SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012408386.1 NCBI__GCF_000020025.1:WP_012408386.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5bshA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with l-proline (see paper)
41% identity, 98% coverage: 5:270/272 of query aligns to 11:271/272 of 5bshA

query
sites
5bshA
F
 
L
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
K
M
 
M
G
 
A
E
 
E
A
 
S
L
 
I
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
A
I
 
V
A
 
R
R
 
S
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
S
S
 
P
S
 
S
E
 
R
V
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
A
I
 
I
V
 
H
S
 
S
E
 
N
P
 
P
L
 
-
P
 
A
S
 
R
R
 
R
L
 
T
D
 
A
F
 
F
L
 
-
Q
 
-
Q
 
E
Q
 
S
Y
 
I
G
 
G
V
 
I
S
 
T
V
 
V
T
 
L
T
 
S
D
 
S
N
 
N
S
 
D
E
 
D
V
 
V
F
 
V
T
 
R
Q
 
D
A
 
S
K
 
N
E
 
V
V
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
-
A
 
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
V
 
L
F
 
L
S
 
K
A
 
D
I
 
V
A
 
V
Q
 
L
E
 
K
L
 
L
A
 
K
D
 
P
I
 
L
D
 
-
I
 
-
I
 
L
N
 
T
R
 
K
E
 
D
Q
 
K
S
 
-
P
 
-
L
 
L
I
 
L
I
 
V
S
 
S
I
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
K
L
 
M
N
 
K
Q
 
D
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
A
 
W
F
 
A
V
 
G
Q
 
H
L
 
E
P
 
R
V
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
E
G
 
A
I
 
A
T
 
S
A
 
V
I
 
M
C
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
A
T
 
A
N
 
T
T
 
E
K
 
E
H
 
D
H
 
A
Q
 
N
I
 
L
A
 
I
Q
 
S
Q
 
Q
V
 
L
F
 
F
S
 
G
A
 
S
V
 
I
G
 
G
E
 
K
V
 
I
V
 
W
E
 
K
V
 
A
S
 
D
E
 
D
G
 
K
L
 
Y
M
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
A
 
Y
L
 
L
L
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
D
I
 
L
A
 
A
N
 
L
Q
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
S
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
S
L
 
M
L
 
A
Y
 
T
E
 
Q
T
 
S
K
 
G
M
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
D
V
|
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
|
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
H
K
 
E
L
 
L
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
G
A
 
I
L
 
L
I
 
M
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
K
R
 
R
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L

5bsgA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NADP+ (see paper)
41% identity, 98% coverage: 5:270/272 of query aligns to 11:271/272 of 5bsgA

query
sites
5bsgA
F
 
L
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
V
x
K
M
|
M
G
 
A
E
 
E
A
 
S
L
 
I
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
A
I
 
V
A
 
R
R
 
S
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
S
S
 
P
S
 
S
E
 
R
V
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
A
I
 
I
V
x
H
S
|
S
E
x
N
P
 
P
L
 
-
P
 
A
S
 
R
R
 
R
L
 
T
D
 
A
F
 
F
L
 
-
Q
 
-
Q
 
E
Q
 
S
Y
 
I
G
 
G
V
 
I
S
 
T
V
 
V
T
 
L
T
 
S
D
 
S
N
|
N
S
 
D
E
 
D
V
 
V
F
 
V
T
 
R
Q
 
D
A
 
S
K
 
N
E
 
V
V
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
-
A
x
S
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
V
x
L
F
 
L
S
 
K
A
 
D
I
x
V
A
 
V
Q
 
L
E
 
K
L
 
L
A
 
K
D
 
P
I
 
L
D
 
-
I
 
-
I
 
L
N
 
T
R
 
K
E
 
D
Q
 
K
S
 
-
P
 
-
L
 
L
I
 
L
I
 
V
S
 
S
I
x
V
L
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
I
P
 
K
L
 
M
N
 
K
Q
 
D
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
A
 
W
F
 
A
V
 
G
Q
 
H
L
 
E
P
 
R
V
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
E
G
 
A
I
 
A
T
 
S
A
 
V
I
 
M
C
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
A
T
 
A
N
 
T
T
 
E
K
 
E
H
 
D
H
 
A
Q
 
N
I
 
L
A
 
I
Q
 
S
Q
 
Q
V
 
L
F
 
F
S
 
G
A
 
S
V
 
I
G
 
G
E
 
K
V
 
I
V
 
W
E
 
K
V
 
A
S
 
D
E
 
D
G
 
K
L
 
Y
M
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
A
 
Y
L
 
L
L
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
D
I
 
L
A
 
A
N
 
L
Q
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
S
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
S
L
 
M
L
 
A
Y
 
T
E
 
Q
T
 
S
K
 
G
M
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
H
K
 
E
L
 
L
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
G
A
 
I
L
 
L
I
 
M
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
K
R
 
R
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L

5bsfA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NAD+ (see paper)
41% identity, 98% coverage: 5:270/272 of query aligns to 11:271/272 of 5bsfA

query
sites
5bsfA
F
 
L
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
V
x
K
M
|
M
G
 
A
E
 
E
A
 
S
L
 
I
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
A
I
 
V
A
 
R
R
 
S
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
S
S
 
P
S
 
S
E
 
R
V
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
A
I
 
I
V
x
H
S
 
S
E
 
N
P
 
P
L
 
-
P
 
A
S
 
R
R
 
R
L
 
T
D
 
A
F
 
F
L
 
-
Q
 
-
Q
 
E
Q
 
S
Y
 
I
G
 
G
V
 
I
S
 
T
V
 
V
T
 
L
T
 
S
D
 
S
N
|
N
S
 
D
E
 
D
V
 
V
F
 
V
T
 
R
Q
 
D
A
 
S
K
 
N
E
 
V
V
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
-
A
x
S
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
V
x
L
F
 
L
S
 
K
A
 
D
I
x
V
A
 
V
Q
 
L
E
 
K
L
 
L
A
 
K
D
 
P
I
 
L
D
 
-
I
 
-
I
 
L
N
 
T
R
 
K
E
 
D
Q
 
K
S
 
-
P
 
-
L
 
L
I
 
L
I
 
V
S
 
S
I
x
V
L
 
A
A
|
A
G
 
G
V
 
I
P
 
K
L
 
M
N
 
K
Q
 
D
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
A
 
W
F
 
A
V
 
G
Q
 
H
L
 
E
P
 
R
V
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
E
G
 
A
I
 
A
T
 
S
A
 
V
I
 
M
C
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
A
T
 
A
N
 
T
T
 
E
K
 
E
H
 
D
H
 
A
Q
 
N
I
 
L
A
 
I
Q
 
S
Q
 
Q
V
 
L
F
 
F
S
 
G
A
 
S
V
 
I
G
 
G
E
 
K
V
 
I
V
 
W
E
 
K
V
 
A
S
 
D
E
 
D
G
 
K
L
 
Y
M
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
A
 
Y
L
 
L
L
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
D
I
 
L
A
 
A
N
 
L
Q
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
S
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
S
L
 
M
L
 
A
Y
 
T
E
 
Q
T
 
S
K
 
G
M
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
H
K
 
E
L
 
L
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
G
A
 
I
L
 
L
I
 
M
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
K
R
 
R
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L

5bseA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) (see paper)
41% identity, 98% coverage: 5:270/272 of query aligns to 11:271/272 of 5bseA

query
sites
5bseA
F
 
L
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
K
M
 
M
G
 
A
E
 
E
A
 
S
L
 
I
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
A
I
 
V
A
 
R
R
 
S
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
S
S
 
P
S
 
S
E
 
R
V
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
A
I
 
I
V
 
H
S
 
S
E
 
N
P
 
P
L
 
-
P
 
A
S
 
R
R
 
R
L
 
T
D
 
A
F
 
F
L
 
-
Q
 
-
Q
 
E
Q
 
S
Y
 
I
G
 
G
V
 
I
S
 
T
V
 
V
T
 
L
T
 
S
D
 
S
N
 
N
S
 
D
E
 
D
V
 
V
F
 
V
T
 
R
Q
 
D
A
 
S
K
 
N
E
 
V
V
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
-
A
 
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
V
 
L
F
 
L
S
 
K
A
 
D
I
 
V
A
 
V
Q
 
L
E
 
K
L
 
L
A
 
K
D
 
P
I
 
L
D
 
-
I
 
-
I
 
L
N
 
T
R
 
K
E
 
D
Q
 
K
S
 
-
P
 
-
L
 
L
I
 
L
I
 
V
S
 
S
I
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
K
L
 
M
N
 
K
Q
 
D
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
A
 
W
F
 
A
V
 
G
Q
 
H
L
 
E
P
 
R
V
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
E
G
 
A
I
 
A
T
 
S
A
 
V
I
 
M
C
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
A
T
 
A
N
 
T
T
 
E
K
 
E
H
 
D
H
 
A
Q
 
N
I
 
L
A
 
I
Q
 
S
Q
 
Q
V
 
L
F
 
F
S
 
G
A
 
S
V
 
I
G
 
G
E
 
K
V
 
I
V
 
W
E
 
K
V
 
A
S
 
D
E
 
D
G
 
K
L
 
Y
M
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
A
 
Y
L
 
L
L
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
D
I
 
L
A
 
A
N
 
L
Q
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
S
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
S
L
 
M
L
 
A
Y
 
T
E
 
Q
T
 
S
K
 
G
M
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
H
K
 
E
L
 
L
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
G
A
 
I
L
 
L
I
 
M
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
K
R
 
R
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L

6xp0A Structure of human pycr1 complexed with n-formyl l-proline (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:270/272 of query aligns to 2:267/272 of 6xp0A

query
sites
6xp0A
T
 
S
I
 
M
K
 
S
F
 
V
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
Q
M
 
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
A
S
 
A
S
 
H
E
 
K
V
 
I
I
 
M
V
 
A
S
 
S
E
 
S
P
 
P
L
 
L
P
 
A
S
 
T
R
 
V
L
 
S
D
 
A
F
 
L
L
 
-
Q
 
-
Q
 
R
Q
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
V
 
L
T
 
T
T
 
P
D
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
F
 
-
T
 
V
Q
 
Q
A
 
H
K
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
F
 
I
S
 
P
A
 
F
I
 
I
A
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
S
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
L
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
L
 
I
N
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
R
Q
 
P
L
 
A
P
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
T
Y
 
H
T
 
A
N
 
Q
T
 
V
K
 
E
H
 
D
H
 
G
Q
 
R
I
 
L
A
 
M
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
L
F
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
V
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
I
 
L
A
 
A
N
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
L
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
L
 
L
Y
 
L
E
 
H
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
S
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
S
A
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L

Q96C36 Pyrroline-5-carboxylate reductase 2; P5C reductase 2; P5CR 2; EC 1.5.1.2 from Homo sapiens (Human) (see paper)
42% identity, 99% coverage: 3:270/272 of query aligns to 1:268/320 of Q96C36

query
sites
Q96C36
I
x
M
K
x
S
F
 
V
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
Q
M
 
L
G
 
A
E
 
Y
A
 
A
L
 
L
L
 
A
S
 
R
R
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
I
Y
 
L
Q
 
S
S
 
A
S
 
H
E
 
K
V
 
I
I
 
I
V
 
A
S
 
S
E
 
S
P
 
P
-
 
E
-
 
M
-
 
N
L
 
L
P
 
P
S
 
T
R
 
V
L
 
S
D
 
A
F
 
L
L
 
-
Q
 
-
Q
 
R
Q
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
N
V
 
L
T
 
T
T
 
R
D
 
S
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
F
 
V
T
 
K
Q
 
H
A
 
S
K
 
-
E
 
D
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
F
 
I
S
 
P
A
 
F
I
 
I
A
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
I
A
 
G
D
 
-
I
 
A
D
 
D
I
 
V
I
 
Q
N
 
A
R
 
R
E
 
H
Q
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
L
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
L
 
I
N
 
S
Q
 
S
L
 
V
E
 
E
A
 
K
-
 
K
-
 
L
-
 
M
A
 
A
F
 
F
V
 
Q
Q
 
P
L
 
A
P
 
P
-
 
K
V
 
V
I
 
I
R
|
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
Q
A
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
T
Y
 
H
T
 
A
N
 
L
T
 
V
K
 
E
H
 
D
H
 
G
Q
 
Q
I
 
L
A
 
L
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
L
F
 
M
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
V
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
A
 
F
L
 
M
L
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
I
 
L
A
 
A
N
 
I
Q
 
Q
L
 
L
A
 
G
L
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
L
 
L
Y
 
L
E
 
D
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
C
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
C
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
A
 
H
K
 
F
L
 
L
E
 
E
Q
 
S
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
|
R
S
 
S
A
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L

8tdcA Structure of pycr1 complexed with nadh and 1,3-dithiane-2-carboxylic acid
41% identity, 99% coverage: 2:270/272 of query aligns to 1:269/276 of 8tdcA

query
sites
8tdcA
T
 
S
I
 
M
K
 
S
F
 
V
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
V
x
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
A
S
 
A
S
 
H
E
 
K
V
 
I
I
 
M
V
 
A
S
 
S
E
x
S
P
|
P
L
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
D
L
 
M
D
 
D
F
 
L
L
 
A
Q
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
L
Q
 
R
Q
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
V
 
L
T
 
T
T
 
P
D
 
H
N
|
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
F
 
-
T
 
V
Q
 
Q
A
 
H
K
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
F
 
I
S
 
P
A
 
F
I
|
I
A
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
S
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
L
 
I
N
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
R
Q
 
P
L
 
A
P
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
T
Y
 
H
T
 
A
N
 
Q
T
 
V
K
 
E
H
 
D
H
 
G
Q
 
R
I
 
L
A
 
M
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
L
F
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
V
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
I
 
L
A
 
A
N
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
L
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
L
 
L
Y
 
L
E
 
H
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
S
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
S
A
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L

8td8A Structure of pycr1 complexed with nadh and 2s-hydroxy-3,3- dimethylbutyric acid
41% identity, 99% coverage: 2:270/272 of query aligns to 1:269/276 of 8td8A

query
sites
8td8A
T
 
S
I
 
M
K
 
S
F
 
V
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
V
x
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
A
S
 
A
S
 
H
E
 
K
V
 
I
I
 
M
V
 
A
S
 
S
E
 
S
P
|
P
L
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
D
L
 
M
D
 
D
F
 
L
L
 
A
Q
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
L
Q
 
R
Q
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
V
 
L
T
 
T
T
 
P
D
 
H
N
|
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
F
 
-
T
 
V
Q
 
Q
A
 
H
K
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
F
 
I
S
 
P
A
 
F
I
 
I
A
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
S
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
L
 
I
N
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
R
Q
 
P
L
 
A
P
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
T
Y
 
H
T
 
A
N
 
Q
T
 
V
K
 
E
H
 
D
H
 
G
Q
 
R
I
 
L
A
 
M
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
L
F
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
V
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
I
 
L
A
 
A
N
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
L
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
L
 
L
Y
 
L
E
 
H
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
S
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
S
A
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L

8td2A Structure of pycr1 complexed with nadh and cyclobutane-1,1- dicarboxylic acid
41% identity, 99% coverage: 2:270/272 of query aligns to 1:269/276 of 8td2A

query
sites
8td2A
T
 
S
I
 
M
K
 
S
F
 
V
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
V
x
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
A
S
 
A
S
 
H
E
 
K
V
 
I
I
 
M
V
 
A
S
 
S
E
 
S
P
|
P
L
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
D
L
 
M
D
 
D
F
x
L
L
 
A
Q
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
L
Q
 
R
Q
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
V
 
L
T
 
T
T
 
P
D
 
H
N
|
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
F
 
-
T
 
V
Q
 
Q
A
 
H
K
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
|
P
Q
 
H
V
 
I
F
 
I
S
 
P
A
 
F
I
|
I
A
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
S
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
L
 
I
N
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
R
Q
 
P
L
 
A
P
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
T
Y
 
H
T
 
A
N
 
Q
T
 
V
K
 
E
H
 
D
H
 
G
Q
 
R
I
 
L
A
 
M
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
L
F
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
V
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
I
 
L
A
 
A
N
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
L
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
L
 
L
Y
 
L
E
 
H
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
S
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
S
A
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L

6xp3A Structure of human pycr1 complexed with cyclopentanecarboxylic acid (see paper)
41% identity, 99% coverage: 2:270/272 of query aligns to 3:271/276 of 6xp3A

query
sites
6xp3A
T
 
S
I
 
M
K
 
S
F
 
V
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
Q
M
 
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
A
S
 
A
S
 
H
E
 
K
V
 
I
I
 
M
V
 
A
S
 
S
E
 
S
P
 
P
L
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
D
L
 
M
D
 
D
F
 
L
L
 
A
Q
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
L
Q
 
R
Q
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
V
 
L
T
 
T
T
 
P
D
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
F
 
-
T
 
V
Q
 
Q
A
 
H
K
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
F
 
I
S
 
P
A
 
F
I
 
I
A
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
S
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
L
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
L
 
I
N
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
R
Q
 
P
L
 
A
P
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
T
Y
 
H
T
 
A
N
 
Q
T
 
V
K
 
E
H
 
D
H
 
G
Q
 
R
I
 
L
A
 
M
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
L
F
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
V
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
|
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
I
 
L
A
 
A
N
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
L
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
L
 
L
Y
 
L
E
 
H
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
S
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
S
A
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L

5uatC Structure of human pycr-1 complexed with NADPH (see paper)
41% identity, 99% coverage: 2:270/272 of query aligns to 4:272/277 of 5uatC

query
sites
5uatC
T
 
S
I
 
M
K
 
S
F
 
V
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
G
x
A
G
|
G
V
x
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
A
S
 
A
S
 
H
E
 
K
V
 
I
I
 
M
V
 
A
S
 
S
E
x
S
P
|
P
L
 
-
P
 
-
S
 
-
R
x
D
L
 
M
D
 
D
F
 
L
L
 
A
Q
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
L
Q
 
R
Q
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
V
 
L
T
 
T
T
 
P
D
 
H
N
|
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
F
 
-
T
 
V
Q
 
Q
A
 
H
K
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
H
V
 
I
F
 
I
S
 
P
A
 
F
I
|
I
A
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
S
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
L
 
I
N
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
R
Q
 
P
L
 
A
P
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
T
Y
 
H
T
 
A
N
 
Q
T
 
V
K
 
E
H
 
D
H
 
G
Q
 
R
I
 
L
A
 
M
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
L
F
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
V
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
I
 
L
A
 
A
N
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
L
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
L
 
L
Y
 
L
E
 
H
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
S
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
S
A
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L

8tddA Structure of pycr1 complexed with nadh and 2-(furan-2-yl)acetic acid
41% identity, 99% coverage: 2:270/272 of query aligns to 3:271/278 of 8tddA

query
sites
8tddA
T
 
S
I
 
M
K
 
S
F
 
V
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
V
x
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
A
S
 
A
S
 
H
E
 
K
V
 
I
I
 
M
V
 
A
S
 
S
E
x
S
P
|
P
L
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
D
L
 
M
D
 
D
F
 
L
L
 
A
Q
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
L
Q
 
R
Q
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
V
 
L
T
 
T
T
 
P
D
 
H
N
|
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
F
 
-
T
 
V
Q
 
Q
A
 
H
K
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
|
P
Q
 
H
V
 
I
F
 
I
S
 
P
A
 
F
I
|
I
A
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
S
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
L
 
I
N
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
R
Q
 
P
L
 
A
P
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
T
Y
 
H
T
 
A
N
 
Q
T
 
V
K
 
E
H
 
D
H
 
G
Q
 
R
I
 
L
A
 
M
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
L
F
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
V
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
|
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
I
 
L
A
 
A
N
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
L
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
L
 
L
Y
 
L
E
 
H
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
S
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
S
A
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L

8td5A Structure of pycr1 complexed with nadh and tetrahydrothiophene-2- carboxylic acid
41% identity, 99% coverage: 2:270/272 of query aligns to 7:275/280 of 8td5A

query
sites
8td5A
T
 
S
I
 
M
K
 
S
F
 
V
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
V
x
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
A
S
 
A
S
 
H
E
 
K
V
 
I
I
 
M
V
 
A
S
 
S
E
x
S
P
|
P
L
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
D
L
 
M
D
 
D
F
x
L
L
 
A
Q
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
L
Q
 
R
Q
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
V
 
L
T
 
T
T
 
P
D
 
H
N
|
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
F
 
-
T
 
V
Q
 
Q
A
 
H
K
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
F
 
I
S
 
P
A
 
F
I
|
I
A
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
S
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
L
 
I
N
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
R
Q
 
P
L
 
A
P
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
T
Y
 
H
T
 
A
N
 
Q
T
 
V
K
 
E
H
 
D
H
 
G
Q
 
R
I
 
L
A
 
M
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
L
F
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
V
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
I
 
L
A
 
A
N
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
L
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
L
 
L
Y
 
L
E
 
H
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
S
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
S
A
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L

8td1A Structure of pycr1 complexed with 3-(6-oxa-9-azaspiro(4.5)decane-9- carbonyl)benzoic acid (see paper)
41% identity, 99% coverage: 2:270/272 of query aligns to 7:275/280 of 8td1A

query
sites
8td1A
T
 
S
I
 
M
K
 
S
F
 
V
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
Q
M
 
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
A
S
 
A
S
 
H
E
 
K
V
 
I
I
 
M
V
 
A
S
 
S
E
 
S
P
 
P
L
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
D
L
 
M
D
 
D
F
 
L
L
 
A
Q
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
L
Q
 
R
Q
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
V
 
L
T
 
T
T
 
P
D
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
F
 
-
T
 
V
Q
 
Q
A
 
H
K
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
F
 
I
S
 
P
A
 
F
I
 
I
A
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
S
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
L
 
I
N
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
R
Q
 
P
L
 
A
P
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
T
Y
 
H
T
 
A
N
 
Q
T
 
V
K
 
E
H
 
D
H
 
G
Q
 
R
I
 
L
A
 
M
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
L
F
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
V
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
I
 
L
A
 
A
N
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
L
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
L
 
L
Y
 
L
E
 
H
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
S
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
S
A
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L

8td0A Structure of pycr1 complexed with 5-oxo-7a-phenyl-hexahydropyrrolo[2, 1-b][1,3]thiazole-3-carboxylic acid (see paper)
41% identity, 99% coverage: 2:270/272 of query aligns to 7:275/280 of 8td0A

query
sites
8td0A
T
 
S
I
 
M
K
 
S
F
 
V
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
A
S
 
A
S
 
H
E
 
K
V
 
I
I
 
M
V
 
A
S
 
S
E
 
S
P
 
P
L
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
D
L
 
M
D
 
D
F
 
L
L
 
A
Q
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
L
Q
 
R
Q
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
V
 
L
T
 
T
T
 
P
D
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
F
 
-
T
 
V
Q
 
Q
A
 
H
K
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
F
 
I
S
 
P
A
 
F
I
 
I
A
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
S
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
L
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
L
 
I
N
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
R
Q
 
P
L
 
A
P
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
T
Y
 
H
T
 
A
N
 
Q
T
 
V
K
 
E
H
 
D
H
 
G
Q
 
R
I
 
L
A
 
M
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
L
F
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
V
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
I
 
L
A
 
A
N
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
L
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
L
 
L
Y
 
L
E
 
H
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
S
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
S
A
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L

8tczA Structure of pycr1 complexed with 2-(pyridin-2-yl)cyclopropane-1- carboxylic acid (see paper)
41% identity, 99% coverage: 2:270/272 of query aligns to 7:275/280 of 8tczA

query
sites
8tczA
T
 
S
I
 
M
K
 
S
F
 
V
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
Q
M
 
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
A
S
 
A
S
 
H
E
 
K
V
 
I
I
 
M
V
 
A
S
 
S
E
 
S
P
 
P
L
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
D
L
 
M
D
 
D
F
 
L
L
 
A
Q
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
L
Q
 
R
Q
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
V
 
L
T
 
T
T
 
P
D
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
F
 
-
T
 
V
Q
 
Q
A
 
H
K
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
F
 
I
S
 
P
A
 
F
I
 
I
A
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
S
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
L
 
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
L
 
I
N
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
R
Q
 
P
L
 
A
P
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
T
Y
 
H
T
 
A
N
 
Q
T
 
V
K
 
E
H
 
D
H
 
G
Q
 
R
I
 
L
A
 
M
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
L
F
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
V
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
I
 
L
A
 
A
N
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
L
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
L
 
L
Y
 
L
E
 
H
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
S
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
S
A
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L

8tcxA Structure of pycr1 complexed with 2,4-dioxo-1,2,3,4- tetrahydroquinazoline-6-carboxylic acid (see paper)
41% identity, 99% coverage: 2:270/272 of query aligns to 7:275/280 of 8tcxA

query
sites
8tcxA
T
 
S
I
 
M
K
 
S
F
 
V
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
A
S
 
A
S
 
H
E
 
K
V
 
I
I
 
M
V
 
A
S
 
S
E
 
S
P
 
P
L
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
D
L
 
M
D
 
D
F
 
L
L
 
A
Q
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
L
Q
 
R
Q
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
V
 
L
T
 
T
T
 
P
D
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
F
 
-
T
 
V
Q
 
Q
A
 
H
K
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
F
 
I
S
 
P
A
 
F
I
 
I
A
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
S
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
L
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
L
 
I
N
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
R
Q
 
P
L
 
A
P
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
T
Y
 
H
T
 
A
N
 
Q
T
 
V
K
 
E
H
 
D
H
 
G
Q
 
R
I
 
L
A
 
M
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
L
F
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
V
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
I
 
L
A
 
A
N
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
L
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
L
 
L
Y
 
L
E
 
H
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
S
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
S
A
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L

2izzA Crystal structure of human pyrroline-5-carboxylate reductase
41% identity, 99% coverage: 2:270/272 of query aligns to 1:269/272 of 2izzA

query
sites
2izzA
T
 
S
I
 
M
K
 
S
F
 
V
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
V
x
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
A
S
 
A
S
 
H
E
 
K
V
 
I
I
 
M
V
 
A
S
 
S
E
x
S
P
|
P
L
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
D
L
 
M
D
 
D
F
 
L
L
 
A
Q
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
L
Q
 
R
Q
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
V
 
L
T
 
T
T
 
P
D
 
H
N
|
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
F
 
-
T
 
V
Q
 
Q
A
 
H
K
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
F
 
I
S
 
P
A
 
F
I
|
I
A
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
S
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
L
 
I
N
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
R
Q
 
P
L
 
A
P
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
T
Y
 
H
T
 
A
N
 
Q
T
 
V
K
 
E
H
 
D
H
 
G
Q
 
R
I
 
L
A
 
M
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
L
F
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
V
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
I
 
L
A
 
A
N
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
L
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
L
 
L
Y
 
L
E
 
H
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
S
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
S
A
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L

8tcvB Structure of pycr1 complexed with 4-bromobenzene-1,3-dicarboxylic acid (see paper)
41% identity, 99% coverage: 2:270/272 of query aligns to 6:274/279 of 8tcvB

query
sites
8tcvB
T
 
S
I
 
M
K
 
S
F
 
V
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
Q
M
 
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
A
S
 
A
S
 
H
E
 
K
V
 
I
I
 
M
V
 
A
S
 
S
E
 
S
P
 
P
L
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
D
L
 
M
D
 
D
F
 
L
L
 
A
Q
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
L
Q
 
R
Q
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
V
 
L
T
 
T
T
 
P
D
 
H
N
 
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
F
 
-
T
 
V
Q
 
Q
A
 
H
K
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
F
 
I
S
 
P
A
 
F
I
 
I
A
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
S
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
L
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
L
 
I
N
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
R
Q
 
P
L
 
A
P
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
T
Y
 
H
T
 
A
N
 
Q
T
 
V
K
 
E
H
 
D
H
 
G
Q
 
R
I
 
L
A
 
M
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
L
F
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
V
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
I
 
L
A
 
A
N
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
L
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
L
 
L
Y
 
L
E
 
H
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
S
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
S
A
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L

8td9A Structure of pycr1 complexed with nadh and l-pipecolic acid
41% identity, 99% coverage: 2:270/272 of query aligns to 4:272/279 of 8td9A

query
sites
8td9A
T
 
S
I
 
M
K
 
S
F
 
V
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
V
x
Q
M
x
L
G
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
S
 
K
R
 
G
L
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
Q
 
A
S
 
A
S
 
H
E
 
K
V
 
I
I
 
M
V
 
A
S
 
S
E
x
S
P
|
P
L
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
D
L
 
M
D
 
D
F
x
L
L
 
A
Q
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
L
Q
 
R
Q
 
K
Y
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
V
 
L
T
 
T
T
 
P
D
 
H
N
|
N
S
 
K
E
 
E
V
 
T
F
 
-
T
 
V
Q
 
Q
A
 
H
K
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
F
 
I
S
 
P
A
 
F
I
|
I
A
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
-
I
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
S
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
L
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
L
 
I
N
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
R
Q
 
P
L
 
A
P
 
P
-
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
T
 
V
V
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
T
Y
 
H
T
 
A
N
 
Q
T
 
V
K
 
E
H
 
D
H
 
G
Q
 
R
I
 
L
A
 
M
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
L
F
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
V
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
R
I
 
L
A
 
A
N
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
L
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
L
 
L
Y
 
L
E
 
H
T
 
S
K
 
E
M
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
A
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
S
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
S
 
S
A
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
E
 
I
R
 
R
S
 
T
Q
 
R
E
 
E
L
 
L

Query Sequence

>WP_012408386.1 NCBI__GCF_000020025.1:WP_012408386.1
MTIKFGLIGGGVMGEALLSRLIARGIYQSSEVIVSEPLPSRLDFLQQQYGVSVTTDNSEV
FTQAKEVVFLAVKPQVFSAIAQELADIDIINREQSPLIISILAGVPLNQLEAAFVQLPVI
RAMPNTPATVGAGITAICLGAYTNTKHHQIAQQVFSAVGEVVEVSEGLMDAVTGLSGSGP
AYVALLVESLADGGVSAGLPRAIANQLALQTVLGTAKLLYETKMHPAELKDRVTSPGGTT
IAGIAKLEQAGFRSALIEAVKAATERSQELGK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory