SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012412572.1 NCBI__GCF_000020025.1:WP_012412572.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6fcyA Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with prpp and adp
36% identity, 98% coverage: 2:210/214 of query aligns to 4:207/208 of 6fcyA

query
sites
6fcyA
L
 
L
T
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
S
K
 
K
G
 
G
E
x
R
L
 
I
L
 
L
K
 
E
N
 
E
S
 
T
I
 
M
R
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
S
 
A
V
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
E
F
 
L
S
 
L
A
 
E
F
 
D
L
 
P
D
 
E
S
 
A
G
 
-
T
 
S
R
 
R
Q
 
K
L
 
L
Q
 
I
I
 
F
P
 
P
D
 
T
T
 
S
K
 
N
G
 
P
L
 
N
A
 
V
K
 
R
A
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
A
Q
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
T
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
Y
 
H
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
A
G
 
G
Y
 
K
D
|
D
V
 
V
L
 
L
R
 
L
E
 
E
K
 
H
-
 
G
Q
 
A
P
 
N
Q
 
H
V
 
V
A
 
Y
H
 
E
L
 
L
V
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
K
F
 
I
G
x
A
Y
 
Q
C
|
C
R
 
K
-
 
L
M
 
M
S
 
T
V
 
A
A
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
D
S
 
A
S
 
P
S
 
L
Y
 
P
R
 
N
S
 
R
P
 
R
L
 
L
D
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
T
K
 
K
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
C
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
A
Y
 
Y
F
 
F
H
 
A
S
 
S
L
 
Q
D
 
G
L
 
Q
P
 
Q
V
 
V
E
 
D
I
 
V
V
 
I
P
 
K
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
V
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
I
 
L
T
 
V
G
 
G
M
 
L
S
 
G
E
 
D
A
 
L
I
 
I
V
 
V
D
 
D
L
x
V
V
 
V
S
x
D
T
|
T
G
|
G
R
 
N
T
|
T
M
 
L
R
 
R
E
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
A
I
 
R
A
 
D
T
 
H
L
 
I
Y
 
C
E
 
D
S
 
V
T
 
S
A
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
V
H
 
N
P
 
Q
L
 
V
S
 
S
Y
 
Y
R
 
K
M
 
R
N
 
K
T
 
F
G
 
A
N
 
L
L
 
L
S
 
E
D
 
P
V
 
I
I
 
L
A
 
D
K
 
S
L
 
F
R
 
K
E
 
N
A
 
S
V
 
I

6fd9A Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with amp
36% identity, 98% coverage: 2:210/214 of query aligns to 4:207/209 of 6fd9A

query
sites
6fd9A
L
 
L
T
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
S
K
 
K
G
 
G
E
x
R
L
 
I
L
 
L
K
 
E
N
 
E
S
 
T
I
 
M
R
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
S
 
A
V
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
E
F
 
L
S
 
L
A
 
E
F
 
D
L
 
P
D
 
E
S
 
A
G
 
-
T
 
S
R
 
R
Q
 
K
L
 
L
Q
 
I
I
 
F
P
 
P
D
 
T
T
 
S
K
 
N
G
 
P
L
 
N
A
 
V
K
 
R
A
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
A
Q
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
T
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
Y
 
H
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
A
G
 
G
Y
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
L
E
 
E
K
 
H
-
 
G
Q
 
A
P
 
N
Q
 
H
V
 
V
A
 
Y
H
 
E
L
 
L
V
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
K
F
 
I
G
x
A
Y
 
Q
C
|
C
R
 
K
-
 
L
M
 
M
S
 
T
V
 
A
A
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
D
S
 
A
S
 
P
S
 
L
Y
 
P
R
 
N
S
 
R
P
 
R
L
 
L
D
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
T
K
 
K
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
C
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
A
Y
 
Y
F
 
F
H
 
A
S
 
S
L
 
Q
D
 
G
L
 
Q
P
 
Q
V
 
V
E
 
D
I
 
V
V
 
I
P
 
K
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
V
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
I
 
L
T
 
V
G
 
G
M
 
L
S
 
G
E
 
D
A
 
L
I
 
I
V
 
V
D
 
D
L
x
V
V
|
V
S
x
D
T
|
T
G
 
G
R
 
N
T
|
T
M
 
L
R
 
R
E
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
A
I
 
R
A
 
D
T
 
H
L
 
I
Y
 
C
E
 
D
S
 
V
T
 
S
A
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
V
H
 
N
P
 
Q
L
 
V
S
 
S
Y
 
Y
R
 
K
M
 
R
N
 
K
T
 
F
G
 
A
N
 
L
L
 
L
S
 
E
D
 
P
V
 
I
I
 
L
A
 
D
K
 
S
L
 
F
R
 
K
E
 
N
A
 
S
V
 
I

6fcwA Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with pratp
36% identity, 98% coverage: 2:210/214 of query aligns to 4:207/209 of 6fcwA

query
sites
6fcwA
L
 
L
T
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
S
K
 
K
G
 
G
E
x
R
L
x
I
L
 
L
K
 
E
N
 
E
S
 
T
I
 
M
R
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
S
 
A
V
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
E
F
 
L
S
 
L
A
 
E
F
 
D
L
 
P
D
 
E
S
 
A
G
 
-
T
 
S
R
 
R
Q
 
K
L
 
L
Q
 
I
I
 
F
P
 
P
D
 
T
T
 
S
K
 
N
G
 
P
L
 
N
A
 
V
K
 
R
A
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
A
Q
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
T
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
Y
 
H
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
A
G
 
G
Y
 
K
D
|
D
V
 
V
L
 
L
R
 
L
E
 
E
K
 
H
-
 
G
Q
 
A
P
 
N
Q
 
H
V
 
V
A
 
Y
H
 
E
L
 
L
V
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
K
F
 
I
G
 
A
Y
 
Q
C
|
C
R
 
K
-
 
L
M
 
M
S
 
T
V
 
A
A
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
D
S
 
A
S
 
P
S
 
L
Y
 
P
R
 
N
S
 
R
P
 
R
L
 
L
D
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
T
K
|
K
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
C
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
A
Y
 
Y
F
 
F
H
 
A
S
 
S
L
 
Q
D
 
G
L
 
Q
P
 
Q
V
 
V
E
 
D
I
 
V
V
 
I
P
 
K
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
V
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
I
 
L
T
 
V
G
 
G
M
 
L
S
 
G
E
 
D
A
 
L
I
 
I
V
 
V
D
|
D
L
x
V
V
 
V
S
x
D
T
|
T
G
|
G
R
 
N
T
|
T
M
 
L
R
 
R
E
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
A
I
 
R
A
 
D
T
 
H
L
 
I
Y
 
C
E
 
D
S
 
V
T
 
S
A
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
V
H
 
N
P
 
Q
L
 
V
S
 
S
Y
 
Y
R
 
K
M
 
R
N
 
K
T
 
F
G
 
A
N
 
L
L
 
L
S
 
E
D
 
P
V
 
I
I
 
L
A
 
D
K
 
S
L
 
F
R
 
K
E
 
N
A
 
S
V
 
I

6fctA Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with prpp and atp
36% identity, 98% coverage: 2:210/214 of query aligns to 4:207/209 of 6fctA

query
sites
6fctA
L
 
L
T
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
S
K
 
K
G
 
G
E
x
R
L
 
I
L
 
L
K
 
E
N
 
E
S
 
T
I
 
M
R
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
S
 
A
V
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
E
F
 
L
S
 
L
A
 
E
F
 
D
L
 
P
D
 
E
S
 
A
G
 
-
T
 
S
R
 
R
Q
 
K
L
 
L
Q
 
I
I
 
F
P
 
P
D
 
T
T
 
S
K
 
N
G
 
P
L
 
N
A
 
V
K
 
R
A
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
A
Q
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
T
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
Y
 
H
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
A
G
 
G
Y
 
K
D
|
D
V
 
V
L
 
L
R
 
L
E
 
E
K
 
H
-
 
G
Q
 
A
P
 
N
Q
 
H
V
 
V
A
 
Y
H
 
E
L
 
L
V
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
K
F
 
I
G
x
A
Y
 
Q
C
|
C
R
 
K
-
 
L
M
 
M
S
 
T
V
 
A
A
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
D
S
 
A
S
 
P
S
 
L
Y
 
P
R
 
N
S
 
R
P
 
R
L
 
L
D
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
T
K
 
K
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
C
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
A
Y
 
Y
F
 
F
H
 
A
S
 
S
L
 
Q
D
 
G
L
 
Q
P
 
Q
V
 
V
E
 
D
I
 
V
V
 
I
P
 
K
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
V
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
I
 
L
T
 
V
G
 
G
M
 
L
S
 
G
E
 
D
A
 
L
I
 
I
V
 
V
D
 
D
L
x
V
V
|
V
S
x
D
T
|
T
G
|
G
R
 
N
T
|
T
M
 
L
R
 
R
E
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
A
I
 
R
A
 
D
T
 
H
L
 
I
Y
 
C
E
 
D
S
 
V
T
 
S
A
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
V
H
 
N
P
 
Q
L
 
V
S
 
S
Y
 
Y
R
 
K
M
 
R
N
 
K
T
 
F
G
 
A
N
 
L
L
 
L
S
 
E
D
 
P
V
 
I
I
 
L
A
 
D
K
 
S
L
 
F
R
 
K
E
 
N
A
 
S
V
 
I

6fcaA Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with prpp
36% identity, 98% coverage: 2:210/214 of query aligns to 4:207/209 of 6fcaA

query
sites
6fcaA
L
 
L
T
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
S
K
 
K
G
 
G
E
 
R
L
 
I
L
 
L
K
 
E
N
 
E
S
 
T
I
 
M
R
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
S
 
A
V
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
E
F
 
L
S
 
L
A
 
E
F
 
D
L
 
P
D
 
E
S
 
A
G
 
-
T
 
S
R
 
R
Q
 
K
L
 
L
Q
 
I
I
 
F
P
 
P
D
 
T
T
 
S
K
 
N
G
 
P
L
 
N
A
 
V
K
 
R
A
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
A
Q
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
T
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
Y
 
H
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
A
G
 
G
Y
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
L
E
 
E
K
 
H
-
 
G
Q
 
A
P
 
N
Q
 
H
V
 
V
A
 
Y
H
 
E
L
 
L
V
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
K
F
 
I
G
 
A
Y
 
Q
C
 
C
R
 
K
-
 
L
M
 
M
S
 
T
V
 
A
A
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
D
S
 
A
S
 
P
S
 
L
Y
 
P
R
 
N
S
 
R
P
 
R
L
 
L
D
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
T
K
 
K
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
C
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
A
Y
 
Y
F
 
F
H
 
A
S
 
S
L
 
Q
D
 
G
L
 
Q
P
 
Q
V
 
V
E
 
D
I
 
V
V
 
I
P
 
K
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
V
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
I
 
L
T
 
V
G
 
G
M
 
L
S
 
G
E
 
D
A
 
L
I
 
I
V
 
V
D
|
D
L
x
V
V
|
V
S
x
D
T
|
T
G
|
G
R
 
N
T
|
T
M
 
L
R
 
R
E
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
A
I
 
R
A
 
D
T
 
H
L
 
I
Y
 
C
E
 
D
S
 
V
T
 
S
A
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
V
H
 
N
P
 
Q
L
 
V
S
 
S
Y
 
Y
R
 
K
M
 
R
N
 
K
T
 
F
G
 
A
N
 
L
L
 
L
S
 
E
D
 
P
V
 
I
I
 
L
A
 
D
K
 
S
L
 
F
R
 
K
E
 
N
A
 
S
V
 
I

2vd3A The structure of histidine inhibited hisg from methanobacterium thermoautotrophicum
33% identity, 98% coverage: 2:210/214 of query aligns to 5:207/289 of 2vd3A

query
sites
2vd3A
L
 
I
T
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
V
P
 
P
-
 
S
K
 
K
G
 
G
E
 
R
L
 
I
L
 
S
K
 
E
N
 
P
S
 
A
I
 
I
R
 
R
L
 
L
L
 
L
Q
x
E
S
 
N
V
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
G
F
 
L
S
 
K
A
 
-
F
 
-
L
 
-
D
 
D
S
 
T
G
 
V
T
 
N
R
 
R
Q
 
K
L
 
L
Q
 
F
I
 
S
P
 
K
D
 
T
T
x
Q
K
 
H
G
 
P
L
 
Q
A
 
I
K
 
E
A
 
V
L
 
M
L
 
F
V
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
A
D
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
E
Y
 
F
V
 
V
E
 
A
Y
 
D
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
L
L
 
I
R
 
V
E
 
E
K
 
R
Q
 
G
P
 
S
Q
 
D
V
 
V
A
 
E
H
 
I
L
 
L
V
 
E
D
 
D
L
 
L
Q
 
K
F
 
Y
G
 
G
Y
 
R
C
 
A
R
 
S
M
 
L
S
 
V
V
 
L
A
 
A
V
 
A
K
 
P
A
 
E
S
 
D
S
 
S
S
 
T
Y
 
I
R
 
R
S
 
G
P
 
P
L
 
E
D
 
D
L
 
I
P
 
P
P
 
R
H
 
G
G
 
A
R
 
V
V
 
I
A
 
A
S
 
T
K
 
E
Y
 
F
V
 
P
N
 
G
C
 
I
A
 
T
R
 
E
E
 
N
Y
 
Y
F
 
L
H
 
R
S
 
E
L
 
H
D
 
G
L
 
I
P
 
D
V
 
A
E
 
E
I
 
V
V
 
V
P
 
E
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
T
E
 
E
L
 
I
G
 
A
P
 
P
I
 
F
T
 
I
G
 
G
M
 
V
S
 
A
E
 
D
A
 
L
I
 
I
V
 
T
D
|
D
L
|
L
V
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
G
R
 
T
T
 
T
M
 
L
R
 
R
E
 
M
N
 
N
G
 
H
L
 
L
I
 
R
E
 
V
I
 
I
A
 
D
T
 
T
L
 
I
Y
 
L
E
 
E
S
 
S
T
 
S
A
 
V
R
 
K
L
 
L
I
 
I
A
 
A
H
 
N
P
 
R
L
 
E
S
 
S
Y
 
Y
R
 
A
M
 
T
N
 
K
T
 
S
G
 
G
N
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
I
I
 
I
A
 
E
K
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
T
A
 
G
V
 
I

Sites not aligning to the query:

1z7nF Atp phosphoribosyl transferase (hiszg atp-prtase) from lactococcus lactis with bound prpp substrate (see paper)
32% identity, 98% coverage: 1:209/214 of query aligns to 1:205/205 of 1z7nF

query
sites
1z7nF
M
 
M
L
 
I
T
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
I
P
 
T
K
 
K
G
 
G
E
 
R
L
 
I
L
 
Q
K
 
K
N
 
Q
S
 
V
I
 
T
R
 
K
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
S
 
N
V
 
A
G
 
D
L
 
Y
D
 
D
F
 
V
S
 
E
A
 
P
F
 
I
L
 
L
D
 
N
S
 
L
G
 
G
T
 
-
R
 
R
Q
 
E
L
 
L
Q
 
Q
I
 
I
P
 
K
D
 
-
T
 
T
K
 
K
G
 
D
L
 
D
A
 
L
K
 
Q
A
 
I
L
 
I
L
 
F
V
 
G
R
 
K
A
 
P
Q
 
N
D
 
D
V
 
V
P
 
I
V
 
T
Y
 
F
V
 
L
E
 
E
Y
 
H
G
 
G
Q
 
I
A
 
V
Q
 
D
L
 
I
G
 
G
V
 
F
V
 
V
G
 
G
Y
 
K
D
 
D
V
 
T
L
 
L
R
 
D
E
 
E
K
 
N
Q
 
D
-
 
F
P
 
D
Q
 
D
V
 
Y
A
 
Y
H
 
E
L
 
L
V
 
L
D
 
Y
L
 
L
Q
 
K
F
 
I
G
 
G
Y
 
Q
C
 
C
R
 
I
M
 
F
S
 
A
V
 
L
A
 
A
V
 
S
K
 
Y
A
 
P
S
 
D
S
 
F
S
 
S
Y
 
N
R
 
K
S
 
N
P
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
F
P
 
Q
P
 
R
H
 
H
G
 
K
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
S
K
 
K
Y
 
Y
V
 
P
N
 
R
C
 
V
A
 
T
R
 
K
E
 
K
Y
 
Y
F
 
F
H
 
A
S
 
Q
L
 
K
D
 
Q
L
 
E
P
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
I
P
 
K
L
 
L
Y
 
E
G
|
G
S
|
S
V
 
V
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
V
T
 
V
G
 
G
M
 
L
S
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
D
|
D
L
 
I
V
|
V
S
x
E
T
|
T
G
|
G
R
 
N
T
|
T
M
 
L
R
 
S
E
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
V
I
 
I
A
 
E
T
 
K
L
 
I
Y
 
S
E
 
D
S
 
I
T
 
S
A
 
T
R
 
R
L
 
M
I
 
I
A
 
V
H
 
N
P
 
K
L
 
S
S
 
S
Y
 
F
R
 
K
M
 
F
N
 
K
T
 
K
G
 
D
N
 
K
L
 
I
S
 
I
D
 
E
V
 
M
I
 
V
A
 
E
K
 
R
L
 
L
R
 
E
E
 
D
A
 
A

1usyG Atp phosphoribosyl transferase (hisg:hisz) complex from thermotoga maritima (see paper)
32% identity, 98% coverage: 1:210/214 of query aligns to 1:198/203 of 1usyG

query
sites
1usyG
M
 
M
L
 
L
T
 
K
V
 
L
A
 
A
L
 
I
P
 
P
K
 
K
G
 
G
E
 
R
L
 
L
L
 
E
K
 
E
N
 
K
S
 
V
I
 
M
R
 
T
L
 
Y
L
 
L
Q
 
K
S
 
K
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
I
F
 
F
-
 
E
-
 
R
-
 
E
S
 
S
A
 
S
F
 
I
L
 
L
D
 
R
S
 
E
G
 
G
T
 
K
R
 
D
Q
 
I
L
 
V
Q
 
-
I
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
K
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
C
L
 
F
L
 
M
V
 
V
R
 
R
A
 
P
Q
 
F
D
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
T
Y
 
Y
V
 
L
E
 
V
Y
 
H
G
 
G
Q
 
V
A
 
A
Q
 
D
L
 
I
G
 
G
V
 
F
V
 
C
G
 
G
Y
x
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
L
E
 
E
K
 
K
Q
 
E
P
 
T
Q
 
S
V
 
L
A
 
I
H
x
Q
L
x
P
V
 
F
D
 
F
L
 
I
Q
 
P
F
 
T
G
 
N
Y
 
I
C
 
S
R
 
R
M
 
M
S
 
V
V
 
L
A
 
A
V
 
G
K
 
P
A
 
K
S
 
G
S
 
R
S
 
G
Y
 
I
R
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
P
H
 
E
G
 
G
-
 
E
-
 
K
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
T
K
 
K
Y
 
F
V
 
P
N
 
N
C
 
V
A
 
T
R
 
Q
E
 
R
Y
 
Y
F
 
C
H
 
E
S
 
S
L
 
K
D
 
G
L
 
W
P
 
H
V
 
C
E
 
R
I
 
I
V
 
I
P
 
P
L
 
L
Y
 
K
G
 
G
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
I
 
I
T
 
A
G
 
G
M
 
L
S
 
S
E
 
D
A
 
L
I
 
I
V
 
V
D
 
D
L
 
I
V
 
T
S
 
E
T
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
T
M
 
L
R
 
K
E
 
E
N
 
N
G
 
N
L
 
L
I
 
E
E
 
I
I
 
L
A
 
D
T
 
E
L
 
I
Y
 
F
E
 
V
S
 
I
T
x
R
A
 
T
R
x
H
L
 
V
I
 
V
A
 
V
H
 
N
P
 
P
L
 
V
S
 
S
Y
|
Y
R
 
R
M
 
T
N
 
K
T
 
R
G
 
E
N
 
E
L
 
V
S
 
V
D
 
S
V
 
F
I
 
L
A
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
A
 
V
V
 
I

1z7mE Atp phosphoribosyl transferase (hiszg atp-prtase) from lactococcus lactis (see paper)
33% identity, 88% coverage: 1:188/214 of query aligns to 1:180/200 of 1z7mE

query
sites
1z7mE
M
 
M
L
 
I
T
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
I
P
 
T
K
 
K
G
 
G
E
 
R
L
 
I
L
 
Q
K
 
K
N
 
Q
S
 
V
I
 
T
R
 
K
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
S
 
N
V
 
A
G
 
D
L
 
Y
D
 
D
F
 
V
S
 
E
A
 
P
F
 
I
L
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
R
Q
 
E
L
 
L
Q
 
Q
I
 
I
P
 
K
D
 
-
T
 
T
K
 
K
G
 
D
L
 
D
A
 
L
K
 
Q
A
 
I
L
 
I
L
 
F
V
 
G
R
 
K
A
 
P
Q
 
N
D
 
D
V
 
V
P
 
I
V
 
T
Y
 
F
V
 
L
E
 
E
Y
 
H
G
 
G
Q
 
I
A
 
V
Q
 
D
L
 
I
G
 
G
V
 
F
V
 
V
G
 
G
Y
 
K
D
 
D
V
 
T
L
 
L
R
 
D
E
 
E
K
 
N
Q
 
D
-
 
F
P
 
D
Q
 
D
V
 
Y
A
 
Y
H
 
E
L
 
L
V
 
L
D
 
Y
L
 
L
Q
 
K
F
 
I
G
 
G
Y
 
Q
C
 
C
R
 
I
M
 
F
S
 
A
V
 
L
A
 
A
V
 
S
K
 
Y
A
 
P
S
 
D
S
 
F
S
 
S
Y
 
N
R
 
K
S
 
N
P
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
F
P
 
Q
P
 
R
H
 
H
G
 
K
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
S
K
 
K
Y
 
Y
V
 
P
N
 
R
C
 
V
A
 
T
R
 
K
E
 
K
Y
 
Y
F
 
F
H
 
A
S
 
Q
L
 
K
D
 
Q
L
 
E
P
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
I
P
 
K
L
 
L
Y
 
E
G
 
G
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
V
T
 
V
G
 
G
M
 
L
S
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
D
 
D
L
 
I
V
 
V
S
x
E
T
|
T
G
|
G
R
 
N
T
|
T
M
 
L
R
 
S
E
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
V
I
 
I
A
 
E
T
 
K
L
 
I
Y
 
S
E
 
D
S
 
I
T
 
S
A
 
T
R
 
R
L
 
M
I
 
I
A
 
V
H
 
N

7dahC Adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from vibrio cholerae in complex with atp and prpp
33% identity, 91% coverage: 8:201/214 of query aligns to 11:208/288 of 7dahC

query
sites
7dahC
K
 
K
G
 
G
E
x
R
L
 
L
L
 
S
K
 
Q
N
 
E
S
 
C
I
 
Q
R
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
S
 
K
V
 
C
G
 
G
L
 
V
D
 
K
F
 
F
S
 
N
A
 
I
F
 
M
L
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
G
T
 
E
R
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
V
-
 
H
Q
 
S
L
 
L
Q
 
N
I
 
M
P
 
P
D
 
-
T
 
-
K
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
I
K
 
D
A
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
V
R
|
R
A
x
D
Q
x
D
D
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
G
Y
 
L
V
 
I
E
 
M
Y
 
D
G
 
G
Q
 
V
A
 
V
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
F
V
 
V
G
 
G
Y
 
E
D
x
N
V
 
V
L
 
L
R
 
E
E
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
L
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
N
K
 
Q
Q
 
R
P
 
N
Q
 
E
V
 
F
A
 
T
H
 
T
L
 
L
V
 
R
D
 
R
L
 
M
Q
 
D
F
 
F
G
 
G
Y
x
G
C
|
C
R
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
I
A
 
A
V
 
I
K
 
E
A
 
K
S
 
D
S
 
A
S
 
E
Y
 
Y
R
 
R
S
 
G
P
 
P
L
 
Q
D
 
D
L
 
L
P
 
N
P
 
G
H
 
K
G
 
-
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
T
K
 
T
Y
 
Y
V
 
P
N
 
Q
C
 
L
A
 
L
R
 
K
E
 
A
Y
 
Y
F
 
M
H
 
D
S
 
R
L
 
Q
D
 
G
L
 
V
P
 
D
V
 
F
E
 
S
I
 
T
V
 
C
P
 
M
L
 
L
Y
 
T
G
|
G
S
|
S
V
 
V
E
|
E
L
 
V
G
 
A
P
 
P
I
 
R
T
 
A
G
 
G
M
 
L
S
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
D
L
|
L
V
 
V
S
|
S
T
|
T
G
|
G
R
x
A
T
|
T
M
 
L
R
 
E
E
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
E
T
 
V
L
 
I
Y
 
F
E
 
E
S
 
S
T
 
K
A
 
A
R
 
T
L
 
L
I
 
I
A
 
Q
H
 
R
P
 
P
L
 
G
S
 
A
Y
 
F
R
 
A
M
 
A
N
 
D
T
 
K
G
 
A
N
 
A
L
 
L
S
 
I
D
 
D

Sites not aligning to the query:

1q1kA Structure of atp-phosphoribosyltransferase from e. Coli complexed with pr-atp (see paper)
37% identity, 64% coverage: 49:186/214 of query aligns to 47:192/288 of 1q1kA

query
sites
1q1kA
L
 
L
L
 
R
V
 
V
R
 
R
A
x
D
Q
x
D
D
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
G
Y
 
L
V
 
V
E
 
M
Y
 
D
G
 
G
Q
 
V
A
 
V
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
E
D
x
N
V
|
V
L
 
L
R
 
E
E
 
E
K
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
N
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
E
Q
 
D
P
 
P
Q
 
R
V
 
Y
A
 
F
H
 
T
L
 
L
V
 
R
D
 
R
L
 
L
Q
 
D
F
 
F
G
 
G
Y
 
G
C
|
C
R
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
T
K
 
P
A
 
V
S
 
D
S
 
E
S
 
A
Y
 
W
R
 
D
S
 
G
P
 
P
L
 
L
D
 
S
L
 
L
P
 
N
P
 
G
H
 
K
G
 
-
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
T
K
 
S
Y
|
Y
V
 
P
N
 
H
C
 
L
A
 
L
R
 
K
E
 
R
Y
 
Y
F
 
L
H
 
D
S
 
Q
L
 
K
D
 
G
L
 
I
P
 
S
V
 
F
E
 
K
I
 
S
V
 
C
P
 
L
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
S
 
S
V
 
V
E
|
E
L
 
V
G
 
A
P
 
P
I
 
R
T
 
A
G
 
G
M
 
L
S
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
L
|
L
V
 
V
S
|
S
T
|
T
G
|
G
R
x
A
T
|
T
M
 
L
R
 
E
E
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
E
T
 
V
L
 
I
Y
 
Y
E
 
R
S
 
S
T
 
K
A
 
A
R
 
C
L
 
L
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1h3dA Structure of the e.Coli atp-phosphoribosyltransferase (see paper)
37% identity, 64% coverage: 49:186/214 of query aligns to 47:192/288 of 1h3dA

query
sites
1h3dA
L
 
L
L
 
R
V
 
V
R
 
R
A
 
D
Q
 
D
D
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
G
Y
 
L
V
 
V
E
 
M
Y
 
D
G
 
G
Q
 
V
A
 
V
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
E
D
 
N
V
 
V
L
 
L
R
 
E
E
 
E
K
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
N
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
E
Q
 
D
P
 
P
Q
 
R
V
 
Y
A
 
F
H
 
T
L
 
L
V
 
R
D
 
R
L
 
L
Q
 
D
F
 
F
G
 
G
Y
 
G
C
 
C
R
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
T
K
 
P
A
 
V
S
 
D
S
 
E
S
 
A
Y
 
W
R
 
D
S
 
G
P
 
P
L
 
L
D
 
S
L
 
L
P
 
N
P
 
G
H
 
K
G
 
-
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
T
K
 
S
Y
 
Y
V
 
P
N
 
H
C
 
L
A
 
L
R
 
K
E
 
R
Y
 
Y
F
 
L
H
 
D
S
 
Q
L
 
K
D
 
G
L
 
I
P
 
S
V
 
F
E
 
K
I
 
S
V
 
C
P
 
L
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
S
 
S
V
 
V
E
|
E
L
 
V
G
 
A
P
 
P
I
 
R
T
 
A
G
 
G
M
 
L
S
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
C
D
|
D
L
|
L
V
 
V
S
|
S
T
|
T
G
|
G
R
x
A
T
|
T
M
 
L
R
 
E
E
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
E
T
 
V
L
 
I
Y
 
Y
E
 
R
S
 
S
T
 
K
A
 
A
R
 
C
L
 
L
I
 
I

Sites not aligning to the query:

4yb6E Adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni in complex with the inhibitors amp and histidine (see paper)
33% identity, 86% coverage: 2:186/214 of query aligns to 4:190/293 of 4yb6E

query
sites
4yb6E
L
 
L
T
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
P
 
Q
K
 
K
-
 
S
G
 
G
E
 
R
L
 
L
L
 
S
K
 
K
N
 
E
S
 
S
I
 
I
R
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
S
S
 
E
V
 
C
G
 
G
L
 
V
D
 
K
F
 
M
S
 
H
A
 
I
F
 
S
L
 
L
D
 
I
S
 
A
G
 
F
T
 
S
R
 
T
Q
 
N
L
 
L
Q
 
P
I
 
I
P
 
-
D
 
-
T
 
-
K
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
D
A
 
I
L
 
L
L
 
R
V
 
V
R
 
R
A
 
D
Q
 
D
D
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
G
Y
 
L
V
 
I
E
 
F
Y
 
D
G
 
G
Q
 
V
A
 
V
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
E
D
 
N
V
 
V
L
 
L
R
 
E
E
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
Q
-
 
S
-
 
L
-
 
G
K
 
E
Q
 
N
P
 
P
Q
 
S
V
 
Y
A
 
K
H
 
L
L
 
L
V
 
K
D
 
K
L
 
L
Q
 
D
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
C
 
C
R
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
L
K
 
P
A
 
Q
S
 
E
S
 
N
S
 
K
Y
 
F
R
 
Q
S
 
N
P
 
L
L
 
K
D
 
D
L
 
F
P
 
-
P
 
-
H
 
E
G
 
G
-
 
L
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
T
K
 
S
Y
 
Y
V
 
P
N
 
Q
C
 
L
A
 
L
R
 
K
E
 
R
Y
 
F
F
 
M
H
 
K
S
 
E
L
 
N
D
 
G
L
 
I
P
 
N
V
 
Y
E
 
K
I
 
N
V
 
C
P
 
T
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
P
I
 
R
T
 
A
G
 
N
M
 
L
S
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
L
|
L
V
 
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
R
 
A
T
|
T
M
 
L
R
 
Q
E
 
A
N
 
N
G
 
N
L
 
L
I
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
K
T
 
V
L
 
I
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
C
L
 
L
I
 
I

Sites not aligning to the query:

5ubgA Catalytic core domain of adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni with bound phosphoribosyl-atp (see paper)
32% identity, 86% coverage: 2:186/214 of query aligns to 4:193/222 of 5ubgA

query
sites
5ubgA
L
 
L
T
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
P
x
Q
K
 
K
-
 
S
G
|
G
E
x
R
L
 
L
L
 
S
K
 
K
N
 
E
S
 
S
I
 
I
R
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
S
S
 
E
V
 
C
G
 
G
L
 
V
D
 
K
F
 
M
S
x
H
A
 
I
F
x
H
L
 
E
D
 
Q
S
 
S
G
 
-
T
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
L
Q
 
I
I
 
A
P
 
F
D
 
S
T
 
T
K
 
N
G
 
L
L
 
P
A
 
I
K
 
D
A
 
I
L
 
L
L
 
R
V
 
V
R
|
R
A
x
D
Q
x
D
D
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
G
Y
 
L
V
 
I
E
 
F
Y
 
D
G
 
G
Q
 
V
A
 
V
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
E
D
x
N
V
 
V
L
 
L
R
 
E
E
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
Q
-
 
S
-
 
L
-
 
G
K
 
E
Q
 
N
P
 
P
Q
 
S
V
 
Y
A
 
K
H
 
L
L
 
L
V
 
K
D
 
K
L
 
L
Q
 
D
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
C
|
C
R
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
L
K
 
P
A
 
Q
S
 
E
S
 
N
S
 
K
Y
 
F
R
 
Q
S
 
N
P
 
L
L
 
K
D
 
D
L
 
F
P
 
E
P
 
G
H
 
L
G
 
-
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
T
K
 
S
Y
 
Y
V
 
P
N
 
Q
C
 
L
A
 
L
R
 
K
E
 
R
Y
 
F
F
 
M
H
 
K
S
 
E
L
 
N
D
 
G
L
 
I
P
 
N
V
 
Y
E
 
K
I
 
N
V
 
C
P
 
T
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
P
I
 
R
T
 
A
G
 
N
M
 
L
S
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
L
|
L
V
 
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
R
x
A
T
|
T
M
 
L
R
 
Q
E
 
A
N
 
N
G
 
N
L
 
L
I
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
K
T
 
V
L
 
I
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
C
L
 
L
I
 
I

5ubiA Catalytic core domain of adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni with bound prpp (see paper)
32% identity, 86% coverage: 2:186/214 of query aligns to 4:193/218 of 5ubiA

query
sites
5ubiA
L
 
L
T
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
P
 
Q
K
 
K
-
 
S
G
 
G
E
 
R
L
 
L
L
 
S
K
 
K
N
 
E
S
 
S
I
 
I
R
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
S
S
 
E
V
 
C
G
 
G
L
 
V
D
 
K
F
 
M
S
x
H
A
 
I
F
x
H
L
 
E
D
 
Q
S
 
S
G
 
-
T
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
L
Q
 
I
I
 
A
P
 
F
D
 
S
T
 
T
K
 
N
G
 
L
L
 
P
A
 
I
K
 
D
A
 
I
L
 
L
L
 
R
V
 
V
R
 
R
A
x
D
Q
x
D
D
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
G
Y
 
L
V
 
I
E
 
F
Y
 
D
G
 
G
Q
 
V
A
 
V
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
E
D
 
N
V
 
V
L
 
L
R
 
E
E
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
Q
-
 
S
-
 
L
-
 
G
K
 
E
Q
 
N
P
 
P
Q
 
S
V
 
Y
A
 
K
H
 
L
L
 
L
V
 
K
D
 
K
L
 
L
Q
 
D
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
C
 
C
R
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
L
K
 
P
A
 
Q
S
 
E
S
 
N
S
 
K
Y
 
F
R
 
Q
S
 
N
P
 
L
L
 
K
D
 
D
L
 
F
P
 
E
P
 
G
H
 
L
G
 
-
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
T
K
 
S
Y
 
Y
V
 
P
N
 
Q
C
 
L
A
 
L
R
 
K
E
 
R
Y
 
F
F
 
M
H
 
K
S
 
E
L
 
N
D
 
G
L
 
I
P
 
N
V
 
Y
E
 
K
I
 
N
V
 
C
P
 
T
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
P
I
 
R
T
 
A
G
 
N
M
 
L
S
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
L
|
L
V
|
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
R
 
A
T
|
T
M
 
L
R
 
Q
E
 
A
N
 
N
G
 
N
L
 
L
I
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
K
T
 
V
L
 
I
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
C
L
 
L
I
 
I

4yb7C Adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni in complex with atp (see paper)
33% identity, 86% coverage: 2:186/214 of query aligns to 4:193/294 of 4yb7C

query
sites
4yb7C
L
 
L
T
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
P
x
Q
K
 
K
-
 
S
G
|
G
E
x
R
L
 
L
L
 
S
K
 
K
N
 
E
S
 
S
I
 
I
R
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
S
S
 
E
V
 
C
G
 
G
L
 
V
D
 
K
F
 
M
S
 
H
A
 
I
F
 
H
L
 
E
D
 
Q
S
 
S
G
 
-
T
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
L
Q
 
I
I
 
A
P
 
F
D
 
S
T
 
T
K
 
N
G
 
L
L
 
P
A
 
I
K
 
D
A
 
I
L
 
L
L
 
R
V
 
V
R
|
R
A
x
D
Q
x
D
D
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
G
Y
 
L
V
 
I
E
 
F
Y
 
D
G
 
G
Q
 
V
A
 
V
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
E
D
x
N
V
 
V
L
 
L
R
 
E
E
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
Q
-
 
S
-
 
L
-
 
G
K
 
E
Q
 
N
P
 
P
Q
 
S
V
 
Y
A
 
K
H
 
L
L
 
L
V
 
K
D
 
K
L
 
L
Q
 
D
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
C
|
C
R
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
L
K
 
P
A
 
Q
S
 
E
S
 
N
S
 
K
Y
 
F
R
 
Q
S
 
N
P
 
L
L
 
K
D
 
D
L
 
F
P
 
-
P
 
-
H
 
E
G
 
G
-
 
L
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
T
K
 
S
Y
 
Y
V
 
P
N
 
Q
C
 
L
A
 
L
R
 
K
E
 
R
Y
 
F
F
 
M
H
 
K
S
 
E
L
 
N
D
 
G
L
 
I
P
 
N
V
 
Y
E
 
K
I
 
N
V
 
C
P
 
T
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
P
I
 
R
T
 
A
G
 
N
M
 
L
S
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
L
|
L
V
|
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
R
 
A
T
|
T
M
 
L
R
 
Q
E
 
A
N
 
N
G
 
N
L
 
L
I
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
K
T
 
V
L
 
I
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
C
L
 
L
I
 
I

4yb7A Adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni in complex with atp (see paper)
33% identity, 86% coverage: 2:186/214 of query aligns to 4:193/296 of 4yb7A

query
sites
4yb7A
L
 
L
T
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
P
x
Q
K
 
K
-
 
S
G
|
G
E
x
R
L
|
L
L
 
S
K
 
K
N
 
E
S
 
S
I
 
I
R
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
S
S
 
E
V
 
C
G
 
G
L
 
V
D
 
K
F
 
M
S
 
H
A
 
I
F
 
H
L
 
E
D
 
Q
S
 
S
G
 
-
T
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
L
Q
 
I
I
 
A
P
 
F
D
 
S
T
 
T
K
 
N
G
 
L
L
 
P
A
 
I
K
 
D
A
 
I
L
 
L
L
 
R
V
 
V
R
|
R
A
x
D
Q
x
D
D
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
G
Y
 
L
V
 
I
E
 
F
Y
 
D
G
 
G
Q
 
V
A
 
V
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
E
D
x
N
V
 
V
L
 
L
R
 
E
E
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
Q
-
 
S
-
 
L
-
 
G
K
 
E
Q
 
N
P
 
P
Q
 
S
V
 
Y
A
 
K
H
 
L
L
 
L
V
 
K
D
 
K
L
 
L
Q
 
D
F
 
F
G
|
G
Y
 
Y
C
|
C
R
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
L
K
 
P
A
 
Q
S
 
E
S
 
N
S
 
K
Y
 
F
R
 
Q
S
 
N
P
 
L
L
 
K
D
 
D
L
 
F
P
 
-
P
 
-
H
 
E
G
 
G
-
 
L
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
T
K
 
S
Y
 
Y
V
 
P
N
 
Q
C
 
L
A
 
L
R
 
K
E
 
R
Y
 
F
F
 
M
H
 
K
S
 
E
L
 
N
D
 
G
L
 
I
P
 
N
V
 
Y
E
 
K
I
 
N
V
 
C
P
 
T
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
P
I
 
R
T
 
A
G
 
N
M
 
L
S
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
L
|
L
V
 
V
S
|
S
T
 
S
G
 
G
R
 
A
T
 
T
M
 
L
R
 
Q
E
 
A
N
 
N
G
 
N
L
 
L
I
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
K
T
 
V
L
 
I
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
C
L
 
L
I
 
I

4yb6A Adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni in complex with the inhibitors amp and histidine (see paper)
33% identity, 86% coverage: 2:186/214 of query aligns to 4:193/296 of 4yb6A

query
sites
4yb6A
L
 
L
T
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
P
 
Q
K
 
K
-
 
S
G
 
G
E
 
R
L
 
L
L
 
S
K
 
K
N
 
E
S
 
S
I
 
I
R
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
S
S
 
E
V
 
C
G
 
G
L
 
V
D
 
K
F
 
M
S
 
H
A
 
I
F
 
H
L
 
E
D
 
Q
S
 
S
G
 
-
T
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
L
Q
 
I
I
 
A
P
 
F
D
 
S
T
 
T
K
 
N
G
 
L
L
 
P
A
 
I
K
 
D
A
 
I
L
 
L
L
 
R
V
 
V
R
 
R
A
 
D
Q
 
D
D
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
G
Y
 
L
V
 
I
E
 
F
Y
 
D
G
 
G
Q
 
V
A
 
V
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
E
D
 
N
V
 
V
L
 
L
R
 
E
E
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
Q
-
 
S
-
 
L
-
 
G
K
 
E
Q
 
N
P
 
P
Q
 
S
V
 
Y
A
 
K
H
 
L
L
 
L
V
 
K
D
 
K
L
 
L
Q
 
D
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
C
 
C
R
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
L
K
 
P
A
 
Q
S
 
E
S
 
N
S
 
K
Y
 
F
R
 
Q
S
 
N
P
 
L
L
 
K
D
 
D
L
 
F
P
 
-
P
 
-
H
 
E
G
 
G
-
 
L
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
T
K
 
S
Y
 
Y
V
 
P
N
 
Q
C
 
L
A
 
L
R
 
K
E
 
R
Y
 
F
F
 
M
H
 
K
S
 
E
L
 
N
D
 
G
L
 
I
P
 
N
V
 
Y
E
 
K
I
 
N
V
 
C
P
 
T
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
P
I
 
R
T
 
A
G
 
N
M
 
L
S
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
L
|
L
V
 
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
R
 
A
T
|
T
M
 
L
R
 
Q
E
 
A
N
 
N
G
 
N
L
 
L
I
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
K
T
 
V
L
 
I
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
C
L
 
L
I
 
I

Sites not aligning to the query:

5ub9A Catalytic core domain of adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni (see paper)
32% identity, 86% coverage: 2:186/214 of query aligns to 3:191/220 of 5ub9A

query
sites
5ub9A
L
 
L
T
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
P
 
Q
K
 
K
-
 
S
G
 
G
E
 
R
L
 
L
L
 
S
K
 
K
N
 
E
S
 
S
I
 
I
R
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
S
S
 
E
V
 
C
G
 
G
L
 
V
D
 
K
F
 
M
S
x
H
A
 
I
F
x
H
L
 
E
D
 
Q
S
 
S
G
 
-
T
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
L
Q
 
I
I
 
A
P
 
F
D
 
S
T
 
T
K
 
N
G
 
L
L
 
P
A
 
I
K
 
D
A
 
I
L
 
L
L
 
R
V
 
V
R
 
R
A
 
D
Q
 
D
D
 
D
V
 
I
P
 
P
V
 
G
Y
 
L
V
 
I
E
 
F
Y
 
D
G
 
G
Q
 
V
A
 
V
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
E
D
 
N
V
 
V
L
 
L
R
 
E
E
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
Q
-
 
S
-
 
L
-
 
G
K
 
E
Q
 
N
P
 
P
Q
 
S
V
 
Y
A
 
K
H
 
L
L
 
L
V
 
K
D
 
K
L
 
L
Q
 
D
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
C
 
C
R
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
L
K
 
P
A
 
Q
S
 
E
S
 
N
S
 
K
Y
 
F
R
 
N
S
 
-
P
 
-
L
 
L
D
 
K
L
 
D
P
 
F
P
 
E
H
 
G
G
 
L
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
T
K
 
S
Y
 
Y
V
 
P
N
 
Q
C
 
L
A
 
L
R
 
K
E
 
R
Y
 
F
F
 
M
H
 
K
S
 
E
L
 
N
D
 
G
L
 
I
P
 
N
V
 
Y
E
 
K
I
 
N
V
 
C
P
 
T
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
P
I
 
R
T
 
A
G
 
N
M
 
L
S
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
L
 
L
V
 
V
S
 
S
T
 
S
G
 
G
R
 
A
T
 
T
M
 
L
R
 
Q
E
 
A
N
 
N
G
 
N
L
 
L
I
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
K
T
 
V
L
 
I
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
C
L
 
L
I
 
I

5u99A Transition state analysis of adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase (see paper)
29% identity, 87% coverage: 1:186/214 of query aligns to 3:184/278 of 5u99A

query
sites
5u99A
M
 
M
L
 
L
T
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
V
P
 
P
-
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
A
L
 
L
L
 
S
K
 
E
N
 
P
S
 
A
I
 
T
R
 
E
L
 
I
L
 
L
Q
 
A
S
 
E
V
 
A
G
 
G
L
 
-
D
 
-
F
 
Y
S
 
R
A
 
R
F
 
R
L
 
T
D
 
D
S
 
S
G
 
-
T
 
-
R
 
K
Q
 
D
L
 
L
Q
 
T
I
 
V
P
 
I
D
 
D
T
 
P
K
 
V
G
 
N
L
 
N
A
 
V
K
 
E
A
 
F
L
 
F
L
 
F
V
 
L
R
 
R
A
 
P
Q
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
A
V
 
I
Y
 
Y
V
 
V
E
 
G
Y
 
S
G
 
G
Q
 
E
A
 
L
Q
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
I
V
 
T
G
 
G
Y
 
R
D
|
D
V
 
L
L
 
V
R
 
C
E
 
D
K
 
S
Q
 
G
P
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
R
H
 
E
L
 
R
V
 
L
D
 
A
L
 
L
Q
 
G
F
 
F
G
 
G
Y
 
S
C
x
S
R
 
S
M
 
F
S
 
R
V
 
Y
A
 
A
V
 
A
K
 
P
A
 
A
S
 
G
S
 
R
S
 
N
Y
 
W
R
 
-
S
 
T
P
 
T
L
 
A
D
 
D
L
 
L
P
 
A
P
 
G
H
 
M
G
 
-
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
T
K
 
A
Y
 
Y
V
 
P
N
 
N
C
 
L
A
 
V
R
 
R
E
 
K
Y
 
D
F
 
L
H
 
A
S
 
T
L
 
K
D
 
G
L
 
I
P
 
E
V
 
A
E
 
T
I
 
V
V
 
I
P
 
R
L
 
L
Y
 
D
G
 
G
S
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
I
G
 
S
P
 
V
I
 
Q
T
 
L
G
 
G
M
 
V
S
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
D
L
x
V
V
 
V
S
 
G
T
 
S
G
 
G
R
 
R
T
 
T
M
 
L
R
 
S
E
 
Q
N
 
H
G
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
A
I
 
F
A
 
G
T
 
E
-
 
P
L
 
L
Y
 
C
E
 
D
S
 
S
T
 
E
A
 
A
R
 
V
L
 
L
I
 
I

Query Sequence

>WP_012412572.1 NCBI__GCF_000020025.1:WP_012412572.1
MLTVALPKGELLKNSIRLLQSVGLDFSAFLDSGTRQLQIPDTKGLAKALLVRAQDVPVYV
EYGQAQLGVVGYDVLREKQPQVAHLVDLQFGYCRMSVAVKASSSYRSPLDLPPHGRVASK
YVNCAREYFHSLDLPVEIVPLYGSVELGPITGMSEAIVDLVSTGRTMRENGLIEIATLYE
STARLIAHPLSYRMNTGNLSDVIAKLREAVLVEV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory