SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012333717.1 NCBI__GCF_000019365.1:WP_012333717.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8gmiA Citrate synthase (cita) in mycobacterium tuberculosis modified by ebselen at c143 residue (see paper)
45% identity, 45% coverage: 209:381/386 of query aligns to 173:358/369 of 8gmiA

query
sites
8gmiA
A
 
A
E
 
E
H
 
H
E
 
G
L
 
M
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
T
V
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
I
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
L
L
 
S
A
 
G
G
 
A
L
 
I
C
 
G
A
 
A
L
 
M
S
 
S
G
 
G
P
 
P
R
 
L
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
P
M
 
A
A
 
R
L
 
V
A
 
L
A
 
P
L
 
M
M
 
L
G
 
D
D
 
E
A
 
V
R
 
E
R
 
R
C
 
A
G
 
G
-
 
D
A
 
A
G
 
R
E
 
S
A
 
V
V
 
V
A
 
K
A
 
G
W
 
I
L
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
R
 
E
A
 
K
L
 
L
P
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
H
P
 
R
L
 
V
Y
 
Y
P
 
R
A
 
A
G
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
V
L
 
L
L
 
R
A
 
A
E
 
A
L
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
G
A
 
A
P
 
P
D
 
R
-
 
Y
E
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
V
A
 
A
L
 
V
Q
 
E
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
L
A
 
S
E
 
E
T
 
L
G
 
R
D
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
P
-
 
D
-
 
R
-
 
A
-
 
I
L
 
E
P
 
T
N
 
N
V
 
V
D
 
E
F
 
F
A
 
W
L
 
A
A
 
A
C
 
V
L
 
V
A
 
L
E
 
D
A
 
F
L
 
A
R
 
R
L
 
V
P
 
P
G
 
A
D
 
N
A
 
M
P
 
M
L
 
P
S
 
A
L
 
M
F
 
F
L
 
T
L
 
C
G
 
G
R
 
R
S
 
T
V
 
A
G
 
G
W
 
W
S
 
C
A
 
A
H
 
H
F
 
I
I
 
L
E
 
E
Q
 
Q
S
 
K
A
 
R
E
 
L
G
 
G
G
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
R
P
 
P
R
 
S
A
 
A
R
 
I
Y
 
Y
R
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
P
 
P
R
 
R
S
 
S

Sites not aligning to the query:

8gi7A C143a variant of citrate synthase (cita) in mycobacterium tuberculosis (see paper)
45% identity, 45% coverage: 209:381/386 of query aligns to 171:356/368 of 8gi7A

query
sites
8gi7A
A
 
A
E
 
E
H
|
H
E
 
G
L
 
M
N
|
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
T
V
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
I
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
L
L
 
S
A
 
G
G
 
A
L
 
I
C
 
G
A
 
A
L
 
M
S
 
S
G
 
G
P
 
P
R
 
L
H
|
H
G
 
G
G
|
G
A
 
A
G
 
P
M
 
A
A
 
R
L
 
V
A
 
L
A
 
P
L
 
M
M
 
L
G
 
D
D
 
E
A
 
V
R
 
E
R
 
R
C
 
A
G
 
G
-
 
D
A
 
A
G
 
R
E
 
S
A
 
V
V
 
V
A
 
K
A
 
G
W
 
I
L
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
R
 
E
A
 
K
L
 
L
P
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
H
P
 
R
L
 
V
Y
 
Y
P
 
R
A
 
A
G
 
E
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
R
 
R
A
 
V
L
 
L
L
 
R
A
 
A
E
 
A
L
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
G
A
 
A
P
 
P
D
 
R
-
 
Y
E
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
V
A
 
A
L
 
V
Q
 
E
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
L
A
 
S
E
 
E
T
 
L
G
 
R
D
 
E
L
 
R
-
 
R
-
 
P
-
 
D
-
 
R
-
 
A
-
 
I
-
 
E
P
 
T
N
 
N
V
 
V
D
 
E
F
 
F
A
 
W
L
 
A
A
 
A
C
 
V
L
 
V
A
 
L
E
 
D
A
 
F
L
 
A
R
 
R
L
 
V
P
 
P
G
 
A
D
 
N
A
 
M
P
 
M
L
 
P
S
 
A
L
 
M
F
 
F
L
 
T
L
 
C
G
 
G
R
|
R
S
 
T
V
 
A
G
 
G
W
 
W
S
 
C
A
 
A
H
 
H
F
 
I
I
 
L
E
 
E
Q
 
Q
S
 
K
A
 
R
E
 
L
G
 
G
G
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
R
P
 
P
R
 
S
A
 
A
R
 
I
Y
 
Y
R
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
P
 
P
R
 
R
S
 
S

8glbD Selenomethionine derivatized citrate synthase (cita) in mycobacterium tuberculosis with pyruvate (see paper)
45% identity, 45% coverage: 209:381/386 of query aligns to 174:359/374 of 8glbD

query
sites
8glbD
A
 
A
E
 
E
H
 
H
E
 
G
L
 
M
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
T
V
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
I
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
L
L
 
S
A
 
G
G
 
A
L
 
I
C
 
G
A
 
A
L
 
M
S
 
S
G
 
G
P
 
P
R
 
L
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
P
M
 
A
A
 
R
L
 
V
A
 
L
A
 
P
L
 
M
M
 
L
G
 
D
D
 
E
A
 
V
R
 
E
R
 
R
C
 
A
G
 
G
-
 
D
A
 
A
G
 
R
E
 
S
A
 
V
V
 
V
A
 
K
A
 
G
W
 
I
L
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
R
 
E
A
 
K
L
 
L
P
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
H
P
 
R
L
 
V
Y
 
Y
P
 
R
A
 
A
G
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
V
L
 
L
L
 
R
A
 
A
E
 
A
L
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
G
A
 
A
P
 
P
D
 
R
-
 
Y
E
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
V
A
 
A
L
 
V
Q
 
E
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
L
A
 
S
E
 
E
T
 
L
G
 
R
D
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
P
-
 
D
-
 
R
-
 
A
-
 
I
L
 
E
P
 
T
N
 
N
V
 
V
D
 
E
F
 
F
A
 
W
L
 
A
A
 
A
C
 
V
L
 
V
A
 
L
E
 
D
A
 
F
L
 
A
R
 
R
L
 
V
P
 
P
G
 
A
D
 
N
A
 
M
P
 
M
L
 
P
S
 
A
L
 
M
F
 
F
L
 
T
L
 
C
G
 
G
R
 
R
S
 
T
V
 
A
G
 
G
W
 
W
S
 
C
A
 
A
H
 
H
F
 
I
I
 
L
E
 
E
Q
 
Q
S
 
K
A
 
R
E
 
L
G
 
G
G
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
R
P
 
P
R
 
S
A
 
A
R
 
I
Y
 
Y
R
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
P
 
P
R
 
R
S
 
S

Sites not aligning to the query:

P39120 Citrate synthase 2; Citrate synthase II; EC 2.3.3.16 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
29% identity, 77% coverage: 84:381/386 of query aligns to 14:364/372 of P39120

query
sites
P39120
A
 
T
T
 
S
S
 
S
I
 
V
S
 
S
T
 
S
V
 
I
H
 
I
Q
 
D
G
 
D
T
 
T
L
 
L
L
 
T
Y
 
Y
R
 
V
G
 
G
V
 
Y
G
 
D
A
 
I
V
 
D
D
 
D
W
 
L
A
 
T
R
 
E
A
 
N
A
 
A
T
 
S
L
 
F
E
 
E
D
 
E
T
 
I
A
 
I
A
 
Y
L
 
L
L
 
L
W
 
W
Q
 
H
-
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
P
G
 
N
D
 
K
R
 
K
E
 
E
I
 
L
R
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
K
-
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
P
-
 
Q
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
H
F
 
F
P
 
K
A
 
S
P
 
Y
R
 
S
V
 
L
R
 
E
P
 
N
R
 
V
E
 
H
P
 
P
F
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
T
-
 
A
-
 
I
-
 
S
-
 
L
-
 
L
-
 
G
L
 
L
A
 
L
A
 
D
S
 
S
G
 
E
R
 
A
A
 
D
T
 
T
L
 
M
G
 
N
L
 
P
G
 
E
G
 
A
N
 
N
G
 
Y
L
 
R
R
 
K
G
 
A
D
 
I
-
 
R
-
 
L
A
 
Q
A
 
A
T
 
K
A
 
V
I
 
P
G
 
G
H
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
F
L
 
S
G
 
R
A
 
I
A
 
R
R
 
K
G
 
G
D
 
L
A
 
E
P
 
P
V
 
V
H
 
E
R
 
P
R
 
R
L
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
D
W
 
Y
S
 
G
L
 
I
G
 
A
E
 
E
S
 
N
-
 
F
-
 
L
-
 
Y
-
 
T
-
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
P
-
 
S
-
 
P
-
 
I
E
 
E
G
 
V
E
 
E
R
 
A
I
 
F
R
 
N
L
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
H
A
 
A
E
 
D
H
 
H
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
T
V
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
C
A
 
V
S
 
A
T
 
T
G
 
L
A
 
S
S
 
D
V
 
I
A
 
Y
A
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
I
C
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
R
 
L
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
N
M
 
E
A
 
G
L
 
V
A
 
M
A
 
K
L
 
M
M
 
L
G
 
T
D
 
E
A
 
I
R
 
G
R
 
E
C
 
V
G
 
E
A
 
N
G
 
A
E
 
E
-
 
P
A
 
Y
V
 
I
A
 
R
A
 
A
W
 
K
L
 
L
A
 
E
R
 
K
G
 
K
R
 
E
A
 
K
L
 
I
P
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
H
P
 
R
L
 
V
Y
 
Y
P
 
K
A
 
H
G
 
G
D
 
D
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
K
A
 
H
L
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
M
-
 
S
-
 
K
-
 
R
L
 
L
A
 
T
E
 
N
L
 
L
A
 
T
P
 
G
D
 
E
-
x
S
-
 
K
-
 
W
-
 
Y
E
 
E
T
 
M
A
 
S
R
 
I
A
 
R
L
 
I
Q
 
E
E
 
D
A
 
I
A
 
V
F
 
T
A
 
S
E
 
E
T
 
K
G
 
K
D
 
L
L
 
P
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
 
D
F
 
F
A
 
Y
L
 
S
A
 
A
C
 
S
L
 
V
A
 
Y
E
 
H
A
 
S
L
 
L
R
 
G
L
 
I
P
 
D
G
 
H
D
 
D
A
 
L
P
 
F
L
 
T
S
 
P
L
 
I
F
 
F
L
 
A
L
 
V
G
 
S
R
 
R
S
 
M
V
 
S
G
 
G
W
 
W
S
 
L
A
 
A
H
 
H
F
 
I
I
 
L
E
 
E
Q
 
Q
S
 
Y
A
 
D
E
 
N
G
 
N
G
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
D
Y
 
Y
R
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
D
P
 
K
R
 
Q
S
 
K

6abyA Crystal structure of citrate synthase (msed_1522) from metallosphaera sedula in complex with oxaloacetate (see paper)
30% identity, 77% coverage: 85:383/386 of query aligns to 15:366/372 of 6abyA

query
sites
6abyA
T
 
T
S
 
S
I
 
I
S
 
T
T
 
Y
V
 
I
-
 
D
-
 
G
H
 
E
Q
 
L
G
 
G
T
 
R
L
 
L
L
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
V
 
Y
G
 
S
A
 
I
V
 
F
D
 
D
W
 
L
A
 
A
R
 
S
A
 
F
A
 
S
T
 
N
L
 
F
E
 
E
D
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
L
 
L
W
 
W
Q
 
Y
G
 
G
D
 
K
R
 
L
E
 
P
I
 
T
R
 
R
F
 
H
P
 
E
A
 
L
P
 
D
R
 
D
V
 
F
R
 
K
P
 
S
R
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
I
-
 
S
E
 
E
P
 
D
F
 
I
A
 
S
A
 
T
L
 
F
A
 
V
A
 
K
L
 
R
A
 
T
A
 
A
S
 
K
G
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
M
-
 
D
-
 
I
-
 
L
R
 
R
A
 
T
T
 
T
L
 
V
G
 
S
L
 
M
G
 
M
G
 
G
N
 
L
G
 
E
L
 
D
R
 
R
-
 
S
-
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
L
A
 
I
T
 
G
A
 
K
I
 
A
G
 
I
H
 
K
L
 
M
A
 
T
A
 
A
S
 
K
L
 
I
G
 
P
A
 
T
A
 
I
R
 
I
G
 
S
D
 
L
A
 
I
P
 
Q
V
 
R
H
 
T
R
 
R
R
 
R
L
 
N
A
 
Q
E
 
E
A
 
F
W
 
V
-
 
E
-
 
P
-
 
D
-
 
P
S
 
S
L
 
L
G
 
S
E
 
H
S
 
S
E
 
E
-
 
N
-
 
F
-
 
L
-
 
Y
-
 
M
-
 
I
-
 
R
G
 
G
E
 
E
R
 
R
-
 
P
-
 
S
-
 
P
-
 
S
-
 
D
-
 
T
-
 
R
-
 
V
I
 
L
R
 
D
L
 
V
A
 
S
L
 
L
I
 
M
L
 
L
L
 
H
A
 
M
E
 
D
H
|
H
E
 
E
L
 
M
N
|
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
M
A
 
A
V
 
C
R
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
L
A
 
S
S
 
D
V
 
I
A
 
Y
A
 
S
G
 
S
L
 
V
L
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
I
C
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
R
 
L
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
N
M
 
S
-
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
Q
L
 
F
M
 
M
G
 
E
D
 
I
A
 
E
R
 
T
R
 
P
C
 
D
G
 
N
A
 
V
G
 
E
E
 
K
A
 
Y
V
 
V
A
 
M
A
 
N
W
 
K
L
 
L
A
 
S
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
A
x
R
L
|
L
P
 
M
G
 
G
F
|
F
G
 
G
H
|
H
P
 
R
L
 
I
Y
 
Y
P
 
K
A
 
T
G
 
M
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
R
 
K
A
 
I
L
 
L
L
 
K
A
 
E
-
 
Y
-
 
A
-
 
N
E
 
Q
L
 
L
A
 
S
P
 
K
D
 
N
E
 
E
T
 
E
A
 
I
R
 
K
A
 
R
L
 
L
Q
 
F
E
 
E
A
 
I
A
 
A
-
 
N
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
I
-
 
K
-
 
I
F
 
L
A
 
G
E
 
K
T
x
R
G
 
G
D
x
I
L
 
Y
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
|
D
F
 
F
A
 
Y
L
 
S
A
 
G
C
 
L
L
 
V
A
 
F
E
 
Y
A
 
A
L
 
M
R
 
G
L
 
F
P
 
D
G
 
P
D
 
D
A
 
L
P
 
F
L
 
P
S
 
T
L
 
I
F
 
F
L
 
A
L
 
S
G
 
A
R
|
R
S
 
V
V
 
I
G
 
G
W
 
W
S
 
T
A
 
A
H
 
H
F
 
V
I
 
D
E
 
E
Q
 
Y
S
 
L
A
 
K
E
 
D
G
 
N
G
 
K
L
 
L
I
 
I
R
 
R
P
 
P
R
 
K
A
 
A
R
 
I
Y
 
Y
R
 
V
G
 
G
P
 
D
-
 
L
G
 
G
P
 
K
R
 
R
S
 
Y
G
 
V
P
 
P

6abxA Crystal structure of citrate synthase (msed_1522) from metallosphaera sedula in complex with citrate (see paper)
30% identity, 77% coverage: 85:383/386 of query aligns to 15:366/370 of 6abxA

query
sites
6abxA
T
 
T
S
 
S
I
 
I
S
 
T
T
 
Y
V
 
I
-
 
D
-
 
G
H
 
E
Q
 
L
G
 
G
T
 
R
L
 
L
L
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
V
 
Y
G
 
S
A
 
I
V
 
F
D
 
D
W
 
L
A
 
A
R
 
S
A
 
F
A
 
S
T
 
N
L
 
F
E
 
E
D
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
L
 
L
W
 
W
Q
 
Y
G
 
G
D
 
K
R
 
L
E
 
P
I
 
T
R
 
R
F
 
H
P
 
E
A
 
L
P
 
D
R
 
D
V
 
F
R
 
K
P
 
S
R
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
I
-
 
S
E
 
E
P
 
D
F
 
I
A
 
S
A
 
T
L
 
F
A
 
V
A
 
K
L
 
R
A
 
T
A
 
A
S
 
K
G
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
M
-
 
D
-
 
I
-
 
L
R
 
R
A
 
T
T
 
T
L
 
V
G
 
S
L
 
M
G
 
M
G
 
G
N
 
L
G
 
E
L
 
D
R
 
R
-
 
S
-
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
L
A
 
I
T
 
G
A
 
K
I
 
A
G
 
I
H
 
K
L
 
M
A
 
T
A
 
A
S
 
K
L
 
I
G
 
P
A
 
T
A
 
I
R
 
I
G
 
S
D
 
L
A
 
I
P
 
Q
V
 
R
H
 
T
R
 
R
R
 
R
L
 
N
A
 
Q
E
 
E
A
 
F
W
 
V
-
 
E
-
 
P
-
 
D
-
 
P
S
 
S
L
 
L
G
 
S
E
 
H
S
 
S
E
 
E
-
 
N
-
 
F
-
 
L
-
 
Y
-
 
M
-
 
I
-
 
R
G
 
G
E
 
E
R
 
R
-
 
P
-
 
S
-
 
P
-
 
S
-
 
D
-
 
T
-
 
R
-
 
V
I
 
L
R
 
D
L
 
V
A
 
S
L
 
L
I
 
M
L
 
L
L
 
H
A
 
M
E
 
D
H
|
H
E
 
E
L
 
M
N
|
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
M
A
 
A
V
 
C
R
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
L
A
 
S
S
 
D
V
 
I
A
 
Y
A
 
S
G
 
S
L
 
V
L
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
I
C
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
R
 
L
H
|
H
G
|
G
G
|
G
A
 
A
G
 
N
M
 
S
-
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
Q
L
 
F
M
 
M
G
 
E
D
 
I
A
 
E
R
 
T
R
 
P
C
 
D
G
 
N
A
 
V
G
 
E
E
 
K
A
 
Y
V
 
V
A
 
M
A
 
N
W
 
K
L
 
L
A
 
S
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
A
 
R
L
 
L
P
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
|
H
P
 
R
L
 
I
Y
 
Y
P
 
K
A
 
T
G
 
M
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
R
 
K
A
 
I
L
 
L
L
 
K
A
 
E
-
 
Y
-
 
A
-
 
N
E
 
Q
L
 
L
A
 
S
P
 
K
D
 
N
E
 
E
T
 
E
A
 
I
R
 
K
A
 
R
L
 
L
Q
 
F
E
 
E
A
 
I
A
 
A
-
 
N
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
I
-
 
K
-
 
I
F
 
L
A
 
G
E
 
K
T
 
R
G
 
G
D
 
I
L
 
Y
P
 
P
N
|
N
V
 
V
D
|
D
F
 
F
A
 
Y
L
 
S
A
 
G
C
 
L
L
 
V
A
 
F
E
 
Y
A
 
A
L
 
M
R
 
G
L
 
F
P
 
D
G
 
P
D
 
D
A
 
L
P
 
F
L
 
P
S
 
T
L
 
I
F
 
F
L
 
A
L
 
S
G
 
A
R
|
R
S
 
V
V
 
I
G
 
G
W
 
W
S
 
T
A
 
A
H
 
H
F
 
V
I
 
D
E
 
E
Q
 
Y
S
 
L
A
 
K
E
 
D
G
 
N
G
 
K
L
 
L
I
 
I
R
 
R
P
 
P
R
 
K
A
 
A
R
 
I
Y
 
Y
R
 
V
G
 
G
P
 
D
-
 
L
G
 
G
P
 
K
R
 
R
S
 
Y
G
 
V
P
 
P

1aj8A Citrate synthase from pyrococcus furiosus (see paper)
29% identity, 74% coverage: 92:376/386 of query aligns to 22:358/371 of 1aj8A

query
sites
1aj8A
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
L
 
L
L
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
V
 
Y
G
 
S
A
 
V
V
 
E
D
 
E
W
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
L
A
 
S
T
 
T
L
 
F
E
 
E
D
 
E
T
 
V
A
 
V
A
 
Y
L
 
L
L
 
L
W
 
W
Q
 
W
G
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
S
-
 
E
-
 
L
-
 
E
D
 
N
R
 
F
E
 
K
I
 
K
R
 
E
F
 
L
P
 
A
A
 
K
P
 
S
R
 
R
V
 
G
R
 
L
P
 
P
R
 
K
E
 
E
P
 
V
F
 
I
A
 
E
A
 
I
L
 
M
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
P
A
 
K
S
 
N
G
 
T
-
 
H
-
 
P
-
 
M
-
 
G
-
 
A
-
 
L
R
 
R
A
 
T
T
 
I
L
 
I
G
 
S
L
 
Y
G
 
L
G
 
G
N
 
N
-
 
I
-
 
D
-
 
D
-
 
S
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
V
G
 
Y
L
 
R
R
 
I
G
 
G
D
 
I
A
 
S
A
 
V
T
 
T
A
 
A
-
 
K
I
 
I
G
 
P
H
 
T
L
 
I
A
 
V
A
 
A
S
 
N
L
 
W
G
 
Y
A
 
R
A
 
I
R
 
K
G
 
N
-
 
G
-
 
L
-
 
E
D
 
Y
A
 
V
P
 
P
V
 
P
H
 
K
R
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
S
E
 
H
A
 
A
W
 
A
S
 
N
L
 
F
-
 
L
-
 
Y
-
 
M
-
 
L
-
 
H
G
 
G
E
 
E
-
 
E
-
 
P
-
 
P
S
 
K
E
 
E
G
 
W
E
 
E
R
 
K
-
 
A
I
 
M
R
 
D
L
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
I
N
 
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
M
V
 
T
A
 
V
A
 
G
S
 
S
T
 
T
G
 
L
A
 
S
S
 
D
V
 
Y
A
 
Y
A
 
S
G
 
A
L
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
I
C
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
R
x
I
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
-
G
 
-
M
 
-
A
|
A
L
 
V
A
 
E
A
 
E
L
 
A
M
 
I
G
 
K
D
 
Q
A
 
F
R
 
M
R
 
E
C
 
I
G
 
G
A
 
S
G
 
P
E
 
E
A
 
K
V
 
V
A
 
E
A
 
E
W
 
W
-
 
F
-
 
F
-
 
K
-
 
A
L
 
L
A
 
Q
R
 
Q
G
 
K
R
 
R
A
x
K
L
x
I
P
 
M
G
|
G
F
x
A
G
|
G
H
|
H
P
x
R
L
 
V
Y
 
Y
P
 
K
A
 
T
G
 
Y
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
R
 
R
A
 
I
L
 
F
-
 
K
-
 
K
-
 
Y
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
K
L
 
L
A
 
F
E
 
E
L
 
I
A
 
A
P
 
-
D
 
-
E
 
E
T
 
R
A
 
L
R
 
E
A
 
R
L
 
L
Q
 
V
E
 
E
A
 
E
A
 
Y
F
 
L
A
 
S
E
 
K
T
x
K
G
 
G
D
x
I
L
 
S
P
 
I
N
|
N
V
 
V
D
|
D
F
 
Y
A
 
W
L
 
S
A
 
G
C
 
L
L
 
V
A
 
F
E
 
Y
A
 
G
L
 
M
R
 
K
L
 
I
P
 
P
G
 
I
D
 
E
A
 
L
P
 
Y
L
 
T
S
 
T
L
 
I
F
 
F
L
 
A
L
 
M
G
 
G
R
 
R
S
 
I
V
 
A
G
 
G
W
 
W
S
 
T
A
 
A
H
 
H
F
 
L
I
 
A
E
 
E
Q
 
Y
S
 
V
A
 
S
E
 
H
G
 
N
G
 
R
L
 
I
I
 
I
R
 
R
P
 
P
R
 
R
A
 
L
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
V
G
 
G

6s87D Crystal structure of 2-methylcitrate synthase (prpc) from pseudomonas aeruginosa in complex with oxaloacetate.
35% identity, 47% coverage: 201:381/386 of query aligns to 167:358/365 of 6s87D

query
sites
6s87D
I
 
M
R
 
N
L
 
V
A
 
S
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
|
H
E
 
E
L
 
F
N
|
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
F
A
 
T
V
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
C
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
L
A
 
S
S
 
D
V
 
L
A
 
Y
A
 
S
G
 
C
L
 
V
L
 
T
A
 
G
G
 
A
L
 
I
C
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
R
G
 
G
P
 
P
R
 
L
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
N
M
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
M
A
 
E
L
 
L
M
 
I
G
 
-
D
 
-
A
 
E
R
 
R
R
 
F
C
 
S
G
 
S
A
 
P
G
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
T
A
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
L
A
 
K
W
 
M
L
 
L
A
 
E
R
 
R
G
 
K
R
 
D
A
 
K
L
 
I
P
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
|
H
P
 
A
L
 
I
Y
 
Y
P
 
K
A
 
D
G
 
S
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
N
R
 
E
A
 
V
L
 
I
-
 
K
-
 
G
-
 
W
-
 
S
-
 
K
-
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
E
A
 
V
P
 
G
D
 
D
E
 
K
T
 
V
A
 
L
R
 
F
A
 
A
L
 
V
Q
 
S
E
 
E
A
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
K
-
 
T
A
 
M
F
 
W
A
 
E
E
 
Q
T
 
K
G
 
K
D
 
L
L
 
F
P
 
P
N
 
N
V
 
A
D
|
D
F
 
F
A
 
Y
L
 
H
A
 
A
C
 
S
L
 
A
A
 
Y
E
 
H
A
 
F
L
 
M
R
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
T
D
 
K
A
 
L
P
 
F
L
 
T
S
 
P
L
 
I
F
 
F
L
 
V
L
 
C
G
 
S
R
|
R
S
 
T
V
 
S
G
 
G
W
 
W
S
 
T
A
 
A
H
 
H
F
 
V
I
 
F
E
 
E
Q
 
Q
S
 
R
A
 
A
E
 
N
G
 
N
G
 
R
L
 
I
I
 
I
R
 
R
P
 
P
R
 
S
A
 
A
R
 
E
Y
 
Y
R
 
T
G
 
G
P
 
V
G
 
E
P
 
Q
R
 
R
S
 
A

2h12B Structure of acetobacter aceti citrate synthase complexed with oxaloacetate and carboxymethyldethia coenzyme a (cmx) (see paper)
34% identity, 49% coverage: 186:376/386 of query aligns to 202:414/426 of 2h12B

query
sites
2h12B
R
 
R
L
 
M
A
 
S
E
 
E
A
 
P
W
 
Y
S
 
K
L
 
V
G
 
N
E
 
P
S
 
V
E
 
L
G
 
A
E
 
R
R
 
A
I
 
M
R
 
N
L
 
R
A
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
H
A
 
A
E
 
D
H
|
H
E
 
E
L
 
Q
N
|
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
S
A
 
T
V
 
V
R
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
G
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
N
V
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
C
L
 
I
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
I
C
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
W
G
 
G
P
 
P
R
x
A
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
N
M
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
L
A
 
K
L
 
M
M
 
L
G
 
A
D
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
R
C
 
I
G
 
G
A
 
K
G
 
K
E
 
E
A
 
N
V
 
I
A
 
P
A
 
A
W
 
F
L
 
I
A
 
A
R
 
Q
-
 
V
-
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
S
G
 
G
R
 
V
A
x
K
L
|
L
P
 
M
G
|
G
F
|
F
G
|
G
H
|
H
P
x
R
L
 
V
Y
 
Y
P
 
K
A
 
N
G
 
F
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
R
 
K
A
 
I
L
 
M
-
 
Q
-
 
Q
-
 
T
-
 
C
-
 
H
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
T
-
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
D
-
 
P
L
 
L
A
 
L
E
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
V
D
 
E
E
 
L
T
 
E
A
 
K
R
 
I
A
 
A
L
 
L
Q
 
S
E
 
D
A
 
D
A
x
Y
F
 
F
A
 
V
E
 
Q
T
x
R
G
 
K
D
x
L
L
 
Y
P
 
P
N
|
N
V
 
V
D
|
D
F
 
F
A
 
Y
L
 
S
A
 
G
C
 
I
L
 
I
A
 
L
E
 
K
A
 
A
L
 
M
R
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
T
D
 
S
A
 
M
P
 
F
L
 
T
S
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
A
L
 
V
G
 
A
R
|
R
S
 
T
V
 
T
G
 
G
W
 
W
S
 
V
A
 
S
H
 
Q
F
 
W
I
 
K
E
 
E
Q
 
M
S
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
P
G
 
G
-
 
Q
-
 
R
L
 
I
I
 
S
R
 
R
P
 
P
R
 
R
A
 
Q
R
 
L
Y
 
Y
R
 
I
G
 
G

6abwA Crystal structure of citrate synthase (msed_0281) from metallosphaera sedula in complex with acetyl-coa (see paper)
28% identity, 77% coverage: 84:380/386 of query aligns to 7:361/369 of 6abwA

query
sites
6abwA
A
 
T
T
 
T
S
 
S
I
 
L
S
 
T
T
 
Y
V
 
I
-
 
D
-
 
G
H
 
E
Q
 
N
G
 
G
T
 
I
L
 
L
L
 
R
Y
 
Y
R
 
G
G
 
G
V
 
Y
G
 
D
A
 
I
V
 
E
D
 
D
W
 
L
A
 
V
R
 
E
A
 
H
A
 
T
T
 
S
L
 
F
E
 
E
D
 
E
T
 
V
A
 
V
A
 
H
L
 
L
L
 
M
W
 
L
Q
 
Y
G
 
G
D
 
D
R
 
L
E
 
P
I
 
T
R
 
K
F
 
L
P
 
Q
A
 
L
P
 
Q
R
 
R
V
 
L
R
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
A
-
 
Y
-
 
E
-
 
V
-
 
P
-
 
Q
-
 
Q
-
 
V
-
 
I
-
 
D
-
 
M
-
 
I
-
 
Y
-
 
S
-
 
L
P
 
P
R
 
R
E
 
D
P
 
S
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
M
-
 
M
-
 
E
-
 
T
-
 
A
F
 
F
A
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
S
L
 
I
A
 
Y
A
 
G
S
 
M
-
 
P
-
 
W
G
 
N
R
 
K
A
 
A
T
 
T
L
 
N
G
 
R
L
 
D
G
 
N
G
 
A
N
 
V
G
 
K
L
 
L
R
 
V
G
 
A
D
 
R
A
 
A
A
 
S
T
 
T
A
 
V
I
 
V
G
 
A
H
 
N
L
 
V
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
G
 
R
A
 
A
A
 
K
R
 
E
G
 
G
D
 
K
A
 
K
P
 
P
V
 
A
H
 
I
R
 
P
R
 
E
L
 
P
A
 
S
E
 
E
A
 
S
W
 
F
S
 
A
L
 
K
G
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
F
-
 
S
-
 
R
-
 
T
-
 
P
-
 
T
E
 
E
S
 
E
E
 
E
G
 
V
E
 
K
R
 
A
I
 
M
R
 
D
L
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
E
 
D
H
 
H
E
 
E
L
 
V
N
 
P
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
T
A
 
A
V
 
A
R
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
L
A
 
S
S
 
D
V
 
I
A
 
Y
A
 
S
G
 
C
L
 
V
L
 
V
A
 
A
G
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
|
P
R
 
L
H
|
H
G
|
G
G
|
G
A
|
A
G
 
A
M
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
E
A
 
E
L
 
A
M
 
F
G
 
K
D
 
Q
A
 
F
R
 
V
R
 
E
C
 
I
G
 
G
A
 
E
G
 
P
E
 
D
A
 
M
V
 
T
A
 
E
A
 
S
W
 
W
L
 
F
A
 
K
R
 
R
-
 
K
-
 
I
-
 
I
-
 
E
G
 
G
R
 
K
A
 
S
-
x
R
L
|
L
P
x
M
G
 
G
F
|
F
G
|
G
H
|
H
P
x
R
L
 
V
Y
 
Y
P
 
K
A
 
T
G
 
Y
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
R
 
K
-
 
I
-
 
F
-
 
K
-
 
K
-
 
Y
-
 
A
A
 
K
L
 
V
L
 
I
A
 
S
E
 
E
L
 
R
A
 
N
P
 
S
D
 
D
-
 
A
-
 
R
-
 
K
-
 
Y
-
 
F
E
 
E
T
 
I
A
 
A
R
 
Q
A
 
K
L
 
L
Q
 
E
E
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
V
A
 
E
A
 
T
F
|
F
A
 
G
E
 
A
T
 
K
G
 
H
D
x
I
L
 
Y
P
 
P
N
 
N
V
 
T
D
|
D
F
 
F
A
 
Y
L
 
S
A
 
G
C
 
V
L
 
V
A
 
F
E
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
G
L
 
F
P
 
P
G
 
V
D
 
Y
A
 
M
P
 
F
L
 
T
S
 
S
L
 
L
F
 
F
L
 
A
L
 
L
G
 
S
R
 
R
S
 
T
V
 
L
G
 
G
W
 
W
S
 
T
A
 
A
H
 
H
F
 
V
I
 
I
E
 
E
Q
 
Y
S
 
V
A
 
E
E
 
D
G
 
Q
G
 
H
-
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
L
Y
 
Y
R
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
L
P
 
K
R
 
R

3msuA Crystal structure of citrate synthase from francisella tularensis
34% identity, 50% coverage: 189:381/386 of query aligns to 211:414/415 of 3msuA

query
sites
3msuA
E
 
E
A
 
S
W
 
Y
S
 
K
L
 
P
G
 
D
E
 
E
S
 
L
E
 
H
G
 
I
E
 
K
R
 
A
I
 
M
R
x
D
L
 
T
A
 
I
L
 
F
I
 
M
L
 
L
L
 
H
A
 
A
E
 
D
H
 
H
E
 
E
L
 
Q
N
 
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
S
A
 
T
V
 
V
R
 
R
V
 
L
A
 
S
A
 
G
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
N
S
 
S
V
 
P
A
 
Y
A
 
A
G
 
A
L
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
I
C
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
W
G
 
G
P
 
P
R
 
A
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
N
M
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
L
A
 
K
L
 
M
M
 
L
G
 
S
D
 
E
A
 
-
R
 
-
R
 
-
C
 
I
G
 
G
A
 
S
G
 
T
E
 
E
A
 
N
V
 
I
A
 
D
A
 
K
W
 
Y
L
 
I
A
 
A
R
 
K
G
 
A
R
 
K
-
 
D
A
 
K
L
 
L
P
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
|
H
P
 
R
L
 
V
Y
 
Y
P
 
K
A
 
N
G
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
R
 
T
A
 
A
L
 
M
-
 
K
-
 
K
-
 
N
-
 
C
-
 
E
-
 
E
-
 
I
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
H
D
 
S
E
 
D
T
 
N
-
 
P
-
 
L
-
 
L
-
 
T
-
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
K
L
 
L
Q
 
E
E
 
E
A
 
I
A
 
A
F
 
L
A
 
-
E
 
E
T
 
R
G
 
K
D
 
L
L
 
F
P
 
S
N
 
N
V
 
V
D
|
D
F
 
F
A
 
Y
L
 
S
A
 
G
C
 
I
L
 
I
A
 
L
E
 
K
A
 
A
L
 
M
R
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
E
D
 
D
A
 
M
P
 
F
L
 
T
S
 
A
L
 
I
F
 
F
L
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
S
 
T
V
 
S
G
 
G
W
 
W
S
 
I
A
 
S
H
 
Q
F
 
W
I
 
I
E
 
E
Q
 
M
S
 
V
A
 
N
E
 
D
-
 
P
-
 
A
G
 
Q
G
 
K
L
 
I
I
 
G
R
 
R
P
 
P
R
 
R
A
 
Q
R
 
L
Y
 
Y
R
 
T
G
 
G
P
 
A
G
 
T
P
 
N
R
 
R
S
 
N

Sites not aligning to the query:

2ifcC The structure of the binary complex of oxalateacetate with citrate synthase from the thermophilic archaeon thermolasma acidophilum
35% identity, 48% coverage: 195:381/386 of query aligns to 169:374/382 of 2ifcC

query
sites
2ifcC
E
 
K
S
 
E
E
 
E
G
 
I
E
 
D
R
 
A
I
 
M
R
 
N
L
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
Y
A
 
T
E
 
D
H
|
H
E
 
E
L
 
V
N
x
P
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
T
A
 
A
V
 
G
R
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
V
S
 
S
T
 
T
G
 
L
A
 
S
S
 
D
V
 
M
A
 
Y
A
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
R
 
L
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
A
M
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
I
A
 
A
L
 
Q
M
 
F
G
 
D
D
 
E
A
 
I
R
 
K
R
 
D
C
 
P
G
 
A
A
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
M
V
 
V
A
 
E
A
 
K
W
 
W
L
 
F
A
 
N
R
 
D
G
 
N
-
 
I
-
 
I
-
 
N
-
 
G
-
 
K
R
 
K
A
 
R
L
 
L
P
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
|
H
P
 
R
L
 
V
Y
 
Y
P
 
K
A
 
T
G
 
Y
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
R
 
K
A
 
I
L
 
F
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
E
-
 
K
L
 
L
A
 
S
E
 
S
L
 
K
A
 
K
P
 
P
D
 
E
-
 
V
-
 
H
-
 
K
-
 
V
-
 
Y
E
 
E
T
 
I
A
 
A
R
 
T
A
 
K
L
 
L
Q
 
E
E
 
D
-
 
F
-
 
G
-
 
I
A
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
G
E
 
S
T
 
K
G
 
G
D
 
I
L
 
Y
P
 
P
N
 
N
V
 
T
D
|
D
F
 
Y
A
 
F
L
 
S
A
 
G
C
 
I
L
 
V
A
 
Y
E
 
M
A
 
S
L
 
I
R
 
G
L
 
F
P
 
P
-
 
L
-
 
R
G
 
N
D
 
N
A
 
I
P
 
Y
L
 
T
S
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
A
L
 
L
G
 
S
R
|
R
S
 
V
V
 
T
G
 
G
W
 
W
S
 
Q
A
 
A
H
 
H
F
 
F
I
 
I
E
 
E
Q
 
Y
S
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
Q
G
 
Q
-
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
V
Y
 
Y
R
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
A
P
 
E
R
 
R
S
 
K

4yboB Structure of citrate synthase from the thermoacidophilic euryarchaeon thermolasma acidophilum (see paper)
35% identity, 48% coverage: 195:381/386 of query aligns to 168:373/381 of 4yboB

query
sites
4yboB
E
 
K
S
 
E
E
 
E
G
 
I
E
 
D
R
 
A
I
 
M
R
 
N
L
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
Y
A
 
T
E
 
D
H
 
H
E
 
E
L
 
V
N
 
P
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
T
A
 
A
V
 
G
R
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
V
S
 
S
T
 
T
G
 
L
A
 
S
S
 
D
V
 
M
A
 
Y
A
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
R
 
L
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
A
M
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
I
A
 
A
L
 
Q
M
 
F
G
 
D
D
 
E
A
 
I
R
 
K
R
 
D
C
 
P
G
 
A
A
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
M
V
 
V
A
 
E
A
 
K
W
 
W
L
 
F
A
 
N
R
 
D
G
 
N
-
 
I
-
 
I
-
 
N
-
 
G
-
 
K
R
 
K
A
 
R
L
 
L
P
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
|
H
P
 
R
L
 
V
Y
 
Y
P
 
K
A
 
T
G
 
Y
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
R
 
K
A
 
I
L
 
F
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
E
-
 
K
L
 
L
A
 
S
E
 
S
L
 
K
A
x
K
P
 
P
D
x
E
-
x
V
-
 
H
-
 
K
-
 
V
-
 
Y
E
 
E
T
 
I
A
 
A
R
 
T
A
 
K
L
 
L
Q
 
E
E
 
D
-
 
F
-
 
G
-
 
I
A
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
G
E
 
S
T
 
K
G
 
G
D
 
I
L
 
Y
P
 
P
N
 
N
V
 
T
D
|
D
F
 
Y
A
 
F
L
 
S
A
 
G
C
 
I
L
 
V
A
 
Y
E
 
M
A
 
S
L
 
I
R
 
G
L
 
F
P
 
P
-
 
L
-
 
R
G
 
N
D
 
N
A
 
I
P
 
Y
L
 
T
S
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
A
L
 
L
G
 
S
R
 
R
S
 
V
V
 
T
G
 
G
W
 
W
S
 
Q
A
 
A
H
 
H
F
 
F
I
 
I
E
 
E
Q
 
Y
S
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
Q
G
 
Q
-
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
V
Y
 
Y
R
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
A
P
 
E
R
 
R
S
 
K

2r9eA The structure of the binary complex of citryl dethia coa and citrate synthase from the thermophilic archaeonthermoplasma acidophilum
35% identity, 48% coverage: 195:381/386 of query aligns to 169:374/381 of 2r9eA

query
sites
2r9eA
E
 
K
S
 
E
E
 
E
G
 
I
E
 
D
R
 
A
I
 
M
R
 
N
L
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
Y
A
 
T
E
 
D
H
|
H
E
 
E
L
 
V
N
x
P
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
T
A
 
A
V
 
G
R
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
V
S
 
S
T
 
T
G
 
L
A
 
S
S
 
D
V
 
M
A
 
Y
A
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
R
x
L
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
A
M
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
I
A
 
A
L
 
Q
M
 
F
G
 
D
D
 
E
A
 
I
R
 
K
R
 
D
C
 
P
G
 
A
A
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
M
V
 
V
A
 
E
A
 
K
W
 
W
L
 
F
A
 
N
R
 
D
G
 
N
-
 
I
-
 
I
-
 
N
-
 
G
-
 
K
R
 
K
A
x
R
L
|
L
P
x
M
G
|
G
F
|
F
G
|
G
H
|
H
P
x
R
L
 
V
Y
 
Y
P
 
K
A
 
T
G
 
Y
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
R
 
K
A
 
I
L
 
F
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
E
-
 
K
L
 
L
A
 
S
E
 
S
L
 
K
A
 
K
P
 
P
D
 
E
-
 
V
-
 
H
-
 
K
-
 
V
-
 
Y
E
 
E
T
 
I
A
 
A
R
 
T
A
 
K
L
 
L
Q
 
E
E
 
D
-
 
F
-
 
G
-
 
I
A
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
G
E
 
S
T
 
K
G
 
G
D
x
I
L
 
Y
P
 
P
N
|
N
V
 
T
D
|
D
F
 
Y
A
 
F
L
 
S
A
 
G
C
 
I
L
 
V
A
 
Y
E
 
M
A
 
S
L
 
I
R
 
G
L
 
F
P
 
P
-
 
L
-
 
R
G
 
N
D
 
N
A
 
I
P
 
Y
L
 
T
S
 
A
L
 
L
F
|
F
L
 
A
L
 
L
G
 
S
R
|
R
S
 
V
V
 
T
G
 
G
W
 
W
S
 
Q
A
 
A
H
 
H
F
 
F
I
 
I
E
 
E
Q
 
Y
S
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
Q
G
 
Q
-
x
R
L
 
L
I
 
I
R
|
R
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
V
Y
 
Y
R
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
A
P
 
E
R
 
R
S
 
K

2r26A The structure of the ternary complex of carboxymethyl coenzyme a and oxalateacetate with citrate synthase from the thermophilic archaeonthermoplasma acidophilum
35% identity, 48% coverage: 195:381/386 of query aligns to 169:374/381 of 2r26A

query
sites
2r26A
E
 
K
S
 
E
E
 
E
G
 
I
E
 
D
R
 
A
I
 
M
R
 
N
L
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
Y
A
 
T
E
 
D
H
|
H
E
 
E
L
 
V
N
x
P
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
T
A
 
A
V
 
G
R
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
V
S
 
S
T
 
T
G
 
L
A
 
S
S
 
D
V
 
M
A
 
Y
A
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
L
C
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
R
x
L
H
|
H
G
|
G
G
 
G
A
|
A
G
 
A
M
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
I
A
 
A
L
 
Q
M
 
F
G
 
D
D
 
E
A
 
I
R
 
K
R
 
D
C
 
P
G
 
A
A
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
M
V
 
V
A
 
E
A
 
K
W
 
W
L
 
F
A
 
N
R
 
D
G
 
N
-
 
I
-
 
I
-
 
N
-
 
G
-
 
K
R
 
K
A
x
R
L
|
L
P
 
M
G
|
G
F
|
F
G
|
G
H
|
H
P
x
R
L
 
V
Y
 
Y
P
 
K
A
 
T
G
 
Y
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
R
 
K
A
 
I
L
 
F
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
E
-
 
K
L
 
L
A
 
S
E
 
S
L
 
K
A
 
K
P
 
P
D
 
E
-
 
V
-
 
H
-
 
K
-
 
V
-
 
Y
E
 
E
T
 
I
A
 
A
R
 
T
A
 
K
L
 
L
Q
 
E
E
 
D
-
 
F
-
 
G
-
 
I
A
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
G
E
 
S
T
 
K
G
 
G
D
 
I
L
 
Y
P
 
P
N
|
N
V
 
T
D
|
D
F
 
Y
A
 
F
L
 
S
A
 
G
C
 
I
L
 
V
A
 
Y
E
 
M
A
 
S
L
 
I
R
 
G
L
 
F
P
 
P
-
 
L
-
 
R
G
 
N
D
 
N
A
 
I
P
 
Y
L
 
T
S
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
A
L
 
L
G
 
S
R
|
R
S
 
V
V
 
T
G
 
G
W
 
W
S
 
Q
A
 
A
H
 
H
F
 
F
I
 
I
E
 
E
Q
 
Y
S
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
Q
G
 
Q
-
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
V
Y
 
Y
R
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
A
P
 
E
R
 
R
S
 
K

3msuB Crystal structure of citrate synthase from francisella tularensis
32% identity, 50% coverage: 189:381/386 of query aligns to 211:425/426 of 3msuB

query
sites
3msuB
E
 
E
A
 
S
W
 
Y
S
 
K
L
 
P
G
 
D
E
 
E
S
 
L
E
 
H
G
 
I
E
 
K
R
 
A
I
 
M
R
 
D
L
 
T
A
 
I
L
 
F
I
 
M
L
 
L
L
 
H
A
 
A
E
 
D
H
 
H
E
 
E
L
 
Q
N
 
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
S
A
 
T
V
 
V
R
 
R
V
 
L
A
 
S
A
 
G
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
N
S
 
S
V
 
P
A
 
Y
A
 
A
G
 
A
L
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
I
C
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
W
G
 
G
P
 
P
R
 
A
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
N
M
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
L
A
 
K
L
 
M
M
 
L
G
 
S
D
 
E
A
 
-
R
 
-
R
 
-
C
 
I
G
 
G
A
 
S
G
 
T
E
 
E
A
 
N
V
 
I
A
 
D
A
 
K
W
 
Y
L
 
I
A
 
A
R
 
K
G
 
A
R
 
K
A
 
D
-
 
K
-
 
D
-
 
D
-
 
P
-
 
F
-
 
R
L
 
L
P
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
|
H
P
 
R
L
 
V
Y
 
Y
P
 
K
A
 
N
G
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
A
 
A
R
 
T
A
 
A
L
 
M
-
 
K
-
 
K
-
 
N
-
 
C
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
G
-
 
H
-
 
S
-
 
D
-
 
N
-
 
P
L
 
L
A
 
L
E
 
T
L
 
V
A
 
A
P
 
K
D
 
K
E
 
L
T
 
E
A
 
E
R
 
I
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
D
A
 
E
A
 
F
F
 
F
A
 
I
E
 
E
T
 
R
G
 
K
D
 
L
L
 
F
P
 
S
N
 
N
V
 
V
D
|
D
F
 
F
A
 
Y
L
 
S
A
 
G
C
 
I
L
 
I
A
 
L
E
 
K
A
 
A
L
 
M
R
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
E
D
 
D
A
 
M
P
 
F
L
 
T
S
 
A
L
 
I
F
 
F
L
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
S
 
T
V
 
S
G
 
G
W
 
W
S
 
I
A
 
S
H
 
Q
F
 
W
I
 
I
E
 
E
Q
 
M
S
 
V
A
 
N
E
 
D
-
 
P
-
 
A
G
 
Q
G
 
K
L
 
I
I
 
G
R
 
R
P
 
P
R
 
R
A
 
Q
R
 
L
Y
 
Y
R
 
T
G
 
G
P
 
A
G
 
T
P
 
N
R
 
R
S
 
N

Sites not aligning to the query:

O34002 2-methylcitrate synthase; 2-MCS; MCS; Citrate synthase; EC 2.3.3.5; EC 2.3.3.16 from Antarctic bacterium DS2-3R (see 2 papers)
29% identity, 78% coverage: 84:383/386 of query aligns to 17:379/379 of O34002

query
sites
O34002
A
 
V
T
 
T
S
 
A
I
 
I
S
 
S
T
 
K
V
 
V
H
 
N
Q
 
S
G
 
D
T
 
T
-
 
N
-
 
S
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
V
 
Y
G
 
P
A
 
V
V
 
Q
D
 
E
W
 
L
A
 
A
R
 
A
A
 
K
A
 
C
T
 
S
L
 
F
E
 
E
D
 
Q
T
 
V
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
L
 
L
W
 
W
Q
 
N
-
 
S
-
 
E
-
 
L
-
 
P
G
 
N
D
 
D
R
 
S
E
 
E
I
 
L
R
 
K
-
 
A
-
 
F
-
 
V
-
 
N
F
 
F
P
 
E
A
 
R
P
 
S
R
 
H
V
 
R
R
 
K
P
 
L
R
 
D
E
 
E
P
 
N
F
 
V
A
 
K
A
 
G
L
 
A
A
 
I
A
 
D
L
 
L
A
 
L
A
 
S
S
 
T
G
 
A
-
 
C
-
 
H
-
 
P
-
 
M
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
R
R
 
T
A
 
A
T
 
V
L
 
S
G
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
A
N
 
N
G
 
H
L
 
A
R
 
R
G
 
A
D
 
Q
A
 
D
A
 
S
T
 
S
A
 
P
I
 
E
G
 
A
H
 
N
L
 
L
-
 
E
-
 
K
A
 
A
A
 
M
S
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
A
A
 
T
-
 
F
-
 
P
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
A
-
 
Y
-
 
D
-
 
Q
-
 
R
-
 
R
-
 
R
R
 
R
G
 
G
D
 
E
A
 
E
P
 
L
V
 
I
H
 
E
R
 
P
R
 
R
L
 
E
A
 
D
E
 
L
A
 
D
W
 
Y
S
 
S
-
 
A
-
 
N
-
 
F
-
 
L
-
 
W
-
 
M
-
 
T
L
 
F
G
 
G
E
 
E
S
 
E
E
 
A
G
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
V
E
 
E
R
 
A
I
 
F
R
 
N
L
 
V
A
 
S
L
 
M
I
 
I
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
H
E
 
S
L
 
F
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
T
V
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
I
A
 
T
S
 
S
T
 
T
G
 
L
A
 
A
S
 
D
V
 
L
A
 
H
A
 
S
G
 
A
L
 
V
L
 
T
A
 
G
G
 
A
L
 
I
C
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
R
 
L
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
N
M
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
M
-
 
H
-
 
T
-
 
F
-
 
E
-
 
E
-
 
I
A
 
G
L
 
I
M
 
R
G
 
K
D
 
D
A
 
E
R
 
S
R
 
L
C
 
D
G
 
E
A
 
A
G
 
A
E
 
T
A
 
R
V
 
S
A
 
K
A
 
A
W
 
W
-
 
M
-
 
V
-
 
D
-
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
G
 
K
R
 
K
A
x
K
L
x
V
P
x
M
G
|
G
F
|
F
G
 
G
H
|
H
P
 
R
L
 
V
Y
 
Y
P
 
K
A
 
N
G
 
G
D
 
D
P
 
S
R
|
R
A
 
V
-
 
P
-
 
T
-
 
M
-
 
K
R
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
D
A
 
A
E
 
M
L
 
I
A
 
K
P
 
H
D
 
Y
E
 
D
T
 
R
A
 
P
R
 
E
A
 
M
L
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
Y
-
 
N
-
 
G
Q
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
M
A
 
E
E
 
E
T
 
A
G
 
K
D
 
Q
L
 
I
-
 
K
P
 
P
N
 
N
V
 
L
D
|
D
F
 
Y
A
 
P
L
 
A
A
 
G
C
 
P
L
 
T
A
 
Y
E
 
N
A
 
L
L
 
M
R
 
G
L
 
F
P
 
D
G
 
T
D
 
E
A
 
M
P
 
F
L
 
T
S
 
P
L
 
L
F
 
F
L
 
I
L
 
A
G
 
A
R
|
R
S
 
I
V
 
T
G
 
G
W
 
W
S
 
T
A
 
A
H
 
H
F
 
I
I
 
M
E
 
E
Q
 
Q
S
 
V
A
 
A
E
 
D
G
 
N
G
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
R
P
 
P
R
 
L
A
 
S
R
 
E
Y
 
Y
R
 
N
G
 
G
P
 
P
G
 
E
P
 
Q
R
 
R
S
 
Q
G
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1a59A Cold-active citrate synthase (see paper)
29% identity, 78% coverage: 84:383/386 of query aligns to 15:377/377 of 1a59A

query
sites
1a59A
A
 
V
T
 
T
S
 
A
I
 
I
S
 
S
T
 
K
V
 
V
H
 
N
Q
 
S
G
 
D
T
 
T
-
 
N
-
 
S
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
V
 
Y
G
 
P
A
 
V
V
 
Q
D
 
E
W
 
L
A
 
A
R
 
A
A
 
K
A
 
C
T
 
S
L
 
F
E
 
E
D
 
Q
T
 
V
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
L
 
L
W
 
W
Q
 
N
-
 
S
-
 
E
-
 
L
-
 
P
G
 
N
D
 
D
R
 
S
E
 
E
I
 
L
R
 
K
-
 
A
-
 
F
-
 
V
-
 
N
F
 
F
P
 
E
A
 
R
P
 
S
R
 
H
V
 
R
R
 
K
P
 
L
R
 
D
E
 
E
P
 
N
F
 
V
A
 
K
A
 
G
L
 
A
A
 
I
A
 
D
L
 
L
A
 
L
A
 
S
S
 
T
G
 
A
-
 
C
-
 
H
-
 
P
-
 
M
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
R
R
 
T
A
 
A
T
 
V
L
 
S
G
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
A
N
 
N
G
 
H
L
 
A
R
 
R
G
 
A
D
 
Q
A
 
D
A
 
S
T
 
S
A
 
P
I
 
E
G
 
A
H
 
N
L
 
L
-
 
E
-
 
K
A
 
A
A
 
M
S
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
A
A
 
T
-
 
F
-
 
P
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
A
-
 
Y
-
 
D
-
 
Q
-
 
R
-
 
R
-
 
R
R
 
R
G
 
G
D
 
E
A
 
E
P
 
L
V
 
I
H
 
E
R
 
P
R
 
R
L
 
E
A
 
D
E
 
L
A
 
D
W
 
Y
S
 
S
-
 
A
-
 
N
-
 
F
-
 
L
-
 
W
-
 
M
-
 
T
L
 
F
G
 
G
E
 
E
S
 
E
E
 
A
G
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
V
E
 
E
R
 
A
I
 
F
R
 
N
L
 
V
A
 
S
L
 
M
I
 
I
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
H
E
 
S
L
 
F
N
 
N
A
 
A
S
|
S
T
 
T
F
 
F
A
 
T
V
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
I
A
 
T
S
 
S
T
 
T
G
 
L
A
 
A
S
 
D
V
 
L
A
 
H
A
 
S
G
 
A
L
 
V
L
 
T
A
 
G
G
 
A
L
 
I
C
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
G
P
 
P
R
x
L
H
|
H
G
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
N
M
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
M
-
 
H
-
 
T
-
 
F
-
 
E
-
 
E
-
 
I
A
 
G
L
 
I
M
 
R
G
 
K
D
 
D
A
 
E
R
 
S
R
 
L
C
 
D
G
 
E
A
 
A
G
 
A
E
 
T
A
 
R
V
 
S
A
 
K
A
 
A
W
 
W
-
 
M
-
 
V
-
 
D
-
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
G
 
K
R
 
K
A
x
K
L
x
V
P
x
M
G
|
G
F
|
F
G
|
G
H
|
H
P
x
R
L
 
V
Y
 
Y
P
 
K
A
 
N
G
 
G
D
 
D
P
 
S
R
|
R
A
 
V
-
 
P
-
 
T
-
 
M
-
 
K
R
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
D
A
 
A
E
 
M
L
 
I
A
 
K
P
 
H
D
 
Y
E
 
D
T
 
R
A
 
P
R
 
E
A
 
M
L
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
Y
-
 
N
-
 
G
Q
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
M
A
 
E
E
 
E
T
 
A
G
 
K
D
 
Q
L
x
I
-
 
K
P
 
P
N
|
N
V
 
L
D
|
D
F
 
Y
A
 
P
L
 
A
A
 
G
C
 
P
L
 
T
A
 
Y
E
 
N
A
 
L
L
 
M
R
 
G
L
 
F
P
 
D
G
 
T
D
 
E
A
 
M
P
 
F
L
 
T
S
 
P
L
 
L
F
 
F
L
 
I
L
 
A
G
 
A
R
 
R
S
 
I
V
 
T
G
 
G
W
 
W
S
 
T
A
 
A
H
 
H
F
 
I
I
 
M
E
 
E
Q
 
Q
S
 
V
A
 
A
E
 
D
G
 
N
G
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
R
P
 
P
R
 
L
A
 
S
R
 
E
Y
 
Y
R
 
N
G
 
G
P
 
P
G
 
E
P
 
Q
R
 
R
S
 
Q
G
 
V
P
 
P

4jagA Structural determination of the a50t:s279g:s280k:v281k:k282e:h283n variant of citrate synthase from e. Coli complexed with oxaloacetate (see paper)
35% identity, 46% coverage: 205:381/386 of query aligns to 223:419/426 of 4jagA

query
sites
4jagA
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
H
A
 
A
E
 
D
H
|
H
E
 
E
L
 
Q
N
|
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
S
A
 
T
V
 
V
R
 
R
V
 
T
A
 
A
A
 
G
S
 
S
T
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
N
V
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
C
L
 
I
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
I
C
 
A
A
 
S
L
 
L
S
 
W
G
 
G
P
 
P
R
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
N
M
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
L
A
 
K
L
 
M
M
 
L
G
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
E
R
 
E
C
 
I
G
 
G
A
 
K
G
 
K
E
 
E
A
 
N
V
 
I
A
 
P
A
 
E
W
 
F
L
 
V
A
 
R
R
 
R
G
 
A
R
 
K
A
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
R
L
 
L
P
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
H
P
x
R
L
 
V
Y
 
Y
P
 
K
A
 
N
G
 
Y
D
 
D
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
T
A
 
V
L
 
M
-
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
C
-
 
H
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
T
-
 
K
-
 
D
-
 
D
L
 
L
A
 
L
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
M
D
 
E
E
 
L
T
 
E
A
 
N
R
 
I
A
 
A
L
 
L
Q
 
N
E
 
D
A
 
P
A
 
Y
F
 
F
A
 
I
E
 
E
T
 
K
G
 
K
D
 
L
L
 
Y
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
|
D
F
 
F
A
 
Y
L
 
S
A
 
G
C
 
I
L
 
I
A
 
L
E
 
K
A
 
A
L
 
M
R
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
S
D
 
S
A
 
M
P
 
F
L
 
T
S
 
V
L
 
I
F
 
F
L
 
A
L
 
M
G
 
A
R
|
R
S
 
T
V
 
V
G
 
G
W
 
W
S
 
I
A
 
A
H
 
H
F
 
W
I
 
S
E
 
E
Q
 
M
S
 
H
A
 
S
E
 
D
G
 
G
G
 
M
L
 
K
I
 
I
-
 
A
R
 
R
P
 
P
R
 
R
A
 
Q
R
 
L
Y
 
Y
R
 
T
G
 
G
P
 
Y
G
 
E
P
 
K
R
 
R
S
 
D

4jaeA Structural determination of the a50t:s279g:s280k:v281k:k282e:h283n variant of citrate synthase from e. Coli complexed with s- carboxymethyl-coa (see paper)
35% identity, 46% coverage: 205:381/386 of query aligns to 223:419/426 of 4jaeA

query
sites
4jaeA
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
H
A
 
A
E
 
D
H
 
H
E
 
E
L
 
Q
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
F
 
S
A
 
T
V
 
V
R
 
R
V
 
T
A
 
A
A
 
G
S
 
S
T
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
N
V
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
C
L
 
I
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
I
C
 
A
A
 
S
L
 
L
S
 
W
G
 
G
P
 
P
R
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
N
M
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
L
A
 
K
L
 
M
M
 
L
G
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
E
R
 
E
C
 
I
G
 
G
A
 
K
G
 
K
E
 
E
A
 
N
V
 
I
A
 
P
A
 
E
W
 
F
L
 
V
A
 
R
R
 
R
G
 
A
R
 
K
A
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
R
L
 
L
P
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
H
P
 
R
L
 
V
Y
 
Y
P
 
K
A
 
N
G
 
Y
D
 
D
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
T
A
 
V
L
 
M
-
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
C
-
 
H
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
T
-
 
K
-
 
D
-
 
D
L
 
L
A
 
L
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
M
D
 
E
E
 
L
T
 
E
A
 
N
R
 
I
A
 
A
L
 
L
Q
 
N
E
 
D
A
 
P
A
 
Y
F
 
F
A
 
I
E
 
E
T
 
K
G
 
K
D
 
L
L
 
Y
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
|
D
F
 
F
A
 
Y
L
 
S
A
 
G
C
 
I
L
 
I
A
 
L
E
 
K
A
 
A
L
 
M
R
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
S
D
 
S
A
 
M
P
 
F
L
 
T
S
 
V
L
 
I
F
 
F
L
 
A
L
 
M
G
 
A
R
 
R
S
 
T
V
 
V
G
 
G
W
 
W
S
 
I
A
 
A
H
 
H
F
 
W
I
 
S
E
 
E
Q
 
M
S
 
H
A
 
S
E
 
D
G
 
G
G
 
M
L
 
K
I
 
I
-
 
A
R
 
R
P
 
P
R
 
R
A
 
Q
R
 
L
Y
 
Y
R
 
T
G
 
G
P
 
Y
G
 
E
P
 
K
R
 
R
S
 
D

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012333717.1 NCBI__GCF_000019365.1:WP_012333717.1
MIDTINMREWIDRDAALHALGIKPQTLYAYVSRGRIGMCPDPGDPRRSLYRADDVAALRA
RHIRGRKLADIAAGALAWGEPSLATSISTVHQGTLLYRGVGAVDWARAATLEDTAALLWQ
GDREIRFPAPRVRPREPFAALAALAASGRATLGLGGNGLRGDAATAIGHLAASLGAARGD
APVHRRLAEAWSLGESEGERIRLALILLAEHELNASTFAVRVAASTGASVAAGLLAGLCA
LSGPRHGGAGMALAALMGDARRCGAGEAVAAWLARGRALPGFGHPLYPAGDPRARALLAE
LAPDETARALQEAAFAETGDLPNVDFALACLAEALRLPGDAPLSLFLLGRSVGWSAHFIE
QSAEGGLIRPRARYRGPGPRSGPAGP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory