SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012466757.1 NCBI__GCF_000020465.1:WP_012466757.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4n6bA Soybean serine acetyltransferase complexed with coa (see paper)
42% identity, 72% coverage: 44:161/164 of query aligns to 115:232/233 of 4n6bA

query
sites
4n6bA
Q
 
Q
T
 
S
I
 
R
K
 
R
R
 
P
I
 
L
A
 
A
V
 
L
L
 
A
Q
 
L
H
 
H
R
 
S
F
 
R
W
 
I
S
 
A
A
 
N
V
 
V
C
 
F
G
 
A
A
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
H
L
 
P
D
 
A
S
 
A
N
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
K
G
 
G
L
 
I
L
 
L
I
 
F
P
 
D
H
|
H
P
 
A
N
 
T
G
 
G
I
 
V
V
 
V
I
 
V
H
 
G
P
 
E
Q
 
T
A
 
A
K
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
N
N
 
N
C
 
V
L
 
S
I
 
I
F
x
L
Q
 
H
Q
 
H
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
x
G
S
 
T
G
 
G
A
 
G
S
 
D
E
 
R
V
 
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
G
G
 
D
H
 
G
V
 
V
D
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
E
H
 
G
A
 
A
R
x
K
I
 
V
G
|
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
I
x
L
T
 
I
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
P
N
 
R
A
 
T
T
 
T
A
 
A
V
|
V
G
 
G
I
 
N
P
 
P
G
 
A
K
 
R
I
 
L

3gvdI Crystal structure of serine acetyltransferase cyse from yersinia pestis
40% identity, 73% coverage: 43:161/164 of query aligns to 125:246/272 of 3gvdI

query
sites
3gvdI
S
 
A
Q
 
Q
T
 
D
I
 
R
K
 
K
R
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
I
L
 
Y
Q
 
L
H
 
Q
R
 
N
F
 
Q
W
 
V
S
 
S
A
 
V
V
 
A
C
 
F
G
 
G
A
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
H
L
 
P
D
 
A
S
 
A
N
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
C
G
 
G
L
 
I
L
 
M
I
 
L
P
x
D
H
 
H
P
 
A
N
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
I
 
I
H
 
G
P
 
E
Q
 
T
A
 
A
K
 
V
I
 
V
G
 
E
P
 
N
N
 
D
C
 
V
L
 
S
I
 
I
F
 
L
Q
 
Q
Q
 
S
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
|
G
A
x
G
S
 
T
G
 
G
A
 
K
S
 
T
E
 
S
-
 
G
-
 
D
-
x
R
V
 
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
R
G
 
E
H
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
R
H
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
Q
D
 
S
I
 
V
P
 
P
A
 
A
N
 
H
A
 
T
T
 
T
A
 
A
V
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
K
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

6wyeA Crystal structure of neisseria gonorrhoeae serine acetyltransferase (cyse) (see paper)
42% identity, 70% coverage: 47:160/164 of query aligns to 127:243/261 of 6wyeA

query
sites
6wyeA
K
 
K
R
 
T
I
 
L
A
 
A
V
 
Y
L
 
F
Q
 
L
H
 
Q
R
 
N
F
 
R
W
 
M
S
 
S
A
 
E
V
 
V
C
 
F
G
 
G
A
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
H
L
 
P
D
 
A
S
 
A
N
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
M
I
 
L
P
x
D
H
|
H
P
 
A
N
 
T
G
 
G
I
 
F
V
 
V
I
 
A
H
 
G
P
 
E
Q
 
T
A
 
A
K
 
V
I
 
L
G
 
G
P
 
N
N
 
N
C
 
I
L
 
S
I
 
I
F
 
L
Q
 
H
Q
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
x
G
S
 
S
G
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
G
A
 
G
S
 
D
E
x
R
V
x
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
G
G
 
D
H
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
N
A
 
A
R
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
S
H
 
N
A
 
A
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
S
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
P
N
 
S
A
 
I
T
 
T
A
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
K
 
K

Sites not aligning to the query:

7ra4A Crystal structure of neisseria gonorrhoeae serine acetyltransferase (cyse) in complex with serine (see paper)
42% identity, 70% coverage: 47:160/164 of query aligns to 125:241/243 of 7ra4A

query
sites
7ra4A
K
 
K
R
 
T
I
 
L
A
 
A
V
 
Y
L
 
F
Q
 
L
H
 
Q
R
 
N
F
 
R
W
 
M
S
 
S
A
 
E
V
 
V
C
 
F
G
 
G
A
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
H
L
 
P
D
 
A
S
 
A
N
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
M
I
 
L
P
x
D
H
|
H
P
 
A
N
 
T
G
 
G
I
 
F
V
 
V
I
 
A
H
 
G
P
 
E
Q
 
T
A
 
A
K
 
V
I
 
L
G
 
G
P
 
N
N
 
N
C
 
I
L
 
S
I
 
I
F
 
L
Q
 
H
Q
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
G
S
 
S
G
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
G
A
 
G
S
 
D
E
x
R
V
x
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
G
G
 
D
H
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
N
A
 
A
R
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
S
H
 
N
A
 
A
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
S
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
P
N
 
S
A
 
I
T
 
T
A
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
K
 
K

Sites not aligning to the query:

1ssqD Serine acetyltransferase- complex with cysteine (see paper)
39% identity, 73% coverage: 43:161/164 of query aligns to 118:239/257 of 1ssqD

query
sites
1ssqD
S
 
N
Q
 
Q
T
 
N
I
 
R
K
 
K
R
 
S
I
 
L
A
 
A
V
 
L
L
 
Y
Q
 
L
H
 
Q
R
 
N
F
 
Q
W
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
A
C
 
F
G
 
D
A
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
H
L
 
P
D
 
A
S
 
A
N
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
H
G
 
G
L
 
I
L
 
M
I
 
F
P
x
D
H
|
H
P
 
A
N
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
I
 
V
H
 
G
P
 
E
Q
 
T
A
 
S
K
 
V
I
 
I
G
 
E
P
 
N
N
 
D
C
 
V
L
 
S
I
 
I
F
 
L
Q
 
Q
Q
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
G
S
 
T
G
 
G
A
 
K
S
 
E
E
 
S
-
 
G
-
 
D
-
 
R
V
 
H
P
 
P
V
 
K
I
 
V
E
 
R
G
 
E
H
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
K
H
 
Y
A
 
A
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
N
D
 
P
I
 
V
P
 
P
A
 
E
N
 
Y
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
K
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

4n69A Soybean serine acetyltransferase complexed with serine (see paper)
40% identity, 72% coverage: 44:161/164 of query aligns to 122:242/243 of 4n69A

query
sites
4n69A
Q
 
Q
T
 
S
I
 
R
K
 
R
R
 
P
I
 
L
A
 
A
V
 
L
L
 
A
Q
 
L
H
 
H
R
 
S
F
 
R
W
 
I
S
 
A
A
 
N
V
 
V
C
 
F
G
 
A
A
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
H
L
 
P
D
 
A
S
 
A
N
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
K
G
 
G
L
 
I
L
 
L
I
 
F
P
 
D
H
 
H
P
 
A
N
 
T
G
 
G
I
 
V
V
 
V
I
 
V
H
 
G
P
 
E
Q
 
T
A
 
A
K
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
N
N
 
N
C
 
V
L
 
S
I
 
I
F
 
L
Q
 
H
Q
 
H
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
x
G
S
 
T
G
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
G
A
 
G
S
 
D
E
x
R
V
x
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
G
G
 
D
H
 
G
V
 
V
D
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
E
H
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
I
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
P
N
 
R
A
 
T
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
N
P
 
P
G
 
A
K
 
R
I
 
L

1sstA Serine acetyltransferase- complex with coa (see paper)
39% identity, 73% coverage: 43:161/164 of query aligns to 118:232/233 of 1sstA

query
sites
1sstA
S
 
N
Q
 
Q
T
 
N
I
 
R
K
 
K
R
 
S
I
 
L
A
 
A
V
 
L
L
 
Y
Q
 
L
H
 
Q
R
 
N
F
 
Q
W
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
A
C
 
F
G
 
D
A
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
H
L
 
P
D
 
A
S
 
A
N
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
H
G
 
G
L
 
I
L
 
M
I
 
F
P
 
D
H
|
H
P
 
A
N
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
I
 
V
H
 
G
P
 
E
Q
 
T
A
 
S
K
 
V
I
 
I
G
 
E
P
 
N
N
 
D
C
 
V
L
 
S
I
 
I
F
x
L
Q
 
Q
Q
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
x
G
S
x
T
G
 
H
A
 
-
S
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
P
V
 
K
I
 
V
E
 
R
G
 
E
H
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
 
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
L
|
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
K
H
 
Y
A
 
A
R
x
K
I
 
I
G
|
G
A
|
A
N
 
N
A
 
S
V
|
V
V
 
V
I
x
L
T
 
N
D
 
P
I
 
V
P
 
P
A
 
E
N
 
Y
A
 
A
T
|
T
A
 
A
V
x
A
G
 
G
I
x
V
P
|
P
G
 
A
K
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

4h7oA Crystal structure of serine acetyltransferase from vibrio cholerae o1 biovar el tor n16961
38% identity, 70% coverage: 47:161/164 of query aligns to 122:239/258 of 4h7oA

query
sites
4h7oA
K
 
K
R
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
T
L
x
Y
Q
 
F
H
 
Q
R
 
N
F
x
Q
W
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
A
C
 
C
G
 
Q
A
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
H
L
 
P
D
 
A
S
 
A
N
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
R
G
 
G
L
 
I
L
 
M
I
 
L
P
x
D
H
|
H
P
 
A
N
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
I
 
I
H
 
G
P
 
E
Q
 
T
A
 
A
K
 
V
I
 
V
G
 
E
P
 
D
N
 
D
C
 
V
L
 
S
I
 
I
F
 
L
Q
 
Q
Q
 
D
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
x
G
S
 
T
G
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
C
A
 
G
S
 
D
E
x
R
V
x
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
R
G
 
E
H
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
E
H
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
S
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
Q
D
 
A
I
 
V
P
 
P
A
 
P
N
 
H
A
 
T
T
 
T
A
 
V
V
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
K
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1t3dA Crystal structure of serine acetyltransferase from e.Coli at 2.2a (see paper)
39% identity, 73% coverage: 43:161/164 of query aligns to 122:243/262 of 1t3dA

query
sites
1t3dA
S
 
N
Q
 
Q
T
 
G
I
 
R
K
 
R
R
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
I
L
 
F
Q
 
L
H
 
Q
R
 
N
F
 
Q
W
 
V
S
 
S
A
 
V
V
 
T
C
 
F
G
 
Q
A
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
H
L
 
P
D
 
A
S
 
A
N
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
R
G
 
G
L
 
I
L
 
M
I
 
L
P
x
D
H
 
H
P
 
A
N
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
I
 
V
H
 
G
P
 
E
Q
 
T
A
 
A
K
 
V
I
 
I
G
 
E
P
 
N
N
 
D
C
 
V
L
 
S
I
 
I
F
 
L
Q
 
Q
Q
 
S
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
x
G
S
 
T
G
 
G
A
 
K
S
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
D
E
x
R
V
x
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
R
G
 
E
H
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
R
H
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
Q
D
 
P
I
 
V
P
 
P
A
 
P
N
 
H
A
 
T
T
 
T
A
 
A
V
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
K
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

4hzdA Crystal structure of serine acetyltransferase in complex with coenzyme a from brucella abortus strain s19 (see paper)
31% identity, 98% coverage: 1:161/164 of query aligns to 70:243/250 of 4hzdA

query
sites
4hzdA
M
 
M
I
 
L
S
 
E
A
 
A
T
 
N
E
 
-
P
 
P
D
 
E
W
 
W
S
 
S
R
 
H
-
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
V
-
 
D
-
 
I
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
Y
-
 
D
E
 
R
K
 
D
P
 
P
V
 
A
P
 
Y
G
 
S
R
 
R
F
 
F
E
 
M
P
 
D
G
 
P
K
 
V
K
 
L
M
 
Y
L
 
L
A
 
K
A
 
G
L
 
F
R
 
H
R
 
A
Y
 
I
Q
 
Q
K
 
T
N
 
H
S
 
R
R
 
L
K
 
A
A
 
H
D
 
W
P
 
L
V
 
Y
S
 
K
Q
 
Q
T
 
G
I
 
R
K
 
K
R
 
D
I
 
F
A
 
A
V
 
Y
L
 
Y
Q
 
L
H
 
Q
R
 
S
F
 
R
W
 
S
S
 
S
A
 
S
V
 
I
C
 
F
G
 
Q
A
 
T
D
 
D
I
 
I
P
 
H
L
 
P
D
 
A
S
 
A
N
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
F
I
 
L
P
 
D
H
|
H
P
 
A
N
 
T
G
 
G
I
 
L
V
 
V
I
 
V
H
 
G
P
 
E
Q
 
T
A
 
A
K
 
V
I
 
V
G
 
E
P
 
D
N
 
N
C
 
V
L
 
S
I
 
I
F
 
L
Q
 
H
Q
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
G
S
 
T
G
 
G
A
 
K
S
 
S
E
 
S
-
 
G
-
 
D
-
 
R
V
 
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
R
G
 
Q
H
 
G
V
 
V
D
 
L
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
Q
I
 
V
G
 
G
A
 
Q
H
 
C
A
 
S
R
 
K
I
 
I
G
x
A
A
|
A
N
 
G
A
x
S
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
K
D
 
S
I
 
V
P
 
P
A
 
H
N
 
N
A
 
V
T
|
T
A
 
V
V
x
A
G
|
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
K
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

8i04A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with serine (see paper)
38% identity, 70% coverage: 47:161/164 of query aligns to 122:239/258 of 8i04A

query
sites
8i04A
K
 
R
R
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
I
L
 
F
Q
 
L
H
 
Q
R
 
N
F
 
Q
W
 
V
S
 
S
A
 
V
V
 
S
C
 
F
G
 
Q
A
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
H
L
 
P
D
 
A
S
 
A
N
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
R
G
 
G
L
 
I
L
 
M
I
 
L
P
x
D
H
|
H
P
 
A
N
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
I
 
V
H
 
G
P
 
E
Q
 
T
A
 
A
K
 
V
I
 
I
G
 
E
P
 
D
N
 
D
C
 
V
L
 
S
I
 
I
F
 
L
Q
 
Q
Q
 
S
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
x
G
S
 
T
G
 
G
A
 
K
S
 
T
E
 
S
-
 
G
-
 
D
-
x
R
V
x
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
R
G
 
E
H
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
R
H
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
Q
D
 
P
I
 
V
P
 
P
A
 
P
N
 
H
A
 
T
T
 
T
A
 
A
V
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
K
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

8i09A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with butyl gallate (see paper)
38% identity, 70% coverage: 47:161/164 of query aligns to 125:242/246 of 8i09A

query
sites
8i09A
K
 
R
R
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
I
L
 
F
Q
 
L
H
 
Q
R
 
N
F
 
Q
W
 
V
S
 
S
A
 
V
V
 
S
C
 
F
G
 
Q
A
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
H
L
 
P
D
 
A
S
 
A
N
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
R
G
 
G
L
 
I
L
 
M
I
 
L
P
x
D
H
|
H
P
 
A
N
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
I
 
V
H
x
G
P
 
E
Q
 
T
A
 
A
K
 
V
I
 
I
G
 
E
P
 
D
N
 
D
C
 
V
L
 
S
I
 
I
F
 
L
Q
 
Q
Q
 
S
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
x
G
S
x
T
G
 
G
A
 
K
S
 
T
E
 
S
-
 
G
-
 
D
-
x
R
V
x
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
R
G
 
E
H
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
|
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
R
H
 
G
A
 
A
R
x
K
I
|
I
G
|
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
I
x
L
T
 
Q
D
 
P
I
 
V
P
 
P
A
 
P
N
 
H
A
 
T
T
 
T
A
 
A
V
x
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
K
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

8i06A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with coa (see paper)
38% identity, 70% coverage: 47:161/164 of query aligns to 126:243/244 of 8i06A

query
sites
8i06A
K
 
R
R
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
I
L
 
F
Q
 
L
H
 
Q
R
 
N
F
 
Q
W
 
V
S
 
S
A
 
V
V
 
S
C
 
F
G
 
Q
A
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
H
L
 
P
D
 
A
S
 
A
N
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
R
G
 
G
L
 
I
L
 
M
I
 
L
P
 
D
H
|
H
P
 
A
N
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
I
 
V
H
 
G
P
 
E
Q
 
T
A
 
A
K
 
V
I
 
I
G
 
E
P
 
D
N
 
D
C
 
V
L
 
S
I
 
I
F
x
L
Q
|
Q
Q
 
S
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
G
S
 
T
G
 
G
A
 
K
S
 
T
E
 
S
-
 
G
-
 
D
-
 
R
V
 
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
R
G
 
E
H
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
R
H
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
G
|
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
Q
D
 
P
I
 
V
P
 
P
A
 
P
N
 
H
A
 
T
T
|
T
A
 
A
V
x
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
K
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

3q1xA Crystal structure of entamoeba histolytica serine acetyltransferase 1 in complex with l-serine (see paper)
40% identity, 55% coverage: 64:153/164 of query aligns to 165:265/267 of 3q1xA

query
sites
3q1xA
D
 
D
I
 
I
P
 
H
L
 
P
D
 
G
S
 
A
N
 
S
I
 
I
G
 
K
G
 
G
G
 
H
L
 
F
L
 
F
I
 
I
P
 
D
H
 
H
P
 
G
N
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
I
 
I
H
 
G
P
 
E
Q
 
T
A
 
A
K
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
E
N
 
W
C
 
C
L
 
R
I
 
I
F
 
Y
Q
 
Q
Q
 
S
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
A
-
 
M
-
x
H
-
 
F
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
K
S
 
R
G
 
G
A
 
T
S
 
K
E
x
R
V
x
H
P
 
P
V
 
T
I
 
V
E
 
G
G
 
D
H
 
Y
V
 
V
D
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
S
H
 
H
A
 
V
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
W
V
 
I
I
 
D
T
 
R
D
 
D
I
 
V
P
 
D
A
 
S
N
 
N
A
 
Q
T
 
T

3p47A Crystal structure of entamoeba histolytica serine acetyltransferase 1 in complex with l-cysteine (see paper)
40% identity, 55% coverage: 64:153/164 of query aligns to 167:267/270 of 3p47A

query
sites
3p47A
D
 
D
I
 
I
P
 
H
L
 
P
D
 
G
S
 
A
N
 
S
I
 
I
G
 
K
G
 
G
G
 
H
L
 
F
L
 
F
I
 
I
P
 
D
H
 
H
P
 
G
N
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
I
 
I
H
 
G
P
 
E
Q
 
T
A
 
A
K
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
E
N
 
W
C
 
C
L
 
R
I
 
I
F
 
Y
Q
 
Q
Q
 
S
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
|
A
-
 
M
-
x
H
-
 
F
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
K
S
 
R
G
 
G
A
 
T
S
 
K
E
x
R
V
x
H
P
 
P
V
 
T
I
 
V
E
 
G
G
 
D
H
 
Y
V
 
V
D
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
S
H
 
H
A
 
V
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
W
V
 
I
I
 
D
T
 
R
D
 
D
I
 
V
P
 
D
A
 
S
N
 
N
A
 
Q
T
 
T

7bw9A Crystal structure of serine acetyltransferase isoform 3 in complex with cysteine from entamoeba histolytica
43% identity, 57% coverage: 59:151/164 of query aligns to 160:255/280 of 7bw9A

query
sites
7bw9A
A
 
S
V
 
V
C
 
T
G
 
G
A
 
I
D
 
D
I
 
I
P
 
H
L
 
P
D
 
G
S
 
T
N
 
S
I
 
I
G
 
G
G
 
N
G
 
H
L
 
F
L
 
F
I
 
I
P
x
D
H
|
H
P
 
G
N
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
I
 
I
H
 
G
P
 
E
Q
 
T
A
 
A
K
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
N
N
 
W
C
 
C
L
 
R
I
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
Q
 
S
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
A
|
A
-
 
M
-
 
S
-
 
F
S
 
K
G
 
G
A
 
N
S
 
K
E
x
R
V
x
H
P
 
P
V
 
T
I
 
I
E
 
G
G
 
D
H
 
F
V
 
V
D
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
S
H
 
N
A
 
V
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
W
V
 
I
I
 
T
T
 
Q
D
 
N
I
 
I
P
 
D
A
 
Q
N
 
D

Sites not aligning to the query:

4mzuB Crystal structure of fdtd, a bifunctional ketoisomerase/n- acetyltransferase from shewanella denitrificans (see paper)
36% identity, 49% coverage: 81:161/164 of query aligns to 63:139/290 of 4mzuB

query
sites
4mzuB
N
 
D
G
 
G
I
 
I
V
 
H
I
 
I
H
 
Q
P
 
D
Q
 
D
A
 
V
K
x
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
C
 
V
L
 
T
I
 
F
F
 
-
Q
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
|
T
I
x
N
G
x
D
A
x
K
S
 
Q
G
x
P
A
 
R
S
 
S
E
 
L
V
 
K
P
 
T
V
 
I
I
 
V
E
 
K
G
 
K
H
 
G
V
 
A
D
 
S
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
 
N
A
 
S
R
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
P
N
 
G
I
 
I
T
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
E
H
 
N
A
 
A
R
 
M
I
 
V
G
|
G
A
|
A
N
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
I
I
x
T
T
x
K
D
 
N
I
 
V
P
 
P
A
 
D
N
 
N
A
 
A
T
 
I
A
 
V
V
x
I
G
 
G
I
 
N
P
 
P
G
 
G
K
x
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

4eaaA X-ray crystal structure of the h141n mutant of perosamine n- acetyltransferase from caulobacter crescentus in complex with coa and gdp-perosamine (see paper)
44% identity, 26% coverage: 120:162/164 of query aligns to 166:208/210 of 4eaaA

query
sites
4eaaA
I
 
L
G
 
G
A
x
V
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
V
L
 
I
G
 
P
N
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
A
H
 
D
A
 
T
R
 
I
I
 
V
G
 
G
A
|
A
N
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
R
D
 
D
I
 
L
P
 
P
A
 
D
N
 
S
A
 
V
T
 
L
A
 
A
V
x
I
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
K
 
K
I
 
I
R
x
K

Sites not aligning to the query:

4ea9A X-ray structure of gdp-perosamine n-acetyltransferase in complex with transition state analog at 0.9 angstrom resolution (see paper)
44% identity, 26% coverage: 120:162/164 of query aligns to 164:206/207 of 4ea9A

query
sites
4ea9A
I
 
L
G
|
G
A
x
V
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
V
L
 
I
G
 
P
N
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
A
H
 
D
A
 
T
R
 
I
I
 
V
G
 
G
A
|
A
N
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
R
D
 
D
I
 
L
P
 
P
A
 
D
N
 
S
A
 
V
T
 
L
A
 
A
V
x
I
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
K
 
K
I
 
I
R
x
K

Sites not aligning to the query:

4ea8A X-ray crystal structure of perb from caulobacter crescentus in complex with coenzyme a and gdp-n-acetylperosamine at 1 angstrom resolution (see paper)
44% identity, 26% coverage: 120:162/164 of query aligns to 164:206/207 of 4ea8A

query
sites
4ea8A
I
 
L
G
|
G
A
x
V
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
V
L
 
I
G
 
P
N
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
A
H
 
D
A
 
T
R
 
I
I
 
V
G
 
G
A
|
A
N
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
R
D
 
D
I
 
L
P
 
P
A
 
D
N
 
S
A
 
V
T
 
L
A
 
A
V
 
I
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
A
K
 
K
I
 
I
R
x
K

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012466757.1 NCBI__GCF_000020465.1:WP_012466757.1
MISATEPDWSREKPVPGRFEPGKKMLAALRRYQKNSRKADPVSQTIKRIAVLQHRFWSAV
CGADIPLDSNIGGGLLIPHPNGIVIHPQAKIGPNCLIFQQVTIGASGASEVPVIEGHVDI
GAGARILGNITIGAHARIGANAVVITDIPANATAVGIPGKIRQT

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory