SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012335778.1 NCBI__GCF_000019365.1:WP_012335778.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

4xfjB Crystal structure of argininosuccinate synthase from mycobacterium thermoresistibile in complex with amppnp and arginine
29% identity, 82% coverage: 31:373/417 of query aligns to 4:338/397 of 4xfjB

query
sites
4xfjB
V
 
V
V
 
I
T
 
L
M
x
A
F
x
Y
S
|
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
|
D
S
x
T
S
 
S
Y
 
V
L
 
A
L
 
I
H
 
S
R
 
W
L
 
I
R
 
G
G
 
K
L
 
E
G
 
T
F
 
G
A
 
R
H
 
E
V
 
V
H
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
V
x
I
D
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
G
L
 
G
D
 
E
-
 
D
-
 
M
E
 
E
P
 
V
A
 
V
L
 
R
R
 
Q
R
 
R
A
 
A
A
 
L
S
 
D
L
 
C
F
 
G
G
 
A
A
 
V
E
 
E
F
 
S
V
 
I
R
 
V
L
 
I
D
 
D
G
 
A
R
 
R
G
 
D
H
 
E
F
 
F
V
 
A
E
 
N
G
 
D
H
 
Y
V
 
C
R
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
R
 
Q
A
 
S
H
 
N
A
 
A
K
 
L
Y
 
Y
L
 
M
G
 
D
I
 
R
Y
|
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
V
S
|
S
S
 
A
L
 
L
S
 
S
R
|
R
P
 
P
A
 
L
I
 
I
A
 
V
E
 
K
L
 
H
V
 
L
A
 
V
R
 
K
Y
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
E
V
 
H
G
 
G
A
 
G
D
 
T
L
 
I
I
 
V
L
 
A
H
 
H
T
x
G
A
x
C
N
 
T
L
 
G
S
 
K
Q
 
G
N
 
N
S
x
D
L
 
Q
P
 
V
R
|
R
L
x
F
N
 
E
N
 
V
S
 
G
L
 
F
A
 
A
R
 
S
L
 
L
G
 
A
F
 
P
P
 
D
G
 
L
Q
 
E
Y
 
V
G
 
L
S
 
A
P
 
P
Y
 
V
E
 
R
Q
 
D
S
 
Y
A
 
A
I
 
W
S
 
T
R
 
R
Q
 
-
Q
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
I
E
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
E
G
 
N
-
 
N
-
 
I
-
 
P
L
 
I
G
 
N
A
 
V
M
 
T
A
 
K
E
 
R
R
 
S
A
 
P
L
 
F
S
|
S
G
 
I
D
 
D
E
 
Q
N
 
N
L
 
V
W
 
W
C
 
G
R
 
R
E
x
A
F
 
V
E
|
E
S
 
T
G
 
G
P
 
F
L
 
L
D
 
E
D
 
H
P
 
L
E
 
-
D
 
-
F
 
W
R
 
N
I
 
A
P
 
P
E
 
T
E
 
K
A
 
D
F
 
V
H
 
Y
W
 
S
T
 
Y
R
 
T
G
 
E
R
 
D
P
 
P
A
 
T
P
 
V
G
 
N
E
 
W
G
 
S
A
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
E
I
 
V
A
 
I
L
 
V
T
 
G
F
 
F
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
D
 
V
L
 
P
V
 
V
A
 
S
L
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
R
P
 
S
I
 
V
A
 
T
L
 
P
I
 
L
D
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
E
E
 
E
L
 
L
N
 
N
Q
 
R
R
 
R
V
 
G
G
 
G
R
 
E
F
 
Q
G
 
G
H
 
V
G
 
G
R
 
R
Y
 
L
V
 
D
G
 
V
L
 
V
E
|
E
H
 
D
L
 
R
S
 
L
G
 
V
G
 
G
E
 
I
K
 
K
V
 
S
L
 
R
E
|
E
V
 
I
R
x
Y
E
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
A
A
 
M
I
 
V
L
 
L
M
 
I
D
 
T
A
 
A
L
 
H
R
 
T
H
 
E
L
 
L
E
 
E
T
 
H
A
 
V
C
 
T
V
 
L
E
 
E
T
 
R
R
 
E
A
 
L
I
 
G
V
 
R
V
 
F
K
 
K
Q
 
R
R
 
I
L
 
T
E
 
D
Q
 
Q
D
 
K
W
 
W
V
 
G
Q
 
E
E
 
L
A
 
V
V
 
Y
S
 
D
G
 
G
R
 
L
W
 
W
G
 
F
S
 
S
T
 
P
L
 
L
H
 
K
A
 
T
M
 
A
C
 
L
G
 
E
E
 
S
A
 
F
I
 
V
R
 
A
Q
 
K
A
 
T
L
 
Q
A
 
E
C
 
H
V
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
E
V
 
I

7k5zA Crystal structure of argininosuccinate synthase from legionella pneumophila philadelphia 1 in complex with anppnp and a substrate analogue arginine
28% identity, 84% coverage: 35:384/417 of query aligns to 10:351/390 of 7k5zA

query
sites
7k5zA
F
x
Y
S
|
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
|
D
S
 
T
S
 
S
Y
 
I
L
 
M
L
 
I
H
 
P
R
 
W
L
 
L
R
 
K
-
 
E
G
 
H
L
 
Y
G
 
E
F
 
H
A
 
A
H
 
E
V
 
V
H
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
I
V
x
C
D
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
Q
L
 
E
D
 
D
E
 
L
P
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
K
R
 
N
A
 
K
A
 
A
S
 
L
L
 
K
F
 
S
G
 
G
A
 
A
-
 
S
E
 
K
F
 
A
V
 
Y
R
 
V
L
 
V
D
 
D
G
 
V
R
 
K
G
 
N
H
 
E
F
 
F
V
 
A
E
 
T
G
 
Q
H
 
Y
V
 
L
R
 
W
P
 
P
A
 
L
I
 
V
R
 
K
A
 
S
H
 
G
A
 
A
K
 
L
Y
 
Y
L
 
E
G
 
D
I
 
Q
Y
|
Y
P
 
I
L
 
L
S
 
G
S
x
T
S
 
-
L
 
I
S
 
S
R
|
R
P
 
P
A
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
Q
L
 
K
V
 
L
A
 
V
R
 
E
Y
 
I
A
 
A
R
 
L
R
 
T
V
 
E
G
 
Q
A
 
V
D
 
N
L
 
A
I
 
V
L
 
A
H
 
H
T
x
G
A
 
A
N
 
T
L
 
G
S
 
K
Q
 
G
N
 
N
S
x
D
L
 
Q
P
 
V
R
|
R
L
x
F
N
 
E
N
 
Y
S
 
S
L
 
I
A
 
K
R
 
A
L
 
L
G
 
A
F
 
P
P
 
Q
G
 
L
Q
 
E
Y
 
I
G
 
I
S
 
A
P
 
P
Y
 
W
E
 
R
Q
 
T
S
 
W
A
 
D
I
 
I
S
 
K
R
 
S
Q
 
R
Q
 
Q
K
 
E
A
 
A
A
 
I
E
 
V
L
 
Y
A
 
A
E
 
K
A
 
A
G
 
H
-
 
G
-
 
I
-
 
E
L
 
V
G
 
P
A
 
V
M
 
T
A
 
P
E
 
K
R
 
A
A
 
P
L
 
Y
S
|
S
G
 
R
D
 
D
E
 
H
N
 
N
L
 
I
W
 
W
C
 
Y
R
 
I
E
x
S
F
 
H
E
|
E
S
 
G
G
 
G
P
 
V
L
 
L
D
 
E
D
 
D
P
 
P
E
 
S
D
 
Q
F
 
-
R
 
E
I
 
M
P
 
P
E
 
N
E
 
D
A
 
V
F
 
L
H
 
L
W
 
M
T
 
T
R
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
S
L
 
Q
A
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
V
I
 
V
A
 
V
L
 
L
T
 
D
F
 
F
E
 
K
R
 
K
G
 
G
D
 
V
L
 
P
V
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
N
G
 
G
R
 
Q
P
 
E
I
 
L
A
 
S
L
 
P
I
 
V
D
 
D
A
 
L
I
 
L
A
 
N
E
 
S
L
 
L
N
 
N
Q
 
Q
R
 
K
V
 
A
G
 
G
R
 
Q
F
 
H
G
 
G
H
 
I
G
 
G
R
 
V
Y
 
A
V
 
D
G
 
I
L
 
V
E
|
E
H
 
N
L
 
R
S
 
L
G
 
V
G
 
G
E
 
M
K
 
K
V
 
I
L
 
R
E
 
G
V
 
I
R
x
Y
E
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
L
 
L
M
 
Y
D
 
K
A
 
A
L
 
H
R
 
K
H
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
S
A
 
L
C
 
C
V
 
L
E
 
T
T
 
R
R
 
S
A
 
T
I
 
L
V
 
H
V
 
L
K
 
K
Q
 
Q
R
 
S
L
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
D
 
T
W
 
Y
V
 
A
Q
 
N
E
 
L
A
 
V
V
 
Y
S
 
E
G
 
G
R
 
R
W
 
W
G
 
F
S
 
S
T
 
Q
L
 
T
H
 
K
A
 
Q
M
 
A
C
 
L
G
 
D
E
 
A
A
 
F
I
 
I
R
 
D
Q
 
V
A
 
T
L
 
Q
A
 
Q
C
 
H
V
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
C
V
 
V
T
 
K
Y
 
L
R
 
K
V
 
L
D
 
F
A
 
K
E
 
G
R
 
N
F
 
I
L
 
I
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P59846 Argininosuccinate synthase; Citrulline--aspartate ligase; EC 6.3.4.5 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see 2 papers)
29% identity, 82% coverage: 31:374/417 of query aligns to 3:334/400 of P59846

query
sites
P59846
V
 
I
V
 
V
T
 
L
M
x
A
F
x
Y
S
|
S
G
|
G
G
|
G
L
|
L
D
|
D
S
x
T
S
|
S
Y
 
I
L
 
I
L
 
L
H
 
K
R
 
W
L
 
L
R
 
K
G
 
E
L
 
T
G
 
Y
F
 
R
A
 
A
H
 
E
V
 
V
H
 
I
A
 
A
V
 
F
A
 
T
V
x
A
D
 
D
V
 
I
G
 
G
A
 
Q
P
 
G
L
 
E
D
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
R
E
 
E
P
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
T
A
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
K
F
 
A
V
 
I
R
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
L
R
 
K
G
 
E
H
 
E
F
 
F
V
 
V
E
 
R
G
 
D
H
 
F
V
 
V
R
 
F
P
 
P
A
 
M
I
 
M
R
 
R
A
 
A
H
 
G
A
 
A
K
 
V
Y
 
Y
L
 
E
G
 
G
I
 
Y
Y
 
Y
P
 
L
L
 
L
S
 
G
S
 
T
S
 
S
L
 
I
S
 
A
R
 
R
P
 
P
A
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
K
L
 
H
V
 
L
A
 
V
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
E
V
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
E
L
 
A
I
 
I
L
 
A
H
 
H
T
x
G
A
 
A
N
 
T
L
 
G
S
 
K
Q
 
G
N
 
N
S
 
D
L
 
Q
P
 
V
R
 
R
L
 
F
N
 
E
N
 
L
S
 
T
L
 
A
A
 
Y
R
 
A
L
 
L
G
 
K
F
 
P
P
 
D
G
 
I
Q
 
K
Y
 
V
G
 
I
S
 
A
P
 
P
Y
 
W
E
 
R
Q
 
E
S
 
W
A
 
S
I
 
F
S
 
Q
R
 
G
Q
 
R
Q
 
K
K
 
E
A
 
M
A
 
I
E
 
A
L
 
Y
A
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
H
-
 
G
-
 
I
-
 
P
L
 
V
G
 
P
A
 
V
M
 
T
A
 
Q
E
 
E
R
 
K
A
 
P
L
 
Y
S
 
S
G
 
M
D
 
D
E
 
A
N
 
N
L
 
L
W
 
L
C
 
H
R
 
I
E
 
S
F
 
Y
E
 
E
S
 
G
G
 
G
P
 
V
L
 
L
D
 
E
D
 
D
P
 
P
E
 
W
D
 
A
F
 
-
R
 
E
I
 
P
P
 
P
E
 
K
E
 
G
A
 
M
F
 
F
H
 
R
W
 
M
T
 
T
R
 
Q
G
 
D
R
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
P
G
 
E
E
 
E
G
 
A
A
 
P
A
 
D
S
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
A
P
 
P
E
 
E
E
 
Y
I
 
V
A
 
E
L
 
V
T
 
E
F
 
F
E
 
F
R
 
E
G
 
G
D
 
D
L
 
P
V
 
V
A
 
A
L
 
V
D
 
N
G
 
G
R
 
E
P
 
R
I
 
L
A
 
S
L
 
P
I
 
A
D
 
A
A
 
L
I
 
L
A
 
Q
E
 
R
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
R
 
I
V
 
G
G
 
G
R
 
R
F
 
H
G
 
G
H
 
V
G
 
G
R
 
R
Y
 
V
V
 
D
G
 
I
L
 
V
E
 
E
H
 
N
L
 
R
S
 
F
G
 
V
G
 
G
E
 
M
K
 
K
V
 
S
L
 
R
E
 
G
V
 
V
R
 
Y
E
 
E
A
 
T
P
 
P
A
 
G
A
 
G
A
 
T
I
 
I
L
 
L
M
 
Y
D
 
H
A
 
A
L
 
R
R
 
R
H
 
A
L
 
V
E
 
E
T
 
S
A
 
L
C
 
T
V
 
L
E
 
D
T
 
R
R
 
E
A
 
V
I
 
L
V
 
H
V
 
Q
K
 
R
Q
 
D
R
 
M
L
 
L
E
 
S
Q
 
P
D
 
K
W
 
Y
V
 
A
Q
 
E
E
 
L
A
 
V
V
 
Y
S
 
Y
G
 
G
R
 
F
W
 
W
G
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
H
 
Y
A
 
A
M
 
P
C
 
E
G
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
Q
Q
 
A
A
 
Y
L
 
F
A
 
D
C
 
H
V
 
V
S
 
A
G
 
R
T
 
S
V
 
V
T
 
T

1kh3A Crystal structure of thermus thermophilus hb8 argininosuccinate synthetase in complex with inhibitor (see paper)
29% identity, 82% coverage: 31:374/417 of query aligns to 3:329/380 of 1kh3A

query
sites
1kh3A
V
 
I
V
 
V
T
 
L
M
x
A
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
|
D
S
x
T
S
 
S
Y
 
I
L
 
I
L
 
L
H
 
K
R
 
W
L
 
L
R
 
K
G
 
E
L
 
T
G
 
Y
F
 
R
A
 
A
H
 
E
V
 
V
H
 
I
A
 
A
V
 
F
A
x
T
V
x
A
D
 
D
V
 
I
G
 
G
A
 
Q
P
 
G
L
 
E
D
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
R
E
 
E
P
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
T
A
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
K
F
 
A
V
 
I
R
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
L
R
 
K
G
 
E
H
 
E
F
 
F
V
 
V
E
 
R
G
 
D
H
 
F
V
 
V
R
 
F
P
 
P
A
 
M
I
 
M
R
 
R
A
 
A
H
 
G
A
 
A
K
 
V
Y
 
Y
L
 
E
G
 
G
I
 
Y
Y
|
Y
P
 
L
L
 
L
S
 
G
S
x
T
S
 
S
L
 
I
S
 
A
R
|
R
P
 
P
A
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
K
L
 
H
V
 
L
A
 
V
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
E
V
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
E
L
 
A
I
 
I
L
 
A
H
|
H
T
x
G
A
|
A
N
x
T
L
 
G
S
 
K
Q
x
G
N
|
N
S
x
D
L
 
Q
P
 
V
R
|
R
L
x
F
N
 
E
N
 
L
S
 
T
L
 
A
A
 
Y
R
 
A
L
 
L
G
 
K
F
 
P
P
 
D
G
 
I
Q
 
K
Y
 
V
G
 
I
S
 
A
P
 
P
Y
 
W
E
 
R
Q
 
E
S
 
W
A
 
S
I
 
F
S
 
Q
R
 
G
Q
 
R
Q
 
K
K
 
E
A
 
M
A
 
I
E
 
A
L
 
Y
A
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
-
L
 
-
G
 
H
A
 
G
M
 
I
A
 
P
E
 
V
R
 
P
A
 
P
L
 
Y
S
|
S
G
x
M
D
|
D
E
 
A
N
 
N
L
 
L
W
 
L
C
 
H
R
 
I
E
x
S
F
 
Y
E
|
E
S
 
G
G
 
G
P
 
V
L
 
L
D
 
E
D
 
D
P
 
P
E
 
W
D
 
A
F
 
-
R
 
E
I
 
P
P
 
P
E
 
K
E
 
G
A
 
M
F
 
F
H
 
R
W
 
M
T
 
T
R
 
Q
G
 
D
R
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
P
G
 
E
E
 
E
G
 
A
A
 
P
A
 
D
S
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
A
P
 
P
E
 
E
E
 
Y
I
 
V
A
 
E
L
 
V
T
 
E
F
 
F
E
 
F
R
 
E
G
 
G
D
 
D
L
 
P
V
 
V
A
 
A
L
 
V
D
 
N
G
 
G
R
 
E
P
 
R
I
 
L
A
 
S
L
 
P
I
 
A
D
 
A
A
 
L
I
 
L
A
 
Q
E
 
R
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
R
 
I
V
 
G
G
 
G
R
 
R
F
 
H
G
 
G
H
 
V
G
 
G
R
 
R
Y
 
V
V
 
D
G
 
I
L
 
V
E
|
E
H
 
N
L
 
R
S
 
F
G
 
V
G
 
G
E
 
M
K
 
K
V
 
S
L
 
R
E
 
G
V
 
V
R
x
Y
E
 
E
A
 
T
P
 
P
A
 
G
A
 
G
A
 
T
I
 
I
L
 
L
M
 
Y
D
 
H
A
 
A
L
 
R
R
 
R
H
 
A
L
 
V
E
 
E
T
 
S
A
 
L
C
 
T
V
 
L
E
 
D
T
 
R
R
 
E
A
 
V
I
 
L
V
 
H
V
 
Q
K
 
R
Q
 
D
R
 
M
L
 
L
E
 
S
Q
 
P
D
 
K
W
 
Y
V
 
A
Q
 
E
E
 
L
A
 
V
V
 
Y
S
 
Y
G
 
G
R
 
F
W
 
W
G
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
H
 
Y
A
 
A
M
 
P
C
 
E
G
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
Q
Q
 
A
A
 
Y
L
 
F
A
 
D
C
 
H
V
 
V
S
 
A
G
 
R
T
 
S
V
 
V
T
 
T

1j20A Crystal structure of thermus thermophilus hb8 argininosuccinate synthetase in complex with product (see paper)
29% identity, 82% coverage: 31:374/417 of query aligns to 3:329/386 of 1j20A

query
sites
1j20A
V
 
I
V
 
V
T
 
L
M
x
A
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
|
D
S
x
T
S
 
S
Y
 
I
L
 
I
L
 
L
H
 
K
R
 
W
L
 
L
R
 
K
G
 
E
L
 
T
G
 
Y
F
 
R
A
 
A
H
 
E
V
 
V
H
 
I
A
 
A
V
 
F
A
 
T
V
x
A
D
 
D
V
 
I
G
 
G
A
 
Q
P
 
G
L
 
E
D
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
R
E
 
E
P
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
T
A
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
K
F
 
A
V
 
I
R
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
L
R
 
K
G
 
E
H
 
E
F
 
F
V
 
V
E
 
R
G
 
D
H
 
F
V
 
V
R
 
F
P
 
P
A
 
M
I
 
M
R
 
R
A
 
A
H
 
G
A
 
A
K
 
V
Y
 
Y
L
 
E
G
 
G
I
 
Y
Y
|
Y
P
 
L
L
 
L
S
 
G
S
x
T
S
 
S
L
 
I
S
 
A
R
|
R
P
 
P
A
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
K
L
 
H
V
 
L
A
 
V
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
E
V
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
E
L
 
A
I
 
I
L
 
A
H
|
H
T
x
G
A
|
A
N
x
T
L
 
G
S
 
K
Q
x
G
N
|
N
S
x
D
L
 
Q
P
 
V
R
|
R
L
x
F
N
 
E
N
 
L
S
 
T
L
 
A
A
 
Y
R
 
A
L
 
L
G
 
K
F
 
P
P
 
D
G
 
I
Q
 
K
Y
 
V
G
 
I
S
 
A
P
 
P
Y
 
W
E
 
R
Q
 
E
S
 
W
A
 
S
I
 
F
S
 
Q
R
 
G
Q
 
R
Q
 
K
K
 
E
A
 
M
A
 
I
E
 
A
L
 
Y
A
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
-
L
 
-
G
 
H
A
 
G
M
 
I
A
 
P
E
 
V
R
 
P
A
 
P
L
 
Y
S
|
S
G
 
M
D
 
D
E
 
A
N
 
N
L
 
L
W
 
L
C
 
H
R
 
I
E
x
S
F
 
Y
E
|
E
S
 
G
G
 
G
P
 
V
L
 
L
D
 
E
D
 
D
P
 
P
E
 
W
D
 
A
F
 
-
R
 
E
I
 
P
P
 
P
E
 
K
E
 
G
A
 
M
F
 
F
H
 
R
W
 
M
T
 
T
R
 
Q
G
 
D
R
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
P
G
 
E
E
 
E
G
 
A
A
 
P
A
 
D
S
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
A
P
 
P
E
 
E
E
 
Y
I
 
V
A
 
E
L
 
V
T
 
E
F
 
F
E
 
F
R
 
E
G
 
G
D
 
D
L
 
P
V
 
V
A
 
A
L
 
V
D
 
N
G
 
G
R
 
E
P
 
R
I
 
L
A
 
S
L
 
P
I
 
A
D
 
A
A
 
L
I
 
L
A
 
Q
E
 
R
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
R
 
I
V
 
G
G
 
G
R
 
R
F
 
H
G
 
G
H
 
V
G
 
G
R
 
R
Y
 
V
V
 
D
G
 
I
L
 
V
E
|
E
H
 
N
L
 
R
S
 
F
G
 
V
G
 
G
E
 
M
K
 
K
V
 
S
L
 
R
E
 
G
V
 
V
R
x
Y
E
 
E
A
 
T
P
 
P
A
 
G
A
 
G
A
 
T
I
 
I
L
 
L
M
 
Y
D
 
H
A
 
A
L
 
R
R
 
R
H
 
A
L
 
V
E
 
E
T
 
S
A
 
L
C
 
T
V
 
L
E
 
D
T
 
R
R
 
E
A
 
V
I
 
L
V
 
H
V
 
Q
K
 
R
Q
 
D
R
 
M
L
 
L
E
 
S
Q
 
P
D
 
K
W
 
Y
V
 
A
Q
 
E
E
 
L
A
 
V
V
 
Y
S
 
Y
G
 
G
R
 
F
W
 
W
G
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
H
 
Y
A
 
A
M
 
P
C
 
E
G
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
Q
Q
 
A
A
 
Y
L
 
F
A
 
D
C
 
H
V
 
V
S
 
A
G
 
R
T
 
S
V
 
V
T
 
T

1j1zA Crystal structure of thermus thermophilus hb8 argininosuccinate synthetase in complex with substrate (see paper)
29% identity, 82% coverage: 31:374/417 of query aligns to 3:329/386 of 1j1zA

query
sites
1j1zA
V
 
I
V
 
V
T
 
L
M
x
A
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
|
D
S
x
T
S
 
S
Y
 
I
L
 
I
L
 
L
H
 
K
R
 
W
L
 
L
R
 
K
G
 
E
L
 
T
G
 
Y
F
 
R
A
 
A
H
 
E
V
 
V
H
 
I
A
 
A
V
 
F
A
 
T
V
x
A
D
 
D
V
 
I
G
 
G
A
 
Q
P
 
G
L
 
E
D
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
R
E
 
E
P
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
T
A
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
K
F
 
A
V
 
I
R
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
L
R
 
K
G
 
E
H
 
E
F
 
F
V
 
V
E
 
R
G
 
D
H
 
F
V
 
V
R
 
F
P
 
P
A
 
M
I
 
M
R
 
R
A
 
A
H
 
G
A
 
A
K
 
V
Y
 
Y
L
 
E
G
 
G
I
 
Y
Y
|
Y
P
 
L
L
 
L
S
 
G
S
x
T
S
 
S
L
 
I
S
 
A
R
|
R
P
 
P
A
 
L
I
|
I
A
 
A
E
 
K
L
 
H
V
 
L
A
 
V
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
E
V
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
E
L
 
A
I
 
I
L
 
A
H
|
H
T
x
G
A
|
A
N
x
T
L
 
G
S
 
K
Q
x
G
N
|
N
S
x
D
L
 
Q
P
 
V
R
|
R
L
x
F
N
 
E
N
 
L
S
 
T
L
 
A
A
 
Y
R
 
A
L
 
L
G
 
K
F
 
P
P
 
D
G
 
I
Q
 
K
Y
 
V
G
 
I
S
 
A
P
 
P
Y
 
W
E
 
R
Q
 
E
S
 
W
A
 
S
I
 
F
S
 
Q
R
 
G
Q
 
R
Q
 
K
K
 
E
A
 
M
A
 
I
E
 
A
L
 
Y
A
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
-
L
 
-
G
 
H
A
 
G
M
 
I
A
 
P
E
 
V
R
 
P
A
 
P
L
 
Y
S
|
S
G
x
M
D
 
D
E
 
A
N
 
N
L
 
L
W
 
L
C
 
H
R
 
I
E
x
S
F
 
Y
E
|
E
S
 
G
G
 
G
P
 
V
L
 
L
D
 
E
D
 
D
P
 
P
E
 
W
D
 
A
F
 
-
R
 
E
I
 
P
P
 
P
E
 
K
E
 
G
A
 
M
F
 
F
H
 
R
W
 
M
T
 
T
R
 
Q
G
 
D
R
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
P
G
 
E
E
 
E
G
 
A
A
 
P
A
 
D
S
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
A
P
 
P
E
 
E
E
 
Y
I
 
V
A
 
E
L
 
V
T
 
E
F
 
F
E
 
F
R
 
E
G
 
G
D
 
D
L
 
P
V
 
V
A
 
A
L
 
V
D
 
N
G
 
G
R
 
E
P
 
R
I
 
L
A
 
S
L
 
P
I
 
A
D
 
A
A
 
L
I
 
L
A
 
Q
E
 
R
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
R
 
I
V
 
G
G
 
G
R
 
R
F
 
H
G
 
G
H
 
V
G
 
G
R
 
R
Y
 
V
V
 
D
G
 
I
L
 
V
E
|
E
H
 
N
L
 
R
S
 
F
G
 
V
G
 
G
E
 
M
K
 
K
V
 
S
L
 
R
E
 
G
V
 
V
R
x
Y
E
 
E
A
 
T
P
 
P
A
 
G
A
 
G
A
 
T
I
 
I
L
 
L
M
 
Y
D
 
H
A
 
A
L
 
R
R
 
R
H
 
A
L
 
V
E
 
E
T
 
S
A
 
L
C
 
T
V
 
L
E
 
D
T
 
R
R
 
E
A
 
V
I
 
L
V
 
H
V
 
Q
K
 
R
Q
 
D
R
 
M
L
 
L
E
 
S
Q
 
P
D
 
K
W
 
Y
V
 
A
Q
 
E
E
 
L
A
 
V
V
 
Y
S
 
Y
G
 
G
R
 
F
W
 
W
G
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
H
 
Y
A
 
A
M
 
P
C
 
E
G
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
Q
Q
 
A
A
 
Y
L
 
F
A
 
D
C
 
H
V
 
V
S
 
A
G
 
R
T
 
S
V
 
V
T
 
T

2nz2A Crystal structure of human argininosuccinate synthase in complex with aspartate and citrulline (see paper)
27% identity, 83% coverage: 31:377/417 of query aligns to 4:349/402 of 2nz2A

query
sites
2nz2A
V
 
V
V
 
V
T
 
L
M
 
A
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
|
D
S
 
T
S
 
S
Y
 
C
L
 
I
L
 
L
H
 
V
R
 
W
L
 
L
R
 
K
G
 
E
L
 
Q
G
 
G
F
 
Y
A
 
-
H
 
D
V
 
V
H
 
I
A
 
A
V
 
Y
A
 
L
V
 
A
D
 
N
V
 
I
G
 
G
A
 
Q
P
 
K
L
 
E
D
 
D
E
 
F
P
 
E
A
 
E
L
 
A
R
 
R
R
 
K
A
 
K
A
 
A
S
 
L
L
 
K
F
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
K
F
 
K
V
 
V
R
 
F
L
 
I
-
 
E
D
 
D
G
 
V
R
 
S
G
 
R
H
 
E
F
 
F
V
 
V
E
 
E
G
 
E
H
 
F
V
 
I
R
 
W
P
 
P
A
 
A
I
 
I
R
 
Q
A
 
S
H
 
S
A
 
A
K
 
L
Y
 
Y
L
 
E
G
 
D
I
 
R
Y
|
Y
P
 
L
L
 
L
S
 
G
S
x
T
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
|
R
P
 
P
A
 
C
I
 
I
A
 
A
E
 
R
L
 
K
V
 
Q
A
 
V
R
 
E
Y
 
I
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
V
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
L
 
Y
I
 
V
L
 
S
H
 
H
T
 
G
A
|
A
N
x
T
L
 
G
S
 
K
Q
x
G
N
|
N
S
x
D
L
 
Q
P
 
V
R
|
R
L
 
F
N
 
E
N
 
L
S
 
S
L
 
C
A
 
Y
R
 
S
L
 
L
G
 
A
F
 
P
P
 
Q
G
 
I
Q
 
K
Y
 
V
G
 
I
S
 
A
P
 
P
Y
 
W
E
 
R
Q
 
M
S
 
P
A
 
E
I
 
F
S
 
Y
R
 
N
Q
 
R
Q
 
F
K
 
K
A
 
R
A
 
N
E
 
D
L
 
L
A
 
M
E
 
E
A
 
Y
G
 
A
-
 
K
-
 
Q
-
 
H
-
 
G
-
 
I
-
 
P
L
 
I
G
 
P
A
 
V
M
 
T
A
 
P
E
 
K
R
 
N
A
 
P
L
 
W
S
|
S
G
 
M
D
|
D
E
 
E
N
 
N
L
 
L
W
 
M
C
 
H
R
 
I
E
x
S
F
 
Y
E
|
E
S
 
A
G
 
G
P
 
I
L
 
L
D
 
E
D
 
N
P
 
P
E
 
K
D
 
N
F
 
Q
R
 
A
I
 
P
P
 
P
E
 
-
E
 
-
A
 
G
F
 
L
H
 
Y
W
 
T
T
 
K
R
 
T
G
 
Q
R
 
D
P
 
P
A
 
A
P
 
K
G
 
A
E
 
P
G
 
N
A
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
I
I
 
L
A
 
E
L
 
I
T
 
E
F
 
F
E
 
K
R
 
K
G
 
G
D
 
V
L
 
P
V
 
V
A
 
K
L
 
V
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
T
P
 
T
I
 
H
A
 
Q
L
 
T
-
 
S
I
 
L
D
 
E
A
 
L
I
 
F
A
 
M
E
 
Y
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
R
 
V
V
 
A
G
 
G
R
 
K
F
 
H
G
 
G
H
 
V
G
 
G
R
 
R
Y
 
I
V
 
D
G
 
I
L
 
V
E
|
E
H
 
N
L
 
R
S
 
F
G
 
I
G
 
G
E
 
M
K
 
K
V
 
S
L
 
R
E
 
G
V
 
I
R
x
Y
E
 
E
A
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
G
A
 
T
I
 
I
L
 
L
M
 
Y
D
 
H
A
 
A
L
 
H
R
 
L
H
 
D
L
 
I
E
 
E
T
 
A
A
 
F
C
 
T
V
 
M
E
 
D
T
 
R
R
 
E
A
 
V
I
 
R
V
 
K
V
 
I
K
 
K
Q
 
Q
R
 
G
L
 
L
E
 
G
Q
 
L
D
 
K
W
 
F
V
 
A
Q
 
E
E
 
L
A
 
V
V
 
Y
S
 
T
G
 
G
R
 
F
W
 
W
G
 
H
S
 
S
T
 
P
L
 
E
H
 
C
A
 
E
M
 
F
C
 
V
G
 
R
E
 
H
A
 
C
I
 
I
R
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
Q
A
 
E
C
 
R
V
 
V
S
 
E
G
 
G
T
 
K
V
 
V
T
 
Q
Y
 
V
R
 
S
V
 
V

P00966 Argininosuccinate synthase; Citrulline--aspartate ligase; EC 6.3.4.5 from Homo sapiens (Human) (see 16 papers)
27% identity, 83% coverage: 31:377/417 of query aligns to 7:353/412 of P00966

query
sites
P00966
V
 
V
V
 
V
T
 
L
M
 
A
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
S
 
T
S
 
S
Y
 
C
L
 
I
L
 
L
H
 
V
R
 
W
L
 
L
R
 
K
G
 
E
L
 
Q
G
 
G
F
 
Y
A
 
-
H
 
D
V
 
V
H
 
I
A
 
A
V
 
Y
A
 
L
V
 
A
D
 
N
V
 
I
G
 
G
A
 
Q
P
 
K
L
 
E
D
 
D
E
 
F
P
 
E
A
 
E
L
 
A
R
 
R
R
 
K
A
 
K
A
 
A
S
 
L
L
 
K
F
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
K
F
 
K
V
 
V
R
 
F
L
 
I
-
 
E
D
 
D
G
x
V
R
 
S
G
 
R
H
 
E
F
 
F
V
 
V
E
 
E
G
 
E
H
 
F
V
 
I
R
 
W
P
 
P
A
 
A
I
 
I
R
 
Q
A
 
S
H
 
S
A
 
A
K
 
L
Y
 
Y
L
 
E
G
 
D
I
 
R
Y
|
Y
P
 
L
L
 
L
S
 
G
S
x
T
S
|
S
L
 
L
S
 
A
R
|
R
P
|
P
A
 
C
I
 
I
A
 
A
E
 
R
L
 
K
V
 
Q
A
 
V
R
 
E
Y
 
I
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
V
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
L
 
Y
I
 
V
L
 
S
H
 
H
T
x
G
A
|
A
N
x
T
L
 
G
S
 
K
Q
 
G
N
|
N
S
x
D
L
 
Q
P
 
V
R
|
R
L
 
F
N
 
E
N
 
L
S
 
S
L
 
C
A
 
Y
R
 
S
L
 
L
G
 
A
F
 
P
P
 
Q
G
 
I
Q
 
K
Y
 
V
G
 
I
S
 
A
P
 
P
Y
 
W
E
 
R
Q
 
M
S
 
P
A
 
E
I
 
F
S
 
Y
R
 
N
Q
 
R
Q
 
F
K
 
K
A
 
G
-
x
R
A
 
N
E
 
D
L
 
L
A
 
M
E
 
E
A
 
Y
G
 
A
-
x
K
-
 
Q
-
 
H
-
 
G
-
 
I
-
 
P
L
 
I
G
 
P
A
 
V
M
 
T
A
 
P
E
x
K
R
 
N
A
 
P
L
x
W
S
|
S
G
 
M
D
 
D
E
 
E
N
 
N
L
 
L
W
 
M
C
 
H
R
 
I
E
x
S
F
 
Y
E
|
E
S
x
A
G
 
G
P
 
I
L
 
L
D
 
E
D
 
N
P
 
P
E
 
K
D
 
N
F
 
Q
R
 
A
I
 
P
P
 
P
E
 
-
E
 
-
A
 
G
F
 
L
H
 
Y
W
 
T
T
 
K
R
 
T
G
 
Q
R
 
D
P
 
P
A
 
A
P
 
K
G
 
A
E
 
P
G
 
N
A
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
I
I
 
L
A
 
E
L
 
I
T
 
E
F
 
F
E
 
K
R
 
K
G
 
G
D
 
V
L
 
P
V
 
V
A
 
K
L
 
V
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
T
P
 
T
I
 
H
A
 
Q
L
 
T
-
 
S
I
 
L
D
 
E
A
 
L
I
 
F
A
 
M
E
 
Y
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
R
 
V
V
 
A
G
 
G
R
 
K
F
 
H
G
 
G
H
x
V
G
 
G
R
|
R
Y
 
I
V
 
D
G
 
I
L
 
V
E
|
E
H
 
N
L
x
R
S
 
F
G
 
I
G
 
G
E
 
M
K
 
K
V
 
S
L
 
R
E
x
G
V
 
I
R
x
Y
E
 
E
A
x
T
P
 
P
A
 
A
A
 
G
A
 
T
I
 
I
L
 
L
M
 
Y
D
 
H
A
 
A
L
 
H
R
 
L
H
 
D
L
 
I
E
 
E
T
 
A
A
 
F
C
 
T
V
x
M
E
 
D
T
x
R
R
 
E
A
 
V
I
 
R
V
 
K
V
 
I
K
 
K
Q
 
Q
R
 
G
L
 
L
E
 
G
Q
 
L
D
 
K
W
 
F
V
 
A
Q
 
E
E
 
L
A
 
V
V
 
Y
S
 
T
G
|
G
R
 
F
W
 
W
G
 
H
S
 
S
T
 
P
L
 
E
H
 
C
A
 
E
M
 
F
C
 
V
G
 
R
E
 
H
A
 
C
I
 
I
R
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
Q
A
 
E
C
 
R
V
 
V
S
 
E
G
|
G
T
 
K
V
 
V
T
 
Q
Y
 
V
R
 
S
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5us8A 2.15 angstrom resolution crystal structure of argininosuccinate synthase from bordetella pertussis
26% identity, 82% coverage: 35:374/417 of query aligns to 21:364/445 of 5us8A

query
sites
5us8A
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
|
D
S
 
T
S
 
S
Y
 
A
L
 
A
L
 
L
H
 
L
R
 
W
L
 
M
R
 
R
G
 
Q
L
 
K
G
 
G
F
 
-
A
 
A
H
 
V
V
 
P
H
 
Y
A
 
A
V
 
Y
A
 
T
V
 
A
D
 
N
V
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
-
D
 
D
E
 
E
P
 
P
-
 
D
-
 
Y
-
 
D
A
 
E
L
 
I
R
 
P
R
 
R
A
 
R
A
 
A
S
 
M
L
 
Q
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
E
F
 
A
V
 
A
R
 
R
L
 
L
-
 
V
D
 
D
G
 
C
R
 
R
G
 
A
H
 
Q
F
 
L
V
 
V
E
 
A
G
 
E
H
 
G
V
 
I
R
 
-
P
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
Q
A
 
A
H
 
G
A
 
A
K
 
F
Y
 
H
L
 
I
G
 
S
I
 
T
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
T
Y
 
Y
P
 
F
L
 
N
S
 
T
S
 
T
S
 
P
L
 
I
S
 
G
R
|
R
P
 
A
A
 
V
I
 
T
A
 
G
E
 
T
L
 
M
V
 
L
A
 
V
R
 
A
Y
 
A
A
 
M
R
 
K
R
 
E
V
 
D
G
 
G
A
 
V
D
 
N
L
 
I
I
 
W
L
 
G
H
 
D
T
 
G
A
 
S
N
 
T
L
 
F
S
 
K
Q
 
G
N
 
N
S
x
D
L
 
I
P
 
E
R
 
R
-
 
F
-
 
Y
-
 
R
-
 
Y
-
 
G
-
 
L
L
 
L
N
 
T
N
 
N
S
 
P
L
 
D
A
 
L
R
 
K
L
 
I
G
 
-
F
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
Y
 
Y
G
 
K
S
 
P
P
 
W
Y
 
L
E
 
D
Q
 
Q
S
 
T
A
 
F
I
 
I
S
 
D
R
 
E
Q
 
L
Q
 
G
K
 
G
A
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
M
A
 
S
E
 
E
-
 
Y
-
 
M
-
 
R
-
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
F
G
 
D
-
 
Y
-
 
K
A
 
M
M
 
S
A
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
A
L
 
Y
S
|
S
G
 
T
D
 
D
E
 
S
N
 
N
L
 
M
W
 
L
C
 
-
R
 
-
E
 
-
F
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
G
P
 
A
L
 
T
D
 
H
D
 
E
P
 
A
E
 
K
D
 
D
F
 
L
R
 
E
I
 
L
P
 
L
E
 
S
E
 
A
A
 
G
F
 
I
H
 
R
W
 
I
T
 
V
R
 
Q
G
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
P
G
 
I
E
 
M
G
 
G
A
 
V
A
 
A
S
 
F
G
 
W
A
 
Q
G
 
D
P
 
S
V
 
V
A
 
Q
L
 
I
A
 
K
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
T
L
 
V
T
 
R
F
 
F
E
 
E
R
 
E
G
 
G
D
 
Q
L
 
P
V
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
N
G
 
G
R
 
V
P
 
E
I
 
Y
A
 
A
L
 
D
-
 
P
I
 
V
D
 
E
A
 
L
I
 
L
A
 
L
E
 
E
L
 
A
N
 
N
Q
 
R
R
 
I
V
 
G
G
 
G
R
 
R
F
 
H
G
 
G
H
 
L
G
 
G
R
 
M
Y
 
S
V
 
D
G
 
Q
L
 
I
E
 
E
H
 
N
L
 
R
S
 
I
G
 
I
G
 
E
E
 
A
K
 
K
V
 
S
L
 
R
E
 
G
V
 
I
R
 
Y
E
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
L
L
 
L
M
 
F
D
 
I
A
 
A
L
 
Y
R
 
E
H
 
R
L
 
L
E
 
V
T
 
T
A
 
G
C
 
I
V
 
H
E
 
N
T
 
E
R
 
D
A
 
T
I
 
I
V
x
E
V
 
Q
K
 
Y
Q
x
R
R
x
E
L
 
N
E
 
G
Q
x
R
D
x
K
W
 
L
V
 
G
Q
 
R
E
 
L
A
 
L
V
 
Y
S
 
Q
G
 
G
R
 
R
W
 
W
G
 
F
S
 
D
T
 
P
L
 
Q
H
 
A
A
 
I
M
 
M
C
 
L
G
 
R
E
 
E
A
 
T
I
 
A
R
 
Q
Q
 
R
A
 
W
L
 
V
A
 
A
-
 
R
C
 
A
V
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
E
V
 
V
T
 
T

6e5yA 1.50 angstrom resolution crystal structure of argininosuccinate synthase from bordetella pertussis in complex with amp.
26% identity, 82% coverage: 35:374/417 of query aligns to 17:360/438 of 6e5yA

query
sites
6e5yA
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
|
D
S
 
T
S
 
S
Y
 
A
L
 
A
L
 
L
H
 
L
R
 
W
L
 
M
R
 
R
G
 
Q
L
 
K
G
 
G
F
 
-
A
 
A
H
 
V
V
 
P
H
 
Y
A
 
A
V
 
Y
A
x
T
V
x
A
D
 
N
V
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
-
D
 
D
E
 
E
P
 
P
-
 
D
-
 
Y
-
 
D
A
 
E
L
 
I
R
 
P
R
 
R
A
 
R
A
 
A
S
 
M
L
 
Q
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
E
F
 
A
V
 
A
R
 
R
L
 
L
-
 
V
D
 
D
G
 
C
R
 
R
G
 
A
H
 
Q
F
 
L
V
 
V
E
 
A
G
 
E
H
 
G
V
 
I
R
 
-
P
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
Q
A
 
A
H
 
G
A
 
A
K
 
F
Y
 
H
L
 
I
G
 
S
I
 
T
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
T
Y
 
Y
P
 
F
L
 
N
S
 
T
S
 
T
S
 
P
L
 
I
S
 
G
R
|
R
P
 
A
A
 
V
I
 
T
A
 
G
E
 
T
L
 
M
V
 
L
A
 
V
R
 
A
Y
 
A
A
 
M
R
 
K
R
 
E
V
 
D
G
 
G
A
 
V
D
 
N
L
 
I
I
 
W
L
 
G
H
 
D
T
 
G
A
 
S
N
 
T
L
 
F
S
 
K
Q
 
G
N
 
N
S
x
D
L
 
I
P
 
E
R
 
R
-
 
F
-
 
Y
-
 
R
-
 
Y
-
 
G
-
 
L
L
 
L
N
 
T
N
 
N
S
 
P
L
 
D
A
 
L
R
 
K
L
 
I
G
 
-
F
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
Y
 
Y
G
 
K
S
 
P
P
 
W
Y
 
L
E
 
D
Q
 
Q
S
 
T
A
 
F
I
 
I
S
 
D
R
 
E
Q
 
L
Q
 
G
K
 
G
A
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
M
A
 
S
E
 
E
-
 
Y
-
 
M
-
 
R
-
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
F
G
 
D
-
 
Y
-
 
K
A
 
M
M
 
S
A
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
A
L
 
Y
S
|
S
G
 
T
D
|
D
E
 
S
N
 
N
L
 
M
W
 
L
C
 
-
R
 
-
E
 
-
F
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
G
P
 
A
L
 
T
D
 
H
D
 
E
P
 
A
E
 
K
D
 
D
F
 
L
R
 
E
I
 
L
P
 
L
E
 
S
E
 
A
A
 
G
F
 
I
H
 
R
W
 
I
T
 
V
R
 
Q
G
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
P
G
 
I
E
 
M
G
 
G
A
 
V
A
 
A
S
 
F
G
 
W
A
 
Q
G
 
D
P
 
S
V
 
V
A
 
Q
L
 
I
A
 
K
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
T
L
 
V
T
 
R
F
 
F
E
 
E
R
 
E
G
 
G
D
 
Q
L
 
P
V
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
N
G
 
G
R
 
V
P
 
E
I
 
Y
A
 
A
L
 
D
-
 
P
I
 
V
D
 
E
A
 
L
I
 
L
A
 
L
E
 
E
L
 
A
N
 
N
Q
 
R
R
 
I
V
 
G
G
 
G
R
 
R
F
 
H
G
 
G
H
 
L
G
 
G
R
 
M
Y
 
S
V
 
D
G
 
Q
L
 
I
E
 
E
H
 
N
L
 
R
S
 
I
G
 
I
G
 
E
E
 
A
K
 
K
V
 
S
L
 
R
E
 
G
V
 
I
R
 
Y
E
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
L
L
 
L
M
 
F
D
 
I
A
 
A
L
 
Y
R
 
E
H
 
R
L
 
L
E
 
V
T
 
T
A
 
G
C
 
I
V
 
H
E
 
N
T
 
E
R
 
D
A
 
T
I
 
I
V
 
E
V
 
Q
K
 
Y
Q
 
R
R
 
E
L
 
N
E
 
G
Q
 
R
D
 
K
W
 
L
V
 
G
Q
 
R
E
 
L
A
 
L
V
 
Y
S
 
Q
G
 
G
R
 
R
W
 
W
G
 
F
S
 
D
T
 
P
L
 
Q
H
 
A
A
 
I
M
 
M
C
 
L
G
 
R
E
 
E
A
 
T
I
 
A
R
 
Q
Q
 
R
A
 
W
L
 
V
A
 
A
-
 
R
C
 
A
V
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
E
V
 
V
T
 
T

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012335778.1 NCBI__GCF_000019365.1:WP_012335778.1
MNFISPLARSSVRVIRSFDHLTGGPTRTAPVVTMFSGGLDSSYLLHRLRGLGFAHVHAVA
VDVGAPLDEPALRRAASLFGAEFVRLDGRGHFVEGHVRPAIRAHAKYLGIYPLSSSLSRP
AIAELVARYARRVGADLILHTANLSQNSLPRLNNSLARLGFPGQYGSPYEQSAISRQQKA
AELAEAGLGAMAERALSGDENLWCREFESGPLDDPEDFRIPEEAFHWTRGRPAPGEGAAS
GAGPVALAPEEIALTFERGDLVALDGRPIALIDAIAELNQRVGRFGHGRYVGLEHLSGGE
KVLEVREAPAAAILMDALRHLETACVETRAIVVKQRLEQDWVQEAVSGRWGSTLHAMCGE
AIRQALACVSGTVTYRVDAERFLPRAIVADAPLYIRDRDLWESREAGRACLGIPRAA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory