SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012275299.1 NCBI__GCF_000019185.1:WP_012275299.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7cd4A Crystal structure of the s103f mutant of bacillus subtilis (natto) yabj protein. (see paper)
56% identity, 97% coverage: 5:127/127 of query aligns to 4:124/124 of 7cd4A

query
sites
7cd4A
I
 
V
H
|
H
T
 
T
E
 
K
N
x
H
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
Q
 
Q
A
 
G
L
 
I
A
 
I
F
 
V
D
 
N
K
 
N
L
 
M
V
 
F
F
 
Y
T
 
S
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
L
 
L
D
 
T
P
 
P
A
 
S
T
 
G
M
 
-
A
 
E
F
 
M
V
 
V
E
 
N
G
 
G
G
 
D
I
 
I
K
 
K
E
|
E
Q
 
Q
A
 
T
Y
 
H
Q
 
Q
S
 
V
L
 
F
K
 
S
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
S
T
 
F
D
 
E
T
 
T
V
 
V
L
 
V
K
 
K
T
 
A
T
 
T
C
 
V
F
 
F
L
 
I
A
 
A
N
 
D
M
 
M
E
 
E
D
 
Q
F
 
F
V
 
A
A
 
E
F
 
V
N
 
N
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
T
 
G
E
 
Q
V
 
Y
F
 
F
G
 
D
T
 
T
E
 
H
A
 
-
A
 
K
P
 
P
A
 
A
R
 
R
S
 
F
C
 
C
V
 
V
Q
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
P
 
P
K
 
K
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
L
T
 
V
K
 
K

5v4dA Crystal structure of the protein of unknown function of the conserved rid protein family yyfa from yersinia pestis
49% identity, 97% coverage: 2:124/127 of query aligns to 3:125/127 of 5v4dA

query
sites
5v4dA
K
 
K
T
 
S
V
 
V
I
 
I
H
 
E
T
 
T
E
 
K
N
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
S
A
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
C
F
 
F
D
 
N
K
 
G
L
 
I
V
 
L
F
 
Y
T
 
A
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
L
 
I
D
 
N
P
 
P
A
 
D
T
 
T
M
 
G
A
 
D
F
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
N
G
 
D
I
 
I
K
 
E
E
 
K
Q
 
Q
A
 
T
Y
 
R
Q
 
Q
S
 
V
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
I
K
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
L
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
T
T
 
K
D
 
D
T
 
K
V
 
I
L
 
V
K
 
K
T
 
T
T
 
T
C
 
I
F
 
F
L
 
I
A
 
T
N
 
N
M
 
I
E
 
N
D
 
N
F
 
S
V
 
S
A
 
Q
F
 
V
N
 
N
E
x
D
V
 
I
Y
 
Y
T
 
A
E
x
D
V
 
Y
F
 
F
G
 
K
T
 
G
E
 
T
A
 
I
A
 
F
P
 
P
A
 
A
R
 
R
S
 
S
C
 
T
V
 
V
Q
 
E
A
 
V
A
 
S
R
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
K
D
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
A

Q7CP78 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; Enamine/imine deaminase; EC 3.5.99.10 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
49% identity, 100% coverage: 1:127/127 of query aligns to 1:128/128 of Q7CP78

query
sites
Q7CP78
M
 
M
K
 
S
T
 
K
V
 
T
I
 
I
H
 
A
T
 
T
E
 
E
N
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
|
Y
S
 
V
Q
 
Q
A
 
G
L
 
V
A
 
D
F
 
L
D
 
G
K
 
S
L
 
M
V
 
V
F
 
I
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
L
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
K
T
 
T
M
 
G
A
 
A
F
 
V
V
 
A
E
 
E
G
 
-
G
 
D
I
 
V
K
 
S
E
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
R
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
K
 
E
N
 
N
L
 
V
K
 
K
A
 
A
V
 
I
L
 
V
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
L
G
 
K
T
 
V
D
 
G
T
 
D
V
 
I
L
 
V
K
 
K
T
 
T
T
 
T
C
 
V
F
 
F
L
 
V
A
 
K
N
 
D
M
 
L
E
 
N
D
 
D
F
 
F
V
 
A
A
 
T
F
 
V
N
 
N
E
 
A
V
 
T
Y
 
Y
T
 
E
E
 
A
V
 
F
F
 
F
G
 
T
T
 
E
E
 
H
A
 
N
A
 
A
-
 
T
-
 
F
P
 
P
A
 
A
R
|
R
S
 
S
C
 
C
V
 
V
Q
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
P
 
P
K
 
K
D
 
D
A
 
V
L
 
K
V
 
I
E
|
E
V
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
V
T
 
R
K
 
R

3vczB 1.80 angstrom resolution crystal structure of a putative translation initiation inhibitor from vibrio vulnificus cmcp6
49% identity, 95% coverage: 4:124/127 of query aligns to 3:125/127 of 3vczB

query
sites
3vczB
V
 
V
I
 
L
H
 
H
T
 
T
E
 
D
N
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
S
 
I
Q
 
Q
A
 
G
L
 
V
A
 
D
F
 
L
D
 
G
K
 
N
L
 
M
V
 
V
F
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
L
 
V
D
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
M
 
-
A
 
G
F
 
E
V
 
V
E
 
P
G
 
A
G
 
D
I
 
I
K
 
A
E
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
R
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
K
 
D
N
 
N
L
 
V
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
V
E
 
E
Q
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
L
G
 
T
T
 
V
D
 
G
T
 
D
V
 
I
L
 
V
K
 
K
T
 
M
T
 
T
C
 
V
F
 
F
L
 
V
A
 
K
N
x
D
M
 
L
E
x
N
D
 
D
F
 
F
V
 
G
A
 
T
F
 
V
N
 
N
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
T
 
G
E
 
N
V
 
F
F
 
F
G
 
D
T
 
E
E
 
H
A
 
N
A
 
V
-
 
A
-
 
H
-
 
Y
P
 
P
A
 
A
R
 
R
S
 
S
C
 
C
V
 
V
Q
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
P
 
P
K
 
K
D
 
D
A
 
V
L
 
G
V
 
I
E
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A

2b33B Crystal structure of a putative endoribonuclease (tm0215) from thermotoga maritima msb8 at 2.30 a resolution
46% identity, 97% coverage: 2:124/127 of query aligns to 1:122/126 of 2b33B

query
sites
2b33B
K
 
K
T
 
R
V
 
F
I
 
V
H
 
E
T
 
T
E
 
D
N
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
K
A
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
V
F
 
V
D
 
G
K
 
N
L
 
M
V
 
M
F
 
F
T
 
V
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
L
 
I
D
|
D
P
 
P
A
x
E
T
 
T
M
 
G
A
 
E
F
 
L
V
 
V
E
 
Q
G
 
G
G
 
T
I
 
I
K
 
E
E
 
E
Q
 
K
A
 
T
Y
 
E
Q
 
R
S
 
V
L
 
L
K
 
E
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
I
L
 
L
E
 
E
Q
 
A
A
 
G
G
 
G
A
 
F
G
 
S
T
 
L
D
 
K
T
 
D
V
 
V
L
 
V
K
 
K
T
 
V
T
 
T
C
 
V
F
 
F
L
 
T
A
 
T
N
 
S
M
 
M
E
 
D
D
 
Y
F
 
F
V
 
Q
A
 
R
F
 
V
N
 
N
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
T
 
S
E
 
R
V
 
Y
F
 
F
G
 
G
T
 
-
E
 
D
A
 
H
A
 
R
P
 
P
A
 
A
R
 
R
S
 
S
C
 
F
V
 
V
Q
 
A
A
 
V
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
K
 
R
D
 
N
A
 
V
L
 
E
V
 
I
E
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A

P80601 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; 14.3 kDa perchloric acid soluble protein; Translation inhibitor L-PSP ribonuclease; UK114 antigen; EC 3.5.99.10; EC 3.1.-.- from Capra hircus (Goat) (see paper)
47% identity, 98% coverage: 1:124/127 of query aligns to 5:127/137 of P80601

query
sites
P80601
M
 
V
K
 
R
T
 
R
V
 
I
I
 
I
H
 
S
T
 
T
E
 
A
N
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
L
F
 
V
D
 
D
K
 
R
L
 
T
V
 
I
F
 
Y
T
 
I
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
P
 
G
L
 
M
D
 
D
P
 
P
A
 
A
T
 
S
M
 
G
A
 
Q
F
 
L
V
 
V
E
 
P
G
 
G
G
 
G
I
 
V
K
 
V
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
Y
 
K
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
K
 
T
N
 
N
L
 
I
K
 
G
A
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
C
G
 
D
T
 
F
D
 
T
T
 
N
V
 
V
L
 
V
K
 
K
T
 
A
T
 
T
C
 
V
F
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
D
M
 
I
E
 
N
D
 
D
F
 
F
V
 
S
A
 
A
F
 
V
N
 
N
E
 
D
V
 
V
Y
 
Y
T
 
K
E
 
Q
V
 
Y
F
 
F
G
 
-
T
 
Q
E
 
S
A
 
S
A
 
F
P
 
P
A
 
A
R
 
R
S
 
A
C
 
A
V
 
Y
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
R
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
K
D
 
G
A
 
G
L
 
R
V
 
V
E
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2uynA Crystal structure of e. Coli tdcf with bound 2-ketobutyrate (see paper)
46% identity, 97% coverage: 2:124/127 of query aligns to 1:124/127 of 2uynA

query
sites
2uynA
K
 
K
T
 
K
V
 
I
I
 
I
H
 
E
T
 
T
E
 
Q
N
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
S
 
V
Q
 
Q
A
 
G
L
 
V
A
 
D
F
 
L
D
 
G
K
 
S
L
 
M
V
 
V
F
 
F
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
L
 
V
D
 
C
P
 
P
A
 
Q
T
 
T
M
 
-
A
 
G
F
 
E
V
 
I
E
 
P
G
 
A
G
 
D
I
 
V
K
 
Q
E
 
D
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
R
Q
 
L
S
 
S
L
 
L
K
 
E
N
 
N
L
 
V
K
 
K
A
 
A
V
 
I
L
 
V
E
 
V
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
L
G
 
S
T
 
V
D
 
G
T
 
D
V
 
I
L
 
I
K
 
K
T
 
M
T
 
T
C
 
V
F
 
F
L
 
I
A
 
T
N
 
D
M
 
L
E
 
N
D
 
D
F
|
F
V
 
A
A
 
T
F
 
I
N
 
N
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
T
 
K
E
 
Q
V
 
F
F
 
F
G
 
D
T
 
E
E
 
H
A
 
Q
A
 
A
-
 
T
-
 
Y
P
 
P
A
 
T
R
|
R
S
|
S
C
|
C
V
 
V
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
P
 
P
K
 
K
D
 
D
A
 
V
L
 
K
V
 
L
E
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A

2uykC Crystal structure of e. Coli tdcf with bound serine (see paper)
46% identity, 97% coverage: 2:124/127 of query aligns to 1:124/127 of 2uykC

query
sites
2uykC
K
 
K
T
 
K
V
 
I
I
 
I
H
 
E
T
 
T
E
 
Q
N
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
S
 
V
Q
 
Q
A
 
G
L
 
V
A
 
D
F
 
L
D
 
G
K
 
S
L
 
M
V
 
V
F
 
F
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
L
 
V
D
 
C
P
 
P
A
 
Q
T
 
T
M
 
-
A
 
G
F
 
E
V
 
I
E
 
P
G
 
A
G
 
D
I
 
V
K
 
Q
E
 
D
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
R
Q
 
L
S
 
S
L
 
L
K
 
E
N
 
N
L
 
V
K
 
K
A
 
A
V
 
I
L
 
V
E
 
V
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
L
G
 
S
T
 
V
D
 
G
T
 
D
V
 
I
L
 
I
K
 
K
T
 
M
T
 
T
C
 
V
F
 
F
L
 
I
A
 
T
N
 
D
M
 
L
E
 
N
D
 
D
F
 
F
V
 
A
A
 
T
F
 
I
N
 
N
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
T
 
K
E
 
Q
V
 
F
F
 
F
G
 
D
T
 
E
E
 
H
A
 
Q
A
 
A
-
 
T
-
 
Y
P
 
P
A
 
T
R
|
R
S
|
S
C
|
C
V
 
V
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
P
 
P
K
 
K
D
 
D
A
 
V
L
 
K
V
 
L
E
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A

8yrcA Chlorinated yabj from staphylococcus aureus (see paper)
46% identity, 98% coverage: 4:127/127 of query aligns to 4:125/125 of 8yrcA

query
sites
8yrcA
V
 
I
I
 
I
H
 
N
T
 
T
E
 
T
N
 
R
A
 
L
P
|
P
A
 
E
A
 
A
I
 
L
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
Q
x
H
A
 
A
L
 
T
A
 
V
F
 
V
D
 
N
K
 
G
L
 
M
V
 
V
F
 
Y
T
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
|
Q
L
 
I
P
 
P
L
 
L
D
 
N
P
 
-
A
 
V
T
 
D
M
 
G
A
 
K
F
 
I
V
 
V
E
 
S
G
 
A
G
 
D
I
 
V
K
 
Q
E
 
A
Q
 
Q
A
 
T
Y
 
K
Q
 
Q
S
 
V
L
 
L
K
 
E
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
S
G
 
D
T
 
L
D
 
N
T
 
S
V
 
V
L
 
A
K
 
K
T
 
A
T
 
T
C
 
I
F
 
F
L
 
I
A
 
K
N
 
D
M
 
M
E
 
N
D
 
D
F
 
F
V
 
Q
A
 
K
F
 
I
N
 
N
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
T
 
G
E
 
Q
V
 
Y
F
 
F
G
 
N
T
 
-
E
 
E
A
 
H
A
 
K
P
 
P
A
 
A
R
 
R
S
 
S
C
 
C
V
 
V
Q
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
P
 
P
K
 
K
D
 
D
A
 
V
L
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
L
I
 
V
A
 
S
F
 
K
T
 
I
K
 
K

P52759 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; Liver perchloric acid-soluble protein; L-PSP; Reactive intermediate imine deaminase A homolog; Translation inhibitor L-PSP ribonuclease; UK114 antigen homolog; rp14.5; EC 3.5.99.10 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
46% identity, 98% coverage: 1:124/127 of query aligns to 5:127/137 of P52759

query
sites
P52759
M
 
I
K
 
R
T
 
K
V
 
V
I
 
I
H
 
S
T
 
T
E
 
S
N
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
A
Y
 
Y
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
L
F
 
V
D
 
D
K
 
R
L
 
T
V
 
I
F
 
Y
T
 
V
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
P
 
G
L
 
M
D
 
D
P
 
P
A
 
S
T
 
S
M
 
G
A
 
Q
F
 
L
V
 
V
E
 
P
G
 
G
G
 
G
I
 
V
K
 
A
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
Y
 
K
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
G
A
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
C
G
 
D
T
 
F
D
 
T
T
 
N
V
 
V
L
 
V
K
 
K
T
 
T
T
 
T
C
 
V
F
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
D
M
 
I
E
 
N
D
 
D
F
 
F
V
 
G
A
 
T
F
 
V
N
 
N
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
T
 
K
E
 
T
V
 
Y
F
 
F
G
 
Q
T
 
G
E
 
N
A
 
-
A
 
L
P
 
P
A
 
A
R
 
R
S
 
A
C
 
A
V
 
Y
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
R
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
K
D
 
G
A
 
S
L
 
R
V
 
I
E
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q94JQ4 Reactive Intermediate Deaminase A, chloroplastic; 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; EC 3.5.99.10 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
47% identity, 97% coverage: 2:124/127 of query aligns to 64:185/187 of Q94JQ4

query
sites
Q94JQ4
K
 
K
T
 
E
V
 
V
I
 
V
H
 
S
T
 
T
E
 
E
N
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
K
F
 
A
D
 
N
K
 
N
L
 
L
V
 
V
F
 
F
T
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
V
L
 
L
P
 
G
L
 
L
D
 
I
P
 
P
A
 
E
T
 
T
M
 
G
A
 
K
F
 
F
V
 
V
E
 
S
G
 
E
G
 
S
I
 
V
K
 
E
E
 
D
Q
 
Q
A
 
T
Y
 
E
Q
 
Q
S
 
V
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
M
K
 
G
A
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
Q
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
D
T
 
Y
D
 
S
T
 
S
V
 
V
L
 
V
K
 
K
T
 
T
T
 
T
C
 
I
F
 
M
L
 
L
A
 
A
N
 
D
M
 
L
E
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
K
A
 
T
F
 
V
N
 
N
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
T
 
A
E
 
K
V
 
Y
F
 
F
G
 
P
T
 
A
E
 
P
A
 
-
A
 
S
P
 
P
A
 
A
R
|
R
S
 
S
C
 
T
V
 
Y
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
R
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
L
D
 
N
A
 
A
L
 
K
V
 
I
E
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
C
I
 
I
A
 
A

3k0tC Crystal structure of pspto -psp protein in complex with d-beta-glucose from pseudomonas syringae pv. Tomato str. Dc3000 (see paper)
45% identity, 96% coverage: 2:123/127 of query aligns to 1:120/124 of 3k0tC

query
sites
3k0tC
K
 
K
T
 
T
V
 
V
I
 
I
H
 
T
T
 
S
E
 
D
N
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
K
F
 
A
D
 
G
K
 
N
L
 
T
V
 
V
F
 
Y
T
 
M
S
 
S
G
|
G
Q
 
Q
L
x
I
P
 
P
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
S
T
 
T
M
 
M
A
 
E
F
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
-
G
 
G
I
 
I
K
 
E
E
 
A
Q
 
Q
A
 
I
Y
 
T
Q
 
Q
S
 
V
L
 
F
K
 
E
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
S
V
 
V
L
 
A
E
 
Q
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
G
G
 
S
T
 
F
D
 
K
T
 
D
V
 
I
L
 
V
K
 
K
T
 
L
T
 
N
C
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
T
N
 
D
M
 
L
E
 
G
D
 
H
F
|
F
V
 
A
A
 
K
F
 
V
N
 
N
E
 
E
V
 
I
Y
 
M
T
 
G
E
 
S
V
 
Y
F
 
F
G
 
-
T
 
S
E
 
Q
A
 
P
A
 
Y
P
 
P
A
 
A
R
|
R
S
 
A
C
 
A
V
 
I
Q
 
G
A
 
V
A
 
A
R
 
A
L
 
L
P
 
P
K
x
R
D
 
G
A
 
A
L
 
Q
V
 
V
E
|
E
V
 
M
E
 
D
A
 
A
I
 
I

A0A1J1DL12 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; Allergen Der f 34; Enamine/imine deaminase; Allergen Der f 34.0101; EC 3.5.99.10 from Dermatophagoides farinae (American house dust mite) (see paper)
44% identity, 96% coverage: 2:123/127 of query aligns to 4:124/128 of A0A1J1DL12

query
sites
A0A1J1DL12
K
 
K
T
 
R
V
 
I
I
 
I
H
 
S
T
 
T
E
 
P
N
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
Q
A
 
P
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
Q
F
 
V
D
 
G
K
 
N
L
 
T
V
 
V
F
 
Y
T
 
L
S
 
S
G
|
G
Q
 
Q
L
 
I
P
 
G
L
 
M
D
 
N
P
 
V
A
 
R
T
 
T
M
 
N
A
 
E
F
 
M
V
 
V
E
 
T
G
 
G
G
 
P
I
 
I
K
 
R
E
 
D
Q
 
E
A
 
A
Y
 
Q
Q
 
Q
S
 
A
L
 
F
K
 
T
N
|
N
L
 
M
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
V
E
 
E
Q
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
K
T
 
M
D
 
S
T
 
D
V
 
V
L
 
V
K
 
K
T
 
V
T
 
N
C
 
I
F
 
F
L
 
I
A
 
R
N
 
N
M
 
F
E
 
N
D
 
D
F
 
F
V
 
P
A
 
A
F
 
I
N
|
N
E
 
D
V
 
V
Y
 
M
T
 
K
E
 
E
V
 
F
F
 
F
G
 
Q
T
 
S
E
 
-
A
 
P
A
 
F
P
 
P
A
 
A
R
|
R
S
 
S
C
 
T
V
 
V
Q
 
G
A
 
V
A
 
A
R
 
E
L
 
L
P
|
P
K
 
K
D
 
N
A
 
A
L
 
R
V
 
V
E
|
E
V
 
I
E
 
E
A
 
S
I
 
I

Sites not aligning to the query:

5hp8A Crystal structures of rida in complex with pyruvate (see paper)
44% identity, 84% coverage: 18:124/127 of query aligns to 1:106/108 of 5hp8A

query
sites
5hp8A
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
K
F
 
A
D
 
N
K
 
N
L
 
L
V
 
V
F
 
F
T
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
V
L
 
L
P
 
G
L
 
L
D
 
I
P
 
P
A
 
E
T
 
T
M
 
G
A
 
K
F
 
F
V
 
V
E
 
S
G
 
E
G
 
S
I
 
V
K
 
E
E
 
D
Q
 
Q
A
 
T
Y
 
E
Q
 
Q
S
 
V
L
 
L
K
 
K
N
 
N
L
 
M
K
 
G
A
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
Q
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
D
T
 
Y
D
 
S
T
 
S
V
 
V
L
 
V
K
 
K
T
 
T
T
 
T
C
 
I
F
 
M
L
 
L
A
 
A
N
 
D
M
 
L
E
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
K
A
 
T
F
 
V
N
 
N
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
T
 
A
E
 
K
V
 
Y
F
 
F
G
 
P
T
 
A
E
 
-
A
 
P
A
 
S
P
 
P
A
 
A
R
|
R
S
 
S
C
x
T
V
 
Y
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
R
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
L
D
 
N
A
 
A
L
 
K
V
 
I
E
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
C
I
 
I
A
 
A

P0AFQ5 3-aminoacrylate deaminase RutC; 3-AA deaminase; EC 3.5.-.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
31% identity, 97% coverage: 2:124/127 of query aligns to 3:124/128 of P0AFQ5

query
sites
P0AFQ5
K
 
K
T
 
S
V
 
V
I
 
I
H
 
I
T
 
P
E
 
A
N
 
G
A
 
S
P
 
S
A
 
A
A
 
P
I
 
L
G
 
A
P
 
P
Y
 
F
S
 
V
Q
 
P
A
 
G
L
 
T
A
 
L
F
 
A
D
 
D
K
 
G
L
 
V
V
 
V
F
 
Y
T
 
V
S
 
S
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
P
 
A
L
 
F
D
 
D
P
 
Q
A
 
H
T
 
N
M
 
N
A
 
V
F
 
L
V
 
F
E
 
A
G
 
D
G
 
D
I
 
P
K
 
K
E
 
A
Q
 
Q
A
 
T
Y
 
R
Q
 
H
S
 
V
L
 
L
K
 
E
N
 
T
L
 
I
K
 
R
A
 
K
V
 
V
L
 
I
E
 
E
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
G
G
 
T
T
 
M
D
 
A
T
 
D
V
 
V
L
 
T
K
 
F
T
 
N
T
 
S
C
 
I
F
 
F
L
 
I
A
 
T
N
 
D
M
 
W
E
 
K
D
 
N
F
 
Y
V
 
A
A
 
A
F
 
I
N
 
N
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
T
 
A
E
 
E
V
 
F
F
 
F
G
 
P
T
 
G
E
 
D
A
 
-
A
 
K
P
 
P
A
 
A
R
|
R
S
 
F
C
 
C
V
 
I
Q
 
Q
A
 
C
A
 
G
R
 
L
L
 
V
P
 
K
K
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
I
E
 
A
A
 
T
I
 
I
A
 
A

9bk8A Crystal structure of rida family protein pa5083 from pseudomonas aeruginosa with 2-ketobutyric acid bound
36% identity, 84% coverage: 18:124/127 of query aligns to 13:113/116 of 9bk8A

query
sites
9bk8A
S
 
S
Q
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
C
F
 
F
D
 
D
K
 
A
L
 
L
V
 
V
F
 
F
T
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
P
 
P
L
 
G
D
 
Q
P
 
A
A
 
E
T
 
-
M
 
-
A
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
D
I
 
I
K
 
H
E
 
G
Q
 
Q
A
 
T
Y
 
R
Q
 
E
S
 
V
L
 
L
K
 
A
N
 
K
L
 
I
K
 
D
A
 
A
V
 
L
L
 
L
E
 
A
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
S
G
 
R
T
 
K
D
 
E
T
 
R
V
 
I
L
 
L
K
 
S
T
 
A
T
 
T
C
 
I
F
 
Y
L
 
L
A
 
K
N
 
D
M
 
I
-
 
A
E
 
R
D
 
D
F
 
F
V
 
A
A
 
A
F
 
L
N
 
N
E
 
E
V
 
V
Y
 
W
T
 
T
E
 
Q
V
 
W
F
 
L
G
 
P
T
 
T
E
 
G
A
 
Q
A
 
A
P
 
P
A
 
S
R
|
R
S
x
T
C
x
T
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
E
R
 
L
L
 
A
P
 
R
K
 
P
D
 
S
A
 
V
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
I
E
 
T
A
 
V
I
 
V
A
 
A

9bk4A Crystal structure of rida family protein pa5083 from pseudomonas aeruginosa with pyruvic acid bound
36% identity, 84% coverage: 18:124/127 of query aligns to 13:113/116 of 9bk4A

query
sites
9bk4A
S
 
S
Q
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
C
F
 
F
D
 
D
K
 
A
L
 
L
V
 
V
F
 
F
T
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
P
 
P
L
 
G
D
 
Q
P
 
A
A
 
E
T
 
-
M
 
-
A
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
D
I
 
I
K
 
H
E
 
G
Q
 
Q
A
 
T
Y
 
R
Q
 
E
S
 
V
L
 
L
K
 
A
N
 
K
L
 
I
K
 
D
A
 
A
V
 
L
L
 
L
E
 
A
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
S
G
 
R
T
 
K
D
 
E
T
 
R
V
 
I
L
 
L
K
 
S
T
 
A
T
 
T
C
 
I
F
 
Y
L
 
L
A
 
K
N
 
D
M
 
I
-
 
A
E
 
R
D
 
D
F
 
F
V
 
A
A
 
A
F
 
L
N
 
N
E
 
E
V
 
V
Y
 
W
T
 
T
E
 
Q
V
 
W
F
 
L
G
 
P
T
 
T
E
 
G
A
 
Q
A
 
A
P
 
P
A
 
S
R
|
R
S
x
T
C
x
T
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
E
R
 
L
L
 
A
P
 
R
K
 
P
D
 
S
A
 
V
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
I
E
 
T
A
 
V
I
 
V
A
 
A

9bjyA Crystal structure of rida family protein pa5083 from pseudomonas aeruginosa with tmao bound
36% identity, 84% coverage: 18:124/127 of query aligns to 11:111/113 of 9bjyA

query
sites
9bjyA
S
 
S
Q
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
C
F
 
F
D
 
D
K
 
A
L
 
L
V
 
V
F
 
F
T
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
P
 
P
L
 
G
D
 
Q
P
 
A
A
 
E
T
 
-
M
 
-
A
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
D
I
 
I
K
 
H
E
 
G
Q
 
Q
A
 
T
Y
 
R
Q
 
E
S
 
V
L
 
L
K
 
A
N
 
K
L
 
I
K
 
D
A
 
A
V
 
L
L
 
L
E
 
A
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
S
G
 
R
T
 
K
D
 
E
T
 
R
V
 
I
L
 
L
K
 
S
T
 
A
T
 
T
C
 
I
F
 
Y
L
 
L
A
 
K
N
 
D
M
 
I
-
 
A
E
 
R
D
 
D
F
 
F
V
 
A
A
 
A
F
 
L
N
 
N
E
 
E
V
 
V
Y
 
W
T
 
T
E
 
Q
V
 
W
F
 
L
G
 
P
T
 
T
E
 
G
A
 
Q
A
 
A
P
 
P
A
 
S
R
 
R
S
x
T
C
x
T
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
E
R
 
L
L
 
A
P
 
R
K
 
P
D
 
S
A
 
V
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
I
E
 
T
A
 
V
I
 
V
A
 
A

3i3fB Hypothetical protein from giardia lamblia gl50803_14299
33% identity, 80% coverage: 19:120/127 of query aligns to 18:120/128 of 3i3fB

query
sites
3i3fB
Q
 
Q
A
 
I
L
 
A
A
 
V
F
 
V
D
 
N
K
 
G
L
 
M
V
 
V
F
 
Y
T
 
L
S
 
G
G
 
G
Q
 
S
L
 
V
P
 
G
L
 
I
D
 
D
P
 
K
A
 
S
T
 
-
M
 
-
A
 
G
F
 
T
V
 
L
E
 
H
G
 
K
G
 
G
I
 
L
K
 
E
E
 
E
Q
 
Q
A
 
T
Y
 
R
Q
 
Q
S
 
T
L
 
F
K
 
D
N
 
N
L
 
I
K
 
R
A
 
K
V
 
C
L
 
L
E
 
E
Q
 
Y
A
 
A
G
 
N
A
 
S
G
 
G
T
 
L
D
 
D
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
K
 
S
T
 
L
T
 
N
C
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
S
-
 
T
N
 
S
M
 
L
E
 
S
D
 
D
F
 
S
-
 
E
-
 
E
V
 
A
A
 
R
F
 
F
N
 
N
E
 
E
V
 
L
Y
 
Y
T
 
R
E
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
C
T
 
V
E
 
P
A
 
A
A
 
T
-
 
R
P
 
P
A
 
C
R
|
R
S
x
C
C
|
C
V
 
V
Q
 
R
A
 
-
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
P
x
Q
K
 
E
D
 
G
A
 
L
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3i3fA Hypothetical protein from giardia lamblia gl50803_14299
33% identity, 80% coverage: 19:120/127 of query aligns to 21:123/131 of 3i3fA

query
sites
3i3fA
Q
 
Q
A
 
I
L
 
A
A
 
V
F
 
V
D
 
N
K
 
G
L
 
M
V
 
V
F
 
Y
T
 
L
S
 
G
G
|
G
Q
 
S
L
 
V
P
 
G
L
 
I
D
 
D
P
 
K
A
 
S
T
 
-
M
 
-
A
 
G
F
 
T
V
 
L
E
 
H
G
 
K
G
 
G
I
 
L
K
 
E
E
 
E
Q
 
Q
A
 
T
Y
 
R
Q
 
Q
S
 
T
L
 
F
K
 
D
N
 
N
L
 
I
K
 
R
A
 
K
V
 
C
L
 
L
E
 
E
Q
 
Y
A
 
A
G
 
N
A
 
S
G
 
G
T
 
L
D
 
D
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
K
 
S
T
 
L
T
 
N
C
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
S
-
 
T
N
 
S
M
 
L
E
 
S
D
 
D
F
 
S
-
 
E
-
 
E
V
 
A
A
 
R
F
 
F
N
 
N
E
 
E
V
 
L
Y
 
Y
T
 
R
E
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
C
T
 
V
E
 
P
A
 
A
A
 
T
-
 
R
P
 
P
A
 
C
R
|
R
S
x
C
C
|
C
V
 
V
Q
 
R
A
 
-
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
P
 
Q
K
 
E
D
 
G
A
 
L
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012275299.1 NCBI__GCF_000019185.1:WP_012275299.1
MKTVIHTENAPAAIGPYSQALAFDKLVFTSGQLPLDPATMAFVEGGIKEQAYQSLKNLKA
VLEQAGAGTDTVLKTTCFLANMEDFVAFNEVYTEVFGTEAAPARSCVQAARLPKDALVEV
EAIAFTK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory