SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012334742.1 NCBI__GCF_000019365.1:WP_012334742.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 7 hits to proteins with known functional sites (download)

2i3gA Crystal structure of n-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase (rv1652) from mycobacterium tuberculosis in complex with NADP+. (see paper)
31% identity, 87% coverage: 40:312/315 of query aligns to 59:332/347 of 2i3gA

query
sites
2i3gA
P
 
P
P
 
L
A
 
A
Q
 
H
R
 
R
K
 
V
D
 
V
P
 
E
D
 
P
A
x
T
K
 
E
R
 
A
A
 
A
L
 
V
L
 
L
A
 
G
E
 
G
V
 
H
D
 
D
L
 
A
V
 
V
V
 
F
L
 
L
C
x
A
L
|
L
P
|
P
D
 
H
D
 
G
A
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
H
T
 
S
V
 
A
A
 
V
M
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
Q
L
 
L
P
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
I
-
 
I
-
 
D
-
x
C
G
 
G
G
 
A
G
 
D
P
 
F
R
 
R
I
 
L
L
 
T
D
 
D
A
 
A
S
 
A
T
 
V
A
 
W
H
 
E
R
 
R
V
 
F
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
H
A
 
A
P
 
G
G
 
S
W
 
W
T
 
P
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
A
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
-
P
 
P
E
 
G
Q
 
A
R
 
R
A
 
D
A
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
G
S
 
T
R
 
R
R
 
R
V
 
I
A
 
A
N
 
V
P
 
P
G
 
G
C
 
C
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
L
L
 
A
L
 
L
R
 
F
P
 
P
L
 
A
V
 
L
D
 
A
A
 
A
G
 
D
L
 
L
I
 
I
P
 
-
A
 
-
D
 
E
H
 
P
P
 
A
I
 
V
S
 
T
I
 
V
N
 
V
A
 
A
V
 
V
S
 
S
G
 
G
Y
 
T
S
 
S
G
|
G
G
 
A
G
|
G
R
|
R
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
T
K
 
D
M
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
E
E
 
V
D
 
I
G
 
G
T
 
S
A
 
A
P
 
R
A
 
A
F
 
Y
E
 
N
L
 
I
Y
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
-
F
 
-
A
 
-
H
 
H
K
 
R
H
 
H
L
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
I
-
 
A
Q
 
Q
A
 
G
Y
 
L
S
 
R
R
 
A
L
 
V
T
 
T
R
 
D
R
 
R
P
 
D
I
 
V
-
 
S
-
 
V
-
 
S
F
 
F
V
 
T
P
 
P
S
 
V
V
 
L
G
 
I
N
 
P
F
 
A
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
M
 
I
L
 
L
V
 
A
S
 
T
I
 
C
P
 
T
L
 
A
H
 
R
L
 
T
D
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
R
P
 
S
H
 
P
P
 
L
G
 
S
D
 
Q
L
 
L
E
 
R
Q
 
A
A
 
A
L
 
Y
A
 
E
A
 
K
R
 
A
Y
 
Y
A
 
H
G
 
A
E
 
E
E
 
P
L
 
F
V
 
I
R
 
Y
V
 
L
V
 
M
T
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
P
E
 
E
G
 
G
A
 
-
H
 
-
R
 
-
E
 
Q
R
 
L
L
 
P
E
 
R
P
 
T
E
 
G
A
 
A
L
 
V
N
 
I
G
 
G
T
 
S
D
 
N
G
 
A
L
 
A
E
 
H
L
 
I
R
 
A
V
 
V
F
 
A
G
 
V
S
 
D
D
 
E
A
 
D
H
 
A
G
 
Q
Q
 
T
A
 
F
V
 
V
L
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
A
L
 
I
D
 
D
N
 
N
L
|
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
x
T
S
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
S
L
 
M
R
 
N
L
 
L
M
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7npjB Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argc in complex with 6-phenoxy-3-pyridinamine
31% identity, 87% coverage: 40:312/315 of query aligns to 56:329/344 of 7npjB

query
sites
7npjB
P
 
P
P
 
L
A
 
A
Q
 
H
R
 
R
K
 
V
D
 
V
P
 
E
D
 
P
A
 
T
K
 
E
R
 
A
A
 
A
L
 
V
L
 
L
A
 
G
E
 
G
V
 
H
D
 
D
L
 
A
V
 
V
V
 
F
L
 
L
C
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
H
D
 
G
A
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
H
T
 
S
V
 
A
A
 
V
M
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
Q
L
 
L
P
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
C
G
 
G
G
 
A
G
 
D
P
 
F
R
 
R
I
 
L
L
 
T
D
 
D
A
 
A
S
 
A
T
 
V
A
 
W
H
 
E
R
 
R
V
 
F
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
H
A
 
A
P
 
G
G
 
S
W
 
W
T
 
P
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
A
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
-
P
 
P
E
 
G
Q
 
A
R
 
R
A
 
D
A
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
G
S
 
T
R
 
R
R
 
R
V
 
I
A
 
A
N
 
V
P
 
P
G
 
G
C
 
C
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
L
L
 
A
L
 
L
R
 
F
P
 
P
L
 
A
V
 
L
D
 
A
A
 
A
G
 
D
L
 
L
I
 
I
P
 
-
A
 
-
D
 
E
H
 
P
P
 
A
I
 
V
S
 
T
I
 
V
N
 
V
A
 
A
V
 
V
S
 
S
G
 
G
Y
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
A
G
|
G
R
|
R
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
T
K
 
D
M
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
E
E
 
V
D
 
I
G
 
G
T
 
S
A
 
A
P
 
R
A
 
A
F
 
Y
E
 
N
L
 
I
Y
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
-
F
 
-
A
 
-
H
 
H
K
 
R
H
 
H
L
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
I
-
 
A
Q
 
Q
A
 
G
Y
 
L
S
 
R
R
 
A
L
 
V
T
 
T
R
 
D
R
 
R
P
 
D
I
 
V
-
 
S
-
 
V
-
 
S
F
 
F
V
 
T
P
 
P
S
 
V
V
 
L
G
 
I
N
 
P
F
 
A
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
M
 
I
L
 
L
V
 
A
S
 
T
I
 
C
P
 
T
L
 
A
H
 
R
L
 
T
D
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
R
P
 
S
H
 
P
P
 
L
G
 
S
D
 
Q
L
 
L
E
 
R
Q
 
A
A
 
A
L
 
Y
A
 
E
A
 
K
R
 
A
Y
 
Y
A
 
H
G
 
A
E
 
E
E
 
P
L
 
F
V
 
I
R
 
Y
V
 
L
V
 
M
T
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
P
E
 
E
G
 
G
A
 
-
H
 
-
R
 
-
E
 
Q
R
 
L
L
 
P
E
 
R
P
 
T
E
 
G
A
 
A
L
 
V
N
 
I
G
 
G
T
 
S
D
 
N
G
 
A
L
 
A
E
 
H
L
 
I
R
 
A
V
 
V
F
 
A
G
 
V
S
 
D
D
 
E
A
 
D
H
 
A
G
 
Q
Q
 
T
A
 
F
V
 
V
L
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
A
L
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
x
T
S
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
S
L
 
M
R
 
N
L
 
L
M
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7nphC Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argc in complex with 5-methoxy-1,3-benzoxazole-2-carboxylic acid
31% identity, 87% coverage: 40:312/315 of query aligns to 56:329/344 of 7nphC

query
sites
7nphC
P
 
P
P
 
L
A
 
A
Q
 
H
R
 
R
K
 
V
D
 
V
P
 
E
D
 
P
A
 
T
K
 
E
R
 
A
A
 
A
L
 
V
L
 
L
A
 
G
E
 
G
V
 
H
D
 
D
L
 
A
V
 
V
V
 
F
L
 
L
C
 
A
L
|
L
P
 
P
D
 
H
D
 
G
A
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
H
T
 
S
V
 
A
A
 
V
M
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
Q
L
 
L
P
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
C
G
 
G
G
 
A
G
 
D
P
 
F
R
 
R
I
 
L
L
 
T
D
 
D
A
 
A
S
 
A
T
 
V
A
 
W
H
 
E
R
 
R
V
 
F
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
H
A
 
A
P
 
G
G
 
S
W
 
W
T
 
P
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
A
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
-
P
 
P
E
 
G
Q
 
A
R
 
R
A
 
D
A
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
G
S
 
T
R
 
R
R
 
R
V
 
I
A
 
A
N
 
V
P
 
P
G
 
G
C
 
C
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
L
L
 
A
L
 
L
R
 
F
P
 
P
L
 
A
V
 
L
D
 
A
A
 
A
G
 
D
L
 
L
I
 
I
P
 
-
A
 
-
D
 
E
H
 
P
P
 
A
I
 
V
S
 
T
I
 
V
N
 
V
A
 
A
V
 
V
S
 
S
G
 
G
Y
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
A
G
|
G
R
|
R
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
T
K
 
D
M
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
E
E
 
V
D
 
I
G
 
G
T
 
S
A
 
A
P
 
R
A
 
A
F
 
Y
E
 
N
L
 
I
Y
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
-
F
 
-
A
 
-
H
 
H
K
 
R
H
 
H
L
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
I
-
 
A
Q
 
Q
A
 
G
Y
 
L
S
 
R
R
 
A
L
 
V
T
 
T
R
 
D
R
 
R
P
 
D
I
 
V
-
 
S
-
 
V
-
 
S
F
 
F
V
 
T
P
 
P
S
 
V
V
 
L
G
 
I
N
 
P
F
 
A
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
M
 
I
L
 
L
V
 
A
S
 
T
I
 
C
P
 
T
L
 
A
H
 
R
L
 
T
D
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
R
P
 
S
H
 
P
P
 
L
G
 
S
D
 
Q
L
 
L
E
 
R
Q
 
A
A
 
A
L
 
Y
A
 
E
A
 
K
R
 
A
Y
 
Y
A
 
H
G
 
A
E
 
E
E
 
P
L
 
F
V
 
I
R
 
Y
V
 
L
V
 
M
T
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
P
E
 
E
G
 
G
A
 
-
H
 
-
R
 
-
E
 
Q
R
 
L
L
 
P
E
 
R
P
 
T
E
 
G
A
 
A
L
 
V
N
 
I
G
 
G
T
 
S
D
 
N
G
 
A
L
 
A
E
 
H
L
 
I
R
 
A
V
 
V
F
 
A
G
 
V
S
 
D
D
 
E
A
 
D
H
 
A
G
 
Q
Q
 
T
A
 
F
V
 
V
L
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
A
L
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
T
S
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
S
L
 
M
R
 
N
L
 
L
M
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7notA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argc in complex with nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADP+) and 5-methoxy-3- indoleacetic acid
31% identity, 87% coverage: 40:312/315 of query aligns to 56:329/344 of 7notA

query
sites
7notA
P
 
P
P
 
L
A
 
A
Q
 
H
R
 
R
K
 
V
D
 
V
P
 
E
D
 
P
A
 
T
K
 
E
R
 
A
A
 
A
L
 
V
L
 
L
A
 
G
E
 
G
V
 
H
D
 
D
L
 
A
V
 
V
V
 
F
L
 
L
C
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
H
D
 
G
A
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
H
T
 
S
V
 
A
A
 
V
M
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
Q
L
 
L
P
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
C
G
 
G
G
 
A
G
 
D
P
 
F
R
 
R
I
 
L
L
 
T
D
 
D
A
 
A
S
 
A
T
 
V
A
 
W
H
 
E
R
 
R
V
 
F
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
H
A
 
A
P
 
G
G
 
S
W
 
W
T
 
P
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
A
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
-
P
 
P
E
 
G
Q
 
A
R
 
R
A
 
D
A
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
G
S
 
T
R
 
R
R
 
R
V
 
I
A
 
A
N
 
V
P
 
P
G
 
G
C
 
C
Y
|
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
L
L
 
A
L
 
L
R
 
F
P
 
P
L
 
A
V
 
L
D
 
A
A
 
A
G
 
D
L
 
L
I
 
I
P
 
-
A
 
-
D
 
E
H
 
P
P
 
A
I
 
V
S
 
T
I
 
V
N
 
V
A
 
A
V
 
V
S
 
S
G
 
G
Y
 
T
S
 
S
G
|
G
G
x
A
G
 
G
R
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
T
K
 
D
M
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
E
E
 
V
D
 
I
G
 
G
T
 
S
A
 
A
P
 
R
A
 
A
F
x
Y
E
 
N
L
 
I
Y
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
-
F
 
-
A
 
-
H
|
H
K
 
R
H
 
H
L
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
I
-
 
A
Q
 
Q
A
 
G
Y
 
L
S
 
R
R
 
A
L
 
V
T
 
T
R
 
D
R
 
R
P
 
D
I
 
V
-
 
S
-
 
V
-
 
S
F
 
F
V
 
T
P
 
P
S
 
V
V
x
L
G
 
I
N
 
P
F
 
A
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
M
 
I
L
 
L
V
 
A
S
 
T
I
 
C
P
 
T
L
 
A
H
 
R
L
 
T
D
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
R
P
 
S
H
 
P
P
 
L
G
 
S
D
 
Q
L
 
L
E
 
R
Q
 
A
A
 
A
L
 
Y
A
 
E
A
 
K
R
 
A
Y
 
Y
A
 
H
G
 
A
E
 
E
E
 
P
L
 
F
V
 
I
R
 
Y
V
 
L
V
 
M
T
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
P
E
 
E
G
 
G
A
 
-
H
 
-
R
 
-
E
 
Q
R
 
L
L
 
P
E
 
R
P
 
T
E
 
G
A
 
A
L
 
V
N
 
I
G
 
G
T
 
S
D
 
N
G
 
A
L
 
A
E
 
H
L
 
I
R
 
A
V
 
V
F
 
A
G
 
V
S
 
D
D
 
E
A
 
D
H
 
A
G
 
Q
Q
 
T
A
 
F
V
 
V
L
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
A
L
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
T
S
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
S
L
 
M
R
 
N
L
 
L
M
 
A
L
 
L

7nnrA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argc in complex with xanthene-9-carboxylic acid
31% identity, 87% coverage: 40:312/315 of query aligns to 56:329/344 of 7nnrA

query
sites
7nnrA
P
 
P
P
 
L
A
 
A
Q
 
H
R
 
R
K
 
V
D
 
V
P
 
E
D
 
P
A
 
T
K
 
E
R
 
A
A
 
A
L
 
V
L
 
L
A
 
G
E
 
G
V
 
H
D
 
D
L
 
A
V
 
V
V
 
F
L
 
L
C
 
A
L
 
L
P
 
P
D
x
H
D
 
G
A
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
H
T
 
S
V
 
A
A
 
V
M
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
Q
L
 
L
P
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
C
G
 
G
G
 
A
G
 
D
P
 
F
R
 
R
I
 
L
L
 
T
D
 
D
A
 
A
S
 
A
T
 
V
A
 
W
H
 
E
R
 
R
V
 
F
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
H
A
 
A
P
 
G
G
 
S
W
 
W
T
 
P
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
A
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
-
P
 
P
E
 
G
Q
 
A
R
 
R
A
 
D
A
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
G
S
 
T
R
 
R
R
 
R
V
 
I
A
 
A
N
 
V
P
 
P
G
 
G
C
 
C
Y
|
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
L
L
 
A
L
 
L
R
 
F
P
 
P
L
 
A
V
 
L
D
 
A
A
 
A
G
 
D
L
 
L
I
 
I
P
 
-
A
 
-
D
 
E
H
 
P
P
 
A
I
 
V
S
 
T
I
 
V
N
 
V
A
 
A
V
 
V
S
|
S
G
 
G
Y
 
T
S
 
S
G
|
G
G
x
A
G
 
G
R
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
T
K
 
D
M
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
E
E
 
V
D
 
I
G
 
G
T
 
S
A
 
A
P
 
R
A
 
A
F
x
Y
E
 
N
L
 
I
Y
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
-
F
 
-
A
 
-
H
|
H
K
 
R
H
 
H
L
 
T
P
 
P
E
 
E
T
 
I
-
 
A
Q
 
Q
A
 
G
Y
 
L
S
 
R
R
 
A
L
 
V
T
 
T
R
 
D
R
 
R
P
 
D
I
 
V
-
 
S
-
 
V
-
 
S
F
 
F
V
 
T
P
 
P
S
 
V
V
x
L
G
 
I
N
 
P
F
 
A
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
M
 
I
L
 
L
V
 
A
S
 
T
I
 
C
P
 
T
L
 
A
H
 
R
L
 
T
D
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
R
P
 
S
H
 
P
P
 
L
G
 
S
D
 
Q
L
 
L
E
 
R
Q
 
A
A
 
A
L
 
Y
A
 
E
A
 
K
R
 
A
Y
 
Y
A
 
H
G
 
A
E
 
E
E
 
P
L
 
F
V
 
I
R
 
Y
V
 
L
V
 
M
T
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
P
E
 
E
G
 
G
A
 
-
H
 
-
R
 
-
E
 
Q
R
 
L
L
 
P
E
 
R
P
 
T
E
 
G
A
 
A
L
 
V
N
 
I
G
 
G
T
 
S
D
 
N
G
 
A
L
 
A
E
 
H
L
 
I
R
 
A
V
 
V
F
 
A
G
 
V
S
 
D
D
 
E
A
 
D
H
 
A
G
 
Q
Q
 
T
A
 
F
V
 
V
L
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
A
L
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
T
S
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
S
L
 
M
R
 
N
L
 
L
M
 
A
L
 
L

2ozpA Crystal structure of n-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase (ttha1904) from thermus thermophilus
27% identity, 67% coverage: 103:312/315 of query aligns to 123:327/342 of 2ozpA

query
sites
2ozpA
F
 
F
A
 
V
E
 
Y
L
 
A
A
 
V
P
 
P
E
 
E
-
 
L
Q
 
Y
R
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
G
S
 
A
R
 
D
R
 
W
V
 
I
A
 
A
N
 
G
P
 
A
G
 
G
C
 
C
Y
 
N
P
 
A
T
 
T
G
 
A
A
 
T
I
 
L
A
 
L
L
 
G
L
 
L
R
 
Y
P
 
P
L
 
L
V
 
L
D
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
P
 
K
A
 
P
D
 
T
H
 
P
P
 
I
I
 
F
S
 
V
I
 
T
N
 
L
A
 
L
V
 
I
S
 
S
G
 
T
Y
 
S
S
 
A
G
 
G
G
 
G
G
x
A
R
 
E
K
 
A
M
 
S
I
 
P
G
 
A
A
 
S
Y
 
H
E
 
H
D
 
P
G
 
E
T
 
R
A
 
A
P
 
G
A
 
S
F
 
I
E
 
R
L
 
V
Y
 
Y
G
 
K
L
 
-
G
 
P
F
 
T
A
 
G
H
 
H
K
 
R
H
 
H
L
 
T
P
 
A
E
 
E
T
 
V
Q
 
-
A
 
-
Y
 
V
S
 
E
R
 
N
L
 
L
T
 
P
R
 
G
R
 
R
P
 
P
-
 
E
I
 
V
F
 
H
V
 
L
P
 
T
S
 
A
V
 
I
G
 
A
N
 
T
F
 
D
R
 
R
-
 
V
Q
 
R
G
 
G
M
 
I
L
 
L
V
 
M
S
 
T
I
 
A
P
 
Q
L
 
C
H
 
F
L
 
V
-
 
Q
D
 
D
A
 
G
L
 
W
P
 
S
G
 
E
R
 
R
P
 
-
H
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
D
L
 
V
E
 
W
Q
 
Q
A
 
A
L
 
Y
A
 
R
A
 
E
R
 
A
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
P
L
 
F
V
 
I
R
 
R
V
 
L
V
 
V
T
 
K
G
 
-
A
 
Q
E
 
K
E
 
K
G
 
G
A
 
V
H
 
H
R
 
R
E
 
Y
R
 
P
L
 
-
E
 
D
P
 
P
E
 
R
A
 
F
L
 
V
N
 
Q
G
 
G
T
 
T
D
 
N
G
 
Y
L
 
A
E
 
D
L
 
I
R
 
G
V
 
F
F
 
E
G
 
L
S
 
E
D
 
E
A
 
D
H
 
T
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
V
 
V
L
 
V
V
 
M
A
 
T
R
 
A
L
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
T
S
 
A
G
 
G
A
 
H
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
A
L
 
L
R
 
N
L
 
V
M
 
R
L
 
M

Sites not aligning to the query:

O50146 [LysW]-L-2-aminoadipate 6-phosphate reductase; EC 1.2.1.103 from Thermus thermophilus (strain ATCC BAA-163 / DSM 7039 / HB27) (see paper)
24% identity, 88% coverage: 35:312/315 of query aligns to 56:329/344 of O50146

query
sites
O50146
T
 
N
L
 
L
R
 
K
S
 
F
L
 
I
P
 
P
P
 
P
A
 
E
Q
 
K
R
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
L
A
 
E
E
 
P
V
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
L
C
 
A
L
|
L
P
 
P
D
 
H
D
 
G
A
 
V
A
 
F
K
 
A
E
 
R
T
 
E
V
 
F
A
 
D
M
 
R
A
 
Y
D
 
S
A
 
A
L
 
L
P
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
A
P
 
P
R
 
I
I
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
L
S
 
S
T
 
A
A
 
D
H
 
F
R
|
R
V
 
L
A
 
K
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
Y
-
 
R
-
 
R
-
 
Y
-
 
Y
-
 
G
-
 
E
-
 
H
-
 
P
-
 
R
P
 
P
G
 
D
W
 
L
T
 
L
Y
 
G
G
 
C
F
 
F
A
 
V
E
 
Y
L
 
A
A
 
V
P
 
P
E
 
E
-
 
L
Q
 
Y
R
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
G
S
 
A
R
 
D
R
 
W
V
 
I
A
 
A
N
 
G
P
 
A
G
 
G
C
|
C
Y
 
N
P
 
A
T
 
T
G
 
A
A
 
T
I
 
L
A
 
L
L
 
G
L
 
L
R
 
Y
P
 
P
L
 
L
V
 
L
D
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
P
 
K
A
 
P
D
 
T
H
 
P
P
 
I
I
 
F
S
 
V
I
 
T
N
 
L
A
 
L
V
 
I
S
 
S
G
 
T
Y
x
S
S
 
A
G
 
A
G
 
G
G
x
A
R
 
E
K
 
A
M
 
S
I
 
P
G
 
A
A
 
S
Y
 
H
E
 
H
D
 
P
G
 
E
T
x
R
A
 
A
P
 
G
A
 
S
F
 
I
E
 
R
L
 
V
Y
 
Y
G
 
K
L
 
-
G
 
P
F
 
T
A
 
G
H
 
H
K
 
R
H
|
H
L
 
T
P
 
A
E
 
E
T
 
V
Q
 
-
A
 
-
Y
 
V
S
 
E
R
 
N
L
 
L
T
 
P
R
 
G
R
 
R
P
 
P
-
 
E
I
 
V
F
 
H
V
 
L
P
 
T
S
 
A
V
 
I
G
 
A
N
 
T
F
 
D
R
 
R
-
 
V
Q
 
R
G
 
G
M
 
I
L
 
L
V
 
M
S
 
T
I
 
A
P
 
Q
L
 
C
H
 
F
L
 
V
-
 
Q
D
 
D
A
 
G
L
 
W
P
 
S
G
 
E
R
 
R
P
 
-
H
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
D
L
 
V
E
 
W
Q
 
Q
A
 
A
L
 
Y
A
x
R
A
 
E
R
 
A
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
P
L
 
F
V
 
I
R
 
R
V
 
L
V
 
V
T
x
K
G
 
-
A
 
Q
E
 
K
E
 
K
G
 
G
A
 
V
H
 
H
R
|
R
E
 
Y
R
 
P
L
 
-
E
 
D
P
 
P
E
 
R
A
 
F
L
 
V
N
 
Q
G
 
G
T
 
T
D
 
N
G
 
Y
L
 
A
E
 
D
L
 
I
R
 
G
V
 
F
F
 
E
G
 
L
S
 
E
D
 
E
A
 
D
H
 
T
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
V
 
V
L
 
V
V
 
M
A
 
T
R
 
A
L
 
I
D
 
D
N
|
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
T
S
 
A
G
 
G
A
 
H
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
A
L
 
L
R
 
N
L
 
V
M
 
R
L
 
M

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012334742.1 NCBI__GCF_000019365.1:WP_012334742.1
MSRTATNRPSVFIDGEAGTTGLGIRERLEPSHEITLRSLPPAQRKDPDAKRALLAEVDLV
VLCLPDDAAKETVAMADALPGGGPRILDASTAHRVAPGWTYGFAELAPEQRAALRASRRV
ANPGCYPTGAIALLRPLVDAGLIPADHPISINAVSGYSGGGRKMIGAYEDGTAPAFELYG
LGFAHKHLPETQAYSRLTRRPIFVPSVGNFRQGMLVSIPLHLDALPGRPHPGDLEQALAA
RYAGEELVRVVTGAEEGAHRERLEPEALNGTDGLELRVFGSDAHGQAVLVARLDNLGKGA
SGAAVQNLRLMLDLA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory