SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012409247.1 NCBI__GCF_000020025.1:WP_012409247.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 8 hits to proteins with known functional sites (download)

Q9X015 Nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase/pyrophosphatase MazG; NTP-PPase; EC 3.6.1.1; EC 3.6.1.9 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
39% identity, 93% coverage: 12:266/273 of query aligns to 8:251/255 of Q9X015

query
sites
Q9X015
L
 
F
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
V
E
 
S
V
 
I
V
 
M
A
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
R
S
 
S
P
 
P
D
 
E
G
 
G
G
 
-
C
 
C
P
 
E
W
 
W
D
 
D
L
 
R
A
 
K
Q
 
Q
T
 
T
A
 
H
E
 
E
T
 
S
L
 
L
T
 
K
P
 
P
Y
 
Y
V
 
L
I
 
I
E
|
E
E
|
E
A
 
C
Y
 
Y
E
|
E
V
 
L
V
 
I
D
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
D
S
 
E
G
 
K
D
 
N
Q
 
D
K
 
D
A
 
M
I
 
M
A
 
K
E
 
E
E
|
E
L
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
V
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
F
Q
 
H
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
S
 
R
E
 
E
S
 
R
G
 
G
Q
 
A
F
 
F
S
 
T
L
 
I
K
 
E
E
 
D
I
 
V
T
 
I
Q
 
R
G
 
T
I
 
L
S
 
N
Q
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
I
R
|
R
R
|
R
H
 
H
P
 
P
H
 
H
V
 
V
F
 
F
G
 
G
D
 
D
V
 
S
S
 
P
V
 
G
A
 
Y
S
 
S
V
 
Y
D
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
Q
 
K
N
 
Q
W
 
W
E
 
E
Q
 
D
I
 
I
K
|
K
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
K
 
K
G
 
G
E
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
K
K
 
K
L
 
K
S
 
S
A
 
S
K
 
R
L
 
I
G
 
G
R
 
E
Y
 
I
G
 
N
R
 
P
T
 
L
L
 
V
P
 
P
P
 
A
L
 
L
T
 
S
A
 
M
A
 
A
M
 
R
K
 
R
I
 
I
S
 
Q
Q
 
E
K
 
N
A
 
A
A
 
S
A
 
Q
I
 
V
G
 
G
F
 
F
E
 
D
W
 
W
E
 
K
N
 
D
I
 
P
Q
 
E
G
 
G
V
 
V
W
 
-
D
 
-
K
 
-
F
 
Y
H
 
E
E
 
K
E
 
I
L
 
E
G
 
E
E
 
E
F
 
L
Q
 
K
Q
x
E
A
 
L
L
 
K
A
x
E
E
 
A
E
 
K
T
 
D
P
 
P
A
 
R
R
 
E
Q
 
L
Q
 
E
A
x
E
E
|
E
L
 
F
G
 
G
D
 
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
A
 
S
V
 
I
I
 
V
Q
 
N
L
 
L
A
 
S
R
 
R
W
 
F
H
 
L
N
 
N
L
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
E
A
 
S
G
 
A
L
 
L
Q
 
R
G
 
K
T
 
A
N
 
T
Q
 
R
R
 
K
F
 
F
V
 
V
Q
 
E
R
 
R
L
 
F
E
 
K
K
 
K
M
 
M
E
 
E
A
 
E
V
 
L
C
 
I
D
 
E
R
 
K
P
 
D
-
 
G
-
 
L
-
 
V
L
 
L
S
 
E
D
 
E
Y
 
L
S
 
P
L
 
I
D
 
E
E
 
K
L
 
L
E
 
D
N
 
E
L
 
Y
W
 
W
Q
 
E
Q
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
G

P0AEY3 Nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase; NTP-PPase; EC 3.6.1.8 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
40% identity, 94% coverage: 12:267/273 of query aligns to 4:259/263 of P0AEY3

query
sites
P0AEY3
L
 
I
Q
 
D
E
 
R
L
 
L
I
 
L
E
 
T
V
 
I
V
 
M
A
 
Q
K
 
R
L
 
L
R
 
R
S
 
D
P
 
P
D
 
E
G
 
N
G
 
G
C
 
C
P
 
P
W
 
W
D
 
D
L
 
K
A
 
E
Q
 
Q
T
 
T
A
 
F
E
 
A
T
 
T
L
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
Y
V
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
T
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
V
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
A
S
 
R
G
 
E
D
 
D
Q
 
F
K
 
D
A
 
D
I
 
L
A
 
R
E
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
F
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
F
Q
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
I
 
M
A
 
A
S
 
Q
E
 
E
S
 
E
G
 
G
Q
 
R
F
 
F
S
 
D
L
 
F
K
 
N
E
 
D
I
 
I
T
 
C
Q
 
A
G
 
A
I
 
I
S
 
S
Q
 
D
K
 
K
L
 
L
I
 
E
R
 
R
R
|
R
H
 
H
P
 
P
H
 
H
V
 
V
F
 
F
G
 
A
D
 
D
V
 
S
S
 
S
V
 
A
A
 
E
S
 
N
V
 
S
D
 
S
E
 
E
V
 
V
R
 
L
Q
 
A
N
 
R
W
 
W
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
K
|
K
A
 
T
Q
 
E
E
 
E
K
 
R
G
 
A
E
 
Q
P
 
K
S
 
A
P
 
Q
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
S
 
H
A
 
S
K
 
A
L
 
L
G
 
D
R
 
D
Y
 
I
G
 
P
R
 
R
T
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
A
L
 
L
T
 
M
A
 
R
A
 
A
M
 
Q
K
 
K
I
 
I
S
 
Q
Q
 
K
K
 
R
A
 
C
A
 
A
A
 
N
I
 
V
G
 
G
F
 
F
E
 
D
W
 
W
E
 
T
N
 
T
I
 
L
Q
 
G
G
 
P
V
 
V
W
 
V
D
 
D
K
|
K
F
x
V
H
x
Y
E
|
E
E
|
E
L
 
I
G
 
D
E
|
E
F
 
V
-
 
M
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
Q
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
V
E
 
D
E
 
Q
T
 
-
P
 
-
A
 
A
R
x
K
Q
x
L
Q
x
E
A
x
E
E
|
E
L
 
M
G
 
G
D
|
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
A
 
A
V
 
T
I
 
V
Q
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
R
W
 
H
H
 
L
N
 
G
L
 
T
D
 
K
P
 
A
S
 
E
A
 
I
G
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
K
T
 
A
N
 
N
Q
 
E
R
x
K
F
|
F
V
x
E
Q
x
R
R
|
R
L
 
F
E
 
R
K
 
E
M
 
V
E
 
E
A
 
R
V
 
I
C
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
R
D
 
G
R
 
L
P
 
E
L
 
M
S
 
T
D
 
G
Y
 
V
S
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
T
L
 
M
E
 
E
N
 
E
L
 
V
W
|
W
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
V
K
|
K
A
 
R
Q
 
Q

3crcA Crystal structure of escherichia coli mazg, the regulator of nutritional stress response (see paper)
36% identity, 94% coverage: 12:267/273 of query aligns to 3:224/225 of 3crcA

query
sites
3crcA
L
 
I
Q
 
D
E
 
R
L
 
L
I
 
L
E
 
T
V
 
I
V
 
M
A
 
Q
K
 
R
L
 
L
R
 
R
S
 
D
P
 
P
D
 
E
G
 
N
G
 
G
C
 
C
P
 
P
W
 
W
D
 
D
L
 
K
A
 
E
Q
 
Q
T
 
T
A
 
F
E
 
A
T
 
T
L
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
Y
V
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
T
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
V
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
A
S
 
R
G
 
E
D
 
D
Q
 
F
K
 
D
A
 
D
I
 
L
A
 
R
E
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
F
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
F
Q
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
I
 
M
A
 
A
S
 
Q
E
 
E
S
 
E
G
 
G
Q
 
R
F
 
F
S
 
D
L
 
F
K
 
N
E
 
D
I
 
I
T
 
C
Q
 
A
G
 
A
I
 
I
S
 
S
Q
 
D
K
 
K
L
 
L
I
 
E
R
 
R
R
 
R
H
 
H
P
 
P
H
 
S
V
 
A
F
 
L
G
 
D
D
 
D
V
 
I
S
 
P
V
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
Q
 
-
N
 
-
W
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
R
 
R
T
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
A
L
 
L
T
 
M
A
 
R
A
 
A
M
 
Q
K
 
K
I
 
I
S
 
Q
Q
 
K
K
 
R
A
 
C
A
 
A
A
 
N
I
 
V
G
 
G
F
 
F
E
 
D
W
 
W
E
 
T
N
 
T
I
 
L
Q
 
G
G
 
P
V
 
V
W
 
V
D
 
D
K
 
K
F
 
V
H
 
Y
E
 
E
E
 
E
L
 
I
G
 
D
E
 
E
F
 
V
-
 
M
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
Q
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
V
E
 
D
E
 
Q
T
 
-
P
 
-
A
 
A
R
 
K
Q
 
L
Q
 
E
A
 
E
E
 
E
L
 
M
G
 
G
D
 
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
A
 
A
V
 
T
I
 
V
Q
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
R
W
 
H
H
 
L
N
 
G
L
 
T
D
 
K
P
 
A
S
 
E
A
 
I
G
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
K
T
 
A
N
 
N
Q
 
E
R
 
K
F
|
F
V
 
E
Q
 
R
R
|
R
L
 
F
E
 
R
K
 
E
M
 
V
E
 
E
-
 
R
A
 
I
V
 
V
C
 
A
D
 
A
R
 
R
P
 
G
L
 
L
S
 
E
D
 
M
Y
 
T
S
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
T
L
 
M
E
 
E
N
 
E
L
 
V
W
|
W
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
V
K
 
A
A
 
R
Q
 
Q

3crcB Crystal structure of escherichia coli mazg, the regulator of nutritional stress response (see paper)
33% identity, 87% coverage: 31:267/273 of query aligns to 14:218/220 of 3crcB

query
sites
3crcB
W
 
W
D
 
D
L
 
K
A
 
E
Q
 
Q
T
 
T
A
 
F
E
 
A
T
 
T
L
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
Y
V
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
T
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
V
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
A
S
 
R
G
 
E
D
 
D
Q
 
F
K
 
D
A
 
D
I
 
L
A
 
R
E
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
F
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
F
Q
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
I
 
M
A
 
A
S
 
Q
E
 
E
S
 
E
G
 
G
Q
 
R
F
 
F
S
 
D
L
 
F
K
 
N
E
 
D
I
 
I
T
 
C
Q
 
A
G
 
A
I
 
I
S
 
S
Q
 
D
K
 
K
L
 
L
I
 
E
R
 
R
R
 
A
H
 
Q
P
 
H
H
 
S
V
 
A
F
 
L
G
 
D
D
 
D
V
 
I
S
 
P
V
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
Q
 
-
N
 
-
W
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
R
 
R
T
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
A
L
 
L
T
 
M
A
 
R
A
 
A
M
 
Q
K
 
K
I
 
I
S
 
Q
Q
 
K
K
 
R
A
 
C
A
 
A
A
 
N
I
 
V
G
 
G
F
|
F
E
 
D
W
|
W
E
 
T
N
 
T
I
 
L
Q
 
G
G
 
P
V
 
V
W
 
V
D
 
D
K
|
K
F
 
V
H
 
Y
E
 
E
E
|
E
L
 
I
G
 
D
E
|
E
F
 
V
-
 
M
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
Q
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
V
E
 
D
E
 
Q
T
 
-
P
 
-
A
 
A
R
 
K
Q
 
L
Q
 
E
A
 
E
E
|
E
L
 
M
G
 
G
D
|
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
A
 
A
V
 
T
I
 
V
Q
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
R
W
 
H
H
 
L
N
 
G
L
 
T
D
 
K
P
 
A
S
 
E
A
 
I
G
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
K
T
 
A
N
 
N
Q
 
E
R
 
K
F
 
F
V
 
E
Q
 
R
R
 
R
L
 
F
E
 
R
K
 
E
M
 
V
E
 
E
A
 
R
V
 
I
C
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
R
D
 
G
R
 
L
P
 
E
L
 
M
S
 
T
D
 
G
Y
 
V
S
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
T
L
 
M
E
 
E
N
 
E
L
 
V
W
 
W
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
V
K
 
A
A
 
R
Q
 
Q

P96379 Nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase; NTP-PPase; EC 3.6.1.8 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
36% identity, 58% coverage: 13:170/273 of query aligns to 85:235/325 of P96379

query
sites
P96379
Q
 
E
E
 
R
L
 
L
I
 
V
E
 
D
V
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
M
L
 
M
R
 
D
S
 
K
P
 
L
D
 
R
G
 
T
G
 
A
C
 
G
P
 
P
W
 
W
D
 
E
L
 
S
A
 
E
Q
 
Q
T
 
T
A
 
H
E
 
D
T
 
S
L
 
L
T
 
R
P
 
R
Y
 
Y
V
 
L
I
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
T
Y
 
Y
E
 
E
V
 
L
V
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
V
K
 
R
S
 
S
G
 
G
D
 
S
Q
 
V
K
 
D
A
 
Q
I
 
L
A
 
R
E
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
V
 
L
L
 
F
Q
 
H
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
E
E
 
D
S
 
A
G
 
S
Q
 
Q
-
 
S
-
 
P
F
 
F
S
 
T
L
 
I
K
 
D
E
 
D
I
 
V
T
 
A
Q
 
D
G
 
T
I
 
L
S
 
M
Q
 
R
K
 
K
L
 
L
I
 
G
R
 
N
R
 
R
H
 
A
P
 
P
H
 
G
V
 
V
F
 
L
G
 
A
D
 
G
V
 
E
S
 
S
V
 
I
A
 
S
S
 
L
V
 
E
D
 
D
E
 
Q
V
 
L
R
 
A
Q
 
Q
N
 
-
W
 
W
E
 
E
Q
 
A
I
 
A
K
 
K
A
 
A
Q
 
S
E
 
E
K
 
K
G
 
-
E
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
A
Q
 
R
K
 
K
L
 
S
S
 
V
A
 
A
K
 
D
L
 
D
G
 
V
R
 
H
Y
 
T
G
 
G
R
 
Q
T
 
-
L
 
-
P
 
P
P
x
A
L
 
L
T
 
A
A
 
L
A
 
A
M
 
Q
K
 
K
I
 
V
S
 
I
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
A
 
Q
A
 
K
I
 
A
G
 
G
F
 
L

A0R3C4 Nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase; NTP-PPase; EC 3.6.1.8 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
39% identity, 44% coverage: 13:131/273 of query aligns to 85:204/324 of A0R3C4

query
sites
A0R3C4
Q
 
E
E
 
R
L
 
L
I
 
V
E
 
D
V
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
L
L
 
M
R
 
D
S
 
K
P
 
L
D
 
R
G
 
T
G
 
S
C
 
G
P
 
P
W
 
W
D
 
E
L
 
S
A
 
E
Q
 
Q
T
 
T
A
 
H
E
 
D
T
 
S
L
 
L
T
 
R
P
 
R
Y
 
Y
V
 
L
I
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
T
Y
 
Y
E
 
E
V
 
L
V
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
V
K
 
R
S
 
S
G
 
G
D
 
N
Q
 
A
K
 
D
A
 
E
I
 
L
A
 
R
E
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
V
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
V
 
L
L
 
F
Q
 
H
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
E
E
 
D
S
 
A
G
 
P
Q
 
H
-
 
H
-
 
P
F
 
F
S
 
S
L
 
I
K
 
D
E
 
D
I
 
V
T
 
A
Q
 
D
G
 
A
I
 
L
S
 
V
Q
 
R
K
 
K
L
 
L
I
 
G
R
 
N
R
 
R
H
 
V
P
 
P
H
 
A
V
 
V
F
 
L
G
 
A
D
 
G
V
 
E
S
 
S
V
 
I
A
 
-
S
 
S
V
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
Q
R
 
L
Q
 
A
N
 
Q
W
 
W
E
 
E
Q
 
E
I
 
R
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
K
 
K

Sites not aligning to the query:

7yh5B Mazg(mycobacterium tuberculosis) (see paper)
38% identity, 33% coverage: 13:103/273 of query aligns to 85:177/177 of 7yh5B

query
sites
7yh5B
Q
 
E
E
 
R
L
 
L
I
 
V
E
 
D
V
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
M
L
 
M
R
 
D
S
 
K
P
 
L
D
 
R
G
 
T
G
 
A
C
 
G
P
 
P
W
 
W
D
 
E
L
 
S
A
 
E
Q
 
Q
T
 
T
A
 
H
E
 
D
T
 
S
L
 
L
T
 
R
P
 
R
Y
 
Y
V
 
L
I
 
L
E
 
E
E
|
E
A
 
T
Y
 
Y
E
|
E
V
 
L
V
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
V
K
 
R
S
 
S
G
 
G
D
 
S
Q
 
V
K
 
D
A
 
Q
I
 
L
A
 
R
E
 
E
E
|
E
L
 
L
G
 
G
D
|
D
L
 
L
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
V
 
L
L
 
F
Q
 
H
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
E
E
 
D
S
 
A
G
 
S
Q
 
Q
-
 
S
-
 
P
F
 
F
S
 
T
L
 
I
K
 
D
E
 
D
I
 
V
T
 
A
Q
 
D
G
 
T
I
 
L
S
 
M
Q
 
R
K
 
K
L
 
L
I
 
G
R
 
N
R
 
R

2yxhA Crystal structure of mazg-related protein from thermotoga maritima
29% identity, 42% coverage: 12:127/273 of query aligns to 2:113/114 of 2yxhA

query
sites
2yxhA
L
 
V
Q
 
E
E
 
R
L
 
L
I
 
L
E
 
E
V
 
I
V
 
I
A
 
E
K
 
R
-
 
S
L
 
L
R
 
R
S
 
K
P
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
C
 
C
P
 
P
W
 
W
D
 
L
L
 
E
A
 
K
Q
 
Q
T
 
S
A
 
I
E
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
L
P
 
E
Y
 
A
V
 
L
I
 
A
E
 
S
E
|
E
A
 
I
Y
 
E
E
|
E
V
 
V
V
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
K
S
 
K
G
 
N
D
 
D
Q
 
L
K
 
A
A
 
N
I
 
L
A
 
E
E
 
E
E
|
E
L
 
I
G
 
G
D
|
D
L
 
M
L
 
I
L
 
Y
Q
x
D
V
 
A
V
 
L
L
 
L
Q
 
V
A
 
A
Q
 
A
I
 
V
A
 
A
S
 
Q
E
 
R
S
 
D
G
 
Y
Q
 
G
F
 
I
S
 
D
L
 
L
K
 
E
E
 
S
I
 
A
T
 
I
Q
 
Q
G
 
K
I
 
V
S
 
V
Q
 
E
K
 
K
L
 
I
I
 
S
R
 
H
R
 
R
H
 
K
P
 
P
H
 
W
V
 
L
F
 
F
G
 
W
D
 
E
V
 
E
S
 
K
V
 
I
A
 
-
S
 
S
V
 
L
D
 
E
E
 
E
V
 
A
R
 
E
Q
 
K
N
 
I
W
 
W
E
 
K
Q
 
E
I
 
R
K
 
K

Query Sequence

>WP_012409247.1 NCBI__GCF_000020025.1:WP_012409247.1
MTSDKVETLAALQELIEVVAKLRSPDGGCPWDLAQTAETLTPYVIEEAYEVVDAIKSGDQ
KAIAEELGDLLLQVVLQAQIASESGQFSLKEITQGISQKLIRRHPHVFGDVSVASVDEVR
QNWEQIKAQEKGEPSPDAQKLSAKLGRYGRTLPPLTAAMKISQKAAAIGFEWENIQGVWD
KFHEELGEFQQALAEETPARQQAELGDLLFAVIQLARWHNLDPSAGLQGTNQRFVQRLEK
MEAVCDRPLSDYSLDELENLWQQAKAQLAKEGL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory