SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012470937.1 NCBI__GCF_000020385.1:WP_012470937.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
46% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 1:259/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
M
 
M
T
 
E
T
 
F
T
 
E
T
 
T
L
 
I
M
 
E
V
 
T
E
 
K
T
 
K
K
 
E
D
 
G
G
 
N
I
 
L
A
 
F
T
 
W
I
 
I
T
 
T
V
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
D
S
x
K
M
x
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
T
 
N
V
 
A
T
 
K
T
 
L
L
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
D
V
 
R
V
 
A
V
 
V
Q
 
S
E
 
Q
L
 
A
S
 
E
A
 
S
S
 
D
A
 
P
V
 
E
V
 
I
R
 
R
A
 
V
V
 
I
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
K
G
 
G
E
 
-
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
C
A
|
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
I
|
I
A
 
T
M
 
Q
L
x
F
Q
 
N
K
 
Q
L
 
L
G
 
T
P
 
P
V
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
W
E
 
K
L
 
F
A
x
S
L
 
K
L
 
K
A
 
G
H
x
R
G
 
E
L
 
I
C
 
M
R
 
D
A
 
K
I
 
I
E
 
E
Q
 
A
S
 
L
P
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
M
V
 
I
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
C
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
I
R
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
E
A
 
A
R
 
Q
F
 
L
G
 
G
Q
 
L
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
N
I
 
L
G
 
G
T
x
I
L
 
Y
P
|
P
G
|
G
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
E
M
 
M
I
 
M
L
 
M
T
 
T
G
 
G
D
 
D
M
x
R
I
 
I
D
 
P
A
 
G
Q
 
K
E
 
D
A
 
A
W
 
E
R
 
K
I
 
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
K
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
L
A
 
A
E
 
N
L
 
L
M
 
E
A
 
Q
A
 
E
A
 
T
N
 
R
A
 
K
V
 
L
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
I
A
 
A
G
 
K
K
 
K
S
 
S
L
 
P
M
 
I
A
 
S
L
 
L
K
 
A
L
 
L
C
 
I
K
 
K
E
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
N
N
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
D
M
 
S
D
 
P
L
 
L
D
 
L
R
 
S
A
 
G
C
 
L
S
x
A
Y
 
L
E
 
E
A
 
S
D
 
V
L
 
G
F
 
W
A
 
G
L
 
V
S
 
V
F
|
F
A
 
S
T
 
T
A
 
E
D
 
D
Q
 
K
Q
 
K
E
 
E
G
 
G
M
 
V
A
 
S
A
 
A
F
|
F
L
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
A
 
E
P
 
P
V
 
T
F
 
F
S
 
K
D
 
G
R
 
K

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
47% identity, 100% coverage: 2:260/260 of query aligns to 1:256/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
T
 
T
T
 
Y
T
 
E
T
 
T
L
 
I
M
 
L
V
 
V
E
 
E
T
 
R
K
 
D
D
 
Q
G
 
R
I
 
V
A
 
G
T
 
I
I
 
I
T
 
T
V
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
Q
S
 
A
M
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
T
 
N
V
 
S
T
 
Q
T
 
V
L
 
M
Q
 
N
E
 
E
L
 
V
S
 
T
V
 
S
V
 
A
V
 
A
Q
 
T
E
 
E
L
 
L
S
 
D
A
 
D
S
 
D
A
 
P
V
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
E
 
-
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
 
A
G
 
G
G
x
A
D
 
D
I
 
I
A
 
K
M
 
E
L
x
M
Q
 
A
K
 
D
L
 
L
G
 
T
P
 
F
V
 
A
A
 
D
A
 
A
R
 
F
E
x
T
L
 
A
A
 
D
L
 
F
L
x
F
A
 
A
-
 
T
H
 
W
G
 
G
L
 
K
C
 
L
R
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
R
Q
 
-
S
 
-
P
 
-
K
 
T
P
 
P
F
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
V
R
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
K
I
 
L
G
 
G
T
x
V
L
 
L
P
|
P
G
|
G
F
 
M
G
 
G
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
M
E
 
D
M
 
L
I
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
R
M
 
T
I
 
M
D
 
D
A
 
A
Q
 
A
E
 
E
A
 
A
W
 
E
R
 
R
I
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
D
E
 
D
L
 
L
M
 
L
A
 
T
A
 
E
A
 
A
N
 
R
A
 
A
V
 
T
A
 
A
Q
 
T
K
 
T
L
 
I
A
 
S
G
 
Q
K
 
M
S
 
S
L
 
A
M
 
S
A
 
A
L
 
A
K
 
R
L
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
V
 
A
V
 
V
V
 
N
N
 
R
G
 
A
L
 
F
E
 
E
M
 
S
D
 
S
L
 
L
D
 
S
R
 
E
A
 
G
C
 
L
S
x
L
Y
 
Y
E
 
E
A
 
R
D
 
R
L
 
L
F
 
F
A
 
H
L
 
S
S
 
A
F
|
F
A
 
A
T
 
T
A
 
E
D
 
D
Q
|
Q
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
A
P
 
P
V
 
Q
F
 
F
S
 
T
D
 
H
R
 
R

3q0jC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
47% identity, 99% coverage: 1:258/260 of query aligns to 1:255/255 of 3q0jC

query
sites
3q0jC
M
 
M
T
 
T
T
 
Y
T
 
E
T
 
T
L
 
I
M
 
L
V
 
V
E
 
E
T
 
R
K
 
D
D
 
Q
G
 
R
I
 
V
A
 
G
T
 
I
I
 
I
T
 
T
V
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
Q
S
x
A
M
x
L
N
 
N
A
|
A
M
 
L
T
 
N
V
 
S
T
 
Q
T
 
V
L
 
M
Q
 
N
E
 
E
L
 
V
S
 
T
V
 
S
V
 
A
V
 
A
Q
 
T
E
 
E
L
 
L
S
 
D
A
 
D
S
 
D
A
 
P
V
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
E
 
-
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
|
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
I
|
I
A
x
K
M
 
E
L
x
M
Q
 
A
K
 
D
L
 
L
G
 
T
P
 
F
V
 
A
A
 
D
A
 
A
R
 
F
E
x
T
L
 
A
A
 
D
L
 
F
L
x
F
A
 
A
-
 
T
H
 
W
G
 
G
L
 
K
C
 
L
R
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
R
Q
 
-
S
 
-
P
 
-
K
 
T
P
 
P
F
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
V
R
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
K
I
 
L
G
 
G
T
x
V
L
 
L
P
|
P
G
|
G
F
x
M
G
 
G
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
M
E
 
D
M
 
L
I
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
R
M
 
T
I
 
M
D
 
D
A
 
A
Q
 
A
E
 
E
A
 
A
W
 
E
R
 
R
I
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
D
E
 
D
L
 
L
M
 
L
A
 
T
A
 
E
A
 
A
N
 
R
A
 
A
V
 
T
A
 
A
Q
 
T
K
 
T
L
 
I
A
 
S
G
 
Q
K
 
M
S
 
S
L
 
A
M
 
S
A
 
A
L
 
A
K
 
R
L
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
V
 
A
V
 
V
V
 
N
N
 
R
G
 
A
L
 
F
E
 
E
M
 
S
D
 
S
L
 
L
D
 
S
R
 
E
A
 
G
C
 
L
S
x
L
Y
 
Y
E
 
E
A
 
R
D
 
R
L
 
L
F
 
F
A
 
H
L
 
S
S
 
A
F
|
F
A
 
A
T
 
T
A
 
E
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
A
P
 
P
V
 
Q
F
 
F
S
 
T

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
47% identity, 99% coverage: 1:258/260 of query aligns to 1:255/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
M
 
M
T
 
T
T
 
Y
T
 
E
T
 
T
L
 
I
M
 
L
V
 
V
E
 
E
T
 
R
K
 
D
D
 
Q
G
 
R
I
 
V
A
 
G
T
 
I
I
 
I
T
 
T
V
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
Q
S
 
A
M
x
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
T
 
N
V
 
S
T
 
Q
T
 
V
L
 
M
Q
 
N
E
 
E
L
 
V
S
 
T
V
 
S
V
 
A
V
 
A
Q
 
T
E
 
E
L
 
L
S
 
D
A
 
D
S
 
D
A
 
P
V
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
E
 
-
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
|
A
G
 
G
G
x
A
D
 
D
I
|
I
A
x
K
M
 
E
L
x
M
Q
 
A
K
 
D
L
 
L
G
 
T
P
 
F
V
 
A
A
 
D
A
 
A
R
 
F
E
x
T
L
 
A
A
 
D
L
 
F
L
x
F
A
 
A
-
 
T
H
 
W
G
 
G
L
 
K
C
 
L
R
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
R
Q
 
-
S
 
-
P
 
-
K
 
T
P
 
P
F
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
A
G
 
G
Y
|
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
V
R
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
K
I
x
L
G
 
G
T
x
V
L
 
L
P
|
P
G
|
G
F
 
M
G
 
G
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
M
E
 
D
M
 
L
I
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
R
M
 
T
I
 
M
D
 
D
A
 
A
Q
 
A
E
 
E
A
 
A
W
 
E
R
 
R
I
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
D
E
 
D
L
 
L
M
 
L
A
 
T
A
 
E
A
 
A
N
 
R
A
 
A
V
 
T
A
 
A
Q
 
T
K
 
T
L
 
I
A
 
S
G
 
Q
K
 
M
S
 
S
L
 
A
M
 
S
A
 
A
L
 
A
K
 
R
L
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
V
 
A
V
 
V
V
 
N
N
 
R
G
 
A
L
 
F
E
 
E
M
 
S
D
 
S
L
 
L
D
 
S
R
 
E
A
 
G
C
 
L
S
x
L
Y
 
Y
E
 
E
A
 
R
D
 
R
L
 
L
F
 
F
A
 
H
L
 
S
S
 
A
F
|
F
A
 
A
T
 
T
A
 
E
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
A
P
 
P
V
 
Q
F
 
F
S
 
T

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
46% identity, 99% coverage: 2:258/260 of query aligns to 1:250/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
T
 
T
T
 
Y
T
 
E
T
 
T
L
 
I
M
 
L
V
 
V
E
 
E
T
 
R
K
 
D
D
 
Q
G
 
R
I
 
V
A
 
G
T
 
I
I
 
I
T
 
T
V
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
Q
S
 
A
M
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
T
 
N
V
 
S
T
 
Q
T
 
V
L
 
M
Q
 
N
E
 
E
L
 
V
S
 
T
V
 
S
V
 
A
V
 
A
Q
 
T
E
 
E
L
 
L
S
 
D
A
 
D
S
 
D
A
 
P
V
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
E
 
-
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
 
A
G
 
G
G
x
A
D
 
D
I
 
I
A
 
-
M
 
-
L
 
-
Q
 
K
K
 
E
L
x
M
G
 
F
P
 
A
V
 
D
A
 
A
A
 
F
R
x
T
E
 
A
L
 
D
A
 
F
L
x
F
L
 
A
A
 
T
H
 
W
G
 
G
L
 
K
C
 
L
R
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
R
Q
 
-
S
 
-
P
 
-
K
 
T
P
 
P
F
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
V
R
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
K
I
 
L
G
 
G
T
x
V
L
 
L
P
|
P
G
|
G
F
 
M
G
 
G
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
M
E
 
D
M
 
L
I
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
R
M
 
T
I
 
M
D
 
D
A
 
A
Q
 
A
E
 
E
A
 
A
W
 
E
R
 
R
I
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
D
E
 
D
L
 
L
M
 
L
A
 
T
A
 
E
A
 
A
N
 
R
A
 
A
V
 
T
A
 
A
Q
 
T
K
 
T
L
 
I
A
 
S
G
 
Q
K
 
M
S
 
S
L
 
A
M
 
S
A
 
A
L
 
A
K
 
R
L
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
V
 
A
V
 
V
V
 
N
N
 
R
G
 
A
L
 
F
E
 
E
M
 
S
D
 
S
L
 
L
D
 
S
R
 
E
A
 
G
C
 
L
S
x
L
Y
 
Y
E
 
E
A
 
R
D
 
R
L
 
L
F
|
F
A
 
H
L
 
S
S
 
A
F
|
F
A
 
A
T
 
T
A
 
E
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
A
F
|
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
A
P
 
P
V
 
Q
F
 
F
S
 
T

1ey3A Structure of enoyl-coa hydratase complexed with the substrate dac-coa (see paper)
45% identity, 95% coverage: 14:260/260 of query aligns to 15:258/258 of 1ey3A

query
sites
1ey3A
I
 
V
A
 
G
T
 
L
I
 
I
T
 
Q
V
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
K
S
 
A
M
x
L
N
 
N
A
|
A
M
 
L
T
 
C
V
 
N
T
 
G
T
 
L
L
 
I
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
N
V
 
Q
V
 
A
V
 
L
Q
 
E
E
 
T
L
 
F
S
 
E
A
 
E
S
 
D
A
 
P
V
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
-
G
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
|
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
I
|
I
A
 
K
M
 
E
L
x
M
Q
 
Q
K
 
N
L
 
R
G
 
T
P
 
F
V
 
Q
A
 
D
A
 
C
R
 
Y
E
x
S
L
 
G
A
 
K
L
 
F
L
|
L
A
 
S
H
 
H
G
 
-
L
 
-
C
x
W
R
 
D
A
 
H
I
 
I
E
 
T
Q
 
R
S
 
I
P
 
K
K
 
K
P
 
P
F
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
I
R
 
I
I
 
Y
A
 
A
A
 
G
E
 
E
N
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
L
I
x
L
G
 
G
T
|
T
L
 
I
P
|
P
G
|
G
F
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
S
R
 
L
A
 
A
L
 
M
E
 
E
M
 
M
I
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
D
M
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
A
Q
 
Q
E
 
D
A
 
A
W
 
K
R
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
K
V
 
I
V
 
F
P
 
P
A
 
V
A
 
E
E
 
T
L
 
L
M
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
N
 
I
A
 
Q
V
 
C
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
I
A
 
A
G
 
N
K
 
N
S
 
S
L
 
K
M
 
I
A
 
I
L
 
V
K
 
A
L
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
V
 
S
V
 
V
V
 
N
N
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
M
 
M
D
 
T
L
 
L
D
 
T
R
 
E
A
 
G
C
 
N
S
x
K
Y
 
L
E
 
E
A
 
K
D
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
Y
L
 
S
S
 
T
F
|
F
A
 
A
T
 
T
A
 
D
D
 
D
Q
 
R
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
M
 
M
A
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
K
P
 
A
V
 
N
F
 
F
S
 
K
D
 
D
R
 
H

1dubA 2-enoyl-coa hydratase, data collected at 100 k, ph 6.5 (see paper)
45% identity, 95% coverage: 14:260/260 of query aligns to 17:260/260 of 1dubA

query
sites
1dubA
I
 
V
A
 
G
T
 
L
I
 
I
T
 
Q
V
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
K
S
x
A
M
x
L
N
 
N
A
|
A
M
 
L
T
 
C
V
 
N
T
 
G
T
 
L
L
 
I
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
N
V
 
Q
V
 
A
V
 
L
Q
 
E
E
 
T
L
 
F
S
 
E
A
 
E
S
 
D
A
 
P
V
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
-
G
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
|
A
G
 
G
G
x
A
D
|
D
I
|
I
A
 
K
M
 
E
L
x
M
Q
 
Q
K
 
N
L
 
R
G
 
T
P
 
F
V
 
Q
A
 
D
A
 
C
R
 
Y
E
x
S
L
 
G
A
 
K
L
 
F
L
|
L
A
 
S
H
 
H
G
 
-
L
 
-
C
 
W
R
 
D
A
 
H
I
 
I
E
 
T
Q
 
R
S
 
I
P
 
K
K
 
K
P
 
P
F
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
|
Y
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
I
R
 
I
I
 
Y
A
 
A
A
 
G
E
 
E
N
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
L
I
x
L
G
 
G
T
|
T
L
 
I
P
|
P
G
|
G
F
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
S
R
 
L
A
 
A
L
 
M
E
 
E
M
 
M
I
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
D
M
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
A
Q
 
Q
E
 
D
A
 
A
W
 
K
R
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
K
V
 
I
V
 
F
P
 
P
A
 
V
A
 
E
E
 
T
L
 
L
M
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
N
 
I
A
 
Q
V
 
C
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
I
A
 
A
G
 
N
K
 
N
S
 
S
L
 
K
M
 
I
A
 
I
L
 
V
K
 
A
L
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
V
 
S
V
 
V
V
 
N
N
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
M
 
M
D
 
T
L
 
L
D
 
T
R
 
E
A
 
G
C
 
N
S
x
K
Y
 
L
E
 
E
A
 
K
D
 
K
L
 
L
F
|
F
A
 
Y
L
 
S
S
 
T
F
|
F
A
 
A
T
 
T
A
 
D
D
 
D
Q
 
R
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
M
 
M
A
 
S
A
 
A
F
|
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
K
P
 
A
V
 
N
F
 
F
S
 
K
D
 
D
R
 
H

P14604 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial; mECH; mECH1; Enoyl-CoA hydratase 1; ECHS1; Short-chain enoyl-CoA hydratase; SCEH; EC 4.2.1.17; EC 5.3.3.8 from Rattus norvegicus (Rat) (see 3 papers)
45% identity, 95% coverage: 14:260/260 of query aligns to 47:290/290 of P14604

query
sites
P14604
I
 
V
A
 
G
T
 
L
I
 
I
T
 
Q
V
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
K
S
 
A
M
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
T
 
C
V
 
N
T
 
G
T
 
L
L
 
I
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
N
V
 
Q
V
 
A
V
 
L
Q
 
E
E
 
T
L
 
F
S
 
E
A
 
E
S
 
D
A
 
P
V
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
-
G
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
K
M
 
E
L
 
M
Q
 
Q
K
 
N
L
 
R
G
 
T
P
 
F
V
 
Q
A
 
D
A
 
C
R
 
Y
E
 
S
L
 
G
A
 
K
L
 
F
L
 
L
A
 
S
H
 
H
G
 
-
L
 
-
C
 
W
R
 
D
A
 
H
I
 
I
E
 
T
Q
 
R
S
 
I
P
 
K
K
 
K
P
 
P
F
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
I
R
 
I
I
 
Y
A
 
A
A
 
G
E
 
E
N
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
|
E
I
 
I
N
 
L
I
 
L
G
 
G
T
 
T
L
 
I
P
 
P
G
 
G
F
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
S
R
 
L
A
 
A
L
 
M
E
 
E
M
 
M
I
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
D
M
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
A
Q
 
Q
E
 
D
A
 
A
W
 
K
R
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
K
V
 
I
V
 
F
P
 
P
A
 
V
A
 
E
E
 
T
L
 
L
M
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
N
 
I
A
 
Q
V
 
C
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
I
A
 
A
G
 
N
K
 
N
S
 
S
L
 
K
M
 
I
A
 
I
L
 
V
K
 
A
L
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
V
 
S
V
 
V
V
 
N
N
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
M
 
M
D
 
T
L
 
L
D
 
T
R
 
E
A
 
G
C
 
N
S
 
K
Y
 
L
E
 
E
A
 
K
D
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
Y
L
 
S
S
 
T
F
 
F
A
 
A
T
 
T
A
 
D
D
 
D
Q
 
R
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
M
 
M
A
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
K
P
 
A
V
 
N
F
 
F
S
 
K
D
 
D
R
 
H

Sites not aligning to the query:

2hw5C The crystal structure of human enoyl-coenzyme a (coa) hydratase short chain 1, echs1
45% identity, 95% coverage: 14:260/260 of query aligns to 17:260/260 of 2hw5C

query
sites
2hw5C
I
 
V
A
 
G
T
 
L
I
 
I
T
 
Q
V
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
K
S
x
A
M
x
L
N
 
N
A
|
A
M
 
L
T
 
C
V
 
D
T
 
G
T
 
L
L
 
I
Q
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
N
V
 
Q
V
 
A
V
 
L
Q
 
K
E
 
I
L
 
F
S
 
E
A
 
E
S
 
D
A
 
P
V
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
-
G
 
G
E
 
D
K
|
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
 
A
G
 
G
G
x
A
D
 
D
I
|
I
A
 
K
M
 
E
L
x
M
Q
 
Q
K
 
N
L
 
L
G
 
S
P
 
F
V
 
Q
A
 
D
A
 
C
R
 
Y
E
x
S
L
 
S
A
 
K
L
 
F
L
|
L
A
 
K
H
 
H
G
 
-
L
 
-
C
 
W
R
 
D
A
 
H
I
 
L
E
 
T
Q
 
Q
S
 
V
P
 
K
K
 
K
P
 
P
F
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
x
F
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
I
R
 
I
I
 
Y
A
 
A
A
 
G
E
 
E
N
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
G
 
A
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
L
I
 
I
G
 
G
T
|
T
L
 
I
P
|
P
G
|
G
F
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
S
R
 
L
A
 
A
L
 
M
E
 
E
M
 
M
I
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
D
M
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
A
Q
 
Q
E
 
D
A
 
A
W
 
K
R
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
K
V
 
I
V
 
C
P
 
P
A
 
V
A
 
E
E
 
T
L
 
L
M
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
N
 
I
A
 
Q
V
 
C
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
I
A
 
A
G
 
S
K
 
N
S
 
S
L
 
K
M
 
I
A
 
V
L
 
V
K
 
A
L
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
V
 
S
V
 
V
V
 
N
N
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
M
 
M
D
 
T
L
 
L
D
 
T
R
 
E
A
 
G
C
 
S
S
x
K
Y
 
L
E
 
E
A
 
K
D
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
Y
L
 
S
S
 
T
F
|
F
A
 
A
T
 
T
A
 
D
D
 
D
Q
 
R
Q
 
K
E
 
E
G
 
G
M
 
M
A
 
T
A
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
K
P
 
A
V
 
N
F
 
F
S
 
K
D
 
D
R
 
Q

1mj3A Crystal structure analysis of rat enoyl-coa hydratase in complex with hexadienoyl-coa (see paper)
45% identity, 95% coverage: 14:260/260 of query aligns to 17:258/258 of 1mj3A

query
sites
1mj3A
I
 
V
A
 
G
T
 
L
I
 
I
T
 
Q
V
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
K
S
x
A
M
x
L
N
 
N
A
|
A
M
 
L
T
 
C
V
 
N
T
 
G
T
 
L
L
 
I
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
N
V
 
Q
V
 
A
V
 
L
Q
 
E
E
 
T
L
 
F
S
 
E
A
 
E
S
 
D
A
 
P
V
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
-
G
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
|
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
I
|
I
A
 
K
M
 
E
L
x
M
Q
 
Q
K
 
N
L
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
R
E
 
T
L
 
F
A
 
Q
L
 
D
L
 
C
A
 
Y
H
x
S
G
 
G
L
|
L
C
 
S
R
 
H
-
 
W
-
 
D
A
 
H
I
 
I
E
 
T
Q
 
R
S
 
I
P
 
K
K
 
K
P
 
P
F
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
I
R
 
I
I
 
Y
A
 
A
A
 
G
E
 
E
N
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
L
I
x
L
G
 
G
T
|
T
L
 
I
P
|
P
G
|
G
F
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
S
R
 
L
A
 
A
L
 
M
E
 
E
M
 
M
I
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
D
M
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
A
Q
 
Q
E
 
D
A
 
A
W
 
K
R
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
K
V
 
I
V
 
F
P
 
P
A
 
V
A
 
E
E
 
T
L
 
L
M
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
N
 
I
A
 
Q
V
 
C
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
I
A
 
A
G
 
N
K
 
N
S
 
S
L
 
K
M
 
I
A
 
I
L
 
V
K
 
A
L
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
V
 
S
V
 
V
V
 
N
N
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
M
 
M
D
 
T
L
 
L
D
 
T
R
 
E
A
 
G
C
 
N
S
x
K
Y
 
L
E
 
E
A
 
K
D
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
Y
L
 
S
S
 
T
F
|
F
A
 
A
T
 
T
A
 
D
D
 
D
Q
 
R
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
M
 
M
A
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
K
P
 
A
V
 
N
F
 
F
S
 
K
D
 
D
R
 
H

2dubA Enoyl-coa hydratase complexed with octanoyl-coa (see paper)
45% identity, 95% coverage: 14:260/260 of query aligns to 16:254/254 of 2dubA

query
sites
2dubA
I
 
V
A
 
G
T
 
L
I
 
I
T
 
Q
V
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
K
S
x
A
M
x
L
N
 
N
A
|
A
M
 
L
T
 
C
V
 
N
T
 
G
T
 
L
L
 
I
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
N
V
 
Q
V
 
A
V
 
L
Q
 
E
E
 
T
L
 
F
S
 
E
A
 
E
S
 
D
A
 
P
V
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
-
G
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
|
A
G
 
G
G
x
A
D
|
D
I
|
I
A
x
K
M
 
E
L
x
M
Q
 
Q
K
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
N
E
 
R
L
 
T
A
 
F
L
 
Q
L
 
D
A
 
C
H
 
Y
G
x
S
L
 
H
C
 
W
R
 
D
A
 
H
I
 
I
E
 
T
Q
 
R
S
 
I
P
 
K
K
 
K
P
 
P
F
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
I
R
 
I
I
 
Y
A
 
A
A
 
G
E
 
E
N
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
L
I
 
L
G
 
G
T
|
T
L
 
I
P
|
P
G
|
G
F
x
A
G
 
G
G
 
G
S
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
S
R
 
L
A
 
A
L
 
M
E
 
E
M
 
M
I
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
D
M
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
A
Q
 
Q
E
 
D
A
 
A
W
 
K
R
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
K
 
K
V
 
I
V
 
F
P
 
P
A
 
V
A
 
E
E
 
T
L
 
L
M
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
N
 
I
A
 
Q
V
 
C
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
I
A
 
A
G
 
N
K
 
N
S
 
S
L
 
K
M
 
I
A
 
I
L
 
V
K
 
A
L
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
V
 
S
V
 
V
V
 
N
N
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
M
 
M
D
 
T
L
 
L
D
 
T
R
 
E
A
 
G
C
 
N
S
x
K
Y
 
L
E
 
E
A
 
K
D
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
Y
L
 
S
S
 
T
F
|
F
A
 
A
T
 
T
A
 
D
D
 
D
Q
 
R
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
M
 
M
A
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
K
P
 
A
V
 
N
F
 
F
S
 
K
D
 
D
R
 
H

5jbxB Crystal structure of liuc in complex with coenzyme a and malonic acid (see paper)
42% identity, 98% coverage: 6:260/260 of query aligns to 7:261/261 of 5jbxB

query
sites
5jbxB
L
 
F
M
 
K
V
 
V
E
 
D
T
 
A
K
 
R
D
 
G
G
 
P
I
 
I
A
 
E
T
 
I
I
 
W
T
 
T
V
 
I
N
 
D
R
 
G
P
 
E
A
x
S
S
x
R
M
x
R
N
 
N
A
|
A
M
 
I
T
 
S
V
 
R
T
 
A
T
 
M
L
 
L
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
G
V
 
E
V
 
L
V
 
V
Q
 
T
E
 
R
L
 
V
S
 
S
A
 
S
S
 
S
A
 
R
V
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
C
A
|
A
G
 
G
G
x
A
D
|
D
I
 
-
A
 
-
M
 
-
L
|
L
Q
x
K
K
 
E
L
x
R
G
 
A
P
 
T
V
 
M
A
 
A
A
 
E
R
 
D
E
 
E
L
 
V
A
 
R
L
 
A
L
 
F
A
x
L
H
 
D
G
 
G
L
 
L
-
x
R
-
 
R
-
 
T
C
 
F
R
 
R
A
 
A
I
 
I
E
 
E
Q
 
K
S
 
S
P
 
D
K
 
C
P
 
V
F
 
F
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
N
 
N
G
 
G
Y
 
A
A
 
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
T
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
C
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
L
R
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
P
N
 
A
A
 
A
R
 
E
F
 
L
G
 
G
Q
 
L
P
x
T
E
|
E
I
 
V
N
 
K
I
x
L
G
 
G
T
x
I
L
 
I
P
|
P
G
|
G
F
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
K
 
P
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
K
E
 
D
M
 
L
I
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
A
D
 
R
M
x
R
I
 
I
D
 
N
A
 
A
Q
 
A
E
 
E
A
 
A
W
 
F
R
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
A
N
 
N
K
 
R
V
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
E
A
 
G
E
 
H
L
 
L
M
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
A
N
 
Y
A
 
G
V
 
L
A
 
A
Q
 
E
K
 
S
L
 
V
A
 
V
G
 
E
K
 
N
S
 
A
L
 
P
M
 
I
A
 
A
L
 
V
K
 
A
L
 
T
C
 
A
K
 
K
E
 
H
V
 
A
V
 
I
V
 
D
N
 
E
G
 
G
L
 
T
E
 
G
M
 
L
D
 
E
L
 
L
D
 
D
R
 
D
A
 
A
C
 
L
S
x
A
Y
 
L
E
 
E
A
 
L
D
 
R
L
 
K
F
 
Y
A
 
E
L
 
E
S
 
I
F
x
L
A
 
K
T
 
T
A
 
E
D
 
D
Q
 
R
Q
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
L
A
 
R
A
 
A
F
 
F
L
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
A
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
S
 
K
D
 
G
R
 
R

6slaAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
38% identity, 98% coverage: 6:260/260 of query aligns to 2:245/245 of 6slaAAA

query
sites
6slaAAA
L
 
I
M
 
L
V
 
K
E
 
E
T
 
R
K
 
Q
D
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
L
T
 
V
I
 
L
T
 
T
V
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
E
S
 
K
M
x
L
N
 
N
A
 
A
M
 
I
T
 
T
V
 
G
T
 
E
T
 
L
L
 
L
Q
 
D
E
 
A
L
 
L
S
 
Y
V
 
A
V
 
A
V
 
L
Q
 
K
E
 
E
L
 
G
S
 
E
A
 
E
S
 
D
A
 
R
V
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
L
I
 
L
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
-
K
 
R
A
 
A
F
 
F
I
 
S
A
|
A
G
 
G
G
x
Q
D
|
D
I
x
L
-
 
T
-
 
E
A
 
A
M
 
H
L
|
L
Q
 
R
K
 
R
L
x
Y
G
x
N
P
 
R
V
 
V
A
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
-
C
 
V
R
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
S
Q
 
G
S
 
L
P
 
E
K
 
K
P
 
P
F
 
L
I
 
V
A
 
V
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
V
A
 
A
L
x
A
G
|
G
G
x
A
G
 
G
C
 
M
E
x
S
L
 
L
A
 
A
L
 
L
C
 
W
C
 
G
D
 
D
M
 
L
R
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
V
N
 
G
A
 
A
R
 
S
F
 
F
G
 
T
Q
 
T
P
x
A
E
x
F
I
 
V
N
 
R
I
|
I
G
 
G
T
x
L
L
 
V
P
|
P
G
x
N
F
 
S
G
 
G
G
 
L
S
 
S
Q
 
F
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
K
 
L
G
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
Q
E
 
E
M
 
L
I
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
S
D
 
P
M
 
R
I
 
L
D
 
S
A
 
A
Q
 
E
E
 
E
A
 
A
W
 
L
R
 
A
I
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
H
K
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
E
E
 
K
L
 
L
M
 
M
A
 
E
A
 
E
A
 
A
N
 
L
A
 
S
V
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
Q
K
 
G
S
 
P
L
 
T
M
 
R
A
 
A
L
 
Y
K
 
A
L
 
L
C
 
T
K
 
K
E
 
K
V
 
L
V
 
L
V
 
L
N
 
E
G
 
T
L
 
Y
E
 
R
M
 
L
D
 
S
L
 
L
D
 
T
R
 
E
A
 
A
C
 
L
S
x
A
Y
 
L
E
 
E
A
 
A
D
 
V
L
 
L
F
 
Q
A
 
G
L
 
Q
S
 
A
F
x
G
A
 
Q
T
 
T
A
 
Q
D
 
D
Q
 
H
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
V
A
 
R
A
 
A
F
|
F
L
 
R
E
 
E
K
|
K
R
 
R
A
 
P
P
 
P
V
 
R
F
 
F
S
 
Q
D
 
G
R
 
R

6slbAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
38% identity, 98% coverage: 6:260/260 of query aligns to 5:257/257 of 6slbAAA

query
sites
6slbAAA
L
 
I
M
 
L
V
 
K
E
 
E
T
 
R
K
 
Q
D
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
L
T
 
V
I
 
L
T
 
T
V
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
E
S
 
K
M
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
I
T
 
T
V
 
G
T
 
E
T
 
L
L
 
L
Q
 
D
E
 
A
L
 
L
S
 
Y
V
 
A
V
 
A
V
 
L
Q
 
K
E
 
E
L
 
G
S
 
E
A
 
E
S
 
D
A
 
R
V
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
L
I
 
L
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
-
K
x
R
A
 
A
F
 
F
I
 
S
A
|
A
G
 
G
G
x
Q
D
|
D
I
x
L
A
 
T
M
 
E
L
x
F
Q
 
G
K
 
D
L
 
R
G
 
K
P
 
P
V
 
D
A
x
Y
A
 
E
R
 
A
E
 
H
L
|
L
A
 
R
L
 
R
L
 
Y
A
 
-
H
x
N
G
 
R
L
 
V
C
 
V
R
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
S
Q
 
G
S
 
L
P
 
E
K
 
K
P
 
P
F
 
L
I
 
V
A
 
V
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
V
A
 
A
L
 
A
G
 
G
G
x
A
G
 
G
C
 
M
E
x
S
L
 
L
A
 
A
L
 
L
C
 
W
C
 
G
D
 
D
M
 
L
R
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
V
N
 
G
A
 
A
R
 
S
F
 
F
G
 
T
Q
 
T
P
x
A
E
x
F
I
 
V
N
 
R
I
 
I
G
 
G
T
x
L
L
 
V
P
|
P
G
x
D
F
 
S
G
 
G
G
 
L
S
 
S
Q
 
F
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
K
 
L
G
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
Q
E
 
E
M
 
L
I
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
S
D
 
P
M
 
R
I
 
L
D
 
S
A
 
A
Q
 
E
E
 
E
A
 
A
W
 
L
R
 
A
I
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
H
K
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
E
E
 
K
L
 
L
M
 
M
A
 
E
A
 
E
A
 
A
N
 
L
A
 
S
V
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
Q
K
 
G
S
 
P
L
 
T
M
 
R
A
 
A
L
 
Y
K
 
A
L
 
L
C
 
T
K
 
K
E
 
K
V
 
L
V
 
L
V
 
L
N
 
E
G
 
T
L
 
Y
E
 
R
M
 
L
D
 
S
L
 
L
D
 
T
R
 
E
A
 
A
C
 
L
S
x
A
Y
 
L
E
 
E
A
 
A
D
 
V
L
 
L
F
 
Q
A
 
G
L
 
Q
S
 
A
F
x
G
A
 
Q
T
 
T
A
 
Q
D
 
D
Q
 
H
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
V
A
 
R
A
 
A
F
 
F
L
 
R
E
 
E
K
 
K
R
 
R
A
 
P
P
 
P
V
 
R
F
 
F
S
 
Q
D
 
G
R
 
R

3h02A 2.15 angstrom resolution crystal structure of naphthoate synthase from salmonella typhimurium.
36% identity, 96% coverage: 9:258/260 of query aligns to 25:260/266 of 3h02A

query
sites
3h02A
E
 
K
T
 
S
K
 
T
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
A
T
 
K
I
 
I
T
 
T
V
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
Q
S
 
V
M
 
R
N
 
N
A
 
A
M
 
F
T
 
R
V
 
P
T
 
L
T
 
T
L
 
V
Q
 
K
E
 
E
L
 
M
S
 
I
V
 
Q
V
 
A
V
 
L
Q
 
A
E
 
D
L
 
A
S
 
R
A
 
Y
S
 
D
A
 
D
V
 
N
V
 
V
R
 
G
A
 
V
V
 
I
I
 
I
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
E
G
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
C
A
 
A
G
 
G
G
|
G
D
 
D
I
 
Q
A
 
H
M
x
H
L
 
L
Q
 
N
K
 
V
L
|
L
G
 
D
P
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
F
C
 
Q
R
 
R
A
 
Q
I
 
I
E
 
R
Q
 
T
S
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
F
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
M
V
 
V
N
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
S
L
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
H
E
x
V
L
 
L
A
 
H
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
L
R
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
N
A
 
A
R
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
|
Q
P
 
T
E
x
G
I
 
P
N
 
K
I
 
V
G
 
G
T
x
S
L
 
F
P
x
D
G
|
G
F
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
A
Q
 
S
R
 
Y
L
 
M
P
 
A
R
 
R
L
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
G
 
K
R
 
K
A
 
A
L
 
R
E
 
E
M
 
I
I
x
W
L
 
F
T
 
L
G
 
C
D
 
R
M
 
Q
I
 
Y
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
E
 
Q
A
 
A
W
 
L
R
 
D
I
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
K
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
L
M
 
E
A
 
K
A
 
E
A
 
T
N
 
V
A
 
R
V
 
W
A
 
C
Q
 
R
K
 
E
L
 
M
A
 
L
G
 
Q
K
 
N
S
 
S
L
 
P
M
 
M
A
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
C
C
 
L
K
 
K
E
 
A
V
 
A
V
 
-
V
 
-
N
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
M
 
-
D
 
-
L
 
L
D
 
N
R
 
A
A
 
D
C
 
C
S
 
D
Y
 
G
E
 
Q
A
 
A
D
 
G
L
 
L
F
 
Q
A
 
E
L
 
L
S
x
A
-
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
M
-
 
L
-
 
F
F
x
Y
A
 
M
T
 
T
A
 
E
D
 
E
Q
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
R
A
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
A
 
Q
P
 
P
V
 
D
F
 
F
S
 
S

Q7CQ56 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase; DHNA-CoA synthase; EC 4.1.3.36 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720)
36% identity, 96% coverage: 9:258/260 of query aligns to 29:279/285 of Q7CQ56

query
sites
Q7CQ56
E
 
K
T
 
S
K
 
T
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
A
T
 
K
I
 
I
T
 
T
V
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
Q
S
 
V
M
 
R
N
 
N
A
 
A
M
 
F
T
 
R
V
 
P
T
 
L
T
 
T
L
 
V
Q
 
K
E
 
E
L
 
M
S
 
I
V
 
Q
V
 
A
V
 
L
Q
 
A
E
 
D
L
 
A
S
 
R
A
 
Y
S
 
D
A
 
D
V
 
N
V
 
V
R
 
G
A
 
V
V
 
I
I
 
I
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
E
G
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
C
A
 
A
G
 
G
G
 
G
D
 
D
I
 
Q
A
 
K
M
 
V
L
 
R
Q
 
G
K
 
D
L
 
Y
G
 
G
P
 
G
V
 
Y
-
 
Q
-
 
D
-
 
D
-
 
S
A
 
G
A
 
V
R
 
H
E
 
H
L
 
L
A
 
N
L
 
V
L
 
L
A
 
-
H
 
-
G
 
D
L
 
F
C
 
Q
R
 
R
A
 
Q
I
 
I
E
 
R
Q
 
T
S
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
F
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
M
V
 
V
N
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
C
 
H
E
 
V
L
 
L
A
 
H
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
L
R
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
N
A
 
A
R
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
|
Q
P
x
T
E
x
G
I
 
P
N
 
K
I
 
V
G
 
G
T
 
S
L
 
F
P
 
D
G
 
G
F
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
A
Q
 
S
R
 
Y
L
 
M
P
 
A
R
 
R
L
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
G
 
K
R
 
K
A
 
A
L
 
R
E
 
E
M
 
I
I
 
W
L
 
F
T
 
L
G
 
C
D
 
R
M
 
Q
I
 
Y
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
E
 
Q
A
 
A
W
 
L
R
 
D
I
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
K
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
L
M
 
E
A
 
K
A
 
E
A
 
T
N
 
V
A
 
R
V
 
W
A
 
C
Q
 
R
K
 
E
L
 
M
A
 
L
G
 
Q
K
 
N
S
 
S
L
 
P
M
 
M
A
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
C
C
 
L
K
 
K
E
 
A
V
 
A
V
 
-
V
 
-
N
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
M
 
-
D
 
-
L
 
L
D
 
N
R
 
A
A
 
D
C
 
C
S
 
D
Y
 
G
E
 
Q
A
 
A
D
 
G
L
 
L
F
 
Q
A
 
E
L
 
L
S
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
M
-
 
L
-
 
F
F
 
Y
A
 
M
T
 
T
A
 
E
D
 
E
Q
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
R
A
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
A
 
Q
P
 
P
V
 
D
F
 
F
S
 
S

4i42A E.Coli. 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl coenzyme a synthase (ecmenb) in complex with 1-hydroxy-2-naphthoyl-coa (see paper)
34% identity, 96% coverage: 9:258/260 of query aligns to 29:279/285 of 4i42A

query
sites
4i42A
E
 
K
T
 
S
K
 
T
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
A
T
 
K
I
 
I
T
 
T
V
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
Q
S
x
V
M
x
R
N
 
N
A
 
A
M
 
F
T
 
R
V
 
P
T
 
L
T
 
T
L
 
V
Q
 
K
E
 
E
L
 
M
S
 
I
V
 
Q
V
 
A
V
 
L
Q
 
A
E
 
D
L
 
A
S
 
R
A
 
Y
S
 
D
A
 
D
V
 
N
V
 
I
R
 
G
A
 
V
V
 
I
I
 
I
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
C
A
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
I
x
Q
A
x
K
M
 
V
L
x
R
Q
 
G
K
 
D
L
 
Y
G
 
G
P
 
-
V
 
-
A
 
G
A
x
Y
R
 
K
E
 
D
L
 
D
A
 
S
L
 
G
L
 
V
A
 
H
H
|
H
-
 
L
-
 
N
-
x
V
-
x
L
G
 
D
L
 
F
C
 
Q
R
 
R
A
 
Q
I
 
I
E
 
R
Q
 
T
S
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
F
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
M
V
 
V
N
 
A
G
 
G
Y
|
Y
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
H
E
x
V
L
 
L
A
 
H
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
L
R
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
N
A
 
A
R
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
x
T
E
x
G
I
 
P
N
 
K
I
 
V
G
 
G
T
x
S
L
 
F
P
x
D
G
|
G
F
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
A
Q
 
S
R
 
Y
L
 
M
P
 
A
R
 
R
L
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
G
 
K
R
 
K
A
 
A
L
 
R
E
 
E
M
 
I
I
 
W
L
 
F
T
 
L
G
 
C
D
 
R
M
 
Q
I
 
Y
D
 
D
A
 
A
Q
 
K
E
 
Q
A
 
A
W
 
L
R
 
D
I
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
K
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
L
M
 
E
A
 
K
A
 
E
A
 
T
N
 
V
A
 
R
V
 
W
A
 
C
Q
 
R
K
 
E
L
 
M
A
 
L
G
 
Q
K
 
N
S
 
S
L
 
P
M
 
M
A
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
C
C
 
L
K
 
K
E
 
A
V
 
A
V
 
-
V
 
-
N
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
M
 
-
D
 
-
L
 
L
D
 
N
R
 
A
A
 
D
C
 
C
S
 
D
Y
 
G
E
 
Q
A
 
A
D
 
G
L
 
L
F
 
Q
A
 
E
L
 
L
S
x
A
-
 
G
-
 
N
-
 
A
-
x
T
-
 
M
-
 
L
-
 
F
F
x
Y
A
 
M
T
 
T
A
 
E
D
 
E
Q
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
R
A
 
N
A
 
A
F
|
F
L
 
N
E
 
Q
K
|
K
R
 
R
A
 
Q
P
 
P
V
 
D
F
 
F
S
 
S

P0ABU0 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase; DHNA-CoA synthase; EC 4.1.3.36 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
34% identity, 96% coverage: 9:258/260 of query aligns to 29:279/285 of P0ABU0

query
sites
P0ABU0
E
 
K
T
 
S
K
 
T
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
A
T
 
K
I
 
I
T
 
T
V
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
Q
S
 
V
M
x
R
N
 
N
A
 
A
M
 
F
T
 
R
V
 
P
T
 
L
T
 
T
L
 
V
Q
 
K
E
 
E
L
 
M
S
 
I
V
 
Q
V
 
A
V
 
L
Q
 
A
E
 
D
L
 
A
S
 
R
A
 
Y
S
 
D
A
 
D
V
 
N
V
 
I
R
 
G
A
 
V
V
 
I
I
 
I
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
C
A
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
I
x
Q
A
x
K
M
 
V
L
x
R
Q
 
G
K
 
D
L
 
Y
G
 
G
P
 
-
V
 
-
A
 
G
A
x
Y
R
 
K
E
 
D
L
 
D
A
 
S
L
 
G
L
 
V
A
 
H
H
 
H
-
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
L
G
 
D
L
 
F
C
 
Q
R
 
R
A
 
Q
I
 
I
E
 
R
Q
 
T
S
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
F
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
M
V
 
V
N
 
A
G
 
G
Y
|
Y
A
x
S
L
x
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
H
E
 
V
L
 
L
A
 
H
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
L
R
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
N
A
 
A
R
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
|
Q
P
x
T
E
x
G
I
 
P
N
 
K
I
 
V
G
 
G
T
x
S
L
 
F
P
 
D
G
 
G
F
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
A
Q
 
S
R
 
Y
L
 
M
P
 
A
R
 
R
L
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
G
 
K
R
 
K
A
 
A
L
 
R
E
 
E
M
 
I
I
x
W
L
 
F
T
 
L
G
 
C
D
 
R
M
 
Q
I
 
Y
D
 
D
A
 
A
Q
 
K
E
 
Q
A
 
A
W
 
L
R
 
D
I
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
K
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
L
M
 
E
A
 
K
A
 
E
A
 
T
N
 
V
A
 
R
V
 
W
A
 
C
Q
 
R
K
 
E
L
 
M
A
 
L
G
 
Q
K
 
N
S
 
S
L
 
P
M
 
M
A
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
C
C
 
L
K
 
K
E
 
A
V
 
A
V
 
-
V
 
-
N
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
M
 
-
D
 
-
L
 
L
D
 
N
R
 
A
A
 
D
C
 
C
S
 
D
Y
 
G
E
 
Q
A
 
A
D
 
G
L
 
L
F
 
Q
A
 
E
L
 
L
S
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
M
-
 
L
-
 
F
F
x
Y
A
 
M
T
 
T
A
 
E
D
 
E
Q
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
x
R
A
 
N
A
 
A
F
|
F
L
 
N
E
 
Q
K
|
K
R
 
R
A
 
Q
P
 
P
V
 
D
F
 
F
S
 
S

3t88A Crystal structure of escherichia coli menb in complex with substrate analogue, osb-ncoa (see paper)
34% identity, 96% coverage: 9:258/260 of query aligns to 25:275/281 of 3t88A

query
sites
3t88A
E
 
K
T
 
S
K
 
T
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
A
T
 
K
I
 
I
T
 
T
V
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
Q
S
x
V
M
x
R
N
 
N
A
|
A
M
 
F
T
 
R
V
 
P
T
 
L
T
 
T
L
 
V
Q
 
K
E
 
E
L
 
M
S
 
I
V
 
Q
V
 
A
V
 
L
Q
 
A
E
 
D
L
 
A
S
 
R
A
 
Y
S
 
D
A
 
D
V
 
N
V
 
I
R
 
G
A
 
V
V
 
I
I
 
I
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
C
A
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
I
x
Q
A
x
K
M
 
V
L
x
R
Q
 
G
K
 
D
L
 
Y
G
 
G
P
 
-
V
 
-
A
 
G
A
x
Y
R
 
K
E
 
D
L
 
D
A
 
S
L
 
G
L
 
V
A
 
H
H
|
H
-
 
L
-
 
N
-
x
V
-
x
L
G
 
D
L
 
F
C
 
Q
R
 
R
A
 
Q
I
 
I
E
 
R
Q
 
T
S
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
F
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
M
V
 
V
N
 
A
G
 
G
Y
|
Y
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
H
E
x
V
L
 
L
A
 
H
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
L
R
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
N
A
 
A
R
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
x
T
E
x
G
I
 
P
N
 
K
I
x
V
G
 
G
T
x
S
L
x
F
P
x
D
G
|
G
F
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
A
Q
 
S
R
 
Y
L
 
M
P
 
A
R
 
R
L
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
G
 
K
R
 
K
A
 
A
L
 
R
E
 
E
M
 
I
I
 
W
L
 
F
T
 
L
G
 
C
D
 
R
M
 
Q
I
 
Y
D
 
D
A
 
A
Q
 
K
E
 
Q
A
 
A
W
 
L
R
 
D
I
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
K
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
L
M
 
E
A
 
K
A
 
E
A
 
T
N
 
V
A
 
R
V
 
W
A
 
C
Q
 
R
K
 
E
L
 
M
A
 
L
G
 
Q
K
 
N
S
 
S
L
 
P
M
 
M
A
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
C
C
 
L
K
 
K
E
 
A
V
 
A
V
 
-
V
 
-
N
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
M
 
-
D
 
-
L
 
L
D
 
N
R
 
A
A
 
D
C
 
C
S
 
D
Y
 
G
E
 
Q
A
 
A
D
 
G
L
 
L
F
 
Q
A
 
E
L
 
L
S
x
A
-
 
G
-
 
N
-
 
A
-
x
T
-
 
M
-
 
L
-
 
F
F
x
Y
A
 
M
T
 
T
A
 
E
D
 
E
Q
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
R
A
 
N
A
 
A
F
|
F
L
 
N
E
 
Q
K
|
K
R
 
R
A
 
Q
P
 
P
V
 
D
F
 
F
S
 
S

4elwA Structure of e. Coli. 1,4-dihydroxy-2- naphthoyl coenzyme a synthases (menb) in complex with nitrate (see paper)
35% identity, 96% coverage: 9:258/260 of query aligns to 26:261/267 of 4elwA

query
sites
4elwA
E
 
K
T
 
S
K
 
T
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
A
T
 
K
I
 
I
T
 
T
V
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
Q
S
 
V
M
 
R
N
 
N
A
 
A
M
 
F
T
 
R
V
 
P
T
 
L
T
 
T
L
 
V
Q
 
K
E
 
E
L
 
M
S
 
I
V
 
Q
V
 
A
V
 
L
Q
 
A
E
 
D
L
 
A
S
 
R
A
 
Y
S
 
D
A
 
D
V
 
N
V
 
I
R
 
G
A
 
V
V
 
I
I
 
I
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
C
A
 
S
G
 
G
G
|
G
D
 
D
I
 
Q
A
 
K
M
 
H
L
 
L
Q
 
N
K
 
V
L
|
L
G
 
D
P
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
F
C
 
Q
R
 
R
A
 
Q
I
 
I
E
 
R
Q
 
T
S
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
F
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
M
V
 
V
N
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
S
L
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
H
E
x
V
L
 
L
A
 
H
L
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
L
R
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
N
A
 
A
R
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
x
T
E
x
G
I
 
P
N
 
K
I
 
V
G
 
G
T
x
S
L
x
F
P
x
D
G
|
G
F
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
A
Q
 
S
R
 
Y
L
 
M
P
 
A
R
 
R
L
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
G
 
K
R
 
K
A
 
A
L
 
R
E
 
E
M
 
I
I
x
W
L
 
F
T
 
L
G
 
C
D
 
R
M
 
Q
I
 
Y
D
 
D
A
 
A
Q
 
K
E
 
Q
A
 
A
W
 
L
R
 
D
I
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
K
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
L
M
 
E
A
 
K
A
 
E
A
 
T
N
 
V
A
 
R
V
 
W
A
 
C
Q
 
R
K
 
E
L
 
M
A
 
L
G
 
Q
K
 
N
S
 
S
L
 
P
M
 
M
A
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
C
C
 
L
K
 
K
E
 
A
V
 
A
V
 
-
V
 
-
N
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
M
 
-
D
 
-
L
 
L
D
 
N
R
 
A
A
 
D
C
 
C
S
 
D
Y
 
G
E
 
Q
A
 
A
D
 
G
L
 
L
F
 
Q
A
 
E
L
 
L
S
x
A
-
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
M
-
 
L
-
 
F
F
x
Y
A
 
M
T
 
T
A
 
E
D
 
E
Q
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
R
A
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
A
 
Q
P
 
P
V
 
D
F
 
F
S
 
S

Query Sequence

>WP_012470937.1 NCBI__GCF_000020385.1:WP_012470937.1
MTTTTLMVETKDGIATITVNRPASMNAMTVTTLQELSVVVQELSASAVVRAVIITGAGEK
AFIAGGDIAMLQKLGPVAARELALLAHGLCRAIEQSPKPFIAAVNGYALGGGCELALCCD
MRIAAENARFGQPEINIGTLPGFGGSQRLPRLVGKGRALEMILTGDMIDAQEAWRIGLVN
KVVPAAELMAAANAVAQKLAGKSLMALKLCKEVVVNGLEMDLDRACSYEADLFALSFATA
DQQEGMAAFLEKRAPVFSDR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory