SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012506718.1 NCBI__GCF_000020625.1:WP_012506718.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6ed7A Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase bound to inhibitor mac13772
63% identity, 98% coverage: 6:424/428 of query aligns to 5:422/429 of 6ed7A

query
sites
6ed7A
D
 
D
T
 
L
D
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
Q
G
 
R
H
 
H
I
 
I
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
T
S
 
S
M
 
M
R
 
T
D
 
S
P
 
P
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
A
 
V
R
 
S
A
 
A
S
 
E
G
 
G
V
 
C
T
 
E
I
 
L
E
 
I
L
 
L
E
 
S
D
 
D
G
 
G
R
 
R
K
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
H
 
H
P
 
P
V
 
Q
L
 
L
N
 
N
H
 
A
A
 
A
V
 
M
T
 
K
R
 
S
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
S
 
A
M
 
M
S
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
A
P
 
P
A
 
A
V
 
I
K
 
E
L
 
L
A
 
C
G
 
R
Q
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
A
L
 
M
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
P
 
P
L
 
L
Q
 
E
K
 
C
V
 
V
F
 
F
F
 
L
S
 
A
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
M
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
Q
A
 
A
A
 
K
G
 
G
L
 
E
S
 
A
R
 
R
K
 
Q
R
 
R
R
 
-
L
 
F
L
 
L
T
 
T
V
 
F
R
 
R
S
 
N
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
|
D
T
 
T
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
N
G
 
S
M
 
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
K
G
 
G
M
 
Y
L
 
L
A
 
P
E
 
E
Q
 
N
L
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
A
P
 
P
Q
 
Q
C
 
S
G
 
R
F
 
M
D
 
D
A
 
G
A
 
E
W
 
W
N
 
D
E
 
E
N
 
R
G
 
D
I
 
M
E
 
V
D
 
G
L
 
F
H
 
A
Q
 
R
K
 
L
L
 
M
R
 
A
Q
 
A
H
 
H
H
 
R
E
 
H
A
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
I
 
I
E
 
E
P
 
P
V
 
I
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
M
Y
 
Y
S
 
H
P
 
P
H
 
E
Y
 
W
L
 
L
I
 
K
R
 
R
L
 
I
R
 
R
E
 
K
L
 
I
C
 
C
D
 
D
E
 
R
Y
 
E
G
 
G
V
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
A
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
K
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
C
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
E
V
 
I
V
 
A
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
L
C
 
C
V
 
L
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
T
M
 
M
T
 
T
L
 
L
A
 
S
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
T
A
 
T
D
 
R
H
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
E
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
N
A
 
G
E
 
E
P
 
A
G
 
G
L
 
C
F
 
F
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
 
P
T
 
T
F
 
F
M
 
M
A
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
A
A
 
A
S
 
N
A
 
A
S
 
S
I
 
L
D
 
A
L
 
I
L
 
L
C
 
E
S
 
S
R
 
G
D
 
D
W
 
W
E
 
Q
Q
 
Q
E
 
Q
V
 
V
Q
 
A
D
 
D
I
 
I
Q
 
E
G
 
V
A
 
Q
L
 
L
Q
 
R
D
 
E
G
 
Q
L
 
L
S
 
A
P
 
P
C
 
A
S
 
R
R
 
D
F
 
A
S
 
E
G
 
M
V
 
V
H
 
A
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
L
 
T
C
 
T
Q
 
H
P
 
P
V
 
V
D
 
N
M
 
M
A
 
A
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
F
 
F
F
 
F
V
 
V
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
I
R
|
R
P
 
P
F
|
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
L
 
L
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
I
S
 
L
P
 
P
S
 
Q
E
 
Q
M
 
L
V
 
Q
I
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
N
D
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
Q

P12995 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase; 7,8-diamino-pelargonic acid aminotransferase; DAPA AT; DAPA aminotransferase; 7,8-diaminononanoate synthase; DANS; Diaminopelargonic acid synthase; EC 2.6.1.62 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
63% identity, 98% coverage: 6:424/428 of query aligns to 5:422/429 of P12995

query
sites
P12995
D
 
D
T
 
L
D
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
Q
G
 
R
H
 
H
I
 
I
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
T
S
 
S
M
 
M
R
 
T
D
 
S
P
 
P
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
A
 
V
R
 
S
A
 
A
S
 
E
G
 
G
V
 
C
T
 
E
I
 
L
E
 
I
L
 
L
E
 
S
D
 
D
G
 
G
R
 
R
K
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
H
 
H
P
 
P
V
 
Q
L
 
L
N
 
N
H
 
A
A
 
A
V
 
M
T
 
K
R
 
S
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
S
 
A
M
 
M
S
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
A
P
 
P
A
 
A
V
 
I
K
 
E
L
 
L
A
 
C
G
 
R
Q
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
A
L
 
M
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
P
 
P
L
 
L
Q
 
E
K
 
C
V
 
V
F
 
F
F
 
L
S
 
A
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
M
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
Q
A
 
A
A
 
K
G
 
G
L
 
E
S
 
A
R
 
R
K
 
Q
R
 
R
R
 
-
L
 
F
L
 
L
T
 
T
V
 
F
R
 
R
S
 
N
G
 
G
Y
|
Y
H
 
H
G
 
G
D
|
D
T
 
T
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
N
G
 
S
M
 
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
K
G
 
G
M
 
Y
L
 
L
A
 
P
E
 
E
Q
 
N
L
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
A
P
 
P
Q
 
Q
C
 
S
G
 
R
F
 
M
D
 
D
A
 
G
A
 
E
W
 
W
N
 
D
E
 
E
N
 
R
G
 
D
I
 
M
E
 
V
D
 
G
L
 
F
H
 
A
Q
 
R
K
 
L
L
 
M
R
 
A
Q
 
A
H
 
H
H
 
R
E
 
H
A
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
I
 
I
E
 
E
P
 
P
V
 
I
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
M
Y
 
Y
S
 
H
P
 
P
H
 
E
Y
 
W
L
 
L
I
 
K
R
 
R
L
 
I
R
 
R
E
 
K
L
 
I
C
 
C
D
 
D
E
 
R
Y
 
E
G
 
G
V
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
A
D
|
D
E
 
E
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
K
 
K
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
C
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
E
V
 
I
V
 
A
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
L
C
 
C
V
 
L
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
T
M
 
M
T
 
T
L
 
L
A
 
S
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
T
A
 
T
D
 
R
H
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
E
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
N
A
 
G
E
 
E
P
 
A
G
 
G
L
 
C
F
 
F
M
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
A
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
A
A
 
A
S
 
N
A
 
A
S
 
S
I
 
L
D
 
A
L
 
I
L
 
L
C
 
E
S
 
S
R
 
G
D
 
D
W
 
W
E
 
Q
Q
 
Q
E
 
Q
V
 
V
Q
 
A
D
 
D
I
 
I
Q
 
E
G
 
V
A
 
Q
L
 
L
Q
 
R
D
 
E
G
 
Q
L
 
L
S
 
A
P
 
P
C
 
A
S
 
R
R
 
D
F
 
A
S
 
E
G
 
M
V
 
V
H
 
A
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
L
 
T
C
 
T
Q
 
H
P
 
P
V
 
V
D
 
N
M
 
M
A
 
A
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
F
 
F
F
 
F
V
 
V
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
I
R
|
R
P
 
P
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
L
 
L
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
I
S
 
L
P
 
P
S
 
Q
E
 
Q
M
 
L
V
 
Q
I
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
N
D
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
Q

1dtyA Crystal structure of adenosylmethionine-8-amino-7-oxonanoate aminotransferase with pyridoxal phosphate cofactor.
62% identity, 98% coverage: 6:424/428 of query aligns to 5:422/429 of 1dtyA

query
sites
1dtyA
D
 
D
T
 
L
D
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
E
G
 
R
H
 
H
I
 
I
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
T
S
 
S
M
 
M
R
 
T
D
 
S
P
 
P
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
A
 
V
R
 
S
A
 
A
S
 
E
G
 
G
V
 
C
T
 
E
I
 
L
E
 
I
L
 
L
E
 
S
D
 
D
G
 
G
R
 
R
K
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
 
W
W
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
H
 
H
P
 
P
V
 
Q
L
 
L
N
 
N
H
 
A
A
 
A
V
 
M
T
 
K
R
 
S
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
S
 
A
M
 
M
S
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
A
P
 
P
A
 
A
V
 
I
K
 
E
L
 
L
A
 
C
G
 
R
Q
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
A
L
 
M
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
P
 
P
L
 
L
Q
 
E
K
 
C
V
 
V
F
 
F
F
 
L
S
 
A
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
M
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
A
 
K
G
 
G
L
 
E
S
 
A
R
 
R
K
 
D
R
 
R
R
 
-
L
 
F
L
 
L
T
 
T
V
 
F
R
 
R
S
 
N
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
N
G
 
S
M
 
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
K
G
 
G
M
 
Y
L
 
L
A
 
P
E
 
E
Q
 
N
L
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
A
P
 
P
Q
 
Q
C
 
S
G
 
R
F
 
M
D
 
D
A
 
G
A
 
E
W
 
W
N
 
D
E
 
E
N
 
R
G
 
D
I
 
M
E
 
V
D
 
G
L
 
F
H
 
A
Q
 
R
K
 
L
L
 
M
R
 
A
Q
 
A
H
 
H
H
 
R
E
 
H
A
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
I
 
I
E
|
E
P
 
P
V
 
I
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
M
Y
 
Y
S
 
H
P
 
P
H
 
E
Y
 
W
L
 
L
I
 
K
R
 
R
L
 
I
R
 
R
E
 
K
L
 
I
C
 
C
D
 
D
E
 
R
Y
 
E
G
 
G
V
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
A
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
K
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
C
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
E
V
 
I
V
 
A
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
L
C
 
C
V
 
L
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
T
M
 
M
T
 
T
L
 
L
A
 
S
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
T
A
 
T
D
 
R
H
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
E
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
D
A
 
G
E
 
E
P
 
A
G
 
G
L
 
C
F
 
F
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
 
P
T
 
T
F
 
F
M
 
M
A
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
A
A
 
A
S
 
N
A
 
A
S
 
S
I
 
L
D
 
A
L
 
I
L
 
L
C
 
E
S
 
S
R
 
G
D
 
D
W
 
W
E
 
Q
Q
 
Q
E
 
Q
V
 
V
Q
 
A
D
 
D
I
 
I
Q
 
E
G
 
V
A
 
Q
L
 
L
Q
 
R
D
 
E
G
 
Q
L
 
L
S
 
A
P
 
P
C
 
A
S
 
R
R
 
D
F
 
A
S
 
E
G
 
M
V
 
V
H
 
A
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
L
 
T
C
 
T
Q
 
H
P
 
P
V
 
V
D
 
N
M
 
M
A
 
A
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
F
 
F
F
 
F
V
 
V
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
I
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
I
 
I
Y
|
Y
L
 
L
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
I
S
 
L
P
 
P
S
 
Q
E
 
Q
M
 
L
V
 
Q
I
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
N
D
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
Q

1mlzA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase in complex with the trans-isomer of amiclenomycin. (see paper)
62% identity, 98% coverage: 6:424/428 of query aligns to 5:421/427 of 1mlzA

query
sites
1mlzA
D
 
D
T
 
L
D
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
Q
G
 
R
H
 
H
I
 
I
W
 
L
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
T
S
 
S
M
 
M
R
 
T
D
 
S
P
 
P
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
A
 
V
R
 
S
A
 
A
S
 
E
G
 
G
V
 
C
T
 
E
I
 
L
E
 
I
L
 
L
E
 
S
D
 
D
G
 
G
R
 
R
K
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
A
 
A
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
H
 
H
P
 
P
V
 
Q
L
 
L
N
 
N
H
 
A
A
 
A
V
 
M
T
 
K
R
 
S
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
S
 
A
M
 
M
S
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
A
P
 
P
A
 
A
V
 
I
K
 
E
L
 
L
A
 
C
G
 
R
Q
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
A
L
 
M
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
P
 
P
L
 
L
Q
 
E
K
 
C
V
 
V
F
 
F
F
 
L
S
 
A
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
M
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
Q
A
 
A
A
 
K
G
 
G
L
 
E
S
 
A
R
 
R
K
 
Q
R
 
R
R
 
-
L
 
F
L
 
L
T
 
T
V
 
F
R
 
R
S
 
N
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
N
G
 
S
M
 
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
K
G
 
G
M
 
Y
L
 
L
A
 
P
E
 
E
Q
 
N
L
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
A
P
 
P
Q
 
Q
C
 
S
G
 
R
F
 
M
D
 
-
A
 
G
A
 
E
W
 
W
N
 
D
E
 
E
N
 
R
G
 
D
I
 
M
E
 
V
D
 
G
L
 
F
H
 
A
Q
 
R
K
 
L
L
 
M
R
 
A
Q
 
A
H
 
H
H
 
R
E
 
H
A
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
I
 
I
E
|
E
P
 
P
V
 
I
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
M
Y
 
Y
S
 
H
P
 
P
H
 
E
Y
 
W
L
 
L
I
 
K
R
 
R
L
 
I
R
 
R
E
 
K
L
 
I
C
 
C
D
 
D
E
 
R
Y
 
E
G
 
G
V
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
A
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
K
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
C
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
E
V
 
I
V
 
A
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
L
C
 
C
V
 
L
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
T
M
 
M
T
 
T
L
 
L
A
 
S
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
T
A
 
T
D
 
R
H
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
E
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
N
A
 
G
E
 
E
P
 
A
G
 
G
L
 
C
F
 
F
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
A
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
A
A
 
A
S
 
N
A
 
A
S
 
S
I
 
L
D
 
A
L
 
I
L
 
L
C
 
E
S
 
S
R
 
G
D
 
D
W
 
W
E
 
Q
Q
 
Q
E
 
Q
V
 
V
Q
 
A
D
 
D
I
 
I
Q
 
E
G
 
V
A
 
Q
L
 
L
Q
 
R
D
 
E
G
 
Q
L
 
L
S
 
A
P
 
P
C
 
A
S
 
R
R
 
D
F
 
A
S
 
E
G
 
M
V
 
V
H
 
A
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
L
 
T
C
 
T
Q
 
H
P
 
P
V
 
V
D
 
N
M
 
M
A
 
A
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
F
 
F
F
 
F
V
 
V
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
I
R
|
R
P
 
P
F
|
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
I
 
I
Y
|
Y
L
 
L
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
I
S
 
L
P
 
P
S
 
Q
E
 
Q
M
 
L
V
 
Q
I
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
N
D
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
Q

1mlyA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase in complex with the cis isomer of amiclenomycin (see paper)
62% identity, 98% coverage: 6:424/428 of query aligns to 5:421/427 of 1mlyA

query
sites
1mlyA
D
 
D
T
 
L
D
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
Q
G
 
R
H
 
H
I
 
I
W
 
L
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
T
S
 
S
M
 
M
R
 
T
D
 
S
P
 
P
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
A
 
V
R
 
S
A
 
A
S
 
E
G
 
G
V
 
C
T
 
E
I
 
L
E
 
I
L
 
L
E
 
S
D
 
D
G
 
G
R
 
R
K
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
A
 
A
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
H
 
H
P
 
P
V
 
Q
L
 
L
N
 
N
H
 
A
A
 
A
V
 
M
T
 
K
R
 
S
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
S
 
A
M
 
M
S
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
A
P
 
P
A
 
A
V
 
I
K
 
E
L
 
L
A
 
C
G
 
R
Q
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
A
L
 
M
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
P
 
P
L
 
L
Q
 
E
K
 
C
V
 
V
F
 
F
F
 
L
S
 
A
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
M
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
Q
A
 
A
A
 
K
G
 
G
L
 
E
S
 
A
R
 
R
K
 
Q
R
 
R
R
 
-
L
 
F
L
 
L
T
 
T
V
 
F
R
 
R
S
 
N
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
N
G
 
S
M
 
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
K
G
 
G
M
 
Y
L
 
L
A
 
P
E
 
E
Q
 
N
L
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
A
P
 
P
Q
 
Q
C
 
S
G
 
R
F
 
M
D
 
-
A
 
G
A
 
E
W
 
W
N
 
D
E
 
E
N
 
R
G
 
D
I
 
M
E
 
V
D
 
G
L
 
F
H
 
A
Q
 
R
K
 
L
L
 
M
R
 
A
Q
 
A
H
 
H
H
 
R
E
 
H
A
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
I
 
I
E
|
E
P
 
P
V
 
I
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
M
Y
 
Y
S
 
H
P
 
P
H
 
E
Y
 
W
L
 
L
I
 
K
R
 
R
L
 
I
R
 
R
E
 
K
L
 
I
C
 
C
D
 
D
E
 
R
Y
 
E
G
 
G
V
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
A
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
K
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
C
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
E
V
 
I
V
 
A
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
L
C
 
C
V
 
L
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
T
M
 
M
T
 
T
L
 
L
A
 
S
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
T
A
 
T
D
 
R
H
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
E
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
N
A
 
G
E
 
E
P
 
A
G
 
G
L
 
C
F
 
F
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
A
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
A
A
 
A
S
 
N
A
 
A
S
 
S
I
 
L
D
 
A
L
 
I
L
 
L
C
 
E
S
 
S
R
 
G
D
 
D
W
 
W
E
 
Q
Q
 
Q
E
 
Q
V
 
V
Q
 
A
D
 
D
I
 
I
Q
 
E
G
 
V
A
 
Q
L
 
L
Q
 
R
D
 
E
G
 
Q
L
 
L
S
 
A
P
 
P
C
 
A
S
 
R
R
 
D
F
 
A
S
 
E
G
 
M
V
 
V
H
 
A
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
L
 
T
C
 
T
Q
 
H
P
 
P
V
 
V
D
 
N
M
 
M
A
 
A
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
F
 
F
F
 
F
V
 
V
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
I
R
|
R
P
 
P
F
|
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
I
 
I
Y
|
Y
L
 
L
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
I
S
 
L
P
 
P
S
 
Q
E
 
Q
M
 
L
V
 
Q
I
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
N
D
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
Q

1qj3A Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase in complex with 7-keto-8-aminopelargonic acid (see paper)
61% identity, 98% coverage: 6:424/428 of query aligns to 5:410/416 of 1qj3A

query
sites
1qj3A
D
 
D
T
 
L
D
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
Q
G
 
R
H
 
H
I
 
I
W
 
L
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
T
S
 
S
M
 
M
R
 
T
D
 
S
P
 
P
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
A
 
V
R
 
S
A
 
A
S
 
E
G
 
G
V
 
C
T
 
E
I
 
L
E
 
I
L
 
L
E
 
S
D
 
D
G
 
G
R
 
R
K
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
H
 
H
P
 
P
V
 
Q
L
 
L
N
 
N
H
 
A
A
 
A
V
 
M
T
 
K
R
 
S
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
S
 
A
M
 
M
S
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
A
P
 
P
A
 
A
V
 
I
K
 
E
L
 
L
A
 
C
G
 
R
Q
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
A
L
 
M
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
P
 
P
L
 
L
Q
 
E
K
 
C
V
 
V
F
 
F
F
 
L
S
 
A
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
M
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
Q
A
 
A
A
 
K
G
 
G
L
 
E
S
 
A
R
 
R
K
 
Q
R
 
-
R
 
R
L
 
F
L
 
L
T
 
T
V
 
F
R
 
R
S
 
N
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
N
G
 
-
M
 
-
H
 
-
S
 
-
L
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
L
A
 
P
E
 
E
Q
 
N
L
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
A
P
 
P
Q
 
Q
C
 
S
G
 
R
F
 
M
D
 
-
A
 
G
A
 
E
W
 
W
N
 
D
E
 
E
N
 
R
G
 
D
I
 
M
E
 
V
D
 
G
L
 
F
H
 
A
Q
 
R
K
 
L
L
 
M
R
 
A
Q
 
A
H
 
H
H
 
R
E
 
H
A
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
I
 
I
E
|
E
P
 
P
V
 
I
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
M
Y
 
Y
S
 
H
P
 
P
H
 
E
Y
 
W
L
 
L
I
 
K
R
 
R
L
 
I
R
 
R
E
 
K
L
 
I
C
 
C
D
 
D
E
 
R
Y
 
E
G
 
G
V
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
A
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
K
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
C
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
E
V
 
I
V
 
A
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
L
C
 
C
V
 
L
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
T
M
 
M
T
 
T
L
 
L
A
 
S
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
T
A
 
T
D
 
R
H
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
E
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
N
A
 
G
E
 
-
P
 
-
G
 
G
L
 
C
F
 
F
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
 
P
T
 
T
F
 
F
M
 
M
A
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
A
A
 
A
S
 
N
A
 
A
S
 
S
I
 
L
D
 
A
L
 
I
L
 
L
C
 
E
S
 
S
R
 
G
D
 
D
W
 
W
E
 
Q
Q
 
Q
E
 
Q
V
 
V
Q
 
A
D
 
D
I
 
I
Q
 
E
G
 
V
A
 
Q
L
 
L
Q
 
R
D
 
E
G
 
Q
L
 
L
S
 
A
P
 
P
C
 
A
S
 
R
R
 
D
F
 
A
S
 
E
G
 
M
V
 
V
H
 
A
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
L
 
T
C
 
T
Q
 
H
P
 
P
V
 
V
D
 
N
M
 
M
A
 
A
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
F
 
F
F
 
F
V
 
V
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
I
R
|
R
P
 
P
F
|
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
I
 
I
Y
|
Y
L
 
L
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
I
S
 
L
P
 
P
S
 
Q
E
 
Q
M
 
L
V
 
Q
I
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
N
D
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
Q

4cxqA Mycobaterium tuberculosis transaminase bioa complexed with substrate kapa (see paper)
55% identity, 98% coverage: 10:428/428 of query aligns to 10:427/427 of 4cxqA

query
sites
4cxqA
D
 
D
R
 
G
G
 
A
H
 
H
I
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
S
S
 
S
M
 
I
-
 
G
R
 
R
D
 
E
P
 
V
L
 
S
P
 
P
V
 
V
Y
 
V
P
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
H
S
 
G
G
 
A
V
 
W
T
 
L
I
 
T
E
 
L
L
 
I
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
K
 
E
L
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
A
 
T
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
N
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
N
 
D
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
S
 
V
M
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
K
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
G
L
 
L
Q
 
D
K
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
P
R
 
G
K
 
K
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
M
T
 
T
V
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
Q
P
 
V
Q
 
P
C
 
R
G
 
D
F
 
Y
D
 
D
A
 
P
A
 
A
W
 
Y
N
 
S
E
 
A
N
 
A
G
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
F
H
 
E
Q
 
A
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
H
 
H
H
 
A
E
 
G
A
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
F
Y
 
H
S
 
D
P
 
P
H
 
R
Y
 
Y
L
 
L
I
 
H
R
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
A
E
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
C
A
 
T
D
 
A
H
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
H
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
G
E
 
A
P
 
A
G
 
G
L
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
V
A
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
L
S
 
G
R
 
Q
D
 
D
W
 
W
E
 
R
Q
 
T
E
 
R
V
 
I
Q
 
T
D
 
E
I
 
L
Q
 
A
G
 
A
A
 
G
L
 
L
Q
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
T
C
 
A
S
 
R
R
 
A
F
 
L
S
 
P
G
 
A
V
 
V
H
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
C
C
 
D
Q
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
A
Q
 
T
N
 
P
F
 
A
F
 
A
V
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
L
R
|
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
R
 
N
L
 
L
I
 
V
Y
|
Y
L
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
C
S
 
T
P
 
P
S
 
A
E
 
E
M
 
I
V
 
T
I
 
Q
L
 
I
T
 
T
R
 
S
A
 
A
V
 
M
R
 
V
D
 
E
A
 
V
V
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
S

4w1vA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a thiazole inhibitor (see paper)
55% identity, 98% coverage: 10:428/428 of query aligns to 10:425/425 of 4w1vA

query
sites
4w1vA
D
 
D
R
 
G
G
 
A
H
 
H
I
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
T
 
S
S
 
S
M
 
I
R
 
G
D
 
R
P
 
S
L
 
-
P
 
P
V
 
V
Y
 
V
P
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
H
S
 
G
G
 
A
V
 
W
T
 
L
I
 
T
E
 
L
L
 
I
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
K
 
E
L
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
A
 
T
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
N
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
N
 
D
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
S
 
V
M
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
K
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
G
L
 
L
Q
 
D
K
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
P
R
 
G
K
 
K
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
M
T
 
T
V
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
Q
P
 
V
Q
 
P
C
 
R
G
 
D
F
 
Y
D
 
D
A
 
P
A
 
A
W
 
Y
N
 
S
E
 
A
N
 
A
G
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
F
H
 
E
Q
 
A
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
H
 
H
H
 
A
E
 
G
A
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
F
Y
 
H
S
 
D
P
 
P
H
 
R
Y
 
Y
L
 
L
I
 
H
R
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
A
E
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
C
A
 
T
D
 
A
H
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
H
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
G
E
 
A
P
 
A
G
 
G
L
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
V
A
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
L
S
 
G
R
 
Q
D
 
D
W
 
W
E
 
R
Q
 
T
E
 
R
V
 
I
Q
 
T
D
 
E
I
 
L
Q
 
A
G
 
A
A
 
G
L
 
L
Q
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
T
C
 
A
S
 
R
R
 
A
F
 
L
S
 
P
G
 
A
V
 
V
H
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
C
C
 
D
Q
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
A
Q
 
T
N
 
P
F
 
A
F
 
A
V
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
|
F
G
 
R
R
 
N
L
 
L
I
 
V
Y
|
Y
L
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
C
S
 
T
P
 
P
S
 
A
E
 
E
M
 
I
V
 
T
I
 
Q
L
 
I
T
 
T
R
 
S
A
 
A
V
 
M
R
 
V
D
 
E
A
 
V
V
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
S

4cxrA Mycobaterium tuberculosis transaminase bioa complexed with 1-(1,3- benzothiazol-2-yl)methanamine (see paper)
55% identity, 98% coverage: 10:428/428 of query aligns to 10:425/425 of 4cxrA

query
sites
4cxrA
D
 
D
R
 
G
G
 
A
H
 
H
I
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
S
S
 
S
M
 
I
R
 
G
D
 
R
P
 
S
L
 
-
P
 
P
V
 
V
Y
 
V
P
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
H
S
 
G
G
 
A
V
 
W
T
 
L
I
 
T
E
 
L
L
 
I
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
K
 
E
L
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
A
 
T
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
N
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
N
 
D
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
S
 
V
M
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
K
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
G
L
 
L
Q
 
D
K
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
P
R
 
G
K
 
K
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
M
T
 
T
V
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
Q
P
 
V
Q
 
P
C
 
R
G
 
D
F
 
Y
D
 
D
A
 
P
A
 
A
W
 
Y
N
 
S
E
 
A
N
 
A
G
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
F
H
 
E
Q
 
A
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
H
 
H
H
 
A
E
 
G
A
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
F
Y
 
H
S
 
D
P
 
P
H
 
R
Y
 
Y
L
 
L
I
 
H
R
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
A
E
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
C
A
 
T
D
 
A
H
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
H
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
G
E
 
A
P
 
A
G
 
G
L
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
V
A
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
L
S
 
G
R
 
Q
D
 
D
W
 
W
E
 
R
Q
 
T
E
 
R
V
 
I
Q
 
T
D
 
E
I
 
L
Q
 
A
G
 
A
A
 
G
L
 
L
Q
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
T
C
 
A
S
 
R
R
 
A
F
 
L
S
 
P
G
 
A
V
 
V
H
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
C
C
 
D
Q
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
A
Q
 
T
N
 
P
F
 
A
F
 
A
V
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
R
 
N
L
 
L
I
 
V
Y
|
Y
L
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
C
S
 
T
P
 
P
S
 
A
E
 
E
M
 
I
V
 
T
I
 
Q
L
 
I
T
 
T
R
 
S
A
 
A
V
 
M
R
 
V
D
 
E
A
 
V
V
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
S

P9WQ81 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase; 7,8-diamino-pelargonic acid aminotransferase; DAPA AT; DAPA aminotransferase; 7,8-diaminononanoate synthase; DANS; 7,8-diaminopelargonic acid synthase; DAPAS; Diaminopelargonic acid synthase; EC 2.6.1.62 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
55% identity, 98% coverage: 10:428/428 of query aligns to 17:435/437 of P9WQ81

query
sites
P9WQ81
D
 
D
R
 
G
G
 
A
H
 
H
I
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
S
S
 
S
M
 
I
-
 
G
R
 
R
D
 
E
P
 
A
L
 
V
P
 
S
V
 
P
Y
 
V
P
 
V
V
 
A
A
 
V
R
 
A
A
 
A
S
 
H
G
 
G
V
 
A
T
 
W
I
 
L
E
 
T
L
 
L
-
 
I
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
K
 
E
L
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
A
 
T
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
N
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
N
 
D
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
S
 
V
M
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
K
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
G
L
 
L
Q
 
D
K
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
G
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
P
R
 
G
K
 
K
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
M
T
 
T
V
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
 
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
Q
P
 
V
Q
 
P
C
 
R
G
 
D
F
 
Y
D
 
D
A
 
P
A
 
A
W
 
Y
N
 
S
E
 
A
N
 
A
G
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
F
H
 
E
Q
 
A
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
H
 
H
H
 
A
E
 
G
A
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
 
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
F
Y
 
H
S
 
D
P
 
P
H
 
R
Y
 
Y
L
 
L
I
 
H
R
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
A
E
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
C
A
 
T
D
 
A
H
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
H
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
G
E
 
A
P
 
A
G
 
G
L
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
|
G
P
 
P
T
 
T
F
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
V
A
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
L
S
 
G
R
 
Q
D
 
D
W
 
W
E
 
R
Q
 
T
E
 
R
V
 
I
Q
 
T
D
 
E
I
 
L
Q
 
A
G
 
A
A
 
G
L
 
L
Q
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
T
C
 
A
S
 
R
R
 
A
F
 
L
S
 
P
G
 
A
V
 
V
H
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
C
C
 
D
Q
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
A
Q
 
T
N
 
P
F
 
A
F
 
A
V
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
R
 
N
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
L
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
C
S
 
T
P
 
P
S
 
A
E
 
E
M
 
I
V
 
T
I
 
Q
L
 
I
T
 
T
R
 
S
A
 
A
V
 
M
R
 
V
D
 
E
A
 
V
V
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
S

5kgtA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with an inhibitor optimized from hts lead: 1-[4-[4-(3-chlorophenyl)carbonylpiperidin-1- yl]phenyl]ethanone (see paper)
55% identity, 98% coverage: 10:428/428 of query aligns to 10:428/429 of 5kgtA

query
sites
5kgtA
D
 
D
R
 
G
G
 
A
H
 
H
I
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
S
S
 
S
M
 
I
-
 
G
R
 
R
D
 
E
P
 
A
L
 
V
P
 
S
V
 
P
Y
 
V
P
 
V
V
 
A
A
 
V
R
 
A
A
 
A
S
 
H
G
 
G
V
 
A
T
 
W
I
 
L
E
 
T
L
 
L
-
 
I
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
K
 
E
L
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
 
W
W
 
W
A
 
T
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
N
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
N
 
D
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
S
 
V
M
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
K
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
G
L
 
L
Q
 
D
K
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
|
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
P
R
 
G
K
 
K
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
M
T
 
T
V
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
Q
P
 
V
Q
 
P
C
 
R
G
 
D
F
 
Y
D
 
D
A
 
P
A
 
A
W
 
Y
N
 
S
E
 
A
N
 
A
G
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
F
H
 
E
Q
 
A
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
H
 
H
H
 
A
E
 
G
A
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
F
Y
 
H
S
 
D
P
 
P
H
 
R
Y
 
Y
L
 
L
I
 
H
R
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
A
E
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
C
A
 
T
D
 
A
H
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
H
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
G
E
 
A
P
 
A
G
 
G
L
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
|
G
P
 
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
V
A
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
L
S
 
G
R
 
Q
D
 
D
W
 
W
E
 
R
Q
 
T
E
 
R
V
 
I
Q
 
T
D
 
E
I
 
L
Q
 
A
G
 
A
A
 
G
L
 
L
Q
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
T
C
 
A
S
 
R
R
 
A
F
 
L
S
 
P
G
 
A
V
 
V
H
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
C
C
 
D
Q
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
A
Q
 
T
N
 
P
F
 
A
F
 
A
V
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
R
 
N
L
 
L
I
 
V
Y
|
Y
L
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
C
S
 
T
P
 
P
S
 
A
E
 
E
M
 
I
V
 
T
I
 
Q
L
 
I
T
 
T
R
 
S
A
 
A
V
 
M
R
 
V
D
 
E
A
 
V
V
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
S

5kgsA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with an inhibitor optimized from hts lead: 5-[4-(1,3-benzodioxol-5-ylcarbonyl)piperazin-1-yl]-2, 3-dihydroinden-1-one (see paper)
55% identity, 98% coverage: 10:428/428 of query aligns to 10:428/429 of 5kgsA

query
sites
5kgsA
D
 
D
R
 
G
G
 
A
H
 
H
I
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
T
 
S
S
 
S
M
 
I
-
 
G
R
 
R
D
 
E
P
 
A
L
 
V
P
 
S
V
 
P
Y
 
V
P
 
V
V
 
A
A
 
V
R
 
A
A
 
A
S
 
H
G
 
G
V
 
A
T
 
W
I
 
L
E
 
T
L
 
L
-
 
I
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
K
 
E
L
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
A
 
T
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
N
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
N
 
D
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
S
 
V
M
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
K
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
G
L
 
L
Q
 
D
K
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
P
R
 
G
K
 
K
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
M
T
 
T
V
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
|
D
P
 
P
D
 
H
T
x
G
G
|
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
Q
P
 
V
Q
 
P
C
 
R
G
 
D
F
 
Y
D
 
D
A
 
P
A
 
A
W
 
Y
N
 
S
E
 
A
N
 
A
G
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
F
H
 
E
Q
 
A
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
H
 
H
H
 
A
E
 
G
A
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
F
Y
 
H
S
 
D
P
 
P
H
 
R
Y
 
Y
L
 
L
I
 
H
R
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
A
E
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
C
A
 
T
D
 
A
H
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
H
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
G
E
 
A
P
 
A
G
 
G
L
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
V
A
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
L
S
 
G
R
 
Q
D
 
D
W
 
W
E
 
R
Q
 
T
E
 
R
V
 
I
Q
 
T
D
 
E
I
 
L
Q
 
A
G
 
A
A
 
G
L
 
L
Q
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
T
C
 
A
S
 
R
R
 
A
F
 
L
S
 
P
G
 
A
V
 
V
H
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
C
C
 
D
Q
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
A
Q
 
T
N
 
P
F
 
A
F
 
A
V
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
|
F
G
 
R
R
 
N
L
 
L
I
 
V
Y
|
Y
L
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
C
S
 
T
P
 
P
S
 
A
E
 
E
M
 
I
V
 
T
I
 
Q
L
 
I
T
 
T
R
 
S
A
 
A
V
 
M
R
 
V
D
 
E
A
 
V
V
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
S

4xjpA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with an inhibitor optimized from hts lead (see paper)
55% identity, 98% coverage: 10:428/428 of query aligns to 10:428/429 of 4xjpA

query
sites
4xjpA
D
 
D
R
 
G
G
 
A
H
 
H
I
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
T
 
S
S
 
S
M
 
I
-
 
G
R
 
R
D
 
E
P
 
A
L
 
V
P
 
S
V
 
P
Y
 
V
P
 
V
V
 
A
A
 
V
R
 
A
A
 
A
S
 
H
G
 
G
V
 
A
T
 
W
I
 
L
E
 
T
L
 
L
-
 
I
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
K
 
E
L
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
A
 
T
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
N
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
N
 
D
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
S
 
V
M
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
K
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
G
L
 
L
Q
 
D
K
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
P
R
 
G
K
 
K
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
M
T
 
T
V
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
x
G
G
|
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
Q
P
 
V
Q
 
P
C
 
R
G
 
D
F
 
Y
D
 
D
A
 
P
A
 
A
W
 
Y
N
 
S
E
 
A
N
 
A
G
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
F
H
 
E
Q
 
A
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
H
 
H
H
 
A
E
 
G
A
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
|
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
F
Y
 
H
S
 
D
P
 
P
H
 
R
Y
 
Y
L
 
L
I
 
H
R
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
A
E
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
C
A
 
T
D
 
A
H
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
H
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
G
E
 
A
P
 
A
G
 
G
L
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
V
A
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
L
S
 
G
R
 
Q
D
 
D
W
 
W
E
 
R
Q
 
T
E
 
R
V
 
I
Q
 
T
D
 
E
I
 
L
Q
 
A
G
 
A
A
 
G
L
 
L
Q
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
T
C
 
A
S
 
R
R
 
A
F
 
L
S
 
P
G
 
A
V
 
V
H
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
C
C
 
D
Q
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
A
Q
 
T
N
 
P
F
 
A
F
 
A
V
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
|
F
G
 
R
R
 
N
L
 
L
I
 
V
Y
|
Y
L
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
C
S
 
T
P
 
P
S
 
A
E
 
E
M
 
I
V
 
T
I
 
Q
L
 
I
T
 
T
R
 
S
A
 
A
V
 
M
R
 
V
D
 
E
A
 
V
V
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
S

4xjmA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a hts lead compound
55% identity, 98% coverage: 10:428/428 of query aligns to 10:428/429 of 4xjmA

query
sites
4xjmA
D
 
D
R
 
G
G
 
A
H
 
H
I
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
T
 
S
S
 
S
M
 
I
-
 
G
R
 
R
D
 
E
P
 
A
L
 
V
P
 
S
V
 
P
Y
 
V
P
 
V
V
 
A
A
 
V
R
 
A
A
 
A
S
 
H
G
 
G
V
 
A
T
 
W
I
 
L
E
 
T
L
 
L
-
 
I
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
K
 
E
L
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
A
 
T
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
N
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
N
 
D
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
S
 
V
M
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
K
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
G
L
 
L
Q
 
D
K
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
P
R
 
G
K
 
K
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
M
T
 
T
V
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
|
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
x
G
G
|
G
M
|
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
x
W
T
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
Q
P
 
V
Q
 
P
C
 
R
G
 
D
F
 
Y
D
 
D
A
 
P
A
 
A
W
 
Y
N
 
S
E
 
A
N
 
A
G
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
F
H
 
E
Q
 
A
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
H
 
H
H
 
A
E
 
G
A
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
F
Y
 
H
S
 
D
P
 
P
H
 
R
Y
 
Y
L
 
L
I
 
H
R
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
A
E
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
C
A
 
T
D
 
A
H
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
H
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
G
E
 
A
P
 
A
G
 
G
L
 
A
F
 
L
M
|
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
V
A
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
L
S
 
G
R
 
Q
D
 
D
W
 
W
E
 
R
Q
 
T
E
 
R
V
 
I
Q
 
T
D
 
E
I
 
L
Q
 
A
G
 
A
A
 
G
L
 
L
Q
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
T
C
 
A
S
 
R
R
 
A
F
 
L
S
 
P
G
 
A
V
 
V
H
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
C
C
 
D
Q
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
A
Q
 
T
N
 
P
F
 
A
F
 
A
V
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
R
 
N
L
 
L
I
 
V
Y
|
Y
L
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
C
S
 
T
P
 
P
S
 
A
E
 
E
M
 
I
V
 
T
I
 
Q
L
 
I
T
 
T
R
 
S
A
 
A
V
 
M
R
 
V
D
 
E
A
 
V
V
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
S

4xjlA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a hts lead compound
55% identity, 98% coverage: 10:428/428 of query aligns to 10:428/429 of 4xjlA

query
sites
4xjlA
D
 
D
R
 
G
G
 
A
H
 
H
I
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
T
 
S
S
 
S
M
 
I
-
 
G
R
 
R
D
 
E
P
 
A
L
 
V
P
 
S
V
 
P
Y
 
V
P
 
V
V
 
A
A
 
V
R
 
A
A
 
A
S
 
H
G
 
G
V
 
A
T
 
W
I
 
L
E
 
T
L
 
L
-
 
I
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
K
 
E
L
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
A
 
T
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
N
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
N
 
D
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
S
 
V
M
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
K
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
G
L
 
L
Q
 
D
K
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
P
R
 
G
K
 
K
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
M
T
 
T
V
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
|
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
x
G
G
|
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
Q
P
 
V
Q
 
P
C
 
R
G
 
D
F
 
Y
D
 
D
A
 
P
A
 
A
W
 
Y
N
 
S
E
 
A
N
 
A
G
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
F
H
 
E
Q
 
A
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
H
 
H
H
 
A
E
 
G
A
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
F
Y
 
H
S
 
D
P
 
P
H
 
R
Y
 
Y
L
 
L
I
 
H
R
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
A
E
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
C
A
 
T
D
 
A
H
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
H
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
G
E
 
A
P
 
A
G
 
G
L
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
V
A
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
L
S
 
G
R
 
Q
D
 
D
W
 
W
E
 
R
Q
 
T
E
 
R
V
 
I
Q
 
T
D
 
E
I
 
L
Q
 
A
G
 
A
A
 
G
L
 
L
Q
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
T
C
 
A
S
 
R
R
 
A
F
 
L
S
 
P
G
 
A
V
 
V
H
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
C
C
 
D
Q
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
A
Q
 
T
N
 
P
F
 
A
F
 
A
V
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
R
 
N
L
 
L
I
 
V
Y
|
Y
L
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
C
S
 
T
P
 
P
S
 
A
E
 
E
M
 
I
V
 
T
I
 
Q
L
 
I
T
 
T
R
 
S
A
 
A
V
 
M
R
 
V
D
 
E
A
 
V
V
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
S

4wygA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis complexed with a fragment hit (see paper)
55% identity, 98% coverage: 10:428/428 of query aligns to 10:428/429 of 4wygA

query
sites
4wygA
D
 
D
R
 
G
G
 
A
H
 
H
I
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
S
S
 
S
M
 
I
-
 
G
R
 
R
D
 
E
P
 
A
L
 
V
P
 
S
V
 
P
Y
 
V
P
 
V
V
 
A
A
 
V
R
 
A
A
 
A
S
 
H
G
 
G
V
 
A
T
 
W
I
 
L
E
 
T
L
 
L
-
 
I
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
K
 
E
L
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
A
 
T
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
N
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
N
 
D
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
S
 
V
M
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
K
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
G
L
 
L
Q
 
D
K
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
P
R
 
G
K
 
K
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
M
T
 
T
V
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
Q
P
 
V
Q
 
P
C
 
R
G
 
D
F
 
Y
D
 
D
A
 
P
A
 
A
W
 
Y
N
 
S
E
 
A
N
 
A
G
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
F
H
 
E
Q
 
A
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
H
 
H
H
 
A
E
 
G
A
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
F
Y
 
H
S
 
D
P
 
P
H
 
R
Y
 
Y
L
 
L
I
 
H
R
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
A
E
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
C
A
 
T
D
 
A
H
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
H
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
G
E
 
A
P
 
A
G
 
G
L
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
V
A
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
L
S
 
G
R
 
Q
D
 
D
W
 
W
E
 
R
Q
 
T
E
 
R
V
 
I
Q
 
T
D
 
E
I
 
L
Q
 
A
G
 
A
A
 
G
L
 
L
Q
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
T
C
 
A
S
 
R
R
 
A
F
 
L
S
 
P
G
 
A
V
 
V
H
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
C
C
 
D
Q
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
A
Q
 
T
N
 
P
F
 
A
F
 
A
V
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
|
F
G
 
R
R
 
N
L
 
L
I
 
V
Y
|
Y
L
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
C
S
 
T
P
 
P
S
 
A
E
 
E
M
 
I
V
 
T
I
 
Q
L
 
I
T
 
T
R
 
S
A
 
A
V
 
M
R
 
V
D
 
E
A
 
V
V
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
S

4wyeA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis complexed with a dsf fragment hit (see paper)
55% identity, 98% coverage: 10:428/428 of query aligns to 10:428/429 of 4wyeA

query
sites
4wyeA
D
 
D
R
 
G
G
 
A
H
 
H
I
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
S
S
 
S
M
 
I
-
 
G
R
 
R
D
 
E
P
 
A
L
 
V
P
 
S
V
 
P
Y
 
V
P
 
V
V
 
A
A
 
V
R
 
A
A
 
A
S
 
H
G
 
G
V
 
A
T
 
W
I
 
L
E
 
T
L
 
L
-
 
I
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
K
 
E
L
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
A
 
T
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
N
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
N
 
D
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
S
 
V
M
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
K
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
G
L
 
L
Q
 
D
K
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
P
R
 
G
K
 
K
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
M
T
 
T
V
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
Q
P
 
V
Q
 
P
C
 
R
G
 
D
F
 
Y
D
 
D
A
 
P
A
 
A
W
 
Y
N
 
S
E
 
A
N
 
A
G
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
F
H
 
E
Q
 
A
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
H
 
H
H
 
A
E
 
G
A
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
F
Y
 
H
S
 
D
P
 
P
H
 
R
Y
 
Y
L
 
L
I
 
H
R
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
A
E
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
C
A
 
T
D
 
A
H
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
H
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
G
E
 
A
P
 
A
G
 
G
L
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
 
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
V
A
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
L
S
 
G
R
 
Q
D
 
D
W
 
W
E
 
R
Q
 
T
E
 
R
V
 
I
Q
 
T
D
 
E
I
 
L
Q
 
A
G
 
A
A
 
G
L
 
L
Q
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
T
C
 
A
S
 
R
R
 
A
F
 
L
S
 
P
G
 
A
V
 
V
H
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
C
C
 
D
Q
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
A
Q
 
T
N
 
P
F
 
A
F
 
A
V
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
|
F
G
 
R
R
 
N
L
 
L
I
 
V
Y
|
Y
L
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
C
S
 
T
P
 
P
S
 
A
E
 
E
M
 
I
V
 
T
I
 
Q
L
 
I
T
 
T
R
 
S
A
 
A
V
 
M
R
 
V
D
 
E
A
 
V
V
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
S

4w1xA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with 1-(4-(4-(3-chlorobenzoyl) piperazin-1-yl)phenyl)ethanone (see paper)
55% identity, 98% coverage: 10:428/428 of query aligns to 10:428/429 of 4w1xA

query
sites
4w1xA
D
 
D
R
 
G
G
 
A
H
 
H
I
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
T
 
S
S
 
S
M
 
I
-
 
G
R
 
R
D
 
E
P
 
A
L
 
V
P
 
S
V
 
P
Y
 
V
P
 
V
V
 
A
A
 
V
R
 
A
A
 
A
S
 
H
G
 
G
V
 
A
T
 
W
I
 
L
E
 
T
L
 
L
-
 
I
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
K
 
E
L
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
A
 
T
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
N
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
N
 
D
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
S
 
V
M
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
K
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
G
L
 
L
Q
 
D
K
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
P
R
 
G
K
 
K
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
M
T
 
T
V
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
x
G
G
|
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
Q
P
 
V
Q
 
P
C
 
R
G
 
D
F
 
Y
D
 
D
A
 
P
A
 
A
W
 
Y
N
 
S
E
 
A
N
 
A
G
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
F
H
 
E
Q
 
A
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
H
 
H
H
 
A
E
 
G
A
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
F
Y
 
H
S
 
D
P
 
P
H
 
R
Y
 
Y
L
 
L
I
 
H
R
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
A
E
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
C
A
 
T
D
 
A
H
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
H
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
G
E
 
A
P
 
A
G
 
G
L
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
V
A
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
L
S
 
G
R
 
Q
D
 
D
W
 
W
E
 
R
Q
 
T
E
 
R
V
 
I
Q
 
T
D
 
E
I
 
L
Q
 
A
G
 
A
A
 
G
L
 
L
Q
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
T
C
 
A
S
 
R
R
 
A
F
 
L
S
 
P
G
 
A
V
 
V
H
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
C
C
 
D
Q
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
A
Q
 
T
N
 
P
F
 
A
F
 
A
V
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
R
 
N
L
 
L
I
 
V
Y
|
Y
L
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
C
S
 
T
P
 
P
S
 
A
E
 
E
M
 
I
V
 
T
I
 
Q
L
 
I
T
 
T
R
 
S
A
 
A
V
 
M
R
 
V
D
 
E
A
 
V
V
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
S

4w1wA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with 7-(diethylamino)-3- (thiophene-2-carbonyl)-2h-chromen-2-one (see paper)
55% identity, 98% coverage: 10:428/428 of query aligns to 10:428/429 of 4w1wA

query
sites
4w1wA
D
 
D
R
 
G
G
 
A
H
 
H
I
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
Y
|
Y
T
 
S
S
 
S
M
 
I
-
 
G
R
 
R
D
 
E
P
 
A
L
 
V
P
 
S
V
 
P
Y
 
V
P
 
V
V
 
A
A
 
V
R
 
A
A
 
A
S
 
H
G
 
G
V
 
A
T
 
W
I
 
L
E
 
T
L
 
L
-
 
I
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
K
 
E
L
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
A
 
T
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
N
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
N
 
D
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
S
 
V
M
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
F
 
F
G
|
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
K
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
G
L
 
L
Q
 
D
K
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
P
R
 
G
K
 
K
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
M
T
 
T
V
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
x
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
Q
P
 
V
Q
 
P
C
 
R
G
 
D
F
 
Y
D
 
D
A
 
P
A
 
A
W
 
Y
N
 
S
E
 
A
N
 
A
G
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
F
H
 
E
Q
 
A
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
H
 
H
H
 
A
E
 
G
A
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
F
Y
 
H
S
 
D
P
 
P
H
 
R
Y
 
Y
L
 
L
I
 
H
R
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
A
E
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
C
A
 
T
D
 
A
H
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
H
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
G
E
 
A
P
 
A
G
 
G
L
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
V
A
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
L
S
 
G
R
 
Q
D
 
D
W
 
W
E
 
R
Q
 
T
E
 
R
V
 
I
Q
 
T
D
 
E
I
 
L
Q
 
A
G
 
A
A
 
G
L
 
L
Q
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
T
C
 
A
S
 
R
R
 
A
F
 
L
S
 
P
G
 
A
V
 
V
H
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
C
C
 
D
Q
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
A
Q
 
T
N
 
P
F
 
A
F
 
A
V
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
L
R
|
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
R
 
N
L
 
L
I
 
V
Y
|
Y
L
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
C
S
 
T
P
 
P
S
 
A
E
 
E
M
 
I
V
 
T
I
 
Q
L
 
I
T
 
T
R
 
S
A
 
A
V
 
M
R
 
V
D
 
E
A
 
V
V
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
S

5te2A Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a mechanism-based inhibitor (see paper)
55% identity, 98% coverage: 10:428/428 of query aligns to 10:428/428 of 5te2A

query
sites
5te2A
D
 
D
R
 
G
G
 
A
H
 
H
I
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
Y
|
Y
T
 
S
S
 
S
M
 
I
-
 
G
R
 
R
D
 
E
P
 
A
L
 
V
P
 
S
V
 
P
Y
 
V
P
 
V
V
 
A
A
 
V
R
 
A
A
 
A
S
 
H
G
 
G
V
 
A
T
 
W
I
 
L
E
 
T
L
 
L
-
 
I
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
K
 
E
L
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
A
M
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
A
 
T
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
H
N
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
A
L
 
L
N
 
D
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
R
S
 
V
M
 
M
S
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
A
K
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
G
L
 
L
Q
 
D
K
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
G
|
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
R
A
 
G
A
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
P
R
 
G
K
 
K
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
M
T
 
T
V
 
W
R
 
R
S
 
G
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
C
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
H
T
 
G
G
 
G
M
 
M
H
 
H
S
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
G
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
P
A
 
Q
P
 
V
Q
 
P
C
 
R
G
 
D
F
 
Y
D
 
D
A
 
P
A
 
A
W
 
Y
N
 
S
E
 
A
N
 
A
G
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
F
H
 
E
Q
 
A
K
 
Q
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
H
 
H
H
 
A
E
 
G
A
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
F
 
F
Y
 
H
S
 
D
P
 
P
H
 
R
Y
 
Y
L
 
L
I
 
H
R
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
I
C
 
C
D
 
R
E
 
R
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
A
E
 
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
S
P
 
P
D
 
D
I
 
I
M
 
M
C
 
C
V
 
V
G
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
C
A
 
T
D
 
A
H
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
H
T
 
T
I
 
I
S
 
S
S
 
A
A
 
G
E
 
A
P
 
A
G
 
G
L
 
A
F
 
L
M
 
M
H
 
H
G
|
G
P
|
P
T
|
T
F
 
F
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
S
 
A
V
 
V
A
 
S
S
 
V
A
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
L
S
 
G
R
 
Q
D
 
D
W
 
W
E
 
R
Q
 
T
E
 
R
V
 
I
Q
 
T
D
 
E
I
 
L
Q
 
A
G
 
A
A
 
G
L
 
L
Q
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
T
C
 
A
S
 
R
R
 
A
F
 
L
S
 
P
G
 
A
V
 
V
H
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
C
C
 
D
Q
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
A
Q
 
T
N
 
P
F
 
A
F
 
A
V
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
W
 
W
V
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
G
 
R
R
 
N
L
 
L
I
 
V
Y
|
Y
L
 
A
M
 
M
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
I
 
C
S
 
T
P
 
P
S
 
A
E
 
E
M
 
I
V
 
T
I
 
Q
L
 
I
T
 
T
R
 
S
A
 
A
V
 
M
R
 
V
D
 
E
A
 
V
V
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
S

Query Sequence

>WP_012506718.1 NCBI__GCF_000020625.1:WP_012506718.1
MKGHIDTDFDRGHIWHPYTSMRDPLPVYPVARASGVTIELEDGRKLVDGMSSWWAAVHGY
NHPVLNHAVTRQLDSMSHVMFGGLTHEPAVKLAGQLIELTPEPLQKVFFSDSGSVSVEVA
IKMALQYWQAAGLSRKRRLLTVRSGYHGDTFGAMSVCDPDTGMHSLFTGMLAEQLFAEAP
QCGFDAAWNENGIEDLHQKLRQHHEAVAAVIIEPVVQGAGGMRFYSPHYLIRLRELCDEY
GVLLIFDEIATGFGRTGKMFALEHAGVVPDIMCVGKALTGGYMTLAATLAADHVADTISS
AEPGLFMHGPTFMANPLACSVASASIDLLCSRDWEQEVQDIQGALQDGLSPCSRFSGVHD
VRVLGAIGVVELCQPVDMAAVQNFFVERGAWVRPFGRLIYLMPPFIISPSEMVILTRAVR
DAVRLIAS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory