SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012469445.1 NCBI__GCF_000020385.1:WP_012469445.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P00890 Citrate synthase, mitochondrial; EC 2.3.3.1 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
52% identity, 99% coverage: 2:435/440 of query aligns to 40:470/479 of P00890

query
sites
P00890
A
 
A
L
 
S
K
 
E
E
 
Q
T
 
T
L
 
L
K
 
K
Q
 
E
K
 
R
I
 
F
E
 
A
E
 
E
H
 
I
R
 
I
P
 
P
R
 
A
T
 
K
T
 
A
R
 
E
L
 
E
V
 
I
K
 
K
E
 
K
F
 
F
-
 
K
-
 
K
-
 
E
-
 
H
G
 
G
K
 
K
V
 
T
K
 
V
I
 
I
D
 
G
E
 
E
V
 
V
T
 
L
I
 
L
D
 
E
Q
 
Q
C
 
A
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
 
R
D
 
G
I
 
I
R
 
K
S
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
W
D
 
E
I
 
G
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
I
F
 
Q
A
 
R
A
 
E
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
A
P
 
E
G
 
G
S
 
S
N
 
T
Y
 
E
P
 
P
T
 
L
V
 
P
E
 
E
S
 
A
F
 
L
W
 
F
Y
 
W
M
 
L
L
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
D
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
K
E
 
A
V
 
L
V
 
S
A
 
A
E
 
D
W
 
L
K
 
A
T
 
A
R
 
R
Q
 
S
E
 
E
V
 
I
P
 
P
Q
 
E
Y
 
H
V
 
V
F
 
I
D
 
Q
V
 
L
L
 
L
R
 
D
A
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
K
D
 
D
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
A
M
 
Q
L
 
F
S
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
V
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
E
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
K
F
 
F
A
 
A
G
 
K
F
 
A
Y
 
Y
N
 
A
S
 
Q
G
 
G
K
 
-
F
 
V
N
 
S
K
 
K
M
 
K
T
 
E
A
 
Y
W
 
W
E
 
S
Y
 
Y
V
 
T
Y
 
F
E
 
E
D
 
D
A
 
S
S
 
L
D
 
D
I
 
L
V
 
L
A
 
G
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
S
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
V
Y
 
F
R
 
K
G
 
D
D
 
G
K
 
K
Q
 
I
I
 
T
A
 
S
I
 
T
D
 
D
P
 
P
S
 
N
L
 
A
D
 
D
M
 
Y
G
 
G
A
 
K
N
 
N
F
 
L
A
 
A
H
 
Q
M
 
L
I
 
L
G
 
G
-
 
Y
Q
 
E
K
 
N
E
 
K
E
 
D
Y
 
F
K
 
I
D
 
D
V
 
L
A
 
M
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
 
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
S
 
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
T
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
S
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
L
H
 
H
G
 
G
L
 
R
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
E
W
 
W
T
 
L
L
 
F
K
 
K
F
 
L
Q
 
R
E
 
E
K
 
E
Y
 
V
C
 
K
K
 
G
D
 
D
V
 
Y
E
 
-
P
 
-
T
 
S
E
 
K
E
 
E
L
 
T
I
 
I
K
 
E
A
 
K
A
 
Y
L
 
L
W
 
W
D
 
D
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
I
 
V
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
A
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
F
K
 
P
D
 
D
Y
 
Y
P
 
E
L
 
L
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
S
K
 
T
I
 
I
F
 
Y
E
 
E
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
K
H
 
H
G
 
G
K
 
K
T
 
T
K
 
K
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
S
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
E
Y
 
A
D
 
S
F
 
F
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
G
 
G
C
 
V
M
 
L
A
 
P
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
I
D
 
D
R
 
R
G
 
A
L
 
V
G
 
G
Y
 
A
A
 
P
L
 
I
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
|
S
V
 
F
T
 
S
T
 
T
A
 
-
M
 
-
L
 
-
E
 
E
K
 
K
W
 
Y
A
 
K
E
 
E

P08679 Citrate synthase, peroxisomal; EC 2.3.3.16 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 3 papers)
51% identity, 98% coverage: 4:435/440 of query aligns to 23:451/460 of P08679

query
sites
P08679
K
 
E
E
 
K
T
 
T
L
 
L
K
 
K
Q
 
E
K
 
R
I
 
F
E
 
S
E
 
E
-
 
I
-
 
Y
-
 
P
-
 
I
H
 
H
R
 
A
P
 
Q
R
 
D
T
 
V
T
 
R
R
 
Q
L
 
F
V
 
V
K
 
K
E
 
E
F
 
H
G
 
G
K
 
K
V
 
T
K
 
K
I
 
I
D
 
S
E
 
D
V
 
V
T
 
L
I
 
L
D
 
E
Q
 
Q
C
 
V
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
 
R
D
 
G
I
 
I
R
 
P
S
 
G
L
 
S
V
 
V
T
 
W
D
 
E
I
 
G
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
E
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
I
P
 
A
E
 
D
T
 
I
F
 
Q
A
 
K
A
 
D
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
A
P
 
K
G
 
G
S
 
S
N
 
S
Y
 
Q
P
 
P
T
 
L
V
 
P
E
 
E
S
 
A
F
 
L
W
 
F
Y
 
W
M
 
L
L
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
V
P
 
P
T
 
T
E
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
E
E
 
N
V
 
L
V
 
S
A
 
A
E
 
D
W
 
L
K
 
M
T
 
S
R
 
R
Q
 
S
E
 
E
V
 
L
P
 
P
Q
 
S
Y
 
H
V
 
V
F
 
V
D
 
Q
V
 
L
L
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
L
P
 
P
R
 
K
D
 
D
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
A
M
 
Q
L
 
F
S
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
V
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
E
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
K
F
 
F
A
 
A
G
 
K
F
 
A
Y
 
Y
N
 
A
S
 
Q
G
 
G
K
 
-
F
 
I
N
 
S
K
 
K
M
 
Q
T
 
D
A
 
Y
W
 
W
E
 
S
Y
 
Y
V
 
T
Y
 
F
E
 
E
D
 
D
A
 
S
S
 
L
D
 
D
I
 
L
V
 
L
A
 
G
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
V
Y
 
F
R
 
K
G
 
D
D
 
G
K
 
K
Q
 
M
I
 
G
A
 
E
I
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
N
L
 
A
D
 
D
M
 
Y
G
 
A
A
 
K
N
 
N
F
 
L
A
 
V
H
 
N
M
 
L
I
 
I
G
 
G
Q
 
S
K
 
K
-
 
D
E
 
E
E
 
D
Y
 
F
K
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
M
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
 
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
S
 
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
S
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
S
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
L
S
 
A
A
 
S
G
 
G
L
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
L
H
|
H
G
|
G
L
 
R
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
E
W
 
W
T
 
L
L
 
F
K
 
A
F
 
L
Q
 
K
E
 
E
K
 
E
Y
 
V
C
 
N
K
 
D
D
 
D
V
 
Y
E
 
-
P
 
-
T
 
S
E
 
K
E
 
D
L
 
T
I
 
I
K
 
E
A
 
K
A
 
Y
L
 
L
W
 
W
D
 
D
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
H
|
H
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
T
 
M
S
 
A
Q
 
Q
R
 
R
E
x
K
F
 
F
C
 
A
L
 
M
N
 
D
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
F
K
 
P
D
 
D
Y
 
Y
P
 
E
L
 
L
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
S
K
 
S
I
 
I
F
 
Y
E
 
E
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
E
H
 
H
G
 
G
K
|
K
T
 
T
K
 
K
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
K
E
 
E
Y
 
S
D
 
S
F
 
F
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
F
G
 
G
C
 
I
M
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
T
D
 
D
R
 
R
G
 
A
L
 
I
G
 
G
Y
 
A
A
 
S
L
 
I
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
Y
T
 
S
T
 
T
A
 
-
M
 
-
L
 
-
E
 
E
K
 
K
W
 
Y
A
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8gr9A Crystal structure of peroxisomal citrate synthase (cit2) from saccharomyces cerevisiae in complex with oxaloacetate and coenzyme-a (see paper)
51% identity, 98% coverage: 4:435/440 of query aligns to 1:424/432 of 8gr9A

query
sites
8gr9A
K
 
E
E
 
K
T
 
T
L
 
L
K
 
K
Q
 
E
K
 
R
I
 
F
E
 
S
E
 
E
-
 
I
-
 
Y
-
 
P
-
 
I
H
 
H
R
 
A
P
 
Q
R
 
D
T
 
V
T
 
R
R
 
Q
L
 
F
V
 
V
K
 
K
E
 
E
F
 
H
G
 
G
K
 
K
V
 
T
K
 
K
I
 
I
D
 
S
E
 
D
V
 
V
T
 
L
I
 
L
D
 
E
Q
 
Q
C
 
V
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
|
R
D
 
G
I
 
I
R
 
P
S
 
G
L
 
S
V
 
V
T
 
W
D
 
E
I
 
G
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
E
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
I
P
 
A
E
 
D
T
 
I
F
 
Q
A
 
K
A
 
D
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
A
P
 
K
G
 
G
S
 
S
N
 
S
Y
 
Q
P
 
P
T
 
L
V
 
P
E
 
E
S
 
A
F
 
L
W
 
F
Y
 
W
M
 
L
L
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
V
P
 
P
T
 
T
E
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
E
E
 
N
V
 
L
V
 
S
A
 
A
E
 
D
W
 
L
K
 
M
T
 
S
R
 
R
Q
 
S
E
 
E
V
 
L
P
 
P
Q
 
S
Y
 
H
V
 
V
F
 
V
D
 
Q
V
 
L
L
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
L
P
 
P
R
 
K
D
 
D
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
A
M
 
Q
L
 
F
S
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
V
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
E
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
K
F
 
F
A
 
A
G
 
K
F
 
A
Y
 
Y
N
 
A
S
 
Q
G
 
G
K
 
-
F
 
I
N
 
S
K
 
K
M
 
Q
T
 
D
A
 
Y
W
 
W
E
 
S
Y
 
Y
V
 
T
Y
 
F
E
 
E
D
 
D
A
 
S
S
 
L
D
 
D
I
 
L
V
 
L
A
 
G
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
V
Y
 
F
R
 
K
G
 
D
D
 
G
K
 
K
Q
 
M
I
 
G
A
 
E
I
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
N
L
 
A
D
 
D
M
 
Y
G
 
A
A
 
K
N
 
N
F
 
L
A
 
V
H
 
N
M
 
L
I
 
I
G
 
G
Q
 
S
K
 
K
-
 
D
E
 
E
E
 
D
Y
 
F
K
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
M
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
|
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
|
N
V
 
V
S
 
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
S
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
S
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
L
S
 
A
A
 
S
G
 
G
L
 
L
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
|
L
H
|
H
G
 
G
L
 
R
A
|
A
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
E
W
 
W
T
 
L
L
 
F
K
 
A
F
 
L
Q
 
K
E
 
E
K
 
E
Y
 
-
C
 
-
K
 
-
D
 
-
V
 
-
E
 
-
P
 
-
T
 
S
E
 
K
E
 
D
L
 
T
I
 
I
K
 
E
A
 
K
A
 
Y
L
 
L
W
 
W
D
 
D
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
|
V
I
|
I
P
 
P
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
A
|
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
Y
 
Y
T
 
M
S
 
A
Q
 
Q
R
 
R
E
 
K
F
 
F
C
 
A
L
 
M
N
 
D
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
F
K
 
P
D
 
D
Y
 
Y
P
 
E
L
 
L
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
S
K
 
S
I
 
I
F
 
Y
E
 
E
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
E
H
 
H
G
 
G
K
|
K
T
|
T
K
|
K
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
|
N
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
K
E
 
E
Y
 
S
D
 
S
F
 
F
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
|
R
A
 
A
L
 
F
G
 
G
C
 
I
M
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
T
D
 
D
R
 
R
G
 
A
L
 
I
G
 
G
Y
 
A
A
 
S
L
 
I
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
Y
T
 
S
T
 
T
A
 
-
M
 
-
L
 
-
E
 
E
K
 
K
W
 
Y
A
 
K
E
 
E

Q29RK1 Citrate synthase, mitochondrial; Citrate (Si)-synthase; EC 2.3.3.1 from Bos taurus (Bovine) (see paper)
49% identity, 99% coverage: 3:436/440 of query aligns to 33:463/466 of Q29RK1

query
sites
Q29RK1
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
I
L
 
L
K
 
A
Q
 
D
K
 
L
I
 
I
E
 
P
E
 
K
H
 
E
R
 
Q
P
 
T
R
 
R
T
 
V
T
 
K
R
 
A
L
 
F
V
 
R
K
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
K
 
K
V
 
T
K
 
V
I
 
V
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
M
C
 
M
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
 
R
D
 
G
I
 
M
R
x
K
S
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
Y
D
 
E
I
 
T
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
Y
T
 
S
I
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
C
F
 
Q
A
 
K
A
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
A
P
 
K
G
 
G
S
 
G
N
 
E
Y
 
E
P
 
P
T
 
L
V
 
P
E
 
E
S
 
G
F
 
L
W
 
F
Y
 
W
M
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
E
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
S
E
 
W
V
 
L
V
 
S
A
 
Q
E
 
E
W
 
W
K
 
A
T
 
K
R
 
R
Q
 
A
E
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
S
Y
 
H
V
 
V
F
 
V
D
 
T
V
 
M
L
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
F
P
 
P
R
 
T
D
 
N
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
S
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
M
 
V
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
T
F
 
F
A
 
A
G
 
R
F
 
A
Y
 
Y
N
 
S
S
 
E
G
 
G
K
 
-
F
 
I
N
 
N
K
 
R
M
 
T
T
 
K
A
 
Y
W
 
W
E
 
E
Y
 
L
V
 
I
Y
 
Y
E
 
E
D
 
D
A
 
S
S
 
M
D
 
D
I
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
C
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
E
D
 
G
K
 
S
Q
 
S
I
 
I
-
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
P
 
P
S
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
W
G
 
S
A
 
H
N
 
N
F
 
F
A
 
T
H
 
N
M
 
M
I
 
L
G
 
G
Q
 
Y
K
 
T
E
 
D
-
 
A
E
 
Q
Y
 
F
K
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
M
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
 
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
S
 
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
S
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
L
H
 
H
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
V
W
 
W
T
 
L
L
 
T
K
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
E
 
K
K
 
E
Y
 
V
C
 
G
K
 
K
D
 
D
V
 
V
E
 
-
P
 
-
T
 
S
E
 
D
E
 
E
L
 
K
I
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
W
 
W
D
 
N
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
I
 
V
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
C
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
L
K
 
P
D
 
Q
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
V
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
N
V
 
I
L
 
L
T
 
L
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
A
K
 
K
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
Y
 
M
D
 
N
F
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
V
M
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
W
D
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
P
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
M
T
 
S
T
 
T
A
 
D
M
 
G
L
 
L
E
 
M
K
 
K
W
 
F
A
 
V
E
 
D
A
 
S

6cscA Chicken citrate synthase complex with trifluoroacetonyl-coa and citrate
49% identity, 99% coverage: 3:437/440 of query aligns to 6:437/437 of 6cscA

query
sites
6cscA
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
V
L
 
L
K
 
A
Q
 
S
K
 
L
I
 
I
E
 
P
E
 
K
H
 
E
R
 
Q
P
 
A
R
 
R
T
 
I
T
 
K
R
 
T
L
 
F
V
 
R
K
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
K
 
N
V
 
T
K
 
A
I
 
V
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
M
C
 
S
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
|
R
D
 
G
I
 
M
R
 
K
S
 
G
L
 
L
V
 
I
T
 
Y
D
 
E
I
 
T
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
F
T
 
S
I
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
C
F
 
Q
A
 
K
A
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
A
P
 
G
G
 
G
S
 
G
N
 
E
Y
 
E
P
 
P
T
 
L
V
 
P
E
 
E
S
 
G
F
 
L
W
 
F
Y
 
W
M
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
P
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
S
E
 
W
V
 
V
V
 
S
A
 
K
E
 
E
W
 
W
K
 
A
T
 
K
R
 
R
Q
 
A
E
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
S
Y
 
H
V
 
V
F
 
V
D
 
T
V
 
M
L
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
F
P
 
P
R
 
T
D
 
N
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
S
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
N
F
 
F
A
 
A
G
 
R
F
 
A
Y
 
Y
N
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
-
F
 
I
N
 
N
K
 
R
M
 
T
T
 
K
A
 
Y
W
 
W
E
 
E
Y
 
F
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
D
 
D
A
 
A
S
 
M
D
 
D
I
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
C
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
A
D
 
G
K
 
S
Q
 
S
I
 
I
-
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
P
 
S
S
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
W
G
 
S
A
 
H
N
 
N
F
 
F
A
 
T
H
 
N
M
 
M
I
 
L
G
 
G
Q
 
Y
K
 
T
E
 
D
-
 
P
E
 
Q
Y
 
F
K
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
M
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
 
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
S
|
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
S
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
|
L
H
|
H
G
 
G
L
 
L
A
|
A
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
L
W
 
W
T
 
L
L
 
S
K
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
E
 
K
K
 
D
Y
 
L
C
 
G
K
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
-
P
 
-
T
 
S
E
 
D
E
 
E
L
 
K
I
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
W
 
W
D
 
N
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
|
V
I
x
V
P
 
P
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
A
|
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
C
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
L
K
 
P
D
 
S
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
V
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
K
|
K
T
x
A
K
|
K
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
|
N
V
 
V
D
|
D
A
 
A
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
Y
 
M
D
 
N
F
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
V
M
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
W
D
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
P
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
M
T
 
S
T
 
T
A
 
A
M
 
G
L
 
L
E
 
E
K
 
K
W
 
L
A
 
S
E
 
A
A
 
G
G
 
G

1cssA Alpha-fluoro acid and alpha-fluoro amide analogs of acetyl-coa as inhibitors of of citrate synthase: effect of pka matching on binding affinity and hydrogen bond length (see paper)
49% identity, 99% coverage: 3:437/440 of query aligns to 4:435/435 of 1cssA

query
sites
1cssA
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
V
L
 
L
K
 
A
Q
 
S
K
 
L
I
 
I
E
 
P
E
 
K
H
 
E
R
 
Q
P
 
A
R
 
R
T
 
I
T
 
K
R
 
T
L
 
F
V
 
R
K
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
K
 
N
V
 
T
K
 
A
I
 
V
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
M
C
 
S
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
|
R
D
 
G
I
 
M
R
 
K
S
 
G
L
 
L
V
 
I
T
 
Y
D
 
E
I
 
T
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
F
T
 
S
I
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
C
F
 
Q
A
 
K
A
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
A
P
 
G
G
 
G
S
 
G
N
 
E
Y
 
E
P
 
P
T
 
L
V
 
P
E
 
E
S
 
G
F
 
L
W
 
F
Y
 
W
M
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
P
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
S
E
 
W
V
 
V
V
 
S
A
 
K
E
 
E
W
 
W
K
 
A
T
 
K
R
 
R
Q
 
A
E
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
S
Y
 
H
V
 
V
F
 
V
D
 
T
V
 
M
L
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
F
P
 
P
R
 
T
D
 
N
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
S
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
N
F
 
F
A
 
A
G
 
R
F
 
A
Y
 
Y
N
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
-
F
 
I
N
 
N
K
 
R
M
 
T
T
 
K
A
 
Y
W
 
W
E
 
E
Y
 
F
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
D
 
D
A
 
A
S
 
M
D
 
D
I
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
C
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
A
D
 
G
K
 
S
Q
 
S
I
 
I
-
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
P
 
S
S
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
W
G
 
S
A
 
H
N
 
N
F
 
F
A
 
T
H
 
N
M
 
M
I
 
L
G
 
G
Q
 
Y
K
 
T
E
 
D
-
 
P
E
 
Q
Y
 
F
K
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
M
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
|
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
|
N
V
 
V
S
|
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
S
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
|
L
H
|
H
G
 
G
L
 
L
A
|
A
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
L
W
 
W
T
 
L
L
 
S
K
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
E
 
K
K
 
D
Y
 
L
C
 
G
K
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
-
P
 
-
T
 
S
E
 
D
E
 
E
L
 
K
I
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
W
 
W
D
 
N
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
|
V
I
x
V
P
 
P
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
A
|
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
C
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
L
K
 
P
D
 
S
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
V
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
K
|
K
T
x
A
K
|
K
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
|
N
V
 
V
D
|
D
A
 
A
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
Y
 
M
D
 
N
F
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
|
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
V
M
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
W
D
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
P
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
M
T
 
S
T
 
T
A
 
A
M
 
G
L
 
L
E
 
E
K
 
K
W
 
L
A
 
S
E
 
A
A
 
G
G
 
G

1csrA Alpha-fluoro acid and alpha-fluoro amide analogs of acetyl-coa as inhibitors of of citrate synthase: effect of pka matching on binding affinity and hydrogen bond length (see paper)
49% identity, 99% coverage: 3:437/440 of query aligns to 4:435/435 of 1csrA

query
sites
1csrA
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
V
L
 
L
K
 
A
Q
 
S
K
 
L
I
 
I
E
 
P
E
 
K
H
 
E
R
 
Q
P
 
A
R
 
R
T
 
I
T
 
K
R
 
T
L
 
F
V
 
R
K
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
K
 
N
V
 
T
K
 
A
I
 
V
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
M
C
 
S
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
|
R
D
 
G
I
 
M
R
 
K
S
 
G
L
 
L
V
 
I
T
 
Y
D
 
E
I
 
T
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
F
T
 
S
I
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
C
F
 
Q
A
 
K
A
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
A
P
 
G
G
 
G
S
 
G
N
 
E
Y
 
E
P
 
P
T
 
L
V
 
P
E
 
E
S
 
G
F
 
L
W
 
F
Y
 
W
M
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
P
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
S
E
 
W
V
 
V
V
 
S
A
 
K
E
 
E
W
 
W
K
 
A
T
 
K
R
 
R
Q
 
A
E
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
S
Y
 
H
V
 
V
F
 
V
D
 
T
V
 
M
L
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
F
P
 
P
R
 
T
D
 
N
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
S
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
N
F
 
F
A
 
A
G
 
R
F
 
A
Y
 
Y
N
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
-
F
 
I
N
 
N
K
 
R
M
 
T
T
 
K
A
 
Y
W
 
W
E
 
E
Y
 
F
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
D
 
D
A
 
A
S
 
M
D
 
D
I
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
C
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
A
D
 
G
K
 
S
Q
 
S
I
 
I
-
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
P
 
S
S
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
W
G
 
S
A
 
H
N
 
N
F
 
F
A
 
T
H
 
N
M
 
M
I
 
L
G
 
G
Q
 
Y
K
 
T
E
 
D
-
 
P
E
 
Q
Y
 
F
K
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
M
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
|
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
|
N
V
 
V
S
|
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
S
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
|
L
H
|
H
G
 
G
L
 
L
A
|
A
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
L
W
 
W
T
 
L
L
 
S
K
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
E
 
K
K
 
D
Y
 
L
C
 
G
K
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
-
P
 
-
T
 
S
E
 
D
E
 
E
L
 
K
I
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
W
 
W
D
 
N
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
|
V
I
x
V
P
 
P
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
A
|
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
C
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
L
K
 
P
D
 
S
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
V
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
K
|
K
T
x
A
K
|
K
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
|
N
V
 
V
D
|
D
A
 
A
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
Y
 
M
D
 
N
F
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
|
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
|
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
V
M
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
W
D
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
P
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
M
T
 
S
T
 
T
A
 
A
M
 
G
L
 
L
E
 
E
K
 
K
W
 
L
A
 
S
E
 
A
A
 
G
G
 
G

1csiA A very short hydrogen bond provides only moderate stabilization of an enzyme: inhibitor complex of citrate synthase (see paper)
49% identity, 99% coverage: 3:437/440 of query aligns to 4:435/435 of 1csiA

query
sites
1csiA
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
V
L
 
L
K
 
A
Q
 
S
K
 
L
I
 
I
E
 
P
E
 
K
H
 
E
R
 
Q
P
 
A
R
 
R
T
 
I
T
 
K
R
 
T
L
 
F
V
 
R
K
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
K
 
N
V
 
T
K
 
A
I
 
V
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
M
C
 
S
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
|
R
D
 
G
I
 
M
R
 
K
S
 
G
L
 
L
V
 
I
T
 
Y
D
 
E
I
 
T
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
F
T
 
S
I
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
C
F
 
Q
A
 
K
A
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
A
P
 
G
G
 
G
S
 
G
N
 
E
Y
 
E
P
 
P
T
 
L
V
 
P
E
 
E
S
 
G
F
 
L
W
 
F
Y
 
W
M
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
P
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
S
E
 
W
V
 
V
V
 
S
A
 
K
E
 
E
W
 
W
K
 
A
T
 
K
R
 
R
Q
 
A
E
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
S
Y
 
H
V
 
V
F
 
V
D
 
T
V
 
M
L
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
F
P
 
P
R
 
T
D
 
N
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
S
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
N
F
 
F
A
 
A
G
 
R
F
 
A
Y
 
Y
N
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
-
F
 
I
N
 
N
K
 
R
M
 
T
T
 
K
A
 
Y
W
 
W
E
 
E
Y
 
F
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
D
 
D
A
 
A
S
 
M
D
 
D
I
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
C
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
A
D
 
G
K
 
S
Q
 
S
I
 
I
-
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
P
 
S
S
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
W
G
 
S
A
 
H
N
 
N
F
 
F
A
 
T
H
 
N
M
 
M
I
 
L
G
 
G
Q
 
Y
K
 
T
E
 
D
-
 
P
E
 
Q
Y
 
F
K
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
M
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
|
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
|
N
V
 
V
S
|
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
S
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
|
L
H
|
H
G
 
G
L
 
L
A
|
A
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
L
W
 
W
T
 
L
L
 
S
K
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
E
 
K
K
 
D
Y
 
L
C
 
G
K
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
-
P
 
-
T
 
S
E
 
D
E
 
E
L
 
K
I
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
W
 
W
D
 
N
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
|
V
I
x
V
P
 
P
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
A
|
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
C
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
L
K
 
P
D
 
S
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
V
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
K
|
K
T
x
A
K
|
K
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
|
N
V
 
V
D
|
D
A
 
A
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
Y
 
M
D
 
N
F
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
|
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
V
M
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
W
D
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
P
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
M
T
 
S
T
 
T
A
 
A
M
 
G
L
 
L
E
 
E
K
 
K
W
 
L
A
 
S
E
 
A
A
 
G
G
 
G

1cshA A very short hydrogen bond provides only moderate stabilization of an enzyme: inhibitor complex of citrate synthase (see paper)
49% identity, 99% coverage: 3:437/440 of query aligns to 4:435/435 of 1cshA

query
sites
1cshA
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
V
L
 
L
K
 
A
Q
 
S
K
 
L
I
 
I
E
 
P
E
 
K
H
 
E
R
 
Q
P
 
A
R
 
R
T
 
I
T
 
K
R
 
T
L
 
F
V
 
R
K
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
K
 
N
V
 
T
K
 
A
I
 
V
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
M
C
 
S
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
|
R
D
 
G
I
 
M
R
 
K
S
 
G
L
 
L
V
 
I
T
 
Y
D
 
E
I
 
T
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
F
T
 
S
I
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
C
F
 
Q
A
 
K
A
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
A
P
 
G
G
 
G
S
 
G
N
 
E
Y
 
E
P
 
P
T
 
L
V
 
P
E
 
E
S
 
G
F
 
L
W
 
F
Y
 
W
M
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
P
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
S
E
 
W
V
 
V
V
 
S
A
 
K
E
 
E
W
 
W
K
 
A
T
 
K
R
 
R
Q
 
A
E
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
S
Y
 
H
V
 
V
F
 
V
D
 
T
V
 
M
L
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
F
P
 
P
R
 
T
D
 
N
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
S
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
N
F
 
F
A
 
A
G
 
R
F
 
A
Y
 
Y
N
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
-
F
 
I
N
 
N
K
 
R
M
 
T
T
 
K
A
 
Y
W
 
W
E
 
E
Y
 
F
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
D
 
D
A
 
A
S
 
M
D
 
D
I
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
C
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
A
D
 
G
K
 
S
Q
 
S
I
 
I
-
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
P
 
S
S
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
W
G
 
S
A
 
H
N
 
N
F
 
F
A
 
T
H
 
N
M
 
M
I
 
L
G
 
G
Q
 
Y
K
 
T
E
 
D
-
 
P
E
 
Q
Y
 
F
K
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
M
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
|
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
|
N
V
 
V
S
|
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
S
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
|
L
H
|
H
G
 
G
L
 
L
A
|
A
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
L
W
 
W
T
 
L
L
 
S
K
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
E
 
K
K
 
D
Y
 
L
C
 
G
K
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
-
P
 
-
T
 
S
E
 
D
E
 
E
L
 
K
I
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
W
 
W
D
 
N
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
|
V
I
x
V
P
 
P
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
A
|
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
C
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
L
K
 
P
D
 
S
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
V
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
K
|
K
T
x
A
K
|
K
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
|
N
V
 
V
D
|
D
A
 
A
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
Y
 
M
D
 
N
F
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
|
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
V
M
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
W
D
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
P
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
M
T
 
S
T
 
T
A
 
A
M
 
G
L
 
L
E
 
E
K
 
K
W
 
L
A
 
S
E
 
A
A
 
G
G
 
G

1amzA Chicken citrate synthase complex with nitromethylde-coa and malate
49% identity, 99% coverage: 3:437/440 of query aligns to 4:435/435 of 1amzA

query
sites
1amzA
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
V
L
 
L
K
 
A
Q
 
S
K
 
L
I
 
I
E
 
P
E
 
K
H
 
E
R
 
Q
P
 
A
R
 
R
T
 
I
T
 
K
R
 
T
L
 
F
V
 
R
K
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
K
 
N
V
 
T
K
 
A
I
 
V
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
M
C
 
S
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
|
R
D
 
G
I
 
M
R
 
K
S
 
G
L
 
L
V
 
I
T
 
Y
D
 
E
I
 
T
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
F
T
 
S
I
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
C
F
 
Q
A
 
K
A
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
A
P
 
G
G
 
G
S
 
G
N
 
E
Y
 
E
P
 
P
T
 
L
V
 
P
E
 
E
S
 
G
F
 
L
W
 
F
Y
 
W
M
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
P
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
S
E
 
W
V
 
V
V
 
S
A
 
K
E
 
E
W
 
W
K
 
A
T
 
K
R
 
R
Q
 
A
E
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
S
Y
 
H
V
 
V
F
 
V
D
 
T
V
 
M
L
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
F
P
 
P
R
 
T
D
 
N
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
S
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
N
F
 
F
A
 
A
G
 
R
F
 
A
Y
 
Y
N
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
-
F
 
I
N
 
N
K
 
R
M
 
T
T
 
K
A
 
Y
W
 
W
E
 
E
Y
 
F
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
D
 
D
A
 
A
S
 
M
D
 
D
I
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
C
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
A
D
 
G
K
 
S
Q
 
S
I
 
I
-
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
P
 
S
S
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
W
G
 
S
A
 
H
N
 
N
F
 
F
A
 
T
H
 
N
M
 
M
I
 
L
G
 
G
Q
 
Y
K
 
T
E
 
D
-
 
P
E
 
Q
Y
 
F
K
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
M
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
 
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
S
|
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
S
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
|
L
H
|
H
G
 
G
L
 
L
A
|
A
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
L
W
 
W
T
 
L
L
 
S
K
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
E
 
K
K
 
D
Y
 
L
C
 
G
K
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
-
P
 
-
T
 
S
E
 
D
E
 
E
L
 
K
I
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
W
 
W
D
 
N
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
|
V
I
x
V
P
 
P
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
A
|
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
C
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
L
K
 
P
D
 
S
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
V
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
K
|
K
T
x
A
K
|
K
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
|
N
V
 
V
D
|
D
A
 
A
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
Y
 
M
D
 
N
F
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
V
M
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
W
D
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
P
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
M
T
 
S
T
 
T
A
 
A
M
 
G
L
 
L
E
 
E
K
 
K
W
 
L
A
 
S
E
 
A
A
 
G
G
 
G

1al6A Chicken citrate synthase complex with n-hydroxyamido-coa and oxaloacetate
49% identity, 99% coverage: 3:437/440 of query aligns to 4:435/435 of 1al6A

query
sites
1al6A
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
V
L
 
L
K
 
A
Q
 
S
K
 
L
I
 
I
E
 
P
E
 
K
H
 
E
R
 
Q
P
 
A
R
 
R
T
 
I
T
 
K
R
 
T
L
 
F
V
 
R
K
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
K
 
N
V
 
T
K
 
A
I
 
V
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
M
C
 
S
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
|
R
D
 
G
I
 
M
R
 
K
S
 
G
L
 
L
V
 
I
T
 
Y
D
 
E
I
 
T
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
F
T
 
S
I
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
C
F
 
Q
A
 
K
A
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
A
P
 
G
G
 
G
S
 
G
N
 
E
Y
 
E
P
 
P
T
 
L
V
 
P
E
 
E
S
 
G
F
 
L
W
 
F
Y
 
W
M
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
P
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
S
E
 
W
V
 
V
V
 
S
A
 
K
E
 
E
W
 
W
K
 
A
T
 
K
R
 
R
Q
 
A
E
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
S
Y
 
H
V
 
V
F
 
V
D
 
T
V
 
M
L
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
F
P
 
P
R
 
T
D
 
N
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
S
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
N
F
 
F
A
 
A
G
 
R
F
 
A
Y
 
Y
N
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
-
F
 
I
N
 
N
K
 
R
M
 
T
T
 
K
A
 
Y
W
 
W
E
 
E
Y
 
F
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
D
 
D
A
 
A
S
 
M
D
 
D
I
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
C
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
A
D
 
G
K
 
S
Q
 
S
I
 
I
-
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
P
 
S
S
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
W
G
 
S
A
 
H
N
 
N
F
 
F
A
 
T
H
 
N
M
 
M
I
 
L
G
 
G
Q
 
Y
K
 
T
E
 
D
-
 
P
E
 
Q
Y
 
F
K
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
M
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
|
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
|
N
V
 
V
S
|
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
S
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
|
L
H
|
H
G
|
G
L
 
L
A
|
A
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
L
W
 
W
T
 
L
L
 
S
K
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
E
 
K
K
 
D
Y
 
L
C
 
G
K
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
-
P
 
-
T
 
S
E
 
D
E
 
E
L
 
K
I
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
W
 
W
D
 
N
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
|
V
I
x
V
P
 
P
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
A
|
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
C
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
L
K
 
P
D
 
S
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
V
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
K
|
K
T
x
A
K
|
K
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
|
N
V
 
V
D
|
D
A
 
A
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
Y
 
M
D
 
N
F
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
|
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
|
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
V
M
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
W
D
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
P
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
M
T
 
S
T
 
T
A
 
A
M
 
G
L
 
L
E
 
E
K
 
K
W
 
L
A
 
S
E
 
A
A
 
G
G
 
G

O75390 Citrate synthase, mitochondrial; Citrate (Si)-synthase; EC 2.3.3.1 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
49% identity, 99% coverage: 3:436/440 of query aligns to 33:463/466 of O75390

query
sites
O75390
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
I
L
 
L
K
 
A
Q
 
D
K
 
L
I
 
I
E
 
P
E
 
K
H
 
E
R
 
Q
P
 
A
R
 
R
T
 
I
T
 
K
R
 
T
L
 
F
V
 
R
K
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
K
 
K
V
 
T
K
 
V
I
 
V
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
M
C
 
M
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
 
R
D
 
G
I
 
M
R
 
K
S
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
Y
D
 
E
I
 
T
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
F
T
 
S
I
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
C
F
 
Q
A
 
K
A
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
A
P
 
K
G
 
G
S
 
G
N
 
E
Y
 
E
P
 
P
T
 
L
V
 
P
E
 
E
S
 
G
F
 
L
W
 
F
Y
 
W
M
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
H
V
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
E
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
S
E
 
W
V
 
L
V
 
S
A
 
K
E
 
E
W
 
W
K
 
A
T
 
K
R
 
R
Q
 
A
E
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
S
Y
 
H
V
 
V
F
 
V
D
 
T
V
 
M
L
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
F
P
 
P
R
 
T
D
 
N
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
S
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
M
 
V
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
N
F
 
F
A
 
A
G
 
R
F
 
A
Y
 
Y
N
 
A
S
 
Q
G
 
G
K
 
-
F
 
I
N
 
S
K
 
R
M
 
T
T
 
K
A
 
Y
W
 
W
E
 
E
Y
 
L
V
 
I
Y
 
Y
E
 
E
D
 
D
A
 
S
S
 
M
D
 
D
I
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
C
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
E
D
 
G
K
 
S
Q
 
G
I
 
I
-
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
P
 
S
S
 
N
L
 
L
D
 
D
M
 
W
G
 
S
A
 
H
N
 
N
F
 
F
A
 
T
H
 
N
M
 
M
I
 
L
G
 
G
Q
 
Y
K
 
T
E
 
D
-
 
H
E
 
Q
Y
 
F
K
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
T
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
 
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
S
 
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
S
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
L
H
 
H
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
V
W
 
W
T
 
L
L
 
T
K
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
E
 
K
K
 
E
Y
 
V
C
 
G
K
 
K
D
 
D
V
 
V
E
 
-
P
 
-
T
 
S
E
 
D
E
 
E
L
 
K
I
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
W
 
W
D
 
N
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
I
 
V
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
C
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
L
K
 
P
D
 
N
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
V
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
K
|
K
T
 
A
K
|
K
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
Y
 
M
D
 
N
F
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
|
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
V
M
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
W
D
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
P
L
 
L
E
 
E
R
|
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
M
T
 
S
T
 
T
A
 
E
M
 
G
L
 
L
E
 
M
K
 
K
W
 
F
A
 
V
E
 
D
A
 
S

Sites not aligning to the query:

2ctsA Crystallographic refinement and atomic models of two different forms of citrate synthase at 2.7 and 1.7 angstroms resolution (see paper)
49% identity, 99% coverage: 3:436/440 of query aligns to 6:436/437 of 2ctsA

query
sites
2ctsA
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
I
L
 
L
K
 
A
Q
 
D
K
 
L
I
 
I
E
 
P
E
 
K
H
 
E
R
 
Q
P
 
A
R
 
R
T
 
I
T
 
K
R
 
T
L
 
F
V
 
R
K
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
K
 
N
V
 
T
K
 
A
I
 
V
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
M
C
 
M
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
|
R
D
 
G
I
 
M
R
 
K
S
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
Y
D
 
E
I
 
T
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
Y
T
 
S
I
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
C
F
 
Q
A
 
K
A
 
M
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
A
P
 
K
G
 
G
S
 
G
N
 
E
Y
 
E
P
 
P
T
 
L
V
 
P
E
 
E
S
 
G
F
 
L
W
 
F
Y
 
W
M
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
E
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
S
E
 
W
V
 
L
V
 
S
A
 
K
E
 
E
W
 
W
K
 
A
T
 
K
R
 
R
Q
 
A
E
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
S
Y
 
H
V
 
V
F
 
V
D
 
T
V
 
M
L
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
F
P
 
P
R
 
T
D
 
N
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
S
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
N
F
 
F
A
 
A
G
 
R
F
 
A
Y
 
Y
N
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
-
F
 
I
N
 
H
K
 
R
M
 
T
T
 
K
A
 
Y
W
 
W
E
 
E
Y
 
L
V
 
I
Y
 
Y
E
 
E
D
 
D
A
 
C
S
 
M
D
 
D
I
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
C
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
E
D
 
G
K
 
S
Q
 
S
I
 
I
-
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
P
 
S
S
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
W
G
 
S
A
 
H
N
 
N
F
 
F
A
 
T
H
 
N
M
 
M
I
 
L
G
 
G
Q
 
Y
K
 
T
E
 
D
-
 
A
E
 
Q
Y
 
F
K
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
M
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
 
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
S
|
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
S
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
|
P
L
 
L
H
|
H
G
 
G
L
 
L
A
|
A
N
 
N
Q
 
Q
E
|
E
V
 
V
L
 
L
D
 
V
W
 
W
T
 
L
L
 
T
K
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
E
 
K
K
 
E
Y
 
V
C
 
G
K
 
K
D
 
D
V
 
V
E
 
-
P
 
-
T
 
S
E
 
D
E
 
E
L
 
K
I
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
W
 
W
D
 
N
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
|
V
I
x
V
P
|
P
G
|
G
Y
|
Y
G
 
G
H
|
H
A
|
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
C
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
L
K
 
P
D
 
H
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
V
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
K
|
K
T
 
A
K
 
K
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
|
D
A
 
A
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
Y
 
M
D
 
N
F
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
V
M
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
W
D
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
P
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
M
T
 
S
T
 
T
A
 
D
M
 
G
L
 
L
E
 
I
K
 
K
W
 
L
A
 
V
E
 
D
A
 
S

P00889 Citrate synthase, mitochondrial; Citrate (Si)-synthase; EC 2.3.3.1 from Sus scrofa (Pig) (see 2 papers)
49% identity, 99% coverage: 3:436/440 of query aligns to 33:463/464 of P00889

query
sites
P00889
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
I
L
 
L
K
 
A
Q
 
D
K
 
L
I
 
I
E
 
P
E
 
K
H
 
E
R
 
Q
P
 
A
R
 
R
T
 
I
T
 
K
R
 
T
L
 
F
V
 
R
K
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
K
 
N
V
 
T
K
 
V
I
 
V
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
M
C
 
M
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
 
R
D
 
G
I
 
M
R
 
K
S
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
Y
D
 
E
I
 
T
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
Y
T
 
S
I
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
C
F
 
Q
A
 
K
A
 
M
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
A
P
 
K
G
 
G
S
 
G
N
 
E
Y
 
E
P
 
P
T
 
L
V
 
P
E
 
E
S
 
G
F
 
L
W
 
F
Y
 
W
M
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
E
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
S
E
 
W
V
 
L
V
 
S
A
 
K
E
 
E
W
 
W
K
 
A
T
 
K
R
 
R
Q
 
A
E
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
S
Y
 
H
V
 
V
F
 
V
D
 
T
V
 
M
L
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
F
P
 
P
R
 
T
D
 
N
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
S
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
N
F
 
F
A
 
A
G
 
R
F
 
A
Y
 
Y
N
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
-
F
 
I
N
 
H
K
 
R
M
 
T
T
 
K
A
 
Y
W
 
W
E
 
E
Y
 
L
V
 
I
Y
 
Y
E
 
E
D
 
D
A
 
C
S
 
M
D
 
D
I
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
C
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
E
D
 
G
K
 
S
Q
 
S
I
 
I
-
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
P
 
S
S
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
W
G
 
S
A
 
H
N
 
N
F
 
F
A
 
T
H
 
N
M
 
M
I
 
L
G
 
G
Q
 
Y
K
 
T
E
 
D
-
 
A
E
 
Q
Y
 
F
K
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
M
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
 
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
S
 
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
S
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
L
H
|
H
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
V
W
 
W
T
 
L
L
 
T
K
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
E
 
K
K
 
E
Y
 
V
C
 
G
K
 
K
D
 
D
V
 
V
E
 
-
P
 
-
T
 
S
E
 
D
E
 
E
L
 
K
I
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
W
 
W
D
 
N
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
I
 
V
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
C
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
L
K
 
P
D
 
H
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
V
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
A
K
|
K
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
|
D
A
 
A
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
Y
 
M
D
 
N
F
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
V
M
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
W
D
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
P
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
M
T
 
S
T
 
T
A
 
D
M
 
G
L
 
L
E
 
I
K
 
K
W
 
L
A
 
V
E
 
D
A
 
S

Sites not aligning to the query:

3enjA Structure of pig heart citrate synthase at 1.78 a resolution (see paper)
49% identity, 99% coverage: 3:436/440 of query aligns to 6:436/437 of 3enjA

query
sites
3enjA
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
I
L
 
L
K
 
A
Q
 
D
K
 
L
I
 
I
E
 
P
E
 
K
H
 
E
R
 
Q
P
 
A
R
 
R
T
 
I
T
 
K
R
 
T
L
 
F
V
 
R
K
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
K
 
N
V
 
T
K
 
V
I
 
V
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
M
C
 
M
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
 
R
D
 
G
I
 
M
R
 
K
S
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
Y
D
 
E
I
 
T
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
Y
T
 
S
I
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
C
F
 
Q
A
 
K
A
 
M
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
A
P
 
K
G
 
G
S
 
G
N
 
E
Y
 
E
P
 
P
T
 
L
V
 
P
E
 
E
S
 
G
F
 
L
W
 
F
Y
 
W
M
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
E
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
S
E
 
W
V
 
L
V
 
S
A
 
K
E
 
E
W
 
W
K
 
A
T
 
K
R
 
R
Q
x
A
E
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
S
Y
 
H
V
 
V
F
 
V
D
 
T
V
 
M
L
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
F
P
 
P
R
 
T
D
 
N
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
S
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
N
F
 
F
A
 
A
G
 
R
F
 
A
Y
 
Y
N
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
-
F
 
I
N
 
H
K
 
R
M
 
T
T
 
K
A
 
Y
W
 
W
E
 
E
Y
 
L
V
 
I
Y
 
Y
E
 
E
D
 
D
A
 
C
S
 
M
D
 
D
I
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
x
C
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
E
D
 
G
K
 
S
Q
 
S
I
 
I
-
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
P
 
S
S
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
W
G
 
S
A
 
H
N
 
N
F
 
F
A
 
T
H
 
N
M
 
M
I
 
L
G
 
G
Q
 
Y
K
 
T
E
 
D
-
 
A
E
 
Q
Y
 
F
K
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
M
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
 
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
S
|
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
S
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
L
H
|
H
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
V
W
 
W
T
 
L
L
 
T
K
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
E
 
K
K
 
E
Y
 
V
C
 
G
K
 
K
D
 
D
V
 
V
E
 
-
P
 
-
T
 
S
E
 
D
E
 
E
L
 
K
I
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
W
 
W
D
 
N
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
I
 
V
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
H
|
H
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
C
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
L
K
 
P
D
 
H
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
V
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
A
K
 
K
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
|
D
A
 
A
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
Y
 
M
D
 
N
F
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
V
M
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
W
D
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
P
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
M
T
 
S
T
 
T
A
 
D
M
 
G
L
 
L
E
 
I
K
 
K
W
 
L
A
 
V
E
 
D
A
 
S

6ctsA Proposed mechanism for the condensation reaction of citrate synthase. 1.9-angstroms structure of the ternary complex with oxaloacetate and carboxymethyl coenzyme a (see paper)
48% identity, 97% coverage: 3:427/440 of query aligns to 6:423/429 of 6ctsA

query
sites
6ctsA
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
V
L
 
L
K
 
A
Q
 
A
K
 
L
I
 
I
E
 
P
E
 
K
H
 
E
R
 
Q
P
 
A
R
 
R
T
 
I
T
 
K
R
 
T
L
 
F
V
 
R
K
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
K
 
G
V
 
T
K
 
A
I
 
L
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
M
C
 
S
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
|
R
D
 
G
I
 
M
R
 
K
S
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
Y
D
 
E
I
 
T
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
F
T
 
S
I
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
C
F
 
Q
A
 
K
A
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
G
P
 
G
G
 
G
S
 
G
N
 
E
Y
 
P
P
 
L
T
 
P
V
 
E
E
 
G
S
 
L
F
 
F
W
 
W
Y
 
-
M
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
S
E
 
W
V
 
L
V
 
S
A
 
K
E
 
E
W
 
W
K
 
A
T
 
K
R
 
R
Q
 
A
E
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
S
Y
 
H
V
 
V
F
 
V
D
 
T
V
 
M
L
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
F
P
 
P
R
 
T
D
 
N
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
S
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
N
F
 
F
A
 
A
G
 
R
F
 
A
Y
 
Y
N
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
I
F
 
L
N
 
-
K
 
R
M
 
T
T
 
K
A
 
Y
W
 
W
E
 
E
Y
 
M
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
D
 
S
A
 
A
S
 
M
D
 
D
I
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
C
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
A
D
 
G
K
 
S
Q
 
S
I
 
I
-
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
P
 
S
S
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
W
G
 
S
A
 
H
N
 
N
F
 
F
A
 
T
H
 
N
M
 
M
I
 
L
G
 
G
Q
 
Y
K
 
T
E
 
D
-
 
A
E
 
Q
Y
 
F
K
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
M
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
|
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
|
N
V
 
V
S
|
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
S
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
|
L
H
|
H
G
 
G
L
 
L
A
|
A
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
G
W
 
W
T
 
L
L
 
A
K
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
E
 
K
K
 
A
Y
 
A
C
 
G
K
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
S
P
 
-
T
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
I
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
W
 
W
D
 
N
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
|
V
I
x
V
P
 
P
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
A
|
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
C
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
L
K
 
P
D
 
G
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
V
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
K
x
A
T
x
A
K
x
A
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
|
N
V
 
V
D
|
D
A
 
A
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
Y
 
M
D
 
N
F
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
|
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
V
M
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
W
D
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
P
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
M
T
 
S
T
 
T

3cscA Structure of ternary complexes of citrate synthase with d-and l- malate: mechanistic implications (see paper)
48% identity, 97% coverage: 3:427/440 of query aligns to 6:423/429 of 3cscA

query
sites
3cscA
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
V
L
 
L
K
 
A
Q
 
A
K
 
L
I
 
I
E
 
P
E
 
K
H
 
E
R
 
Q
P
 
A
R
 
R
T
 
I
T
 
K
R
 
T
L
 
F
V
 
R
K
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
K
 
G
V
 
T
K
 
A
I
 
L
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
M
C
 
S
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
|
R
D
 
G
I
 
M
R
 
K
S
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
Y
D
 
E
I
 
T
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
F
T
 
S
I
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
C
F
 
Q
A
 
K
A
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
G
P
 
G
G
 
G
S
 
G
N
 
E
Y
 
P
P
 
L
T
 
P
V
 
E
E
 
G
S
 
L
F
 
F
W
 
W
Y
 
-
M
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
S
E
 
W
V
 
L
V
 
S
A
 
K
E
 
E
W
 
W
K
 
A
T
 
K
R
 
R
Q
 
A
E
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
S
Y
 
H
V
 
V
F
 
V
D
 
T
V
 
M
L
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
F
P
 
P
R
 
T
D
 
N
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
S
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
N
F
 
F
A
 
A
G
 
R
F
 
A
Y
 
Y
N
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
I
F
 
L
N
 
-
K
 
R
M
 
T
T
 
K
A
 
Y
W
 
W
E
 
E
Y
 
M
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
D
 
S
A
 
A
S
 
M
D
 
D
I
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
C
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
A
D
 
G
K
 
S
Q
 
S
I
 
I
-
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
P
 
S
S
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
W
G
 
S
A
 
H
N
 
N
F
 
F
A
 
T
H
 
N
M
 
M
I
 
L
G
 
G
Q
 
Y
K
 
T
E
 
D
-
 
A
E
 
Q
Y
 
F
K
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
M
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
|
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
|
N
V
 
V
S
|
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
S
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
|
L
H
|
H
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
G
W
 
W
T
 
L
L
 
A
K
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
E
 
K
K
 
A
Y
 
A
C
 
G
K
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
S
P
 
-
T
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
I
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
W
 
W
D
 
N
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
|
V
I
x
V
P
 
P
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
A
|
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
C
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
L
K
 
P
D
 
G
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
V
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
K
x
A
T
x
A
K
x
A
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
|
N
V
 
V
D
|
D
A
 
A
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
Y
 
M
D
 
N
F
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
|
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
V
M
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
W
D
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
P
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
M
T
 
S
T
 
T

2cscA Structure of ternary complexes of citrate synthase with d-and l- malate: mechanistic implications (see paper)
48% identity, 97% coverage: 3:427/440 of query aligns to 6:423/429 of 2cscA

query
sites
2cscA
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
V
L
 
L
K
 
A
Q
 
A
K
 
L
I
 
I
E
 
P
E
 
K
H
 
E
R
 
Q
P
 
A
R
 
R
T
 
I
T
 
K
R
 
T
L
 
F
V
 
R
K
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
K
 
G
V
 
T
K
 
A
I
 
L
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
M
C
 
S
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
|
R
D
 
G
I
 
M
R
 
K
S
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
Y
D
 
E
I
 
T
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
F
T
 
S
I
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
C
F
 
Q
A
 
K
A
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
G
P
 
G
G
 
G
S
 
G
N
 
E
Y
 
P
P
 
L
T
 
P
V
 
E
E
 
G
S
 
L
F
 
F
W
 
W
Y
 
-
M
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
S
E
 
W
V
 
L
V
 
S
A
 
K
E
 
E
W
 
W
K
 
A
T
 
K
R
 
R
Q
 
A
E
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
S
Y
 
H
V
 
V
F
 
V
D
 
T
V
 
M
L
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
F
P
 
P
R
 
T
D
 
N
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
S
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
N
F
 
F
A
 
A
G
 
R
F
 
A
Y
 
Y
N
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
I
F
 
L
N
 
-
K
 
R
M
 
T
T
 
K
A
 
Y
W
 
W
E
 
E
Y
 
M
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
D
 
S
A
 
A
S
 
M
D
 
D
I
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
C
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
A
D
 
G
K
 
S
Q
 
S
I
 
I
-
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
P
 
S
S
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
W
G
 
S
A
 
H
N
 
N
F
 
F
A
 
T
H
 
N
M
 
M
I
 
L
G
 
G
Q
 
Y
K
 
T
E
 
D
-
 
A
E
 
Q
Y
 
F
K
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
M
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
|
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
|
N
V
 
V
S
|
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
S
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
|
L
H
|
H
G
|
G
L
 
L
A
|
A
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
G
W
 
W
T
 
L
L
 
A
K
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
E
 
K
K
 
A
Y
 
A
C
 
G
K
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
S
P
 
-
T
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
I
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
W
 
W
D
 
N
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
|
V
I
x
V
P
 
P
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
A
|
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
C
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
L
K
 
P
D
 
G
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
V
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
K
x
A
T
x
A
K
x
A
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
|
N
V
 
V
D
|
D
A
 
A
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
Y
 
M
D
 
N
F
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
|
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
V
M
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
W
D
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
P
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
M
T
 
S
T
 
T

1cscA Structure of ternary complexes of citrate synthase with d-and l- malate: mechanistic implications (see paper)
48% identity, 97% coverage: 3:427/440 of query aligns to 6:423/429 of 1cscA

query
sites
1cscA
L
 
L
K
 
K
E
 
D
T
 
V
L
 
L
K
 
A
Q
 
A
K
 
L
I
 
I
E
 
P
E
 
K
H
 
E
R
 
Q
P
 
A
R
 
R
T
 
I
T
 
K
R
 
T
L
 
F
V
 
R
K
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
K
 
G
V
 
T
K
 
A
I
 
L
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
M
C
 
S
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
|
R
D
 
G
I
 
M
R
 
K
S
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
Y
D
 
E
I
 
T
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
F
T
 
S
I
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
C
F
 
Q
A
 
K
A
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
G
P
 
G
G
 
G
S
 
G
N
 
E
Y
 
P
P
 
L
T
 
P
V
 
E
E
 
G
S
 
L
F
 
F
W
 
W
Y
 
-
M
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
T
E
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
S
E
 
W
V
 
L
V
 
S
A
 
K
E
 
E
W
 
W
K
 
A
T
 
K
R
 
R
Q
 
A
E
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
S
Y
 
H
V
 
V
F
 
V
D
 
T
V
 
M
L
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
F
P
 
P
R
 
T
D
 
N
S
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
S
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
N
F
 
F
A
 
A
G
 
R
F
 
A
Y
 
Y
N
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
I
F
 
L
N
 
-
K
 
R
M
 
T
T
 
K
A
 
Y
W
 
W
E
 
E
Y
 
M
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
D
 
S
A
 
A
S
 
M
D
 
D
I
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
C
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
L
 
N
K
 
L
Y
 
Y
R
 
R
G
 
A
D
 
G
K
 
S
Q
 
S
I
 
I
-
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
D
P
 
S
S
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
W
G
 
S
A
 
H
N
 
N
F
 
F
A
 
T
H
 
N
M
 
M
I
 
L
G
 
G
Q
 
Y
K
 
T
E
 
D
-
 
A
E
 
Q
Y
 
F
K
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
M
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
T
L
 
I
H
 
H
S
 
S
D
 
D
H
|
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
|
N
V
 
V
S
|
S
A
 
A
H
 
H
T
 
T
T
 
S
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
L
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
M
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
|
L
H
|
H
G
|
G
L
 
L
A
|
A
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
G
W
 
W
T
 
L
L
 
A
K
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
E
 
K
K
 
A
Y
 
A
C
 
G
K
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
S
P
 
-
T
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
I
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
Y
L
 
I
W
 
W
D
 
N
T
 
T
L
 
L
N
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
|
V
I
x
V
P
 
P
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
A
|
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
|
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
C
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
F
 
F
C
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
H
P
 
-
G
 
-
L
 
L
K
 
P
D
 
G
Y
 
D
P
 
P
L
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
V
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
K
x
A
T
x
A
K
x
A
N
 
N
P
 
P
W
 
W
P
 
P
N
|
N
V
 
V
D
|
D
A
 
A
Q
 
H
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
L
M
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
Y
 
M
D
 
N
F
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
|
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
V
M
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
W
D
 
S
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
P
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
M
T
 
S
T
 
T

5uquB Crystal structure of mutant 2-methylcitrate synthase (mcsag352a) from aspergillus fumigatus (see paper)
46% identity, 98% coverage: 3:432/440 of query aligns to 6:436/436 of 5uquB

query
sites
5uquB
L
 
L
K
 
K
E
 
T
T
 
A
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
K
 
V
I
 
I
E
 
P
E
 
A
H
 
K
R
 
R
P
 
-
R
 
E
T
 
L
T
 
F
R
 
K
L
 
Q
V
 
V
K
 
K
E
 
E
F
 
R
G
 
S
K
 
D
V
 
E
K
 
V
I
 
I
D
 
G
E
 
E
V
 
V
T
 
K
I
 
V
D
 
A
Q
 
N
C
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
M
R
|
R
D
 
G
I
 
L
R
 
K
S
 
S
L
 
M
V
 
L
T
 
W
D
 
E
I
 
G
S
 
S
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
H
G
 
G
K
 
K
T
 
T
I
 
I
P
 
K
E
 
D
T
 
C
F
 
Q
A
 
K
A
 
E
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
G
P
 
T
G
 
S
S
 
G
N
 
T
Y
 
E
P
 
M
T
 
L
V
 
P
E
 
E
S
 
A
F
 
M
W
 
F
Y
 
W
M
 
L
L
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
V
 
V
P
 
P
T
 
S
E
 
T
A
 
N
Q
 
Q
V
 
V
A
 
R
E
 
A
V
 
F
V
 
S
A
 
R
E
 
E
W
 
L
K
 
A
T
 
E
R
 
Q
Q
 
S
E
 
H
V
 
L
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
H
V
 
I
F
 
L
D
 
D
V
 
L
L
 
I
R
 
K
A
 
S
L
 
F
P
 
P
R
 
R
D
 
S
S
 
M
H
 
H
P
 
P
M
 
M
V
 
T
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
V
L
 
A
T
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
T
D
 
E
S
 
S
K
 
K
F
 
F
A
 
A
G
 
K
F
 
A
Y
 
Y
N
 
E
S
 
K
G
 
G
K
 
-
F
 
L
N
 
S
K
 
K
M
 
A
T
 
D
A
 
Y
W
 
W
E
 
E
Y
 
P
V
 
T
Y
 
F
E
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
I
D
 
S
I
 
L
V
 
L
A
 
A
R
 
K
I
 
I
P
 
P
I
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
L
I
 
V
Y
 
F
N
 
-
L
 
-
K
 
-
Y
 
-
R
 
R
G
 
P
D
 
D
K
 
E
-
 
V
-
 
D
Q
 
Q
I
 
V
-
 
G
-
 
T
-
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
D
P
 
A
S
 
S
L
 
Q
D
 
D
M
 
W
G
 
S
A
 
Y
N
 
N
F
 
F
A
 
A
H
 
E
M
 
L
I
 
L
G
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
K
Q
 
E
K
 
N
E
 
Q
E
 
D
Y
 
F
K
 
H
D
 
D
V
 
L
A
 
L
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
F
 
L
I
 
A
L
 
L
H
 
H
S
 
G
D
 
D
H
 
H
E
 
E
S
 
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
S
|
S
A
 
A
H
 
H
T
 
A
T
 
T
H
 
H
L
 
L
V
 
V
H
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
Y
 
L
A
 
S
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
|
L
H
|
H
G
 
G
L
 
L
A
|
A
N
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
R
W
 
W
T
 
I
L
 
L
K
 
A
F
 
M
Q
 
Q
E
 
D
K
 
K
Y
 
I
C
 
G
K
 
T
D
 
K
V
 
F
E
 
-
P
 
-
T
 
T
E
 
D
E
 
D
L
 
D
I
 
V
K
 
R
A
 
N
A
 
Y
L
 
L
W
 
W
D
 
D
T
 
T
L
 
L
N
 
K
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
|
V
I
x
V
P
 
P
G
|
G
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
A
|
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
P
D
 
D
P
 
P
R
|
R
Y
 
F
T
 
Q
S
 
A
Q
 
L
R
 
M
E
 
D
F
 
F
C
 
A
L
 
A
N
 
T
T
 
R
P
 
P
G
 
D
L
 
V
K
 
L
D
 
A
Y
 
N
P
 
P
L
 
V
F
 
F
K
 
Q
V
 
L
I
 
V
A
 
K
K
 
K
I
 
N
F
 
S
E
 
E
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
E
H
 
H
G
 
G
K
|
K
T
|
T
K
|
K
N
 
N
P
 
P
W
 
H
P
 
P
N
|
N
V
 
V
D
|
D
A
 
A
Q
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
F
M
 
Y
Y
 
H
Y
 
Y
G
 
G
L
 
F
T
 
Q
E
 
Q
Y
 
P
D
 
L
F
 
Y
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
T
F
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
P
M
 
L
A
 
V
N
 
Q
I
 
L
T
 
I
W
 
W
D
 
D
R
 
R
G
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
L
A
 
P
L
 
I
E
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
S
V
 
I
T
 
N
T
 
L
A
 
L
M
 
G
L
 
L
E
 
K
K
 
K

Query Sequence

>WP_012469445.1 NCBI__GCF_000020385.1:WP_012469445.1
MALKETLKQKIEEHRPRTTRLVKEFGKVKIDEVTIDQCIGGARDIRSLVTDISYLDPQEG
IRFRGKTIPETFAALPKAPGSNYPTVESFWYMLLTGDVPTEAQVAEVVAEWKTRQEVPQY
VFDVLRALPRDSHPMVMLSVAMLTLQKDSKFAGFYNSGKFNKMTAWEYVYEDASDIVARI
PIIAAFIYNLKYRGDKQIAIDPSLDMGANFAHMIGQKEEYKDVARMYFILHSDHESGNVS
AHTTHLVHSALSDPYYAYSAGLNGLAGPLHGLANQEVLDWTLKFQEKYCKDVEPTEELIK
AALWDTLNAGQVIPGYGHAVLRKTDPRYTSQREFCLNTPGLKDYPLFKVIAKIFEVAPGV
LTEHGKTKNPWPNVDAQSGVIQMYYGLTEYDFYTVLFGVGRALGCMANITWDRGLGYALE
RPKSVTTAMLEKWAEAGGRN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory