SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012277980.1 NCBI__GCF_000019185.1:WP_012277980.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6p5uE Structure of an enoyl-coa hydratase/aldolase isolated from a lignin- degrading consortium (see paper)
35% identity, 61% coverage: 16:195/293 of query aligns to 5:187/246 of 6p5uE

query
sites
6p5uE
L
 
L
Q
 
T
Y
 
T
V
 
V
S
 
K
C
 
V
T
 
Q
L
 
F
D
 
D
G
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
A
Q
 
W
M
 
V
V
 
S
L
 
L
D
 
N
R
 
R
A
 
P
D
|
D
K
|
K
H
x
R
N
 
N
A
|
A
F
 
M
D
 
S
E
 
P
V
 
T
M
 
L
I
 
N
S
 
R
E
 
E
M
 
M
I
 
L
K
 
Q
V
 
V
L
 
L
E
 
E
H
 
A
F
 
L
S
 
E
A
 
F
N
 
D
V
 
D
Q
 
R
C
 
C
Q
 
G
V
 
V
L
 
V
V
 
V
I
 
L
K
 
T
A
 
G
N
 
E
G
 
G
K
 
D
N
 
S
F
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
M
D
|
D
L
|
L
N
 
K
W
 
-
M
 
-
R
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
M
 
-
D
 
E
F
x
Y
G
 
F
Q
 
R
N
 
E
L
 
T
S
x
D
D
 
N
A
 
A
N
 
P
E
 
A
L
 
L
A
 
I
K
 
K
L
 
A
-
 
Q
-
 
I
-
 
R
-
x
R
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
x
A
-
 
W
-
 
Q
M
 
W
S
 
R
L
 
K
L
 
L
D
 
R
K
 
F
F
 
Y
P
 
A
K
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
M
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
A
x
W
A
 
C
F
|
F
G
 
G
G
|
G
A
 
A
L
 
F
G
x
T
L
 
P
I
 
L
C
 
I
C
 
A
S
 
C
D
 
D
I
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
N
 
A
Q
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
T
F
 
F
C
 
G
L
 
L
S
|
S
E
|
E
V
 
I
K
 
N
L
x
W
G
 
G
L
x
I
I
 
I
P
|
P
A
|
A
V
 
G
-
 
N
I
 
V
S
 
T
P
 
K
Y
 
A
V
 
V
T
 
S
R
 
Q
A
 
V
M
 
C
G
 
G
Q
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
L
R
 
Y
Y
 
Y
M
 
I
L
 
M
T
 
S
A
 
G
E
 
E
R
 
P
F
 
F
D
 
G
V
 
G
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
I
Q
 
G
V
 
L
I
 
V
H
 
N
E
 
E

Sites not aligning to the query:

6n97A Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-sulfonate-propionyl- amino(dethia)-coa (see paper)
29% identity, 87% coverage: 17:270/293 of query aligns to 3:257/260 of 6n97A

query
sites
6n97A
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
S
 
N
C
 
V
T
 
V
L
 
T
D
 
I
G
 
N
G
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
V
M
 
I
V
 
E
L
 
F
D
 
N
R
 
Y
A
 
G
D
 
R
K
 
K
H
x
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
D
 
S
E
 
K
V
 
V
M
 
F
I
 
I
S
 
D
E
 
D
M
 
L
I
 
M
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
S
H
 
D
F
 
L
S
 
N
-
 
R
A
 
P
N
 
E
V
 
I
Q
 
R
C
 
C
Q
 
I
V
 
I
L
 
L
V
 
R
I
 
A
K
 
P
A
 
S
N
 
G
G
 
S
K
|
K
N
 
V
F
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
H
D
|
D
L
x
I
N
 
H
W
 
E
M
x
L
R
 
P
K
 
S
Q
 
G
A
 
G
K
 
R
M
 
-
D
 
-
F
 
-
G
 
-
Q
 
D
N
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
Y
A
 
D
N
 
D
E
 
P
L
 
L
A
 
R
K
 
Q
L
 
I
M
 
T
S
 
R
L
 
M
L
 
I
D
 
Q
K
 
K
F
 
F
P
 
P
K
 
K
P
 
P
T
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
M
V
 
V
Q
 
E
G
 
G
A
 
S
A
 
V
F
x
W
G
|
G
G
|
G
A
 
A
L
 
F
G
x
E
L
 
M
I
 
I
C
 
M
C
 
S
S
 
S
D
 
D
I
 
L
A
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
A
Q
 
S
R
 
T
A
 
S
S
 
T
F
 
F
C
 
S
L
 
M
S
x
T
E
x
P
V
 
V
K
 
N
L
|
L
G
 
G
L
x
V
I
 
P
P
x
Y
A
 
N
V
 
L
I
 
V
S
 
G
P
 
I
Y
 
H
-
 
N
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
D
M
 
A
G
 
G
Q
 
F
R
 
H
A
 
I
A
 
V
R
 
K
R
 
E
Y
 
L
M
 
I
L
 
F
T
 
T
A
 
A
E
 
S
R
 
P
F
 
I
D
 
T
V
 
A
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
V
Q
 
G
V
 
I
I
 
L
H
 
N
E
 
H
V
 
V
-
 
V
-
 
E
N
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
D
A
 
F
A
 
T
Q
 
L
P
 
Q
M
 
M
I
 
A
D
 
H
A
 
H
L
 
I
L
 
S
C
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
L
 
L
G
 
A
M
 
I
T
 
A
W
 
V
V
 
I
K
 
K
T
 
E
L
 
E
L
 
L
L
 
R
S
 
V
L
 
L
E
 
G
D
 
E
G
 
A
V
 
-
I
 
-
D
 
-
Q
 
-
N
 
H
T
 
T
L
 
M
D
 
N
Y
 
S
T
 
D
S
 
E
-
 
F
E
|
E
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
R
 
G
I
 
M
R
 
R
V
 
R
-
 
A
-
 
V
-
x
Y
-
 
D
S
 
S
E
 
E
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
M
N
 
N
A
 
A
F
|
F
F
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
S
 
K
P
 
P
Q
 
N
W
 
F

6n96A Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-sulfonate-propionyl- oxa(dethia)-coa (see paper)
29% identity, 87% coverage: 17:270/293 of query aligns to 3:257/260 of 6n96A

query
sites
6n96A
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
S
 
N
C
 
V
T
 
V
L
 
T
D
 
I
G
 
N
G
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
V
M
 
I
V
 
E
L
 
F
D
 
N
R
 
Y
A
 
G
D
 
R
K
 
K
H
 
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
D
 
S
E
 
K
V
 
V
M
 
F
I
 
I
S
 
D
E
 
D
M
 
L
I
 
M
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
S
H
 
D
F
 
L
S
 
N
-
 
R
A
 
P
N
 
E
V
 
I
Q
 
R
C
 
C
Q
 
I
V
 
I
L
 
L
V
 
R
I
 
A
K
 
P
A
 
S
N
 
G
G
 
S
K
|
K
N
 
V
F
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
H
D
|
D
L
x
I
N
x
H
W
 
E
M
x
L
R
 
P
K
 
S
Q
 
G
A
 
G
K
 
R
M
 
-
D
 
-
F
 
-
G
 
-
Q
 
D
N
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
Y
A
 
D
N
 
D
E
 
P
L
 
L
A
 
R
K
 
Q
L
 
I
M
 
T
S
 
R
L
 
M
L
 
I
D
 
Q
K
 
K
F
 
F
P
 
P
K
 
K
P
 
P
T
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
M
V
 
V
Q
 
E
G
 
G
A
 
S
A
 
V
F
x
W
G
|
G
G
|
G
A
 
A
L
 
F
G
x
E
L
 
M
I
 
I
C
 
M
C
 
S
S
 
S
D
 
D
I
 
L
A
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
A
Q
 
S
R
 
T
A
 
S
S
 
T
F
 
F
C
 
S
L
 
M
S
x
T
E
x
P
V
 
V
K
 
N
L
|
L
G
 
G
L
x
V
I
 
P
P
x
Y
A
 
N
V
 
L
I
 
V
S
 
G
P
 
I
Y
 
H
-
 
N
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
D
M
 
A
G
 
G
Q
 
F
R
 
H
A
 
I
A
 
V
R
 
K
R
 
E
Y
 
L
M
 
I
L
 
F
T
 
T
A
 
A
E
 
S
R
 
P
F
 
I
D
 
T
V
 
A
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
V
Q
 
G
V
 
I
I
 
L
H
 
N
E
 
H
V
 
V
-
 
V
-
 
E
N
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
D
A
 
F
A
 
T
Q
 
L
P
 
Q
M
 
M
I
 
A
D
 
H
A
 
H
L
 
I
L
 
S
C
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
L
 
L
G
 
A
M
 
I
T
 
A
W
 
V
V
 
I
K
 
K
T
 
E
L
 
E
L
 
L
L
 
R
S
 
V
L
 
L
E
 
G
D
 
E
G
 
A
V
 
-
I
 
-
D
 
-
Q
 
-
N
 
H
T
 
T
L
 
M
D
 
N
Y
 
S
T
 
D
S
 
E
-
 
F
E
|
E
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
R
 
G
I
 
M
R
 
R
V
 
R
-
 
A
-
 
V
-
x
Y
-
 
D
S
 
S
E
 
E
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
M
N
 
N
A
 
A
F
|
F
F
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
S
 
K
P
 
P
Q
 
N
W
 
F

6n95A Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-sulfonate-propionyl- coa (see paper)
29% identity, 87% coverage: 17:270/293 of query aligns to 3:257/260 of 6n95A

query
sites
6n95A
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
S
 
N
C
 
V
T
 
V
L
 
T
D
 
I
G
 
N
G
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
V
M
 
I
V
 
E
L
 
F
D
 
N
R
 
Y
A
 
G
D
 
R
K
|
K
H
x
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
D
 
S
E
 
K
V
 
V
M
 
F
I
 
I
S
 
D
E
 
D
M
 
L
I
 
M
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
S
H
 
D
F
 
L
S
 
N
-
 
R
A
 
P
N
 
E
V
 
I
Q
 
R
C
 
C
Q
 
I
V
 
I
L
 
L
V
 
R
I
 
A
K
 
P
A
 
S
N
 
G
G
 
S
K
|
K
N
 
V
F
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
H
D
|
D
L
x
I
N
x
H
W
 
E
M
x
L
R
 
P
K
 
S
Q
 
G
A
 
G
K
 
R
M
 
-
D
 
-
F
 
-
G
 
-
Q
 
D
N
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
Y
A
 
D
N
 
D
E
 
P
L
 
L
A
 
R
K
 
Q
L
 
I
M
 
T
S
 
R
L
 
M
L
 
I
D
 
Q
K
 
K
F
 
F
P
 
P
K
 
K
P
 
P
T
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
M
V
 
V
Q
 
E
G
 
G
A
 
S
A
 
V
F
x
W
G
|
G
G
|
G
A
 
A
L
 
F
G
x
E
L
 
M
I
 
I
C
 
M
C
 
S
S
 
S
D
 
D
I
 
L
A
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
A
Q
 
S
R
 
T
A
 
S
S
 
T
F
 
F
C
 
S
L
 
M
S
x
T
E
x
P
V
 
V
K
 
N
L
|
L
G
 
G
L
x
V
I
 
P
P
x
Y
A
 
N
V
 
L
I
 
V
S
 
G
P
 
I
Y
 
H
-
 
N
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
D
M
 
A
G
 
G
Q
 
F
R
 
H
A
 
I
A
 
V
R
 
K
R
 
E
Y
 
L
M
 
I
L
 
F
T
 
T
A
 
A
E
 
S
R
 
P
F
 
I
D
 
T
V
 
A
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
V
Q
 
G
V
 
I
I
 
L
H
 
N
E
 
H
V
 
V
-
 
V
-
 
E
N
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
D
A
 
F
A
 
T
Q
 
L
P
 
Q
M
 
M
I
 
A
D
 
H
A
 
H
L
 
I
L
 
S
C
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
L
 
L
G
 
A
M
 
I
T
 
A
W
 
V
V
 
I
K
 
K
T
 
E
L
 
E
L
 
L
L
 
R
S
 
V
L
 
L
E
 
G
D
 
E
G
 
A
V
 
-
I
 
-
D
 
-
Q
 
-
N
 
H
T
 
T
L
 
M
D
 
N
Y
 
S
T
 
D
S
 
E
-
 
F
E
|
E
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
R
 
G
I
 
M
R
 
R
V
 
R
-
 
A
-
 
V
-
x
Y
-
 
D
S
 
S
E
 
E
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
M
N
 
N
A
 
A
F
|
F
F
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
S
 
K
P
 
P
Q
 
N
W
 
F

6n94A Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-nitronate-propionyl- amino(dethia)-coa (see paper)
29% identity, 87% coverage: 17:270/293 of query aligns to 3:257/260 of 6n94A

query
sites
6n94A
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
S
 
N
C
 
V
T
 
V
L
 
T
D
 
I
G
 
N
G
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
V
M
 
I
V
 
E
L
 
F
D
 
N
R
 
Y
A
 
G
D
 
R
K
|
K
H
x
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
D
 
S
E
 
K
V
 
V
M
 
F
I
 
I
S
 
D
E
 
D
M
 
L
I
 
M
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
S
H
 
D
F
 
L
S
 
N
-
 
R
A
 
P
N
 
E
V
 
I
Q
 
R
C
 
C
Q
 
I
V
 
I
L
 
L
V
 
R
I
 
A
K
 
P
A
 
S
N
 
G
G
 
S
K
 
K
N
 
V
F
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
H
D
|
D
L
x
I
N
x
H
W
 
E
M
x
L
R
 
P
K
 
S
Q
 
G
A
 
G
K
 
R
M
 
-
D
 
-
F
 
-
G
 
-
Q
 
D
N
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
Y
A
 
D
N
 
D
E
 
P
L
 
L
A
 
R
K
 
Q
L
 
I
M
 
T
S
 
R
L
 
M
L
 
I
D
 
Q
K
 
K
F
 
F
P
 
P
K
 
K
P
 
P
T
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
M
V
 
V
Q
 
E
G
 
G
A
 
S
A
 
V
F
x
W
G
|
G
G
|
G
A
 
A
L
 
F
G
x
E
L
 
M
I
 
I
C
 
M
C
 
S
S
 
S
D
 
D
I
 
L
A
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
A
Q
 
S
R
 
T
A
 
S
S
 
T
F
 
F
C
 
S
L
 
M
S
x
T
E
x
P
V
 
V
K
 
N
L
 
L
G
 
G
L
x
V
I
 
P
P
x
Y
A
 
N
V
 
L
I
 
V
S
 
G
P
 
I
Y
 
H
-
 
N
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
D
M
 
A
G
 
G
Q
 
F
R
 
H
A
 
I
A
 
V
R
 
K
R
 
E
Y
 
L
M
 
I
L
 
F
T
 
T
A
 
A
E
 
S
R
 
P
F
 
I
D
 
T
V
 
A
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
V
Q
 
G
V
 
I
I
 
L
H
 
N
E
 
H
V
 
V
-
 
V
-
 
E
N
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
D
A
 
F
A
 
T
Q
 
L
P
 
Q
M
 
M
I
 
A
D
 
H
A
 
H
L
 
I
L
 
S
C
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
L
 
L
G
 
A
M
 
I
T
 
A
W
 
V
V
 
I
K
 
K
T
 
E
L
 
E
L
 
L
L
 
R
S
 
V
L
 
L
E
 
G
D
 
E
G
 
A
V
 
-
I
 
-
D
 
-
Q
 
-
N
 
H
T
 
T
L
 
M
D
 
N
Y
 
S
T
 
D
S
 
E
-
 
F
E
|
E
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
R
 
G
I
 
M
R
 
R
V
 
R
-
 
A
-
 
V
-
x
Y
-
 
D
S
 
S
E
 
E
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
M
N
 
N
A
 
A
F
 
F
F
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
S
 
K
P
 
P
Q
 
N
W
 
F

6n93A Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-nitronate-propionyl- oxa(dethia)-coa (see paper)
29% identity, 87% coverage: 17:270/293 of query aligns to 3:257/260 of 6n93A

query
sites
6n93A
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
S
 
N
C
 
V
T
 
V
L
 
T
D
 
I
G
 
N
G
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
V
M
 
I
V
 
E
L
 
F
D
 
N
R
 
Y
A
 
G
D
 
R
K
 
K
H
x
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
D
 
S
E
 
K
V
 
V
M
 
F
I
 
I
S
 
D
E
 
D
M
 
L
I
 
M
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
S
H
 
D
F
 
L
S
 
N
-
 
R
A
 
P
N
 
E
V
 
I
Q
 
R
C
 
C
Q
 
I
V
 
I
L
 
L
V
 
R
I
 
A
K
 
P
A
 
S
N
 
G
G
 
S
K
 
K
N
 
V
F
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
H
D
|
D
L
x
I
N
x
H
W
 
E
M
x
L
R
 
P
K
 
S
Q
 
G
A
 
G
K
 
R
M
 
-
D
 
-
F
 
-
G
 
-
Q
 
D
N
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
Y
A
 
D
N
 
D
E
 
P
L
 
L
A
 
R
K
 
Q
L
 
I
M
 
T
S
 
R
L
 
M
L
 
I
D
 
Q
K
 
K
F
 
F
P
 
P
K
 
K
P
 
P
T
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
M
V
 
V
Q
 
E
G
 
G
A
 
S
A
 
V
F
x
W
G
 
G
G
|
G
A
 
A
L
 
F
G
x
E
L
 
M
I
 
I
C
 
M
C
 
S
S
 
S
D
 
D
I
 
L
A
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
A
Q
 
S
R
 
T
A
 
S
S
 
T
F
 
F
C
 
S
L
 
M
S
x
T
E
x
P
V
 
V
K
 
N
L
|
L
G
 
G
L
x
V
I
 
P
P
x
Y
A
 
N
V
 
L
I
 
V
S
 
G
P
 
I
Y
 
H
-
 
N
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
D
M
 
A
G
 
G
Q
 
F
R
 
H
A
 
I
A
 
V
R
 
K
R
 
E
Y
 
L
M
 
I
L
 
F
T
 
T
A
 
A
E
 
S
R
 
P
F
 
I
D
 
T
V
 
A
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
V
Q
 
G
V
 
I
I
 
L
H
 
N
E
 
H
V
 
V
-
 
V
-
 
E
N
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
D
A
 
F
A
 
T
Q
 
L
P
 
Q
M
 
M
I
 
A
D
 
H
A
 
H
L
 
I
L
 
S
C
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
L
 
L
G
 
A
M
 
I
T
 
A
W
 
V
V
 
I
K
 
K
T
 
E
L
 
E
L
 
L
L
 
R
S
 
V
L
 
L
E
 
G
D
 
E
G
 
A
V
 
-
I
 
-
D
 
-
Q
 
-
N
 
H
T
 
T
L
 
M
D
 
N
Y
 
S
T
 
D
S
 
E
-
 
F
E
|
E
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
R
 
G
I
 
M
R
 
R
V
 
R
-
 
A
-
 
V
-
x
Y
-
 
D
S
 
S
E
 
E
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
M
N
 
N
A
 
A
F
|
F
F
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
S
 
K
P
 
P
Q
 
N
W
 
F

6n92F Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-nitronate-propionyl- coa (see paper)
29% identity, 87% coverage: 17:270/293 of query aligns to 3:257/260 of 6n92F

query
sites
6n92F
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
S
 
N
C
 
V
T
 
V
L
 
T
D
 
I
G
 
N
G
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
V
M
 
I
V
 
E
L
 
F
D
 
N
R
 
Y
A
 
G
D
x
R
K
|
K
H
x
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
D
 
S
E
 
K
V
 
V
M
 
F
I
 
I
S
 
D
E
 
D
M
 
L
I
 
M
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
S
H
 
D
F
 
L
S
 
N
-
 
R
A
 
P
N
 
E
V
 
I
Q
 
R
C
 
C
Q
 
I
V
 
I
L
 
L
V
 
R
I
 
A
K
 
P
A
 
S
N
 
G
G
 
S
K
 
K
N
 
V
F
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
H
D
|
D
L
 
I
N
 
H
W
 
E
M
x
L
R
 
P
K
 
S
Q
 
G
A
 
G
K
 
R
M
 
-
D
 
-
F
 
-
G
 
-
Q
 
D
N
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
Y
A
 
D
N
 
D
E
 
P
L
 
L
A
 
R
K
 
Q
L
 
I
M
 
T
S
 
R
L
 
M
L
 
I
D
 
Q
K
 
K
F
 
F
P
 
P
K
 
K
P
 
P
T
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
M
V
 
V
Q
 
E
G
 
G
A
x
S
A
 
V
F
x
W
G
|
G
G
|
G
A
 
A
L
 
F
G
x
E
L
 
M
I
 
I
C
 
M
C
 
S
S
 
S
D
 
D
I
 
L
A
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
A
Q
 
S
R
 
T
A
 
S
S
x
T
F
|
F
C
x
S
L
 
M
S
x
T
E
x
P
V
 
V
K
 
N
L
 
L
G
 
G
L
x
V
I
 
P
P
x
Y
A
 
N
V
 
L
I
 
V
S
 
G
P
 
I
Y
 
H
-
 
N
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
D
M
 
A
G
 
G
Q
 
F
R
 
H
A
 
I
A
 
V
R
 
K
R
 
E
Y
 
L
M
 
I
L
 
F
T
 
T
A
 
A
E
x
S
R
x
P
F
 
I
D
 
T
V
 
A
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
V
Q
 
G
V
 
I
I
 
L
H
 
N
E
 
H
V
 
V
-
 
V
-
 
E
N
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
D
A
 
F
A
 
T
Q
 
L
P
 
Q
M
 
M
I
 
A
D
 
H
A
 
H
L
 
I
L
 
S
C
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
L
 
L
G
 
A
M
 
I
T
 
A
W
 
V
V
 
I
K
 
K
T
 
E
L
 
E
L
 
L
L
 
R
S
 
V
L
 
L
E
 
G
D
 
E
G
 
A
V
 
-
I
 
-
D
 
-
Q
 
-
N
 
H
T
 
T
L
 
M
D
 
N
Y
 
S
T
 
D
S
 
E
-
 
F
E
|
E
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
R
 
G
I
 
M
R
 
R
V
 
R
-
 
A
-
 
V
-
x
Y
-
 
D
S
 
S
E
|
E
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
M
N
 
N
A
 
A
F
|
F
F
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
S
 
K
P
 
P
Q
 
N
W
 
F

Sites not aligning to the query:

6n92A Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-nitronate-propionyl- coa (see paper)
29% identity, 87% coverage: 17:270/293 of query aligns to 3:257/260 of 6n92A

query
sites
6n92A
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
S
 
N
C
 
V
T
 
V
L
 
T
D
 
I
G
 
N
G
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
V
M
 
I
V
 
E
L
 
F
D
 
N
R
 
Y
A
 
G
D
 
R
K
 
K
H
x
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
D
 
S
E
 
K
V
 
V
M
 
F
I
 
I
S
 
D
E
 
D
M
 
L
I
 
M
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
S
H
 
D
F
 
L
S
 
N
-
 
R
A
 
P
N
 
E
V
 
I
Q
 
R
C
 
C
Q
 
I
V
 
I
L
 
L
V
 
R
I
 
A
K
 
P
A
 
S
N
 
G
G
 
S
K
 
K
N
 
V
F
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
H
D
|
D
L
x
I
N
x
H
W
 
E
M
x
L
R
 
P
K
 
S
Q
 
G
A
 
G
K
 
R
M
 
-
D
 
-
F
 
-
G
 
-
Q
 
D
N
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
Y
A
 
D
N
 
D
E
 
P
L
 
L
A
 
R
K
 
Q
L
 
I
M
 
T
S
 
R
L
 
M
L
 
I
D
 
Q
K
 
K
F
 
F
P
 
P
K
 
K
P
 
P
T
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
M
V
 
V
Q
 
E
G
 
G
A
 
S
A
 
V
F
x
W
G
|
G
G
|
G
A
 
A
L
 
F
G
x
E
L
 
M
I
 
I
C
 
M
C
 
S
S
 
S
D
 
D
I
 
L
A
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
A
Q
 
S
R
 
T
A
 
S
S
 
T
F
 
F
C
 
S
L
 
M
S
x
T
E
x
P
V
 
V
K
 
N
L
 
L
G
 
G
L
x
V
I
 
P
P
x
Y
A
 
N
V
 
L
I
 
V
S
 
G
P
 
I
Y
 
H
-
 
N
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
D
M
 
A
G
 
G
Q
 
F
R
 
H
A
 
I
A
 
V
R
 
K
R
 
E
Y
 
L
M
 
I
L
 
F
T
 
T
A
 
A
E
 
S
R
 
P
F
 
I
D
 
T
V
 
A
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
V
Q
 
G
V
 
I
I
 
L
H
 
N
E
 
H
V
 
V
-
 
V
-
 
E
N
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
D
A
 
F
A
 
T
Q
 
L
P
 
Q
M
 
M
I
 
A
D
 
H
A
 
H
L
 
I
L
 
S
C
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
L
 
L
G
 
A
M
 
I
T
 
A
W
 
V
V
 
I
K
 
K
T
 
E
L
 
E
L
 
L
L
 
R
S
 
V
L
 
L
E
 
G
D
 
E
G
 
A
V
 
-
I
 
-
D
 
-
Q
 
-
N
 
H
T
 
T
L
 
M
D
 
N
Y
 
S
T
 
D
S
 
E
-
 
F
E
|
E
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
R
 
G
I
 
M
R
 
R
V
 
R
-
 
A
-
 
V
-
x
Y
-
 
D
S
 
S
E
 
E
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
M
N
 
N
A
 
A
F
|
F
F
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
S
 
K
P
 
P
Q
 
N
W
 
F

1ef9A The crystal structure of methylmalonyl coa decarboxylase complexed with 2s-carboxypropyl coa (see paper)
29% identity, 87% coverage: 17:270/293 of query aligns to 4:258/261 of 1ef9A

query
sites
1ef9A
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
S
 
N
C
 
V
T
 
V
L
 
T
D
 
I
G
 
N
G
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
V
M
 
I
V
 
E
L
 
F
D
 
N
R
 
Y
A
 
G
D
 
R
K
 
K
H
 
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
D
 
S
E
 
K
V
 
V
M
 
F
I
 
I
S
 
D
E
 
D
M
 
L
I
 
M
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
S
H
 
D
F
 
L
S
 
N
-
 
R
A
 
P
N
 
E
V
 
I
Q
 
R
C
 
C
Q
 
I
V
 
I
L
 
L
V
 
R
I
 
A
K
 
P
A
 
S
N
 
G
G
 
S
K
 
K
N
 
V
F
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
H
D
|
D
L
x
I
N
x
H
W
 
E
M
x
L
R
 
P
K
 
S
Q
 
G
A
 
G
K
 
R
M
 
-
D
 
-
F
 
-
G
 
-
Q
 
D
N
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
Y
A
x
D
N
 
D
E
 
P
L
 
L
A
x
R
K
 
Q
L
 
I
M
 
T
S
 
R
L
 
M
L
 
I
D
 
Q
K
 
K
F
 
F
P
 
P
K
 
K
P
 
P
T
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
M
V
 
V
Q
 
E
G
 
G
A
 
S
A
 
V
F
x
W
G
 
G
G
|
G
A
 
A
L
 
F
G
x
E
L
 
M
I
 
I
C
 
M
C
 
S
S
 
S
D
 
D
I
 
L
A
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
A
Q
 
S
R
 
T
A
 
S
S
 
T
F
 
F
C
 
S
L
 
M
S
x
T
E
x
P
V
 
V
K
 
N
L
 
L
G
 
G
L
x
V
I
 
P
P
x
Y
A
x
N
V
 
L
I
 
V
S
 
G
P
 
I
Y
 
H
-
 
N
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
D
M
 
A
G
 
G
Q
 
F
R
 
H
A
 
I
A
 
V
R
 
K
R
 
E
Y
 
L
M
 
I
L
 
F
T
 
T
A
 
A
E
 
S
R
 
P
F
 
I
D
 
T
V
 
A
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
V
Q
 
G
V
 
I
I
 
L
H
 
N
E
 
H
V
 
V
-
 
V
-
 
E
N
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
D
A
 
F
A
 
T
Q
 
L
P
 
Q
M
 
M
I
 
A
D
 
H
A
 
H
L
 
I
L
 
S
C
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
L
 
L
G
 
A
M
 
I
T
 
A
W
 
V
V
 
I
K
 
K
T
 
E
L
 
E
L
 
L
L
 
R
S
 
V
L
 
L
E
 
G
D
 
E
G
 
A
V
 
-
I
 
-
D
 
-
Q
 
-
N
 
H
T
 
T
L
 
M
D
 
N
Y
 
S
T
 
D
S
 
E
-
 
F
E
|
E
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
R
 
G
I
 
M
R
 
R
V
 
R
-
 
A
-
 
V
-
x
Y
-
 
D
S
 
S
E
 
E
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
M
N
 
N
A
 
A
F
 
F
F
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
S
 
K
P
 
P
Q
 
N
W
 
F

P52045 Methylmalonyl-CoA decarboxylase; MMCD; Transcarboxylase; EC 4.1.1.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
29% identity, 87% coverage: 17:270/293 of query aligns to 4:258/261 of P52045

query
sites
P52045
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
S
 
N
C
 
V
T
 
V
L
 
T
D
 
I
G
 
N
G
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
V
M
 
I
V
 
E
L
 
F
D
 
N
R
 
Y
A
 
G
D
 
R
K
 
K
H
 
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
D
 
S
E
 
K
V
 
V
M
 
F
I
 
I
S
 
D
E
 
D
M
 
L
I
 
M
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
S
H
 
D
F
 
L
S
 
N
-
 
R
A
 
P
N
 
E
V
 
I
Q
 
R
C
 
C
Q
 
I
V
 
I
L
 
L
V
 
R
I
 
A
K
 
P
A
 
S
N
 
G
G
 
S
K
 
K
N
 
V
F
 
F
S
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
H
D
 
D
L
 
I
N
 
H
W
 
E
M
 
L
R
 
P
K
 
S
Q
 
G
A
 
G
K
 
R
M
 
-
D
 
-
F
 
-
G
 
-
Q
 
D
N
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
Y
A
 
D
N
 
D
E
 
P
L
 
L
A
 
R
K
 
Q
L
 
I
M
 
T
S
 
R
L
 
M
L
 
I
D
 
Q
K
 
K
F
 
F
P
 
P
K
 
K
P
 
P
T
 
I
I
 
I
A
 
S
L
 
M
V
 
V
Q
 
E
G
 
G
A
 
S
A
 
V
F
 
W
G
 
G
G
|
G
A
 
A
L
 
F
G
 
E
L
 
M
I
 
I
C
 
M
C
 
S
S
 
S
D
 
D
I
 
L
A
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
A
Q
 
S
R
 
T
A
 
S
S
 
T
F
 
F
C
 
S
L
 
M
S
x
T
E
 
P
V
 
V
K
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
V
I
 
P
P
 
Y
A
 
N
V
 
L
I
 
V
S
 
G
P
 
I
Y
 
H
-
 
N
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
D
M
 
A
G
 
G
Q
 
F
R
 
H
A
 
I
A
 
V
R
 
K
R
 
E
Y
 
L
M
 
I
L
 
F
T
 
T
A
 
A
E
 
S
R
 
P
F
 
I
D
 
T
V
 
A
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
V
Q
 
G
V
 
I
I
 
L
H
 
N
E
 
H
V
 
V
-
 
V
-
 
E
N
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
D
A
 
F
A
 
T
Q
 
L
P
 
Q
M
 
M
I
 
A
D
 
H
A
 
H
L
 
I
L
 
S
C
 
E
N
 
K
S
 
A
P
 
P
L
 
L
G
 
A
M
 
I
T
 
A
W
 
V
V
 
I
K
 
K
T
 
E
L
 
E
L
 
L
L
 
R
S
 
V
L
 
L
E
 
G
D
 
E
G
 
A
V
 
-
I
 
-
D
 
-
Q
 
-
N
 
H
T
 
T
L
 
M
D
 
N
Y
 
S
T
 
D
S
 
E
-
 
F
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
R
 
G
I
 
M
R
 
R
V
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
Y
-
 
D
S
 
S
E
 
E
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
M
N
 
N
A
 
A
F
 
F
F
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
S
 
K
P
 
P
Q
 
N
W
 
F

6l3pA Crystal strcuture of feruloyl-coa hydratase lyase(fchl) complexed with coa
31% identity, 60% coverage: 19:195/293 of query aligns to 10:184/244 of 6l3pA

query
sites
6l3pA
V
 
V
S
 
K
C
 
V
T
 
E
L
 
L
D
 
E
G
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
A
Q
 
W
M
 
V
V
 
T
L
 
L
D
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
E
K
|
K
H
x
R
N
 
N
A
|
A
F
 
M
D
 
S
E
 
P
V
 
T
M
 
L
I
 
N
S
 
R
E
 
E
M
 
M
I
 
V
K
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
E
H
 
T
F
 
L
S
 
E
A
 
Q
N
 
D
V
 
A
Q
 
D
C
 
A
Q
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
L
K
 
T
A
 
G
N
 
A
G
 
G
K
 
E
N
 
S
F
 
W
S
 
T
A
|
A
G
 
G
A
x
M
D
|
D
L
|
L
N
 
K
W
 
E
M
x
Y
R
 
F
K
 
R
Q
 
E
A
 
E
K
 
I
M
 
L
D
 
Q
F
 
E
G
 
K
Q
 
I
N
 
R
L
x
R
S
 
E
D
 
A
A
 
S
N
x
Q
E
 
W
L
 
Q
A
 
W
K
 
K
L
 
L
M
 
L
S
 
R
L
 
L
L
 
-
D
 
-
K
 
-
F
 
Y
P
 
A
K
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
M
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
A
 
W
A
 
C
F
 
F
G
|
G
G
|
G
A
 
G
L
 
F
G
x
S
L
 
P
I
 
L
C
 
V
C
 
A
S
 
C
D
 
D
I
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
C
N
 
A
Q
 
N
R
 
E
A
 
A
S
 
T
F
 
F
C
 
G
L
 
L
S
|
S
E
|
E
V
 
I
K
 
N
L
 
W
G
 
G
L
x
I
I
 
P
P
|
P
A
x
G
-
 
N
V
 
L
I
 
V
S
 
S
P
 
K
Y
 
A
V
 
M
T
 
A
R
 
D
A
 
T
M
 
V
G
 
G
Q
 
H
R
 
R
A
 
Q
A
 
S
R
 
L
R
 
Y
Y
 
Y
M
 
I
L
 
M
T
 
T
A
 
G
E
 
K
R
 
T
F
 
F
D
 
D
V
 
G
Q
 
R
K
 
K
A
 
A
L
 
A
E
 
E
L
 
M
Q
 
G
V
 
L
I
 
V
H
 
N
E
 
D

Sites not aligning to the query:

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
25% identity, 87% coverage: 15:270/293 of query aligns to 2:256/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
Q
 
E
L
 
F
Q
 
E
Y
 
T
V
 
I
S
 
E
C
 
T
T
 
K
L
 
K
D
 
E
G
 
G
G
 
N
V
 
L
A
 
F
Q
 
W
M
 
I
V
 
T
L
 
L
D
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
D
K
|
K
H
x
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
D
 
N
E
 
A
V
 
K
M
 
L
I
 
L
S
 
E
E
 
E
M
 
L
I
 
D
K
 
R
V
 
A
L
 
V
E
 
S
H
 
Q
F
 
A
S
 
E
A
 
S
N
 
D
V
 
P
Q
 
E
C
 
I
Q
 
R
V
 
V
L
 
I
V
 
I
I
 
I
K
 
T
A
 
G
N
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
A
F
 
F
S
 
C
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
L
x
I
N
 
T
W
 
Q
M
x
F
R
 
N
K
 
Q
Q
 
L
A
 
T
K
 
P
M
 
A
D
 
E
F
 
A
G
 
W
Q
 
K
N
 
F
L
x
S
S
 
K
D
 
K
A
 
G
N
x
R
E
 
E
L
 
I
A
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
M
S
 
D
L
 
K
L
 
I
D
 
E
K
 
A
F
 
L
P
 
S
K
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
M
V
 
I
Q
 
N
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
|
G
A
 
G
L
 
L
G
x
E
L
 
L
I
 
A
C
 
L
C
 
A
S
 
C
D
 
D
I
 
I
A
 
R
I
 
I
A
 
A
N
 
A
Q
 
E
R
 
E
A
 
A
S
 
Q
F
 
L
C
 
G
L
 
L
S
x
P
E
|
E
V
 
I
K
 
N
L
 
L
G
 
G
L
x
I
I
 
Y
P
|
P
A
x
G
V
 
Y
-
 
G
I
 
G
S
 
T
P
 
Q
Y
 
R
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
V
M
 
I
G
 
G
Q
 
K
R
 
G
A
 
R
A
 
A
R
 
L
R
 
E
Y
 
M
M
 
M
L
 
M
T
 
T
A
 
G
E
 
D
R
|
R
F
 
I
D
 
P
V
 
G
Q
 
K
K
 
D
A
 
A
L
 
E
E
 
K
L
 
Y
Q
 
G
V
 
L
I
 
V
H
 
N
E
 
R
V
 
V
N
 
V
D
 
P
-
 
L
-
 
A
D
 
N
L
 
L
D
 
E
A
 
Q
A
 
E
A
 
T
Q
 
R
P
 
K
M
 
L
I
 
A
D
 
E
A
 
K
L
 
I
L
 
A
C
 
K
N
 
K
S
 
S
P
 
P
L
 
I
G
 
S
M
 
L
T
 
A
W
 
L
V
 
I
K
 
K
T
 
E
L
 
V
L
 
V
-
 
N
L
 
R
S
 
G
L
 
L
E
 
D
D
 
S
G
 
P
V
 
L
I
 
L
D
 
S
Q
 
G
N
 
L
T
x
A
L
 
L
D
 
E
Y
 
S
T
 
V
S
 
G
E
 
W
R
 
G
I
 
V
A
 
-
R
 
-
I
 
V
R
x
F
V
 
S
S
 
T
E
 
E
E
 
D
G
 
K
Q
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
V
N
 
S
A
 
A
F
|
F
F
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
S
 
E
P
 
P
Q
 
T
W
 
F

O69762 Hydroxycinnamoyl-CoA hydratase-lyase; HCHL; P-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase; Trans-feruloyl-CoA hydratase/vanillin synthase; EC 4.1.2.61 from Pseudomonas fluorescens (see 2 papers)
28% identity, 85% coverage: 19:267/293 of query aligns to 11:266/276 of O69762

query
sites
O69762
V
 
V
S
 
K
C
 
V
T
 
E
L
 
I
D
 
E
G
 
D
G
 
G
V
 
I
A
 
A
Q
 
F
M
 
V
V
 
I
L
 
L
D
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
E
K
|
K
H
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
M
D
 
S
E
 
P
V
 
T
M
 
L
I
 
N
S
 
R
E
 
E
M
 
M
I
 
I
K
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
E
H
 
T
F
 
L
S
 
E
A
 
Q
N
 
D
V
 
P
Q
 
A
C
 
A
Q
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
L
K
 
T
A
 
G
N
 
A
G
 
G
K
 
E
N
 
A
F
 
W
S
 
T
A
|
A
G
 
G
A
x
M
D
 
D
L
|
L
N
 
K
W
 
E
M
x
Y
R
 
F
K
 
R
Q
 
E
A
 
-
K
 
-
M
 
V
D
 
D
F
 
A
G
 
G
Q
 
P
N
 
E
L
 
I
-
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
R
S
 
R
D
 
E
A
 
A
N
 
S
E
 
Q
L
 
W
A
 
Q
K
 
-
L
 
-
M
 
W
S
 
K
L
 
L
L
 
L
D
 
R
K
 
M
F
 
Y
P
 
A
K
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
M
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
A
 
W
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
|
G
A
 
G
L
 
F
G
x
S
L
 
P
I
 
L
C
 
V
C
 
A
S
 
C
D
 
D
I
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
C
N
 
A
Q
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
T
F
 
F
C
 
G
L
 
L
S
|
S
E
|
E
V
 
I
K
 
N
L
x
W
G
 
G
L
 
I
I
 
P
P
 
P
A
x
G
-
 
N
V
 
L
I
 
V
S
 
S
P
 
K
Y
 
A
V
 
M
T
 
A
R
 
D
A
 
T
M
 
V
G
 
G
Q
 
H
R
 
R
A
 
Q
A
 
S
R
 
L
R
 
Y
Y
 
Y
M
 
I
L
 
M
T
 
T
A
 
G
E
 
K
R
 
T
F
 
F
D
 
G
V
 
G
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
L
 
A
E
 
E
L
 
M
Q
 
G
V
 
L
I
 
V
H
 
N
E
 
E
V
 
S
N
 
V
D
 
P
-
 
L
-
 
A
D
 
Q
L
 
L
D
 
R
A
 
E
A
 
V
A
 
T
Q
 
I
P
 
E
M
 
L
I
 
A
D
 
R
A
 
N
L
 
L
L
 
L
C
 
E
N
 
K
S
 
N
P
 
P
L
 
V
G
 
V
M
 
L
T
 
R
W
 
A
V
 
A
K
 
K
T
 
H
L
 
G
L
 
F
L
 
K
S
 
R
L
 
C
E
 
R
D
 
E
G
 
L
V
 
T
I
 
W
D
 
E
Q
 
Q
N
 
N
T
 
E
L
 
-
D
 
D
Y
 
Y
T
 
L
S
x
Y
E
 
A
R
 
K
I
 
L
A
 
D
R
 
Q
I
 
S
R
 
R
V
 
L
-
 
L
-
 
D
S
 
T
E
 
E
E
 
G
G
 
G
Q
 
R
E
 
E
-
 
Q
G
 
G
L
 
M
N
 
K
A
 
Q
F
 
F
F
 
L
E
 
D
K
 
D
R
 
K
S
 
S

Sites not aligning to the query:

2vssB Wild-type hydroxycinnamoyl-coa hydratase lyase in complex with acetyl- coa and vanillin (see paper)
32% identity, 60% coverage: 19:195/293 of query aligns to 8:187/247 of 2vssB

query
sites
2vssB
V
 
V
S
 
K
C
 
V
T
 
E
L
 
I
D
 
E
G
 
D
G
 
G
V
 
I
A
 
A
Q
 
F
M
 
V
V
 
I
L
 
L
D
 
N
R
 
R
A
 
P
D
x
E
K
|
K
H
x
R
N
 
N
A
|
A
F
 
M
D
 
S
E
 
P
V
 
T
M
 
L
I
 
N
S
 
R
E
 
E
M
 
M
I
 
I
K
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
E
H
 
T
F
 
L
S
 
E
A
 
Q
N
 
D
V
 
P
Q
 
A
C
 
A
Q
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
L
K
 
T
A
 
G
N
 
A
G
 
G
K
 
E
N
 
A
F
 
W
S
 
T
A
|
A
G
 
G
A
x
M
D
|
D
L
 
L
N
 
K
W
 
E
M
x
Y
R
 
F
K
 
R
Q
 
E
A
 
-
K
 
-
M
 
V
D
|
D
F
 
A
G
 
G
Q
 
P
N
 
E
L
 
I
-
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
R
S
x
R
D
 
E
A
 
A
N
 
S
E
x
Q
L
 
W
A
 
Q
K
 
-
L
 
-
M
 
W
S
 
K
L
 
L
L
 
L
D
 
R
K
 
M
F
 
Y
P
 
A
K
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
M
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
A
x
W
A
 
C
F
|
F
G
 
G
G
|
G
A
 
G
L
 
F
G
x
S
L
 
P
I
 
L
C
 
V
C
 
A
S
 
C
D
 
D
I
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
C
N
 
A
Q
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
T
F
 
F
C
 
G
L
 
L
S
|
S
E
|
E
V
 
I
K
 
N
L
 
W
G
 
G
L
x
I
I
 
P
P
|
P
A
x
G
-
 
N
V
 
L
I
 
V
S
 
S
P
 
K
Y
 
A
V
 
M
T
 
A
R
 
D
A
 
T
M
 
V
G
 
G
Q
 
H
R
 
R
A
 
Q
A
 
S
R
 
L
R
 
Y
Y
 
Y
M
 
I
L
 
M
T
 
T
A
 
G
E
 
K
R
 
T
F
 
F
D
 
G
V
 
G
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
L
 
A
E
 
E
L
 
M
Q
 
G
V
 
L
I
 
V
H
 
N
E
 
E

Sites not aligning to the query:

2vssD Wild-type hydroxycinnamoyl-coa hydratase lyase in complex with acetyl- coa and vanillin (see paper)
32% identity, 60% coverage: 19:195/293 of query aligns to 9:188/246 of 2vssD

query
sites
2vssD
V
 
V
S
 
K
C
 
V
T
 
E
L
 
I
D
 
E
G
 
D
G
 
G
V
 
I
A
 
A
Q
 
F
M
 
V
V
 
I
L
 
L
D
 
N
R
 
R
A
 
P
D
x
E
K
|
K
H
x
R
N
 
N
A
|
A
F
 
M
D
 
S
E
 
P
V
 
T
M
 
L
I
 
N
S
 
R
E
 
E
M
 
M
I
 
I
K
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
E
H
 
T
F
 
L
S
 
E
A
 
Q
N
 
D
V
 
P
Q
 
A
C
 
A
Q
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
L
K
 
T
A
 
G
N
 
A
G
 
G
K
 
E
N
 
A
F
 
W
S
 
T
A
|
A
G
 
G
A
x
M
D
|
D
L
|
L
N
 
K
W
 
E
M
x
Y
R
x
F
K
 
R
Q
 
E
A
 
-
K
 
-
M
 
V
D
|
D
F
 
A
G
 
G
Q
 
P
N
 
E
L
 
I
-
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
R
S
x
R
D
 
E
A
 
A
N
 
S
E
x
Q
L
 
W
A
x
Q
K
 
-
L
 
-
M
 
W
S
 
K
L
 
L
L
 
L
D
 
R
K
 
M
F
 
Y
P
 
A
K
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
M
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
A
x
W
A
 
C
F
|
F
G
 
G
G
|
G
A
 
G
L
 
F
G
x
S
L
 
P
I
 
L
C
 
V
C
 
A
S
 
C
D
 
D
I
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
C
N
 
A
Q
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
T
F
 
F
C
 
G
L
 
L
S
|
S
E
|
E
V
 
I
K
 
N
L
 
W
G
 
G
L
x
I
I
 
P
P
|
P
A
x
G
-
x
N
V
 
L
I
 
V
S
 
S
P
 
K
Y
 
A
V
 
M
T
 
A
R
 
D
A
 
T
M
 
V
G
 
G
Q
 
H
R
 
R
A
 
Q
A
 
S
R
 
L
R
 
Y
Y
 
Y
M
 
I
L
 
M
T
 
T
A
 
G
E
 
K
R
 
T
F
 
F
D
 
G
V
 
G
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
L
 
A
E
 
E
L
 
M
Q
 
G
V
 
L
I
 
V
H
 
N
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Q7CQ56 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase; DHNA-CoA synthase; EC 4.1.3.36 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720)
28% identity, 88% coverage: 26:282/293 of query aligns to 33:284/285 of Q7CQ56

query
sites
Q7CQ56
G
 
G
V
 
I
A
 
A
Q
 
K
M
 
I
V
 
T
L
 
I
D
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
Q
K
 
V
H
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
D
 
R
E
 
P
V
 
L
M
 
T
I
 
V
S
 
K
E
 
E
M
 
M
I
 
I
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
A
H
 
D
F
 
A
S
 
R
A
 
Y
N
 
D
V
 
D
Q
 
N
C
 
V
Q
 
G
V
 
V
L
 
I
V
 
I
I
 
L
K
 
T
A
 
G
N
 
E
G
 
G
-
 
D
K
 
K
N
 
A
F
 
F
S
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
G
D
 
D
L
 
-
N
 
-
W
 
-
M
 
-
R
 
-
K
 
Q
Q
 
K
A
 
V
K
 
R
M
 
G
D
 
D
F
 
Y
G
 
G
Q
 
G
N
 
Y
L
 
Q
S
 
D
D
 
D
A
 
S
N
 
G
E
 
-
L
 
-
A
 
V
K
 
H
L
 
H
M
 
L
S
 
N
L
 
V
L
 
L
D
 
D
-
 
F
-
 
Q
-
 
R
-
 
Q
-
 
I
-
 
R
K
 
T
F
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
T
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
S
F
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
G
L
 
H
G
 
V
L
 
L
I
 
H
C
 
M
C
 
M
S
 
C
D
 
D
I
 
L
A
 
T
I
 
I
A
 
A
N
 
A
Q
 
E
R
 
N
A
 
A
S
 
I
F
 
F
C
 
G
L
x
Q
S
x
T
E
x
G
V
 
P
K
 
K
L
 
V
G
 
G
L
 
S
I
 
F
P
 
D
A
 
G
V
 
G
I
 
W
-
 
G
S
 
A
P
 
S
Y
 
Y
V
 
M
T
 
A
R
 
R
A
 
I
M
 
V
G
 
G
Q
 
Q
R
 
K
A
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
E
Y
 
I
M
 
W
L
 
F
T
 
L
A
 
C
E
 
R
R
 
Q
F
 
Y
D
 
D
V
 
A
Q
 
Q
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
M
Q
 
G
V
 
L
I
 
V
H
 
N
E
 
T
V
 
V
N
 
V
D
 
P
-
 
L
-
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
K
A
 
E
A
 
T
Q
 
V
P
 
R
M
 
W
I
 
C
D
 
R
A
 
E
L
 
M
L
 
L
C
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
L
 
M
G
 
A
M
 
L
T
 
R
W
 
C
V
 
L
K
 
K
T
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
N
S
 
A
L
 
D
E
 
C
D
 
D
G
 
G
V
 
Q
I
 
A
D
 
G
Q
 
L
N
 
Q
T
 
E
L
 
L
D
 
A
Y
 
G
T
 
N
S
 
A
E
 
T
R
 
M
I
 
L
A
 
-
R
 
-
I
 
F
R
 
Y
V
 
M
S
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
F
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
S
 
Q
P
 
P
Q
 
-
W
 
-
P
 
-
A
 
-
T
 
-
T
 
-
D
 
D
F
 
F
N
 
S
A
 
K
A
 
F
T
 
K
K
 
R
N
 
N

3h02A 2.15 angstrom resolution crystal structure of naphthoate synthase from salmonella typhimurium.
28% identity, 88% coverage: 26:282/293 of query aligns to 29:265/266 of 3h02A

query
sites
3h02A