SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012407398.1 NCBI__GCF_000020025.1:WP_012407398.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1o5iB Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reductase (tm1169) from thermotoga maritima at 2.50 a resolution
37% identity, 96% coverage: 5:256/262 of query aligns to 2:228/234 of 1o5iB

query
sites
1o5iB
L
 
I
R
 
R
G
 
D
K
 
K
V
 
G
A
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
L
A
|
A
A
 
A
S
|
S
K
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
V
A
 
A
R
 
D
Q
 
V
F
 
L
A
 
S
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
E
V
 
V
A
 
T
I
 
I
C
 
C
A
 
A
R
|
R
S
 
N
E
 
E
S
 
-
I
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
E
I
 
L
A
 
L
S
 
K
E
 
R
T
 
S
G
 
G
T
 
H
E
 
R
V
 
Y
L
 
V
S
 
V
L
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
T
 
-
S
 
-
Q
 
-
A
 
C
D
|
D
I
x
L
E
 
R
R
 
K
V
 
D
I
 
L
N
 
D
T
 
L
T
 
L
V
 
F
E
 
E
R
 
K
F
 
V
G
 
K
G
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
|
G
P
 
P
P
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
F
F
 
F
D
 
D
D
 
E
I
 
L
D
 
T
L
 
N
A
 
E
T
 
D
W
 
F
E
 
K
T
 
E
S
 
A
I
 
I
N
 
D
L
 
S
T
 
L
L
 
F
L
 
L
S
 
N
A
 
M
V
 
I
R
 
K
L
 
I
V
 
V
K
 
R
F
 
N
A
 
Y
L
 
L
P
 
P
H
 
A
L
 
M
R
 
K
Q
 
E
S
 
K
T
 
G
T
 
W
P
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
V
T
 
A
I
 
I
T
 
T
S
|
S
T
 
F
S
 
S
T
 
V
K
 
I
Q
 
S
P
 
P
V
 
I
E
 
E
N
 
N
L
|
L
V
x
Y
L
 
T
S
|
S
N
 
N
S
 
S
I
 
A
R
|
R
L
 
M
A
 
A
V
 
L
I
 
T
G
 
G
L
 
F
T
 
L
K
 
K
T
 
T
L
 
L
S
 
S
Q
 
F
E
 
E
L
 
V
G
 
A
S
 
P
D
 
Y
K
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
C
I
 
V
L
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
W
T
 
T
Y
 
E
T
 
T
E
 
E
R
|
R
V
 
V
E
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
L
N
 
S
A
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
K
 
-
E
 
E
A
 
E
E
 
K
I
 
K
A
 
K
R
 
Q
V
 
V
S
 
E
A
 
S
T
 
Q
V
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
R
R
 
R
I
 
M
G
 
A
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
F
 
I
A
 
A
N
 
S
V
 
V
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
P
 
E
A
 
K
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
L
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
M
 
T
L
 
I
E
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6jhbB Crystal structure of NADPH and 4-hydroxyphenylpyruvic acid bound aerf from microcystis aeruginosa (see paper)
33% identity, 98% coverage: 1:256/262 of query aligns to 1:260/264 of 6jhbB

query
sites
6jhbB
M
 
M
D
 
D
L
 
L
Q
 
G
L
 
L
R
 
K
G
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
x
G
A
 
S
S
|
S
K
x
A
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
F
A
 
T
T
 
I
A
 
A
R
 
E
Q
 
K
F
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
C
K
 
H
V
 
L
A
 
I
I
 
I
C
 
C
A
x
G
R
|
R
-
x
N
S
 
S
E
 
Q
S
 
R
I
 
L
D
 
E
T
 
Q
T
 
A
A
 
Y
A
 
Q
E
 
S
I
 
L
A
 
A
-
 
Q
S
 
A
E
 
Y
T
 
P
G
 
A
T
 
Q
E
 
Q
V
 
I
L
 
L
S
 
R
L
 
L
R
 
V
A
|
A
D
|
D
V
|
V
T
x
H
S
 
Q
Q
 
A
A
 
Q
D
 
D
I
 
S
E
 
E
R
 
Q
V
 
L
I
 
I
N
 
Q
T
 
D
T
 
S
V
 
L
E
 
N
R
 
Q
F
 
Y
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
N
N
|
N
A
x
S
G
x
E
G
 
G
P
 
A
-
 
N
-
 
F
P
 
A
A
 
E
G
 
N
T
 
L
F
 
I
D
 
E
D
 
N
I
 
L
D
 
S
L
 
D
A
 
E
T
 
D
W
 
W
E
 
L
T
 
N
S
 
V
I
 
F
N
 
Q
L
 
G
T
x
K
L
 
L
L
 
I
S
 
G
A
 
Y
V
 
I
R
 
R
L
 
L
V
 
T
K
 
N
F
 
L
A
 
V
L
 
L
P
 
P
H
 
I
L
 
M
R
 
K
Q
 
K
S
 
Q
T
 
H
T
 
W
P
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
V
T
 
N
I
|
I
T
x
I
S
x
G
T
 
T
S
|
S
T
 
G
K
 
K
Q
 
E
P
 
P
V
 
S
E
 
P
N
 
R
L
|
L
V
 
V
L
 
K
S
|
S
N
 
G
S
 
V
I
 
V
R
x
N
L
 
A
A
 
A
V
 
L
I
 
M
G
 
N
L
 
F
T
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
V
S
 
A
Q
 
R
E
 
Q
L
 
T
G
 
A
S
 
P
D
 
Y
K
 
N
I
 
V
R
 
L
V
 
I
N
 
N
S
 
S
I
 
V
L
 
N
P
|
P
G
 
G
W
 
V
T
x
I
Y
 
D
T
|
T
E
x
P
R
|
R
V
 
H
E
 
R
E
 
E
L
 
Y
I
 
L
N
 
E
A
 
I
R
 
Y
I
 
A
A
 
K
K
 
K
S
 
E
G
 
G
E
 
T
T
 
T
K
 
P
E
 
D
A
 
L
E
 
I
I
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
I
S
 
L
A
 
K
T
 
T
V
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
N
R
 
R
I
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
T
E
 
E
E
 
E
F
 
F
A
 
A
N
 
N
V
 
L
A
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
P
 
E
A
 
C
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
I
M
 
T
L
 
I
E
 
P
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5vpsA Crystal structure of an sdr from burkholderia ambifaria in complex with NADPH with a tcep adduct (see paper)
33% identity, 100% coverage: 1:262/262 of query aligns to 2:260/260 of 5vpsA

query
sites
5vpsA
M
 
M
D
 
D
L
 
L
Q
 
G
L
 
I
R
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
C
A
|
A
A
 
A
S
|
S
K
 
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
K
 
R
A
 
G
T
 
C
A
 
A
R
 
E
Q
 
A
F
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
V
K
 
N
V
 
L
A
 
V
I
 
I
C
 
V
A
|
A
R
|
R
S
x
T
-
 
R
E
 
D
S
 
T
I
 
L
D
 
E
T
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
R
S
 
A
E
 
A
T
 
S
G
 
N
T
 
V
E
 
S
V
 
V
L
 
T
S
 
A
L
 
V
R
 
A
A
 
C
D
|
D
V
x
I
T
 
T
S
 
T
Q
 
P
A
 
D
D
 
G
I
 
R
E
 
A
R
 
A
V
 
A
I
 
L
N
 
A
T
 
A
T
 
C
V
 
P
E
 
Q
R
 
P
F
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
G
|
G
P
 
P
P
 
P
A
 
P
G
 
G
T
 
D
F
 
F
D
 
R
D
 
D
I
 
F
D
 
S
L
 
H
A
 
D
T
 
D
W
 
W
E
 
I
T
 
R
S
 
A
I
 
L
N
 
E
L
 
A
T
 
N
L
 
M
L
 
L
S
 
T
A
 
P
V
 
I
R
 
E
L
 
L
V
 
I
K
 
R
F
 
A
A
 
T
L
 
V
P
 
D
H
 
G
L
 
M
R
 
I
Q
 
G
S
 
R
T
 
G
T
 
F
P
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
V
T
x
N
I
 
I
T
 
T
S
|
S
T
x
S
S
 
A
T
 
V
K
 
K
Q
 
A
P
 
P
V
 
I
E
 
D
N
 
V
L
|
L
V
 
A
L
 
L
S
|
S
N
 
N
S
 
G
I
 
A
R
|
R
L
 
S
A
 
G
V
 
L
I
 
T
G
 
G
L
 
F
T
 
V
K
 
A
T
 
G
L
 
L
S
 
S
Q
 
R
E
 
K
L
 
V
G
 
A
S
 
G
D
 
Q
K
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
I
N
 
N
S
 
N
I
 
L
L
 
L
P
|
P
G
|
G
W
x
L
T
x
F
Y
 
D
T
|
T
E
 
D
R
|
R
V
x
I
E
 
A
E
 
T
L
x
T
I
 
L
N
 
A
A
|
A
R
 
S
I
 
A
A
 
K
K
 
A
S
 
Q
G
 
G
E
 
V
T
 
T
K
 
V
E
 
D
A
 
E
E
 
L
I
 
R
A
 
A
R
 
R
V
 
R
S
 
A
A
 
K
T
 
E
V
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
R
E
 
A
E
 
E
F
 
F
A
 
G
N
 
A
V
 
A
A
 
C
V
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
P
 
V
A
 
H
A
 
A
S
 
G
F
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
M
 
N
L
 
W
E
 
L
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
Y
Q
 
P
G
 
G
T
 
T
F
 
F

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
34% identity, 97% coverage: 4:256/262 of query aligns to 4:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
Q
 
R
L
 
L
R
 
Q
G
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
A
x
G
A
 
A
S
 
A
K
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
V
F
 
F
A
 
M
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
C
 
A
A
x
D
R
x
F
S
 
N
E
 
E
S
 
A
I
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
A
A
 
G
E
 
K
I
 
E
A
 
A
S
 
V
E
 
E
T
 
A
G
 
N
T
 
P
E
 
G
V
 
V
L
 
V
S
 
F
L
 
I
R
 
R
A
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
S
 
D
Q
 
R
A
 
E
D
 
S
I
 
V
E
 
H
R
 
R
V
 
L
I
 
V
N
 
E
T
 
N
T
 
V
V
 
A
E
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
G
x
I
P
 
T
P
 
R
A
x
D
G
 
S
T
 
M
F
 
L
D
 
S
D
x
K
I
 
M
D
 
T
L
 
V
A
 
D
T
 
Q
W
 
F
E
 
Q
T
 
Q
S
 
V
I
 
I
N
 
N
L
 
V
T
x
N
L
 
L
L
 
T
S
 
G
A
 
V
V
 
F
R
 
H
L
 
C
V
 
T
K
 
Q
F
 
A
A
 
V
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
L
 
M
R
 
A
Q
 
E
S
 
Q
T
 
G
T
 
K
P
 
G
A
 
K
I
 
I
L
 
-
T
 
-
I
 
I
T
 
N
S
x
T
T
 
S
S
|
S
T
 
V
K
 
T
Q
 
G
P
 
T
V
 
Y
E
 
G
N
|
N
L
x
V
V
 
G
L
x
Q
S
 
T
N
 
N
-
x
Y
-
 
A
S
 
A
I
 
A
R
x
K
L
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
K
T
 
T
L
 
W
S
 
A
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
S
 
R
D
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
V
L
 
A
P
|
P
G
 
G
W
x
F
T
|
T
Y
 
E
T
|
T
E
 
A
R
x
M
V
 
V
E
 
A
E
 
E
L
 
V
I
 
-
N
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
K
 
P
E
 
E
A
 
K
E
 
V
I
 
I
A
 
E
R
x
K
V
 
M
S
 
K
A
 
A
T
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
F
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
A
A
 
Y
V
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
P
 
H
A
 
E
A
 
S
S
 
D
F
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
H
M
 
V
L
 
L
E
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5idyB Crystal structure of an oxidoreductase from burkholderia vietnamiensis in complex with NADP
33% identity, 100% coverage: 1:262/262 of query aligns to 6:264/264 of 5idyB

query
sites
5idyB
M
 
M
D
 
D
L
 
L
Q
 
G
L
 
I
R
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
C
A
|
A
A
 
A
S
|
S
K
 
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
K
 
R
A
 
G
T
 
C
A
 
A
R
 
E
Q
 
A
F
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
V
K
 
N
V
 
L
A
 
V
I
 
I
C
 
V
A
|
A
R
|
R
S
x
T
-
 
R
E
 
D
S
 
T
I
 
L
D
 
E
T
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
R
S
 
A
E
 
A
T
 
S
G
 
N
T
 
V
E
 
S
V
 
V
L
 
A
S
 
T
L
 
V
R
 
A
A
 
C
D
|
D
V
x
I
T
 
T
S
 
T
Q
 
P
A
 
D
D
 
G
I
 
R
E
 
A
R
 
A
V
 
A
I
 
L
N
 
A
T
 
A
T
 
C
V
 
P
E
 
Q
R
 
P
F
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
G
|
G
P
 
P
P
 
P
A
 
P
G
 
G
T
 
D
F
 
F
D
 
R
D
 
D
I
 
F
D
 
S
L
 
H
A
 
D
T
 
D
W
 
W
E
 
I
T
 
R
S
 
A
I
 
L
N
 
E
L
 
S
T
 
N
L
 
M
L
 
L
S
 
T
A
 
P
V
 
I
R
 
E
L
 
L
V
 
I
K
 
R
F
 
A
A
 
T
L
 
V
P
 
D
H
 
G
L
 
M
R
 
I
Q
 
A
S
 
R
T
 
G
T
 
F
P
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
V
T
x
N
I
 
I
T
 
T
S
|
S
T
 
S
S
 
A
T
 
V
K
 
K
Q
 
A
P
 
P
V
 
I
E
 
D
N
 
V
L
 
L
V
 
A
L
 
L
S
|
S
N
 
N
S
 
G
I
 
A
R
|
R
L
 
S
A
 
G
V
 
L
I
 
T
G
 
G
L
 
F
T
 
V
K
 
A
T
 
G
L
 
L
S
 
A
Q
 
R
E
 
K
L
 
V
G
 
V
S
 
G
D
 
Q
K
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
I
N
 
N
S
 
N
I
 
L
L
 
L
P
|
P
G
|
G
W
x
L
T
x
F
Y
 
D
T
|
T
E
 
D
R
|
R
V
x
I
E
 
A
E
 
T
L
 
T
I
 
L
N
 
A
A
|
A
R
 
A
I
 
A
A
 
N
K
 
A
S
 
Q
G
 
G
E
 
V
T
 
T
K
 
V
E
 
D
A
 
E
E
 
L
I
 
R
A
 
A
R
 
R
V
 
R
S
 
T
A
 
R
T
 
D
V
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
R
E
 
A
E
 
E
F
 
F
A
 
G
N
 
A
V
 
A
A
 
C
V
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
P
 
V
A
 
H
A
 
A
S
 
G
F
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
M
 
N
L
 
W
E
 
L
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
Y
Q
 
P
G
 
G
T
 
T
F
 
F

5va8A Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase sdr from burkholderia phymatum in complex with NADP
34% identity, 100% coverage: 1:262/262 of query aligns to 3:261/261 of 5va8A

query
sites
5va8A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
Q
 
G
L
 
I
R
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
C
A
|
A
A
 
A
S
|
S
K
|
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
K
 
R
A
 
G
T
 
C
A
 
A
R
 
E
Q
 
A
F
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
V
K
 
N
V
 
V
A
 
T
I
 
I
C
 
V
A
|
A
R
|
R
S
x
T
-
 
P
E
 
E
S
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
A
I
 
I
A
 
R
S
 
A
E
 
N
T
 
A
G
 
G
T
 
V
E
 
D
V
 
V
L
 
Q
S
 
A
L
 
V
R
 
A
A
 
C
D
|
D
V
x
I
T
 
T
S
 
T
Q
 
P
A
 
E
D
 
G
I
 
R
E
 
A
R
 
A
V
 
A
I
 
L
N
 
A
T
 
A
T
 
C
V
 
P
E
 
Q
R
 
P
F
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
G
|
G
P
 
P
P
 
P
A
 
P
G
 
G
T
 
D
F
 
F
D
 
R
D
 
N
I
 
F
D
 
T
L
 
H
A
 
D
T
 
D
W
 
W
E
 
I
T
 
R
S
 
A
I
 
L
N
 
E
L
 
A
T
 
N
L
 
M
L
 
L
S
 
T
A
 
P
V
 
I
R
 
E
L
 
L
V
 
I
K
 
R
F
 
A
A
 
T
L
 
I
P
 
D
H
 
G
L
 
M
R
 
I
Q
 
S
S
 
R
T
 
G
T
 
F
P
 
G
A
 
R
I
 
V
L
 
V
T
 
N
I
 
I
T
 
T
S
|
S
T
x
S
S
 
S
T
 
V
K
 
K
Q
 
A
P
 
P
V
x
I
E
 
D
N
 
V
L
|
L
V
 
G
L
 
L
S
|
S
N
 
N
S
 
G
I
 
A
R
|
R
L
 
S
A
 
G
V
 
L
I
 
T
G
 
G
L
 
F
T
 
I
K
 
A
T
 
G
L
 
V
S
 
A
Q
 
R
E
 
K
L
 
V
G
 
A
S
 
P
D
 
N
K
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
I
N
 
N
S
 
N
I
 
L
L
 
L
P
|
P
G
|
G
W
x
I
T
x
F
Y
 
D
T
|
T
E
 
D
R
 
R
V
 
I
E
 
A
E
 
V
L
x
T
I
 
F
N
 
D
A
 
A
R
 
A
I
 
A
-
 
K
A
 
A
K
 
Q
S
 
N
G
 
I
E
 
S
T
 
V
K
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
R
I
 
K
A
 
Q
R
 
R
V
 
M
S
 
-
A
 
A
T
 
T
V
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
R
R
 
R
I
 
F
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
E
F
 
F
A
 
G
N
 
R
V
 
A
A
 
C
V
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
P
 
V
A
 
H
A
 
A
S
 
G
F
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
M
 
N
L
 
W
E
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
Y
Q
 
P
G
 
G
T
 
T
F
 
Y

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
31% identity, 97% coverage: 3:256/262 of query aligns to 2:248/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
L
 
F
Q
 
D
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
G
S
 
S
K
x
R
G
|
G
L
|
L
G
 
G
K
 
F
A
 
G
T
 
I
A
 
A
R
 
Q
Q
 
G
F
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
A
G
 
G
A
 
C
K
 
S
V
 
V
A
 
V
I
 
V
C
 
A
A
x
S
R
|
R
S
 
N
-
 
L
E
 
E
S
 
E
I
 
A
D
 
S
T
 
E
T
 
A
A
 
A
A
 
Q
E
 
K
I
 
L
A
 
T
S
 
E
E
 
K
T
 
Y
G
 
G
T
 
V
E
 
E
V
 
T
L
 
M
S
 
A
L
 
F
R
 
R
A
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
S
S
 
N
Q
 
Y
A
 
E
D
 
E
I
 
V
E
 
K
R
 
K
V
 
L
I
 
L
N
 
E
T
 
A
T
 
V
V
 
K
E
 
E
R
 
K
F
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
T
L
 
V
V
 
V
T
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
G
x
I
P
 
N
P
 
R
A
 
R
G
 
H
T
 
P
F
 
A
D
 
E
D
 
E
I
 
F
D
 
P
L
 
L
A
 
D
T
 
E
W
 
F
E
 
R
T
 
Q
S
 
V
I
 
I
N
 
E
L
x
V
T
 
N
L
 
L
L
 
F
S
 
G
A
 
T
V
 
Y
R
 
Y
L
 
V
V
 
C
K
 
R
F
 
E
A
 
A
L
 
F
P
 
S
H
 
L
L
 
L
R
 
R
Q
 
E
S
 
S
T
 
D
T
 
N
P
 
P
A
 
S
I
 
I
L
 
I
T
 
N
I
|
I
T
 
G
S
|
S
T
 
L
S
 
T
T
 
V
K
 
E
Q
 
E
-
 
V
P
 
T
V
 
M
E
 
P
N
 
N
L
x
I
V
 
S
L
 
A
S
x
Y
N
 
A
S
 
A
I
 
S
R
x
K
L
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
A
G
 
S
L
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
A
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
E
 
E
L
 
W
G
 
G
S
 
R
D
 
Y
K
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
V
I
 
I
L
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
W
T
x
Y
Y
 
R
T
|
T
E
 
K
R
x
M
V
x
T
E
 
E
E
 
A
L
 
V
I
 
F
N
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
S
K
 
D
E
 
P
A
 
E
E
 
K
I
 
L
A
 
D
R
 
Y
V
 
M
S
 
L
A
 
K
T
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
T
G
 
G
T
 
V
P
 
P
E
 
E
E
 
D
F
 
L
A
 
K
N
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
P
 
E
A
 
E
A
 
A
S
 
K
F
 
Y
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
M
 
I
L
 
I
E
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1ahiA 7 alpha-hydroxysteroid dehydrogenase complexed with nadh and 7-oxo glycochenodeoxycholic acid (see paper)
33% identity, 98% coverage: 2:259/262 of query aligns to 6:252/255 of 1ahiA

query
sites
1ahiA
D
 
N
L
 
L
Q
 
R
L
 
L
R
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
C
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
A
x
G
A
 
A
S
 
G
K
x
A
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
K
A
 
E
T
 
I
A
 
A
R
 
I
Q
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
T
E
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
S
V
 
V
A
 
V
I
 
V
C
 
S
A
x
D
R
x
I
S
 
N
E
 
A
S
 
D
I
 
A
D
 
A
T
 
N
T
 
H
A
 
V
A
 
V
E
 
D
I
 
E
A
 
I
S
 
Q
E
 
Q
T
 
L
G
 
G
T
 
G
E
 
Q
V
 
A
L
 
F
S
 
A
L
 
C
R
 
R
A
 
C
D
|
D
V
x
I
T
 
T
S
 
S
Q
 
E
A
 
Q
D
 
E
I
 
L
E
 
S
R
 
A
V
 
L
I
 
A
N
 
D
T
 
F
T
 
A
V
 
I
E
 
S
R
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
K
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
G
P
 
G
A
 
P
G
 
K
T
 
P
F
 
F
D
 
-
D
 
D
I
 
M
D
 
P
L
 
M
A
 
A
T
 
D
W
 
F
E
 
R
T
 
R
S
 
A
I
 
Y
N
 
E
L
 
L
T
 
N
L
 
V
L
 
F
S
 
S
A
 
F
V
 
F
R
 
H
L
 
L
V
 
S
K
 
Q
F
 
L
A
 
V
L
 
A
P
 
P
H
 
E
L
 
M
R
 
E
Q
 
K
S
 
N
T
 
G
T
 
G
P
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
L
T
 
T
I
 
I
T
 
T
S
|
S
T
 
M
S
x
A
T
 
A
K
 
E
Q
x
N
P
 
K
V
 
N
E
 
I
N
 
N
L
x
M
V
 
T
L
 
S
S
x
Y
N
 
A
S
 
S
I
 
S
R
x
K
L
 
A
A
 
A
V
 
A
I
 
S
G
 
H
L
 
L
T
 
V
K
 
R
T
 
N
L
 
M
S
 
A
Q
 
F
E
 
D
L
 
L
G
 
G
S
 
E
D
 
K
K
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
G
I
 
I
L
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
A
T
x
I
Y
 
L
T
|
T
E
 
D
R
x
A
V
 
L
E
 
K
E
 
S
L
x
V
I
 
I
N
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
T
K
 
P
E
 
E
A
 
I
E
 
E
I
 
Q
A
 
K
R
 
M
V
 
L
S
 
Q
A
 
H
T
 
T
V
 
-
P
 
P
L
 
I
G
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
E
 
Q
E
 
D
F
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
A
A
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
F
 
W
V
 
V
N
 
S
G
 
G
V
 
Q
M
 
I
L
 
L
E
 
T
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
G
I
 
V
Q
|
Q

Sites not aligning to the query:

P0AET8 7alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; 7alpha-HSDH; NAD-dependent 7alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; EC 1.1.1.159 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
33% identity, 98% coverage: 2:259/262 of query aligns to 6:252/255 of P0AET8

query
sites
P0AET8
D
 
N
L
 
L
Q
 
R
L
 
L
R
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
C
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
A
 
G
A
 
A
S
 
G
K
 
A
G
 
G
L
x
I
G
 
G
K
 
K
A
 
E
T
 
I
A
 
A
R
 
I
Q
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
T
E
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
S
V
 
V
A
 
V
I
 
V
C
 
S
A
x
D
R
x
I
S
 
N
E
 
A
S
 
D
I
 
A
D
 
A
T
 
N
T
 
H
A
 
V
A
 
V
E
 
D
I
 
E
A
 
I
S
 
Q
E
 
Q
T
 
L
G
 
G
T
 
G
E
 
Q
V
 
A
L
 
F
S
 
A
L
 
C
R
 
R
A
 
C
D
|
D
V
x
I
T
 
T
S
 
S
Q
 
E
A
 
Q
D
 
E
I
 
L
E
 
S
R
 
A
V
 
L
I
 
A
N
 
D
T
 
F
T
 
A
V
 
I
E
 
S
R
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
K
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
x
G
P
 
G
A
 
P
G
 
K
T
 
P
F
 
F
D
 
-
D
 
D
I
 
M
D
 
P
L
 
M
A
 
A
T
 
D
W
 
F
E
 
R
T
 
R
S
 
A
I
 
Y
N
 
E
L
 
L
T
 
N
L
 
V
L
 
F
S
 
S
A
 
F
V
 
F
R
 
H
L
 
L
V
 
S
K
 
Q
F
 
L
A
 
V
L
 
A
P
 
P
H
 
E
L
 
M
R
 
E
Q
 
K
S
 
N
T
 
G
T
 
G
P
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
L
T
 
T
I
 
I
T
 
T
S
|
S
T
 
M
S
 
A
T
 
A
K
 
E
Q
x
N
P
 
K
V
 
N
E
 
I
N
 
N
L
 
M
V
 
T
L
 
S
S
x
Y
N
 
A
S
 
S
I
 
S
R
x
K
L
 
A
A
 
A
V
 
A
I
 
S
G
 
H
L
 
L
T
 
V
K
 
R
T
 
N
L
 
M
S
 
A
Q
 
F
E
 
D
L
 
L
G
 
G
S
 
E
D
 
K
K
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
G
I
 
I
L
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
A
T
x
I
Y
x
L
T
|
T
E
 
D
R
 
A
V
 
L
E
 
K
E
 
S
L
 
V
I
 
I
N
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
T
K
 
P
E
 
E
A
 
I
E
 
E
I
 
Q
A
 
K
R
 
M
V
 
L
S
 
Q
A
 
H
T
 
T
V
 
-
P
 
P
L
 
I
G
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
E
 
Q
E
 
D
F
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
A
A
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
F
 
W
V
 
V
N
 
S
G
 
G
V
 
Q
M
 
I
L
 
L
E
 
T
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
G
I
 
V
Q
 
Q

1ahhA 7 alpha-hydroxysteroid dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
33% identity, 98% coverage: 2:259/262 of query aligns to 6:252/253 of 1ahhA

query
sites
1ahhA
D
 
N
L
 
L
Q
 
R
L
 
L
R
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
C
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
A
x
G
A
 
A
S
 
G
K
x
A
G
|
G
L
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
E
T
 
I
A
 
A
R
 
I
Q
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
T
E
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
S
V
 
V
A
 
V
I
 
V
C
 
S
A
x
D
R
x
I
S
 
N
E
 
A
S
 
D
I
 
A
D
 
A
T
 
N
T
 
H
A
 
V
A
 
V
E
 
D
I
 
E
A
 
I
S
 
Q
E
 
Q
T
 
L
G
 
G
T
 
G
E
 
Q
V
 
A
L
 
F
S
 
A
L
 
C
R
 
R
A
x
C
D
|
D
V
x
I
T
 
T
S
 
S
Q
 
E
A
 
Q
D
 
E
I
 
L
E
 
S
R
 
A
V
 
L
I
 
A
N
 
D
T
 
F
T
 
A
V
 
I
E
 
S
R
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
K
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
G
 
G
P
 
G
P
 
G
A
 
P
G
 
K
T
 
P
F
 
F
D
 
-
D
 
D
I
 
M
D
 
P
L
 
M
A
 
A
T
 
D
W
 
F
E
 
R
T
 
R
S
 
A
I
 
Y
N
 
E
L
 
L
T
 
N
L
 
V
L
 
F
S
 
S
A
 
F
V
 
F
R
 
H
L
 
L
V
 
S
K
 
Q
F
 
L
A
 
V
L
 
A
P
 
P
H
 
E
L
 
M
R
 
E
Q
 
K
S
 
N
T
 
G
T
 
G
P
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
L
T
 
T
I
 
I
T
|
T
S
|
S
T
 
M
S
 
A
T
 
A
K
 
E
Q
 
N
P
 
K
V
 
N
E
 
I
N
 
N
L
x
M
V
 
T
L
 
S
S
x
Y
N
 
A
S
 
S
I
 
S
R
x
K
L
 
A
A
 
A
V
 
A
I
 
S
G
 
H
L
 
L
T
 
V
K
 
R
T
 
N
L
 
M
S
 
A
Q
 
F
E
 
D
L
 
L
G
 
G
S
 
E
D
 
K
K
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
G
I
 
I
L
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
A
T
x
I
Y
 
L
T
 
T
E
 
D
R
 
A
V
 
L
E
 
K
E
 
S
L
 
V
I
 
I
N
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
T
K
 
P
E
 
E
A
 
I
E
 
E
I
 
Q
A
 
K
R
 
M
V
 
L
S
 
Q
A
 
H
T
 
T
V
 
-
P
 
P
L
 
I
G
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
E
 
Q
E
 
D
F
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
A
A
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
F
 
W
V
 
V
N
 
S
G
 
G
V
 
Q
M
 
I
L
 
L
E
 
T
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
G
I
 
V
Q
 
Q

6jhaA Crystal structure of NADPH bound aerf from microcystis aeruginosa (see paper)
32% identity, 98% coverage: 1:256/262 of query aligns to 1:237/242 of 6jhaA

query
sites
6jhaA
M
 
M
D
 
D
L
 
L
Q
 
G
L
 
L
R
 
K
G
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
x
G
A
 
S
S
|
S
K
 
A
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
F
A
 
T
T
 
I
A
 
A
R
 
E
Q
 
K
F
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
C
K
 
H
V
 
L
A
 
I
I
 
I
C
 
C
A
x
G
R
|
R
-
x
N
S
 
S
E
 
Q
S
 
R
I
 
L
D
 
E
T
 
Q
T
 
A
A
 
Y
A
 
Q
E
 
S
I
 
L
A
 
A
-
 
Q
S
 
A
E
 
Y
T
 
P
G
 
A
T
 
Q
E
 
Q
V
 
I
L
 
L
S
 
R
L
 
L
R
 
V
A
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
H
S
 
Q
Q
 
A
A
 
Q
D
 
D
I
 
S
E
 
E
R
 
Q
V
 
L
I
 
I
N
 
Q
T
 
D
T
 
S
V
 
L
E
 
N
R
 
Q
F
 
Y
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
N
N
|
N
A
x
S
G
x
E
G
 
G
P
 
N
P
 
L
A
 
I
G
 
E
T
 
N
F
 
L
D
 
S
D
 
D
I
 
E
D
 
D
L
 
-
A
 
-
T
 
-
W
 
W
E
 
L
T
 
N
S
 
V
I
 
F
N
 
Q
L
 
G
T
x
K
L
 
L
L
 
I
S
 
G
A
 
Y
V
 
I
R
 
R
L
 
L
V
 
T
K
 
N
F
 
L
A
 
V
L
 
L
P
 
P
H
 
I
L
 
M
R
 
K
Q
 
K
S
 
Q
T
 
H
T
 
W
P
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
V
T
 
N
I
|
I
T
 
I
S
 
-
T
 
-
S
 
-
T
 
-
K
 
-
Q
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
N
 
-
L
|
L
V
 
V
L
 
K
S
|
S
N
 
G
S
 
V
I
 
V
R
 
N
L
 
A
A
 
A
V
 
L
I
 
M
G
 
N
L
 
F
T
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
V
S
 
A
Q
 
R
E
 
Q
L
 
T
G
 
A
S
 
P
D
 
Y
K
 
N
I
 
V
R
 
L
V
 
I
N
 
N
S
 
S
I
 
V
L
 
N
P
|
P
G
 
G
W
 
V
T
 
I
Y
 
D
T
|
T
E
 
P
R
|
R
V
 
H
E
 
R
E
 
E
L
 
Y
I
 
L
N
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
E
T
 
I
K
 
Y
E
 
D
A
 
L
E
 
I
I
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
I
S
 
L
A
 
K
T
 
T
V
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
N
R
 
R
I
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
T
E
 
E
E
 
E
F
 
F
A
 
A
N
 
N
V
 
L
A
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
P
 
E
A
 
C
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
I
M
 
T
L
 
I
E
 
P
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3ai2A The crystal structure of l-sorbose reductase from gluconobacter frateurii complexed with NADPH (see paper)
33% identity, 99% coverage: 1:259/262 of query aligns to 1:261/263 of 3ai2A

query
sites
3ai2A
M
 
M
D
 
D
L
 
M
Q
 
G
L
 
I
R
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
A
x
G
A
 
S
S
|
S
K
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
Q
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
H
V
 
I
A
 
V
I
 
L
C
 
V
A
|
A
R
|
R
S
x
Q
-
 
V
E
 
D
S
 
R
I
 
L
D
 
H
T
 
E
T
 
A
A
 
A
A
 
R
E
 
S
I
 
L
A
 
K
S
 
E
E
 
K
T
 
F
G
 
G
T
 
V
E
 
R
V
 
V
L
 
L
S
 
E
L
 
V
R
 
A
A
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
A
S
 
T
Q
 
P
A
 
E
D
 
G
I
 
V
E
 
D
R
 
A
V
 
V
I
 
V
N
 
E
T
 
S
T
 
V
V
 
R
E
 
S
R
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
G
 
T
P
 
G
P
 
S
A
 
N
G
 
E
T
 
T
F
 
I
D
 
M
D
 
E
I
 
A
D
 
A
L
 
D
A
 
E
T
 
K
W
 
W
E
 
Q
T
 
F
S
 
Y
I
 
W
N
 
E
L
 
L
T
 
H
L
 
V
L
 
M
S
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
V
 
A
K
 
R
F
 
G
A
 
L
L
 
V
P
 
P
H
 
G
L
 
M
R
 
R
Q
 
A
S
 
R
T
 
G
T
 
G
P
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
I
T
 
H
I
x
N
T
 
A
S
|
S
T
 
I
S
 
C
T
 
A
K
 
V
Q
 
Q
P
 
P
V
 
L
E
 
W
N
 
Y
L
 
E
V
 
P
L
 
I
S
x
Y
N
 
N
S
 
V
I
 
T
R
x
K
L
 
A
A
 
A
V
 
L
I
 
M
G
 
M
L
 
F
T
 
S
K
 
K
T
 
T
L
 
L
S
 
A
Q
 
T
E
 
E
L
 
V
G
 
I
S
 
K
D
 
D
K
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
C
I
 
I
L
 
N
P
|
P
G
 
G
-
 
L
-
x
I
-
 
L
-
x
T
-
 
P
-
 
D
W
|
W
T
 
I
Y
 
K
T
 
T
E
 
A
R
 
K
V
 
-
E
 
-
E
 
E
L
 
L
I
 
T
N
 
K
A
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
D
K
 
N
S
 
G
G
 
G
E
 
D
T
 
W
K
 
K
E
 
G
A
 
Y
E
 
L
I
 
Q
A
 
S
R
 
V
V
 
A
S
 
D
A
 
E
T
 
H
V
 
A
P
 
P
L
 
I
G
 
K
R
 
R
I
 
F
G
 
A
T
 
S
P
 
P
E
 
E
E
 
E
F
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
F
A
 
F
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
P
 
E
A
 
R
A
 
A
S
 
T
F
 
Y
V
 
S
N
 
V
G
 
G
V
 
S
M
 
A
L
 
Y
E
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
M
I
 
L
Q
 
K

3ai3C The crystal structure of l-sorbose reductase from gluconobacter frateurii complexed with NADPH and l-sorbose (see paper)
33% identity, 99% coverage: 1:259/262 of query aligns to 1:261/263 of 3ai3C

query
sites
3ai3C
M
 
M
D
 
D
L
 
M
Q
 
G
L
 
I
R
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
A
x
G
A
 
S
S
|
S
K
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
Q
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
H
V
 
I
A
 
V
I
 
L
C
 
V
A
|
A
R
|
R
S
x
Q
-
 
V
E
 
D
S
x
R
I
 
L
D
 
H
T
 
E
T
 
A
A
 
A
A
 
R
E
 
S
I
 
L
A
 
K
S
 
E
E
 
K
T
 
F
G
 
G
T
 
V
E
 
R
V
 
V
L
 
L
S
 
E
L
 
V
R
 
A
A
 
V
D
|
D
V
|
V
T
 
A
S
 
T
Q
 
P
A
 
E
D
 
G
I
 
V
E
 
D
R
 
A
V
 
V
I
 
V
N
 
E
T
 
S
T
 
V
V
 
R
E
 
S
R
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
G
 
T
P
x
G
P
 
S
A
 
N
G
 
E
T
 
T
F
 
I
D
 
M
D
 
E
I
 
A
D
 
A
L
 
D
A
 
E
T
 
K
W
 
W
E
 
Q
T
 
F
S
 
Y
I
 
W
N
 
E
L
 
L
T
 
L
L
 
V
L
 
M
S
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
V
 
A
K
 
R
F
 
G
A
 
L
L
 
V
P
 
P
H
 
G
L
 
M
R
 
R
Q
 
A
S
 
R
T
 
G
T
 
G
P
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
I
T
 
H
I
x
N
T
 
A
S
|
S
T
 
I
S
 
C
T
 
A
K
 
V
Q
 
Q
P
 
P
V
 
L
E
 
W
N
 
Y
L
x
E
V
 
P
L
 
I
S
x
Y
N
 
N
S
 
V
I
 
T
R
x
K
L
 
A
A
 
A
V
 
L
I
 
M
G
 
M
L
 
F
T
 
S
K
 
K
T
 
T
L
 
L
S
 
A
Q
 
T
E
 
E
L
 
V
G
 
I
S
 
K
D
 
D
K
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
C
I
 
I
L
 
N
P
|
P
G
|
G
-
 
L
-
x
I
-
 
L
-
x
T
-
 
P
-
 
D
W
|
W
T
 
I
Y
 
K
T
 
T
E
 
A
R
 
K
V
 
-
E
 
-
E
 
E
L
 
L
I
 
T
N
 
K
A
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
D
K
 
N
S
 
G
G
 
G
E
 
D
T
 
W
K
 
K
E
 
G
A
 
Y
E
 
L
I
 
Q
A
 
S
R
 
V
V
 
A
S
 
D
A
 
E
T
 
H
V
 
A
P
 
P
L
 
I
G
 
K
R
 
R
I
 
F
G
 
A
T
 
S
P
 
P
E
 
E
E
 
E
F
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
F
A
 
F
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
P
 
E
A
 
R
A
 
A
S
 
T
F
 
Y
V
 
S
N
 
V
G
 
G
V
 
S
M
x
A
L
 
Y
E
x
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
M
I
 
L
Q
 
K

Sites not aligning to the query:

3ai3A The crystal structure of l-sorbose reductase from gluconobacter frateurii complexed with NADPH and l-sorbose (see paper)
33% identity, 99% coverage: 1:259/262 of query aligns to 1:261/263 of 3ai3A

query
sites
3ai3A
M
 
M
D
 
D
L
 
M
Q
 
G
L
 
I
R
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
A
x
G
A
 
S
S
|
S
K
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
Q
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
H
V
 
I
A
 
V
I
 
L
C
 
V
A
|
A
R
|
R
S
x
Q
-
 
V
E
 
D
S
x
R
I
 
L
D
 
H
T
 
E
T
 
A
A
 
A
A
 
R
E
 
S
I
 
L
A
 
K
S
 
E
E
 
K
T
 
F
G
 
G
T
 
V
E
 
R
V
 
V
L
 
L
S
 
E
L
 
V
R
 
A
A
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
A
S
 
T
Q
 
P
A
 
E
D
 
G
I
 
V
E
 
D
R
 
A
V
 
V
I
 
V
N
 
E
T
 
S
T
 
V
V
 
R
E
 
S
R
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
G
 
T
P
x
G
P
 
S
A
 
N
G
 
E
T
 
T
F
 
I
D
 
M
D
 
E
I
 
A
D
 
A
L
 
D
A
 
E
T
 
K
W
 
W
E
 
Q
T
 
F
S
 
Y
I
 
W
N
 
E
L
 
L
T
 
L
L
 
V
L
 
M
S
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
V
 
A
K
 
R
F
 
G
A
 
L
L
 
V
P
 
P
H
 
G
L
 
M
R
 
R
Q
 
A
S
 
R
T
 
G
T
 
G
P
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
I
T
 
H
I
x
N
T
 
A
S
|
S
T
 
I
S
 
C
T
 
A
K
 
V
Q
 
Q
P
 
P
V
x
L
E
 
W
N
 
Y
L
x
E
V
 
P
L
 
I
S
x
Y
N
 
N
S
 
V
I
 
T
R
x
K
L
 
A
A
 
A
V
 
L
I
 
M
G
 
M
L
 
F
T
 
S
K
 
K
T
 
T
L
 
L
S
 
A
Q
 
T
E
 
E
L
 
V
G
 
I
S
 
K
D
 
D
K
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
C
I
 
I
L
 
N
P
|
P
G
|
G
-
 
L
-
x
I
-
 
L
-
x
T
-
 
P
-
 
D
W
|
W
T
 
I
Y
 
K
T
 
T
E
 
A
R
 
K
V
 
-
E
 
-
E
 
E
L
 
L
I
 
T
N
 
K
A
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
D
K
 
N
S
 
G
G
 
G
E
 
D
T
 
W
K
 
K
E
 
G
A
 
Y
E
 
L
I
 
Q
A
 
S
R
 
V
V
 
A
S
 
D
A
 
E
T
 
H
V
 
A
P
 
P
L
 
I
G
 
K
R
 
R
I
 
F
G
 
A
T
 
S
P
 
P
E
 
E
E
 
E
F
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
F
A
 
F
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
P
 
E
A
 
R
A
 
A
S
 
T
F
 
Y
V
 
S
N
 
V
G
 
G
V
 
S
M
 
A
L
 
Y
E
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
M
I
 
L
Q
 
K

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
33% identity, 96% coverage: 5:256/262 of query aligns to 3:244/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
R
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
A
S
 
G
K
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
T
 
V
A
 
A
R
 
H
Q
 
S
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
V
C
 
S
A
x
D
R
x
I
S
 
N
E
 
E
S
 
D
I
 
H
D
 
G
T
 
N
T
 
K
A
 
A
A
 
V
E
 
E
I
 
D
A
 
I
S
 
K
E
 
A
T
 
Q
G
 
G
T
 
G
E
 
E
V
 
A
L
 
S
S
 
F
L
 
V
R
 
K
A
|
A
D
|
D
V
x
T
T
 
S
S
 
N
Q
 
P
A
 
E
D
 
E
I
 
V
E
 
E
R
 
A
V
 
L
I
 
V
N
 
K
T
 
R
T
 
T
V
 
V
E
 
E
R
 
I
F
 
Y
G
 
G
G
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
T
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
-
 
I
G
 
G
P
 
G
P
 
E
A
 
Q
G
 
A
T
 
L
F
 
A
D
 
G
D
 
D
I
 
Y
D
 
G
L
 
L
A
 
D
T
 
S
W
 
W
E
 
R
T
 
K
S
 
V
I
 
L
N
 
S
L
 
I
T
 
N
L
 
L
L
 
D
S
 
G
A
 
V
V
 
F
R
 
Y
L
 
G
V
 
C
K
 
K
F
 
Y
A
 
E
L
 
L
P
 
E
H
 
Q
L
 
M
R
 
E
Q
 
K
S
 
N
T
 
G
T
 
G
P
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
V
T
 
N
I
x
M
T
 
A
S
|
S
T
 
I
S
 
H
-
 
G
-
 
I
T
 
V
K
 
A
Q
 
A
P
 
P
V
 
L
E
 
S
N
 
S
L
 
A
V
x
Y
L
 
-
S
 
-
N
 
T
S
 
S
I
 
A
R
x
K
L
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
N
L
 
I
S
 
G
Q
 
A
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
S
 
Q
D
 
K
K
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
S
 
A
I
 
V
L
 
G
P
|
P
G
x
A
W
x
Y
T
x
I
Y
 
E
T
 
T
E
 
P
R
x
L
V
 
L
E
 
E
E
 
S
L
 
L
I
 
T
N
 
K
A
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
E
T
 
M
K
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
L
I
 
I
A
 
S
R
 
K
V
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
H
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
F
 
V
A
 
A
N
 
E
V
 
L
A
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
S
S
 
S
P
 
E
A
 
K
A
 
S
S
 
S
F
 
F
V
 
M
N
 
T
G
 
G
V
 
G
M
 
Y
L
 
Y
E
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5jc8D Crystal structure of a putative short-chain dehydrogenase/reductase from burkholderia xenovorans
34% identity, 97% coverage: 4:256/262 of query aligns to 3:256/262 of 5jc8D

query
sites
5jc8D
Q
 
R
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
A
 
G
A
 
A
S
 
G
K
 
C
-
 
I
-
 
G
-
 
P
-
 
G
-
 
W
G
|
G
L
 
N
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
V
Q
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
H
V
 
V
A
 
I
I
 
A
C
 
V
A
 
D
R
 
R
S
 
D
-
 
L
E
 
A
S
 
S
I
 
M
D
 
D
T
 
A
T
 
T
A
 
L
A
 
-
E
 
E
I
 
L
A
 
V
S
 
R
E
 
A
T
 
A
G
 
G
T
 
G
E
 
S
V
 
V
L
 
T
S
 
P
L
 
C
R
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
V
T
 
T
S
 
D
Q
 
S
A
 
A
D
 
S
I
 
V
E
 
E
R
 
R
V
 
L
I
 
V
N
 
A
T
 
D
T
 
S
V
 
V
E
 
A
R
 
R
F
 
C
G
 
G
G
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
N
N
 
N
A
 
V
G
 
G
G
 
A
P
 
P
P
 
S
A
 
P
G
 
G
T
 
G
F
 
P
D
 
V
D
 
A
I
 
L
D
 
D
L
 
E
A
 
A
T
 
Q
W
 
W
E
 
A
T
 
M
S
 
Q
I
 
L
N
 
E
L
 
L
T
 
N
L
 
L
L
 
T
S
 
T
A
 
A
V
 
F
R
 
L
L
 
M
V
 
C
K
 
K
F
 
Y
A
 
V
L
 
L
P
 
P
H
 
V
L
 
M
R
 
E
Q
 
Q
S
 
Q
T
 
G
T
 
G
P
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
T
 
N
I
 
I
T
 
A
S
|
S
T
 
T
S
 
S
-
 
G
T
 
I
K
 
R
Q
 
W
P
 
T
V
 
G
E
 
A
N
 
A
L
 
Q
V
 
V
L
 
G
S
x
Y
N
 
A
S
 
A
I
 
A
R
x
K
L
 
A
A
 
G
V
 
M
I
 
I
G
 
Q
L
 
M
T
 
G
K
 
R
T
 
V
L
 
V
S
 
A
Q
 
V
E
 
E
L
 
Y
G
 
A
S
 
A
D
 
K
K
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
S
I
 
V
L
 
V
P
 
P
G
 
G
W
 
L
T
 
L
Y
 
H
T
 
T
E
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
E
x
P
L
x
M
I
 
V
N
 
D
A
 
T
R
 
K
I
 
I
A
 
A
K
 
H
S
 
N
G
 
G
E
 
D
T
 
V
K
 
-
E
 
E
A
 
L
E
 
L
I
 
L
A
 
R
R
 
K
V
 
R
S
 
Q
A
 
A
T
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
P
R
 
F
I
 
M
G
 
G
T
 
D
P
 
G
E
 
R
E
 
D
F
 
T
A
 
A
N
 
N
V
 
A
A
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
E
A
 
A
S
 
R
F
 
F
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
T
M
 
E
L
 
I
E
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

8hsaA Brucella melitensis 7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase mutant: 1-53 truncation/m196i/i258m/k262t-NAD+
34% identity, 98% coverage: 3:259/262 of query aligns to 3:248/248 of 8hsaA

query
sites
8hsaA
L
 
F
Q
 
H
L
 
L
R
 
N
G
 
D
K
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
A
S
 
A
K
 
A
G
 
G
L
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
G
Q
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
S
V
 
V
A
 
V
I
 
V
C
 
T
-
x
D
A
x
L
R
 
K
S
 
S
E
 
E
S
 
G
I
 
A
D
 
E
T
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
A
I
 
I
A
 
-
S
 
R
E
 
Q
T
 
A
G
 
G
T
 
G
E
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
G
L
 
L
R
 
E
A
x
C
D
x
N
V
|
V
T
 
T
S
 
D
Q
 
E
A
 
Q
D
 
H
I
 
R
E
 
E
R
 
A
V
 
V
I
 
I
N
 
K
T
 
A
T
 
A
V
 
L
E
 
D
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
T
I
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
G
 
G
P
 
G
P
 
G
A
 
P
G
 
K
T
 
P
F
 
F
D
 
-
D
 
D
I
 
M
D
 
P
L
 
M
A
 
S
T
 
D
W
 
F
E
 
E
T
 
W
S
 
A
I
 
F
N
 
K
L
 
L
T
 
N
L
 
L
L
 
F
S
 
S
A
 
L
V
 
F
R
 
R
L
 
L
V
 
S
K
 
Q
F
 
L
A
 
A
L
 
A
P
 
P
H
 
H
L
 
M
R
 
Q
Q
 
K
S
 
A
T
 
G
T
 
G
P
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
L
T
 
N
I
|
I
T
x
S
S
 
S
T
 
I
S
 
A
T
 
G
K
 
E
Q
 
N
P
 
T
V
 
N
E
 
V
N
 
R
L
 
M
V
 
A
L
 
S
S
x
Y
N
 
G
S
 
S
I
 
S
R
x
K
L
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
N
G
 
H
L
 
L
T
 
T
K
 
R
T
 
N
L
 
I
S
 
A
Q
 
F
E
 
D
L
 
V
G
 
G
S
 
P
D
 
M
K
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
I
L
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
A
T
 
M
Y
 
K
T
 
T
E
 
D
R
 
A
V
 
L
E
 
A
E
 
T
L
 
V
I
 
L
N
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
T
K
 
P
E
 
E
A
 
I
E
 
E
I
 
R
A
 
A
R
 
M
V
 
L
S
 
K
A
 
H
T
 
T
V
 
-
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
E
P
 
A
E
 
Q
E
 
D
F
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
A
A
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
A
F
 
W
V
 
I
N
 
S
G
 
G
V
 
Q
M
 
V
L
 
L
E
 
T
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
G
I
 
V
Q
 
Q

5t5qC Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase sdr:glucose/ribitol dehydrogenase from brucella melitensis
32% identity, 98% coverage: 1:256/262 of query aligns to 1:241/245 of 5t5qC

query
sites
5t5qC
M
 
M
D
 
K
L
 
F
Q
 
E
L
 
F
R
 
E
G
 
N
K
 
R
V
 
T
A
 
L
L
 
V
I
 
L
T
 
T
A
 
G
A
 
A
S
x
N
K
x
G
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
Q
 
L
F
 
F
A
 
H
R
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
K
 
N
V
 
L
A
 
V
I
 
L
C
 
T
-
x
D
A
x
L
R
 
D
S
 
R
E
 
E
S
 
G
I
 
L
D
 
D
T
 
A
T
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
S
I
 
L
A
 
G
S
 
S
E
 
P
T
 
E
G
 
-
T
 
-
E
 
R
V
 
I
L
 
A
S
 
T
L
 
I
R
 
K
A
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
S
S
 
S
Q
 
A
A
 
D
D
 
D
I
 
A
E
 
E
R
 
K
V
 
T
I
 
V
N
 
A
T
 
L
T
 
A
V
 
M
E
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
F
L
 
L
V
 
V
T
 
P
N
x
S
A
 
A
G
 
G
G
 
I
P
 
Y
P
 
Q
A
 
A
G
 
K
T
 
P
F
 
F
D
 
A
D
 
E
I
 
M
D
 
S
L
 
D
A
 
A
T
 
D
W
 
W
E
 
H
T
 
R
S
 
T
I
 
I
N
 
S
L
x
I
T
 
N
L
 
L
L
 
D
S
 
G
A
 
V
V
 
F
R
 
Y
L
 
L
V
 
C
K
 
K
F
 
R
A
 
A
L
 
L
P
 
P
H
 
A
L
 
L
R
 
K
Q
 
E
S
 
D
T
 
S
T
 
S
P
 
-
A
 
-
I
 
I
L
 
V
T
 
T
I
 
L
T
 
A
S
|
S
T
 
L
S
 
A
T
 
A
K
 
Y
Q
 
R
P
 
G
V
 
A
E
 
Y
N
 
V
L
x
N
V
 
A
L
 
H
S
x
Y
N
 
G
S
 
A
I
 
T
R
x
K
L
 
G
A
 
A
V
 
M
I
 
V
G
 
S
L
 
M
T
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
S
 
S
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
-
S
 
A
D
 
P
K
 
K
I
 
T
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
G
I
 
V
L
 
S
P
|
P
G
 
G
W
 
I
T
x
I
Y
 
E
T
|
T
E
 
P
R
x
M
V
 
T
E
 
S
E
 
E
L
 
L
I
 
L
N
 
K
A
 
T
R
 
R
I
 
M
A
 
D
K
 
E
S
 
T
G
 
-
E
 
-
T
 
-
K
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
S
 
M
A
 
T
T
 
Q
V
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
K
R
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
S
E
 
E
F
 
I
A
 
A
N
 
S
V
 
V
A
 
I
V
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
C
S
 
S
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
E
M
 
T
L
 
I
E
 
Q
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

6ci9D Rmm microcompartment-associated aminopropanol dehydrogenase NADP + aminoacetone holo-structure (see paper)
31% identity, 98% coverage: 1:258/262 of query aligns to 3:250/259 of 6ci9D

query
sites
6ci9D
M
 
M
D
 
F
L
 
T
Q
 
S
L
 
L
R
 
E
G
 
G
K
 
R
V
 
S
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
G
S
|
S
K
 
K
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
G
T
 
I
A
 
A
R
 
E
Q
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
N
E
 
A
G
 
G
A
 
V
K
 
D
V
 
V
A
 
V
I
 
I
C
 
T
A
x
G
R
|
R
S
x
N
E
 
Q
S
 
D
-
 
D
I
 
L
D
 
D
T
 
R
T
 
T
A
 
V
A
 
A
E
 
D
I
 
L
A
 
S
S
 
G
E
 
T
T
 
R
G
 
G
T
 
-
E
 
K
V
 
V
L
 
T
S
 
A
L
 
V
R
 
R
A
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
S
 
D
Q
 
P
A
 
E
D
 
D
I
 
A
E
 
R
R
 
R
V
 
T
I
 
V
N
 
A
T
 
E
T
 
T
V
 
V
E
 
S
R
 
R
F
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
V
V
 
C
T
 
A
N
|
N
A
 
A
G
|
G
G
 
I
P
x
F
P
 
P
A
 
S
G
 
G
T
 
R
F
 
L
D
 
E
D
 
D
I
 
L
D
 
T
L
 
P
A
 
D
T
 
D
W
 
I
E
 
E
T
 
Q
S
 
V
I
 
L
N
 
G
L
 
V
T
 
N
L
 
F
L
 
K
S
 
G
A
 
T
V
 
V
R
 
Y
L
 
I
V
 
V
K
 
Q
F
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
Q
H
 
A
L
 
L
R
 
T
Q
 
A
S
 
S
T
 
G
T
 
H
P
 
G
A
 
R
I
 
V
L
 
V
-
 
V
-
x
T
-
 
S
T
x
S
I
 
I
T
|
T
S
 
G
T
 
P
S
 
I
T
 
T
K
 
G
Q
 
Y
P
 
P
V
 
-
E
 
-
N
 
G
L
x
W
V
 
S
L
 
H
S
x
Y
N
 
G
S
 
A
I
 
S
R
x
K
L
 
A
A
 
A
V
 
Q
I
 
L
G
 
G
L
 
F
T
 
L
K
 
R
T
 
T
L
 
A
S
 
A
Q
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
A
S
 
P
D
 
K
K
 
K
I
 
I
R
 
T
V
 
I
N
 
N
S
 
A
I
 
V
L
 
L
P
|
P
G
|
G
W
x
N
T
x
I
Y
 
M
T
|
T
E
 
E
R
x
G
V
x
L
E
 
D
E
 
E
L
 
M
I
 
-
N
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
K
 
G
E
 
Q
A
 
D
E
 
Y
I
 
L
A
 
D
R
 
Q
V
 
M
S
 
A
A
 
S
T
 
A
V
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
S
P
 
V
E
 
A
E
 
D
F
 
I
A
 
G
N
 
N
V
 
A
A
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
F
S
 
A
S
 
T
P
 
D
A
 
E
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
Q
M
 
T
L
 
L
E
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
Q
I
 
V

5ojiA Crystal structure of the dehydrogenase/reductase sdr family member 4 (dhrs4) from caenorhabditis elegans (see paper)
30% identity, 97% coverage: 4:256/262 of query aligns to 7:255/260 of 5ojiA

query
sites
5ojiA
Q
 
R
L
 
F
R
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
A
|
A
A
 
A
S
x
T
K
 
K
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
Q
 
R
F
 
L
A
 
L
R
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
S
V
 
V
A
 
V
I
 
I
C
 
G
A
x
S
R
|
R
S
x
N
E
 
Q
S
 
K
I
x
N
D
 
V
T
 
D
T
 
E
A
 
A
A
 
I
E
 
E
I
 
Y
A
 
L
S
 
K
E
 
N
T
 
K
G
 
G
-
 
L
T
 
T
E
 
K
V
 
V
L
 
A
S
 
G
L
 
I
R
 
A
A
 
G
D
 
H
V
x
I
T
 
A
S
 
S
Q
 
T
A
 
D
D
 
D
I
 
Q
E
 
K
R
 
K
V
 
L
I
 
V
N
 
D
T
 
F
T
 
T
V
 
L
E
 
Q
R
 
K
F
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
N
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
N
N
|
N
A
x
H
G
|
G
G
 
I
P
 
N
P
 
P
A
 
A
-
 
F
G
 
G
T
 
H
F
 
I
D
 
L
D
 
E
I
 
V
D
 
S
L
 
D
A
 
Q
T
 
V
W
 
W
E
 
D
T
 
K
S
 
L
I
 
F
N
 
E
L
 
V
T
 
N
L
 
V
L
 
K
S
 
A
A
 
G
V
 
F
R
 
Q
L
 
M
V
 
T
K
 
K
F
 
L
A
 
V
L
 
H
P
 
P
H
 
H
L
 
I
R
 
A
Q
 
K
S
 
E
T
 
G
T
 
G
P
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
I
T
 
F
I
x
N
T
 
A
S
|
S
T
 
Y
S
|
S
T
 
A
K
 
Y
Q
 
K
P
 
S
V
 
P
E
 
P
N
 
G
L
 
I
V
 
A
L
 
A
S
x
Y
N
 
G
S
 
V
I
 
T
R
x
K
L
 
T
A
 
T
V
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
S
 
A
Q
 
M
E
 
G
L
 
L
G
 
A
S
 
K
D
 
D
K
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
G
I
 
I
L
 
A
P
 
P
G
|
G
W
x
V
T
x
I
Y
 
K
T
|
T
E
 
K
R
x
M
V
x
S
E
 
Q
E
 
V
L
|
L
I
 
W
N
 
D
A
 
G
R
 
-
I
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
G
E
 
E
T
 
D
K
 
A
E
 
E
A
 
K
E
 
E
I
 
L
A
 
T
R
 
D
V
 
I
S
 
Q
A
 
-
T
 
E
V
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
V
P
 
P
E
 
D
E
 
D
F
 
C
A
 
A
N
 
G
V
 
T
A
 
V
V
 
A
F
 
Y
L
 
L
S
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
D
A
 
S
S
 
S
F
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
E
M
 
M
L
 
I
E
 
I
V
 
I
D
 
A
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>WP_012407398.1 NCBI__GCF_000020025.1:WP_012407398.1
MDLQLRGKVALITAASKGLGKATARQFAREGAKVAICARSESIDTTAAEIASETGTEVLS
LRADVTSQADIERVINTTVERFGGLDILVTNAGGPPAGTFDDIDLATWETSINLTLLSAV
RLVKFALPHLRQSTTPAILTITSTSTKQPVENLVLSNSIRLAVIGLTKTLSQELGSDKIR
VNSILPGWTYTERVEELINARIAKSGETKEAEIARVSATVPLGRIGTPEEFANVAVFLSS
PAASFVNGVMLEVDGGAIQGTF

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory