SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012401398.1 NCBI__GCF_000020045.1:WP_012401398.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4y96A Crystal structure of triosephosphate isomerase from gemmata obscuriglobus (see paper)
48% identity, 96% coverage: 5:252/259 of query aligns to 2:249/250 of 4y96A

query
sites
4y96A
R
 
R
A
 
K
K
 
K
L
 
F
V
 
V
V
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
T
R
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
E
N
 
A
R
 
K
V
 
A
L
 
L
L
 
G
Q
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
A
R
 
K
G
 
G
A
 
V
D
 
T
D
 
D
L
 
-
P
 
-
D
 
D
D
 
R
V
 
V
R
 
T
V
 
V
G
 
A
V
 
V
C
 
F
V
 
P
P
 
P
C
 
Y
L
 
P
Y
 
W
L
 
L
A
 
T
Q
 
A
A
 
V
Q
 
G
T
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
K
S
 
G
G
 
S
R
 
P
V
 
V
A
 
A
W
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
D
I
 
V
S
 
S
A
 
S
Y
 
E
T
 
K
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
P
E
 
A
M
 
M
A
 
L
A
 
L
E
 
E
F
 
T
G
 
G
A
 
C
T
 
K
L
 
Y
A
 
A
I
 
L
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
Y
 
I
H
 
I
R
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
E
E
 
T
V
 
F
V
 
I
A
 
N
L
 
H
K
 
K
T
 
V
Q
 
H
R
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
S
P
 
V
I
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
M
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
A
E
 
E
R
 
R
E
 
E
C
 
R
G
 
G
K
 
L
T
 
Q
E
 
E
Q
 
R
I
 
V
V
 
F
G
 
Q
E
 
R
Q
 
Q
I
 
V
D
 
Y
V
 
A
V
 
A
L
 
C
A
 
A
K
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
D
E
 
E
D
 
Q
A
 
F
A
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
A
H
 
H
A
 
A
F
 
F
L
 
V
R
 
R
A
 
S
R
 
K
L
 
L
V
 
R
A
 
L
K
 
L
G
 
Y
G
 
G
D
 
D
-
 
K
-
 
I
A
 
A
A
 
D
N
 
S
V
 
T
S
 
P
L
 
I
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
P
E
 
D
N
 
N
A
 
T
E
 
V
E
 
G
L
 
L
F
 
M
G
 
S
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
A
K
 
D
D
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
I
C
 
V
S
 
K
A
 
A
A
 
A

P36204 Bifunctional PGK/TIM; EC 2.7.2.3; EC 5.3.1.1 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
46% identity, 92% coverage: 5:242/259 of query aligns to 402:640/654 of P36204

query
sites
P36204
R
 
R
A
 
K
K
 
L
L
 
I
V
 
L
V
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
K
R
 
T
L
 
I
A
 
S
D
 
E
N
 
A
R
 
K
V
 
-
L
 
-
L
 
-
Q
 
K
A
 
F
V
 
V
S
 
S
R
 
L
G
 
L
A
 
V
D
 
N
D
 
E
L
 
L
P
 
H
D
 
D
-
 
V
-
 
K
D
 
E
V
 
F
R
 
E
V
 
I
G
 
V
V
 
V
C
 
C
V
 
P
P
 
P
C
 
F
L
 
T
Y
 
A
L
 
L
A
 
S
Q
 
E
A
 
V
Q
 
G
T
 
E
L
 
I
L
 
L
E
 
S
S
 
G
G
 
R
R
 
N
V
 
I
A
 
K
W
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
I
 
V
S
 
F
A
 
Y
Y
 
E
T
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
P
E
 
L
M
 
M
A
 
L
A
 
Q
E
 
E
F
 
I
G
 
G
A
 
V
T
 
E
L
 
Y
A
 
V
I
 
I
V
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
R
Y
 
I
H
 
F
R
 
K
E
 
E
S
 
D
A
 
D
E
 
E
V
 
F
V
 
I
A
 
N
L
 
R
K
 
K
T
 
V
Q
 
K
R
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
K
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
L
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
C
 
K
G
 
G
K
 
L
T
 
T
E
 
F
Q
 
C
I
 
V
V
 
V
G
 
E
E
 
K
Q
 
Q
I
 
V
D
 
R
V
 
E
V
 
G
L
 
F
A
 
Y
K
 
G
L
 
L
S
 
D
V
 
K
E
 
E
D
 
E
A
 
A
A
 
K
R
 
R
I
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
R
S
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
F
L
 
I
R
 
R
A
 
-
R
 
K
L
 
L
V
 
L
A
 
S
K
 
E
G
 
M
G
 
Y
D
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
T
A
 
A
A
 
G
N
 
S
V
 
I
S
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
I
K
 
K
P
 
P
E
 
D
N
 
N
A
 
F
E
 
L
E
 
G
L
 
L
F
 
I
G
 
V
Q
 
Q
P
 
K
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
E

Sites not aligning to the query:

4mvaA 1.43 angstrom resolution crystal structure of triosephosphate isomerase (tpia) from escherichia coli in complex with acetyl phosphate. (see paper)
46% identity, 98% coverage: 5:258/259 of query aligns to 2:255/255 of 4mvaA

query
sites
4mvaA
R
 
R
A
 
H
K
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
S
N
 
R
R
 
H
V
 
M
L
 
V
L
 
H
Q
 
E
A
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
N
G
 
L
A
 
R
D
 
K
D
 
E
L
 
L
P
 
A
D
 
G
-
 
V
-
 
A
D
 
G
V
 
C
R
 
A
V
 
V
G
 
A
V
 
I
C
 
A
V
 
P
P
 
P
C
 
E
L
 
M
Y
 
Y
L
 
I
A
 
D
Q
 
M
A
 
A
Q
 
K
T
 
R
L
 
E
L
 
A
E
 
E
S
 
G
G
 
S
R
 
H
V
 
I
A
 
M
W
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
I
 
V
S
 
D
A
 
L
Y
 
N
T
 
L
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
A
E
 
A
M
 
M
A
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
Q
L
 
Y
A
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
T
Y
 
Y
H
 
H
R
 
K
E
 
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
V
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
K
K
 
K
T
 
F
Q
 
A
R
 
V
A
 
L
L
 
K
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
E
E
 
A
E
 
E
R
 
N
E
 
E
C
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
E
Q
 
E
I
 
V
V
 
C
G
 
A
E
 
R
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
K
K
 
T
L
 
Q
S
 
G
V
 
A
E
 
A
D
 
A
A
 
F
A
 
E
R
 
G
I
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
K
F
 
F
L
 
I
R
 
R
A
 
D
R
 
H
L
 
I
V
 
A
A
 
K
K
 
V
G
 
D
G
 
A
D
 
N
-
 
I
A
 
A
A
 
E
N
 
Q
V
 
V
S
 
I
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
E
 
S
N
 
N
A
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
A
K
 
D
D
 
A
F
 
F
L
 
A
A
 
V
I
 
I
C
 
V
S
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
K
A
 
Q
A
 
A

B1XB85 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Escherichia coli (strain K12 / DH10B) (see paper)
46% identity, 98% coverage: 5:258/259 of query aligns to 2:255/255 of B1XB85

query
sites
B1XB85
R
 
R
A
 
H
K
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
S
N
 
R
R
 
H
V
 
M
L
 
V
L
 
H
Q
 
E
A
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
N
G
 
L
A
 
R
D
 
K
D
 
E
L
 
L
P
 
A
D
 
G
-
 
V
-
 
A
D
 
G
V
 
C
R
 
A
V
 
V
G
 
A
V
 
I
C
 
A
V
 
P
P
 
P
C
 
E
L
 
M
Y
 
Y
L
 
I
A
 
D
Q
 
M
A
 
A
Q
 
K
T
 
R
L
 
E
L
 
A
E
 
E
S
 
G
G
 
S
R
 
H
V
 
I
A
 
M
W
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
I
 
V
S
 
D
A
 
L
Y
 
N
T
 
L
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
A
E
 
A
M
 
M
A
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
Q
L
 
Y
A
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
T
Y
 
Y
H
 
H
R
 
K
E
 
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
V
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
K
K
 
K
T
 
F
Q
 
A
R
 
V
A
 
L
L
 
K
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
E
E
 
A
E
 
E
R
 
N
E
 
E
C
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
E
Q
 
E
I
 
V
V
 
C
G
 
A
E
 
R
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
K
K
 
T
L
 
Q
S
 
G
V
 
A
E
 
A
D
 
A
A
 
F
A
 
E
R
 
G
I
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
K
F
 
F
L
 
I
R
 
R
A
 
D
R
 
H
L
 
I
V
 
A
A
 
K
K
 
V
G
 
D
G
 
A
D
 
N
-
 
I
A
 
A
A
 
E
N
 
Q
V
 
V
S
 
I
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
E
 
S
N
 
N
A
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
A
K
 
D
D
 
A
F
 
F
L
 
A
A
 
V
I
 
I
C
 
V
S
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
K
A
 
Q
A
 
A

6neeB Crystal structure of a reconstructed ancestor of triosephosphate isomerase from eukaryotes (see paper)
45% identity, 95% coverage: 5:251/259 of query aligns to 4:250/252 of 6neeB

query
sites
6neeB
R
 
R
A
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
S
N
 
I
R
 
K
V
 
A
L
 
L
L
 
V
Q
 
E
A
 
T
V
 
L
S
 
N
R
 
S
G
 
A
A
 
-
D
 
-
D
 
Q
L
 
L
P
 
D
D
 
P
D
 
N
V
 
T
R
 
E
V
 
V
G
 
V
V
 
V
C
 
A
V
 
P
P
 
P
C
 
A
L
 
I
Y
 
Y
L
 
L
A
 
P
Q
 
F
A
 
A
Q
 
R
T
 
S
L
 
K
L
 
L
E
 
K
S
 
K
G
 
P
R
 
K
-
 
E
V
 
I
A
 
Q
W
 
V
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
I
 
C
S
 
Y
A
 
T
Y
 
K
T
 
P
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
A
E
 
E
M
 
M
A
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
P
L
 
W
A
 
V
I
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
T
Y
 
I
H
 
F
R
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
V
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
E
K
 
K
T
 
V
Q
 
K
R
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
K
P
 
V
I
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
C
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
M
Q
 
E
I
 
V
V
 
V
G
 
A
E
 
R
Q
 
Q
I
 
I
D
 
L
V
 
K
V
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
D
L
 
-
S
 
K
V
 
I
E
 
K
D
 
D
A
 
W
A
 
S
R
 
N
I
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
K
R
 
W
L
 
L
V
 
K
A
 
E
K
 
N
G
 
V
G
 
S
D
 
P
-
 
E
-
 
V
A
 
A
A
 
E
N
 
S
V
 
T
S
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
E
 
A
N
 
N
A
 
C
E
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
G
 
K
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
A
K
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
S
 
N
A
 
A

6ooiC Crystal structure of triosephosphate isomerase from schistosoma mansoni in complex with 2pg (see paper)
43% identity, 97% coverage: 1:251/259 of query aligns to 4:253/255 of 6ooiC

query
sites
6ooiC
M
 
M
A
 
S
K
 
G
Q
 
S
R
 
R
A
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
R
 
S
L
 
R
A
 
D
D
 
D
N
 
N
R
 
D
V
 
K
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
A
 
L
V
 
L
S
 
S
R
 
E
G
 
A
A
 
H
D
 
F
D
 
D
L
 
-
P
 
-
D
 
D
D
 
N
V
 
T
R
 
E
V
 
V
G
 
L
V
 
I
C
 
A
V
 
P
P
 
P
C
 
S
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
H
Q
 
E
A
 
I
Q
 
R
T
 
K
L
 
S
L
 
L
E
 
K
S
 
K
G
 
-
R
 
E
V
 
I
A
 
H
W
 
V
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
I
 
C
S
 
Y
A
 
K
Y
 
V
T
 
S
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
P
E
 
A
M
 
M
A
 
I
A
 
R
E
 
D
F
 
I
G
 
G
A
 
C
T
 
D
L
 
W
A
 
V
I
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
N
Y
 
I
H
 
F
R
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
V
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
E
K
 
K
T
 
V
Q
 
Q
R
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
S
P
 
V
I
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
E
R
 
R
E
 
E
C
 
S
G
 
N
K
 
K
T
 
T
E
 
E
Q
 
E
I
 
V
V
 
C
G
 
V
E
 
R
Q
 
Q
I
 
L
D
 
K
V
 
A
V
 
I
L
 
A
A
 
N
K
 
K
L
 
I
-
 
K
S
 
S
V
 
A
E
 
D
D
 
E
A
 
W
A
 
K
R
 
R
I
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
N
F
 
F
L
 
L
R
 
R
A
 
K
-
 
W
-
 
F
R
 
K
L
 
T
V
 
N
A
 
A
K
 
P
G
 
N
G
 
G
D
 
V
A
 
D
A
 
E
N
 
K
V
 
I
S
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
A
E
 
A
N
 
N
A
 
C
E
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
G
 
Q
Q
 
Q
P
 
H
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
-
K
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
T
A
 
E
I
 
I
C
 
C
S
 
K
A
 
A

P50921 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Moritella marina (Vibrio marinus) (see paper)
46% identity, 91% coverage: 5:240/259 of query aligns to 2:239/256 of P50921

query
sites
P50921
R
 
R
A
 
H
K
 
P
L
 
V
V
 
V
V
 
M
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
S
L
 
K
A
 
E
D
 
M
N
 
V
R
 
V
V
 
D
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
A
 
G
V
 
L
S
 
N
R
 
A
G
 
E
A
 
L
D
 
E
D
 
G
L
 
V
P
 
-
D
 
T
D
 
G
V
 
V
R
 
D
V
 
V
G
 
A
V
 
V
C
 
A
V
 
P
P
 
P
C
 
A
L
 
L
Y
 
F
L
 
V
A
 
D
Q
 
L
A
 
A
Q
 
E
-
 
R
T
 
T
L
 
L
L
 
T
E
 
E
S
 
A
G
 
G
R
 
S
-
 
A
V
 
I
A
 
I
W
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
I
 
T
S
 
D
A
 
L
Y
 
N
T
 
N
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
M
A
 
S
A
 
P
E
 
A
M
 
M
A
 
L
A
 
K
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
H
A
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
Y
 
Y
H
 
H
R
 
A
E
 
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
V
 
F
V
 
V
A
 
A
L
 
K
K
 
K
T
 
F
Q
 
A
R
 
F
A
 
L
L
 
K
E
 
E
A
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
D
E
 
A
E
 
Q
R
 
N
E
 
E
C
 
A
G
 
G
K
 
E
T
 
T
E
 
M
Q
 
A
I
 
V
V
 
C
G
 
A
E
 
R
Q
 
Q
I
 
L
D
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
N
K
 
T
L
 
Q
S
 
G
V
 
V
E
 
E
D
 
A
A
 
L
A
 
E
R
 
G
I
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
Q
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
D
 
R
V
 
I
H
 
H
A
 
A
F
 
Q
L
 
I
R
 
R
A
 
A
R
 
H
L
 
I
V
 
A
A
 
E
K
 
K
G
 
S
-
 
E
G
 
A
D
 
V
A
 
A
A
 
K
N
 
N
V
 
V
S
 
V
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
N
A
 
A
E
 
A
E
 
A
L
 
Y
F
 
F
G
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
x
A
L
 
L

1aw1A Triosephosphate isomerase of vibrio marinus complexed with 2- phosphoglycolate (see paper)
46% identity, 91% coverage: 5:240/259 of query aligns to 1:238/255 of 1aw1A

query
sites
1aw1A
R
 
R
A
 
H
K
 
P
L
 
V
V
 
V
V
 
M
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
S
L
 
K
A
 
E
D
 
M
N
 
V
R
 
V
V
 
D
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
A
 
G
V
 
L
S
 
N
R
 
A
G
 
E
A
 
L
D
 
E
D
 
G
L
 
V
P
 
-
D
 
T
D
 
G
V
 
V
R
 
D
V
 
V
G
 
A
V
 
V
C
 
A
V
 
P
P
 
P
C
 
A
L
 
L
Y
 
F
L
 
V
A
 
D
Q
 
L
A
 
A
Q
 
E
-
 
R
T
 
T
L
 
L
L
 
T
E
 
E
S
 
A
G
 
G
R
 
S
-
 
A
V
 
I
A
 
I
W
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
I
 
T
S
 
D
A
 
L
Y
 
N
T
 
N
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
M
A
 
S
A
 
P
E
 
A
M
 
M
A
 
L
A
 
K
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
H
A
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
Y
 
Y
H
 
H
R
 
A
E
 
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
V
 
F
V
 
V
A
 
A
L
 
K
K
 
K
T
 
F
Q
 
A
R
 
F
A
 
L
L
 
K
E
 
E
A
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
D
E
 
A
E
 
Q
R
 
N
E
 
E
C
 
A
G
 
G
K
 
E
T
 
T
E
 
M
Q
 
A
I
 
V
V
 
C
G
 
A
E
 
R
Q
 
Q
I
 
L
D
 
D
V
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
N
K
 
T
L
 
Q
S
 
G
V
 
V
E
 
E
D
 
A
A
 
L
A
 
E
R
 
G
I
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
Q
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
D
 
R
V
 
I
H
 
H
A
 
A
F
 
Q
L
 
I
R
 
R
A
 
A
R
 
H
L
 
I
V
 
A
A
 
E
K
 
K
G
 
S
-
 
E
G
 
A
D
 
V
A
 
A
A
 
K
N
 
N
V
 
V
S
 
V
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
N
A
 
A
E
 
A
E
 
A
L
 
Y
F
 
F
G
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L

P00939 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Oryctolagus cuniculus (Rabbit) (see 2 papers)
44% identity, 97% coverage: 1:251/259 of query aligns to 1:247/249 of P00939

query
sites
P00939
M
 
M
A
 
A
K
 
P
Q
 
S
R
 
R
A
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
H
x
N
G
 
G
R
 
R
L
 
K
A
 
K
D
 
N
N
 
L
R
 
G
V
 
E
L
 
L
L
 
I
Q
 
T
A
 
T
V
 
L
S
 
N
R
 
-
G
 
-
A
 
A
D
 
A
D
 
K
L
 
V
P
 
P
D
 
A
D
 
D
V
 
T
R
 
E
V
 
V
G
 
V
V
 
C
C
 
A
V
 
P
P
 
P
C
 
T
L
 
A
Y
 
Y
L
 
I
A
 
D
Q
 
F
A
 
A
Q
 
R
T
 
Q
L
 
K
L
 
L
E
 
D
S
 
P
G
 
-
R
 
K
V
 
I
A
 
A
W
 
V
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
I
 
C
S
 
Y
A
 
K
Y
 
V
T
 
T
Q
x
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
P
E
 
G
M
 
M
A
 
I
A
 
K
E
 
D
F
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
W
A
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
Y
 
V
H
 
F
R
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
V
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
Q
K
 
K
T
 
V
Q
 
A
R
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
S
A
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
G
P
 
V
I
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
C
 
A
G
 
G
K
 
I
T
 
T
E
 
E
Q
 
K
I
 
V
V
 
V
G
 
F
E
 
E
Q
 
Q
I
 
T
D
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
A
A
 
D
K
 
-
L
 
-
S
 
N
V
 
V
E
 
K
D
 
D
A
 
W
A
 
S
R
 
K
I
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
E
F
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
G
R
 
W
L
 
L
V
 
K
A
 
S
K
 
N
G
 
V
G
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
V
-
 
A
-
 
Q
N
 
S
V
 
T
S
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
E
 
A
N
 
T
A
 
C
E
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
G
 
S
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
-
K
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
S
 
N
A
 
A

5zfxB Crystal structure of triosephosphate isomerase from opisthorchis viverrini (see paper)
44% identity, 95% coverage: 5:251/259 of query aligns to 1:246/248 of 5zfxB

query
sites
5zfxB
R
 
R
A
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
R
 
S
L
 
K
A
 
K
D
 
E
N
 
N
R
 
D
V
 
K
L
 
L
L
 
I
Q
x
E
A
 
M
V
 
L
S
 
T
R
x
H
G
 
A
A
 
K
D
 
I
D
 
D
L
 
-
P
 
-
D
 
P
D
 
N
V
 
T
R
 
E
V
 
V
G
 
L
V
 
V
C
 
A
V
 
P
P
 
P
C
 
A
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
P
Q
 
S
A
 
V
Q
 
R
T
 
E
L
 
K
L
 
L
E
 
D
S
 
K
G
 
-
R
 
R
V
 
F
A
 
H
W
 
V
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
I
 
C
S
 
Y
A
 
K
Y
 
V
T
 
P
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
P
E
 
A
M
 
M
A
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
V
G
 
G
A
 
C
T
 
D
L
 
W
A
 
V
I
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
Y
 
I
H
 
L
R
 
L
E
 
E
S
 
T
A
 
D
E
 
Q
V
 
L
V
 
V
A
 
G
L
 
E
K
 
K
T
 
T
Q
 
N
R
 
H
A
 
A
L
 
I
E
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
V
T
 
N
P
 
V
I
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
C
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
E
Q
 
E
I
 
V
V
 
C
G
 
F
E
 
R
Q
 
Q
I
 
M
D
 
E
V
 
A
V
 
I
L
 
R
A
 
K
K
 
N
L
 
L
S
 
S
V
 
S
E
 
A
D
 
D
A
 
M
-
 
W
A
 
N
R
 
H
I
 
I
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
|
A
I
 
I
G
|
G
T
|
T
G
 
G
K
|
K
S
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
L
F
 
A
L
 
V
R
 
R
A
 
R
R
 
W
L
 
M
V
 
E
A
 
E
K
 
K
G
 
V
G
 
S
D
 
P
A
 
A
A
 
V
-
 
A
-
 
K
N
 
S
V
 
I
S
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
A
E
 
A
N
 
N
A
 
C
E
 
R
E
 
T
L
 
L
F
 
A
G
 
K
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
-
K
 
P
D
 
D
F
 
F
L
 
I
A
 
E
I
 
I
C
 
C
S
 
N
A
 
A

P60174 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
44% identity, 97% coverage: 1:251/259 of query aligns to 1:247/249 of P60174

query
sites
P60174
M
 
M
A
 
A
K
 
P
Q
 
S
R
 
R
A
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
R
 
R
L
 
K
A
 
Q
D
 
S
N
 
L
R
 
G
V
 
E
L
 
L
L
 
I
Q
 
G
A
 
T
V
 
L
S
 
N
R
 
-
G
 
-
A
 
A
D
 
A
D
 
K
L
 
V
P
 
P
D
 
A
D
 
D
V
 
T
R
 
E
V
 
V
G
 
V
V
 
C
C
 
A
V
 
P
P
 
P
C
 
T
L
 
A
Y
 
Y
L
 
I
A
 
D
Q
 
F
A
 
A
Q
 
R
T
 
Q
L
 
K
L
 
L
E
 
D
S
 
P
G
 
-
R
 
K
V
 
I
A
 
A
W
 
V
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
I
 
C
S
 
Y
A
 
K
Y
 
V
T
 
T
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
P
E
 
G
M
 
M
A
 
I
A
 
K
E
 
D
F
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
W
A
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
Y
 
V
H
 
F
R
 
G
E
|
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
V
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
Q
K
 
K
T
 
V
Q
 
A
R
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
T
x
G
P
 
V
I
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
C
 
A
G
 
G
K
 
I
T
 
T
E
 
E
Q
 
K
I
 
V
V
 
V
G
 
F
E
 
E
Q
 
Q
I
 
T
D
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
A
A
 
D
K
 
-
L
 
-
S
 
N
V
 
V
E
 
K
D
 
D
A
 
W
A
 
S
R
 
K
I
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
E
F
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
G
R
 
W
L
 
L
V
 
K
A
 
S
K
 
N
G
 
V
G
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
V
-
 
A
-
 
Q
N
 
S
V
 
T
S
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
E
 
A
N
 
T
A
 
C
E
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
G
 
S
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
-
K
 
P
D
 
E
F
|
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
S
 
N
A
 
A

1btmA Triosephosphate isomerase (tim) complexed with 2-phosphoglycolic acid (see paper)
43% identity, 95% coverage: 5:251/259 of query aligns to 1:248/251 of 1btmA

query
sites
1btmA
R
 
R
A
 
K
K
 
P
L
 
I
V
 
I
V
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
H
G
 
K
R
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
E
N
 
A
R
 
V
V
 
Q
L
 
F
L
 
V
Q
 
E
A
 
D
V
 
V
S
 
-
R
 
K
G
 
G
A
 
H
D
 
V
D
 
P
L
 
P
P
 
A
D
 
D
D
 
E
V
 
V
R
 
I
V
 
S
G
 
V
V
 
V
C
 
C
V
 
A
P
 
P
C
 
F
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
D
Q
 
R
A
 
L
Q
 
V
T
 
Q
L
 
A
L
 
A
E
 
D
S
 
G
G
 
T
R
 
D
V
 
L
A
 
K
W
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
T
I
 
M
S
 
H
A
 
F
Y
 
A
T
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
M
A
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
T
L
 
Y
A
 
V
I
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
Q
Y
 
M
H
 
F
R
 
A
E
 
E
S
 
T
A
 
D
E
 
E
V
 
T
V
 
V
A
 
N
L
 
K
K
 
K
T
 
V
Q
 
L
R
 
A
A
 
A
L
 
F
E
 
T
A
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
C
 
A
G
 
G
K
 
Q
T
 
T
E
 
N
Q
 
A
I
 
V
V
 
V
G
 
A
E
 
S
Q
 
Q
I
 
V
D
 
E
V
 
K
V
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
P
E
 
E
D
 
Q
A
 
V
A
 
K
R
 
Q
I
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
P
Q
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
D
 
S
V
 
V
H
 
C
A
 
G
F
 
H
L
 
I
R
 
R
-
 
S
-
 
V
-
 
V
A
 
S
R
 
R
L
 
L
V
 
F
A
 
-
K
 
-
G
 
G
G
 
P
D
 
E
A
 
A
A
 
A
N
 
E
-
 
A
V
 
I
S
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
D
N
 
N
A
 
I
E
 
R
E
 
D
L
 
F
F
 
L
G
 
A
Q
 
Q
P
 
Q
D
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
P
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
D
 
P
K
 
A
D
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
Q
I
 
L
C
 
V
S
 
E
A
 
A

P00943 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
43% identity, 95% coverage: 5:251/259 of query aligns to 2:249/253 of P00943

query
sites
P00943
R
 
R
A
 
K
K
 
P
L
 
I
V
 
I
V
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
H
|
H
G
x
K
R
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
E
N
 
A
R
 
V
V
 
Q
L
 
F
L
 
V
Q
 
E
A
 
D
V
 
V
S
 
-
R
 
K
G
 
G
A
 
H
D
 
V
D
 
P
L
 
P
P
 
A
D
 
D
D
 
E
V
 
V
R
 
I
V
 
S
G
 
V
V
 
V
C
 
C
V
 
A
P
 
P
C
 
F
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
D
Q
 
R
A
 
L
Q
 
V
T
 
Q
L
 
A
L
 
A
E
 
D
S
 
G
G
 
T
R
 
D
V
 
L
A
 
K
W
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
T
I
 
M
S
 
H
A
 
F
Y
 
A
T
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
M
A
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
T
L
 
Y
A
 
V
I
 
I
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
Q
Y
 
M
H
 
F
R
 
A
E
 
E
S
 
T
A
 
D
E
 
E
V
 
T
V
 
V
A
 
N
L
 
K
K
 
K
T
 
V
Q
 
L
R
 
A
A
 
A
L
 
F
E
 
T
A
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
C
 
A
G
 
G
K
 
Q
T
 
T
E
 
N
Q
 
A
I
 
V
V
 
V
G
 
A
E
 
S
Q
 
Q
I
 
V
D
 
E
V
 
K
V
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
P
E
 
E
D
 
Q
A
 
V
A
 
K
R
 
Q
I
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
P
Q
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
D
 
S
V
 
V
H
 
C
A
 
G
F
 
H
L
 
I
R
 
R
-
 
S
-
 
V
-
 
V
A
 
S
R
 
R
L
 
L
V
 
F
A
 
-
K
 
-
G
 
G
G
 
P
D
 
E
A
 
A
A
 
A
N
 
E
-
 
A
V
 
I
S
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
D
N
 
N
A
 
I
E
 
R
E
 
D
L
 
F
F
 
L
G
 
A
Q
 
Q
P
 
Q
D
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
P
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
D
 
P
K
 
A
D
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
Q
I
 
L
C
 
V
S
 
E
A
 
A

6bveA Triosephosphate isomerase of synechocystis in complex with 2- phosphoglycolic acid (see paper)
40% identity, 95% coverage: 5:250/259 of query aligns to 2:239/242 of 6bveA

query
sites
6bveA
R
 
R
A
 
K
K
 
I
L
 
I
V
 
I
V
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
H
G
 
K
R
 
T
L
 
Q
A
 
A
D
 
E
N
 
A
R
 
Q
V
 
A
L
 
F
L
 
L
Q
 
Q
A
 
G
V
 
F
S
 
K
R
 
P
G
 
L
A
 
I
D
 
E
D
 
D
L
 
A
P
 
A
D
 
E
D
 
S
V
 
R
R
 
E
V
 
V
G
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
V
P
 
P
C
 
F
L
 
T
Y
 
D
L
 
L
A
 
S
Q
 
G
A
 
M
Q
 
S
T
 
Q
L
 
Q
L
 
L
E
 
H
S
 
G
G
 
G
R
 
R
V
 
V
A
 
R
W
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
I
 
V
S
 
H
A
 
W
Y
 
E
T
 
A
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
A
E
 
A
M
 
M
A
 
L
A
 
T
E
 
E
F
 
I
G
 
G
A
 
I
T
 
H
L
 
Y
A
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
Q
Y
 
Y
H
 
F
R
 
G
E
 
E
S
 
T
A
 
D
E
 
E
V
 
T
V
 
A
A
 
N
L
 
L
K
 
R
T
 
V
Q
 
L
R
 
A
A
 
A
L
 
Q
E
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
L
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
K
E
 
A
E
 
Q
R
 
R
E
 
D
C
 
A
G
 
G
K
 
E
T
 
T
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
V
 
I
G
 
V
E
 
D
Q
 
Q
I
 
V
D
 
K
V
 
K
V
 
G
L
 
L
A
 
V
K
 
N
L
 
V
S
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
D
A
 
Q
A
 
S
R
 
N
I
 
L
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
D
S
 
T
A
 
C
T
 
A
A
 
A
Q
 
T
Q
 
E
A
 
A
Q
 
N
D
 
R
V
 
V
H
 
I
A
 
G
F
 
L
L
 
I
R
 
R
A
 
E
R
 
Q
L
 
L
V
 
T
A
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
N
A
 
S
N
 
Q
V
 
V
S
 
T
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
E
 
N
N
 
N
A
 
V
E
 
D
E
 
E
L
 
I
F
 
M
G
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
 
E
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
D
 
P
K
 
Q
D
 
S
F
 
F
L
 
A
A
 
R
I
 
I
C
 
V
S
 
N

3uwuA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-3-phosphate (see paper)
40% identity, 96% coverage: 5:252/259 of query aligns to 2:252/253 of 3uwuA

query
sites
3uwuA
R
 
R
A
 
T
K
 
P
L
 
I
V
 
I
V
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
K
R
 
T
L
 
V
A
 
Q
D
 
E
N
 
A
R
 
K
V
 
D
L
 
F
L
 
V
Q
 
N
A
 
A
V
 
L
S
 
P
R
 
T
G
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
L
P
 
P
D
 
D
-
 
S
-
 
K
D
 
E
V
 
V
R
 
E
V
 
S
G
 
V
V
 
I
C
 
C
V
 
A
P
 
P
C
 
A
L
 
I
Y
 
Q
L
 
L
A
 
D
Q
 
A
A
 
L
Q
 
T
T
 
T
L
 
A
L
 
V
E
 
K
S
 
E
G
 
G
R
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
V
 
L
A
 
E
W
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
I
 
T
S
 
Y
A
 
F
Y
 
E
T
 
D
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
A
 
L
A
 
A
E
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
K
L
 
Y
A
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
Y
 
L
H
 
F
R
 
H
E
 
E
S
 
T
A
 
D
E
 
E
V
 
E
V
 
I
A
 
N
L
 
K
K
 
K
T
 
A
Q
 
H
R
 
A
A
 
I
L
 
F
E
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
C
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
A
E
 
N
Q
 
D
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
K
V
 
K
V
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
E
E
 
D
D
 
Q
A
 
L
A
 
K
R
 
S
I
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
S
Q
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
D
 
E
V
 
M
H
 
C
A
 
A
F
 
F
L
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
A
 
A
R
 
D
L
 
L
V
 
S
A
 
S
K
 
K
G
 
E
G
 
V
D
 
S
A
 
E
A
 
A
N
 
-
V
 
T
S
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
N
N
 
N
A
 
I
E
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
G
 
A
Q
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
V
K
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L
C
 
L
S
 
E
A
 
G
A
 
A

Q6GIL6 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Staphylococcus aureus (strain MRSA252) (see paper)
40% identity, 96% coverage: 5:252/259 of query aligns to 2:252/253 of Q6GIL6

query
sites
Q6GIL6
R
 
R
A
 
T
K
 
P
L
 
I
V
 
I
V
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
K
R
 
T
L
 
V
A
 
Q
D
 
E
N
 
A
R
 
K
V
 
D
L
 
F
L
 
V
Q
 
N
A
 
A
V
 
L
S
 
P
R
 
T
G
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
L
P
 
P
D
 
D
-
 
S
-
 
K
D
 
E
V
 
V
R
 
E
V
 
S
G
 
V
V
 
I
C
 
C
V
 
A
P
 
P
C
 
A
L
 
I
Y
 
Q
L
 
L
A
 
D
Q
 
A
A
 
L
Q
 
T
T
 
T
L
 
A
L
 
V
E
 
K
S
 
E
G
 
G
R
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
V
 
L
A
 
E
W
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
I
 
T
S
 
Y
A
 
F
Y
 
E
T
 
D
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
A
 
L
A
 
A
E
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
K
L
 
Y
A
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
Y
 
L
H
 
F
R
 
H
E
 
E
S
 
T
A
 
D
E
 
E
V
 
E
V
 
I
A
 
N
L
 
K
K
 
K
T
 
A
Q
 
H
R
 
A
A
 
I
L
 
F
E
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
C
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
A
E
 
N
Q
 
D
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
K
V
 
K
V
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
E
E
 
D
D
 
Q
A
 
L
A
 
K
R
 
S
I
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
S
Q
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
D
 
E
V
 
M
H
 
C
A
 
A
F
 
F
L
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
A
 
A
R
 
D
L
 
L
V
 
S
A
 
S
K
 
K
G
 
E
G
 
V
D
 
S
A
 
E
A
 
A
N
 
-
V
 
T
S
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
N
N
 
N
A
 
I
E
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
G
 
A
Q
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
V
K
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L
C
 
L
S
 
E
A
 
G
A
 
A

3uwzA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate (see paper)
40% identity, 96% coverage: 5:252/259 of query aligns to 3:253/254 of 3uwzA

query
sites
3uwzA
R
 
R
A
 
T
K
 
P
L
 
I
V
 
I
V
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
K
R
 
T
L
 
V
A
 
Q
D
 
E
N
 
A
R
 
K
V
 
D
L
 
F
L
 
V
Q
 
N
A
 
A
V
 
L
S
 
P
R
 
T
G
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
L
P
 
P
D
 
D
-
 
S
-
 
K
D
 
E
V
 
V
R
 
E
V
 
S
G
 
V
V
 
I
C
 
C
V
 
A
P
 
P
C
 
A
L
 
I
Y
 
Q
L
 
L
A
 
D
Q
 
A
A
 
L
Q
 
T
T
 
T
L
 
A
L
 
V
E
 
K
S
 
E
G
 
G
R
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
V
 
L
A
 
E
W
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
I
 
T
S
 
Y
A
 
F
Y
 
E
T
 
D
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
A
 
L
A
 
A
E
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
K
L
 
Y
A
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
Y
 
L
H
 
F
R
 
H
E
 
E
S
 
T
A
 
D
E
 
E
V
 
E
V
 
I
A
 
N
L
 
K
K
 
K
T
 
A
Q
 
H
R
 
A
A
 
I
L
 
F
E
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
C
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
A
E
 
N
Q
 
D
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
K
V
 
K
V
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
E
E
 
D
D
 
Q
A
 
L
A
 
K
R
 
S
I
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
S
Q
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
D
 
E
V
 
M
H
 
C
A
 
A
F
 
F
L
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
A
 
A
R
 
D
L
 
L
V
 
S
A
 
S
K
 
K
G
 
E
G
 
V
D
 
S
A
 
E
A
 
A
N
 
-
V
 
T
S
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
N
N
 
N
A
 
I
E
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
G
 
A
Q
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
V
K
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L
C
 
L
S
 
E
A
 
G
A
 
A

3uwwA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 3-phosphoglyceric acid (see paper)
40% identity, 96% coverage: 5:252/259 of query aligns to 3:253/254 of 3uwwA

query
sites
3uwwA
R
 
R
A
 
T
K
 
P
L
 
I
V
 
I
V
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
K
R
 
T
L
 
V
A
 
Q
D
 
E
N
 
A
R
 
K
V
 
D
L
 
F
L
 
V
Q
 
N
A
 
A
V
 
L
S
 
P
R
 
T
G
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
L
P
 
P
D
 
D
-
 
S
-
 
K
D
 
E
V
 
V
R
 
E
V
 
S
G
 
V
V
 
I
C
 
C
V
 
A
P
 
P
C
 
A
L
 
I
Y
 
Q
L
 
L
A
 
D
Q
 
A
A
 
L
Q
 
T
T
 
T
L
 
A
L
 
V
E
 
K
S
 
E
G
 
G
R
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
V
 
L
A
 
E
W
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
I
 
T
S
 
Y
A
 
F
Y
 
E
T
 
D
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
A
 
L
A
 
A
E
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
K
L
 
Y
A
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
Y
 
L
H
 
F
R
 
H
E
 
E
S
 
T
A
 
D
E
 
E
V
 
E
V
 
I
A
 
N
L
 
K
K
 
K
T
 
A
Q
 
H
R
 
A
A
 
I
L
 
F
E
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
C
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
A
E
 
N
Q
 
D
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
K
V
 
K
V
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
E
E
 
D
D
 
Q
A
 
L
A
 
K
R
 
S
I
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
S
Q
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
D
 
E
V
 
M
H
 
C
A
 
A
F
 
F
L
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
A
 
A
R
 
D
L
 
L
V
 
S
A
 
S
K
 
K
G
 
E
G
 
V
D
 
S
A
 
E
A
 
A
N
 
-
V
 
T
S
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
N
N
 
N
A
 
I
E
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
G
 
A
Q
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
V
K
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L
C
 
L
S
 
E
A
 
G
A
 
A

3uwvA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 2-phosphoglyceric acid (see paper)
40% identity, 96% coverage: 5:252/259 of query aligns to 4:254/255 of 3uwvA

query
sites
3uwvA
R
 
R
A
 
T
K
 
P
L
 
I
V
 
I
V
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
K
R
 
T
L
 
V
A
 
Q
D
 
E
N
 
A
R
 
K
V
 
D
L
 
F
L
 
V
Q
 
N
A
 
A
V
 
L
S
 
P
R
 
T
G
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
L
P
 
P
D
 
D
-
 
S
-
 
K
D
 
E
V
 
V
R
 
E
V
 
S
G
 
V
V
 
I
C
 
C
V
 
A
P
 
P
C
 
A
L
 
I
Y
 
Q
L
 
L
A
 
D
Q
 
A
A
 
L
Q
 
T
T
 
T
L
 
A
L
 
V
E
 
K
S
 
E
G
 
G
R
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
V
 
L
A
 
E
W
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
I
 
T
S
 
Y
A
 
F
Y
 
E
T
 
D
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
A
 
L
A
 
A
E
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
K
L
 
Y
A
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
Y
 
L
H
 
F
R
 
H
E
 
E
S
 
T
A
 
D
E
 
E
V
 
E
V
 
I
A
 
N
L
 
K
K
 
K
T
 
A
Q
 
H
R
 
A
A
 
I
L
 
F
E
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
C
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
A
E
 
N
Q
 
D
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
K
V
 
K
V
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
E
E
 
D
D
 
Q
A
 
L
A
 
K
R
 
S
I
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
S
Q
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
D
 
E
V
 
M
H
 
C
A
 
A
F
 
F
L
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
A
 
A
R
 
D
L
 
L
V
 
S
A
 
S
K
 
K
G
 
E
G
 
V
D
 
S
A
 
E
A
 
A
N
 
-
V
 
T
S
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
|
K
P
 
P
E
 
N
N
 
N
A
 
I
E
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
G
 
A
Q
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
V
K
 
E
D
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L
C
 
L
S
 
E
A
 
G
A
 
A

P27876 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
40% identity, 94% coverage: 5:248/259 of query aligns to 2:246/253 of P27876

query
sites
P27876
R
 
R
A
 
K
K
 
P
L
 
I
V
 
I
V
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
H
 
N
G
 
K
R
 
T
L
 
L
A
 
G
D
 
E
N
 
A
R
 
V
V
 
S
L
 
F
L
 
V
Q
 
E
A
 
E
V
 
V
S
 
-
R
 
K
G
 
S
A
 
S
D
 
I
D
 
P
L
 
A
P
 
A
D
 
D
D
 
K
V
 
A
R
 
E
V
 
A
G
 
V
V
 
V
C
 
C
V
 
A
P
 
P
C
 
A
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
E
Q
 
K
A
 
L
Q
 
A
T
 
S
L
 
A
L
 
V
E
 
K
S
 
G
G
 
T
R
 
D
V
 
L
A
 
K
W
 
V
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
I
 
M
S
 
H
A
 
F
Y
 
E
T
 
E
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
A
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
D
L
 
Y
A
 
C
I
 
V
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
Y
 
M
H
 
F
R
 
A
E
 
E
S
 
T
A
 
D
E
 
E
V
 
T
V
 
V
A
 
N
L
 
K
K
 
K
T
 
A
Q
 
H
R
 
A
A
 
A
L
 
F
E
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
I
T
 
V
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
C
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
N
Q
 
D
I
 
L
V
 
V
G
 
A
E
 
D
Q
 
Q
I
 
V
D
 
K
V
 
K
V
 
G
L
 
L
A
 
A
K
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
E
E
 
E
D
 
Q
A
 
V
A
 
A
R
 
A
I
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
A
Q
 
K
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
D
 
D
V
 
V
H
 
C
A
 
A
F
 
H
L
 
I
R
 
R
A
 
K
R
 
T
L
 
V
V
 
A
A
 
E
K
 
S
G
 
F
G
 
S
D
 
Q
A
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
D
N
 
K
V
 
L
S
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
A
N
 
N
A
 
I
E
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
G
 
A
Q
 
E
P
 
S
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
D
 
P
K
 
Q
D
 
S
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L

Query Sequence

>WP_012401398.1 NCBI__GCF_000020045.1:WP_012401398.1
MAKQRAKLVVGNWKMHGRLADNRVLLQAVSRGADDLPDDVRVGVCVPCLYLAQAQTLLES
GRVAWGVQDISAYTQGAYTGEVAAEMAAEFGATLAIVGHSERRAYHRESAEVVALKTQRA
LEAGLTPIVCVGETLEERECGKTEQIVGEQIDVVLAKLSVEDAARIVIAYEPVWAIGTGK
SATAQQAQDVHAFLRARLVAKGGDAANVSLLYGGSVKPENAEELFGQPDIDGGLIGGASL
KDKDFLAICSAAVAATAAR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory