SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012277222.1 NCBI__GCF_000019185.1:WP_012277222.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

O53547 Hydroxyacyl-CoA dehydrogenase ChsB1; EC 1.1.1.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
40% identity, 96% coverage: 7:285/292 of query aligns to 21:306/317 of O53547

query
sites
O53547
R
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
G
 
A
G
 
A
G
 
G
L
|
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Y
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
|
D
I
 
V
R
 
A
A
 
S
G
 
A
A
 
L
A
 
D
A
 
A
A
 
S
-
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
L
 
G
T
 
A
Q
 
A
G
 
A
G
 
A
Q
 
D
A
 
A
I
 
G
A
 
A
N
 
K
S
 
A
D
 
V
-
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
G
D
|
D
I
|
I
T
 
S
R
 
Q
M
 
R
D
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
D
N
 
E
I
 
L
V
 
L
D
 
A
A
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
-
A
 
G
F
 
L
G
 
G
E
 
G
V
 
L
H
 
D
V
 
I
L
 
V
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
T
A
 
R
D
 
D
R
 
R
M
 
M
F
 
L
I
 
F
S
 
N
L
 
M
S
 
S
E
 
D
A
 
E
D
 
E
W
 
W
D
 
D
K
 
A
V
 
V
M
 
I
Q
 
A
V
 
V
H
 
H
L
 
L
K
 
R
G
 
G
H
 
H
F
 
F
C
 
L
L
 
L
A
 
T
N
 
R
I
 
N
L
 
A
G
 
A
R
 
A
R
 
Y
W
 
W
R
 
R
D
 
D
L
 
K
A
 
A
K
 
K
-
 
D
-
 
A
A
 
E
G
 
G
Q
 
G
P
 
S
V
 
V
D
 
F
A
 
G
R
 
R
I
 
L
I
 
V
N
 
N
T
 
T
S
 
S
S
|
S
G
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
V
G
 
G
S
 
P
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
S
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
L
V
 
S
Q
 
A
A
 
A
A
 
R
E
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
T
 
C
V
 
A
N
 
N
A
 
V
L
 
I
A
 
C
P
 
P
A
 
R
A
 
A
R
 
R
T
|
T
S
 
A
M
 
M
T
 
T
Q
 
A
S
 
D
-
 
V
-
 
F
-
 
G
A
 
A
M
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
-
K
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
E
D
 
A
G
 
G
S
 
Q
F
 
I
D
 
D
L
 
P
W
 
L
A
 
S
P
 
P
E
 
Q
N
 
H
V
 
V
A
 
V
P
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
Q
W
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
S
 
P
E
 
A
S
 
A
K
 
A
H
 
E
I
 
V
S
 
N
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
L
 
F
E
 
I
S
 
V
Q
 
Y
G
 
G
G
 
P
R
 
Q
I
 
V
S
 
T
L
 
L
C
 
V
D
 
S
G
 
P
-
 
P
-
 
H
W
 
M
R
 
E
T
 
R
G
 
R
L
 
F
T
 
S
V
 
A
D
 
D
H
 
-
G
 
G
K
 
T
R
 
S
W
 
W
D
 
D
I
 
P
A
 
T
E
 
E
V
 
L
G
 
T
P
 
A
A
 
T
I
 
L
-
 
R
D
 
D
Q
 
Y
L
 
F
I
 
A
G
 
G
K
 
R
A
 
D
P
 
P
K
 
E

P22414 Peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase; HDE; Multifunctional beta-oxidation protein; MFP; EC 4.2.1.119; EC 1.1.1.n12 from Candida tropicalis (Yeast) (see paper)
39% identity, 86% coverage: 7:258/292 of query aligns to 9:252/906 of P22414

query
sites
P22414
R
 
K
T
 
V
V
 
V
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
K
A
 
Y
Y
 
Y
A
 
S
L
 
L
A
 
E
L
 
F
A
 
A
A
 
K
E
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
D
I
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
R
 
N
A
 
S
G
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
D
A
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
L
 
V
T
 
K
Q
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
N
 
D
S
 
Y
D
 
N
D
 
N
I
 
V
T
 
L
R
 
D
M
 
G
D
 
D
T
 
-
A
 
-
T
 
-
N
 
K
I
 
I
V
 
V
D
 
E
A
 
T
A
 
A
L
 
V
E
 
K
A
 
N
F
 
F
G
 
G
E
 
T
V
 
V
H
 
H
V
 
V
L
 
I
I
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
L
A
 
R
D
 
D
R
 
A
M
 
S
F
 
M
I
 
K
S
 
K
L
 
M
S
 
T
E
 
E
A
 
K
D
 
D
W
 
Y
D
 
K
K
 
L
V
 
V
M
 
I
Q
 
D
V
 
V
H
 
H
L
 
L
K
 
N
G
 
G
H
 
A
F
 
F
C
 
A
L
 
V
A
 
T
N
 
K
I
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
A
R
 
A
W
 
W
R
 
P
D
 
Y
L
 
F
A
 
Q
K
 
K
A
 
Q
G
 
K
Q
 
Y
P
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
T
 
T
S
 
S
S
 
S
G
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
Y
G
 
G
S
 
N
I
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
 
Y
S
 
A
A
 
S
A
 
A
K
 
K
G
 
S
G
 
A
I
 
L
A
 
L
S
 
G
L
 
F
T
 
A
L
 
E
V
 
T
Q
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
E
L
 
G
G
 
A
R
 
K
Y
 
Y
G
 
N
V
 
I
T
 
K
V
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
S
S
 
R
M
 
M
T
 
T
Q
 
E
S
 
S
A
 
I
M
 
L
P
 
P
D
 
P
V
 
P
V
 
M
K
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
L
D
 
E
L
 
K
W
 
L
A
 
G
P
 
P
E
 
E
N
 
K
V
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
L
W
 
Y
L
 
L
S
 
S
S
 
S
S
 
A
E
 
E
S
 
N
K
 
E
H
 
-
I
 
L
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
F
L
 
F
E
 
E
S
 
V
Q
 
A
G
 
A
G
 
G
R
 
F
I
 
Y
S
 
A
L
 
Q
C
 
I
D
 
R
G
 
W
W
 
E
R
 
R
T
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7lgbA Chsb1 in complex with NAD+ (see paper)
41% identity, 91% coverage: 7:272/292 of query aligns to 6:270/282 of 7lgbA

query
sites
7lgbA
R
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
G
 
A
G
 
A
G
|
G
L
|
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Y
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
|
D
I
x
V
R
 
A
A
 
S
G
 
A
A
 
L
A
 
D
A
 
A
A
 
S
-
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
L
 
G
T
 
A
Q
 
A
G
 
D
G
 
A
Q
 
G
A
 
A
I
 
K
A
 
A
N
 
V
S
 
A
D
 
V
-
 
A
-
x
G
D
|
D
I
|
I
T
 
S
R
 
Q
M
 
R
D
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
D
N
 
E
I
 
L
V
 
L
D
 
A
A
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
-
A
 
G
F
 
L
G
 
G
E
 
G
V
 
L
H
 
D
V
 
I
L
 
V
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
L
 
T
A
 
R
D
 
D
R
 
R
M
 
M
F
 
L
I
 
F
S
 
N
L
 
M
S
 
S
E
 
D
A
 
E
D
 
E
W
 
W
D
 
D
K
 
A
V
 
V
M
 
I
Q
 
A
V
|
V
H
 
H
L
 
L
K
 
R
G
 
G
H
 
H
F
 
F
C
 
L
L
 
L
A
 
T
N
 
R
I
 
N
L
 
A
G
 
A
R
 
A
R
 
Y
W
 
W
R
 
R
D
 
D
L
 
K
A
 
A
K
 
K
-
 
D
-
 
A
A
 
E
G
 
G
Q
 
G
P
 
S
V
 
V
D
 
F
A
 
G
R
 
R
I
 
L
I
 
V
N
 
N
T
|
T
S
 
S
S
|
S
G
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
V
G
 
G
S
 
P
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
S
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
L
V
 
S
Q
 
A
A
 
A
A
 
R
E
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
T
 
C
V
 
A
N
 
N
A
 
V
L
 
I
A
 
C
P
|
P
A
 
R
A
 
A
R
 
R
T
|
T
S
 
A
M
|
M
T
|
T
Q
 
A
S
 
-
A
 
-
M
 
-
P
 
-
D
 
D
V
 
V
V
 
F
-
 
G
K
 
A
K
 
A
P
 
P
E
 
Q
D
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
I
D
 
D
L
 
P
W
 
L
A
 
S
P
 
P
E
 
Q
N
 
H
V
 
V
A
 
V
P
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
Q
W
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
S
 
P
E
 
A
S
 
A
K
 
A
H
 
E
I
 
V
S
 
N
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
L
 
F
E
 
I
S
 
V
Q
 
Y
G
 
G
G
 
P
R
 
Q
I
 
V
S
 
T
L
 
L
C
 
V
D
 
S
G
 
P
-
 
P
-
 
H
W
 
M
R
 
E
T
 
R
G
 
R
L
 
F
T
 
S
V
 
A
D
 
D
H
 
-
G
 
G
K
 
T
R
 
S
W
 
W
D
 
D
I
 
P
A
 
T
E
 
E
V
 
L

P51659 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2; MFE-2; 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 4; 17-beta-HSD 4; D-bifunctional protein; DBP; Multifunctional protein 2; MFP-2; Short chain dehydrogenase/reductase family 8C member 1; EC 1.1.1.n12; EC 4.2.1.107; EC 4.2.1.119 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
40% identity, 86% coverage: 5:255/292 of query aligns to 8:243/736 of P51659

query
sites
P51659
N
 
D
S
 
G
R
 
R
T
 
V
V
 
V
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
N
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
D
I
 
L
R
 
G
A
 
G
G
 
D
-
 
F
-
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
D
A
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
R
T
 
R
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
N
 
N
S
 
Y
D
 
D
D
 
S
I
 
V
T
 
-
R
 
-
M
 
-
D
 
E
T
 
E
A
 
G
T
 
E
N
 
K
I
 
V
V
 
V
D
 
K
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
R
V
 
I
H
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
L
A
 
R
D
 
D
R
|
R
M
 
S
F
 
F
I
 
A
S
 
R
L
 
I
S
 
S
E
 
D
A
 
E
D
 
D
W
 
W
D
 
D
K
 
I
V
 
I
M
 
H
Q
 
R
V
 
V
H
 
H
L
 
L
K
 
R
G
 
G
H
 
S
F
 
F
C
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
Q
I
 
V
L
 
T
G
 
R
R
 
A
R
 
A
W
 
W
R
 
E
D
 
H
L
 
M
A
 
K
K
 
K
A
 
Q
G
 
K
Q
 
Y
P
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
M
T
 
T
S
 
S
S
 
S
G
 
A
A
 
S
G
 
G
L
 
I
Q
 
Y
G
 
G
S
 
N
I
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
L
S
 
G
L
 
L
T
 
A
L
 
N
V
 
S
Q
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
G
G
 
R
R
 
K
Y
 
S
G
 
N
V
 
I
T
 
H
V
 
C
N
 
N
A
 
T
L
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
N
A
 
A
R
 
G
T
 
S
S
 
R
M
 
M
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
V
M
 
M
P
 
P
-
 
E
D
 
D
V
 
L
V
 
V
K
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
D
 
E
L
 
A
W
 
L
A
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
Y
V
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
L
W
 
W
L
 
L
S
 
C
S
 
H
S
 
E
E
 
S
S
 
C
K
 
-
H
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
I
 
-
L
 
-
E
 
E
S
 
E
Q
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
L
I
 
F
S
 
E
L
 
V
C
 
G
D
 
A
G
 
G
W
 
W

Sites not aligning to the query:

P96825 Putative short-chain type dehydrogenase/reductase Rv0148; EC 1.1.1.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
40% identity, 80% coverage: 1:233/292 of query aligns to 1:229/286 of P96825

query
sites
P96825
M
 
M
K
 
P
A
 
G
C
 
V
N
 
Q
S
 
D
R
 
R
T
 
V
V
 
I
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
E
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
A
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
D
I
 
L
R
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
R
-
 
D
-
 
G
A
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
M
V
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
L
 
V
T
 
A
Q
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
D
-
 
K
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
I
 
V
A
 
A
N
 
N
S
 
Y
D
 
D
D
 
S
I
 
V
T
 
A
R
 
T
M
 
E
D
 
D
T
 
G
A
 
A
T
 
A
N
 
N
I
 
I
V
 
I
D
 
K
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
E
F
 
F
G
 
G
E
 
A
V
 
V
H
 
H
V
 
G
L
 
V
I
 
V
N
 
S
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
L
A
 
R
D
 
D
R
 
G
M
 
T
F
 
F
I
 
H
S
 
K
L
 
M
S
 
S
E
 
F
A
 
E
D
 
N
W
 
W
D
 
D
K
 
A
V
 
V
M
 
L
Q
 
K
V
 
V
H
 
H
L
 
L
K
 
Y
G
 
G
H
 
G
F
 
Y
C
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
H
I
 
V
L
 
L
G
 
R
R
 
A
R
 
A
W
 
W
R
 
P
D
 
H
L
 
F
A
 
R
K
 
E
A
 
Q
G
 
S
Q
 
Y
P
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
G
R
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
V
T
 
A
S
 
T
S
 
S
G
 
T
A
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
F
G
 
G
S
 
N
I
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
Y
 
Y
S
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
I
L
 
N
V
 
T
Q
 
L
A
 
A
A
 
L
E
 
E
L
 
G
G
 
A
R
 
K
Y
 
Y
G
 
N
V
 
I
T
 
H
V
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
I
A
 
A
R
 
A
T
 
T
S
 
R
M
 
M
T
 
T
Q
 
Q
S
 
D
A
 
I
M
 
L
P
 
P
D
 
-
V
 
-
V
 
-
K
 
-
K
 
-
P
 
P
E
 
E
D
 
-
G
 
-
S
 
V
F
 
L
D
 
E
L
 
K
W
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
E
N
 
F
V
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
V
V
 
V
V
 
A
W
 
Y
L
 
L
S
 
C
S
 
T
S
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1zbqA Crystal structure of human 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 4 in complex with NAD
40% identity, 86% coverage: 5:255/292 of query aligns to 6:241/302 of 1zbqA

query
sites
1zbqA
N
 
D
S
 
G
R
 
R
T
 
V
V
 
V
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
G
 
G
G
 
A
G
|
G
L
|
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
N
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
|
D
I
x
L
R
 
G
A
 
G
G
 
D
-
 
F
-
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
D
A
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
R
T
 
R
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
N
 
N
S
 
Y
D
 
D
D
x
S
I
x
V
T
 
-
R
 
-
M
 
-
D
 
E
T
 
E
A
 
G
T
 
E
N
 
K
I
 
V
V
 
V
D
 
K
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
R
V
 
I
H
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
L
 
L
A
 
R
D
 
D
R
 
R
M
 
S
F
 
F
I
 
A
S
 
R
L
 
I
S
 
S
E
 
D
A
 
E
D
 
D
W
 
W
D
 
D
K
 
I
V
 
I
M
 
H
Q
 
R
V
 
V
H
 
H
L
 
L
K
 
R
G
 
G
H
 
S
F
 
F
C
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
Q
I
 
V
L
 
T
G
 
R
R
 
A
R
 
A
W
 
W
R
 
E
D
 
H
L
 
M
A
 
K
K
 
K
A
 
Q
G
 
K
Q
 
Y
P
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
M
T
|
T
S
 
S
S
|
S
G
 
A
A
 
S
G
 
G
L
 
I
Q
 
Y
G
 
G
S
 
N
I
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
L
S
 
G
L
 
L
T
 
A
L
 
N
V
 
S
Q
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
G
G
 
R
R
 
K
Y
 
S
G
 
N
V
 
I
T
 
H
V
 
C
N
 
N
A
 
T
L
 
I
A
 
A
P
|
P
A
x
N
A
|
A
R
 
G
T
x
S
S
x
R
M
|
M
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
V
M
 
M
P
 
P
D
 
E
V
 
D
V
 
L
K
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
V
D
 
E
L
 
A
W
 
L
A
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
Y
V
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
L
W
 
W
L
 
L
S
 
C
S
 
H
S
 
-
E
 
-
S
 
-
K
 
-
H
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
E
I
 
S
L
 
C
E
 
E
S
 
E
Q
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
L
I
 
F
S
 
E
L
 
V
C
 
G
D
 
A
G
 
G
W
 
W

P97852 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2; MFE-2; 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 4; 17-beta-HSD 4; D-bifunctional protein; DBP; Multifunctional protein 2; MFP-2; EC 1.1.1.n12; EC 4.2.1.107; EC 4.2.1.119 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
39% identity, 86% coverage: 5:255/292 of query aligns to 8:243/735 of P97852

query
sites
P97852
N
 
D
S
 
G
R
 
R
T
 
V
V
 
V
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
x
A
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
A
|
A
Y
|
Y
A
|
A
L
|
L
A
|
A
L
x
F
A
|
A
A
x
E
E
x
R
G
|
G
A
|
A
N
x
L
V
|
V
V
|
V
V
|
V
N
|
N
D
|
D
I
 
L
R
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
F
-
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
G
A
 
S
G
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
D
A
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
R
T
 
R
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
N
 
N
S
 
Y
D
 
D
D
 
S
I
 
V
T
 
-
R
 
-
M
 
-
D
 
E
T
 
A
A
 
G
T
 
E
N
 
K
I
 
L
V
 
V
D
 
K
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
T
F
 
F
G
 
G
E
 
R
V
 
I
H
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
L
A
 
R
D
 
D
R
 
R
M
 
S
F
 
F
I
 
S
S
 
R
L
 
I
S
 
S
E
 
D
A
 
E
D
 
D
W
 
W
D
 
D
K
 
I
V
 
I
M
 
Q
Q
 
R
V
 
V
H
 
H
L
 
L
K
 
R
G
 
G
H
 
S
F
 
F
C
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
Q
I
 
V
L
 
T
G
 
R
R
 
A
R
 
A
W
 
W
R
 
D
D
 
H
L
 
M
A
 
K
K
 
K
A
 
Q
G
 
N
Q
 
Y
P
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
M
T
 
T
S
 
A
S
 
S
G
 
A
A
 
S
G
 
G
L
 
I
Q
 
Y
G
 
G
S
 
N
I
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
L
S
 
G
L
 
L
T
 
A
L
 
N
V
 
T
Q
 
L
A
 
V
A
 
I
E
 
E
L
 
G
G
 
R
R
 
K
Y
 
N
G
 
N
V
 
I
T
 
H
V
 
C
N
 
N
A
 
T
L
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
N
A
 
A
R
 
G
T
 
S
S
 
R
M
 
M
T
 
T
Q
 
E
S
 
T
A
 
V
M
 
M
P
 
P
-
 
E
D
 
D
V
 
L
V
 
V
K
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
D
 
E
L
 
A
W
 
L
A
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
Y
V
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
L
W
 
W
L
 
L
S
 
C
S
 
H
S
 
E
E
 
S
S
 
C
K
 
-
H
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
I
 
-
L
 
-
E
 
E
S
 
E
Q
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
L
I
 
F
S
 
E
L
 
V
C
 
G
D
 
A
G
 
G
W
 
W

1gz6A (3r)-hydroxyacyl-coa dehydrogenase fragment of rat peroxisomal multifunctional enzyme type 2 (see paper)
38% identity, 86% coverage: 5:255/292 of query aligns to 6:241/301 of 1gz6A

query
sites
1gz6A
N
 
D
S
 
G
R
 
R
T
 
V
V
 
V
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
|
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
N
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
|
D
I
x
L
R
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
F
-
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
G
A
 
S
G
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
D
A
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
R
T
 
R
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
N
 
N
S
 
Y
D
 
D
D
x
S
I
x
V
T
 
-
R
 
-
M
 
-
D
 
E
T
 
A
A
 
G
T
 
E
N
 
K
I
 
L
V
 
V
D
 
K
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
T
F
 
F
G
 
G
E
 
R
V
 
I
H
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
L
 
L
A
 
R
D
 
D
R
 
R
M
 
S
F
 
F
I
 
S
S
 
R
L
 
I
S
 
S
E
 
D
A
 
E
D
 
D
W
 
W
D
 
D
K
 
I
V
 
I
M
 
Q
Q
 
R
V
 
V
H
|
H
L
 
L
K
 
R
G
 
G
H
 
S
F
 
F
C
 
Q
L
 
V
A
 
T
N
 
R
I
 
A
L
 
A
G
 
-
R
 
-
R
 
-
W
 
W
R
 
D
D
 
H
L
 
M
A
 
K
K
 
K
A
 
Q
G
 
N
Q
 
Y
P
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
M
T
|
T
S
 
A
S
|
S
G
 
A
A
 
S
G
 
G
L
 
I
Q
 
Y
G
 
G
S
 
N
I
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
L
S
 
G
L
 
L
T
 
A
L
 
N
V
 
T
Q
 
L
A
 
V
A
 
I
E
 
E
L
 
G
G
 
R
R
 
K
Y
 
N
G
 
N
V
 
I
T
 
H
V
 
C
N
 
N
A
 
T
L
 
I
A
 
A
P
|
P
A
 
N
A
|
A
R
 
G
T
x
S
S
x
R
M
|
M
T
 
T
Q
 
E
S
 
T
A
 
V
M
 
M
P
 
P
D
 
E
V
 
D
V
 
L
K
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
V
D
 
E
L
 
A
W
 
L
A
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
Y
V
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
L
W
 
W
L
 
L
S
 
C
S
 
H
S
 
E
E
 
S
S
 
C
K
 
-
H
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
I
 
-
L
 
-
E
 
E
S
 
E
Q
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
L
I
 
F
S
 
E
L
 
V
C
 
G
D
 
A
G
 
G
W
 
W

1gz6B (3r)-hydroxyacyl-coa dehydrogenase fragment of rat peroxisomal multifunctional enzyme type 2 (see paper)
38% identity, 86% coverage: 5:255/292 of query aligns to 6:218/278 of 1gz6B

query
sites
1gz6B
N
 
D
S
 
G
R
 
R
T
 
V
V
 
V
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
|
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
N
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
|
D
I
x
L
R
 
G
A
 
G
G
 
S
A
 
S
A
 
A
A
 
A
-
 
D
A
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
R
T
 
R
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
N
 
N
S
 
Y
D
 
D
D
x
S
I
x
V
T
 
-
R
 
-
M
 
-
D
 
E
T
 
A
A
 
G
T
 
E
N
 
K
I
 
L
V
 
V
D
 
K
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
T
F
 
F
G
 
G
E
 
R
V
 
I
H
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
L
 
L
A
 
R
D
 
D
R
 
R
M
 
S
F
 
F
I
 
S
S
 
R
L
 
I
S
 
S
E
 
D
A
 
E
D
 
D
W
 
W
D
 
D
K
 
I
V
 
I
M
 
Q
Q
 
R
V
 
V
H
|
H
L
 
L
K
 
R
G
 
G
H
 
S
F
 
F
C
 
Q
L
 
V
A
 
T
N
 
R
I
 
A
L
 
A
G
 
-
R
 
-
R
 
-
W
 
W
R
 
D
D
 
H
L
 
M
A
 
K
K
 
K
A
 
Q
G
 
N
Q
 
Y
P
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
M
T
|
T
S
 
A
S
|
S
G
 
A
A
 
S
G
 
G
L
 
I
Q
 
Y
G
 
G
S
 
N
I
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
L
S
 
G
L
 
L
T
 
A
L
 
N
V
 
T
Q
 
L
A
 
V
A
 
I
E
 
E
L
 
G
G
 
R
R
 
K
Y
 
N
G
 
N
V
 
I
T
 
H
V
 
C
N
 
N
A
 
T
L
 
I
A
 
A
P
|
P
A
 
N
A
 
-
R
 
-
T
 
-
S
 
-
M
 
-
T
 
-
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
M
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
V
 
-
K
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
D
 
E
L
 
A
W
 
L
A
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
Y
V
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
L
W
 
W
L
 
L
S
 
C
S
 
H
S
 
E
E
 
S
S
 
C
K
 
-
H
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
I
 
-
L
 
-
E
 
E
S
 
E
Q
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
L
I
 
F
S
 
E
L
 
V
C
 
G
D
 
A
G
 
G
W
 
W

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
36% identity, 83% coverage: 6:248/292 of query aligns to 4:242/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
S
 
N
R
 
R
T
 
V
V
 
A
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
S
G
 
A
G
 
S
G
 
G
L
x
M
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
Y
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
R
L
 
F
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
N
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
I
N
 
N
D
|
D
I
|
I
R
 
D
A
 
A
G
 
E
A
 
K
A
 
V
A
 
R
A
 
A
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
F
L
 
S
T
 
A
Q
 
R
G
 
G
G
 
H
Q
 
R
A
 
V
I
 
L
A
 
G
N
 
A
S
 
V
D
 
A
D
 
D
I
|
I
T
 
G
R
 
N
M
 
K
D
 
A
T
 
A
A
 
V
T
 
D
N
 
G
I
 
M
V
 
V
D
 
K
A
 
Q
A
 
T
L
 
I
E
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
R
V
 
I
H
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
M
L
 
E
A
 
R
D
 
A
R
 
G
M
 
A
F
 
L
I
 
R
S
 
K
L
 
L
S
 
S
E
 
E
A
 
A
D
 
D
W
 
W
D
 
D
K
 
V
V
 
T
M
 
I
Q
 
N
V
 
V
H
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
H
 
T
F
 
F
-
 
L
C
 
C
L
 
T
A
 
Q
N
 
A
I
 
V
L
 
H
G
 
G
R
 
H
R
 
M
W
 
V
R
 
E
D
 
N
L
 
-
A
 
-
K
 
K
A
 
H
G
 
G
Q
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
T
x
I
S
 
A
S
|
S
G
 
R
A
 
A
G
 
W
L
 
L
Q
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
-
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
V
S
 
G
L
 
M
T
 
T
L
 
R
V
 
A
Q
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
R
Y
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
L
R
x
I
T
 
H
S
 
T
M
 
P
T
 
M
Q
 
W
S
 
D
A
 
E
M
 
L
P
 
P
D
 
E
-
 
K
-
 
D
-
 
Q
-
 
Q
-
 
F
-
 
L
V
 
L
V
 
S
K
 
R
K
 
Q
P
 
P
E
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
T
F
 
G
D
 
K
L
 
L
W
 
G
A
 
E
P
 
P
E
 
D
N
 
D
V
 
I
A
 
A
P
 
N
L
 
T
V
 
L
V
 
L
W
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
D
S
 
D
E
 
D
S
 
S
K
 
G
H
 
F
I
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
E
 
Y
S
 
V
Q
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
R

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
36% identity, 83% coverage: 6:248/292 of query aligns to 5:243/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
S
 
N
R
 
R
T
 
V
V
 
A
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
G
 
A
G
x
S
G
 
G
L
 
M
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
Y
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
R
L
 
F
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
N
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
I
N
 
N
D
|
D
I
 
I
R
 
D
A
 
A
G
 
E
A
 
K
A
 
V
A
 
R
A
 
A
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
F
L
 
S
T
 
A
Q
 
R
G
 
G
G
 
H
Q
 
R
A
 
V
I
 
L
A
 
G
N
 
A
S
 
V
D
 
A
D
|
D
I
|
I
T
 
G
R
 
N
M
 
K
D
 
A
T
 
A
A
 
V
T
 
D
N
 
G
I
 
M
V
 
V
D
 
K
A
 
Q
A
 
T
L
 
I
E
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
R
V
 
I
H
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
M
L
 
E
A
 
R
D
 
A
R
 
G
M
 
A
F
 
L
I
 
R
S
 
K
L
 
L
S
 
S
E
 
E
A
 
A
D
 
D
W
 
W
D
 
D
K
 
V
V
 
T
M
 
I
Q
 
N
V
 
V
H
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
H
 
T
F
 
F
-
 
L
C
 
C
L
 
T
A
 
Q
N
 
A
I
 
V
L
 
H
G
 
G
R
 
H
R
 
M
W
 
V
R
 
E
D
 
N
L
 
-
A
 
-
K
 
K
A
 
H
G
 
G
Q
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
T
 
I
S
 
A
S
 
S
G
 
R
A
 
A
G
 
W
L
 
L
Q
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
-
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
V
S
 
G
L
 
M
T
 
T
L
 
R
V
 
A
Q
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
R
Y
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
L
R
 
I
T
 
H
S
 
T
M
 
P
T
 
M
Q
 
W
S
 
D
A
 
E
M
 
L
P
 
P
D
 
E
-
 
K
-
 
D
-
 
Q
-
 
Q
-
 
F
-
 
L
V
 
L
V
 
S
K
 
R
K
 
Q
P
 
P
E
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
T
F
 
G
D
 
K
L
 
L
W
 
G
A
 
E
P
 
P
E
 
D
N
 
D
V
 
I
A
 
A
P
 
N
L
 
T
V
 
L
V
 
L
W
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
D
S
 
D
E
 
D
S
 
S
K
 
G
H
 
F
I
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
E
 
Y
S
 
V
Q
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
35% identity, 83% coverage: 6:247/292 of query aligns to 4:243/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
S
 
T
R
 
K
T
 
S
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
G
 
S
G
 
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
Y
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
N
 
N
V
 
V
V
 
A
V
 
V
N
 
N
D
 
-
I
 
-
R
 
Y
A
 
A
G
 
G
A
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
K
A
 
A
A
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
K
T
 
A
Q
 
K
G
 
G
G
 
V
Q
 
D
A
 
S
I
 
F
A
 
A
N
 
I
S
 
Q
D
 
A
D
 
N
I
 
V
T
 
A
R
 
D
M
 
A
D
 
D
T
 
E
A
 
V
T
 
K
N
 
A
I
 
M
V
 
I
D
 
K
A
 
E
A
 
V
L
 
V
E
 
S
A
 
Q
F
 
F
G
 
G
E
 
S
V
 
L
H
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
T
A
 
R
D
 
D
R
 
N
M
 
L
F
 
L
I
 
M
S
 
R
L
 
M
S
 
K
E
 
E
A
 
Q
D
 
E
W
 
W
D
 
D
K
 
D
V
 
V
M
 
I
Q
 
D
V
 
T
H
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
H
 
V
F
 
F
-
 
N
C
 
C
L
 
I
A
 
Q
N
 
K
I
 
A
L
 
T
G
 
P
R
 
Q
R
 
M
W
 
L
R
 
R
D
 
Q
L
 
R
A
 
S
K
 
G
A
 
A
G
 
-
Q
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
I
I
 
I
N
 
N
T
 
L
S
 
S
S
|
S
G
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
A
Q
 
V
G
 
G
S
 
N
I
 
P
G
 
G
Q
|
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
V
 
S
Q
 
A
A
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
F
R
 
I
T
 
V
S
 
S
M
 
D
T
 
M
Q
 
T
S
 
D
A
 
A
M
 
L
P
 
S
D
 
D
V
 
E
V
 
L
K
 
K
K
 
E
P
 
Q
E
 
M
D
 
L
G
 
T
S
 
Q
F
 
I
D
 
P
L
 
L
W
 
A
-
 
R
-
 
F
-
 
G
A
 
Q
P
 
D
E
 
T
N
 
D
V
 
I
A
 
A
P
 
N
L
 
T
V
 
V
V
 
A
W
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
S
 
D
E
 
K
S
 
A
K
 
K
H
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
L
 
I
E
 
H
S
 
V
Q
 
N
G
 
G
G
 
G

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
37% identity, 83% coverage: 7:249/292 of query aligns to 2:250/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
R
 
R
T
 
V
V
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
A
G
 
A
G
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Y
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
E
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
Y
N
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
A
N
 
W
D
|
D
I
x
L
R
 
A
A
 
E
G
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
V
 
I
D
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
A
T
 
D
Q
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
S
A
 
A
I
 
D
A
 
F
N
 
A
S
 
R
D
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
R
 
A
M
 
A
D
 
E
T
 
S
A
 
V
T
 
E
N
 
A
I
 
A
V
 
V
D
 
A
A
 
E
A
 
I
L
 
I
E
 
A
A
 
E
F
 
H
G
 
G
E
 
R
V
 
V
H
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
L
 
L
A
 
H
D
 
D
R
 
G
M
 
Q
F
 
L
I
 
V
S
 
K
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
V
-
 
K
-
 
K
L
 
M
S
 
A
E
 
E
A
 
A
D
 
Q
W
 
F
D
 
D
K
 
A
V
 
V
M
 
I
Q
 
S
V
 
V
H
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
H
 
V
F
 
F
C
 
L
L
 
C
A
 
T
N
 
Q
I
 
A
L
 
V
G
 
A
R
 
P
R
 
H
W
 
M
R
 
I
D
 
A
L
 
-
A
 
A
K
 
K
A
 
Y
G
 
G
Q
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
R
I
 
I
I
 
L
N
 
N
T
 
A
S
 
S
S
|
S
G
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
L
Q
 
Y
G
 
G
S
 
N
I
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
S
G
 
G
I
 
V
A
 
I
S
 
G
L
 
M
T
 
T
L
 
K
V
 
V
Q
 
W
A
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
F
R
x
I
T
 
A
S
x
T
M
 
E
T
 
M
Q
 
V
S
 
Q
A
 
Q
M
 
M
P
 
P
D
 
E
-
 
R
-
 
V
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
M
V
 
V
V
 
A
K
 
R
K
 
T
P
 
P
E
 
V
D
 
G
G
 
R
S
 
I
F
 
G
D
 
D
L
 
-
W
 
-
A
 
-
P
 
P
E
 
V
N
 
D
V
 
I
A
 
A
P
 
R
L
 
A
V
 
Y
V
 
L
W
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
S
 
E
E
 
E
S
 
S
K
 
G
H
 
F
I
 
I
S
 
S
G
 
G
Q
 
T
I
 
T
L
 
L
E
 
S
S
 
V
Q
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
M
I
 
V

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
37% identity, 84% coverage: 6:249/292 of query aligns to 8:246/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
S
 
S
R
 
K
T
 
T
V
 
A
I
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
G
 
A
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
F
A
 
G
Y
 
I
A
 
A
L
 
Q
A
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
R
V
 
V
V
 
I
V
 
I
-
 
A
-
x
D
N
x
R
D
 
D
I
 
A
R
 
H
A
 
G
G
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
S
V
 
L
D
 
R
E
 
E
I
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
 
S
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
F
N
 
I
S
 
S
D
x
C
D
 
N
I
|
I
T
 
A
R
 
E
M
 
K
D
 
T
T
 
Q
A
 
V
T
 
E
N
 
A
I
 
L
V
 
F
D
 
S
A
 
Q
A
 
A
L
 
E
E
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
P
V
 
V
H
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
L
 
N
A
 
R
D
 
D
R
 
A
M
 
M
F
 
L
I
 
H
S
 
K
L
 
L
S
 
T
E
 
E
A
 
A
D
 
D
W
 
W
D
 
D
K
 
T
V
 
V
M
 
I
Q
 
D
V
|
V
H
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
H
 
T
F
 
F
C
 
L
L
 
C
A
 
M
N
 
Q
I
 
Q
L
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
R
W
 
M
R
 
R
D
 
E
L
 
R
A
 
G
K
 
A
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
T
 
I
S
 
A
S
 
S
G
 
A
A
 
S
G
 
W
L
 
L
Q
 
-
G
 
G
S
 
N
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
V
S
 
G
L
 
M
T
 
T
L
 
K
V
 
T
Q
 
A
A
 
C
A
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
R
 
K
Y
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
C
P
 
P
A
 
G
-
 
F
A
x
I
R
 
D
T
|
T
S
 
D
M
 
M
T
|
T
Q
 
R
S
 
G
A
 
V
M
 
P
P
 
E
D
 
N
V
 
V
-
 
W
-
 
Q
-
 
I
-
 
M
V
 
V
K
 
S
K
 
K
P
 
I
E
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
-
F
 
-
D
 
-
L
 
-
W
 
Y
A
 
A
P
 
G
E
 
E
-
 
A
-
 
K
N
 
D
V
 
V
A
 
G
P
 
E
L
 
C
V
 
V
V
 
A
W
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
S
 
D
E
 
G
S
 
A
K
 
R
H
 
Y
I
 
I
S
 
N
G
 
G
Q
 
E
I
 
V
L
 
I
E
 
N
S
 
V
Q
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
M
I
 
V

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
35% identity, 83% coverage: 6:247/292 of query aligns to 1:236/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
S
 
T
R
 
K
T
 
S
V
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
Y
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
N
 
N
V
 
V
V
 
A
V
 
V
N
|
N
D
 
-
I
 
-
R
x
Y
A
|
A
G
|
G
A
x
S
-
 
K
-
 
E
-
 
K
A
 
A
A
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
K
T
 
A
Q
 
K
G
 
G
G
 
V
Q
 
D
A
 
S
I
 
F
A
 
A
N
 
I
S
 
Q
D
x
A
D
x
N
I
x
V
T
 
A
R
 
D
M
 
A
D
 
D
T
 
E
A
 
V
T
 
K
N
 
A
I
 
M
V
 
I
D
 
K
A
 
E
A
 
V
L
 
V
E
 
S
A
 
Q
F
 
F
G
 
G
E
 
S
V
 
L
H
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
L
 
T
A
 
R
D
 
D
R
 
N
M
 
L
F
 
L
I
 
M
S
 
R
L
 
M
S
 
K
E
 
E
A
 
Q
D
 
E
W
 
W
D
 
D
K
 
D
V
 
V
M
 
I
Q
 
D
V
x
T
H
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
H
 
V
F
 
F
-
 
N
C
 
C
L
 
I
A
 
Q
N
 
K
I
 
A
L
 
T
G
 
P
R
 
Q
R
 
M
W
 
L
R
 
R
D
 
Q
L
 
R
A
 
S
K
 
G
A
 
A
G
 
-
Q
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
I
I
 
I
N
 
N
T
 
L
S
 
S
S
|
S
G
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
A
Q
 
V
G
 
G
S
 
N
I
 
P
G
 
G
Q
|
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
V
 
S
Q
 
A
A
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
A
 
F
R
 
I
T
 
V
S
 
S
-
 
D
M
 
M
T
 
T
Q
 
D
S
 
E
A
 
L
M
 
K
P
 
E
D
 
Q
V
 
M
V
 
L
K
 
T
K
 
Q
P
 
I
E
 
P
D
 
L
G
 
A
S
 
R
F
 
F
D
 
-
L
 
-
W
 
G
A
 
Q
P
 
D
E
 
T
N
 
D
V
 
I
A
 
A
P
 
N
L
 
T
V
 
V
V
 
A
W
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
S
 
D
E
 
K
S
 
A
K
 
K
H
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
L
 
I
E
 
H
S
 
V
Q
 
N
G
 
G
G
 
G

Q9L9F8 Short-chain reductase protein NovJ; Novobiocin biosynthesis protein J; EC 1.1.1.- from Streptomyces niveus (Streptomyces spheroides) (see paper)
37% identity, 82% coverage: 10:248/292 of query aligns to 20:261/262 of Q9L9F8

query
sites
Q9L9F8
I
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
G
 
G
G
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
A
A
 
A
Y
 
T
A
 
A
L
 
E
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
M
N
 
A
V
 
V
V
 
I
V
 
V
N
 
V
D
 
D
I
 
R
R
 
T
A
 
E
G
 
Q
A
 
D
A
 
T
A
 
R
A
 
A
V
 
T
V
 
V
D
 
A
E
 
A
I
 
I
L
 
R
T
 
T
Q
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
I
 
R
A
 
G
N
 
I
S
 
G
D
 
C
D
 
D
I
 
V
T
 
A
R
 
V
M
 
A
D
 
Q
T
 
A
A
 
V
T
 
T
N
 
A
I
 
A
V
 
V
D
 
A
A
 
T
A
 
A
L
 
V
E
 
E
A
 
E
F
 
F
G
 
G
E
 
R
V
 
I
H
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
C
A
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
N
A
 
R
D
 
D
R
 
R
M
 
L
F
 
L
I
 
L
S
 
T
L
 
M
S
 
G
E
 
D
A
 
Q
D
 
E
W
 
W
D
 
D
K
 
T
V
 
V
M
 
L
Q
 
D
V
 
V
H
 
N
L
 
L
K
 
G
G
 
G
H
 
T
F
 
M
C
 
R
L
 
C
A
 
S
N
 
F
I
 
A
L
 
V
G
 
G
R
 
R
R
 
H
W
 
M
R
 
R
D
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
R
A
 
Q
G
 
G
Q
 
H
P
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
T
 
F
S
 
S
S
|
S
G
 
V
A
 
A
G
 
A
L
 
-
Q
 
R
G
 
G
S
 
N
I
 
A
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
T
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
G
L
 
F
T
 
T
L
 
R
V
 
T
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
P
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
G
-
 
F
A
 
V
R
 
A
T
 
T
S
 
P
M
 
M
T
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
R
Q
 
D
S
 
S
A
 
V
M
 
M
P
 
S
D
 
E
V
 
A
V
 
A
K
 
K
K
 
S
P
 
S
E
 
A
D
 
V
G
 
G
S
 
R
F
 
-
D
 
-
L
 
I
W
 
G
A
 
T
P
 
P
E
 
E
N
 
E
V
 
I
A
 
A
P
 
A
L
 
T
V
 
V
V
 
V
W
 
F
L
 
V
S
 
A
S
 
R
S
 
P
E
 
E
S
 
S
K
 
G
H
 
Y
I
 
L
S
 
T
G
 
G
Q
 
E
I
 
T
L
 
V
E
 
H
S
 
V
Q
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
R

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
33% identity, 83% coverage: 7:249/292 of query aligns to 6:246/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
R
 
K
T
 
V
V
 
A
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
G
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
Y
 
I
A
 
A
L
 
I
A
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
N
V
 
I
V
 
F
V
 
F
N
|
N
D
x
Y
I
x
N
R
x
G
A
x
S
G
 
P
A
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
E
V
 
E
V
 
T
D
 
A
E
 
K
I
 
L
L
 
V
T
 
A
Q
 
E
G
 
H
G
 
G
Q
 
V
A
 
E
I
 
V
-
 
E
A
 
A
N
 
M
S
 
K
D
 
A
D
x
N
I
x
V
T
 
A
R
 
I
M
 
A
D
 
E
T
 
D
A
 
V
T
 
D
N
 
A
I
 
F
V
 
F
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
R
F
 
F
G
 
G
E
 
R
V
 
V
H
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
L
 
T
A
 
R
D
 
D
R
 
N
M
 
L
F
 
L
I
 
M
S
 
R
L
 
M
S
 
K
E
 
E
A
 
D
D
 
E
W
 
W
D
 
D
K
 
D
V
 
V
M
 
I
Q
 
N
V
x
I
H
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
H
 
T
F
 
F
C
 
L
L
 
C
A
 
T
N
 
K
I
 
A
L
 
V
G
 
S
R
 
R
R
 
T
W
 
M
R
 
M
D
 
K
L
 
-
A
 
Q
K
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
T
 
M
S
 
A
S
|
S
G
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
L
Q
 
I
G
 
G
S
 
N
I
 
A
G
 
G
Q
|
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
V
 
T
Q
 
T
A
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
R
 
P
Y
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
|
P
A
 
G
A
 
F
R
x
I
T
 
T
S
x
T
M
 
D
T
 
M
Q
 
T
S
 
D
A
 
K
M
 
L
P
 
D
D
 
E
V
 
K
V
 
T
K
 
K
K
 
E
P
 
A
E
 
M
D
 
L
G
 
A
S
 
Q
F
 
I
D
 
P
L
 
L
W
 
G
A
 
A
-
 
Y
-
 
G
-
 
T
P
 
T
E
 
E
N
 
D
V
 
I
A
 
A
P
 
N
L
 
A
V
 
V
V
 
L
W
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
S
 
D
E
 
A
S
 
S
K
 
K
H
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
I
 
T
L
 
L
E
 
S
S
 
V
Q
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
M
I
 
V