SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012469280.1 NCBI__GCF_000020385.1:WP_012469280.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 9 hits to proteins with known functional sites (download)

6ioxA Crystal structure of porphyromonas gingivalis phosphotransacetylase in complex with acetyl-coa (see paper)
51% identity, 99% coverage: 3:331/333 of query aligns to 7:334/339 of 6ioxA

query
sites
6ioxA
L
 
L
V
 
I
D
 
Q
Q
 
D
I
 
V
K
 
I
Q
 
R
K
 
R
A
 
A
Q
 
Q
K
 
E
N
 
N
L
 
K
Q
 
Q
T
 
R
V
 
I
V
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
G
Y
 
L
D
 
E
E
 
P
R
 
R
M
 
T
L
 
L
Y
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
D
K
 
R
I
 
L
V
 
M
A
 
A
E
 
D
G
 
K
L
 
V
A
 
V
K
 
N
L
 
I
V
 
I
I
 
L
L
 
I
G
 
G
D
 
N
P
 
V
A
 
D
K
 
S
I
 
V
Q
 
K
A
 
A
E
 
K
A
 
V
A
 
A
A
 
E
K
 
L
G
 
G
I
 
L
-
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
D
G
 
E
V
 
A
E
 
V
L
 
I
L
 
I
N
 
D
P
 
P
A
 
N
D
 
N
S
 
H
P
 
P
K
 
K
L
 
K
D
 
Q
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
T
A
 
D
D
 
L
F
 
L
V
 
L
E
 
Q
L
 
I
R
 
R
K
 
Q
S
 
K
K
 
K
G
 
G
M
 
L
T
 
T
A
 
P
E
 
E
E
 
K
A
 
A
K
 
A
K
 
E
L
 
L
L
 
V
T
 
-
A
 
-
D
 
E
D
 
N
N
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
G
G
 
C
M
 
L
M
 
I
V
 
V
R
 
K
N
 
S
G
 
G
D
 
D
A
 
A
G
 
D
G
 
G
E
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
Q
G
 
N
T
 
T
T
 
T
G
 
G
N
 
D
V
 
V
L
 
L
K
 
R
A
 
P
A
 
A
F
x
L
Q
 
Q
T
 
V
V
 
I
G
 
K
P
 
T
A
 
A
A
 
P
G
 
G
I
 
M
K
 
T
T
x
S
V
|
V
S
 
S
S
 
G
F
 
T
F
 
F
L
 
L
M
 
L
I
 
F
T
 
T
K
 
K
T
 
A
P
 
K
S
 
E
F
 
Y
G
 
G
E
 
K
N
 
D
G
 
G
I
 
L
I
 
L
L
 
L
F
 
V
A
 
A
D
 
D
C
 
C
A
|
A
V
|
V
N
 
I
P
 
P
N
 
N
P
 
P
D
 
T
A
 
A
Q
 
D
A
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
I
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
R
N
 
T
C
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
I
L
 
A
D
 
D
V
 
I
E
 
E
A
 
P
R
 
R
V
 
V
G
 
A
M
 
M
L
 
L
S
 
S
F
 
F
S
 
S
T
 
T
K
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
K
H
 
H
A
 
E
D
 
M
V
 
T
D
 
D
K
 
K
V
 
V
T
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
T
E
 
R
I
 
M
A
 
A
K
 
Q
T
 
E
I
 
M
K
 
A
P
 
P
D
 
D
I
 
L
Q
 
L
I
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
M
Q
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
V
P
 
E
K
 
R
V
 
V
G
 
A
E
 
A
K
 
L
K
 
K
A
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
S
P
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
A
N
 
N
V
 
V
L
 
L
I
 
V
F
 
F
P
 
P
D
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
V
G
 
G
N
 
N
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
K
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
R
V
 
L
A
 
G
G
 
H
A
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
P
 
P
I
 
I
I
 
L
Q
 
Q
G
 
G
L
 
M
A
 
A
K
 
A
P
 
P
V
 
V
N
 
N
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
G
 
G
C
 
C
S
 
S
V
 
V
D
 
E
D
 
D
I
 
I
V
 
Y
N
 
R
V
 
M
V
 
V
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
A
V
 
N
Q
 
Q
A
 
A

P38503 Phosphate acetyltransferase; Phosphotransacetylase; EC 2.3.1.8 from Methanosarcina thermophila (see 2 papers)
46% identity, 99% coverage: 3:333/333 of query aligns to 4:330/333 of P38503

query
sites
P38503
L
 
F
V
 
L
D
 
E
Q
 
K
I
 
I
K
 
S
Q
 
E
K
 
R
A
 
A
Q
 
K
K
 
K
N
 
L
L
 
N
Q
 
K
T
 
T
V
 
I
V
 
A
L
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
T
Y
 
E
D
 
D
E
 
I
R
 
R
M
 
T
L
 
L
Y
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
A
K
 
K
I
 
I
V
 
L
A
 
E
E
 
R
G
 
G
L
 
I
A
 
A
K
 
D
L
 
I
V
 
V
I
 
L
L
 
V
G
 
G
D
 
N
P
 
E
A
 
A
K
 
D
I
 
I
Q
 
K
A
 
A
E
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
-
K
 
-
G
 
D
I
 
L
N
 
D
L
 
L
A
 
S
G
 
K
V
 
A
E
 
K
L
 
I
L
 
V
N
 
D
P
 
P
A
 
K
D
 
T
S
 
Y
P
 
E
K
 
K
L
 
K
D
 
D
Q
 
E
Y
 
Y
I
 
I
A
 
N
D
 
A
F
 
F
V
 
Y
E
 
E
L
 
L
R
 
R
K
 
K
S
 
H
K
 
K
G
 
G
M
 
I
T
 
T
A
 
L
E
 
E
E
 
N
A
 
A
K
 
A
K
 
E
L
 
I
L
 
M
T
 
S
A
 
-
D
 
-
D
 
D
N
 
Y
L
 
V
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
A
G
 
V
M
 
M
M
 
M
V
 
A
R
 
K
N
 
L
G
 
G
D
 
E
A
 
V
G
 
D
G
 
G
E
 
V
V
 
V
A
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
A
G
 
H
T
 
S
T
 
S
G
 
S
N
 
D
V
 
T
L
 
L
K
 
R
A
 
P
A
 
A
F
 
V
Q
 
Q
T
 
I
V
 
V
G
 
K
P
 
T
A
 
A
A
 
K
G
 
G
I
 
A
K
 
A
T
 
L
V
 
A
S
 
S
S
 
A
F
 
F
F
 
F
L
 
I
M
 
I
I
 
S
T
 
V
K
 
P
T
 
D
P
x
C
S
 
E
F
 
Y
G
 
G
E
 
S
N
 
D
G
 
G
I
 
T
I
 
F
L
 
L
F
 
F
A
 
A
D
 
D
C
 
S
A
 
G
V
 
M
N
 
V
P
 
E
N
 
M
P
 
P
D
 
S
A
 
V
Q
 
E
A
 
D
L
 
V
A
 
A
E
 
N
I
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
I
T
 
S
A
 
A
G
 
K
N
 
T
C
 
F
K
 
E
A
 
L
F
 
L
L
 
V
D
 
Q
V
 
D
E
 
V
A
 
P
R
 
K
V
 
V
G
 
A
M
 
M
L
 
L
S
 
S
F
 
Y
S
 
S
T
 
T
K
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
K
H
 
S
A
 
K
D
 
L
V
 
T
D
 
E
K
 
A
V
 
T
T
 
I
K
 
A
A
 
S
A
 
T
E
 
K
I
 
L
A
 
A
K
 
Q
T
 
E
I
 
L
K
 
A
P
 
P
D
 
D
I
 
I
Q
 
A
I
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
A
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
V
P
 
P
K
 
K
V
 
V
G
 
A
E
 
A
K
 
S
K
 
K
A
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
A
N
 
N
V
 
V
L
 
F
I
 
I
F
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
N
A
 
C
G
 
G
N
 
N
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
K
 
K
L
 
I
V
 
A
E
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
A
G
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
Y
G
 
G
P
 
P
I
 
I
I
 
T
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
A
K
 
K
P
 
P
V
 
I
N
 
N
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
G
 
G
C
 
C
S
 
S
V
 
D
D
 
E
D
 
D
I
 
I
V
 
V
N
 
G
V
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
C
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
G
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2af3C Phosphotransacetylase from methanosarcina thermophila soaked with coenzyme a (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:333/333 of query aligns to 3:329/332 of 2af3C

query
sites
2af3C
L
 
F
V
 
L
D
 
E
Q
 
K
I
 
I
K
 
S
Q
 
E
K
 
R
A
 
A
Q
 
K
K
 
K
N
 
L
L
 
N
Q
 
K
T
 
T
V
 
I
V
 
A
L
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
T
Y
 
E
D
 
D
E
 
I
R
 
R
M
 
T
L
 
L
Y
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
A
K
 
K
I
 
I
V
 
L
A
 
E
E
 
R
G
 
G
L
 
I
A
 
A
K
 
D
L
 
I
V
 
V
I
 
L
L
 
V
G
 
G
D
 
N
P
 
E
A
 
A
K
 
D
I
 
I
Q
 
K
A
 
A
E
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
-
K
 
-
G
 
D
I
 
L
N
 
D
L
 
L
A
 
S
G
 
K
V
 
A
E
 
K
L
 
I
L
 
V
N
 
D
P
 
P
A
 
K
D
 
T
S
 
Y
P
 
E
K
 
K
L
 
K
D
 
D
Q
 
E
Y
 
Y
I
 
I
A
 
N
D
 
A
F
 
F
V
 
Y
E
 
E
L
 
L
R
|
R
K
 
K
S
 
H
K
 
K
G
 
G
M
 
I
T
 
T
A
 
L
E
 
E
E
 
N
A
 
A
K
 
A
K
 
E
L
 
I
L
 
M
T
 
S
A
 
-
D
 
-
D
 
D
N
 
Y
L
 
V
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
A
G
 
V
M
 
M
M
 
M
V
 
A
R
 
K
N
 
L
G
 
G
D
 
E
A
 
V
G
 
D
G
 
G
E
 
V
V
 
V
A
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
A
G
 
H
T
 
S
T
x
S
G
 
S
N
 
D
V
 
T
L
|
L
K
 
R
A
 
P
A
 
A
F
x
V
Q
 
Q
T
 
I
V
 
V
G
 
K
P
 
T
A
 
A
A
 
K
G
 
G
I
 
A
K
 
A
T
x
L
V
x
A
S
 
S
S
 
A
F
 
F
F
 
F
L
 
I
M
 
I
I
 
S
T
 
V
K
 
P
T
 
D
P
 
C
S
 
E
F
 
Y
G
 
G
E
 
S
N
 
D
G
 
G
I
 
T
I
 
F
L
 
L
F
 
F
A
 
A
D
 
D
C
 
S
A
x
G
V
x
M
N
x
V
P
x
E
N
 
M
P
 
P
D
 
S
A
 
V
Q
 
E
A
 
D
L
 
V
A
 
A
E
 
N
I
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
I
T
 
S
A
 
A
G
 
K
N
 
T
C
 
F
K
 
E
A
 
L
F
 
L
L
 
V
D
 
Q
V
 
D
E
 
V
A
 
P
R
 
K
V
 
V
G
 
A
M
 
M
L
 
L
S
 
S
F
 
Y
S
 
S
T
 
T
K
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
K
H
 
S
A
 
K
D
 
L
V
 
T
D
 
E
K
 
A
V
 
T
T
 
I
K
 
A
A
 
S
A
 
T
E
 
K
I
 
L
A
 
A
K
 
Q
T
 
E
I
 
L
K
 
A
P
 
P
D
 
D
I
 
I
Q
 
A
I
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
A
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
V
P
 
P
K
 
K
V
 
V
G
 
A
E
 
A
K
 
S
K
 
K
A
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
A
N
 
N
V
 
V
L
 
F
I
 
I
F
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
N
A
 
C
G
 
G
N
|
N
I
 
I
A
 
A
Y
|
Y
K
|
K
L
 
I
V
 
A
E
x
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
A
G
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
Y
G
|
G
P
|
P
I
 
I
I
x
T
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
A
K
 
K
P
 
P
V
 
I
N
 
N
D
|
D
L
|
L
S
|
S
R
 
R
G
 
G
C
 
C
S
 
S
V
 
D
D
 
E
D
 
D
I
 
I
V
 
V
N
 
G
V
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
C
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
G
 
A
A
 
A

Q8ZND6 Phosphate acetyltransferase; Phosphotransacetylase; EC 2.3.1.222; EC 2.3.1.8 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
44% identity, 98% coverage: 6:332/333 of query aligns to 394:710/714 of Q8ZND6

query
sites
Q8ZND6
Q
 
Q
I
 
L
K
 
T
Q
 
E
K
 
L
A
 
A
Q
 
R
K
 
K
N
 
A
L
 
G
Q
 
K
T
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
G
Y
 
D
D
 
E
E
 
P
R
 
R
M
 
T
L
 
V
Y
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
A
K
 
I
I
 
C
V
 
A
A
 
E
E
 
R
G
 
G
L
 
I
A
 
A
K
 
T
L
 
C
V
 
V
I
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
N
P
 
P
A
 
D
K
 
E
I
 
I
Q
 
N
A
 
R
E
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
 
Q
G
 
G
I
 
V
N
 
E
L
 
L
-
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
I
L
 
V
N
 
D
P
 
P
A
 
-
D
 
-
S
 
E
P
 
V
K
 
V
L
 
R
D
 
E
Q
 
S
Y
 
Y
I
 
V
A
 
A
D
 
R
F
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
L
R
 
R
K
 
K
S
 
S
K
 
K
G
 
G
M
 
M
T
 
T
A
 
E
E
 
P
E
 
V
A
 
A
K
 
R
K
 
E
L
 
Q
L
 
L
T
 
-
A
 
-
D
 
E
D
 
D
N
 
N
L
 
V
Y
 
V
Y
 
L
A
 
G
G
 
T
M
 
L
M
 
M
V
 
L
R
 
E
N
 
Q
G
 
D
D
 
E
A
 
V
G
 
D
G
 
G
E
 
L
V
 
V
A
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
V
G
 
H
T
 
T
T
 
T
G
 
A
N
 
N
V
 
T
L
 
I
K
 
R
A
 
P
A
 
P
F
 
L
Q
 
Q
T
 
L
V
 
I
G
 
K
P
 
T
A
 
A
A
 
P
G
 
G
I
 
S
K
 
S
T
 
L
V
 
V
S
 
S
S
 
S
F
 
V
F
 
F
L
 
F
M
 
M
I
 
L
T
 
L
K
 
P
T
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
E
G
 
Q
I
 
V
I
 
Y
L
 
V
F
 
Y
A
 
G
D
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
I
N
 
N
P
 
P
N
 
D
P
 
P
D
 
T
A
 
A
Q
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
T
 
S
A
 
A
G
 
D
N
 
S
C
 
A
K
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
-
D
 
G
V
 
I
E
 
E
A
 
P
R
 
R
V
 
V
G
 
A
M
 
M
L
 
L
S
 
S
F
 
Y
S
 
S
T
 
T
K
 
G
G
 
T
S
 
S
A
 
G
A
 
A
H
 
G
A
 
S
D
 
D
V
 
V
D
 
E
K
 
K
V
 
V
T
 
R
K
 
E
A
 
A
A
 
T
E
 
R
I
 
L
A
 
A
K
 
Q
T
 
E
I
 
K
K
 
R
P
 
P
D
 
D
I
 
L
Q
 
M
I
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
P
L
 
L
Q
 
Q
A
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
V
L
 
M
P
 
A
K
 
D
V
 
V
G
 
A
E
 
K
K
 
S
K
 
K
A
 
A
P
 
P
G
 
N
S
 
S
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
R
A
 
A
N
 
T
V
 
V
L
 
F
I
 
I
F
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
N
A
 
T
G
 
G
N
 
N
I
 
T
A
 
T
Y
 
Y
K
 
K
L
 
A
V
 
V
E
 
Q
R
 
R
V
 
S
A
 
A
G
 
D
A
 
L
E
 
I
A
 
S
V
 
I
G
 
G
P
 
P
I
 
M
I
 
L
Q
 
Q
G
 
G
L
 
M
A
 
R
K
 
K
P
 
P
V
 
V
N
 
N
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
G
 
G
C
 
A
S
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
I
 
I
V
 
V
N
 
Y
V
 
T
V
 
I
A
 
A
I
 
L
T
 
T
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
G
 
S

Sites not aligning to the query:

1xcoD Crystal structure of a phosphotransacetylase from bacillus subtilis in complex with acetylphosphate (see paper)
43% identity, 99% coverage: 3:331/333 of query aligns to 6:324/325 of 1xcoD

query
sites
1xcoD
L
 
L
V
 
F
D
 
S
Q
 
T
I
 
V
K
 
Q
Q
 
E
K
 
K
A
 
V
Q
 
A
K
 
G
N
 
K
L
 
D
Q
 
V
T
 
K
V
 
I
V
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
E
S
 
G
Y
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
M
 
I
L
 
L
Y
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
S
K
 
K
I
 
L
V
 
A
A
 
G
E
 
N
G
 
K
L
 
V
A
 
L
K
 
N
L
 
P
V
 
I
I
 
V
L
 
I
G
 
G
D
 
N
P
 
E
A
 
N
K
 
E
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
K
A
 
E
K
 
L
G
 
N
I
 
L
N
 
T
L
 
L
A
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
K
L
 
I
L
 
Y
N
 
D
P
 
P
A
 
H
D
 
T
S
 
Y
P
 
E
K
 
G
L
 
M
D
 
E
Q
 
D
Y
 
L
I
 
V
A
 
Q
D
 
A
F
 
F
V
 
V
E
 
E
L
x
R
R
|
R
K
 
K
S
 
G
K
|
K
G
 
A
M
 
-
T
 
T
A
 
E
E
 
E
E
 
Q
A
 
A
K
 
R
K
 
K
L
 
A
L
 
L
T
 
L
A
 
-
D
 
D
D
 
E
N
 
N
L
 
-
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
G
G
 
T
M
 
M
M
 
L
V
 
V
R
 
Y
N
 
K
G
 
G
D
 
L
A
 
A
G
 
D
G
 
G
E
 
L
V
 
V
A
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
A
G
 
H
T
 
S
T
|
T
G
 
A
N
 
D
V
 
T
L
 
V
K
 
R
A
 
P
A
 
A
F
 
L
Q
 
Q
T
 
I
V
 
I
G
x
K
P
 
T
A
 
K
A
 
E
G
 
G
I
 
V
K
 
K
T
 
K
V
 
T
S
 
S
S
 
G
F
 
V
F
 
F
L
 
I
M
 
M
I
 
A
T
 
R
K
 
G
T
 
E
P
 
E
S
 
Q
F
 
Y
G
 
-
E
 
-
N
 
-
G
 
-
I
 
-
I
 
-
L
 
V
F
 
F
A
 
A
D
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
I
N
 
N
P
 
I
N
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
S
Q
 
Q
A
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
I
A
 
E
T
 
S
A
 
A
G
 
N
N
 
T
C
 
A
K
 
K
A
 
M
F
 
F
L
 
-
D
 
D
V
 
I
E
 
E
A
 
P
R
 
R
V
 
V
G
 
A
M
 
M
L
 
L
S
 
S
F
 
F
S
 
S
T
 
T
K
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
K
H
 
S
A
 
D
D
 
E
V
 
T
D
 
E
K
 
K
V
 
V
T
 
A
K
 
D
A
 
A
A
 
V
E
 
K
I
 
I
A
 
A
K
 
K
T
 
E
I
 
K
K
 
A
P
 
P
D
 
E
I
 
L
Q
 
T
I
 
L
D
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
F
Q
 
Q
A
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
F
L
 
V
P
 
P
K
 
S
V
 
V
G
 
A
E
 
E
K
 
K
K
 
K
A
 
A
P
 
P
G
 
D
S
 
S
P
 
E
V
 
I
A
 
K
G
 
G
K
 
D
A
 
A
N
 
N
V
 
V
L
 
F
I
 
V
F
 
F
P
 
P
D
 
S
L
 
L
D
 
E
A
 
A
G
 
G
N
 
N
I
 
I
A
 
G
Y
|
Y
K
|
K
L
 
I
V
 
A
E
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
G
G
 
N
A
 
F
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
P
 
P
I
 
I
I
 
L
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
x
N
K
 
M
P
 
P
V
 
V
N
 
N
D
 
D
L
 
L
S
|
S
R
|
R
G
 
G
C
 
C
S
 
N
V
 
A
D
 
E
D
 
D
I
 
V
V
 
Y
N
 
N
V
 
L
V
 
A
A
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
V
 
A
Q
 
Q
A
 
A

6zngF Maeb full-length acetyl-coa bound state (see paper)
36% identity, 98% coverage: 4:331/333 of query aligns to 423:743/753 of 6zngF

query
sites
6zngF
V
 
I
D
 
N
Q
 
R
I
 
V
K
 
H
Q
 
Q
K
 
N
A
 
S
Q
 
A
K
 
A
N
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
E
L
 
L
Q
 
P
T
 
R
V
 
I
V
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
E
S
 
G
Y
 
T
D
 
S
E
 
T
R
 
K
M
 
V
L
 
L
Y
 
K
A
 
A
A
 
L
E
 
A
K
 
T
I
 
L
V
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
K
L
 
I
A
 
C
K
 
Q
L
 
P
V
 
I
I
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
Y
P
 
P
A
 
E
K
 
R
I
 
V
Q
 
K
A
 
E
E
 
K
A
 
I
A
 
K
A
 
A
K
 
L
G
 
D
I
 
I
N
 
P
L
 
L
A
 
L
G
 
N
-
 
D
V
 
V
E
 
S
L
 
I
L
 
V
N
 
H
P
 
P
A
 
S
D
 
S
S
 
H
P
 
P
K
 
K
L
 
Y
D
 
F
Q
 
S
Y
 
F
I
 
V
A
 
E
D
 
K
F
 
L
V
 
Y
E
 
S
L
 
L
R
|
R
K
 
Q
S
 
R
K
|
K
G
 
G
M
 
I
T
 
N
A
 
L
E
 
G
E
 
E
A
 
A
K
 
E
K
 
R
L
 
L
L
 
M
T
 
-
A
 
A
D
 
D
D
 
P
N
 
N
L
 
-
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
A
G
 
A
M
 
M
M
 
M
V
 
V
R
 
N
N
 
Q
G
 
G
D
 
E
A
 
A
G
 
D
G
 
G
E
 
M
V
 
V
A
 
S
G
 
G
A
 
S
T
 
S
G
 
I
T
 
N
T
x
Y
G
x
A
N
 
D
V
 
A
L
 
V
K
x
R
A
 
P
A
 
I
F
x
L
Q
 
Q
T
 
T
V
 
I
G
 
G
-
 
V
P
 
Y
A
 
K
A
 
E
G
 
G
I
 
I
K
x
P
T
 
A
V
 
G
S
 
L
S
 
N
F
 
F
F
 
V
L
 
L
M
 
L
I
 
-
T
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
G
 
-
E
 
E
N
 
D
G
 
K
I
 
F
I
 
L
L
 
V
F
 
L
A
 
A
D
 
D
C
 
T
A
x
T
V
|
V
N
|
N
P
x
L
N
 
N
P
 
P
D
 
T
A
 
A
Q
 
E
A
 
Q
L
 
C
A
 
A
E
 
Q
I
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
Q
T
 
A
A
 
A
G
 
K
N
 
I
C
 
V
K
 
E
A
 
Y
F
 
F
L
 
-
D
 
G
V
 
I
E
 
E
A
 
P
R
 
R
V
 
V
G
 
A
M
 
M
L
 
L
S
 
S
F
x
Y
S
 
S
T
 
N
K
 
-
G
 
F
S
 
S
A
 
G
A
 
A
H
 
E
A
 
G
D
 
T
V
 
P
D
 
R
K
 
K
V
 
M
T
 
K
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
R
T
 
S
I
 
L
K
 
R
P
 
P
D
 
D
I
 
L
Q
 
M
I
 
I
D
 
E
G
 
G
E
 
D
L
 
M
Q
|
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
T
A
 
A
L
 
V
L
 
N
P
 
P
K
 
E
V
 
I
G
 
M
E
 
E
K
 
R
K
 
L
A
 
F
P
 
P
G
 
F
S
 
S
P
 
G
V
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
G
A
 
A
N
 
N
V
 
V
L
 
L
I
 
V
F
 
F
P
 
P
D
 
N
L
|
L
D
 
E
A
 
S
G
 
S
N
|
N
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
K
 
K
L
 
L
V
 
I
E
 
Q
R
 
Q
V
 
I
A
 
G
G
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
P
I
 
F
I
 
L
Q
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
R
K
 
R
P
 
S
V
 
A
N
 
N
D
 
V
L
 
L
S
x
Q
R
 
R
G
 
T
C
 
T
S
 
T
V
 
V
D
 
D
D
 
G
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
S
V
 
V
A
 
V
I
 
F
T
 
T
A
 
A
V
 
L
Q
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P76558 NADP-dependent malic enzyme; NADP-ME; EC 1.1.1.40 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
34% identity, 98% coverage: 7:331/333 of query aligns to 434:754/759 of P76558

query
sites
P76558
I
 
I
K
 
F
Q
 
S
K
 
Q
A
 
A
Q
 
R
K
 
K
N
 
A
L
 
P
Q
 
K
T
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
G
Y
 
E
D
 
E
E
 
A
R
 
R
M
 
V
L
 
L
Y
 
H
A
 
A
A
 
T
E
 
Q
K
 
E
I
 
L
V
 
V
A
 
T
E
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
P
V
 
I
I
 
L
L
 
I
G
 
G
D
 
R
P
 
P
A
 
N
K
 
V
I
 
I
Q
 
E
A
 
M
E
 
R
A
 
I
A
 
Q
A
 
K
K
 
L
G
 
G
I
 
L
N
 
Q
L
 
I
-
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
D
-
 
F
E
 
E
L
 
I
L
 
V
N
 
N
P
 
N
A
 
E
D
 
S
S
 
D
P
 
P
K
 
R
L
 
F
D
 
K
Q
 
E
Y
 
Y
I
 
W
A
 
T
D
 
E
F
 
Y
V
 
F
E
 
Q
L
 
I
R
 
M
K
 
K
S
 
R
K
 
R
G
 
G
M
 
V
T
 
T
A
 
Q
E
 
E
E
 
Q
A
 
A
K
 
Q
K
 
R
L
 
A
L
 
L
T
 
I
A
 
S
D
 
N
D
 
P
N
 
T
L
 
V
Y
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
-
M
 
I
M
 
M
V
 
V
R
 
Q
N
 
R
G
 
G
D
 
E
A
 
A
G
 
D
G
 
A
E
 
M
V
 
I
A
 
C
G
 
G
A
 
T
T
 
V
G
 
G
T
 
D
T
 
Y
G
 
H
N
 
E
V
 
H
L
 
F
K
 
S
A
 
V
A
 
V
F
 
K
Q
 
N
T
 
V
V
 
F
G
 
G
P
 
Y
A
 
R
A
 
D
G
 
G
I
 
V
K
 
H
T
 
T
V
 
A
S
 
G
S
 
A
F
 
M
F
 
N
L
 
A
M
 
L
I
 
L
T
 
L
K
 
-
T
 
-
P
 
P
S
 
S
F
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
G
 
G
I
 
N
I
 
T
L
 
F
F
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
T
A
 
Y
V
 
V
N
 
N
P
 
D
N
 
E
P
 
P
D
 
D
A
 
A
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
T
V
 
L
A
 
M
T
 
A
A
 
A
G
 
E
N
 
T
C
 
V
K
 
R
A
 
R
F
 
F
L
 
-
D
 
G
V
 
I
E
 
E
A
 
P
R
 
R
V
 
V
G
 
A
M
 
L
L
 
L
S
 
S
F
 
H
S
 
S
T
 
N
K
 
F
G
 
G
S
 
S
A
 
S
A
 
D
H
 
C
A
 
P
D
 
S
V
 
S
D
 
S
K
 
K
V
 
M
T
 
R
K
 
Q
A
 
A
A
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
V
K
 
R
T
 
E
I
 
R
K
 
A
P
 
P
D
 
E
I
 
L
Q
 
M
I
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
M
Q
 
H
A
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
V
P
 
E
K
 
A
V
 
I
G
 
R
E
 
N
K
 
D
K
 
R
A
 
M
P
 
P
G
 
D
S
 
S
P
 
S
V
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
S
A
 
A
N
 
N
V
 
I
L
 
L
I
 
V
F
 
M
P
 
P
D
 
N
L
 
M
D
 
E
A
 
A
G
 
A
N
 
R
I
 
I
A
 
S
Y
 
Y
K
 
N
L
 
L
V
 
L
E
 
-
R
 
R
V
 
V
A
 
S
G
 
S
A
 
S
E
 
E
-
 
G
-
 
V
A
 
T
V
 
V
G
 
G
P
 
P
I
 
V
I
 
L
Q
 
M
G
 
G
L
 
V
A
 
A
K
 
K
P
 
P
V
 
V
N
 
H
D
 
V
L
 
L
S
 
T
R
 
P
G
 
I
C
 
A
S
 
S
V
 
V
D
 
R
D
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
M
V
 
V
A
 
A
I
 
L
T
 
A
A
 
V
V
 
V
Q
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3u9eB The crystal structure of a possible phosphate acetyl/butaryl transferase (from listeria monocytogenes egd-e) in complex with coa.
28% identity, 44% coverage: 170:316/333 of query aligns to 129:271/288 of 3u9eB

query
sites
3u9eB
I
 
L
L
 
L
F
 
I
A
 
T
D
 
D
C
 
C
A
 
A
V
x
M
N
 
N
P
 
V
N
 
A
P
 
P
D
 
K
A
 
T
Q
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
I
A
 
A
L
 
I
A
 
T
E
 
E
I
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
V
A
 
A
G
 
H
N
 
Q
C
 
I
K
 
G
A
 
I
F
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
T
E
 
N
A
 
P
R
 
K
V
 
I
G
 
A
M
 
L
L
 
L
S
 
S
F
 
A
S
 
V
T
 
E
K
x
E
G
 
V
S
 
T
A
 
A
A
 
-
H
 
-
A
 
-
D
 
K
V
 
M
D
 
P
K
 
S
V
 
T
T
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
I
 
V
A
 
V
K
 
Q
T
 
H
I
 
F
K
 
G
P
 
N
D
 
Q
I
 
I
Q
 
S
I
 
V
D
 
S
G
 
G
E
 
P
L
 
L
Q
 
A
A
 
L
D
 
D
A
 
V
A
 
A
L
 
I
L
 
S
P
 
K
K
 
E
V
 
A
G
 
A
E
 
L
K
 
H
K
|
K
A
 
G
P
 
I
G
 
T
S
 
D
P
 
S
V
 
S
A
 
A
G
 
G
K
 
E
A
 
A
N
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
I
F
 
A
P
 
P
D
 
N
L
 
I
D
 
E
A
 
T
G
 
G
N
|
N
I
 
A
A
 
L
Y
 
Y
K
|
K
L
 
S
V
 
L
E
 
V
R
 
Y
V
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
K
A
 
-
V
 
V
G
 
G
P
 
S
I
 
A
I
 
V
Q
 
V
G
 
G
L
 
A
A
 
K
K
 
V
P
 
P
V
 
I
N
 
V
D
x
I
L
x
S
S
|
S
R
|
R
G
 
N
C
x
D
S
 
S

Sites not aligning to the query:

3uf6A The crystal structure of a possible phosphate acetyl/butaryl transferase (from listeria monocytogenes egd-e) in complex with cod (3'-dephosphocoenzyme a)
28% identity, 44% coverage: 170:316/333 of query aligns to 127:269/285 of 3uf6A

query
sites
3uf6A
I
 
L
L
 
L
F
 
I
A
 
T
D
 
D
C
 
C
A
|
A
V
x
M
N
 
N
P
 
V
N
 
A
P
 
P
D
 
K
A
 
T
Q
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
I
A
 
A
L
 
I
A
 
T
E
 
E
I
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
V
A
 
A
G
 
H
N
 
Q
C
 
I
K
 
G
A
 
I
F
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
T
E
 
N
A
 
P
R
 
K
V
 
I
G
 
A
M
 
L
L
 
L
S
 
S
F
 
A
S
 
V
T
 
E
K
 
E
G
 
V
S
 
T
A
 
A
A
 
-
H
 
-
A
 
-
D
 
K
V
 
M
D
 
P
K
 
S
V
 
T
T
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
I
 
V
A
 
V
K
 
Q
T
 
H
I
 
F
K
 
G
P
 
N
D
 
Q
I
 
I
Q
 
S
I
 
V
D
 
S
G
 
G
E
 
P
L
 
L
Q
 
A
A
 
L
D
 
D
A
 
V
A
 
A
L
 
I
L
 
S
P
 
K
K
 
E
V
 
A
G
 
A
E
 
L
K
 
H
K
 
K
A
 
G
P
 
I
G
 
T
S
 
D
P
 
S
V
 
S
A
 
A
G
 
G
K
 
E
A
 
A
N
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
I
F
 
A
P
 
P
D
 
N
L
 
I
D
 
E
A
 
T
G
 
G
N
 
N
I
 
A
A
 
L
Y
|
Y
K
|
K
L
 
S
V
 
L
E
 
V
R
 
Y
V
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
K
A
 
-
V
 
V
G
 
G
P
x
S
I
 
A
I
 
V
Q
 
V
G
 
G
L
 
A
A
 
K
K
 
V
P
 
P
V
 
I
N
 
V
D
x
I
L
 
S
S
|
S
R
 
R
G
 
N
C
 
D
S
 
S

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012469280.1 NCBI__GCF_000020385.1:WP_012469280.1
MHLVDQIKQKAQKNLQTVVLPESYDERMLYAAEKIVAEGLAKLVILGDPAKIQAEAAAKG
INLAGVELLNPADSPKLDQYIADFVELRKSKGMTAEEAKKLLTADDNLYYAGMMVRNGDA
GGEVAGATGTTGNVLKAAFQTVGPAAGIKTVSSFFLMITKTPSFGENGIILFADCAVNPN
PDAQALAEIAVATAGNCKAFLDVEARVGMLSFSTKGSAAHADVDKVTKAAEIAKTIKPDI
QIDGELQADAALLPKVGEKKAPGSPVAGKANVLIFPDLDAGNIAYKLVERVAGAEAVGPI
IQGLAKPVNDLSRGCSVDDIVNVVAITAVQAGA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory