SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012410662.1 NCBI__GCF_000020025.1:WP_012410662.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6bveA Triosephosphate isomerase of synechocystis in complex with 2- phosphoglycolic acid (see paper)
72% identity, 99% coverage: 1:241/243 of query aligns to 1:241/242 of 6bveA

query
sites
6bveA
M
 
M
R
 
R
K
 
K
I
 
I
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
F
 
H
K
 
K
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
T
 
A
Q
 
Q
E
 
A
F
 
F
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
L
 
K
P
 
P
H
 
L
L
 
I
E
 
E
E
 
D
T
 
A
P
 
A
Q
 
E
G
 
S
R
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
V
L
 
L
C
 
C
P
 
V
P
 
P
F
 
F
T
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
S
V
 
G
L
 
M
S
 
S
K
 
Q
T
 
Q
L
 
L
H
 
H
G
 
G
S
 
G
L
 
R
I
 
V
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
H
 
H
W
 
W
E
 
E
E
 
A
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
G
 
A
P
 
A
M
 
M
L
 
L
T
 
T
E
 
E
S
 
I
G
 
G
V
 
I
R
 
H
F
 
Y
V
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
T
V
 
A
N
 
N
L
 
L
R
 
R
L
 
V
R
 
L
T
 
A
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
F
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
I
P
 
P
I
 
I
L
 
L
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
S
K
 
K
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
E
S
 
Q
L
 
V
I
 
I
A
 
V
L
 
D
Q
 
Q
L
 
V
D
 
K
K
 
K
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
N
I
 
V
D
 
D
Q
 
Q
N
 
S
N
 
N
L
 
L
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
D
T
 
T
C
 
C
E
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
E
A
 
A
N
 
N
R
 
R
I
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
R
S
 
E
Q
 
Q
L
 
L
S
 
T
N
 
N
P
 
S
N
 
Q
V
 
V
S
 
T
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
N
 
N
N
 
N
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
M
 
M
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
I
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
P
 
P
E
 
Q
S
 
S
F
 
F
A
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
F
 
F
H
 
Q

P27876 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
47% identity, 98% coverage: 1:238/243 of query aligns to 1:247/253 of P27876

query
sites
P27876
M
 
M
R
 
R
K
 
K
I
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
F
 
N
K
 
K
T
 
T
Q
 
L
A
 
G
E
 
E
T
 
A
Q
 
V
E
 
S
F
 
F
L
 
V
Q
 
E
G
 
E
F
 
V
L
 
K
P
 
S
H
 
S
L
 
I
E
 
P
E
 
A
T
 
A
P
 
D
Q
 
K
G
 
A
R
 
-
E
 
E
V
 
A
I
 
V
L
 
V
C
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
A
T
 
L
D
 
F
L
 
L
S
 
E
V
 
K
L
 
L
S
 
A
K
 
S
T
 
A
L
 
V
H
 
K
G
 
G
S
 
T
L
 
D
I
 
L
Q
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
M
H
 
H
W
 
F
E
 
E
E
 
E
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
G
 
P
P
 
V
M
 
A
L
 
L
T
 
K
E
 
D
S
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
D
F
 
Y
V
 
C
I
 
V
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
Y
 
M
F
 
F
G
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
T
V
 
V
N
 
N
L
 
K
R
 
K
L
 
A
R
 
H
T
 
A
A
 
A
Q
 
F
R
 
K
F
 
H
G
 
G
L
 
I
T
 
V
P
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
K
 
L
Q
 
E
Q
 
E
R
 
R
D
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
E
 
N
S
 
D
L
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
D
Q
 
Q
L
 
V
D
 
K
K
 
K
G
 
G
L
 
L
V
 
A
D
 
G
I
 
L
D
 
S
Q
 
E
N
 
E
N
 
Q
L
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
T
 
S
C
 
S
E
 
T
A
 
A
V
 
K
E
 
D
A
 
A
N
 
N
R
 
D
I
 
V
I
 
C
G
 
A
L
 
H
I
 
I
R
 
R
-
 
K
-
 
T
-
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
F
S
 
S
Q
 
Q
L
 
E
S
 
A
N
 
A
P
 
D
N
 
K
V
 
L
S
 
R
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
N
 
A
N
 
N
I
 
I
D
 
K
E
 
E
I
 
Y
M
 
M
A
 
A
Q
 
E
P
 
S
E
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
P
 
P
E
 
Q
S
 
S
F
 
F
A
 
V
R
 
Q
I
 
L
V
 
L

P00943 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
48% identity, 98% coverage: 1:238/243 of query aligns to 1:247/253 of P00943

query
sites
P00943
M
 
M
R
 
R
K
 
K
I
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
F
x
H
K
|
K
T
 
T
Q
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
A
Q
 
V
E
 
Q
F
 
F
L
 
V
Q
 
E
G
 
D
F
 
V
L
 
K
P
 
G
H
 
H
L
 
V
E
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
P
Q
 
P
G
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
-
 
S
-
 
V
L
 
V
C
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
F
T
 
L
D
 
F
L
 
L
S
 
D
V
 
R
L
 
L
S
 
V
K
 
Q
T
 
A
L
 
A
H
 
D
G
 
G
S
 
T
L
 
D
I
 
L
Q
 
K
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
T
I
 
M
H
 
H
W
 
F
E
 
A
E
 
D
F
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
S
G
 
P
P
 
V
M
 
M
L
 
L
T
 
K
E
 
D
S
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
T
F
 
Y
V
 
V
I
 
I
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
M
F
 
F
G
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
T
V
 
V
N
 
N
L
 
K
R
 
K
L
 
V
R
 
L
T
 
A
A
 
A
Q
 
F
R
 
T
F
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
I
P
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
K
 
L
Q
 
E
Q
 
E
R
 
R
D
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
E
 
N
S
 
A
L
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
S
Q
 
Q
L
 
V
D
 
E
K
 
K
G
 
A
L
 
L
V
 
A
D
 
G
I
 
L
D
 
T
Q
 
P
N
 
E
N
 
Q
L
 
V
-
 
K
-
 
Q
-
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
T
 
S
C
 
S
E
 
T
A
 
P
V
 
E
E
 
D
A
 
A
N
 
N
R
 
S
I
 
V
I
 
C
G
 
G
L
 
H
I
 
I
R
 
R
S
 
S
Q
 
V
L
 
V
S
 
S
N
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
A
P
 
E
N
 
A
V
 
I
S
 
R
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
N
 
D
N
 
N
I
 
I
D
 
R
E
 
D
I
 
F
M
 
L
A
 
A
Q
 
Q
P
 
Q
E
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
P
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
P
 
P
E
 
A
S
 
S
F
 
F
A
 
L
R
 
Q
I
 
L
V
 
V

1btmA Triosephosphate isomerase (tim) complexed with 2-phosphoglycolic acid (see paper)
48% identity, 98% coverage: 2:238/243 of query aligns to 1:246/251 of 1btmA

query
sites
1btmA
R
 
R
K
 
K
I
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
F
 
H
K
 
K
T
 
T
Q
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
A
Q
 
V
E
 
Q
F
 
F
L
 
V
Q
 
E
G
 
D
F
 
V
L
 
K
P
 
G
H
 
H
L
 
V
E
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
P
Q
 
P
G
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
-
 
S
-
 
V
L
 
V
C
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
F
T
 
L
D
 
F
L
 
L
S
 
D
V
 
R
L
 
L
S
 
V
K
 
Q
T
 
A
L
 
A
H
 
D
G
 
G
S
 
T
L
 
D
I
 
L
Q
 
K
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
T
I
 
M
H
 
H
W
 
F
E
 
A
E
 
D
F
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
S
G
 
P
P
 
V
M
 
M
L
 
L
T
 
K
E
 
D
S
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
T
F
 
Y
V
 
V
I
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
M
F
 
F
G
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
T
V
 
V
N
 
N
L
 
K
R
 
K
L
 
V
R
 
L
T
 
A
A
 
A
Q
 
F
R
 
T
F
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
I
P
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
K
 
L
Q
 
E
Q
 
E
R
 
R
D
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
E
 
N
S
 
A
L
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
S
Q
 
Q
L
 
V
D
 
E
K
 
K
G
 
A
L
 
L
V
 
A
D
 
G
I
 
L
D
 
T
Q
 
P
N
 
E
N
 
Q
L
 
V
-
 
K
-
 
Q
-
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
T
 
S
C
 
S
E
 
T
A
 
P
V
 
E
E
 
D
A
 
A
N
 
N
R
 
S
I
 
V
I
 
C
G
 
G
L
 
H
I
 
I
R
 
R
S
 
S
Q
 
V
L
 
V
S
 
S
N
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
A
P
 
E
N
 
A
V
 
I
S
 
R
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
N
 
D
N
 
N
I
 
I
D
 
R
E
 
D
I
 
F
M
 
L
A
 
A
Q
 
Q
P
 
Q
E
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
P
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
P
 
P
E
 
A
S
 
S
F
 
F
A
 
L
R
 
Q
I
 
L
V
 
V

3uwuA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-3-phosphate (see paper)
44% identity, 98% coverage: 1:238/243 of query aligns to 1:249/253 of 3uwuA

query
sites
3uwuA
M
 
M
R
 
R
K
 
T
I
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
F
 
N
K
 
K
T
 
T
Q
 
V
A
 
Q
E
 
E
T
 
A
Q
 
K
E
 
D
F
 
F
L
 
V
Q
 
N
G
 
A
F
 
-
L
 
L
P
 
P
H
 
T
L
 
L
E
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
P
Q
 
D
G
 
S
R
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
I
 
V
L
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
A
T
 
I
D
 
Q
L
 
L
S
 
D
V
 
A
L
 
L
S
 
T
K
 
T
T
 
A
L
 
V
H
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
K
G
 
A
S
 
Q
L
 
G
I
 
L
Q
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
T
H
 
Y
W
 
F
E
 
E
E
 
D
F
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
G
 
P
P
 
V
M
 
A
L
 
L
T
 
A
E
 
D
S
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
K
F
 
Y
V
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
Y
 
L
F
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
E
V
 
I
N
 
N
L
 
K
R
 
K
L
 
A
R
 
H
T
 
A
A
 
I
Q
 
F
R
 
K
F
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
K
 
D
Q
 
E
Q
 
E
R
 
R
D
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
A
E
 
N
S
 
D
L
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
E
Q
 
Q
L
 
V
D
 
K
K
 
K
G
 
A
L
 
V
V
 
A
D
 
G
I
 
L
D
 
S
Q
 
E
N
 
D
N
 
Q
L
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
T
 
S
C
 
S
E
 
T
A
 
S
V
 
E
E
 
D
A
 
A
N
 
N
R
 
E
I
 
M
I
 
C
G
 
A
L
 
F
I
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
S
 
A
Q
 
D
L
 
L
S
 
S
N
 
S
P
 
K
N
 
E
V
 
V
S
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
R
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
N
 
N
N
 
N
I
 
I
D
 
K
E
 
E
I
 
Y
M
 
M
A
 
A
Q
 
Q
P
 
T
E
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
K
P
 
V
E
 
E
S
 
D
F
 
F
A
 
V
R
 
Q
I
 
L
V
 
L

Q6GIL6 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Staphylococcus aureus (strain MRSA252) (see paper)
44% identity, 98% coverage: 1:238/243 of query aligns to 1:249/253 of Q6GIL6

query
sites
Q6GIL6
M
 
M
R
 
R
K
 
T
I
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
F
 
N
K
 
K
T
 
T
Q
 
V
A
 
Q
E
 
E
T
 
A
Q
 
K
E
 
D
F
 
F
L
 
V
Q
 
N
G
 
A
F
 
-
L
 
L
P
 
P
H
 
T
L
 
L
E
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
P
Q
 
D
G
 
S
R
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
I
 
V
L
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
A
T
 
I
D
 
Q
L
 
L
S
 
D
V
 
A
L
 
L
S
 
T
K
 
T
T
 
A
L
 
V
H
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
K
G
 
A
S
 
Q
L
 
G
I
 
L
Q
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
T
H
 
Y
W
 
F
E
 
E
E
 
D
F
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
G
 
P
P
 
V
M
 
A
L
 
L
T
 
A
E
 
D
S
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
K
F
 
Y
V
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
Y
 
L
F
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
E
V
 
I
N
 
N
L
 
K
R
 
K
L
 
A
R
 
H
T
 
A
A
 
I
Q
 
F
R
 
K
F
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
K
 
D
Q
 
E
Q
 
E
R
 
R
D
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
A
E
 
N
S
 
D
L
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
E
Q
 
Q
L
 
V
D
 
K
K
 
K
G
 
A
L
 
V
V
 
A
D
 
G
I
 
L
D
 
S
Q
 
E
N
 
D
N
 
Q
L
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
T
 
S
C
 
S
E
 
T
A
 
S
V
 
E
E
 
D
A
 
A
N
 
N
R
 
E
I
 
M
I
 
C
G
 
A
L
 
F
I
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
S
 
A
Q
 
D
L
 
L
S
 
S
N
 
S
P
 
K
N
 
E
V
 
V
S
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
R
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
N
 
N
N
 
N
I
 
I
D
 
K
E
 
E
I
 
Y
M
 
M
A
 
A
Q
 
Q
P
 
T
E
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
K
P
 
V
E
 
E
S
 
D
F
 
F
A
 
V
R
 
Q
I
 
L
V
 
L

3uwzA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate (see paper)
44% identity, 98% coverage: 1:238/243 of query aligns to 2:250/254 of 3uwzA

query
sites
3uwzA
M
 
M
R
 
R
K
 
T
I
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
F
 
N
K
 
K
T
 
T
Q
 
V
A
 
Q
E
 
E
T
 
A
Q
 
K
E
 
D
F
 
F
L
 
V
Q
 
N
G
 
A
F
 
-
L
 
L
P
 
P
H
 
T
L
 
L
E
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
P
Q
 
D
G
 
S
R
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
I
 
V
L
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
A
T
 
I
D
 
Q
L
 
L
S
 
D
V
 
A
L
 
L
S
 
T
K
 
T
T
 
A
L
 
V
H
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
K
G
 
A
S
 
Q
L
 
G
I
 
L
Q
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
T
H
 
Y
W
 
F
E
 
E
E
 
D
F
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
G
 
P
P
 
V
M
 
A
L
 
L
T
 
A
E
 
D
S
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
K
F
 
Y
V
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
Y
 
L
F
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
E
V
 
I
N
 
N
L
 
K
R
 
K
L
 
A
R
 
H
T
 
A
A
 
I
Q
 
F
R
 
K
F
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
K
 
D
Q
 
E
Q
 
E
R
 
R
D
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
A
E
 
N
S
 
D
L
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
E
Q
 
Q
L
 
V
D
 
K
K
 
K
G
 
A
L
 
V
V
 
A
D
 
G
I
 
L
D
 
S
Q
 
E
N
 
D
N
 
Q
L
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
T
 
S
C
 
S
E
 
T
A
 
S
V
 
E
E
 
D
A
 
A
N
 
N
R
 
E
I
 
M
I
 
C
G
 
A
L
 
F
I
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
S
 
A
Q
 
D
L
 
L
S
 
S
N
 
S
P
 
K
N
 
E
V
 
V
S
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
R
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
N
 
N
N
 
N
I
 
I
D
 
K
E
 
E
I
 
Y
M
 
M
A
 
A
Q
 
Q
P
 
T
E
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
K
P
 
V
E
 
E
S
 
D
F
 
F
A
 
V
R
 
Q
I
 
L
V
 
L

3uwwA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 3-phosphoglyceric acid (see paper)
44% identity, 98% coverage: 1:238/243 of query aligns to 2:250/254 of 3uwwA

query
sites
3uwwA
M
 
M
R
 
R
K
 
T
I
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
F
 
N
K
 
K
T
 
T
Q
 
V
A
 
Q
E
 
E
T
 
A
Q
 
K
E
 
D
F
 
F
L
 
V
Q
 
N
G
 
A
F
 
-
L
 
L
P
 
P
H
 
T
L
 
L
E
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
P
Q
 
D
G
 
S
R
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
I
 
V
L
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
A
T
 
I
D
 
Q
L
 
L
S
 
D
V
 
A
L
 
L
S
 
T
K
 
T
T
 
A
L
 
V
H
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
K
G
 
A
S
 
Q
L
 
G
I
 
L
Q
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
T
H
 
Y
W
 
F
E
 
E
E
 
D
F
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
G
 
P
P
 
V
M
 
A
L
 
L
T
 
A
E
 
D
S
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
K
F
 
Y
V
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
Y
 
L
F
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
E
V
 
I
N
 
N
L
 
K
R
 
K
L
 
A
R
 
H
T
 
A
A
 
I
Q
 
F
R
 
K
F
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
K
 
D
Q
 
E
Q
 
E
R
 
R
D
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
A
E
 
N
S
 
D
L
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
E
Q
 
Q
L
 
V
D
 
K
K
 
K
G
 
A
L
 
V
V
 
A
D
 
G
I
 
L
D
 
S
Q
 
E
N
 
D
N
 
Q
L
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
T
 
S
C
 
S
E
 
T
A
 
S
V
 
E
E
 
D
A
 
A
N
 
N
R
 
E
I
 
M
I
 
C
G
 
A
L
 
F
I
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
S
 
A
Q
 
D
L
 
L
S
 
S
N
 
S
P
 
K
N
 
E
V
 
V
S
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
R
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
N
 
N
N
 
N
I
 
I
D
 
K
E
 
E
I
 
Y
M
 
M
A
 
A
Q
 
Q
P
 
T
E
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
K
P
 
V
E
 
E
S
 
D
F
 
F
A
 
V
R
 
Q
I
 
L
V
 
L

3uwvA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 2-phosphoglyceric acid (see paper)
44% identity, 98% coverage: 1:238/243 of query aligns to 3:251/255 of 3uwvA

query
sites
3uwvA
M
 
M
R
 
R
K
 
T
I
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
F
 
N
K
 
K
T
 
T
Q
 
V
A
 
Q
E
 
E
T
 
A
Q
 
K
E
 
D
F
 
F
L
 
V
Q
 
N
G
 
A
F
 
-
L
 
L
P
 
P
H
 
T
L
 
L
E
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
P
Q
 
D
G
 
S
R
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
I
 
V
L
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
A
T
 
I
D
 
Q
L
 
L
S
 
D
V
 
A
L
 
L
S
 
T
-
 
T
-
 
A
-
 
V
K
 
K
T
 
E
L
 
G
H
 
K
G
 
A
S
 
Q
L
 
G
I
 
L
Q
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
T
H
 
Y
W
 
F
E
 
E
E
 
D
F
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
G
 
P
P
 
V
M
 
A
L
 
L
T
 
A
E
 
D
S
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
K
F
 
Y
V
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
Y
 
L
F
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
E
V
 
I
N
 
N
L
 
K
R
 
K
L
 
A
R
 
H
T
 
A
A
 
I
Q
 
F
R
 
K
F
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
K
 
D
Q
 
E
Q
 
E
R
 
R
D
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
A
E
 
N
S
 
D
L
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
E
Q
 
Q
L
 
V
D
 
K
K
 
K
G
 
A
L
 
V
V
 
A
D
 
G
I
 
L
D
 
S
Q
 
E
N
 
D
N
 
Q
L
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
T
 
S
C
 
S
E
 
T
A
 
S
V
 
E
E
 
D
A
 
A
N
 
N
R
 
E
I
 
M
I
 
C
G
 
A
L
 
F
I
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
S
 
A
Q
 
D
L
 
L
S
 
S
N
 
S
P
 
K
N
 
E
V
 
V
S
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
R
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
|
K
P
 
P
N
 
N
N
 
N
I
 
I
D
 
K
E
 
E
I
 
Y
M
 
M
A
 
A
Q
 
Q
P
 
T
E
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
K
P
 
V
E
 
E
S
 
D
F
 
F
A
 
V
R
 
Q
I
 
L
V
 
L

P36204 Bifunctional PGK/TIM; EC 2.7.2.3; EC 5.3.1.1 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
45% identity, 98% coverage: 2:239/243 of query aligns to 402:650/654 of P36204

query
sites
P36204
R
 
R
K
 
K
I
 
L
V
 
I
I
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
F
 
H
K
 
K
T
 
T
Q
 
I
A
 
S
E
 
E
T
 
A
Q
 
K
E
 
K
F
 
F
L
 
V
Q
 
S
G
 
L
F
 
L
L
 
V
P
 
N
H
 
E
L
 
L
E
 
H
E
 
D
T
 
V
P
 
K
Q
 
E
G
 
-
R
 
F
E
 
E
V
 
I
I
 
V
L
 
V
C
 
C
P
 
P
P
 
P
F
 
F
T
 
T
D
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
E
L
 
V
S
 
G
K
 
E
T
 
I
L
 
L
H
 
S
G
 
G
S
 
R
L
 
N
I
 
I
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
H
 
F
W
 
Y
E
 
E
E
 
D
F
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
G
 
P
P
 
L
M
 
M
L
 
L
T
 
Q
E
 
E
S
 
I
G
 
G
V
 
V
R
 
E
F
 
Y
V
 
V
I
 
I
V
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
R
Y
 
I
F
 
F
G
 
K
E
 
E
T
 
D
D
 
D
A
 
E
T
 
F
V
 
I
N
 
N
L
 
R
R
 
K
L
 
V
R
 
K
T
 
A
A
 
V
Q
 
L
R
 
E
F
 
K
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
L
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
K
 
L
Q
 
E
Q
 
E
R
 
R
D
 
E
A
 
K
G
 
G
E
 
L
T
 
T
E
 
F
S
 
C
L
 
V
I
 
V
A
 
E
L
 
K
Q
 
Q
L
 
V
D
 
R
K
 
E
G
 
G
L
 
F
V
 
Y
D
 
G
I
 
L
D
 
D
Q
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
A
N
 
K
N
 
R
L
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
R
T
 
V
C
 
A
E
 
T
A
 
P
V
 
Q
E
 
Q
A
 
A
N
 
Q
R
 
E
I
 
V
I
 
H
G
 
A
L
 
F
I
 
I
R
 
R
S
 
K
Q
 
L
L
 
L
S
 
S
N
 
E
-
 
M
-
 
Y
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
A
P
 
G
N
 
S
V
 
I
S
 
R
I
 
I
Q
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
I
K
 
K
P
 
P
N
 
D
N
 
N
I
 
F
D
 
L
E
 
G
I
 
L
M
 
I
A
 
V
Q
 
Q
P
 
K
E
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
K
P
 
-
E
 
E
S
 
S
F
 
F
-
 
I
-
 
E
-
 
L
A
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
M
N
 
R

Sites not aligning to the query:

3uwzB Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate (see paper)
43% identity, 98% coverage: 1:238/243 of query aligns to 1:246/250 of 3uwzB

query
sites
3uwzB
M
 
M
R
 
R
K
 
T
I
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
F
 
N
K
 
K
T
 
T
Q
 
V
A
 
Q
E
 
E
T
 
A
Q
 
K
E
 
D
F
 
F
L
 
V
Q
 
N
G
 
A
F
 
-
L
 
L
P
 
P
H
 
T
L
 
L
E
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
P
Q
 
D
G
 
S
R
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
I
 
V
L
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
A
T
 
I
D
 
Q
L
 
L
S
 
D
V
 
A
L
 
L
S
 
T
K
 
T
T
 
A
L
 
V
H
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
K
G
 
A
S
 
Q
L
 
G
I
 
L
Q
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
T
H
 
Y
W
 
F
E
 
E
E
 
D
F
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
G
 
P
P
 
V
M
 
A
L
 
L
T
 
A
E
 
D
S
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
K
F
 
Y
V
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
Y
 
L
F
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
T
 
E
V
 
I
N
 
N
L
 
K
R
 
K
L
 
A
R
 
H
T
 
A
A
 
I
Q
 
F
R
 
K
F
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
K
 
D
Q
 
E
Q
 
E
R
 
R
D
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
A
E
 
N
S
 
D
L
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
E
Q
 
Q
L
 
V
D
 
K
K
 
K
G
 
A
L
 
V
V
 
A
D
 
G
I
 
L
D
 
S
Q
 
E
N
 
D
N
 
Q
L
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
K
T
 
S
C
 
S
E
 
T
A
 
S
V
 
E
E
 
D
A
 
A
N
 
N
R
 
E
I
 
M
I
 
C
G
 
A
L
 
F
I
 
V
R
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
S
 
A
Q
 
D
L
 
L
S
 
S
N
 
S
P
 
K
N
 
E
V
 
V
S
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
R
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
N
 
N
N
 
N
I
 
I
D
 
K
E
 
E
I
 
Y
M
|
M
A
 
A
Q
|
Q
P
 
T
E
 
D
I
|
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
K
P
 
V
E
 
E
S
 
D
F
 
F
A
 
V
R
 
Q
I
 
L
V
 
L

P50921 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Moritella marina (Vibrio marinus) (see paper)
44% identity, 95% coverage: 1:230/243 of query aligns to 1:240/256 of P50921

query
sites
P50921
M
 
M
R
 
R
K
 
H
I
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
M
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
L
F
 
N
K
 
G
T
 
S
Q
 
K
A
 
E
E
 
M
T
 
V
Q
 
V
E
 
D
F
 
L
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
F
 
L
L
 
N
P
 
A
H
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
G
T
 
V
P
 
-
Q
 
T
G
 
G
R
 
V
E
 
D
V
 
V
I
 
A
L
 
V
C
 
A
P
 
P
P
 
P
-
 
A
-
 
L
F
 
F
T
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
A
V
 
E
L
 
R
S
 
T
K
 
L
T
 
T
L
 
E
H
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
A
I
 
I
Q
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
T
H
 
D
W
 
L
E
 
N
E
 
N
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
I
 
M
S
 
S
G
 
P
P
 
A
M
 
M
L
 
L
T
 
K
E
 
E
S
 
F
G
 
G
V
 
A
R
 
T
F
 
H
V
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
Y
 
Y
F
 
H
G
 
A
E
 
E
T
 
S
D
 
D
A
 
E
T
 
F
V
 
V
N
 
A
L
 
K
R
 
K
L
 
F
R
 
A
T
 
F
A
 
L
Q
 
K
R
 
E
F
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
K
 
D
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
N
D
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
M
S
 
A
L
 
V
I
 
C
A
 
A
L
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
T
K
 
Q
G
 
G
L
 
V
V
 
E
D
 
A
I
 
L
D
 
E
Q
 
-
N
 
-
N
 
G
L
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
T
 
A
C
 
A
E
 
T
A
 
A
V
 
E
E
 
D
A
 
A
N
 
Q
R
 
R
I
 
I
I
 
H
G
 
A
L
 
Q
I
 
I
R
 
R
S
 
A
Q
 
H
L
 
I
S
 
A
N
 
E
-
 
K
-
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
A
P
 
K
N
 
N
V
 
V
S
 
V
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
N
 
E
N
 
N
I
 
A
D
 
A
E
 
A
I
 
Y
M
 
F
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
E
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
x
A
L
 
L
E
 
D

1aw1A Triosephosphate isomerase of vibrio marinus complexed with 2- phosphoglycolate (see paper)
44% identity, 94% coverage: 2:230/243 of query aligns to 1:239/255 of 1aw1A

query
sites
1aw1A
R
 
R
K
 
H
I
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
M
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
L
F
 
N
K
 
G
T
 
S
Q
 
K
A
 
E
E
 
M
T
 
V
Q
 
V
E
 
D
F
 
L
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
F
 
L
L
 
N
P
 
A
H
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
G
T
 
V
P
 
-
Q
 
T
G
 
G
R
 
V
E
 
D
V
 
V
I
 
A
L
 
V
C
 
A
P
 
P
P
 
P
-
 
A
-
 
L
F
 
F
T
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
A
V
 
E
L
 
R
S
 
T
K
 
L
T
 
T
L
 
E
H
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
A
I
 
I
Q
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
T
H
 
D
W
 
L
E
 
N
E
 
N
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
I
 
M
S
 
S
G
 
P
P
 
A
M
 
M
L
 
L
T
 
K
E
 
E
S
 
F
G
 
G
V
 
A
R
 
T
F
 
H
V
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
Y
 
Y
F
 
H
G
 
A
E
 
E
T
 
S
D
 
D
A
 
E
T
 
F
V
 
V
N
 
A
L
 
K
R
 
K
L
 
F
R
 
A
T
 
F
A
 
L
Q
 
K
R
 
E
F
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
K
 
D
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
N
D
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
M
S
 
A
L
 
V
I
 
C
A
 
A
L
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
T
K
 
Q
G
 
G
L
 
V
V
 
E
D
 
A
I
 
L
D
 
E
Q
 
-
N
 
-
N
 
G
L
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
T
 
A
C
 
A
E
 
T
A
 
A
V
 
E
E
 
D
A
 
A
N
 
Q
R
 
R
I
 
I
I
 
H
G
 
A
L
 
Q
I
 
I
R
 
R
S
 
A
Q
 
H
L
 
I
S
 
A
N
 
E
-
 
K
-
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
A
P
 
K
N
 
N
V
 
V
S
 
V
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
N
 
E
N
 
N
I
 
A
D
 
A
E
 
A
I
 
Y
M
 
F
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
E
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L
E
 
D

4mvaA 1.43 angstrom resolution crystal structure of triosephosphate isomerase (tpia) from escherichia coli in complex with acetyl phosphate. (see paper)
40% identity, 98% coverage: 1:239/243 of query aligns to 1:247/255 of 4mvaA

query
sites
4mvaA
M
 
M
R
 
R
K
 
H
I
 
P
V
 
L
I
 
V
A
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
F
 
N
K
 
G
T
 
S
Q
 
R
A
 
H
E
 
M
T
 
V
Q
 
H
E
 
E
F
 
L
L
 
V
Q
 
S
G
 
N
F
 
L
L
 
R
P
 
K
H
 
E
L
 
L
E
 
A
E
 
G
T
 
V
P
 
A
Q
 
-
G
 
G
R
 
C
E
 
A
V
 
V
I
 
A
L
 
I
C
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
E
T
 
M
D
 
Y
L
 
I
S
 
D
V
 
M
L
 
A
S
 
K
K
 
R
T
 
E
L
 
A
H
 
E
G
 
G
S
 
S
L
 
H
I
 
I
Q
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
H
 
D
W
 
L
E
 
N
E
 
L
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
G
 
A
P
 
A
M
 
M
L
 
L
T
 
K
E
 
D
S
 
I
G
 
G
V
 
A
R
 
Q
F
 
Y
V
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
T
Y
 
Y
F
 
H
G
 
K
E
 
E
T
 
S
D
 
D
A
 
E
T
 
L
V
 
I
N
 
A
L
 
K
R
 
K
L
 
F
R
 
A
T
 
V
A
 
L
Q
 
K
R
 
E
F
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
K
 
E
Q
 
A
Q
 
E
R
 
N
D
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
E
 
E
S
 
E
L
 
V
I
 
C
A
 
A
L
 
R
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
K
 
A
G
 
V
L
 
L
V
 
K
D
 
T
I
 
Q
D
 
G
Q
 
A
N
 
A
N
 
A
L
 
F
-
 
E
-
 
G
-
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
T
 
S
C
 
A
E
 
T
A
 
P
V
 
A
E
 
Q
A
 
A
N
 
Q
R
 
A
I
 
V
I
 
H
G
 
K
L
 
F
I
 
I
R
 
R
S
 
D
Q
 
H
L
 
I
S
 
A
-
 
K
-
 
V
N
 
D
P
 
A
N
 
N
V
 
I
S
 
A
-
 
E
-
 
Q
-
 
V
-
 
I
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
N
 
S
N
 
N
I
 
A
D
 
A
E
 
E
I
 
L
M
 
F
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
E
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
K
P
 
A
E
 
D
S
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
K

B1XB85 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Escherichia coli (strain K12 / DH10B) (see paper)
40% identity, 98% coverage: 1:239/243 of query aligns to 1:247/255 of B1XB85

query
sites
B1XB85
M
 
M
R
 
R
K
 
H
I
 
P
V
 
L
I
 
V
A
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
F
 
N
K
 
G
T
 
S
Q
 
R
A
 
H
E
 
M
T
 
V
Q
 
H
E
 
E
F
 
L
L
 
V
Q
 
S
G
 
N
F
 
L
L
 
R
P
 
K
H
 
E
L
 
L
E
 
A
E
 
G
T
 
V
P
 
A
Q
 
-
G
 
G
R
 
C
E
 
A
V
 
V
I
 
A
L
 
I
C
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
E
T
 
M
D
 
Y
L
 
I
S
 
D
V
 
M
L
 
A
S
 
K
K
 
R
T
 
E
L
 
A
H
 
E
G
 
G
S
 
S
L
 
H
I
 
I
Q
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
H
 
D
W
 
L
E
 
N
E
 
L
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
G
 
A
P
 
A
M
 
M
L
 
L
T
 
K
E
 
D
S
 
I
G
 
G
V
 
A
R
 
Q
F
 
Y
V
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
T
Y
 
Y
F
 
H
G
 
K
E
 
E
T
 
S
D
 
D
A
 
E
T
 
L
V
 
I
N
 
A
L
 
K
R
 
K
L
 
F
R
 
A
T
 
V
A
 
L
Q
 
K
R
 
E
F
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
K
 
E
Q
 
A
Q
 
E
R
 
N
D
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
E
 
E
S
 
E
L
 
V
I
 
C
A
 
A
L
 
R
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
K
 
A
G
 
V
L
 
L
V
 
K
D
 
T
I
 
Q
D
 
G
Q
 
A
N
 
A
N
 
A
L
 
F
-
 
E
-
 
G
-
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
T
 
S
C
 
A
E
 
T
A
 
P
V
 
A
E
 
Q
A
 
A
N
 
Q
R
 
A
I
 
V
I
 
H
G
 
K
L
 
F
I
 
I
R
 
R
S
 
D
Q
 
H
L
 
I
S
 
A
-
 
K
-
 
V
N
 
D
P
 
A
N
 
N
V
 
I
S
 
A
-
 
E
-
 
Q
-
 
V
-
 
I
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
N
 
S
N
 
N
I
 
A
D
 
A
E
 
E
I
 
L
M
 
F
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
E
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
K
P
 
A
E
 
D
S
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
K

4y96A Crystal structure of triosephosphate isomerase from gemmata obscuriglobus (see paper)
40% identity, 98% coverage: 2:239/243 of query aligns to 2:247/250 of 4y96A

query
sites
4y96A
R
 
R
K
 
K
I
 
K
V
 
F
I
 
V
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
F
 
N
K
 
T
T
 
T
Q
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
A
Q
 
K
E
 
A
F
 
L
L
 
G
Q
 
A
G
 
A
F
 
V
L
 
A
P
 
K
H
 
G
L
 
V
E
 
-
E
 
-
T
 
T
P
 
D
Q
 
D
G
 
R
R
 
V
E
 
T
V
 
V
I
 
A
L
 
V
C
 
F
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
T
 
P
D
 
W
L
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
V
S
 
G
K
 
E
T
 
V
L
 
L
H
 
K
G
 
G
S
 
S
L
 
P
I
 
V
Q
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
D
I
 
V
H
 
S
W
 
S
E
 
E
E
 
K
F
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
S
G
 
P
P
 
A
M
 
M
L
 
L
T
 
L
E
 
E
S
 
T
G
 
G
V
 
C
R
 
K
F
 
Y
V
 
A
I
 
L
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
Y
 
I
F
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
E
A
 
T
T
 
F
V
 
I
N
 
N
L
 
H
R
 
K
L
 
V
R
 
H
T
 
T
A
 
A
Q
 
L
R
 
E
F
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
S
P
 
V
I
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
M
G
 
G
E
 
E
T
 
T
K
 
L
Q
 
A
Q
 
E
R
 
R
D
 
E
A
 
R
G
 
G
E
 
L
T
 
Q
E
 
E
S
 
R
L
 
V
I
 
F
A
 
Q
L
 
R
Q
 
Q
L
 
V
D
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
C
K
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
T
D
 
D
I
 
E
D
 
Q
Q
 
F
N
 
G
N
 
R
L
 
I
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
T
 
V
C
 
A
E
 
T
A
 
P
V
 
E
E
 
Q
A
 
A
N
 
Q
R
 
E
I
 
A
I
 
H
G
 
A
L
 
F
I
 
V
R
 
R
S
 
S
Q
 
K
L
 
L
S
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
Y
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
I
N
 
A
P
 
D
N
 
S
V
 
T
S
 
P
I
 
I
Q
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
P
N
 
D
N
 
N
I
 
T
D
 
V
E
 
G
I
 
L
M
 
M
A
 
S
Q
 
Q
P
 
P
E
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
K
P
 
A
E
 
D
S
 
S
F
 
F
A
 
L
R
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
K

6neeB Crystal structure of a reconstructed ancestor of triosephosphate isomerase from eukaryotes (see paper)
41% identity, 98% coverage: 2:239/243 of query aligns to 4:249/252 of 6neeB

query
sites
6neeB
R
 
R
K
 
K
I
 
F
V
 
F
I
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
F
 
N
K
 
G
T
 
T
Q
 
L
A
 
E
E
 
S
T
 
I
Q
 
K
E
 
A
F
 
L
L
 
V
Q
 
E
G
 
T
F
 
L
L
 
-
P
 
-
H
 
N
L
 
S
E
 
A
E
 
Q
T
 
L
P
 
D
Q
 
P
G
 
N
R
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
V
L
 
V
C
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
A
T
 
I
D
 
Y
L
 
L
S
 
P
-
 
F
V
 
A
L
 
R
S
 
S
K
 
K
T
 
L
L
 
K
H
 
K
G
 
P
S
 
K
L
 
E
I
 
I
Q
 
Q
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
C
H
 
Y
W
 
T
E
 
K
E
 
P
F
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
G
 
A
P
 
E
M
 
M
L
 
L
T
 
K
E
 
D
S
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
P
F
 
W
V
 
V
I
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
T
Y
 
I
F
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
D
A
 
E
T
 
L
V
 
I
N
 
A
L
 
E
R
 
K
L
 
V
R
 
K
T
 
Y
A
 
A
Q
 
L
R
 
D
F
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
K
P
 
V
I
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
K
 
L
Q
 
E
Q
 
E
R
 
R
D
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
E
 
M
S
 
E
L
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
R
Q
 
Q
L
 
I
D
 
L
K
 
K
G
 
A
L
 
I
V
 
A
D
 
D
-
 
K
-
 
I
I
 
K
D
 
D
Q
 
W
N
 
S
N
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
T
 
V
C
 
A
E
 
T
A
 
P
V
 
E
E
 
Q
A
 
A
N
 
Q
R
 
E
I
 
V
I
 
H
G
 
A
L
 
A
I
 
L
R
 
R
S
 
K
Q
 
W
L
 
L
S
 
K
-
 
E
-
 
N
-
 
V
N
 
S
P
 
P
N
 
E
V
 
V
S
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
T
-
 
R
I
 
I
Q
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
N
 
A
N
 
N
I
 
C
D
 
K
E
 
E
I
 
L
M
 
A
A
 
K
Q
 
Q
P
 
P
E
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
K
P
 
A
E
 
P
S
 
E
F
 
F
A
 
V
R
 
D
I
 
I
V
 
I
N
 
N

3taoA Structure of mycobacterium tuberculosis triosephosphate isomerase bound to phosphoglycolohydroxamate (see paper)
41% identity, 97% coverage: 2:237/243 of query aligns to 2:250/256 of 3taoA

query
sites
3taoA
R
 
R
K
 
K
I
 
P
V
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
F
 
N
K
 
L
T
 
N
Q
 
H
A
 
Y
E
 
E
T
 
A
Q
 
I
E
 
A
F
 
L
L
 
V
Q
 
Q
G
 
K
F
 
I
L
 
A
P
 
F
H
 
S
L
 
L
E
 
P
E
 
D
T
 
K
P
 
Y
Q
 
Y
G
 
D
R
 
R
-
 
V
E
 
D
V
 
V
I
 
A
L
 
V
C
 
I
P
 
P
P
 
P
F
 
F
T
 
T
D
 
D
L
 
L
S
x
R
V
x
S
L
 
V
S
 
Q
K
x
T
T
 
L
L
 
V
H
 
D
G
 
G
S
 
D
L
 
K
I
 
L
Q
 
R
L
 
L
-
 
T
-
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
D
I
 
L
H
 
S
W
 
P
E
 
H
E
 
D
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
D
I
 
V
S
 
S
G
 
G
P
 
A
M
 
F
L
 
L
T
 
A
E
 
K
S
 
L
G
 
G
V
 
C
R
 
S
F
 
Y
V
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
T
Y
 
Y
F
 
H
G
 
N
E
 
E
T
 
D
D
 
D
A
 
A
T
 
L
V
 
V
N
 
A
L
 
A
R
 
K
L
 
A
R
 
A
T
 
T
A
 
A
Q
 
L
R
 
K
F
 
H
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
V
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
H
K
 
L
Q
 
D
Q
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
N
T
 
H
E
 
V
S
 
A
L
 
H
I
 
N
A
 
I
L
 
E
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
-
 
G
-
 
S
-
 
L
K
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
A
I
 
E
D
 
Q
Q
 
I
N
 
G
N
 
S
L
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
R
T
 
V
C
 
A
E
 
S
A
 
A
V
 
A
E
 
D
A
 
A
N
 
Q
R
 
E
I
 
V
I
 
C
G
 
A
L
 
A
I
 
I
R
 
R
S
 
K
Q
 
E
L
 
L
S
 
A
N
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
P
-
 
R
-
 
I
-
 
A
P
 
D
N
 
T
V
 
V
S
 
R
I
 
V
Q
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
N
 
K
N
 
N
I
 
V
D
 
G
E
 
D
I
 
I
M
 
V
A
 
A
Q
 
Q
P
 
D
E
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
G
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
D
P
 
G
E
 
E
S
 
H
F
 
F
A
 
A
R
 
T
I
 
L

P9WG43 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
41% identity, 97% coverage: 2:237/243 of query aligns to 3:251/261 of P9WG43

query
sites
P9WG43
R
 
R
K
 
K
I
 
P
V
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
F
 
N
K
 
L
T
 
N
Q
 
H
A
 
Y
E
 
E
T
 
A
Q
 
I
E
 
A
F
 
L
L
 
V
Q
 
Q
G
 
K
F
 
I
L
 
A
P
 
F
H
 
S
L
 
L
E
 
P
E
 
D
T
 
K
P
 
Y
Q
 
Y
G
 
D
R
 
R
-
 
V
E
 
D
V
 
V
I
 
A
L
 
V
C
 
I
P
 
P
P
 
P
F
 
F
T
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
R
V
 
S
L
 
V
S
 
Q
K
 
T
T
 
L
L
 
V
H
 
D
G
 
G
S
 
D
L
 
K
I
 
L
Q
 
R
L
 
L
-
 
T
-
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
D
I
 
L
H
 
S
W
 
P
E
 
H
E
 
D
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
D
I
 
V
S
 
S
G
 
G
P
 
A
M
 
F
L
 
L
T
 
A
E
 
K
S
 
L
G
 
G
V
 
C
R
 
S
F
 
Y
V
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
T
Y
 
Y
F
 
H
G
 
N
E
 
E
T
 
D
D
 
D
A
 
A
T
 
L
V
 
V
N
 
A
L
 
A
R
 
K
L
 
A
R
 
A
T
 
T
A
 
A
Q
 
L
R
 
K
F
 
H
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
V
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
H
K
 
L
Q
 
D
Q
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
N
T
 
H
E
 
V
S
 
A
L
 
H
I
 
N
A
 
I
L
 
E
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
-
 
G
-
 
S
-
 
L
K
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
A
I
 
E
D
 
Q
Q
 
I
N
 
G
N
 
S
L
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
R
T
 
V
C
 
A
E
 
S
A
 
A
V
 
A
E
 
D
A
 
A
N
 
Q
R
 
E
I
 
V
I
 
C
G
 
A
L
 
A
I
 
I
R
 
R
S
 
K
Q
 
E
L
 
L
S
 
A
N
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
P
-
 
R
-
 
I
-
 
A
P
 
D
N
 
T
V
 
V
S
 
R
I
 
V
Q
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
N
 
K
N
 
N
I
 
V
D
 
G
E
 
D
I
 
I
M
 
V
A
 
A
Q
 
Q
P
 
D
E
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
G
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
D
P
 
G
E
 
E
S
 
H
F
 
F
A
 
A
R
 
T
I
 
L

4y90A Crystal structure of triosephosphate isomerase from deinococcus radiodurans (see paper)
42% identity, 94% coverage: 3:230/243 of query aligns to 2:232/244 of 4y90A

query
sites
4y90A
K
 
Q
I
 
T
V
 
L
I
 
L
A
 
A
G
 
L
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
F
 
N
K
 
K
T
 
T
Q
 
P
A
 
T
E
 
E
T
 
A
Q
 
R
E
 
S
F
 
W
L
 
A
Q
 
E
G
 
E
F
 
L
L
 
T
P
 
T
H
 
K
L
 
Y
E
 
A
E
 
P
T
 
A
P
 
-
Q
 
E
G
 
G
R
 
V
E
 
D
V
 
L
I
 
A
L
 
V
C
 
L
P
 
A
P
 
P
F
 
A
T
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
S
V
 
A
L
 
L
S
 
A
K
 
A
T
 
N
L
 
L
H
 
P
G
 
A
S
 
G
L
 
-
I
 
I
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
A
 
G
Q
 
Q
N
 
D
I
 
V
H
 
S
W
 
A
E
 
H
E
 
E
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
G
 
A
P
 
A
M
 
M
L
 
L
T
 
K
E
 
D
S
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
S
F
 
C
V
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
Y
 
Y
F
 
H
G
 
D
E
 
E
T
 
S
D
 
D
A
 
A
T
 
T
V
 
V
N
 
A
L
 
A
R
 
K
L
 
A
R
 
R
T
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
F
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
V
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
N
K
 
L
Q
 
D
Q
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
R
G
 
G
E
 
E
T
 
H
E
 
V
S
 
P
L
 
Q
I
 
T
A
 
L
L
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
-
K
 
R
G
 
G
L
 
S
V
 
L
D
 
E
I
 
G
D
 
V
Q
 
G
N
 
A
N
 
D
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
E
 
K
T
 
T
C
 
A
E
 
T
A
 
A
V
 
D
E
 
D
A
 
A
N
 
E
R
 
E
I
 
L
I
 
A
G
 
A
L
 
A
I
 
I
R
 
R
S
 
G
Q
 
A
L
 
L
S
 
R
N
 
E
-
 
Q
-
 
Y
-
 
G
-
 
A
-
 
R
-
 
A
P
 
E
N
 
G
V
 
I
S
 
R
I
 
V
Q
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
N
 
E
N
 
N
I
 
I
D
 
A
E
 
E
I
 
I
M
 
C
A
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
N
I
 
V
D
 
N
G
 
G
V
 
A
L
|
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
K

Query Sequence

>WP_012410662.1 NCBI__GCF_000020025.1:WP_012410662.1
MRKIVIAGNWKMFKTQAETQEFLQGFLPHLEETPQGREVILCPPFTDLSVLSKTLHGSLI
QLGAQNIHWEEFGAYTGEISGPMLTESGVRFVIVGHSERRQYFGETDATVNLRLRTAQRF
GLTPILCVGETKQQRDAGETESLIALQLDKGLVDIDQNNLVIAYEPIWAIGTGETCEAVE
ANRIIGLIRSQLSNPNVSIQYGGSVKPNNIDEIMAQPEIDGVLVGGASLEPESFARIVNF
HLV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory