SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012469824.1 NCBI__GCF_000020385.1:WP_012469824.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P58350 Aspartate aminotransferase; AAT; AspAT; Putative 2-aminoadipate transaminase; Transaminase A; EC 2.6.1.1; EC 2.6.1.39 from Rhizobium meliloti (strain 1021) (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
51% identity, 99% coverage: 4:398/399 of query aligns to 15:409/410 of P58350

query
sites
P58350
A
 
A
D
 
S
R
 
R
V
 
I
N
 
S
K
 
S
I
 
I
Q
 
G
P
 
V
S
 
S
P
 
E
T
 
I
L
 
L
A
 
K
I
 
I
D
 
G
A
 
A
K
 
R
A
 
A
K
 
A
A
 
A
L
 
M
K
 
K
A
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
K
D
 
P
V
 
V
V
 
I
G
 
I
F
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
E
H
 
H
I
 
V
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
G
 
A
K
 
S
K
 
D
A
 
A
I
 
I
D
 
H
A
 
R
G
 
G
F
 
E
T
 
T
R
 
K
Y
 
Y
M
 
T
P
 
A
V
 
L
G
 
D
G
 
G
A
 
T
D
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
K
A
 
A
I
 
I
I
 
R
A
 
E
K
 
K
M
 
F
K
 
Q
R
 
R
D
 
E
H
 
N
N
 
G
L
 
L
E
 
A
Y
 
Y
T
 
E
R
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
T
V
 
V
A
 
A
C
 
T
G
 
G
A
 
A
K
 
K
H
 
Q
T
 
I
L
 
L
Y
 
F
N
 
N
I
 
A
S
 
M
Q
 
M
A
 
A
L
 
S
I
 
L
Q
 
D
E
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
I
P
 
P
G
 
T
P
 
P
Y
 
Y
W
 
W
V
 
T
S
 
S
Y
 
Y
P
 
S
D
 
D
Q
 
I
I
 
V
V
 
H
L
 
I
A
 
C
G
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
P
V
 
V
F
 
L
I
 
I
M
 
A
T
 
C
D
 
D
E
 
A
S
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
F
K
 
R
I
 
L
T
 
T
P
 
A
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
D
 
E
K
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
K
 
R
T
 
T
R
 
R
Y
 
W
L
 
V
I
 
L
L
 
L
N
 
N
S
 
S
P
 
P
C
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
A
T
 
A
Y
 
Y
S
 
S
K
 
A
E
 
A
E
 
D
L
 
Y
A
 
R
A
 
P
L
 
L
G
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
R
H
 
H
E
 
P
H
 
H
V
 
V
L
 
W
V
 
L
V
 
L
A
 
V
D
 
D
D
 
D
I
 
M
Y
 
Y
E
 
E
R
 
H
L
 
I
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
L
 
F
S
 
R
F
 
F
Y
 
V
N
 
T
I
 
P
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
V
 
E
P
 
P
A
 
G
L
 
L
K
 
K
S
 
N
R
 
R
T
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
V
S
 
S
K
|
K
T
 
A
Y
 
Y
A
 
A
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
G
G
 
G
P
 
P
K
 
R
E
 
E
L
 
L
M
 
I
A
 
K
A
 
A
M
 
M
T
 
A
K
 
V
M
 
V
Q
 
Q
S
 
S
Q
 
Q
S
 
A
T
 
T
S
 
S
N
 
C
A
 
P
T
 
S
S
 
S
I
 
I
A
 
S
Q
 
Q
K
 
A
A
 
A
S
 
S
V
 
V
E
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
E
 
D
P
 
F
V
 
L
A
 
K
A
 
E
M
 
R
C
 
T
V
 
E
E
 
S
F
 
F
E
 
Q
K
 
R
R
 
R
R
 
R
T
 
D
Y
 
L
I
 
V
V
 
V
E
 
N
R
 
G
L
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
I
P
 
D
G
 
G
V
 
L
S
 
D
C
 
C
F
 
R
K
 
V
S
 
P
N
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
V
 
T
F
 
F
P
 
S
N
 
G
F
 
C
S
 
A
G
 
G
V
 
V
Y
 
L
G
 
G
K
 
K
T
 
V
T
 
T
P
 
P
G
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
R
I
 
I
E
 
K
T
 
T
S
 
D
S
 
T
D
 
D
F
 
F
A
 
C
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
A
K
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
S
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
L
D
 
S
R
 
P
Y
 
F
A
 
F
R
 
R
L
 
I
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
I
 
T
S
 
S
M
 
E
E
 
A
N
 
E
I
 
L
K
 
K
K
 
E
G
 
A
M
 
L
D
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
A
E
 
A
A
 
A
I
 
C
K
 
D
N
 
R
L
 
L

6f35A Crystal structure of the aspartate aminotranferase from rhizobium meliloti (see paper)
51% identity, 99% coverage: 4:398/399 of query aligns to 5:399/400 of 6f35A

query
sites
6f35A
A
 
A
D
 
S
R
 
R
V
 
I
N
 
S
K
 
S
I
 
I
Q
 
G
P
 
V
S
 
S
P
 
E
T
 
I
L
 
L
A
 
K
I
 
I
D
 
G
A
 
A
K
 
R
A
 
A
K
 
A
A
 
A
L
 
M
K
 
K
A
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
K
D
 
P
V
 
V
V
 
I
G
 
I
F
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
E
H
 
H
I
 
V
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
G
 
A
K
 
S
K
 
D
A
 
A
I
 
I
D
 
H
A
 
R
G
 
G
F
 
E
T
 
T
R
 
K
Y
 
Y
M
 
T
P
 
A
V
 
L
G
 
D
G
 
G
A
 
T
D
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
K
A
 
A
I
 
I
I
 
R
A
 
E
K
 
K
M
 
F
K
 
Q
R
 
R
D
 
E
H
 
N
N
 
G
L
 
L
E
 
A
Y
 
Y
T
 
E
R
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
T
V
 
V
A
 
A
C
 
T
G
|
G
A
|
A
K
|
K
H
 
Q
T
 
I
L
 
L
Y
 
F
N
 
N
I
 
A
S
 
M
Q
 
M
A
 
A
L
 
S
I
 
L
Q
 
D
E
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
I
P
 
P
G
 
T
P
 
P
Y
 
Y
W
 
W
V
 
T
S
 
S
Y
 
Y
P
 
S
D
 
D
Q
 
I
I
 
V
V
 
H
L
 
I
A
 
C
G
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
P
V
 
V
F
 
L
I
 
I
M
 
A
T
 
C
D
 
D
E
 
A
S
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
F
K
 
R
I
 
L
T
 
T
P
 
A
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
D
 
E
K
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
K
 
R
T
 
T
R
 
R
Y
 
W
L
 
V
I
 
L
L
 
L
N
 
N
S
 
S
P
 
P
C
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
A
T
 
A
Y
 
Y
S
 
S
K
 
A
E
 
A
E
 
D
L
 
Y
A
 
R
A
 
P
L
 
L
G
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
R
H
 
H
E
 
P
H
 
H
V
 
V
L
 
W
V
 
L
V
 
L
A
 
V
D
|
D
D
 
D
I
x
M
Y
|
Y
E
 
E
R
 
H
L
 
I
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
L
 
F
S
 
R
F
 
F
Y
 
V
N
 
T
I
 
P
A
 
A
Q
 
Q
V
 
L
V
 
E
P
 
P
A
 
G
L
 
L
K
 
K
S
 
N
R
 
R
T
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
V
S
|
S
K
|
K
T
 
A
Y
 
Y
A
 
A
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
G
G
 
G
P
 
P
K
 
R
E
 
E
L
 
L
M
 
I
A
 
K
A
 
A
M
 
M
T
 
A
K
 
V
M
 
V
Q
 
Q
S
 
S
Q
 
Q
S
 
A
T
 
T
S
 
S
N
 
C
A
 
P
T
 
S
S
 
S
I
 
I
A
 
S
Q
 
Q
K
 
A
A
 
A
S
 
S
V
 
V
E
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
E
 
D
P
 
F
V
 
L
A
 
K
A
 
E
M
 
R
C
 
T
V
 
E
E
 
S
F
 
F
E
 
Q
K
 
R
R
 
R
R
 
R
T
 
D
Y
 
L
I
 
V
V
 
V
E
 
N
R
 
G
L
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
I
P
 
D
G
 
G
V
 
L
S
 
D
C
 
C
F
 
R
K
 
V
S
 
P
N
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
V
 
T
F
 
F
P
 
S
N
 
G
F
 
C
S
 
A
G
 
G
V
 
V
Y
 
L
G
 
G
K
 
K
T
 
V
T
 
T
P
 
P
G
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
R
I
 
I
E
 
K
T
 
T
S
 
D
S
 
T
D
 
D
F
 
F
A
 
C
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
A
K
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
S
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
L
D
 
S
R
 
P
Y
 
F
A
 
F
R
 
R
L
 
I
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
I
 
T
S
 
S
M
 
E
E
 
A
N
 
E
I
 
L
K
 
K
K
 
E
G
 
A
M
 
L
D
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
A
E
 
A
A
 
A
I
 
C
K
 
D
N
 
R
L
 
L

Q02635 Aspartate/prephenate aminotransferase; AspAT / PAT; Transaminase A; EC 2.6.1.1; EC 2.6.1.79 from Rhizobium meliloti (strain 1021) (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
51% identity, 98% coverage: 3:392/399 of query aligns to 4:393/400 of Q02635

query
sites
Q02635
L
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
A
V
 
L
N
 
S
K
 
R
I
 
V
Q
x
K
P
 
P
S
 
S
P
 
A
T
 
T
L
 
I
A
 
A
I
 
V
D
 
S
A
 
Q
K
 
K
A
 
A
K
 
R
A
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
V
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
D
H
 
N
I
 
I
R
 
K
E
 
K
A
 
A
G
 
A
K
 
I
K
 
D
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
R
G
 
G
F
 
E
T
 
T
R
 
K
Y
 
Y
M
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
S
G
 
G
A
 
I
D
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
I
I
 
A
A
 
K
K
 
K
M
 
F
K
 
K
R
 
R
D
 
E
H
 
N
N
 
N
L
 
L
E
 
D
Y
 
Y
T
 
T
R
 
A
D
 
A
E
 
Q
I
 
T
S
 
I
V
 
V
A
 
G
C
 
T
G
 
G
A
 
G
K
 
K
H
 
Q
T
 
I
L
 
L
Y
 
F
N
 
N
I
 
A
S
 
F
Q
 
M
A
 
A
L
 
T
I
 
L
Q
 
N
E
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
A
P
 
P
Y
 
Y
W
 
W
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
Q
 
M
I
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
C
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
V
F
 
F
I
 
V
M
 
P
T
 
T
D
 
R
E
 
Q
S
 
E
T
 
N
G
 
N
F
 
F
K
 
K
I
 
L
T
 
K
P
 
A
E
 
E
Q
 
D
L
 
L
D
 
D
K
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
K
 
K
T
 
T
R
 
K
Y
 
W
L
 
F
I
 
V
L
 
F
N
 
N
S
 
S
P
 
P
C
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
A
T
 
A
Y
 
Y
S
 
S
K
 
H
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
T
E
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
M
K
 
K
H
 
H
E
 
P
H
 
H
V
 
V
L
 
W
V
 
V
V
 
L
A
 
T
D
 
D
D
 
D
I
 
M
Y
 
Y
E
 
E
R
 
H
L
 
L
I
 
T
Y
 
Y
D
 
G
G
 
D
L
 
F
S
 
R
F
 
F
Y
 
A
N
 
T
I
 
P
A
 
V
Q
 
E
V
 
V
V
 
E
P
 
P
A
 
G
L
 
L
K
 
Y
S
 
E
R
 
R
T
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
M
N
 
N
G
 
G
V
 
V
S
 
S
K
 
K
T
 
A
Y
 
Y
A
 
A
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
A
G
 
G
P
 
P
K
 
L
E
 
H
L
 
L
M
 
I
A
 
K
A
 
A
M
 
M
T
 
D
K
 
M
M
 
I
Q
 
Q
S
 
G
Q
 
Q
S
 
Q
T
 
T
S
 
S
N
 
G
A
 
A
T
 
A
S
 
S
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
K
 
W
A
 
A
S
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
E
 
D
P
 
F
V
 
I
A
 
G
A
 
R
M
 
N
C
 
K
V
 
E
E
 
I
F
 
F
E
 
Q
K
 
G
R
 
R
R
 
R
T
 
D
Y
 
L
I
 
V
V
 
V
E
 
S
R
 
M
L
 
L
N
 
N
A
 
Q
M
 
A
P
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
S
C
 
C
F
 
P
K
 
T
S
 
P
N
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
F
 
Y
P
 
P
N
 
S
F
 
C
S
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
I
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
A
P
 
P
G
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
V
I
 
I
E
 
E
T
 
T
S
 
D
S
 
E
D
 
D
F
 
F
A
 
V
A
 
S
Y
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
D
 
T
A
 
E
K
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
H
G
 
G
V
 
S
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
L
D
 
G
R
 
P
Y
 
N
A
 
F
R
 
R
L
 
I
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
I
 
T
S
 
S
M
 
E
E
 
A
N
 
L
I
 
L
K
 
E
K
 
E
G
 
A
M
 
C
D
 
R
R
 
R
I
 
I
E
 
Q

6f77A Crystal structure of the prephenate aminotransferase from rhizobium meliloti (see paper)
51% identity, 98% coverage: 3:392/399 of query aligns to 3:392/399 of 6f77A

query
sites
6f77A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
A
V
 
L
N
 
S
K
 
R
I
 
V
Q
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
A
T
 
T
L
 
I
A
 
A
I
 
V
D
 
S
A
 
Q
K
 
K
A
 
A
K
 
R
A
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
V
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
D
H
 
N
I
 
I
R
 
K
E
 
K
A
 
A
G
 
A
K
 
I
K
 
D
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
R
G
 
G
F
 
E
T
 
T
R
 
K
Y
 
Y
M
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
S
G
 
G
A
 
I
D
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
I
I
 
A
A
 
K
K
 
K
M
 
F
K
 
K
R
 
R
D
 
E
H
 
N
N
 
N
L
 
L
E
 
D
Y
 
Y
T
 
T
R
 
A
D
 
A
E
 
Q
I
 
T
S
 
I
V
 
V
A
 
G
C
 
T
G
|
G
A
x
G
K
|
K
H
 
Q
T
 
I
L
 
L
Y
 
F
N
 
N
I
 
A
S
 
F
Q
 
M
A
 
A
L
 
T
I
 
L
Q
 
N
E
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
A
P
 
P
Y
 
Y
W
|
W
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
Q
 
M
I
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
C
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
V
F
 
F
I
 
V
M
 
P
T
 
T
D
 
R
E
 
Q
S
 
E
T
 
N
G
 
N
F
 
F
K
 
K
I
 
L
T
 
K
P
 
A
E
 
E
Q
 
D
L
 
L
D
 
D
K
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
K
 
K
T
 
T
R
 
K
Y
 
W
L
 
F
I
 
V
L
 
F
N
|
N
S
 
S
P
 
P
C
 
S
N
|
N
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
A
T
 
A
Y
 
Y
S
 
S
K
 
H
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
T
E
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
M
K
 
K
H
 
H
E
 
P
H
 
H
V
 
V
L
 
W
V
 
V
V
 
L
A
 
T
D
|
D
D
 
D
I
 
M
Y
|
Y
E
 
E
R
 
H
L
 
L
I
 
T
Y
 
Y
D
 
G
G
 
D
L
 
F
S
 
R
F
 
F
Y
 
A
N
 
T
I
 
P
A
 
V
Q
 
E
V
 
V
V
 
E
P
 
P
A
 
G
L
 
L
K
 
Y
S
 
E
R
 
R
T
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
M
N
 
N
G
 
G
V
 
V
S
|
S
K
|
K
T
 
A
Y
 
Y
A
 
A
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
A
G
 
G
P
 
P
K
 
L
E
 
H
L
 
L
M
 
I
A
 
K
A
 
A
M
 
M
T
 
D
K
 
M
M
 
I
Q
 
Q
S
 
G
Q
 
Q
S
 
Q
T
 
T
S
 
S
N
 
G
A
 
A
T
 
A
S
 
S
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
K
 
W
A
 
A
S
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
E
 
D
P
 
F
V
 
I
A
 
G
A
 
R
M
 
N
C
 
K
V
 
E
E
 
I
F
 
F
E
 
Q
K
 
G
R
 
R
R
 
R
T
 
D
Y
 
L
I
 
V
V
 
V
E
 
S
R
 
M
L
 
L
N
 
N
A
 
Q
M
 
A
P
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
S
C
 
C
F
 
P
K
 
T
S
 
P
N
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
F
 
Y
P
 
P
N
 
S
F
 
C
S
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
I
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
A
P
 
P
G
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
V
I
 
I
E
 
E
T
 
T
S
 
D
S
 
E
D
 
D
F
 
F
A
 
V
A
 
S
Y
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
D
 
T
A
 
E
K
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
H
G
 
G
V
 
S
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
L
D
 
G
R
 
P
Y
 
N
A
 
F
R
 
R
L
 
I
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
I
 
T
S
 
S
M
 
E
E
 
A
N
 
L
I
 
L
K
 
E
K
 
E
G
 
A
M
 
C
D
 
R
R
 
R
I
 
I
E
 
Q

1j32A Aspartate aminotransferase from phormidium lapideum
46% identity, 100% coverage: 1:398/399 of query aligns to 1:387/388 of 1j32A

query
sites
1j32A
M
 
M
K
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
A
R
 
R
V
 
V
N
 
E
K
 
S
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
S
 
S
P
 
M
T
 
T
L
 
L
A
 
I
I
 
I
D
 
D
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
M
K
 
K
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
C
G
 
S
F
 
F
G
 
S
A
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
K
H
 
H
I
 
I
R
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
A
K
 
K
K
 
A
A
 
A
I
 
L
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
F
 
K
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
M
 
G
P
 
P
V
 
A
G
 
A
G
 
G
A
 
E
D
 
P
D
 
R
L
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
I
I
 
A
A
 
Q
K
 
K
M
 
L
K
 
Q
R
 
R
D
 
D
H
 
N
N
 
G
L
 
L
E
 
C
Y
 
Y
T
 
G
R
 
A
D
 
D
E
 
N
I
 
I
S
 
L
V
 
V
A
 
T
C
 
N
G
|
G
A
x
G
K
|
K
H
 
Q
T
 
S
L
 
I
Y
 
F
N
 
N
I
 
L
S
 
M
Q
 
L
A
 
A
L
 
M
I
 
I
Q
 
E
E
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
I
P
 
P
G
 
A
P
 
P
Y
 
F
W
|
W
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
Q
 
M
I
 
V
V
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
V
F
 
I
I
 
L
M
 
P
T
 
T
D
 
T
E
 
V
S
 
E
T
 
T
G
 
Q
F
 
F
K
 
K
I
 
V
T
 
S
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
L
 
I
D
 
R
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
K
 
K
T
 
T
R
 
K
Y
 
L
L
 
L
I
 
V
L
 
F
N
 
N
S
 
T
P
 
P
C
 
S
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
M
T
 
V
Y
 
Y
S
 
T
K
 
P
E
 
D
E
 
E
L
 
V
A
 
R
A
 
A
L
 
I
G
 
A
E
 
Q
V
 
V
L
 
A
L
 
V
K
 
E
H
 
-
E
 
A
H
 
G
V
 
L
L
 
W
V
 
V
V
 
L
A
 
S
D
|
D
D
 
E
I
|
I
Y
|
Y
E
 
E
R
 
K
L
 
I
I
 
L
Y
 
Y
D
 
D
G
 
D
L
 
A
S
 
Q
F
 
H
Y
 
L
N
 
S
I
 
I
A
 
G
Q
 
A
V
 
A
V
 
S
P
 
P
A
 
E
L
 
A
K
 
Y
S
 
E
R
 
R
T
 
S
I
 
V
V
 
V
V
 
C
N
 
S
G
 
G
V
 
F
S
 
A
K
|
K
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
I
 
V
G
 
G
Y
 
F
A
 
L
C
 
A
G
 
G
P
 
P
K
 
V
E
 
P
L
 
L
M
 
V
A
 
K
A
 
A
M
 
A
T
 
T
K
 
K
M
 
I
Q
 
Q
S
 
G
Q
 
H
S
 
S
T
 
T
S
 
S
N
 
N
A
 
V
T
 
C
S
 
T
I
 
F
A
 
A
Q
 
Q
K
 
Y
A
 
G
S
 
A
V
 
I
E
 
A
A
 
A
L
 
Y
N
 
E
G
 
N
P
 
S
Q
 
Q
E
 
D
P
 
C
V
 
V
A
 
Q
A
 
E
M
 
M
C
 
L
V
 
A
E
 
A
F
 
F
E
 
A
K
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
R
Y
 
Y
I
 
M
V
 
L
E
 
D
R
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
L
S
 
E
C
 
C
F
 
P
K
 
K
S
 
P
N
 
D
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
V
 
M
F
 
F
P
 
P
N
 
S
F
 
I
S
 
A
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
K
K
 
T
I
 
G
E
 
R
T
 
S
S
 
S
S
 
L
D
 
D
F
 
F
A
 
C
A
 
S
Y
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
D
D
 
Q
A
 
H
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
L
 
T
V
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
A
D
 
D
R
 
D
Y
 
C
A
 
I
R
 
R
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
I
 
T
S
 
D
M
 
L
E
 
D
N
 
T
I
 
I
K
 
K
K
 
R
G
 
G
M
 
M
D
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
E
 
K
A
 
F
I
 
L
K
 
H
N
 
G
L
 
I

8wkjA The crystal structure of aspartate aminotransferases lpg0070 from legionella pneumophila (see paper)
48% identity, 98% coverage: 1:392/399 of query aligns to 3:387/391 of 8wkjA

query
sites
8wkjA
M
 
I
K
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
K
R
 
R
V
 
V
N
 
Q
K
 
K
I
 
V
Q
 
K
P
 
-
S
 
S
P
 
P
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
A
A
 
Q
L
 
M
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
L
G
 
G
A
 
T
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
H
 
H
I
 
I
R
 
K
E
 
L
A
 
A
G
 
A
K
 
I
K
 
S
A
 
A
I
 
I
D
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
D
T
 
T
R
 
K
Y
 
Y
M
 
T
P
 
A
V
 
V
G
 
D
G
 
G
A
 
I
D
 
V
D
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
E
A
 
A
I
 
V
I
 
K
A
 
N
K
 
K
M
 
F
K
 
K
R
 
R
D
 
D
H
 
N
N
 
E
L
 
L
E
 
D
Y
 
Y
T
 
Q
R
 
L
D
 
N
E
 
Q
I
 
I
S
 
L
V
 
V
A
 
S
C
 
V
G
|
G
A
x
G
K
|
K
H
 
Q
T
 
S
L
 
C
Y
 
Y
N
 
N
I
 
L
S
 
C
Q
 
Q
A
 
A
L
 
Y
I
 
L
Q
 
N
E
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
I
P
 
P
G
 
A
P
 
P
Y
 
Y
W
|
W
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
 
M
I
 
V
V
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
D
G
 
G
T
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
I
I
 
I
M
 
E
T
 
T
D
 
T
E
 
P
S
 
A
T
 
Q
G
 
R
F
 
Y
K
 
K
I
 
I
T
 
N
P
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
D
 
E
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
K
 
K
T
 
T
R
 
R
Y
 
M
L
 
I
I
 
F
L
 
L
N
|
N
S
 
S
P
 
P
C
 
S
N
|
N
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
I
T
 
A
Y
 
Y
S
 
T
K
 
Q
E
 
N
E
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
E
L
 
L
G
 
G
E
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
K
K
 
K
H
 
H
E
 
P
H
 
Q
V
 
I
L
 
L
V
 
I
V
 
A
A
 
T
D
|
D
D
 
D
I
 
M
Y
|
Y
E
 
E
R
 
H
L
 
I
I
 
I
Y
 
W
D
 
S
G
 
Q
L
 
-
S
 
P
F
 
F
Y
 
T
N
 
N
I
 
I
A
 
L
Q
 
N
V
 
A
V
 
C
P
 
P
A
 
E
L
 
L
K
 
Y
S
 
D
R
 
R
T
 
T
I
 
I
V
 
V
V
 
L
N
 
N
G
 
G
V
 
V
S
|
S
K
|
K
T
 
A
Y
 
Y
A
 
A
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
A
G
 
G
P
 
P
K
 
A
E
 
P
L
 
L
M
 
I
A
 
N
A
 
A
M
 
M
T
 
K
K
 
T
M
 
I
Q
 
Q
S
 
S
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
S
 
S
N
 
N
A
 
P
T
 
C
S
 
S
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
S
 
A
V
 
V
E
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
P
 
S
Q
 
N
E
 
E
P
 
S
V
 
I
A
 
E
A
 
E
M
 
M
C
 
V
V
 
N
E
 
A
F
 
F
E
 
H
K
 
Q
R
 
R
R
 
H
T
 
D
Y
 
Y
I
 
V
V
 
A
E
 
D
R
 
R
L
 
L
N
 
Q
A
 
S
M
 
I
P
 
D
G
 
G
V
 
I
S
 
E
C
 
V
F
 
I
K
 
P
S
 
A
N
 
D
G
 
G
A
 
T
F
 
F
Y
 
Y
V
 
I
F
 
F
P
 
P
N
 
S
F
 
V
S
 
Q
G
 
A
V
 
I
Y
 
I
G
 
E
K
 
K
T
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
R
K
 
G
I
 
Y
E
 
A
T
 
N
S
 
D
S
 
I
D
 
E
F
 
F
A
 
S
A
 
E
Y
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
N
D
 
E
A
 
V
K
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
S
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
T
D
 
E
R
 
G
Y
 
C
A
 
I
R
 
R
L
 
I
S
 
S
Y
 
F
A
 
A
I
 
T
S
 
G
M
 
I
E
 
D
N
 
T
I
 
L
K
 
K
K
 
D
G
 
A
M
 
L
D
 
N
R
 
R
I
 
L
E
 
Q

5wmlA Arabidopsis thaliana prephenate aminotransferase mutant- k306a (see paper)
44% identity, 100% coverage: 1:399/399 of query aligns to 1:401/404 of 5wmlA

query
sites
5wmlA
M
 
M
K
 
S
L
 
L
A
 
S
D
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
Q
K
 
S
I
 
L
Q
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
K
T
|
T
L
x
M
A
 
V
I
 
I
D
 
T
A
 
D
K
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
T
L
 
L
K
 
V
A
 
Q
Q
 
S
G
 
G
V
 
V
D
 
P
V
 
V
V
 
I
G
 
R
F
 
L
G
 
A
A
|
A
G
|
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
K
H
 
V
I
 
V
R
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
I
K
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
R
A
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
M
 
T
P
 
L
V
 
N
G
 
A
G
 
G
A
 
I
D
 
T
D
 
E
L
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
I
I
 
C
A
 
R
K
 
K
M
 
L
K
 
K
R
 
E
D
 
E
H
 
N
N
 
G
L
 
L
E
 
S
Y
 
Y
T
 
A
R
 
P
D
 
D
E
 
Q
I
 
I
S
 
L
V
 
V
A
 
S
C
 
N
G
|
G
A
|
A
K
|
K
H
 
Q
T
 
S
L
|
L
Y
 
L
N
 
Q
I
 
A
S
 
V
Q
 
L
A
 
A
L
 
V
I
 
C
Q
 
S
E
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
I
P
 
P
G
 
A
P
 
P
Y
 
Y
W
|
W
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
P
 
T
D
 
E
Q
 
Q
I
 
A
V
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
D
G
 
A
T
 
T
P
 
P
V
 
V
F
 
V
I
 
I
M
 
P
T
 
T
D
 
K
E
 
I
S
 
S
T
 
N
G
 
N
F
 
F
K
 
L
I
 
L
T
 
D
P
 
P
E
 
K
Q
 
D
L
 
L
D
 
E
K
 
S
A
 
K
I
 
L
T
 
T
P
 
E
K
 
K
T
 
S
R
 
R
Y
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
L
N
 
C
S
 
S
P
 
P
C
 
S
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
V
Y
 
Y
S
 
P
K
 
K
E
 
S
E
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
E
L
 
I
G
 
A
E
 
R
V
 
I
L
 
I
L
 
A
K
 
K
H
 
H
E
 
P
H
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
L
A
 
S
D
|
D
D
 
E
I
 
I
Y
|
Y
E
 
E
R
 
H
L
 
I
I
 
I
Y
 
Y
D
 
A
G
 
P
L
 
A
S
 
T
F
 
H
Y
 
T
N
 
S
I
 
F
A
 
A
Q
 
S
V
 
-
V
 
L
P
 
P
A
 
D
L
 
M
K
 
Y
S
 
E
R
 
R
T
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
F
S
|
S
K
 
A
T
 
A
Y
 
F
A
 
A
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
L
C
 
A
G
 
G
P
 
P
K
 
K
E
 
H
L
 
I
M
 
V
A
 
A
A
 
A
M
 
C
T
 
S
K
 
K
M
 
L
Q
 
Q
S
 
G
Q
 
Q
S
 
V
T
 
S
S
 
S
N
 
G
A
 
A
T
 
S
S
 
S
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
S
 
G
V
 
V
E
 
A
A
 
A
L
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
G
N
 
K
G
 
A
P
 
G
Q
 
G
E
 
E
P
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
E
M
 
M
C
 
V
V
 
K
E
 
A
F
 
Y
E
 
R
K
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
D
Y
 
F
I
 
L
V
 
V
E
 
K
R
 
S
L
 
L
N
 
G
A
 
D
M
 
I
P
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
K
C
 
I
F
 
S
K
 
E
S
 
P
N
 
Q
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
|
Y
V
 
L
F
 
F
P
 
I
N
 
D
F
 
F
S
 
S
G
 
A
V
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
K
 
S
T
 
E
T
 
A
P
 
E
G
 
G
G
 
F
K
 
G
K
 
L
I
 
I
E
 
N
T
 
D
S
 
S
S
 
S
D
 
S
F
 
L
A
 
A
A
 
L
Y
 
Y
L
 
F
L
 
L
E
 
D
D
 
K
A
 
F
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
D
D
 
D
R
 
S
Y
 
C
A
 
I
R
|
R
L
 
I
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
I
 
T
S
 
S
M
 
L
E
 
D
N
 
V
I
 
L
K
 
Q
K
 
A
G
 
A
M
 
V
D
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
R
E
 
K
A
 
A
I
 
L
K
 
E
N
 
P
L
 
L
K
 
R

5wmhA Arabidopsis thaliana prephenate aminotransferase (see paper)
45% identity, 99% coverage: 3:398/399 of query aligns to 2:399/399 of 5wmhA

query
sites
5wmhA
L
 
L
A
 
S
D
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
Q
K
 
S
I
 
L
Q
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
K
T
 
T
L
 
M
A
 
V
I
 
I
D
 
T
A
 
D
K
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
T
L
 
L
K
 
V
A
 
Q
Q
 
S
G
 
G
V
 
V
D
 
P
V
 
V
V
 
I
G
 
R
F
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
K
H
 
V
I
 
V
R
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
I
K
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
R
A
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
M
 
T
P
 
L
V
 
N
G
 
A
G
 
G
A
 
I
D
 
T
D
 
E
L
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
I
I
 
C
A
 
R
K
 
K
M
 
L
K
 
K
R
 
E
D
 
E
H
 
N
N
 
G
L
 
L
E
 
S
Y
 
Y
T
 
A
R
 
P
D
 
D
E
 
Q
I
 
I
S
 
L
V
 
V
A
 
S
C
 
N
G
|
G
A
|
A
K
|
K
H
 
Q
T
 
S
L
 
L
Y
 
L
N
 
Q
I
 
A
S
 
V
Q
 
L
A
 
A
L
 
V
I
 
C
Q
 
S
E
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
I
P
 
P
G
 
A
P
 
P
Y
 
Y
W
|
W
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
P
 
T
D
 
E
Q
 
Q
I
 
A
V
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
D
G
 
A
T
 
T
P
 
P
V
 
V
F
 
V
I
 
I
M
 
P
T
 
T
D
 
K
E
 
I
S
 
S
T
 
N
G
 
N
F
 
F
K
 
L
I
 
L
T
 
D
P
 
P
E
 
K
Q
 
D
L
 
L
D
 
E
K
 
S
A
 
K
I
 
L
T
 
T
P
 
E
K
 
K
T
 
S
R
 
R
Y
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
L
N
 
C
S
 
S
P
 
P
C
 
S
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
V
Y
 
Y
S
 
P
K
 
K
E
 
S
E
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
E
L
 
I
G
 
A
E
 
R
V
 
I
L
 
I
L
 
A
K
 
K
H
 
H
E
 
P
H
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
L
A
 
S
D
|
D
D
 
E
I
|
I
Y
|
Y
E
 
E
R
 
H
L
 
I
I
 
I
Y
 
Y
D
 
A
G
 
P
L
 
A
S
 
T
F
 
H
Y
 
T
N
 
S
I
 
F
A
 
A
Q
 
S
V
 
-
V
 
L
P
 
P
A
 
D
L
 
M
K
 
Y
S
 
E
R
 
R
T
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
F
S
|
S
K
|
K
T
 
A
Y
 
F
A
 
A
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
L
C
 
A
G
 
G
P
 
P
K
 
K
E
 
H
L
 
I
M
 
V
A
 
A
A
 
A
M
 
C
T
 
S
K
 
K
M
 
L
Q
 
Q
S
 
G
Q
 
Q
S
 
V
T
 
S
S
 
S
N
 
G
A
 
A
T
 
S
S
 
S
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
S
 
G
V
 
V
E
 
A
A
 
A
L
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
G
N
 
K
G
 
A
P
 
G
Q
 
G
E
 
E
P
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
E
M
 
M
C
 
V
V
 
K
E
 
A
F
 
Y
E
 
R
K
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
D
Y
 
F
I
 
L
V
 
V
E
 
K
R
 
S
L
 
L
N
 
G
A
 
D
M
 
I
P
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
K
C
 
I
F
 
S
K
 
E
S
 
P
N
 
Q
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
V
 
L
F
 
F
P
 
I
N
 
D
F
 
F
S
 
S
G
 
A
V
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
K
 
S
T
 
E
T
 
A
P
 
E
G
 
G
G
 
F
K
 
G
K
 
L
I
 
I
E
 
N
T
 
D
S
 
S
S
 
S
D
 
S
F
 
L
A
 
A
A
 
L
Y
 
Y
L
 
F
L
 
L
E
 
D
D
 
K
A
 
F
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
D
D
 
D
R
 
S
Y
 
C
A
 
I
R
 
R
L
 
I
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
I
 
T
S
 
S
M
 
L
E
 
D
N
 
V
I
 
L
K
 
Q
K
 
A
G
 
A
M
 
V
D
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
R
E
 
K
A
 
A
I
 
L
K
 
E
N
 
P
L
 
L

5wmiA Arabidopsis thaliana prephenate aminotransferase mutant- t84v (see paper)
44% identity, 100% coverage: 1:399/399 of query aligns to 1:400/402 of 5wmiA

query
sites
5wmiA
M
 
M
K
 
S
L
 
L
A
 
S
D
 
P
R
 
R
V
 
V
N
 
Q
K
 
S
I
 
L
Q
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
K
T
x
V
L
 
M
A
 
V
I
 
I
D
 
T
A
 
D
K
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
T
L
 
L
K
 
-
A
 
V
Q
 
S
G
 
G
V
 
V
D
 
P
V
 
V
V
 
I
G
 
R
F
 
L
G
 
A
A
|
A
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
K
H
 
V
I
 
V
R
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
I
K
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
R
A
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
M
 
T
P
 
L
V
 
N
G
 
A
G
 
G
A
 
I
D
 
T
D
 
E
L
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
I
I
 
C
A
 
R
K
 
K
M
 
L
K
 
K
R
 
E
D
 
E
H
 
N
N
 
G
L
 
L
E
 
S
Y
 
Y
T
 
A
R
 
P
D
 
D
E
 
Q
I
 
I
S
 
L
V
 
V
A
 
S
C
 
N
G
 
G
A
 
A
K
 
K
H
 
Q
T
 
S
L
 
L
Y
 
L
N
 
Q
I
 
A
S
 
V
Q
 
L
A
 
A
L
 
V
I
 
C
Q
 
S
E
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
I
P
 
P
G
 
A
P
 
P
Y
 
Y
W
 
W
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
P
 
T
D
 
E
Q
 
Q
I
 
A
V
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
D
G
 
A
T
 
T
P
 
P
V
 
V
F
 
V
I
 
I
M
 
P
T
 
T
D
 
K
E
 
I
S
 
S
T
 
N
G
 
N
F
 
F
K
 
L
I
 
L
T
 
D
P
 
P
E
 
K
Q
 
D
L
 
L
D
 
E
K
 
S
A
 
K
I
 
L
T
 
T
P
 
E
K
 
K
T
 
S
R
 
R
Y
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
L
N
 
C
S
 
S
P
 
P
C
 
S
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
V
Y
 
Y
S
 
P
K
 
K
E
 
S
E
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
E
L
 
I
G
 
A
E
 
R
V
 
I
L
 
I
L
 
A
K
 
K
H
 
H
E
 
P
H
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
L
A
 
S
D
 
D
D
 
E
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
R
 
H
L
 
I
I
 
I
Y
 
Y
D
 
A
G
 
P
L
 
A
S
 
T
F
 
H
Y
 
T
N
 
S
I
 
F
A
 
A
Q
 
S
V
 
-
V
 
L
P
 
P
A
 
D
L
 
M
K
 
Y
S
 
E
R
 
R
T
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
F
S
 
S
K
|
K
T
 
A
Y
 
F
A
 
A
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
L
C
 
A
G
 
G
P
 
P
K
 
K
E
 
H
L
 
I
M
 
V
A
 
A
A
 
A
M
 
C
T
 
S
K
 
K
M
 
L
Q
 
Q
S
 
G
Q
 
Q
S
 
V
T
 
S
S
 
S
N
 
G
A
 
A
T
 
S
S
 
S
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
S
 
G
V
 
V
E
 
A
A
 
A
L
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
G
N
 
K
G
 
A
P
 
G
Q
 
G
E
 
E
P
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
E
M
 
M
C
 
V
V
 
K
E
 
A
F
 
Y
E
 
R
K
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
D
Y
 
F
I
 
L
V
 
V
E
 
K
R
 
S
L
 
L
N
 
G
A
 
D
M
 
I
P
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
K
C
 
I
F
 
S
K
 
E
S
 
P
N
 
Q
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
V
 
L
F
 
F
P
 
I
N
 
D
F
 
F
S
 
S
G
 
A
V
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
K
 
S
T
 
E
T
 
A
P
 
E
G
 
G
G
 
F
K
 
G
K
 
L
I
 
I
E
 
N
T
 
D
S
 
S
S
 
S
D
 
S
F
 
L
A
 
A
A
 
L
Y
 
Y
L
 
F
L
 
L
E
 
D
D
 
K
A
 
F
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
D
D
 
D
R
 
S
Y
 
C
A
 
I
R
|
R
L
 
I
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
I
 
T
S
 
S
M
 
L
E
 
D
N
 
V
I
 
L
K
 
Q
K
 
A
G
 
A
M
 
V
D
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
R
E
 
K
A
 
A
I
 
L
K
 
E
N
 
P
L
 
L
K
 
R

Q56232 Aspartate/prephenate aminotransferase; AspAT / PAT; Transaminase A; EC 2.6.1.1; EC 2.6.1.78 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see 3 papers)
44% identity, 97% coverage: 3:391/399 of query aligns to 4:378/385 of Q56232

query
sites
Q56232
L
 
L
A
 
S
D
 
R
R
 
R
V
 
V
N
 
Q
K
 
A
I
 
M
Q
x
K
P
 
P
S
 
S
P
 
A
T
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
V
D
 
N
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
L
A
 
E
L
 
L
K
 
R
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
V
G
 
A
F
 
L
G
 
T
A
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
E
H
 
H
I
 
V
R
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
A
K
 
R
K
 
R
A
 
A
I
 
L
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
F
 
K
T
 
T
R
 
K
Y
 
Y
M
 
A
P
 
P
V
 
P
G
 
A
G
 
G
A
 
I
D
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
L
I
 
A
A
 
E
K
 
K
M
 
F
K
 
R
R
 
R
D
 
E
H
 
N
N
 
G
L
 
L
E
 
S
Y
 
V
T
 
T
R
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
T
S
 
I
V
 
V
A
 
T
C
 
V
G
 
G
A
 
G
K
 
K
H
 
Q
T
 
A
L
 
L
Y
 
F
N
 
N
I
 
L
S
 
F
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
I
 
L
Q
 
D
E
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
L
G
 
S
P
 
P
Y
 
Y
W
 
W
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
Q
 
M
I
 
V
V
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
V
P
 
V
V
 
V
F
 
E
I
 
V
M
 
E
T
 
T
D
 
L
E
 
P
S
 
E
T
 
E
G
 
G
F
 
F
K
 
V
I
 
P
T
 
D
P
 
P
E
 
E
Q
 
R
L
 
V
D
 
R
K
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
K
 
R
T
 
T
R
 
K
Y
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
V
N
 
N
S
 
S
P
 
P
C
 
N
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
V
Y
 
Y
S
 
P
K
 
K
E
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
R
V
 
L
L
 
A
L
 
V
K
 
E
H
 
H
E
 
D
H
 
F
V
 
Y
L
 
L
V
 
-
V
 
V
A
 
S
D
 
D
D
 
E
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
R
 
H
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
L
 
E
S
 
H
F
 
F
Y
 
-
N
 
S
I
 
P
A
 
G
Q
 
R
V
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
-
L
 
-
K
 
-
S
 
E
R
 
H
T
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
A
S
 
A
K
|
K
T
 
A
Y
 
F
A
 
A
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
C
G
 
G
P
 
P
K
 
K
E
 
E
L
 
V
M
 
I
A
 
K
A
 
A
M
 
M
T
 
A
K
 
S
M
 
V
Q
 
S
S
 
S
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
S
 
T
N
 
S
A
 
P
T
 
D
S
 
T
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
K
 
W
A
 
A
S
 
T
V
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
T
G
 
N
P
 
Q
Q
 
E
E
 
A
P
 
S
V
 
R
A
 
A
-
 
F
-
 
V
A
 
E
M
 
M
C
 
A
V
 
R
E
 
E
-
 
A
F
 
Y
E
 
R
K
 
R
R
 
R
R
 
R
T
 
D
Y
 
L
I
 
L
V
 
L
E
 
E
R
 
G
L
 
L
N
 
T
A
 
A
M
 
L
P
 
-
G
 
G
V
 
L
S
 
K
C
 
A
F
 
V
K
 
R
S
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
F
 
L
P
 
M
N
 
D
F
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
T
T
 
S
P
 
P
G
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
I
 
I
E
 
A
T
 
P
S
 
D
S
 
E
D
 
V
F
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
E
L
 
R
L
 
L
E
 
L
D
 
E
A
 
A
K
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
T
A
 
D
F
 
F
G
 
A
D
 
A
D
 
F
R
 
G
Y
 
H
A
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
I
 
T
S
 
S
M
 
E
E
 
E
N
 
N
I
 
L
K
 
R
K
 
K
G
 
A
M
 
L
D
 
E
R
 
R
I
 
F

1bkgA Aspartate aminotransferase from thermus thermophilus with maleate (see paper)
44% identity, 97% coverage: 3:391/399 of query aligns to 4:378/382 of 1bkgA

query
sites
1bkgA
L
 
L
A
 
S
D
 
R
R
 
R
V
 
V
N
 
Q
K
 
A
I
 
M
Q
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
A
T
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
V
D
 
N
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
L
A
 
E
L
 
L
K
 
R
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
V
G
 
A
F
 
L
G
 
T
A
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
E
H
 
H
I
 
V
R
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
A
K
 
R
K
 
R
A
 
A
I
 
L
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
F
 
K
T
 
T
R
 
K
Y
 
Y
M
 
A
P
 
P
V
 
P
G
 
A
G
 
G
A
 
I
D
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
L
I
 
A
A
 
E
K
 
K
M
 
F
K
 
R
R
 
R
D
 
E
H
 
N
N
 
G
L
 
L
E
 
S
Y
 
V
T
 
T
R
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
T
S
 
I
V
 
V
A
 
T
C
 
V
G
|
G
A
x
G
K
|
K
H
 
Q
T
 
A
L
 
L
Y
 
F
N
 
N
I
 
L
S
 
F
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
I
 
L
Q
 
D
E
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
L
G
 
S
P
 
P
Y
 
Y
W
|
W
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
Q
 
M
I
 
V
V
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
V
P
 
V
V
 
V
F
 
E
I
 
V
M
 
E
T
 
T
D
 
L
E
 
P
S
 
E
T
 
E
G
 
G
F
 
F
K
 
V
I
 
P
T
 
D
P
 
P
E
 
E
Q
 
R
L
 
V
D
 
R
K
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
K
 
R
T
 
T
R
 
K
Y
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
V
N
|
N
S
 
S
P
 
P
C
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
V
Y
 
Y
S
 
P
K
 
K
E
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
R
V
 
L
L
 
A
L
 
V
K
 
E
H
 
H
E
 
D
H
 
F
V
 
Y
L
 
L
V
 
-
V
 
V
A
 
S
D
|
D
D
 
E
I
|
I
Y
|
Y
E
 
E
R
 
H
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
L
 
E
S
 
H
F
 
F
Y
 
-
N
 
S
I
 
P
A
 
G
Q
 
R
V
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
-
L
 
-
K
 
-
S
 
E
R
 
H
T
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
A
S
 
A
K
|
K
T
 
A
Y
 
F
A
 
A
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
C
G
 
G
P
 
P
K
 
K
E
 
E
L
 
V
M
 
I
A
 
K
A
 
A
M
 
M
T
 
A
K
 
S
M
 
V
Q
 
S
S
 
S
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
S
 
T
N
 
S
A
 
P
T
 
D
S
 
T
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
K
 
W
A
 
A
S
 
T
V
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
T
G
 
N
P
 
Q
Q
 
E
E
 
A
P
 
S
V
 
R
A
 
A
-
 
F
-
 
V
A
 
E
M
 
M
C
 
A
V
 
R
E
 
E
-
 
A
F
 
Y
E
 
R
K
 
R
R
 
R
R
 
R
T
 
D
Y
 
L
I
 
L
V
 
L
E
 
E
R
 
G
L
 
L
N
 
T
A
 
A
M
 
L
P
 
-
G
 
G
V
 
L
S
 
K
C
 
A
F
 
V
K
 
R
S
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
F
 
L
P
 
M
N
 
D
F
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
T
T
 
S
P
 
P
G
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
I
 
I
E
 
A
T
 
P
S
 
D
S
 
E
D
 
V
F
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
E
L
 
R
L
 
L
E
 
L
D
 
E
A
 
A
K
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
T
A
 
D
F
 
F
G
 
A
D
 
A
D
 
F
R
 
G
Y
 
H
A
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
I
 
T
S
 
S
M
 
E
E
 
E
N
 
N
I
 
L
K
 
R
K
 
K
G
 
A
M
 
L
D
 
E
R
 
R
I
 
F

1bjwA Aspartate aminotransferase from thermus thermophilus (see paper)
44% identity, 97% coverage: 3:391/399 of query aligns to 4:378/382 of 1bjwA

query
sites
1bjwA
L
 
L
A
 
S
D
 
R
R
 
R
V
 
V
N
 
Q
K
 
A
I
 
M
Q
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
A
T
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
V
D
 
N
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
L
A
 
E
L
 
L
K
 
R
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
V
G
 
A
F
 
L
G
 
T
A
 
A
G
|
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
E
H
 
H
I
 
V
R
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
A
K
 
R
K
 
R
A
 
A
I
 
L
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
F
 
K
T
 
T
R
 
K
Y
 
Y
M
 
A
P
 
P
V
 
P
G
 
A
G
 
G
A
 
I
D
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
L
I
 
A
A
 
E
K
 
K
M
 
F
K
 
R
R
 
R
D
 
E
H
 
N
N
 
G
L
 
L
E
 
S
Y
 
V
T
 
T
R
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
T
S
 
I
V
 
V
A
 
T
C
 
V
G
 
G
A
 
G
K
 
K
H
 
Q
T
 
A
L
 
L
Y
 
F
N
 
N
I
 
L
S
 
F
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
I
 
L
Q
 
D
E
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
L
G
 
S
P
 
P
Y
 
Y
W
|
W
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
Q
 
M
I
 
V
V
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
V
P
 
V
V
 
V
F
 
E
I
 
V
M
 
E
T
 
T
D
 
L
E
 
P
S
 
E
T
 
E
G
 
G
F
 
F
K
 
V
I
 
P
T
 
D
P
 
P
E
 
E
Q
 
R
L
 
V
D
 
R
K
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
K
 
R
T
 
T
R
 
K
Y
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
V
N
 
N
S
 
S
P
 
P
C
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
V
Y
 
Y
S
 
P
K
 
K
E
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
R
V
 
L
L
 
A
L
 
V
K
 
E
H
 
H
E
 
D
H
 
F
V
 
Y
L
 
L
V
 
-
V
 
V
A
 
S
D
|
D
D
 
E
I
|
I
Y
 
Y
E
 
E
R
 
H
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
L
 
E
S
 
H
F
 
F
Y
 
-
N
 
S
I
 
P
A
 
G
Q
 
R
V
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
-
L
 
-
K
 
-
S
 
E
R
 
H
T
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
A
S
 
A
K
|
K
T
 
A
Y
 
F
A
 
A
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
C
G
 
G
P
 
P
K
 
K
E
 
E
L
 
V
M
 
I
A
 
K
A
 
A
M
 
M
T
 
A
K
 
S
M
 
V
Q
 
S
S
 
S
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
S
 
T
N
 
S
A
 
P
T
 
D
S
 
T
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
K
 
W
A
 
A
S
 
T
V
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
T
G
 
N
P
 
Q
Q
 
E
E
 
A
P
 
S
V
 
R
A
 
A
-
 
F
-
 
V
A
 
E
M
 
M
C
 
A
V
 
R
E
 
E
-
 
A
F
 
Y
E
 
R
K
 
R
R
 
R
R
 
R
T
 
D
Y
 
L
I
 
L
V
 
L
E
 
E
R
 
G
L
 
L
N
 
T
A
 
A
M
 
L
P
 
-
G
 
G
V
 
L
S
 
K
C
 
A
F
 
V
K
 
R
S
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
F
 
L
P
 
M
N
 
D
F
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
T
T
 
S
P
 
P
G
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
I
 
I
E
 
A
T
 
P
S
 
D
S
 
E
D
 
V
F
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
E
L
 
R
L
 
L
E
 
L
D
 
E
A
 
A
K
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
T
A
 
D
F
 
F
G
 
A
D
 
A
D
 
F
R
 
G
Y
 
H
A
 
V
R
|
R
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
I
 
T
S
 
S
M
 
E
E
 
E
N
 
N
I
 
L
K
 
R
K
 
K
G
 
A
M
 
L
D
 
E
R
 
R
I
 
F

1b5oA Thermus thermophilus aspartate aminotransferase single mutant 1 (see paper)
43% identity, 97% coverage: 3:391/399 of query aligns to 4:378/382 of 1b5oA

query
sites
1b5oA
L
 
L
A
 
S
D
 
R
R
 
R
V
 
V
N
 
Q
K
 
A
I
 
M
Q
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
A
T
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
V
D
 
N
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
L
A
 
E
L
 
L
K
 
R
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
V
G
 
A
F
 
L
G
 
T
A
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
E
H
 
H
I
 
V
R
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
A
K
 
R
K
 
R
A
 
A
I
 
L
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
F
 
K
T
 
T
R
 
K
Y
 
Y
M
 
A
P
 
P
V
 
P
G
 
A
G
 
G
A
 
I
D
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
L
I
 
A
A
 
E
K
 
K
M
 
F
K
 
R
R
 
R
D
 
E
H
 
N
N
 
G
L
 
L
E
 
S
Y
 
V
T
 
T
R
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
T
S
 
I
V
 
V
A
 
T
C
 
V
G
|
G
A
x
G
K
x
S
H
 
Q
T
 
A
L
 
L
Y
 
F
N
 
N
I
 
L
S
 
F
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
I
 
L
Q
 
D
E
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
L
G
 
S
P
 
P
Y
 
Y
W
|
W
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
Q
 
M
I
 
V
V
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
V
P
 
V
V
 
V
F
 
E
I
 
V
M
 
E
T
 
T
D
 
L
E
 
P
S
 
E
T
 
E
G
 
G
F
 
F
K
 
V
I
 
P
T
 
D
P
 
P
E
 
E
Q
 
R
L
 
V
D
 
R
K
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
K
 
R
T
 
T
R
 
K
Y
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
V
N
 
N
S
 
S
P
 
P
C
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
V
Y
 
Y
S
 
P
K
 
K
E
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
R
V
 
L
L
 
A
L
 
V
K
 
E
H
 
H
E
 
D
H
 
F
V
 
Y
L
 
L
V
 
-
V
 
V
A
 
S
D
|
D
D
 
E
I
|
I
Y
|
Y
E
 
E
R
 
H
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
L
 
E
S
 
H
F
 
F
Y
 
-
N
 
S
I
 
P
A
 
G
Q
 
R
V
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
-
L
 
-
K
 
-
S
 
E
R
 
H
T
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
A
S
x
A
K
|
K
T
 
A
Y
 
F
A
 
A
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
C
G
 
G
P
 
P
K
 
K
E
 
E
L
 
V
M
 
I
A
 
K
A
 
A
M
 
M
T
 
A
K
 
S
M
 
V
Q
 
S
S
 
S
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
S
 
T
N
 
S
A
 
P
T
 
D
S
 
T
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
K
 
W
A
 
A
S
 
T
V
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
T
G
 
N
P
 
Q
Q
 
E
E
 
A
P
 
S
V
 
R
A
 
A
-
 
F
-
 
V
A
 
E
M
 
M
C
 
A
V
 
R
E
 
E
-
 
A
F
 
Y
E
 
R
K
 
R
R
 
R
R
 
R
T
 
D
Y
 
L
I
 
L
V
 
L
E
 
E
R
 
G
L
 
L
N
 
T
A
 
A
M
 
L
P
 
-
G
 
G
V
 
L
S
 
K
C
 
A
F
 
V
K
 
R
S
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
F
 
L
P
 
M
N
 
D
F
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
T
T
 
S
P
 
P
G
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
I
 
I
E
 
A
T
 
P
S
 
D
S
 
E
D
 
V
F
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
E
L
 
R
L
 
L
E
 
L
D
 
E
A
 
A
K
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
T
A
 
D
F
 
F
G
 
A
D
 
A
D
 
F
R
 
G
Y
 
H
A
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
I
 
T
S
 
S
M
 
E
E
 
E
N
 
N
I
 
L
K
 
R
K
 
K
G
 
A
M
 
L
D
 
E
R
 
R
I
 
F

1gc4A Thermus thermophilus aspartate aminotransferase tetra mutant 2 complexed with aspartate (see paper)
43% identity, 97% coverage: 3:391/399 of query aligns to 4:378/382 of 1gc4A

query
sites
1gc4A
L
 
L
A
 
S
D
 
R
R
 
R
V
 
V
N
 
Q
K
 
A
I
 
M
Q
 
K
P
 
P
S
 
D
P
 
A
T
 
V
L
 
V
A
 
A
I
 
V
D
 
N
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
L
A
 
E
L
 
L
K
 
R
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
V
G
 
A
F
 
L
G
 
T
A
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
E
H
 
H
I
 
V
R
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
A
K
 
R
K
 
R
A
 
A
I
 
L
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
F
 
K
T
 
T
R
 
K
Y
|
Y
M
 
A
P
 
P
V
 
P
G
 
A
G
 
G
A
 
I
D
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
L
I
 
A
A
 
E
K
 
K
M
 
F
K
 
R
R
 
R
D
 
E
H
 
N
N
 
G
L
 
L
E
 
S
Y
 
V
T
 
T
R
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
T
S
 
I
V
 
V
A
 
T
C
 
V
G
|
G
A
x
G
K
x
S
H
 
Q
T
 
A
L
 
L
Y
 
F
N
 
N
I
 
L
S
 
F
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
I
 
L
Q
 
D
E
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
L
G
 
S
P
 
P
Y
 
Y
W
|
W
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
Q
 
M
I
 
V
V
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
V
P
 
V
V
 
V
F
 
E
I
 
V
M
 
E
T
 
T
D
 
L
E
 
P
S
 
E
T
 
E
G
 
G
F
 
F
K
 
V
I
 
P
T
 
D
P
 
P
E
 
E
Q
 
R
L
 
V
D
 
R
K
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
K
 
R
T
 
T
R
 
K
Y
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
V
N
 
N
S
 
S
P
 
P
C
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
V
Y
 
Y
S
 
P
K
 
K
E
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
R
V
 
L
L
 
A
L
 
V
K
 
E
H
 
H
E
 
D
H
 
F
V
 
Y
L
 
L
V
 
-
V
 
V
A
 
S
D
|
D
D
 
E
I
 
I
Y
|
Y
E
 
E
R
 
H
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
L
 
E
S
 
H
F
 
F
Y
 
-
N
 
S
I
 
P
A
 
G
Q
 
R
V
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
-
L
 
-
K
 
-
S
 
E
R
 
H
T
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
A
S
 
A
K
 
K
T
 
A
Y
 
F
A
 
A
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
C
G
 
G
P
 
P
K
 
K
E
 
E
L
 
V
M
 
I
A
 
K
A
 
A
M
 
M
T
 
A
K
 
S
M
 
V
Q
 
S
S
x
R
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
S
 
T
N
 
S
A
 
P
T
 
D
S
 
T
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
K
 
W
A
 
A
S
 
T
V
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
T
G
 
N
P
 
Q
Q
 
E
E
 
A
P
 
S
V
 
R
A
 
A
-
 
F
-
 
V
A
 
E
M
 
M
C
 
A
V
 
R
E
 
E
-
 
A
F
 
Y
E
 
R
K
 
R
R
 
R
R
 
R
T
 
D
Y
 
L
I
 
L
V
 
L
E
 
E
R
 
G
L
 
L
N
 
T
A
 
A
M
 
L
P
 
-
G
 
G
V
 
L
S
 
K
C
 
A
F
 
V
K
 
R
S
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
|
Y
V
 
V
F
 
L
P
 
M
N
 
D
F
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
T
T
 
S
P
 
P
G
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
I
 
I
E
 
A
T
 
P
S
 
D
S
 
E
D
 
V
F
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
E
L
 
R
L
 
L
E
 
L
D
 
E
A
 
A
K
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
T
A
 
D
F
 
F
G
 
A
D
 
A
D
 
F
R
 
G
Y
 
H
A
 
V
R
|
R
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
I
 
T
S
 
S
M
 
E
E
 
E
N
 
N
I
 
L
K
 
R
K
 
K
G
 
A
M
 
L
D
 
E
R
 
R
I
 
F

1gc3A Thermus thermophilus aspartate aminotransferase tetra mutant 2 complexed with tryptophan (see paper)
43% identity, 97% coverage: 3:391/399 of query aligns to 4:378/382 of 1gc3A

query
sites
1gc3A
L
 
L
A
 
S
D
 
R
R
 
R
V
 
V
N
 
Q
K
 
A
I
 
M
Q
 
K
P
 
P
S
 
D
P
 
A
T
x
V
L
 
V
A
 
A
I
 
V
D
x
N
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
L
A
 
E
L
 
L
K
 
R
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
V
G
 
A
F
 
L
G
x
T
A
|
A
G
|
G
E
|
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
E
H
 
H
I
 
V
R
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
A
K
 
R
K
 
R
A
 
A
I
 
L
D
 
A
A
 
Q
G
 
G
F
 
K
T
 
T
R
 
K
Y
 
Y
M
 
A
P
 
P
V
 
P
G
 
A
G
 
G
A
 
I
D
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
L
I
 
A
A
 
E
K
 
K
M
 
F
K
 
R
R
 
R
D
 
E
H
 
N
N
 
G
L
 
L
E
 
S
Y
 
V
T
 
T
R
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
T
S
 
I
V
 
V
A
 
T
C
 
V
G
 
G
A
x
G
K
x
S
H
 
Q
T
 
A
L
 
L
Y
 
F
N
 
N
I
 
L
S
 
F
Q
 
Q
A
 
A
L
 
I
I
 
L
Q
 
D
E
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
L
G
 
S
P
 
P
Y
 
Y
W
|
W
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
Q
 
M
I
 
V
V
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
V
P
 
V
V
 
V
F
 
E
I
 
V
M
 
E
T
 
T
D
 
L
E
 
P
S
 
E
T
 
E
G
 
G
F
 
F
K
 
V
I
 
P
T
 
D
P
 
P
E
 
E
Q
 
R
L
 
V
D
 
R
K
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
K
 
R
T
 
T
R
 
K
Y
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
V
N
 
N
S
 
S
P
 
P
C
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
V
Y
 
Y
S
 
P
K
 
K
E
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
R
V
 
L
L
 
A
L
 
V
K
 
E
H
 
H
E
 
D
H
 
F
V
 
Y
L
 
L
V
 
-
V
 
V
A
 
S
D
|
D
D
 
E
I
 
I
Y
|
Y
E
 
E
R
 
H
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
L
 
E
S
 
H
F
 
F
Y
 
-
N
 
S
I
 
P
A
 
G
Q
 
R
V
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
-
L
 
-
K
 
-
S
 
E
R
 
H
T
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
A
S
 
A
K
|
K
T
 
A
Y
 
F
A
 
A
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
C
G
 
G
P
 
P
K
 
K
E
 
E
L
 
V
M
 
I
A
 
K
A
 
A
M
 
M
T
 
A
K
 
S
M
 
V
Q
 
S
S
 
R
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
S
 
T
N
 
S
A
 
P
T
 
D
S
 
T
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
K
 
W
A
 
A
S
 
T
V
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
T
G
 
N
P
 
Q
Q
 
E
E
 
A
P
 
S
V
 
R
A
 
A
-
 
F
-
 
V
A
 
E
M
 
M
C
 
A
V
 
R
E
 
E
-
 
A
F
 
Y
E
 
R
K
 
R
R
 
R
R
 
R
T
 
D
Y
 
L
I
 
L
V
 
L
E
 
E
R
 
G
L
 
L
N
 
T
A
 
A
M
 
L
P
 
-
G
 
G
V
 
L
S
 
K
C
 
A
F
 
V
K
 
R
S
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
|
Y
V
 
V
F
 
L
P
 
M
N
 
D
F
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
T
T
 
S
P
 
P
G
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
I
 
I
E
 
A
T
 
P
S
 
D
S
 
E
D
 
V
F
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
E
L
 
R
L
 
L
E
 
L
D
 
E
A
 
A
K
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
T
A
 
D
F
 
F
G
 
A
D
 
A
D
 
F
R
 
G
Y
 
H
A
 
V
R
|
R
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
I
 
T
S
 
S
M
 
E
E
 
E
N
 
N
I
 
L
K
 
R
K
 
K
G
 
A
M
 
L
D
 
E
R
 
R
I
 
F

1gdeA Crystal structure of pyrococcus protein a-1 e-form (see paper)
38% identity, 99% coverage: 3:399/399 of query aligns to 2:386/388 of 1gdeA

query
sites
1gdeA
L
 
L
A
 
S
D
 
D
R
 
R
V
 
L
N
 
E
K
 
L
I
 
V
Q
 
S
P
 
A
S
 
S
P
 
E
T
 
I
L
 
R
A
 
K
I
 
L
D
 
F
A
 
D
K
 
I
A
 
A
K
 
A
A
 
G
L
 
M
K
 
K
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
D
V
 
V
V
 
I
G
 
S
F
 
L
G
 
G
A
 
I
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
H
 
H
I
 
I
R
 
K
E
 
E
A
 
Y
G
 
A
K
 
K
K
 
E
A
 
A
I
 
L
D
 
D
A
 
K
G
 
G
F
 
L
T
 
T
R
 
H
Y
 
Y
M
 
G
P
 
P
V
 
N
G
 
I
G
 
G
A
 
L
D
 
L
D
 
E
L
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
I
I
 
A
A
 
E
K
 
K
M
 
L
K
 
K
R
 
K
D
 
Q
H
 
N
N
 
G
L
 
I
E
 
E
Y
 
A
T
 
D
-
 
P
R
 
K
D
 
T
E
 
E
I
 
I
S
 
M
V
 
V
A
 
L
C
 
L
G
|
G
A
|
A
K
x
N
H
 
Q
T
 
A
L
 
F
Y
 
L
N
 
M
I
 
G
S
 
L
Q
 
S
A
 
A
L
 
F
I
 
L
Q
 
K
E
 
D
G
 
G
D
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
T
P
 
P
Y
 
A
W
x
F
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
P
 
A
D
 
P
Q
 
A
I
 
V
V
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
K
P
 
P
V
 
V
F
 
E
I
 
V
M
 
P
T
 
T
D
 
Y
E
 
E
S
 
E
T
 
D
G
 
E
F
 
F
K
 
R
I
 
L
T
 
N
P
 
V
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
D
 
K
K
 
K
A
 
Y
I
 
V
T
 
T
P
 
D
K
 
K
T
 
T
R
 
R
Y
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
I
N
|
N
S
 
S
P
 
P
C
 
C
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
V
Y
 
L
S
 
T
K
 
K
E
 
K
E
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
E
L
 
I
G
 
A
E
 
D
V
 
F
L
 
V
L
 
V
K
 
E
H
 
H
E
 
D
H
 
-
V
 
L
L
 
I
V
 
V
V
 
I
A
 
S
D
|
D
D
 
E
I
 
V
Y
|
Y
E
 
E
R
 
H
L
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
G
 
D
L
 
A
S
 
R
F
 
H
Y
 
Y
N
 
S
I
 
I
A
 
A
Q
 
S
V
 
-
V
 
L
P
 
D
A
 
G
L
 
M
K
 
F
S
 
E
R
 
R
T
 
T
I
 
I
V
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
F
S
|
S
K
|
K
T
 
T
Y
 
F
A
 
A
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
I
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
V
C
 
A
G
 
A
P
 
P
K
 
S
E
 
W
L
 
I
M
 
I
A
 
E
A
 
R
M
 
M
T
 
V
K
 
K
M
 
F
Q
 
Q
S
 
M
Q
 
Y
S
 
N
T
 
A
S
 
T
N
 
C
A
 
P
T
 
V
S
 
T
I
 
F
A
 
I
Q
 
Q
K
 
Y
A
 
A
S
 
A
V
 
A
E
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
K
G
 
D
P
 
E
Q
 
R
-
 
S
-
 
W
E
 
K
P
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
E
M
 
M
C
 
R
V
 
K
E
 
E
F
 
Y
E
 
D
K
 
R
R
 
R
R
 
R
T
 
K
Y
 
L
I
 
V
V
 
W
E
 
K
R
 
R
L
 
L
N
 
N
A
 
E
M
 
M
P
 
-
G
 
G
V
 
L
S
 
P
C
 
T
F
 
V
K
 
K
S
 
P
N
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
V
 
I
F
 
F
P
 
P
N
 
R
F
 
I
-
 
R
-
 
D
S
 
T
G
 
G
V
 
L
Y
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
T
S
 
S
S
 
K
D
 
K
F
 
F
A
 
S
A
 
E
Y
 
L
L
 
M
L
 
L
E
 
K
D
 
E
A
 
A
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
S
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
K
-
 
A
-
 
G
D
 
E
R
 
G
Y
 
Y
A
 
V
R
|
R
L
 
I
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
I
 
T
S
 
A
M
 
Y
E
 
E
N
 
K
I
 
L
K
 
E
K
 
E
G
 
A
M
 
M
D
 
D
R
 
R
I
 
M
E
 
E
E
 
R
A
 
V
I
 
L
K
 
K
N
 
E
L
 
R
K
 
K

1gd9A Crystall structure of pyrococcus protein-a1 (see paper)
38% identity, 99% coverage: 3:399/399 of query aligns to 2:386/388 of 1gd9A

query
sites
1gd9A
L
 
L
A
 
S
D
 
D
R
 
R
V
 
L
N
 
E
K
 
L
I
 
V
Q
 
S
P
 
A
S
 
S
P
 
E
T
 
I
L
 
R
A
 
K
I
 
L
D
 
F
A
 
D
K
 
I
A
 
A
K
 
A
A
 
G
L
 
M
K
 
K
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
D
V
 
V
V
 
I
G
 
S
F
 
L
G
 
G
A
 
I
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
H
 
H
I
 
I
R
 
K
E
 
E
A
 
Y
G
 
A
K
 
K
K
 
E
A
 
A
I
 
L
D
 
D
A
 
K
G
 
G
F
 
L
T
 
T
R
 
H
Y
 
Y
M
 
G
P
 
P
V
 
N
G
 
I
G
 
G
A
 
L
D
 
L
D
 
E
L
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
I
I
 
A
A
 
E
K
 
K
M
 
L
K
 
K
R
 
K
D
 
Q
H
 
N
N
 
G
L
 
I
E
 
E
Y
 
A
T
 
D
-
 
P
R
 
K
D
 
T
E
 
E
I
 
I
S
 
M
V
 
V
A
 
L
C
 
L
G
|
G
A
|
A
K
x
N
H
 
Q
T
 
A
L
 
F
Y
 
L
N
 
M
I
 
G
S
 
L
Q
 
S
A
 
A
L
 
F
I
 
L
Q
 
K
E
 
D
G
 
G
D
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
T
P
 
P
Y
 
A
W
x
F
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
P
 
A
D
 
P
Q
 
A
I
 
V
V
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
K
P
 
P
V
 
V
F
 
E
I
 
V
M
 
P
T
 
T
D
 
Y
E
 
E
S
 
E
T
 
D
G
 
E
F
 
F
K
 
R
I
 
L
T
 
N
P
 
V
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
D
 
K
K
 
K
A
 
Y
I
 
V
T
 
T
P
 
D
K
 
K
T
 
T
R
 
R
Y
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
I
N
 
N
S
 
S
P
 
P
C
 
C
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
V
Y
 
L
S
 
T
K
 
K
E
 
K
E
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
E
L
 
I
G
 
A
E
 
D
V
 
F
L
 
V
L
 
V
K
 
E
H
 
H
E
 
D
H
 
-
V
 
L
L
 
I
V
 
V
V
 
I
A
 
S
D
|
D
D
 
E
I
x
V
Y
|
Y
E
 
E
R
 
H
L
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
G
 
D
L
 
A
S
 
R
F
 
H
Y
 
Y
N
 
S
I
 
I
A
 
A
Q
 
S
V
 
-
V
 
L
P
 
D
A
 
G
L
 
M
K
 
F
S
 
E
R
 
R
T
 
T
I
 
I
V
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
F
S
|
S
K
|
K
T
 
T
Y
 
F
A
 
A
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
I
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
V
C
 
A
G
 
A
P
 
P
K
 
S
E
 
W
L
 
I
M
 
I
A
 
E
A
 
R
M
 
M
T
 
V
K
 
K
M
 
F
Q
 
Q
S
 
M
Q
 
Y
S
 
N
T
 
A
S
 
T
N
 
C
A
 
P
T
 
V
S
 
T
I
 
F
A
 
I
Q
 
Q
K
 
Y
A
 
A
S
 
A
V
 
A
E
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
K
G
 
D
P
 
E
Q
 
R
-
 
S
-
 
W
E
 
K
P
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
E
M
 
M
C
 
R
V
 
K
E
 
E
F
 
Y
E
 
D
K
 
R
R
 
R
R
 
R
T
 
K
Y
 
L
I
 
V
V
 
W
E
 
K
R
 
R
L
 
L
N
 
N
A
 
E
M
 
M
P
 
-
G
 
G
V
 
L
S
 
P
C
 
T
F
 
V
K
 
K
S
 
P
N
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
V
 
I
F
 
F
P
 
P
N
 
R
F
 
I
-
 
R
-
 
D
S
 
T
G
 
G
V
 
L
Y
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
T
S
 
S
S
 
K
D
 
K
F
 
F
A
 
S
A
 
E
Y
 
L
L
 
M
L
 
L
E
 
K
D
 
E
A
 
A
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
S
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
K
-
 
A
-
 
G
D
 
E
R
 
G
Y
 
Y
A
 
V
R
 
R
L
 
I
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
I
 
T
S
 
A
M
 
Y
E
 
E
N
 
K
I
 
L
K
 
E
K
 
E
G
 
A
M
 
M
D
 
D
R
 
R
I
 
M
E
 
E
E
 
R
A
 
V
I
 
L
K
 
K
N
 
E
L
 
R
K
 
K

1o4sB Crystal structure of aspartate aminotransferase (tm1255) from thermotoga maritima at 1.90 a resolution (see paper)
36% identity, 99% coverage: 3:397/399 of query aligns to 10:384/384 of 1o4sB

query
sites
1o4sB
L
 
V
A
 
S
D
 
R
R
 
R
V
 
I
N
 
S
K
 
E
I
 
I
Q
 
P
P
 
I
S
 
S
P
 
K
T
 
T
L
 
M
A
 
E
I
 
L
D
 
D
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
I
A
 
K
Q
 
K
G
 
G
V
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
I
G
 
N
F
 
L
G
 
T
A
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
P
T
 
T
P
 
P
A
 
E
H
 
P
I
 
V
R
 
V
E
 
E
A
 
E
G
 
A
K
 
V
K
 
R
A
 
F
I
 
L
D
 
Q
A
 
K
G
 
G
F
 
E
T
 
V
R
 
K
Y
 
Y
M
 
T
P
 
D
V
 
P
G
 
R
G
 
G
A
 
I
D
 
Y
D
 
E
L
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
G
I
 
I
I
 
A
A
 
K
K
 
R
M
 
I
K
 
G
R
 
E
D
 
R
H
 
Y
N
 
K
L
 
K
E
 
D
Y
 
I
T
 
S
R
 
P
D
 
D
E
 
Q
I
 
V
S
 
V
V
 
V
A
 
T
C
 
N
G
|
G
A
|
A
K
|
K
H
 
Q
T
 
A
L
 
L
Y
 
F
N
 
N
I
 
A
S
 
F
Q
 
M
A
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
D
E
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
F
G
 
S
P
 
P
Y
 
V
W
|
W
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
P
 
I
D
 
P
Q
 
Q
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
V
V
 
N
F
 
V
I
 
V
M
 
E
T
 
T
D
 
F
E
 
M
S
 
S
T
 
K
G
 
N
F
 
F
K
 
Q
I
 
P
T
 
S
P
 
L
E
 
E
Q
 
E
L
 
V
D
 
E
K
 
G
A
 
L
I
 
L
T
 
V
P
 
G
K
 
K
T
 
T
R
 
K
Y
 
A
L
 
V
I
 
L
L
 
I
N
 
N
S
 
S
P
 
P
C
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
V
T
 
V
Y
 
Y
S
 
R
K
 
R
E
 
E
E
 
F
L
 
L
A
 
E
A
 
G
L
 
L
G
 
V
E
 
R
V
 
-
L
 
L
L
 
A
K
 
K
H
 
K
E
 
R
H
 
N
V
 
F
L
 
Y
V
 
I
V
 
I
A
 
S
D
|
D
D
 
E
I
x
V
Y
|
Y
E
 
D
R
 
S
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
D
 
T
G
 
D
L
 
-
S
 
E
F
 
F
Y
 
T
N
 
S
I
 
I
A
 
L
Q
 
D
V
 
V
V
 
S
P
 
E
A
 
G
L
 
F
K
 
-
S
 
D
R
 
R
T
 
I
I
 
V
V
 
Y
V
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
F
S
|
S
K
|
K
T
 
S
Y
 
H
A
 
S
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
A
 
L
C
 
I
G
 
S
P
 
S
K
 
E
E
 
K
L
 
V
M
 
A
A
 
T
A
 
A
M
 
V
T
 
S
K
 
K
M
 
I
Q
 
Q
S
 
S
Q
 
H
S
 
T
T
 
T
S
 
S
N
 
C
A
 
I
T
 
N
S
 
T
I
 
V
A
 
A
Q
 
Q
K
 
Y
A
 
A
S
 
A
V
 
L
E
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
E
G
 
V
P
 
D
Q
 
N
E
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
S
A
 
Y
M
 
M
C
 
V
V
 
Q
E
 
T
F
 
F
E
 
K
K
 
E
R
 
R
R
 
K
T
 
N
Y
 
F
I
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
L
N
 
K
A
 
K
M
 
M
P
 
-
G
 
G
V
 
V
S
 
K
C
 
F
F
 
V
K
 
E
S
 
P
N
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
V
 
L
F
 
F
P
 
F
N
 
K
F
 
V
S
 
R
G
 
G
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
D
S
 
D
S
 
V
D
 
K
F
 
F
A
 
C
A
 
E
Y
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
E
D
 
E
A
 
K
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
S
A
 
A
F
 
F
G
 
L
D
 
K
D
 
P
R
 
G
Y
 
F
A
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
S
Y
 
F
A
 
A
I
 
T
S
 
S
M
 
I
E
 
E
N
 
R
I
 
L
K
 
T
K
 
E
G
 
A
M
 
L
D
 
D
R
 
R
I
 
I
E
 
E
E
 
D
A
 
F
I
 
L
K
 
N
N
 
S

P14909 Aspartate aminotransferase; AspAT; Transaminase A; EC 2.6.1.1 from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see 3 papers)
32% identity, 92% coverage: 26:393/399 of query aligns to 31:393/402 of P14909

query
sites
P14909
K
 
K
A
 
T
Q
 
K
G
 
K
V
 
I
D
 
K
V
 
I
V
 
I
G
 
D
F
 
F
G
 
G
A
 
I
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
L
D
 
P
T
 
T
P
 
F
A
 
K
H
 
R
I
 
I
R
 
R
E
 
D
A
 
A
G
 
A
K
 
K
K
 
E
A
 
A
I
 
L
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
F
 
F
T
 
T
R
 
F
Y
 
Y
M
 
T
P
 
S
V
 
A
G
 
F
G
 
G
A
 
I
D
 
D
D
 
E
L
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
K
I
 
I
I
 
A
A
 
Q
K
 
Y
M
 
L
K
 
N
R
 
T
D
 
R
H
 
Y
N
 
G
L
 
T
E
 
D
Y
 
V
T
 
K
R
 
K
D
 
E
E
 
E
I
 
V
S
 
I
V
 
V
A
 
T
C
 
P
G
 
G
A
 
A
K
 
K
H
 
P
T
 
A
L
 
L
Y
 
F
N
 
L
I
 
V
S
 
F
Q
 
I
A
 
L
L
 
Y
I
 
I
Q
 
N
E
 
P
G
 
S
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
L
P
 
P
G
 
D
P
 
P
Y
 
S
W
 
F
V
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
P
 
A
D
 
E
Q
 
V
I
 
V
V
 
K
L
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
K
P
 
P
V
 
I
F
 
Y
-
 
A
-
 
N
I
 
L
M
 
K
T
 
W
D
 
S
E
 
R
S
 
E
T
 
E
G
 
G
F
 
F
K
 
S
I
 
I
T
 
D
P
 
V
E
 
D
Q
 
D
L
 
L
D
 
Q
K
 
S
A
 
K
I
 
I
T
 
S
P
 
K
K
 
R
T
 
T
R
 
K
Y
 
M
L
 
I
I
 
V
L
 
F
N
 
N
S
 
N
P
 
P
C
 
H
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
T
T
 
L
Y
 
F
S
 
S
K
 
P
E
 
N
E
 
D
L
 
V
A
 
K
A
 
K
L
 
I
G
 
V
E
 
D
V
 
I
L
 
-
L
 
S
K
 
R
H
 
D
E
 
N
H
x
K
V
 
I
L
 
I
V
 
L
V
 
L
A
 
S
D
 
D
D
 
E
I
 
I
Y
 
Y
E
 
D
R
 
N
L
 
F
I
 
V
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
L
 
K
S
 
M
F
 
R
Y
 
S
N
 
T
I
 
L
A
 
E
Q
 
D
V
 
-
V
 
-
P
 
S
A
 
D
L
 
W
K
 
R
S
 
D
R
 
F
T
 
L
I
 
I
V
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
T
Y
 
F
A
 
S
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
I
C
 
V
G
 
A
P
 
K
K
 
R
E
 
E
L
 
I
M
 
I
A
 
Q
A
 
K
M
 
M
T
 
G
K
 
I
M
 
L
Q
 
A
S
 
A
Q
 
N
S
 
V
T
 
Y
S
 
T
N
 
A
A
 
P
T
 
T
S
 
S
I
 
F
A
 
V
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
S
 
A
V
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
F
N
 
D
G
 
T
P
 
F
Q
 
D
E
 
E
P
 
-
V
 
V
A
 
N
A
 
Q
M
 
M
C
 
V
V
 
S
E
 
L
F
 
F
E
 
K
K
 
K
R
 
R
R
 
R
T
 
D
Y
 
V
I
 
M
V
 
Y
E
 
D
R
 
E
L
 
L
N
 
T
A
 
K
M
 
V
P
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
E
C
 
V
F
 
S
K
 
K
S
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
V
 
M
F
 
F
P
 
P
N
 
N
F
 
V
S
 
S
G
 
K
V
 
I
Y
 
L
G
 
K
K
 
T
T
 
S
T
 
G
P
 
F
G
 
D
G
 
V
K
 
K
K
 
S
I
 
L
E
 
-
T
 
-
S
 
-
S
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
A
A
 
I
Y
 
K
L
 
L
L
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
K
K
 
G
V
 
V
A
 
V
L
 
T
V
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
E
A
 
V
F
 
F
G
 
P
D
 
L
D
 
N
-
 
I
-
 
G
-
 
K
R
 
E
Y
 
F
A
 
L
R
 
R
L
 
L
S
 
S
Y
 
F
A
 
A
I
 
V
S
 
N
M
 
E
E
 
E
N
 
V
I
 
I
K
|
K
K
 
E
G
 
G
M
 
I
D
 
Q
R
 
K
I
 
I
E
 
R
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Q58097 (5-formylfuran-3-yl)methyl phosphate transaminase; 4-HFC-P:alanine aminotransferase; EC 2.6.1.108 from Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440) (Methanococcus jannaschii)
33% identity, 98% coverage: 3:395/399 of query aligns to 2:368/370 of Q58097

query
sites
Q58097
L
 
L
A
 
S
D
 
K
R
 
R
V
 
L
N
 
L
K
 
N
I
 
F
Q
 
E
P
 
S
S
 
F
P
 
E
T
 
V
L
 
M
A
 
D
I
 
I
D
 
L
A
 
A
K
 
L
A
 
A
K
 
Q
A
 
K
L
 
L
K
 
E
A
 
S
Q
 
E
G
 
G
V
 
K
D
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
H
F
 
L
G
 
E
A
 
I
G
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
D
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
K
H
 
P
I
 
I
R
 
V
E
 
D
A
 
E
G
 
G
K
 
I
K
 
K
A
 
S
I
 
L
D
 
K
A
 
E
G
 
G
F
 
K
T
 
T
R
 
H
Y
 
Y
M
 
T
P
 
D
V
 
S
G
 
R
G
 
G
A
 
I
D
 
L
D
 
E
L
 
L
K
 
R
D
 
E
A
 
K
I
 
I
I
 
S
A
 
E
K
 
L
M
 
Y
K
 
K
R
 
D
D
 
K
H
 
Y
N
 
K
L
 
A
E
 
D
Y
 
I
T
 
I
R
 
P
D
 
D
E
 
N
I
 
I
S
 
I
V
 
I
A
 
T
C
 
G
G
 
G
A
 
S
K
 
S
H
 
L
T
 
G
L
 
L
Y
 
F
N
 
F
I
 
A
S
 
L
Q
 
S
A
 
S
L
 
I
I
 
I
Q
 
D
E
 
D
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
L
I
 
I
P
 
Q
G
 
N
P
 
P
Y
 
C
W
 
Y
V
 
P
S
 
C
Y
 
Y
P
 
K
D
 
N
Q
 
F
I
 
I
V
 
R
L
 
F
A
 
L
G
 
G
G
 
A
T
 
K
P
 
P
V
 
V
F
 
F
I
 
C
M
 
-
T
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
D
I
 
F
T
 
T
P
 
V
E
 
E
Q
 
S
L
 
L
D
 
E
K
 
E
A
 
A
I
 
L
T
 
S
P
 
D
K
 
K
T
 
T
R
 
K
Y
 
A
L
 
I
I
 
I
L
 
I
N
 
N
S
 
S
P
 
P
C
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
L
G
 
G
S
 
E
T
 
V
Y
 
I
S
 
D
K
 
R
E
 
E
-
 
I
-
 
Y
E
 
E
L
 
F
A
 
A
A
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
H
 
Y
E
 
E
H
 
N
V
 
I
-
 
P
L
 
Y
V
 
I
V
 
I
A
 
S
D
 
D
D
 
E
I
 
I
Y
 
Y
E
 
N
R
 
G
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
L
 
-
S
 
K
F
 
C
Y
 
Y
N
 
S
I
 
A
A
 
I
Q
 
E
V
 
F
V
 
D
P
 
E
A
 
N
L
 
L
K
 
E
S
 
-
R
 
K
T
 
T
I
 
I
V
 
L
V
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
F
S
 
S
K
|
K
T
 
L
Y
 
Y
A
 
A
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
V
C
 
I
G
 
S
P
 
N
K
 
D
E
 
E
L
 
I
M
 
I
A
 
E
A
 
A
M
 
I
T
 
L
K
 
K
M
 
L
Q
 
Q
S
 
Q
Q
 
N
S
 
L
T
 
F
S
 
I
N
 
S
A
 
A
T
 
P
S
 
T
I
 
I
A
 
S
Q
 
Q
K
 
Y
A
 
A
S
 
A
V
 
L
E
 
K
A
 
A
L
 
F
N
 
E
G
 
K
P
 
E
Q
 
T
E
 
E
-
 
R
P
 
E
V
 
I
A
 
N
A
 
S
M
 
M
C
 
I
V
 
K
E
 
E
F
 
F
E
 
D
K
 
R
R
 
R
R
 
R
T
 
R
Y
 
L
I
 
V
V
 
L
E
 
K
R
 
Y
L
 
V
N
 
K
A
 
D
M
 
F
P
 
-
G
 
G
V
 
W
S
 
E
C
 
V
F
 
N
K
 
N
S
 
P
N
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
F
 
F
P
 
P
N
 
N
F
 
I
S
 
G
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
I
 
-
E
 
E
T
 
D
S
 
G
S
 
R
D
 
E
F
 
F
A
 
A
A
 
Y
Y
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
K
D
 
E
A
 
K
K
 
F
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
I
A
 
G
F
 
F
G
 
G
D
 
S
-
 
K
-
 
G
D
 
K
R
 
N
Y
 
Y
A
 
I
R
 
R
L
 
I
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
I
 
N
S
 
S
M
 
Y
E
 
E
N
 
N
I
 
I
K
 
K
K
 
E
G
 
G
M
 
L
D
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
K
E
 
E
A
 
F
I
 
L

Query Sequence

>WP_012469824.1 NCBI__GCF_000020385.1:WP_012469824.1
MKLADRVNKIQPSPTLAIDAKAKALKAQGVDVVGFGAGEPDFDTPAHIREAGKKAIDAGF
TRYMPVGGADDLKDAIIAKMKRDHNLEYTRDEISVACGAKHTLYNISQALIQEGDEVIIP
GPYWVSYPDQIVLAGGTPVFIMTDESTGFKITPEQLDKAITPKTRYLILNSPCNPTGSTY
SKEELAALGEVLLKHEHVLVVADDIYERLIYDGLSFYNIAQVVPALKSRTIVVNGVSKTY
AMTGWRIGYACGPKELMAAMTKMQSQSTSNATSIAQKASVEALNGPQEPVAAMCVEFEKR
RTYIVERLNAMPGVSCFKSNGAFYVFPNFSGVYGKTTPGGKKIETSSDFAAYLLEDAKVA
LVPGVAFGDDRYARLSYAISMENIKKGMDRIEEAIKNLK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory