SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012470844.1 NCBI__GCF_000020385.1:WP_012470844.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4grsA Crystal structure of a chimeric dah7ps (see paper)
53% identity, 98% coverage: 1:330/338 of query aligns to 1:329/333 of 4grsA

query
sites
4grsA
M
|
M
L
 
I
I
 
V
V
 
V
M
 
L
N
 
K
H
 
P
T
 
G
A
 
S
S
 
T
Q
 
E
A
 
E
D
 
D
I
 
I
D
 
R
K
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
K
V
 
L
V
 
A
S
 
E
G
 
S
M
 
Y
G
 
N
F
 
L
T
 
K
A
 
C
A
 
H
P
 
I
I
x
S
P
 
K
G
|
G
G
 
Q
E
|
E
R
|
R
T
 
T
A
x
V
I
 
I
G
|
G
V
x
I
L
x
I
G
|
G
N
 
D
K
x
D
G
 
R
Y
 
Y
V
 
V
D
 
V
D
 
A
S
 
D
T
 
K
I
 
F
R
 
E
D
 
S
L
 
L
P
 
D
G
 
C
V
 
V
Q
 
E
Q
 
S
A
 
V
I
 
V
H
 
R
V
 
V
S
 
L
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
K
 
K
L
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
R
D
 
E
F
 
F
H
 
H
P
 
P
D
 
E
N
 
D
T
 
T
I
 
V
V
 
I
D
 
D
V
 
L
A
 
G
G
 
D
V
 
V
K
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
N
G
 
G
E
 
-
R
 
Y
P
 
F
V
 
T
V
 
I
V
 
I
G
 
A
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
 
S
V
 
I
E
 
E
S
 
S
E
 
R
E
 
D
Q
 
Q
I
 
I
L
 
M
K
 
K
T
 
V
A
 
A
R
 
E
F
 
F
V
 
L
K
 
A
Q
 
E
C
 
V
G
 
G
A
 
I
D
 
K
L
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
F
K
 
K
P
 
P
R
 
R
T
 
T
G
 
S
P
 
P
H
 
Y
T
 
S
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
L
 
Y
R
 
G
E
 
E
E
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
W
L
 
M
A
 
R
K
 
E
A
 
A
R
 
A
T
 
D
A
 
E
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
V
I
 
T
V
 
V
T
 
T
E
 
E
V
 
V
M
 
M
S
 
D
P
 
T
D
 
R
N
 
H
V
 
V
A
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
K
Y
 
Y
A
 
S
D
 
D
L
 
I
L
 
L
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
R
N
 
N
M
 
S
Q
 
Q
N
 
N
F
 
F
D
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
V
G
 
G
R
 
K
I
 
V
R
 
E
K
 
N
P
 
P
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
G
A
 
N
T
 
T
I
 
I
E
 
Q
E
 
E
F
 
L
L
 
L
A
 
Y
A
 
S
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
L
 
M
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
N
 
N
D
 
E
Q
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
L
C
 
C
E
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
T
A
 
A
T
 
T
R
 
R
N
 
F
T
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
I
A
 
S
M
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
V
K
 
K
E
 
E
L
 
L
T
 
S
H
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
I
V
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
S
H
 
H
A
 
P
T
 
A
G
 
G
K
 
R
R
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
V
T
 
I
P
 
P
M
 
L
S
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
Y
V
 
A
A
 
I
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
G
V
 
I
L
 
M
V
 
V
E
 
E
V
 
V
H
 
H
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
S
P
 
Q
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
L
T
 
T
F
 
F
P
 
D
G
 
D
F
 
F
E
 
L
A
 
Q
L
 
L
M
 
L
A
 
K
D
 
E
L
 
L
K
 
E
K
 
A
L
 
L

3pg9A Thermotoga maritima dah7p synthase in complex with inhibitor (see paper)
51% identity, 99% coverage: 1:334/338 of query aligns to 1:333/338 of 3pg9A

query
sites
3pg9A
M
|
M
L
 
I
I
 
V
V
 
V
M
 
L
N
 
K
H
 
P
T
 
G
A
 
S
S
 
T
Q
 
E
A
 
E
D
 
D
I
 
I
D
 
R
K
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
K
V
 
L
V
 
A
S
 
E
G
 
S
M
 
Y
G
 
N
F
 
L
T
 
K
A
 
C
A
 
H
P
 
I
I
x
S
P
 
K
G
|
G
G
x
Q
E
|
E
R
|
R
T
 
T
A
x
V
I
 
I
G
|
G
V
x
I
L
x
I
G
|
G
N
 
D
K
 
D
G
 
R
Y
 
Y
V
 
V
D
 
V
D
 
A
S
 
D
T
 
K
I
 
F
R
 
E
D
 
S
L
 
L
P
 
D
G
 
C
V
 
V
Q
 
E
Q
 
S
A
 
V
I
 
V
H
 
R
V
 
V
S
x
L
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
K
 
K
L
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
R
D
 
E
F
 
F
H
 
H
P
 
P
D
 
E
N
 
D
T
 
T
I
 
V
V
 
I
D
 
D
V
 
L
A
 
G
G
 
D
V
 
V
K
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
N
G
 
G
E
 
-
R
 
Y
P
 
F
V
 
T
V
 
I
V
 
I
G
 
A
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
 
S
V
 
V
E
 
E
S
 
G
E
 
R
E
 
E
Q
 
M
I
 
L
L
 
M
K
 
E
T
 
T
A
 
A
R
 
H
F
 
F
V
 
L
K
 
S
Q
 
E
C
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
K
L
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
K
 
K
P
 
P
R
 
R
T
 
T
G
 
S
P
 
P
H
 
Y
T
 
S
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
R
 
G
E
 
E
E
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
E
L
 
Y
L
 
L
A
 
R
K
 
E
A
 
A
R
 
A
T
 
D
A
 
K
T
 
Y
G
 
G
L
 
M
P
 
Y
I
 
V
V
 
V
T
 
T
E
 
E
V
 
A
M
 
L
S
 
G
P
 
E
D
 
D
N
 
D
V
 
L
A
 
P
L
 
K
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
I
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
R
N
 
N
M
 
A
Q
 
Q
N
 
N
F
 
F
D
 
R
L
 
L
L
 
L
R
 
S
E
 
K
L
 
A
G
 
G
R
 
S
I
 
Y
R
 
N
K
 
K
P
 
P
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
R
G
 
G
M
 
F
S
 
M
A
 
N
T
 
T
I
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
L
A
 
S
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
L
 
A
A
 
N
E
 
S
G
 
G
N
 
N
D
 
T
Q
 
K
V
 
I
I
 
I
L
 
L
C
 
C
E
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
K
A
 
A
T
 
T
R
 
R
N
 
N
T
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
I
A
 
S
M
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
I
V
 
I
K
 
R
E
 
K
L
 
E
T
 
S
H
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
L
V
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
S
H
 
H
A
 
S
T
 
G
G
 
G
K
 
R
R
 
R
S
 
D
L
 
L
V
 
V
T
 
I
P
 
P
M
 
L
S
 
S
K
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
I
V
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
A
H
 
H
G
 
G
V
 
I
L
 
I
V
 
V
E
 
E
V
 
V
H
 
H
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
G
P
 
K
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
T
 
D
F
 
F
P
 
E
G
 
L
F
 
F
E
 
K
A
 
E
L
 
L
M
 
V
A
 
Q
D
 
E
L
 
M
K
 
K
K
 
K
L
 
L
R
 
A
N
 
D
C
 
A
L
 
L

1rzmA Crystal structure of 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase (dahps) from thermotoga maritima complexed with cd2+, pep and e4p (see paper)
51% identity, 99% coverage: 1:334/338 of query aligns to 1:333/338 of 1rzmA

query
sites
1rzmA
M
 
M
L
 
I
I
 
V
V
 
V
M
 
L
N
 
K
H
 
P
T
 
G
A
 
S
S
 
T
Q
 
E
A
 
E
D
 
D
I
 
I
D
 
R
K
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
K
V
 
L
V
 
A
S
 
E
G
 
S
M
 
Y
G
 
N
F
 
L
T
 
K
A
 
C
A
 
H
P
 
I
I
 
S
P
 
K
G
 
G
G
 
Q
E
 
E
R
 
R
T
 
T
A
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
I
L
 
I
G
 
G
N
 
D
K
 
D
G
 
R
Y
 
Y
V
 
V
D
 
V
D
 
A
S
 
D
T
 
K
I
 
F
R
 
E
D
 
S
L
 
L
P
 
D
G
 
C
V
 
V
Q
 
E
Q
 
S
A
 
V
I
 
V
H
 
R
V
 
V
S
 
L
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
K
 
K
L
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
R
D
 
E
F
 
F
H
 
H
P
 
P
D
 
E
N
 
D
T
 
T
I
 
V
V
 
I
D
 
D
V
 
L
A
 
G
G
 
D
V
 
V
K
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
N
G
 
G
E
 
-
R
 
Y
P
 
F
V
 
T
V
 
I
V
 
I
G
 
A
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
 
S
V
 
V
E
 
E
S
 
G
E
 
R
E
 
E
Q
 
M
I
 
L
L
 
M
K
 
E
T
 
T
A
 
A
R
 
H
F
 
F
V
 
L
K
 
S
Q
 
E
C
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
K
L
 
V
L
 
L
R
|
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
K
|
K
P
|
P
R
|
R
T
|
T
G
 
S
P
 
P
H
 
Y
T
 
S
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
R
 
G
E
 
E
E
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
E
L
 
Y
L
 
L
A
 
R
K
 
E
A
 
A
R
 
A
T
 
D
A
 
K
T
 
Y
G
 
G
L
 
M
P
 
Y
I
 
V
V
 
V
T
 
T
E
 
E
V
 
A
M
 
L
S
 
G
P
 
E
D
 
D
N
 
D
V
 
L
A
 
P
L
 
K
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
I
Q
|
Q
V
 
I
G
|
G
A
|
A
R
|
R
N
 
N
M
 
A
Q
 
Q
N
 
N
F
 
F
D
 
R
L
 
L
L
 
L
R
 
S
E
 
K
L
 
A
G
 
G
R
 
S
I
 
Y
R
 
N
K
 
K
P
 
P
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
|
K
R
 
R
G
 
G
M
 
F
S
 
M
A
 
N
T
 
T
I
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
L
A
 
S
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
L
 
A
A
 
N
E
 
S
G
 
G
N
 
N
D
 
T
Q
 
K
V
 
I
I
 
I
L
 
L
C
 
C
E
 
E
R
|
R
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
K
A
 
A
T
 
T
R
 
R
N
 
N
T
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
I
A
 
S
M
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
I
V
 
I
K
 
R
E
 
K
L
 
E
T
 
S
H
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
L
V
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
S
H
|
H
A
 
S
T
 
G
G
 
G
K
 
R
R
 
R
S
 
D
L
 
L
V
 
V
T
 
I
P
 
P
M
 
L
S
 
S
K
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
I
V
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
A
H
 
H
G
 
G
V
 
I
L
 
I
V
 
V
E
 
E
V
 
V
H
 
H
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
G
P
 
K
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
T
 
D
F
 
F
P
 
E
G
 
L
F
 
F
E
 
K
A
 
E
L
 
L
M
 
V
A
 
Q
D
 
E
L
 
M
K
 
K
K
 
K
L
 
L
R
 
A
N
 
D
C
 
A
L
 
L

1zcoB Crystal structure of pyrococcus furiosus 3-deoxy-d-arabino- heptulosonate 7-phosphate synthase (see paper)
57% identity, 75% coverage: 77:330/338 of query aligns to 7:258/262 of 1zcoB

query
sites
1zcoB
H
 
Y
P
 
D
D
 
E
N
 
K
T
 
T
I
 
V
V
 
V
D
 
K
V
 
I
A
 
N
G
 
D
V
 
V
K
 
K
I
 
F
G
 
G
E
 
E
G
 
G
E
 
-
R
 
-
P
 
F
V
 
T
V
 
I
V
 
I
G
 
A
G
 
G
P
 
P
C
|
C
A
 
S
V
 
I
E
 
E
S
 
S
E
 
R
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
L
 
M
K
 
K
T
 
V
A
 
A
R
 
E
F
 
F
V
 
L
K
 
A
Q
 
E
C
 
V
G
 
G
A
 
I
D
 
K
L
 
V
L
 
L
R
|
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
F
K
|
K
P
 
P
R
 
R
T
 
T
G
 
S
P
 
P
H
 
Y
T
 
S
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
L
 
Y
R
 
G
E
 
E
E
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
W
L
 
M
A
 
R
K
 
E
A
 
A
R
 
A
T
 
D
A
 
E
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
V
I
 
T
V
 
V
T
 
T
E
 
E
V
 
V
M
 
M
S
 
D
P
 
T
D
 
R
N
 
H
V
 
V
A
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
K
Y
 
Y
A
 
S
D
 
D
L
 
I
L
 
L
Q
|
Q
V
 
I
G
 
G
A
|
A
R
 
R
N
 
N
M
 
S
Q
 
Q
N
 
N
F
 
F
D
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
V
G
 
G
R
 
K
I
 
V
R
 
E
K
 
N
P
 
P
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
|
K
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
G
A
 
N
T
 
T
I
 
I
E
 
Q
E
 
E
F
 
L
L
 
L
A
 
Y
A
 
S
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
L
 
M
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
N
 
N
D
 
E
Q
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
L
C
 
C
E
 
E
R
|
R
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
T
A
 
A
T
 
T
R
 
R
N
 
F
T
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
I
A
 
S
M
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
V
K
 
K
E
 
E
L
 
L
T
 
S
H
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
I
V
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
S
H
|
H
A
 
P
T
 
A
G
 
G
K
 
R
R
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
V
T
 
I
P
 
P
M
 
L
S
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
Y
V
 
A
A
 
I
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
G
V
 
I
L
 
M
V
 
V
E
|
E
V
 
V
H
 
H
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
|
D
G
 
S
P
 
Q
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
L
T
 
T
F
 
F
P
 
D
G
 
D
F
 
F
E
 
L
A
 
Q
L
 
L
M
 
L
A
 
K
D
 
E
L
 
L
K
 
E
K
 
A
L
 
L

1zcoA Crystal structure of pyrococcus furiosus 3-deoxy-d-arabino- heptulosonate 7-phosphate synthase (see paper)
57% identity, 75% coverage: 77:330/338 of query aligns to 7:258/262 of 1zcoA

query
sites
1zcoA
H
 
Y
P
 
D
D
 
E
N
 
K
T
 
T
I
 
V
V
 
V
D
 
K
V
 
I
A
 
N
G
 
D
V
 
V
K
 
K
I
 
F
G
 
G
E
 
E
G
 
G
E
 
-
R
 
-
P
 
F
V
 
T
V
 
I
V
 
I
G
 
A
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
 
S
V
 
I
E
 
E
S
 
S
E
 
R
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
L
 
M
K
 
K
T
 
V
A
 
A
R
 
E
F
 
F
V
 
L
K
 
A
Q
 
E
C
 
V
G
 
G
A
 
I
D
 
K
L
 
V
L
 
L
R
|
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
F
K
 
K
P
 
P
R
 
R
T
 
T
G
 
S
P
 
P
H
 
Y
T
 
S
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
L
 
Y
R
 
G
E
 
E
E
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
W
L
 
M
A
 
R
K
 
E
A
 
A
R
 
A
T
 
D
A
 
E
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
V
I
 
T
V
 
V
T
 
T
E
 
E
V
 
V
M
 
M
S
 
D
P
 
T
D
 
R
N
 
H
V
 
V
A
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
K
Y
 
Y
A
 
S
D
 
D
L
 
I
L
 
L
Q
|
Q
V
 
I
G
|
G
A
|
A
R
 
R
N
 
N
M
 
S
Q
 
Q
N
 
N
F
 
F
D
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
V
G
 
G
R
 
K
I
 
V
R
 
E
K
 
N
P
 
P
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
|
K
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
G
A
 
N
T
 
T
I
 
I
E
 
Q
E
 
E
F
 
L
L
 
L
A
 
Y
A
 
S
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
L
 
M
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
N
 
N
D
 
E
Q
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
L
C
 
C
E
 
E
R
|
R
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
T
A
 
A
T
 
T
R
 
R
N
 
F
T
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
I
A
 
S
M
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
V
K
 
K
E
 
E
L
 
L
T
 
S
H
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
I
V
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
S
H
|
H
A
 
P
T
 
A
G
 
G
K
 
R
R
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
V
T
 
I
P
 
P
M
 
L
S
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
Y
V
 
A
A
 
I
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
G
V
 
I
L
 
M
V
 
V
E
 
E
V
 
V
H
 
H
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
S
P
 
Q
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
L
T
 
T
F
 
F
P
 
D
G
 
D
F
 
F
E
 
L
A
 
Q
L
 
L
M
 
L
A
 
K
D
 
E
L
 
L
K
 
E
K
 
A
L
 
L

4c1kA Crystal structure of pyrococcus furiosus 3-deoxy-d-arabino- heptulosonate 7-phosphate synthase (see paper)
57% identity, 75% coverage: 77:330/338 of query aligns to 7:258/262 of 4c1kA

query
sites
4c1kA
H
 
Y
P
 
K
D
 
E
N
 
K
T
 
T
I
 
V
V
 
V
D
 
K
V
 
I
A
 
N
G
 
D
V
 
V
K
 
K
I
 
F
G
 
G
E
 
E
G
 
G
E
 
-
R
 
-
P
 
F
V
 
T
V
 
I
V
 
I
G
 
A
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
 
S
V
 
I
E
 
E
S
 
S
E
 
R
E
 
D
Q
 
Q
I
 
I
L
 
M
K
 
K
T
 
V
A
 
A
R
 
E
F
 
F
V
 
L
K
 
A
Q
 
E
C
 
V
G
 
G
A
 
I
D
 
K
L
 
V
L
 
L
R
|
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
F
K
 
K
P
 
P
R
 
R
T
 
T
G
 
S
P
 
P
H
 
Y
T
 
S
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
L
 
Y
R
 
G
E
 
E
E
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
W
L
 
M
A
 
R
K
 
E
A
 
A
R
 
A
T
 
D
A
 
E
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
V
I
 
T
V
 
V
T
 
T
E
 
E
V
 
V
M
 
M
S
 
D
P
 
T
D
 
R
N
 
H
V
 
V
A
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
K
Y
 
Y
A
 
S
D
 
D
L
 
I
L
 
L
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
A
|
A
R
|
R
N
 
N
M
 
S
Q
 
Q
N
 
N
F
 
F
D
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
V
G
 
G
R
 
K
I
 
V
R
 
E
K
 
N
P
 
P
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
|
K
R
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
G
A
 
N
T
 
T
I
 
I
E
 
Q
E
 
E
F
 
L
L
 
L
A
 
Y
A
 
S
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
L
 
M
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
N
 
N
D
 
E
Q
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
L
C
 
C
E
 
E
R
|
R
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
T
A
 
A
T
 
T
R
 
R
N
 
F
T
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
I
A
 
S
M
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
V
K
 
K
E
 
E
L
 
L
T
 
S
H
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
I
V
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
S
H
|
H
A
 
P
T
 
A
G
 
G
K
 
R
R
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
V
T
 
I
P
 
P
M
 
L
S
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
Y
V
 
A
A
 
I
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
G
V
 
I
L
 
M
V
 
V
E
 
E
V
 
V
H
 
H
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
S
P
 
Q
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
L
T
 
T
F
 
F
P
 
D
G
 
D
F
 
F
E
 
L
A
 
Q
L
 
L
M
 
L
A
 
K
D
 
E
L
 
L
K
 
E
K
 
A
L
 
L

5j6fA Crystal structure of dah7ps-cm complex from geobacillus sp. With prephenate (see paper)
54% identity, 77% coverage: 71:331/338 of query aligns to 93:352/352 of 5j6fA

query
sites
5j6fA
L
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
R
D
 
K
F
 
K
H
 
H
P
 
P
D
 
E
N
 
N
T
 
T
I
 
I
V
 
V
D
 
E
V
 
V
A
 
K
G
 
G
V
 
E
K
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
E
 
N
R
 
Q
P
 
Y
V
 
F
V
 
V
V
 
M
G
 
G
G
 
-
P
 
P
C
|
C
A
 
A
V
 
V
E
 
E
S
 
S
E
 
Y
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
L
 
A
K
 
A
T
 
V
A
 
A
R
 
E
F
 
A
V
 
V
K
 
K
Q
 
K
C
 
Q
G
 
G
A
 
I
D
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
K
 
K
P
 
P
R
 
R
T
 
T
G
 
S
P
 
P
H
 
Y
T
 
D
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
R
 
G
E
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
K
L
 
I
L
 
L
A
 
K
K
 
R
A
 
I
R
 
A
T
 
D
A
 
E
T
 
F
G
 
D
L
 
L
P
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
S
E
 
E
V
 
I
M
 
V
S
 
T
P
 
P
D
 
A
N
 
D
V
 
I
A
 
E
L
 
I
V
 
A
A
 
L
E
 
D
Y
 
Y
A
 
I
D
 
D
L
 
V
L
 
I
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
R
N
 
N
M
 
M
Q
 
Q
N
 
N
F
 
F
D
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
A
L
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
V
R
 
N
K
 
K
P
 
P
I
 
I
L
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
R
G
 
G
M
 
L
S
 
A
A
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
F
L
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
L
 
M
A
 
S
E
 
Q
G
 
G
N
 
N
D
 
G
Q
 
Q
V
 
I
I
 
I
L
 
L
C
 
C
E
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
T
F
 
Y
E
 
E
T
 
R
A
 
A
T
 
T
R
 
R
N
 
N
T
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
I
A
 
S
M
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
I
V
 
L
K
 
K
E
 
K
L
 
E
T
 
T
H
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
F
V
 
V
D
 
D
P
 
V
S
 
T
H
|
H
A
 
S
T
 
T
G
 
G
K
 
R
R
 
R
S
 
D
L
 
L
V
 
L
T
 
I
P
 
P
M
 
C
S
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
I
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
M
V
 
A
E
|
E
V
 
V
H
 
H
P
 
P
E
 
D
P
 
P
E
 
A
K
 
V
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
|
D
G
 
S
P
 
A
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
M
T
 
D
F
 
I
P
 
A
G
 
Q
F
 
F
E
 
N
A
 
E
L
 
F
M
 
M
A
 
E
D
 
E
L
 
V
K
 
R
K
 
A
L
 
F
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

3tfcA 1.95 angstrom crystal structure of a bifunctional 3-deoxy-7- phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase (aroa) from listeria monocytogenes egd-e in complex with phosphoenolpyruvate (see paper)
50% identity, 87% coverage: 32:324/338 of query aligns to 35:334/343 of 3tfcA

query
sites
3tfcA
P
 
P
G
 
L
G
 
R
E
 
E
R
 
R
T
 
E
A
 
M
I
 
L
G
 
N
V
 
T
L
 
I
-
 
L
-
 
A
G
 
A
N
 
N
K
 
E
G
 
G
Y
 
P
V
 
F
D
 
E
D
 
D
S
 
S
T
 
T
I
 
V
R
 
Q
D
 
K
L
 
L
-
 
F
-
 
K
-
 
E
-
 
I
-
 
F
-
 
K
P
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
E
Q
 
L
A
 
Q
I
 
E
H
 
E
V
 
D
S
 
H
K
 
S
P
 
K
Y
 
A
K
 
L
L
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
R
D
 
K
F
 
N
H
 
K
P
 
K
D
 
E
N
 
D
T
 
T
I
 
I
V
 
V
D
 
T
V
 
V
A
 
K
G
 
G
V
 
L
K
 
P
I
 
I
G
 
G
E
 
N
G
 
G
E
 
E
R
 
-
P
 
P
V
 
V
V
 
F
V
 
V
G
 
F
G
 
G
P
 
P
C
|
C
A
 
S
V
 
V
E
 
E
S
 
S
E
 
Y
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
L
 
A
K
 
A
T
 
V
A
 
A
R
 
E
F
 
S
V
 
I
K
 
K
Q
 
A
C
 
K
G
 
G
A
 
L
D
 
K
L
 
L
L
 
I
R
|
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
F
K
 
K
P
 
P
R
 
R
T
 
T
G
 
S
P
 
P
H
 
Y
T
 
D
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
R
 
G
E
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
K
L
 
I
L
 
L
A
 
K
K
 
R
A
 
V
R
 
S
T
 
D
A
 
E
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
G
I
 
V
V
 
I
T
 
S
E
 
E
V
 
I
M
 
V
S
 
T
P
 
P
D
 
A
N
 
D
V
 
I
A
 
E
L
 
V
V
 
A
A
 
L
E
 
D
Y
 
Y
A
 
V
D
 
D
L
 
V
L
 
I
Q
|
Q
V
 
I
G
 
G
A
|
A
R
 
R
N
 
N
M
 
M
Q
 
Q
N
 
N
F
 
F
D
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
A
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
V
R
 
D
K
 
K
P
 
P
I
 
I
L
 
L
L
 
L
K
|
K
R
 
R
G
 
G
M
 
L
S
 
S
A
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
F
L
 
I
A
 
G
A
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
L
 
M
A
 
S
E
 
Q
G
 
G
N
 
N
D
 
G
Q
 
K
V
 
I
I
 
I
L
 
L
C
 
C
E
 
E
R
|
R
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
T
F
 
Y
E
 
E
T
 
K
A
 
A
T
 
T
R
 
R
N
 
N
T
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
I
A
 
S
M
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
I
V
 
L
K
 
K
E
 
K
L
 
E
T
 
T
H
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
V
 
V
D
 
D
P
 
V
S
 
T
H
|
H
A
 
S
T
 
T
G
 
G
K
 
R
R
 
K
S
 
D
L
 
L
V
 
L
T
 
L
P
 
P
M
 
C
S
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
I
G
 
E
A
 
A
H
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
M
V
 
A
E
|
E
V
 
V
H
 
H
P
 
P
E
 
D
P
 
P
E
 
A
K
 
V
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
|
D
G
 
S
P
 
A
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
M
T
 
D
F
 
I
P
 
P
G
 
E
F
 
F
E
 
E
A
 
E
L
 
F
M
 
W

3nvtA 1.95 angstrom crystal structure of a bifunctional 3-deoxy-7- phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase (aroa) from listeria monocytogenes egd-e (see paper)
50% identity, 87% coverage: 32:324/338 of query aligns to 36:335/345 of 3nvtA

query
sites
3nvtA
P
 
P
G
 
L
G
 
R
E
 
E
R
 
R
T
 
E
A
 
M
I
 
L
G
 
N
V
 
T
L
 
I
-
 
L
-
 
A
G
 
A
N
 
N
K
 
E
G
 
G
Y
 
P
V
 
F
D
 
E
D
 
D
S
 
S
T
 
T
I
 
V
R
 
Q
D
 
K
L
 
L
-
 
F
-
 
K
-
 
E
-
 
I
-
 
F
-
 
K
P
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
E
Q
 
L
A
 
Q
I
 
E
H
 
E
V
 
D
S
 
H
K
 
S
P
 
K
Y
 
A
K
 
L
L
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
R
D
 
K
F
 
N
H
 
K
P
 
K
D
 
E
N
 
D
T
 
T
I
 
I
V
 
V
D
 
T
V
 
V
A
 
K
G
 
G
V
 
L
K
 
P
I
 
I
G
 
G
E
 
N
G
 
G
E
 
E
R
 
-
P
 
P
V
 
V
V
 
F
V
 
V
G
 
F
G
 
G
P
 
P
C
|
C
A
 
S
V
 
V
E
 
E
S
 
S
E
 
Y
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
L
 
A
K
 
A
T
 
V
A
 
A
R
 
E
F
 
S
V
 
I
K
 
K
Q
 
A
C
 
K
G
 
G
A
 
L
D
 
K
L
 
L
L
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
F
K
 
K
P
 
P
R
 
R
T
 
T
G
 
S
P
 
P
H
 
Y
T
 
D
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
R
 
G
E
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
K
L
 
I
L
 
L
A
 
K
K
 
R
A
 
V
R
 
S
T
 
D
A
 
E
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
G
I
 
V
V
 
I
T
 
S
E
 
E
V
 
I
M
 
V
S
 
T
P
 
P
D
 
A
N
 
D
V
 
I
A
 
E
L
 
V
V
 
A
A
 
L
E
 
D
Y
 
Y
A
 
V
D
 
D
L
 
V
L
 
I
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
R
N
 
N
M
 
M
Q
 
Q
N
 
N
F
 
F
D
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
A
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
V
R
 
D
K
 
K
P
 
P
I
 
I
L
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
R
G
 
G
M
 
L
S
 
S
A
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
E
E
 
E
F
 
F
L
 
I
A
 
G
A
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
L
 
M
A
 
S
E
 
Q
G
 
G
N
 
N
D
 
G
Q
 
K
V
 
I
I
 
I
L
 
L
C
 
C
E
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
T
F
 
Y
E
 
E
T
 
K
A
 
A
T
 
T
R
 
R
N
 
N
T
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
I
A
 
S
M
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
I
V
 
L
K
 
K
E
 
K
L
 
E
T
 
T
H
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
V
 
V
D
 
D
P
 
V
S
 
T
H
|
H
A
 
S
T
 
T
G
 
G
K
 
R
R
 
K
S
 
D
L
 
L
V
 
L
T
 
L
P
 
P
M
 
C
S
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
I
G
 
E
A
 
A
H
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
M
V
 
A
E
|
E
V
 
V
H
 
H
P
 
P
E
 
D
P
 
P
E
 
A
K
 
V
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
|
D
G
 
S
P
 
A
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
M
T
 
D
F
 
I
P
 
P
G
 
E
F
 
F
E
 
E
A
 
E
L
 
F
M
 
W

P39912 Protein AroA(G); EC 2.5.1.54; EC 5.4.99.5 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
50% identity, 88% coverage: 32:328/338 of query aligns to 48:351/358 of P39912

query
sites
P39912
P
 
P
G
 
V
G
 
R
E
 
E
R
 
R
T
 
T
A
 
M
I
 
L
G
 
N
-
 
N
-
 
I
V
 
I
L
 
E
G
 
N
N
 
N
K
 
D
G
 
G
Y
 
P
V
 
F
D
 
E
D
 
N
S
 
S
T
 
T
I
 
I
R
 
Q
D
 
H
L
 
I
-
 
F
-
 
K
-
 
E
-
 
I
-
 
F
-
 
K
P
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
E
Q
 
L
A
 
Q
I
 
E
H
 
E
V
 
D
S
 
H
K
 
S
P
 
K
Y
 
A
K
 
L
L
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
R
D
 
K
F
 
K
H
 
K
P
 
P
D
 
E
N
 
D
T
 
T
I
 
I
V
 
V
D
 
D
V
 
I
A
 
K
G
 
G
V
 
E
K
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
E
 
Q
R
 
Q
P
 
R
V
 
F
V
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
-
P
 
P
C
 
C
A
 
A
V
 
V
E
 
E
S
 
S
E
 
Y
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
L
 
A
K
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
A
F
 
A
V
 
A
K
 
K
Q
 
K
C
 
Q
G
 
G
A
 
I
D
 
K
L
 
I
L
 
L
R
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
F
K
 
K
P
 
P
R
 
R
T
 
T
G
 
S
P
 
P
H
 
Y
T
 
D
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
R
 
G
E
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
Q
L
 
I
L
 
L
A
 
K
K
 
R
A
 
V
R
 
A
T
 
D
A
 
E
T
 
F
G
 
D
L
 
L
P
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
S
E
 
E
V
 
I
M
 
V
S
 
T
P
 
P
D
 
A
N
 
H
V
 
I
A
 
E
L
 
E
V
 
A
A
 
L
E
 
D
Y
 
Y
A
 
I
D
 
D
L
 
V
L
 
I
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
R
N
 
N
M
 
M
Q
 
Q
N
 
N
F
 
F
D
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
A
L
 
A
G
 
G
R
 
A
I
 
V
R
 
K
K
 
K
P
 
P
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
R
G
 
G
M
 
L
S
 
A
A
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
S
E
 
E
F
 
F
L
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
L
 
M
A
 
S
E
 
Q
G
 
G
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
V
 
I
I
 
I
L
 
L
C
 
C
E
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
T
F
 
Y
E
 
E
T
 
T
A
 
A
T
 
T
R
 
R
N
 
N
T
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
I
A
 
S
M
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
I
V
 
L
K
 
K
E
 
Q
L
 
E
T
 
T
H
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
F
V
 
V
D
 
D
P
 
V
S
 
T
H
 
H
A
 
S
T
 
T
G
 
G
K
 
R
R
 
R
S
 
D
L
 
L
V
 
L
T
 
L
P
 
P
M
 
T
S
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
I
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
M
V
 
A
E
 
E
V
 
V
H
 
H
P
 
P
E
 
D
P
 
P
E
 
S
K
 
V
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
S
P
 
A
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
M
T
 
A
F
 
I
P
 
P
G
 
E
F
 
F
E
 
E
A
 
K
L
 
W
M
 
L
A
 
N
D
 
E
L
 
L
K
 
K

Sites not aligning to the query:

1vs1D Crystal structure of 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase (dahp synthase) from aeropyrum pernix in complex with mn2+ and pep
60% identity, 78% coverage: 67:331/338 of query aligns to 6:269/271 of 1vs1D

query
sites
1vs1D
K
 
K
P
 
G
Y
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
A
S
 
L
R
 
K
D
 
S
F
 
E
H
 
E
P
 
R
D
 
R
N
 
E
T
 
T
I
 
V
V
 
V
D
 
E
V
 
V
A
 
E
G
 
G
V
 
V
K
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
G
G
 
G
E
 
S
R
 
K
P
 
-
V
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
A
G
 
G
P
 
P
C
|
C
A
 
S
V
 
V
E
 
E
S
 
S
E
 
W
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
L
 
R
K
 
E
T
 
A
A
 
A
R
 
L
F
 
A
V
 
V
K
 
K
Q
 
E
C
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
H
L
 
M
L
 
L
R
|
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
F
K
 
K
P
 
P
R
 
R
T
 
T
G
 
S
P
 
P
H
 
Y
T
 
S
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
R
 
G
E
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
R
K
 
R
A
 
A
R
 
G
T
 
D
A
 
E
T
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
V
V
 
V
T
 
T
E
 
E
V
 
V
M
 
L
S
 
D
P
 
P
D
 
R
N
 
H
V
 
V
A
 
E
L
 
T
V
 
V
A
 
S
E
 
R
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
L
 
M
L
 
L
Q
|
Q
V
 
I
G
|
G
A
 
A
R
 
R
N
 
N
M
 
M
Q
 
Q
N
 
N
F
 
F
D
 
P
L
 
L
L
 
L
R
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
S
R
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
V
L
 
L
L
 
L
K
|
K
R
 
R
G
 
G
M
 
F
S
 
G
A
 
N
T
 
T
I
 
V
E
 
E
E
 
E
F
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
A
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
N
D
 
W
Q
 
Q
V
 
V
I
 
V
L
 
L
C
 
V
E
 
E
R
|
R
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
R
N
 
F
T
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
V
A
 
A
M
 
A
V
 
V
P
 
A
L
 
V
V
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
A
T
 
T
H
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
I
V
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
S
H
|
H
A
 
P
T
 
A
G
 
G
K
 
R
R
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
V
T
 
P
P
 
A
M
 
L
S
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
G
V
 
L
L
 
I
V
 
V
E
|
E
V
 
V
H
 
H
P
 
P
E
 
N
P
 
P
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
|
D
G
 
A
P
 
K
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
L
T
 
T
F
 
P
P
 
G
G
 
E
F
 
F
E
 
A
A
 
R
L
 
L
M
 
M
A
 
G
D
 
E
L
 
L
K
 
R
K
 
W
L
 
H
R
 
R

1jcxA Aquifex aeolicus kdo8p synthase in complex with api and cadmium (see paper)
30% identity, 72% coverage: 94:335/338 of query aligns to 1:249/255 of 1jcxA

query
sites
1jcxA
E
 
E
R
 
K
P
 
F
V
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
A
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
S
E
 
E
E
 
E
Q
 
L
I
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
V
A
 
G
R
 
E
F
 
E
V
 
I
K
 
K
Q
 
R
C
 
L
G
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
F
-
 
K
-
 
E
A
 
V
D
 
E
L
 
F
L
 
V
R
 
F
G
x
K
G
 
S
A
 
S
F
 
F
K
 
D
P
x
K
-
 
A
-
x
N
R
|
R
T
x
S
G
 
S
P
 
I
H
 
H
T
 
S
F
 
F
Q
 
R
G
 
G
L
 
H
-
 
G
R
 
L
E
 
E
E
 
Y
G
 
G
L
 
V
K
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
R
K
 
K
A
 
V
R
 
K
T
 
E
A
 
E
T
 
F
G
 
G
L
 
L
P
 
K
I
 
I
V
 
T
T
 
T
E
 
D
V
 
I
M
 
H
S
 
E
P
 
S
D
 
W
N
 
Q
V
 
A
A
 
E
L
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
I
Q
|
Q
V
 
I
G
x
P
A
|
A
R
 
F
N
 
L
M
 
C
Q
 
R
N
 
Q
F
 
T
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
L
E
 
A
L
 
A
G
 
A
R
 
K
I
 
T
R
 
G
K
 
R
P
 
A
I
 
V
L
 
N
L
 
V
K
|
K
R
 
K
G
 
G
M
 
Q
S
 
F
A
 
L
T
 
A
I
 
P
E
 
W
E
 
D
F
 
T
L
 
K
A
 
N
A
 
V
A
 
V
E
 
E
Y
 
K
I
 
L
L
 
K
A
 
F
E
 
G
G
 
G
N
 
A
D
 
K
Q
 
E
V
 
I
I
 
Y
L
 
L
C
 
T
E
 
E
R
|
R
G
 
G
I
 
T
R
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
T
 
T
A
 
F
T
 
G
R
 
Y
N
 
N
T
 
N
L
 
L
-
 
V
-
 
V
D
 
D
L
 
F
A
 
R
M
 
S
V
 
L
P
 
P
L
 
I
V
 
M
K
 
K
E
 
Q
L
 
W
T
 
A
H
 
K
L
 
-
P
 
-
V
 
V
M
 
I
V
 
Y
D
 
D
P
 
A
S
 
T
H
|
H
A
 
S
T
 
V
-
x
Q
-
 
L
-
 
P
G
 
G
K
 
M
R
 
R
S
 
E
L
 
F
V
 
I
T
 
F
P
 
P
M
 
L
S
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
C
H
 
D
G
 
G
V
 
V
L
x
F
V
 
M
E
|
E
V
 
T
H
 
H
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
A
P
 
S
Q
 
T
S
 
Q
L
 
L
T
 
P
F
 
L
P
 
S
G
 
Q
F
 
L
E
 
E
A
 
G
L
 
I
M
 
I
A
 
E
D
 
A
L
 
I
K
 
L
K
 
E
L
 
I
R
 
R
N
 
E
C
 
V
L
 
A
S
 
S

1pcwA Aquifex aeolicus kdo8ps in complex with cadmium and app, a bisubstrate inhibitor (see paper)
30% identity, 72% coverage: 94:335/338 of query aligns to 1:251/257 of 1pcwA

query
sites
1pcwA
E
 
E
R
 
K
P
 
F
V
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
A
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
S
E
 
E
E
 
E
Q
 
L
I
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
V
A
 
G
R
 
E
F
 
E
V
 
I
K
 
K
Q
 
R
C
 
L
G
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
F
-
 
K
-
 
E
A
 
V
D
 
E
L
 
F
L
 
V
R
 
F
G
 
K
G
 
S
A
 
S
F
 
F
K
 
D
P
x
K
-
 
A
-
x
N
R
|
R
T
x
S
G
 
S
P
 
I
H
 
H
T
 
S
F
 
F
Q
 
R
G
 
G
L
 
H
-
 
G
R
 
L
E
 
E
E
 
Y
G
 
G
L
 
V
K
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
R
K
 
K
A
 
V
R
 
K
T
 
E
A
 
E
T
 
F
G
 
G
L
 
L
P
 
K
I
 
I
V
 
T
T
 
T
E
 
D
V
 
I
M
 
H
S
 
E
P
 
S
D
 
W
N
 
Q
V
 
A
A
 
E
L
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
I
Q
 
Q
V
 
I
G
x
P
A
|
A
R
 
F
N
 
L
M
 
C
Q
 
R
N
 
Q
F
 
T
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
L
E
 
A
L
 
A
G
 
A
R
 
K
I
 
T
R
 
G
K
 
R
P
 
A
I
 
V
L
 
N
L
 
V
K
|
K
R
 
K
G
 
G
M
 
Q
S
 
F
A
 
L
T
 
A
I
 
P
E
 
W
E
 
D
F
 
T
L
 
K
A
 
N
A
 
V
A
 
V
E
 
E
Y
 
K
I
 
L
L
 
K
A
 
F
E
 
G
G
 
G
N
 
A
D
 
K
Q
 
E
V
 
I
I
 
Y
L
 
L
C
 
T
E
 
E
R
|
R
G
 
G
I
 
T
R
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
T
 
T
A
 
F
T
 
G
R
 
Y
N
 
N
T
 
N
L
 
L
-
 
V
-
 
V
D
 
D
L
 
F
A
 
R
M
 
S
V
 
L
P
 
P
L
 
I
V
 
M
K
 
K
E
 
Q
L
 
W
T
 
A
H
 
K
L
 
-
P
 
-
V
 
V
M
 
I
V
 
Y
D
 
D
P
 
A
S
 
T
H
|
H
A
 
S
T
 
V
-
x
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
G
G
 
G
K
 
M
R
 
R
S
 
E
L
 
F
V
 
I
T
 
F
P
 
P
M
 
L
S
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
C
H
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
F
V
 
M
E
 
E
V
 
T
H
 
H
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
|
D
G
 
A
P
 
S
Q
 
T
S
 
Q
L
 
L
T
 
P
F
 
L
P
 
S
G
 
Q
F
 
L
E
 
E
A
 
G
L
 
I
M
 
I
A
 
E
D
 
A
L
 
I
K
 
L
K
 
E
L
 
I
R
 
R
N
 
E
C
 
V
L
 
A
S
 
S

1pe1A Aquifex aeolicus kdo8ps in complex with cadmium and 2-pga (see paper)
30% identity, 72% coverage: 94:335/338 of query aligns to 2:252/258 of 1pe1A

query
sites
1pe1A
E
 
E
R
 
K
P
 
F
V
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
A
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
S
E
 
E
E
 
E
Q
 
L
I
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
V
A
 
G
R
 
E
F
 
E
V
 
I
K
 
K
Q
 
R
C
 
L
G
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
F
-
 
K
-
 
E
A
 
V
D
 
E
L
 
F
L
 
V
R
 
F
G
x
K
G
 
S
A
 
S
F
 
F
K
 
D
P
 
K
-
 
A
-
 
N
R
 
R
T
 
S
G
 
S
P
 
I
H
 
H
T
 
S
F
 
F
Q
 
R
G
 
G
L
 
H
-
 
G
R
 
L
E
 
E
E
 
Y
G
 
G
L
 
V
K
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
R
K
 
K
A
 
V
R
 
K
T
 
E
A
 
E
T
 
F
G
 
G
L
 
L
P
 
K
I
 
I
V
 
T
T
 
T
E
x
D
V
 
I
M
 
H
S
 
E
P
 
S
D
 
W
N
 
Q
V
 
A
A
 
E
L
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
I
Q
|
Q
V
 
I
G
x
P
A
|
A
R
 
F
N
 
L
M
 
C
Q
 
R
N
 
Q
F
 
T
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
L
E
 
A
L
 
A
G
 
A
R
 
K
I
 
T
R
 
G
K
 
R
P
 
A
I
 
V
L
 
N
L
 
V
K
|
K
R
 
K
G
 
G
M
 
Q
S
 
F
A
 
L
T
 
A
I
 
P
E
 
W
E
 
D
F
 
T
L
 
K
A
 
N
A
 
V
A
 
V
E
 
E
Y
 
K
I
 
L
L
 
K
A
 
F
E
 
G
G
 
G
N
 
A
D
 
K
Q
 
E
V
 
I
I
 
Y
L
 
L
C
 
T
E
 
E
R
|
R
G
 
G
I
 
T
R
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
T
 
T
A
 
F
T
 
G
R
 
Y
N
 
N
T
 
N
L
 
L
-
 
V
-
 
V
D
 
D
L
 
F
A
 
R
M
 
S
V
 
L
P
 
P
L
 
I
V
 
M
K
 
K
E
 
Q
L
 
W
T
 
A
H
 
K
L
 
-
P
 
-
V
 
V
M
 
I
V
 
Y
D
 
D
P
 
A
S
 
T
H
|
H
A
 
S
T
 
V
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
G
G
 
G
K
 
M
R
 
R
S
 
E
L
 
F
V
 
I
T
 
F
P
 
P
M
 
L
S
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
C
H
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
F
V
 
M
E
 
E
V
 
T
H
 
H
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
A
P
 
S
Q
 
T
S
 
Q
L
 
L
T
 
P
F
 
L
P
 
S
G
 
Q
F
 
L
E
 
E
A
 
G
L
 
I
M
 
I
A
 
E
D
 
A
L
 
I
K
 
L
K
 
E
L
 
I
R
 
R
N
 
E
C
 
V
L
 
A
S
 
S

1pckA Aquifex aeolicus kdo8ps in complex with z-methyl-pep (see paper)
30% identity, 72% coverage: 94:335/338 of query aligns to 1:252/258 of 1pckA

query
sites
1pckA
E
 
E
R
 
K
P
 
F
V
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
A
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
S
E
 
E
E
 
E
Q
 
L
I
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
V
A
 
G
R
 
E
F
 
E
V
 
I
K
 
K
Q
 
R
C
 
L
G
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
F
-
 
K
-
 
E
A
 
V
D
 
E
L
 
F
L
 
V
R
 
F
G
x
K
G
 
S
A
 
S
F
 
F
K
 
D
P
x
K
-
 
A
-
x
N
R
 
R
T
 
S
G
 
S
P
 
I
H
 
H
T
 
S
F
 
F
Q
 
R
G
 
G
L
 
H
-
 
G
R
 
L
E
 
E
E
 
Y
G
 
G
L
 
V
K
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
R
K
 
K
A
 
V
R
 
K
T
 
E
A
 
E
T
 
F
G
 
G
L
 
L
P
 
K
I
 
I
V
 
T
T
 
T
E
 
D
V
 
I
M
 
H
S
 
E
P
 
S
D
 
W
N
 
Q
V
 
A
A
 
E
L
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
I
Q
|
Q
V
 
I
G
x
P
A
|
A
R
 
F
N
 
L
M
 
C
Q
 
R
N
 
Q
F
 
T
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
L
E
 
A
L
 
A
G
 
A
R
 
K
I
 
T
R
 
G
K
 
R
P
 
A
I
 
V
L
 
N
L
 
V
K
|
K
R
 
K
G
 
G
M
 
Q
S
 
F
A
 
L
T
 
A
I
 
P
E
 
W
E
 
D
F
 
T
L
 
K
A
 
N
A
 
V
A
 
V
E
 
E
Y
 
K
I
 
L
L
 
K
A
 
F
E
 
G
G
 
G
N
 
A
D
 
K
Q
 
E
V
 
I
I
 
Y
L
 
L
C
 
T
E
 
E
R
|
R
G
 
G
I
 
T
R
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
T
 
T
A
 
F
T
 
G
R
 
Y
N
 
N
T
 
N
L
 
L
-
 
V
-
 
V
D
 
D
L
 
F
A
 
R
M
 
S
V
 
L
P
 
P
L
 
I
V
 
M
K
 
K
E
 
Q
L
 
W
T
 
A
H
 
K
L
 
-
P
 
-
V
 
V
M
 
I
V
 
Y
D
 
D
P
 
A
S
 
T
H
|
H
A
 
S
T
 
V
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
L
G
 
G
K
 
M
R
 
R
S
 
E
L
 
F
V
 
I
T
 
F
P
 
P
M
 
L
S
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
C
H
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
F
V
 
M
E
 
E
V
 
T
H
 
H
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
A
P
 
S
Q
 
T
S
 
Q
L
 
L
T
 
P
F
 
L
P
 
S
G
 
Q
F
 
L
E
 
E
A
 
G
L
 
I
M
 
I
A
 
E
D
 
A
L
 
I
K
 
L
K
 
E
L
 
I
R
 
R
N
 
E
C
 
V
L
 
A
S
 
S

3e12A Cu2+ substituted aquifex aeolicus kdo8ps in complex with kdo8p (see paper)
30% identity, 72% coverage: 94:335/338 of query aligns to 1:252/258 of 3e12A

query
sites
3e12A
E
 
E
R
 
K
P
 
F
V
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
A
G
 
G
P
 
P
C
|
C
A
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
S
E
 
E
E
 
E
Q
 
L
I
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
V
A
 
G
R
 
E
F
 
E
V
 
I
K
 
K
Q
 
R
C
 
L
G
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
F
-
 
K
-
 
E
A
 
V
D
 
E
L
 
F
L
 
V
R
 
F
G
x
K
G
 
S
A
 
S
F
 
F
K
 
D
P
x
K
-
 
A
-
x
N
R
|
R
T
x
S
G
 
S
P
 
I
H
 
H
T
 
S
F
 
F
Q
 
R
G
 
G
L
 
H
-
 
G
R
 
L
E
 
E
E
 
Y
G
 
G
L
 
V
K
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
R
K
 
K
A
 
V
R
 
K
T
 
E
A
 
E
T
 
F
G
 
G
L
 
L
P
 
K
I
 
I
V
 
T
T
 
T
E
 
D
V
 
I
M
 
H
S
 
E
P
 
S
D
 
W
N
 
Q
V
 
A
A
 
E
L
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
I
Q
|
Q
V
 
I
G
x
P
A
|
A
R
 
F
N
 
L
M
 
C
Q
 
R
N
 
Q
F
 
T
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
L
E
 
A
L
 
A
G
 
A
R
 
K
I
 
T
R
 
G
K
 
R
P
 
A
I
 
V
L
 
N
L
 
V
K
|
K
R
 
K
G
 
G
M
 
Q
S
 
F
A
 
L
T
 
A
I
 
P
E
 
W
E
 
D
F
 
T
L
 
K
A
 
N
A
 
V
A
 
V
E
 
E
Y
 
K
I
 
L
L
 
K
A
 
F
E
 
G
G
 
G
N
 
A
D
 
K
Q
 
E
V
 
I
I
 
Y
L
 
L
C
 
T
E
 
E
R
|
R
G
 
G
I
 
T
R
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
T
 
T
A
 
F
T
 
G
R
 
Y
N
 
N
T
 
N
L
 
L
-
 
V
-
 
V
D
 
D
L
 
F
A
 
R
M
 
S
V
 
L
P
 
P
L
 
I
V
 
M
K
 
K
E
 
Q
L
 
W
T
 
A
H
 
K
L
 
-
P
 
-
V
 
V
M
 
I
V
 
Y
D
 
D
P
 
A
S
 
T
H
|
H
A
 
S
T
 
V
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
G
G
 
G
K
 
M
R
 
R
S
 
E
L
 
F
V
 
I
T
 
F
P
 
P
M
 
L
S
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
C
H
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
F
V
 
M
E
|
E
V
 
T
H
 
H
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
|
D
G
 
A
P
 
S
Q
 
T
S
 
Q
L
 
L
T
 
P
F
 
L
P
 
S
G
 
Q
F
 
L
E
 
E
A
 
G
L
 
I
M
 
I
A
 
E
D
 
A
L
 
I
K
 
L
K
 
E
L
 
I
R
 
R
N
 
E
C
 
V
L
 
A
S
 
S

3e0iA Cu2+ substituted aquifex aeolicus kdo8ps in complex with pep (see paper)
29% identity, 72% coverage: 94:335/338 of query aligns to 1:257/263 of 3e0iA

query
sites
3e0iA
E
 
E
R
 
K
P
 
F
V
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
A
G
 
G
P
 
P
C
|
C
A
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
S
E
 
E
E
 
E
Q
 
L
I
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
V
A
 
G
R
 
E
F
 
E
V
 
I
K
 
K
Q
 
R
C
 
L
G
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
F
-
 
K
-
 
E
A
 
V
D
 
E
L
 
F
L
 
V
R
 
F
G
x
K
G
 
S
A
 
S
F
 
F
K
 
D
P
x
K
-
 
A
-
 
N
R
|
R
T
x
S
G
 
S
P
 
I
H
 
H
T
 
S
F
 
F
Q
 
R
G
 
G
L
 
H
-
 
G
R
 
L
E
 
E
E
 
Y
G
 
G
L
 
V
K
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
R
K
 
K
A
 
V
R
 
K
T
 
E
A
 
E
T
 
F
G
 
G
L
 
L
P
 
K
I
 
I
V
 
T
T
 
T
E
 
D
V
 
I
M
 
H
S
 
E
P
 
S
D
 
W
N
 
Q
V
 
A
A
 
E
L
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
I
Q
|
Q
V
 
I
G
x
P
A
|
A
R
 
F
N
 
L
M
 
C
Q
 
R
N
 
Q
F
 
T
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
L
E
 
A
L
 
A
G
 
A
R
 
K
I
 
T
R
 
G
K
 
R
P
 
A
I
 
V
L
 
N
L
 
V
K
|
K
R
 
K
G
 
G
M
 
Q
S
 
F
A
 
L
T
 
A
I
 
P
E
 
W
E
 
D
F
 
T
L
 
K
A
 
N
A
 
V
A
 
V
E
 
E
Y
 
K
I
 
L
L
 
K
A
 
F
E
 
G
G
 
G
N
 
A
D
 
K
Q
 
E
V
 
I
I
 
Y
L
 
L
C
 
T
E
 
E
R
|
R
G
 
G
I
 
T
R
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
T
 
T
A
 
F
T
 
G
R
 
Y
N
 
N
T
 
N
L
 
L
-
 
V
-
 
V
D
 
D
L
 
F
A
 
R
M
 
S
V
 
L
P
 
P
L
 
I
V
 
M
K
 
K
E
 
Q
L
 
W
T
 
A
H
 
K
L
 
-
P
 
-
V
 
V
M
 
I
V
 
Y
D
 
D
P
 
A
S
 
T
H
|
H
A
 
S
T
 
V
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
x
K
-
x
S
-
 
G
G
 
G
K
 
M
R
 
R
S
 
E
L
 
F
V
 
I
T
 
F
P
 
P
M
 
L
S
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
C
H
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
F
V
 
M
E
|
E
V
 
T
H
 
H
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
A
P
 
S
Q
 
T
S
 
Q
L
 
L
T
 
P
F
 
L
P
 
S
G
 
Q
F
 
L
E
 
E
A
 
G
L
 
I
M
 
I
A
 
E
D
 
A
L
 
I
K
 
L
K
 
E
L
 
I
R
 
R
N
 
E
C
 
V
L
 
A
S
 
S

2a21A Aquifex aeolicus kdo8ps in complex with pep, po4, and zn2+ (see paper)
29% identity, 72% coverage: 94:335/338 of query aligns to 1:257/263 of 2a21A

query
sites
2a21A
E
 
E
R
 
K
P
 
F
V
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
A
G
 
G
P
 
P
C
|
C
A
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
S
E
 
E
E
 
E
Q
 
L
I
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
V
A
 
G
R
 
E
F
 
E
V
 
I
K
 
K
Q
 
R
C
 
L
G
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
F
-
 
K
-
 
E
A
 
V
D
 
E
L
 
F
L
 
V
R
 
F
G
x
K
G
 
S
A
 
S
F
 
F
K
 
D
P
x
K
-
 
A
-
 
N
R
|
R
T
x
S
G
 
S
P
 
I
H
 
H
T
 
S
F
 
F
Q
 
R
G
 
G
L
 
H
-
 
G
R
 
L
E
 
E
E
 
Y
G
 
G
L
 
V
K
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
R
K
 
K
A
 
V
R
 
K
T
 
E
A
 
E
T
 
F
G
 
G
L
 
L
P
 
K
I
 
I
V
 
T
T
 
T
E
 
D
V
 
I
M
 
H
S
 
E
P
 
S
D
 
W
N
 
Q
V
 
A
A
 
E
L
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
I
Q
|
Q
V
 
I
G
x
P
A
|
A
R
 
F
N
 
L
M
 
C
Q
 
R
N
 
Q
F
 
T
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
L
E
 
A
L
 
A
G
 
A
R
 
K
I
 
T
R
 
G
K
 
R
P
 
A
I
 
V
L
 
N
L
 
V
K
|
K
R
 
K
G
 
G
M
 
Q
S
 
F
A
 
L
T
 
A
I
 
P
E
 
W
E
 
D
F
 
T
L
 
K
A
 
N
A
 
V
A
 
V
E
 
E
Y
 
K
I
 
L
L
 
K
A
 
F
E
 
G
G
 
G
N
 
A
D
 
K
Q
 
E
V
 
I
I
 
Y
L
 
L
C
 
T
E
 
E
R
|
R
G
 
G
I
 
T
R
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
T
 
T
A
 
F
T
 
G
R
 
Y
N
 
N
T
 
N
L
 
L
-
 
V
-
 
V
D
 
D
L
 
F
A
 
R
M
 
S
V
 
L
P
 
P
L
 
I
V
 
M
K
 
K
E
 
Q
L
 
W
T
 
A
H
 
K
L
 
-
P
 
-
V
 
V
M
 
I
V
 
Y
D
 
D
P
 
A
S
 
T
H
|
H
A
 
S
T
 
V
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
x
S
-
 
G
G
 
G
K
 
M
R
 
R
S
 
E
L
 
F
V
 
I
T
 
F
P
 
P
M
 
L
S
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
C
H
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
F
V
 
M
E
|
E
V
 
T
H
 
H
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
|
D
G
 
A
P
 
S
Q
 
T
S
 
Q
L
 
L
T
 
P
F
 
L
P
 
S
G
 
Q
F
 
L
E
 
E
A
 
G
L
 
I
M
 
I
A
 
E
D
 
A
L
 
I
K
 
L
K
 
E
L
 
I
R
 
R
N
 
E
C
 
V
L
 
A
S
 
S

1jcyA Aquifex aeolicus kdo8p synthase in complex with r5p, pep and cadmium (see paper)
29% identity, 72% coverage: 94:335/338 of query aligns to 1:257/263 of 1jcyA

query
sites
1jcyA
E
 
E
R
 
K
P
 
F
V
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
A
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
S
E
 
E
E
 
E
Q
 
L
I
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
V
A
 
G
R
 
E
F
 
E
V
 
I
K
 
K
Q
 
R
C
 
L
G
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
F
-
 
K
-
 
E
A
 
V
D
 
E
L
 
F
L
 
V
R
 
F
G
x
K
G
 
S
A
 
S
F
 
F
K
 
D
P
x
K
-
 
A
-
x
N
R
|
R
T
x
S
G
 
S
P
 
I
H
 
H
T
 
S
F
 
F
Q
 
R
G
 
G
L
 
H
-
 
G
R
 
L
E
 
E
E
 
Y
G
 
G
L
 
V
K
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
R
K
 
K
A
 
V
R
 
K
T
 
E
A
 
E
T
 
F
G
 
G
L
 
L
P
 
K
I
 
I
V
 
T
T
 
T
E
 
D
V
 
I
M
 
H
S
 
E
P
 
S
D
 
W
N
 
Q
V
 
A
A
 
E
L
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
I
Q
|
Q
V
 
I
G
x
P
A
|
A
R
 
F
N
 
L
M
 
C
Q
 
R
N
 
Q
F
 
T
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
L
E
 
A
L
 
A
G
 
A
R
 
K
I
 
T
R
 
G
K
 
R
P
 
A
I
 
V
L
 
N
L
 
V
K
|
K
R
 
K
G
 
G
M
 
Q
S
 
F
A
 
L
T
 
A
I
 
P
E
 
W
E
 
D
F
 
T
L
 
K
A
 
N
A
 
V
A
 
V
E
 
E
Y
 
K
I
 
L
L
 
K
A
 
F
E
 
G
G
 
G
N
 
A
D
 
K
Q
 
E
V
 
I
I
 
Y
L
 
L
C
 
T
E
 
E
R
|
R
G
 
G
I
 
T
R
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
T
 
T
A
 
F
T
 
G
R
 
Y
N
 
N
T
 
N
L
 
L
-
 
V
-
 
V
D
 
D
L
 
F
A
 
R
M
 
S
V
 
L
P
 
P
L
 
I
V
 
M
K
 
K
E
 
Q
L
 
W
T
 
A
H
 
K
L
 
-
P
 
-
V
 
V
M
 
I
V
 
Y
D
 
D
P
 
A
S
 
T
H
|
H
A
 
S
T
 
V
-
x
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
x
S
-
 
G
G
 
G
K
 
M
R
 
R
S
 
E
L
 
F
V
 
I
T
 
F
P
 
P
M
 
L
S
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
C
H
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
F
V
 
M
E
 
E
V
 
T
H
 
H
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
A
P
 
S
Q
 
T
S
 
Q
L
 
L
T
 
P
F
 
L
P
 
S
G
 
Q
F
 
L
E
 
E
A
 
G
L
 
I
M
 
I
A
 
E
D
 
A
L
 
I
K
 
L
K
 
E
L
 
I
R
 
R
N
 
E
C
 
V
L
 
A
S
 
S

1fwwA Aquifex aeolicus kdo8p synthase in complex with pep, a5p and cadmium (see paper)
29% identity, 72% coverage: 94:335/338 of query aligns to 1:257/263 of 1fwwA

query
sites
1fwwA
E
 
E
R
 
K
P
 
F
V
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
A
G
 
G
P
 
P
C
 
C
A
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
S
E
 
E
E
 
E
Q
 
L
I
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
V
A
 
G
R
 
E
F
 
E
V
 
I
K
 
K
Q
 
R
C
 
L
G
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
F
-
 
K
-
 
E
A
 
V
D
 
E
L
 
F
L
 
V
R
 
F
G
x
K
G
 
S
A
 
S
F
 
F
K
 
D
P
x
K
-
 
A
-
x
N
R
|
R
T
x
S
G
 
S
P
 
I
H
 
H
T
 
S
F
 
F
Q
 
R
G
 
G
L
 
H
-
 
G
R
 
L
E
 
E
E
 
Y
G
 
G
L
 
V
K
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
R
K
 
K
A
 
V
R
 
K
T
 
E
A
 
E
T
 
F
G
 
G
L
 
L
P
 
K
I
 
I
V
 
T
T
 
T
E
 
D
V
 
I
M
 
H
S
 
E
P
 
S
D
 
W
N
 
Q
V
 
A
A
 
E
L
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
I
Q
|
Q
V
 
I
G
x
P
A
|
A
R
 
F
N
 
L
M
 
C
Q
 
R
N
 
Q
F
 
T
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
L
E
 
A
L
 
A
G
 
A
R
 
K
I
 
T
R
 
G
K
 
R
P
 
A
I
 
V
L
 
N
L
 
V
K
|
K
R
 
K
G
 
G
M
 
Q
S
 
F
A
 
L
T
 
A
I
 
P
E
 
W
E
 
D
F
 
T
L
 
K
A
 
N
A
 
V
A
 
V
E
 
E
Y
 
K
I
 
L
L
 
K
A
 
F
E
 
G
G
 
G
N
 
A
D
 
K
Q
 
E
V
 
I
I
 
Y
L
 
L
C
 
T
E
 
E
R
|
R
G
 
G
I
 
T
R
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
-
T
 
T
A
 
F
T
 
G
R
 
Y
N
 
N
T
 
N
L
 
L
-
 
V
-
 
V
D
 
D
L
 
F
A
 
R
M
 
S
V
 
L
P
 
P
L
 
I
V
 
M
K
 
K
E
 
Q
L
 
W
T
 
A
H
 
K
L
 
-
P
 
-
V
 
V
M
 
I
V
 
Y
D
 
D
P
 
A
S
 
T
H
|
H
A
 
S
T
 
V
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
x
S
-
 
G
G
 
G
K
 
M
R
 
R
S
 
E
L
 
F
V
 
I
T
 
F
P
 
P
M
 
L
S
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
C
H
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
F
V
 
M
E
 
E
V
 
T
H
 
H
P
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
|
D
G
 
A
P
 
S
Q
 
T
S
 
Q
L
 
L
T
 
P
F
 
L
P
 
S
G
 
Q
F
 
L
E
 
E
A
 
G
L
 
I
M
 
I
A
 
E
D
 
A
L
 
I
K
 
L
K
 
E
L
 
I
R
 
R
N
 
E
C
 
V
L
 
A
S
 
S

Query Sequence

>WP_012470844.1 NCBI__GCF_000020385.1:WP_012470844.1
MLIVMNHTASQADIDKVIEVVSGMGFTAAPIPGGERTAIGVLGNKGYVDDSTIRDLPGVQ
QAIHVSKPYKLVSRDFHPDNTIVDVAGVKIGEGERPVVVGGPCAVESEEQILKTARFVKQ
CGADLLRGGAFKPRTGPHTFQGLREEGLKLLAKARTATGLPIVTEVMSPDNVALVAEYAD
LLQVGARNMQNFDLLRELGRIRKPILLKRGMSATIEEFLAAAEYILAEGNDQVILCERGI
RTFETATRNTLDLAMVPLVKELTHLPVMVDPSHATGKRSLVTPMSKAALVAGAHGVLVEV
HPEPEKALSDGPQSLTFPGFEALMADLKKLRNCLSCCG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory