SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012399876.1 NCBI__GCF_000020045.1:WP_012399876.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P0A799 Phosphoglycerate kinase; EC 2.7.2.3 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
63% identity, 99% coverage: 3:397/397 of query aligns to 2:385/387 of P0A799

query
sites
P0A799
N
 
S
V
 
V
L
 
I
R
 
K
L
 
M
S
 
T
D
 
D
L
 
L
I
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
D
L
 
L
S
 
A
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
F
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
A
D
 
D
L
 
L
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Q
 
V
D
 
K
D
 
D
A
 
-
G
 
G
N
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
S
D
 
D
T
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
S
 
S
V
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
I
K
 
E
S
 
L
A
 
A
L
 
L
D
 
K
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
M
 
M
V
 
V
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
T
E
 
E
G
 
G
D
 
E
F
 
Y
K
 
N
P
 
E
E
 
E
D
 
F
S
 
S
L
 
L
A
 
L
P
 
P
V
 
V
A
 
V
K
 
N
R
 
Y
L
 
L
A
 
K
E
 
D
L
x
K
L
 
L
G
 
S
R
 
N
D
 
P
V
 
V
P
 
R
L
 
L
V
 
V
Q
 
K
N
 
D
W
 
Y
V
 
L
E
 
-
N
 
D
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
V
A
 
A
P
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
V
 
V
L
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
V
R
 
R
V
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
K
 
K
K
 
K
D
 
D
S
 
D
D
 
E
E
 
T
L
 
L
A
 
S
Q
 
K
K
 
K
M
 
Y
A
 
A
K
 
A
L
 
L
C
 
C
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
V
 
V
N
 
M
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
T
 
S
T
 
T
H
 
H
G
 
G
I
 
I
A
 
G
K
 
K
Y
 
F
A
 
A
S
 
D
V
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
E
P
 
P
K
 
A
R
 
R
P
 
P
L
 
M
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
G
G
 
G
S
 
S
K
 
K
V
 
V
S
 
S
T
 
T
K
 
K
L
 
L
T
 
T
I
 
V
L
 
L
K
 
D
S
 
S
L
 
L
A
 
S
D
 
K
K
 
I
V
 
A
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
N
 
N
T
 
T
F
 
F
M
 
I
L
 
A
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
L
 
H
K
 
D
I
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
L
V
 
Y
E
 
E
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
K
 
K
A
 
R
I
 
L
I
 
L
E
 
T
A
 
T
A
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
C
S
 
N
V
 
I
P
 
P
I
 
V
P
 
P
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
R
T
 
V
A
 
A
K
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
A
 
E
T
 
T
A
 
A
Q
 
P
A
 
A
T
 
T
V
 
L
K
 
K
Q
 
S
V
 
V
A
 
N
D
 
D
I
 
V
E
 
K
D
 
A
D
 
D
D
 
E
M
 
Q
I
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
D
E
 
A
T
 
S
A
 
A
K
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
E
Q
 
I
L
 
L
E
 
K
K
 
N
A
 
A
G
 
K
T
 
T
V
 
I
V
 
L
W
 
W
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
E
F
 
F
D
 
P
Q
 
N
F
 
F
G
 
R
N
 
K
G
 
G
T
 
T
K
 
E
T
 
I
L
 
V
A
 
A
E
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
D
S
 
S
S
 
E
A
 
A
Y
 
F
S
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
D
K
 
L
Y
 
F
G
 
G
I
 
I
H
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
I
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
F
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
V
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
M
L
 
L
E
 
E
S
 
E
R
 
R
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1zmrA Crystal structure of the e. Coli phosphoglycerate kinase (see paper)
63% identity, 99% coverage: 3:397/397 of query aligns to 1:384/386 of 1zmrA

query
sites
1zmrA
N
 
S
V
 
V
L
 
I
R
 
K
L
 
M
S
 
T
D
 
D
L
 
L
I
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
D
L
 
L
S
 
A
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
F
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
A
D
 
D
L
 
L
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Q
 
V
D
 
K
D
 
D
A
 
-
G
 
G
N
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
S
D
 
D
T
 
A
R
|
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
S
 
S
V
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
I
K
 
E
S
 
L
A
 
A
L
 
L
D
 
K
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
M
 
M
V
 
V
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
T
E
 
E
G
 
G
D
 
E
F
 
Y
K
 
N
P
 
E
E
 
E
D
 
F
S
 
S
L
 
L
A
 
L
P
 
P
V
 
V
A
 
V
K
 
N
R
 
Y
L
 
L
A
x
K
E
 
D
L
 
K
L
|
L
G
 
S
R
 
N
D
 
P
V
 
V
P
 
R
L
 
L
V
 
V
Q
 
K
N
 
D
W
 
Y
V
 
L
E
 
-
N
 
D
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
V
A
 
A
P
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
V
 
V
L
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
V
R
 
R
V
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
K
 
K
K
 
K
D
 
D
S
 
D
D
 
E
E
 
T
L
 
L
A
 
S
Q
 
K
K
 
K
M
 
Y
A
 
A
K
 
A
L
 
L
C
 
C
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
V
 
V
N
 
M
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
T
 
S
T
 
T
H
 
H
G
 
G
I
 
I
A
 
G
K
 
K
Y
 
F
A
 
A
S
 
D
V
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
E
P
 
P
K
 
A
R
 
R
P
 
P
L
 
M
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
G
G
 
G
S
 
S
K
|
K
V
 
V
S
 
S
T
 
T
K
 
K
L
 
L
T
 
T
I
 
V
L
 
L
K
 
D
S
 
S
L
 
L
A
 
S
D
 
K
K
 
I
V
 
A
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
N
 
N
T
 
T
F
 
F
M
 
I
L
 
A
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
L
 
H
K
 
D
I
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
L
V
 
Y
E
 
E
A
 
A
D
|
D
L
 
L
V
 
V
D
|
D
E
 
E
A
 
A
K
 
K
A
 
R
I
 
L
I
 
L
E
 
T
A
 
T
A
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
C
S
 
N
V
 
I
P
 
P
I
 
V
P
 
P
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
R
T
 
V
A
 
A
K
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
A
 
E
T
 
T
A
 
A
Q
 
P
A
 
A
T
 
T
V
 
L
K
 
K
Q
 
S
V
 
V
A
 
N
D
 
D
I
 
V
E
 
K
D
 
A
D
 
D
D
 
E
M
 
Q
I
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
D
E
 
A
T
 
S
A
 
A
K
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
E
Q
 
I
L
 
L
E
 
K
K
 
N
A
 
A
G
 
K
T
 
T
V
 
I
V
 
L
W
 
W
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
E
F
 
F
D
 
P
Q
 
N
F
 
F
G
 
R
N
 
K
G
 
G
T
 
T
K
 
E
T
 
I
L
 
V
A
 
A
E
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
D
S
 
S
S
 
E
A
 
A
Y
 
F
S
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
|
G
D
 
D
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
D
K
 
L
Y
 
F
G
 
G
I
 
I
H
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
I
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
|
G
A
 
A
F
 
F
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
V
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
M
L
 
L
E
 
E
S
 
E
R
 
R
A
 
A

4feyA An x-ray structure of a putative phosphogylcerate kinase with bound adp from francisella tularensis subsp. Tularensis schu s4
58% identity, 96% coverage: 16:397/397 of query aligns to 11:390/392 of 4feyA

query
sites
4feyA
L
 
L
S
 
K
G
 
D
K
 
K
R
 
K
V
 
V
F
 
L
I
 
V
R
 
R
A
 
V
D
 
D
L
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Q
 
V
D
 
K
D
 
D
A
 
-
G
 
G
N
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
S
D
 
K
T
 
V
R
|
R
I
 
I
R
 
E
A
 
A
S
 
A
V
 
I
P
 
P
A
 
T
I
 
I
K
 
Q
S
 
Y
A
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
G
A
 
A
V
 
V
M
 
I
V
 
L
T
 
M
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
T
E
 
E
G
 
G
D
 
E
F
 
Y
K
 
D
P
 
S
E
 
Q
D
 
F
S
 
S
L
 
L
A
 
E
P
 
P
V
 
V
A
 
A
K
 
K
R
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
E
L
 
I
L
 
I
G
 
N
R
 
K
D
 
P
V
 
V
P
 
K
L
 
F
V
 
A
Q
 
K
N
 
D
W
 
W
V
 
L
E
 
-
N
 
D
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
V
A
 
K
P
 
A
G
 
G
Q
 
E
V
 
I
V
 
V
L
 
M
L
 
C
E
 
E
N
 
N
C
 
V
R
 
R
V
 
F
N
 
N
K
 
S
G
 
G
E
 
E
K
 
K
K
 
K
D
 
S
S
 
T
D
 
D
E
 
D
L
 
L
A
 
S
Q
 
K
K
 
K
M
 
I
A
 
A
K
 
S
L
 
L
C
 
G
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
V
 
V
N
 
M
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
A
T
 
T
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
T
 
S
T
 
T
H
 
Y
G
 
G
I
 
V
A
 
A
K
 
K
Y
 
Y
A
 
I
S
 
P
V
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
G
 
G
P
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
T
A
 
N
E
 
E
L
 
I
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
S
P
 
P
K
 
K
R
 
K
P
 
P
L
 
M
V
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
G
G
|
G
S
|
S
K
|
K
V
 
V
S
 
S
T
 
T
K
|
K
L
 
L
T
 
S
I
 
V
L
 
L
K
 
N
S
 
N
L
 
L
A
 
L
D
 
D
K
 
K
V
 
V
D
 
E
Q
 
I
L
 
L
I
 
I
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
N
 
N
T
 
T
F
 
F
M
 
I
L
 
K
A
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
F
K
 
D
I
 
V
G
 
G
K
 
N
S
 
S
L
 
L
V
 
Y
E
 
E
A
 
Q
D
 
D
L
 
L
V
 
V
D
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
T
A
 
E
I
 
I
I
 
L
E
 
A
A
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
A
R
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
N
V
 
I
P
 
P
I
 
V
P
 
P
S
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
R
T
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
E
F
 
F
S
 
S
A
 
E
T
 
N
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
T
 
I
V
 
I
K
 
K
Q
 
K
V
 
V
A
 
S
D
 
D
I
 
V
E
 
V
D
 
A
D
 
D
D
 
E
M
 
M
I
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
E
T
 
S
A
 
Q
K
 
K
A
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
E
Q
 
L
L
 
L
E
 
K
K
 
S
A
 
A
G
 
N
T
 
T
V
 
I
V
 
L
W
 
W
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
|
G
V
|
V
F
 
F
E
|
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
N
F
 
F
G
 
A
N
 
E
G
 
G
T
 
T
K
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
S
 
S
S
 
H
A
 
A
Y
 
F
S
 
S
I
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
|
G
D
|
D
T
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
E
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
I
 
I
H
 
K
D
 
D
K
 
Q
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
T
 
T
G
 
A
G
 
G
G
|
G
A
 
A
F
 
F
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
K
L
 
L
P
 
P
A
 
A
V
 
I
A
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
S
 
E
R
 
K
A
 
A

4ng4B Structure of phosphoglycerate kinase (cbu_1782) from coxiella burnetii (see paper)
55% identity, 99% coverage: 5:397/397 of query aligns to 3:388/389 of 4ng4B

query
sites
4ng4B
L
 
L
R
 
S
L
 
M
S
 
S
D
 
N
L
 
L
I
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
N
L
 
L
S
 
H
G
 
N
K
 
K
R
 
R
V
 
V
F
 
M
I
 
I
R
 
R
A
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Q
 
M
D
 
K
D
 
N
A
 
-
G
 
G
N
 
K
I
 
I
T
 
T
E
 
N
D
 
D
T
 
E
R
|
R
I
 
I
R
 
V
A
 
R
S
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
I
K
 
Q
S
 
K
A
 
A
L
 
I
D
 
E
A
 
Q
G
 
K
A
 
A
A
 
R
V
 
V
M
 
M
V
 
I
T
 
L
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
E
E
 
E
G
 
G
D
 
K
F
 
F
K
 
E
P
 
K
E
 
E
D
 
F
S
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
A
K
 
R
R
 
L
L
 
L
A
 
S
E
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
N
R
 
K
D
 
-
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
I
Q
 
N
N
 
D
W
 
W
V
 
L
E
 
K
N
 
-
G
 
G
V
 
V
N
 
A
V
 
V
A
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
V
 
I
L
 
L
L
 
C
E
 
E
N
 
N
C
 
V
R
 
R
V
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
E
D
 
N
S
 
N
D
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
R
M
 
M
A
 
A
K
 
E
L
 
L
C
 
C
D
 
D
V
 
I
Y
 
F
V
 
V
N
 
M
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
A
T
 
T
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
T
 
S
T
 
T
H
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
A
K
 
A
Y
 
Y
A
 
A
S
 
K
V
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
A
 
I
A
 
S
E
 
E
L
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
S
K
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
E
A
 
N
P
 
P
K
 
Q
R
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
V
A
 
G
G
|
G
S
 
S
K
|
K
V
 
V
S
 
S
T
 
T
K
|
K
L
 
I
T
 
H
I
 
L
L
 
L
K
 
E
S
 
N
L
 
L
A
 
L
D
 
D
K
 
K
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
N
 
N
T
 
T
F
 
F
M
 
L
L
 
K
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
L
 
Y
K
 
S
I
 
I
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
L
V
 
C
E
 
E
A
 
N
D
 
E
L
 
W
V
 
L
D
 
D
E
 
A
A
 
A
K
 
Q
A
 
Q
I
 
F
I
 
W
E
 
E
A
 
K
A
 
A
K
 
A
A
 
E
R
 
K
G
 
N
A
 
V
S
 
S
V
 
L
P
 
P
I
 
L
P
 
P
S
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
I
T
 
V
A
 
A
K
 
D
E
 
E
F
 
L
S
 
S
A
 
E
T
 
D
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
T
 
T
V
 
V
K
 
K
Q
 
N
V
 
I
A
 
D
D
 
A
I
 
V
E
 
T
D
 
S
D
 
N
D
 
E
M
 
S
I
|
I
L
 
F
D
|
D
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
N
T
 
T
A
 
S
K
 
A
A
 
T
L
 
Y
A
 
A
G
 
K
Q
 
L
L
 
M
E
 
A
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
I
V
 
V
W
 
W
N
|
N
G
|
G
P
|
P
V
 
I
G
|
G
V
|
V
F
 
F
E
|
E
F
 
I
D
 
E
Q
 
A
F
|
F
G
x
S
N
 
Q
G
 
G
T
|
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
K
S
 
S
S
 
T
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
A
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
D
|
D
T
|
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
K
 
K
Y
 
F
G
 
N
I
 
L
H
 
T
D
 
D
K
 
Q
V
 
M
S
 
S
Y
 
Y
I
 
V
S
 
S
T
 
T
G
 
A
G
 
G
G
|
G
A
 
A
F
 
F
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
I
L
 
L
P
 
P
A
 
A
V
 
I
A
 
K
V
 
I
L
 
L
E
 
T
S
 
Q
R
 
R
A
 
A

P40924 Phosphoglycerate kinase; EC 2.7.2.3 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
48% identity, 96% coverage: 16:396/397 of query aligns to 11:394/394 of P40924

query
sites
P40924
L
 
V
S
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
V
F
 
F
I
 
C
R
 
R
A
 
V
D
 
D
L
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Q
 
M
D
 
K
D
 
D
A
 
-
G
 
G
N
 
E
I
 
V
T
 
T
E
 
D
D
 
D
T
 
T
R
 
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
S
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
I
K
 
K
S
 
H
A
 
L
L
 
A
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
M
 
L
V
 
L
T
 
A
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
-
E
 
K
G
 
G
D
 
E
F
 
V
K
 
V
P
 
E
E
 
E
D
 
L
S
 
R
L
 
L
A
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
K
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
K
D
 
E
V
 
V
P
 
K
L
 
K
V
 
A
Q
 
D
N
 
E
W
 
A
V
 
Y
E
 
G
N
 
D
G
 
A
V
 
V
N
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
-
 
S
-
 
E
V
 
M
A
 
K
P
 
D
G
 
G
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
L
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
V
R
 
R
V
 
F
N
 
Y
K
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
E
K
 
K
D
 
N
S
 
D
D
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
A
M
 
F
A
 
A
K
 
E
L
 
L
C
 
A
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
A
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
A
E
 
H
A
 
A
T
 
S
T
 
T
H
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
E
Y
 
H
A
 
L
S
 
P
V
 
-
A
 
A
C
 
V
A
 
A
G
 
G
P
 
F
L
 
L
L
 
M
A
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
D
A
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
A
L
 
V
G
x
S
A
 
N
P
 
P
K
 
D
R
 
R
P
 
P
L
 
F
V
 
T
A
 
A
I
 
I
V
 
I
A
 
G
G
 
G
S
 
A
K
 
K
V
 
V
S
 
K
T
 
D
K
 
K
L
 
I
T
 
G
I
 
V
L
 
I
K
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
L
D
 
D
K
 
K
V
 
V
D
 
D
Q
 
N
L
 
L
I
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
L
A
 
A
N
 
Y
T
 
T
F
 
F
M
 
V
L
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
Y
K
 
E
I
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
L
V
 
L
E
 
E
A
 
E
D
 
D
L
 
K
V
 
I
D
 
E
E
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
S
I
 
F
I
 
M
E
 
D
A
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
E
R
 
K
G
 
G
A
 
V
S
 
N
V
 
F
P
 
Y
I
 
M
P
 
P
S
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
L
T
 
V
A
 
A
K
 
D
E
 
D
F
 
F
S
 
S
A
 
N
T
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
V
T
 
K
V
 
I
K
 
V
Q
 
P
V
 
I
A
 
S
D
 
E
I
 
I
E
 
P
D
 
S
D
 
D
D
 
L
M
 
E
I
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
T
E
 
K
T
|
T
A
 
R
K
 
E
A
 
T
L
 
Y
A
 
A
G
 
D
Q
 
V
L
 
I
E
 
K
K
 
N
A
 
S
G
 
K
T
 
L
V
 
V
V
 
V
W
 
W
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
M
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
E
F
 
I
D
 
D
Q
 
L
F
 
F
G
 
A
N
 
Q
G
 
G
T
 
T
K
 
K
T
 
A
L
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
E
S
 
A
-
 
K
S
 
D
A
 
T
Y
 
Y
S
 
S
I
 
V
A
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
E
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
I
 
L
H
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
M
S
 
S
Y
 
H
I
 
I
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
M
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
E
L
 
L
P
 
P
A
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
A
L
 
L
E
 
N
S
 
D
R
 
K

1vpeA Crystallographic analysis of phosphoglycerate kinase from the hyperthermophilic bacterium thermotoga maritima (see paper)
48% identity, 95% coverage: 16:393/397 of query aligns to 10:393/398 of 1vpeA

query
sites
1vpeA
L
 
L
S
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
F
 
I
I
 
M
R
 
R
A
 
V
D
 
D
L
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Q
 
V
D
 
K
D
 
D
A
 
-
G
 
G
N
 
V
I
 
V
T
 
Q
E
 
D
D
 
D
T
 
T
R
|
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
S
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
I
K
 
K
S
 
Y
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
M
 
I
V
 
L
T
 
L
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
-
E
 
K
G
 
G
D
 
E
F
 
P
K
 
S
P
 
P
E
 
E
D
 
F
S
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
A
K
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
S
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
K
D
 
E
V
 
V
P
 
K
L
 
F
V
 
V
Q
 
P
N
 
A
W
 
V
V
 
V
E
 
G
N
 
D
G
 
E
V
 
V
N
 
K
V
 
K
A
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
K
P
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
V
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
T
R
 
R
V
 
F
N
 
H
K
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
T
K
 
K
D
 
N
S
 
D
D
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
F
M
 
W
A
 
A
K
 
S
L
 
L
C
 
A
D
 
D
V
 
I
Y
 
H
V
 
V
N
 
N
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
A
E
 
H
A
 
A
T
 
S
T
 
N
H
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
Q
Y
 
F
A
 
I
S
 
P
V
 
-
A
 
S
C
 
V
A
 
A
G
 
G
P
 
F
L
 
L
L
 
M
A
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
I
E
 
K
A
 
F
L
 
L
G
 
S
K
 
K
A
 
V
L
 
T
G
 
Y
A
 
N
P
 
P
K
 
E
R
 
K
P
 
P
L
 
Y
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
L
A
 
G
G
|
G
S
x
A
K
|
K
V
 
V
S
 
S
T
 
D
K
|
K
L
 
I
T
 
G
I
 
V
L
 
I
K
 
T
S
 
N
L
 
L
A
 
M
D
 
E
K
 
K
V
 
A
D
 
D
Q
 
R
L
 
I
I
 
L
V
 
I
G
 
G
G
|
G
G
x
A
I
 
M
A
 
M
N
 
F
T
 
T
F
 
F
M
 
L
L
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
K
K
 
E
I
 
V
G
 
G
K
 
S
S
 
S
L
 
R
V
 
V
E
 
E
A
 
E
D
 
D
L
 
K
V
 
I
D
 
D
E
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
E
I
 
L
I
 
V
E
 
E
A
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
E
R
 
K
G
 
G
A
 
V
S
 
E
V
 
I
P
 
V
I
 
L
P
 
P
S
 
V
D
 
D
V
 
A
V
 
V
T
 
I
A
 
A
K
 
Q
E
 
K
F
 
I
S
 
E
A
 
P
T
 
G
A
 
V
Q
 
E
A
 
K
T
 
K
V
 
V
K
 
V
Q
 
R
V
 
I
A
 
D
D
 
D
-
 
G
I
 
I
E
 
P
D
 
E
D
 
G
D
 
W
M
 
M
I
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
E
T
 
T
A
 
I
K
 
E
A
 
L
L
 
F
A
 
K
G
 
Q
Q
 
K
L
 
L
E
 
S
K
 
D
A
 
A
G
 
K
T
 
T
V
 
V
V
 
V
W
 
W
N
|
N
G
 
G
P
|
P
V
 
M
G
|
G
V
|
V
F
 
F
E
|
E
F
 
I
D
 
D
Q
 
D
F
 
F
G
 
A
N
 
E
G
 
G
T
 
T
K
 
K
T
 
Q
L
 
V
A
 
A
E
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
T
R
 
E
S
 
K
S
 
G
A
 
A
Y
 
I
S
 
T
I
 
V
A
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
D
|
D
T
x
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
N
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
I
 
L
H
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
F
S
 
S
Y
 
H
I
 
V
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
|
G
A
 
A
F
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
E
L
 
L
P
 
P
A
 
G
V
 
I
A
 
A
V
 
S
L
 
M

P36204 Bifunctional PGK/TIM; EC 2.7.2.3; EC 5.3.1.1 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
48% identity, 95% coverage: 16:391/397 of query aligns to 11:392/654 of P36204

query
sites
P36204
L
 
L
S
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
F
 
I
I
 
M
R
 
R
A
 
V
D
 
D
L
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Q
 
V
D
 
K
D
 
D
A
 
-
G
 
G
N
 
V
I
 
V
T
 
Q
E
 
D
D
 
D
T
 
T
R
|
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
S
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
I
K
 
K
S
 
Y
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
M
 
I
V
 
L
T
 
L
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
-
E
 
K
G
 
G
D
 
E
F
 
P
K
 
S
P
 
P
E
 
E
D
 
F
S
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
A
K
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
S
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
K
D
 
E
V
 
V
P
 
K
L
 
F
V
 
V
Q
 
P
N
 
A
W
 
V
V
 
V
E
 
G
N
 
D
G
 
E
V
 
V
N
 
K
V
 
K
A
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
K
P
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
V
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
T
R
|
R
V
 
F
N
 
H
K
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
T
K
 
K
D
 
N
S
 
D
D
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
F
M
 
W
A
 
A
K
 
S
L
 
L
C
 
A
D
 
D
V
 
I
Y
 
H
V
 
V
N
 
N
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
A
H
 
H
R
|
R
A
 
A
E
 
H
A
 
A
T
 
S
T
 
N
H
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
Q
Y
 
F
A
 
I
S
 
P
V
 
-
A
 
S
C
 
V
A
 
A
G
 
G
P
 
F
L
 
L
L
 
M
A
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
I
E
 
K
A
 
F
L
 
L
G
 
S
K
 
K
A
 
V
L
 
T
G
 
Y
A
 
N
P
 
P
K
 
E
R
 
K
P
 
P
L
 
Y
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
L
A
 
G
G
 
G
S
 
A
K
 
K
V
 
V
S
 
S
T
 
D
K
 
K
L
 
I
T
 
G
I
 
V
L
 
I
K
 
T
S
 
N
L
 
L
A
 
M
D
 
E
K
 
K
V
 
A
D
 
D
Q
 
R
L
 
I
I
 
L
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
A
I
 
M
A
 
M
N
 
F
T
 
T
F
 
F
M
 
L
L
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
K
K
 
E
I
 
V
G
 
G
K
 
S
S
 
S
L
 
R
V
 
V
E
 
E
A
 
E
D
 
D
L
 
K
V
 
I
D
 
D
E
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
E
I
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
E
R
 
K
G
 
G
A
 
V
S
 
E
V
 
I
P
 
V
I
 
L
P
 
P
S
 
V
D
 
D
V
 
A
V
 
V
T
 
I
A
 
A
K
 
Q
E
 
K
F
 
I
S
 
E
A
 
P
T
 
G
A
 
V
Q
 
E
A
 
K
T
 
K
V
 
V
K
 
V
Q
 
R
V
 
I
A
 
D
D
 
D
-
 
G
I
 
I
E
 
P
D
 
E
D
 
G
D
 
W
M
 
M
I
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
E
T
 
T
A
 
I
K
 
E
A
 
L
L
 
F
A
 
K
G
 
Q
Q
 
K
L
 
L
E
 
S
K
 
D
A
 
A
G
 
K
T
 
T
V
 
V
V
 
V
W
 
W
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
M
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
E
F
 
I
D
 
D
Q
 
D
F
 
F
G
 
A
N
 
E
G
 
G
T
 
T
K
 
K
T
 
Q
L
 
V
A
 
A
E
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
T
R
 
E
S
 
K
S
 
G
A
 
A
Y
 
I
S
 
T
I
 
V
A
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
N
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
I
 
L
H
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
F
S
 
S
Y
 
H
I
 
V
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
E
L
 
L
P
 
P
A
 
G
V
 
I
A
 
A

1phpA Structure of the adp complex of the 3-phosphoglycerate kinase from bacillus stearothermophilus at 1.65 angstroms (see paper)
48% identity, 96% coverage: 16:396/397 of query aligns to 11:394/394 of 1phpA

query
sites
1phpA
L
 
V
S
 
R
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
F
 
F
I
 
C
R
 
R
A
 
V
D
 
D
L
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Q
 
M
D
 
E
D
 
Q
A
 
-
G
 
G
N
 
A
I
 
I
T
 
T
E
 
D
D
 
D
T
 
T
R
|
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
S
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
I
K
 
R
S
 
Y
A
 
L
L
 
I
D
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
M
 
I
V
 
L
T
 
A
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
-
E
 
K
G
 
G
D
 
K
F
 
V
K
 
V
P
 
E
E
 
E
D
 
L
S
 
R
L
 
L
A
 
D
P
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
E
R
 
R
D
 
P
V
 
V
P
 
A
L
 
K
V
 
T
Q
 
N
N
 
E
W
 
A
V
 
V
E
 
G
N
 
D
G
 
E
V
 
V
N
 
K
V
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
N
P
 
E
G
 
G
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
V
R
 
R
V
 
F
N
 
Y
K
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
E
K
 
K
D
 
N
S
 
D
D
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
A
M
 
F
A
 
A
K
 
E
L
 
L
C
 
A
D
 
D
V
 
L
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
A
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
A
E
 
H
A
 
A
T
 
S
T
 
T
H
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
H
Y
 
Y
A
 
L
S
 
P
V
 
-
A
 
A
C
 
V
A
 
A
G
 
G
P
 
F
L
 
L
L
 
M
A
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
S
A
 
N
P
 
P
K
 
D
R
 
R
P
 
P
L
 
F
V
 
T
A
 
A
I
 
I
V
 
I
A
 
G
G
|
G
S
 
A
K
|
K
V
 
V
S
 
K
T
 
D
K
|
K
L
 
I
T
 
G
I
 
V
L
 
I
K
 
D
S
 
N
L
 
L
A
 
L
D
 
E
K
 
K
V
 
V
D
 
D
Q
 
N
L
 
L
I
 
I
V
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
I
 
L
A
 
A
N
 
Y
T
 
T
F
 
F
M
 
V
L
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
H
K
 
D
I
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
|
L
V
 
L
E
 
E
A
 
E
D
 
D
L
 
K
V
 
I
D
 
E
E
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
S
I
 
F
I
 
M
E
 
E
A
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
E
R
 
K
G
 
G
A
 
V
S
 
R
V
 
F
P
 
Y
I
 
M
P
 
P
S
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
V
A
 
A
K
 
D
E
 
R
F
 
F
S
 
A
A
 
N
T
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
T
T
 
K
V
 
V
K
 
V
Q
 
P
V
 
I
A
 
D
D
 
A
I
 
I
E
 
P
D
 
A
D
 
D
D
 
W
M
 
S
I
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
K
T
 
T
A
 
R
K
 
E
A
 
L
L
 
Y
A
 
R
G
 
D
Q
 
V
L
 
I
E
 
R
K
 
E
A
 
S
G
 
K
T
 
L
V
 
V
V
 
V
W
 
W
N
|
N
G
 
G
P
|
P
V
 
M
G
|
G
V
|
V
F
 
F
E
|
E
F
 
M
D
 
D
Q
 
A
F
 
F
G
 
A
N
 
H
G
 
G
T
 
T
K
 
K
-
 
A
T
 
I
L
 
A
A
 
E
E
 
A
A
 
L
I
 
A
A
 
E
R
 
A
S
 
L
S
 
D
A
 
T
Y
 
Y
S
 
S
I
 
V
A
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
D
|
D
T
x
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
E
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
I
 
L
H
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
M
S
 
D
Y
 
H
I
 
I
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
|
G
A
 
A
F
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
M
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
G
V
 
V
A
 
V
V
 
A
L
 
L
E
 
E
S
 
D
R
 
K

P18912 Phosphoglycerate kinase; EC 2.7.2.3 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see paper)
48% identity, 96% coverage: 16:396/397 of query aligns to 11:394/394 of P18912

query
sites
P18912
L
 
V
S
 
R
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
F
 
F
I
 
C
R
 
R
A
 
V
D
 
D
L
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Q
 
M
D
 
E
D
 
Q
A
 
-
G
 
G
N
 
A
I
 
I
T
 
T
E
 
D
D
 
D
T
 
T
R
 
R
I
 
I
R
 
R
A
 
A
S
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
I
K
 
R
S
 
Y
A
 
L
L
 
I
D
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
M
 
I
V
 
L
T
 
A
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
-
E
 
K
G
 
G
D
 
K
F
 
V
K
 
V
P
 
E
E
 
E
D
 
L
S
 
R
L
 
L
A
 
D
P
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
E
R
 
R
D
 
P
V
 
V
P
 
A
L
 
K
V
 
T
Q
 
N
N
 
E
W
 
A
V
 
V
E
 
G
N
 
D
G
 
E
V
 
V
N
 
K
V
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
N
P
 
E
G
 
G
Q
 
D
V
 
V
V
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
V
R
 
R
V
 
F
N
 
Y
K
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
E
K
 
K
D
 
N
S
 
D
D
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
A
M
 
F
A
 
A
K
 
E
L
 
L
C
 
A
D
 
D
V
 
L
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
A
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
A
E
 
H
A
 
A
T
 
S
T
 
T
H
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
H
Y
 
Y
A
 
L
S
 
P
V
 
-
A
 
A
C
 
V
A
 
A
G
 
G
P
 
F
L
 
L
L
 
M
A
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
S
A
 
N
P
 
P
K
 
D
R
 
R
P
 
P
L
 
F
V
 
T
A
 
A
I
 
I
V
 
I
A
 
G
G
 
G
S
 
A
K
 
K
V
 
V
S
 
K
T
 
D
K
|
K
L
 
I
T
 
G
I
 
V
L
 
I
K
 
D
S
 
N
L
 
L
A
 
L
D
 
E
K
 
K
V
 
V
D
 
D
Q
 
N
L
 
L
I
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
L
A
 
A
N
 
Y
T
 
T
F
 
F
M
 
V
L
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
H
K
 
D
I
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
L
V
 
L
E
 
E
A
 
E
D
 
D
L
 
K
V
 
I
D
 
E
E
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
S
I
 
F
I
 
M
E
 
E
A
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
E
R
 
K
G
 
G
A
 
V
S
 
R
V
 
F
P
 
Y
I
 
M
P
 
P
S
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
V
A
 
A
K
 
D
E
 
R
F
 
F
S
 
A
A
 
N
T
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
T
T
 
K
V
 
V
K
 
V
Q
 
P
V
 
I
A
 
D
D
 
A
I
 
I
E
 
P
D
 
A
D
 
D
D
 
W
M
 
S
I
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
K
T
 
T
A
 
R
K
 
E
A
 
L
L
 
Y
A
 
R
G
 
D
Q
 
V
L
 
I
E
 
R
K
 
E
A
 
S
G
 
K
T
 
L
V
 
V
V
 
V
W
 
W
N
|
N
G
 
G
P
 
P
V
 
M
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
|
E
F
 
M
D
 
D
Q
 
A
F
 
F
G
 
A
N
 
H
G
 
G
T
 
T
K
 
K
-
 
A
T
 
I
L
 
A
A
 
E
E
 
A
A
 
L
I
 
A
A
 
E
R
 
A
S
 
L
S
 
D
A
 
T
Y
 
Y
S
 
S
I
 
V
A
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
D
|
D
T
x
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
E
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
I
 
L
H
 
A
D
 
D
K
 
K
V
 
M
S
 
D
Y
 
H
I
 
I
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
M
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
G
V
 
V
A
 
V
V
 
A
L
 
L
E
 
E
S
 
D
R
 
K

3pgkA The structure of yeast phosphoglycerate kinase at 0.25 nm resolution (see paper)
44% identity, 96% coverage: 16:396/397 of query aligns to 13:414/415 of 3pgkA

query
sites
3pgkA
L
 
L
S
 
K
G
 
D
K
 
K
R
 
R
V
 
V
F
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
V
D
 
D
L
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Q
 
L
D
 
D
D
 
-
A
 
G
G
 
K
N
 
K
I
 
I
T
 
T
E
 
S
D
 
N
T
 
Q
R
|
R
I
 
I
R
 
V
A
 
A
S
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
I
K
 
K
S
 
Y
A
 
V
L
 
L
D
 
E
A
 
H
G
 
H
A
 
P
-
 
R
A
 
Y
V
 
V
M
 
V
V
 
L
T
 
A
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
N
E
 
-
G
 
G
D
 
E
F
 
R
K
 
N
P
 
E
E
 
K
D
 
Y
S
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
A
K
 
K
R
 
E
L
 
L
A
 
Q
E
 
S
L
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
T
L
 
F
V
 
L
Q
 
N
N
 
D
W
 
C
V
 
V
E
 
G
N
 
P
G
 
E
V
 
V
N
 
E
V
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
V
 
I
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
L
R
 
R
V
 
Y
N
 
H
-
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
K
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
K
-
 
V
K
 
K
G
 
A
E
 
S
K
 
K
K
 
E
D
 
D
S
 
V
D
 
Q
E
 
K
L
 
F
A
 
R
Q
 
H
K
 
E
M
 
L
A
 
S
K
 
S
L
 
L
C
 
A
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
V
 
I
N
 
N
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
A
E
 
H
A
 
S
T
 
S
T
 
M
H
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
D
K
 
-
Y
 
-
A
 
L
S
 
P
V
 
Q
A
 
R
C
 
A
A
 
A
G
 
G
P
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
K
A
 
Y
L
 
F
G
 
G
K
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
E
A
 
N
P
 
P
K
 
T
R
 
R
P
 
P
L
 
F
V
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
L
A
 
G
G
|
G
S
x
A
K
|
K
V
 
V
S
 
A
T
 
D
K
 
K
L
 
I
T
 
Q
I
 
L
L
 
I
K
 
D
S
 
N
L
 
L
A
 
L
D
 
D
K
 
K
V
 
V
D
 
D
Q
 
S
L
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
M
A
 
A
N
 
F
T
 
T
F
 
F
M
 
K
-
 
K
L
 
V
A
 
L
A
 
E
G
 
N
L
 
T
K
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
D
S
 
S
L
 
I
V
 
F
E
 
D
A
 
K
D
 
A
L
 
V
V
 
G
D
 
P
E
 
E
A
 
I
K
 
A
A
 
K
I
 
L
I
 
M
E
 
E
A
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
A
R
 
K
G
 
G
A
 
V
S
 
E
V
 
V
P
 
V
I
 
L
P
 
P
S
 
V
D
 
D
V
 
F
V
 
I
T
 
I
A
 
A
K
 
D
E
 
A
F
|
F
S
 
S
A
 
A
T
 
S
A
 
A
Q
 
N
A
 
T
-
 
K
T
 
T
V
 
V
K
 
T
Q
 
D
V
 
K
A
 
E
D
 
G
I
 
I
E
 
P
D
 
A
D
 
G
D
 
W
M
 
Q
I
 
G
L
|
L
D
 
D
I
 
N
G
 
G
P
 
P
E
 
E
T
 
S
A
 
R
K
 
K
A
 
L
L
 
F
A
 
A
G
 
A
Q
 
T
L
 
V
E
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
T
T
 
V
V
 
I
V
 
L
W
 
W
N
|
N
G
|
G
P
|
P
V
 
P
G
|
G
V
|
V
F
 
F
E
 
E
F
 
F
D
 
E
Q
 
K
F
 
F
G
 
A
N
 
A
G
 
G
T
 
T
K
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
D
A
 
E
I
 
V
A
 
V
R
 
K
S
 
S
S
 
S
A
 
A
Y
 
A
S
 
G
-
 
N
-
 
T
-
 
V
I
 
I
A
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
D
|
D
T
 
T
L
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
A
A
 
K
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
I
 
V
H
 
T
D
 
D
K
 
K
V
 
I
S
 
S
Y
 
H
I
 
V
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
|
G
A
 
A
F
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
E
L
 
L
P
 
P
A
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
F
L
 
L
E
 
S
S
 
E
R
 
K

16pkA Phosphoglycerate kinase from trypanosoma brucei bisubstrate analog (see paper)
41% identity, 97% coverage: 11:396/397 of query aligns to 5:415/415 of 16pkA

query
sites
16pkA
I
 
I
A
 
N
E
 
E
G
 
C
K
 
D
L
 
L
S
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
K
V
 
V
F
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
V
D
 
D
L
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Q
 
V
D
 
K
D
 
N
A
 
-
G
 
G
N
 
K
I
 
I
T
 
T
E
 
N
D
 
D
T
 
Y
R
|
R
I
 
I
R
 
R
A
 
S
S
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
L
K
 
K
S
 
K
A
 
V
L
 
L
D
 
T
A
 
E
G
 
G
A
 
G
A
 
S
V
 
C
M
 
V
V
 
L
T
 
M
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
M
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
S
T
 
T
E
 
G
G
 
G
-
 
V
-
 
P
D
 
G
F
 
F
K
 
Q
P
 
Q
E
 
K
D
 
A
S
 
T
L
 
L
A
 
K
P
 
P
V
 
V
A
 
A
K
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
S
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
L
R
 
R
D
 
P
V
 
V
-
 
T
-
 
F
-
 
A
P
 
P
L
 
D
V
 
C
Q
 
L
N
 
N
W
 
A
V
 
A
E
 
D
N
 
V
G
 
V
V
 
S
N
 
K
V
 
M
A
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
V
R
 
R
V
 
F
N
 
Y
K
 
K
G
 
E
E
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
K
K
 
A
K
 
K
D
 
D
S
 
R
D
 
E
E
 
A
L
 
M
A
 
A
Q
 
K
K
 
I
M
 
L
A
 
A
K
 
S
L
 
Y
C
 
G
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
V
 
I
N
 
S
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
D
E
 
S
A
 
A
T
 
T
T
 
M
H
 
T
G
 
G
I
 
I
A
 
P
K
 
K
Y
 
I
A
 
L
S
 
G
V
 
N
A
 
G
C
 
A
A
 
A
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
L
 
M
A
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
I
E
 
S
A
 
Y
L
 
F
G
 
A
K
 
K
A
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
N
P
 
P
K
 
P
R
 
R
P
 
P
L
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
G
G
|
G
S
x
A
K
|
K
V
 
V
S
 
S
T
 
D
K
|
K
L
 
I
T
 
Q
I
 
L
L
 
L
K
 
D
S
 
N
L
 
M
A
 
L
D
 
Q
K
 
R
V
 
I
D
 
D
Q
 
Y
L
 
L
I
 
L
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
x
A
I
 
M
A
 
A
N
x
Y
T
 
T
F
 
F
M
 
L
L
 
K
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
L
 
Y
K
 
S
I
 
I
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
K
V
 
C
E
 
E
A
 
E
D
 
S
L
 
K
V
 
L
D
 
E
E
 
F
A
 
A
K
 
R
A
 
S
I
 
L
I
 
L
E
 
K
A
 
K
A
 
A
K
 
E
A
 
D
R
 
R
G
 
K
A
 
V
S
 
Q
V
 
V
P
 
I
I
 
L
P
 
P
S
 
I
D
 
D
V
 
H
V
 
V
T
 
C
A
 
H
K
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
K
A
 
A
T
 
V
A
 
D
Q
 
S
A
 
P
T
 
L
V
 
I
K
 
T
Q
 
E
V
 
D
A
 
Q
D
 
N
I
 
I
E
 
P
D
 
E
D
 
G
D
 
H
M
 
M
I
 
A
L
|
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
K
T
 
T
A
 
I
K
 
E
A
 
K
L
 
Y
A
 
V
G
 
Q
Q
 
T
L
 
I
E
 
G
K
 
K
A
 
C
G
 
K
T
 
S
V
 
A
V
 
I
W
 
W
N
 
N
G
 
G
P
|
P
V
 
M
G
|
G
V
|
V
F
 
F
E
|
E
F
 
M
D
 
V
Q
 
P
F
 
Y
G
 
S
N
 
K
G
 
G
T
 
T
K
 
F
T
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
K
A
 
A
I
 
M
A
 
G
R
 
R
S
 
G
S
 
T
A
 
H
-
 
E
-
 
H
-
 
G
-
 
L
Y
 
M
S
 
S
I
 
I
A
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
D
 
D
T
 
S
L
 
A
A
 
S
A
 
A
I
 
A
A
 
E
K
 
L
Y
 
S
G
 
G
I
 
E
H
 
A
D
 
K
K
 
R
V
 
M
S
 
S
Y
 
H
I
 
V
S
 
S
T
 
T
G
|
G
G
|
G
G
|
G
A
 
A
F
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
D
S
 
D
R
 
K

13pkA Ternary complex of phosphoglycerate kinase from trypanosoma brucei (see paper)
41% identity, 97% coverage: 11:396/397 of query aligns to 5:415/415 of 13pkA

query
sites
13pkA
I
 
I
A
 
N
E
 
E
G
 
C
K
 
D
L
 
L
S
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
K
V
 
V
F
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
V
D
 
D
L
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Q
 
V
D
 
K
D
 
N
A
 
-
G
 
G
N
 
K
I
 
I
T
 
T
E
 
N
D
 
D
T
 
Y
R
|
R
I
 
I
R
 
R
A
 
S
S
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
L
K
 
K
S
 
K
A
 
V
L
 
L
D
 
T
A
 
E
G
 
G
A
 
G
A
 
S
V
 
C
M
 
V
V
 
L
T
 
M
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
M
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
S
T
 
T
E
 
G
G
 
G
-
 
V
-
 
P
D
 
G
F
 
F
K
 
Q
P
 
Q
E
 
K
D
 
A
S
 
T
L
 
L
A
 
K
P
 
P
V
 
V
A
 
A
K
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
S
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
L
R
 
R
D
 
P
V
 
V
-
 
T
-
 
F
-
 
A
P
 
P
L
 
D
V
 
C
Q
 
L
N
 
N
W
 
A
V
 
A
E
 
D
N
 
V
G
 
V
V
 
S
N
 
K
V
 
M
A
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
V
R
 
R
V
 
F
N
 
Y
K
 
K
G
 
E
E
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
K
K
 
A
K
 
K
D
 
D
S
 
R
D
 
E
E
 
A
L
 
M
A
 
A
Q
 
K
K
 
I
M
 
L
A
 
A
K
 
S
L
 
Y
C
 
G
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
V
 
I
N
 
S
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
D
E
 
S
A
 
A
T
 
T
T
 
M
H
 
T
G
 
G
I
 
I
A
 
P
K
 
K
Y
 
I
A
 
L
S
 
G
V
 
N
A
 
G
C
 
A
A
 
A
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
L
 
M
A
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
I
E
 
S
A
 
Y
L
 
F
G
 
A
K
 
K
A
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
N
P
 
P
K
 
P
R
 
R
P
 
P
L
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
G
G
|
G
S
x
A
K
|
K
V
 
V
S
 
S
T
 
D
K
|
K
L
 
I
T
 
Q
I
 
L
L
 
L
K
 
D
S
 
N
L
 
M
A
 
L
D
 
Q
K
 
R
V
 
I
D
 
D
Q
 
Y
L
 
L
I
 
L
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
A
I
 
M
A
 
A
N
 
Y
T
 
T
F
 
F
M
 
L
L
 
K
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
L
 
Y
K
 
S
I
 
I
G
 
G
K
 
K