SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012400006.1 NCBI__GCF_000020045.1:WP_012400006.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2ordA Crystal structure of acetylornithine aminotransferase (ec 2.6.1.11) (acoat) (tm1785) from thermotoga maritima at 1.40 a resolution
45% identity, 97% coverage: 11:391/394 of query aligns to 11:390/393 of 2ordA

query
sites
2ordA
L
 
L
M
 
M
Y
 
N
I
 
T
T
 
Y
N
 
S
R
 
R
P
 
F
E
 
P
I
 
A
V
 
T
F
 
F
T
 
V
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
G
 
G
S
 
S
W
 
W
L
 
I
Y
 
Y
D
 
D
N
 
E
T
 
K
G
 
G
K
 
N
R
 
A
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
T
Q
 
S
G
 
G
W
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
N
S
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
S
N
 
H
D
 
P
G
 
R
V
 
L
I
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
I
T
 
K
Q
 
D
Q
 
Q
A
 
A
R
 
E
T
 
K
L
 
L
I
 
I
N
 
H
P
 
C
S
 
S
P
 
N
A
 
L
F
 
F
Y
 
W
N
 
N
E
 
R
P
 
P
M
 
Q
A
 
M
K
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
S
Q
 
K
H
 
N
S
 
T
C
 
F
F
 
G
D
 
G
K
 
K
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
A
N
 
N
S
 
T
G
|
G
A
x
T
E
 
E
A
 
A
N
 
N
E
 
E
G
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
K
L
 
I
A
 
A
R
 
R
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
K
K
 
S
N
 
E
G
 
K
A
 
K
Y
 
Y
E
 
R
I
 
I
I
 
L
T
 
S
F
 
A
D
 
H
H
 
N
S
 
S
F
|
F
H
|
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
G
T
 
S
M
 
L
S
 
T
A
 
A
S
 
T
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
G
 
K
W
 
Y
D
 
Q
T
 
K
I
 
P
Y
 
F
A
 
E
P
 
P
Q
 
L
V
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
E
K
 
Y
A
 
F
E
 
E
L
 
F
N
 
N
D
 
N
I
 
V
A
 
E
S
 
D
V
 
L
E
 
R
K
 
R
L
 
K
I
 
M
N
 
S
D
 
E
K
 
D
T
 
V
I
 
C
A
 
A
V
 
V
M
 
F
L
 
L
E
|
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
S
G
 
G
V
 
I
I
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
R
 
K
E
 
E
F
 
F
M
 
L
Q
 
E
Q
 
E
L
 
A
R
 
R
E
 
K
L
 
L
T
 
C
T
 
D
K
 
E
H
 
Y
N
 
D
L
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
V
V
 
F
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
S
 
C
G
 
G
C
 
M
G
 
G
R
 
R
A
 
T
G
 
G
T
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
E
 
Q
L
 
K
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
E
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
V
M
 
L
T
 
T
L
 
T
A
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
L
G
 
G
S
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
V
L
 
I
C
 
V
K
 
N
K
 
E
H
 
R
V
 
A
E
 
N
V
 
V
F
 
L
E
 
E
A
 
P
G
 
G
D
 
D
Q
 
H
G
 
G
G
 
T
T
|
T
Y
 
F
N
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
M
 
A
T
 
C
A
 
R
A
 
A
G
 
G
Y
 
V
S
 
T
V
 
V
I
 
I
S
 
K
Q
 
E
L
 
L
T
 
T
A
 
K
P
 
E
G
 
G
F
 
F
L
 
L
E
 
E
G
 
E
V
 
V
R
 
E
A
 
E
R
 
K
G
 
G
E
 
N
Y
 
Y
L
 
L
R
 
M
T
 
K
K
 
K
L
 
L
L
 
Q
E
 
E
L
 
M
S
 
K
A
 
E
E
 
E
R
 
Y
G
 
D
F
 
V
E
 
V
G
 
A
E
 
D
-
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
M
G
 
G
L
 
L
L
 
M
R
 
I
A
 
G
L
 
I
L
 
Q
L
 
F
G
 
R
K
 
E
D
 
E
I
 
V
G
 
S
N
 
N
Q
 
R
I
 
-
V
 
-
E
 
E
K
 
V
A
 
A
R
 
T
L
 
K
M
 
C
Q
 
F
P
 
E
D
 
N
G
 
K
L
 
L
L
 
L
L
 
V
N
 
V
A
 
P
A
 
A
R
 
G
P
 
N
N
 
N
L
 
T
L
 
I
R
|
R
F
 
F
M
 
L
P
 
P
A
 
P
L
 
L
N
 
T
V
 
V
S
 
E
T
 
Y
E
 
G
E
 
E
I
 
I
D
 
D
Q
 
L
M
 
A
M
 
V
S
 
E
M
 
T
L
 
L
R
 
K
S
 
K
I
 
V
L
 
L

Q9X2A5 Acetylornithine aminotransferase; ACOAT; EC 2.6.1.11 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8)
45% identity, 97% coverage: 11:391/394 of query aligns to 3:382/385 of Q9X2A5

query
sites
Q9X2A5
L
 
L
M
 
M
Y
 
N
I
 
T
T
 
Y
N
 
S
R
 
R
P
 
F
E
 
P
I
 
A
V
 
T
F
 
F
T
 
V
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
G
 
G
S
 
S
W
 
W
L
 
I
Y
 
Y
D
 
D
N
 
E
T
 
K
G
 
G
K
 
N
R
 
A
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
T
Q
 
S
G
 
G
W
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
N
S
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
S
N
 
H
D
 
P
G
 
R
V
 
L
I
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
I
T
 
K
Q
 
D
Q
 
Q
A
 
A
R
 
E
T
 
K
L
 
L
I
 
I
N
 
H
P
 
C
S
 
S
P
 
N
A
 
L
F
 
F
Y
 
W
N
 
N
E
 
R
P
 
P
M
 
Q
A
 
M
K
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
S
Q
 
K
H
 
N
S
 
T
C
 
F
F
 
G
D
 
G
K
 
K
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
A
N
 
N
S
 
T
G
|
G
A
x
T
E
 
E
A
 
A
N
 
N
E
 
E
G
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
K
L
 
I
A
 
A
R
 
R
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
K
K
 
S
N
 
E
G
 
K
A
 
K
Y
 
Y
E
 
R
I
 
I
I
 
L
T
 
S
F
 
A
D
 
H
H
 
N
S
 
S
F
 
F
H
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
G
T
 
S
M
 
L
S
 
T
A
 
A
S
 
T
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
G
 
K
W
 
Y
D
 
Q
T
 
K
I
 
P
Y
 
F
A
 
E
P
 
P
Q
 
L
V
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
E
K
 
Y
A
 
F
E
 
E
L
 
F
N
 
N
D
 
N
I
 
V
A
 
E
S
 
D
V
 
L
E
 
R
K
 
R
L
 
K
I
 
M
N
 
S
D
 
E
K
 
D
T
 
V
I
 
C
A
 
A
V
 
V
M
 
F
L
 
L
E
 
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
S
G
 
G
V
 
I
I
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
R
 
K
E
 
E
F
 
F
M
 
L
Q
 
E
Q
 
E
L
 
A
R
 
R
E
 
K
L
 
L
T
 
C
T
 
D
K
 
E
H
 
Y
N
 
D
L
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
V
V
 
F
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
S
 
C
G
 
G
C
 
M
G
 
G
R
 
R
A
 
T
G
 
G
T
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
E
 
Q
L
 
K
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
E
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
V
M
 
L
T
 
T
L
 
T
A
 
A
K
 
K
G
 
G
I
 
L
G
 
G
S
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
V
L
 
I
C
 
V
K
 
N
K
 
E
H
 
R
V
 
A
E
 
N
V
 
V
F
 
L
E
 
E
A
 
P
G
 
G
D
 
D
Q
 
H
G
 
G
G
 
T
T
|
T
Y
 
F
N
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
M
 
A
T
 
C
A
 
R
A
 
A
G
 
G
Y
 
V
S
 
T
V
 
V
I
 
I
S
 
K
Q
 
E
L
 
L
T
 
T
A
 
K
P
 
E
G
 
G
F
 
F
L
 
L
E
 
E
G
 
E
V
 
V
R
 
E
A
 
E
R
 
K
G
 
G
E
 
N
Y
 
Y
L
 
L
R
 
M
T
 
K
K
 
K
L
 
L
L
 
Q
E
 
E
L
 
M
S
 
K
A
 
E
E
 
E
R
 
Y
G
 
D
F
 
V
E
 
V
G
 
A
E
 
D
-
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
M
G
 
G
L
 
L
L
 
M
R
 
I
A
 
G
L
 
I
L
 
Q
L
 
F
G
 
R
K
 
E
D
 
E
I
 
V
G
 
S
N
 
N
Q
 
R
I
 
-
V
 
-
E
 
E
K
 
V
A
 
A
R
 
T
L
 
K
M
 
C
Q
 
F
P
 
E
D
 
N
G
 
K
L
 
L
L
 
L
L
 
V
N
 
V
A
 
P
A
 
A
R
 
G
P
 
N
N
 
N
L
 
T
L
 
I
R
 
R
F
 
F
M
 
L
P
 
P
A
 
P
L
 
L
N
 
T
V
 
V
S
 
E
T
 
Y
E
 
G
E
 
E
I
 
I
D
 
D
Q
 
L
M
 
A
M
 
V
S
 
E
M
 
T
L
 
L
R
 
K
S
 
K
I
 
V
L
 
L

O66442 Acetylornithine aminotransferase; ACOAT; EC 2.6.1.11 from Aquifex aeolicus (strain VF5)
41% identity, 97% coverage: 11:391/394 of query aligns to 1:376/376 of O66442

query
sites
O66442
L
 
M
M
 
T
Y
 
Y
I
 
L
T
 
M
N
 
N
-
 
N
-
 
Y
-
 
A
R
 
R
P
 
L
E
 
P
I
 
V
V
 
K
F
 
F
T
 
V
H
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
G
S
 
V
W
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
N
 
E
T
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
V
Q
 
S
G
 
G
W
 
I
A
 
G
V
 
V
N
 
N
S
 
S
L
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
A
N
 
Y
D
 
P
G
 
K
V
 
L
I
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
E
Q
 
Q
A
 
V
R
 
E
T
 
K
L
 
L
I
 
L
N
 
H
P
 
V
S
 
S
P
 
N
A
 
L
F
 
Y
Y
 
E
N
 
N
E
 
P
P
 
W
M
 
Q
A
 
E
K
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
H
L
 
K
L
 
L
T
 
V
Q
 
K
H
 
H
S
 
F
C
 
W
F
 
T
D
 
E
-
 
G
K
 
K
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
A
N
 
N
S
 
S
G
|
G
A
x
T
E
 
E
A
 
S
N
 
V
E
 
E
G
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
K
 
K
Y
 
Y
G
 
W
K
 
R
K
 
D
F
 
K
K
 
G
N
 
K
G
 
N
A
 
K
Y
 
W
E
 
K
I
 
F
I
 
I
T
 
S
F
 
F
D
 
E
H
 
N
S
 
S
F
 
F
H
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
Y
A
 
G
T
 
S
M
 
L
S
 
S
A
 
A
S
 
T
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
G
 
K
W
 
F
D
 
H
T
 
K
I
 
G
Y
 
F
A
 
E
P
 
P
Q
 
L
V
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
S
K
 
Y
A
 
A
E
 
K
L
 
L
N
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
D
S
 
S
V
 
V
E
 
Y
K
 
K
L
 
L
I
 
L
N
 
D
D
 
E
K
 
E
T
 
T
I
 
A
A
 
G
V
 
I
M
 
I
L
 
I
E
 
E
P
 
V
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
N
P
 
E
A
 
A
T
 
S
R
 
E
E
 
D
F
 
F
M
 
L
Q
 
S
Q
 
K
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
L
 
I
T
 
C
T
 
K
K
 
E
H
 
K
N
 
D
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
I
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
S
 
T
G
 
G
C
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
G
 
G
T
 
E
L
 
F
F
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
E
 
Q
L
 
H
S
 
F
G
 
N
I
 
L
E
 
K
P
 
P
D
 
D
V
 
V
M
 
I
T
 
A
L
 
L
A
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
L
G
 
G
S
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
I
L
 
L
C
 
A
K
 
R
K
 
E
H
 
E
V
 
V
-
 
A
E
 
Q
V
 
S
F
 
F
E
 
T
A
 
P
G
 
G
D
 
S
Q
 
H
G
 
G
G
 
S
T
|
T
Y
 
F
N
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
M
 
A
T
 
C
A
 
R
A
 
A
G
 
G
Y
 
T
S
 
V
V
 
V
I
 
V
S
 
D
Q
 
E
L
 
V
T
 
E
A
 
K
P
 
-
G
 
-
F
 
L
L
 
L
E
 
P
G
 
H
V
 
V
R
 
R
A
 
E
R
 
V
G
 
G
E
 
N
Y
 
Y
L
 
F
R
 
K
T
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
G
A
 
K
E
 
G
R
 
K
G
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
V
R
 
K
G
 
G
E
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
M
R
 
L
A
 
G
L
 
L
L
 
E
L
 
L
G
 
E
K
 
R
D
 
E
I
 
C
G
 
K
N
 
D
Q
 
Y
I
 
V
V
 
L
E
 
K
K
 
A
A
 
L
R
 
E
L
 
-
M
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
I
N
 
N
A
 
C
A
 
T
R
 
A
P
 
G
N
 
K
L
 
V
L
 
L
R
 
R
F
 
F
M
 
L
P
 
P
A
 
P
L
 
L
N
 
I
V
 
I
S
 
Q
T
 
K
E
 
E
E
 
H
I
 
I
D
 
D
Q
 
R
M
 
A
M
 
I
S
 
S
M
 
V
L
 
L
R
 
R
S
 
E
I
 
I
L
 
L

4addA Structural and functional study of succinyl-ornithine transaminase from e. Coli (see paper)
42% identity, 96% coverage: 2:380/394 of query aligns to 7:384/400 of 4addA

query
sites
4addA
N
 
N
F
 
F
N
 
D
E
 
E
Y
 
W
P
 
-
I
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
M
M
 
I
Y
 
P
I
 
V
T
x
Y
N
 
A
R
 
P
P
 
A
E
 
P
I
 
F
V
 
I
F
 
P
T
 
V
H
 
R
G
 
G
K
 
E
G
 
G
S
 
S
W
 
R
L
 
L
Y
 
W
D
 
D
N
 
Q
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
E
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
F
 
F
I
 
A
Q
 
G
G
 
G
W
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
N
S
 
A
L
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
A
N
 
H
D
 
P
G
 
E
V
 
L
I
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
N
Q
 
E
Q
 
Q
A
 
A
R
 
S
T
 
K
L
 
F
I
 
W
N
 
H
P
 
T
S
 
G
P
 
N
A
 
G
F
 
Y
Y
 
T
N
 
N
E
 
E
P
 
P
M
 
V
A
 
L
K
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
K
L
 
K
L
 
L
T
 
I
Q
 
D
H
 
A
S
 
T
C
 
F
F
 
A
D
 
D
K
 
R
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
C
N
 
N
S
 
S
G
|
G
A
|
A
E
 
E
A
 
A
N
 
N
E
 
E
G
 
A
A
 
A
I
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
K
 
K
Y
 
F
G
 
A
K
 
H
-
 
D
K
 
R
F
 
Y
K
 
G
N
 
S
G
 
H
A
 
K
Y
 
S
E
 
G
I
 
I
I
 
V
T
 
A
F
 
F
D
 
K
H
 
N
S
 
A
F
|
F
H
|
H
G
 
G
R
|
R
T
 
T
L
 
L
A
 
F
T
 
T
M
 
V
S
 
S
A
 
A
S
 
G
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
G
 
A
W
 
Y
D
 
S
T
 
Q
I
 
D
Y
 
F
A
 
A
P
 
P
Q
 
L
V
 
P
P
 
A
G
 
D
F
 
I
P
 
R
K
 
H
A
 
A
E
 
A
L
 
Y
N
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
N
S
 
S
V
 
A
E
 
S
K
 
A
L
 
L
I
 
I
N
 
D
D
 
D
K
 
S
T
 
T
I
 
C
A
 
A
V
 
V
M
 
I
L
 
V
E
|
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
S
R
 
N
E
 
A
F
 
F
M
 
L
Q
 
Q
Q
 
G
L
 
L
R
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
C
T
 
N
K
 
R
H
 
H
N
 
N
L
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
F
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
S
 
T
G
 
G
C
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
T
G
 
G
T
 
E
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
E
 
M
L
 
H
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
E
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
L
M
 
L
T
 
T
L
 
T
A
 
A
K
|
K
G
 
A
I
 
L
G
 
G
S
 
G
G
 
G
V
 
F
P
 
P
L
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
C
 
A
K
 
T
K
 
E
H
 
E
V
 
C
-
 
A
E
 
R
V
 
V
F
 
M
E
 
T
A
 
V
G
 
G
D
 
T
Q
 
H
G
 
G
G
 
T
T
|
T
Y
 
Y
N
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
M
 
A
T
 
S
A
 
A
A
 
V
G
 
A
Y
 
G
S
 
K
V
 
V
I
 
L
S
 
E
Q
 
L
L
 
I
T
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
E
F
 
M
L
 
L
E
 
N
G
 
G
V
 
V
R
 
K
A
 
Q
R
 
R
G
 
H
E
 
D
Y
 
W
L
 
F
R
 
V
T
 
E
K
 
R
L
 
L
L
 
N
E
 
T
L
 
I
S
 
N
A
 
H
E
 
R
R
 
Y
G
 
G
F
 
L
E
 
F
G
 
S
E
 
E
-
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
R
 
I
A
 
G
L
 
C
L
 
V
L
 
L
G
 
N
K
 
A
D
 
D
I
 
Y
G
 
A
N
 
G
Q
 
Q
I
 
A
V
 
K
E
 
Q
K
 
I
A
 
S
R
 
Q
L
 
E
M
 
A
Q
 
A
P
 
K
D
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
M
L
 
V
N
 
L
A
 
I
A
 
A
R
 
G
P
 
G
N
 
N
L
 
V
L
 
V
R
|
R
F
 
F
M
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
N
V
 
V
S
 
S
T
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
V

4adbB Structural and functional study of succinyl-ornithine transaminase from e. Coli (see paper)
42% identity, 96% coverage: 2:380/394 of query aligns to 7:384/401 of 4adbB

query
sites
4adbB
N
 
N
F
 
F
N
 
D
E
 
E
Y
 
W
P
 
-
I
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
M
M
 
I
Y
 
P
I
 
V
T
 
Y
N
 
A
R
 
P
P
 
A
E
 
P
I
 
F
V
 
I
F
 
P
T
 
V
H
 
R
G
 
G
K
 
E
G
 
G
S
 
S
W
 
R
L
 
L
Y
 
W
D
 
D
N
 
Q
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
E
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
F
 
F
I
 
A
Q
 
G
G
 
G
W
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
N
S
 
A
L
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
A
N
 
H
D
 
P
G
 
E
V
 
L
I
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
N
Q
 
E
Q
 
Q
A
 
A
R
 
S
T
 
K
L
 
F
I
 
W
N
 
H
P
 
T
S
 
G
P
 
N
A
 
G
F
 
Y
Y
 
T
N
 
N
E
 
E
P
 
P
M
 
V
A
 
L
K
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
K
L
 
K
L
 
L
T
 
I
Q
 
D
H
 
A
S
 
T
C
 
F
F
 
A
D
 
D
K
 
R
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
C
N
 
N
S
|
S
G
|
G
A
|
A
E
 
E
A
 
A
N
 
N
E
 
E
G
 
A
A
 
A
I
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
K
 
K
Y
 
F
G
 
A
K
 
H
-
 
D
K
 
R
F
 
Y
K
 
G
N
 
S
G
 
H
A
 
K
Y
 
S
E
 
G
I
 
I
I
 
V
T
 
A
F
 
F
D
 
K
H
 
N
S
 
A
F
|
F
H
|
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
F
T
 
T
M
 
V
S
 
S
A
 
A
S
 
G
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
G
 
A
W
 
Y
D
 
S
T
 
Q
I
 
D
Y
 
F
A
 
A
P
 
P
Q
 
L
V
 
P
P
 
A
G
 
D
F
 
I
P
 
R
K
 
H
A
 
A
E
 
A
L
 
Y
N
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
N
S
 
S
V
 
A
E
 
S
K
 
A
L
 
L
I
 
I
N
 
D
D
 
D
K
 
S
T
 
T
I
 
C
A
 
A
V
 
V
M
 
I
L
 
V
E
|
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
S
R
 
N
E
 
A
F
 
F
M
 
L
Q
 
Q
Q
 
G
L
 
L
R
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
C
T
 
N
K
 
R
H
 
H
N
 
N
L
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
F
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
S
 
T
G
 
G
C
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
T
G
 
G
T
 
E
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
E
 
M
L
 
H
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
E
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
L
M
 
L
T
 
T
L
 
T
A
 
A
K
|
K
G
 
A
I
 
L
G
 
G
S
 
G
G
 
G
V
 
F
P
 
P
L
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
C
 
A
K
 
T
K
 
E
H
 
E
V
 
C
-
 
A
E
 
R
V
 
V
F
 
M
E
 
T
A
 
V
G
 
G
D
 
T
Q
 
H
G
 
G
G
 
T
T
|
T
Y
 
Y
N
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
M
 
A
T
 
S
A
 
A
A
 
V
G
 
A
Y
 
G
S
 
K
V
 
V
I
 
L
S
 
E
Q
 
L
L
 
I
T
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
E
F
 
M
L
 
L
E
 
N
G
 
G
V
 
V
R
 
K
A
 
Q
R
 
R
G
 
H
E
 
D
Y
 
W
L
 
F
R
 
V
T
 
E
K
 
R
L
 
L
L
 
N
E
 
T
L
 
I
S
 
N
A
 
H
E
 
R
R
 
Y
G
 
G
F
 
L
E
 
F
G
 
S
E
 
E
-
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
R
 
I
A
 
G
L
 
C
L
 
V
L
 
L
G
 
N
K
 
A
D
 
D
I
 
Y
G
 
A
N
 
G
Q
 
Q
I
 
A
V
 
K
E
 
Q
K
 
I
A
 
S
R
 
Q
L
 
E
M
 
A
Q
 
A
P
 
K
D
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
M
L
 
V
N
 
L
A
 
I
A
 
A
R
 
G
P
 
G
N
 
N
L
 
V
L
 
V
R
|
R
F
 
F
M
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
N
V
 
V
S
 
S
T
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
V

2eh6A Crystal structure of acetylornithine aminotransferase from aquifex aeolicus vf5
42% identity, 97% coverage: 11:391/394 of query aligns to 3:375/375 of 2eh6A

query
sites
2eh6A
L
 
L
M
 
M
Y
 
N
I
 
N
T
 
Y
N
 
A
R
 
R
P
 
L
E
 
P
I
 
V
V
 
K
F
 
F
T
 
V
H
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
G
S
 
V
W
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
N
 
E
T
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
V
Q
 
S
G
 
G
W
 
I
A
 
G
V
 
V
N
 
N
S
 
S
L
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
A
N
 
Y
D
 
P
G
 
K
V
 
L
I
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
E
Q
 
Q
A
 
V
R
 
E
T
 
K
L
 
L
I
 
L
N
 
H
P
 
V
S
 
S
P
 
N
A
 
L
F
 
Y
Y
 
E
N
 
N
E
 
P
P
 
W
M
 
Q
A
 
E
K
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
H
L
 
K
L
 
L
T
 
V
Q
 
K
H
 
H
S
 
F
C
 
W
F
 
T
D
 
E
-
 
G
K
 
K
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
A
N
 
N
S
 
S
G
|
G
A
x
T
E
 
E
A
 
S
N
 
V
E
 
E
G
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
K
 
K
Y
 
Y
G
 
W
K
 
R
K
 
D
F
 
K
K
 
G
N
 
K
G
 
N
A
 
K
Y
 
W
E
 
K
I
 
F
I
 
I
T
 
S
F
 
F
D
 
E
H
 
N
S
 
S
F
|
F
H
|
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
Y
A
 
G
T
 
S
M
 
L
S
 
S
A
 
A
S
 
T
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
G
 
K
W
 
F
D
 
H
T
 
K
I
 
G
Y
 
F
A
 
E
P
 
P
Q
 
L
V
 
V
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
S
K
 
Y
A
 
A
E
 
K
L
 
L
N
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
D
S
 
S
V
 
V
E
 
Y
K
 
K
L
 
L
I
 
L
N
 
D
D
 
E
K
 
E
T
 
T
I
 
A
A
 
G
V
 
I
M
 
I
L
 
I
E
|
E
P
 
V
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
N
P
 
E
A
 
A
T
 
S
R
 
E
E
 
D
F
 
F
M
 
L
Q
 
S
Q
 
K
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
L
 
I
T
 
C
T
 
K
K
 
E
H
 
K
N
 
D
L
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
I
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
S
 
T
G
 
G
C
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
G
 
G
T
 
E
L
 
F
F
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
E
 
Q
L
 
H
S
 
F
G
 
N
I
 
L
E
 
K
P
 
P
D
 
D
V
 
V
M
 
I
T
 
A
L
 
L
A
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
L
G
 
G
S
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
I
L
 
L
C
 
A
K
 
R
K
 
E
H
 
E
V
 
V
-
 
A
E
 
Q
V
 
S
F
 
F
E
 
T
A
 
P
G
 
G
D
 
S
Q
 
H
G
 
G
G
 
S
T
|
T
Y
 
F
N
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
M
 
A
T
 
C
A
 
R
A
 
A
G
 
G
Y
 
T
S
 
V
V
 
V
I
 
V
S
 
D
Q
 
E
L
 
V
T
 
E
A
 
K
P
 
-
G
 
-
F
 
L
L
 
L
E
 
P
G
 
H
V
 
V
R
 
R
A
 
E
R
 
V
G
 
G
E
 
N
Y
 
Y
L
 
F
R
 
K
T
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
G
A
 
K
E
 
G
R
 
K
G
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
V
R
 
K
G
 
G
E
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
M
R
 
L
A
 
G
L
 
L
L
 
E
L
 
L
G
 
E
K
 
R
D
 
E
I
 
C
G
 
K
N
 
D
Q
 
Y
I
 
V
V
 
L
E
 
K
K
 
A
A
 
L
R
 
E
L
 
-
M
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
I
N
 
N
A
 
C
A
 
T
R
 
A
P
 
G
N
 
K
L
 
V
L
 
L
R
|
R
F
 
F
M
 
L
P
 
P
A
 
P
L
 
L
N
 
I
V
 
I
S
 
Q
T
 
K
E
 
E
E
 
H
I
 
I
D
 
D
Q
 
R
M
 
A
M
 
I
S
 
S
M
 
V
L
 
L
R
 
R
S
 
E
I
 
I
L
 
L

3nx3A Crystal structure of acetylornithine aminotransferase (argd) from campylobacter jejuni
41% identity, 96% coverage: 17:394/394 of query aligns to 10:388/388 of 3nx3A

query
sites
3nx3A
R
 
R
P
 
F
E
 
D
I
 
I
V
 
V
F
 
L
T
 
E
H
 
K
G
 
G
K
 
Q
G
 
G
S
 
V
W
 
Y
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
N
 
D
T
 
K
G
 
A
K
 
K
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
F
I
 
S
Q
 
S
G
 
G
W
 
I
A
 
G
V
 
V
N
 
C
S
 
A
L
 
L
G
 
G
H
 
Y
C
 
N
N
 
H
D
 
A
G
 
K
V
 
F
I
 
N
E
 
A
A
 
K
L
 
I
T
 
K
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
V
R
 
D
T
 
K
L
 
L
I
 
L
N
 
H
P
 
T
S
 
S
P
 
N
A
 
L
F
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
E
 
E
P
 
N
M
 
I
A
 
A
K
 
A
L
 
A
A
 
A
G
 
K
L
 
N
L
 
L
T
 
A
Q
 
K
H
 
A
S
 
S
C
 
A
F
 
L
D
 
E
K
 
R
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
T
N
 
N
S
 
S
G
 
G
A
 
T
E
 
E
A
 
S
N
 
I
E
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
M
K
 
K
L
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
K
Y
 
Y
G
 
A
-
 
F
-
 
N
K
 
K
K
 
G
F
 
V
K
 
K
N
 
G
G
 
G
A
 
Q
Y
 
F
E
 
-
I
 
-
I
 
I
T
 
A
F
 
F
D
 
K
H
 
H
S
 
S
F
|
F
H
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
G
T
 
A
M
 
L
S
 
S
A
 
L
S
 
T
G
 
A
K
 
N
P
 
E
G
 
K
W
 
Y
D
 
Q
T
 
K
I
 
P
Y
 
F
A
 
K
P
 
P
Q
 
L
V
 
I
P
 
S
G
 
G
F
 
V
P
 
K
K
 
F
A
 
A
E
 
K
L
 
Y
N
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
S
S
 
S
V
 
V
E
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
V
N
 
N
D
 
E
K
 
K
T
 
T
I
 
C
A
 
A
V
 
I
M
 
I
L
 
L
E
|
E
P
 
S
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
N
P
 
P
A
 
A
T
x
N
R
 
K
E
 
D
F
|
F
M
 
Y
Q
 
K
Q
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
K
L
 
L
T
 
C
T
 
D
K
 
E
H
 
K
N
 
D
L
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
A
D
|
D
E
 
E
V
 
I
Q
|
Q
S
 
C
G
 
G
C
 
M
G
 
G
R
 
R
A
 
S
G
 
G
T
 
K
L
 
F
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
L
 
H
S
 
A
G
 
Q
I
 
I
E
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
I
M
 
M
T
 
T
L
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
A
I
 
L
G
 
G
S
 
C
G
 
G
V
 
L
P
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
F
L
 
V
C
 
I
K
 
N
K
 
Q
H
 
K
V
 
V
-
 
A
-
 
S
E
 
N
V
 
S
F
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
D
Q
 
H
G
 
G
G
 
S
T
|
T
Y
 
Y
N
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
M
 
V
T
 
C
A
 
A
A
 
G
G
 
V
Y
 
N
S
 
A
V
 
V
I
 
F
S
 
E
Q
 
I
L
 
F
T
 
K
A
 
E
P
 
E
G
 
K
F
 
I
L
 
L
E
 
E
G
 
N
V
 
V
R
 
N
A
 
K
R
 
L
G
 
T
E
 
P
Y
 
Y
L
 
L
R
 
E
T
 
Q
K
 
S
L
 
L
L
 
D
E
 
E
L
 
L
S
x
I
A
 
N
E
 
E
R
x
F
G
x
D
F
 
F
E
x
C
G
 
K
E
 
K
R
 
R
-
 
K
G
 
G
E
 
L
G
 
G
L
 
F
L
 
M
R
 
Q
A
 
G
L
 
L
L
 
S
L
 
L
G
 
D
K
 
K
D
 
S
I
 
V
G
 
-
N
 
-
Q
 
K
I
 
V
V
 
A
E
 
K
K
 
V
A
 
I
R
 
Q
L
 
K
M
 
C
Q
 
Q
P
 
E
D
 
N
G
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
N
 
I
A
 
S
A
 
C
R
 
G
P
 
E
N
 
N
L
 
D
L
 
L
R
|
R
F
 
F
M
 
L
P
 
P
A
 
P
L
 
L
N
 
I
V
 
L
S
x
Q
T
x
K
E
 
E
E
 
H
I
 
I
D
 
D
Q
 
E
M
 
M
M
 
S
S
 
E
M
 
K
L
 
L
R
 
R
S
 
K
I
 
A
L
 
L
D
 
K
T
 
S
L
 
F

Q9M8M7 Acetylornithine aminotransferase, chloroplastic/mitochondrial; ACOAT; Acetylornithine transaminase; AOTA; Protein HOPW1-1-INTERACTING 1; EC 2.6.1.11 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
40% identity, 96% coverage: 17:394/394 of query aligns to 75:456/457 of Q9M8M7

query
sites
Q9M8M7
R
 
R
P
 
A
E
 
P
I
 
V
V
 
V
F
 
L
T
 
S
H
 
S
G
 
G
K
 
K
G
 
G
S
 
C
W
 
K
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
N
 
P
T
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
F
 
C
I
 
A
Q
 
S
G
 
G
W
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
N
S
 
A
L
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
G
N
 
D
D
 
P
G
 
D
V
 
W
I
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
V
T
 
T
Q
 
E
Q
 
Q
A
 
A
R
 
G
T
 
V
L
 
L
I
 
A
N
 
H
P
 
V
S
 
S
P
 
N
A
 
V
F
 
Y
Y
 
Y
N
 
T
E
 
I
P
 
P
M
 
Q
A
 
I
K
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
K
L
 
R
L
 
L
T
 
V
Q
 
A
H
 
S
S
 
S
C
 
F
F
 
A
D
 
D
K
 
R
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
C
N
 
N
S
 
S
G
 
G
A
 
T
E
 
E
A
 
A
N
 
N
E
 
E
G
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
K
L
 
F
A
 
S
R
 
R
K
 
K
Y
 
F
G
 
-
K
 
Q
K
 
R
F
 
F
-
 
T
-
 
H
-
 
P
-
 
E
-
 
D
K
 
K
N
 
E
G
 
V
A
 
A
Y
 
T
E
 
G
I
 
F
I
 
I
T
 
A
F
 
F
D
 
T
H
 
N
S
 
S
F
 
F
H
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
G
T
 
A
M
 
L
S
 
A
A
 
L
S
 
T
G
 
S
K
 
K
P
 
E
G
 
Q
W
 
Y
D
 
R
T
 
T
I
 
P
Y
 
F
A
 
E
P
 
P
Q
 
I
V
 
M
P
 
P
G
 
G
F
 
V
P
 
T
K
 
F
A
 
L
E
 
E
L
 
Y
N
 
G
D
 
N
I
 
I
A
 
Q
S
 
A
V
 
A
E
 
T
K
 
D
L
 
L
I
 
I
N
 
R
D
 
S
-
 
G
K
 
K
T
 
I
I
 
A
A
 
A
V
 
V
M
 
F
L
 
V
E
 
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
Y
P
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
K
E
 
E
F
 
F
M
 
L
Q
 
Q
Q
 
S
L
 
L
R
 
R
E
 
S
L
 
A
T
 
C
T
 
D
K
 
A
H
 
A
N
 
G
L
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
V
V
 
F
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
S
 
C
G
 
G
C
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
T
G
 
G
T
 
L
L
 
M
F
 
W
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
L
 
A
S
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
I
M
 
M
T
 
T
L
 
V
A
 
A
K
 
K
G
 
P
I
 
L
G
 
A
S
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
V
L
 
L
C
 
V
K
 
T
K
 
E
H
 
K
V
 
V
-
 
A
E
 
E
V
 
T
F
 
I
E
 
N
A
 
Y
G
 
G
D
 
D
Q
 
H
G
 
G
G
 
S
T
 
T
Y
 
F
N
 
A
G
 
G
N
 
S
P
 
P
L
 
L
M
 
V
T
 
C
A
 
S
A
 
A
G
 
A
Y
 
I
S
 
A
V
 
V
I
 
M
S
 
D
Q
 
K
L
 
V
T
 
S
A
 
K
P
 
P
G
 
S
F
 
F
L
 
L
E
 
S
G
 
S
V
 
V
R
 
S
A
 
N
R
 
K
G
 
G
E
 
R
Y
 
Y
L
 
F
R
 
R
T
 
D
K
 
L
L
 
L
L
 
V
-
 
K
E
 
K
L
 
L
S
 
G
A
 
G
E
 
N
R
 
S
G
 
H
F
 
V
E
 
K
G
 
E
E
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
I
R
 
I
A
 
G
L
 
V
L
 
E
L
 
L
G
 
-
K
 
-
D
 
D
I
 
V
-
 
P
G
 
A
N
 
S
Q
 
S
I
 
L
V
 
V
E
 
D
K
 
A
A
 
C
R
 
R
L
 
-
M
 
-
Q
 
D
P
 
S
D
 
G
G
 
L
L
 
L
L
 
I
L
 
L
N
 
T
A
 
A
A
 
G
R
 
K
P
 
G
N
 
N
L
 
V
L
 
V
R
 
R
F
 
I
M
 
V
P
 
P
A
 
P
L
 
L
N
 
V
V
 
I
S
 
S
T
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
I
D
 
E
Q
 
R
M
 
A
M
 
V
S
 
E
M
 
I
L
 
M
R
 
S
S
 
Q
I
 
N
L
 
L
D
 
T
T
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4jevB N-acetylornithine aminotransferase from s. Typhimurium complexed with gabaculine
39% identity, 91% coverage: 25:384/394 of query aligns to 26:388/402 of 4jevB

query
sites
4jevB
G
 
G
K
 
K
G
 
G
S
 
S
W
 
R
L
 
V
Y
 
W
D
 
D
N
 
Q
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
E
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
F
 
F
I
 
A
Q
 
G
G
 
G
W
x
I
A
 
A
V
 
V
N
 
T
S
 
A
L
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
C
N
 
H
D
 
P
G
 
A
V
 
L
I
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
S
Q
 
Q
A
 
G
R
 
E
T
 
T
L
 
L
I
 
W
N
 
H
P
 
T
S
 
S
P
 
N
A
 
V
F
 
F
Y
 
T
N
 
N
E
 
E
P
 
P
M
 
A
A
 
L
K
 
R
L
 
L
A
 
G
G
 
R
L
 
K
L
 
L
T
 
I
Q
 
D
H
 
A
S
 
T
C
 
F
F
 
A
D
 
E
K
 
R
V
 
V
F
 
L
F
 
F
T
 
M
N
 
N
S
|
S
G
|
G
A
x
T
E
 
E
A
 
A
N
 
N
E
 
E
G
 
T
A
 
A
I
 
F
K
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
K
 
H
Y
 
Y
G
 
A
-
 
C
-
 
V
-
 
R
-
 
H
K
 
S
K
 
P
F
 
F
K
 
K
N
 
T
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
K
I
 
I
I
 
I
T
 
A
F
 
F
D
 
H
H
 
N
S
 
A
F
|
F
H
|
H
G
 
G
R
 
R
T
 
S
L
 
L
A
 
F
T
 
T
M
 
V
S
 
S
A
 
V
S
 
G
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
G
 
K
W
 
Y
D
 
S
T
 
D
I
 
G
Y
 
F
A
 
G
P
 
P
Q
 
K
V
 
P
P
 
A
G
 
D
F
 
I
P
 
I
K
 
H
A
 
V
E
 
P
L
 
F
N
 
N
D
 
D
I
 
L
A
 
H
S
 
A
V
 
V
E
 
K
K
 
A
L
 
V
I
 
M
N
 
D
D
 
D
K
 
H
T
 
T
I
 
C
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
V
E
|
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
Q
P
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
P
E
 
E
F
 
F
M
 
L
Q
 
K
Q
 
G
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
L
T
 
C
T
 
D
K
 
E
H
 
H
N
 
Q
L
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
V
V
 
F
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
S
 
C
G
 
G
C
 
M
G
 
G
R
 
R
A
 
T
G
 
G
T
 
D
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
E
 
M
L
 
H
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
E
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
I
M
 
L
T
 
T
L
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
A
I
 
L
G
 
G
S
 
G
G
 
G
V
 
F
P
 
P
L
 
V
G
 
S
A
 
A
L
 
M
L
 
L
C
 
T
K
 
T
K
 
Q
H
 
E
V
 
I
-
 
A
E
 
S
V
 
A
F
 
F
E
 
H
A
 
V
G
 
G
D
 
S
Q
 
H
G
 
G
G
 
S
T
|
T
Y
 
Y
N
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
M
 
A
T
 
C
A
 
A
A
 
V
G
 
A
Y
 
G
S
 
A
V
 
T
I
 
F
S
 
D
Q
 
I
L
 
I
T
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
H
A
 
T
R
 
K
G
 
R
E
 
Q
Y
 
Q
L
 
F
R
 
V
T
 
Q
K
 
H
L
 
L
L
 
Q
E
 
A
L
 
I
S
 
D
A
 
E
E
 
Q
R
 
F
G
 
D
-
 
I
F
 
F
E
 
S
G
 
D
E
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
M
G
 
G
L
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
L
L
 
I
G
 
G
K
 
A
D
 
E
I
 
L
G
 
K
N
 
P
Q
 
K
I
 
Y
V
 
K
E
 
G
K
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
D
M
 
F
Q
 
L
P
 
Y
D
 
A
G
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
V
L
 
M
L
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
G
R
 
-
P
 
A
N
 
D
L
 
V
L
 
M
R
|
R
F
 
F
M
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
N
 
V
V
 
V
S
 
E
T
 
E
E
 
A
E
 
D
I
 
I
D
 
H
Q
 
E
M
 
G
M
 
M

P40732 Acetylornithine/succinyldiaminopimelate aminotransferase; ACOAT; DapATase; Succinyldiaminopimelate transferase; EC 2.6.1.11; EC 2.6.1.17 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
39% identity, 91% coverage: 25:384/394 of query aligns to 31:393/405 of P40732

query
sites
P40732
G
 
G
K
 
K
G
 
G
S
 
S
W
 
R
L
 
V
Y
 
W
D
 
D
N
 
Q
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
E
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
F
 
F
I
 
A
Q
 
G
G
 
G
W
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
T
S
 
A
L
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
C
N
 
H
D
 
P
G
 
A
V
 
L
I
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
S
Q
 
Q
A
 
G
R
 
E
T
 
T
L
 
L
I
 
W
N
 
H
P
 
T
S
 
S
P
 
N
A
 
V
F
 
F
Y
 
T
N
 
N
E
 
E
P
 
P
M
 
A
A
 
L
K
 
R
L
 
L
A
 
G
G
 
R
L
 
K
L
 
L
T
 
I
Q
 
D
H
 
A
S
 
T
C
 
F
F
 
A
D
 
E
K
 
R
V
 
V
F
 
L
F
 
F
T
 
M
N
 
N
S
 
S
G
|
G
A
x
T
E
 
E
A
 
A
N
 
N
E
 
E
G
 
T
A
 
A
I
 
F
K
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
K
 
H
Y
 
Y
G
 
A
-
 
C
-
 
V
-
 
R
-
 
H
K
 
S
K
 
P
F
 
F
K
 
K
N
 
T
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
K
I
 
I
I
 
I
T
 
A
F
 
F
D
 
H
H
 
N
S
 
A
F
 
F
H
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
S
L
 
L
A
 
F
T
 
T
M
 
V
S
 
S
A
 
V
S
 
G
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
G
 
K
W
 
Y
D
 
S
T
 
D
I
 
G
Y
 
F
A
 
G
P
 
P
Q
 
K
V
 
P
P
 
A
G
 
D
F
 
I
P
 
I
K
 
H
A
 
V
E
 
P
L
 
F
N
 
N
D
 
D
I
 
L
A
 
H
S
 
A
V
 
V
E
 
K
K
 
A
L
 
V
I
 
M
N
 
D
D
 
D
K
 
H
T
 
T
I
 
C
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
V
E
 
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
Q
P
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
P
E
 
E
F
 
F
M
 
L
Q
 
K
Q
 
G
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
L
T
 
C
T
 
D
K
 
E
H
 
H
N
 
Q
L
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
V
V
 
F
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
S
 
C
G
 
G
C
 
M
G
 
G
R
 
R
A
 
T
G
 
G
T
 
D
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
E
 
M
L
 
H
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
E
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
I
M
 
L
T
 
T
L
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
A
I
 
L
G
 
G
S
 
G
G
 
G
V
 
F
P
 
P
L
 
V
G
 
S
A
 
A
L
 
M
L
 
L
C
 
T
K
 
T
K
 
Q
H
 
E
V
 
I
-
 
A
E
 
S
V
 
A
F
 
F
E
 
H
A
 
V
G
 
G
D
 
S
Q
 
H
G
 
G
G
 
S
T
|
T
Y
 
Y
N
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
M
 
A
T
 
C
A
 
A
A
 
V
G
 
A
Y
 
G
S
 
A
V
 
A
I
 
F
S
 
D
Q
 
I
L
 
I
T
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
H
A
 
T
R
 
K
G
 
R
E
 
Q
Y
 
Q
L
 
F
R
 
V
T
 
Q
K
 
H
L
 
L
L
 
Q
E
 
A
L
 
I
S
 
D
A
 
E
E
 
Q
R
 
F
G
 
D
-
 
I
F
 
F
E
 
S
G
 
D
E
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
M
G
 
G
L
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
L
L
 
I
G
 
G
K
 
A
D
 
E
I
 
L
G
 
K
N
 
P
Q
 
K
I
 
Y
V
 
K
E
 
G
K
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
D
M
 
F
Q
 
L
P
 
Y
D
 
A
G
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
V
L
 
M
L
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
G
R
 
-
P
 
A
N
 
D
L
 
V
L
 
M
R
 
R
F
 
F
M
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
N
 
V
V
 
V
S
 
E
T
 
E
E
 
A
E
 
D
I
 
I
D
 
H
Q
 
E
M
 
G
M
 
M

2pb0A Structure of biosynthetic n-acetylornithine aminotransferase from salmonella typhimurium: studies on substrate specificity and inhibitor binding (see paper)
38% identity, 91% coverage: 25:384/394 of query aligns to 20:377/389 of 2pb0A

query
sites
2pb0A
G
 
G
K
 
K
G
 
G
S
 
S
W
 
R
L
 
V
Y
 
W
D
 
D
N
 
Q
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
E
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
F
 
F
I
 
A
Q
 
G
G
 
G
W
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
T
S
 
A
L
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
C
N
 
H
D
 
P
G
 
A
V
 
L
I
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
S
Q
 
Q
A
 
G
R
 
E
T
 
T
L
 
L
I
 
W
N
 
H
P
 
T
S
 
S
P
 
N
A
 
V
F
 
F
Y
 
T
N
 
N
E
 
E
P
 
P
M
 
A
A
 
L
K
 
R
L
 
L
A
 
G
G
 
R
L
 
K
L
 
L
T
 
I
Q
 
D
H
 
A
S
 
T
C
 
F
F
 
A
D
 
E
K
 
R
V
 
V
F
 
L
F
 
F
T
 
M
N
 
N
S
|
S
G
|
G
A
x
T
E
 
E
A
 
A
N
 
N
E
 
E
G
 
T
A
 
A
I
 
F
K
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
K
 
H
Y
 
Y
G
 
A
-
 
C
-
 
V
-
 
R
-
 
H
K
 
S
K
 
P
F
 
F
K
 
K
N
 
T
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
K
I
 
I
I
 
I
T
 
A
F
 
F
D
 
H
H
 
N
S
 
A
F
|
F
H
|
H
G
 
G
R
 
R
T
 
S
L
 
L
A
 
F
T
 
T
M
 
V
S
 
S
A
 
V
S
 
G
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
G
 
K
W
 
Y
D
 
S
T
 
D
I
 
G
Y
 
F
A
 
G
P
 
P
Q
 
K
V
 
P
P
 
A
G
 
D
F
 
I
P
 
I
K
 
H
A
 
V
E
 
P
L
 
F
N
 
N
D
 
D
I
 
L
A
 
H
S
 
A
V
 
V
E
 
K
K
 
A
L
 
V
I
 
M
N
 
D
D
 
D
K
 
H
T
 
T
I
 
C
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
V
E
|
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
Q
P
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
P
E
 
E
F
 
F
M
 
L
Q
 
K
Q
 
G
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
L
T
 
C
T
 
D
K
 
E
H
 
H
N
 
Q
L
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
V
V
 
F
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
S
 
C
G
 
G
C
 
M
G
 
G
R
 
R
A
 
T
G
 
G
T
 
D
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
E
 
M
L
 
H
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
E
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
I
M
 
L
T
 
T
L
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
A
I
 
L
G
 
G
S
 
G
G
 
G
V
 
F
P
 
P
L
 
V
G
 
S
A
 
A
L
 
M
L
 
L
C
 
T
K
 
T
K
 
Q
H
 
E
V
 
I
E
 
-
V
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
A
G
 
S
D
 
A
Q
 
F
G
 
G
G
 
S
T
|
T
Y
 
Y
N
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
M
 
A
T
 
C
A
 
A
A
 
V
G
 
A
Y
 
G
S
 
A
V
 
A
I
 
F
S
 
D
Q
 
I
L
 
I
T
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
H
A
 
T
R
 
K
G
 
R
E
 
Q
Y
 
Q
L
 
F
R
 
V
T
 
Q
K
 
H
L
 
L
L
 
Q
E
 
A
L
 
I
S
 
D
A
 
E
E
 
Q
R
 
F
G
 
D
-
 
I
F
 
F
E
 
S
G
 
D
E
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
M
G
 
G
L
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
L
L
 
I
G
 
G
K
 
A
D
 
E
I
 
L
G
 
K
N
 
P
Q
 
K
I
 
Y
V
 
K
E
 
G
K
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
D
M
 
F
Q
 
L
P
 
Y
D
 
A
G
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
V
L
 
M
L
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
G
R
 
-
P
 
A
N
 
D
L
 
V
L
 
M
R
|
R
F
 
F
M
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
N
 
V
V
 
V
S
 
E
T
 
E
E
 
A
E
 
D
I
 
I
D
 
H
Q
 
E
M
 
G
M
 
M

4jewA N-acetylornithine aminotransferase from s. Typhimurium complexed with l-canaline
38% identity, 91% coverage: 25:384/394 of query aligns to 26:383/397 of 4jewA

query
sites
4jewA
G
 
G
K
|
K
G
 
G
S
 
S
W
 
R
L
 
V
Y
x
W
D
 
D
N
 
Q
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
E
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
F
 
F
I
 
A
Q
 
G
G
 
G
W
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
T
S
 
A
L
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
C
N
 
H
D
 
P
G
 
A
V
 
L
I
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
S
Q
 
Q
A
 
G
R
 
E
T
 
T
L
 
L
I
 
W
N
 
H
P
 
T
S
 
S
P
 
N
A
 
V
F
 
F
Y
 
T
N
 
N
E
 
E
P
 
P
M
 
A
A
 
L
K
 
R
L
 
L
A
 
G
G
 
R
L
 
K
L
 
L
T
 
I
Q
 
D
H
 
A
S
 
T
C
 
F
F
 
A
D
 
E
K
 
R
V
 
V
F
 
L
F
 
F
T
 
M
N
 
N
S
 
S
G
|
G
A
x
T
E
 
E
A
 
A
N
 
N
E
 
E
G
 
T
A
 
A
I
 
F
K
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
K
 
H
Y
 
Y
G
 
A
-
 
C
-
 
V
-
 
R
-
 
H
K
 
S
K
 
P
F
 
F
K
 
K
N
 
T
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
K
I
 
I
I
 
I
T
 
A
F
 
F
D
 
H
H
 
N
S
 
A
F
|
F
H
|
H
G
 
G
R
|
R
T
 
S
L
 
L
A
 
F
T
 
T
M
 
V
S
 
S
A
 
V
S
 
G
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
G
 
K
W
 
Y
D
 
S
T
 
D
I
 
G
Y
 
F
A
 
G
P
 
P
Q
 
K
V
 
P
P
 
A
G
 
D
F
 
I
P
 
I
K
 
H
A
 
V
E
 
P
L
 
F
N
 
N
D
 
D
I
 
L
A
 
H
S
 
A
V
 
V
E
 
K
K
 
A
L
 
V
I
 
M
N
 
D
D
 
D
K
 
H
T
 
T
I
 
C
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
V
E
|
E
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
Q
P
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
P
E
 
E
F
 
F
M
 
L
Q
 
K
Q
 
G
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
L
T
 
C
T
 
D
K
 
E
H
 
H
N
 
Q
L
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
V
V
 
F
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
S
 
C
G
 
G
C
 
M
G
 
G
R
 
R
A
 
T
G
 
G
T
 
D
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
E
 
M
L
 
H
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
E
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
I
M
 
L
T
 
T
L
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
A
I
 
L
G
 
G
S
 
G
G
 
G
V
 
F
P
 
P
L
 
V
G
 
S
A
 
A
L
 
M
L
 
L
C
 
T
K
 
T
K
 
Q
H
 
E
V
 
I
E
 
-
V
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
A
G
 
S
D
 
A
Q
 
F
G
 
G
G
 
S
T
|
T
Y
 
Y
N
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
M
 
A
T
 
C
A
 
A
A
 
V
G
 
A
Y
 
G
S
 
A
V
 
T
I
 
F
S
 
D
Q
 
I
L
 
I
T
 
N
A
 
T
P
 
P
G
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
H
A
 
T
R
 
K
G
 
R
E
 
Q
Y
 
Q
L
 
F
R
 
V
T
 
Q
K
 
H
L
 
L
L
 
Q
E
 
A
L
 
I
S
 
D
A
 
E
E
 
Q
R
 
F
G
 
D
-
 
I
F
 
F
E
 
S
G
 
D
E
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
M
G
 
G
L
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
L
L
 
I
G
 
G
K
 
A
D
 
E
I
 
L
G
 
K
N
 
P
Q
 
K
I
 
Y
V
 
K
E
 
G
K
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
D
M
 
F
Q
 
L
P
 
Y
D
 
A
G
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
V
L
 
M
L
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
G
R
 
-
P
 
A
N
 
D
L
 
V
L
 
M
R
|
R
F
 
F
M
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
N
 
V
V
 
V
S
 
E
T
 
E
E
 
A