SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012333617.1 NCBI__GCF_000019365.1:WP_012333617.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5ktlA Dihydrodipicolinate synthase from the industrial and evolutionarily important cyanobacteria anabaena variabilis. (see paper)
27% identity, 90% coverage: 5:273/299 of query aligns to 4:274/295 of 5ktlA

query
sites
5ktlA
D
 
D
W
 
F
G
 
G
G
 
T
I
 
V
F
 
L
P
 
T
V
 
A
L
 
M
V
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
K
P
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
S
I
 
V
N
 
N
E
 
Y
L
 
A
R
 
V
Y
 
A
K
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
A
E
 
H
A
 
L
I
 
V
R
 
D
N
 
N
G
 
G
A
 
T
R
 
D
G
 
T
I
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
C
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
x
S
Y
 
P
A
 
T
L
|
L
T
 
S
I
 
W
S
 
D
E
 
E
R
x
E
A
 
Y
R
 
N
L
 
L
Y
 
F
K
 
V
L
x
E
T
 
V
V
 
L
D
x
Q
H
 
T
V
 
V
A
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
A
P
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
C
A
 
G
D
 
S
L
 
N
R
 
S
V
 
T
E
 
K
D
 
E
V
 
A
V
 
I
D
 
A
A
 
A
C
 
T
Q
 
Q
A
 
K
A
 
A
V
 
A
A
 
K
A
 
I
G
 
G
C
 
V
V
 
H
G
 
G
G
 
T
M
 
L
I
 
Q
L
 
V
P
 
V
P
 
P
I
 
Y
Y
|
Y
A
 
N
M
 
K
P
 
P
S
 
P
P
 
Q
R
 
A
E
 
G
I
 
L
V
 
Y
A
 
Q
F
 
H
F
 
F
E
 
Q
H
 
A
V
 
I
S
 
A
R
 
Q
S
 
A
S
 
C
-
 
P
S
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
L
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
V
P
 
P
R
 
G
R
|
R
A
 
T
G
 
G
I
 
Q
D
 
N
I
 
L
N
 
S
P
 
P
A
 
E
L
 
T
V
 
V
E
 
V
Q
 
R
L
 
L
S
 
A
K
 
E
L
 
I
P
 
D
T
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
V
K
|
K
D
 
E
S
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
N
I
 
L
N
 
D
Q
 
Q
V
 
A
T
 
G
E
 
E
L
 
I
V
 
R
Q
 
R
R
 
S
V
 
T
G
 
P
G
 
K
S
 
E
L
 
F
R
 
Q
V
 
I
F
 
Y
V
 
A
G
 
G
Y
 
D
E
 
D
T
 
S
M
 
L
I
 
T
V
 
L
P
 
P
A
 
L
R
 
L
A
 
A
V
 
I
G
 
G
A
 
A
H
 
K
G
 
G
V
 
V
I
x
V
A
 
S
M
 
V
A
 
A
H
 
S
Q
 
H
I
 
L
A
 
V
G
 
G
P
 
N
L
 
Q
I
 
L
R
 
Q
D
 
Q
Y
 
M
W
 
I
D
 
-
Q
 
Q
A
 
A
L
 
F
K
 
N
G
 
S
G
 
G
E
 
Q
S
 
V
V
 
T
-
 
V
-
 
A
D
 
S
D
 
D
M
 
I
G
 
H
R
 
L
D
 
R
V
 
L
F
 
L
A
 
P
F
 
L
Y
 
F
R
 
K
C
 
A
F
 
L
Q
 
F
S
 
I
G
 
T
A
 
T
Y
 
N
Y
 
P
A
 
I
A
 
P
I
 
I
K
 
K
E
 
Q
T
 
A
M
 
L
T
 
K
Q
 
L
L
 
Q
G
 
G
R
 
W
D
 
E
A
 
V
G
 
G
G
 
S
P
 
T
R
 
R
L
 
P
P
 
P
L
 
L

4pfmA Shewanella benthica dhdps with lysine and pyruvate
29% identity, 89% coverage: 13:279/299 of query aligns to 10:278/295 of 4pfmA

query
sites
4pfmA
L
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
L
G
 
N
P
 
S
D
 
D
G
 
G
S
 
T
I
 
V
N
 
D
E
 
Y
L
 
T
R
 
S
Y
 
L
K
 
E
E
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
E
E
 
Y
A
 
H
I
 
I
R
 
T
N
 
E
G
 
G
A
 
T
R
 
D
G
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
x
S
Y
x
A
A
 
T
L
|
L
T
 
P
I
 
I
S
 
S
E
 
E
R
x
H
A
 
I
R
 
A
L
 
V
Y
 
V
K
 
G
L
 
Q
T
 
T
V
 
V
D
 
K
H
 
F
V
 
A
A
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
G
G
 
G
V
 
N
A
 
G
D
 
A
L
x
N
R
 
A
V
 
T
E
 
A
D
x
E
V
 
A
V
 
I
D
 
E
A
 
L
C
 
T
Q
 
K
A
 
A
A
 
Q
V
 
N
A
 
K
A
 
L
G
 
G
C
 
V
V
 
A
G
 
A
G
 
M
M
 
L
I
 
G
L
 
V
P
 
T
P
 
P
I
x
Y
Y
|
Y
A
 
N
M
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
K
E
 
G
I
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
H
F
 
Y
E
 
T
H
 
A
V
 
V
S
 
A
R
 
A
S
 
S
S
 
T
S
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
V
P
 
P
R
 
G
R
|
R
A
 
T
G
 
A
I
 
V
D
 
D
I
 
M
N
 
L
P
 
P
A
 
E
L
 
T
V
 
I
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
V
K
 
E
L
 
V
P
 
P
T
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
V
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
D
I
 
V
N
 
A
Q
 
R
V
 
V
T
 
K
E
 
Q
L
 
L
V
 
R
Q
 
D
R
 
L
V
 
C
G
 
G
G
 
N
S
 
D
L
 
F
R
 
L
V
 
L
F
 
Y
V
 
S
G
 
G
Y
 
D
E
 
D
T
 
A
M
 
T
I
 
A
V
 
R
P
 
E
A
 
F
R
 
L
A
 
T
V
 
L
G
 
G
A
 
G
H
 
D
G
 
G
V
 
V
I
|
I
A
 
S
M
 
V
A
 
A
H
 
N
Q
 
N
I
 
I
A
 
V
G
 
P
P
 
K
L
 
L
I
 
F
R
 
K
D
 
L
Y
 
M
W
 
C
D
 
D
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
A
G
 
G
G
 
D
E
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
A
-
 
M
S
 
A
V
 
A
D
 
E
D
 
D
M
 
Q
G
 
I
R
 
K
D
 
G
V
 
L
F
 
F
A
 
S
F
 
A
Y
 
L
R
 
F
C
 
C
F
 
-
Q
 
-
S
 
-
G
 
E
A
 
A
Y
 
N
Y
 
P
A
 
I
A
 
P
I
 
V
K
 
K
E
 
W
T
 
A
M
 
A
T
 
H
Q
 
K
L
 
M
G
 
G
R
 
L
-
 
I
D
 
S
A
 
Q
G
 
G
G
 
D
P
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
T
P
 
E
L
 
L
T
 
S
G
 
T
D
 
E

3s8hA Structure of dihydrodipicolinate synthase complexed with 3- hydroxypropanoic acid(hpa)at 2.70 a resolution
32% identity, 69% coverage: 8:214/299 of query aligns to 4:210/292 of 3s8hA

query
sites
3s8hA
G
 
G
I
 
S
F
 
M
P
 
V
V
x
A
L
|
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
D
P
 
A
D
 
Q
G
 
G
S
 
R
I
 
L
N
 
D
E
 
W
L
 
D
R
 
S
Y
 
L
K
 
A
E
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
F
A
 
H
I
 
L
R
 
Q
N
 
D
G
 
G
A
 
T
R
 
N
G
 
A
I
 
I
V
|
V
A
 
A
A
 
V
G
|
G
S
x
T
T
|
T
G
|
G
E
 
E
F
 
S
Y
 
A
A
 
T
L
 
L
T
 
D
I
 
V
S
 
E
E
 
E
R
 
H
A
 
I
R
 
Q
L
 
V
Y
 
V
K
 
R
L
 
R
T
 
V
V
 
V
D
 
D
H
 
Q
V
 
V
A
 
K
G
 
G
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
A
 
G
D
 
A
L
 
N
R
 
S
V
 
T
E
 
R
D
 
E
V
 
A
V
 
V
D
 
A
A
 
L
C
 
T
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
K
A
 
S
A
 
G
G
 
G
C
 
A
V
 
D
G
 
A
G
 
C
M
 
L
I
 
L
L
 
V
P
 
T
P
 
P
I
 
Y
Y
|
Y
A
 
N
M
 
K
P
 
P
S
 
T
P
 
Q
R
 
E
E
 
G
I
 
M
V
 
Y
A
 
Q
F
 
H
F
 
F
E
 
R
H
 
H
V
 
I
S
 
A
R
 
E
S
 
A
S
 
V
S
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
V
P
 
P
R
 
G
R
|
R
A
 
T
G
 
S
I
 
C
D
 
D
I
 
M
N
 
L
P
 
P
A
 
E
L
 
T
V
 
V
E
 
E
Q
 
R
L
 
L
S
 
S
K
 
K
L
 
V
P
 
P
T
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
E
S
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
D
I
 
L
N
 
Q
Q
 
R
V
 
A
T
 
K
E
 
E
L
 
V
V
 
I
Q
 
E
R
 
R
V
 
V
G
 
G
G
 
K
S
 
D
L
 
F
R
 
L
V
 
V
F
 
Y
V
 
S
G
 
G
Y
 
D
E
 
D
T
 
A
M
 
T
I
 
A
V
 
V
P
 
E
A
 
L
R
 
M
A
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
G
H
 
K
G
 
G
V
 
N
I
|
I
A
 
S
M
 
V
A
 
T
H
 
A
Q
 
N
I
 
V
A
 
A

3puoA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from pseudomonas aeruginosa(psdhdps)complexed with l-lysine at 2.65a resolution (see paper)
32% identity, 69% coverage: 8:214/299 of query aligns to 4:210/292 of 3puoA

query
sites
3puoA
G
 
G
I
 
S
F
 
M
P
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
D
P
 
A
D
 
Q
G
 
G
S
 
R
I
 
L
N
 
D
E
 
W
L
 
D
R
 
S
Y
 
L
K
 
A
E
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
F
A
 
H
I
 
L
R
 
Q
N
 
D
G
 
G
A
 
T
R
 
N
G
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
x
S
Y
x
A
A
 
T
L
|
L
T
x
D
I
x
V
S
 
E
E
 
E
R
 
H
A
 
I
R
 
Q
L
 
V
Y
 
V
K
 
R
L
 
R
T
 
V
V
 
V
D
 
D
H
 
Q
V
 
V
A
 
K
G
 
G
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
A
 
G
D
 
A
L
 
N
R
 
S
V
 
T
E
 
R
D
 
E
V
 
A
V
 
V
D
 
A
A
 
L
C
 
T
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
K
A
 
S
A
 
G
G
 
G
C
 
A
V
 
D
G
 
A
G
 
C
M
 
L
I
 
L
L
 
V
P
 
T
P
 
P
I
 
Y
Y
|
Y
A
 
N
M
 
K
P
 
P
S
 
T
P
 
Q
R
 
E
E
 
G
I
 
M
V
 
Y
A
 
Q
F
 
H
F
 
F
E
 
R
H
 
H
V
 
I
S
 
A
R
 
E
S
 
A
S
 
V
S
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
V
P
 
P
R
 
G
R
|
R
A
 
T
G
 
S
I
 
C
D
 
D
I
 
M
N
 
L
P
 
P
A
 
E
L
 
T
V
 
V
E
 
E
Q
 
R
L
 
L
S
 
S
K
 
K
L
 
V
P
 
P
T
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
E
S
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
D
I
 
L
N
 
Q
Q
 
R
V
 
A
T
 
K
E
 
E
L
 
V
V
 
I
Q
 
E
R
 
R
V
 
V
G
 
G
G
 
K
S
 
D
L
 
F
R
 
L
V
 
V
F
 
Y
V
 
S
G
 
G
Y
 
D
E
 
D
T
 
A
M
 
T
I
 
A
V
 
V
P
 
E
A
 
L
R
 
M
A
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
G
H
 
K
G
 
G
V
 
N
I
|
I
A
 
S
M
 
V
A
 
T
H
 
A
Q
 
N
I
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4ptnA Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein in complex with magnesium cation coordinated l-glyceraldehyde (see paper)
29% identity, 89% coverage: 6:272/299 of query aligns to 3:275/298 of 4ptnA

query
sites
4ptnA
W
 
F
G
 
T
G
 
G
I
 
I
F
 
I
P
 
P
V
x
P
L
 
V
V
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
G
 
T
P
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
Q
I
 
L
N
 
D
E
 
K
L
 
P
R
 
G
Y
 
T
K
 
A
E
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
D
A
 
L
I
 
I
R
 
K
N
 
A
G
 
G
A
 
V
R
 
D
G
 
G
I
 
L
V
 
F
A
 
F
A
 
L
G
 
G
S
|
S
T
x
G
G
 
G
E
 
E
F
 
F
Y
 
S
A
 
Q
L
 
L
T
 
G
I
 
A
S
 
E
E
 
E
R
 
R
A
 
K
R
 
A
L
 
I
Y
 
A
K
 
R
L
 
F
T
 
A
V
 
I
D
 
D
H
 
H
V
 
V
A
 
D
G
 
R
R
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
G
 
G
V
 
T
A
 
G
D
 
G
L
 
T
R
 
N
V
 
A
E
 
R
D
 
E
V
 
T
V
 
I
D
 
E
A
 
L
C
 
S
Q
 
Q
A
 
H
A
 
A
V
 
Q
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
C
 
A
V
 
D
G
 
G
G
 
I
M
 
V
I
 
V
L
 
I
P
 
N
P
 
P
I
 
Y
Y
|
Y
A
 
W
M
 
K
P
 
V
S
 
S
P
 
E
R
 
A
E
 
N
I
 
L
V
 
I
A
 
R
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
H
 
Q
V
 
V
S
 
A
R
 
D
S
 
S
S
 
V
S
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
F
P
 
P
R
 
A
R
x
L
A
 
T
G
 
G
I
 
Q
D
 
D
I
 
L
N
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
K
Q
 
T
L
 
L
S
 
A
-
 
D
K
 
S
L
 
R
P
 
S
T
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
 
T
S
 
I
G
 
D
L
 
S
I
 
V
N
 
A
Q
 
H
V
 
L
T
 
R
E
 
S
L
 
M
V
 
I
Q
 
H
R
 
T
V
 
V
G
 
K
G
 
G
S
 
A
-
 
H
-
 
P
-
 
H
L
 
F
R
 
T
V
 
V
F
 
L
V
 
C
G
|
G
Y
|
Y
E
 
D
T
 
D
M
 
H
I
 
L
V
 
F
P
 
N
A
 
T
R
 
L
A
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
G
H
 
D
G
 
G
V
 
A
I
|
I
A
 
S
M
x
A
A
 
S
H
 
G
Q
 
N
I
 
F
A
 
A
G
 
-
P
 
P
L
 
Q
I
 
V
R
 
S
D
 
V
Y
 
N
W
 
L
D
 
L
Q
 
K
A
 
A
L
 
W
K
 
R
G
 
D
G
 
G
E
 
D
S
 
V
V
 
A
D
 
K
D
 
A
M
 
A
G
 
G
-
 
Y
-
 
H
R
 
Q
D
 
T
V
 
L
F
 
L
A
 
Q
F
 
I
Y
 
P
R
 
Q
C
 
M
F
 
Y
Q
 
Q
-
 
L
S
 
D
G
 
T
A
 
P
Y
 
F
Y
 
V
A
 
N
A
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
T
 
A
M
 
I
T
 
V
Q
 
L
L
 
C
G
 
G
R
 
R
D
 
P
A
 
V
G
 
S
G
 
T
P
 
H
R
 
V
L
 
L
P
 
P

4onvA Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein in complex with 2- keto-3-deoxy gluconate
29% identity, 89% coverage: 6:272/299 of query aligns to 3:275/298 of 4onvA

query
sites
4onvA
W
 
F
G
 
T
G
 
G
I
 
I
F
 
I
P
 
P
V
x
P
L
 
V
V
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
G
 
T
P
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
Q
I
 
L
N
 
D
E
 
K
L
 
P
R
 
G
Y
 
T
K
 
A
E
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
D
A
 
L
I
 
I
R
 
K
N
 
A
G
 
G
A
 
V
R
 
D
G
 
G
I
 
L
V
x
F
A
 
F
A
 
L
G
|
G
S
|
S
T
 
G
G
 
G
E
 
E
F
 
F
Y
 
S
A
 
Q
L
 
L
T
 
G
I
 
A
S
 
E
E
 
E
R
 
R
A
 
K
R
 
A
L
 
I
Y
 
A
K
 
R
L
 
F
T
 
A
V
 
I
D
 
D
H
 
H
V
 
V
A
 
D
G
 
R
R
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
G
 
G
V
 
T
A
 
G
D
 
G
L
 
T
R
 
N
V
 
A
E
 
R
D
 
E
V
 
T
V
 
I
D
 
E
A
 
L
C
 
S
Q
 
Q
A
 
H
A
 
A
V
 
Q
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
C
 
A
V
 
D
G
 
G
G
 
I
M
 
V
I
 
V
L
 
I
P
 
N
P
 
P
I
 
Y
Y
|
Y
A
 
W
M
 
K
P
 
V
S
 
S
P
 
E
R
 
A
E
 
N
I
 
L
V
 
I
A
 
R
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
H
 
Q
V
 
V
S
 
A
R
 
D
S
 
S
S
 
V
S
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
F
P
 
P
R
 
A
R
x
L
A
 
T
G
 
G
I
 
Q
D
 
D
I
 
L
N
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
K
Q
 
T
L
 
L
S
 
A
-
 
D
K
 
S
L
 
R
P
 
S
T
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
 
T
S
 
I
G
 
D
L
 
S
I
 
V
N
 
A
Q
 
H
V
 
L
T
 
R
E
 
S
L
 
M
V
 
I
Q
 
H
R
 
T
V
 
V
G
 
K
G
 
G
S
 
A
-
 
H
-
 
P
-
 
H
L
 
F
R
 
T
V
 
V
F
 
L
V
 
C
G
|
G
Y
|
Y
E
 
D
T
 
D
M
 
H
I
 
L
V
 
F
P
 
N
A
 
T
R
 
L
A
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
G
H
 
D
G
 
G
V
 
A
I
|
I
A
x
S
M
 
A
A
 
S
H
 
G
Q
 
N
I
 
F
A
 
A
G
 
-
P
 
P
L
 
Q
I
 
V
R
 
S
D
 
V
Y
 
N
W
 
L
D
 
L
Q
 
K
A
 
A
L
 
W
K
 
R
G
 
D
G
 
G
E
 
D
S
 
V
V
 
A
D
 
K
D
 
A
M
 
A
G
 
G
-
 
Y
-
 
H
R
 
Q
D
 
T
V
 
L
F
 
L
A
 
Q
F
 
I
Y
 
P
R
 
Q
C
 
M
F
 
Y
Q
 
Q
-
 
L
S
 
D
G
 
T
A
 
P
Y
 
F
Y
 
V
A
 
N
A
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
T
 
A
M
 
I
T
 
V
Q
 
L
L
 
C
G
 
G
R
 
R
D
 
P
A
 
V
G
 
S
G
 
T
P
 
H
R
 
V
L
 
L
P
 
P

4oe7D Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein, in complex with aldol condensed product of pyruvate and glyoxal
29% identity, 89% coverage: 6:272/299 of query aligns to 3:275/298 of 4oe7D

query
sites
4oe7D
W
 
F
G
 
T
G
 
G
I
 
I
F
 
I
P
 
P
V
x
P
L
 
V
V
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
G
 
T
P
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
Q
I
 
L
N
 
D
E
 
K
L
 
P
R
 
G
Y
 
T
K
 
A
E
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
D
A
 
L
I
 
I
R
 
K
N
 
A
G
 
G
A
 
V
R
 
D
G
 
G
I
 
L
V
 
F
A
 
F
A
 
L
G
|
G
S
|
S
T
x
G
G
 
G
E
 
E
F
 
F
Y
 
S
A
 
Q
L
 
L
T
 
G
I
 
A
S
 
E
E
 
E
R
 
R
A
 
K
R
 
A
L
 
I
Y
 
A
K
 
R
L
 
F
T
 
A
V
 
I
D
 
D
H
 
H
V
 
V
A
 
D
G
 
R
R
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
G
 
G
V
 
T
A
 
G
D
 
G
L
 
T
R
 
N
V
 
A
E
 
R
D
 
E
V
 
T
V
 
I
D
 
E
A
 
L
C
 
S
Q
 
Q
A
 
H
A
 
A
V
 
Q
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
C
 
A
V
 
D
G
 
G
G
 
I
M
 
V
I
 
V
L
 
I
P
 
N
P
 
P
I
 
Y
Y
|
Y
A
 
W
M
 
K
P
 
V
S
 
S
P
 
E
R
 
A
E
 
N
I
 
L
V
 
I
A
 
R
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
H
 
Q
V
 
V
S
 
A
R
 
D
S
 
S
S
 
V
S
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
x
F
P
 
P
R
 
A
R
x
L
A
 
T
G
 
G
I
 
Q
D
 
D
I
 
L
N
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
K
Q
 
T
L
 
L
S
 
A
-
 
D
K
 
S
L
 
R
P
 
S
T
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
x
T
S
 
I
G
 
D
L
 
S
I
 
V
N
 
A
Q
 
H
V
 
L
T
 
R
E
 
S
L
 
M
V
 
I
Q
 
H
R
 
T
V
 
V
G
 
K
G
 
G
S
 
A
-
 
H
-
 
P
-
 
H
L
 
F
R
 
T
V
 
V
F
 
L
V
 
C
G
|
G
Y
 
Y
E
 
D
T
 
D
M
 
H
I
 
L
V
 
F
P
 
N
A
 
T
R
 
L
A
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
G
H
 
D
G
 
G
V
 
A
I
|
I
A
 
S
M
 
A
A
 
S
H
 
G
Q
 
N
I
 
F
A
 
A
G
 
-
P
 
P
L
 
Q
I
 
V
R
 
S
D
 
V
Y
 
N
W
 
L
D
 
L
Q
 
K
A
 
A
L
 
W
K
 
R
G
 
D
G
 
G
E
 
D
S
 
V
V
 
A
D
 
K
D
 
A
M
 
A
G
 
G
-
 
Y
-
 
H
R
 
Q
D
 
T
V
 
L
F
 
L
A
 
Q
F
 
I
Y
 
P
R
 
Q
C
 
M
F
 
Y
Q
 
Q
-
 
L
S
 
D
G
 
T
A
 
P
Y
 
F
Y
 
V
A
 
N
A
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
T
 
A
M
 
I
T
 
V
Q
 
L
L
 
C
G
 
G
R
 
R
D
 
P
A
 
V
G
 
S
G
 
T
P
 
H
R
 
V
L
 
L
P
 
P

4oe7B Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein, in complex with aldol condensed product of pyruvate and glyoxal
29% identity, 89% coverage: 6:272/299 of query aligns to 3:275/298 of 4oe7B

query
sites
4oe7B
W
 
F
G
 
T
G
 
G
I
 
I
F
 
I
P
 
P
V
x
P
L
 
V
V
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
G
 
T
P
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
Q
I
 
L
N
 
D
E
 
K
L
 
P
R
 
G
Y
 
T
K
 
A
E
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
D
A
 
L
I
 
I
R
 
K
N
 
A
G
 
G
A
 
V
R
 
D
G
 
G
I
 
L
V
 
F
A
 
F
A
 
L
G
|
G
S
|
S
T
x
G
G
 
G
E
 
E
F
 
F
Y
 
S
A
 
Q
L
 
L
T
 
G
I
 
A
S
 
E
E
 
E
R
 
R
A
 
K
R
 
A
L
 
I
Y
 
A
K
 
R
L
 
F
T
 
A
V
 
I
D
 
D
H
 
H
V
 
V
A
 
D
G
 
R
R
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
G
 
G
V
 
T
A
 
G
D
 
G
L
 
T
R
 
N
V
 
A
E
 
R
D
 
E
V
 
T
V
 
I
D
 
E
A
 
L
C
 
S
Q
 
Q
A
 
H
A
 
A
V
 
Q
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
C
 
A
V
 
D
G
 
G
G
 
I
M
 
V
I
 
V
L
 
I
P
 
N
P
 
P
I
 
Y
Y
|
Y
A
 
W
M
 
K
P
 
V
S
 
S
P
 
E
R
 
A
E
 
N
I
 
L
V
 
I
A
 
R
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
H
 
Q
V
 
V
S
 
A
R
 
D
S
 
S
S
 
V
S
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
x
F
P
 
P
R
 
A
R
x
L
A
 
T
G
 
G
I
 
Q
D
 
D
I
 
L
N
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
K
Q
 
T
L
 
L
S
 
A
-
 
D
K
 
S
L
 
R
P
 
S
T
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
x
T
S
 
I
G
 
D
L
 
S
I
 
V
N
 
A
Q
 
H
V
 
L
T
 
R
E
 
S
L
 
M
V
 
I
Q
 
H
R
 
T
V
 
V
G
 
K
G
 
G
S
 
A
-
 
H
-
 
P
-
 
H
L
 
F
R
 
T
V
 
V
F
 
L
V
 
C
G
|
G
Y
 
Y
E
 
D
T
 
D
M
 
H
I
 
L
V
 
F
P
 
N
A
 
T
R
 
L
A
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
G
H
 
D
G
 
G
V
 
A
I
|
I
A
 
S
M
 
A
A
 
S
H
 
G
Q
 
N
I
 
F
A
 
A
G
 
-
P
 
P
L
 
Q
I
 
V
R
 
S
D
 
V
Y
 
N
W
 
L
D
 
L
Q
 
K
A
 
A
L
 
W
K
 
R
G
 
D
G
 
G
E
 
D
S
 
V
V
 
A
D
 
K
D
 
A
M
 
A
G
 
G
-
 
Y
-
 
H
R
 
Q
D
 
T
V
 
L
F
 
L
A
 
Q
F
 
I
Y
 
P
R
 
Q
C
 
M
F
 
Y
Q
 
Q
-
 
L
S
 
D
G
 
T
A
 
P
Y
 
F
Y
 
V
A
 
N
A
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
T
 
A
M
 
I
T
 
V
Q
 
L
L
 
C
G
 
G
R
 
R
D
 
P
A
 
V
G
 
S
G
 
T
P
 
H
R
 
V
L
 
L
P
 
P

4oe7A Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein, in complex with aldol condensed product of pyruvate and glyoxal
29% identity, 89% coverage: 6:272/299 of query aligns to 3:275/298 of 4oe7A

query
sites
4oe7A
W
 
F
G
 
T
G
 
G
I
 
I
F
 
I
P
 
P
V
x
P
L
 
V
V
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
G
 
T
P
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
Q
I
 
L
N
 
D
E
 
K
L
 
P
R
 
G
Y
 
T
K
 
A
E
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
D
A
 
L
I
 
I
R
 
K
N
 
A
G
 
G
A
 
V
R
 
D
G
 
G
I
 
L
V
 
F
A
 
F
A
 
L
G
|
G
S
|
S
T
x
G
G
 
G
E
 
E
F
 
F
Y
 
S
A
 
Q
L
 
L
T
 
G
I
 
A
S
 
E
E
 
E
R
 
R
A
 
K
R
 
A
L
 
I
Y
 
A
K
 
R
L
 
F
T
 
A
V
 
I
D
 
D
H
 
H
V
 
V
A
 
D
G
 
R
R
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
G
 
G
V
 
T
A
 
G
D
 
G
L
 
T
R
 
N
V
 
A
E
 
R
D
 
E
V
 
T
V
 
I
D
 
E
A
 
L
C
 
S
Q
 
Q
A
 
H
A
 
A
V
 
Q
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
C
 
A
V
 
D
G
 
G
G
 
I
M
 
V
I
 
V
L
 
I
P
 
N
P
 
P
I
 
Y
Y
|
Y
A
 
W
M
 
K
P
 
V
S
 
S
P
 
E
R
 
A
E
 
N
I
 
L
V
 
I
A
 
R
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
H
 
Q
V
 
V
S
 
A
R
 
D
S
 
S
S
 
V
S
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
F
P
 
P
R
 
A
R
x
L
A
 
T
G
 
G
I
 
Q
D
 
D
I
 
L
N
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
K
Q
 
T
L
 
L
S
 
A
-
 
D
K
 
S
L
 
R
P
 
S
T
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
 
T
S
 
I
G
 
D
L
 
S
I
 
V
N
 
A
Q
 
H
V
 
L
T
 
R
E
 
S
L
 
M
V
 
I
Q
 
H
R
 
T
V
 
V
G
 
K
G
 
G
S
 
A
-
 
H
-
 
P
-
 
H
L
 
F
R
 
T
V
 
V
F
 
L
V
 
C
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
T
 
D
M
 
H
I
 
L
V
 
F
P
 
N
A
 
T
R
 
L
A
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
G
H
 
D
G
 
G
V
 
A
I
|
I
A
 
S
M
 
A
A
 
S
H
 
G
Q
 
N
I
 
F
A
 
A
G
 
-
P
 
P
L
 
Q
I
 
V
R
 
S
D
 
V
Y
 
N
W
 
L
D
 
L
Q
 
K
A
 
A
L
 
W
K
 
R
G
 
D
G
 
G
E
 
D
S
 
V
V
 
A
D
 
K
D
 
A
M
 
A
G
 
G
-
 
Y
-
 
H
R
 
Q
D
 
T
V
 
L
F
 
L
A
 
Q
F
 
I
Y
 
P
R
 
Q
C
 
M
F
 
Y
Q
 
Q
-
 
L
S
 
D
G
 
T
A
 
P
Y
 
F
Y
 
V
A
 
N
A
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
T
 
A
M
 
I
T
 
V
Q
 
L
L
 
C
G
 
G
R
 
R
D
 
P
A
 
V
G
 
S
G
 
T
P
 
H
R
 
V
L
 
L
P
 
P

3nevA Crystal structure of yage, a prophage protein from e. Coli k12 in complex with kdgal (see paper)
29% identity, 89% coverage: 6:272/299 of query aligns to 3:275/298 of 3nevA

query
sites
3nevA
W
 
F
G
 
T
G
 
G
I
 
I
F
 
I
P
 
P
V
x
P
L
 
V
V
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
G
 
T
P
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
Q
I
 
L
N
 
D
E
 
K
L
 
P
R
 
G
Y
 
T
K
 
A
E
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
D
A
 
L
I
 
I
R
 
K
N
 
A
G
 
G
A
 
V
R
 
D
G
 
G
I
 
L
V
 
F
A
 
F
A
 
L
G
|
G
S
|
S
T
x
G
G
 
G
E
 
E
F
 
F
Y
 
S
A
 
Q
L
 
L
T
 
G
I
 
A
S
 
E
E
 
E
R
 
R
A
 
K
R
 
A
L
 
I
Y
 
A
K
 
R
L
 
F
T
 
A
V
 
I
D
 
D
H
 
H
V
 
V
A
 
D
G
 
R
R
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
G
 
G
V
 
T
A
 
G
D
 
G
L
 
T
R
 
N
V
 
A
E
 
R
D
 
E
V
 
T
V
 
I
D
 
E
A
 
L
C
 
S
Q
 
Q
A
 
H
A
 
A
V
 
Q
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
C
 
A
V
 
D
G
 
G
G
 
I
M
 
V
I
 
V
L
 
I
P
 
N
P
 
P
I
 
Y
Y
|
Y
A
 
W
M
 
K
P
 
V
S
 
S
P
 
E
R
 
A
E
 
N
I
 
L
V
 
I
A
 
R
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
H
 
Q
V
 
V
S
 
A
R
 
D
S
 
S
S
 
V
S
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
x
F
P
 
P
R
 
A
R
x
L
A
 
T
G
 
G
I
 
Q
D
 
D
I
 
L
N
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
K
Q
 
T
L
 
L
S
 
A
-
 
D
K
 
S
L
 
R
P
 
S
T
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
x
T
S
 
I
G
 
D
L
 
S
I
 
V
N
 
A
Q
 
H
V
 
L
T
 
R
E
 
S
L
 
M
V
 
I
Q
 
H
R
 
T
V
 
V
G
 
K
G
 
G
S
 
A
-
 
H
-
 
P
-
 
H
L
 
F
R
 
T
V
 
V
F
 
L
V
 
C
G
|
G
Y
 
Y
E
 
D
T
 
D
M
 
H
I
 
L
V
 
F
P
 
N
A
 
T
R
 
L
A
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
G
H
 
D
G
 
G
V
 
A
I
|
I
A
 
S
M
x
A
A
 
S
H
 
G
Q
 
N
I
 
F
A
 
A
G
 
-
P
 
P
L
 
Q
I
 
V
R
 
S
D
 
V
Y
 
N
W
 
L
D
 
L
Q
 
K
A
 
A
L
 
W
K
 
R
G
 
D
G
 
G
E
 
D
S
 
V
V
 
A
D
 
K
D
 
A
M
 
A
G
 
G
-
 
Y
-
 
H
R
 
Q
D
 
T
V
 
L
F
 
L
A
 
Q
F
 
I
Y
 
P
R
 
Q
C
 
M
F
 
Y
Q
 
Q
-
 
L
S
 
D
G
 
T
A
 
P
Y
 
F
Y
 
V
A
 
N
A
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
T
 
A
M
 
I
T
 
V
Q
 
L
L
 
C
G
 
G
R
 
R
D
 
P
A
 
V
G
 
S
G
 
T
P
 
H
R
 
V
L
 
L
P
 
P

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
24% identity, 96% coverage: 8:293/299 of query aligns to 4:290/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
G
 
G
I
 
S
F
 
I
P
 
V
V
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
G
 
L
P
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
G
I
 
V
N
 
D
E
 
W
L
 
K
R
 
S
Y
 
L
K
 
E
E
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
E
E
 
W
A
 
H
I
 
I
R
 
E
N
 
Q
G
 
G
A
 
T
R
 
N
G
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
A
Y
 
S
A
 
T
L
 
L
T
 
S
I
 
M
S
 
E
E
 
E
R
 
H
A
 
T
R
 
Q
L
 
V
Y
 
I
K
 
K
L
 
E
T
 
I
V
 
I
D
 
R
H
 
V
V
 
A
A
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
A
 
G
D
 
A
L
 
N
R
 
S
V
 
T
E
 
R
D
 
E
V
 
A
V
 
I
D
 
E
A
 
L
C
 
T
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
D
G
 
A
G
 
A
M
 
L
I
 
L
L
 
V
P
x
T
P
 
P
I
 
Y
Y
|
Y
A
 
N
M
 
K
P
 
P
S
 
T
P
 
Q
R
 
E
E
 
G
I
 
L
V
 
Y
A
 
Q
F
 
H
F
 
Y
E
 
K
H
 
A
V
 
I
S
 
A
R
 
E
S
 
A
S
 
V
S
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
|
N
S
x
V
P
|
P
R
 
G
R
|
R
A
x
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
L
N
 
S
P
 
N
A
 
D
L
 
T
V
 
A
E
 
V
Q
 
R
L
 
L
S
 
A
K
 
E
L
 
I
P
 
P
T
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
D
I
 
V
N
 
P
Q
 
R
V
 
G
T
 
K
E
 
A
L
 
L
V
 
I
Q
 
D
R
 
A
V
 
L
G
 
N
G
 
G
S
 
K
L
 
M
R
 
A
V
 
V
F
 
Y
V
 
S
G
 
G
Y
 
D
E
 
D
T
 
E
M
 
T
I
 
A
V
 
W
P
 
E
A
 
L
R
 
M
A
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
G
V
 
N
I
|
I
A
 
S
M
 
V
A
 
T
H
 
A
Q
 
N
I
 
I
A
 
A
G
 
P
P
 
K
L
 
A
I
 
M
R
 
S
D
 
E
Y
 
V
W
 
C
D
 
A
Q
 
V
A
 
A
L
 
I
-
 
A
K
 
K
G
 
D
G
 
E
E
 
Q
S
 
Q
V
 
A
D
 
K
D
 
T
M
 
L
G
 
N
R
 
N
D
 
K
V
 
I
F
 
A
A
 
N
F
 
L
Y
 
H
R
 
N
C
 
I
F
 
L
Q
 
F
S
 
C
G
 
E
A
 
S
Y
 
N
Y
 
P
A
 
I
A
 
P
I
 
V
K
 
K
E
 
W
T
 
A
M
 
L
T
 
H
Q
 
E
L
 
M
G
 
G
R
 
L
D
 
I
A
 
D
G
 
T
G
 
G
P
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
T
P
 
P
L
 
L
T
 
A
G
 
E
D
 
Q
Q
 
Y
K
 
R
A
 
E
A
 
P
I
 
L
A
 
R
K
 
N
I
 
A
I
 
L
G
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
I

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
24% identity, 96% coverage: 8:293/299 of query aligns to 4:290/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
G
 
G
I
 
S
F
 
I
P
 
V
V
x
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
G
 
L
P
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
G
I
 
V
N
 
D
E
 
W
L
 
K
R
 
S
Y
 
L
K
 
E
E
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
E
E
 
W
A
 
H
I
 
I
R
 
E
N
 
Q
G
 
G
A
 
T
R
 
N
G
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
V
G
|
G
S
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
F
 
A
Y
 
S
A
 
T
L
 
L
T
 
S
I
 
M
S
 
E
E
 
E
R
 
H
A
 
T
R
 
Q
L
 
V
Y
 
I
K
 
K
L
 
E
T
 
I
V
 
I
D
 
R
H
 
V
V
 
A
A
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
A
 
G
D
 
A
L
 
N
R
 
S
V
 
T
E
 
R
D
 
E
V
 
A
V
 
I
D
 
E
A
 
L
C
 
T
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
D
G
 
A
G
 
A
M
x
L
I
 
L
L
 
V
P
 
T
P
 
P
I
 
Y
Y
|
Y
A
 
N
M
 
K
P
 
P
S
 
T
P
 
Q
R
 
E
E
 
G
I
 
L
V
 
Y
A
 
Q
F
 
H
F
 
Y
E
 
K
H
 
A
V
 
I
S
 
A
R
 
E
S
 
A
S
 
V
S
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
V
P
 
P
R
 
G
R
|
R
A
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
L
N
 
S
P
 
N
A
 
D
L
 
T
V
 
A
E
 
V
Q
 
R
L
 
L
S
 
A
K
 
E
L
 
I
P
 
P
T
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
D
I
 
V
N
 
P
Q
 
R
V
 
G
T
 
K
E
 
A
L
 
L
V
 
I
Q
 
D
R
 
A
V
 
L
G
 
N
G
 
G
S
 
K
L
 
M
R
 
A
V
 
V
F
 
Y
V
 
S
G
 
G
Y
 
D
E
 
D
T
 
E
M
 
T
I
 
A
V
 
W
P
 
E
A
 
L
R
 
M
A
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
G
V
 
N
I
|
I
A
 
S
M
 
V
A
 
T
H
 
A
Q
 
N
I
 
I
A
 
A
G
 
P
P
 
K
L
 
A
I
 
M
R
 
S
D
 
E
Y
 
V
W
 
C
D
 
A
Q
 
V
A
 
A
L
 
I
-
 
A
K
 
K
G
 
D
G
 
E
E
 
Q
S
 
Q
V
 
A
D
 
K
D
 
T
M
 
L
G
 
N
R
 
N
D
 
K
V
 
I
F
 
A
A
 
N
F
 
L
Y
 
H
R
 
N
C
 
I
F
 
L
Q
 
F
S
 
C
G
 
E
A
 
S
Y
 
N
Y
 
P
A
 
I
A
 
P
I
 
V
K
 
K
E
 
W
T
 
A
M
 
L
T
 
H
Q
 
E
L
 
M
G
 
G
R
 
L
D
 
I
A
 
D
G
 
T
G
 
G
P
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
T
P
 
P
L
 
L
T
 
A
G
 
E
D
 
Q
Q
 
Y
K
 
R
A
 
E
A
 
P
I
 
L
A
 
R
K
 
N
I
 
A
I
 
L
G
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
I

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
24% identity, 96% coverage: 8:293/299 of query aligns to 4:290/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
G
 
G
I
 
S
F
 
I
P
 
V
V
x
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
G
 
L
P
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
G
I
 
V
N
 
D
E
 
W
L
 
K
R
 
S
Y
 
L
K
 
E
E
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
E
E
 
W
A
 
H
I
 
I
R
 
E
N
 
Q
G
 
G
A
 
T
R
 
N
G
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
G
S
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
F
 
A
Y
 
S
A
 
T
L
 
L
T
 
S
I
 
M
S
 
E
E
 
E
R
 
H
A
 
T
R
 
Q
L
 
V
Y
 
I
K
 
K
L
 
E
T
 
I
V
 
I
D
 
R
H
 
V
V
 
A
A
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
A
 
G
D
 
A
L
 
N
R
 
S
V
 
T
E
 
R
D
 
E
V
 
A
V
 
I
D
 
E
A
 
L
C
 
T
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
D
G
 
A
G
 
A
M
 
L
I
 
L
L
 
V
P
 
T
P
 
P
I
 
Y
Y
|
Y
A
 
N
M
 
K
P
 
P
S
 
T
P
 
Q
R
 
E
E
 
G
I
 
L
V
 
Y
A
 
Q
F
 
H
F
 
Y
E
 
K
H
 
A
V
 
I
S
 
A
R
 
E
S
 
A
S
 
V
S
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
V
P
 
P
R
 
G
R
|
R
A
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
L
N
 
S
P
 
N
A
 
D
L
 
T
V
 
A
E
 
V
Q
 
R
L
 
L
S
 
A
K
 
E
L
 
I
P
 
P
T
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
D
I
 
V
N
 
P
Q
 
R
V
 
G
T
 
K
E
 
A
L
 
L
V
 
I
Q
 
D
R
 
A
V
 
L
G
 
N
G
 
G
S
 
K
L
 
M
R
 
A
V
 
V
F
 
Y
V
 
S
G
 
G
Y
 
D
E
 
D
T
 
E
M
 
T
I
 
A
V
 
W
P
 
E
A
 
L
R
 
M
A
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
G
V
 
N
I
|
I
A
 
S
M
 
V
A
 
T
H
 
A
Q
 
N
I
 
I
A
 
A
G
 
P
P
 
K
L
 
A
I
 
M
R
 
S
D
 
E
Y
 
V
W
 
C
D
 
A
Q
 
V
A
 
A
L
 
I
-
 
A
K
 
K
G
 
D
G
 
E
E
 
Q
S
 
Q
V
 
A
D
 
K
D
 
T
M
 
L
G
 
N
R
 
N
D
 
K
V
 
I
F
 
A
A
 
N
F
 
L
Y
 
H
R
 
N
C
 
I
F
 
L
Q
 
F
S
 
C
G
 
E
A
 
S
Y
 
N
Y
 
P
A
 
I
A
 
P
I
 
V
K
 
K
E
 
W
T
 
A
M
 
L
T
 
H
Q
 
E
L
 
M
G
 
G
R
 
L
D
 
I
A
 
D
G
 
T
G
 
G
P
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
T
P
 
P
L
 
L
T
 
A
G
 
E
D
 
Q
Q
 
Y
K
 
R
A
 
E
A
 
P
I
 
L
A
 
R
K
 
N
I
 
A
I
 
L
G
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
I

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
24% identity, 96% coverage: 8:293/299 of query aligns to 4:290/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
G
 
G
I
 
S
F
 
I
P
 
V
V
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
G
 
L
P
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
G
I
 
V
N
 
D
E
 
W
L
 
K
R
 
S
Y
 
L
K
 
E
E
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
E
E
 
W
A
 
H
I
 
I
R
 
E
N
 
Q
G
 
G
A
 
T
R
 
N
G
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
A
Y
x
S
A
 
T
L
|
L
T
 
S
I
 
M
S
 
E
E
 
E
R
x
H
A
 
T
R
 
Q
L
 
V
Y
 
I
K
 
K
L
 
E
T
 
I
V
 
I
D
 
R
H
 
V
V
 
A
A
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
A
 
G
D
 
A
L
 
N
R
 
S
V
 
T
E
 
R
D
 
E
V
 
A
V
 
I
D
 
E
A
 
L
C
 
T
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
D
G
 
A
G
 
A
M
 
L
I
 
L
L
 
V
P
 
T
P
 
P
I
x
Y
Y
|
Y
A
 
N
M
 
K
P
 
P
S
 
T
P
 
Q
R
 
E
E
 
G
I
 
L
V
 
Y
A
 
Q
F
 
H
F
 
Y
E
 
K
H
 
A
V
 
I
S
 
A
R
 
E
S
 
A
S
 
V
S
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
V
P
 
P
R
 
G
R
|
R
A
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
L
N
 
S
P
 
N
A
 
D
L
 
T
V
 
A
E
 
V
Q
 
R
L
 
L
S
 
A
K
 
E
L
 
I
P
 
P
T
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
D
I
 
V
N
 
P
Q
 
R
V
 
G
T
 
K
E
 
A
L
 
L
V
 
I
Q
 
D
R
 
A
V
 
L
G
 
N
G
 
G
S
 
K
L
 
M
R
 
A
V
 
V
F
 
Y
V
 
S
G
 
G
Y
 
D
E
 
D
T
 
E
M
 
T
I
 
A
V
 
W
P
 
E
A
 
L
R
 
M
A
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
G
V
 
N
I
|
I
A
 
S
M
 
V
A
 
T
H
 
A
Q
 
N
I
 
I
A
 
A
G
 
P
P
 
K
L
 
A
I
 
M
R
 
S
D
 
E
Y
 
V
W
 
C
D
 
A
Q
 
V
A
 
A
L
 
I
-
 
A
K
 
K
G
 
D
G
 
E
E
 
Q
S
 
Q
V
 
A
D
 
K
D
 
T
M
 
L
G
 
N
R
 
N
D
 
K
V
 
I
F
 
A
A
 
N
F
 
L
Y
 
H
R
 
N
C
 
I
F
 
L
Q
 
F
S
 
C
G
 
E
A
 
S
Y
 
N
Y
 
P
A
 
I
A
 
P
I
 
V
K
 
K
E
 
W
T
 
A
M
 
L
T
 
H
Q
 
E
L
 
M
G
 
G
R
 
L
D
 
I
A
 
D
G
 
T
G
 
G
P
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
T
P
 
P
L
 
L
T
 
A
G
 
E
D
 
Q
Q
 
Y
K
 
R
A
 
E
A
 
P
I
 
L
A
 
R
K
 
N
I
 
A
I
 
L
G
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
I

3rk8A Crystal structure of the chloride inhibited dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with pyruvate at 1.8 a resolution
24% identity, 96% coverage: 8:293/299 of query aligns to 4:290/291 of 3rk8A

query
sites
3rk8A
G
 
G
I
 
S
F
 
I
P
 
V
V
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
G
 
L
P
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
G
I
 
V
N
 
D
E
 
W
L
 
K
R
 
S
Y
 
L
K
 
E
E
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
E
E
 
W
A
 
H
I
 
I
R
 
E
N
 
Q
G
 
G
A
 
T
R
 
N
G
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
A
Y
 
S
A
 
T
L
 
L
T
 
S
I
 
M
S
 
E
E
 
E
R
 
H
A
 
T
R
 
Q
L
 
V
Y
 
I
K
 
K
L
 
E
T
 
I
V
 
I
D
 
R
H
 
V
V
 
A
A
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
A
 
G
D
 
A
L
 
N
R
 
S
V
 
T
E
 
R
D
 
E
V
 
A
V
 
I
D
 
E
A
 
L
C
 
T
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
D
G
 
A
G
 
A
M
 
L
I
 
L
L
 
V
P
 
T
P
 
P
I
 
Y
Y
|
Y
A
 
N
M
 
K
P
 
P
S
 
T
P
 
Q
R
 
E
E
 
G
I
 
L
V
 
Y
A
 
Q
F
 
H
F
 
Y
E
 
K
H
 
A
V
 
I
S
 
A
R
 
E
S
 
A
S
 
V
S
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
V
P
 
P
R
 
G
R
|
R
A
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
L
N
 
S
P
 
N
A
 
D
L
 
T
V
 
A
E
 
V
Q
 
R
L
 
L
S
 
A
K
 
E
L
 
I
P
 
P
T
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
D
I
 
V
N
 
P
Q
 
R
V
 
G
T
 
K
E
 
A
L
 
L
V
 
I
Q
 
D
R
 
A
V
 
L
G
 
N
G
 
G
S
 
K
L
 
M
R
 
A
V
 
V
F
 
Y
V
 
S
G
|
G
Y
 
D
E
 
D
T
 
E
M
 
T
I
 
A
V
 
W
P
 
E
A
 
L
R
 
M
A
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
G
V
 
N
I
|
I
A
 
S
M
 
V
A
 
T
H
 
A
Q
 
N
I
 
I
A
 
A
G
 
P
P
 
K
L
 
A
I
 
M
R
 
S
D
 
E
Y
 
V
W
 
C
D
 
A
Q
 
V
A
 
A
L
 
I
-
 
A
K
 
K
G
 
D
G
 
E
E
 
Q
S
 
Q
V
 
A
D
 
K
D
 
T
M
 
L
G
 
N
R
 
N
D
 
K
V
 
I
F
 
A
A
 
N
F
 
L
Y
 
H
R
 
N
C
 
I
F
 
L
Q
x
F
S
 
C
G
 
E
A
 
S
Y
 
N
Y
 
P
A
 
I
A
 
P
I
 
V
K
 
K
E
 
W
T
 
A
M
 
L
T
 
H
Q
 
E
L
 
M
G
 
G
R
 
L
D
 
I
A
 
D
G
 
T
G
 
G
P
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
T
P
 
P
L
 
L
T
 
A
G
 
E
D
 
Q
Q
 
Y
K
 
R
A
 
E
A
 
P
I
 
L
A
 
R
K
 
N
I
 
A
I
 
L
G
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
I

3pueB Crystal structure of the complex of dhydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with lysine at 2.6a resolution
24% identity, 96% coverage: 8:293/299 of query aligns to 4:290/291 of 3pueB

query
sites
3pueB
G
 
G
I
 
S
F
 
I
P
 
V
V
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
G
 
L
P
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
G
I
 
V
N
 
D
E
 
W
L
 
K
R
 
S
Y
 
L
K
 
E
E
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
E
E
 
W
A
 
H
I
 
I
R
 
E
N
 
Q
G
 
G
A
 
T
R
 
N
G
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
A
Y
 
S
A
 
T
L
 
L
T
 
S
I
 
M
S
 
E
E
 
E
R
 
H
A
 
T
R
 
Q
L
 
V
Y
 
I
K
 
K
L
 
E
T
 
I
V
 
I
D
 
R
H
 
V
V
 
A
A
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
A
 
G
D
 
A
L
 
N
R
 
S
V
 
T
E
 
R
D
 
E
V
 
A
V
 
I
D
 
E
A
 
L
C
 
T
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
D
G
 
A
G
 
A
M
 
L
I
 
L
L
 
V
P
 
T
P
 
P
I
 
Y
Y
|
Y
A
 
N
M
 
K
P
 
P
S
 
T
P
 
Q
R
 
E
E
 
G
I
 
L
V
 
Y
A
 
Q
F
 
H
F
 
Y
E
 
K
H
 
A
V
 
I
S
 
A
R
 
E
S
 
A
S
 
V
S
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
V
P
 
P
R
 
G
R
|
R
A
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
L
N
 
S
P
 
N
A
 
D
L
 
T
V
 
A
E
 
V
Q
 
R
L
 
L
S
 
A
K
 
E
L
 
I
P
 
P
T
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
D
I
 
V
N
 
P
Q
 
R
V
 
G
T
 
K
E
 
A
L
 
L
V
 
I
Q
 
D
R
 
A
V
 
L
G
 
N
G
 
G
S
 
K
L
 
M
R
 
A
V
 
V
F
 
Y
V
 
S
G
 
G
Y
 
D
E
 
D
T
 
E
M
 
T
I
 
A
V
 
W
P
 
E
A
 
L
R
 
M
A
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
G
V
 
N
I
|
I
A
 
S
M
 
V
A
 
T
H
 
A
Q
 
N
I
 
I
A
 
A
G
 
P
P
 
K
L
 
A
I
 
M
R
 
S
D
 
E
Y
 
V
W
 
C
D
 
A
Q
 
V
A
 
A
L
 
I
-
 
A
K
 
K
G
 
D
G
 
E
E
 
Q
S
 
Q
V
 
A
D
 
K
D
 
T
M
 
L
G
 
N
R
 
N
D
 
K
V
 
I
F
 
A
A
 
N
F
 
L
Y
 
H
R
 
N
C
 
I
F
 
L
Q
x
F
S
 
C
G
 
E
A
 
S
Y
x
N
Y
 
P
A
 
I
A
 
P
I
 
V
K
 
K
E
 
W
T
 
A
M
 
L
T
 
H
Q
 
E
L
 
M
G
 
G
R
 
L
D
 
I
A
 
D
G
 
T
G
 
G
P
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
T
P
 
P
L
 
L
T
 
A
G
 
E
D
 
Q
Q
 
Y
K
 
R
A
 
E
A
 
P
I
 
L
A
 
R
K
 
N
I
 
A
I
 
L
G
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
I

5t25A Kinetic, spectral and structural characterization of the slow binding inhibitor acetopyruvate with dihydrodipicolinate synthase from escherichia coli.
27% identity, 96% coverage: 6:293/299 of query aligns to 3:292/293 of 5t25A

query
sites
5t25A
W
 
F
G
 
T
G
 
G
I
 
S
F
 
I
P
 
V
V
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
G
 
D
P
 
E
D
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
V
N
 
C
E
 
R
L
 
A
R
 
S
Y
 
L
K
 
K
E
 
K
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
Y
A
 
H
I
 
V
R
 
A
N
 
S
G
 
G
A
 
T
R
 
S
G
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
S
A
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
Y
x
A
A
 
T
L
|
L
T
 
N
I
x
H
S
 
D
E
 
E
R
 
H
A
 
A
R
 
D
L
 
V
Y
 
V
K
 
M
L
 
M
T
 
T
V
 
L
D
 
D
H
 
L
V
 
A
A
 
D
G
 
G
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
A
 
G
D
 
A
L
x
N
R
 
A
V
 
T
E
 
A
D
x
E
V
 
A
V
 
I
D
 
S
A
 
L
C
 
T
Q
 
Q
A
 
R
A
 
F
V
 
N
A
 
D
A
 
S
G
 
G
C
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
C
M
 
L
I
 
T
L
 
V
P
 
T
P
 
P
I
x
Y
Y
|
Y
A
 
N
M
 
R
P
 
P
S
 
S
P
 
Q
R
 
E
E
 
G
I
 
L
V
 
Y
A
 
Q
F
 
H
F
 
F
E
 
K
H
 
A
V
 
I
S
 
A
R
 
E
S
 
H
S
 
T
S
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
V
P
 
P
R
 
S
R
|
R
A
 
T
G
 
G
I
 
C
D
 
D
I
 
L
N
 
L
P
 
P
A
 
E
L
 
T
V
 
V
E
 
G
Q
 
R
L
 
L
S
 
A
K
 
K
L
 
V
P
 
K
T
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
E
S
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
N
I
 
L
N
 
T
Q
 
R
V
 
V
T
 
N
E
 
Q
L
 
I
V
 
K
Q
 
E
R
 
L
V
 
V
G
 
S
G
 
D
S
 
D
L
 
F
R
 
V
V
 
L
F
 
L
V
 
S
G
 
G
Y
 
D
E
 
D
T
 
A
M
 
S
I
 
A
V
 
L
P
 
D
A
 
F
R
 
M
A
 
Q
V
 
L
G
 
G
A
 
G
H
 
H
G
 
G
V
 
V
I
|
I
A
 
S
M
 
V
A
 
T
H
 
A
Q
 
N
I
 
V
A
 
A
G
 
A
P
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
R
D
 
D
Y
 
M
W
 
A
D
 
Q
Q
 
M
A
 
C
L
 
K
K
 
L
G
 
A
G
 
A
E
 
E
S
 
G
V
 
H
D
 
F
D
 
A
M
 
E
G
 
A
R
 
R
D
 
V
V
 
I
F
 
N
A
 
Q
F
 
R
Y
 
L
R
 
M
C
 
P
F
 
L
Q
 
H
S
 
N
G
 
K
A
 
L
Y
 
F
Y
 
V
A
 
E
-
 
P
-
 
N
-
 
P
-
 
I
A
 
P
I
 
V
K
 
K
E
 
W
T
 
A
M
 
C
T
 
K
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
L
D
 
V
A
 
A
G
 
T
G
 
D
P
 
T
-
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
M
L
 
T
P
 
P
L
 
I
T
 
T
G
 
D
D
 
S
Q
 
G
K
 
R
A
 
E
A
 
T
I
 
V
A
 
R
K
 
A
I
 
A
I
 
L
G
 
K
E
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L

2atsA Dihydrodipicolinate synthase co-crystallised with (s)-lysine
27% identity, 96% coverage: 6:293/299 of query aligns to 2:291/292 of 2atsA

query
sites
2atsA
W
 
F
G
 
T
G
 
G
I
 
S
F
 
I
P
 
V
V
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
G
 
D
P
 
E
D
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
V
N
 
C
E
 
R
L
 
A
R
 
S
Y
 
L
K
 
K
E
 
K
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
Y
A
 
H
I
 
V
R
 
A
N
 
S
G
 
G
A
 
T
R
 
S
G
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
S
A
 
V
G
 
G
S
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
Y
x
A
A
 
T
L
|
L
T
 
N
I
x
H
S
 
D
E
 
E
R
x
H
A
 
A
R
 
D
L
 
V
Y
 
V
K
 
M
L
 
M
T
 
T
V
 
L
D
 
D
H
 
L
V
 
A
A
 
D
G
 
G
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
A
 
G
D
 
A
L
x
N
R
 
A
V
 
T
E
 
A
D
x
E
V
 
A
V
 
I
D
 
S
A
 
L
C
 
T
Q
 
Q
A
 
R
A
 
F
V
 
N
A
 
D
A
 
S
G
 
G
C
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
C
M
 
L
I
 
T
L
 
V
P
 
T
P
 
P
I
x
Y
Y
|
Y
A
 
N
M
 
R
P
 
P
S
 
S
P
 
Q
R
 
E
E
 
G
I
 
L
V
 
Y
A
 
Q
F
 
H
F
 
F
E
 
K
H
 
A
V
 
I
S
 
A
R
 
E
S
 
H
S
 
T
S
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
V
P
 
P
R
 
S
R
|
R
A
 
T
G
 
G
I
 
C
D
 
D
I
 
L
N
 
L
P
 
P
A
 
E
L
 
T
V
 
V
E
 
G
Q
 
R
L
 
L
S
 
A
K
 
K
L
 
V
P
 
K
T
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
E
S
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
N
I
 
L
N
 
T
Q
 
R
V
 
V
T
 
N
E
 
Q
L
 
I
V
 
K
Q
 
E
R
 
L
V
 
V
G
 
S
G
 
D
S
 
D
L
 
F
R
 
V
V
 
L
F
 
L
V
 
S
G
 
G
Y
 
D
E
 
D
T
 
A
M
 
S
I
 
A
V
 
L
P
 
D
A
 
F
R
 
M
A
 
Q
V
 
L
G
 
G
A
 
G
H
 
H
G
 
G
V
 
V
I
|
I
A
 
S
M
 
V
A
 
T
H
 
A
Q
 
N
I
 
V
A
 
A
G
 
A
P
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
R
D
 
D
Y
 
M
W
 
A
D
 
Q
Q
 
M
A
 
C
L
 
K
K
 
L
G
 
A
G
 
A
E
 
E
S
 
G
V
 
H
D
 
F
D
 
A
M
 
E
G
 
A
R
 
R
D
 
V
V
 
I
F
 
N
A
 
Q
F
 
R
Y
 
L
R
 
M
C
 
P
F
 
L
Q
 
H
S
 
N
G
 
K
A
 
L
Y
 
F
Y
 
V
A
 
E
-
 
P
-
 
N
-
 
P
-
 
I
A
 
P
I
 
V
K
 
K
E
 
W
T
 
A
M
 
C
T
 
K
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
L
D
 
V
A
 
A
G
 
T
G
 
D
P
 
T
-
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
M
L
 
T
P
 
P
L
 
I
T
 
T
G
 
D
D
 
S
Q
 
G
K
 
R
A
 
E
A
 
T
I
 
V
A
 
R
K
 
A
I
 
A
I
 
L
G
 
K
E
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L

P0A6L2 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Escherichia coli (strain K12) (see 7 papers)
27% identity, 96% coverage: 6:293/299 of query aligns to 2:291/292 of P0A6L2

query
sites
P0A6L2
W
 
F
G
 
T
G
 
G
I
 
S
F
 
I
P
 
V
V
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
G
 
D
P
 
E
D
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
V
N
 
C
E
 
R
L
 
A
R
 
S
Y
 
L
K
 
K
E
 
K
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
Y
A
 
H
I
 
V
R
 
A
N
 
S
G
 
G
A
 
T
R
 
S
G
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
S
A
 
V
G
 
G
S
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
Y
 
A
A
 
T
L
 
L
T
 
N
I
 
H
S
 
D
E
 
E
R
 
H
A
 
A
R
 
D
L
 
V
Y
 
V
K
 
M
L
 
M
T
 
T
V
 
L
D
 
D
H
 
L
V
 
A
A
 
D
G
 
G
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
A
 
G
D
 
A
L
 
N
R
 
A
V
 
T
E
 
A
D
 
E
V
 
A
V
 
I
D
 
S
A
 
L
C
 
T
Q
 
Q
A
 
R
A
 
F
V
 
N
A
 
D
A
 
S
G
 
G
C
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
C
M
 
L
I
 
T
L
 
V
P
 
T
P
 
P
I
 
Y
Y
|
Y
A
 
N
M
 
R
P
 
P
S
 
S
P
 
Q
R
 
E
E
 
G
I
 
L
V
 
Y
A
 
Q
F
 
H
F
 
F
E
 
K
H
 
A
V
 
I
S
 
A
R
 
E
S
 
H
S
 
T
S
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
Q
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
S
 
V
P
 
P
R
 
S
R
|
R
A
 
T
G
 
G
I
 
C
D
 
D
I
 
L
N
 
L
P
 
P
A
 
E
L
 
T
V
 
V
E
 
G
Q
 
R
L
 
L
S
 
A
K
 
K
L
 
V
P
 
K
T
 
N
V
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
E
S
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
N
I
 
L
N
 
T
Q
 
R
V
 
V
T
 
N
E
 
Q
L
 
I
V
 
K
Q
 
E
R
 
L
V
 
V
G
 
S
G
 
D
S
 
D
L
 
F
R
 
V
V
 
L
F
 
L
V
 
S
G
 
G
Y
 
D
E
 
D
T
 
A
M
 
S
I
 
A
V
 
L
P
 
D
A
 
F
R
 
M
A
 
Q
V
x
L
G
 
G
A
 
G
H
 
H
G
 
G
V
 
V
I
|
I
A
 
S
M
 
V
A
 
T
H
 
A
Q
 
N
I
 
V
A
 
A
G
 
A
P
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
R
D
 
D
Y
 
M
W
 
A
D
 
Q
Q
 
M
A
 
C
L
 
K
K
 
L
G
 
A
G
 
A
E
 
E
S
 
G
V
 
H
D
 
F
D
 
A
M
 
E
G
 
A
R
 
R
D
 
V
V
 
I
F
 
N
A
 
Q
F
 
R
Y
 
L
R
 
M
C
 
P
F
 
L
Q
 
H
S
 
N
G
 
K
A
 
L
Y
 
F
Y
 
V
A
 
E
-
 
P
-
 
N
-
 
P
-
 
I
A
 
P
I
 
V
K
 
K
E
 
W
T
 
A
M
 
C
T
 
K
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
L
D
 
V
A
 
A
G
 
T
G
 
D
P
 
T
-
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
M
L
 
T
P
 
P
L
 
I
T
 
T
G
 
D
D
 
S
Q
 
G
K
 
R
A
 
E
A
 
T
I
 
V
A
 
R
K
 
A
I
 
A
I
 
L
G
 
K
E
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L

Q07607 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; Protein MosA; EC 4.3.3.7 from Rhizobium meliloti (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
28% identity, 96% coverage: 6:293/299 of query aligns to 2:290/292 of Q07607

query
sites
Q07607
W
 
F
G
 
E
G
 
G
I
 
S
F
 
I
P
 
T
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
A
P
 
-
D
 
D
G
 
D
S
 
R
I
 
I
N
 
D
E
 
E
L
 
V
R
 
A
Y
 
L
K
 
H
E
 
D
L
 
L
I
 
V
D
 
E
E
 
W
A
 
Q
I
 
I
R
 
E
N
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
F
G
 
G
I
 
L
V
 
V
A
 
P
A
 
C
G
 
G
S
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
S
Y
 
P
A
 
T
L
 
L
T
 
S
I
 
K
S
 
S
E
 
E
R
 
H
A
 
E
R
 
Q
L
 
V
Y
 
V
K
 
E
L
 
I
T
 
T
V
 
I
D
 
K
H
 
T
V
 
A
A
 
N
G
 
G
R
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
A
A
 
G
D
 
S
L
 
N
R
 
S
V
 
T
E
 
A
D
 
E
V
 
A
V
 
I
D
 
A
A
 
F
C
 
V
Q
 
R
A
 
H
A
 
A
V
 
Q
A
 
N
A
 
A
G
 
G
C
 
A
V
 
D
G
 
G
G
 
V
M
 
L
I
 
I
L
 
V
P
 
S
P
 
P
I
 
Y
Y
 
Y
A
 
N
M
 
K
P
 
P
S
 
T
P
 
Q
R
 
E
E
 
G
I
 
I
V
 
Y
A
 
Q
F
 
H
F
 
F
E
 
K
H
 
A
V
 
I
S
 
D
R
 
A
S
 
A
S
 
S
S
 
T
L
 
I
P
 
P
L
 
I
M
 
I
L
 
V
Y
 
Y
N
 
N
S
 
I
P
 
P
R
 
G
R
 
R
A
 
S
G
 
A
I
 
I
D
 
E
I
 
I
N
 
H
P
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
V
E
 
E
Q
 
T
L
 
L
S
 
A
K
 
R
L
 
I
-
 
F
-
 
E
-
 
D
-
 
C
P
 
P
T
 
N
V
 
V
V
 
K
A
 
G
I
 
V
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
N
I
 
L
N
 
L
Q
 
R
V
 
P
T
 
S
E
 
L
L
 
E
V
 
R
Q
 
M
R
 
A
V
 
C
G
 
G
G
 
E
S
 
D
L
 
F
R
 
N
V
 
L
F
 
L
V
 
T
G
 
G
Y
 
E
E
 
D
T
 
G
M
 
T
I
 
A
V
 
L
P
 
G
A
 
Y
R
 
M
A
 
A
V
 
H
G
 
G
A
 
G
H
 
H
G
 
G
V
 
C
I
 
I
A
 
S
M
 
V
A
 
T
H
 
A
Q
 
N
I
 
V
A
 
A
G
 
P
P
 
A
L
 
L
I
 
C
R
 
A
D
 
D
Y
 
F
W
 
Q
D
 
Q
Q
 
A
A
 
C
L
 
L
K
 
N
G
 
G
G
 
D
E
 
F
S
 
A
V
 
A
D
 
A
D
 
L
M
 
K
G
 
L
R
 
Q
D
 
D
-
 
R
V
 
L
F
 
M
A
 
P
F
 
L
Y
 
H
R
 
R
C
 
A
F
 
L
Q
 
F
S
 
L
G
 
E
A
 
T
Y
 
N
Y
 
P
A
 
A
A
 
G
I
 
A
K
 
K
E
 
Y
T
 
A
M
 
L
T
 
Q
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
D
 
M
A
 
R
G
 
G
G
 
D
P
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
V
P
 
T
L
 
I
T
 
S
G
 
P
D
 
S
Q
 
F
K
 
Q
A
 
E
A
 
E
I
 
I
A
 
D
K
 
D
I
 
A
I
 
M
G
 
R
E
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
I

Query Sequence

>WP_012333617.1 NCBI__GCF_000019365.1:WP_012333617.1
MANIDWGGIFPVLVTPFGPDGSINELRYKELIDEAIRNGARGIVAAGSTGEFYALTISER
ARLYKLTVDHVAGRIPVLAGVADLRVEDVVDACQAAVAAGCVGGMILPPIYAMPSPREIV
AFFEHVSRSSSLPLMLYNSPRRAGIDINPALVEQLSKLPTVVAIKDSSGLINQVTELVQR
VGGSLRVFVGYETMIVPARAVGAHGVIAMAHQIAGPLIRDYWDQALKGGESVDDMGRDVF
AFYRCFQSGAYYAAIKETMTQLGRDAGGPRLPLLPLTGDQKAAIAKIIGEAGLSRWAKT

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory