L
A
 
C
Y
 
Y
V
 
I
N
 
D
G
 
G
D
 
K
F
 
F
V
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
K
I
 
L
S
 
P
P
 
V
L
 
T
D
 
D
R
 
L
G
 
I
F
 
I
L
 
Q
F
 
R
A
 
G
D
 
V
G
 
G
I
 
V
Y
 
F
E
 
E
V
x
T
S
 
I
A
 
S
V
 
T
L
 
H
D
 
S
G
 
R
K
 
R
L
 
P
V
 
L
D
 
M
N
 
L
D
 
T
S
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
K
R
|
R
L
 
L
K
 
E
R
 
G
S
 
S
V
 
A
G
 
T
E
 
A
I
 
S
A
 
S
L
 
I
D
 
V
L
 
M
P
 
P
V
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
D
E
 
E
L
 
M
V
 
A
E
 
R
L
 
I
E
 
I
R
 
R
E
 
E
L
 
G
V
 
I
R
 
K
R
 
K
N
 
M
S
 
G
L
 
-
T
 
C
E
 
E
G
 
T
V
 
M
V
 
V
Y
 
R
M
 
P
Q
 
Y
V
 
I
T
 
T
R
 
G
G
 
G
V
 
D
A
 
S
-
 
F
D
 
G
R
 
K
D
 
D
F
 
H
T
 
L
F
 
F
P
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
S
K
 
S
P
 
S
T
 
R
L
 
Y
F
 
F
M
 
V
F
 
I
T
 
F
Q
 
E
E
 
E
K
 
I
N
 
R
I
 
K
L
 
P
A
 
D
S
 
P
K
 
I
A
 
L
A
 
Y
E
 
E
T
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
A
V
 
L
K
 
H
S
 
P
V
 
I
P
 
N
D
 
A
L
 
E
R
|
R
W
 
Y
A
 
L
R
 
P
R
 
-
D
 
S
I
 
T
K
|
K
S
 
S
V
 
I
A
 
N
L
x
Y
L
 
M
A
 
L
Q
 
S
V
 
F
L
 
T
A
 
G
K
 
Q
Q
 
R
A
 
D
A
 
S
A
 
K
E
 
-
A
 
-
G
 
G
C
 
A
Q
 
Y
E
 
E
A
 
I
W
 
L
M
 
Y
V
 
C
Q
 
P
D
 
E
G
 
G
F
 
E
I
 
I
T
 
V
E
|
E
G
 
G
G
 
-
S
|
S
S
x
H
S
|
S
A
 
T
F
 
F
I
 
F
I
 
L
T
 
I
A
 
K
N
 
N
D
 
G
V
 
H
V
 
L
V
 
I
T
 
T
R
 
A
P
 
P
N
 
T
S
 
S
T
 
R
A
 
A
V
 
-
L
|
L
P
 
S
G
|
G
C
x
T
T
|
T
R
 
R
R
 
Q
A
 
I
L
 
V
L
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
R
G
 
G
T
 
N
I
 
I
T
 
Q
V
 
V
E
 
E
E
 
E
R
 
R
L
 
C
F
 
P
T
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
P
A
 
E
A
 
A
K
 
E
E
 
E
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
T
S
x
G
A
x
T
S
x
V
S
x
K
F
 
E
V
 
L
Q
 
L
A
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
R
I
 
I
D
 
G
D
 
D
K
 
Q
P
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
N
G
 
G
T
 
V
P
 
P
G
 
G
P
 
K
L
 
L
T
 
T
K
 
K
R
 
H
L
 
L
R
 
H
E
 
Q
L
 
V
Y
 
Y
I
 
L
A
 
S

Query Sequence

>WP_012170490.1 NCBI__GCF_000010525.1:WP_012170490.1
MDRIAYVNGDFVPLAEARISPLDRGFLFADGIYEVSAVLDGKLVDNDSHLARLKRSVGEI
ALDLPVTLEELVELERELVRRNSLTEGVVYMQVTRGVADRDFTFPKDAKPTLFMFTQEKN
ILASKAAETGIRVKSVPDLRWARRDIKSVALLAQVLAKQAAAEAGCQEAWMVQDGFITEG
GSSSAFIITANDVVVTRPNSTAVLPGCTRRALLALAAEGTITVEERLFTLDEALAAKEAF
IASASSFVQAVVAIDDKPIGTGTPGPLTKRLRELYIAFARQTAV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory